View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13265_low_1 (Length: 1193)

Name: NF13265_low_1
Description: NF13265
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13265_low_1
NF13265_low_1
[»] chr3 (520 HSPs)
chr3 (107-934)||(6501004-6501832)
chr3 (108-934)||(6490350-6491177)
chr3 (138-934)||(9993894-9994695)
chr3 (108-934)||(12237615-12238446)
chr3 (159-934)||(12249441-12250215)
chr3 (108-934)||(9981886-9982717)
chr3 (108-934)||(23635110-23635944)
chr3 (156-934)||(10655264-10656044)
chr3 (138-934)||(10626942-10627745)
chr3 (138-934)||(37885013-37885813)
chr3 (108-934)||(8774056-8774893)
chr3 (138-934)||(37865880-37866680)
chr3 (160-934)||(4174757-4175530)
chr3 (108-934)||(28314232-28315069)
chr3 (108-934)||(38194123-38194960)
chr3 (160-934)||(18483503-18484280)
chr3 (108-934)||(23767300-23768129)
chr3 (108-934)||(29472066-29472900)
chr3 (166-934)||(29461214-29461982)
chr3 (108-934)||(39382090-39382926)
chr3 (138-934)||(5865694-5866498)
chr3 (138-934)||(5876293-5877097)
chr3 (108-934)||(38204658-38205496)
chr3 (138-934)||(6220702-6221502)
chr3 (197-934)||(39672883-39673620)
chr3 (159-934)||(23756759-23757533)
chr3 (163-934)||(24706555-24707328)
chr3 (138-934)||(5537022-5537821)
chr3 (138-934)||(6180528-6181328)
chr3 (138-934)||(13557009-13557809)
chr3 (159-934)||(39371511-39372289)
chr3 (138-934)||(13121097-13121897)
chr3 (138-934)||(19788457-19789257)
chr3 (108-934)||(19887355-19888185)
chr3 (159-934)||(20720572-20721348)
chr3 (159-934)||(28324848-28325624)
chr3 (159-934)||(11216722-11217501)
chr3 (138-934)||(5547606-5548405)
chr3 (107-934)||(933026-933861)
chr3 (138-934)||(7804519-7805319)
chr3 (138-934)||(19777820-19778620)
chr3 (138-934)||(24383519-24384321)
chr3 (138-934)||(23647184-23647983)
chr3 (166-934)||(5579634-5580403)
chr3 (138-934)||(14475656-14476458)
chr3 (163-934)||(4743202-4743972)
chr3 (138-934)||(7794608-7795408)
chr3 (138-934)||(20683781-20684578)
chr3 (159-934)||(9535067-9535842)
chr3 (138-934)||(37759103-37759905)
chr3 (163-934)||(504168-504939)
chr3 (163-934)||(526534-527305)
chr3 (163-934)||(41683142-41683913)
chr3 (163-934)||(41693711-41694482)
chr3 (159-934)||(5510156-5510930)
chr3 (159-934)||(5520334-5521108)
chr3 (138-931)||(9391206-9392006)
chr3 (163-934)||(35186841-35187612)
chr3 (159-934)||(13372670-13373442)
chr3 (138-934)||(11272383-11273186)
chr3 (166-934)||(12286979-12287749)
chr3 (166-934)||(12296801-12297571)
chr3 (166-934)||(5628018-5628786)
chr3 (138-934)||(10098502-10099302)
chr3 (202-934)||(48336743-48337475)
chr3 (138-934)||(20673196-20673994)
chr3 (163-934)||(24659364-24660135)
chr3 (138-934)||(13131339-13132140)
chr3 (159-934)||(13383264-13384036)
chr3 (163-934)||(4753789-4754557)
chr3 (167-934)||(13393858-13394622)
chr3 (163-934)||(24669944-24670715)
chr3 (138-931)||(9380660-9381460)
chr3 (166-934)||(1794483-1795253)
chr3 (108-934)||(1784071-1784904)
chr3 (108-934)||(17910003-17910837)
chr3 (161-934)||(11163291-11164063)
chr3 (166-878)||(16385542-16386251)
chr3 (107-934)||(4403676-4404506)
chr3 (106-934)||(13261674-13262505)
chr3 (107-934)||(38314096-38314933)
chr3 (108-934)||(27882787-27883617)
chr3 (108-934)||(8995957-8996787)
chr3 (106-934)||(9006509-9007341)
chr3 (138-934)||(8740128-8740925)
chr3 (138-934)||(16076361-16077163)
chr3 (108-934)||(1053111-1053943)
chr3 (108-934)||(1063540-1064372)
chr3 (139-934)||(17281434-17282234)
chr3 (441-934)||(14465332-14465826)
chr3 (447-934)||(8784989-8785478)
chr3 (108-934)||(13199243-13200081)
chr3 (138-934)||(29906181-29906983)
chr3 (198-934)||(2245857-2246601)
chr3 (332-934)||(16671163-16671766)
chr3 (108-934)||(29933559-29934393)
chr3 (108-934)||(29982713-29983547)
chr3 (431-934)||(28168811-28169315)
chr3 (138-934)||(29947346-29948149)
chr3 (138-934)||(29996500-29997303)
chr3 (159-600)||(11206408-11206850)
chr3 (108-663)||(14321962-14322521)
chr3 (110-934)||(14580541-14581372)
chr3 (138-583)||(14258416-14258867)
chr3 (108-565)||(4433164-4433624)
chr3 (561-934)||(4456776-4457149)
chr3 (159-462)||(8784729-8785034)
chr3 (403-934)||(15662706-15663240)
chr3 (880-1185)||(53056598-53056902)
chr3 (405-934)||(15651071-15651603)
chr3 (218-934)||(31113987-31114712)
chr3 (138-440)||(13601666-13601973)
chr3 (880-1185)||(29855393-29855698)
chr3 (460-934)||(21735868-21736344)
chr3 (694-1162)||(2784862-2785330)
chr3 (201-934)||(51989144-51989888)
chr3 (694-1158)||(33583027-33583492)
chr3 (138-406)||(19121370-19121643)
chr3 (203-458)||(15194516-15194772)
chr3 (706-934)||(18851693-18851919)
chr3 (159-401)||(33650661-33650901)
chr3 (138-377)||(11530232-11530474)
chr3 (201-459)||(28168611-28168870)
chr3 (901-1162)||(14955432-14955692)
chr3 (694-1161)||(24775427-24775895)
chr3 (268-930)||(22150605-22151280)
chr3 (829-1185)||(24775388-24775760)
chr3 (201-931)||(41045034-41045778)
chr3 (693-1185)||(28581902-28582396)
chr3 (693-1129)||(20627358-20627795)
chr3 (882-1185)||(46349715-46350018)
chr3 (163-356)||(35579002-35579193)
chr3 (266-915)||(49989618-49990280)
chr3 (108-355)||(13076293-13076547)
chr3 (693-1129)||(47405348-47405784)
chr3 (268-737)||(17006553-17007035)
chr3 (108-346)||(7608861-7609105)
chr3 (107-489)||(15663183-15663570)
chr3 (880-1146)||(11223548-11223812)
chr3 (769-934)||(16391615-16391780)
chr3 (766-934)||(16666128-16666295)
chr3 (431-931)||(27172565-27173063)
chr3 (693-1146)||(2560984-2561439)
chr3 (880-1129)||(47207690-47207939)
chr3 (829-1129)||(40799807-40800106)
chr3 (289-444)||(18857426-18857580)
chr3 (918-1185)||(50300245-50300490)
chr3 (880-1112)||(5213562-5213791)
chr3 (880-1185)||(18121491-18121797)
chr3 (108-469)||(15651568-15651935)
chr3 (880-1114)||(22140748-22140981)
chr3 (694-1185)||(21640664-21641154)
chr3 (431-937)||(10528871-10529387)
chr3 (881-1185)||(21636550-21636844)
chr3 (693-1183)||(49642634-49643125)
chr3 (274-401)||(24393356-24393483)
chr3 (108-312)||(27244975-27245182)
chr3 (403-1159)||(51340509-51341266)
chr3 (694-1185)||(49666286-49666767)
chr3 (880-1193)||(6090716-6091028)
chr3 (266-563)||(13953620-13953923)
chr3 (266-606)||(15832765-15833116)
chr3 (693-1174)||(20645949-20646433)
chr3 (863-1184)||(52920372-52920693)
chr3 (962-1146)||(11869133-11869317)
chr3 (897-1186)||(15903199-15903489)
chr3 (693-1115)||(49553428-49553852)
chr3 (828-934)||(15216341-15216446)
chr3 (880-1114)||(18142692-18142927)
chr3 (693-1129)||(38177568-38178006)
chr3 (863-1146)||(46796287-46796560)
chr3 (268-457)||(27172428-27172622)
chr3 (202-460)||(10528665-10528931)
chr3 (828-934)||(12567271-12567376)
chr3 (266-934)||(12752741-12753425)
chr3 (880-1173)||(21605546-21605829)
chr3 (902-1075)||(41495005-41495177)
chr3 (880-1082)||(12726204-12726405)
chr3 (907-1174)||(13948347-13948614)
chr3 (864-1193)||(14392869-14393196)
chr3 (789-934)||(16476367-16476513)
chr3 (218-429)||(21735682-21735896)
chr3 (863-1146)||(30054136-30054410)
chr3 (268-460)||(17017389-17017586)
chr3 (138-289)||(30390729-30390883)
chr3 (523-934)||(13147885-13148304)
chr3 (108-342)||(17960805-17961043)
chr3 (863-1185)||(1727896-1728208)
chr3 (431-577)||(17961073-17961223)
chr3 (687-934)||(15833197-15833442)
chr3 (687-934)||(15850800-15851048)
chr3 (910-1146)||(14969341-14969578)
chr3 (693-1183)||(30000464-30000955)
chr3 (881-1059)||(37467318-37467495)
chr3 (863-1047)||(13780593-13780777)
chr3 (686-934)||(45861693-45861942)
chr3 (863-1186)||(31303352-31303679)
chr3 (688-1001)||(11909079-11909393)
chr3 (693-1183)||(29951310-29951801)
chr3 (918-1082)||(13824091-13824254)
chr3 (266-488)||(15848499-15848726)
chr3 (270-606)||(11909492-11909840)
chr3 (897-1011)||(16032526-16032639)
chr3 (523-737)||(17017620-17017841)
chr3 (908-1082)||(17238896-17239069)
chr3 (692-1016)||(25398295-25398619)
chr3 (138-274)||(40456960-40457099)
chr3 (845-934)||(14321683-14321771)
chr3 (266-461)||(37411992-37412193)
chr3 (266-460)||(45862162-45862362)
chr3 (266-460)||(13147650-13147851)
chr3 (274-352)||(27849590-27849668)
chr3 (767-900)||(17961419-17961551)
chr3 (447-568)||(18006038-18006158)
chr3 (767-900)||(18006364-18006496)
chr3 (138-262)||(14353859-14353983)
chr3 (403-606)||(15848700-15848910)
chr3 (863-1018)||(16658656-16658811)
chr3 (1066-1158)||(33598020-33598112)
chr3 (880-959)||(11868253-11868332)
chr3 (277-352)||(13931364-13931439)
chr3 (138-267)||(14465099-14465231)
chr3 (693-1018)||(12388910-12389235)
chr3 (693-1146)||(12962995-12963448)
chr3 (968-1146)||(19888854-19889033)
chr3 (433-606)||(45862042-45862220)
chr3 (448-562)||(52919976-52920091)
chr3 (880-1186)||(12962970-12963260)
chr3 (403-567)||(13931456-13931620)
chr3 (460-568)||(12410292-12410399)
chr3 (918-1146)||(40850990-40851208)
chr3 (405-562)||(8729489-8729648)
chr3 (405-562)||(9081376-9081535)
chr3 (844-934)||(17021975-17022065)
chr3 (447-562)||(21606157-21606275)
chr3 (687-733)||(6253210-6253256)
chr3 (1134-1193)||(6490100-6490161)
chr3 (1134-1193)||(6500754-6500815)
chr3 (687-733)||(13410370-13410416)
chr3 (687-733)||(14077672-14077718)
chr3 (268-373)||(17769645-17769754)
chr3 (268-373)||(19070946-19071055)
chr3 (288-353)||(13410752-13410817)
chr3 (1135-1184)||(13824271-13824320)
chr3 (269-488)||(51340340-51340565)
chr3 (880-984)||(9700108-9700211)
chr3 (1121-1185)||(33598090-33598154)
chr3 (433-737)||(37412134-37412447)
chr3 (1137-1185)||(40851184-40851232)
chr3 (403-553)||(932343-932492)
chr3 (266-347)||(2560542-2560624)
chr3 (1134-1193)||(9981637-9981698)
chr3 (1134-1193)||(9993645-9993706)
chr3 (287-353)||(11078134-11078200)
chr3 (687-733)||(12396857-12396903)
chr3 (448-562)||(14954969-14955085)
chr3 (448-562)||(15902736-15902853)
chr3 (687-733)||(16794604-16794650)
chr3 (448-562)||(22140304-22140420)
chr3 (687-733)||(27374554-27374600)
chr3 (863-944)||(37412571-37412653)
chr3 (1136-1182)||(46796266-46796312)
chr3 (274-347)||(3238057-3238130)
chr3 (1136-1185)||(9699950-9699999)
chr3 (1135-1184)||(12388729-12388778)
chr3 (688-733)||(12968099-12968144)
chr3 (693-734)||(14955224-14955265)
chr3 (274-347)||(23538884-23538957)
chr3 (1136-1185)||(30054112-30054161)
chr3 (1121-1185)||(37412830-37412895)
chr3 (138-249)||(40287577-40287691)
chr3 (287-559)||(50299613-50299887)
chr3 (687-735)||(8729308-8729356)
chr3 (687-735)||(9081195-9081243)
chr3 (694-734)||(11223361-11223401)
chr3 (693-733)||(12726553-12726593)
chr3 (693-733)||(13948132-13948172)
chr3 (693-733)||(17239245-17239285)
chr3 (693-733)||(18121935-18121975)
chr3 (693-733)||(19249735-19249775)
chr3 (287-339)||(20724466-20724518)
chr3 (694-734)||(21636992-21637032)
chr3 (1135-1183)||(25398147-25398195)
chr3 (693-733)||(37467129-37467169)
chr3 (694-734)||(40850774-40850814)
chr3 (693-733)||(52920204-52920244)
chr3 (287-353)||(6252799-6252866)
chr3 (1138-1185)||(11223789-11223836)
chr3 (687-726)||(13653718-13653757)
chr3 (286-353)||(19198588-19198655)
chr3 (687-734)||(21317192-21317239)
chr3 (693-1018)||(22804061-22804385)
chr3 (289-344)||(22804746-22804801)
chr3 (448-562)||(26418178-26418293)
chr3 (261-347)||(26418397-26418484)
chr3 (408-562)||(27849689-27849843)
chr3 (1135-1186)||(41495213-41495264)
chr3 (1136-1185)||(10529552-10529602)
chr3 (687-733)||(10851599-10851645)
chr3 (448-562)||(12963586-12963703)
chr3 (1136-1185)||(13977941-13977991)
chr3 (286-562)||(14077822-14078096)
chr3 (1136-1185)||(15833612-15833662)
chr3 (687-733)||(16879807-16879853)
chr3 (1137-1183)||(17238825-17238871)
chr3 (266-347)||(17239643-17239725)
chr3 (403-460)||(18006023-18006081)
chr3 (687-733)||(20418023-20418069)
chr3 (287-353)||(21316932-21316998)
chr3 (448-562)||(21640406-21640523)
chr3 (1103-1193)||(21736514-21736607)
chr3 (287-353)||(22770571-22770637)
chr3 (448-562)||(28581645-28581761)
chr3 (448-562)||(38178147-38178263)
chr3 (448-562)||(40799437-40799553)
chr3 (287-348)||(47207083-47207145)
chr3 (448-562)||(49643263-49643380)
chr3 (275-352)||(8693512-8693589)
chr3 (275-352)||(9045399-9045476)
chr3 (1152-1193)||(12237373-12237414)
chr3 (1152-1193)||(12249199-12249240)
chr3 (687-732)||(13699157-13699202)
chr3 (280-352)||(15647145-15647218)
chr3 (1136-1185)||(18142653-18142702)
chr3 (449-562)||(30054683-30054799)
chr3 (1121-1158)||(37412815-37412852)
chr3 (1134-1183)||(4174517-4174568)
chr3 (698-734)||(5213378-5213414)
chr3 (287-339)||(6090105-6090157)
chr3 (1134-1183)||(13557997-13558048)
chr3 (287-347)||(14063710-14063770)
chr3 (1135-1183)||(16199683-16199731)
chr3 (1134-1183)||(16476701-16476752)
chr3 (1134-1183)||(16493460-16493511)
chr3 (690-726)||(17697402-17697438)
chr3 (693-733)||(18143067-18143107)
chr3 (1134-1183)||(19778808-19778859)
chr3 (1133-1173)||(19888842-19888882)
chr3 (693-733)||(20724884-20724924)
chr3 (419-562)||(21638746-21638893)
chr3 (1134-1183)||(23757721-23757772)
chr3 (266-348)||(28581462-28581546)
chr3 (260-347)||(29952157-29952245)
chr3 (260-347)||(30001311-30001399)
chr3 (1134-1183)||(37866868-37866919)
chr3 (693-733)||(46350166-46350206)
chr3 (289-348)||(49669207-49669267)
chr3 (523-562)||(1728518-1728557)
chr3 (523-562)||(2025705-2025744)
chr3 (448-487)||(11074019-11074058)
chr3 (1135-1183)||(11167913-11167963)
chr3 (274-352)||(12410413-12410492)
chr3 (523-562)||(13410549-13410588)
chr3 (523-562)||(13698987-13699026)
chr3 (288-347)||(13939275-13939334)
chr3 (448-562)||(14072240-14072354)
chr3 (523-562)||(15961132-15961171)
chr3 (523-562)||(16032213-16032252)
chr3 (1135-1183)||(16391359-16391409)
chr3 (694-729)||(16812010-16812045)
chr3 (523-562)||(16881906-16881945)
chr3 (523-562)||(19249914-19249953)
chr3 (901-1036)||(20725092-20725226)
chr3 (523-562)||(22128662-22128701)
chr3 (523-562)||(22463595-22463634)
chr3 (523-562)||(22465053-22465092)
chr3 (523-562)||(24776035-24776074)
chr3 (523-562)||(25398759-25398798)
chr3 (523-562)||(29855026-29855065)
chr3 (523-562)||(29951939-29951978)
chr3 (523-562)||(30001093-30001132)
chr3 (1135-1186)||(37467541-37467592)
chr3 (694-733)||(40799670-40799709)
chr3 (523-562)||(40850594-40850633)
chr3 (523-562)||(41494615-41494654)
chr3 (523-562)||(46796870-46796909)
chr3 (523-562)||(47207321-47207360)
chr3 (523-562)||(47405925-47405964)
chr3 (266-347)||(49554216-49554299)
chr3 (275-352)||(932249-932327)
chr3 (462-559)||(1463847-1463942)
chr3 (1135-1182)||(1783816-1783865)
chr3 (1150-1184)||(4404729-4404763)
chr3 (303-353)||(6174730-6174780)
chr3 (448-562)||(11223103-11223220)
chr3 (266-347)||(12963806-12963888)
chr3 (287-353)||(13698783-13698849)
chr3 (687-733)||(16882078-16882124)
chr3 (448-562)||(17239424-17239541)
chr3 (687-733)||(17762415-17762461)
chr3 (1133-1184)||(17909763-17909816)
chr3 (687-733)||(19063735-19063781)
chr3 (307-373)||(20736609-20736673)
chr3 (696-734)||(21605976-21606014)
chr3 (287-348)||(30054898-30054960)
chr3 (1149-1183)||(37886001-37886035)
chr3 (448-562)||(53057232-53057349)
chr3 (1133-1183)||(934048-934100)
chr3 (1150-1183)||(6220463-6220496)
chr3 (687-724)||(7832970-7833007)
chr3 (513-562)||(11078297-11078346)
chr3 (288-348)||(13823446-13823507)
chr3 (696-733)||(13823877-13823914)
chr3 (680-721)||(13954036-13954077)
chr3 (1141-1185)||(15851163-15851208)
chr3 (692-733)||(16199752-16199793)
chr3 (266-335)||(16305781-16305850)
chr3 (431-488)||(18005989-18006049)
chr3 (1150-1183)||(18851453-18851486)
chr3 (1133-1183)||(19887116-19887168)
chr3 (292-345)||(20645537-20645590)
chr3 (1150-1183)||(23648189-23648222)
chr3 (1133-1193)||(23680154-23680215)
chr3 (1133-1193)||(24052391-24052452)
chr3 (696-733)||(26417998-26418035)
chr3 (288-348)||(31302728-31302789)
chr3 (274-339)||(52919830-52919895)
chr3 (266-348)||(2782835-2782919)
chr3 (448-562)||(2784604-2784722)
chr3 (1135-1184)||(4457355-4457406)
chr3 (1121-1165)||(5213783-5213826)
chr3 (448-488)||(8710404-8710444)
chr3 (448-562)||(8874621-8874737)
chr3 (448-488)||(9062291-9062331)
chr3 (290-354)||(12396450-12396514)
chr3 (901-937)||(12968311-12968347)
chr3 (1134-1183)||(13122085-13122136)
chr3 (1134-1183)||(13132328-13132379)
chr3 (693-733)||(14393327-14393367)
chr3 (1134-1183)||(14466014-14466065)
chr3 (1134-1183)||(14476646-14476697)
chr3 (523-559)||(18122119-18122155)
chr3 (1134-1183)||(19789445-19789496)
chr3 (287-346)||(20628153-20628213)
chr3 (266-348)||(21638991-21639075)
chr3 (289-348)||(22463751-22463811)
chr3 (289-348)||(22465209-22465269)
chr3 (1135-1183)||(22803972-22804020)
chr3 (448-562)||(22804523-22804641)
chr3 (693-733)||(23538487-23538527)
chr3 (1134-1183)||(23768317-23768368)
chr3 (1135-1184)||(27883821-27883872)
chr3 (1134-1183)||(37760093-37760144)
chr3 (1134-1183)||(39672644-39672695)
chr3 (266-348)||(40850333-40850417)
chr3 (698-734)||(46796689-46796725)
chr3 (693-733)||(47207501-47207541)
chr3 (694-734)||(53057050-53057090)
chr3 (266-373)||(1463743-1463853)
chr3 (1135-1183)||(2246804-2246854)
chr3 (523-558)||(2560804-2560839)
chr3 (523-562)||(3238309-3238348)
chr3 (403-461)||(4243694-4243753)
chr3 (523-562)||(5213195-5213234)
chr3 (523-562)||(6174954-6174993)
chr3 (1134-1176)||(7804304-7804349)
chr3 (523-562)||(7833129-7833168)
chr3 (687-734)||(7921030-7921077)
chr3 (1135-1183)||(8739874-8739924)
chr3 (1135-1183)||(9092112-9092162)
chr3 (1148-1183)||(9536029-9536064)
chr3 (694-729)||(11868065-11868100)
chr3 (288-347)||(12967687-12967746)
chr3 (523-562)||(12967926-12967965)
chr3 (523-562)||(13781087-13781126)
chr3 (523-562)||(13947955-13947994)
chr3 (698-733)||(14969168-14969203)
chr3 (523-562)||(16659120-16659159)
chr3 (1135-1183)||(16670891-16670941)
chr3 (523-562)||(16879634-16879673)
chr3 (523-562)||(17697235-17697274)
chr3 (523-562)||(18143248-18143287)
chr3 (687-722)||(19198213-19198248)
chr3 (1150-1193)||(19249276-19249318)
chr3 (690-733)||(19658302-19658345)
chr3 (523-562)||(20627936-20627975)
chr3 (448-562)||(20724630-20724745)
chr3 (1135-1174)||(20725323-20725362)
chr3 (286-373)||(20747293-20747377)
chr3 (1135-1183)||(23636133-23636183)
chr3 (1136-1182)||(28169487-28169536)
chr3 (1135-1183)||(29905933-29905983)
chr3 (1135-1183)||(29947098-29947148)
chr3 (1135-1183)||(29996252-29996302)
chr3 (287-349)||(53057446-53057509)
chr3 (287-348)||(1728734-1728796)
chr3 (1152-1182)||(1794228-1794258)
chr3 (287-348)||(2025467-2025529)
chr3 (287-353)||(4243830-4243896)
chr3 (1150-1184)||(9380400-9380434)
chr3 (274-347)||(11189378-11189452)
chr3 (1131-1169)||(11908882-11908920)
chr3 (1131-1169)||(12752501-12752539)
chr3 (1150-1184)||(14254139-14254173)
chr3 (303-353)||(15961340-15961389)
chr3 (460-558)||(16305651-16305749)
chr3 (687-733)||(27851334-27851380)
chr3 (703-733)||(31303192-31303222)
chr3 (287-348)||(40799276-40799338)
chr3 (287-348)||(46797114-46797176)
chr3 (688-733)||(1464074-1464119)
chr3 (321-373)||(4768229-4768281)
chr3 (1150-1183)||(6180289-6180322)
chr3 (403-440)||(8710418-8710455)
chr3 (1137-1183)||(8758245-8758293)
chr3 (403-440)||(9062305-9062342)
chr3 (1133-1183)||(10626702-10626754)
chr3 (266-330)||(10849947-10850012)
chr3 (1150-1183)||(11216483-11216516)
chr3 (287-347)||(12726955-12727016)
chr3 (1150-1183)||(13372431-13372464)
chr3 (1150-1183)||(13383025-13383058)
chr3 (1150-1183)||(13393619-13393652)
chr3 (403-459)||(13410623-13410680)
chr3 (287-347)||(13781306-13781367)
chr3 (1148-1185)||(14955693-14955730)
chr3 (1150-1183)||(16348379-16348412)
chr3 (1136-1169)||(22140971-22141004)
chr3 (1150-1183)||(29460975-29461008)
chr3 (1150-1183)||(29471827-29471860)
[»] chr4 (377 HSPs)
chr4 (108-934)||(5022158-5022988)
chr4 (108-934)||(18752497-18753325)
chr4 (108-934)||(27814951-27815780)
chr4 (138-934)||(18763107-18763905)
chr4 (159-934)||(40470594-40471370)
chr4 (159-934)||(40454355-40455132)
chr4 (159-934)||(48370611-48371385)
chr4 (168-934)||(25656621-25657388)
chr4 (138-934)||(450030-450830)
chr4 (138-934)||(14843659-14844459)
chr4 (138-934)||(30937078-30937878)
chr4 (166-934)||(18077912-18078681)
chr4 (138-934)||(30926500-30927300)
chr4 (138-934)||(17928153-17928954)
chr4 (138-934)||(460611-461411)
chr4 (138-934)||(15561085-15561885)
chr4 (138-934)||(22006465-22007265)
chr4 (108-934)||(24639667-24640502)
chr4 (138-934)||(4947791-4948589)
chr4 (138-934)||(17917505-17918306)
chr4 (138-934)||(21995867-21996667)
chr4 (138-934)||(52703242-52704042)
chr4 (219-934)||(10908945-10909661)
chr4 (138-934)||(19944333-19945133)
chr4 (138-934)||(19954968-19955768)
chr4 (138-934)||(55745258-55746058)
chr4 (166-934)||(24028091-24028861)
chr4 (138-934)||(55755869-55756669)
chr4 (159-934)||(16265939-16266716)
chr4 (138-934)||(27656052-27656855)
chr4 (138-934)||(27666625-27667428)
chr4 (159-934)||(18130245-18131022)
chr4 (163-934)||(36017819-36018590)
chr4 (163-934)||(36028372-36029143)
chr4 (163-934)||(49517618-49518389)
chr4 (138-934)||(16255320-16256123)
chr4 (108-934)||(14836110-14836939)
chr4 (163-934)||(10751174-10751945)
chr4 (163-934)||(10964943-10965714)
chr4 (163-934)||(10740600-10741371)
chr4 (163-934)||(10954369-10955140)
chr4 (108-934)||(16316751-16317583)
chr4 (108-934)||(16304527-16305359)
chr4 (111-934)||(3370136-3370968)
chr4 (219-934)||(10695179-10695892)
chr4 (200-934)||(3389972-3390708)
chr4 (108-934)||(5872796-5873622)
chr4 (159-745)||(29041852-29042439)
chr4 (138-934)||(19580692-19581493)
chr4 (108-934)||(11535268-11536098)
chr4 (107-934)||(10299956-10300787)
chr4 (202-934)||(24712947-24713683)
chr4 (108-934)||(11514459-11515288)
chr4 (108-934)||(31266804-31267627)
chr4 (108-934)||(49001985-49002816)
chr4 (460-934)||(4987052-4987526)
chr4 (107-934)||(55650745-55651577)
chr4 (138-680)||(15207647-15208194)
chr4 (431-934)||(47152086-47152589)
chr4 (268-931)||(18774686-18775357)
chr4 (450-934)||(23508884-23509370)
chr4 (181-475)||(25008395-25008689)
chr4 (138-441)||(19143504-19143812)
chr4 (107-462)||(47152528-47152887)
chr4 (205-890)||(19241541-19242235)
chr4 (243-934)||(18007087-18007786)
chr4 (306-567)||(4986784-4987045)
chr4 (702-934)||(15207420-15207649)
chr4 (694-1161)||(8105430-8105898)
chr4 (478-934)||(8997284-8997743)
chr4 (863-1146)||(10692812-10693095)
chr4 (863-1146)||(10906578-10906861)
chr4 (107-401)||(10290047-10290345)
chr4 (450-934)||(16819380-16819867)
chr4 (875-1161)||(29121344-29121618)
chr4 (108-330)||(20649445-20649673)
chr4 (107-330)||(3188988-3189218)
chr4 (159-328)||(29030156-29030325)
chr4 (694-1184)||(17247035-17247525)
chr4 (138-357)||(9920958-9921180)
chr4 (166-356)||(28050050-28050238)
chr4 (693-1186)||(14604734-14605224)
chr4 (163-356)||(49509461-49509652)
chr4 (901-1130)||(56532943-56533173)
chr4 (900-1129)||(54679929-54680155)
chr4 (863-1146)||(6517446-6517729)
chr4 (266-934)||(33377762-33378444)
chr4 (201-376)||(19570536-19570711)
chr4 (693-1146)||(412792-413246)
chr4 (693-1182)||(37435352-37435856)
chr4 (693-1146)||(19884493-19884947)
chr4 (107-462)||(23508563-23508926)
chr4 (431-931)||(14778473-14778979)
chr4 (693-1129)||(22675404-22675841)
chr4 (268-395)||(8183486-8183613)
chr4 (431-931)||(14710809-14711315)
chr4 (159-356)||(17199074-17199271)
chr4 (694-1146)||(17398551-17398993)
chr4 (108-462)||(16819825-16820192)
chr4 (693-1150)||(3395380-3395840)
chr4 (449-931)||(17993824-17994310)
chr4 (863-1129)||(13575998-13576264)
chr4 (880-1184)||(45833373-45833677)
chr4 (863-1114)||(3105319-3105569)
chr4 (201-462)||(14711253-14711521)
chr4 (201-462)||(14778917-14779185)
chr4 (431-934)||(36210136-36210647)
chr4 (881-1183)||(12811007-12811306)
chr4 (918-1142)||(3483738-3483963)
chr4 (880-1186)||(16632419-16632723)
chr4 (973-1184)||(55731851-55732060)
chr4 (693-1114)||(19620958-19621381)
chr4 (138-293)||(43347078-43347236)
chr4 (433-957)||(1671908-1672445)
chr4 (864-1070)||(16939978-16940183)
chr4 (880-1071)||(25651046-25651235)
chr4 (693-1115)||(55380081-55380505)
chr4 (693-1098)||(37985525-37985932)
chr4 (693-1144)||(56034363-56034816)
chr4 (863-1059)||(9140873-9141069)
chr4 (881-1082)||(19666352-19666552)
chr4 (881-1185)||(40860647-40860941)
chr4 (268-460)||(36210587-36210784)
chr4 (693-1058)||(10072725-10073091)
chr4 (863-1059)||(29680498-29680694)
chr4 (243-373)||(39532269-39532399)
chr4 (902-1082)||(12601102-12601281)
chr4 (968-1184)||(14833462-14833674)
chr4 (524-957)||(1674476-1674920)
chr4 (880-1001)||(16853482-16853602)
chr4 (880-1129)||(19911762-19912013)
chr4 (1092-1185)||(3499491-3499582)
chr4 (863-984)||(9751569-9751690)
chr4 (863-1146)||(22190807-22191082)
chr4 (693-959)||(6641475-6641742)
chr4 (863-1115)||(14904252-14904506)
chr4 (460-563)||(39532174-39532277)
chr4 (995-1185)||(17700639-17700825)
chr4 (863-962)||(39419784-39419884)
chr4 (880-1184)||(40846078-40846382)
chr4 (268-377)||(18775559-18775674)
chr4 (166-275)||(25067344-25067451)
chr4 (163-268)||(49503396-49503499)
chr4 (287-562)||(19889443-19889717)
chr4 (419-562)||(16939534-16939681)
chr4 (268-343)||(18775930-18776005)
chr4 (863-984)||(20977418-20977539)
chr4 (403-567)||(18394034-18394198)
chr4 (687-733)||(10249647-10249693)
chr4 (1134-1193)||(18752246-18752307)
chr4 (1134-1193)||(18762856-18762917)
chr4 (687-733)||(18773842-18773888)
chr4 (863-984)||(38513839-38513960)
chr4 (266-562)||(3105879-3106178)
chr4 (403-567)||(7222001-7222165)
chr4 (287-578)||(9751982-9752277)
chr4 (1136-1185)||(10693070-10693119)
chr4 (1136-1185)||(10906836-10906885)
chr4 (266-347)||(13693199-13693280)
chr4 (1136-1185)||(14571243-14571292)
chr4 (403-597)||(17526804-17527000)
chr4 (1136-1185)||(20977648-20977697)
chr4 (399-562)||(41115216-41115381)
chr4 (287-562)||(55731221-55731497)
chr4 (403-562)||(18473522-18473682)
chr4 (1137-1185)||(39419587-39419635)
chr4 (287-347)||(55379683-55379743)
chr4 (690-733)||(13027567-13027610)
chr4 (1039-1146)||(14571161-14571268)
chr4 (448-562)||(17788498-17788613)
chr4 (687-733)||(8685721-8685767)
chr4 (687-733)||(10661446-10661492)
chr4 (687-733)||(10875591-10875637)
chr4 (687-733)||(14154275-14154321)
chr4 (881-1115)||(15475050-15475274)
chr4 (448-562)||(40860205-40860322)
chr4 (1121-1182)||(1672623-1672684)
chr4 (1121-1182)||(1675098-1675159)
chr4 (1152-1193)||(5023191-5023232)
chr4 (403-562)||(13693302-13693459)
chr4 (399-562)||(13890317-13890482)
chr4 (399-562)||(17057573-17057737)
chr4 (163-254)||(17276223-17276312)
chr4 (1136-1193)||(17398519-17398576)
chr4 (1121-1193)||(19244203-19244276)
chr4 (266-562)||(20571458-20571754)
chr4 (1136-1185)||(22191057-22191106)
chr4 (448-553)||(23123055-23123163)
chr4 (1136-1185)||(27188509-27188558)
chr4 (1066-1146)||(3793287-3793367)
chr4 (1135-1183)||(6641915-6641963)
chr4 (1103-1183)||(8997032-8997115)
chr4 (287-347)||(11900564-11900624)
chr4 (687-735)||(13890615-13890663)
chr4 (419-562)||(14154455-14154601)
chr4 (266-353)||(14903084-14903172)
chr4 (693-733)||(15014667-15014707)
chr4 (287-347)||(15015064-15015124)
chr4 (266-348)||(16939352-16939436)
chr4 (266-348)||(19884084-19884168)
chr4 (694-734)||(40860459-40860499)
chr4 (694-734)||(54679720-54679760)
chr4 (523-562)||(6641297-6641336)
chr4 (1133-1184)||(9141093-9141144)
chr4 (288-347)||(12600134-12600193)
chr4 (266-347)||(15135080-15135163)
chr4 (385-462)||(17994267-17994343)
chr4 (274-353)||(18473427-18473506)
chr4 (307-373)||(19052738-19052803)
chr4 (448-562)||(23750060-23750175)
chr4 (274-373)||(24619079-24619181)
chr4 (695-734)||(25651376-25651415)
chr4 (1136-1183)||(55380494-55380541)
chr4 (1136-1174)||(6517704-6517742)
chr4 (304-373)||(7221936-7222007)
chr4 (448-562)||(16853039-16853155)
chr4 (694-732)||(16939808-16939846)
chr4 (693-766)||(17540190-17540263)
chr4 (268-334)||(17994362-17994427)
chr4 (687-733)||(20571279-20571325)
chr4 (289-347)||(23749899-23749957)
chr4 (695-951)||(23750315-23750572)
chr4 (448-562)||(29120900-29121016)
chr4 (257-346)||(41115436-41115526)
chr4 (1136-1181)||(3105284-3105329)
chr4 (863-983)||(3499682-3499802)
chr4 (287-347)||(14190088-14190149)
chr4 (1136-1185)||(14904163-14904212)
chr4 (274-347)||(16476056-16476129)
chr4 (287-347)||(16847921-16847982)
chr4 (287-347)||(16852877-16852938)
chr4 (274-347)||(17788718-17788791)
chr4 (1133-1183)||(20648401-20648453)
chr4 (261-348)||(22676198-22676287)
chr4 (880-984)||(27188667-27188771)
chr4 (1134-1183)||(4948777-4948828)
chr4 (266-348)||(6516839-6516923)
chr4 (403-553)||(9266769-9266919)
chr4 (694-730)||(11900982-11901018)
chr4 (693-733)||(11915492-11915532)
chr4 (693-733)||(12600548-12600588)
chr4 (448-562)||(12811635-12811751)
chr4 (693-733)||(16632231-16632271)
chr4 (694-734)||(16853295-16853335)
chr4 (266-352)||(17527016-17527104)
chr4 (1134-1183)||(19954729-19954780)
chr4 (138-229)||(20579520-20579614)
chr4 (266-345)||(22089637-22089717)
chr4 (694-734)||(22190638-22190678)
chr4 (1134-1183)||(24027852-24027903)
chr4 (694-734)||(29121161-29121201)
chr4 (287-347)||(29681194-29681254)
chr4 (523-600)||(38513490-38513572)
chr4 (1134-1183)||(52704230-52704281)
chr4 (266-348)||(54679279-54679363)
chr4 (694-734)||(55731637-55731677)
chr4 (448-562)||(56034107-56034223)
chr4 (694-734)||(56533340-56533380)
chr4 (523-562)||(3395202-3395241)
chr4 (1135-1183)||(4987732-4987782)
chr4 (523-562)||(6517098-6517137)
chr4 (288-347)||(6641059-6641117)
chr4 (523-562)||(8105250-8105289)
chr4 (288-347)||(8686121-8686180)
chr4 (346-440)||(8997740-8997831)
chr4 (523-562)||(11900803-11900842)
chr4 (266-347)||(14154672-14154755)
chr4 (690-733)||(14357411-14357454)
chr4 (523-562)||(14605364-14605403)
chr4 (290-353)||(16325167-16325230)
chr4 (523-562)||(17399134-17399173)
chr4 (690-733)||(17526668-17526711)
chr4 (523-562)||(17701215-17701254)
chr4 (403-462)||(18773578-18773637)
chr4 (523-562)||(19884314-19884353)
chr4 (1135-1183)||(19944077-19944127)
chr4 (523-562)||(21350659-21350698)
chr4 (523-562)||(29681005-29681044)
chr4 (403-537)||(32491310-32491444)
chr4 (292-373)||(32491438-32491521)
chr4 (523-562)||(36470441-36470480)
chr4 (523-562)||(37986070-37986109)
chr4 (694-733)||(40845885-40845924)
chr4 (690-733)||(41115048-41115091)
chr4 (694-733)||(45833186-45833225)
chr4 (523-562)||(54679540-54679579)
chr4 (523-562)||(55379922-55379961)
chr4 (448-562)||(10072468-10072584)
chr4 (1136-1185)||(15474994-15475044)
chr4 (687-733)||(16324796-16324842)
chr4 (274-347)||(16631800-16631874)
chr4 (863-928)||(16848508-16848574)
chr4 (687-733)||(17057396-17057442)
chr4 (477-562)||(17539965-17540051)
chr4 (687-729)||(19889278-19889320)
chr4 (448-562)||(22190380-22190497)
chr4 (280-370)||(22223437-22223525)
chr4 (687-733)||(23087470-23087516)
chr4 (687-733)||(24619431-24619477)
chr4 (274-347)||(36470329-36470403)
chr4 (1136-1185)||(38514089-38514139)
chr4 (524-562)||(45832998-45833036)
chr4 (687-732)||(2651596-2651641)
chr4 (1133-1183)||(8182643-8182695)
chr4 (280-367)||(8911037-8911122)
chr4 (1133-1183)||(10696080-10696132)
chr4 (1133-1183)||(10909849-10909901)
chr4 (1136-1193)||(16940196-16940252)
chr4 (1133-1183)||(17198189-17198241)
chr4 (138-227)||(18066032-18066123)
chr4 (1133-1183)||(18077673-18077725)
chr4 (687-736)||(18473811-18473860)
chr4 (274-347)||(18773455-18773528)
chr4 (1134-1182)||(18774448-18774497)
chr4 (693-730)||(36470610-36470647)
chr4 (1133-1183)||(47151846-47151898)
chr4 (1150-1183)||(48371591-48371624)
chr4 (694-734)||(3105698-3105738)
chr4 (693-733)||(3483521-3483561)
chr4 (523-563)||(3500111-3500151)
chr4 (694-734)||(6517277-6517317)
chr4 (288-347)||(8103659-8103719)
chr4 (1149-1185)||(9751391-9751427)
chr4 (287-347)||(11915074-11915134)
chr4 (288-347)||(14605582-14605642)
chr4 (526-562)||(15014845-15014881)
chr4 (1134-1183)||(15560846-15560897)
chr4 (266-348)||(17399350-17399434)
chr4 (1134-1183)||(17918494-17918545)
chr4 (1135-1184)||(24713888-24713939)
chr4 (1136-1184)||(25650987-25651035)
chr4 (1134-1183)||(27814712-27814763)
chr4 (1150-1186)||(29680385-29680421)
chr4 (448-562)||(37436000-37436115)
chr4 (266-348)||(45832738-45832822)
chr4 (1150-1185)||(3486351-3486386)
chr4 (274-353)||(10661838-10661917)
chr4 (274-353)||(10875983-10876062)
chr4 (1135-1183)||(11536302-11536352)
chr4 (319-373)||(13977914-13977968)
chr4 (523-562)||(16324974-16325013)
chr4 (286-353)||(18393952-18394019)
chr4 (450-544)||(18775816-18775911)
chr4 (1135-1183)||(19581700-19581750)
chr4 (266-339)||(19665716-19665791)
chr4 (523-562)||(20977070-20977109)
chr4 (523-562)||(22675982-22676021)
chr4 (523-562)||(25651555-25651594)
chr4 (287-330)||(37986307-37986350)
chr4 (523-562)||(39420195-39420234)
chr4 (1135-1183)||(39525913-39525963)
chr4 (693-728)||(44397642-44397677)
chr4 (523-562)||(56533520-56533559)
chr4 (1136-1166)||(413221-413251)
chr4 (403-460)||(1671908-1671966)
chr4 (1146-1184)||(3395853-3395891)
chr4 (287-348)||(13576791-13576853)
chr4 (523-553)||(15135342-15135372)
chr4 (1152-1182)||(16317791-16317821)
chr4 (287-348)||(17701431-17701493)
chr4 (695-733)||(17788323-17788361)
chr4 (1121-1193)||(18006828-18006902)
chr4 (691-733)||(18394324-18394366)
chr4 (287-344)||(37436212-37436270)
chr4 (1150-1183)||(451036-451069)
chr4 (1150-1183)||(461617-461650)
chr4 (288-353)||(13890209-13890274)
chr4 (1089-1171)||(14153842-14153926)
chr4 (1150-1183)||(14835854-14835887)
chr4 (1150-1183)||(14843420-14843453)
chr4 (280-321)||(15193165-15193206)
chr4 (1136-1169)||(16853702-16853735)
chr4 (1136-1165)||(19884922-19884951)
chr4 (696-733)||(19912160-19912197)
chr4 (1150-1183)||(30926261-30926294)
chr4 (1150-1183)||(30936839-30936872)
chr4 (288-348)||(39420380-39420441)
[»] chr6 (404 HSPs)
chr6 (138-934)||(26043595-26044397)
chr6 (108-934)||(27505293-27506128)
chr6 (138-934)||(9123143-9123943)
chr6 (108-934)||(27372183-27373018)
chr6 (108-934)||(27462533-27463368)
chr6 (138-934)||(9112506-9113306)
chr6 (138-934)||(25985465-25986266)
chr6 (108-934)||(12827048-12827877)
chr6 (108-934)||(28356724-28357554)
chr6 (163-934)||(32301054-32301825)
chr6 (163-934)||(32311743-32312514)
chr6 (138-934)||(12864932-12865732)
chr6 (159-934)||(20029916-20030691)
chr6 (108-934)||(28251577-28252406)
chr6 (138-934)||(3671432-3672231)
chr6 (138-934)||(25787085-25787885)
chr6 (138-934)||(12854406-12855206)
chr6 (159-934)||(7375770-7376546)
chr6 (138-934)||(3660768-3661567)
chr6 (138-934)||(17982512-17983314)
chr6 (138-934)||(17984721-17985523)
chr6 (138-934)||(12716845-12717649)
chr6 (138-934)||(12727494-12728298)
chr6 (163-934)||(26024873-26025644)
chr6 (163-934)||(26035447-26036218)
chr6 (163-934)||(31982637-31983408)
chr6 (166-934)||(34807171-34807941)
chr6 (166-934)||(34817803-34818572)
chr6 (159-934)||(20062667-20063442)
chr6 (163-934)||(4630285-4631058)
chr6 (163-934)||(27341108-27341879)
chr6 (163-934)||(27401848-27402619)
chr6 (163-934)||(27412507-27413278)
chr6 (166-934)||(32961940-32962712)
chr6 (138-934)||(29384136-29384936)
chr6 (163-934)||(16929865-16930635)
chr6 (138-934)||(33198712-33199513)
chr6 (166-934)||(32972559-32973332)
chr6 (169-934)||(7751247-7752015)
chr6 (138-934)||(26864169-26864973)
chr6 (163-934)||(16959036-16959806)
chr6 (138-934)||(26874793-26875597)
chr6 (138-934)||(27383818-27384617)
chr6 (108-934)||(18925774-18926606)
chr6 (107-934)||(16123549-16124377)
chr6 (108-934)||(31571769-31572598)
chr6 (138-934)||(5844464-5845268)
chr6 (201-935)||(17745793-17746530)
chr6 (138-934)||(27166455-27167252)
chr6 (106-934)||(18834646-18835476)
chr6 (225-934)||(18826250-18826959)
chr6 (268-934)||(29765053-29765719)
chr6 (418-934)||(27504013-27504529)
chr6 (164-934)||(22308201-22308974)
chr6 (418-934)||(27474515-27475030)
chr6 (460-934)||(11147261-11147736)
chr6 (107-934)||(17741714-17742548)
chr6 (201-934)||(25518134-25518874)
chr6 (504-934)||(31542909-31543338)
chr6 (107-934)||(25686761-25687595)
chr6 (445-934)||(4292420-4292910)
chr6 (108-621)||(32756756-32757271)
chr6 (108-934)||(11234847-11235683)
chr6 (447-787)||(12353252-12353593)
chr6 (460-934)||(9933683-9934159)
chr6 (584-934)||(8653496-8653844)
chr6 (515-857)||(26022882-26023226)
chr6 (447-934)||(17063895-17064379)
chr6 (138-489)||(27474202-27474556)
chr6 (201-934)||(21127525-21128265)
chr6 (108-429)||(11147708-11148033)
chr6 (138-489)||(27503700-27504054)
chr6 (108-438)||(25583264-25583600)
chr6 (166-442)||(10404043-10404319)
chr6 (166-443)||(12352997-12353277)
chr6 (450-934)||(12953142-12953628)
chr6 (201-934)||(7586268-7587012)
chr6 (460-931)||(25735573-25736044)
chr6 (431-934)||(31931101-31931607)
chr6 (450-934)||(18554968-18555454)
chr6 (829-1185)||(20487777-20488133)
chr6 (159-356)||(1902143-1902340)
chr6 (450-934)||(19289392-19289879)
chr6 (694-1166)||(21618041-21618514)
chr6 (163-402)||(12416901-12417137)
chr6 (431-934)||(11205623-11206130)
chr6 (537-931)||(25679024-25679418)
chr6 (705-934)||(13913006-13913233)
chr6 (901-1162)||(19832915-19833176)
chr6 (266-934)||(20635079-20635758)
chr6 (718-934)||(17042590-17042806)
chr6 (693-1146)||(15954503-15954953)
chr6 (108-356)||(30120483-30120736)
chr6 (863-1146)||(16877180-16877463)
chr6 (163-356)||(27819055-27819246)
chr6 (108-462)||(18554650-18555010)
chr6 (863-1168)||(22076284-22076589)
chr6 (268-934)||(17608417-17609095)
chr6 (693-1185)||(9717640-9718133)
chr6 (107-395)||(22292245-22292538)
chr6 (266-934)||(22386162-22386841)
chr6 (108-299)||(11021312-11021509)
chr6 (108-462)||(31930802-31931163)
chr6 (218-460)||(17047051-17047297)
chr6 (138-334)||(12575773-12575971)
chr6 (693-1146)||(29917814-29918266)
chr6 (138-334)||(18720098-18720297)
chr6 (693-1146)||(32544062-32544517)
chr6 (108-460)||(11205325-11205683)
chr6 (693-1146)||(20730603-20731056)
chr6 (882-1115)||(12348980-12349211)
chr6 (863-1184)||(13435499-13435821)
chr6 (863-1185)||(16336094-16336427)
chr6 (863-1185)||(18435523-18435847)
chr6 (880-1185)||(26972086-26972390)
chr6 (138-429)||(9934131-9934425)
chr6 (863-1146)||(22802108-22802391)
chr6 (863-1183)||(23284531-23284852)
chr6 (202-462)||(12953586-12953849)
chr6 (686-934)||(18498557-18498804)
chr6 (880-1146)||(16265049-16265314)
chr6 (447-931)||(17047254-17047736)
chr6 (108-300)||(17573069-17573267)
chr6 (201-737)||(19452827-19453379)
chr6 (138-304)||(18576114-18576283)
chr6 (880-1071)||(12423246-12423435)
chr6 (863-1184)||(15531484-15531806)
chr6 (138-297)||(5521748-5521909)
chr6 (863-1183)||(13602139-13602460)
chr6 (287-620)||(14070501-14070843)
chr6 (784-931)||(25675196-25675342)
chr6 (201-457)||(17063680-17063935)
chr6 (693-1059)||(15301997-15302363)
chr6 (694-1146)||(20112596-20113051)
chr6 (880-1146)||(33351828-33352090)
chr6 (875-1114)||(14100369-14100608)
chr6 (881-1146)||(19065926-19066181)
chr6 (693-1184)||(21624898-21625386)
chr6 (1085-1185)||(17381603-17381703)
chr6 (859-934)||(6158316-6158391)
chr6 (881-1186)||(24116814-24117119)
chr6 (918-1114)||(19688789-19688984)
chr6 (692-1002)||(14051425-14051731)
chr6 (881-1146)||(12715318-12715583)
chr6 (405-620)||(14051820-14052039)
chr6 (280-373)||(14757752-14757848)
chr6 (692-1002)||(14070106-14070412)
chr6 (975-1183)||(25597558-25597767)
chr6 (844-931)||(25722973-25723059)
chr6 (201-343)||(25678860-25679001)
chr6 (274-353)||(15551392-15551471)
chr6 (403-564)||(18027209-18027370)
chr6 (897-1059)||(18378316-18378477)
chr6 (863-959)||(17381488-17381585)
chr6 (829-1000)||(21235058-21235229)
chr6 (693-1115)||(19623776-19624200)
chr6 (1040-1146)||(139267-139374)
chr6 (1040-1146)||(147288-147395)
chr6 (863-1059)||(15987200-15987397)
chr6 (163-270)||(3390779-3390884)
chr6 (863-1186)||(19086125-19086424)
chr6 (1039-1185)||(22386928-22387076)
chr6 (1121-1185)||(26589833-26589897)
chr6 (255-347)||(3680459-3680552)
chr6 (1136-1185)||(19065902-19065951)
chr6 (1124-1185)||(19482982-19483043)
chr6 (1121-1185)||(20635932-20635997)
chr6 (202-320)||(27720820-27720937)
chr6 (266-352)||(18027387-18027474)
chr6 (286-353)||(21034409-21034476)
chr6 (201-378)||(21119103-21119285)
chr6 (687-733)||(12347880-12347926)
chr6 (448-562)||(12715913-12716030)
chr6 (280-352)||(15478450-15478522)
chr6 (863-959)||(17316610-17316707)
chr6 (1136-1185)||(17608198-17608247)
chr6 (687-736)||(31127623-31127672)
chr6 (1135-1183)||(10640297-10640345)
chr6 (461-577)||(15478259-15478374)
chr6 (861-984)||(19482717-19482840)
chr6 (266-353)||(24719437-24719525)
chr6 (266-353)||(25929835-25929923)
chr6 (1136-1193)||(26044569-26044628)
chr6 (266-348)||(13435242-13435325)
chr6 (138-298)||(19289957-19290121)
chr6 (1031-1146)||(21235248-21235363)
chr6 (897-1036)||(26943578-26943716)
chr6 (1133-1193)||(28251326-28251388)
chr6 (1137-1184)||(34451545-34451592)
chr6 (1136-1182)||(16877438-16877484)
chr6 (287-353)||(17927171-17927237)
chr6 (687-733)||(17927581-17927627)
chr6 (687-733)||(18172345-18172391)
chr6 (266-347)||(20113347-20113429)
chr6 (347-462)||(19289837-19289950)
chr6 (1135-1184)||(26943802-26943851)
chr6 (925-1115)||(34451596-34451787)
chr6 (287-347)||(14101148-14101208)
chr6 (693-733)||(15531936-15531976)
chr6 (403-562)||(15551487-15551646)
chr6 (694-734)||(19066329-19066369)
chr6 (1135-1183)||(19470907-19470955)
chr6 (694-734)||(19833343-19833383)
chr6 (287-347)||(24116206-24116266)
chr6 (880-959)||(26589584-26589664)
chr6 (288-348)||(29917407-29917467)
chr6 (1150-1193)||(7750997-7751040)
chr6 (1092-1176)||(21128406-21128492)
chr6 (687-726)||(25592409-25592448)
chr6 (1066-1161)||(26589763-26589858)
chr6 (1150-1193)||(27384824-27384867)
chr6 (1150-1193)||(27475237-27475280)
chr6 (1150-1193)||(27504736-27504779)
chr6 (268-373)||(30372716-30372823)
chr6 (687-733)||(10704849-10704895)
chr6 (287-353)||(12347471-12347537)
chr6 (288-346)||(15395333-15395391)
chr6 (287-348)||(18377821-18377883)
chr6 (289-347)||(18434919-18434977)
chr6 (1134-1193)||(18555640-18555701)
chr6 (448-562)||(19085700-19085817)
chr6 (287-348)||(19482131-19482193)
chr6 (287-348)||(21234538-21234600)
chr6 (689-735)||(23230980-23231026)
chr6 (687-733)||(24719054-24719100)
chr6 (266-347)||(25591979-25592061)
chr6 (880-958)||(25594053-25594131)
chr6 (1133-1184)||(25800722-25800775)
chr6 (523-561)||(31127801-31127839)
chr6 (1136-1185)||(12423446-12423495)
chr6 (1136-1185)||(16265025-16265074)
chr6 (693-734)||(16335923-16335964)
chr6 (287-347)||(16528689-16528750)
chr6 (288-353)||(18172925-18172990)
chr6 (288-353)||(18226811-18226876)
chr6 (692-733)||(19470463-19470504)
chr6 (266-338)||(19623336-19623409)
chr6 (1136-1181)||(19688974-19689019)
chr6 (450-562)||(21034534-21034647)
chr6 (1133-1183)||(25788072-25788124)
chr6 (266-562)||(32335199-32335494)
chr6 (1136-1185)||(33351804-33351853)
chr6 (1134-1183)||(9112267-9112318)
chr6 (1134-1183)||(9122904-9122955)
chr6 (901-1036)||(10640427-10640562)
chr6 (266-348)||(12422621-12422705)
chr6 (1133-1173)||(12715306-12715346)
chr6 (1134-1183)||(12855394-12855445)
chr6 (1134-1183)||(12865920-12865971)
chr6 (287-347)||(15301594-15301654)
chr6 (399-553)||(17446155-17446310)
chr6 (1134-1193)||(19289146-19289206)
chr6 (693-733)||(19688576-19688616)
chr6 (288-347)||(21624471-21624531)
chr6 (687-766)||(23296516-23296596)
chr6 (693-733)||(25593865-25593905)
chr6 (1121-1183)||(25675535-25675601)
chr6 (1121-1183)||(25679611-25679677)
chr6 (448-562)||(29597615-29597731)
chr6 (1134-1183)||(33199700-33199751)
chr6 (694-734)||(33352237-33352277)
chr6 (523-562)||(7763272-7763311)
chr6 (286-353)||(7811387-7811454)
chr6 (523-562)||(9717460-9717499)
chr6 (1135-1183)||(9933429-9933479)
chr6 (523-562)||(10631721-10631760)
chr6 (523-562)||(10705025-10705064)
chr6 (523-562)||(12422880-12422919)
chr6 (523-562)||(13601786-13601825)
chr6 (523-562)||(15395178-15395217)
chr6 (693-732)||(15987030-15987069)
chr6 (523-562)||(16265643-16265682)
chr6 (523-562)||(17317016-17317055)
chr6 (523-562)||(18435158-18435197)
chr6 (288-562)||(19066510-19066787)
chr6 (288-351)||(19470047-19470110)
chr6 (523-562)||(19482370-19482409)
chr6 (304-347)||(19625206-19625249)
chr6 (523-562)||(19625429-19625468)
chr6 (523-562)||(20731197-20731236)
chr6 (523-562)||(21234776-21234815)
chr6 (523-562)||(21617862-21617901)
chr6 (523-562)||(22076898-22076937)
chr6 (403-461)||(24719301-24719360)
chr6 (403-461)||(24729086-24729145)
chr6 (1102-1175)||(25722722-25722799)
chr6 (1135-1183)||(25986471-25986521)
chr6 (523-562)||(26589217-26589256)
chr6 (523-562)||(26942055-26942094)
chr6 (693-728)||(26943383-26943418)
chr6 (687-761)||(32335621-32335696)
chr6 (523-562)||(32543882-32543921)
chr6 (287-348)||(10631513-10631575)
chr6 (1103-1193)||(12952879-12952972)
chr6 (403-460)||(14051954-14052012)
chr6 (687-733)||(15478099-15478145)
chr6 (687-733)||(15551776-15551822)
chr6 (287-348)||(15954077-15954139)
chr6 (287-348)||(17380956-17381018)
chr6 (687-733)||(17445969-17446014)
chr6 (477-562)||(18172720-18172806)
chr6 (477-562)||(18226995-18227081)
chr6 (1134-1193)||(18498990-18499051)
chr6 (287-344)||(19952282-19952340)
chr6 (687-733)||(23006360-23006406)
chr6 (687-733)||(23781960-23782006)
chr6 (687-733)||(24728858-24728904)
chr6 (288-353)||(24729222-24729288)
chr6 (287-348)||(26588977-26589039)
chr6 (1104-1184)||(31572769-31572853)
chr6 (1136-1185)||(139243-139292)
chr6 (1136-1185)||(147264-147313)
chr6 (1133-1183)||(10971298-10971350)
chr6 (287-347)||(12716132-12716193)
chr6 (287-343)||(14052095-14052152)
chr6 (292-353)||(17303976-17304037)
chr6 (901-934)||(19625814-19625847)
chr6 (1148-1185)||(19832877-19832914)
chr6 (1133-1183)||(20029677-20029729)
chr6 (1133-1183)||(20062428-20062480)
chr6 (1136-1185)||(21235338-21235387)
chr6 (280-348)||(21617618-21617687)
chr6 (288-498)||(23006561-23006769)
chr6 (288-498)||(23781597-23781805)
chr6 (399-562)||(24729014-24729179)
chr6 (461-562)||(25595733-25595833)
chr6 (268-365)||(31720245-31720345)
chr6 (159-222)||(9817970-9818031)
chr6 (448-480)||(10820696-10820728)
chr6 (1121-1193)||(11235870-11235945)
chr6 (1150-1182)||(14100334-14100366)
chr6 (693-733)||(14100750-14100790)
chr6 (305-353)||(14883651-14883699)
chr6 (403-562)||(14923703-14923863)
chr6 (266-353)||(14923879-14923966)
chr6 (1148-1184)||(15302422-15302458)
chr6 (693-733)||(16265462-16265502)
chr6 (693-733)||(16915221-16915261)
chr6 (694-734)||(17381320-17381360)
chr6 (697-733)||(19625609-19625645)
chr6 (1141-1185)||(20730579-20730623)
chr6 (694-734)||(22076718-22076758)
chr6 (693-733)||(22801937-22801977)
chr6 (693-733)||(24116625-24116665)
chr6 (280-373)||(24471041-24471137)
chr6 (1135-1176)||(25686497-25686540)
chr6 (1121-1175)||(25735322-25735380)
chr6 (693-733)||(26972538-26972578)
chr6 (1136-1193)||(30401363-30401422)
chr6 (1134-1183)||(31931809-31931860)
chr6 (1134-1183)||(34806932-34806983)
chr6 (1134-1183)||(34817564-34817615)
chr6 (523-562)||(7811631-7811670)
chr6 (694-733)||(12423059-12423098)
chr6 (687-726)||(13144795-13144834)
chr6 (266-347)||(13601523-13601606)
chr6 (1134-1169)||(14051248-14051283)
chr6 (1134-1169)||(14069929-14069964)
chr6 (523-562)||(15301834-15301873)
chr6 (523-562)||(15532118-15532157)
chr6 (1146-1185)||(15954938-15954977)
chr6 (526-561)||(16876525-16876560)
chr6 (1135-1183)||(18925517-18925567)
chr6 (523-562)||(19470285-19470324)
chr6 (523-562)||(19688397-19688436)
chr6 (523-562)||(19952064-19952103)
chr6 (523-562)||(24116447-24116486)
chr6 (687-734)||(24398563-24398610)
chr6 (1135-1183)||(30120020-30120070)
chr6 (287-349)||(32543644-32543707)
chr6 (687-733)||(7811803-7811849)
chr6 (1135-1182)||(8654052-8654101)
chr6 (1150-1184)||(13928577-13928611)
chr6 (694-724)||(16876701-16876731)
chr6 (1149-1183)||(16930823-16930857)
chr6 (303-353)||(19875234-19875284)
chr6 (688-726)||(25930267-25930305)
chr6 (287-353)||(26185164-26185230)
chr6 (287-348)||(33352935-33352997)
chr6 (280-354)||(34659352-34659424)
chr6 (1150-1183)||(9397-9430)
chr6 (1135-1185)||(4293114-4293166)
chr6 (1150-1183)||(7375531-7375564)
chr6 (287-347)||(7763031-7763092)
chr6 (287-347)||(9717222-9717283)
chr6 (1150-1183)||(10402874-10402907)
chr6 (1150-1183)||(11147005-11147038)
chr6 (1134-1192)||(11206331-11206391)
chr6 (287-339)||(12041230-12041283)
chr6 (1133-1183)||(12828064-12828116)
chr6 (688-729)||(15541787-15541828)
chr6 (1150-1183)||(16960012-16960045)
chr6 (687-728)||(18027042-18027083)
chr6 (1135-1193)||(18825986-18826046)
chr6 (1121-1158)||(19482964-19483001)
chr6 (687-732)||(19875625-19875670)
chr6 (696-733)||(19951883-19951920)
chr6 (1145-1174)||(20112583-20112612)
chr6 (696-733)||(20890835-20890872)
chr6 (307-356)||(21689533-21689580)
chr6 (687-736)||(26185503-26185552)
chr6 (1134-1180)||(27373187-27373235)
chr6 (1134-1180)||(27463537-27463585)
chr6 (1134-1180)||(27506297-27506345)
[»] chr5 (390 HSPs)
chr5 (156-934)||(10754614-10755391)
chr5 (108-934)||(30069209-30070046)
chr5 (108-934)||(34772032-34772863)
chr5 (108-934)||(34782977-34783808)
chr5 (159-934)||(43043034-43043811)
chr5 (108-934)||(31418782-31419616)
chr5 (138-934)||(5289915-5290716)
chr5 (138-934)||(22559557-22560357)
chr5 (138-934)||(27602758-27603558)
chr5 (138-934)||(27622107-27622907)
chr5 (108-934)||(31448673-31449507)
chr5 (138-934)||(5300486-5301292)
chr5 (108-934)||(14456919-14457752)
chr5 (138-934)||(40390477-40391277)
chr5 (159-934)||(20797816-20798592)
chr5 (108-934)||(23406567-23407398)
chr5 (108-934)||(1121210-1122043)
chr5 (108-934)||(14446306-14447140)
chr5 (159-934)||(40401139-40401913)
chr5 (107-934)||(1108451-1109285)
chr5 (108-934)||(8521962-8522794)
chr5 (138-934)||(16003231-16004031)
chr5 (138-934)||(6130909-6131711)
chr5 (166-934)||(40513360-40514130)
chr5 (108-934)||(37739874-37740708)
chr5 (138-934)||(9346663-9347462)
chr5 (138-934)||(22146641-22147442)
chr5 (138-934)||(23362230-23363031)
chr5 (138-934)||(9336076-9336875)
chr5 (138-934)||(36084582-36085383)
chr5 (160-934)||(37728616-37729392)
chr5 (138-934)||(22157224-22158025)
chr5 (159-934)||(39352608-39353382)
chr5 (108-934)||(19464092-19464925)
chr5 (138-934)||(15992669-15993469)
chr5 (138-934)||(23306965-23307767)
chr5 (107-934)||(35226209-35227042)
chr5 (108-934)||(19478122-19478955)
chr5 (108-934)||(35215625-35216457)
chr5 (138-934)||(31844079-31844884)
chr5 (105-934)||(23707563-23708395)
chr5 (138-934)||(36228860-36229661)
chr5 (138-934)||(14557355-14558157)
chr5 (138-934)||(14567992-14568794)
chr5 (163-934)||(17607181-17607950)
chr5 (138-934)||(23296397-23297199)
chr5 (166-934)||(39490321-39491090)
chr5 (166-934)||(39501511-39502280)
chr5 (108-934)||(42395101-42395936)
chr5 (138-934)||(36581897-36582698)
chr5 (138-934)||(33951138-33951941)
chr5 (163-934)||(31348655-31349424)
chr5 (163-934)||(36687816-36688585)
chr5 (163-934)||(36698382-36699151)
chr5 (163-934)||(14040717-14041488)
chr5 (108-934)||(20551936-20552768)
chr5 (163-934)||(27470680-27471451)
chr5 (138-934)||(36592452-36593253)
chr5 (163-934)||(17617795-17618565)
chr5 (163-934)||(31359269-31360038)
chr5 (163-934)||(9376831-9377602)
chr5 (163-934)||(14030164-14030935)
chr5 (163-934)||(15693401-15694171)
chr5 (163-934)||(24567210-24567980)
chr5 (163-934)||(24816255-24817026)
chr5 (163-934)||(24826843-24827614)
chr5 (163-934)||(27460281-27461052)
chr5 (166-934)||(22676236-22677006)
chr5 (166-934)||(22686127-22686897)
chr5 (138-934)||(42042905-42043706)
chr5 (138-934)||(42053480-42054281)
chr5 (138-934)||(30226834-30227637)
chr5 (138-934)||(30237361-30238164)
chr5 (166-934)||(6975928-6976698)
chr5 (166-934)||(6986418-6987188)
chr5 (163-934)||(17719038-17719808)
chr5 (163-934)||(17729690-17730460)
chr5 (163-934)||(15740087-15740859)
chr5 (163-934)||(15769247-15770019)
chr5 (138-934)||(27203913-27204711)
chr5 (163-934)||(24808033-24808803)
chr5 (163-934)||(27041581-27042352)
chr5 (163-929)||(27052205-27052971)
chr5 (107-934)||(21702432-21703268)
chr5 (159-934)||(24925501-24926279)
chr5 (159-934)||(24982782-24983560)
chr5 (115-895)||(31833641-31834429)
chr5 (108-934)||(21705272-21706115)
chr5 (159-851)||(39364685-39365375)
chr5 (201-934)||(34062741-34063475)
chr5 (108-934)||(34052080-34052912)
chr5 (108-934)||(17446005-17446835)
chr5 (108-934)||(20562461-20563277)
chr5 (108-934)||(17456621-17457451)
chr5 (138-850)||(23696988-23697706)
chr5 (156-934)||(37406769-37407546)
chr5 (108-934)||(20624885-20625718)
chr5 (156-753)||(43621254-43621853)
chr5 (138-934)||(106239-107041)
chr5 (108-934)||(20417022-20417854)
chr5 (431-934)||(7031762-7032268)
chr5 (138-934)||(32753285-32754085)
chr5 (156-556)||(23392900-23393300)
chr5 (138-462)||(7031496-7031823)
chr5 (450-934)||(35543247-35543733)
chr5 (450-934)||(13522737-13523224)
chr5 (268-934)||(20215218-20215897)
chr5 (460-934)||(13533474-13533951)
chr5 (461-931)||(20168188-20168661)
chr5 (218-934)||(40227964-40228694)
chr5 (880-1146)||(14086428-14086695)
chr5 (450-934)||(36095771-36096257)
chr5 (450-934)||(36097228-36097714)
chr5 (880-1185)||(42243662-42243966)
chr5 (863-1161)||(33933230-33933532)
chr5 (694-1162)||(30742775-30743242)
chr5 (108-464)||(21420071-21420431)
chr5 (268-934)||(23477732-23478404)
chr5 (863-1149)||(11993851-11994137)
chr5 (694-1185)||(29138260-29138749)
chr5 (789-934)||(43621855-43621999)
chr5 (863-1146)||(4886985-4887268)
chr5 (693-1146)||(33022460-33022910)
chr5 (108-462)||(13522418-13522779)
chr5 (685-1169)||(32160552-32161036)
chr5 (431-934)||(1914940-1915452)
chr5 (694-1162)||(26758943-26759411)
chr5 (106-459)||(35543694-35544055)
chr5 (721-934)||(23372631-23372848)
chr5 (863-1146)||(15516933-15517215)
chr5 (880-1114)||(31117858-31118092)
chr5 (694-1146)||(3245333-3245784)
chr5 (792-934)||(21414197-21414338)
chr5 (679-1012)||(11208011-11208342)
chr5 (108-380)||(13533176-13533456)
chr5 (266-937)||(25111977-25112661)
chr5 (266-937)||(25171068-25171752)
chr5 (138-462)||(36096215-36096546)
chr5 (138-462)||(36097672-36098003)
chr5 (110-462)||(20168630-20168989)
chr5 (694-1146)||(28464240-28464681)
chr5 (863-1184)||(17814931-17815251)
chr5 (431-933)||(40032869-40033381)
chr5 (865-1146)||(41566323-41566606)
chr5 (693-1115)||(89342-89766)
chr5 (201-460)||(40033321-40033586)
chr5 (541-931)||(13404753-13405148)
chr5 (693-1114)||(20550687-20551111)
chr5 (693-1184)||(7745532-7746037)
chr5 (694-1115)||(10848567-10848979)
chr5 (880-1116)||(9088950-9089175)
chr5 (863-1185)||(35986093-35986406)
chr5 (1008-1146)||(5429991-5430130)
chr5 (863-1146)||(23412865-23413148)
chr5 (694-1075)||(26765292-26765672)
chr5 (882-1115)||(21910539-21910773)
chr5 (268-460)||(23487908-23488104)
chr5 (201-460)||(1914734-1915000)
chr5 (266-606)||(32160102-32160454)
chr5 (880-1116)||(25930086-25930312)
chr5 (694-1018)||(13545531-13545855)
chr5 (863-1185)||(19536153-19536475)
chr5 (693-1146)||(26784146-26784602)
chr5 (897-1146)||(6512322-6512567)
chr5 (287-606)||(11208441-11208771)
chr5 (694-1031)||(28139401-28139738)
chr5 (881-1185)||(21660194-21660489)
chr5 (869-934)||(23392837-23392901)
chr5 (863-1011)||(30115863-30116011)
chr5 (163-269)||(24646542-24646646)
chr5 (859-934)||(39362434-39362510)
chr5 (881-1036)||(35932016-35932161)
chr5 (882-1036)||(21072241-21072394)
chr5 (693-994)||(21199046-21199346)
chr5 (1121-1185)||(23391481-23391545)
chr5 (448-562)||(20550432-20550547)
chr5 (266-562)||(33932622-33932921)
chr5 (1135-1183)||(642561-642609)
chr5 (403-562)||(34637068-34637226)
chr5 (692-937)||(25096925-25097172)
chr5 (692-937)||(25154895-25155142)
chr5 (266-352)||(26056184-26056271)
chr5 (1121-1180)||(28139793-28139852)
chr5 (1134-1193)||(10754365-10754426)
chr5 (266-562)||(10848126-10848426)
chr5 (347-462)||(13403702-13403817)
chr5 (1133-1183)||(23412843-23412893)
chr5 (687-736)||(22586298-22586347)
chr5 (1135-1184)||(25096661-25096710)
chr5 (1135-1184)||(25154631-25154680)
chr5 (1137-1185)||(5430106-5430154)
chr5 (280-348)||(21659581-21659649)
chr5 (687-868)||(23488303-23488483)
chr5 (1137-1185)||(35931881-35931929)
chr5 (687-735)||(39799178-39799226)
chr5 (694-959)||(6499033-6499299)
chr5 (403-545)||(12078357-12078502)
chr5 (1092-1183)||(21099558-21099648)
chr5 (687-761)||(26120103-26120178)
chr5 (1133-1175)||(6512308-6512350)
chr5 (266-347)||(7746396-7746478)
chr5 (693-957)||(21099783-21100048)
chr5 (1092-1185)||(23478546-23478640)
chr5 (477-567)||(26056004-26056093)
chr5 (266-339)||(31117232-31117306)
chr5 (287-353)||(31589637-31589703)
chr5 (1136-1185)||(3245309-3245358)
chr5 (287-351)||(6513128-6513193)
chr5 (863-959)||(9398811-9398908)
chr5 (693-734)||(15516762-15516803)
chr5 (1135-1193)||(17447041-17447101)
chr5 (1136-1193)||(30115735-30115792)
chr5 (1136-1185)||(33022885-33022934)
chr5 (287-347)||(13546223-13546283)
chr5 (693-733)||(13736437-13736477)
chr5 (693-733)||(23413279-23413319)
chr5 (694-734)||(25930458-25930498)
chr5 (1066-1146)||(30115767-30115847)
chr5 (694-734)||(31145938-31145978)
chr5 (448-562)||(643184-643299)
chr5 (288-347)||(9399318-9399377)
chr5 (694-959)||(12352872-12353138)
chr5 (399-563)||(20567296-20567461)
chr5 (420-562)||(22586466-22586609)
chr5 (863-984)||(23391656-23391778)
chr5 (694-733)||(25740917-25740956)
chr5 (266-562)||(28464821-28465120)
chr5 (687-734)||(31589302-31589349)
chr5 (418-562)||(16607020-16607166)
chr5 (693-731)||(19536604-19536642)
chr5 (266-347)||(25097528-25097610)
chr5 (266-347)||(25155498-25155580)
chr5 (287-353)||(26120517-26120583)
chr5 (266-562)||(35932490-35932790)
chr5 (1137-1186)||(89303-89352)
chr5 (906-959)||(642784-642837)
chr5 (1143-1184)||(4887250-4887291)
chr5 (287-347)||(11993265-11993326)
chr5 (1135-1193)||(17457657-17457717)
chr5 (447-563)||(23488061-23488178)
chr5 (687-736)||(24019403-24019452)
chr5 (1133-1183)||(34771793-34771845)
chr5 (1133-1183)||(34782738-34782790)
chr5 (1104-1193)||(35542967-35543059)
chr5 (1134-1184)||(39362194-39362246)
chr5 (1136-1185)||(41566299-41566348)
chr5 (1133-1183)||(42394862-42394914)
chr5 (287-347)||(90125-90185)
chr5 (693-733)||(643006-643046)
chr5 (266-348)||(3246140-3246224)
chr5 (1134-1183)||(7032456-7032507)
chr5 (694-734)||(11993682-11993722)
chr5 (1135-1183)||(20551114-20551162)
chr5 (693-733)||(22000361-22000401)
chr5 (693-733)||(23880860-23880900)
chr5 (290-349)||(26764883-26764943)
chr5 (1136-1184)||(26784577-26784625)
chr5 (266-348)||(28138958-28139042)
chr5 (266-348)||(30742336-30742420)
chr5 (1137-1185)||(33933523-33933571)
chr5 (698-734)||(35932309-35932345)
chr5 (1134-1183)||(39352369-39352420)
chr5 (288-347)||(643402-643461)
chr5 (687-722)||(2156591-2156626)
chr5 (523-562)||(2156757-2156796)
chr5 (523-562)||(3245925-3245964)
chr5 (523-562)||(4886637-4886676)
chr5 (523-562)||(6498852-6498891)
chr5 (523-562)||(9088583-9088622)
chr5 (448-562)||(12353279-12353393)
chr5 (523-562)||(13546008-13546047)
chr5 (523-562)||(15516584-15516623)
chr5 (689-736)||(17263030-17263077)
chr5 (266-347)||(17814317-17814400)
chr5 (288-347)||(19536999-19537058)
chr5 (448-562)||(21072720-21072835)
chr5 (523-562)||(21100186-21100225)
chr5 (448-562)||(21199484-21199599)
chr5 (523-562)||(21659826-21659865)
chr5 (523-562)||(23880680-23880719)
chr5 (880-959)||(23881048-23881127)
chr5 (523-562)||(25740725-25740764)
chr5 (523-562)||(28139221-28139260)
chr5 (523-562)||(29138889-29138928)
chr5 (1135-1183)||(30070251-30070301)
chr5 (523-562)||(31117493-31117532)
chr5 (523-562)||(31146118-31146157)
chr5 (1135-1183)||(31418526-31418576)
chr5 (694-733)||(31488042-31488081)
chr5 (523-562)||(34638070-34638109)
chr5 (523-562)||(35986716-35986755)
chr5 (1149-1183)||(5301480-5301514)
chr5 (403-562)||(7746177-7746339)
chr5 (1134-1193)||(13523426-13523487)
chr5 (1134-1193)||(13534153-13534214)
chr5 (524-562)||(13736618-13736656)
chr5 (687-733)||(20567599-20567645)
chr5 (1103-1183)||(20624631-20624715)
chr5 (1135-1182)||(21519925-21519974)
chr5 (266-347)||(22000729-22000811)
chr5 (448-562)||(23392088-23392205)
chr5 (1133-1184)||(24926466-24926519)
chr5 (266-347)||(26766537-26766619)
chr5 (1149-1183)||(27203691-27203725)
chr5 (448-562)||(30742519-30742635)
chr5 (687-721)||(34638242-34638276)
chr5 (693-734)||(4886815-4886856)
chr5 (1136-1185)||(10848985-10849034)
chr5 (288-348)||(13736773-13736834)
chr5 (1133-1183)||(20797577-20797629)
chr5 (693-733)||(21072541-21072582)
chr5 (274-347)||(23880428-23880501)
chr5 (901-934)||(31815283-31815316)
chr5 (288-348)||(33022040-33022101)
chr5 (1133-1183)||(36084343-36084395)
chr5 (288-353)||(39799536-39799601)
chr5 (1150-1183)||(40390238-40390271)
chr5 (1150-1183)||(40400900-40400933)
chr5 (1133-1183)||(43043998-43044050)
chr5 (266-348)||(4886317-4886401)
chr5 (1134-1183)||(6130670-6130721)
chr5 (266-344)||(6498666-6498746)
chr5 (523-559)||(6512916-6512952)
chr5 (698-734)||(9088767-9088803)
chr5 (280-367)||(9823663-9823749)
chr5 (288-347)||(12353496-12353556)
chr5 (431-498)||(13403755-13403823)
chr5 (694-734)||(14086841-14086881)
chr5 (287-347)||(20968623-20968683)
chr5 (287-347)||(21199702-21199762)
chr5 (693-733)||(21203949-21203989)
chr5 (1150-1182)||(21517592-21517624)
chr5 (1136-1183)||(21703441-21703491)
chr5 (1136-1184)||(21910762-21910810)
chr5 (1134-1183)||(22146402-22146453)
chr5 (1134-1183)||(22156985-22157036)
chr5 (403-462)||(23589238-23589298)
chr5 (687-731)||(23589500-23589544)
chr5 (1092-1180)||(23881260-23881347)
chr5 (280-372)||(24495158-24495248)
chr5 (1135-1184)||(24983766-24983817)
chr5 (321-373)||(26013259-26013310)
chr5 (1134-1183)||(27460042-27460093)
chr5 (1134-1183)||(27470441-27470492)
chr5 (1134-1183)||(27623095-27623146)
chr5 (266-348)||(30116535-30116619)
chr5 (693-733)||(31117670-31117710)
chr5 (1134-1183)||(31815044-31815095)
chr5 (1134-1183)||(31843840-31843891)
chr5 (694-734)||(33933062-33933102)
chr5 (1150-1182)||(34051842-34051874)
chr5 (1150-1182)||(34062503-34062535)
chr5 (266-348)||(35986932-35987016)
chr5 (694-734)||(42243475-42243515)
chr5 (1136-1183)||(9398612-9398659)
chr5 (523-562)||(9399099-9399138)
chr5 (523-562)||(17814580-17814619)
chr5 (1135-1183)||(20562205-20562255)
chr5 (266-344)||(23413679-23413758)
chr5 (523-562)||(26765118-26765157)
chr5 (523-562)||(26783969-26784008)
chr5 (523-562)||(30116320-30116359)
chr5 (1152-1183)||(31448417-31448448)
chr5 (1102-1193)||(32754257-32754351)
chr5 (523-562)||(39799359-39799398)
chr5 (287-348)||(15516347-15516409)
chr5 (1121-1193)||(20167940-20168014)
chr5 (1134-1180)||(21198877-21198923)
chr5 (286-367)||(22747800-22747880)
chr5 (524-562)||(23413457-23413495)
chr5 (287-353)||(23589095-23589161)
chr5 (523-553)||(25097319-25097349)
chr5 (523-553)||(25155289-25155319)
chr5 (1151-1185)||(25930047-25930081)
chr5 (1131-1185)||(31118092-31118146)
chr5 (1135-1182)||(37406521-37406570)
chr5 (1150-1183)||(1109491-1109524)
chr5 (1150-1183)||(1122249-1122282)
chr5 (1150-1183)||(8521723-8521756)
chr5 (1150-1183)||(15993675-15993708)
chr5 (1150-1183)||(16004237-16004270)
chr5 (1150-1183)||(20551697-20551730)
chr5 (1133-1183)||(21706303-21706355)
chr5 (274-347)||(26783716-26783789)
chr5 (693-734)||(30116140-30116180)
chr5 (696-733)||(34637356-34637393)
chr5 (1103-1182)||(36095520-36095601)
chr5 (1103-1182)||(36096977-36097058)
chr5 (1133-1183)||(36228621-36228673)
chr5 (1133-1183)||(43622197-43622249)
[»] chr8 (356 HSPs)
chr8 (107-934)||(6318551-6319388)
chr8 (138-934)||(3220078-3220878)
chr8 (108-934)||(31214425-31215261)
chr8 (159-934)||(36077406-36078182)
chr8 (159-934)||(36087992-36088768)
chr8 (159-934)||(19128220-19128994)
chr8 (107-934)||(20161264-20162101)
chr8 (159-934)||(19138752-19139526)
chr8 (108-934)||(23469495-23470329)
chr8 (159-934)||(19224403-19225179)
chr8 (159-934)||(36292391-36293165)
chr8 (159-934)||(36302994-36303768)
chr8 (159-934)||(32088304-32089077)
chr8 (138-934)||(29076176-29076976)
chr8 (159-934)||(32077731-32078504)
chr8 (138-934)||(26110677-26111478)
chr8 (138-934)||(13688601-13689404)
chr8 (166-934)||(3348661-3349429)
chr8 (166-934)||(3359258-3360026)
chr8 (159-934)||(30314731-30315511)
chr8 (138-934)||(18448816-18449616)
chr8 (138-934)||(251853-252654)
chr8 (138-934)||(849002-849803)
chr8 (159-934)||(19417821-19418597)
chr8 (138-934)||(6150517-6151316)
chr8 (163-934)||(9340619-9341390)
chr8 (163-934)||(9367763-9368534)
chr8 (163-934)||(44480566-44481337)
chr8 (163-934)||(44491182-44491953)
chr8 (166-934)||(9856506-9857278)
chr8 (108-934)||(18157669-18158500)
chr8 (159-934)||(19428396-19429174)
chr8 (138-934)||(210188-210989)
chr8 (138-934)||(241268-242069)
chr8 (138-934)||(723811-724612)
chr8 (138-934)||(6160472-6161271)
chr8 (138-915)||(43247771-43248553)
chr8 (159-934)||(26120378-26121156)
chr8 (138-934)||(29086427-29087227)
chr8 (201-934)||(15791333-15792068)
chr8 (108-934)||(16746412-16747246)
chr8 (201-934)||(15780744-15781479)
chr8 (138-911)||(794623-795401)
chr8 (108-934)||(18153150-18153980)
chr8 (164-934)||(18769172-18769943)
chr8 (108-934)||(40213205-40214032)
chr8 (108-934)||(3842937-3843768)
chr8 (431-934)||(20195697-20196203)
chr8 (108-934)||(22167058-22167893)
chr8 (213-934)||(22135893-22136619)
chr8 (224-934)||(20259652-20260363)
chr8 (224-934)||(21046282-21046993)
chr8 (403-934)||(7018416-7018954)
chr8 (138-463)||(13697185-13697515)
chr8 (880-1185)||(9320546-9320851)
chr8 (107-443)||(20195395-20195739)
chr8 (829-1161)||(1237563-1237894)
chr8 (880-1161)||(24551251-24551531)
chr8 (694-1162)||(15425046-15425515)
chr8 (450-934)||(22211423-22211911)
chr8 (108-383)||(23290312-23290593)
chr8 (863-1146)||(45538348-45538631)
chr8 (694-1162)||(15335981-15336450)
chr8 (694-1162)||(15516350-15516819)
chr8 (523-934)||(23370386-23370794)
chr8 (742-934)||(23457339-23457530)
chr8 (747-934)||(30325287-30325473)
chr8 (694-1185)||(40845258-40845748)
chr8 (901-1146)||(24832965-24833210)
chr8 (880-1185)||(17797399-17797703)
chr8 (107-377)||(23270531-23270806)
chr8 (863-1162)||(36105154-36105453)
chr8 (159-377)||(15998808-15999026)
chr8 (693-1182)||(19943024-19943516)
chr8 (108-374)||(26735573-26735844)
chr8 (694-1182)||(22673568-22674056)
chr8 (789-934)||(1750194-1750339)
chr8 (792-1146)||(23185135-23185489)
chr8 (268-934)||(17519178-17519857)
chr8 (138-478)||(23363573-23363920)
chr8 (266-934)||(40002576-40003260)
chr8 (138-489)||(7018897-7019255)
chr8 (700-1185)||(21932679-21933166)
chr8 (693-1129)||(30421354-30421792)
chr8 (523-934)||(23271239-23271655)
chr8 (863-1186)||(39693494-39693818)
chr8 (777-934)||(6576554-6576712)
chr8 (166-324)||(21547546-21547702)
chr8 (880-1160)||(16207283-16207563)
chr8 (897-1159)||(22663110-22663371)
chr8 (108-460)||(19460407-19460767)
chr8 (108-460)||(19558085-19558445)
chr8 (431-761)||(19460707-19461045)
chr8 (431-761)||(19558385-19558723)
chr8 (898-1184)||(23263483-23263768)
chr8 (107-462)||(22211869-22212230)
chr8 (694-1185)||(43639572-43640055)
chr8 (107-460)||(23271689-23272049)
chr8 (693-1184)||(16188772-16189263)
chr8 (880-1146)||(6407703-6407958)
chr8 (685-1013)||(45567943-45568270)
chr8 (693-1129)||(18121033-18121468)
chr8 (863-1146)||(14989369-14989643)
chr8 (881-1146)||(19156174-19156440)
chr8 (693-1186)||(20382264-20382756)
chr8 (918-1184)||(33082872-33083136)
chr8 (880-1146)||(602627-602894)
chr8 (863-1184)||(29693274-29693596)
chr8 (881-1182)||(24646316-24646617)
chr8 (159-262)||(27392104-27392207)
chr8 (523-934)||(29379191-29379609)
chr8 (693-1146)||(12757670-12758125)
chr8 (266-606)||(45568367-45568719)
chr8 (1028-1185)||(3598216-3598373)
chr8 (883-1184)||(16681175-16681474)
chr8 (523-931)||(8031640-8032062)
chr8 (403-937)||(21540444-21540986)
chr8 (687-934)||(28903244-28903490)
chr8 (270-460)||(29378961-29379157)
chr8 (907-1186)||(17914463-17914742)
chr8 (287-562)||(28902839-28903119)
chr8 (863-1183)||(17525600-17525921)
chr8 (897-1186)||(17267468-17267754)
chr8 (201-462)||(8031340-8031608)
chr8 (880-1146)||(18151574-18151820)
chr8 (968-1186)||(20255436-20255652)
chr8 (270-1184)||(21287756-21288659)
chr8 (138-274)||(34275350-34275489)
chr8 (863-987)||(13430696-13430820)
chr8 (163-274)||(23580576-23580685)
chr8 (880-1082)||(17701722-17701923)
chr8 (1092-1185)||(43774056-43774150)
chr8 (275-352)||(12541041-12541118)
chr8 (243-343)||(15969520-15969618)
chr8 (688-1115)||(18321097-18321526)
chr8 (403-563)||(21298504-21298666)
chr8 (907-1129)||(17441732-17441954)
chr8 (881-1146)||(21301000-21301255)
chr8 (280-373)||(24498761-24498857)
chr8 (880-1018)||(18718978-18719115)
chr8 (268-373)||(17687372-17687479)
chr8 (897-1146)||(18679809-18680057)
chr8 (1133-1186)||(18680029-18680082)
chr8 (901-1018)||(18722683-18722799)
chr8 (901-1018)||(18731028-18731144)
chr8 (790-930)||(19461051-19461190)
chr8 (790-930)||(19558729-19558868)
chr8 (452-562)||(19956838-19956949)
chr8 (1011-1183)||(22745594-22745767)
chr8 (403-562)||(1210243-1210405)
chr8 (266-347)||(15934381-15934463)
chr8 (448-562)||(19942770-19942884)
chr8 (1136-1185)||(1745368-1745417)
chr8 (419-562)||(15934132-15934277)
chr8 (1136-1185)||(18151550-18151599)
chr8 (901-1018)||(18685434-18685550)
chr8 (280-373)||(24634749-24634847)
chr8 (419-562)||(18152148-18152295)
chr8 (266-488)||(21298332-21298560)
chr8 (108-262)||(23800829-23800988)
chr8 (687-734)||(12193697-12193744)
chr8 (687-734)||(12438125-12438172)
chr8 (447-562)||(14990563-14990681)
chr8 (1104-1182)||(15335931-15336007)
chr8 (1104-1182)||(15424996-15425072)
chr8 (1104-1182)||(15516300-15516376)
chr8 (687-733)||(17917141-17917187)
chr8 (449-562)||(18321659-18321773)
chr8 (687-733)||(18557805-18557851)
chr8 (266-347)||(19942585-19942667)
chr8 (448-562)||(29692846-29692963)
chr8 (410-567)||(33052374-33052531)
chr8 (448-562)||(45538938-45539055)
chr8 (1136-1185)||(13430521-13430570)
chr8 (1136-1185)||(14989345-14989394)
chr8 (688-733)||(17267258-17267303)
chr8 (274-347)||(19706874-19706947)
chr8 (266-559)||(26832425-26832722)
chr8 (403-562)||(1744640-1744802)
chr8 (694-734)||(1744947-1744987)
chr8 (694-734)||(6407516-6407556)
chr8 (694-734)||(13430949-13430989)
chr8 (419-562)||(14989952-14990099)
chr8 (694-734)||(14990382-14990422)
chr8 (694-734)||(18151967-18152007)
chr8 (693-733)||(19956660-19956700)
chr8 (693-733)||(20255833-20255873)
chr8 (693-733)||(22461959-22461999)
chr8 (266-348)||(22673149-22673233)
chr8 (693-733)||(23263934-23263974)
chr8 (286-373)||(23433607-23433693)
chr8 (266-353)||(24679101-24679189)
chr8 (693-733)||(33082653-33082693)
chr8 (865-1036)||(43644857-43645028)
chr8 (1121-1169)||(45567770-45567818)
chr8 (1133-1193)||(1750528-1750590)
chr8 (266-344)||(20383060-20383139)
chr8 (1133-1193)||(22135647-22135709)
chr8 (287-353)||(16376048-16376114)
chr8 (448-562)||(17796954-17797070)
chr8 (289-347)||(19153407-19153464)
chr8 (266-351)||(19957053-19957139)
chr8 (1134-1193)||(22166796-22166857)
chr8 (693-937)||(25163859-25164104)
chr8 (287-348)||(43773491-43773553)
chr8 (1141-1182)||(602606-602647)
chr8 (303-373)||(1210399-1210471)
chr8 (403-562)||(17687473-17687631)
chr8 (1133-1183)||(19225366-19225418)
chr8 (693-730)||(19707296-19707333)
chr8 (427-562)||(22462138-22462275)
chr8 (1136-1183)||(6318330-6318380)
chr8 (403-558)||(12541134-12541289)
chr8 (1134-1183)||(15780505-15780556)
chr8 (1134-1183)||(15791094-15791145)
chr8 (693-733)||(16681625-16681665)
chr8 (1134-1183)||(18449804-18449855)
chr8 (693-733)||(18679603-18679643)
chr8 (693-733)||(18685718-18685758)
chr8 (693-733)||(18731312-18731352)
chr8 (1134-1183)||(19129164-19129215)
chr8 (1134-1183)||(19139714-19139765)
chr8 (693-733)||(19156031-19156071)
chr8 (1135-1183)||(19707735-19707783)
chr8 (266-348)||(22662436-22662520)
chr8 (1103-1183)||(23783729-23783812)
chr8 (694-734)||(24551064-24551104)
chr8 (1134-1183)||(26111666-26111717)
chr8 (1134-1183)||(26121344-26121395)
chr8 (1134-1183)||(43248751-43248802)
chr8 (694-734)||(45292625-45292665)
chr8 (523-562)||(12193524-12193563)
chr8 (523-562)||(12437952-12437991)
chr8 (523-562)||(13431121-13431160)
chr8 (523-562)||(17701352-17701391)
chr8 (694-733)||(17701530-17701569)
chr8 (694-733)||(17797211-17797250)
chr8 (523-562)||(17928664-17928703)
chr8 (286-353)||(18557421-18557487)
chr8 (523-562)||(19707119-19707158)
chr8 (897-1036)||(19707500-19707638)
chr8 (523-562)||(20382894-20382933)
chr8 (523-562)||(21932492-21932531)
chr8 (1150-1193)||(23469228-23469271)
chr8 (449-568)||(24634858-24634974)
chr8 (523-562)||(25163682-25163721)
chr8 (274-365)||(27739279-27739374)
chr8 (287-349)||(30422117-30422180)
chr8 (1135-1183)||(31215466-31215516)
chr8 (448-578)||(33560699-33560833)
chr8 (523-562)||(40845888-40845927)
chr8 (523-562)||(43639392-43639431)
chr8 (288-347)||(43644269-43644328)
chr8 (523-562)||(43644507-43644546)
chr8 (523-562)||(43773730-43773769)
chr8 (523-562)||(45292445-45292484)
chr8 (446-562)||(2810340-2810458)
chr8 (1149-1183)||(6576351-6576385)
chr8 (687-733)||(12541421-12541467)
chr8 (285-355)||(13644660-13644728)
chr8 (285-355)||(13745085-13745153)
chr8 (694-732)||(14989773-14989811)
chr8 (303-353)||(17928475-17928525)
chr8 (1150-1184)||(18154205-18154239)
chr8 (460-562)||(19505938-19506040)
chr8 (1131-1169)||(21541186-21541224)
chr8 (694-728)||(22662906-22662940)
chr8 (408-461)||(24678970-24679024)
chr8 (448-562)||(30421934-30422050)
chr8 (918-984)||(33560295-33560360)
chr8 (287-348)||(33560932-33560994)
chr8 (289-349)||(14990196-14990257)
chr8 (1133-1183)||(16436856-16436908)
chr8 (516-553)||(17879237-17879274)
chr8 (448-553)||(18121618-18121725)
chr8 (1136-1177)||(18719203-18719244)
chr8 (274-347)||(18772050-18772123)
chr8 (1133-1183)||(19418784-19418836)
chr8 (1133-1183)||(19429361-19429413)
chr8 (1148-1185)||(22663375-22663412)
chr8 (1136-1185)||(23185111-23185160)
chr8 (292-353)||(23192484-23192545)
chr8 (1150-1183)||(23269688-23269721)
chr8 (274-347)||(25163429-25163502)
chr8 (399-562)||(25850494-25850659)
chr8 (688-733)||(26832821-26832866)
chr8 (901-934)||(26833034-26833067)
chr8 (287-347)||(29692683-29692744)
chr8 (1148-1185)||(36105454-36105491)
chr8 (292-348)||(40846106-40846163)
chr8 (288-348)||(43639155-43639215)
chr8 (287-347)||(45539155-45539215)
chr8 (688-724)||(2810593-2810629)
chr8 (1134-1183)||(3221066-3221117)
chr8 (288-347)||(15336807-15336867)
chr8 (288-347)||(15425872-15425932)
chr8 (288-347)||(15517176-15517236)
chr8 (266-348)||(16206620-16206703)
chr8 (1150-1186)||(17441691-17441727)
chr8 (523-563)||(17442319-17442359)
chr8 (288-347)||(18121827-18121887)
chr8 (399-498)||(18557517-18557617)
chr8 (523-563)||(18679425-18679465)
chr8 (523-563)||(18718614-18718654)
chr8 (419-562)||(22662619-22662766)
chr8 (687-735)||(25850323-25850371)
chr8 (694-734)||(45538760-45538800)
chr8 (699-734)||(9320364-9320399)
chr8 (523-562)||(15336589-15336628)
chr8 (523-562)||(15425654-15425693)
chr8 (523-562)||(15516958-15516997)
chr8 (523-562)||(16206908-16206947)
chr8 (694-733)||(16207095-16207134)
chr8 (523-562)||(17526233-17526272)
chr8 (280-373)||(17879066-17879161)
chr8 (1135-1174)||(18730856-18730895)
chr8 (1135-1183)||(18768916-18768966)
chr8 (523-562)||(18772303-18772342)
chr8 (523-562)||(19155854-19155893)
chr8 (288-347)||(20256232-20256291)
chr8 (1133-1193)||(22211176-22211238)
chr8 (523-562)||(23264126-23264165)
chr8 (1150-1193)||(23380772-23380815)
chr8 (1150-1193)||(23457072-23457115)
chr8 (523-562)||(24498610-24498649)
chr8 (523-558)||(24645942-24645977)
chr8 (288-347)||(25850708-25850767)
chr8 (523-562)||(27739493-27739532)
chr8 (527-562)||(36104811-36104846)
chr8 (523-562)||(39693145-39693184)
chr8 (266-347)||(12758456-12758538)
chr8 (687-729)||(17687759-17687801)
chr8 (403-452)||(17879155-17879205)
chr8 (266-347)||(18679163-18679245)
chr8 (266-347)||(18718352-18718434)
chr8 (695-733)||(18772478-18772516)
chr8 (266-344)||(19506063-19506141)
chr8 (1149-1183)||(19956222-19956256)
chr8 (523-553)||(22707941-22707971)
chr8 (1134-1193)||(23370995-23371056)
chr8 (1151-1185)||(24551536-24551570)
chr8 (287-348)||(39692907-39692969)
chr8 (902-958)||(1745158-1745215)
chr8 (1135-1193)||(3833174-3833234)
chr8 (1133-1183)||(3843952-3844004)
chr8 (285-354)||(5825261-5825328)
chr8 (688-733)||(15598532-15598577)
chr8 (1150-1183)||(16747469-16747502)
chr8 (277-345)||(17796783-17796852)
chr8 (1137-1174)||(18685291-18685328)
chr8 (1150-1183)||(20161025-20161058)
chr8 (1150-1183)||(20196409-20196442)
chr8 (1133-1183)||(20259416-20259468)
chr8 (1133-1183)||(21046046-21046098)
chr8 (405-489)||(28888788-28888873)
chr8 (1150-1183)||(30325089-30325122)
[»] chr7 (454 HSPs)
chr7 (107-934)||(14745750-14746583)
chr7 (138-934)||(5684938-5685738)
chr7 (138-934)||(20989073-20989872)
chr7 (138-934)||(9432683-9433483)
chr7 (138-934)||(21003089-21003889)
chr7 (138-934)||(9443279-9444079)
chr7 (138-934)||(15888410-15889211)
chr7 (166-934)||(3165185-3165953)
chr7 (108-934)||(11004567-11005404)
chr7 (108-934)||(1367014-1367848)
chr7 (159-934)||(1986982-1987760)
chr7 (159-934)||(1997603-1998381)
chr7 (138-934)||(31116592-31117393)
chr7 (108-934)||(42865211-42866047)
chr7 (108-934)||(20490394-20491225)
chr7 (159-934)||(42875895-42876673)
chr7 (159-934)||(37343645-37344419)
chr7 (138-934)||(6867306-6868106)
chr7 (138-934)||(26699735-26700535)
chr7 (138-934)||(48710572-48711372)
chr7 (163-934)||(9084733-9085502)
chr7 (163-934)||(9094447-9095216)
chr7 (108-934)||(8002145-8002981)
chr7 (108-934)||(8012790-8013626)
chr7 (138-934)||(6877938-6878738)
chr7 (138-934)||(26653406-26654206)
chr7 (138-934)||(8627366-8628168)
chr7 (138-934)||(24930684-24931485)
chr7 (138-934)||(467662-468462)
chr7 (138-934)||(40042190-40042991)
chr7 (138-934)||(40052739-40053540)
chr7 (138-934)||(22099157-22099957)
chr7 (108-934)||(21770024-21770855)
chr7 (138-934)||(22088542-22089342)
chr7 (108-934)||(9169573-9170403)
chr7 (138-934)||(17960805-17961607)
chr7 (138-934)||(26294110-26294911)
chr7 (138-934)||(588630-589431)
chr7 (138-931)||(24734170-24734969)
chr7 (138-931)||(24744117-24744916)
chr7 (138-934)||(17950199-17951001)
chr7 (159-934)||(26390177-26390953)
chr7 (159-934)||(26400819-26401595)
chr7 (138-934)||(8616804-8617605)
chr7 (159-934)||(2705693-2706469)
chr7 (138-934)||(4222029-4222829)
chr7 (167-934)||(2716297-2717065)
chr7 (159-934)||(9159174-9159948)
chr7 (166-934)||(30048970-30049738)
chr7 (138-934)||(166314-167101)
chr7 (138-934)||(176906-177693)
chr7 (106-934)||(40054835-40055666)
chr7 (108-934)||(18440584-18441415)
chr7 (386-934)||(454880-455429)
chr7 (108-892)||(38403331-38404124)
chr7 (406-934)||(11095744-11096274)
chr7 (431-934)||(44280209-44280715)
chr7 (108-934)||(26209629-26210460)
chr7 (181-934)||(3476421-3477175)
chr7 (280-934)||(18418677-18419334)
chr7 (431-934)||(540798-541304)
chr7 (138-934)||(13681739-13682540)
chr7 (138-934)||(15215735-15216536)
chr7 (431-934)||(4211724-4212230)
chr7 (141-934)||(29589414-29590212)
chr7 (201-934)||(12734247-12734980)
chr7 (181-821)||(48381651-48382297)
chr7 (108-782)||(8932954-8933631)
chr7 (591-934)||(9170863-9171204)
chr7 (138-459)||(540532-540857)
chr7 (138-462)||(4211460-4211785)
chr7 (108-524)||(17064021-17064442)
chr7 (107-443)||(44279907-44280251)
chr7 (863-1182)||(12174216-12174535)
chr7 (431-792)||(38593935-38594298)
chr7 (107-377)||(19986159-19986436)
chr7 (863-1185)||(35952560-35952883)
chr7 (431-934)||(24882501-24883007)
chr7 (138-443)||(38594256-38594563)
chr7 (268-934)||(8999014-8999694)
chr7 (880-1185)||(4821455-4821758)
chr7 (201-934)||(11087124-11087870)
chr7 (138-390)||(457618-457873)
chr7 (694-1146)||(16111796-16112249)
chr7 (770-934)||(19985894-19986058)
chr7 (897-1114)||(14426545-14426761)
chr7 (108-335)||(23643053-23643286)
chr7 (158-373)||(11015240-11015463)
chr7 (159-375)||(20967112-20967328)
chr7 (694-1146)||(28622268-28622721)
chr7 (107-462)||(24882945-24883307)
chr7 (108-296)||(6169834-6170028)
chr7 (159-395)||(25212471-25212707)
chr7 (159-310)||(1775577-1775728)
chr7 (829-1146)||(48236814-48237130)
chr7 (880-1185)||(9069543-9069849)
chr7 (159-322)||(23303859-23304023)
chr7 (694-1114)||(30945300-30945721)
chr7 (693-1144)||(33691624-33692077)
chr7 (159-303)||(45930881-45931025)
chr7 (880-1184)||(28409020-28409323)
chr7 (270-934)||(13174685-13175362)
chr7 (863-1114)||(30944267-30944518)
chr7 (863-1145)||(44467027-44467312)
chr7 (880-1185)||(8182911-8183214)
chr7 (693-1140)||(23279875-23280324)
chr7 (138-324)||(1251598-1251787)
chr7 (925-1146)||(16542932-16543152)
chr7 (925-1146)||(16622510-16622730)
chr7 (882-1146)||(33605668-33605932)
chr7 (159-315)||(12220268-12220422)
chr7 (693-1162)||(21283270-21283738)
chr7 (897-1184)||(22577896-22578181)
chr7 (694-1183)||(48062704-48063184)
chr7 (694-1129)||(2265448-2265882)
chr7 (880-1186)||(10883044-10883350)
chr7 (138-312)||(22499347-22499524)
chr7 (863-1129)||(9709731-9709997)
chr7 (108-342)||(6044957-6045193)
chr7 (266-959)||(4412060-4412771)
chr7 (829-1185)||(15467846-15468202)
chr7 (881-1186)||(13880086-13880391)
chr7 (880-1183)||(16316433-16316734)
chr7 (863-1146)||(21695364-21695649)
chr7 (880-1146)||(27871699-27871956)
chr7 (881-1146)||(2913518-2913784)
chr7 (897-1146)||(15088518-15088768)
chr7 (828-934)||(8933634-8933739)
chr7 (880-1110)||(15704447-15704666)
chr7 (693-1185)||(11319198-11319691)
chr7 (863-1169)||(19710900-19711208)
chr7 (693-1115)||(24787935-24788358)
chr7 (266-606)||(4432991-4433343)
chr7 (863-1184)||(12366623-12366943)
chr7 (881-1143)||(19339174-19339426)
chr7 (138-290)||(24072028-24072183)
chr7 (881-1115)||(21692269-21692504)
chr7 (880-1115)||(32264669-32264895)
chr7 (863-1146)||(331608-331894)
chr7 (828-934)||(38593816-38593921)
chr7 (863-1082)||(13137871-13138090)
chr7 (897-1026)||(14193112-14193240)
chr7 (287-620)||(602139-602481)
chr7 (863-1115)||(13302773-13303027)
chr7 (693-1182)||(11792700-11793191)
chr7 (881-984)||(24794788-24794891)
chr7 (863-1146)||(30025868-30026153)
chr7 (863-1036)||(29935380-29935553)
chr7 (689-956)||(602553-602822)
chr7 (881-1082)||(2500020-2500220)
chr7 (272-365)||(1878923-1879018)
chr7 (897-1036)||(19237065-19237203)
chr7 (138-274)||(20327837-20327976)
chr7 (138-274)||(22392645-22392784)
chr7 (138-274)||(22467785-22467924)
chr7 (897-1110)||(14425445-14425647)
chr7 (863-1056)||(1292993-1293176)
chr7 (872-934)||(6044292-6044354)
chr7 (881-1082)||(13648711-13648911)
chr7 (880-1161)||(48805785-48806056)
chr7 (881-1081)||(13730652-13730851)
chr7 (880-1019)||(5000861-5000999)
chr7 (993-1184)||(13692435-13692625)
chr7 (280-352)||(11572876-11572949)
chr7 (138-260)||(37556005-37556130)
chr7 (1122-1185)||(48805745-48805809)
chr7 (270-373)||(12223090-12223196)
chr7 (696-1036)||(13018527-13018867)
chr7 (1102-1185)||(4428944-4429026)
chr7 (863-1018)||(39284604-39284759)
chr7 (286-353)||(7488620-7488687)
chr7 (1125-1184)||(24794631-24794690)
chr7 (266-347)||(4820839-4820921)
chr7 (266-373)||(16105624-16105733)
chr7 (274-348)||(19711733-19711807)
chr7 (863-1186)||(21381324-21381624)
chr7 (280-352)||(2501662-2501735)
chr7 (274-347)||(13259125-13259198)
chr7 (274-347)||(13266465-13266538)
chr7 (1134-1183)||(13880826-13880875)
chr7 (1136-1185)||(19339147-19339196)
chr7 (874-934)||(48382304-48382365)
chr7 (478-562)||(2501517-2501600)
chr7 (403-552)||(13263274-13263421)
chr7 (880-1004)||(16309961-16310084)
chr7 (280-352)||(25806797-25806869)
chr7 (403-567)||(25806885-25807051)
chr7 (1136-1184)||(30026128-30026176)
chr7 (693-950)||(4494370-4494628)
chr7 (1068-1184)||(14193242-14193359)
chr7 (687-733)||(7488229-7488275)
chr7 (448-562)||(12174844-12174961)
chr7 (448-562)||(13302397-13302514)
chr7 (448-562)||(15088085-15088202)
chr7 (275-352)||(15871754-15871832)
chr7 (687-733)||(16308041-16308087)
chr7 (287-353)||(16308426-16308492)
chr7 (287-353)||(16411383-16411449)
chr7 (1136-1185)||(1293185-1293234)
chr7 (1028-1161)||(4428984-4429117)
chr7 (1136-1185)||(7339772-7339821)
chr7 (897-1183)||(13730566-13730835)
chr7 (1137-1185)||(14425659-14425707)
chr7 (445-562)||(16472227-16472342)
chr7 (1138-1183)||(19236886-19236931)
chr7 (403-567)||(23125439-23125602)
chr7 (399-562)||(25687345-25687509)
chr7 (1136-1185)||(30945261-30945310)
chr7 (266-348)||(1292443-1292527)
chr7 (694-734)||(1292824-1292864)
chr7 (694-734)||(2266647-2266687)
chr7 (1034-1110)||(7339822-7339898)
chr7 (693-733)||(9098559-9098599)
chr7 (693-733)||(9099365-9099405)
chr7 (266-344)||(11318757-11318837)
chr7 (287-347)||(11792284-11792344)
chr7 (694-734)||(12174664-12174704)
chr7 (693-733)||(13260940-13260980)
chr7 (287-347)||(14187063-14187123)
chr7 (694-734)||(14425241-14425281)
chr7 (1137-1185)||(14426752-14426800)
chr7 (940-1032)||(16556664-16556755)
chr7 (940-1032)||(16608907-16608998)
chr7 (455-562)||(19237540-19237648)
chr7 (694-734)||(19339572-19339612)
chr7 (694-734)||(27871511-27871551)
chr7 (694-734)||(32265043-32265083)
chr7 (1136-1184)||(39284452-39284500)
chr7 (863-958)||(41842372-41842468)
chr7 (693-732)||(5001151-5001190)
chr7 (405-562)||(5034880-5035039)
chr7 (288-347)||(13261338-13261397)
chr7 (694-733)||(13472833-13472872)
chr7 (1136-1183)||(27871931-27871978)
chr7 (694-733)||(48237230-48237269)
chr7 (266-347)||(5001549-5001631)
chr7 (687-733)||(10254654-10254700)
chr7 (266-347)||(10883894-10883976)
chr7 (398-562)||(13172858-13173023)
chr7 (266-347)||(13302213-13302295)
chr7 (266-347)||(13645803-13645885)
chr7 (403-562)||(13731178-13731341)
chr7 (1141-1183)||(15088748-15088790)
chr7 (508-562)||(15871583-15871637)
chr7 (448-562)||(16557094-16557211)
chr7 (448-562)||(16608451-16608568)
chr7 (516-562)||(18362071-18362117)
chr7 (448-562)||(28622863-28622980)
chr7 (287-348)||(28623080-28623142)
chr7 (418-558)||(44466570-44466712)
chr7 (448-562)||(48063316-48063433)
chr7 (1102-1185)||(4411828-4411910)
chr7 (1136-1185)||(5826185-5826234)
chr7 (403-487)||(9802671-9802756)
chr7 (1135-1184)||(13260498-13260547)
chr7 (1102-1183)||(13303042-13303122)
chr7 (1133-1183)||(14745511-14745563)
chr7 (287-347)||(24787735-24787796)
chr7 (1136-1185)||(48236790-48236839)
chr7 (1134-1183)||(589636-589687)
chr7 (693-729)||(2499830-2499866)
chr7 (1136-1184)||(2500261-2500309)
chr7 (1138-1187)||(3476164-3476215)
chr7 (448-562)||(4494113-4494229)
chr7 (287-347)||(5034669-5034729)
chr7 (1134-1183)||(6867067-6867118)
chr7 (1134-1183)||(6877699-6877750)
chr7 (266-348)||(8182312-8182396)
chr7 (693-729)||(9069355-9069391)
chr7 (1135-1183)||(9098118-9098166)
chr7 (1134-1183)||(9433671-9433722)
chr7 (1134-1183)||(9444267-9444318)
chr7 (1136-1184)||(13648935-13648983)
chr7 (693-733)||(13683388-13683428)
chr7 (266-348)||(13879522-13879606)
chr7 (693-733)||(15467710-15467750)
chr7 (694-734)||(15704813-15704853)
chr7 (403-462)||(16308289-16308349)
chr7 (693-733)||(16314865-16314905)
chr7 (693-733)||(16316882-16316922)
chr7 (287-347)||(16317278-16317337)
chr7 (266-352)||(16464376-16464461)
chr7 (287-347)||(19237758-19237818)
chr7 (1134-1183)||(20990060-20990111)
chr7 (1134-1183)||(21002850-21002901)
chr7 (694-734)||(21381752-21381792)
chr7 (693-733)||(21692081-21692121)
chr7 (1134-1183)||(23264433-23264484)
chr7 (1134-1183)||(24930445-24930496)
chr7 (693-729)||(28408832-28408868)
chr7 (287-347)||(29936069-29936128)
chr7 (693-733)||(30025698-30025738)
chr7 (693-733)||(33605478-33605518)
chr7 (1134-1183)||(37344607-37344658)
chr7 (523-562)||(2499651-2499690)
chr7 (1137-1184)||(2913495-2913542)
chr7 (1016-1159)||(4411870-4412013)
chr7 (523-562)||(4821098-4821137)
chr7 (523-562)||(8182544-8182583)
chr7 (523-562)||(10883675-10883714)
chr7 (523-562)||(11015575-11015614)
chr7 (523-562)||(11319020-11319059)
chr7 (523-578)||(12222922-12222977)
chr7 (448-562)||(13027406-13027521)
chr7 (693-728)||(13034169-13034204)
chr7 (523-562)||(13034342-13034381)
chr7 (523-562)||(13261118-13261157)
chr7 (901-1036)||(13894020-13894154)
chr7 (523-562)||(14187304-14187343)
chr7 (523-562)||(14425070-14425109)
chr7 (523-562)||(14426161-14426200)
chr7 (694-733)||(14426341-14426380)
chr7 (523-562)||(15467530-15467569)
chr7 (523-562)||(15704993-15705032)
chr7 (687-722)||(16105306-16105341)
chr7 (448-559)||(16112392-16112506)
chr7 (523-562)||(16315043-16315082)
chr7 (1135-1183)||(19193306-19193356)
chr7 (523-562)||(19711517-19711556)
chr7 (288-347)||(21211267-21211326)
chr7 (523-562)||(21381933-21381972)
chr7 (523-562)||(22579719-22579758)
chr7 (286-352)||(23125356-23125423)
chr7 (523-562)||(23280465-23280504)
chr7 (1136-1183)||(24788347-24788394)
chr7 (523-562)||(24795219-24795258)
chr7 (523-562)||(27871331-27871370)
chr7 (523-562)||(29935849-29935888)
chr7 (523-562)||(30945864-30945903)
chr7 (523-562)||(33692206-33692245)
chr7 (288-347)||(41843147-41843206)
chr7 (266-347)||(44466446-44466529)
chr7 (266-350)||(331003-331089)
chr7 (274-347)||(2499424-2499498)
chr7 (687-733)||(2501363-2501409)
chr7 (448-562)||(2914114-2914231)
chr7 (266-347)||(4493927-4494009)
chr7 (1149-1183)||(5685926-5685960)
chr7 (687-729)||(11015743-11015785)
chr7 (687-733)||(13172679-13172725)
chr7 (1134-1193)||(13682725-13682786)
chr7 (287-348)||(15087925-15087987)
chr7 (266-347)||(16310630-16310712)
chr7 (694-732)||(16556915-16556953)
chr7 (694-732)||(16608709-16608747)
chr7 (687-733)||(18056577-18056623)
chr7 (693-731)||(19237363-19237401)
chr7 (287-348)||(19339969-19340031)
chr7 (1103-1193)||(24882238-24882331)
chr7 (287-348)||(30946079-30946141)
chr7 (448-562)||(32265224-32265341)
chr7 (266-339)||(33604259-33604333)
chr7 (287-348)||(35954625-35954687)
chr7 (287-348)||(48237561-48237623)
chr7 (1133-1183)||(1368035-1368087)
chr7 (287-351)||(2914329-2914394)
chr7 (1133-1183)||(9160135-9160187)
chr7 (1133-1183)||(9170590-9170642)
chr7 (1133-1183)||(9171391-9171443)
chr7 (292-365)||(10257765-10257841)
chr7 (287-347)||(13034560-13034621)
chr7 (692-733)||(16310232-16310273)
chr7 (287-347)||(16546057-16546118)
chr7 (287-347)||(16619544-16619605)
chr7 (1133-1183)||(21769785-21769837)
chr7 (696-729)||(29935675-29935708)
chr7 (1134-1183)||(454641-454692)
chr7 (1134-1183)||(467423-467474)
chr7 (1134-1183)||(2705454-2705505)
chr7 (1134-1183)||(2716058-2716109)
chr7 (694-734)||(8182724-8182764)
chr7 (1134-1183)||(8617793-8617844)
chr7 (1134-1183)||(8628356-8628407)
chr7 (433-488)||(9802671-9802727)
chr7 (693-733)||(10883498-10883538)
chr7 (1134-1183)||(11096462-11096513)
chr7 (693-733)||(12367073-12367113)
chr7 (266-348)||(13138617-13138701)
chr7 (693-733)||(14187484-14187524)
chr7 (291-347)||(14425926-14425982)
chr7 (693-733)||(15088342-15088382)
chr7 (1134-1183)||(17949960-17950011)
chr7 (289-348)||(19328732-19328792)
chr7 (288-347)||(21284096-21284156)
chr7 (303-347)||(21691751-21691795)
chr7 (1134-1183)||(22089530-22089581)
chr7 (1134-1183)||(22100145-22100196)
chr7 (693-733)||(22579542-22579582)
chr7 (1134-1183)||(26290193-26290244)
chr7 (1141-1185)||(32264614-32264658)
chr7 (266-348)||(33421104-33421188)
chr7 (694-734)||(35953011-35953051)
chr7 (1133-1182)||(38593578-38593629)
chr7 (693-733)||(39284889-39284929)
chr7 (287-347)||(39285226-39285286)
chr7 (287-562)||(48806384-48806662)
chr7 (523-562)||(1292644-1292683)
chr7 (523-562)||(1878763-1878802)
chr7 (523-562)||(2266020-2266059)
chr7 (1135-1183)||(6044055-6044105)
chr7 (403-577)||(11572686-11572860)
chr7 (523-562)||(13138401-13138440)
chr7 (286-353)||(13173065-13173132)
chr7 (523-558)||(13879785-13879820)
chr7 (1135-1183)||(15888154-15888204)
chr7 (523-562)||(16105470-16105509)
chr7 (1138-1185)||(16542908-16542955)
chr7 (693-736)||(18361894-18361937)
chr7 (523-562)||(19339753-19339792)
chr7 (523-562)||(21691945-21691984)
chr7 (274-348)||(22579903-22579978)
chr7 (274-348)||(23280673-23280748)
chr7 (698-733)||(41842598-41842633)
chr7 (448-550)||(41842941-41843044)
chr7 (1135-1183)||(48382569-48382619)
chr7 (687-733)||(1878570-1878616)
chr7 (287-348)||(2266234-2266296)
chr7 (523-553)||(7488418-7488448)
chr7 (287-348)||(9069134-9069196)
chr7 (287-348)||(9710524-9710586)
chr7 (687-733)||(11572526-11572572)
chr7 (523-553)||(12367250-12367280)
chr7 (524-562)||(13473002-13473040)
chr7 (915-1036)||(13880604-13880725)
chr7 (310-348)||(15467316-15467354)
chr7 (266-347)||(16315262-16315343)
chr7 (523-553)||(16411617-16411647)
chr7 (690-732)||(16411783-16411825)
chr7 (687-733)||(16412523-16412569)
chr7 (287-348)||(16557309-16557371)
chr7 (287-348)||(16608291-16608353)
chr7 (403-468)||(20094640-20094706)
chr7 (1135-1182)||(25201426-25201475)
chr7 (1135-1182)||(30049944-30049993)
chr7 (1133-1180)||(31116356-31116405)
chr7 (1143-1185)||(33691598-33691640)
chr7 (1134-1180)||(167289-167337)
chr7 (1134-1180)||(177881-177929)
chr7 (1151-1184)||(2265423-2265456)
chr7 (1133-1183)||(8933924-8933976)
chr7 (516-553)||(9065113-9065150)
chr7 (1150-1183)||(9261605-9261638)
chr7 (268-321)||(9802571-9802624)
chr7 (274-347)||(12367460-12367533)
chr7 (880-937)||(13260735-13260792)
chr7 (266-337)||(15705218-15705291)
chr7 (523-552)||(16317070-16317099)
chr7 (1150-1183)||(17960566-17960599)
chr7 (1133-1183)||(19985654-19985706)
chr7 (1150-1183)||(20491431-20491464)
chr7 (1133-1183)||(26209393-26209445)
chr7 (1133-1183)||(29590396-29590448)
chr7 (1136-1185)||(30944228-30944277)
chr7 (1150-1183)||(44280921-44280954)
[»] chr1 (366 HSPs)
chr1 (138-934)||(35012289-35013085)
chr1 (108-934)||(51629231-51630065)
chr1 (107-934)||(47618582-47619417)
chr1 (107-934)||(51656492-51657327)
chr1 (138-934)||(19187201-19188001)
chr1 (138-934)||(47607974-47608778)
chr1 (138-934)||(19178322-19179122)
chr1 (138-934)||(4177278-4178078)
chr1 (159-934)||(5973144-5973926)
chr1 (159-934)||(3171008-3171786)
chr1 (159-934)||(3181610-3182388)
chr1 (159-934)||(154333-155109)
chr1 (138-934)||(35648734-35649537)
chr1 (108-934)||(5832550-5833382)
chr1 (108-934)||(5843152-5843984)
chr1 (138-934)||(7689503-7690308)
chr1 (159-934)||(12898027-12898799)
chr1 (138-934)||(12729910-12730710)
chr1 (138-934)||(12740503-12741303)
chr1 (159-934)||(21863050-21863824)
chr1 (138-934)||(33083924-33084725)
chr1 (159-934)||(21877155-21877930)
chr1 (166-934)||(35404435-35405205)
chr1 (138-934)||(10997828-10998628)
chr1 (138-934)||(12614360-12615160)
chr1 (138-934)||(12623825-12624625)
chr1 (138-934)||(38094437-38095240)
chr1 (138-934)||(38105062-38105865)
chr1 (166-934)||(7506696-7507465)
chr1 (166-934)||(7517293-7518062)
chr1 (159-934)||(4250609-4251389)
chr1 (201-934)||(5639754-5640488)
chr1 (138-934)||(36247021-36247822)
chr1 (159-934)||(36236474-36237249)
chr1 (166-934)||(5650311-5651078)
chr1 (107-934)||(20441361-20442193)
chr1 (138-934)||(35638082-35638881)
chr1 (138-934)||(2537898-2538698)
chr1 (159-934)||(39194138-39194916)
chr1 (107-934)||(18381948-18382780)
chr1 (108-934)||(17956571-17957402)
chr1 (314-934)||(148258-148879)
chr1 (108-934)||(39586301-39587132)
chr1 (385-934)||(4166872-4167422)
chr1 (138-934)||(20195737-20196537)
chr1 (447-934)||(23580370-23580857)
chr1 (142-934)||(11195111-11195908)
chr1 (406-934)||(47194896-47195424)
chr1 (138-934)||(674808-675609)
chr1 (198-934)||(14388170-14388910)
chr1 (108-934)||(18311016-18311850)
chr1 (181-934)||(41132659-41133416)
chr1 (431-934)||(9050532-9051036)
chr1 (201-934)||(22610018-22610757)
chr1 (532-934)||(21894963-21895365)
chr1 (108-565)||(7677173-7677637)
chr1 (579-934)||(35401208-35401565)
chr1 (138-583)||(12944571-12945020)
chr1 (138-459)||(23580816-23581140)
chr1 (268-934)||(23926421-23927096)
chr1 (138-934)||(5928935-5929741)
chr1 (431-934)||(46180923-46181429)
chr1 (450-934)||(20883926-20884412)
chr1 (694-1146)||(35039964-35040415)
chr1 (108-356)||(13223382-13223637)
chr1 (523-934)||(20798689-20799102)
chr1 (880-1161)||(2327255-2327536)
chr1 (201-488)||(47194632-47194919)
chr1 (166-396)||(16710229-16710457)
chr1 (159-354)||(9749843-9750038)
chr1 (694-1161)||(25448380-25448849)
chr1 (159-356)||(36099927-36100124)
chr1 (166-377)||(4717527-4717736)
chr1 (694-1183)||(22427151-22427641)
chr1 (693-1166)||(22464619-22465093)
chr1 (159-356)||(24049120-24049315)
chr1 (243-934)||(28379329-28380033)
chr1 (138-357)||(36551159-36551381)
chr1 (694-1185)||(48570024-48570514)
chr1 (268-937)||(17370400-17371083)
chr1 (447-934)||(44200559-44201049)
chr1 (268-934)||(22018690-22019374)
chr1 (201-934)||(19170376-19171115)
chr1 (863-1185)||(21702780-21703101)
chr1 (694-1183)||(46088786-46089266)
chr1 (201-357)||(25218042-25218198)
chr1 (693-1184)||(22599974-22600466)
chr1 (431-931)||(28473756-28474262)
chr1 (693-1146)||(2834485-2834938)
chr1 (108-462)||(46181367-46181730)
chr1 (294-443)||(9050994-9051143)
chr1 (159-303)||(10256336-10256480)
chr1 (269-1185)||(34255320-34256238)
chr1 (115-299)||(5234525-5234715)
chr1 (398-934)||(19037499-19038045)
chr1 (268-934)||(26548299-26548979)
chr1 (693-1146)||(32785767-32786222)
chr1 (450-761)||(20867068-20867383)
chr1 (880-1146)||(44821376-44821641)
chr1 (108-462)||(45071117-45071478)
chr1 (693-1129)||(1900141-1900579)
chr1 (418-934)||(22654989-22655515)
chr1 (880-1184)||(2268515-2268815)
chr1 (880-1114)||(14263312-14263548)
chr1 (693-1184)||(33256145-33256635)
chr1 (693-1184)||(33276317-33276807)
chr1 (403-934)||(22642392-22642933)
chr1 (880-1183)||(35401792-35402094)
chr1 (898-1146)||(39200823-39201070)
chr1 (693-1114)||(2266885-2267306)
chr1 (880-1174)||(10250970-10251253)
chr1 (1-107)||(45683687-45683793)
chr1 (449-931)||(52350731-52351217)
chr1 (693-1185)||(38282363-38282855)
chr1 (693-1129)||(29215592-29216029)
chr1 (880-1172)||(22153841-22154133)
chr1 (433-1161)||(7744906-7745634)
chr1 (138-310)||(19087862-19088037)
chr1 (863-1059)||(36134156-36134351)
chr1 (450-703)||(45070902-45071159)
chr1 (880-1146)||(28492233-28492500)
chr1 (431-930)||(20251301-20251808)
chr1 (829-1183)||(23036322-23036676)
chr1 (863-1116)||(30572163-30572415)
chr1 (729-931)||(45070700-45070900)
chr1 (863-1047)||(16235226-16235410)
chr1 (881-1184)||(20954265-20954568)
chr1 (266-488)||(22642220-22642448)
chr1 (912-1183)||(19717540-19717809)
chr1 (201-460)||(20251096-20251361)
chr1 (138-289)||(11958360-11958514)
chr1 (829-1146)||(10757354-10757671)
chr1 (881-1047)||(1577852-1578017)
chr1 (901-1181)||(21204726-21204998)
chr1 (880-1186)||(12284407-12284729)
chr1 (201-343)||(19037299-19037441)
chr1 (881-1047)||(22201666-22201831)
chr1 (687-931)||(21543820-21544064)
chr1 (308-462)||(28473660-28473818)
chr1 (523-911)||(24028751-24029145)
chr1 (201-343)||(23058886-23059028)
chr1 (882-1183)||(48704190-48704504)
chr1 (864-984)||(37642215-37642335)
chr1 (903-1082)||(7309826-7310003)
chr1 (159-239)||(23160800-23160880)
chr1 (863-1185)||(42284594-42284891)
chr1 (874-934)||(12946818-12946878)
chr1 (403-578)||(31358825-31358999)
chr1 (266-562)||(21215100-21215400)
chr1 (1042-1185)||(19170140-19170287)
chr1 (403-468)||(19965760-19965825)
chr1 (280-352)||(23975486-23975558)
chr1 (166-268)||(34190138-34190238)
chr1 (138-260)||(46687603-46687728)
chr1 (881-984)||(21121057-21121159)
chr1 (269-347)||(21541164-21541243)
chr1 (406-559)||(8698357-8698510)
chr1 (863-956)||(21135180-21135274)
chr1 (1102-1183)||(17024774-17024855)
chr1 (347-462)||(20884370-20884483)
chr1 (687-766)||(20909199-20909279)
chr1 (880-984)||(23024772-23024875)
chr1 (309-462)||(44200443-44200604)
chr1 (897-1036)||(21191806-21191944)
chr1 (445-567)||(2819728-2819849)
chr1 (288-562)||(16233552-16233824)
chr1 (289-347)||(22202376-22202434)
chr1 (399-562)||(17025386-17025551)
chr1 (1136-1185)||(21120879-21120928)
chr1 (1136-1193)||(21984811-21984868)
chr1 (1136-1185)||(23024984-23025033)
chr1 (1141-1185)||(2327216-2327260)
chr1 (287-443)||(7745595-7745752)
chr1 (1105-1185)||(19215792-19215872)
chr1 (1137-1185)||(21134975-21135023)
chr1 (900-984)||(21984600-21984683)
chr1 (448-562)||(10756966-10757081)
chr1 (1039-1161)||(17371167-17371290)
chr1 (405-562)||(26280474-26280633)
chr1 (274-352)||(31358730-31358809)
chr1 (266-562)||(7309175-7309475)
chr1 (687-733)||(18130254-18130300)
chr1 (268-334)||(52351269-52351335)
chr1 (901-1018)||(17024923-17025039)
chr1 (863-959)||(19215578-19215675)
chr1 (274-352)||(22639682-22639762)
chr1 (448-580)||(25448961-25449097)
chr1 (694-734)||(10250783-10250823)
chr1 (287-347)||(12283800-12283860)
chr1 (693-733)||(12624799-12624839)
chr1 (287-347)||(12625195-12625255)
chr1 (694-734)||(21135403-21135443)
chr1 (694-734)||(21205116-21205156)
chr1 (287-562)||(21205296-21205574)
chr1 (433-563)||(21543566-21543698)
chr1 (694-734)||(21984392-21984432)
chr1 (287-347)||(22427980-22428040)
chr1 (266-353)||(22601219-22601306)
chr1 (882-934)||(23064935-23064987)
chr1 (863-954)||(26702151-26702243)
chr1 (403-562)||(26703073-26703233)
chr1 (897-1036)||(12613756-12613893)
chr1 (1136-1183)||(16235105-16235152)
chr1 (448-562)||(18897017-18897131)
chr1 (1136-1183)||(21029019-21029066)
chr1 (1136-1183)||(28492211-28492258)
chr1 (385-462)||(52351174-52351250)
chr1 (452-562)||(2834230-2834343)
chr1 (280-342)||(8698265-8698327)
chr1 (687-733)||(9346563-9346609)
chr1 (1121-1174)||(17371265-17371319)
chr1 (287-562)||(21121488-21121766)
chr1 (405-562)||(22639779-22639934)
chr1 (687-733)||(23054158-23054204)
chr1 (274-347)||(26702771-26702845)
chr1 (287-348)||(44824399-44824461)
chr1 (446-562)||(48703741-48703859)
chr1 (1133-1183)||(4250370-4250422)
chr1 (1128-1169)||(7744883-7744924)
chr1 (1138-1183)||(12613588-12613633)
chr1 (418-562)||(14263854-14264002)
chr1 (693-734)||(21702610-21702651)
chr1 (288-348)||(23037145-23037206)
chr1 (266-348)||(1577223-1577307)
chr1 (693-733)||(2268327-2268367)
chr1 (1134-1183)||(4167610-4167661)
chr1 (1134-1183)||(5639515-5639566)
chr1 (1134-1183)||(5650072-5650123)
chr1 (693-733)||(12284219-12284259)
chr1 (693-733)||(16235540-16235580)
chr1 (461-562)||(18130434-18130537)
chr1 (293-353)||(18614301-18614361)
chr1 (1134-1183)||(19179311-19179362)
chr1 (1134-1183)||(19188171-19188222)
chr1 (1133-1182)||(20441123-20441174)
chr1 (694-734)||(21121307-21121347)
chr1 (1135-1175)||(21191680-21191720)
chr1 (693-733)||(21192109-21192149)
chr1 (261-347)||(21192506-21192594)
chr1 (694-734)||(21214920-21214960)
chr1 (693-733)||(22201980-22202020)
chr1 (287-562)||(23024171-23024449)
chr1 (1136-1193)||(23927268-23927327)
chr1 (159-222)||(24211201-24211262)
chr1 (287-350)||(25449196-25449260)
chr1 (693-733)||(26702373-26702413)
chr1 (863-1018)||(30893058-30893213)
chr1 (1134-1183)||(33084913-33084964)
chr1 (1134-1183)||(35013273-35013324)
chr1 (448-562)||(36133742-36133858)
chr1 (693-733)||(36133985-36134025)
chr1 (523-578)||(37640627-37640683)
chr1 (694-734)||(42284425-42284465)
chr1 (523-562)||(2327859-2327898)
chr1 (403-461)||(9346299-9346358)
chr1 (523-562)||(10250603-10250642)
chr1 (288-347)||(10756803-10756862)
chr1 (280-351)||(12669814-12669883)
chr1 (523-562)||(14293107-14293146)
chr1 (687-734)||(18517404-18517451)
chr1 (523-562)||(18517583-18517622)
chr1 (688-731)||(18614707-18614750)
chr1 (523-562)||(22202157-22202196)
chr1 (523-562)||(22427761-22427800)
chr1 (292-347)||(22465452-22465507)
chr1 (274-348)||(22600826-22600901)
chr1 (523-562)||(23036930-23036969)
chr1 (523-562)||(30892711-30892750)
chr1 (523-562)||(33256773-33256812)
chr1 (523-562)||(33276945-33276984)
chr1 (523-562)||(35039783-35039822)
chr1 (523-562)||(38282181-38282220)
chr1 (523-562)||(44824185-44824224)
chr1 (1133-1193)||(46180676-46180738)
chr1 (523-562)||(48570654-48570693)
chr1 (1149-1183)||(4178266-4178300)
chr1 (287-348)||(10250367-10250429)
chr1 (448-562)||(16235732-16235848)
chr1 (687-733)||(17018370-17018416)
chr1 (1150-1184)||(18381707-18381741)
chr1 (687-733)||(20110193-20110239)
chr1 (1103-1193)||(20799271-20799364)
chr1 (1138-1193)||(20883662-20883719)
chr1 (403-460)||(21543566-21543624)
chr1 (1136-1185)||(21544237-21544287)
chr1 (287-348)||(21983974-21984036)
chr1 (687-733)||(23935333-23935379)
chr1 (461-562)||(27858295-27858397)
chr1 (266-347)||(28492924-28493005)
chr1 (448-562)||(46088528-46088645)
chr1 (1133-1183)||(148019-148071)
chr1 (287-347)||(2328076-2328137)
chr1 (693-730)||(10757219-10757256)
chr1 (694-734)||(14263696-14263737)
chr1 (700-733)||(18896839-18896872)
chr1 (448-561)||(19215153-19215268)
chr1 (701-734)||(21206876-21206909)
chr1 (1134-1180)||(23580134-23580182)
chr1 (1138-1183)||(26701936-26701981)
chr1 (1152-1193)||(30572421-30572462)
chr1 (448-562)||(2268070-2268186)
chr1 (693-733)||(7309615-7309655)
chr1 (1134-1183)||(12614121-12614172)
chr1 (1134-1183)||(12623586-12623637)
chr1 (1134-1183)||(12897788-12897839)
chr1 (901-937)||(18896636-18896672)
chr1 (693-729)||(21028590-21028626)
chr1 (863-959)||(21028760-21028856)
chr1 (1134-1183)||(21864012-21864063)
chr1 (1134-1183)||(21878118-21878169)
chr1 (693-733)||(22153653-22153693)
chr1 (694-734)||(30571994-30572034)
chr1 (693-733)||(30892889-30892929)
chr1 (1149-1185)||(37642477-37642513)
chr1 (1141-1185)||(39200799-39200843)
chr1 (287-562)||(42284019-42284297)
chr1 (694-734)||(44824005-44824045)
chr1 (1103-1193)||(45070435-45070527)
chr1 (523-562)||(1577483-1577522)
chr1 (1153-1184)||(7310060-7310091)
chr1 (1135-1183)||(7689245-7689295)
chr1 (523-562)||(12284042-12284081)
chr1 (523-562)||(12624977-12625016)
chr1 (693-732)||(17025207-17025246)
chr1 (523-562)||(18515612-18515651)
chr1 (523-562)||(19717140-19717179)
chr1 (523-558)||(21028412-21028447)
chr1 (523-562)||(21702431-21702470)
chr1 (693-732)||(23036751-23036790)
chr1 (687-761)||(26280271-26280346)
chr1 (266-345)||(26702970-26703049)
chr1 (523-562)||(28492824-28492863)
chr1 (523-562)||(30571814-30571853)
chr1 (523-562)||(32786363-32786402)
chr1 (274-348)||(36133569-36133644)
chr1 (267-348)||(48570868-48570951)
chr1 (288-347)||(48703642-48703701)
chr1 (1136-1182)||(2267296-2267342)
chr1 (687-733)||(2819561-2819607)
chr1 (1147-1185)||(2834924-2834962)
chr1 (1135-1182)||(9050276-9050325)
chr1 (288-346)||(9346157-9346215)
chr1 (287-353)||(17017969-17018035)
chr1 (421-462)||(20867341-20867383)
chr1 (287-353)||(21684593-21684659)
chr1 (287-348)||(21702193-21702255)
chr1 (523-561)||(23053988-23054026)
chr1 (403-460)||(26280547-26280605)
chr1 (287-373)||(27858155-27858241)
chr1 (1148-1186)||(30893314-30893352)
chr1 (687-733)||(31359111-31359157)
chr1 (287-348)||(38281763-38281825)
chr1 (1150-1183)||(154094-154127)
chr1 (1150-1183)||(5974133-5974166)
chr1 (1150-1183)||(12730916-12730949)
chr1 (1150-1183)||(12741509-12741542)
chr1 (287-347)||(14293265-14293326)
chr1 (316-353)||(18130613-18130650)
chr1 (1150-1183)||(21895571-21895604)
chr1 (1150-1183)||(22609783-22609816)
chr1 (1150-1183)||(26576987-26577020)
chr1 (694-736)||(26703351-26703395)
chr1 (1134-1180)||(30291884-30291932)
chr1 (1133-1183)||(39193899-39193951)
chr1 (1133-1183)||(39587319-39587371)
chr1 (288-348)||(46088368-46088429)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (108-934)||(6926-7756)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (159-934)||(14023-14800)
scaffold0028 (108-934)||(54164-54995)
scaffold0028 (694-1185)||(5424-5915)
scaffold0028 (1134-1183)||(14988-15039)
scaffold0028 (523-562)||(81015-81054)
scaffold0028 (287-347)||(80775-80835)
scaffold0028 (523-561)||(6056-6094)
[»] chr2 (349 HSPs)
chr2 (160-934)||(30488842-30489618)
chr2 (159-934)||(29243657-29244431)
chr2 (159-934)||(29254236-29255010)
chr2 (138-934)||(16768352-16769152)
chr2 (108-934)||(35262965-35263801)
chr2 (108-934)||(35273590-35274426)
chr2 (138-934)||(43082063-43082856)
chr2 (138-934)||(43092672-43093465)
chr2 (138-934)||(7005826-7006627)
chr2 (108-934)||(27220755-27221591)
chr2 (108-934)||(35252356-35253192)
chr2 (159-934)||(11388828-11389602)
chr2 (159-934)||(24338423-24339197)
chr2 (159-934)||(2560921-2561698)
chr2 (159-934)||(24327753-24328527)
chr2 (138-934)||(1099214-1100014)
chr2 (138-934)||(17857456-17858255)
chr2 (138-934)||(34477337-34478137)
chr2 (138-934)||(22914883-22915683)
chr2 (138-934)||(22960351-22961151)
chr2 (138-934)||(4219890-4220692)
chr2 (138-934)||(40250602-40251403)
chr2 (138-934)||(9762789-9763586)
chr2 (138-934)||(11395191-11395993)
chr2 (138-934)||(11405507-11406309)
chr2 (138-934)||(18392656-18393458)
chr2 (138-934)||(40221741-40222542)
chr2 (138-934)||(4209298-4210100)
chr2 (138-934)||(9773325-9774122)
chr2 (138-934)||(32217281-32218083)
chr2 (163-934)||(10277009-10277780)
chr2 (138-934)||(21172486-21173290)
chr2 (108-934)||(24415042-24415873)
chr2 (159-934)||(36251863-36252637)
chr2 (163-934)||(10266432-10267203)
chr2 (138-934)||(9908181-9908984)
chr2 (108-934)||(28721336-28722168)
chr2 (159-934)||(43354457-43355231)
chr2 (201-934)||(34790236-34790970)
chr2 (159-934)||(43344842-43345616)
chr2 (138-934)||(9897593-9898396)
chr2 (108-934)||(18768926-18769755)
chr2 (201-934)||(34804379-34805113)
chr2 (166-934)||(39170114-39170882)
chr2 (167-926)||(28731930-28732689)
chr2 (108-934)||(26866450-26867280)
chr2 (138-873)||(24427667-24428407)
chr2 (108-934)||(26879039-26879869)
chr2 (106-934)||(38586107-38586940)
chr2 (108-934)||(27978402-27979231)
chr2 (108-934)||(28064931-28065760)
chr2 (138-734)||(4099223-4099822)
chr2 (138-934)||(36784824-36785619)
chr2 (139-934)||(967522-968323)
chr2 (108-934)||(24274404-24275235)
chr2 (108-934)||(22763029-22763864)
chr2 (108-934)||(22773734-22774568)
chr2 (506-934)||(21650551-21650979)
chr2 (138-934)||(19355723-19356529)
chr2 (138-484)||(21650975-21651325)
chr2 (107-639)||(1041527-1042063)
chr2 (523-934)||(17969228-17969641)
chr2 (694-1146)||(28711553-28712007)
chr2 (243-934)||(20646626-20647325)
chr2 (431-934)||(19498010-19498517)
chr2 (156-597)||(17970626-17971068)
chr2 (880-1185)||(28701045-28701350)
chr2 (696-1161)||(30557160-30557626)
chr2 (694-1146)||(6392426-6392879)
chr2 (431-934)||(19313036-19313544)
chr2 (431-934)||(19300029-19300537)
chr2 (108-413)||(30794187-30794497)
chr2 (694-1185)||(33074018-33074509)
chr2 (880-1185)||(22802440-22802741)
chr2 (694-1146)||(31800743-31801195)
chr2 (916-1162)||(45087022-45087269)
chr2 (269-1185)||(23392494-23393412)
chr2 (863-1161)||(31327806-31328104)
chr2 (863-1161)||(31334527-31334825)
chr2 (897-1185)||(35743819-35744104)
chr2 (881-1186)||(23234987-23235292)
chr2 (829-1185)||(31800719-31801059)
chr2 (693-1185)||(22317384-22317879)
chr2 (694-1161)||(34321777-34322244)
chr2 (761-934)||(4099819-4099993)
chr2 (108-462)||(19313482-19313843)
chr2 (693-1146)||(6573978-6574435)
chr2 (108-460)||(19302918-19303278)
chr2 (269-934)||(1083368-1084047)
chr2 (198-460)||(19498457-19498725)
chr2 (881-1186)||(30666969-30667274)
chr2 (829-1146)||(20151890-20152198)
chr2 (863-1183)||(22187920-22188241)
chr2 (863-1185)||(22785482-22785794)
chr2 (269-737)||(24801814-24802293)
chr2 (693-1175)||(38781189-38781671)
chr2 (159-302)||(20221058-20221199)
chr2 (863-1183)||(10009569-10009889)
chr2 (694-1146)||(28550784-28551226)
chr2 (863-1146)||(1586898-1587171)
chr2 (694-1146)||(44840226-44840665)
chr2 (688-1186)||(24575821-24576334)
chr2 (269-606)||(24814912-24815260)
chr2 (881-1164)||(25037096-25037379)
chr2 (881-1164)||(25041203-25041486)
chr2 (698-1146)||(13963832-13964282)
chr2 (902-1184)||(20568567-20568849)
chr2 (880-1182)||(21537067-21537369)
chr2 (907-1115)||(25829140-25829349)
chr2 (863-1183)||(24850483-24850805)
chr2 (798-934)||(22779811-22779946)
chr2 (243-462)||(38033296-38033518)
chr2 (902-1184)||(9015188-9015467)
chr2 (880-1146)||(31967909-31968164)
chr2 (863-1114)||(22776186-22776427)
chr2 (863-1114)||(22781564-22781805)
chr2 (863-1146)||(24377062-24377347)
chr2 (863-1115)||(19540377-19540631)
chr2 (693-1186)||(40782268-40782754)
chr2 (138-278)||(5027893-5028036)
chr2 (880-1082)||(18376826-18377027)
chr2 (138-282)||(38207597-38207744)
chr2 (863-1146)||(40332048-40332322)
chr2 (285-462)||(22754871-22755054)
chr2 (873-934)||(28374534-28374595)
chr2 (882-1059)||(30621197-30621373)
chr2 (882-1059)||(30623818-30623994)
chr2 (693-1036)||(23595535-23595875)
chr2 (792-937)||(24814647-24814792)
chr2 (243-378)||(38040538-38040677)
chr2 (447-932)||(22755009-22755497)
chr2 (968-1180)||(22260472-22260683)
chr2 (693-960)||(23184345-23184612)
chr2 (280-352)||(22682798-22682871)
chr2 (869-934)||(24425571-24425635)
chr2 (280-352)||(14794452-14794523)
chr2 (280-352)||(19321021-19321093)
chr2 (286-553)||(24843578-24843847)
chr2 (903-1146)||(3277032-3277265)
chr2 (204-343)||(22615176-22615315)
chr2 (403-562)||(21911311-21911473)
chr2 (692-959)||(39037684-39037952)
chr2 (880-984)||(14581494-14581597)
chr2 (1136-1183)||(39037474-39037521)
chr2 (687-732)||(44880954-44880999)
chr2 (287-347)||(24851329-24851389)
chr2 (901-1036)||(26619067-26619201)
chr2 (461-567)||(15671053-15671157)
chr2 (687-733)||(20567920-20567966)
chr2 (266-347)||(21537852-21537934)
chr2 (687-733)||(21845934-21845980)
chr2 (880-962)||(22455029-22455111)
chr2 (1135-1193)||(28140444-28140502)
chr2 (138-250)||(28226921-28227036)
chr2 (286-355)||(8684995-8685062)
chr2 (1136-1185)||(22776147-22776196)
chr2 (1136-1185)||(22781525-22781574)
chr2 (881-1018)||(24779323-24779459)
chr2 (427-562)||(26619548-26619685)
chr2 (1136-1185)||(28550760-28550809)
chr2 (685-737)||(1089149-1089201)
chr2 (694-734)||(1587300-1587340)
chr2 (693-733)||(9015637-9015677)
chr2 (431-562)||(14794307-14794438)
chr2 (406-489)||(16587512-16587596)
chr2 (693-733)||(19114875-19114915)
chr2 (287-347)||(22257575-22257635)
chr2 (287-553)||(22382859-22383125)
chr2 (693-733)||(22455257-22455297)
chr2 (694-734)||(22785922-22785962)
chr2 (690-761)||(24157629-24157701)
chr2 (693-733)||(24850935-24850975)
chr2 (694-734)||(40331879-40331919)
chr2 (693-733)||(41121987-41122027)
chr2 (687-761)||(22383266-22383341)
chr2 (513-568)||(22525269-22525324)
chr2 (1105-1184)||(23184147-23184225)
chr2 (1105-1184)||(23595404-23595482)
chr2 (690-733)||(24843992-24844035)
chr2 (288-347)||(28141268-28141327)
chr2 (694-733)||(28701482-28701521)
chr2 (865-955)||(41121765-41121856)
chr2 (266-347)||(10010418-10010500)
chr2 (695-733)||(18702533-18702571)
chr2 (687-733)||(22271918-22271964)
chr2 (266-347)||(24376458-24376540)
chr2 (693-731)||(24376895-24376933)
chr2 (448-562)||(24575571-24575688)
chr2 (461-559)||(25918265-25918363)
chr2 (448-562)||(38780931-38781048)
chr2 (688-733)||(10010020-10010065)
chr2 (1135-1180)||(18376741-18376786)
chr2 (688-733)||(18431207-18431252)
chr2 (1092-1183)||(19297423-19297516)
chr2 (385-460)||(19300477-19300551)
chr2 (449-562)||(20152449-20152564)
chr2 (288-353)||(21845537-21845602)
chr2 (399-562)||(22271619-22271784)
chr2 (897-1018)||(28140603-28140723)
chr2 (1136-1184)||(1586875-1586923)
chr2 (1134-1183)||(9897354-9897405)
chr2 (1134-1183)||(9907942-9907993)
chr2 (289-353)||(10899171-10899235)
chr2 (286-354)||(17418219-17418285)
chr2 (1134-1183)||(17857217-17857268)
chr2 (287-347)||(18702114-18702174)
chr2 (1134-1183)||(20070661-20070712)
chr2 (693-733)||(20152268-20152308)
chr2 (1134-1183)||(20236791-20236842)
chr2 (693-733)||(20569019-20569059)
chr2 (693-733)||(21537519-21537559)
chr2 (287-347)||(22271504-22271564)
chr2 (1134-1183)||(24327514-24327565)
chr2 (693-733)||(24779165-24779205)
chr2 (693-733)||(25189189-25189229)
chr2 (907-959)||(25189404-25189456)
chr2 (287-347)||(25828536-25828595)
chr2 (1136-1184)||(25829338-25829386)
chr2 (280-367)||(26655322-26655408)
chr2 (693-733)||(28140871-28140911)
chr2 (523-563)||(31328410-31328450)
chr2 (523-563)||(31335131-31335171)
chr2 (1134-1183)||(40222730-40222781)
chr2 (1134-1183)||(40251591-40251642)
chr2 (266-348)||(44839785-44839869)
chr2 (1135-1183)||(6081589-6081639)
chr2 (1146-1185)||(6392864-6392903)
chr2 (523-562)||(6574576-6574615)
chr2 (523-562)||(10010198-10010237)
chr2 (523-562)||(14581171-14581210)
chr2 (1102-1193)||(17968963-17969057)
chr2 (523-562)||(18431386-18431425)
chr2 (523-562)||(18702354-18702393)
chr2 (448-487)||(21548821-21548860)
chr2 (287-354)||(21822976-21823041)
chr2 (403-461)||(21845679-21845738)
chr2 (523-562)||(21845771-21845810)
chr2 (523-562)||(22188551-22188590)
chr2 (523-562)||(22786103-22786142)
chr2 (523-562)||(22802083-22802122)
chr2 (523-562)||(24376719-24376758)
chr2 (288-347)||(26367074-26367133)
chr2 (523-562)||(28551367-28551406)
chr2 (523-562)||(31801336-31801375)
chr2 (523-562)||(40331722-40331761)
chr2 (523-562)||(44840046-44840085)
chr2 (266-347)||(19539768-19539850)
chr2 (524-562)||(20569197-20569235)
chr2 (448-562)||(22317127-22317243)
chr2 (398-567)||(22682882-22683051)
chr2 (695-729)||(26619372-26619406)
chr2 (1135-1182)||(26867487-26867536)
chr2 (1135-1182)||(26880076-26880125)
chr2 (448-562)||(30557769-30557885)
chr2 (1143-1185)||(31967885-31967927)
chr2 (694-728)||(31968317-31968351)
chr2 (1149-1183)||(36251641-36251675)
chr2 (266-347)||(40781828-40781910)
chr2 (1136-1185)||(6573954-6574003)
chr2 (1133-1183)||(18768687-18768739)
chr2 (288-353)||(21911489-21911554)
chr2 (525-562)||(22257817-22257854)
chr2 (1135-1193)||(24275437-24275497)
chr2 (1133-1183)||(24414803-24414855)
chr2 (288-353)||(24838480-24838545)
chr2 (305-373)||(27766146-27766213)
chr2 (1150-1183)||(43083063-43083096)
chr2 (1150-1183)||(43093672-43093705)
chr2 (1148-1185)||(44840652-44840689)
chr2 (523-563)||(1088980-1089020)
chr2 (1134-1183)||(7005587-7005638)
chr2 (689-733)||(15670888-15670932)
chr2 (287-347)||(18431604-18431664)
chr2 (693-733)||(19540207-19540247)
chr2 (1134-1183)||(21172230-21172281)
chr2 (693-733)||(22257992-22258032)
chr2 (694-734)||(22802253-22802293)
chr2 (1134-1183)||(22914644-22914695)
chr2 (1134-1183)||(22960112-22960163)
chr2 (523-559)||(23234620-23234656)
chr2 (1134-1183)||(24338184-24338235)
chr2 (277-373)||(27939418-27939516)
chr2 (448-562)||(28141049-28141165)
chr2 (1150-1182)||(28374278-28374310)
chr2 (1134-1183)||(29244619-29244670)
chr2 (1134-1183)||(29255198-29255249)
chr2 (1134-1183)||(32218271-32218322)
chr2 (1134-1183)||(34789997-34790048)
chr2 (1134-1183)||(34804140-34804191)
chr2 (523-580)||(38033205-38033264)
chr2 (288-347)||(39038307-39038367)
chr2 (523-558)||(13964431-13964466)
chr2 (287-345)||(13964641-13964700)
chr2 (306-353)||(15671234-15671281)
chr2 (523-562)||(19540030-19540069)
chr2 (900-931)||(20568134-20568165)
chr2 (266-347)||(20569416-20569499)
chr2 (523-562)||(21537699-21537738)
chr2 (523-562)||(22455436-22455475)
chr2 (679-733)||(22683156-22683211)
chr2 (1135-1183)||(22764069-22764119)
chr2 (523-562)||(23184750-23184789)
chr2 (292-347)||(23184968-23185023)
chr2 (523-562)||(23596013-23596052)
chr2 (292-347)||(23596231-23596286)
chr2 (308-347)||(27296835-27296874)
chr2 (1150-1193)||(27978138-27978180)
chr2 (1150-1193)||(28064667-28064709)
chr2 (1146-1185)||(28711529-28711568)
chr2 (1151-1186)||(30621437-30621472)
chr2 (1151-1186)||(30624058-30624093)
chr2 (477-559)||(44880734-44880817)
chr2 (523-562)||(45087430-45087469)
chr2 (287-348)||(6574761-6574823)
chr2 (687-733)||(10898792-10898838)
chr2 (523-553)||(10898980-10899010)
chr2 (1151-1185)||(14581685-14581719)
chr2 (687-733)||(19320676-19320722)
chr2 (1133-1192)||(19356715-19356776)
chr2 (1121-1193)||(20646367-20646441)
chr2 (286-352)||(21770295-21770359)
chr2 (287-348)||(22782279-22782341)
chr2 (287-348)||(22786319-22786381)
chr2 (287-348)||(22801845-22801907)
chr2 (523-553)||(24441173-24441203)
chr2 (274-347)||(24575395-24575469)
chr2 (524-562)||(27939600-27939638)
chr2 (687-733)||(27939766-27939812)
chr2 (287-348)||(28701876-28701938)
chr2 (287-348)||(34322596-34322658)
chr2 (1150-1184)||(38631184-38631218)
chr2 (1135-1193)||(967259-967319)
chr2 (1134-1180)||(1098978-1099026)
chr2 (1134-1180)||(4100181-4100229)
chr2 (1150-1183)||(9762550-9762583)
chr2 (1150-1183)||(9773086-9773119)
chr2 (1134-1180)||(16777251-16777299)
chr2 (1133-1183)||(19497773-19497825)
chr2 (1133-1182)||(19540632-19540680)
chr2 (1136-1185)||(20151866-20151915)
chr2 (863-931)||(22258162-22258231)
chr2 (1138-1175)||(22272367-22272404)
chr2 (288-348)||(22316967-22317028)
chr2 (693-734)||(24440986-24441027)
chr2 (287-339)||(25188772-25188825)
chr2 (1133-1183)||(28721097-28721149)
chr2 (1133-1183)||(28731685-28731737)
chr2 (287-347)||(30557988-30558049)
chr2 (525-562)||(35744426-35744463)
[»] scaffold0047 (8 HSPs)
scaffold0047 (159-934)||(40493-41267)
scaffold0047 (108-934)||(32944-33773)
scaffold0047 (968-1184)||(30296-30508)
scaffold0047 (880-959)||(9888-9967)
scaffold0047 (693-729)||(9701-9737)
scaffold0047 (523-562)||(8253-8292)
scaffold0047 (1150-1183)||(32688-32721)
scaffold0047 (1150-1183)||(40254-40287)
[»] scaffold0133 (3 HSPs)
scaffold0133 (138-934)||(30546-31348)
scaffold0133 (107-934)||(42561-43397)
scaffold0133 (138-270)||(26711-26848)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (138-934)||(6882-7682)
scaffold0027 (1150-1183)||(6643-6676)
[»] scaffold0105 (3 HSPs)
scaffold0105 (138-934)||(7375-8178)
scaffold0105 (138-934)||(36997-37800)
scaffold0105 (789-934)||(47631-47778)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (108-934)||(36775-37607)
scaffold0072 (1150-1184)||(36518-36552)
[»] scaffold0386 (2 HSPs)
scaffold0386 (158-934)||(11798-12572)
scaffold0386 (1134-1183)||(12760-12811)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (107-934)||(2259-3092)
scaffold0391 (1135-1183)||(2021-2071)
[»] scaffold0068 (4 HSPs)
scaffold0068 (107-934)||(10642-11478)
scaffold0068 (108-934)||(7795-8638)
scaffold0068 (1136-1183)||(10419-10469)
scaffold0068 (1133-1183)||(7555-7607)
[»] scaffold0747 (3 HSPs)
scaffold0747 (108-639)||(2073-2610)
scaffold0747 (743-934)||(2824-3014)
scaffold0747 (1133-1183)||(3202-3254)
[»] scaffold0407 (3 HSPs)
scaffold0407 (138-934)||(12156-12958)
scaffold0407 (828-934)||(15987-16092)
scaffold0407 (1135-1183)||(11902-11952)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (108-934)||(4681-5511)
scaffold0042 (1135-1193)||(13110-13170)
scaffold0042 (1133-1193)||(5696-5758)
[»] scaffold0084 (11 HSPs)
scaffold0084 (108-934)||(56822-57656)
scaffold0084 (863-1146)||(32452-32737)
scaffold0084 (887-1169)||(182-464)
scaffold0084 (881-1129)||(49318-49567)
scaffold0084 (266-606)||(790-1142)
scaffold0084 (686-913)||(464-691)
scaffold0084 (266-347)||(31943-32026)
scaffold0084 (274-347)||(48698-48772)
scaffold0084 (693-733)||(32282-32322)
scaffold0084 (693-733)||(49129-49169)
scaffold0084 (1135-1192)||(56558-56617)
[»] scaffold0154 (2 HSPs)
scaffold0154 (181-934)||(34997-35753)
scaffold0154 (1135-1193)||(35956-36016)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (108-934)||(39887-40718)
[»] scaffold0497 (2 HSPs)
scaffold0497 (280-931)||(10331-10984)
scaffold0497 (1135-1193)||(10064-10124)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (106-934)||(15110-15945)
scaffold0410 (1135-1193)||(6959-7019)
[»] scaffold0739 (2 HSPs)
scaffold0739 (280-934)||(1554-2210)
scaffold0739 (1135-1193)||(2413-2473)
[»] scaffold0012 (7 HSPs)
scaffold0012 (156-934)||(127077-127862)
scaffold0012 (523-934)||(140608-141021)
scaffold0012 (108-621)||(15984-16508)
scaffold0012 (694-1185)||(215319-215810)
scaffold0012 (523-931)||(7693-8107)
scaffold0012 (1134-1186)||(128047-128101)
scaffold0012 (1135-1186)||(141224-141277)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (195-934)||(18679-19466)
scaffold0099 (202-924)||(16985-17756)
[»] scaffold0163 (4 HSPs)
scaffold0163 (108-934)||(28854-29691)
scaffold0163 (1103-1193)||(29861-29955)
scaffold0163 (1133-1183)||(36583-36635)
scaffold0163 (266-347)||(25817-25899)
[»] scaffold0017 (8 HSPs)
scaffold0017 (460-934)||(175062-175540)
scaffold0017 (201-931)||(40388-41130)
scaffold0017 (201-931)||(58934-59674)
scaffold0017 (138-413)||(174796-175074)
scaffold0017 (1121-1193)||(40126-40200)
scaffold0017 (108-177)||(41191-41263)
scaffold0017 (1135-1185)||(175744-175796)
scaffold0017 (1135-1185)||(180656-180708)
[»] scaffold0272 (3 HSPs)
scaffold0272 (591-934)||(13648-13989)
scaffold0272 (1135-1182)||(13087-13136)
scaffold0272 (1135-1182)||(13392-13441)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (623-934)||(52143-52457)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (450-934)||(28836-29324)
scaffold0001 (138-462)||(29282-29613)
scaffold0001 (159-311)||(411983-412133)
scaffold0001 (1134-1183)||(408010-408061)
[»] scaffold0007 (7 HSPs)
scaffold0007 (450-934)||(59332-59817)
scaffold0007 (693-1146)||(142894-143340)
scaffold0007 (419-562)||(63881-64027)
scaffold0007 (419-562)||(46207-46353)
scaffold0007 (384-462)||(59775-59852)
scaffold0007 (1134-1193)||(59085-59146)
scaffold0007 (287-347)||(46044-46105)
[»] scaffold0752 (4 HSPs)
scaffold0752 (477-931)||(961-1418)
scaffold0752 (477-931)||(1576-2033)
scaffold0752 (106-462)||(612-976)
scaffold0752 (1103-1193)||(2206-2298)
[»] scaffold0627 (3 HSPs)
scaffold0627 (108-394)||(8650-8941)
scaffold0627 (859-934)||(8103-8178)
scaffold0627 (1133-1182)||(7865-7916)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (166-403)||(23220-23455)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (108-391)||(1-289)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (515-712)||(2601-2800)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (218-934)||(61040-61771)
[»] scaffold0171 (5 HSPs)
scaffold0171 (108-423)||(1-321)
scaffold0171 (863-1146)||(27290-27573)
scaffold0171 (1133-1185)||(27266-27318)
scaffold0171 (266-347)||(28098-28181)
scaffold0171 (693-733)||(27703-27743)
[»] scaffold0544 (3 HSPs)
scaffold0544 (450-853)||(9912-10317)
scaffold0544 (217-462)||(10275-10524)
scaffold0544 (1134-1193)||(9696-9757)
[»] scaffold0002 (8 HSPs)
scaffold0002 (220-934)||(475322-476051)
scaffold0002 (220-934)||(481842-482571)
scaffold0002 (138-373)||(100034-100272)
scaffold0002 (767-934)||(117148-117314)
scaffold0002 (523-934)||(156698-157117)
scaffold0002 (287-373)||(111786-111874)
scaffold0002 (1133-1183)||(347448-347500)
scaffold0002 (1150-1183)||(117537-117570)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (880-1146)||(78227-78492)
scaffold0043 (1138-1185)||(78203-78250)
scaffold0043 (270-347)||(2433-2510)
scaffold0043 (694-734)||(78639-78680)
[»] scaffold0439 (3 HSPs)
scaffold0439 (694-1161)||(6586-7054)
scaffold0439 (880-1185)||(6547-6866)
scaffold0439 (287-347)||(7412-7473)
[»] scaffold0547 (2 HSPs)
scaffold0547 (450-934)||(447-934)
scaffold0547 (138-462)||(152-489)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (138-364)||(1627-1856)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (516-851)||(38120-38458)
scaffold0149 (138-457)||(38487-38813)
[»] scaffold1359 (7 HSPs)
scaffold1359 (897-1114)||(548-764)
scaffold1359 (897-1110)||(1662-1864)
scaffold1359 (1144-1185)||(1602-1643)
scaffold1359 (1137-1185)||(509-557)
scaffold1359 (694-733)||(929-968)
scaffold1359 (523-562)||(1109-1148)
scaffold1359 (291-347)||(1327-1383)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (641-934)||(12865-13158)
[»] scaffold0471 (4 HSPs)
scaffold0471 (863-1162)||(3271-3570)
scaffold0471 (1148-1185)||(3571-3608)
scaffold0471 (694-734)||(3103-3143)
scaffold0471 (527-562)||(2928-2963)
[»] scaffold0267 (3 HSPs)
scaffold0267 (770-934)||(6259-6423)
scaffold0267 (108-278)||(7052-7228)
scaffold0267 (1150-1183)||(6004-6037)
[»] scaffold0090 (4 HSPs)
scaffold0090 (431-934)||(355-862)
scaffold0090 (431-934)||(4735-5242)
scaffold0090 (108-460)||(4436-4795)
scaffold0090 (108-460)||(53-415)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (159-356)||(4169-4364)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (159-372)||(155682-155893)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (780-934)||(1-155)
scaffold0216 (1150-1183)||(378-411)
[»] scaffold0414 (5 HSPs)
scaffold0414 (107-355)||(1271-1524)
scaffold0414 (901-1185)||(6978-7261)
scaffold0414 (694-734)||(7431-7471)
scaffold0414 (523-562)||(7611-7650)
scaffold0414 (1135-1183)||(2709-2759)
[»] scaffold0073 (4 HSPs)
scaffold0073 (587-934)||(58170-58517)
scaffold0073 (138-462)||(57776-58107)
scaffold0073 (450-547)||(58065-58162)
scaffold0073 (1133-1193)||(58702-58764)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (163-356)||(61136-61327)
[»] scaffold0005 (7 HSPs)
scaffold0005 (693-1186)||(212154-212644)
scaffold0005 (431-931)||(60751-61257)
scaffold0005 (201-462)||(60545-60813)
scaffold0005 (968-1184)||(6025-6237)
scaffold0005 (1136-1185)||(246084-246133)
scaffold0005 (1039-1146)||(246108-246215)
scaffold0005 (288-347)||(211736-211796)
[»] scaffold0004 (17 HSPs)
scaffold0004 (694-1185)||(211198-211685)
scaffold0004 (881-1182)||(377383-377684)
scaffold0004 (863-1183)||(220205-220525)
scaffold0004 (286-353)||(87788-87855)
scaffold0004 (902-1035)||(244256-244388)
scaffold0004 (427-562)||(244734-244870)
scaffold0004 (693-733)||(220035-220075)
scaffold0004 (523-562)||(211018-211057)
scaffold0004 (266-347)||(219597-219679)
scaffold0004 (266-347)||(244952-245034)
scaffold0004 (526-562)||(88027-88063)
scaffold0004 (693-733)||(244555-244595)
scaffold0004 (523-562)||(219858-219897)
scaffold0004 (523-562)||(377999-378038)
scaffold0004 (288-347)||(378218-378277)
scaffold0004 (1141-1183)||(244076-244118)
scaffold0004 (288-354)||(382181-382245)
[»] scaffold1331 (2 HSPs)
scaffold1331 (694-1108)||(1598-2012)
scaffold1331 (1136-1185)||(448-497)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (268-1162)||(1521-2424)
scaffold0570 (108-465)||(1-363)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (266-934)||(4474-5156)
[»] scaffold0227 (2 HSPs)
scaffold0227 (880-1175)||(22661-22957)
scaffold0227 (694-730)||(22473-22509)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (108-365)||(4437-4700)
[»] scaffold0176 (3 HSPs)
scaffold0176 (863-1145)||(9122-9403)
scaffold0176 (694-734)||(8953-8993)
scaffold0176 (522-562)||(8773-8813)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (266-934)||(20449-21127)
scaffold0177 (1136-1185)||(20229-20279)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (108-338)||(52370-52606)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (201-608)||(32282-32700)
scaffold0185 (880-934)||(9281-9335)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (269-937)||(1197-1879)
[»] scaffold0003 (7 HSPs)
scaffold0003 (693-1146)||(89916-90369)
scaffold0003 (287-353)||(95-161)
scaffold0003 (1136-1185)||(89892-89941)
scaffold0003 (523-553)||(329-359)
scaffold0003 (690-732)||(495-537)
scaffold0003 (687-733)||(1235-1281)
scaffold0003 (310-348)||(90725-90763)
[»] scaffold0035 (8 HSPs)
scaffold0035 (880-1162)||(99053-99331)
scaffold0035 (897-1183)||(19297-19581)
scaffold0035 (687-733)||(29585-29631)
scaffold0035 (287-347)||(20141-20201)
scaffold0035 (403-562)||(99660-99823)
scaffold0035 (523-562)||(19921-19960)
scaffold0035 (523-562)||(29413-29452)
scaffold0035 (694-734)||(99478-99518)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (269-937)||(1004-1686)
[»] scaffold0056 (8 HSPs)
scaffold0056 (863-1185)||(25496-25809)
scaffold0056 (694-1146)||(34674-35117)
scaffold0056 (880-1185)||(34650-34930)
scaffold0056 (1135-1174)||(36019-36058)
scaffold0056 (699-734)||(25938-25973)
scaffold0056 (687-733)||(36455-36501)
scaffold0056 (266-348)||(35415-35499)
scaffold0056 (523-562)||(35258-35297)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (694-1146)||(60601-61053)
scaffold0015 (1146-1185)||(61038-61077)
[»] scaffold0217 (7 HSPs)
scaffold0217 (863-1162)||(21976-22275)
scaffold0217 (880-1146)||(9545-9809)
scaffold0217 (693-1146)||(18828-19283)
scaffold0217 (694-734)||(22404-22444)
scaffold0217 (523-562)||(18648-18687)
scaffold0217 (523-562)||(22584-22623)
scaffold0217 (287-348)||(18411-18473)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (266-1100)||(37991-38839)
[»] scaffold0251 (3 HSPs)
scaffold0251 (108-331)||(21200-21430)
scaffold0251 (829-1139)||(7639-7948)
scaffold0251 (525-562)||(7443-7480)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (880-1182)||(36599-36901)
scaffold0120 (880-1182)||(42104-42406)
scaffold0120 (266-352)||(37412-37499)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (107-446)||(5331-5674)
[»] scaffold0290 (3 HSPs)
scaffold0290 (881-1186)||(18441-18746)
scaffold0290 (287-348)||(19292-19354)
scaffold0290 (523-560)||(19078-19115)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (880-1186)||(4767-5073)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (138-313)||(10201-10379)
scaffold0261 (1150-1183)||(9220-9253)
scaffold0261 (1136-1183)||(5776-5823)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (201-462)||(1525-1790)
scaffold0443 (431-895)||(1116-1587)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (107-315)||(17714-17929)
[»] scaffold0116 (5 HSPs)
scaffold0116 (863-1182)||(20795-21115)
scaffold0116 (448-562)||(21429-21544)
scaffold0116 (693-733)||(21245-21285)
scaffold0116 (448-562)||(2427-2544)
scaffold0116 (693-734)||(2246-2287)
[»] scaffold0479 (4 HSPs)
scaffold0479 (880-1146)||(9954-10219)
scaffold0479 (1133-1183)||(10191-10241)
scaffold0479 (693-733)||(9766-9806)
scaffold0479 (287-347)||(9343-9404)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (159-302)||(17772-17913)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (558-808)||(16349-16601)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (881-1193)||(12195-12507)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (108-325)||(7054-7274)
[»] scaffold0280 (4 HSPs)
scaffold0280 (687-934)||(17878-18127)
scaffold0280 (694-1038)||(2700-3043)
scaffold0280 (449-562)||(3183-3298)
scaffold0280 (266-348)||(3337-3421)
[»] scaffold0026 (10 HSPs)
scaffold0026 (863-1184)||(59983-60303)
scaffold0026 (693-1110)||(7723-8142)
scaffold0026 (1135-1182)||(151714-151761)
scaffold0026 (693-733)||(59813-59853)
scaffold0026 (1135-1186)||(115759-115810)
scaffold0026 (287-347)||(59459-59519)
scaffold0026 (1148-1184)||(8148-8184)
scaffold0026 (446-562)||(59556-59675)
scaffold0026 (523-562)||(7544-7583)
scaffold0026 (266-347)||(7283-7364)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (403-959)||(3942-4511)
[»] scaffold0249 (4 HSPs)
scaffold0249 (863-1146)||(17636-17909)
scaffold0249 (1136-1185)||(17612-17661)
scaffold0249 (694-734)||(18038-18078)
scaffold0249 (523-578)||(18202-18258)
[»] scaffold2071 (2 HSPs)
scaffold2071 (450-639)||(806-997)
scaffold2071 (304-462)||(955-1117)
[»] scaffold0210 (3 HSPs)
scaffold0210 (693-1115)||(1457-1881)
scaffold0210 (448-562)||(1201-1317)
scaffold0210 (1136-1180)||(1870-1914)
[»] scaffold0771 (6 HSPs)
scaffold0771 (907-1174)||(487-754)
scaffold0771 (266-429)||(5760-5927)
scaffold0771 (693-733)||(272-312)
scaffold0771 (462-606)||(5901-6051)
scaffold0771 (680-721)||(6124-6165)
scaffold0771 (523-562)||(95-134)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (687-956)||(7076-7346)
scaffold0269 (280-378)||(16338-16442)
[»] scaffold0161 (8 HSPs)
scaffold0161 (880-1118)||(9994-10234)
scaffold0161 (880-959)||(14819-14898)
scaffold0161 (693-728)||(10386-10421)
scaffold0161 (448-562)||(10561-10676)
scaffold0161 (693-728)||(15050-15085)
scaffold0161 (448-562)||(15225-15340)
scaffold0161 (266-335)||(10791-10861)
scaffold0161 (266-335)||(15455-15525)
[»] scaffold0011 (16 HSPs)
scaffold0011 (973-1146)||(65290-65462)
scaffold0011 (973-1146)||(144335-144507)
scaffold0011 (860-1109)||(164843-165093)
scaffold0011 (266-500)||(165146-165386)
scaffold0011 (687-732)||(59349-59394)
scaffold0011 (694-734)||(65678-65718)
scaffold0011 (694-734)||(144723-144763)
scaffold0011 (1121-1169)||(164768-164816)
scaffold0011 (448-562)||(65859-65976)
scaffold0011 (448-562)||(144904-145021)
scaffold0011 (1136-1174)||(65277-65315)
scaffold0011 (406-553)||(59060-59208)
scaffold0011 (275-351)||(251037-251114)
scaffold0011 (287-353)||(58944-59010)
scaffold0011 (287-348)||(66074-66136)
scaffold0011 (526-567)||(251224-251265)
[»] scaffold0337 (3 HSPs)
scaffold0337 (863-1082)||(14615-14834)
scaffold0337 (693-733)||(14445-14485)
scaffold0337 (1123-1186)||(14889-14952)
[»] scaffold0045 (3 HSPs)
scaffold0045 (882-1185)||(87433-87724)
scaffold0045 (448-562)||(88054-88171)
scaffold0045 (694-734)||(87873-87913)
[»] scaffold0083 (4 HSPs)
scaffold0083 (897-1183)||(25798-26084)
scaffold0083 (968-1059)||(44652-44743)
scaffold0083 (1134-1193)||(53439-53500)
scaffold0083 (693-733)||(26249-26289)
[»] scaffold0065 (3 HSPs)
scaffold0065 (863-1082)||(1657-1876)
scaffold0065 (693-733)||(1487-1527)
scaffold0065 (1123-1186)||(1931-1994)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (863-1185)||(7348-7661)
[»] scaffold0359 (4 HSPs)
scaffold0359 (881-1184)||(5514-5815)
scaffold0359 (693-733)||(5964-6004)
scaffold0359 (448-562)||(6144-6261)
scaffold0359 (274-348)||(6359-6434)
[»] scaffold0527 (4 HSPs)
scaffold0527 (926-1116)||(7963-8151)
scaffold0527 (1028-1116)||(1-88)
scaffold0527 (1140-1185)||(97-142)
scaffold0527 (1140-1185)||(8160-8205)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (968-1184)||(610-825)
[»] scaffold0398 (1 HSPs)
scaffold0398 (108-252)||(13208-13360)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (880-1110)||(103556-103788)
scaffold0023 (693-733)||(103369-103408)
[»] scaffold0422 (4 HSPs)
scaffold0422 (268-488)||(11091-11315)
scaffold0422 (687-934)||(11553-11799)
scaffold0422 (403-563)||(11259-11421)
scaffold0422 (1141-1185)||(11975-12019)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (688-1001)||(1803-2117)
scaffold0220 (270-460)||(2338-2534)
scaffold0220 (447-606)||(2216-2381)
[»] scaffold0211 (4 HSPs)
scaffold0211 (860-1062)||(15567-15769)
scaffold0211 (266-489)||(2-231)
scaffold0211 (1121-1169)||(15455-15503)
scaffold0211 (403-460)||(1-59)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (685-937)||(16745-16997)
scaffold0297 (266-563)||(9325-9631)
[»] scaffold0207 (6 HSPs)
scaffold0207 (269-488)||(19923-20147)
scaffold0207 (433-821)||(10250-10645)
scaffold0207 (685-737)||(20410-20462)
scaffold0207 (405-563)||(20123-20283)
scaffold0207 (403-460)||(10250-10308)
scaffold0207 (403-460)||(20151-20209)
[»] scaffold0050 (3 HSPs)
scaffold0050 (268-488)||(34977-35201)
scaffold0050 (403-563)||(35145-35307)
scaffold0050 (1136-1185)||(35442-35491)
[»] scaffold0473 (2 HSPs)
scaffold0473 (882-1146)||(2573-2815)
scaffold0473 (1136-1183)||(2551-2598)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (201-378)||(1882-2065)
[»] scaffold0426 (4 HSPs)
scaffold0426 (881-1059)||(13557-13734)
scaffold0426 (1108-1184)||(13823-13899)
scaffold0426 (693-729)||(13368-13404)
scaffold0426 (523-562)||(13191-13230)
[»] scaffold0146 (5 HSPs)
scaffold0146 (908-1082)||(15130-15303)
scaffold0146 (693-733)||(14914-14954)
scaffold0146 (266-347)||(14475-14557)
scaffold0146 (1137-1183)||(15328-15374)
scaffold0146 (523-562)||(14736-14775)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (138-278)||(82714-82857)
scaffold0034 (1134-1183)||(81899-81950)
[»] scaffold0247 (7 HSPs)
scaffold0247 (1018-1146)||(23424-23551)
scaffold0247 (880-1022)||(25384-25525)
scaffold0247 (266-348)||(16385-16469)
scaffold0247 (880-934)||(15811-15865)
scaffold0247 (1136-1185)||(23400-23449)
scaffold0247 (693-734)||(16012-16052)
scaffold0247 (693-734)||(25672-25712)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (269-488)||(7010-7234)
scaffold0018 (792-937)||(6591-6736)
scaffold0018 (403-606)||(6856-7066)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (863-934)||(7375-7446)
scaffold0201 (266-353)||(18558-18646)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (138-267)||(8611-8743)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (266-347)||(20-102)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (138-262)||(17688-17815)
[»] scaffold0324 (4 HSPs)
scaffold0324 (863-1018)||(9923-10078)
scaffold0324 (693-728)||(9752-9787)
scaffold0324 (449-562)||(9501-9615)
scaffold0324 (1139-1184)||(10199-10243)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (1121-1185)||(923-987)
scaffold0016 (863-984)||(690-812)
scaffold0016 (448-562)||(263-380)
scaffold0016 (1103-1193)||(163511-163604)
[»] scaffold0622 (4 HSPs)
scaffold0622 (403-567)||(3844-4011)
scaffold0622 (687-732)||(2451-2496)
scaffold0622 (687-735)||(3672-3720)
scaffold0622 (274-353)||(4027-4106)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (405-562)||(13542-13701)
scaffold0081 (698-733)||(40441-40476)
scaffold0081 (897-1036)||(40639-40777)
[»] scaffold1477 (2 HSPs)
scaffold1477 (880-934)||(1701-1755)
scaffold1477 (1135-1182)||(1479-1528)
[»] scaffold0040 (7 HSPs)
scaffold0040 (403-562)||(4464-4625)
scaffold0040 (693-734)||(1792-1833)
scaffold0040 (274-339)||(6815-6880)
scaffold0040 (288-347)||(2731-2790)
scaffold0040 (687-734)||(4285-4332)
scaffold0040 (403-442)||(8279-8318)
scaffold0040 (420-489)||(8261-8331)
[»] scaffold0334 (3 HSPs)
scaffold0334 (973-1186)||(9872-10084)
scaffold0334 (688-733)||(7617-7662)
scaffold0334 (1134-1183)||(19594-19645)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (202-320)||(10238-10355)
scaffold0349 (314-443)||(13934-14068)
scaffold0349 (431-488)||(14026-14084)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (1121-1185)||(11601-11665)
scaffold0151 (1067-1161)||(11532-11626)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (1121-1184)||(9215-9278)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (108-237)||(5271-5404)
[»] scaffold0022 (9 HSPs)
scaffold0022 (974-1145)||(39503-39676)
scaffold0022 (974-1145)||(137563-137736)
scaffold0022 (693-956)||(37199-37463)
scaffold0022 (693-956)||(135259-135523)
scaffold0022 (1135-1182)||(159309-159356)
scaffold0022 (448-558)||(158653-158764)
scaffold0022 (693-733)||(158906-158946)
scaffold0022 (1136-1186)||(39652-39702)
scaffold0022 (1136-1186)||(137712-137762)
[»] scaffold0009 (6 HSPs)
scaffold0009 (687-733)||(268572-268618)
scaffold0009 (693-929)||(84191-84429)
scaffold0009 (287-353)||(268162-268228)
scaffold0009 (523-562)||(84011-84050)
scaffold0009 (523-562)||(268400-268439)
scaffold0009 (274-348)||(83759-83834)
[»] scaffold0352 (4 HSPs)
scaffold0352 (901-1110)||(727-926)
scaffold0352 (694-734)||(1093-1133)
scaffold0352 (1136-1179)||(673-716)
scaffold0352 (523-559)||(1277-1313)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (138-257)||(1-123)
[»] scaffold0567 (2 HSPs)
scaffold0567 (687-935)||(9698-9946)
scaffold0567 (266-347)||(9263-9345)
[»] scaffold0092 (2 HSPs)
scaffold0092 (403-562)||(7591-7749)
scaffold0092 (687-733)||(7878-7924)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (266-373)||(9630-9740)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (1121-1184)||(74806-74869)
scaffold0025 (287-347)||(73961-74022)
scaffold0025 (693-733)||(74378-74418)
scaffold0025 (902-962)||(74588-74648)
[»] scaffold0598 (3 HSPs)
scaffold0598 (274-356)||(2443-2525)
scaffold0598 (688-733)||(2067-2112)
scaffold0598 (523-562)||(2246-2285)
[»] scaffold0275 (2 HSPs)
scaffold0275 (1139-1185)||(8511-8557)
scaffold0275 (287-348)||(24010-24072)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (687-733)||(32060-32106)
scaffold0078 (287-347)||(32457-32517)
scaffold0078 (900-934)||(31856-31890)
[»] scaffold0064 (4 HSPs)
scaffold0064 (1135-1193)||(43719-43776)
scaffold0064 (901-992)||(43934-44024)
scaffold0064 (693-733)||(44193-44233)
scaffold0064 (523-563)||(44342-44382)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (287-353)||(76625-76691)
scaffold0037 (448-553)||(76757-76863)
[»] scaffold0772 (3 HSPs)
scaffold0772 (688-733)||(1153-1198)
scaffold0772 (523-562)||(1331-1370)
scaffold0772 (287-353)||(1538-1604)
[»] scaffold0364 (3 HSPs)
scaffold0364 (863-1015)||(5974-6126)
scaffold0364 (1134-1175)||(6229-6270)
scaffold0364 (695-729)||(5807-5841)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1121-1193)||(22249-22322)
[»] scaffold0774 (1 HSPs)
scaffold0774 (1121-1193)||(6141-6216)
[»] scaffold0607 (3 HSPs)
scaffold0607 (694-734)||(5804-5844)
scaffold0607 (880-932)||(5991-6043)
scaffold0607 (523-562)||(5625-5664)
[»] scaffold0530 (4 HSPs)
scaffold0530 (693-733)||(2266-2306)
scaffold0530 (523-562)||(2440-2479)
scaffold0530 (911-959)||(2042-2090)
scaffold0530 (287-347)||(2688-2747)
[»] scaffold0330 (2 HSPs)
scaffold0330 (448-562)||(107-223)
scaffold0330 (274-348)||(321-396)
[»] scaffold0273 (4 HSPs)
scaffold0273 (693-733)||(5426-5466)
scaffold0273 (477-562)||(5202-5288)
scaffold0273 (286-347)||(22396-22457)
scaffold0273 (901-937)||(5633-5669)
[»] scaffold0193 (4 HSPs)
scaffold0193 (287-347)||(16800-16860)
scaffold0193 (897-1146)||(15795-16044)
scaffold0193 (1138-1193)||(16021-16076)
scaffold0193 (700-734)||(16410-16444)
[»] scaffold0069 (5 HSPs)
scaffold0069 (694-734)||(5597-5637)
scaffold0069 (995-1115)||(5225-5345)
scaffold0069 (523-562)||(5778-5817)
scaffold0069 (1151-1185)||(5185-5219)
scaffold0069 (287-347)||(5939-6000)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (292-347)||(2056-2111)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (1150-1193)||(4289-4332)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (687-734)||(19863-19910)
scaffold0311 (303-353)||(19473-19523)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (405-562)||(144405-144564)
scaffold0020 (287-347)||(144285-144345)
scaffold0020 (688-733)||(144698-144743)
[»] scaffold0859 (4 HSPs)
scaffold0859 (863-929)||(2951-3016)
scaffold0859 (523-562)||(2599-2638)
scaffold0859 (287-348)||(2361-2423)
scaffold0859 (694-733)||(2781-2820)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (159-241)||(12280-12362)
[»] scaffold0205 (3 HSPs)
scaffold0205 (448-562)||(393-510)
scaffold0205 (287-346)||(611-671)
scaffold0205 (523-562)||(279-318)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (438-475)||(4829-4866)
[»] scaffold0314 (1 HSPs)
scaffold0314 (1133-1183)||(20575-20627)
[»] scaffold0488 (2 HSPs)
scaffold0488 (266-562)||(11554-11855)
scaffold0488 (694-734)||(11996-12036)
[»] scaffold1657 (1 HSPs)
scaffold1657 (448-562)||(1384-1498)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (108-191)||(1558-1643)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (523-562)||(5801-5840)
[»] scaffold0498 (3 HSPs)
scaffold0498 (266-352)||(3925-4011)
scaffold0498 (687-729)||(3582-3624)
scaffold0498 (901-934)||(384-417)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (523-562)||(5811-5850)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (693-728)||(3021-3056)
scaffold0113 (287-347)||(2610-2671)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (266-378)||(1191-1310)
[»] scaffold1747 (2 HSPs)
scaffold1747 (901-959)||(1323-1381)
scaffold1747 (287-347)||(701-761)
[»] scaffold1745 (2 HSPs)
scaffold1745 (901-959)||(30-88)
scaffold1745 (287-347)||(650-710)
[»] scaffold0795 (1 HSPs)
scaffold0795 (1149-1183)||(37-71)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (900-934)||(35199-35233)
scaffold0077 (1135-1183)||(34943-34993)
[»] scaffold0758 (3 HSPs)
scaffold0758 (288-353)||(3689-3754)
scaffold0758 (403-562)||(3770-3931)
scaffold0758 (687-726)||(4061-4100)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (1135-1193)||(165-225)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (1150-1183)||(27160-27193)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1135-1193)||(15286-15346)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (268-373)||(17387-17495)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1135-1183)||(4816-4864)
[»] scaffold0683 (1 HSPs)
scaffold0683 (523-577)||(9-64)
[»] scaffold0388 (2 HSPs)
scaffold0388 (513-560)||(5001-5048)
scaffold0388 (687-733)||(5178-5224)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (523-562)||(31356-31395)
scaffold0074 (687-734)||(31528-31575)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (266-352)||(17000-17087)
[»] scaffold1339 (1 HSPs)
scaffold1339 (403-483)||(1755-1836)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (1150-1183)||(2218-2251)
[»] scaffold1026 (1 HSPs)
scaffold1026 (523-560)||(2702-2739)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (1150-1183)||(5013-5046)
[»] scaffold0374 (1 HSPs)
scaffold0374 (1150-1183)||(17154-17187)
[»] scaffold0226 (2 HSPs)
scaffold0226 (1150-1183)||(19002-19035)
scaffold0226 (1150-1183)||(28396-28429)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 760; Significance: 0; HSPs: 520)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 760; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6501832 - 6501004
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgctt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6501832 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgctt 6501733  T
206 ctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6501732 ctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaaaacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgg 6501633  T
306 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
6501632 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgc 6501533  T
406 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatac 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
6501532 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 6501433  T
506 agagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaa 605  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6501432 agagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaa 6501333  T
606 tcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcc 705  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
6501332 tcagtgcagatattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatttctctatatcatcttcaagtcttcactcc 6501233  T
706 tttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgg 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
6501232 tttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgg 6501133  T
806 gtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaac 905  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6501132 gtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaac 6501033  T
906 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
6501032 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 6501004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 747; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6491177 - 6490350
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6491177 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctaaaaattctttttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttc 6491078  T
207 tgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6491077 tgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaaaacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgga 6490978  T
307 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
6490977 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgct 6490878  T
407 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagataca 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
6490877 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 6490778  T
507 gagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaat 606  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
6490777 gagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaattagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctggactttgaatttctaagatgtatcaaat 6490678  T
607 cagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcct 706  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
6490677 cagtgcagatattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatttctctatatcatcttcaagtcttcactcct 6490578  T
707 ttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttggg 806  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
6490577 ttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttggg 6490478  T
807 tgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaaca 906  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6490477 tgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaaca 6490378  T
907 gagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
6490377 gagtagtggaggtagtggttgtacactt 6490350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 701; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9994695 - 9993894
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9994695 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 9994596  T
233 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9994595 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 9994496  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9994495 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 9994396  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacactt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
9994395 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 9994296  T
533 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9994295 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 9994196  T
633 agaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9994195 agaatcaatttgacagagttttggcacttttgaacttgtatat-tttctatttttcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 9994097  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
9994096 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagctt 9993997  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
9993996 caaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 9993898  T
931 actt 934  Q
    ||||    
9993897 actt 9993894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 696; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12238446 - 12237615
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttc-ttttct-----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
12238446 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagattgtgagt 12238347  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12238346 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 12238247  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
12238246 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 12238147  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
12238146 ctgctcaagaacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 12238047  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 601  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
12238046 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactatagactttgaatttctaagatgtat 12237947  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttca 701  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||    
12237946 caaatcagtgcagaaattcattgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctgtcatcttcaagtcttca 12237847  T
702 ctcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgat 801  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12237846 ctcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgat 12237747  T
802 ttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa 901  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
12237746 ttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctattgtcttgtcttgtagcgtggac-a 12237648  T
902 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
12237647 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12237615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 688; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12250215 - 12249441
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12250215 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcggattgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 12250116  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12250115 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 12250016  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttc 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12250015 attacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttc 12249916  T
459 taatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12249915 taatgctcaagcacgcaggcaagagacttataatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 12249816  T
559 acaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
12249815 acaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaatttagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcg 12249716  T
659 cttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 758  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12249715 ctttttaacttgtatatctctatttgtcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 12249616  T
759 gtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 858  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12249615 gtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 12249516  T
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12249515 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12249441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 678; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9982717 - 9981886
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
9982717 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagaccgtgagtg 9982618  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9982617 cttctgatgaaatgatcagaatcatatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 9982518  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
9982517 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcataaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac 9982418  T
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaga 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
9982417 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 9982318  T
503 tacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatc 602  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9982317 tacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatc 9982218  T
603 aaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttc 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||    
9982217 aaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcacttttgaacttgtatat-tttctatttttcatcttcaagtcttc 9982119  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
9982118 actctattatatagaagtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcatttgaaatcctttgatcatccaccagtgatcctttgcctga 9982019  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
9982018 tttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagatgttgtcttgtcttgtagcgtggac- 9981920  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9981919 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9981886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 662; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 23635110 - 23635944
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttc-ttttct-----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
23635110 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 23635209  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23635210 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 23635309  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
23635310 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa 23635409  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
23635410 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 23635509  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
23635510 aatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgt 23635609  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |   |||||||||||||    
23635610 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtctt 23635709  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
23635710 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatccttttcctg 23635809  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23635810 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 23635909  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23635910 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 23635944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 609; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 156 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 10656044 - 10655264
Alignment:
156 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagag 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
10656044 tctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaataatcagaataagatttgcagcggaaaagaacagagcagag 10655945  T
255 aaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10655944 aaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 10655845  T
355 aaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 454  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10655844 aacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 10655745  T
455 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaga-tacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10655744 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 10655645  T
554 tcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttt 653  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
10655644 tcaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttt 10655545  T
654 tggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 753  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
10655544 tggcgcttttgaacttgtatatctctatctactatcttcaagtcttcaatcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtcgaaa 10655445  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
10655444 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataatcttcaaattcattcccatcttgaagg 10655345  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | || | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
10655344 cgcaaaatctgcaggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10655264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 608; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 10627745 - 10626942
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
10627745 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaataatcagaataagatttg 10627646  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
10627645 cagcggaaaagaacatagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttttcctggttccttccacaacacggaagtagtacagtcccccttgcacttc 10627546  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
10627545 caaggagatttcactataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 10627446  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaga-tacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
10627445 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 10627346  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
10627345 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgcttt 10627246  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
10627245 gtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatctactatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 10627146  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
10627145 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataataatctt 10627046  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
10627045 caaattcattcccatcttgaaggcgcagaatctgcaggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtac 10626946  T
931 actt 934  Q
    ||||    
10626945 actt 10626942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 608; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 37885013 - 37885813
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
37885013 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatactttttctgataaaacttcagaagcaa--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 37885109  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37885110 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 37885209  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
37885210 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 37885309  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
37885310 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 37885409  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37885410 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 37885509  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37885510 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 37885609  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
37885610 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 37885709  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
37885710 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaagtagtggttgtac 37885809  T
931 actt 934  Q
    ||||    
37885810 actt 37885813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 601; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 8774056 - 8774893
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa---ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| | || ||    
8774056 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgaga 8774155  T
200 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8774156 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 8774255  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
8774256 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 8774354  T
400 aact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
8774355 aactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 8774454  T
498 aaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagat 597  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
8774455 aaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagat 8774554  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
8774555 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatatttctattttatcttcaagtc 8774654  T
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcc 797  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
8774655 ttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcc 8774754  T
798 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
8774755 tgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgta 8774854  T
897 gaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8774855 gacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 8774893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 600; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 37865880 - 37866680
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
37865880 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatactttttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 37865976  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37865977 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 37866076  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
37866077 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 37866176  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
37866177 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 37866276  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37866277 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 37866376  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37866377 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 37866476  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
37866477 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcccgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 37866576  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
37866577 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagttgaggtagtggttgtac 37866676  T
931 actt 934  Q
    ||||    
37866677 actt 37866680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 598; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 160 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 4175530 - 4174757
Alignment:
160 aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
4175530 aaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaa 4175434  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4175433 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 4175334  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttc 458  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4175333 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttc 4175234  T
459 taatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
4175233 taatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 4175134  T
559 acaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcg 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
4175133 acaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcg 4175034  T
659 cttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 758  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4175033 ctttttaacttgtgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 4174934  T
759 gtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 858  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||     
4174933 gtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaa 4174834  T
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4174833 cttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4174757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 28315069 - 28314232
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa---ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||   | |||||||||||||| |||||||||||   || ||    
28315069 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaatccttcttctgataaaacttcagaagcagtttgaga 28314970  T
200 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28314969 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 28314870  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
28314869 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 28314771  T
400 aact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
28314770 aactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 28314671  T
498 aaaga-tacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaaga 596  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
28314670 aaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaaga 28314571  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagt 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
28314570 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatatctctgttttatcttcaagt 28314471  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
28314470 cttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgc 28314371  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
28314370 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgta 28314271  T
897 gac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28314270 gacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28314232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 38194123 - 38194960
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa---ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||   || ||    
38194123 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgaga 38194222  T
200 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38194223 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 38194322  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
38194323 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 38194421  T
400 aact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
38194422 aactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 38194521  T
498 aaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagat 597  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
38194522 aaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagat 38194621  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||||||    
38194622 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatatctctgttttatcttcaagtc 38194721  T
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcc 797  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
38194722 ttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcc 38194821  T
798 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
38194822 tgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgta 38194921  T
897 gaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38194922 gacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 38194960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 160 - 934
Target Start/End: Original strand, 18483503 - 18484280
Alignment:
160 aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaag 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18483503 aaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaag 18483602  T
260 aaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaaga 359  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
18483603 aaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-ga 18483701  T
360 ttacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18483702 ttacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 18483801  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
18483802 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 18483901  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
18483902 tacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 18484001  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18484002 gcttttgaacttatatatctctatctaaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 18484101  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcac 856  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||    
18484102 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtac 18484201  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18484202 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18484280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 23767300 - 23768129
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
23767300 tgaaggtga-aaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 23767396  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23767397 cttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 23767495  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
23767496 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 23767595  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
23767596 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 23767695  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 601  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23767696 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtat 23767795  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttca 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   |||||||||||||||    
23767796 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttca 23767895  T
702 ctcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgat 801  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
23767896 ctcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgat 23767995  T
802 ttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca- 900  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||     
23767996 ttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacag 23768095  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23768096 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 23768129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 29472900 - 29472066
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct----aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||    
29472900 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtga 29472801  T
200 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
29472800 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccac 29472702  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 398  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
29472701 aaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctca 29472602  T
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
29472601 aaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaaca 29472502  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagat 597  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
29472501 aaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagat 29472402  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |   |||||||||||    
29472401 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctctctacaatcttcaagtc 29472302  T
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcc 797  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
29472301 ttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacatctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcc 29472202  T
798 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
29472201 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 29472102  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29472101 ac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29472066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 29461982 - 29461214
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
29461982 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 29461884  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29461883 caaagacacaagcagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataataacaaagattaca 29461784  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 464  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
29461783 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgc 29461684  T
465 tcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaata 564  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
29461683 tcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaata 29461584  T
565 caataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 663  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
29461583 caattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttt 29461484  T
664 gaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 763  Q
     ||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
29461483 taacttgtgtatgtctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacatctaaagagtcgtttg 29461384  T
764 aaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 863  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
29461383 aaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattct 29461284  T
864 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29461283 gcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29461214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 39382090 - 39382926
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa--ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
39382090 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 39382189  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39382190 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 39382289  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
39382290 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 39382388  T
401 act--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
39382389 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 39382488  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
39382489 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatg 39382588  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| | || | ||| ||||| | ||||||||||||||    
39382589 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgtatttatgtatatctctgttttatcttcaagtct 39382688  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
39382689 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcct 39382788  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
39382789 gatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtag 39382888  T
898 aca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39382889 acagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39382926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 5866498 - 5865694
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
5866498 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5866402  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5866401 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5866302  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
5866301 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 5866202  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
5866201 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 5866102  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5866101 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 5866002  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 727  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5866001 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctatcttgaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 5865902  T
728 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattag 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
5865901 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaa 5865802  T
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
5865801 cttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggtt 5865702  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
5865701 gtacactt 5865694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 5877097 - 5876293
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
5877097 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5877001  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5877000 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5876901  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
5876900 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 5876801  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
5876800 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 5876701  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5876700 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 5876601  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 727  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5876600 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctatcttgaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 5876501  T
728 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattag 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
5876500 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaa 5876401  T
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
5876400 cttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggtt 5876301  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
5876300 gtacactt 5876293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 38204658 - 38205496
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa---ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||   || ||    
38204658 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgaga 38204757  T
200 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38204758 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 38204857  T
300 acacggaagtagtccagtccccc-ttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
38204858 acacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcaca 38204956  T
399 aaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaa 496  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
38204957 aaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 38205056  T
497 caaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaaga 596  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
38205057 caaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaaga 38205156  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagt 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||||    
38205157 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatatctctgttttatcttcaagt 38205256  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
38205257 cttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgc 38205356  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
38205357 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgt 38205456  T
896 ggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38205457 agacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 38205496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6221502 - 6220702
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
6221502 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 6221406  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6221405 cagcagaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 6221306  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
6221305 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 6221206  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
6221205 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 6221106  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6221105 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 6221006  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
6221005 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaatttatgtatctctatgtataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 6220906  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
6220905 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 6220806  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
6220805 aaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 6220706  T
931 actt 934  Q
    ||||    
6220705 actt 6220702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 39673620 - 39672883
Alignment:
197 tgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
39673620 tgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcgggaaaggacagagcagagaaaagaaagacaaagaca-aagcagttatcctggttccttc 39673523  T
296 cacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
39673522 cacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttc 39673423  T
396 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaa 495  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39673422 acaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaa 39673323  T
496 acaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaag 595  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39673322 acaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaag 39673223  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaag 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   |||||||||    
39673222 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaag 39673123  T
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttg 795  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
39673122 tcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttg 39673023  T
796 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
39673022 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgaacatacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgt 39672923  T
896 ggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39672922 agacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39672883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 23756759 - 23757533
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
23756759 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 23756855  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23756856 agaaagacaaagacacaagcagttgtcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 23756955  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23756956 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 23757055  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
23757056 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 23757155  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
23757156 tacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 23757255  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23757256 gcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 23757355  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||    
23757356 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtaca 23757455  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23757456 aattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 23757533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 24707328 - 24706555
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
24707328 attcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaaagcttctaatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 24707229  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24707228 aagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 24707130  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttcta 460  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24707129 acaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagatttcta 24707030  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatac 560  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
24707029 atgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacagtgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatat 24706930  T
561 aatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
24706929 aatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 24706830  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||||| ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
24706829 ttttgaacttgtgtatctctatctccaatcttcaagtcttcactcctttatataaaggcgtgaaagagacgttgagagaattagcacgtctaaagagtcg 24706730  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
24706729 tttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 24706630  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
24706629 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24706555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 5537821 - 5537022
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
5537821 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5537725  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5537724 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5537625  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
5537624 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 5537525  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||    
5537524 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacact 5537425  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5537424 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 5537325  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
5537324 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 5537225  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
5537224 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 5537125  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
5537124 aaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 5537026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6181328 - 6180528
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
6181328 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 6181232  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6181231 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 6181132  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
6181131 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 6181032  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
6181031 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 6180932  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6180931 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 6180832  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
6180831 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaatttatgtatctctatgtataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 6180732  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
6180731 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccaatgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 6180632  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
6180631 aaattcattcccatcttgaacgtacaaattatgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 6180532  T
931 actt 934  Q
    ||||    
6180531 actt 6180528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 13557009 - 13557809
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
13557009 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13557105  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13557106 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 13557205  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
13557206 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 13557305  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
13557306 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 13557405  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13557406 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 13557505  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
13557506 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 13557605  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13557606 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 13557705  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
13557706 aaactcattcccatcttgaacgtacaaattctgcatgcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggagatagtggttgtac 13557805  T
931 actt 934  Q
    ||||    
13557806 actt 13557809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 577; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 39371511 - 39372289
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39371511 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 39371610  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
39371611 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-g 39371709  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39371710 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcatacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 39371809  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
39371810 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 39371909  T
557 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
39371910 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 39372009  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    |||||||| | || | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39372010 cgcttttgtatttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 39372109  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 855  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
39372110 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 39372209  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39372210 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39372289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 13121097 - 13121897
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
13121097 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13121193  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13121194 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 13121293  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
13121294 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 13121393  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
13121394 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 13121493  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13121494 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 13121593  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
13121594 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 13121693  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13121694 tgagataatcagcacgtctaaggagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 13121793  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
13121794 aaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 13121893  T
931 actt 934  Q
    ||||    
13121894 actt 13121897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 19788457 - 19789257
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
19788457 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 19788553  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19788554 cagcggaaaagaacagagcagaaaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19788653  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
19788654 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19788753  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
19788754 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 19788853  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19788854 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 19788953  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
19788954 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 19789053  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19789054 tgagataatcaacacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaacagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 19789153  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
19789154 aaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 19789253  T
931 actt 934  Q
    ||||    
19789254 actt 19789257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 19888185 - 19887355
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
19888185 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 19888087  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
19888086 cttctaatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcttggttccttccacaaa 19887988  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
19887987 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 19887888  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
19887887 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaatcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 19887788  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagact-ttgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
19887787 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacgataaagactctagactcttgaatttctaagatgta 19887688  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||    
19887687 tcaaatcagtgcaggaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctagaatcttcaagtcttc 19887588  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
19887587 gctcatttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcgtttgcctga 19887488  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
19887487 tttgggtgtactactttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac- 19887389  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
19887388 aaaacagagtagtggagttagtggttgtacactt 19887355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 20720572 - 20721348
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
20720572 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcaacggaaaagaacagagcagagaaa 20720668  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20720669 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 20720768  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20720769 gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 20720868  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
20720869 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 20720968  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
20720969 aatacaatatagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttg 20721068  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 753  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20721069 gcgcttttaaacttgtgta--tctctatcttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 20721166  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |    
20721167 gagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtg 20721266  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20721267 tacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20721348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 28325624 - 28324848
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28325624 aaaaatccttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 28325525  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
28325524 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-g 28325426  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28325425 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 28325326  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaga-tacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
28325325 tctaatgctcaagcac--aggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 28325228  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
28325227 aatacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttg 28325128  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
28325127 gcgcttttgaacttgtgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtttaaaga 28325028  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |    
28325027 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgta 28324928  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28324927 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28324848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 11217501 - 11216722
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||    
11217501 aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcaatttgggaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagttcaaagcaaagaaa 11217402  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11217401 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 11217303  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
11217302 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcactcacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 11217203  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
11217202 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 11217103  T
558 tacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
11217102 tacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 11217003  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatctt----atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 752  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
11217002 cgctttttaacttgtatatatctctatctcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaa 11216903  T
753 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 852  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11216902 agagtcgtt-gagatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 11216804  T
853 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11216803 gcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11216722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 5548405 - 5547606
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
5548405 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5548309  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5548308 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5548209  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
5548208 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 5548109  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||    
5548108 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacact 5548009  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5548008 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 5547909  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
5547908 tagaatcaaattgacaaagttttggcgcttttgaacttatgtatttctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 5547809  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
5547808 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 5547709  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
5547708 aaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgtaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 5547610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Original strand, 933026 - 933861
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||   |||||||||||   || ||     
933026 atgaaggtgagaaaaacacaagaaggggtggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaa 933125  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
933126 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 933225  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||    
933226 aaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctca 933325  T
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
933326 aaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaaca 933425  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagat 597  Q
    || |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
933426 aaaatacaatgaaataggtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacattacgttaaagactctagacttgtgaatttctaagat 933525  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaag 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  |||||||||    
933526 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatat--ctctatcttcaatcttcaag 933623  T
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttg 795  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
933624 tcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcatgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttg 933723  T
796 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
933724 tctgatttggatgtagtcctttgaagaattagtttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 933823  T
896 ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
933824 ggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 933861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 7805319 - 7804519
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
7805319 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttttgataaaacttcagaagcagtttgtaagtgcttctgatgaaatgatcaaaatcagatatgca 7805220  T
235 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
7805219 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 7805121  T
334 aggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
7805120 aggagatttcactataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 7805021  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacactt 532  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
7805020 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatataatgaaataagtttgacttgaacactt 7804921  T
533 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7804920 gatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 7804821  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7804820 tagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 7804721  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
7804720 tgagatgatttgcacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttc 7804621  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
7804620 aaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtattgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 7804522  T
932 ctt 934  Q
    |||    
7804521 ctt 7804519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 19777820 - 19778620
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
19777820 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgatatgatcagagtcagat-tg 19777916  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19777917 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagttgttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19778016  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
19778017 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19778116  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
19778117 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 19778216  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19778217 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaataaagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 19778316  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
19778317 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 19778416  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19778417 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaacagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 19778516  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
19778517 aaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 19778616  T
931 actt 934  Q
    ||||    
19778617 actt 19778620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 24384321 - 24383519
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
24384321 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24384225  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24384224 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcttggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24384125  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
24384124 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 24384025  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
24384024 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 24383925  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24383924 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 24383825  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
24383824 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagac 24383725  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
24383724 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 24383625  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
24383624 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 24383525  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
24383524 acactt 24383519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 23647184 - 23647983
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
23647184 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 23647280  T
234 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23647281 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 23647380  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
23647381 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 23647480  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
23647481 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 23647580  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23647581 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 23647680  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
23647681 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 23647779  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
23647780 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcatttgaagaataagcttc 23647879  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
23647880 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 23647979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 5580403 - 5579634
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
5580403 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 5580307  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5580306 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 5580207  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5580206 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 5580107  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
5580106 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 5580007  T
563 tacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttt 662  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
5580006 tacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttt 5579907  T
663 tgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgt 760  Q
    | ||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5579906 taaacttgtgta--tctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgt 5579809  T
761 ttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatat 860  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||    
5579808 ttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaat 5579709  T
861 tctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5579708 tctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5579634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 14475656 - 14476458
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
14475656 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 14475752  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14475753 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14475852  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
14475853 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 14475952  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
14475953 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 14476052  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14476053 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 14476152  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
14476153 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 14476252  T
732 tgag--ataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
14476253 tgagatataatcagcacgtctaaggagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagct 14476352  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
14476353 tcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagtgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 14476452  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
14476453 acactt 14476458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 4743202 - 4743972
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
4743202 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 4743298  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
4743299 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 4743397  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4743398 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 4743497  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
4743498 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 4743597  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
4743598 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 4743697  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4743698 ttttaaacttatgtatctctctctattatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 4743797  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
4743798 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-a 4743896  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4743897 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4743972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 7795408 - 7794608
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7795408 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttttgataaaacttcagaagcagtttgtaagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 7795309  T
235 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
7795308 gtggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagtagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttcga 7795210  T
334 aggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
7795209 aggagatttcactataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 7795110  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacactt 532  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
7795109 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacactt 7795010  T
533 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7795009 gatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 7794910  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7794909 tagaatcaaattgatagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 7794810  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
7794809 tgagatgattttcacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttc 7794710  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
7794709 aaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 7794611  T
932 ctt 934  Q
    |||    
7794610 ctt 7794608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20684578 - 20683781
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
20684578 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 20684482  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20684481 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 20684382  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
20684381 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 20684283  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
20684282 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 20684183  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
20684182 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaactcagtgcagaaattcagtgtgctttg 20684083  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
20684082 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctcta--taatcttcaagtcttcacttctttatatagaggcgtgaaagggacgt 20683985  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20683984 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 20683885  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
20683884 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 20683785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 9535067 - 9535842
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
9535067 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 9535166  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
9535167 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaa 9535265  T
358 gattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
9535266 gattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgctaagcaagagtct 9535365  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
9535366 tctaatgctcaagcatgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 9535465  T
557 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
9535466 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 9535565  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
9535566 gcgctttttaacttgtgtatctctatctccaat-ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 9535664  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9535665 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 9535764  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9535765 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcatggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9535842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 37759103 - 37759905
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa---ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatat 231  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
37759103 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaagagtacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 37759199  T
232 gcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 330  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
37759200 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcatggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcactt 37759299  T
331 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
37759300 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactcctcaatactttctaagtgtgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 37759399  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
37759400 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 37759499  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaataca-ataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
37759500 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctt 37759599  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
37759600 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctatatgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 37759699  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
37759700 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagct 37759799  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
37759800 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 37759899  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
37759900 acactt 37759905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 504939 - 504168
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
504939 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 504843  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
504842 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 504744  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
504743 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 504644  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
504643 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 504544  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
504543 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 504444  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
504443 ttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 504344  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
504343 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 504244  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
504243 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 504168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 527305 - 526534
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
527305 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 527209  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
527208 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 527110  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
527109 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 527010  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
527009 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 526910  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
526909 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 526810  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
526809 ttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 526710  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
526709 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 526610  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
526609 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 526534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 41683142 - 41683913
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
41683142 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 41683238  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
41683239 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 41683337  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41683338 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 41683437  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
41683438 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 41683537  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
41683538 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 41683637  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41683638 ttttaaacttatgtatatctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 41683737  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
41683738 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 41683837  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41683838 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 41683913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 41693711 - 41694482
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
41693711 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 41693807  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
41693808 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 41693906  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41693907 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 41694006  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
41694007 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 41694106  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
41694107 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 41694206  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41694207 ttttaaacttatgtatatctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 41694306  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
41694307 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 41694406  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41694407 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 41694482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 5510156 - 5510930
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
5510156 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 5510252  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
5510253 agaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa- 5510351  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5510352 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 5510451  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
5510452 ttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 5510551  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
5510552 aatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 5510651  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5510652 gcgcttttaaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 5510751  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |    
5510752 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgta 5510851  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5510852 ca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5510930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 5520334 - 5521108
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
5520334 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 5520430  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
5520431 agaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa- 5520529  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5520530 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 5520629  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
5520630 ttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 5520729  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
5520730 aatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 5520829  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5520830 gcgcttttaaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 5520929  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |    
5520930 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgta 5521029  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5521030 ca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5521108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 9392006 - 9391206
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||  |||||||||||   |||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
9392006 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttctgataatacttcagaagcagtttgtaggtgcttctgatgtaataaccagaatcagatatg 9391907  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
9391906 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaatagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagaagtccagtcccccttgcacttc 9391808  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
9391807 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccc 9391708  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
9391707 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 9391608  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9391607 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 9391508  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
9391507 gtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagaga 9391408  T
729 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 828  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9391407 cgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 9391309  T
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
9391308 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtggt 9391209  T
929 aca 931  Q
    |||    
9391208 aca 9391206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 35186841 - 35187612
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
35186841 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 35186937  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
35186938 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 35187036  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35187037 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 35187136  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
35187137 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 35187236  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
35187237 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 35187336  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35187337 ttttaaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 35187436  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
35187437 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 35187536  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35187537 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35187612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 553; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 13373442 - 13372670
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
13373442 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 13373346  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13373345 agaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 13373246  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13373245 gattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 13373146  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
13373145 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 13373046  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
13373045 aatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttg 13372946  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13372945 gcgcttttgaacttatgtatctcttta----atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 13372850  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |    
13372849 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgta 13372750  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13372749 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 13372670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 11273186 - 11272383
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
11273186 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 11273090  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11273089 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 11272990  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
11272989 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 11272890  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
11272889 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcactcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 11272790  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11272789 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 11272690  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
11272689 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctatgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggggtgaaagagac 11272590  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
11272589 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 11272490  T
830 tcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
11272489 tcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttg 11272390  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
11272389 tacactt 11272383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12287749 - 12286979
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
12287749 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 12287653  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12287652 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 12287553  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
12287552 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaaccaagagacttctaat 12287453  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
12287452 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 12287353  T
562 atacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctt 661  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
12287352 atacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctt 12287253  T
662 ttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    |||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12287252 ttgaacttatgtatctctctcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 12287153  T
762 tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatatt 861  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |||    
12287152 tgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaatt 12287053  T
862 ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12287052 ctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12286979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12297571 - 12296801
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
12297571 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 12297475  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12297474 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 12297375  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12297374 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 12297275  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
12297274 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 12297175  T
562 atacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctt 661  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
12297174 atacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctt 12297075  T
662 ttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    |||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
12297074 ttgaacttatgtatctctctcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagaggcgtt 12296975  T
762 tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatatt 861  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |||    
12296974 tgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaatt 12296875  T
862 ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12296874 ctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12296801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 5628786 - 5628018
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
5628786 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 5628690  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5628689 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 5628591  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5628590 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 5628491  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
5628490 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 5628391  T
563 tacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttt 662  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
5628390 tacagaaaagactctagacttagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttt 5628291  T
663 tgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgt 760  Q
    | ||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5628290 taaacttgtgta--tctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgt 5628193  T
761 ttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatat 860  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||    
5628192 ttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaat 5628093  T
861 tctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5628092 tctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5628018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 10098502 - 10099302
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
10098502 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 10098598  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10098599 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 10098698  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
10098699 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 10098797  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
10098798 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 10098897  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10098898 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 10098997  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
10098998 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctatgtctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 10099097  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
10099098 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 10099197  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
10099198 tcaaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 10099296  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
10099297 acactt 10099302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 202 - 934
Target Start/End: Original strand, 48336743 - 48337475
Alignment:
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
48336743 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 48336841  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
48336842 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 48336941  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
48336942 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaa 48337041  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
48337042 aatacaatgaaattagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgt 48337141  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |   |||||||||||||    
48337142 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctatctacaatcttcaagtctt 48337241  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
48337242 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaagagtcgtttagaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgtctg 48337341  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48337342 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 48337441  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48337442 -aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 48337475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20673994 - 20673196
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
20673994 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 20673898  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
20673897 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttc 20673798  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
20673797 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 20673699  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
20673698 aatgctcaagcactaagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 20673599  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
20673598 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaactcagtgcagaaattcagtgtgcttt 20673499  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
20673498 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctcta--taatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 20673401  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
20673400 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 20673301  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
20673300 caaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 20673201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 24659364 - 24660135
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
24659364 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24659460  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24659461 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 24659559  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24659560 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 24659659  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24659660 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 24659759  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||    
24659760 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggtgc 24659859  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24659860 ttttaaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 24659959  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |    
24659960 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 24660059  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24660060 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24660135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 13131339 - 13132140
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
13131339 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13131435  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13131436 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagctgttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 13131535  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
13131536 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 13131635  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
13131636 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 13131735  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13131736 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 13131835  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | | | | || | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
13131836 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttctgacctaatgtttcggctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 13131935  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
13131936 ttgagataatcagcacgtctaaggagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 13132035  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
13132036 caaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 13132135  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
13132136 cactt 13132140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 13384036 - 13383264
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
13384036 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 13383940  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13383939 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 13383840  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
13383839 gattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagtaagagtcttccaatgctcaagaactaagcaagagac 13383740  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
13383739 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 13383640  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
13383639 aatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttg 13383540  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13383539 gcgcttttgaacttatgtatctcttta----atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 13383444  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |    
13383443 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgta 13383344  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13383343 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 13383264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 4753789 - 4754557
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
4753789 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 4753885  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
4753886 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 4753984  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4753985 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 4754084  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
4754085 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 4754184  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
4754185 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 4754284  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
4754285 ttttaaacttatgtatctctctctattatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgag-taatcagcacgtctaaagagtcg 4754383  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
4754384 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaa-aaataacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-a 4754481  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4754482 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4754557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 167 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 13394622 - 13393858
Alignment:
167 ttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaac 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
13394622 ttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagac 13394526  T
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13394525 aaagacacaagcagttatcctagttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 13394426  T
366 atgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 463  Q
     |||||| |||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13394425 ctgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 13394326  T
464 ctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
13394325 ctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaat 13394226  T
564 acaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 663  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
13394225 acagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtactttttagaatcaaattgacagagttttggcgctttt 13394126  T
664 gaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 763  Q
    |||||| | ||| ||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13394125 gaacttatgtatctcttta----atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 13394030  T
764 aaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 863  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||    
13394029 aaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattct 13393930  T
864 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13393929 gcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 13393858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 24669944 - 24670715
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
24669944 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24670040  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24670041 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 24670139  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24670140 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 24670239  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
24670240 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatataatcagtggtgttcacaata 24670339  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||    
24670340 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggtgc 24670439  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24670440 ttttaaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 24670539  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |    
24670540 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 24670639  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24670640 ttctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24670715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 9381460 - 9380660
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||   |||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
9381460 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttccgataatacttcagaagcagtttgtaggtgcttctgatgtaataaccagaatcagatatg 9381361  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
9381360 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaatagcaac-acacaagcagttaccctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9381262  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
9381261 caatgagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcagtactatctaagtatgagacttcttaaaagtgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9381162  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
9381161 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 9381062  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9381061 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 9380962  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
9380961 gtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagaga 9380862  T
729 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 828  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9380861 cgttgagatgattagcatgtctaaagagtcg-ttgagatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 9380763  T
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9380762 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 9380663  T
929 aca 931  Q
    |||    
9380662 aca 9380660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 1795253 - 1794483
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa-cagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||     
1795253 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaggatcaaagcagagaaaagaaaag 1795154  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1795153 caa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 1795055  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 464  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
1795054 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgc 1794955  T
465 tcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaata 564  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
1794954 tcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttaaacacttgatatacaatcagtagtgttcacaatacaata 1794855  T
565 caataaagactctagac-tttgaatttcta-agatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttt 662  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
1794854 caataaagactctagacttttaaatttctatagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttt 1794755  T
663 tgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 762  Q
    | ||||||| ||| ||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
1794754 ttaacttgtgtatctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-tt 1794656  T
763 gaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 862  Q
    ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
1794655 gagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttc 1794557  T
863 tgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1794556 tgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1794483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 1784904 - 1784071
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||       ||||||  |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |    
1784904 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggcttgaattgtattttctttttctctcttaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaat 1784805  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
1784804 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 1784706  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||    
1784705 aatggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcgatactctctaagtatgagacttctcaaa 1784606  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
1784605 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgattaaacaaa 1784506  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
1784505 aatacaaagaaataagtttgacttaaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgt 1784406  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |    ||||||||||||    
1784405 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgcagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacattcttcaagtctt 1784306  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
1784305 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctg 1784207  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgt-tgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
1784206 atttgggtgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgtgtttcttgtcttgtagcgtgga 1784108  T
899 c-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1784107 caaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1784071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 530; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17910837 - 17910003
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||    
17910837 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctttaaagattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtaagtg 17910739  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
17910738 cttctgatgaaatgatcagaatcagatacgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 17910640  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
17910639 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa 17910540  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa- 499  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
17910539 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaag 17910440  T
500 --agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaaga 596  Q
      | |||||  ||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
17910439 aaaaatacaatgaaatatttttgatttgaacacttgatatgcaatcagtggtgttcacactacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaaga 17910340  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagt 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |  ||||||||||    
17910339 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgatagagttttggcgctttttaacttgtatatatctatcaccaatcttcaagt 17910240  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
17910239 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatccttttc 17910140  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
17910139 ctgatttgggtgttgtccttttaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcataaattctgcaggcatagatgttgtcttgtcttgtagcgtg 17910040  T
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17910039 gac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 17910003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 161 - 934
Target Start/End: Original strand, 11163291 - 11164063
Alignment:
161 aaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaag 259  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||   || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||    
11163291 aaatacttcttctaataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagataagcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag 11163390  T
260 aaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaaga 359  Q
    |||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11163391 aaaagcga-gacacaagcagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaaga 11163489  T
360 ttacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
11163490 ttacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 11163588  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
11163589 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 11163688  T
560 caatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcg 658  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||     
11163689 taataccataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaattgacagagttttggca 11163788  T
659 cttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 758  Q
    ||||| ||||||||| | ||| | |   ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
11163789 ctttttaacttgtatttctctatctacaatcttcaagtcttcactcccttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaagagtc 11163888  T
759 gtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 858  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
11163889 g-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaaaa 11163987  T
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
11163988 attctgtaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11164063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 878
Target Start/End: Original strand, 16385542 - 16386251
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
16385542 cttcttctgataaaatttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 16385638  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
16385639 caaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttactataatcacaa-gattaca 16385737  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16385738 actgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 16385837  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
16385838 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 16385937  T
563 tacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttt 662  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
16385938 tacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttt 16386037  T
663 tgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 762  Q
    | ||||| | ||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
16386038 taaacttatgtatctc-ctctgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtat 16386136  T
763 gaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 862  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
16386137 gaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagattcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttc 16386235  T
863 tgcaggcatagctgtt 878  Q
    ||||||||| ||||||    
16386236 tgcaggcatggctgtt 16386251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Original strand, 4403676 - 4404506
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa--ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||   |||||||  | ||||||||||||   |||||||||||   ||  | |    
4403676 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaactgtgttttctttttctctaaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaat 4403774  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
4403775 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 4403873  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
4403874 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 4403973  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
4403974 a-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 4404072  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttg--aatttctaagatg 598  Q
     |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
4404073 aatacagggaaatatgtttgacttgaacacttcatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgtgaatttctaagata 4404172  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |    |||||||||||    
4404173 tatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacatagttttggcgctttttaacttgtatctctctatctacattcttcaagtct 4404272  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
4404273 tcactcctttatatataggcgtgaaagagacgttgagatgaatagcacgtctaaagagttgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgctt 4404371  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
4404372 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtaga 4404470  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4404471 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4404506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 13262505 - 13261674
Alignment:
106 aatgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||   |  || ||    
13262505 aatgaaggtgaaaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcaaaagcagttttggaatg 13262406  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
13262405 cttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 13262307  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
13262306 tcggaagtagtccagtccccgttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 13262207  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
13262206 atgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaa 13262107  T
502 atacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa-tacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatg 598  Q
    ||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
13262106 atacagagaaa-atgtttgaccttaaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatg 13262008  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |   |||  |||||||    
13262007 tatcaaatcagtacagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacaaagttttgacgctttttaacttgtatatctctatctacaatcaacaagtct 13261908  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
13261907 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattaacacgtctaaagattcgtt-gagtccctttgatcatccactagtaatcctttgcct 13261809  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
13261808 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtaga 13261710  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
13261709 caaaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacactt 13261674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Original strand, 38314096 - 38314933
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | |    
38314096 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaat 38314195  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
38314196 gcttatgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 38314294  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
38314295 aacggaagtagtccagtcccccttgcagttccaaggagatttcactataaccacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 38314394  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
38314395 a-tgctcaagcacacagacaagagtctaccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 38314493  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc-----tcaatacaatacaataaagactctagactt--tgaatttcta 593  Q
     |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
38314494 aatacagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaatacaataaagactctagactttgtgaatttcta 38314593  T
594 agatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttca 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |    ||||||    
38314594 agatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacattcttca 38314693  T
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
38314694 agtcttcactcctttatatagaggagtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctt 38314792  T
794 tgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtag 892  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||||    
38314793 tgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaaacagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtag 38314891  T
893 cgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38314892 cgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 38314933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 27882787 - 27883617
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||   |  || ||||    
27882787 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctaataatacttcagaagcagtttaggaatgct 27882886  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
27882887 tctgatgtgatgatcagaatcatatatgcagcagaaaagaacagagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatc 27882984  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
27882985 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 27883083  T
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||     
27883084 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaa 27883183  T
502 atacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgt 599  Q
    ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
27883184 atacagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgt 27883282  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagt 696  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||   ||||||||||    
27883283 atcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttgacagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatctctatctacaatcttcaagt 27883381  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
27883382 ctccactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgtttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgc 27883480  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
27883481 ctgatttgagtgtagtcctttgaagaatcaatttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgta 27883579  T
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27883580 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27883617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 8996787 - 8995957
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  |||||||    
8996787 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataatacttcagaagcaggttaggagtgct 8996688  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |    
8996687 tctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattattttggttccttccacaaatc 8996590  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
8996589 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 8996491  T
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||     
8996490 tgctcaagcacgcaggcaagagttttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaa 8996391  T
502 atacagagaattaagtttgact-tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgt 599  Q
    ||||||||||  | ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
8996390 atacagagaaa-atgtttgatgatgaacacttgatatacaatcagtggttttctcaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgt 8996292  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagt 696  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |  ||||||||||    
8996291 atcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtattgatgtctcttgccaatcttcaagt 8996193  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
8996192 cctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgatatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgc 8996094  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
8996093 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcgacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgta 8995995  T
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8995994 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 8995957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9007341 - 9006509
Alignment:
106 aatgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  |||||    
9007341 aatgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataatacttcagaagcaggttaggagtg 9007242  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaga-acagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
9007241 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataatacatagtagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 9007144  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||    
9007143 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctgagtatgagacttctcaaa 9007044  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
9007043 a-tgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagctctaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaa 9006945  T
500 agatacagagaattaagtttgact-tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagat 597  Q
    | ||||||||||  | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
9006944 aaatacagagaaa-atgtttgatgatgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagat 9006846  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaa 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |  ||||||||    
9006845 gtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtattgatgtctcttgccaatcttcaa 9006747  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtccttt 794  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||    
9006746 gtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagattcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatctttt 9006648  T
795 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcg 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
9006647 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcgacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcg 9006549  T
895 tggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9006548 tagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9006509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 8740925 - 8740128
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
8740925 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 8740826  T
235 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||    
8740825 gcggaataaaacagagaagagaaaggaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcgaaagtagtccagtctcccttgctcttcca 8740728  T
334 aggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
8740727 aggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaa 8740629  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacactt 532  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||    
8740628 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaacactt 8740529  T
533 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
8740528 gatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgggaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca-agtgctttg 8740430  T
632 tagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||  |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
8740429 tagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtcacttgccaatcttcaagttttcactcctttatatagaagtgtgaaagaga 8740331  T
729 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 828  Q
    |||||||||  | ||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |    
8740330 cgttgagatttttagcacgtct-aagagtcg-ttgtgttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatcaac 8740233  T
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
8740232 ttcaaattcattcccatcttgaaggagca-attctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 8740134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 16076361 - 16077163
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||   |  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
16076361 ttgaattgtgttttcttgttctctaaaaattcttcttctgataatactttagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgatcagaatcaaatatgca 16076460  T
235 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    || ||| | ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
16076461 gcagaataaaacagagcagagagaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 16076559  T
334 aggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
16076560 aggagatttccactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttcca 16076658  T
432 atgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaaca 529  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||  | ||||||  |||||||    
16076659 atgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgatgttgaaca 16076757  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
16076758 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgct 16076857  T
629 ttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaag 725  Q
    |||||||||| | |||| || ||||||||||||||| |||||||||  || |||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
16076858 ttgtagaatcaaatttggcaaagttttggcgctttt-aacttgtattgatatctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaag 16076956  T
726 agacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatt 825  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
16076957 agacgttgagattttgagcacgtctaaagagtcg-ttgagtttctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatc 16077055  T
826 agcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 925  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
16077056 aacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-tgctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 16077154  T
926 tgtacactt 934  Q
    |||||||||    
16077155 tgtacactt 16077163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 1053111 - 1053943
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaa-cacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   |  || |||    
1053111 tgaaggtgagaaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaatcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgc 1053210  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
1053211 ttcagatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 1053308  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
1053309 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 1053408  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac-- 497  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||      
1053409 a-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacga 1053507  T
498 aaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaag 595  Q
    ||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
1053508 aaagacacagaaaat---gtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaag 1053604  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttc 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||    
1053605 atgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcactttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttc 1053703  T
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcct 792  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |    
1053704 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatctt 1053802  T
793 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtag 892  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
1053803 ttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctacaggcagagctgttgtcttgtcttgtag 1053901  T
893 cgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
1053902 cgtagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 1053943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 1063540 - 1064372
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaa-cacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||       || ||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||   |  || |||    
1063540 tgaaggtgagaaaaaacacaagaaggtggggttaaattgtgttttctttttctctaaaaaatattcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgc 1063639  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
1063640 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcagaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 1063737  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
1063738 cagaagttgtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 1063837  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac-- 497  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||      
1063838 a-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagaggcttctaatcaaacga 1063936  T
498 aaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaag 595  Q
    ||||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
1063937 aaagacacagaaaat---gtttgactttgaacacttgatatacaataagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaag 1064033  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttc 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||    
1064034 atgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggtagagttttggcgctttt-aacttgtgtttatgtctcttgccaatcttc 1064132  T
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcct 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |    
1064133 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagactttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatctt 1064231  T
793 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtag 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
1064232 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggtagagctgttgtcttgtcttgtag 1064330  T
893 cgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1064331 cgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1064372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17282234 - 17281434
Alignment:
139 tgaattgtgttttctttt---ct-aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| ||   |||||||||| |  || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
17282234 tgaattgtgttttctttttctctgaaaaattcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgctcagaatcagatatgca 17282135  T
235 gcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 334  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
17282134 gcggataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 17282037  T
335 ggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||    
17282036 ggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaa 17281939  T
433 tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacac 530  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||  | ||||||| ||||||||    
17281938 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacacagaa-aatgtttgactttgaacac 17281840  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||    
17281839 ttgatatactatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgttt 17281740  T
630 tgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    | ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
17281739 tatagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgcctcttgccaatcttcaagtcttcattcctttatatagaagtgtgaaaga 17281641  T
727 gacgttgaga-taatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatt 825  Q
    |||||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
17281640 gacgttgagattttttagcatgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgccagatttgggtgtagtcctttgaagaatc 17281542  T
826 agcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 925  Q
    | |||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
17281541 aacttcaaattcattttcattttgaaggaacat-ttctgcaggtatagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 17281443  T
926 tgtacactt 934  Q
    |||||||||    
17281442 tgtacactt 17281434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 934
Target Start/End: Original strand, 14465332 - 14465826
Alignment:
441 cactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatataca 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
14465332 cactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatataca 14465431  T
541 atcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag 640  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
14465432 atcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa 14465531  T
641 tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataat 740  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
14465532 attgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataat 14465631  T
741 cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 840  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
14465632 cagcacgtctaaggagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcatt 14465731  T
841 cccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14465732 cccatcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14465826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 447 - 934
Target Start/End: Original strand, 8784989 - 8785478
Alignment:
447 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
8784989 gcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagt 8785088  T
547 ggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgac 646  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
8785089 ggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgac 8785188  T
647 agagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcac 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
8785189 agagttttggcgcttttgaacttgtgtatatttctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcac 8785288  T
747 gtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatc 846  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
8785289 gtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatc 8785388  T
847 ttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||   | |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8785389 ttgagttgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 8785478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 13200081 - 13199243
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||    |  || |||    
13200081 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttctctctaaaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttaggaatgc 13199982  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
13199981 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 13199884  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||     
13199883 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaataatcacacagattacaaatgcttaatactctctag-tatgagacttct 13199785  T
397 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaa 495  Q
    ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||    
13199784 caaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcgtcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaa 13199687  T
496 acaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttcta 593  Q
    |||||  |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
13199686 acaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttcta 13199587  T
594 agatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatct 690  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||   || ||||    
13199586 agatatatcaaatcggtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcctgctaatct 13199488  T
691 tcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |    
13199487 tcaagtcttcactcctttatacagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaat 13199389  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttg 889  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
13199388 cttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggatcat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttg 13199290  T
890 tagcgtggac--aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13199289 tagcatagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 13199243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 29906983 - 29906181
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
29906983 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 29906884  T
235 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
29906883 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagtaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 29906785  T
334 aggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||    
29906784 aggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcca 29906687  T
432 atgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaaca 529  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||| ||||  | ||||||  |||||||    
29906686 atgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttgagattgaaca 29906588  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
29906587 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgct 29906488  T
629 ttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaa 724  Q
    ||  |||||| | |||  |||||||||| ||||||| ||||||| |  || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
29906487 tttgagaatcaaatttagcagagttttgacgctttt-aacttgtgttgatatctctat-aaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaga 29906390  T
725 gagacgttgaga-taatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaa 823  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |    
29906389 gagacgttgagattctttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaagga 29906291  T
824 ttagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtg 923  Q
    | |  ||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||    
29906290 tcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaaat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtg 29906192  T
924 gttgtacactt 934  Q
    |||||| ||||    
29906191 gttgtaaactt 29906181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 198 - 934
Target Start/End: Original strand, 2245857 - 2246601
Alignment:
198 gagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttc 295  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |  || | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
2245857 gagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagagcagagaaaa-aggaagagagacacaagcaattatcatggttccttc 2245955  T
296 cacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatga 389  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||    
2245956 cacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctcaag-tatga 2246054  T
390 gacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
2246055 gacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 2246152  T
489 tgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-ga 586  Q
    | |||||||| |  |||| ||||    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
2246153 taatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaaga 2246252  T
587 atttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctat 683  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||      
2246253 atttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttg 2246351  T
684 cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccac 782  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
2246352 ccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccac 2246450  T
783 cagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtct 882  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||    
2246451 cagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttatgcaggcagagctgttgtct 2246549  T
883 tgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
2246550 tgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacactt 2246601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 332 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 16671766 - 16671163
Alignment:
332 caaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||    
16671766 caaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctctaaa-tgctcaagcacacaggcgagagacttcc 16671668  T
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || |||| |||||  ||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||    
16671667 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacatgcgagaggcttcttttcaaacaaaaatacagagaaa-atgtttgatttgaaca 16671569  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16671568 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgct 16671469  T
629 ttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaag 725  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
16671468 ttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgtgaaag 16671370  T
726 agacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatt 825  Q
    ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
16671369 agatgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagaatc 16671271  T
826 agcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 925  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||    
16671270 aacttcaaattcattcacatcttgaaggaaca-attctacaggcagagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaagagaaaagtagtggaggtagtggt 16671172  T
926 tgtacactt 934  Q
    |||||||||    
16671171 tgtacactt 16671163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 29934393 - 29933559
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
29934393 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgct 29934294  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag-ttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||| |||||| | |  ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||     
29934293 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaatagagtagagagaagaaagaga--gacacgagcaaattatcctggatccttccacaaa 29934196  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
29934195 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaa 29934096  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
29934095 a--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttccaatcaaaca 29933998  T
499 aagatacagagaattaagttt-gacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaaga 596  Q
    ||  |||| ||||  | |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
29933997 aaattacacagaa-aatgtttgggattgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaaga 29933899  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct-tatcttcaa 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||  |||||||||| ||||||| ||||||| | | | ||| | |  ||||||||    
29933898 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgctttt-aacttgtgtttatatctctgtaaatcttcaa 29933800  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcct 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| |  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |    
29933799 gtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagactttgagattctttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatctt 29933701  T
793 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat-tagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgta 891  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||  |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
29933700 ttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcgaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctattgtcttgtcttgta 29933602  T
892 gcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29933601 gcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29933559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 29983547 - 29982713
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
29983547 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgct 29983448  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag-ttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||| |||||| | |  ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||     
29983447 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaatagagtagagagaagaaagaga--gacacgagcaaattatcctggatccttccacaaa 29983350  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
29983349 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaa 29983250  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
29983249 a--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttccaatcaaaca 29983152  T
499 aagatacagagaattaagttt-gacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaaga 596  Q
    ||  |||| ||||  | |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
29983151 aaattacacagaa-aatgtttgggattgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaaga 29983053  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct-tatcttcaa 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||  |||||||||| ||||||| ||||||| | | | ||| | |  ||||||||    
29983052 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgctttt-aacttgtgtttatatctctgtaaatcttcaa 29982954  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcct 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| |  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |    
29982953 gtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagactttgagattctttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatctt 29982855  T
793 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat-tagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgta 891  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||  |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
29982854 ttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcgaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctattgtcttgtcttgta 29982756  T
892 gcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29982755 gcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29982713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Original strand, 28168811 - 28169315
Alignment:
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaac 528  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||    
28168811 aatgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaaa-atgtttgaccttgaac 28168909  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaa-tacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
28168910 acttgatatacaatcagtagtgttcacaaatacaatgcaataaaaactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtg 28169009  T
627 ctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
28169010 ctttgtagaatcaaattgacagggttttggcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcccttatatagaggtgtgaaaga 28169109  T
727 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 826  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
28169110 gacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcatttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 28169208  T
827 gcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
28169209 gcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 28169307  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
28169308 gtacactt 28169315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 29948149 - 29947346
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
29948149 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 29948050  T
235 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag-ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||  | ||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
29948049 gcggaataaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 29947952  T
332 caaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||    
29947951 caaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttc 29947854  T
430 caatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaa 527  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||| ||||  | ||||||  |||||    
29947853 caatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttgagattgaa 29947755  T
528 cacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
29947754 cacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtg 29947655  T
627 ctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-a 722  Q
    ||||  |||||| | |||  |||||||||| ||||||| ||||||| |  || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
29947654 cttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgctttt-aacttgtgttgatatctctat-aaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagta 29947557  T
723 aagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaag 821  Q
     ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
29947556 gagagacgttgagattctttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaag 29947458  T
822 aattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtag 921  Q
     || |  ||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||    
29947457 gatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaaat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtag 29947359  T
922 tggttgtacactt 934  Q
    |||||||| ||||    
29947358 tggttgtaaactt 29947346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 29997303 - 29996500
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
29997303 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 29997204  T
235 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag-ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||  | ||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
29997203 gcggaataaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 29997106  T
332 caaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||    
29997105 caaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttc 29997008  T
430 caatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaa 527  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||| ||||  | ||||||  |||||    
29997007 caatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttgagattgaa 29996909  T
528 cacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
29996908 cacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtg 29996809  T
627 ctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-a 722  Q
    ||||  |||||| | |||  |||||||||| ||||||| ||||||| |  || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
29996808 cttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgctttt-aacttgtgttgatatctctat-aaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagta 29996711  T
723 aagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaag 821  Q
     ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
29996710 gagagacgttgagattctttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaag 29996612  T
822 aattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtag 921  Q
     || |  ||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||    
29996611 gatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaaat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtag 29996513  T
922 tggttgtacactt 934  Q
    |||||||| ||||    
29996512 tggttgtaaactt 29996500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 159 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 11206850 - 11206408
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
11206850 aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcaatttgagaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 11206751  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11206750 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 11206652  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
11206651 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacatacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 11206552  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
11206551 ctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 11206452  T
558 tacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
11206451 tacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgta 11206408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 108 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 14322521 - 14321962
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   |  || ||||    
14322521 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagttttggaatgct 14322422  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
14322421 tctaatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagaacaaatcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatc 14322323  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
14322322 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaactatgagacttctcaaaa-t 14322224  T
404 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| ||    
14322223 gctcaaccacacaggcaagagtcttctaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggctagaggcttctgttcaaacaaaaat 14322124  T
504 acagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc-aatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgta 600  Q
    ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
14322123 acagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgta 14322025  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 663  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
14322024 tcaaatcagagcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttt 14321962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 110 - 934
Target Start/End: Original strand, 14580541 - 14581372
Alignment:
110 aaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      | ||||| |||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
14580541 aaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttttaaaatccttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 14580640  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||      
14580641 tctgatgtgatgttcagaataagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcagttatcctggttccttccacaatc 14580738  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta------taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
    ||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||| |||||      ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
14580739 cggaagtagtcta----cccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctcacagattacaactgctcaatactttcaag-tatgagacttc 14580833  T
396 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc--aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat 492  Q
     ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  |    
14580834 tcaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctatt 14580931  T
493 caaacaaagatacagagaat-taagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagactttgaatt 589  Q
    |||||| |  |||| ||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  |    |||||    
14580932 caaacagaattacacagaaaatatgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctcta----gaatt 14581027  T
590 tctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagttt-gacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttat 688  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| || ||| | ||||||||  |||||||| |||||||  |||||||| |||| |    
14581028 tctaagatatatcaaatcagtgaagaaattcaaagtgcttttgagaaacaattttggcagagtttgtgcgctttt-aacttgtg-atgtctctctcttgt 14581125  T
689 -cttcaagtcttcact-cctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagt 786  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
14581126 tcttcaagtcttcacttcctttatatggaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagt 14581224  T
787 agtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtc 886  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||    
14581225 aatcttttgcctgatttggatgaagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaaattctgcaggtagagctgttgtcttgtc 14581324  T
887 ttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
14581325 ttgtagcgtggacaagaacagggtagtggaggtagtggttgtacactt 14581372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 138 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 14258867 - 14258416
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
14258867 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 14258768  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
14258767 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacataagcagttatccttgttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14258669  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
14258668 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctgaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttcca 14258570  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaga-tacagagaat-taagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||  ||  |||||||||||||    
14258569 atgctcaagcactaagcaggagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaaatatctttgacttgaaca 14258470  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
14258469 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactt 14258416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 108 - 565
Target Start/End: Original strand, 4433164 - 4433624
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||   ||| |||||||   ||  | ||    
4433164 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttgagaagcagtttggaaatg 4433262  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||     
4433263 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcttggttccttccacaaa 4433361  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
4433362 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 4433461  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
4433462 -tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 4433560  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatac 565  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
4433561 atacagggaaatatgtttgacttgaacacttcatatacaatcagtggtgttcacaatacaatac 4433624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 561 - 934
Target Start/End: Original strand, 4456776 - 4457149
Alignment:
561 aatacaataaagactctagactttg--aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcg 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
4456776 aatacaataaagactctagactttgtgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcg 4456875  T
659 cttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 758  Q
    ||||| ||||||||| | ||| | |    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||     
4456876 ctttttaacttgtatctctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatataggcgtgaaagagacattgagatgaatagcacgtctaaagagtt 4456975  T
759 gtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 858  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
4456976 gtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaacat 4457074  T
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4457075 -ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4457149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 159 - 462
Target Start/End: Original strand, 8784729 - 8785034
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8784729 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 8784828  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
8784829 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aag 8784927  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagac 455  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
8784928 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagac 8785027  T
456 ttctaat 462  Q
    |||||||    
8785028 ttctaat 8785034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 403 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15663240 - 15662706
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |     
15663240 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaa 15663141  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgta 600  Q
     |||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||    
15663140 ttacacagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaatacagactctagacttaagaatttctaagatata 15663041  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtc 697  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| |  |  |||||||||||    
15663040 tcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctgtttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtcttttgccaatcttcaagtc 15662942  T
698 ttcactcctttatatagaggtg-tgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    ||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
15662941 ttcactcctttatatagtggcgactagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagggtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgc 15662843  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| || ||||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |    
15662842 ctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctattttgaagg-aaaaattctgtaggcagagctgttgtcttttcttgtagcgag 15662744  T
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||    ||| || |||||||||||||||||||||||    
15662743 gacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 15662706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 53056902 - 53056598
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||    
53056902 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctcttt-gaagaacaagcatcc 53056804  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
53056803 aatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgatgttgaatccattaaacagcttttgaaacctta 53056704  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagc 1179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||    
53056703 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctagtgatttttggcttctgataaacttgtttttgatgaactaacttctgatgacgtcaccacttcaggagc 53056604  T
1180 actttg 1185  Q
    ||||||    
53056603 actttg 53056598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 405 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15651603 - 15651071
Alignment:
405 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |  |    
15651603 ctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaaggactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagagacttctaatcaaacagaatt 15651504  T
504 acagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatc 602  Q
    ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
15651503 acacagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaatacagactctagacttaagaatttctaagatatatc 15651404  T
603 aaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||| |  |  |||||||||||||    
15651403 aaatcagtgcagaaattcaaagtgctgtttagaatcaaatttggcagagttttggcactttt-aacttgtgttgatgtcttttgccaatcttcaagtctt 15651305  T
700 cactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||  || | | | |||||| |||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||    
15651304 cactcctttatataatggcgagtagagagacattgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcct 15651206  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| || ||||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
15651205 gatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctattttgaagg-aaaaattctgtaggcagagctgttgtcttttcttgtagcgagga 15651107  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||    ||| || |||||||||||||||||||||||    
15651106 catgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 15651071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 218 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31114712 - 31113987
Alignment:
218 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 315  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
31114712 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtcca 31114615  T
316 gtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaa 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||  ||  |||||||    
31114614 gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcaataa--tgctcaa 31114518  T
410 gcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacaga 508  Q
    |||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| |    
31114517 gcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacaca 31114418  T
509 gaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaa 604  Q
    |||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
31114417 gaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaa 31114318  T
605 atcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttg-tat-atgtctctatcttatcttcaagtcttca 701  Q
    || |   ||||||||||  |||||||  |||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||  || |||||||||||||||    
31114317 attaacacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaattttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttataatgtctct-cctgatcttcaagtcttca 31114220  T
702 ctcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||    | |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || || || || ||||| ||    
31114219 ctcctttttatagaggtgtgtagagaaacgttgagacctttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagaacctttgatcattcaacattaatcttttgcttg 31114121  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||  |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||    
31114120 atttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaaaccattcctaacttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgcagac 31114022  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||    
31114021 acaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 31113987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 138 - 440
Target Start/End: Original strand, 13601666 - 13601973
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
13601666 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttttgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 13601765  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
13601766 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 13601864  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
13601865 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 13601964  T
432 atgctcaag 440  Q
    |||||||||    
13601965 atgctcaag 13601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Original strand, 29855393 - 29855698
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||    
29855393 tcttgtcttgtagcagagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgcttttt-gaagaacaagcatcc 29855491  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcc-agtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctt 1078  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
29855492 aatgccttcaaattctttcaaactagccgttgcttcactttttttagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagtctt 29855591  T
1079 aagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
29855592 aagttgcatcccatgatgaactgcaggttttggtgatttttggcttccgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgacgtaaccacttcagaag 29855691  T
1179 cactttg 1185  Q
    |||||||    
29855692 cactttg 29855698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 460 - 934
Target Start/End: Original strand, 21735868 - 21736344
Alignment:
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| | ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
21735868 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaattacacaaaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcggtggtgttcacaata 21735967  T
560 caatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttgg 656  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  |||| |||||||| ||    
21735968 caatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagtttggg 21736067  T
657 cgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaa 753  Q
    ||||||| ||||||| |  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||||    
21736068 cgctttt-aacttgtgttgatatctctat-tgatcttcaagtcttcactcctttaaatagtggtgagtagagagacgttgagatctttagcacgtctaaa 21736165  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    | |||||| ||  ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||  ||    
21736166 gtgtcgtt-gagttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtggg 21736264  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
21736265 aaca-attctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 21736344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 694 - 1162
Target Start/End: Original strand, 2784862 - 2785330
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
2784862 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 2784959  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| | | ||||   |||| || |  ||||||| |||||||||   ||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
2784960 atttgcctgatatggttattgtccaaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattct-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 2785058  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
2785059 tagcagagacaaat-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttca 2785157  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||     
2785158 aatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaagttgcatct 2785257  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 1162  Q
    | ||||||||| || |||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2785258 cctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctaataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 2785330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 51989888 - 51989144
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||| ||||  || ||||||| | |||||||||| | |  |||||||||| |||| ||| ||||||||||    
51989888 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcaacggagtaaaaacagagtaaagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactgattccttccac 51989791  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagac 392  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||| | ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||    
51989790 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcatacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagac 51989692  T
393 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga 491  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||  |  |||||||||||| |    
51989691 ttcacaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaaacaagagacttctaa 51989594  T
492 tcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaa 587  Q
    ||||||| |  |||| || |    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||    
51989593 tcaaacagaattacacagtaaattgtttgagtttgaacacttgatatactatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaa 51989494  T
588 tttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tatgtctctat- 683  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||| | |||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| | ||| |     
51989493 tttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtat-tgtctttg 51989396  T
684 cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatcca 781  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   |    
51989395 ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaata 51989297  T
782 ccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt- 880  Q
    ||| |  || ||| |||||||||| ||| ||||| | |||||| |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |     
51989296 ccaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctataaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttttt 51989198  T
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
51989197 cttgtcttgtagcgtagacacaaacagattcgtggaggtagtggttgtacactt 51989144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 694 - 1158
Target Start/End: Original strand, 33583027 - 33583492
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| || |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
33583027 agtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttga-atttccaggacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 33583124  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||||||||||| | |||||||||    
33583125 ctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtcttg 33583223  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
33583224 tagcagagacaaaat-agagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttca 33583322  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaat-ccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
33583323 aatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctacaatccttagacaaggttgaatcccataaaacaacttttgaagccttaagttgcatc 33583422  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 1158  Q
    |  ||||||||| || ||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
33583423 ctctgatgaactacaacttttggtgatttttagcttctgatagacttgcttctgatgaactcgcttctga 33583492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19121643 - 19121370
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
19121643 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 19121544  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
19121543 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19121445  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgct 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||    
19121444 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgct 19121370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 203 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 15194772 - 15194516
Alignment:
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
15194772 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagtagaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 15194674  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
15194673 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttcctaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 15194574  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttc 458  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
15194573 aatgctcaagcacacacacaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttc 15194516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 706 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18851919 - 18851693
Alignment:
706 tttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgg 805  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
18851919 tttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgg 18851821  T
806 gtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaac 905  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18851820 gtgtagtcctttaaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attttgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaac 18851722  T
906 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
18851721 agagtagtggaggtagtggttgtatactt 18851693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 159 - 401
Target Start/End: Original strand, 33650661 - 33650901
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
33650661 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgaatgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 33650757  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33650758 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 33650857  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
33650858 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 33650901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 138 - 377
Target Start/End: Original strand, 11530232 - 11530474
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
11530232 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 11530328  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11530329 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 11530428  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
11530429 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 11530474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 201 - 459
Target Start/End: Original strand, 28168611 - 28168870
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
28168611 tgcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaaacga-gacacaagtagttatcctggttccttccaca 28168709  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
28168710 aatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 28168809  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 459  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
28168810 aaatgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttct 28168870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 901 - 1162
Target Start/End: Original strand, 14955432 - 14955692
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
14955432 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttcaaatactttcaa 14955530  T
1001 aatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaact 1100  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| | |||||||||    
14955531 aatagttgttgctttacctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgagttacatctcctgatgaact 14955630  T
1101 gcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 1162  Q
    ||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14955631 gcaacttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 14955692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 694 - 1161
Target Start/End: Complemental strand, 24775895 - 24775427
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| |  ||   ||||||||||| || | ||||||||  ||||| |  |     
24775895 agtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttga-atttccagcacattcaaaatagagtcgtttg-aagcttttgatcaatcaccaatgatt 24775798  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    |||||||| || | | | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
24775797 ctttgcctaatat-gttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttacttgtcttg 24775700  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| |||  ||||| |||||| ||||    
24775699 tagcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagc-tctttgaagaataagcattcaatgccttca 24775601  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||     
24775600 aatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatct 24775501  T
1090 catgatgaact--gcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    | |||||||||  |||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
24775500 cctgatgaactgcgcagcttctggtgattctcagcttgtgataaacttggttctgatgaactggcttctgatga 24775427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 152; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 268 - 930
Target Start/End: Original strand, 22150605 - 22151280
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 362  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
22150605 agacacatgcaattatactggttcctttcacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 22150704  T
363 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||      
22150705 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggaaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 22150802  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
22150803 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaaaa 22150902  T
560 caatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt---tgtagaatcagtttgacagagt 651  Q
    |||| ||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  ||||||   |||  ||  | |||| ||||||    
22150903 caatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgcttttgtgtgaaacaaatttggcagagt 22151002  T
652 tttggcgcttttgaacttgtatatgtc-tctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtc 749  Q
    || ||||||||| ||||||| | | || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   | ||||||||    
22151003 ttgggcgctttt-aacttgt-tgtctcttctctctgatcttcaagttttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtc 22151100  T
750 taaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatctt 848  Q
     | ||||||||| |||||  |||||||||  || || |  || |||||||||||||| ||| ||| | ||||| || |  ||||||| |||||| |||||    
22151101 aatagagtcgttgtgaaa--ctttgatcaaacagcaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcacgttcaaatccattcctatctt 22151198  T
849 gaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||| | |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||    
22151199 gaaagaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagaatcgtggaggtagtggttgtac 22151280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 829 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 24775760 - 24775388
Alignment:
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
24775760 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttacttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttg 24775662  T
928 tacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagta 1027  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || |||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
24775661 tacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctcttt-gaagaataagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtc 24775563  T
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgc--agcttctgatgatttttggcttc 1125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  |||||||| ||||| |  ||||     
24775562 ttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcgcagcttctggtgattctcagcttg 24775463  T
1126 tgataaacttg---------------cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||               |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
24775462 tgataaacttggttctgatgaactggcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcagaagcactttg 24775388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 201 - 931
Target Start/End: Original strand, 41045034 - 41045778
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||| || |||||||| ||    
41045034 tgcttctgatgtattgttcagaatcagatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatactagttccttctac 41045131  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgaga 391  Q
    ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||    
41045132 aaactggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 41045231  T
392 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctg 490  Q
    |||||||||  || |||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||   | |||||||||||||     
41045232 cttcacaaa--tgttcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttcta 41045329  T
491 atcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt- 584  Q
    |||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||      
41045330 atcaaacagaattacacagaaagttgtttgagtttgaacacttgatatactattggtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaa 41045429  T
585 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tat-gtctc 680  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    |||||||||  |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||  |||||||| |||||||  ||| |||||    
41045430 gaatttctaagatatatcaaatcaacatagaaattcaaagtgctttgtatgaaacaaatttggcagagtttgagcgctttt-aacttgttgtattgtctc 41045528  T
681 tatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaa-gagtcgtttgaaatcctttgatca 777  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| ||| |||| |||   || |||| |||||    
41045529 tat-tgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaaagagttgttgagaaacctt-gatca 41045626  T
778 tccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgt 877  Q
       |||| |  |  ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
41045627 at-accaattattttttgcatgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgt 41045724  T
878 tgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    | |||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
41045725 tatcttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 41045778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 693 - 1185
Target Start/End: Original strand, 28581902 - 28582396
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
28581902 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 28581999  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||| | ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||| ||    
28582000 cttttgcctgctatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtttt 28582098  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||  |     
28582099 gtaccagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccatt 28582197  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt--tgca 1086  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||   |||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||  ||||    
28582198 aaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgca 28582297  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    || | ||||||| |  |||||||| |||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
28582298 tctcctgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctaatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 28582396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 693 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 20627795 - 20627358
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |   |||||| |  |||   ||||||||||||    ||||||||  ||||| |      
20627795 aagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttgtgaattgccagcacattcaaaacagagtcgtttgaaga--tttgatcaatcaccaatga 20627698  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    || |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| || |||| | ||| |||    
20627697 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagttgtttttcttatct 20627599  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    ||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||| ||    
20627598 tgtagcagagataaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gataaacaagcatccaatgcctt 20627500  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcat 1087  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
20627499 caaatccattcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaagttgcat 20627400  T
1088 cccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    | | |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
20627399 ctcctgatgaactgcaacttctggtgattttcagcttctgat 20627358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 882 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 46350018 - 46349715
Alignment:
882 ttgtcttgtagcgtggacaaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    ||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | || | ||| |||| ||||||||    
46350018 ttgtcttgtagcagagacaaagaacatagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatg-ttctctgaagaacaagcatcca 46349920  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||| ||| || | ||||||||| |||||    
46349919 atgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaa 46349820  T
1081 gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||| || | |||||||||||| |||||| |||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
46349819 gttgcttctcctgatgaactgcaacttctggtgattttcagcttctaatgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgacgtcaccacttcaggagca 46349720  T
1181 ctttg 1185  Q
    |||||    
46349719 ctttg 46349715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 163 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35579193 - 35579002
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
35579193 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 35579097  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35579096 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 35579002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 132; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 266 - 915
Target Start/End: Original strand, 49989618 - 49990280
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-ga 359  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
49989618 aaagacacagacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 49989717  T
360 ttacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagactt 457  Q
    |||||| |||||||||||   |  | ||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
49989718 ttacaattgctcaatactgcacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 49989814  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    |  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| | ||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
49989815 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 49989914  T
557 atacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacag 648  Q
    ||||||| |||   |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   |||||||   ||  ||  |  ||  |||    
49989915 atacaatgcaaataaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaaattagcag 49990014  T
649 agttttggcgcttttga-acttgtatatgtctc-tatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagca 745  Q
    ||||| |||||||||   ||||||   |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||    
49990015 agtttgggcgctttttttacttgt---tgtctcatgtctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagca 49990111  T
746 cgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 844  Q
    |||| | ||||||||| |||||  |||||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |    
49990112 cgtcaatagagtcgttgtgaaa--ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattccta 49990209  T
845 tcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtgg 915  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
49990210 tcttgaaggaacat-ttctgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataagcagagtagtgg 49990280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 355
Target Start/End: Original strand, 13076293 - 13076547
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||   |||||     
13076293 tgaaggtgagaaaaacacaagaaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaactttagaagcagtttgtgaa 13076392  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
13076393 tgcttctaatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaggcagagaaaagaaaggcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccaca 13076491  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 355  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13076492 aaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 13076547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 693 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 47405784 - 47405348
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||  || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
47405784 aagtcttcactcctttatatagaggtatgaaagagacgttgtgaattgtcagcatatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 47405687  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| || |||||||| ||||||| | ||||||||    
47405686 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 47405588  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||| || |||| | |||| ||||| |||    
47405587 gtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttt-gaagaacaaacatcaaatgccttc 47405489  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||    
47405488 aaatcctttcaaactagttgttgcttcatttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttatgttgcatc 47405389  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
47405388 tcgtgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgat 47405348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 268 - 737
Target Start/End: Original strand, 17006553 - 17007035
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 362  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
17006553 agacacaagcgattatactggtttcttccacaaactggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 17006652  T
363 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||     
17006653 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctt 17006750  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
17006751 atgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 17006850  T
560 caatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatc-agtttgacagagtt 652  Q
    ||||  |||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  |||||||||  ||| | | |||| |||||||    
17006851 caatgaaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgtgtgaaacaaatttggcagagtt 17006950  T
653 ttggcgcttttgaacttgt--atatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 737  Q
    | ||||||||| |||||||     ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
17006951 tgggcgctttt-aacttgttgtcttgtctct-tatgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttgagat 17007035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 125; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7609105 - 7608861
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |    
7609105 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaat 7609006  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
7609005 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcaacggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 7608907  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 346  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7608906 atcggaagtactccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 7608861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 15663570 - 15663183
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||   |||||||| |    |  || |||    
15663570 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttctctctaaaaattcttcttctggtatcacttcagaaacgggttaggaatgc 15663472  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
15663471 ttctgatgtgatgttcagaatcagataagcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagata--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 15663374  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
     | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||     
15663373 tgaaagtagaccagtcccccttgcactttcaaggagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttct 15663275  T
397 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 489  Q
    ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||    
15663274 caaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 15663183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Original strand, 11223548 - 11223812
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| || |||| |||||||    
11223548 tcttgtcttgtagcagagacaaaa-cagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatcc 11223645  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||   |    
11223646 aatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatgcatagacgagattgaacccattgaacagcttttgaagctcaa 11223745  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
11223746 agttgtatctcctgatgaactgctgcttctggtgattttcagattctgatgaacttgcttctgatga 11223812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 769 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 16391780 - 16391615
Alignment:
769 ctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcagg 868  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
16391780 ctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtactcatttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagggtacacattctgcagg 16391681  T
869 catagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
16391680 catagctgttgttttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtatactt 16391615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 766 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 16666295 - 16666128
Alignment:
766 atcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgc 865  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
16666295 atcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcacatcttgaaggaaca-attctgc 16666197  T
866 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
16666196 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 16666128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 431 - 931
Target Start/End: Original strand, 27172565 - 27173063
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagataca-gagaattaagtttgac-ttgaa 527  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||| |  |||| || ||||  ||||||| |||||    
27172565 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaacagaattacaagaaaatt--gtttgacgttgaa 27172662  T
528 cacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||    
27172663 cacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatgcaataaaagactctcta----gaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtg 27172758  T
627 ctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgt-atatgtctctatcttatcttcaagtcttcact-cctttatatagaggtgtgaa 723  Q
    ||||  |||| ||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| || | | |    
27172759 cttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgatatgtctctacca-atcttcaagtcttcacttcctttatataggggagagta 27172856  T
724 -agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaag 821  Q
     ||||||||||||||  ||  ||||   || |||||||||   || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||    
27172857 gagagacgttgagattttcttgcac---tatagagtcgttgagaaacctttgatctttcaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctttgaag 27172953  T
822 aattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagag-tagtggaggta 920  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||     
27172954 aattaacttcaaattcattcctatcttgaaagaaca-aatctgcaggcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagagttcgtggaggtc 27173052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Original strand, 2560984 - 2561439
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaaga--gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || ||| |  ||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
2560984 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataaagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 2561081  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||  || |  |||||||||||||||||  |||||| ||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||    
2561082 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggtagagctgtttttcttgtctt 2561180  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||   |||    
2561181 gtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacg-atctttgaagaacaagcatccaatttcttc 2561279  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  |||||    
2561280 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 2561379  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    || | |||||||||  |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||    
2561380 tctcctgatgaactagagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatga 2561439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 880 - 1129
Target Start/End: Original strand, 47207690 - 47207939
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||    
47207690 tcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaagaacaagcatcc 47207788  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat-ctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctt 1078  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || | | |||||||  ||    
47207789 aatgccttcaaatcatttcaaactagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttt 47207888  T
1079 aagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
47207889 atgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgat 47207939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 829 - 1129
Target Start/End: Original strand, 40799807 - 40800106
Alignment:
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
40799807 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 40799905  T
928 tacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagta 1027  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| || ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
40799906 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagtatccaattccttcaaatactttcaaactagtcgttgcttcgcttttccagtc 40800004  T
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctg 1127  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
40800005 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttatgatgcatctcttgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctg 40800104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 289 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18857580 - 18857426
Alignment:
289 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatg 388  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
18857580 ttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatg 18857481  T
389 agacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 444  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
18857480 agacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact 18857426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 918 - 1185
Target Start/End: Original strand, 50300245 - 50300490
Alignment:
918 gtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcac 1017  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||    
50300245 gtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacatacatccaatgcgttcaaatcccttcaaa-tagcagttgcttcac 50300343  T
1018 ttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgattt 1117  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||                     ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
50300344 ttttccagtcttctgcaatccttagacga---------------------tttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgattt 50300422  T
1118 ttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
50300423 ttaacttatgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttg 50300490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 880 - 1112
Target Start/End: Original strand, 5213562 - 5213791
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||  ||  ||||||     
5213562 tcttgtcttgtagcatagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactacgtcaacgctttt--gaataataagcatct 5213658  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||    
5213659 aatgccttcaaatccttccaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttatacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttta 5213758  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgat 1112  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
5213759 agttgcatctcctgatgaactacagcttctgat 5213791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 18121797 - 18121491
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||| || |||  ||||| |    
18121797 tcttgtcttgtagcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctcttt-gaagaaaaagcattc 18121699  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  | | ||||| ||||||||||| || | | |||||||| |||    
18121698 aatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttta 18121599  T
1080 agt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    | |  |||||| | |||||||||  |||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |    
18121598 aatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttatgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatgatgtcaccacgtcagga 18121499  T
1178 gcactttg 1185  Q
    ||||||||    
18121498 gcactttg 18121491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15651935 - 15651568
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||   ||| ||||||    |  || ||||    
15651935 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttctctctaaaaattcttattctggtatcactttagaagcgggttaggaatgct 15651836  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    |||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |    
15651835 tctgatgtgatgttcagaatcaaataagcagcggaataaaacagatcagagaaaagaaagata--gacgcaagcaattatcctggttccttccacaaacc 15651738  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 397  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |    
15651737 ggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctc 15651639  T
398 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaag 469  Q
    |||  |||||||||||  | || |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
15651638 aaa--tgctcaagcacgtaggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaag 15651568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 880 - 1114
Target Start/End: Original strand, 22140748 - 22140981
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||    
22140748 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatcc 22140846  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||  ||||||  | |||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||| |||| |||||||| || || |||||||||| | |||    
22140847 aatgttttcaaaacccttcaaaatagtcgttggttcacttatctagtcttctgcaatccttaggcgagtttgaatccgttgaacagcttttgaaacttta 22140946  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
22140947 agttgcatctcctgatgaactgtagcttctgatga 22140981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 694 - 1185
Target Start/End: Original strand, 21640664 - 21641154
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
21640664 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 21640761  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||   ||||||   |||||  ||||  | || ||||| ||||||| | |||||||||    
21640762 ctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaagaaacattgt-tggaggcagagctgttattcttgtcttg 21640860  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||  ||  |||||||||||| ||      
21640861 taaaagagacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaaaaataagcatccaatgcttttc 21640959  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||     
21640960 aatccttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctacaatc-ttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggctttaagttgcatct 21641058  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
21641059 cctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttatgctgaacttgcttctgatgatgtcatcactttatgagcactttg 21641154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 431 - 937
Target Start/End: Original strand, 10528871 - 10529387
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||    
10528871 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagtttgaac 10528970  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagt 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||      
10528971 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaattaacacagaaattcaaa 10529070  T
624 gtgctttgtag---aatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 718  Q
    |||||||  ||   ||  | |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
10529071 gtgcttttgagtgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtattgtctct-tctgatcttcaagtcttcactcctttatacagagat 10529168  T
719 gtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctt 816  Q
    ||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||| ||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| |||||     
10529169 gtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcattgagaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtccta 10529267  T
817 tgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtgga 916  Q
    ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
10529268 tgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtgga 10529366  T
917 ggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    |||||||||||||||||||||    
10529367 ggtagtggttgtacacttcgt 10529387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 881 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 21636844 - 21636550
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  ||||||||    
21636844 cttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatcca 21636746  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||         ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| | ||| |||| | || ||| | ||| |||||||||||| ||||    
21636745 atgcatt---------tcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaagctttaa 21636655  T
1081 gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||| || | | |||||||||||  |||||| ||||     ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
21636654 gttccaactcctgatgaactgccacttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagca 21636555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 693 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 49643125 - 49642634
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||| ||||||   |||||||||  ||||| || |    
49643125 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgcgaattgccagcacatcaaaatagagtcatttgaag--ctttgatcaatcaccaataat 49643028  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatct-tgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| || | || ||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||    
49643027 cttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattcc-atgtatgtaggaacattgt-tgcaggcagagctgttattcttgtct 49642930  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    ||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||   || ||| | |||||||||| ||    
49642929 tgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaag-aacaatcatccaatgcctt 49642831  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgc 1085  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||| ||| || | | |||||||| |||||  ||||    
49642830 caaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgc 49642731  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||| | ||||||||| || |||||| |||| ||  |||||| ||  |  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
49642730 atctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctaat-gagatgcttctgatgaccttgcttctgattgcgtcatcacttcaggagcactt 49642634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 274 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24393483 - 24393356
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
24393483 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcaatacaaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaa 24393384  T
374 tactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||    
24393383 tactttcaaagtatgagacttcacaaaa 24393356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27245182 - 27244975
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||| | |||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
27245182 tgaaggttataaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 27245085  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27245084 ctactgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 27244986  T
302 acggaagtagt 312  Q
    |||||||||||    
27244985 acggaagtagt 27244975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 403 - 1159
Target Start/End: Original strand, 51340509 - 51341266
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||   | |||||||||||||  ||||||| |     
51340509 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttctattcaaacagaa 51340608  T
502 atacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaaga----ctctagacttt-gaatttctaag 595  Q
     |||| | ||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||    ||||||||||| |||||||||||    
51340609 ttacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgagagactctctagactttagaatttctaag 51340708  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctc---tatcttatc 689  Q
    || |||||||| |   || ||||||   |||||||   ||  ||  | |||  |||||||||||||||||| || ||||   ||||||   | | |||||    
51340709 atatatcaaatgaacacaaaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaatttagcagagttttggcgctttt-aatttgt---tgtctcgtgtcttttatc 51340804  T
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagta 787  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |     
51340805 ttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagattcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatg 51340902  T
788 gtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtc 886  Q
     || |||||||||||||| ||| || || ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| | ||||||    
51340903 atcttttgcctgatttggttgttgtactatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttctgcgggcagagctgtttttcttgtc 51341001  T
887 ttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgt 986  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||| | ||||| | |  |||||||||||| |    
51341002 ttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt--------cgtactttgtcaacgc-tctttgaaggataagcatccaatgcct 51341092  T
987 tcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttc--cagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagct-tttgaagccttaagtt 1083  Q
    |||| | ||||||||  |  ||||||  ||||||||  |||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| | ||| |||    
51341093 tcaattcctttcaaatgaaccgttgc--cacttttcttcagtctttcgctttctttagacgaggttgaatccattaaacaactatatgaaactttaggtt 51341190  T
1084 gcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    |||||   ||||||||| ||| ||||  |||| |   ||||||||| || | |||||||||  |||||||||||||    
51341191 gcatcttctgatgaactacagtttctagtgatatacagcttctgatgaaatagcttctgatagacttgcttctgat 51341266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 102; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 694 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 49666767 - 49666286
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | |||||| |  ||||| |  ||    
49666767 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-atttccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgataaatcaccaatgatc 49666670  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||  | | ||| | ||||| || |  ||||||| | ||||||   |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
49666669 ctttgcctgatatgattattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 49666571  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||| || |||          |||  ||      
49666570 tagcagagacagaatcagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaatgctcttt-gaagaat---------atgtctttc 49666481  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||     
49666480 aatcctttcaaaatagtcgttgttatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatct 49666382  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||     ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
49666381 cctgatgaactgcagcttctggtgattcacaacttatgatgaaattgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 49666286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 880 - 1193
Target Start/End: Original strand, 6090716 - 6091028
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| || ||||| | |||| ||||| |    
6090716 tcttgtcttgcagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagc-tttttaaagaacaagcattc 6090814  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |  | | |||||||  |||    
6090815 aatgccttcaaatcctttcaaattagatgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagtttta 6090914  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
6090915 agtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgat-gagatgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcataacttcatga 6091013  T
1178 gcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||| ||||||||    
6091014 gcacttt-aacttcag 6091028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 563
Target Start/End: Original strand, 13953620 - 13953923
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 359  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
13953620 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 13953719  T
360 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagactt 457  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||    
13953720 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagactt 13953816  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    |  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
13953817 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 13953916  T
557 atacaat 563  Q
    |||||||    
13953917 atacaat 13953923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 606
Target Start/End: Original strand, 15832765 - 15833116
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 359  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
15832765 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 15832864  T
360 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 457  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
15832865 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 15832961  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    |  ||||||||| ||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
15832962 cctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 15833061  T
557 atacaatacaa--taaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaat 606  Q
    ||||||| |||   |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
15833062 atacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaat 15833116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 693 - 1174
Target Start/End: Original strand, 20645949 - 20646433
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||   ||||| ||||||   |||||||||  ||||| |      
20645949 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaataagagtcatttgaag--ctttgatcaatcaccaatga 20646046  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    || |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| ||||||||   || ||| ||||  | |||||||| | ||||| | |||||||    
20646047 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcagaactgttattcttgtct 20646145  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    ||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| | ||  | |||| |||||||||||| ||    
20646146 tgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgc-tcttcaaagaacaagcatccaatgcttt 20646244  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatag-cttttgaagccttaag--ttg 1084  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||  || |||| ||||  || |||||| |  ||| |||| || || ||||| |||| |||||  |||    
20646245 caaatcctttcaaaatagacgttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttg 20646344  T
1085 catcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    |||| | ||||||||| || |||||| |||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20646345 catctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 20646433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 863 - 1184
Target Start/End: Original strand, 52920372 - 52920693
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||   || |||||||||||| |    
52920372 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtatcagagacaaaaacagggtagtagaggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctct 52920471  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||  || ||| |||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
52920472 ttaaag-aacaagcatcaaatgccttcaaatacttt-aaattagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattga 52920569  T
1062 atagcttttgaagccttaagt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
      ||| |||||| | ||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||    
52920570 gcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctgat 52920668  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
52920669 gacgtcatcacttcaggagcacttt 52920693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 962 - 1146
Target Start/End: Original strand, 11869133 - 11869317
Alignment:
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||| |||||| ||||||    
11869133 tttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcacttttccagtcttctgtatttcttagacgagattgaattcattaa 11869232  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||    
11869233 acaaattttgaagccttaagttgcatcccctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaaattgcttctgatga 11869317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 897 - 1186
Target Start/End: Original strand, 15903199 - 15903489
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||   || |   ||||| |||||| ||||||| |||    
15903199 gacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatcctt 15903298  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatga 1094  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||  ||||||| | |||    
15903299 tcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcctga 15903398  T
1095 tgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    | || | |||||| || |||| ||  |||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15903399 taaattacagcttttggtgatcttcagcttctgat-gagatggttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 15903489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 693 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 49553852 - 49553428
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  ||| ||| || |||  |||||||||||    |||||||||  ||||| |  |    
49553852 aagtcttcactcctttatataggggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcaacacatcaaaatagagtcgtttgacg--ctttgatcaatcaccaatgat 49553755  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||| ||||  | ||||| || || |||| | | ||||||    
49553754 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcagacaaagttgtttttcctgtctt 49553656  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | | ||| |||| | |||||||||| |||    
49553655 gtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctctgaagaacaaacatccaatgccttc 49553557  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||| || || | |||||||||  |||||||| ||| |||| |||||| ||| |||||| | |||||  |||||    
49553556 aaatcctttcaaaatagtcactgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgca 49553457  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    || | ||||||||| | ||||||| ||||    
49553456 tctcctgatgaacttcggcttctggtgat 49553428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 828 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15216446 - 15216341
Alignment:
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
15216446 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 15216348  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
15216347 tacactt 15216341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 90; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 880 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 18142927 - 18142692
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||| || |||  ||||| |    
18142927 tcttgtcttgtagcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctcttt-gaagaaaaagcattc 18142829  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||    
18142828 aatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagcttta 18142729  T
1080 a--gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
    |   ||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
18142728 aatcttgcatctcctgatgaactagagcttctgatga 18142692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 90; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 693 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 38178006 - 38177568
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
38178006 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 38177909  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||| ||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||  |||| |||  |||||| ||||  | |||||||| || |||| | ||||||||    
38177908 cttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatcaattctcattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagttgtttttcttgtctt 38177810  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||| |||    
38177809 gtagcagagtcaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttaaagaacaagcatccaatgccttc 38177711  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |  | ||||||| || ||| |||| || | | |||||||| |||||  |||||    
38177710 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 38177611  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    || | | || ||||  ||||||||||||| ||  |||||||||    
38177610 tctcctaataaactagagcttctgatgatcttctgcttctgat 38177568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 46796560 - 46796287
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
46796560 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctct 46796461  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  || ||| |||||         |||||||| ||| |||||    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
46796460 tt-gaagaataagtatctaatgc---------ctttcaaattagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatcctttaa 46796372  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
46796371 acaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttcttgtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 46796287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 268 - 457
Target Start/End: Original strand, 27172428 - 27172622
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact------ataatcacaaagat 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| ||||    
27172428 agacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaatcaataatcacacagat 27172527  T
361 tacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 457  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
27172528 tacaactgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 27172622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 460
Target Start/End: Original strand, 10528665 - 10528931
Alignment:
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||| | | |||||||  |||| |||||||||  | ||||||| |||||||  | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
10528665 gcttctgatgagaagttcagaattggatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaagaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccaca 10528764  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagac 392  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||    
10528765 aaccggaagtagtccagtcccccttgaacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagac 10528864  T
393 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||| |||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
10528865 ttcataaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 10528931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 828 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12567376 - 12567271
Alignment:
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
12567376 cttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttg 12567278  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
12567277 tacactt 12567271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 266 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12753425 - 12752741
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 358  Q
    ||||||||| | | |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
12753425 aaagacacaggtaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 12753326  T
359 attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa-gagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || || ||||||    
12753325 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggaaagagact 12753229  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |    
12753228 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcattggtgttcac 12753129  T
556 aatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgaca 647  Q
    |||||||| |||   | |||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   |||||||   ||  ||  | |||  ||    
12753128 aatacaatgcaaatgatagactctttagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaatttagca 12753029  T
648 gagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctc-tatc----ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatc 741  Q
    |||||||||||||||  || ||||   |||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||   |     
12753028 gagttttggcgctttcaaa-ttgt---tgtctcgtatcacatttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagattcattgagatcttta 12752933  T
742 agcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 840  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||  | |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||  ||||    
12752932 agcacgtcaataaagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaatgatcacgttcaaagccatt 12752835  T
841 cccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||  |||||| |||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
12752834 cctattctgaaggaacat-ttttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagttgtggagatagtggtcgtacactt 12752741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 880 - 1173
Target Start/End: Complemental strand, 21605829 - 21605546
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||| |||  |||||||    
21605829 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatcc 21605731  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    |||||          |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| | ||| |||| | || ||| | ||| | |||||||||| |||    
21605730 aatgc---------atttcaaaatagtcgttgtcatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacaacttttgaagcttta 21605640  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 1173  Q
    |||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||      |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
21605639 agttccatctcctgatgaactgcaacttctggtgatacacaacttctgatgaacttgcttatgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttc 21605546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 902 - 1075
Target Start/End: Original strand, 41495005 - 41495177
Alignment:
902 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaa 1001  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
41495005 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 41495103  T
1002 atagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagc 1075  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| || ||| ||||||||    
41495104 atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagc 41495177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 880 - 1082
Target Start/End: Complemental strand, 12726405 - 12726204
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||| || |||  || |   |||||||    
12726405 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaag-agtaagcatcc 12726307  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||    
12726306 aatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagcttta 12726207  T
1080 agt 1082  Q
    |||    
12726206 agt 12726204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 907 - 1174
Target Start/End: Original strand, 13948347 - 13948614
Alignment:
907 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagt 1006  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
13948347 gagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 13948445  T
1007 cgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcag 1104  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||| ||| || | | ||||| || |||||  ||||||| | |||||| ||  ||    
13948446 cgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttag 13948545  T
1105 cttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    |||||| |||| ||  |||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
13948546 cttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 13948614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 864 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 14393196 - 14392869
Alignment:
864 gcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgctttt 962  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||    
14393196 gcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 14393097  T
963 ttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaa 1062  Q
       || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||  ||||||||| || |||||||| ||    
14393096 caaag-aacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaa 14392998  T
1063 tagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 1160  Q
     | | |||||| | |||||  ||| ||| | | ||||||| ||||||||  |||| ||  |||| ||||  |  ||||| |||||| |||||||||||||    
14392997 caacctttgaaactttaagtcttgtatctcctaatgaacttcagcttctagtgatctt--gcttttgat-gagatgcttatgatgatcttgcttctgatg 14392901  T
1161 acgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
14392900 acgtcatcacttcaggagcacttt-aacttcag 14392869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 789 - 934
Target Start/End: Original strand, 16476367 - 16476513
Alignment:
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 888  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
16476367 tcctgtgcctgtttggggtgtagtcctttgaaggataagcttcaaattcattcccatggtgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtctt 16476466  T
889 gtagcgtggacaa-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
16476467 gtagcgtagacaagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16476513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 218 - 429
Target Start/End: Original strand, 21735682 - 21735896
Alignment:
218 tcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
21735682 tcagaattagatatgcagcggaatgaaaacagagcaaagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca 21735779  T
316 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaa 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  |||||||    
21735780 gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaa 21735876  T
410 gcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||| || ||||||| ||||    
21735877 gcacgcaggcaagagacttc 21735896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 30054410 - 30054136
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtctt-gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |    
30054410 tgcaggcagagctgttatctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctct 30054311  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||  |||  |||| |||||||         |||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||| | | ||    
30054310 tttgttgaataagcacccaatgc---------ctttcaaagtagtcgttgctatacttttcaagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaattcttgaa 30054221  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | |||||||||||| || | ||||||| | |||||||||| || ||||| |||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
30054220 acagcttttgaagctttgaattgcatctcctgatgaactgaagtttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 30054136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 268 - 460
Target Start/End: Original strand, 17017389 - 17017586
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 362  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
17017389 agacacaagcgattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 17017488  T
363 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
17017489 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 17017586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 289
Target Start/End: Original strand, 30390729 - 30390883
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
30390729 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 30390825  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggt 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
30390826 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggt 30390883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 523 - 934
Target Start/End: Original strand, 13147885 - 13148304
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaa 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||    
13147885 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaa 13147984  T
618 -ttcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatata 713  Q
     ||||  |||||||   ||  ||  | |||| |||||||| ||||||||| |||||||     | ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
13147985 attcaaagtgcttttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtcttgtcactctgatcttcaagtcttcactcctttatata 13148083  T
714 gaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtag 811  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| |    
13148084 gaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttg 13148181  T
812 tcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagt 910  Q
    |||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||| |||  |  || |||    
13148182 tcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtatcgtagacgcacgcatagt 13148280  T
911 agtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||||||||||||||||    
13148281 cgtggaggtagtggttgtacactt 13148304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Original strand, 17960805 - 17961043
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      ||| || ||||||||||||||  |||||||||| |  || ||| |    
17960805 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctttaagaaatcttcttctgataagacttcagaagctatatgagagag 17960903  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaa 300  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |  |  |||||||||| || || ||||||||||||||||    
17960904 cttctgatgaactgttcagagtcagatatgcatcggaataaaacagagcagagaaaagaagatga--gacacaagcaatttatactggttccttccacaa 17961001  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 342  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17961002 tccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagattt 17961043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 863 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 1728208 - 1727896
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||     
1728208 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaatg-ttc 1728110  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||         ||||||||| ||||| || ||||| | ||| || |||||| ||  | |||| |||||||| | ||    
1728109 cttgaggaataagcatccaatgcttt---------tcaaaatagccgttg-ttaactttccaagtcttttgcaattttctggcgagattgaatccttgaa 1728020  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    | | |||||||| |  ||||||  ||| | ||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
1728019 acaacttttgaaactataagttcaatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttttgatgaactagcttctgatga 1727920  T
1162 cgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
1727919 cgtcatcactttagaagcactttg 1727896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 431 - 577
Target Start/End: Original strand, 17961073 - 17961223
Alignment:
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttct--aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaa 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||| |  ||| ||||||||    
17961073 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctcaaatgctcaagcacacaggcaagagacttctattcaaacaaaaatataaagaaattggttggacttgaa 17961172  T
528 cacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat-aaagactct 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
17961173 cacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaatgaaagactct 17961223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 687 - 934
Target Start/End: Original strand, 15833197 - 15833442
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||| | |  |||||||  |||||    
15833197 atcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaatagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgacacc--ttgatcaatcacca 15833294  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 883  Q
     |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  |||||||  ||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||    
15833295 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcaattcctat--tgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttctt 15833391  T
884 gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15833392 gtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15833442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 687 - 934
Target Start/End: Original strand, 15850800 - 15851048
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagc-acgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||  | | | ||||| | ||||||||| ||| | |  |||||||  |||||    
15850800 atcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagtcattgagatctttaaccacgtcaatagagtcgttgtgacacc--ttgatcaatcacca 15850897  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 883  Q
     |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| |||| || | |||    
15850898 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctggaggcagagctatttttctt 15850996  T
884 gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtgg-ttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
15850997 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtttgtacactt 15851048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 910 - 1146
Target Start/End: Original strand, 14969341 - 14969578
Alignment:
910 tagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgt 1009  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||    
14969341 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctattt-gaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgt 14969439  T
1010 tgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagctt 1107  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  ||||||  | | |||||||  |||||    
14969440 tgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagctt 14969539  T
1108 ctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||| |||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||    
14969540 ctggtgatcttcagcatctgatgaacttgcttatgatga 14969578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 693 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 30000955 - 30000464
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
30000955 aagtcttcactcctttatatagaggtgtggaagagacattgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 30000858  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |   |||||| ||||  | |||||||||||||||| || |||||      
30000857 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgttatccttgtcca 30000759  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||| || ||   || ||| |||||||||||| |||    
30000758 gtagcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttc 30000660  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgca-- 1086  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||  ||  || |||| ||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| ||||||  |       
30000659 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcg 30000560  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||   ||||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
30000559 tcttctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggt-gcttctgatgaacttgcttctgaagacgtcatcacttcaggagcactt 30000464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 881 - 1059
Target Start/End: Original strand, 37467318 - 37467495
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| ||||||||    
37467318 cttgtcttgtagcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcca 37467416  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt 1059  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||| ||| || ||||||||    
37467417 atgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccatt 37467495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 863 - 1047
Target Start/End: Complemental strand, 13780777 - 13780593
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |    
13780777 tgcaggcaaagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 13780678  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgag 1047  Q
    |   |  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||    
13780677 tcaaat-aacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgag 13780593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 686 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 45861942 - 45861693
Alignment:
686 tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaa-agagtcgttt-gaaatcctttgatcatccac 782  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||| || |||||||||  ||||||  |||||||  |||    
45861942 tatctttaagtcttgactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaaatagagtcgttcagaaatc--ttgatcaatcac 45861845  T
783 cagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtct 882  Q
    || |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |    
45861844 caatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttt 45861746  T
883 t-gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
45861745 ttgtcttgtagcgtagacataaacatagtagtggaggtagtggtcgtacactt 45861693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 863 - 1186
Target Start/End: Original strand, 31303352 - 31303679
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |     
31303352 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tc 31303450  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||  | |||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||  ||||||||| || ||| |||| |    
31303451 ttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattga 31303550  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttc---t 1156  Q
    | | | ||| |||| |||||  || |||| | |||  ||||  |||||||| |||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||||||||   |    
31303551 acaacctttaaagctttaagtctttcatctcctgagtaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgat 31303649  T
1157 gatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
31303650 gatgacgtcatcacttcaggagcactttga 31303679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 688 - 1001
Target Start/End: Complemental strand, 11909393 - 11909079
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccag 785  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||| || | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||     
11909393 tctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacatcaatagagtcgttctgaaaac--ttgatcaatcaccaa 11909296  T
786 tagtcctttgcctgatttgggt-gtagtcctttgaagaattagc-ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ct 882  Q
    |  || ||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |   ||||||| |||||| ||  ||| || |||| ||||||||||| ||||||| | ||    
11909295 tgatcttttgcctaatttgggttgttgtcctatgaaggatcaaagttcaaatccattcctattctgagggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttct 11909197  T
883 tgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaat 982  Q
    ||||||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||| | |  ||||||||||    
11909196 tgtcttgtaacatagacataaacaaagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgc-tctttgaaggataagcatccaat 11909098  T
983 gcgttcaaattctttcaaa 1001  Q
    || ||||||| ||||||||    
11909097 gccttcaaatcctttcaaa 11909079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 693 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 29951801 - 29951310
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |    ||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
29951801 aagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacattgtgaattgaaagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 29951704  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |   |||||| ||||  | |||||||||||||||| || |||||      
29951703 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgttatccttgtcca 29951605  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||| || ||   || ||| |||||||||||| |||    
29951604 gtagcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttc 29951506  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgca-- 1086  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||  ||  || |||| ||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| ||||||  |       
29951505 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcg 29951406  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||   ||||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
29951405 tcttctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggt-gcttctgatgaacttgcttctgaagacgtcatcacttcaggagcactt 29951310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 918 - 1082
Target Start/End: Original strand, 13824091 - 13824254
Alignment:
918 gtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcac 1017  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||    
13824091 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaaacatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagttgttgcttcac 13824189  T
1018 ttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt 1082  Q
    | ||||||| |||| || | |||||||||| || |||||||| || | | |||||||| ||||||    
13824190 tcttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagt 13824254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 488
Target Start/End: Original strand, 15848499 - 15848726
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 359  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  ||    
15848499 aaagacacagacaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagagtttcactaagtttaatcacaactga 15848598  T
360 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 457  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||    
15848599 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactt 15848695  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
       ||||||||||||  | ||||||||||||    
15848696 tctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 15848726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 270 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 11909840 - 11909492
Alignment:
270 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 362  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  || |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||    
11909840 acacaggcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 11909741  T
363 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||      
11909740 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagaaacttcctttgctcaagcccacaagcaagagacttcct 11909644  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgact-tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
11909643 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtgtgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaaca 11909544  T
560 caatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaat 606  Q
    |||| ||||  |||||  ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||    
11909543 caatgcaattgaaagactctctaaacttaagaatttctaagatatatcaaat 11909492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 897 - 1011
Target Start/End: Original strand, 16032526 - 16032639
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| || | ||  | |||| |||||||||||| ||||||| |||    
16032526 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgc-tcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 16032624  T
997 tcaaaatagtcgttg 1011  Q
    |||||||||||||||    
16032625 tcaaaatagtcgttg 16032639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 523 - 737
Target Start/End: Original strand, 17017620 - 17017841
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaa 617  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||    
17017620 ttgaacacttgatatacaatgagtggtgttcacaatacaatgaaattaaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgagcacagaaa 17017719  T
618 ttcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtata--tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatata 713  Q
    ||||  |||||||||  ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||     ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
17017720 ttcaaagtgctttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtcttgtctct-tatgatcttcaagtcttcactcctttatata 17017817  T
714 gaggtgtgaaagagacgttgagat 737  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
17017818 gaggtgtgagagagacgttgagat 17017841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 908 - 1082
Target Start/End: Complemental strand, 17239069 - 17238896
Alignment:
908 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtc 1007  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
17239069 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaag-aacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 17238971  T
1008 gttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt 1082  Q
    | ||||||||| |||  || |||||||||  ||||||||| || |||||||| |  ||| |||||||| ||||||    
17238970 gatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagt 17238896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 692 - 1016
Target Start/End: Complemental strand, 25398619 - 25398295
Alignment:
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||   |||||| || ||  |||||||||||||   |||||||||  ||||| |      
25398619 caagacttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttatgaattgccagcacatcaaagtagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatga 25398522  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtct 887  Q
    || |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  || |||| |||||| ||   || || ||||  | |||||||| ||||| || | ||||||    
25398521 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaattttaaatccattccaattgagagggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttattgtct 25398423  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| | ||||| || | |  || |||||| ||    
25398422 tgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgc-tctttgaagagcaaatatgcaatgcctt 25398324  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttca 1016  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
25398323 caaatcctttcaaaatagtcgttgcttca 25398295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40457099 - 40456960
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
40457099 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40457003  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacaca 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
40457002 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaca 40456960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 845 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 14321771 - 14321683
Alignment:
845 tcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14321771 tcttgaaggaacat-ttctgcaggaagagttgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14321683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 461
Target Start/End: Original strand, 37411992 - 37412193
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 358  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
37411992 aaagacacaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 37412091  T
359 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
37412092 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 37412188  T
457 tctaa 461  Q
    |||||    
37412189 tctaa 37412193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 45862362 - 45862162
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 358  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
45862362 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 45862263  T
359 attacaaatgctcaatact-atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 456  Q
    ||||||| |||||||||||   |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
45862262 attacaactgctcaatactgcacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagact 45862166  T
457 tcta 460  Q
    ||||    
45862165 tcta 45862162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 460
Target Start/End: Original strand, 13147650 - 13147851
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 359  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
13147650 aaagacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 13147749  T
360 ttacaa-atgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 456  Q
    ||||||  ||||||||||||  |  | ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |  || ||||||||| ||||||||||||    
13147750 ttacaacttgctcaatactacacctagtatgagactt--caaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttactttgatcaagcactaaagcaagagact 13147847  T
457 tcta 460  Q
    ||||    
13147848 tcta 13147851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 352
Target Start/End: Original strand, 27849590 - 27849668
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27849590 aagcaattatcctcgttccttccacaatccggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 27849668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 767 - 900
Target Start/End: Original strand, 17961419 - 17961551
Alignment:
767 tcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 866  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| || ||||||||| | ||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||    
17961419 tcctttgatcatccaccagtgatctgttgcctgatttggatgcagtcctttgcataatcaacttcaaattcattgctatcttgaaggaaca-aatctgca 17961517  T
867 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
17961518 ggcagagctgttttcttgtcttgtagcgcggaca 17961551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 447 - 568
Target Start/End: Original strand, 18006038 - 18006158
Alignment:
447 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| | ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
18006038 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacacaaataca-agaaattggtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 18006136  T
547 ggtgttctcaatacaatacaat 568  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
18006137 ggtgttcacaatacaatgcaat 18006158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 767 - 900
Target Start/End: Original strand, 18006364 - 18006496
Alignment:
767 tcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 866  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| || ||||||||| | ||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||    
18006364 tcctttgatcatccaccagtgatctgttgcctgatttggatgcagtcctttgcataatcaacttcaaattcattgctatcttgaaggaaca-aatctgca 18006462  T
867 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
18006463 ggcagagctgttttcttgtcttgtagcgcggaca 18006496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 262
Target Start/End: Original strand, 14353859 - 14353983
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 235  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
14353859 ttgaattgtgttttctttttctcaatattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 14353955  T
236 cgg-aaagaacagagcagagaaaagaaa 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
14353956 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaa 14353983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 403 - 606
Target Start/End: Original strand, 15848700 - 15848910
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||||| |     
15848700 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctattcaaacagaa 15848799  T
502 atacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa--taaaga--ctctagactt-tgaatttctaag 595  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||  ||||||||||  |||||||||||    
15848800 ttacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaag 15848899  T
596 atgtatcaaat 606  Q
    || ||||||||    
15848900 atatatcaaat 15848910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 863 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 16658811 - 16658656
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||| |    
16658811 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctct 16658712  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcact 1018  Q
    |   || ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
16658711 tcaaag-aataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 16658656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1066 - 1158
Target Start/End: Original strand, 33598020 - 33598112
Alignment:
1066 cttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 1158  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
33598020 cttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactacaacttttggtgatttttagcttctgatagacttgcttctgatgaactcgcttctga 33598112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 880 - 959
Target Start/End: Original strand, 11868253 - 11868332
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
11868253 tcttgttttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgct 11868332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 352
Target Start/End: Original strand, 13931364 - 13931439
Alignment:
277 cagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
13931364 cagttatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccctttgcacatctaaggagatttcactataatc 13931439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 267
Target Start/End: Original strand, 14465099 - 14465231
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
14465099 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 14465195  T
233 cagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaa 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
14465196 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaa 14465231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 693 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 12389235 - 12388910
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||  |||||||| |||   |||||||||  |||||    |    
12389235 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattctcagcacatcaaaaaagagtcgttagaag--ctttgatcaatcaccaacgat 12389138  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||||||| | | ||||  ||||| || |  ||||||| |||||| |   | |||| ||||  | ||||||||||| |||| | || |||||    
12389137 cttttgcctgatttggttattgtccaatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctaaaggaacatcgt-tgcaggcatagttgttattctagtctt 12389039  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||| | ||  | |||  |||||||||||| ||     
12389038 gttgcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgc-tcttcaaagaagaagcatccaatgcctta 12388940  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcact 1018  Q
    |||||||||  || ||||||| ||||||||    
12388939 aaattcttttgaattagtcgtagcttcact 12388910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 12963448 - 12962995
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| || ||  |||||||||||||   ||| |||||  ||||| |  |    
12963448 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaa--gcttcgatcaatcaccaatgat 12963351  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt-gtcttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||  | | ||||| ||||  ||    ||||||| |||||  ||  |||||| |||| |  |||||  | |||||||  |||||||||    
12963350 cttttgcctgatatgtttattgtcctatgaacgatcgctttcaaatccattctaattatgaaggaacat-tgttgcagatagagctgttattcttgtctt 12963252  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| | | ||  | |||| |||||||||||| |||    
12963251 gtagcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacac-tcttcaaagaacaagcatccaatgctttc 12963153  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||  |||  |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |  |||||| || || ||||| || || | |  ||||||| |||||  |||||    
12963152 aaaaccttctaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgca 12963053  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    || | ||||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
12963052 tctcctgatgaactacaacttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 12962995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 968 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 19889033 - 19888854
Alignment:
968 gaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatag-c 1066  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  || || ||||||  || |||||| ||||||||||| || || |    
19889033 gaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtc 19888934  T
1067 ttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||| |||| |||||  ||||||| | |||||||||  |||||||  |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
19888933 tttttaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactttagcttctagtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 19888854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 433 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 45862220 - 45862042
Alignment:
433 tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag--atacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |   ||||||| ||||  |||||| || ||||    
45862220 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattatacagaaaatt--gtttgagtttgaac 45862123  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaat 606  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||    
45862122 acttaatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctatacttaagaatttctaagatatatcaaat 45862042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 52919976 - 52920091
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
52919976 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 52920075  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
52920076 ggtgttcacaatacaa 52920091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 880 - 1186
Target Start/End: Complemental strand, 12963260 - 12962970
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| || ||   || ||| |||||||    
12963260 tcttgtcttgtagcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaag-aacaagcatcc 12963162  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |  |||||| || || ||||| || || | |  ||||||| |||    
12963161 aatgctttcaaaaccttctaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagcttta 12963062  T
1080 agt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    |||  |||||| | ||||||||| || |||||| ||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
12963061 agtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat-----------------cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaaga 12962979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 403 - 567
Target Start/End: Original strand, 13931456 - 13931620
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  ||| ||||||  ||  |||||||||||   | | ||||||||||| | ||||||||     
13931456 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagaaagagatatcctatgctcaagcaaaaaagtaagagacttctaaacaaacaaat 13931555  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa 567  Q
     |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
13931556 -tacaaagaaataagtttggtttgaacacttgatatacaatcagtgttgttcacaatacaaaacaa 13931620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 460 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 12410399 - 12410292
Alignment:
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||  |||| |||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
12410399 aatgctcaagcacacaagcaagagacttctaaacaaacaaat-tacaaagaaataagtttggtttgaacaatttatatacaatcagtggtgttcacaata 12410301  T
560 caatacaat 568  Q
    ||| |||||    
12410300 caaaacaat 12410292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 918 - 1146
Target Start/End: Original strand, 40850990 - 40851208
Alignment:
918 gtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcac 1017  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||| || |||  |||||||||||| ||         ||||||||||||||||   ||    
40850990 gtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgcatt---------tcaaaatagtcgttgccatac 40851079  T
1018 ttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgattt 1117  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| |||| | || ||| | ||  |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||| |||||||| ||||      
40851080 ttttccagtcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaccagcttttgaagctttaagttccatctcctgatgaactgtagcttctggtgatac 40851179  T
1118 ttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
        |||||||| ||||||||||||||||    
40851180 acaacttctgatgaacttgcttctgatga 40851208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 8729648 - 8729489
Alignment:
405 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    ||||| |||| | |||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||  | | ||||||||||| | |||||| |  |    
8729648 ctcaaacacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcactgacgcaagagacttcttatgttcaagcacaaaagtaagagacttctaaacaaacacaatt 8729549  T
504 acagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||| |||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
8729548 acacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatataatcagtggtgttcacaatacaa 8729489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9081535 - 9081376
Alignment:
405 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    ||||| |||| | |||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||  | | ||||||||||| | |||||| |  |    
9081535 ctcaaacacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcactgacgcaagagacttcttatgttcaagcacaaaagtaagagacttctaaacaaacacaatt 9081436  T
504 acagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||| |||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
9081435 acacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatataatcagtggtgttcacaatacaa 9081376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 844 - 934
Target Start/End: Original strand, 17021975 - 17022065
Alignment:
844 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17021975 atcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 17022065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 447 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21606275 - 21606157
Alignment:
447 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatc 543  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||    
21606275 gcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatc 21606176  T
544 agtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||| ||||||||    
21606175 agtggtgttcacaatacaa 21606157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 6253210 - 6253256
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6253210 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 6253256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 6490161 - 6490100
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6490161 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 6490100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 6500815 - 6500754
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6500815 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 6500754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 13410416 - 13410370
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13410416 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13410370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 14077718 - 14077672
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14077718 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 14077672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17769754 - 17769645
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccag-tcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattac 363  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
17769754 agacacaaacaattatcctagttccttccacaatccggaaatagtccagttcccatttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattac 17769655  T
364 aaatgctcaa 373  Q
    || |||||||    
17769654 aattgctcaa 17769645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19071055 - 19070946
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccag-tcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattac 363  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
19071055 agacacaaacaattatcctagttccttccacaatccggaaatagtccagttcccatttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattac 19070956  T
364 aaatgctcaa 373  Q
    || |||||||    
19070955 aattgctcaa 19070946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13410817 - 13410752
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
13410817 gttccttccacaattcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 13410752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1184
Target Start/End: Original strand, 13824271 - 13824320
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13824271 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 13824320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Original strand, 51340340 - 51340565
Alignment:
269 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatt 361  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||    
51340340 gacacaagcaattatacaggttcctttcacaaaacggaagtcagtcctctcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 51340439  T
362 acaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||||  |  | ||||||| |||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||     
51340440 acaactgctcaatactacacctagtatgagatttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggcaagagacttcc 51340536  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
     |||||||||||   | ||||||||||||    
51340537 tatgctcaagcattaaagcaagagacttc 51340565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 880 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 9700211 - 9700108
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |  ||||||||  |||||||    
9700211 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgc-tccttgaggaataagcatcc 9700113  T
980 aatgc 984  Q
    |||||    
9700112 aatgc 9700108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1185
Target Start/End: Original strand, 33598090 - 33598154
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
33598090 gcttctgatgaactcgcttctgacgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 33598154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 737
Target Start/End: Original strand, 37412134 - 37412447
Alignment:
433 tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacac 530  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||| | |||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||    
37412134 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaaacaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 37412233  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaaga---ctctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | |||    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   | |    
37412234 ttgatatacaatcagcggtgttcacaatacaatgcagtgaaggactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagag 37412333  T
627 ctttgtag--aatcagtttga-cagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa 723  Q
    |||||  |  || || ||| | |||||||||||||||||| || |  | || ||| ||   | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
37412334 ctttgatgtgaaacaatttcaacagagttttggcgcttttaaattgttgtaagtcacttaatgatcttcaggtcttcactcctttatatagtggtgtgaa 37412433  T
724 agagacgttgagat 737  Q
    | ||||||||||||    
37412434 aaagacgttgagat 37412447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1185
Target Start/End: Original strand, 40851184 - 40851232
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
40851184 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 40851232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 553
Target Start/End: Original strand, 932343 - 932492
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||| | | ||| |||| ||| ||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||||| | |||| |||     
932343 tgctcaagcacacaagtacgagacttcaaatactcaatcacacaagcaagagatttcttatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaagaaat 932442  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
     |||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
932443 -tacttagaaataagtttgg-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 932492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 2560542 - 2560624
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
2560542 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2560624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 9981698 - 9981637
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
9981698 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaaacactttgaacttcag 9981637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 9993706 - 9993645
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
9993706 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaaacactttgaacttcag 9993645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 11078134 - 11078200
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
11078134 ggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 11078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 12396857 - 12396903
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
12396857 atcttcaagtcttcactcctttatacagaggtgtgaaagagacgttg 12396903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 14954969 - 14955085
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| |  |||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
14954969 caagagacctctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaa-tatgtttgagtttgaacacttgatatacaatca 14955067  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
14955068 gtggtgttcacaatacaa 14955085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 15902736 - 15902853
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |  |||||||||  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
15902736 caagagacttctaatgctcaagcacaattgcaagagacttccaaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 15902835  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
15902836 gtggtgttcacaatacaa 15902853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16794650 - 16794604
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
16794650 atcttcaagtcttcactcctttatgtagaggtgtgaaagagacgttg 16794604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #259
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 22140304 - 22140420
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
22140304 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaat-atgtttgagtttgaacacttgatatacaatca 22140402  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
22140403 gtggtgttcacaatacaa 22140420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #260
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 27374554 - 27374600
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27374554 atcttaaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 27374600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #261
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 863 - 944
Target Start/End: Original strand, 37412571 - 37412653
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacg 944  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
37412571 tgcaggcatagctgttttacttgtcttgtagtgaagacagaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacg 37412653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #262
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 46796312 - 46796266
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
46796312 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 46796266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #263
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 3238057 - 3238130
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
3238057 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 3238130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #264
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 9699999 - 9699950
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
9699999 gcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcaacacttcagaagcactttg 9699950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #265
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 12388778 - 12388729
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12388778 tgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 12388729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #266
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 733
Target Start/End: Original strand, 12968099 - 12968144
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12968099 tcttcatgtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12968144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #267
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 734
Target Start/End: Original strand, 14955224 - 14955265
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14955224 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 14955265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #268
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23538957 - 23538884
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
23538957 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtccccattgcacttccaaggagagttcacta 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #269
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 30054161 - 30054112
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
30054161 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttg 30054112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #270
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1185
Target Start/End: Original strand, 37412830 - 37412895
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
37412830 gcttctgatgaacttgcttctgacgagctttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttg 37412895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #271
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 249
Target Start/End: Original strand, 40287577 - 40287691
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
40287577 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40287673  T
233 cagcgg-aaagaacagag 249  Q
    |||||| |||||||||||    
40287674 cagcggaaaagaacagag 40287691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #272
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 559
Target Start/End: Original strand, 50299613 - 50299887
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact-atcaaaa 384  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    ||||||||||||||| |||| | |  |     
50299613 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactataaata-tctgattacaaatgctcactactaaacttag 50299711  T
385 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagag 483  Q
    || ||||||||   ||| ||||||||||||   || |||| ||||| | ||||  | ||  || |||||||||| || |||||||||||  | |||||||    
50299712 taagagacttc---aaattgctcaagcacaactgcgagagacttcctaggctcctgaacacaatcaagagacttatattgctcaagcacaaatgcaagag 50299808  T
484 acttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttg-acttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
50299809 acttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 50299887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #273
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 8729356 - 8729308
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
8729356 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacattgag 8729308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #274
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 9081243 - 9081195
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
9081243 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacattgag 9081195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #275
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 11223361 - 11223401
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11223361 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 11223401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #276
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 12726593 - 12726553
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12726593 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12726553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #277
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 13948132 - 13948172
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13948132 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13948172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #278
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 17239285 - 17239245
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17239285 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 17239245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #279
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 18121975 - 18121935
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18121975 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18121935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #280
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 19249775 - 19249735
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19249775 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 19249735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #281
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 339
Target Start/End: Original strand, 20724466 - 20724518
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 339  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
20724466 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 20724518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #282
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 21637032 - 21636992
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21637032 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #283
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 25398195 - 25398147
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
25398195 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcgtcacttcaggagcactt 25398147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #284
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 37467129 - 37467169
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37467129 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 37467169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #285
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 40850774 - 40850814
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40850774 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 40850814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #286
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 52920204 - 52920244
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52920204 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 52920244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #287
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 6252799 - 6252866
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtc-cagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
6252799 ggttccttccacaaaccggaagtagtttctgtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatca 6252866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #288
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1138 - 1185
Target Start/End: Original strand, 11223789 - 11223836
Alignment:
1138 ttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
11223789 ttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 11223836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #289
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 687 - 726
Target Start/End: Original strand, 13653718 - 13653757
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13653718 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 13653757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #290
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19198655 - 19198588
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
19198655 tggttccttccacaatccgggagtagtccactcccccttgaacttccaaggagagttcactaaaatca 19198588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #291
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 687 - 734
Target Start/End: Original strand, 21317192 - 21317239
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
21317192 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagatacgttga 21317239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #292
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 693 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 22804385 - 22804061
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt-tgagataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||   |||||| || ||  ||||||||||  ||  |||||||||  ||||| |  |    
22804385 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacttgtga-attgccagcacatcaaaatagagtcgttt--aaagctttgatcaatcaccaatgat 22804289  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt-gtcttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |   ||| || ||| | | |||||||| |||||||  ||||||| |    
22804288 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgagggaacaaagt-tgcaggcagagctgttattcttgtcct 22804190  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||  | |||| | |||| ||||| |||    
22804189 gtagcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tcttcaaagaacaatcatcgaatgccttc 22804091  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcact 1018  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||    
22804090 aagtcctttcaaaatagccgttgcttcact 22804061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #293
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22804801 - 22804746
Alignment:
289 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 344  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
22804801 ttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaatgagatttca 22804746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #294
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 26418293 - 26418178
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||  |||| |||| || ||||||  |||||||| | |||||||||||||    
26418293 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacaaaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacctaatatacaatcagt 26418194  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
26418193 ggtgttcacaatacaa 26418178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #295
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26418484 - 26418397
Alignment:
261 aaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
26418484 aaaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtgccccttgcacttccaagtagagttcacta 26418397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #296
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 562
Target Start/End: Original strand, 27849689 - 27849843
Alignment:
408 aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagataca 506  Q
    ||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  |  |||||||||||| | ||||||||  ||||    
27849689 aagcacaaaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgcttaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaacaaat-taca 27849787  T
507 gagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
     | || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
27849788 cataaataagtttggtttggacacttgatatacaatcagtggtgttaacaatacaa 27849843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #297
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1186
Target Start/End: Original strand, 41495213 - 41495264
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
41495213 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcatgagcactttga 41495264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #298
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 10529552 - 10529602
Alignment:
1136 gcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
10529552 gcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttg 10529602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #299
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 10851599 - 10851645
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
10851599 atcttcaagtcttcactcctttatattgaggtgtgaaagagatgttg 10851645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #300
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12963703 - 12963586
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
12963703 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 12963604  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
12963603 gtggtgttcacaatacaa 12963586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #301
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 13977941 - 13977991
Alignment:
1136 gcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13977941 gcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttg 13977991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #302
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14078096 - 14077822
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa--gattacaaatgctcaatactatcaaa 383  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |   |||||||| |||||||     |||||    
14078096 tggttccttccataatctggaagtagtccactcccccttgcacttcaaaggagagttcactaaaatcaatatttgattacaattgctcaagc---tcaaa 14078000  T
384 at-atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 481  Q
    |  | || ||||||   |||| ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||     ||||     
14077999 agcaagacacttca---aactactcaagcacaactgcaagaggtttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagcataactgcaaa 14077903  T
482 agacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||  |||||||||  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14077902 agacttctactcaaacaaaattacaaagaaa-atgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14077822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #303
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 15833612 - 15833662
Alignment:
1136 gcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15833612 gcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttg 15833662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #304
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 16879807 - 16879853
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
16879807 atcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagagacgttg 16879853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #305
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 17238871 - 17238825
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17238871 cttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 17238825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #306
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17239725 - 17239643
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
17239725 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcacta 17239643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #307
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 460
Target Start/End: Original strand, 18006023 - 18006081
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
18006023 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 18006081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #308
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 20418023 - 20418069
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
20418023 atcttcaagtctacactcctttatatagacgtgtgaaagagacgttg 20418069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #309
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 21316932 - 21316998
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
21316932 ggttccttccacaatccggaagtagtcttgtctcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21316998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #310
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 21640406 - 21640523
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||| || |||||||||||    |||||||||||||||  ||||||| |  |||| |||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||    
21640406 caagagacttatattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaatattgtttgaagttgaacacttgatatacaatca 21640505  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
21640506 gtggtgttcacaatacaa 21640523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #311
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1193
Target Start/End: Original strand, 21736514 - 21736607
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
21736514 agcttctgatgaaatcttgcttctgatgaactttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgtaacttcag 21736607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #312
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22770637 - 22770571
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
22770637 ggttccttccacaattcggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactaaaatca 22770571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #313
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 28581645 - 28581761
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
28581645 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacataattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 28581743  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
28581744 gtggtgttcacaatacaa 28581761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #314
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 38178263 - 38178147
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
38178263 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttacttcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 38178165  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
38178164 gtggtgttcacaatacaa 38178147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #315
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 40799437 - 40799553
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
40799437 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 40799535  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
40799536 gtggtgttcacaatacaa 40799553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #316
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 47207083 - 47207145
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
47207083 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 47207145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #317
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 49643380 - 49643263
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |  |||||||||  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||     
49643380 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcg 49643281  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
49643280 gtggtgttcacaatacaa 49643263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #318
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 352
Target Start/End: Original strand, 8693512 - 8693589
Alignment:
275 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||   ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
8693512 agcaattatcctggttccttcaaaaatctggaagtagtgcagtcccccttgcttgtccaaggagatttcactataatc 8693589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #319
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 352
Target Start/End: Original strand, 9045399 - 9045476
Alignment:
275 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||   ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
9045399 agcaattatcctggttccttcaaaaatctggaagtagtgcagtcccccttgcttgtccaaggagatttcactataatc 9045476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #320
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1152 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 12237414 - 12237373
Alignment:
1152 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12237414 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttaaacttcag 12237373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #321
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1152 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 12249240 - 12249199
Alignment:
1152 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12249240 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttaaacttcag 12249199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #322
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 687 - 732
Target Start/End: Original strand, 13699157 - 13699202
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
13699157 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagatacgtt 13699202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #323
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Original strand, 15647145 - 15647218
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 352  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
15647145 ttatcccggttccttccacaatgcggaagtactccagtaccccttgcacttccaagaacattttcactataatc 15647218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #324
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 18142702 - 18142653
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
18142702 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggaacactttg 18142653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #325
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 449 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 30054799 - 30054683
Alignment:
449 aagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |  |||||||||  |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||    
30054799 aagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacaaaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcag 30054700  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| ||||||||    
30054699 tggtgttcacaatacaa 30054683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #326
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1158
Target Start/End: Original strand, 37412815 - 37412852
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 1158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37412815 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 37412852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #327
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 4174568 - 4174517
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
4174568 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 4174517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #328
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 734
Target Start/End: Original strand, 5213378 - 5213414
Alignment:
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5213378 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 5213414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #329
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 339
Target Start/End: Original strand, 6090105 - 6090157
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 339  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
6090105 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 6090157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #330
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 13557997 - 13558048
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
13557997 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 13558048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #331
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14063770 - 14063710
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
14063770 ggttccttccacaaactggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14063710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #332
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 16199731 - 16199683
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
16199731 tgcttcttatgaacttgcttctgatgacgtcatcagttcaggagcactt 16199683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #333
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 16476701 - 16476752
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
16476701 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 16476752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #334
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 16493460 - 16493511
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
16493460 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 16493511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #335
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 690 - 726
Target Start/End: Original strand, 17697402 - 17697438
Alignment:
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17697402 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 17697438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #336
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 18143107 - 18143067
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
18143107 aagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttg 18143067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #337
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19778808 - 19778859
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19778808 ttgcttctgatgaccttatgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19778859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #338
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1173
Target Start/End: Complemental strand, 19888882 - 19888842
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 1173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
19888882 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttc 19888842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #339
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 20724884 - 20724924
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
20724884 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 20724924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #340
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21638893 - 21638746
Alignment:
419 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaa 515  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  ||||||| |  | || ||||  |     
21638893 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagccttctattgctcaaacacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattgcaaagaaaaat 21638794  T
516 gtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21638793 gtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21638746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #341
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 23757721 - 23757772
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
23757721 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 23757772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #342
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 28581462 - 28581546
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
28581462 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28581546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #343
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29952245 - 29952157
Alignment:
260 aaaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||    
29952245 aaaaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccctttgcactttcaaggggagttcacta 29952157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #344
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30001399 - 30001311
Alignment:
260 aaaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||    
30001399 aaaaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccctttgcactttcaaggggagttcacta 30001311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #345
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 37866868 - 37866919
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
37866868 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 37866919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #346
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 46350206 - 46350166
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
46350206 aagtctttactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 46350166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #347
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 49669267 - 49669207
Alignment:
289 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
49669267 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 49669207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #348
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 1728557 - 1728518
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
1728557 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 1728518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #349
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 2025705 - 2025744
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2025705 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 2025744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #350
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 487
Target Start/End: Original strand, 11074019 - 11074058
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagactt 487  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
11074019 caagagacttctattgctcaagcacgcaggcaagagactt 11074058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #351
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 11167913 - 11167963
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
11167913 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 11167963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #352
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12410492 - 12410413
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 352  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
12410492 aagcaattatcttggttccttccacaatccagaagtagtccagcttcccttacacttccaaggagattttcactataatc 12410413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #353
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13410588 - 13410549
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13410588 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13410549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #354
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 13698987 - 13699026
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13698987 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13699026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #355
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 13939275 - 13939334
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
13939275 gttccttccacaaaccggaagttgtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13939334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #356
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 14072240 - 14072354
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||| ||||| | ||  | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
14072240 caagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttatattcaaacaaaaatacataaaaa-atgtttgaggttgaaaacttgatatacaatcagt 14072338  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
14072339 ggtgttcacaatacaa 14072354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #357
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15961171 - 15961132
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15961171 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 15961132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #358
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 16032213 - 16032252
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
16032213 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 16032252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #359
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 16391409 - 16391359
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
16391409 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 16391359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #360
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 729
Target Start/End: Original strand, 16812010 - 16812045
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16812010 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 16812045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #361
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 16881906 - 16881945
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
16881906 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 16881945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #362
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19249953 - 19249914
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19249953 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 19249914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #363
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 901 - 1036
Target Start/End: Original strand, 20725092 - 20725226
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  || |||| ||||||| | ||  || ||| |||||||||||  ||||||| ||||  |    
20725092 aaaacagagtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgc-tcttcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttga 20725190  T
1001 aatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    | |||||||||||||||| |||  || |||||||||    
20725191 attagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaat 20725226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #364
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 22128662 - 22128701
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22128662 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22128701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #365
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22463634 - 22463595
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22463634 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22463595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #366
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22465092 - 22465053
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22465092 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22465053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #367
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24776074 - 24776035
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
24776074 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 24776035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #368
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 25398798 - 25398759
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
25398798 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 25398759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #369
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 29855026 - 29855065
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
29855026 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 29855065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #370
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 29951978 - 29951939
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
29951978 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 29951939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #371
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 30001132 - 30001093
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
30001132 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 30001093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #372
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1186
Target Start/End: Original strand, 37467541 - 37467592
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
37467541 tgcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagctctttga 37467592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #373
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Original strand, 40799670 - 40799709
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
40799670 agtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttg 40799709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #374
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 40850594 - 40850633
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
40850594 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 40850633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #375
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 41494615 - 41494654
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
41494615 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 41494654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #376
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 46796909 - 46796870
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
46796909 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 46796870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #377
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 47207321 - 47207360
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
47207321 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 47207360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #378
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 47405964 - 47405925
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
47405964 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 47405925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #379
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 49554299 - 49554216
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
49554299 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 49554216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #380
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 352
Target Start/End: Original strand, 932249 - 932327
Alignment:
275 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 352  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||    
932249 agcaattatcatggttccttccacaatacagaagtaacccagtccccctcgtacttccaaagagattttcactataatc 932327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #381
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 462 - 559
Target Start/End: Original strand, 1463847 - 1463942
Alignment:
462 tgctcaagcacgcaggcaagagacttc-tgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | | ||||||||  |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
1463847 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctaaacaaacaaat-tacaaagaat-aagtttgg-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 1463942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #382
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 1783865 - 1783816
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
1783865 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1783816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #383
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1184
Target Start/End: Original strand, 4404729 - 4404763
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4404729 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 4404763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #384
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 353
Target Start/End: Original strand, 6174730 - 6174780
Alignment:
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
6174730 cggaagtagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 6174780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #385
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 11223103 - 11223220
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||| |    
11223103 caagagacttctaatggtcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaataa 11223202  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
11223203 gtggtgttcacaatacaa 11223220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #386
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12963888 - 12963806
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
12963888 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtaatcatgtcccccttacacttccaaggagagttcacta 12963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #387
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 13698783 - 13698849
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
13698783 ggttccttccacaatccggtagtagtcttgtccctcttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 13698849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #388
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 16882078 - 16882124
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
16882078 atctttaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagagacgttg 16882124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #389
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17239541 - 17239424
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
17239541 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 17239442  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||| |||| ||||||||    
17239441 gtggcgttcacaatacaa 17239424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #390
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 17762461 - 17762415
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
17762461 atcttcaagtcttcattccttcatatagaggtatgaaagagacgttg 17762415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #391
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 17909816 - 17909763
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
17909816 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttt 17909763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #392
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 19063781 - 19063735
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
19063781 atcttcaagtcttcattccttcatatagaggtatgaaagagacgttg 19063735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #393
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20736673 - 20736609
Alignment:
307 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 373  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
20736673 agtagtccagtcccc-ttgcactttcaagg-gatttcactataacctcaaacattacaaatgctcaa 20736609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #394
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 696 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 21606014 - 21605976
Alignment:
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
21606014 tcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttga 21605976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #395
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30054960 - 30054898
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
30054960 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 30054898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #396
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1183
Target Start/End: Original strand, 37886001 - 37886035
Alignment:
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37886001 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 37886035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #397
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 53057349 - 53057232
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||| |||    
53057349 caagagacttctaatgctcaggcacaattgcaagagacttcttaattcaaacataattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacagtca 53057250  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
53057249 gtggtgttcacaatacaa 53057232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #398
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 934048 - 934100
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
934048 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 934100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #399
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 6220496 - 6220463
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6220496 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 6220463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #400
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 7833007 - 7832970
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
7833007 atcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaa 7832970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #401
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 562
Target Start/End: Original strand, 11078297 - 11078346
Alignment:
513 taagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
11078297 taagtttggtttgaaaacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 11078346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #402
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Original strand, 13823446 - 13823507
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13823446 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 13823507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #403
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 733
Target Start/End: Original strand, 13823877 - 13823914
Alignment:
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
13823877 tcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13823914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #404
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 721
Target Start/End: Original strand, 13954036 - 13954077
Alignment:
680 ctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 721  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
13954036 ctatctgatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtg 13954077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #405
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1141 - 1185
Target Start/End: Original strand, 15851163 - 15851208
Alignment:
1141 tgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15851163 tgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttg 15851208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #406
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 692 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16199793 - 16199752
Alignment:
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
16199793 caagtgttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttg 16199752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #407
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16305850 - 16305781
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 335  Q
    |||||| |||| | |||| | ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
16305850 aaagacgcaagaaattatacaggttccttccacaattcggaagtagacctgtcccccttgcacttccaag 16305781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #408
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 488
Target Start/End: Original strand, 18005989 - 18006049
Alignment:
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||    
18005989 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctcagatgctcaagcacacaggcaagagacttc 18006049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #409
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 18851486 - 18851453
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18851486 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 18851453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #410
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 19887168 - 19887116
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19887168 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 19887116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #411
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 345
Target Start/End: Original strand, 20645537 - 20645590
Alignment:
292 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 345  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
20645537 cttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 20645590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #412
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 23648189 - 23648222
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23648189 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 23648222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #413
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 23680215 - 23680154
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
23680215 cttgcttctgatgaactttgcttctgatgatgtcatcacttcagagacacttgaaacttcag 23680154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #414
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 24052452 - 24052391
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
24052452 cttgcttctgatgaactttgcttctgatgatgtcatcacttcagagacacttgaaacttcag 24052391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #415
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 26418035 - 26417998
Alignment:
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
26418035 tcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 26417998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #416
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Original strand, 31302728 - 31302789
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
31302728 gttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 31302789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #417
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 339
Target Start/End: Original strand, 52919830 - 52919895
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 339  Q
    ||||| |||| | |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
52919830 aagcaattatacaggtttcttccacaaatcggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 52919895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #418
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 2782835 - 2782919
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
2782835 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactat 2782919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #419
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 2784604 - 2784722
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac--ttgaacacttgatatacaatc 543  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||   |||||||||||||||||||||    
2784604 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagtttgaacacttgatatacaatc 2784703  T
544 agtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||  |||||||    
2784704 agtggtgttcataatacaa 2784722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #420
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1184
Target Start/End: Original strand, 4457355 - 4457406
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
4457355 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaaacacttt 4457406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #421
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1165
Target Start/End: Original strand, 5213783 - 5213826
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtc 1165  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
5213783 gcttctgataaacttgcttatgatgaac-tgcttctgatgacgtc 5213826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #422
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 488
Target Start/End: Original strand, 8710404 - 8710444
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
8710404 caagagacttctattgctcaagcacacaggcaagagacttc 8710444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #423
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 8874737 - 8874621
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat-caaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||| || |||||| |  |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||| ||    
8874737 caagagacttctaatgcttaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagattgaacacttgatatacaataag 8874638  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| ||||||||    
8874637 tggtgttcacaatacaa 8874621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #424
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 488
Target Start/End: Original strand, 9062291 - 9062331
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
9062291 caagagacttctattgctcaagcacacaggcaagagacttc 9062331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #425
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 354
Target Start/End: Original strand, 12396450 - 12396514
Alignment:
290 tccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 354  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
12396450 tccttccacaaaccggaagtagtcctatctcccttgcacttccaaggagagttcgctaaaatcac 12396514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #426
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 901 - 937
Target Start/End: Original strand, 12968311 - 12968347
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
12968311 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgt 12968347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #427
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 13122085 - 13122136
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
13122085 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 13122136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #428
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 13132328 - 13132379
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
13132328 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 13132379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #429
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 14393367 - 14393327
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
14393367 aagttttcactcctttatatagaggtgtgtaagagacgttg 14393327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #430
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 14466014 - 14466065
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
14466014 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 14466065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #431
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 14476646 - 14476697
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
14476646 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 14476697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #432
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 18122155 - 18122119
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
18122155 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcgcaata 18122119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #433
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19789445 - 19789496
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
19789445 ttgcttctgatgaccttatgcttctgatgacatcatcacttcagaagcactt 19789496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #434
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20628213 - 20628153
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 346  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
20628213 ggttccttccacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 20628153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #435
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21639075 - 21638991
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||| |||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21639075 aaagacacaagcaatttatacaggttccttcctcaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 21638991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #436
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22463811 - 22463751
Alignment:
289 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
22463811 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 22463751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #437
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22465269 - 22465209
Alignment:
289 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
22465269 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 22465209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #438
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 22804020 - 22803972
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
22804020 tgcttctgaggaacttgcttttgatgacgtcatcactttaggagcactt 22803972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #439
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22804641 - 22804523
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga---tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatc 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |   ||||||| |  |||  |||| |  ||||||  ||||||| |||||||||||||    
22804641 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaaattcaaacagaattactaagaaatttgtttgaggttgaacatttgatatacaatc 22804542  T
544 agtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||| ||||||||    
22804541 agtggtgttcacaatacaa 22804523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #440
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 23538527 - 23538487
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
23538527 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagaaacgttg 23538487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #441
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 23768317 - 23768368
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
23768317 ttgcttctgatgaccttctgcttctgacgacgtcatcacttcagaagcactt 23768368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #442
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1184
Target Start/End: Original strand, 27883821 - 27883872
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
27883821 tgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcacttt 27883872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #443
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 37760093 - 37760144
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
37760093 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 37760144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #444
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 39672695 - 39672644
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
39672695 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 39672644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #445
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 40850333 - 40850417
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
40850333 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 40850417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #446
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 698 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 46796725 - 46796689
Alignment:
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
46796725 ttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgttga 46796689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #447
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 47207501 - 47207541
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
47207501 aagtcttcacttctttatatagagatgtgaaagagacgttg 47207541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #448
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 53057090 - 53057050
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
53057090 agtcttcactcctttatacagaggtgtgaaagatacgttga 53057050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #449
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 373
Target Start/End: Original strand, 1463743 - 1463853
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatca-caaagatta 362  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||   |||||||    
1463743 aaagtcacaagcaattatcatggtttcttccacaatcaagaattagtctagtcccccttgcacttccaaagatatttttcactataatcatgcaagatta 1463842  T
363 caaatgctcaa 373  Q
    ||| |||||||    
1463843 caattgctcaa 1463853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #450
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 2246804 - 2246854
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
2246804 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 2246854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #451
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 558
Target Start/End: Original strand, 2560804 - 2560839
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
2560804 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 2560839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #452
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 3238309 - 3238348
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
3238309 ttgaacacttgatatacaaacagtggtgttcacaatacaa 3238348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #453
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 4243753 - 4243694
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 461  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||    
4243753 tgcttaagcacacacgcaagagtcttcctatgttcaaccacaaaagcaagagacttctaa 4243694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #454
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 5213195 - 5213234
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
5213195 ttgaacacttgatatacaatcagtagtgttcacaatacaa 5213234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #455
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 6174954 - 6174993
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
6174954 ttgaagacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 6174993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #456
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1176
Target Start/End: Complemental strand, 7804349 - 7804304
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaa---cttgcttctgatgacgtcatcacttcaga 1176  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
7804349 ttgcttctgatgaaaaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaga 7804304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #457
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 7833168 - 7833129
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
7833168 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaa 7833129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #458
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 7921077 - 7921030
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
7921077 atcttcaagtcttcaatcctttatatagaggttgaaaagagacgttga 7921030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #459
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 8739924 - 8739874
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
8739924 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 8739874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #460
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9092162 - 9092112
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
9092162 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 9092112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #461
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1148 - 1183
Target Start/End: Original strand, 9536029 - 9536064
Alignment:
1148 cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
9536029 cttgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 9536064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #462
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 729
Target Start/End: Original strand, 11868065 - 11868100
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
11868065 agtctttactcctttatatagaggtgtgaaagagac 11868100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #463
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 12967687 - 12967746
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||    
12967687 gttccttccacaacccgaaagtagtcatgtccccattgcactttcaaggagagttcacta 12967746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #464
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 12967926 - 12967965
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
12967926 ttgaacacttcatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 12967965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #465
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13781126 - 13781087
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
13781126 ttgaacacttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaa 13781087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #466
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 13947955 - 13947994
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
13947955 ttgaacacttgatatacagtcagtggtgttcacaatacaa 13947994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #467
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 733
Target Start/End: Original strand, 14969168 - 14969203
Alignment:
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
14969168 ttcactcctttatatagaggtgtcaaagagacgttg 14969203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #468
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16659159 - 16659120
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
16659159 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaa 16659120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #469
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 16670941 - 16670891
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
16670941 tgcttttgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 16670891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #470
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 16879634 - 16879673
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
16879634 ttgaacacttgatataaaatcagtggtgttcacaatacaa 16879673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #471
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 17697235 - 17697274
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
17697235 ttgaacacttaatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 17697274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #472
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18143287 - 18143248
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
18143287 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 18143248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #473
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 19198248 - 19198213
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 722  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
19198248 atcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtga 19198213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #474
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 19249318 - 19249276
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
19249318 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagca-tttgaacttcag 19249276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #475
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 690 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 19658345 - 19658302
Alignment:
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
19658345 ttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagagatgttg 19658302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #476
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20627975 - 20627936
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
20627975 ttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaa 20627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #477
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 20724630 - 20724745
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||| |  |||| |||| || ||||||  |||||| | ||||||| |||||||    
20724630 caagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagatacttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacgcctgatatataatcagt 20724729  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||  |||||||    
20724730 ggtgttcataatacaa 20724745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #478
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1174
Target Start/End: Original strand, 20725323 - 20725362
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
20725323 tgcttatgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttca 20725362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #479
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20747377 - 20747293
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 373  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
20747377 tggttcctcccataacacaaaagtagtccagt-ccccttgcactttcaagg-gatttcactataa-cctaaacattacaaatgctcaa 20747293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #480
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 23636133 - 23636183
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
23636133 tgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 23636183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #481
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1182
Target Start/End: Original strand, 28169487 - 28169536
Alignment:
1136 gcttctgatgaa---cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
28169487 gcttctgatgaaaaccttgcttctgatgacgtcattacttcagaagcact 28169536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #482
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 29905983 - 29905933
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
29905983 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 29905933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #483
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 29947148 - 29947098
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
29947148 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 29947098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #484
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 29996302 - 29996252
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
29996302 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 29996252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #485
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 53057509 - 53057446
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 349  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
53057509 ggttccttccacgaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactata 53057446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #486
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1728796 - 1728734
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
1728796 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 1728734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #487
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1152 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 1794258 - 1794228
Alignment:
1152 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
1794258 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1794228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #488
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 2025467 - 2025529
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2025467 ggttcctttcacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2025529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #489
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4243896 - 4243830
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
4243896 ggttccttccacaatccggaagtaatattgtcccccttgcacttccaaagagacttcactaaaatca 4243830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #490
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 9380434 - 9380400
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
9380434 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 9380400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #491
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 11189378 - 11189452
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
11189378 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaacgagagttcacta 11189452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #492
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1131 - 1169
Target Start/End: Complemental strand, 11908920 - 11908882
Alignment:
1131 aacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
11908920 aacttgcttctgataaactcgcttctgatgacgtcatca 11908882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #493
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1131 - 1169
Target Start/End: Complemental strand, 12752539 - 12752501
Alignment:
1131 aacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
12752539 aacttgcttctaatgaactcgcttctgatgacgtcatca 12752501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #494
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 14254173 - 14254139
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
14254173 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcacttt 14254139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #495
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15961389 - 15961340
Alignment:
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
15961389 cggaagtagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 15961340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #496
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 16305749 - 16305651
Alignment:
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    |||||| ||||||  | ||||||||||||| | ||||||||  |||||||||  | |||||  ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
16305749 aatgctgaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaaactacagagaaagatgtttggtttgaacaattaatatacaatcaatggtgttcacaat 16305651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #497
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 27851334 - 27851380
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||    
27851334 atcttcaagtcttcattcctttatatagatgtatgaaagatacgttg 27851380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #498
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 703 - 733
Target Start/End: Original strand, 31303192 - 31303222
Alignment:
703 tcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
31303192 tcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 31303222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #499
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 40799276 - 40799338
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
40799276 ggttccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggatagttcactat 40799338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #500
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 46797176 - 46797114
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
46797176 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 46797114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #501
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 688 - 733
Target Start/End: Original strand, 1464074 - 1464119
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
1464074 tcttcaagtcttcatttctttatatggaggtatgaaagagacgttg 1464119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #502
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4768281 - 4768229
Alignment:
321 ccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-agattacaaatgctcaa 373  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
4768281 ccttgcacttccaag-agatttcactataatctcactagattacaaatgctcaa 4768229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #503
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 6180322 - 6180289
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
6180322 tgcttctgatgacgtcatcactttagaagcactt 6180289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #504
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 440
Target Start/End: Original strand, 8710418 - 8710455
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 440  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
8710418 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 8710455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #505
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 8758293 - 8758245
Alignment:
1137 cttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
8758293 cttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 8758245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #506
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 440
Target Start/End: Original strand, 9062305 - 9062342
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 440  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
9062305 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 9062342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #507
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 10626754 - 10626702
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
10626754 cttgcttctgatgatcttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaggcactt 10626702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #508
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 330
Target Start/End: Original strand, 10849947 - 10850012
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 330  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||    
10849947 aaagacacaaagcaattatagtggttccttccacaatccggaagtagtccactcctccttgcactt 10850012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #509
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 11216516 - 11216483
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
11216516 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagaactt 11216483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #510
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12727016 - 12726955
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
12727016 ggttccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 12726955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #511
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 13372464 - 13372431
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
13372464 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 13372431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #512
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 13383058 - 13383025
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
13383058 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 13383025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #513
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 13393652 - 13393619
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
13393652 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 13393619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #514
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 13410680 - 13410623
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttct 459  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
13410680 tgctcaagcacaaacgcaagagttttcctatgctcaagcacaagagcaagaaacttct 13410623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #515
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13781367 - 13781306
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
13781367 ggttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacatccaaggagagttcacta 13781306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #516
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1148 - 1185
Target Start/End: Original strand, 14955693 - 14955730
Alignment:
1148 cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
14955693 cttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttg 14955730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #517
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 16348412 - 16348379
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16348412 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 16348379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #518
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1169
Target Start/End: Original strand, 22140971 - 22141004
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
22140971 gcttctgatgaactagcttctgatgacgtcatca 22141004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #519
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 29461008 - 29460975
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
29461008 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 29460975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #520
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 29471860 - 29471827
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
29471860 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 29471827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 703; Significance: 0; HSPs: 377)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 703; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 5022158 - 5022988
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt-----tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
5022158 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttatctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtg 5022257  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5022258 attatgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 5022357  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
5022358 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataattacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac 5022457  T
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaga 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
5022458 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 5022557  T
503 tacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatc 602  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5022558 tacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatc 5022657  T
603 aaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcac 702  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    
5022658 aaattagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatatctatctattatcttcaagtcttcac 5022757  T
703 tcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatt 802  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
5022758 tcatttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatt 5022857  T
803 tgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaa 902  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
5022858 tgggtgtagtcctttgaagaattagctccaaattcattcccatcttaaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aa 5022956  T
903 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
5022957 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5022988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 660; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18753325 - 18752497
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||   |||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
18753325 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttatctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 18753228  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18753227 cttctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 18753129  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
18753128 acggaagtagtccagtcccccttgctcttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 18753029  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
18753028 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 18752929  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 601  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18752928 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 18752829  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttca 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
18752828 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatgtttctctctcttatcttcaagtcttca 18752729  T
702 ctcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgat 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
18752728 ctcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatccattgatcattcaccagtaatcctttgcctgat 18752629  T
802 ttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa 901  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
18752628 ttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgccttgtcttgtagcgtggac-a 18752530  T
902 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
18752529 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18752497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 654; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 27815780 - 27814951
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||    
27815780 tgaaggtga-aaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtg 27815684  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27815683 cttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 27815585  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
27815584 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 27815485  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
27815484 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 27815385  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 601  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27815384 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 27815285  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttca 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
27815284 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatgtcttatcttcaagtcttca 27815185  T
702 ctcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgat 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
27815184 ctcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgat 27815085  T
802 ttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca- 900  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
27815084 ttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacat 27814985  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27814984 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27814951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 647; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18763905 - 18763107
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
18763905 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaagtgatcagagtcagat-tg 18763809  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18763808 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 18763709  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18763708 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 18763609  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
18763608 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 18763509  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18763508 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 18763409  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18763408 tagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatgtttctctctcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 18763309  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18763308 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatccattgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 18763209  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
18763208 aaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcataactgttgccttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 18763110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 622; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 40471370 - 40470594
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
40471370 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgttaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 40471271  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40471270 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 40471171  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40471170 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 40471071  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40471070 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 40470971  T
558 t-acaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    | | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
40470970 taaaaaaacaataaagtctctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 40470871  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40470870 cgctttttaacttgtgtatctctatctccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 40470771  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 856  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40470770 tcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 40470671  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40470670 aaaatctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 40470594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 616; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 40455132 - 40454355
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
40455132 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgttaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 40455033  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40455032 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 40454933  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40454932 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 40454833  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40454832 ctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 40454733  T
558 t--acaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
40454732 taaaaaaaacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 40454633  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40454632 gcgctttttaacttgtgtatctctatctccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 40454533  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40454532 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 40454433  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40454432 caaaatctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 40454355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 48370611 - 48371385
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
48370611 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgtttatgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 48370707  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48370708 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 48370807  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48370808 gattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 48370907  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
48370908 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 48371007  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
48371008 tacaatacaataaagactctggactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggc 48371107  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48371108 gcttttgaacttatatatttctatcttcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 48371207  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
48371208 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtaca 48371307  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48371308 aattatgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 48371385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 597; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 934
Target Start/End: Original strand, 25656621 - 25657388
Alignment:
168 tcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaaca 266  Q
    |||||||||||| ||| |||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
25656621 tcttctgataaaactttagaagcagtttgttaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagaca 25656720  T
267 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 366  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25656721 aagacacaggcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 25656820  T
367 tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctc 466  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25656821 tgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctc 25656920  T
467 aagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaata-c 565  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |    
25656921 aagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagcggtgttctcaataaaaaaac 25657020  T
566 aataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttga 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
25657021 aataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttta 25657120  T
666 acttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaa 765  Q
    |||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25657121 acttatgtatatctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaa 25657220  T
766 atcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgc 865  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
25657221 atcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgc 25657320  T
866 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
25657321 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaagcagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25657388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 450030 - 450830
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
450030 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 450126  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
450127 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 450226  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
450227 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 450326  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
450327 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 450426  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
450427 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttg 450526  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
450527 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctatttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 450626  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
450627 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 450726  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
450727 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 450826  T
931 actt 934  Q
    ||||    
450827 actt 450830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 14844459 - 14843659
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
14844459 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 14844363  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14844362 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14844263  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
14844262 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 14844163  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
14844162 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 14844063  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14844062 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 14843963  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
14843962 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctatttaatcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagagacgt 14843863  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
14843862 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 14843763  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
14843762 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 14843663  T
931 actt 934  Q
    ||||    
14843662 actt 14843659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 30937878 - 30937078
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
30937878 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 30937782  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
30937781 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagttccccttgcacttc 30937682  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
30937681 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 30937582  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||    
30937581 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacggagaattgagtttgaattgaacact 30937482  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30937481 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 30937382  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
30937381 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctatttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 30937282  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
30937281 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 30937182  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
30937181 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 30937082  T
931 actt 934  Q
    ||||    
30937081 actt 30937078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18078681 - 18077912
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
18078681 cttcttctgataaaatttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 18078585  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18078584 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 18078485  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18078484 aatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagaggcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 18078385  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
18078384 gctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacgcttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 18078285  T
563 tacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctt 661  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
18078284 tacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctt 18078185  T
662 ttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    |||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
18078184 ttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtt 18078085  T
762 tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatatt 861  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
18078084 tgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaatt 18077985  T
862 ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
18077984 ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagaggagtggaggtagtggttgtacactt 18077912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 30927300 - 30926500
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
30927300 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 30927204  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30927203 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 30927104  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
30927103 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 30927004  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
30927003 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 30926904  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30926903 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaagacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 30926804  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
30926803 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctatttaatcttcaagtcttcactcatttatatagaggcgtgaaagagacgt 30926704  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
30926703 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttt 30926604  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
30926603 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 30926504  T
931 actt 934  Q
    ||||    
30926503 actt 30926500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 577; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 17928153 - 17928954
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
17928153 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 17928249  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17928250 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17928349  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
17928350 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 17928449  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
17928450 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacac 17928549  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17928550 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 17928649  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17928650 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 17928749  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
17928750 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 17928849  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
17928850 caaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 17928949  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
17928950 cactt 17928954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 460611 - 461411
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
460611 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaataatcagagtcagat-tg 460707  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
460708 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 460807  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
460808 caaggagatttcactataatcacaaagattactactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 460907  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
460908 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagaattctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 461007  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
461008 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 461107  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
461108 tataatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctatttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 461207  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
461208 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 461307  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
461308 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 461407  T
931 actt 934  Q
    ||||    
461408 actt 461411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15561885 - 15561085
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
15561885 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 15561789  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15561788 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 15561689  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15561688 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 15561589  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
15561588 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 15561489  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15561488 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 15561389  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15561388 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 15561289  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
15561288 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 15561189  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
15561188 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 15561089  T
931 actt 934  Q
    ||||    
15561088 actt 15561085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 22006465 - 22007265
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
22006465 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22006561  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22006562 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22006661  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
22006662 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 22006761  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
22006762 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22006861  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22006862 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttataagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 22006961  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
22006962 tagaattaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctcactttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 22007061  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22007062 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 22007161  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22007162 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 22007261  T
931 actt 934  Q
    ||||    
22007262 actt 22007265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 24639667 - 24640502
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt-----tctaaaaa--ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||     ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||   || |||    
24639667 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttctctgtctaaaaaaattcttcttttgataaaacttcagaagcagtttgagag 24639766  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24639767 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 24639866  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
24639867 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 24639965  T
401 act--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
24639966 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 24640065  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
24640066 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatg 24640165  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |   ||||||||||||    
24640166 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatgtctctgt-aaatcttcaagtct 24640264  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
24640265 tcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcct 24640364  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
24640365 gatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtag 24640464  T
898 aca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24640465 acagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24640502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 4947791 - 4948589
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
4947791 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaactccagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tg 4947887  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4947888 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 4947987  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
4947988 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 4948087  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
4948088 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 4948187  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4948188 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 4948287  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
4948288 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctgtatc--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 4948385  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
4948386 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtggtcatttgaagaataagcttc 4948485  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
4948486 aaattcattcccatcttgagtgtacatattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 4948585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 17917505 - 17918306
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
17917505 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 17917601  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17917602 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17917701  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
17917702 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 17917801  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
17917802 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacac 17917901  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17917902 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 17918001  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17918002 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatctttatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 17918101  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
17918102 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 17918201  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
17918202 caaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 17918301  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
17918302 cactt 17918306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 21995867 - 21996667
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
21995867 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 21995963  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21995964 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21996063  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
21996064 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 21996163  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
21996164 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 21996263  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21996264 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttataagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 21996363  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
21996364 tagaattaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctcactttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 21996463  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
21996464 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 21996563  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
21996564 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtagaggtagtggttgtac 21996663  T
931 actt 934  Q
    ||||    
21996664 actt 21996667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 52703242 - 52704042
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
52703242 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 52703338  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
52703339 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttc 52703438  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
52703439 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 52703538  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
52703539 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatgaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttaaacact 52703638  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52703639 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 52703738  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
52703739 tataatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 52703838  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
52703839 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 52703938  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
52703939 aaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 52704038  T
931 actt 934  Q
    ||||    
52704039 actt 52704042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 219 - 934
Target Start/End: Original strand, 10908945 - 10909661
Alignment:
219 cagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
10908945 cagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagt 10909043  T
318 cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
10909044 cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacac 10909143  T
418 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
10909144 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagt 10909243  T
518 ttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaa 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10909244 ttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaa 10909343  T
617 attcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagag 716  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
10909344 attcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagag 10909443  T
717 gtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctt 816  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
10909444 gcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctt 10909543  T
817 tgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtgga 916  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10909544 tgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtgga 10909643  T
917 ggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||    
10909644 ggtagtggttgtacactt 10909661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 19945133 - 19944333
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
19945133 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 19945037  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19945036 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaaacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19944937  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
19944936 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19944837  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
19944836 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 19944737  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19944736 tgatatacaatcagtggtgttcacaaaacaatacagtaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 19944637  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
19944636 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 19944537  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19944536 tgagataatcagcacgtctaaagagtcatttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 19944437  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
19944436 aaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttatagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 19944337  T
931 actt 934  Q
    ||||    
19944336 actt 19944333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 19955768 - 19954968
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
19955768 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttattctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 19955672  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19955671 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19955572  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
19955571 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19955472  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
19955471 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 19955372  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19955371 tgatatacaatcagtggtgttcacaaaacaatacagtaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 19955272  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
19955271 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 19955172  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
19955171 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctggtttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 19955072  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
19955071 aaattcattctcatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaaaagagtagtggaggtagtggttgtac 19954972  T
931 actt 934  Q
    ||||    
19954971 actt 19954968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 55746058 - 55745258
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
55746058 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 55745962  T
233 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55745961 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 55745862  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
55745861 aaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttcc 55745763  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
55745762 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 55745663  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55745662 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 55745563  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
55745562 gtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatttctctgtcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 55745463  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
55745462 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaactt 55745363  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
55745362 caaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 55745263  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
55745262 cactt 55745258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 565; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 24028861 - 24028091
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
24028861 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 24028765  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24028764 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaatacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 24028665  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac---tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 461  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24028664 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 24028565  T
462 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
24028564 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 24028465  T
562 atacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctt 661  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
24028464 atacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctt 24028365  T
662 ttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    |||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24028364 ttgaacttatgtatatctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 24028265  T
762 tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatatt 861  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||    
24028264 tgaaatcctttgataatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaatt 24028165  T
862 ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24028164 ctgcaggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24028091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 55756669 - 55755869
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
55756669 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 55756573  T
233 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55756572 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 55756473  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
55756472 aaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttcc 55756374  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
55756373 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacaaagaattgagtttgaattgaacac 55756274  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55756273 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 55756174  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
55756173 gtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatttctctgtcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 55756074  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
55756073 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaactt 55755974  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
55755973 caaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 55755874  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
55755873 cactt 55755869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 16265939 - 16266716
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
16265939 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 16266035  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
16266036 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa- 16266134  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16266135 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 16266234  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat-acagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
16266235 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaattacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 16266334  T
557 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
16266335 atacaatgtagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 16266434  T
657 cgcttttgaacttgtatatgt-ctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 753  Q
    ||||||||||||| | ||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16266435 cgcttttgaacttatgtattttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 16266534  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
16266535 gagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtg 16266634  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16266635 tacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16266716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 27656052 - 27656855
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
27656052 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27656148  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27656149 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27656248  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
27656249 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 27656348  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
27656349 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 27656448  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27656449 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 27656548  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
27656549 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggggtgaaagagac 27656648  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
27656649 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 27656748  T
830 tcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
27656749 tcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttg 27656848  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
27656849 tacactt 27656855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 27666625 - 27667428
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
27666625 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27666721  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27666722 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27666821  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
27666822 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 27666921  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
27666922 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 27667021  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27667022 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 27667121  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
27667122 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggggtgaaagagac 27667221  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
27667222 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 27667321  T
830 tcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
27667322 tcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttg 27667421  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
27667422 tacactt 27667428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18131022 - 18130245
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
18131022 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 18130926  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18130925 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 18130826  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18130825 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 18130726  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaa-caaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttct 554  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
18130725 ttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttca 18130626  T
555 caatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt 654  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
18130625 caatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagtttt 18130526  T
655 ggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 754  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18130525 ggcgcttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 18130426  T
755 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 854  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |     
18130425 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgt 18130326  T
855 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18130325 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18130245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 36017819 - 36018590
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
36017819 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 36017915  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
36017916 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 36018014  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36018015 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 36018114  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
36018115 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 36018214  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
36018215 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 36018314  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36018315 ttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 36018414  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
36018415 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 36018514  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36018515 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36018590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 36028372 - 36029143
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
36028372 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 36028468  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
36028469 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 36028567  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36028568 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 36028667  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
36028668 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 36028767  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
36028768 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 36028867  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36028868 ttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 36028967  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
36028968 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 36029067  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36029068 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36029143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 49517618 - 49518389
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
49517618 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 49517714  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
49517715 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 49517813  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49517814 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 49517913  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
49517914 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 49518013  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
49518014 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 49518113  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49518114 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 49518213  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
49518214 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 49518313  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49518314 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 49518389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 16255320 - 16256123
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
16255320 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 16255416  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16255417 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 16255516  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
16255517 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 16255615  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat-acagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||    
16255616 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaattacagagaattgagtttgaattgaacac 16255715  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16255716 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 16255815  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgt-ctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 727  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
16255816 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtattttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagag 16255915  T
728 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattag 827  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
16255916 acgttgagataatcagcacgtttaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataag 16256015  T
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
16256016 cttcaaattcattcccatcttgagtgtacaagttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggtt 16256115  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
16256116 gtacactt 16256123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 14836939 - 14836110
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
14836939 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctataaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 14836841  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
14836840 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcatttatcctggttccttccacaaa 14836742  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
14836741 acggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 14836642  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||     
14836641 atacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaa 14836542  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 600  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
14836541 atacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactataaacttttgaatttctaagatgta 14836442  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||    
14836441 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttc 14836342  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
14836341 actcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctga 14836243  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
14836242 tttaggtgtagtcctttgaagaattagctttaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac- 14836144  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14836143 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14836110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 10751945 - 10751174
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
10751945 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 10751849  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
10751848 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 10751750  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
10751749 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactttt 10751650  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
10751649 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 10751550  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
10751549 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 10751450  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10751449 ttttaaacttatgtatctctgtctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 10751350  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |    
10751349 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 10751250  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10751249 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10751174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 10965714 - 10964943
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
10965714 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 10965618  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
10965617 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 10965519  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
10965518 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactttt 10965419  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
10965418 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 10965319  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
10965318 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 10965219  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10965218 ttttaaacttatgtatctctgtctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 10965119  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |    
10965118 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 10965019  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10965018 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10964943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 10741371 - 10740600
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
10741371 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 10741275  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
10741274 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 10741176  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10741175 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 10741076  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
10741075 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 10740976  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||    
10740975 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgaccgagttttggcgc 10740876  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10740875 ttttaaacttatgtatctctgtctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 10740776  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |    
10740775 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 10740676  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10740675 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10740600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 10955140 - 10954369
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
10955140 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 10955044  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
10955043 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 10954945  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10954944 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 10954845  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
10954844 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 10954745  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||    
10954744 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgaccgagttttggcgc 10954645  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10954644 ttttaaacttatgtatctctgtctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 10954545  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |    
10954544 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 10954445  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10954444 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10954369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 16316751 - 16317583
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaa-cacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |    
16316751 tgaaggtgagaaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 16316850  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
16316851 gcttctgatgtaataatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 16316949  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
16316950 cacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 16317049  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
16317050 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 16317149  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16317150 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatagaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgt 16317249  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |    ||||||||||||    
16317250 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcatattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatatctatctacattcttcaagtctt 16317349  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
16317350 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgatttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctg 16317448  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
16317449 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtgga 16317547  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16317548 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16317583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 16304527 - 16305359
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaa-cacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |    
16304527 tgaaggtgagaaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 16304626  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
16304627 gcttctgatgtaataattagaatcagatatgcagcggaaaagattaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 16304725  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
16304726 cacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 16304825  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
16304826 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaataaa 16304925  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16304926 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatagaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgt 16305025  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |    ||||||||||||    
16305026 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatatctatctacattcttcaagtctt 16305125  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
16305126 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgatttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctg 16305224  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | || || |||||||||||||||||||    
16305225 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatggttgtttttcttgtcttgtagcgtgga 16305323  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16305324 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16305359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 934
Target Start/End: Original strand, 3370136 - 3370968
Alignment:
111 aggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa----ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||    | |||||||||||||  ||||||||| |   ||   ||||    
3370136 aggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagtagtttggaggtgc 3370235  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||      
3370236 ttctgatgtaataatcagaatcagatatgcagcgcaaaagatcaaagtagagaaaagaaacacga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaat 3370334  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||     
3370335 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaa 3370434  T
403 -tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
3370435 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacttagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaa 3370534  T
502 atacagagaattaagtttgact-tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgt 599  Q
    ||||||||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
3370535 atacagagaaaaatgtttgattatgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgt 3370634  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtc 697  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||    
3370635 atcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgtttttgaacttgtatat--ctctatcttcaatcttcaagtc 3370732  T
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcc 797  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||    
3370733 ttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaagagtcgtt-gagtttctttgatcacccaccagtaatcctttgcc 3370831  T
798 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3370832 tgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattttgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 3370931  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
3370932 acaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacactt 3370968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 219 - 934
Target Start/End: Original strand, 10695179 - 10695892
Alignment:
219 cagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
10695179 cagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagt 10695277  T
318 cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
10695278 cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaa 10695376  T
418 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
10695377 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgt 10695476  T
518 ttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaa 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
10695477 ttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaa 10695576  T
617 attcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtcttcactcctttatatag 714  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||    
10695577 attcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttg--tatgtctctatctacattcttcaaatcttcactcctttatatag 10695674  T
715 aggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcc 814  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
10695675 aggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcc 10695773  T
815 tttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtg 914  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
10695774 tttgaagaattagcttcaaattcattcccatctcgaaggaaca-attctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagggtagtg 10695872  T
915 gaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||    
10695873 gaggtagtggttgtacactt 10695892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 200 - 934
Target Start/End: Original strand, 3389972 - 3390708
Alignment:
200 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
3389972 gtgcttctgatgtaataatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaacacga-gacacgagcagttatcctggttccttccac 3390070  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 398  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
3390071 aaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctca 3390170  T
399 aaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
3390171 aaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacttagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaac 3390270  T
498 aaagatacagagaattaagtttgact-tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaag 595  Q
    ||| ||||||||||  | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
3390271 aaaaatacagagaaaaatgtttgatgatgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaag 3390370  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttca 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
3390371 atgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgtttttgaacttgtatat--ctctatcttcaatcttca 3390468  T
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||| |||||    
3390469 agtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaagagtcgtt-gagtttctttgatcacccaccagtaatcctt 3390567  T
794 tgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagc 893  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
3390568 tgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcataaattctgcatgcatagctgttgtcttgtcttgtagc 3390667  T
894 gtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
3390668 gtggacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacactt 3390708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 496; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 5872796 - 5873622
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||   |  |||||||    
5872796 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttctctctaaaaatacttctcctgataatacttcataagcattttaggagtgct 5872894  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
5872895 tctgatgtaataaccagaatcagatatgcagtggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttcctcccacaaatc 5872993  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
5872994 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 5873092  T
404 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
     ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||    
5873093 actcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaat 5873192  T
504 acagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatc 602  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
5873193 acaaagaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatc 5873292  T
603 aaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcac 702  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||    
5873293 aaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagggttttggcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcac 5873392  T
703 tcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatt 802  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
5873393 tcctttatatagaggtgtgaaaaagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttccttggatcatccaccagtaatcctttgcctgatt 5873491  T
803 tgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaa 902  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
5873492 tgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaatttcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaa 5873590  T
903 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
5873591 aacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 5873622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 29042439 - 29041852
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29042439 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 29042340  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
29042339 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-g 29042241  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29042240 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 29042141  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
29042140 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 29042041  T
557 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
29042040 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 29041941  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagca 745  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
29041940 cgcttttgaacttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagca 29041852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 19580692 - 19581493
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
19580692 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 19580791  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||| ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
19580792 cagcggaaatgatcaaagcaaagaaaagaagaataa-gtcacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtctagtcccccttgcacttc 19580890  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
19580891 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggaaagagtcttcca 19580989  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa-agatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || | |||||| ||| || |||||||||||||||    
19580990 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcgggcaagagtcttttgatcaaaaaagaaatacagggaaatatgtttgacttgaacac 19581089  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt--tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
19581090 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgtgaatttctaagatataccaaatcagtgcagaaattcaatgtgct 19581189  T
629 ttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    || ||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19581190 ttttagaatcaaattgatagagttttggcgcttttaaatttg--tatttctctatcttcattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaaga 19581287  T
727 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 826  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
19581288 gacgttgagatgaatagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 19581386  T
827 gcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19581387 gcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 19581485  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
19581486 gtacactt 19581493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 11535268 - 11536098
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  |||||||    
11535268 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggagtgct 11535367  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
11535368 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaggaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatc 11535465  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
11535466 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 11535564  T
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||     
11535565 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaa 11535664  T
502 atacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgt 599  Q
    ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
11535665 atacagagaaa-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgt 11535763  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagt 696  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||||    
11535764 atcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagt 11535862  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
11535863 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgc 11535961  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
11535962 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgta 11536060  T
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11536061 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11536098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Original strand, 10299956 - 10300787
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || |||    
10299956 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataatacttcagaagcaggttaggaatgc 10300055  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||      
10300056 ttctgatgtgatgataataatcagatatgcagcggaataaaacagcgcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaat 10300154  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
10300155 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 10300254  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||    
10300255 -tgctcaagcacgcaggctagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaa 10300353  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgt 599  Q
     ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
10300354 aatacagagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaaaattcaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgt 10300453  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagt 696  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||||    
10300454 atcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctct-cccaatcttcaagt 10300551  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
10300552 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgc 10300650  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
10300651 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgta 10300749  T
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10300750 gataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10300787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 202 - 934
Target Start/End: Original strand, 24712947 - 24713683
Alignment:
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
24712947 gcttctgatgcaatgaacagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaa 24713045  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||    
24713046 atcggaagtagtccagtccccattgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttttcaa 24713145  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga----tcaa 495  Q
    || ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| ||||||     ||||    
24713146 aa-tgctcaagcacgcaggaaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcagacgagaggcttctgtacgttcaa 24713244  T
496 acaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttcta 593  Q
    ||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
24713245 acaaaaatacagagaaa-atgtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatataatgcaataaagactctagacttgtgaatttcta 24713343  T
594 agatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atct 690  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||   ||||    
24713344 agatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttgacagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatctctatctacaatct 24713442  T
691 tcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||    
24713443 tcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatctaccagtaatc 24713541  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt 890  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
24713542 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgt 24713640  T
891 agcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24713641 agcgt-gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24713683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 11514459 - 11515288
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |  || ||||    
11514459 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcaggttaggaatgct 11514557  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| | |  ||  |||||| |||||||||||||||||||||  |    
11514558 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgtagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gatgcaagcaattatcctggttccttccacaaacc 11514655  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||     
11514656 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa- 11514754  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
     ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||    
11514755 -tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaa 11514853  T
501 gatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatg 598  Q
     ||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
11514854 aatacatagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatcggtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagatg 11514952  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||| | |||    
11514953 tatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcattaag 11515051  T
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttg 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||    
11515052 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttg 11515150  T
796 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
11515151 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgt 11515249  T
896 ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11515250 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11515288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31267627 - 31266804
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || ||||    
31267627 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgct 31267529  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
31267528 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaacc 31267431  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||    
31267430 ggaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagatttccactaataatctcaaagattacaaatgctcaatattctctaagtatgagacttctcaaaa 31267332  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
     ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||    
31267331 -tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaa 31267233  T
501 gatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatg 598  Q
     ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
31267232 aatacagagaaa-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagatg 31267134  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaag 695  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  |||||||||    
31267133 tatcaaatcagtccagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaag 31267035  T
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtccttt 794  Q
    |||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| || |||    
31267034 tcttcac-------tatagaggtgtgaaagagacgttgagattttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagtttctttgatcatccaccagtaatctttt 31266943  T
795 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcg 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
31266942 gcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcg 31266844  T
895 tggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
31266843 tagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31266804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 49002816 - 49001985
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
49002816 tgaaggtgagaaaaacacaagaatggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattctttttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 49002718  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| | |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||      
49002717 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaaccaattattctggttccttccacaaac 49002620  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||    
49002619 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa 49002521  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
49002520 --tgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaa 49002423  T
500 agatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt--gaatttctaaga 596  Q
    |  |||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
49002422 aattacacagaaa-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagactttaagaatttctaaga 49002324  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttca 693  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  |||||||    
49002323 tatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttca 49002225  T
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcct 792  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || |    
49002224 agtctttactcctttatatagagatgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccattaatctt 49002126  T
793 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtag 892  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
49002125 ttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtag 49002027  T
893 cgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49002026 cgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 49001985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 460 - 934
Target Start/End: Original strand, 4987052 - 4987526
Alignment:
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
4987052 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 4987151  T
560 caatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcg 658  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
4987152 cattacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcg 4987251  T
659 cttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 758  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
4987252 ctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaagagtc 4987351  T
759 gtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 858  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
4987352 gtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaa 4987450  T
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4987451 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4987526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Original strand, 55650745 - 55651577
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || | |    
55650745 atgaaggtgagaaaaacacaagaaggaggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatac 55650844  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || | ||| || | ||| | |||||||| || |||||||||||||||| ||||  |    
55650845 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaatagaacagagaaaagaaagagagacacaaacaattatcctggttccttctacaaacc 55650944  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||     
55650945 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaatcacacagattacagatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa- 55651042  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
     ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
55651043 -tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgaaggcaagagacttctattcaaacaaa 55651141  T
501 gatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatg 598  Q
      |||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||     
55651142 attacacagaa-aatgtttgacattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagata 55651240  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||     |||||||||    
55651241 tatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttaaagaaacaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtcacttgtcaatcttcaag 55651339  T
696 tcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtccttt 794  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||    
55651340 tctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatctttt 55651438  T
795 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcg 894  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
55651439 gactgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcg 55651537  T
895 tggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55651538 tagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 55651577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 15208194 - 15207647
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||  ||||||||| |   || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
15208194 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaatacttcttctgataatacttcagaagaagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 15208095  T
234 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
15208094 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagg-cacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 15207996  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
15207995 aaggagatttcaccataatcactaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaa 15207897  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac-aaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||    
15207896 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacact 15207797  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagact-ttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15207796 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagactagtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 15207697  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctc 680  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
15207696 gtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctc 15207647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 47152589 - 47152086
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaat-taagtttgacttgaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||    
47152589 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagtcttctaatcaaacaaagatacagggaaaatatgtttgacttgaac 47152491  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgc 627  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
47152490 acatgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctaaacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgc 47152391  T
628 tttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctta--tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaag 725  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
47152390 tttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtat--gtctctatctgcattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaag 47152293  T
726 agacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatt 825  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47152292 agacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatt 47152194  T
826 agcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 925  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
47152193 agcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcatggttgttgtcttgtcttgtagcgtagataaaaacagagtagtggaggtagtggt 47152095  T
926 tgtacactt 934  Q
    |||||||||    
47152094 tgtacactt 47152086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 268 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 18775357 - 18774686
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-actat-----aatcacaaagatt 361  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||| |||||    
18775357 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagatt 18775258  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttcta 460  Q
    |||| |||||||||||  | |  |  |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||      
18775257 acaactgctcaatactgcctag-tgggagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcct 18775161  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
18775160 atgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 18775061  T
560 caatacaat-aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttgg 656  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| |||||||| |     
18775060 caatgcaattaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcagagtttgga 18774961  T
657 cgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaa 753  Q
    ||||||| |||||||    ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||    
18774960 cgctttt-aacttgttgtaatgtctcttactaatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaa 18774862  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
18774861 gagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaagg 18774763  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |   || || |||||| |||||||||||||    
18774762 aaca-attatgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacacttagggtcgtggagatagtggttgtaca 18774686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Original strand, 23508884 - 23509370
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 549  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23508884 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 23508983  T
550 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgac 646  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||| |    
23508984 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttggc 23509083  T
647 agagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 743  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||    
23509084 agagtttttgcgctttt-aacttgtgttgatgtctct-tccgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttag 23509181  T
744 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 843  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||     
23509182 cacgtccaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcct 23509280  T
844 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
23509281 atcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 23509370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 181 - 475
Target Start/End: Original strand, 25008395 - 25008689
Alignment:
181 cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag 279  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
25008395 cttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcag 25008493  T
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactat 379  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
25008494 ttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactct 25008593  T
380 caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgca 475  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
25008594 ctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgca 25008689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 138 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19143812 - 19143504
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19143812 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgatacaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 19143713  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
19143712 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19143614  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
19143613 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttcca 19143514  T
432 atgctcaagc 441  Q
    ||||||||||    
19143513 atgctcaagc 19143504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 107 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 47152887 - 47152528
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |    
47152887 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctttcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggatt 47152788  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
47152787 gcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 47152689  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
47152688 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 47152589  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
47152588 a-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 47152528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 205 - 890
Target Start/End: Original strand, 19241541 - 19242235
Alignment:
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||||||| | || |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||      
19241541 tctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagataaa--cacaagcaattatactggttccttccacaaac 19241638  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||    
19241639 cggaagtagtccagtcctccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttca 19241737  T
397 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaa 495  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
19241738 caaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaa 19241835  T
496 acaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagactt-tgaatttc 591  Q
    ||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||    
19241836 acagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttc 19241935  T
592 taagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgt--atatgtctctatcttat 688  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||| | | |||| |||||||| | ||||||| |||||||    ||||||||| || ||    
19241936 taagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaattttggcagagtttggacgctttt-aacttgttgtaatgtctcta-ctgat 19242033  T
689 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagt 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||| |    
19242034 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagacctttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagaacctttgatcatttaccaat 19242132  T
787 agtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtc 886  Q
      || ||| |||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
19242133 gatctttttcctgatttggatgttgtcctatgaatgatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtc 19242231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 243 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18007786 - 18007087
Alignment:
243 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 342  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18007786 aacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaggcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 18007689  T
343 c-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgct 436  Q
    | ||||     |||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |  |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||    
18007688 ccactaagaaataatcacacagattacaactgcttaatactacctag-tatgagacttcc--aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 18007592  T
437 caagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttga 534  Q
    ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||  | | |||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||    
18007591 caagcactaaatcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttga 18007492  T
535 tatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca--gtgtgctt 629  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||  ||    
18007491 tatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgttttt 18007392  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact--tgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-aga 726  Q
    |||  ||  | |||| |||||||| ||||||||| |  |  ||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
18007391 tgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaatttgttgtct-tgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagaga 18007294  T
727 gacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatt 825  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||     
18007293 gacgttgagatctttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagaacctttgatcatccaccagtaatcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatc 18007195  T
826 agcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 925  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||    
18007194 aagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttt-tgcaggcagagctgttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggt 18007096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 306 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 4987045 - 4986784
Alignment:
306 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgc 405  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
4987045 aagtagtccagtcccccttacacttccaagcagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgc 4986946  T
406 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatac 505  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
4986945 tcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatac 4986846  T
506 agagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa 567  Q
    |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
4986845 aatgaaatatgtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacattacaa 4986784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 702 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15207649 - 15207420
Alignment:
702 ctcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgat 801  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15207649 ctcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgat 15207551  T
802 ttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa 901  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
15207550 ttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcataactgttgtcttgtcttgtagcgtggac-a 15207453  T
902 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
15207452 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15207420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 694 - 1161
Target Start/End: Original strand, 8105430 - 8105898
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   || ||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
8105430 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttga-attgccaacacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 8105527  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||| |||||    
8105528 ctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttatcttg 8105626  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
8105627 tagcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttca 8105725  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaat-ccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
8105726 aatcctttcaaaatagccgttgcttcaattttccagtcttctgcaatccttagacgaagttgaatcccattaaacaacttttgaagccttaagttgcatc 8105825  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    |  | |||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
8105826 ctctaatgaacggcaacttctggtgatttttaacttctgataaacttgcttctgatgaactcacttctgatga 8105898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 478 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 8997743 - 8997284
Alignment:
478 caagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactc 576  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
8997743 caagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgtcttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactc 8997644  T
577 tagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtata 674  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||| |     
8997643 tagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttgtgagaatcaaatttggcagagttttgacgctttt-aacttgtgtt 8997545  T
675 ---tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcct 770  Q
       |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||  ||||    
8997544 gattgtctctacca-atcttcaagtcttcacttctttatatagatgtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtccaaagagtcgtt-gagttcct 8997447  T
771 ttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggca 870  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||    
8997446 ttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcctgtcttgaaggaaca-cttctgcaggca 8997348  T
871 tagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     | ||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
8997347 gaactgttatcttgtcttgtagcgaggacatactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 8997284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 10692812 - 10693095
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |    
10692812 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctct 10692911  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
10692912 tt-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaa 10693010  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||    
10693011 acaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatga 10693095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 10906578 - 10906861
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |    
10906578 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctct 10906677  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
10906678 tt-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaa 10906776  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||    
10906777 acaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatga 10906861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 107 - 401
Target Start/End: Original strand, 10290047 - 10290345
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||   |  || |||    
10290047 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctaataatacttcagaagcaggttaggaatgc 10290146  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||      
10290147 ttctgatgtgatgatcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaat 10290245  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
10290246 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 10290345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 16819867 - 16819380
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtgg 548  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
16819867 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtgg 16819768  T
549 tgttctcaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttga 645  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||| | | ||||     
16819767 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaggaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttgg 16819668  T
646 cagagttttggcgcttttgaacttgt-at-atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgaga-taatc 741  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    |     
16819667 caaagttttggcgctttt-aacttgtgatgatgtctct-gcagatcttcaagtcttcactccttt-tatagaggtgtgtagagagacgttgagaccttta 16819571  T
742 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 841  Q
    | |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
16819570 aacacgtccaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 16819472  T
842 ccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||  || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
16819471 ctatcttgtgggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcaaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 16819380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 875 - 1161
Target Start/End: Original strand, 29121344 - 29121618
Alignment:
875 tgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactag 974  Q
    |||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||    
29121344 tgttttcttgtcttgtaacagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaag-aacaag 29121442  T
975 catccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaag 1074  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
29121443 catccagtgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaag 29121542  T
1075 ccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    |||||||||||||           || || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
29121543 ccttaagttgcat-----------ctacaacttctggtgatttttagattctgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatga 29121618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 152; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 108 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20649673 - 20649445
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
20649673 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggattgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 20649574  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20649573 cttctgatgaaatgttcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 20649474  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcactt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
20649473 acggaagtagtccagtcccccttgcactt 20649445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 107 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3189218 - 3188988
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||    
3189218 atgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgaga 3189119  T
200 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3189118 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 3189019  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcactt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
3189018 acacggaagtagtccagtcccccttgcactt 3188988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 159 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29030325 - 29030156
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29030325 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 29030226  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29030225 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac 29030156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 146; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 694 - 1184
Target Start/End: Original strand, 17247035 - 17247525
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  ||    
17247035 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgatc 17247132  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| | | ||||||||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||  |||| || ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
17247133 ttttgcctgatatggttattgtcctttgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagtaacatctt-tgctggcagagctgtttttcttgccttg 17247231  T
890 tagcgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | || ||||| |||| | ||| |||||| |||    
17247232 tagtagagacaaaaaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatg-ttctttgaagaacaaacattcaatgccttc 17247330  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| ||||| | ||||    
17247331 aaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttt-ccaatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaagattcatc 17247429  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
17247430 tcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgacatcaccacttcaggagcacttt 17247525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 138 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9921180 - 9920958
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
9921180 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9921084  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9921083 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9920984  T
332 caaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
9920983 caaggagatttcactataatcacaaa 9920958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 166 - 356
Target Start/End: Original strand, 28050050 - 28050238
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
28050050 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 28050146  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28050147 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 28050238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 693 - 1186
Target Start/End: Complemental strand, 14605224 - 14604734
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
14605224 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 14605127  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | ||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| ||||    |||||||| ||||||| | ||||||||    
14605126 ctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacat----tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 14605031  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||  | |||| |||||||||||| |||    
14605030 gtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tcttcaaagaacaagcatccaatgctttc 14604932  T
989 aaattc-tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgc 1085  Q
    |||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||  |||     
14604931 aaatccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttgg 14604832  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||| | ||||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
14604831 atctcctgatgaagtttagcttctgatgatctt--gcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttg 14604735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 163 - 356
Target Start/End: Original strand, 49509461 - 49509652
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
49509461 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 49509557  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49509558 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 49509652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 901 - 1130
Target Start/End: Complemental strand, 56533173 - 56532943
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||    
56533173 aaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaaacatctaatgcattcaaatcctttcaa 56533074  T
1001 aatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaat-ccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaac 1099  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||    
56533073 aatagccgttgcttcattttttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaagttacatcctctaatgaac 56532974  T
1100 tgcagcttctgatgatttttggcttctgata 1130  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
56532973 tgcagtttctggtgatttttggcttctgata 56532943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 900 - 1129
Target Start/End: Original strand, 54679929 - 54680155
Alignment:
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttca 999  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || |||| | |||||||||| ||||||| ||||||    
54679929 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttt-gaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttca 54680027  T
1000 aaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaac 1099  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
54680028 aaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttga--ccattaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaac 54680125  T
1100 tgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||    
54680126 tgcagcttctggtgattttcagcttctgat 54680155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 6517446 - 6517729
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
6517446 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctct 6517545  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  ||||||  |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
6517546 tt-gaagaataagcatctcatgctttccaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaa 6517644  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||    
6517645 ataacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatga 6517729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 266 - 934
Target Start/End: Original strand, 33377762 - 33378444
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-ga 359  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
33377762 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccattacacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 33377861  T
360 ttacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagactt 457  Q
    |||||| | ||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
33377862 ttacaacttctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 33377958  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    |  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||| | |  |||  ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
33377959 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaatagaattacgcagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 33378058  T
557 atac-aatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgaca 647  Q
    |||| ||| |||   |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   |||||||   ||  ||  |  ||| ||    
33378059 ataccaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaaattggca 33378158  T
648 gagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctc-tatc--ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-g 743  Q
    ||||||  |||||||| | |||||   |||||| ||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | |    
33378159 gagtttgagcgcttttta-cttgt---tgtctcgtatcactgatctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaag 33378254  T
744 cacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 842  Q
    ||| || | ||||||||| |||||  |||||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |  ||||||| ||||||    
33378255 cacatcaatagagtcgttgtgaaa--ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcacgttcaaatccattcc 33378352  T
843 catcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||| |||| ||||||||| | | ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33378353 tatcttgaaggaacat-ttctgcaggtagaactgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 33378444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 129; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 201 - 376
Target Start/End: Original strand, 19570536 - 19570711
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||    
19570536 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaatgatcaaagcagagaaaagaagaataa-gatacaagcagttatcctggttccttccaca 19570634  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac 376  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19570635 aaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac 19570711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 125; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Original strand, 412792 - 413246
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
412792 aagtcttcatttctttatatagaggtgtgaaagagacattgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 412889  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| |   || || ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| | ||||| | ||||| ||    
412890 cttttgcctgatatggttactgttctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagaactgtttttcttgtttt 412988  T
889 gtagcgtggacaaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||| | ||| |||||| ||    
412989 gtagcaaagacaaagaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaaacattcaatgcctt 413087  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcat 1087  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||    
413088 caaatcctttcaaattagccgttgcttcacttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaagttgaat 413187  T
1088 cccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
413188 ctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 413246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 693 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 37435856 - 37435352
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataat--cagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |  ||||| ||| |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |      
37435856 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttatgaatttgccagcatgtcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatga 37435759  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    || |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||   || || ||||| | |||||||| ||||||| | |||||||    
37435758 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatagt-tgcaggcagagctgtttttcttgtct 37435660  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    | ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||    
37435659 tatagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgcctt 37435561  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgc 1085  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  || |||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  ||||    
37435560 caaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgc 37435461  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttt-----tg-------gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 1173  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||     ||       ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
37435460 atctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcctctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttc 37435361  T
1174 agaagcact 1182  Q
    || ||||||    
37435360 aggagcact 37435352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Original strand, 19884493 - 19884947
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||| | |  |||   |||||||||||| |  ||||||||  ||||| |      
19884493 aagtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaatttccagcgcattcaaaatagagtcgtttgaagt--tttgatcaatcaccaatga 19884590  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    || |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||| ||||  |||||| |||| || |||||||| ||||||| | |||||||    
19884591 tc-tttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtct 19884688  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    ||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||    
19884689 tgtagcagagacaaaaacagattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgcctt 19884787  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgc 1085  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||| | || | | |||||||| |||||  ||||    
19884788 caaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacatcctttgaagctttaagtcttgc 19884886  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||    
19884887 atctcctgatgaactacagcttctggtgattgtcagcttctgatgaacttgcttctgatga 19884947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 107 - 462
Target Start/End: Original strand, 23508563 - 23508926
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    |||||||||    || |||||    
23508563 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaaattcttcttctgatatcaattcagaagcttggtgagagtg 23508662  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    ||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
23508663 cttctgatatgatattcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttcattccacaa 23508760  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagactt 394  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
23508761 accggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagactt 23508859  T
395 cacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
23508860 ctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 23508926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 431 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 14778979 - 14778473
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||    
14778979 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 14778880  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgt 625  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  ||    
14778879 acttgatatactatcagtggtgttcacaaaacaatgcaattgaaagactctagtcttaagaatttctaagatttatcaaatgaacacagaaattcaaagt 14778780  T
626 gctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 721  Q
    |||||| | ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14778779 gctttgcatgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttttaacttgtcgtattgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 14778681  T
722 aaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaa 820  Q
    | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||    
14778680 agagagacgttgagatctttaagcacgtc-aaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaa 14778583  T
821 gaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggta 920  Q
    | || |  ||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||    
14778582 ggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggta 14778484  T
921 gtggttgtaca 931  Q
    |||||||||||    
14778483 gtggttgtaca 14778473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 693 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 22675841 - 22675404
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  || || |  |    
22675841 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcatcaatgat 22675744  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | || ||||| |||| || | ||||||||    
22675743 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgtaggcagagctatttttcttgtctt 22675645  T
889 gtagcgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||| || |||| |||||| ||||| ||    
22675644 gtagcagagacaaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatcaaatgcctt 22675546  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcat 1087  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||    
22675545 caaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttatgttgcat 22675446  T
1088 cccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    | | | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
22675445 ctcctaatgaactgcagcttctggggattttttgcttctgat 22675404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 268 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8183613 - 8183486
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8183613 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 8183514  T
368 gctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||    
8183513 gctcaatactatctaagtatgagacttc 8183486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 431 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 14711315 - 14710809
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||    
14711315 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 14711216  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgt 625  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  ||    
14711215 acttgatatactatcagtggtgttcacaaaacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatttatcaaatgaacacagaaattcaaagt 14711116  T
626 gctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 721  Q
    |||||||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
14711115 gctttgtatgaaacaaatttggcagagtttaggcgctttttaacttgtcgtattgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtg 14711017  T
722 aaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaa 820  Q
    | ||||||||||||||   | |||||||| ||||||||| |||| |  | |||||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||    
14711016 agagagacgttgagatctttaagcacgtc-aaagagtcg-ttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaa 14710919  T
821 gaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggta 920  Q
    | || |  ||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||    
14710918 ggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacat-ttctataggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggta 14710820  T
921 gtggttgtaca 931  Q
    |||||||||||    
14710819 gtggttgtaca 14710809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 159 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17199271 - 17199074
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||    
17199271 aaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttgaaaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaa 17199172  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17199171 agaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 17199074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 17398993 - 17398551
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
17398993 agtcttcactcctttatatagaggtgtggaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 17398896  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| ||||||||   ||||   ||||  | |||||||| ||||||| || ||||||||    
17398895 atttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccaatgtgaataaacattgt-tgcaggcagagctgttatccttgtcttg 17398797  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  ||||||||||||         
17398796 tagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgc----- 17398703  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
        ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||     
17398702 ----ctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatct 17398608  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
17398607 cctgatgaaccgcagcttctggtgattcatagcttctgatgaacttgcttctgatga 17398551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 16820192 - 16819825
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||| ||||||||   ||||||||||    || |||||||    
16820192 tgaaggtgagaaaaacagaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcctaaaattctttttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgct 16820093  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagat------atgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 296  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||      | |||||||||  | |||| || ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
16820092 tctgatgtgatgttcagaatcagattcaaatacgcagcggaataaaaacatagtagagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcctggttccttcc 16819995  T
297 acaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgag 390  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||    
16819994 acaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactaac-tagtatgag 16819896  T
391 acttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16819895 acttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 16819825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 693 - 1150
Target Start/End: Original strand, 3395380 - 3395840
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||   ||||||||||||   |||||||||  ||||| |      
3395380 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatga 3395477  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatct-tgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtc 886  Q
    ||||| ||||||| ||  | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| || | || ||| ||||  | |||||||| ||||||| || |||||    
3395478 tccttagcctgatatgattattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc-atgtatgtaggaacattgt-tgcaggcagagctgttatccttgtc 3395575  T
887 ttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgt 986  Q
    |||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || |||||||||||||||| |    
3395576 ttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aactagcatccaatgctt 3395674  T
987 tcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttg 1084  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||  || |||||||| || | |||||||||  |||||  |||    
3395675 tcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttg 3395774  T
1085 catcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactt 1150  Q
    |||| | |||||||||  |||||||  |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
3395775 catctcctgatgaactatagcttctagtgatcttcaacttctgataaacttgcttctgatgaactt 3395840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 449 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 17994310 - 17993824
Alignment:
449 aagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtg 547  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||| || |||||||||||||||||||||||    
17994310 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtg 17994211  T
548 gtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatcag-tt 642  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||| | |||| ||  ||    
17994210 gtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgagaaacaaatt 17994111  T
643 tgacagagttttggcgcttttgaacttgtata--tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataa 739  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||  |  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |      
17994110 tggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgaattgtctctaa-taatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgttgagagacgttgagttct 17994013  T
740 tca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattca 838  Q
    | | ||||||| |||||||| ||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| ||    
17994012 ttaagcacgtc-aaagagtcattgagaaacctt-gatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatcca 17993916  T
839 ttcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
17993915 ttcctaacttgaagggacat-ttctgcaggcagagctattatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtaca 17993824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 863 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 13576264 - 13575998
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||   ||||| |||||||||| |    
13576264 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctct 13576165  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
13576164 tt-gaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattga 13576066  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    | ||  |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
13576065 acaggctttgaagctttatgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgat 13575998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 880 - 1184
Target Start/End: Original strand, 45833373 - 45833677
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    |||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||  |||||||    
45833373 tcttgttttgtagcagagaccaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaa-agcatcc 45833471  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||    
45833472 aatgcattcaaatactttcaaaatagaagttgcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta 45833571  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||  ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||  |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
45833572 agtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgat-gagatgcttatgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaaga 45833670  T
1178 gcacttt 1184  Q
    |||||||    
45833671 gcacttt 45833677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 863 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 3105569 - 3105319
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |    
3105569 tgcaggcagagctgttatccttgccttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctct 3105470  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  | |||||||| | ||  ||| |||||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||    
3105469 tt-gaagaataaccatccaatacttttcaatcctttcaaaatagccgttggaatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatccttgaa 3105372  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
3105371 acagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctgatga 3105319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 201 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 14711521 - 14711253
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga---aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 297  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||||||||||    
14711521 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttcca 14711424  T
298 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgag 390  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||    
14711423 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 14711324  T
391 acttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
14711323 acttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 14711253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 201 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 14779185 - 14778917
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga---aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 297  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||||||||||    
14779185 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttcca 14779088  T
298 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgag 390  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||    
14779087 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 14778988  T
391 acttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
14778987 acttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 14778917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 36210647 - 36210136
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||    
36210647 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 36210548  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagt 623  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||| |||||||| |   ||||||||||      
36210547 acttaatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttcaaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaa 36210448  T
624 gtgctttgta-gaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtata--tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgt 720  Q
    |||||||||  |||  | |||| |||||||| ||||||||| |||||||     |||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
36210447 gtgctttgtgtgaaaaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtcttgtctcta-ctgatctttaagttttcactcctttatatagaggtgt 36210350  T
721 gaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttga 819  Q
    || ||||||||||||||  | | ||| ||| | |||||||||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| |||    
36210349 gagagagacgttgagatctttaagcatgtcaatagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatga 36210251  T
820 agaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagg 918  Q
    || || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
36210250 aggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttatgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggagg 36210152  T
919 tagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||    
36210151 tagtggttgtacactt 36210136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 881 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 12811306 - 12811007
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||     |||| ||||||||    
12811306 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctatta----gaacaagcatcca 12811211  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||   | |||||||| || | | |||||||| ||||    
12811210 atgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaa 12811111  T
1081 g--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
    |  ||||||| | | |||||||  |||||||| |||| ||   || |||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
12811110 gtcttgcatctcctaatgaactagagcttctggtgatcttctactactgat-gagatgcttctgatgaacttgcttttgatgacgttatcacttcagaag 12811012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 918 - 1142
Target Start/End: Original strand, 3483738 - 3483963
Alignment:
918 gtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcac 1017  Q
    ||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
3483738 gtagtggttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 3483836  T
1018 ttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||| | | |||||||  | |||||| ||||    
3483837 ttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtgat 3483936  T
1116 ttttggcttctgataaacttgcttctg 1142  Q
     ||  ||||||||| ||||||||||||    
3483937 cttcagcttctgatgaacttgcttctg 3483963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 880 - 1186
Target Start/End: Original strand, 16632419 - 16632723
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| || ||||    
16632419 tcttgtcttgtagcagagacacaaactgattggtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagaatcc 16632517  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| || |||||||| || | | |||||||| |||    
16632518 aatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta 16632617  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||  ||||||| | |||||||||  |||||||  |||| ||  |||||||||  |  ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
16632618 agtcttgcatctcctgatgaactttagcttctagtgatctt--gcttctgat-gagatgcttttgatgaccttgcttctgatggtgtcatcacttcagaa 16632714  T
1178 gcactttga 1186  Q
    |||||||||    
16632715 gcactttga 16632723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 84; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 973 - 1184
Target Start/End: Original strand, 55731851 - 55732060
Alignment:
973 agcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttga 1072  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| || || | |||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
55731851 agcatccaatcc-ttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatttacctctccagtcttttgcaattgttagacgagtttgaatccattaaacaacttttga 55731949  T
1073 agccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt 1172  Q
    ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
55731950 agttttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttccggtgattctcagcttct-aaaaacttgtttctgatgaccttgcttctgatggcatcatcactt 55732048  T
1173 cagaagcacttt 1184  Q
    ||| ||||||||    
55732049 caggagcacttt 55732060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 693 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 19621381 - 19620958
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
19621381 aagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 19621284  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||| | |||||||| |  ||||||| ||||||||   || ||| | ||  | |||||||| ||||||| || |||||||    
19621283 cttttgcctgatatggttattgtcatatgaagaatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaaaattgt-tgcaggcagagctgttatccttgtctt 19621185  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   | |||| |||||||||||| |||    
19621184 gtagcagagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcata-gaacaagcatccaatgctttc 19621086  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa--gttgca 1086  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || || ||||||  || |||||| ||||||||||| || | | |||||||| ||||   |||||    
19621085 aaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgca 19620986  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||    
19620985 tctcctgatgaacttcagcttctgatga 19620958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43347236 - 43347078
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
43347236 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 43347140  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttcct 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
43347139 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcct 43347078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 433 - 957
Target Start/End: Original strand, 1671908 - 1672445
Alignment:
433 tgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacac 530  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||    
1671908 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 1672007  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgt 625  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| | | |||||||||   ||    
1672008 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaatacagaaattctaagt 1672107  T
626 gcttt-gtag--aatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatat-gtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtg 719  Q
     |||| |||   ||| | ||   |||||||| |||||||| ||| ||||  || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
1672108 acttttgtatgaaatgatttcagcagagtttaggcgcttt-gaa-ttgttgattgtctctctcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtg 1672205  T
720 tgaaagagacgttgagataatca--gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctt 816  Q
    | ||||||||||||| ||  |    ||||||| | ||||||||| ||||   |||| || || ||||| |  || |||||||||||||| | | |||||     
1672206 taaaagagacgttgaaatctttttggcacgtcaatagagtcgttctgaag--ctttcataattcaccattgatcttttgcctgatttggttattgtccta 1672303  T
817 tgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtgg 915  Q
    ||||| || |  ||||||| | ||||||   || |   ||||  | ||||| || ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
1672304 tgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattatttgcagacagagctgttattcttgttttgtagcgtagacaagaacagagtagtgg 1672403  T
916 aggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacg 957  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
1672404 aggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacg 1672445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 864 - 1070
Target Start/End: Original strand, 16939978 - 16940183
Alignment:
864 gcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgctttt 962  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |      
16939978 gcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagggacaaaaacatagcagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tcc 16940076  T
963 ttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaa 1062  Q
    |||| |||  ||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
16940077 ttgaagaataagcattcaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatc-ttagacgagtttgaatccattaag 16940175  T
1063 tagctttt 1070  Q
     |||||||    
16940176 cagctttt 16940183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 880 - 1071
Target Start/End: Complemental strand, 25651235 - 25651046
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||| || |||  ||||| |    
25651235 tcttgtcttgtagcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctcttt-gaagaataagcattc 25651138  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttg 1071  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||    
25651137 aatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgcttcacttttcaagtcttctgcgatctttagacaagtttgaatccgttaaacaacttttg 25651046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 693 - 1115
Target Start/End: Original strand, 55380081 - 55380505
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | ||||| |  |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
55380081 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgttagcacataaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 55380178  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||||||||| |   |||||| ||||  | |||||||| ||||||| |  |||||||    
55380179 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgttattattgtctt 55380277  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| | ||  | |||| |||||||||||| |||    
55380278 gtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgc-tcttcaaagaacaagcatccaatgctttc 55380376  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatag-cttttgaagccttaag--ttgc 1085  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||  |||| |  | || |||||||| || || |||||||||| |||||  ||||    
55380377 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaat-gttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgc 55380475  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    ||| | | ||||||| ||||||||||||||    
55380476 atctcctaatgaacttcagcttctgatgat 55380505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 693 - 1098
Target Start/End: Complemental strand, 37985932 - 37985525
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
37985932 aagttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 37985835  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtctt 888  Q
    | |||||||||| | | | | ||||| ||||| || |  ||||||| ||||||||   || ||| ||||  | |||||||| || |||| || ||||| |    
37985834 cttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcagagttgttatccttgtcct 37985736  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || ||| |||||||||||| |||    
37985735 gtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttc 37985637  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||| ||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  |||||    
37985636 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 37985537  T
1087 tcccatgatgaa 1098  Q
    || |||||||||    
37985536 tctcatgatgaa 37985525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 693 - 1144
Target Start/End: Original strand, 56034363 - 56034816
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga--taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||  ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |      
56034363 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaatttgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatga 56034461  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtct 887  Q
    || ||||| |||| ||| | | ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||   || || ||||| | || ||||| ||||||| || ||||||    
56034462 tcttttgcttgatatggttattgtcctatgaaagatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatagt-tgtaggcagagctgttatccttgtct 56034560  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    |||||    |||| | |  ||||||||||| |||| |||||||| ||    |||  |||||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||| ||    
56034561 tgtagtagagacacatattgagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaaacatccaatgcctt 56034659  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgc 1085  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  || |||||| || |||||||| || ||  |||||||| |||||  ||||    
56034660 caaattatttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgc 56034759  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgat 1144  Q
    |||   ||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||    
56034760 atcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgat 56034816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 863 - 1059
Target Start/End: Original strand, 9140873 - 9141069
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||||   |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |    
9140873 tgcaggcagagctgttatccttgtcttatagcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctct 9140972  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt 1059  Q
    |   || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||||||||    
9140973 tcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccatt 9141069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 881 - 1082
Target Start/End: Original strand, 19666352 - 19666552
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||   || ||| || || ||    
19666352 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaag-aacaagtattca 19666450  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |||| | ||| |||| ||||    
19666451 atgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaa 19666550  T
1081 gt 1082  Q
    ||    
19666551 gt 19666552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 881 - 1185
Target Start/End: Original strand, 40860647 - 40860941
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | ||||| |||  ||||||||    
40860647 cttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatcca 40860745  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    ||||          ||||||| ||| | ||||   ||||||||||| ||||||||| | ||| |||| |  | ||| | ||| | |||||||| | ||||    
40860746 atgc---------atttcaaattagccattgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagttatagtccttgaaacaacttttgaaactttaa 40860836  T
1081 gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||| |||| | |||||||||| |||||||| ||||      |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
40860837 gttccatctcctgatgaactgtagcttctggtgatacacaacttctgatgaacctgcttatgatgaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 40860936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 268 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 36210784 - 36210587
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagatta 362  Q
    |||||||| || |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||    
36210784 agacacaaacaattatactggttcgttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 36210685  T
363 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||| ||||  |  | ||||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
36210684 caactgctcaagactacacctagtatgagaattcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 36210587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 693 - 1058
Target Start/End: Original strand, 10072725 - 10073091
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| |  |||   || |||||||||   |||||||||  ||||| |      
10072725 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacattcaaaatagaatcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatga 10072822  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    || |||| ||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| || |||||| |  |||||| | |||||||    
10072823 tcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggtagggctgtttttcttgtct 10072921  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    | ||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||| ||    
10072922 tatagcagagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgc-tctttgaataacaagcctccaatgcctt 10073020  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccat 1058  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||| || |||||||    
10073021 caaatcctttcaaactagcagttgcttcacttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatccat 10073091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 863 - 1059
Target Start/End: Complemental strand, 29680694 - 29680498
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| | || ||||||||||| || || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |    
29680694 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacatactgagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 29680595  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt 1059  Q
    |   || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| || || ||||||||    
29680594 tcaaag-aacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccatt 29680498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 243 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39532399 - 39532269
Alignment:
243 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tt 341  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
39532399 aacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttacaaggagattt 39532302  T
342 tcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaa 373  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
39532301 tcactaaaaatcacacagattacaaatgctcaa 39532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 902 - 1082
Target Start/End: Original strand, 12601102 - 12601281
Alignment:
902 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaa 1001  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
12601102 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 12601200  T
1002 atagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt 1082  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| ||||| || ||||||    
12601201 atagtcgttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagt 12601281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 968 - 1184
Target Start/End: Original strand, 14833462 - 14833674
Alignment:
968 gaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagct 1067  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||| || | |     
14833462 gaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatctattgaacatcc 14833561  T
1068 tttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtc 1165  Q
    |||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | || ||||||  ||| ||  ||||||||      ||||||| |||||| ||||||||||||| |     
14833562 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctga------tgcttcttatgaacctgcttctgatgacttt 14833655  T
1166 atcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||| ||||||||    
14833656 atcacttcaggagcacttt 14833674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 524 - 957
Target Start/End: Original strand, 1674476 - 1674920
Alignment:
524 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| | | |||||||    
1674476 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaatacagaaat 1674575  T
619 tcagtgtgcttt-gtag--aatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatat-gtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatat 712  Q
    ||   || |||| |||   ||| | ||   |||||||| |||||||| ||| ||||  || |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
1674576 tctaagtacttttgtatgaaatgatttcagcagagtttaggcgcttt-gaa-ttgttgattgtctctctcttttatcttcaagtcttcactcctttatat 1674673  T
713 agaggtgtgaaagagacgttgagataatca--gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgt 809  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  |    ||||||| | ||||||||| ||||   |||| || || ||||| |  || |||||||||||||| | |    
1674674 agaggtgtaaaagagacgttgaaatctttttggcacgtcaatagagtcgttctgaag--ctttcataattcaccattgatcttttgcctgatttggttat 1674771  T
810 agtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacaga 908  Q
     ||||| ||||| || |  ||||||| | ||||||   || |   ||||  | ||||| || ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
1674772 tgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattatttgcagacagagctgttattcttgttttgtagcgtagacaagaacaga 1674871  T
909 gtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacg 957  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
1674872 gtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacg 1674920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 880 - 1001
Target Start/End: Original strand, 16853482 - 16853602
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
16853482 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgc-tctttgaggaacaagcatcc 16853580  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaa 1001  Q
    ||||| ||||||| | ||||||    
16853581 aatgctttcaaatcccttcaaa 16853602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 880 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 19912013 - 19911762
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||| |||  | |||  |||||||    
19912013 tcttgtcttgtagcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatcc 19911914  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  || || ||||||  || |||||| ||||||| ||| || | | ||| |||| |||    
19911913 aatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagcttta 19911814  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||    
19911813 agtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgat 19911762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1092 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 3499582 - 3499491
Alignment:
1092 tgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||| |||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
3499582 tgatgatctgcagcttctggtgaactt--gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcagaagcactttg 3499491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 863 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 9751690 - 9751569
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |     
9751690 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtgcaaacatactatgtcaacgc-tc 9751592  T
962 tttgaggaactagcatccaatgc 984  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
9751591 tttgaagaattagcatccaatgc 9751569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 22190807 - 22191082
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtctt-gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |     
22190807 tgcaggcagagctgttatctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tc 22190905  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||| |||  ||||||||||||          |||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||| | ||  | || | || ||| | ||    
22190906 tttgaagaatcagcatccaatgc---------atttcaaaatagttgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaagcaagttagagtccttgaa 22190996  T
1062 atagcttttg-aagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | |||||||| || | ||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||    
22190997 acagcttttgaaaactttaagttccacctcttgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgatga 22191082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 693 - 959
Target Start/End: Original strand, 6641475 - 6641742
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
6641475 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaaaagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 6641572  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| |||||||| |  ||||||| |||||| |   |||||| ||||  | |||||||||| ||||| | |||||| |    
6641573 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaagaatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgt-tgcaggcatatctgttattcttgtcct 6641671  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
     ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
6641672 atagcagagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 6641742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 863 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 14904506 - 14904252
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| |||| |||||| || |||||||  ||||||| |||  ||||| |||||||||| |    
14904506 tgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctct 14904407  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || ||  |||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| || ||||| || |    
14904406 tcaaag-aataagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatggacgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttga 14904308  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||||||| | ||||||||| || |||||| ||||    
14904307 atagcttttgaagctttaggtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 14904252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 460 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 39532277 - 39532174
Alignment:
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
39532277 aatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaagatacagagaaa-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 39532179  T
559 acaat 563  Q
    |||||    
39532178 acaat 39532174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 995 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 17700825 - 17700639
Alignment:
995 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatga 1094  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||| ||  | |||| |||||||| | ||| | |||||||||| ||| |||| |||   |||    
17700825 tttcaaaatagccgttg-ttaactttccaagtcttctgcaattttctggcgagcttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaggttg-atcttctga 17700728  T
1095 tgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||| |||||||||||| |||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17700727 tgatctgcagcttctggtgaactt--gcttctgatgaacttgcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcactttagaagcactttg 17700639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 863 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 39419884 - 39419784
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
39419884 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttt 39419785  T
962 t 962  Q
    |    
39419784 t 39419784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 880 - 1184
Target Start/End: Original strand, 40846078 - 40846382
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   |  | | |||||||    
40846078 tcttgtcttgtagcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaa-agcaagcatcc 40846176  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagc-ttttgaagcctt 1078  Q
    ||||| ||||| ||| ||  || |||||||||||||||||| |  || |||||||||  | || || | || |||||||| || ||| ||||||||| ||    
40846177 aatgctttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactttcctggtcttctgcaatgct-aggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagcttt 40846275  T
1079 aagttgc--atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaga 1176  Q
    ||||  |  |||   ||||||||| ||||||| | |||| ||  ||||||||| |  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
40846276 aagtctctcatcttctgatgaacttcagcttccggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcagg 40846374  T
1177 agcacttt 1184  Q
    ||||||||    
40846375 agcacttt 40846382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18775674 - 18775559
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 361  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
18775674 agacacaaacaattatcctggttccttccacgaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaacgagatttccactatgaaataatcacacagatt 18775575  T
362 acaaatgctcaatact 377  Q
    |||| |||||||||||    
18775574 acaactgctcaatact 18775559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 275
Target Start/End: Original strand, 25067344 - 25067451
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
25067344 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 25067440  T
265 caaagacacaa 275  Q
    |||| ||||||    
25067441 caaacacacaa 25067451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 268
Target Start/End: Original strand, 49503396 - 49503499
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
49503396 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 49503492  T
262 aaacaaa 268  Q
    | |||||    
49503493 agacaaa 49503499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19889717 - 19889443
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaatactatcaaaa 384  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |   |||||||| || |||  |  |  |||     
19889717 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgattacaattgatca--agcacaaaag 19889620  T
385 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagag 483  Q
     | ||||||||   ||||| |||||||||| |  ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||    
19889619 caagagacttc---aaactactcaagcacaaaatcaagaggtttcctatgctcaagcacaaagacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagag 19889523  T
484 acttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga--cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||| |||||||| |  |||| ||||  | ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
19889522 acttctaatcaaacagaattacacagaa-aatgtttgaggtttgaacacttgacatacaatcagtggtgttcacaatacaa 19889443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 419 - 562
Target Start/End: Original strand, 16939534 - 16939681
Alignment:
419 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaa 515  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||  |     
16939534 caagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaaat 16939633  T
516 gtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
16939634 gtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 16939681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18776005 - 18775930
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 343  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
18776005 agacacaaacaattatcctggttccttccacgaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaacgagatttc 18775930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 863 - 984
Target Start/End: Original strand, 20977418 - 20977539
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |     
20977418 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgc-tc 20977516  T
962 tttgaggaactagcatccaatgc 984  Q
     ||||||||  ||||||||||||    
20977517 cttgaggaataagcatccaatgc 20977539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 403 - 567
Target Start/End: Original strand, 18394034 - 18394198
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||  |  |||||||||||  | ||||||||     
18394034 tgctcaagaacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaacagatttcttatgctcaagcacaaaaacaagagacttcaaaacaaacaaat 18394133  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa 567  Q
     |||  | || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
18394134 -tacgaaaaaataagtttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaaaacaa 18394198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 10249647 - 10249693
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10249647 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 10249693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 18752307 - 18752246
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18752307 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 18752246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 18762917 - 18762856
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18762917 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 18762856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 18773842 - 18773888
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18773842 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18773888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 863 - 984
Target Start/End: Original strand, 38513839 - 38513960
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | || ||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |     
38513839 tgcaggcagagctgtttttctcgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgc-tc 38513937  T
962 tttgaggaactagcatccaatgc 984  Q
    ||||| ||| || ||||||||||    
38513938 tttgaagaattaacatccaatgc 38513960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 3106178 - 3105879
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta--taatcacaaagatt 361  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  |   ||||    
3106178 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagttatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatc--tgatt 3106081  T
362 acaaatgctcaatact-atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 459  Q
    ||||||| ||| |||| | |  | || ||||||||   ||| ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||  | ||  || ||||||||||||    
3106080 acaaatgttcactactaaacttagtaagagacttc---aaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttct 3105984  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
3105983 attgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaaatgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 3105884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 567
Target Start/End: Original strand, 7222001 - 7222165
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| ||  |||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||| |||| | ||||||||     
7222001 tgctcaagcacataagcaagagacttcaaacactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagatttctaaacaaacaaat 7222100  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa 567  Q
     |||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||    
7222101 -tacacagaaataagttttatttgaacacttgatatgcaatcactggtgttcataatacaaaacaa 7222165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 9752277 - 9751982
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtag-tccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat--aatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caa 382  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||  |   |||||||||||||||||||||  |      
9752277 ggttccttccacaaaccggaagtcggtcctgtcccccttgcacttccaagaggagttcactatgtaatatct--gattacaaatgctcaatactaaactt 9752180  T
383 aatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 481  Q
    | ||||||||||||   || ||||||||||||   ||||||| | ||| ||||||||| || | | ||||||||||||| |||||||||||    |||||    
9752179 agtatgagacttca---aattgctcaagcacaactgcaagagacatcctatgctcaagaacaagatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaag 9752083  T
482 agacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaataca-ataaagactct 577  Q
    |||||||| |  ||||||| |  ||||  |||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||    
9752082 agacttctaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaaatcagataaagactct 9751983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 10693070 - 10693119
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
10693070 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 10693119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 10906836 - 10906885
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
10906836 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 10906885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 13693199 - 13693280
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
13693199 aaagacacaagcaattatacaggttccttccataatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13693280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 14571243 - 14571292
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
14571243 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 14571292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 17527000 - 17526804
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||  || | ||| | |||  || |||||||||  | |||| |||||||| | ||||||||     
17527000 tgctcaagcatacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaaactagatatttcgtattctcaagcacaaaagcaaaagacttctaaacaaacaaat 17526901  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactct-agact-ttgaatttctaagat 597  Q
     |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||    
17526900 -tacaaagaattcagtttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcataatacaaaacaattcagactctaagactctagaatttctaagat 17526804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 20977648 - 20977697
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20977648 gcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 20977697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 399 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 41115381 - 41115216
Alignment:
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| ||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||    
41115381 aaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgcttaagaactaaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaac 41115282  T
498 aaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    | |  |||| |||| || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
41115281 agaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatgtacaatcagtggtgttcacaatacaa 41115216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 562
Target Start/End: Original strand, 55731221 - 55731497
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat--aatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caa 382  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  |   ||||||||||| ||| |||||  |      
55731221 ggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatct--gattacaaatgttcactactaaactt 55731318  T
383 aatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 481  Q
    | || ||||||||| |    |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||  | ||  || ||||||||||||| |||||||||||  | |||||    
55731319 agtaagagacttcaaa----tgctcaagcacaaatgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaag 55731414  T
482 agacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||  ||||||| |  |||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
55731415 agacttctgaattcaaacataattacaaagaa-tatgtttgagtttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaa 55731497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Original strand, 18473522 - 18473682
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||| |||  |||||||||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||| |||     
18473522 tgctcaagcatacaagcaagagacttcaaatactcaaccacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttatgaacaaataaaa 18473621  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
     |||| ||||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
18473622 ttacatagaaagatggttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacactacaa 18473682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 39419635 - 39419587
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39419635 cttctgatgaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 39419587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 55379683 - 55379743
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
55379683 ggttccttccacaaaacggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 55379743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 690 - 733
Target Start/End: Original strand, 13027567 - 13027610
Alignment:
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13027567 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13027610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1039 - 1146
Target Start/End: Original strand, 14571161 - 14571268
Alignment:
1039 ttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgct 1138  Q
    |||| |||| |||||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||    ||||||||| ||||||||    
14571161 ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgct 14571260  T
1139 tctgatga 1146  Q
    ||||||||    
14571261 tctgatga 14571268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17788613 - 17788498
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
17788613 caagagaattcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagt 17788514  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
17788513 ggtgttcacaatacaa 17788498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 8685767 - 8685721
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
8685767 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 8685721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 10661492 - 10661446
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10661492 atcttcaagccttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 10661446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 10875637 - 10875591
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10875637 atcttcaagccttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 10875591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 14154321 - 14154275
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14154321 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaatagacgttg 14154275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 881 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 15475274 - 15475050
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||   ||||||||    
15475274 cttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtattggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgc-tctttgaggagtaagcatcca 15475176  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    ||||          ||||||||||| ||||||   ||||||| | | |||||||||||||||||||| |  ||||| | ||| |||||||||| | || |    
15475175 atgc---------atttcaaaatagccgttgccatacttttctactcttctgcaatctttagacgagttaaaatccttgaaacagcttttgaaactttga 15475085  T
1081 gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    |||  ||  | |||||||||| |||||||| ||||    
15475084 gttcaatttcctgatgaactgtagcttctggtgat 15475050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 40860205 - 40860322
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  |||| || |  |||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
40860205 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaatcagaattacaaagaaaaatgtttgacgttgaacacttgatatacaatca 40860304  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
40860305 gtggtgttcacaatacaa 40860322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1182
Target Start/End: Original strand, 1672623 - 1672684
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
1672623 gcttctgataggcttgcatctgatgaacttgcttctgatgacgtcataactacagaagcact 1672684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1182
Target Start/End: Original strand, 1675098 - 1675159
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
1675098 gcttctgataggcttgcatctgatgaacttgcttctgatgacgtcataactacagaagcact 1675159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1152 - 1193
Target Start/End: Original strand, 5023191 - 5023232
Alignment:
1152 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5023191 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 5023232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Original strand, 13693302 - 13693459
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||   ||||||||||||  | || |||||||||| | |||||||      
13693302 tgctcaaacacacaagcaagagacttcaaatactcaa-cacataagcaagagattttgtatgctcaagcacaaaagctagagacttctaaacaaacaat- 13693399  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
     |||| ||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13693400 -tacacagaaagatgtttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcgcaatacaa 13693459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 562
Target Start/End: Original strand, 13890317 - 13890482
Alignment:
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||  ||| || ||||  ||||||||||||  | ||||||| ||||| | |||||    
13890317 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaacacaatagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagtcttctaaacaaac 13890416  T
498 aaagatacagagaattaagtttgacttg-aacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    | |  |||| |||| || ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13890417 acaattacacagaaatatgtttgaggtggaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13890482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17057737 - 17057573
Alignment:
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||  ||| |||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||    
17057737 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaacacaaaagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttttattcaaac 17057638  T
498 aaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    | |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17057637 agaattacaaagaaa-atgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 17057573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Original strand, 17276223 - 17276312
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagag 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||    
17276223 attcttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagaacagag 17276312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 17398576 - 17398519
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||    
17398576 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcacttcaaacttcag 17398519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1193
Target Start/End: Original strand, 19244203 - 19244276
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
19244203 gcttctgatgaagttgcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgaaacttcag 19244276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20571754 - 20571458
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca--caaagatta 362  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||    | |||||    
20571754 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggatagttcactaaaatcaatatatgatta 20571655  T
363 caaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 461  Q
    ||||||||||  |  |  |||  | ||||||||   ||||| |||||||||| | |||||||  |||  |||||||||||| ||  |||||||||||  |    
20571654 caaatgctca--agcacaaaagcaagagacttc---aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcatatgctcaagcacatacacaagagacttccta 20571560  T
462 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatac 560  Q
    || |||| |||  | ||||||||||||| | |||||| |  |||| ||||  | ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
20571559 tgttcaaacacaaaagcaagagacttctaaacaaacacaattacacagaaaaatgttagaggttgaacacttgatatacaaccagtggtgttcacagtac 20571460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 22191057 - 22191106
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
22191057 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttg 22191106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 553
Target Start/End: Original strand, 23123055 - 23123163
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | |||||| || ||||||||||||||||||||    
23123055 caagagacttctaatgctcaagcacaatggcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgagtttgaacacttgatatacaatca 23123154  T
545 gtggtgttc 553  Q
    |||||||||    
23123155 gtggtgttc 23123163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 27188558 - 27188509
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
27188558 gcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcaacacttcagaagcactttg 27188509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1066 - 1146
Target Start/End: Original strand, 3793287 - 3793367
Alignment:
1066 cttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||    
3793287 cttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctagtgattttcagcttctggtgaacttgcttttgatga 3793367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 6641915 - 6641963
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
6641915 tgcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcactt 6641963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 8997115 - 8997032
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
8997115 agcttctgatgaaatcttgcttctgatgaactttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 8997032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 11900564 - 11900624
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
11900564 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11900624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 735
Target Start/End: Original strand, 13890615 - 13890663
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 735  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13890615 atctacaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgttgag 13890663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14154601 - 14154455
Alignment:
419 caagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaa 515  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |  ||||||| |  ||||  |||  |     
14154601 caagagacttcctatgctcaagaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaaatgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaggaaa-at 14154503  T
516 gtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14154502 gtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14154455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14903172 - 14903084
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
14903172 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagtagtcctgtctcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 14903084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 15014707 - 15014667
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15014707 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 15014667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15015124 - 15015064
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
15015124 ggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcacta 15015064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 16939352 - 16939436
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
16939352 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 16939436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 19884084 - 19884168
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19884084 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19884168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 40860459 - 40860499
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40860459 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 40860499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 54679720 - 54679760
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
54679720 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 54679760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 6641297 - 6641336
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6641297 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 6641336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1184
Target Start/End: Original strand, 9141093 - 9141144
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
9141093 cttgcttctgaagaacttgcatctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 9141144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 12600134 - 12600193
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
12600134 gttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgaacttccaaggagagttcacta 12600193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 15135080 - 15135163
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
15135080 aaagacacaaagcagttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtccagtcccccttgcgcatccaaggagagttcacta 15135163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 17994343 - 17994267
Alignment:
385 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
17994343 tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 17994267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 353
Target Start/End: Original strand, 18473427 - 18473506
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
18473427 aagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactaaaatca 18473506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 373
Target Start/End: Original strand, 19052738 - 19052803
Alignment:
307 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 373  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
19052738 agtagtccagtcccc-ttgcacttccaagg-gatttcactataatcacacaagattacaattgctcaa 19052803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 23750060 - 23750175
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
23750060 caagagacttcttatgctcaagcacgactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 23750159  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||| || ||||||||    
23750160 ggtgatcacaatacaa 23750175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Original strand, 24619079 - 24619181
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgct 370  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||   |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
24619079 aagcaattatcctgattccttccataatttggaagtagtctagtcccccatgcacttccaatgagatttttcactttaatcacacaagattacaattgct 24619178  T
371 caa 373  Q
    |||    
24619179 caa 24619181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 695 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 25651415 - 25651376
Alignment:
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25651415 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 25651376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Original strand, 55380494 - 55380541
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
55380494 gcttctgatgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 55380541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1174
Target Start/End: Original strand, 6517704 - 6517742
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6517704 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 6517742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Original strand, 7221936 - 7222007
Alignment:
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa---gattacaaatgctcaa 373  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
7221936 ggaagtagtccagtccgccttgcactttcaatgagatttcactataatc-caaatttgattacaaatgctcaa 7222007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 16853039 - 16853155
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
16853039 caagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctcacttcaaacagaagtacaaagaat-atgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 16853137  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
     |||||||| ||||||||    
16853138 atggtgttcacaatacaa 16853155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 694 - 732
Target Start/End: Original strand, 16939808 - 16939846
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16939808 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 16939846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 766
Target Start/End: Original strand, 17540190 - 17540263
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtc-taaagagtcgtttgaaa 766  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||  ||||||||||||||||    
17540190 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttga-attgtcagcacatcaaaaagagtcgtttgaaa 17540263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17994427 - 17994362
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 334  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
17994427 agacacaagcaattatactggttccttctacaaaccggaagtagtccagtccccc-tgcacttccaa 17994362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 20571325 - 20571279
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
20571325 atcttcaagtctacactcctttatatagaggtgtgaaaaagacgttg 20571279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 23749899 - 23749957
Alignment:
289 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
23749899 ttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 23749957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 695 - 951
Target Start/End: Original strand, 23750315 - 23750572
Alignment:
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcc 791  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| || ||  |||||||||||||   |||||||||  ||||| |  ||     
23750315 gtcttcactcgtttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatgatct 23750412  T
792 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt-gtcttgtcttgt 890  Q
    ||||| |||| ||| | | ||||| ||||| || |  || ||||||||||| |   |||||| |||| |  |||||||| |||||||  |||||||||||    
23750413 tttgcatgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttaaaattcattccaagtatgaaggaacat-tgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgt 23750511  T
891 agcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttg 951  Q
    |||   |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||||    
23750512 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg 23750572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 29120900 - 29121016
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
29120900 caagagacttctaatgctcaagcacgactgcaagagacttctaaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 29120998  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| || |||||    
29120999 gtggtgttcacagtacaa 29121016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41115526 - 41115436
Alignment:
257 aagaaaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 346  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
41115526 aagaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttcctcaaaccggaagtagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 41115436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1181
Target Start/End: Complemental strand, 3105329 - 3105284
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac 1181  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
3105329 gcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcac 3105284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 863 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 3499802 - 3499682
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |   ||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |     
3499802 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaacagagacaaactcagagtagtagaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgc-tc 3499704  T
962 tttgaggaactagcatccaatg 983  Q
     |||| ||| ||||||||||||    
3499703 attgaagaaatagcatccaatg 3499682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14190149 - 14190088
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
14190149 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14190088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 14904212 - 14904163
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
14904212 gcttctgatgaacttgcttctgaagacgtcatcacttcaatagcactttg 14904163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16476129 - 16476056
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
16476129 aagcagttatacatgttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcacta 16476056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 16847921 - 16847982
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
16847921 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16847982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 16852877 - 16852938
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
16852877 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16852938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17788791 - 17788718
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
17788791 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcatttccaaggagagttcacta 17788718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #233
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 20648453 - 20648401
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
20648453 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 20648401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #234
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22676287 - 22676198
Alignment:
261 aaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22676287 aaaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22676198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #235
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 880 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 27188771 - 27188667
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatc 978  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |  ||||||||  ||||||    
27188771 tcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgc-tccttgaggaataagcatc 27188673  T
979 caatgc 984  Q
    ||||||    
27188672 caatgc 27188667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #236
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 4948777 - 4948828
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
4948777 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 4948828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #237
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 6516839 - 6516923
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
6516839 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 6516923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #238
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 553
Target Start/End: Original strand, 9266769 - 9266919
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| | || ||||||||    
9266769 tgctcaagcacacatacaagagactttcaatactcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagactt-ttataaaacaaag 9266867  T
502 a-tacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    | |||| |||||   |||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||||    
9266868 attacaaagaatattgtttg-gttgaacacttaatataaaatcagaggtgttc 9266919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #239
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 730
Target Start/End: Original strand, 11900982 - 11901018
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11900982 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 11901018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #240
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 11915492 - 11915532
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
11915492 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 11915532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #241
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 12600548 - 12600588
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
12600548 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 12600588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #242
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12811751 - 12811635
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat-caaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || |||| | |  ||||  |||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
12811751 caagagacttctaatgctcaagcacaattgcaagagacttctaattcaaatagaattacaacgaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcag 12811652  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| ||||||||    
12811651 tggtgttcacaatacaa 12811635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #243
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 16632231 - 16632271
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
16632231 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttg 16632271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #244
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 16853295 - 16853335
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
16853295 agtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttga 16853335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #245
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17527104 - 17527016
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 352  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
17527104 aaagacacaaagcaattattctggttccttccatgatcggaaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 17527016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #246
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 19954780 - 19954729
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19954780 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19954729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #247
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Original strand, 20579520 - 20579614
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat 229  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
20579520 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat 20579614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #248
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 345
Target Start/End: Original strand, 22089637 - 22089717
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 345  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
22089637 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaattagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 22089717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #249
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 22190638 - 22190678
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
22190638 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaatagacgttga 22190678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #250
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 24027903 - 24027852
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
24027903 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 24027852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #251
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 29121161 - 29121201
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
29121161 agtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttga 29121201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #252
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29681254 - 29681194
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
29681254 ggttccttccacaaaccagaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 29681194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #253
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 600
Target Start/End: Original strand, 38513490 - 38513572
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaataca-ataaagactct---agacttt-gaatttctaagatgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
38513490 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaaatcagatacagactcttaaagactttagaatttctaagatgta 38513572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #254
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 52704230 - 52704281
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
52704230 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 52704281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #255
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 54679279 - 54679363
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
54679279 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 54679363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #256
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 55731637 - 55731677
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
55731637 agtcttcactcctttatatcgaggtgtgaaagagacgttga 55731677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #257
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 56034107 - 56034223
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat-caaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||| || |||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
56034107 caagagacttcaaatgctcaagcacaattgcaagagacttctaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcag 56034206  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||| ||| ||||||||    
56034207 tggtattcacaatacaa 56034223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #258
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 56533380 - 56533340
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
56533380 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaaacgttga 56533340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #259
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 3395202 - 3395241
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
3395202 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 3395241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #260
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 4987732 - 4987782
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
4987732 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 4987782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #261
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 6517098 - 6517137
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
6517098 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 6517137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #262
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 6641059 - 6641117
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
6641059 gttccttccacaa-accgaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 6641117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #263
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 8105250 - 8105289
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
8105250 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 8105289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #264
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8686180 - 8686121
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||    
8686180 gttccttccacaaaccggaagtagtcctgccccccttgcactttcaaggagagttcacta 8686121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #265
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8997831 - 8997740
Alignment:
346 tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 440  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
8997831 tataatcacacagattacaattgctcaatactatc-tagtacgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 8997740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #266
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 11900803 - 11900842
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
11900803 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 11900842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #267
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14154755 - 14154672
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
14154755 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagaattcacta 14154672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #268
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 14357454 - 14357411
Alignment:
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
14357454 ttcaagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagaggttg 14357411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #269
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14605403 - 14605364
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14605403 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14605364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #270
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16325230 - 16325167
Alignment:
290 tccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
16325230 tccttccataatccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 16325167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #271
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17399173 - 17399134
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17399173 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 17399134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #272
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 17526711 - 17526668
Alignment:
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
17526711 ttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 17526668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #273
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17701254 - 17701215
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17701254 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 17701215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #274
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 462
Target Start/End: Original strand, 18773578 - 18773637
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
18773578 tgctcaagcacacacacaagagacttcctatgctcaagcacaaatcaatagacttctaat 18773637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #275
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 19884314 - 19884353
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19884314 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 19884353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #276
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 19944127 - 19944077
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19944127 tgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19944077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #277
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21350698 - 21350659
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21350698 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21350659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #278
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 29681044 - 29681005
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
29681044 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 29681005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #279
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 32491444 - 32491310
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||| |||  |  |||||||||||| | ||||||||     
32491444 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagctcataagcaagagatttcctatgctcaaacacaaaaacaagagacttctaaacaaacaaa- 32491346  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatat 537  Q
     |||| |||| |||||||   |||||||||||||||    
32491345 ttacaaagaaataagtttagtttgaacacttgatat 32491310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #280
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32491521 - 32491438
Alignment:
292 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc-acaaagattacaaatgctcaa 373  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
32491521 cttccacaatccagaagtagttcagtccctcttgcactttcaaggagattttcactataatctacactgattacaaatgctcaa 32491438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #281
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 36470441 - 36470480
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
36470441 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 36470480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #282
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 37986109 - 37986070
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
37986109 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 37986070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #283
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Original strand, 40845885 - 40845924
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
40845885 agtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 40845924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #284
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 41115091 - 41115048
Alignment:
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
41115091 ttcaagtcttcactcctttatatataggtgtgagagagacgttg 41115048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #285
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Original strand, 45833186 - 45833225
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
45833186 agtcttcactcctttatatagaggtctgaaagagacgttg 45833225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #286
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 54679540 - 54679579
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
54679540 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 54679579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #287
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 55379922 - 55379961
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
55379922 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 55379961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #288
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 10072468 - 10072584
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
10072468 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 10072566  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||| ||||| ||||||||    
10072567 gtgatgttcacaatacaa 10072584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #289
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 15475044 - 15474994
Alignment:
1136 gcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
15475044 gcttttgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcataagcactttg 15474994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #290
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16324842 - 16324796
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
16324842 atcttcaagtcttcactcttttatacagaggtatgaaagagacgttg 16324796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #291
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 16631800 - 16631874
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
16631800 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16631874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #292
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 863 - 928
Target Start/End: Original strand, 16848508 - 16848574
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
16848508 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaggagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 16848574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #293
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 17057442 - 17057396
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
17057442 atcttcaagtcttcactccattatatagaggtgtgagatagacgttg 17057396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #294
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 562
Target Start/End: Original strand, 17539965 - 17540051
Alignment:
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||| |||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
17539965 gcaagagacttctattcaaacaaaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatataatcagtgatgttcacaatacaa 17540051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #295
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 19889320 - 19889278
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
19889320 atcttcaatttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 19889278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #296
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 22190380 - 22190497
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
22190380 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 22190479  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||| ||||    
22190480 gtggtgttcacaaaacaa 22190497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #297
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22223525 - 22223437
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgct 370  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| ||||    
22223525 ttatactggttcctcccacaacacaggagtagtcaagtcctc-ttgcacttccaagg-gatttcactataatctcacatattacaattgct 22223437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #298
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 23087470 - 23087516
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
23087470 atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtatcaaagagacgttg 23087516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #299
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 24619431 - 24619477
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
24619431 atcttcaagtcttcattcatttatatagaggtatgaaagagacgttg 24619477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #300
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 36470329 - 36470403
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
36470329 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 36470403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #301
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 38514089 - 38514139
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttg-cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
38514089 gcttctgatgaactaggcttctgatgacatcatcacttcagaagcactttg 38514139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #302
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 562
Target Start/End: Original strand, 45832998 - 45833036
Alignment:
524 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
45832998 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 45833036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #303
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 732
Target Start/End: Original strand, 2651596 - 2651641
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
2651596 atcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagatacgtt 2651641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #304
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 8182695 - 8182643
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
8182695 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 8182643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #305
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 367
Target Start/End: Original strand, 8911037 - 8911122
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 367  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
8911037 ttatactggttcctcccacaacacaggagtaatccag--ccccttacacttctaagg-gatttcactataatcacacaagattacaaat 8911122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #306
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 10696080 - 10696132
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
10696080 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 10696132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #307
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 10909849 - 10909901
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
10909849 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 10909901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #308
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1193
Target Start/End: Original strand, 16940196 - 16940252
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
16940196 gcttctgataaacttgcttctgattacgtcatcacttcaagagcacttt-aacttcag 16940252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #309
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 17198241 - 17198189
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17198241 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 17198189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #310
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Original strand, 18066032 - 18066123
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcag 227  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||| |||||||| |||||||| ||||    
18066032 ttgaattgtgttttcttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgctcctgatgaagtgatcagagtcag 18066123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #311
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 18077725 - 18077673
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
18077725 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 18077673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #312
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 736
Target Start/End: Original strand, 18473811 - 18473860
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 736  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
18473811 atcttcaagtatttactcttttatatagaggtgtgaaaaagacgttgaga 18473860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #313
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 18773455 - 18773528
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
18773455 aagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgccctttcaaggagagttcacta 18773528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #314
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 18774497 - 18774448
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
18774497 ttgcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcattacttcagaggcact 18774448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #315
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 730
Target Start/End: Original strand, 36470610 - 36470647
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
36470610 aagtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacg 36470647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #316
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 47151898 - 47151846
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
47151898 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 47151846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #317
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 48371591 - 48371624
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48371591 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 48371624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #318
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 3105738 - 3105698
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
3105738 agtcttcacttctttatatagaggtgtgaaaaagacgttga 3105698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #319
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 3483521 - 3483561
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
3483521 aagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaatagacgttg 3483561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #320
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 3500151 - 3500111
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
3500151 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaat 3500111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #321
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 6517277 - 6517317
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
6517277 agtcttcacttctttatataaaggtgtgaaagagacgttga 6517317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #322
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 8103659 - 8103719
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
8103659 gttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 8103719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #323
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 9751427 - 9751391
Alignment:
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
9751427 ttgcttctgatgacgtcatcacttcataagcactttg 9751391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #324
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 11915074 - 11915134
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
11915074 ggttccttccacaaaccagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggatagttcacta 11915134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #325
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14605642 - 14605582
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
14605642 gttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14605582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #326
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 526 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15014881 - 15014845
Alignment:
526 aacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15014881 aacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 15014845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #327
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 15560897 - 15560846
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
15560897 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 15560846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #328
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17399434 - 17399350
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17399434 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 17399350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #329
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 17918494 - 17918545
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
17918494 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 17918545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #330
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1184
Target Start/End: Original strand, 24713888 - 24713939
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
24713888 tgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcacttt 24713939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #331
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 25651035 - 25650987
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||    
25651035 gcttctgatgaacttgcttatgatgatgtcatcacttcaggaacacttt 25650987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #332
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 27814763 - 27814712
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
27814763 ttgcttctgatgaccttctgtttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 27814712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #333
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1186
Target Start/End: Complemental strand, 29680421 - 29680385
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
29680421 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttga 29680385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #334
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 37436115 - 37436000
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga-tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| | ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
37436115 caagagacttcta-tgctcaagcacaactgcaagagacttctaactcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcag 37436017  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| | ||||||    
37436016 tggtgttcacgatacaa 37436000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #335
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 45832738 - 45832822
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
45832738 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccaaaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 45832822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #336
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1185
Target Start/End: Original strand, 3486351 - 3486386
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
3486351 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 3486386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #337
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10661917 - 10661838
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
10661917 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccacttgcacctcccaggagagttcactaaaatca 10661838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #338
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10876062 - 10875983
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
10876062 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccacttgcacctcccaggagagttcactaaaatca 10875983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #339
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 11536302 - 11536352
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
11536302 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 11536352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #340
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13977968 - 13977914
Alignment:
319 ccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aaagattacaaatgctcaa 373  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
13977968 ccccttgcacttc-aaggaattttcactataatcactaaagattacaaatgctcaa 13977914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #341
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16325013 - 16324974
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
16325013 ttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaa 16324974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #342
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Original strand, 18393952 - 18394019
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||    
18393952 tggttccttccacaattcggaagtagtttactcccccttgcacttccaaagaaattttactaaaatca 18394019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #343
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 18775911 - 18775816
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
18775911 agagacttccaatactcaagcactcgggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaagattgtttgactttgaacacttgatatacaatca 18775816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #344
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19581700 - 19581750
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19581700 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 19581750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #345
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Original strand, 19665716 - 19665791
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 339  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
19665716 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 19665791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #346
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 20977070 - 20977109
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
20977070 ttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaa 20977109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #347
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22676021 - 22675982
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22676021 ttgaacatttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22675982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #348
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 25651594 - 25651555
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
25651594 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacagtacaa 25651555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #349
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37986350 - 37986307
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 330  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
37986350 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcactt 37986307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #350
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 39420234 - 39420195
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
39420234 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttaacaatacaa 39420195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #351
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 39525963 - 39525913
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
39525963 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 39525913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #352
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 728
Target Start/End: Original strand, 44397642 - 44397677
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
44397642 aagtcttcactccattatatagaggtgtgaaagaga 44397677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #353
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 56533559 - 56533520
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
56533559 ttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaa 56533520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #354
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1166
Target Start/End: Original strand, 413221 - 413251
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtca 1166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
413221 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtca 413251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #355
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 460
Target Start/End: Original strand, 1671908 - 1671966
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
1671908 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1671966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #356
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1146 - 1184
Target Start/End: Original strand, 3395853 - 3395891
Alignment:
1146 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
3395853 aacttgcttctgatgacgtcatcactttaggagcacttt 3395891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #357
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13576853 - 13576791
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
13576853 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactat 13576791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #358
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 553
Target Start/End: Original strand, 15135342 - 15135372
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
15135342 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 15135372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #359
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1152 - 1182
Target Start/End: Original strand, 16317791 - 16317821
Alignment:
1152 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
16317791 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 16317821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #360
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17701493 - 17701431
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
17701493 ggttccttcaacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 17701431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #361
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 695 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 17788361 - 17788323
Alignment:
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
17788361 gtcttcactcctttatatagaggttggaaagagacgttg 17788323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #362
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 18006902 - 18006828
Alignment:
1121 gcttctgataaactt-gcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
18006902 gcttctgatgaactttgcttctgatgagttttgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgaaacttcag 18006828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #363
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 733
Target Start/End: Original strand, 18394324 - 18394366
Alignment:
691 tcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
18394324 tcaagtcttcattcctttatatagaagtatgaaagagacgttg 18394366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #364
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37436270 - 37436212
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 344  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
37436270 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttca 37436212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #365
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 451036 - 451069
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
451036 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 451069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #366
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 461617 - 461650
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
461617 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 461650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #367
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 353
Target Start/End: Original strand, 13890209 - 13890274
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||  || |||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
13890209 gttccttccacaattcgaaagtagttttgtcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaatca 13890274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #368
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1089 - 1171
Target Start/End: Complemental strand, 14153926 - 14153842
Alignment:
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcact 1171  Q
    ||||| ||| || ||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||  | |||||  |||||||||||||||||||||    
14153926 ccatgttgatcttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctagttaacttcggcttctgatgacgtcatcact 14153842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #369
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 14835887 - 14835854
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
14835887 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 14835854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #370
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 14843453 - 14843420
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
14843453 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 14843420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #371
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 321
Target Start/End: Original strand, 15193165 - 15193206
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc 321  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
15193165 ttatcctggttccttccataattcggaagtagtccagtcccc 15193206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #372
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1169
Target Start/End: Original strand, 16853702 - 16853735
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
16853702 gcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatca 16853735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #373
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1165
Target Start/End: Original strand, 19884922 - 19884951
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtc 1165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
19884922 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtc 19884951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #374
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 696 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 19912197 - 19912160
Alignment:
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
19912197 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaataaacgttg 19912160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #375
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 30926294 - 30926261
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
30926294 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 30926261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #376
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 30936872 - 30936839
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
30936872 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 30936839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #377
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39420441 - 39420380
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
39420441 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttacaaggagagttcactat 39420380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 701; Significance: 0; HSPs: 404)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 701; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 26043595 - 26044397
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26043595 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 26043694  T
233 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26043695 cagcggaaagaactgagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 26043794  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
26043795 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaagctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 26043894  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacactt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
26043895 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 26043994  T
533 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26043995 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 26044094  T
633 agaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatc--ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26044095 agaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 26044194  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
26044195 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagctt 26044294  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
26044295 caaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaagcagagtagtggaggtagtggttgtac 26044393  T
931 actt 934  Q
    ||||    
26044394 actt 26044397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 649; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 27505293 - 27506128
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
27505293 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 27505392  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27505393 gcttctgatgaactgatcagaattggatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 27505492  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
27505493 cacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaa 27505592  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27505593 gatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 27505692  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgta 600  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
27505693 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgta 27505792  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
27505793 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatcttctatcttcaagtcttc 27505892  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27505893 actcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctga 27505992  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac- 899  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
27505993 tttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagaca 27506092  T
900 -aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27506093 aaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27506128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 645; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9123943 - 9123143
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
9123943 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 9123847  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9123846 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9123747  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
9123746 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9123647  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
9123646 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 9123547  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9123546 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 9123447  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
9123446 tagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 9123347  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
9123346 tgagataatcagcacgtctaaagagtcttttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 9123247  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
9123246 aaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 9123147  T
931 actt 934  Q
    ||||    
9123146 actt 9123143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 641; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 27372183 - 27373018
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
27372183 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 27372282  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
27372283 gcttctgatgaactgatcagaattggatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaa 27372382  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
27372383 cacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaa 27372482  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27372483 gatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 27372582  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgta 600  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
27372583 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgta 27372682  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
27372683 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatcttctatcttcaagtcttc 27372782  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27372783 actcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctga 27372882  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac- 899  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
27372883 tttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagtgtagaca 27372982  T
900 -aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27372983 aaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27373018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 641; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 27462533 - 27463368
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
27462533 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 27462632  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
27462633 gcttctgatgaactgatcagaattggatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaa 27462732  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
27462733 cacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaa 27462832  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27462833 gatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 27462932  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgta 600  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
27462933 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgta 27463032  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
27463033 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatcttctatcttcaagtcttc 27463132  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27463133 actcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctga 27463232  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac- 899  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
27463233 tttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagtgtagaca 27463332  T
900 -aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27463333 aaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27463368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9113306 - 9112506
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
9113306 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 9113210  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9113209 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9113110  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
9113109 caaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9113010  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
9113009 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 9112910  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9112909 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 9112810  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
9112809 tagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagagacgt 9112710  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
9112709 tgagataatcagcacgtctaaagagtcttttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 9112610  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
9112609 aaattcattcccatcttgaaggtacaaattttgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 9112510  T
931 actt 934  Q
    ||||    
9112509 actt 9112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 598; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 25985465 - 25986266
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
25985465 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 25985561  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25985562 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 25985661  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
25985662 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 25985761  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
25985762 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 25985861  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25985862 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 25985961  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
25985962 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 25986061  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
25986062 gttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagct 25986161  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
25986162 tcaaatttattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgta 25986261  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
25986262 cactt 25986266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 12827048 - 12827877
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||   |||||| |||||||||||   ||||| ||    
12827048 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttct---gataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 12827144  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
12827145 cttctgatgaaatgatcagactcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 12827243  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
12827244 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 12827343  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
12827344 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 12827443  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
12827444 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgta 12827543  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||    
12827544 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttc 12827643  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
12827644 actcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctga 12827743  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12827744 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcgcaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 12827843  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12827844 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12827877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 28357554 - 28356724
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||| | |||||||| |||||| |||||||||||   | |||||    
28357554 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaataatcttcttcagataaatcttcagaagcagtttatgagt 28357455  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28357454 gcttctgatgaattgatcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 28357355  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
28357354 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaa 28357255  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||    
28357254 gatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaa 28357156  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgta 600  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
28357155 aatacagacaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagattta 28357056  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
28357055 tcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctgtctactatcttcaagtcttc 28356956  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
28356955 actcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcatgtctaaagagtcgtttgaattccttaaatcat-caccagtaatcctttgcctga 28356857  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
28356856 tttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac- 28356758  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28356757 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28356724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 32301825 - 32301054
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
32301825 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 32301729  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
32301728 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 32301630  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32301629 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 32301530  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
32301529 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 32301430  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
32301429 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 32301330  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32301329 ttttgaacttatgtatgtctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 32301230  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
32301229 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 32301130  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32301129 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 32301054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 32312514 - 32311743
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
32312514 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 32312418  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
32312417 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 32312319  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32312318 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 32312219  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
32312218 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 32312119  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
32312118 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 32312019  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32312018 ttttgaacttatgtatgtctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 32311919  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
32311918 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 32311819  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32311818 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 32311743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 12864932 - 12865732
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
12864932 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12865028  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12865029 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 12865128  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12865129 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12865228  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
12865229 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12865328  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12865329 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 12865428  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12865429 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 12865528  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
12865529 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 12865628  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12865629 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 12865728  T
931 actt 934  Q
    ||||    
12865729 actt 12865732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20030691 - 20029916
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
20030691 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 20030592  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20030591 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 20030493  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
20030492 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 20030393  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
20030392 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatactatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 20030293  T
558 tacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
20030292 tacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 20030193  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||| |||||||| || ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
20030192 cgctttttaacttgtacatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaagag 20030093  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 856  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20030092 tcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 20029993  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20029992 aaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20029916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 28252406 - 28251577
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||| | |||||||| |||||| |||||||||||   | |||||    
28252406 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctcttaaataatcttcttcagataaatcttcagaagcagtttatgagt 28252308  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28252307 gcttctgatgaattgatcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 28252208  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
28252207 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaa 28252108  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||    
28252107 gatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaa 28252009  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgta 600  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
28252008 aatacagacaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagattta 28251909  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
28251908 tcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctgtctactatcttcaagtcttc 28251809  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
28251808 actcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcatgtctaaagagtcgtttgaattccttaaatcat-caccagtaatcctttgcctga 28251710  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
28251709 tttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac- 28251611  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28251610 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28251577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 3671432 - 3672231
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
3671432 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 3671528  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3671529 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 3671628  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
3671629 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 3671728  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
3671729 atgctcaagcacaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 3671828  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3671829 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 3671928  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
3671929 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctatatttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 3672028  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
3672029 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 3672128  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
3672129 aaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 3672227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 25787085 - 25787885
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
25787085 ttgaattgtgttttctttttctttctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatgtg 25787184  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
25787185 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 25787283  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
25787284 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgacacttctcaaaa-tgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 25787382  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
25787383 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 25787482  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25787483 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 25787582  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
25787583 gtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 25787682  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25787683 ttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 25787782  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
25787783 caaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 25787881  T
931 actt 934  Q
    ||||    
25787882 actt 25787885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 12854406 - 12855206
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
12854406 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12854502  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
12854503 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacataagcagttatcctggttccttccacaacatggaagtagtccagtcccccttgcacttc 12854602  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12854603 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12854702  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
12854703 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12854802  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12854803 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 12854902  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12854903 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 12855002  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
12855003 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 12855102  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12855103 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 12855202  T
931 actt 934  Q
    ||||    
12855203 actt 12855206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 7376546 - 7375770
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
7376546 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 7376447  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
7376446 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacgaa 7376348  T
358 gattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
7376347 gattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtct 7376248  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
7376247 tctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 7376148  T
557 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
7376147 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 7376048  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
7376047 gcgctttttaacttgtgtatatctttctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 7375948  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7375947 gtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 7375848  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7375847 caaattctgctggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7375770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 3660768 - 3661567
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
3660768 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 3660864  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
3660865 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgaaagtagtccagtcccccttgcacttc 3660964  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
3660965 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 3661064  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
3661065 atgctcaagcacaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 3661164  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3661165 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 3661264  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
3661265 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctatattcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 3661364  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
3661365 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 3661464  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
3661465 aaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 3661563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17983314 - 17982512
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
17983314 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 17983218  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17983217 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17983118  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
17983117 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 17983018  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
17983017 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 17982918  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17982917 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctggactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 17982818  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
17982817 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctcacttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagac 17982718  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
17982717 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctctgaagaataaact 17982618  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
17982617 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 17982518  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
17982517 acactt 17982512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17985523 - 17984721
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
17985523 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaattatcagagtcagat-tg 17985427  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17985426 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17985327  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
17985326 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 17985227  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
17985226 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 17985127  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17985126 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctggactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 17985027  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
17985026 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctcacttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagac 17984927  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
17984926 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 17984827  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
17984826 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 17984727  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
17984726 acactt 17984721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12717649 - 12716845
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
12717649 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12717553  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12717552 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 12717453  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
12717452 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 12717353  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
12717352 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 12717253  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12717252 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 12717153  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt---atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
12717152 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttgtgta--tctctatcttcaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaaga 12717055  T
727 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 826  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
12717054 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataa 12716955  T
827 gcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtgg 924  Q
     |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
12716954 acttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtgg 12716855  T
925 ttgtacactt 934  Q
    ||||||||||    
12716854 ttgtacactt 12716845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12728298 - 12727494
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
12728298 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12728202  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12728201 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 12728102  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
12728101 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 12728002  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
12728001 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 12727902  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12727901 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 12727802  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt---atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
12727801 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttgtgta--tctctatcttcaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaaga 12727704  T
727 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 826  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
12727703 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataa 12727604  T
827 gcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtgg 924  Q
     |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
12727603 acttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtgg 12727504  T
925 ttgtacactt 934  Q
    ||||||||||    
12727503 ttgtacactt 12727494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 26024873 - 26025644
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
26024873 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 26024969  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
26024970 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 26025068  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26025069 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 26025168  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
26025169 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 26025268  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
26025269 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 26025368  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26025369 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 26025468  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
26025469 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 26025568  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26025569 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 26025644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 26035447 - 26036218
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
26035447 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 26035543  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
26035544 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 26035642  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26035643 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 26035742  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
26035743 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 26035842  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
26035843 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 26035942  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26035943 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 26036042  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
26036043 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 26036142  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26036143 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 26036218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31983408 - 31982637
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
31983408 attcttcttctgagaaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 31983312  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
31983311 agacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 31983213  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31983212 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 31983113  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
31983112 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 31983013  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
31983012 caatacaaaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 31982913  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31982912 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 31982813  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
31982812 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 31982713  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31982712 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31982637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 34807941 - 34807171
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
34807941 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 34807845  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34807844 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 34807745  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac---tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 461  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34807744 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 34807645  T
462 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
34807644 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 34807545  T
562 atacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctt 661  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
34807544 atacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgttt 34807445  T
662 ttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    |||||||| | ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34807444 ttgaacttatgtatctctatattcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 34807345  T
762 tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatatt 861  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||    
34807344 tgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaatt 34807245  T
862 ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34807244 ctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagatagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 34807171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 34818572 - 34817803
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
34818572 cttcttctgataaaacttcagaaacag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 34818476  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34818475 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 34818376  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34818375 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 34818276  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
34818275 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 34818176  T
563 tacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttt 662  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
34818175 tacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgtttt 34818076  T
663 tgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 762  Q
    ||||||| | ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34818075 tgaacttatgtatctctatattcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 34817976  T
763 gaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 862  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||    
34817975 gaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattc 34817876  T
863 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34817875 tgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagatagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 34817803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20063442 - 20062667
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
20063442 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 20063343  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20063342 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 20063244  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
20063243 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtctt 20063144  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
20063143 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatactatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 20063044  T
558 tacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
20063043 tacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgatagagttttgg 20062944  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
20062943 cgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacattgagatgatttgcacgtctaaagag 20062844  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 856  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20062843 tcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 20062744  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20062743 aaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20062667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 4630285 - 4631058
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
4630285 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 4630381  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
4630382 agtcaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 4630480  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4630481 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 4630580  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
4630581 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 4630680  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||    
4630681 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacaaagttttggcgc 4630780  T
660 ttttgaacttgtatatgtctc--tatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||| | ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4630781 ttttgaacttatgtatgtctctgtatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 4630880  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | |||    
4630881 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca 4630980  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4630981 aattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4631058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 27341108 - 27341879
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27341108 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27341204  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27341205 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27341303  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27341304 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27341403  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
27341404 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 27341503  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
27341504 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 27341603  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27341604 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 27341703  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
27341704 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 27341803  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27341804 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27341879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 27401848 - 27402619
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27401848 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27401944  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27401945 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27402043  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27402044 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27402143  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
27402144 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 27402243  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
27402244 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 27402343  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27402344 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 27402443  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
27402444 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 27402543  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27402544 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27402619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 27412507 - 27413278
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27412507 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27412603  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27412604 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27412702  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27412703 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27412802  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
27412803 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 27412902  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
27412903 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 27413002  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27413003 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 27413102  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
27413103 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 27413202  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27413203 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27413278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 553; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 32962712 - 32961940
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaag-aacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
32962712 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagtt-tgcagcggaaaggaacagagcagagaaaagaaaga 32962616  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32962615 taaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 32962516  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 464  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32962515 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 32962416  T
465 tcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaata 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
32962415 tcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaata 32962316  T
565 caataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttg 664  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
32962315 cagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaattgacagagttttgacgcttttg 32962216  T
665 aacttgtatatgtctctatctt-----atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    ||||| | ||| ||| | ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32962215 aacttctgtatatctatctcttttttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 32962116  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |    
32962115 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 32962016  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32962015 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagagagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 32961940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 29384136 - 29384936
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
29384136 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 29384232  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29384233 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 29384332  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
29384333 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 29384431  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
29384432 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 29384531  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29384532 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 29384631  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
29384632 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 29384731  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
29384732 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 29384831  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
29384832 tcaaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 29384930  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
29384931 acactt 29384936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 16929865 - 16930635
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
16929865 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 16929961  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
16929962 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 16930060  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16930061 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 16930160  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
16930161 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatg 16930260  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
16930261 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 16930360  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16930361 ttttaaacttatgtatatctatataaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 16930460  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
16930461 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-a 16930559  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16930560 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16930635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 33198712 - 33199513
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||   | ||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
33198712 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatatttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgattctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 33198808  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33198809 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttattctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 33198908  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
33198909 taaggagatttgactataatcaccaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 33199008  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
33199009 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacac 33199108  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33199109 ttgatatacaatcagtggtgttcacaaaacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 33199208  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
33199209 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 33199308  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
33199309 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 33199408  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
33199409 caaattcattcctatcttgaatgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 33199508  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
33199509 cactt 33199513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 32973332 - 32972559
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaag-aacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
32973332 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagtt-tgcagcggaaaggaacagagcagagaaaagaaaga 32973236  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc-ttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac 363  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32973235 taaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac 32973136  T
364 aaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 463  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32973135 aactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 32973036  T
464 ctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
32973035 ctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaat 32972936  T
564 acaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 663  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||    
32972935 acagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaattgacagagttttgacgctttt 32972836  T
664 gaacttgtatatgtctctatctt-----atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 758  Q
    |||||| | ||| ||| | ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32972835 gaacttctgtatatctatctcttttttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 32972736  T
759 gtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 858  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||     
32972735 gtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa 32972636  T
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32972635 attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagagagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 32972559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 169 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 7752015 - 7751247
Alignment:
169 cttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
7752015 cttctgataaaccttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaatagatcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaa 7751916  T
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc-ttgcacttccaaggagattt-cactataatcacaaagattacaa 365  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
7751915 agaaacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaagagattttcactataatcaacaagattacaa 7751816  T
366 atgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgct 465  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7751815 ctgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgct 7751716  T
466 caagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatac 565  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
7751715 caagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtgatgttctcaatacaatac 7751616  T
566 aataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttga 665  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
7751615 agtaaagactctagactttgaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttga 7751516  T
666 acttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaa 765  Q
    |||||||||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7751515 acttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaa 7751416  T
766 atcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgc 865  Q
     |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
7751415 ttcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaattcattcccatcttgaaggcgcacattctgc 7751316  T
866 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7751315 aggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7751247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 26864169 - 26864973
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatat 231  Q
    |||||||||||||||||||   ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
26864169 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 26864265  T
232 gcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 330  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26864266 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 26864365  T
331 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtctt 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
26864366 ccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtctt 26864464  T
429 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
26864465 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaac 26864564  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26864565 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 26864664  T
629 ttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
26864665 ttgtagactcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctatctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaaga 26864764  T
727 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 826  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
26864765 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataa 26864864  T
827 gcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggt 925  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
26864865 gcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaaatctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggt 26864964  T
926 tgtacactt 934  Q
    |||||||||    
26864965 tgtacactt 26864973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 16959036 - 16959806
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
16959036 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatctgagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 16959132  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
16959133 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaa-gatt 16959231  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16959232 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 16959331  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
16959332 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatg 16959431  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
16959432 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 16959531  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16959532 ttttaaacttatgtatatctatataaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 16959631  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
16959632 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-a 16959730  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16959731 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgcacactt 16959806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 26874793 - 26875597
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatat 231  Q
    |||||||||||||||||||   ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |    
26874793 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgattagagtcagat-t 26874889  T
232 gcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 330  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26874890 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 26874989  T
331 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtctt 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
26874990 ccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtctt 26875088  T
429 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
26875089 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaac 26875188  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26875189 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 26875288  T
629 ttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
26875289 ttgtagactcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctatctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaaga 26875388  T
727 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 826  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
26875389 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataa 26875488  T
827 gcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggt 925  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
26875489 gcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaaatctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggt 26875588  T
926 tgtacactt 934  Q
    |||||||||    
26875589 tgtacactt 26875597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 27383818 - 27384617
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||    
27383818 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagca--ctttgattgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tg 27383914  T
233 cagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27383915 cagcggaagagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27384014  T
332 caaggagattt-cactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
27384015 caaggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttcc 27384114  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||    
27384115 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagtttgatttgaacac 27384213  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
27384214 ttgatatacaatcagtgatgttctcaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgcttt 27384313  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
27384314 gtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatg 27384413  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
27384414 ttgagattatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagctt 27384513  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
27384514 caaaatcattcccatcttgaaggcgcacattctgcaggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtac 27384613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 517; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18926606 - 18925774
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||   |||| ||||||   ||  | ||    
18926606 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcggaagcagtttggaaatg 18926507  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
18926506 cttctaatgtaataatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggtttcttccacaac 18926408  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
18926407 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 18926308  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
18926307 tt-ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 18926209  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||    
18926208 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgatacagactctagacttttgaatttctaagatata 18926109  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    |||||||||||    
18926108 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtggaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatatctctatctacattcttcaagtct 18926009  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
18926008 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcct 18925910  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
18925909 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtgg 18925811  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18925810 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18925774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 16124377 - 16123549
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |||    
16124377 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgc 16124279  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    || ||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||      
16124278 ttttgatgtaataaccagaatgagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcatggttccttccacaaat 16124180  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
16124179 cggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaa 16124080  T
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaga 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
16124079 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctaaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctattcaaacaaaaa 16123980  T
503 tacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc-aatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgt 599  Q
    |||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
16123979 tacagagaaaaatgtttgaccttgaacacttgatgtacaatcagtgatgttcacaaatacaatgtaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgt 16123880  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| | |   |||||||||||||    
16123879 atcaaatcagtgcaaaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaact--tatatctctatgtacaatcttcaagtctt 16123782  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
16123781 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatactttgactg 16123683  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
16123682 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattacaatcttgaaggaacat-ttatgaaggcatggatgttgtcttgtcttgtagcgtagac 16123584  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16123583 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16123549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 31571769 - 31572598
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || ||||    
31571769 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataatacttcagaagcaggttaggaatgct 31571868  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
31571869 tctgatgtgatgatcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatc 31571967  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||     
31571968 ggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaa- 31572066  T
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||     
31572067 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaa 31572166  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgta 600  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
31572167 atacagagaaa-atgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgta 31572265  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtc 697  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |  |||||||||||    
31572266 tcaaatcagtgcagaaattcaa-gtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtattgatgtctcttgccaatcttcaagtc 31572363  T
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcc 797  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
31572364 ctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcc 31572462  T
798 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |    
31572463 tgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgatagaacat-ttctgcaggcatggtcgttgtcttgtcttgtagcgtag 31572561  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31572562 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31572598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 5844464 - 5845268
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||   |  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
5844464 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttctgataatactttagaagcagtttaggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 5844563  T
234 agcggaaag-aacagagcagagaaaagaaaaacaaag----acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac 328  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||    ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
5844564 agcggaaaataacaaagcagagaaaagaaaagaaaagcgaaacacaagcaattatcctgcttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcac 5844663  T
329 ttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtct 427  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
5844664 ttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtct 5844762  T
428 tccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttg 525  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||    
5844763 tccaatgctcaagcactaaagcaagactctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgaccttg 5844861  T
526 aacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtg 624  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
5844862 aacacttgatatacaatcggtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctatgatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtg 5844961  T
625 tgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 724  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  || | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
5844962 t-ttttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttattttttttatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaa 5845060  T
725 gagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 824  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
5845061 gagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgcagtcctttgaagaat 5845159  T
825 tagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 924  Q
      ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
5845160 cggcttcaaattcattcccatcttgaatgaacat-tcctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 5845258  T
925 ttgtacactt 934  Q
    ||||||||||    
5845259 ttgtacactt 5845268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 201 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 17746530 - 17745793
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
17746530 tgcttctgatgtgatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccaca 17746432  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 398  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
17746431 aatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctca 17746332  T
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||    
17746331 aaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaac 17746233  T
498 aaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaag 595  Q
    ||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17746232 aaaaatacagagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatataatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaag 17746134  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattc-agtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatctt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  || ||||| |   |||||    
17746133 atgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggatgctttgtagaatcaaatttgacagagttttggcactttt-aacttgtgttaatctctctctacaatctt 17746035  T
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcc 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||| |      
17746034 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgtttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgattattcaccagtaatga 17745936  T
792 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgta 891  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
17745935 ttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 17745837  T
892 gcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttc 935  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
17745836 gcgtagacaaaaacagagtagtggaggtaatggttgtacacttc 17745793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 27167252 - 27166455
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 235  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||||   |  || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
27167252 ttgaattgtgttttctattctctaaaaattcttcttctgaaaacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgatcaaaatcagatatgcag 27167153  T
236 cggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 334  Q
    ||||| | || |||| |||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
27167152 cggaataaaatagagtagagaaaagagaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcactttcaa 27167055  T
335 ggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
27167054 ggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaat 27166956  T
434 gctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacactt 532  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||    
27166955 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgaattgaacactt 27166857  T
533 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
27166856 gatacacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttg 27166757  T
632 tagaat-cagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctc-tatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 727  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
27166756 tagaataaaatttgacagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttatc-aatcttcaagtcttcactcctttatatagaagtgtgaaagag 27166659  T
728 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattag 827  Q
    ||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| || |     
27166658 acgttgagatgtttagcacgtct-aagagtcg-ttgagtttctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatcaa 27166561  T
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
27166560 cttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagccgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagtgtagtggaggtagtggttg 27166462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18835476 - 18834646
Alignment:
106 aatgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||    |   | ||    
18835476 aatgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgagttttctttttcactaaaaattcttcttctaataacactttagaagctggttagaaatg 18835377  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
18835376 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaatagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 18835279  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
18835278 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 18835179  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    | |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | || |||| |||||  ||||||||    
18835178 a-tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacagaagcgagaggcttcttttcaaacaa 18835080  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatg 598  Q
    | ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18835079 aaatacagagaa-aatgtttgatttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatg 18834981  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaag 695  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||||| |  |||||| |  |  |||||||||    
18834980 tatcaaatcagtg-agaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttggcagagttgtggcgctttt-aacttgtgttgatgtcttttgccaatcttcaag 18834883  T
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttg 795  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||    
18834882 tcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttg 18834784  T
796 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
    |||||||||||   |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
18834783 cctgatttgggaaaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgt 18834685  T
896 ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18834684 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18834646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 225 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18826959 - 18826250
Alignment:
225 cagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccct 323  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
18826959 cagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccataaatcggaagtagtccagtccccct 18826862  T
324 tgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||    
18826861 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcgag 18826763  T
423 agtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga 521  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||  | ||||||    
18826762 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatactcaagcacacaggcgacagacttcttttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttga 18826664  T
522 cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattc 620  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18826663 tttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattc 18826564  T
621 agtgtgctttgtagaa-tcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagagg 717  Q
    |  ||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
18826563 aaggtgctttgtagaattaaatttggcagagttttggcactttt-aacttgtgttgatgtcttttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagagg 18826465  T
718 tgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtccttt 817  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
18826464 tgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtaaagtccttt 18826366  T
818 gaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggag 917  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
18826365 gaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 18826267  T
918 gtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||    
18826266 gtagtggttgtacactt 18826250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 268 - 934
Target Start/End: Original strand, 29765053 - 29765719
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaa 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
29765053 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcctccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaa 29765152  T
367 tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgct 465  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
29765153 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgct 29765251  T
466 caagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatac 565  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
29765252 caagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaaa-atgtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgc 29765350  T
566 aataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgctttt 663  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
29765351 aataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtactttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt 29765450  T
664 gaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
     ||||||| |  ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
29765451 -aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagtacgtctaa-gagtcgtt 29765548  T
762 tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatatt 861  Q
     ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
29765549 -gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-att 29765646  T
862 ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29765647 ctgcaggcagagctgttgtcttgtctgatagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29765719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 418 - 934
Target Start/End: Original strand, 27504013 - 27504529
Alignment:
418 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagt 517  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
27504013 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagacaattgagt 27504112  T
518 ttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaa 617  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
27504113 ttgatttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaa 27504212  T
618 ttcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagagg 717  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||    
27504213 ttctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagagg 27504312  T
718 tgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtccttt 817  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
27504313 tgtgaaagagacgttgagattatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtccttt 27504412  T
818 gaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggag 917  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
27504413 gaagagttagcttcaaaatcattcccatcttgaaggcgcacattctgcaggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggag 27504512  T
918 gtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||    
27504513 gtagtggttgtacactt 27504529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 164 - 934
Target Start/End: Original strand, 22308201 - 22308974
Alignment:
164 ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaa 262  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||| |  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
22308201 ttcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaa 22308300  T
263 aacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagat 360  Q
     | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||    
22308301 gaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaatccgtaagtagtccagtcccccttgcacttcgaaggagattttcaataataatctcaaagat 22308398  T
361 tacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 459  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
22308399 tacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 22308497  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
22308498 aatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 22308596  T
559 acaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttgg 656  Q
     |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
22308597 gcaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttgg 22308696  T
657 cgcttttgaactt--gtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 754  Q
     ||||||  ||||  ||  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
22308697 tgctttttgacttgcgttaatgtctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaag 22308796  T
755 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 854  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||     
22308797 agtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcatgatttgggtgtagtcctttgaggaatcaatttcaaattcattcccatcttgaagga 22308895  T
855 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | || |||| |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
22308896 atat-ttctacaggtagagctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacactt 22308974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 418 - 934
Target Start/End: Original strand, 27474515 - 27475030
Alignment:
418 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagt 517  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||    
27474515 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagt 27474613  T
518 ttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaa 617  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
27474614 ttgatttgaacacttgatatacaatcagtgatgttctcaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaa 27474713  T
618 ttcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagagg 717  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||    
27474714 ttctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagagg 27474813  T
718 tgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtccttt 817  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
27474814 tgtgaaagagacgttgagattatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtccttt 27474913  T
818 gaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggag 917  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
27474914 gaagagttagcttcaaaatcattcccatcttgaaggcgcacattctgcaggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggag 27475013  T
918 gtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||    
27475014 gtagtggttgtacactt 27475030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 460 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 11147736 - 11147261
Alignment:
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
11147736 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttcttatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 11147637  T
560 caatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcg 658  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
11147636 caatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcg 11147537  T
659 cttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 758  Q
    ||||| ||||| | |||  || | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
11147536 ctttttaacttatgtatcactatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtc 11147437  T
759 gtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 858  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
11147436 atttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaa 11147337  T
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
11147336 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17742548 - 17741714
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || |||    
17742548 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgc 17742449  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||     
17742448 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctagttccttccacaaa 17742351  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttcc-aaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 398  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||    
17742350 ccggaagtagtccagtcccccttgcactttttaaggagatttccactaataatcgcacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctca 17742252  T
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga-tcaaa 496  Q
    ||  ||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
17742251 aa--tgctcaagcacgcaggcgggagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcttaatcaaa 17742154  T
497 caaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaa 594  Q
    || |  |||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
17742153 cagaattacatagaaa-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgctcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaa 17742055  T
595 gatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatctt 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  |||||    
17742054 gatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttaccaatctt 17741956  T
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||    
17741955 caagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatacaccagtaatc 17741857  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt 890  Q
     | ||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||    
17741856 ttatgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagatgttgtattgtcttgt 17741758  T
891 agcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17741757 agcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 17741714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Original strand, 25518134 - 25518874
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||  || ||||||| || ||||||||| | |  |||||||  |||||| ||||||||||||||    
25518134 tgcttctgatgtattgttcagaattagatacgcagcggagtaataacagagtagggaaaagaaagaga--gacacaaatagttatactggttccttccac 25518231  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact 393  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||    
25518232 aacccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttccactaaaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagact 25518330  T
394 tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat 492  Q
    || ||||  |||||||| || || |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
25518331 tctcaaa--tgctcaagtacgcaggcaaaagactttcaatgctcaagcactacagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaat 25518428  T
493 caaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaattt 590  Q
    |||||| |  |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
25518429 caaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaattt 25518528  T
591 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctct----atct 685  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    || |    
25518529 ataagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaaacaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtatatctctctctgtattt 25518627  T
686 tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
25518628 tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccag 25518726  T
786 tagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgt 885  Q
    || || |||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
25518727 taatcttttgcctgatttgggtgttgtgctatgaaggatcaacttcaaattcattcctgtcttgaaggaacat-ttctggaggcagagctgttgtcttgt 25518825  T
886 cttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25518826 cttgtaacgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25518874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 504 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31543338 - 31542909
Alignment:
504 acagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatca 603  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
31543338 acagagaattgagtttcagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatatatca 31543239  T
604 aatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcact 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
31543238 aatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgcatgtctct--cttgtcttcaagtcttcact 31543141  T
704 cctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgattt 803  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
31543140 cctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgattt 31543041  T
804 gggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aa 902  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
31543040 gggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaa 31542941  T
903 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
31542940 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31542909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 25687595 - 25686761
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || |||    
25687595 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgc 25687496  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| | || |||| ||||| |||||| | |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||      
25687495 ttctgatgtgatgttcataatcaaatatgcagcggaataaaaaagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttctttccacaaac 25687398  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
25687397 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttca 25687299  T
397 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaa 495  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||    
25687298 caaa--tgctcaagcactcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcaa 25687201  T
496 acaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttcta 593  Q
    |||||  |||| | ||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
25687200 acaaaattacacataaa-atgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatataatgcaataaagactctagacttaagaatttcta 25687102  T
594 agatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatat-gtctctatcttatctt 691  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||     |||||    
25687101 agatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtgctttatagaatcaaatttgacagagtttaggcgctttt-aacttgtatgttgtctcttgtcaatctt 25687003  T
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataa-tcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| |    
25687002 caagtctatactcctttatatagaggtgagcagagagacgttgagattccttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctt-gatcatccaccagtaat 25686905  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttg 889  Q
    | ||| | |||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
25686904 ctttttcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttg 25686806  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
25686805 tagcgtagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacactt 25686761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 445 - 934
Target Start/End: Original strand, 4292420 - 4292910
Alignment:
445 aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
4292420 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagcgaaatttttttgacttgaacacttgatatacaatca 4292519  T
545 gtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tt 642  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
4292520 gtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatt 4292619  T
643 tgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataat 740  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
4292620 tgacagagttttggcgcttttga-cttgtgttgatatctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttt 4292718  T
741 cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 840  Q
     ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
4292719 tagcacgtctaaagagtcgtta-agttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctttgaaggatcagcttcaaattcatt 4292817  T
841 cccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4292818 cccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcctgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4292910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 108 - 621
Target Start/End: Original strand, 32756756 - 32757271
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||    
32756756 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgct 32756854  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
32756855 tttgatgtaattaccagaatcagatttgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatc 32756953  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| |    
32756954 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac--tctaagtatgagacttctcaaaaat 32757051  T
404 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
32757052 gctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagtacgcagacaagagacttctgttcaaacaaaaat 32757151  T
504 acagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc-aatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgta 600  Q
    ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
32757152 acagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggttttcacaaatataatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgta 32757250  T
601 tcaaatcagtgcagaaattca 621  Q
    |||||||||||||||||||||    
32757251 tcaaatcagtgcagaaattca 32757271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 11234847 - 11235683
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttcta----aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||| |     |||||||| |||||||||   ||||||||||    || ||||||    
11234847 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgtttttttttttcttagaaaattctccttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgc 11234946  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||      
11234947 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactgattccttccacaaac 11235044  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
11235045 cggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttca 11235143  T
397 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaa 495  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
11235144 caaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaa 11235241  T
496 acaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat-aaagactctagacttt-gaatttct 592  Q
    ||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||    
11235242 acagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttct 11235341  T
593 aagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-ta-tgtctctatcttatc 689  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| |||||||| ||||||||| || ||||  || |||||||| |  |||    
11235342 aagatgtatcaaatcagtacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aatttgttgtagtgtctctacca-atc 11235439  T
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||||| |||     
11235440 ttcaagtctttactcctttatatagaggtgtggagagagacgttgagatcttaagcacatctaaagagtcgtt-gagaaccattgatcatccacctgtaa 11235538  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 888  Q
    || |||||||||||||| | | ||||| |||| ||| |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
11235539 tcttttgcctgatttggatattgtcctatgaaaaatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtctt 11235637  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
11235638 gtagcgtagacaaaagtagaatagtggaggtagtggttgtacactt 11235683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 447 - 787
Target Start/End: Original strand, 12353252 - 12353593
Alignment:
447 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
12353252 gcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgaattgaacacttgatatacaatcagt 12353351  T
547 ggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttga 645  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
12353352 ggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattga 12353451  T
646 cagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcag 743  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
12353452 tagagttttggcgcttttgaact--tatatgtctctcacttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaggagacgttgagataattag 12353549  T
744 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagta 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12353550 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagta 12353593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 460 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9934159 - 9933683
Alignment:
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |  |||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9934159 aatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctaatcaaacagaattacacagaaa-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 9934061  T
559 acaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
9934060 acaatgcaataaagactctagacttacgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttgg 9933961  T
657 cgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 753  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||  | ||||||||||||    
9933960 cgctttt-aacttgtgttaatgtctcttttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagatgttgagatttttagcacgtctaaa 9933862  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||| ||||||||||    
9933861 gagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgattttggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattccttcctatcttgaagg 9933763  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
9933762 aacat-ttctgcaggcagagttgttgtcttgtcttgtagcatagacagaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 9933683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 584 - 934
Target Start/End: Original strand, 8653496 - 8653844
Alignment:
584 tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctat 683  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |  |||| |    
8653496 tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgcagaatcaaattgacatagttttggcgctttttaacttatatctccctctct 8653595  T
684 cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacc 783  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
8653596 tcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagttgattagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccacc 8653694  T
784 agtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtctt 883  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||    
8653695 aataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccgttttgaaggaacat-ttctacaggcatagcttttgtctt 8653793  T
884 gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8653794 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 8653844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 515 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 26023226 - 26022882
Alignment:
515 agtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcag 614  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
26023226 agttggacttgaacacctgataaaccattaggggtgttctccatacaataccataaagactctagcctttggatttctaagatgtatcaaatcagtgcag 26023127  T
615 aaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatat 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||     
26023126 aaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgaaagagttttggcgcttttgaactggtaaatctctccatctttgatcttcaagtcttcactcctttataa 26023027  T
713 agaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagt 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
26023026 agaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcaagtttaaagagtcgtttgaaatcctttgattattcaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagt 26022927  T
813 cctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
26022926 cctttgaaggattaggtttaaattcattcccattttgaaggcaca 26022882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 447 - 934
Target Start/End: Original strand, 17063895 - 17064379
Alignment:
447 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagataca-gagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||| |  |||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
17063895 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaacagaattacaagaaaatt--gtttgacgttgaacacttgatatacaatca 17063992  T
545 gtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagttt 643  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| || |||    
17063993 gtggtgttctcaatacaatgcaataaaagactctcta----gaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaattt 17064088  T
644 -gacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcact-cctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc 741  Q
     | ||||||||  |||||||| |||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |     
17064089 tggcagagtttgtgcgctttttaacttgtg-atgtctctctca-atctccaagtcttcacttcctttatatagagatgtgaaagagacgttgagattttt 17064186  T
742 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 841  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
17064187 agcacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagtattaacttcaaattcattc 17064286  T
842 ccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
17064287 ccatcttgaaggaacaaattctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacatagtagtggaggtagttgttgtacactt 17064379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 138 - 489
Target Start/End: Original strand, 27474202 - 27474556
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||    
27474202 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagca--ctttgattgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tg 27474298  T
233 cagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27474299 cagcggaagagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27474398  T
332 caaggaga-tttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
27474399 caaggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttcc 27474498  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
27474499 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 27474556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Original strand, 21127525 - 21128265
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||| | ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||| ||||| |||| ||||||||||||||    
21127525 tgcttttgatgtattgttcagaatcagacacgcagcggagtaaaaacagag-agagaaaagaaagaga--gacataagcaattatactggttccttccac 21127621  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagac 392  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||    
21127622 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagac 21127720  T
393 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga 491  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |    
21127721 ttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaa 21127818  T
492 tcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaa 587  Q
    ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||    
21127819 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaa 21127918  T
588 tttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tat-gtctctatct 685  Q
    |||||||||| ||||||||||    |||||||||  |||||| ||  ||  | |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||| ||    
21127919 tttctaagatatatcaaatcaacatagaaattcaaagtgcttggtgaaacaaatttggcagagtttaggcgctttttaacttgttgtattgtctcta-ct 21128017  T
686 tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| || | |||||||||   || |||| |||||  |||||    
21128018 gatcttaaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatctttaagcacttcaatagagtcgttgcgaaacctt-gatcaatcacca 21128116  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttg 884  Q
     |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||    
21128117 attatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaagaatcgcattcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagatgttatcttg 21128215  T
885 tcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
21128216 tcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaagtagtggttgtacactt 21128265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 108 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11148033 - 11147708
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||| ||    
11148033 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataagacttcagaagcagtttgtgaatg 11147934  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa-cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
11147933 cttctgatgaaatgatcagaatcagatgtgcagcggaaaggatcagagcagagaaaagaaagacaaagaca--agcagttatcctggttccttccacaac 11147836  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||    
11147835 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgcttaatactctctaagtatgagacttcacaaaa 11147736  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
11147735 atgctcaagcacacacgcaagagtcttc 11147708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 138 - 489
Target Start/End: Original strand, 27503700 - 27504054
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||    
27503700 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tg 27503796  T
233 cagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27503797 cagcggaagagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27503896  T
332 caaggaga-tttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
27503897 caaggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttcc 27503996  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
27503997 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 27504054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 108 - 438
Target Start/End: Original strand, 25583264 - 25583600
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||    | ||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||    
25583264 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctttttaatcttcttctaataaaacttcagaagcagtttgtgagtg 25583363  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25583364 cttctgatgaattgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaatgacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 25583463  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
25583464 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 25583563  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctca 438  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
25583564 atgctcaagcacacacgcatgagtcttccaatgctca 25583600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 166 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 10404319 - 10404043
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa-cagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||     
10404319 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaggatcaaagcagagaaaagaaaag 10404220  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10404219 caa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 10404121  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 442  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10404120 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 10404043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 166 - 443
Target Start/End: Original strand, 12352997 - 12353277
Alignment:
166 cttcttctgataaac-cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaa 263  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
12352997 cttcttctgataaaaacttcagaagcagtttgtaagtgcttctgatgaaatgatcagaatcaggtatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaag 12353096  T
264 acaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12353097 acaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac 12353196  T
364 aaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 443  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12353197 aaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 12353277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12953628 - 12953142
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 549  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||||| |  |||| | || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
12953628 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaggcttctaatcaaacagaattacacaaaaatttgtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 12953529  T
550 gttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgaca 647  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||    
12953528 gttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggca 12953429  T
648 gagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagc 744  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||    
12953428 gagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctacca-atcatcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagc 12953331  T
745 acgtct-aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 843  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
12953330 acgtcttaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 12953232  T
844 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
12953231 atcttgaaggaaca-attctacaggcagagctgttatcttgtattgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 12953142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 7587012 - 7586268
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||||||| | || | |||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
7587012 tgcttctgatgtattgtttagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccac 7586915  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagac 392  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||  |||||||| |||||||||||| | |  ||||||||    
7586914 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacactgattacaactgctcaatactacctag-tatgagac 7586816  T
393 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga 491  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |    
7586815 ttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaa 7586718  T
492 tcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaa 587  Q
    ||||||| |  |||| ||||    |||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||    
7586717 tcaaacagatttacacagaaaattgtttgagtttgaacgcttgatatactatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaa 7586618  T
588 tttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt--gta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tat-gtctct 681  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||  ||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||    
7586617 tttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtattgtctct 7586519  T
682 atcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatc 779  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||      
7586518 at-tgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaat 7586421  T
780 caccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg 879  Q
     |||| |  ||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||     
7586420 -accaatgatctgttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtta 7586323  T
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
7586322 tcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 7586268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 460 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 25736044 - 25735573
Alignment:
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
25736044 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcaaacaaaattacacagaaa-atgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 25735946  T
559 acaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||    
25735945 acaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtgctttatagaatcaaattgacagagtttaggc 25735846  T
658 gcttttgaacttgtatatg-tctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag-cacgtctaaag 754  Q
    |||||| ||||||||| || |||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  | |||||||||||    
25735845 gctttt-aacttgtatgtggtctcttgtcaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattctttggcacgtctaaag 25735747  T
755 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 854  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||||     
25735746 agtcgtt-gagttcctt-gatcatctaccagtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaagga 25735649  T
855 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25735648 acat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 25735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Original strand, 31931101 - 31931607
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||    
31931101 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 31931200  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgc 627  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
31931201 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 31931300  T
628 tttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa- 723  Q
    |||  |||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |||  | |     
31931301 ttttgagaaacaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttcatgtctctttag-atcttcaagtcttcactcctttatatagtggtaagtag 31931398  T
724 agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaa 823  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
31931399 agagacgttgagatctttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatattttgcctgatttgggtgtagtcctatgaagga 31931497  T
824 ttagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtg 923  Q
    | | ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||    
31931498 tcaacttcaaattcattcctaacttgaaggaaca-attctgcaggcagagttgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtg 31931596  T
924 gttgtacactt 934  Q
    |||||||||||    
31931597 gttgtacactt 31931607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Original strand, 18554968 - 18555454
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 549  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18554968 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 18555067  T
550 gttctcaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgac 646  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| | ||||      
18555068 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggt 18555167  T
647 agagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcag 743  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||    
18555168 agagtttgggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctgtc-aatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttag 18555265  T
744 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 843  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||     
18555266 cacatctaaagagtcg-ttgagttccttagatcatccacgagtaaacttttgcctgatttgggtgtagtcctacgaaggatcaacttcaaattcattcct 18555364  T
844 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
18555365 atcttgagggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 18555454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 829 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 20488133 - 20487777
Alignment:
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
20488133 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 20488035  T
928 tacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagta 1027  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
20488034 taaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttacagtc 20487936  T
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatcc-attaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttct 1126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
20487935 ttctgcaatctttagacgaggttgaaccccattaaacaacttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactgcaacttctagtgatttttagcttct 20487836  T
1127 gataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
20487835 gataaacttgcttctgattaactcgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 20487777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 159 - 356
Target Start/End: Original strand, 1902143 - 1902340
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1902143 aaaaattcttcttctgataaatcttcagaagcagactgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 1902242  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1902243 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 1902340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 19289879 - 19289392
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttg-aacacttgatatacaatcagtgg 548  Q
    |||||||||  ||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
19289879 agagacttcctatgctcaagcactaaaggaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttttaacacttgatatacaatcagtgg 19289780  T
549 tgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttga 645  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||  ||||     
19289779 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctggacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttgg 19289680  T
646 cagagttttggcgcttttgaacttgt-atat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca 742  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |    
19289679 cagagtttggacgctttt-aacttgtgataacgtctcta-ctgatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 19289582  T
743 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 842  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||    
19289581 gcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttggatgtagtcctatgaaggatcgacttcaaattcattcc 19289483  T
843 catcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
19289482 tatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 19289392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 694 - 1166
Target Start/End: Original strand, 21618041 - 21618514
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
21618041 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgtcagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 21618138  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||   ||||| ||||  | |||||||| |||| || |  ||||||||    
21618139 ctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgt-tgcaggcagagctatttttattgtcttg 21618237  T
890 tagcgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  |||||||||||| |||    
21618238 tagcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttc 21618336  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||    
21618337 aaatccttccaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatctttagaagagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaagttgcatc 21618436  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtca 1166  Q
       ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21618437 ttctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtca 21618514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12417137 - 12416901
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
12417137 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 12417041  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
12417040 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagatt 12416942  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
12416941 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaac 12416901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 164; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Original strand, 11205623 - 11206130
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||  || ||||    
11205623 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgtgtttgaac 11205722  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat-aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||    
11205723 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaatcaaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcaatacagaaattcaaagtg 11205822  T
627 ctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-ta-tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa 723  Q
    ||||  |||| ||  |||| |||||||| ||||||||| || ||||  || |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
11205823 cttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aatttgttgtagtgtctctacca-atcttcaagtctttactcctttatatagaggtgtgga 11205920  T
724 -agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaga 822  Q
     ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | || || |||| |    
11205921 gagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagaacctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatattgtactatgaaaa 11206019  T
823 attagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagt 922  Q
    || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
11206020 atcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtgttgtagcatagacaaaagcagagtagtggaggtagt 11206118  T
923 ggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||    
11206119 ggttgtacactt 11206130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 537 - 931
Target Start/End: Original strand, 25679024 - 25679418
Alignment:
537 tacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtaga 635  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
25679024 tacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtgctttataga 25679123  T
636 atcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatg-tctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttg 733  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
25679124 atcaaattgacagagtttaggcgctttt-aacttgtatgtggtctcttgtcaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttg 25679222  T
734 agataatcag-cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttca 832  Q
    ||||  |  | |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||    
25679223 agattctttggcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctt-gatcatctactagtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttca 25679320  T
833 aattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25679321 aatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggaagagctgatgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 25679418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 705 - 934
Target Start/End: Original strand, 13913006 - 13913233
Alignment:
705 ctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttg 804  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
13913006 ctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagttgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttg 13913104  T
805 ggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaa 904  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
13913105 ggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaa 13913203  T
905 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
13913204 caaagtagtggaggtagtggttgtacactt 13913233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 901 - 1162
Target Start/End: Complemental strand, 19833176 - 19832915
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
19833176 aaaacagagtagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaa 19833077  T
1001 aatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaact 1100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||    
19833076 aatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccgttaaacagcttttaaagctttaagttgcatctcctgatgaact 19832977  T
1101 gcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 1162  Q
     || |||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
19832976 acatcttctggtgattctcagcttctgataatcttgctttggatgaacttgtttctgatgac 19832915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 266 - 934
Target Start/End: Original strand, 20635079 - 20635758
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-ga 359  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
20635079 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 20635178  T
360 ttacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagactt 457  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||||||    
20635179 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aactgctcaagcacgcaggcaagagacttcatttgctcaagtactaaagcaagagactt 20635275  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    |  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
20635276 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgaaatacaatcagtggtgttcaca 20635375  T
557 atacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacag 648  Q
    ||||||| |||   |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   |||||||   ||  ||  |  ||| |||    
20635376 atacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaaattggcag 20635475  T
649 agttttggcgcttttgaacttgtatatgtctct-atcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcac 746  Q
    ||||| ||||||||| | |||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||    
20635476 agtttgggcgcttttta-cttgt---tgtctcttatttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcac 20635571  T
747 gtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 845  Q
    ||| | |||||| || ||||| |  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||    
20635572 gtcaatagagtctttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctat 20635669  T
846 cttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20635670 cttgaaggaacat-tgctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20635758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 718 - 934
Target Start/End: Original strand, 17042590 - 17042806
Alignment:
718 tgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtccttt 817  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
17042590 tgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtccttt 17042689  T
818 gaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggag 917  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
17042690 gaagtattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaattctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggag 17042789  T
918 gtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||    
17042790 gtagtggttgtacactt 17042806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Original strand, 15954503 - 15954953
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |       
15954503 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgaa 15954600  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||| ||||| |   | | ||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
15954601 cttttgtctgatgt---tattgtcctatgaaggattaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 15954696  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||| |||    
15954697 gtagaagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gaataacaagcattcaatgccttc 15954795  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
15954796 aaatcctttcaaattagtcgttgcttcatttttccagtcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatc 15954895  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
     | ||||||||| ||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
15954896 tcttgatgaactacagcttctggtaattctcagcttctgataaacttgcttctgatga 15954953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 146; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30120736 - 30120483
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||    
30120736 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcttcttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtg 30120637  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||     
30120636 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagtagttatcttggttccttccacaaa 30120538  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30120537 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 30120483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 16877180 - 16877463
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
16877180 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaggcaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctct 16877279  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || |||||| ||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
16877280 tt-gaggaattagcatccaattccttcaaatccttttaagatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaa 16877378  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||| || |||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
16877379 acaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacaacttttggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 16877463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 163 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27819246 - 27819055
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27819246 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27819150  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27819149 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 27819055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 462
Target Start/End: Original strand, 18554650 - 18555010
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct-aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgctt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||   ||||||||||    || || |||||    
18554650 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttgggaatgctt 18554749  T
206 ctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
18554750 ctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaacc 18554847  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |    
18554848 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttccc 18554946  T
398 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    |||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18554947 aaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 18555010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 863 - 1168
Target Start/End: Complemental strand, 22076589 - 22076284
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |    
22076589 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctct 22076490  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  |||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
22076489 tt-gaagaataagcatcaaatgctttccaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcgagtcttctgcaatctttagacgagtttaaatcctttaa 22076391  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| || |||||| |||||    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
22076390 acagcttttaaagctttaagttgcatctcctgatgaactacatcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 22076291  T
1162 cgtcatc 1168  Q
    |||||||    
22076290 cgtcatc 22076284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 268 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17609095 - 17608417
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagatta 362  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||    
17609095 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagattttcactaagtttaatcacacagatta 17608996  T
363 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttcta 460  Q
    ||| | |||||||| |  |  | ||| ||||||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||      
17608995 caactactcaataccacacctagtataagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 17608899  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| | ||    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
17608898 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 17608799  T
560 caatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagt 651  Q
    |||| |||   |||||||||  |||| |  ||||||||||||| |||||||| |   || ||||||   |||||||   ||  ||  | |||  ||||||    
17608798 caatgcaaatgaaagactctctagacataagaatttctaagatatatcaaatgaacacataaattctaagtgcttttatgtgaaacaaattttgcagagt 17608699  T
652 tttggcgcttttgaacttgta-tatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtc 749  Q
    || ||||||||| |||||||  | |   ||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | | |||||||    
17608698 ttgggcgctttt-aacttgttgtcttgttctatttgatctttaagtcttcactcctttgtatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtc 17608600  T
750 taaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatctt 848  Q
     | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  |||||||||||||| |||||    
17608599 aatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaattcattcctatctt 17608502  T
849 gaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
17608501 gaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagac-aaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 17608417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 693 - 1185
Target Start/End: Original strand, 9717640 - 9718133
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
9717640 aagtcttcactcctttatacaaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 9717737  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | |  |||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
9717738 cttttgcctgatatggttattctcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 9717836  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||| ||     
9717837 gtatcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaagaacaagcatcaaatgccttt 9717935  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  |||||    
9717936 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 9718035  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    || | |||||||||  |||||||  |||| |||  ||||||||     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
9718036 tctcctgatgaactagagcttctagtgatctttaacttctgat-gggatgcttatgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttg 9718133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 107 - 395
Target Start/End: Original strand, 22292245 - 22292538
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctt-ttc---taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||| |  || |||||    
22292245 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtattttcttcttctcttaaaaattcttcttctggtattacttcagaagctagttgagagtg 22292344  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
22292345 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaag--aaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaat 22292442  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
22292443 ccggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttc 22292538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 266 - 934
Target Start/End: Original strand, 22386162 - 22386841
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-ga 359  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
22386162 aaagacacaggcaattatactggtttcttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 22386261  T
360 ttacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagactt 457  Q
    |||||| ||||||||| ||  |  | ||||||||||||   || |||||||| || || ||| ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
22386262 ttacaactgctcaatattacacctagtatgagacttca---aattgctcaagtacgcaggcatgagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 22386358  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    |  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
22386359 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 22386458  T
557 atacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacag 648  Q
    ||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   |||||||   ||  ||  |  ||   ||    
22386459 atacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaaattagaag 22386558  T
649 agttttggcgcttttgaacttgtatatgtctc-tatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcac 746  Q
    ||||| ||||||||| | ||| |   |||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||     
22386559 agtttgggcgcttttta-cttat---tgtctcatgtttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcat 22386654  T
747 gtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 845  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  || |||| ||||   ||    
22386655 gtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttaaaatccattaatat 22386752  T
846 cttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22386753 cttgaaggaacat-tactgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22386841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 125; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Original strand, 11021312 - 11021509
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttc-ttttct-----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||    
11021312 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagt 11021411  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11021412 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 11021509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 462
Target Start/End: Original strand, 31930802 - 31931163
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||   ||||| ||||    || ||||||    
31930802 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggagg-ttgaattgtgttttctttttctcgtaaaaaatcttcttctgatatcacttcaaaagctggttgagagtgc 31930900  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  | |||| || |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
31930901 ttctgatgtgatgttcagaattagatatgcagcggaataaaaacaaagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 31930998  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
31930999 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttc 31931097  T
396 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
     ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
31931098 ccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 31931163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 460
Target Start/End: Original strand, 17047051 - 17047297
Alignment:
218 tcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
17047051 tcagaattagatatgcagcggaataagaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagtcca 17047148  T
316 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaa 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||    
17047149 gtcccccttgcacttccaaggagattttcactaaaaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-aagtatgagacttctcaaa--tgctcaa 17047245  T
410 gcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||  || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
17047246 gcatgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 17047297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 138 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12575971 - 12575773
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||  |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
12575971 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 12575875  T
234 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12575874 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 12575775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Original strand, 29917814 - 29918266
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
29917814 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 29917911  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
      |||||||||| |||   | ||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||  |||| | |||| || |||||||| ||||||| | ||||||||    
29917912 tttttgcctgatatggtcattgtcctatgaagaatcaatttcaaatgcattcccattgtgaatgaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 29918010  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||  |||| |||    
29918011 gtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaagaacaagcatctgatgccttc 29918109  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| || |||||| | || | | |||||||| |||||  |||||    
29918110 aaatcttttcaaactagtcgttgcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 29918208  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| ||||    
29918209 tctcctgatgaactacagcttctgatgaactt--gcttctgatggacttgcttctaatga 29918266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 138 - 334
Target Start/End: Original strand, 18720098 - 18720297
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| || ||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
18720098 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatactccttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 18720194  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18720195 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 18720294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Original strand, 32544062 - 32544517
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
32544062 aagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 32544159  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | ||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
32544160 ctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 32544258  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||| |||  | |||||||||| ||     
32544259 gtagcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaagaataaacatccaatgccttt 32544357  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  |||||    
32544358 aaatcctttcaaaatagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 32544457  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    || | |||||||||  ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
32544458 tctcctgatgaactagagcttatggtgattttcagcttctgatgaacttgcatctgatga 32544517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 108 - 460
Target Start/End: Original strand, 11205325 - 11205683
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc--ta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||   || |||||||| |||||||||   ||||||||||    || |||||||    
11205325 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgttttttttttcttagaaaattctccttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgct 11205424  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |    
11205425 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaacc 11205522  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 397  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
11205523 agaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcac 11205621  T
398 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
11205622 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 11205683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 20731056 - 20730603
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaaga--gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||  || ||| |  ||| ||||||   ||||||| |  ||||| |  |    
20731056 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcaaatcaaaataaagtcatttgaag--ctttgattaatcaccaatgat 20730959  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  ||||||| ||||| |||  |||||| |||| || || ||||| ||||||| | ||||||||    
20730958 cttttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcacattgtgaaggaacatctt-tgtaggcagagctgtttttcttgtctt 20730860  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||| |||    
20730859 gtagctgagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaaacatccaatgccttc 20730761  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| || ||||| || || ||| |||||||| ||  ||| ||||    
20730760 aaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagctttttgttacatc 20730661  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
     | ||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||    
20730660 tcctgatgaactgcagcttctagtgattttcagcttatgatgaacttgcttctgatga 20730603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 882 - 1115
Target Start/End: Original strand, 12348980 - 12349211
Alignment:
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaa 981  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| | ||||| |||  |||||||||    
12348980 ttgtcttgtagtagggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatccaa 12349078  T
982 tgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag 1081  Q
    ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||    
12349079 tgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatc-ttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaag 12349177  T
1082 ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
12349178 ttgcatctcctgatgaactgcagcttctgatgat 12349211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 863 - 1184
Target Start/End: Original strand, 13435499 - 13435821
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
13435499 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaatatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttt 13435598  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || ||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||| ||||| || |||||||| |    
13435599 tcaaag-aacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattga 13435697  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    | | | |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| |||||| || |||| ||  |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||    
13435698 aaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttatggtgatcttctgcttctgat-gagatgcttttgatgaacttgcttctgat 13435796  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
13435797 gacgtcatcacttcaggagcacttt 13435821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 863 - 1185
Target Start/End: Original strand, 16336094 - 16336427
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |    
16336094 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctct 16336193  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  ||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
16336194 tt-gaagaataagcattcaatgccttctaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagtttgaatcctttaa 16336292  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgata-----------aacttgcttctgatgaactt 1150  Q
    | | |||||||||| | |||||||||| | |||||| || || |||||| ||||| |  ||||||||||           |||||||||  ||||| |||    
16336293 acaacttttgaagcttcaagttgcatctcctgatgatctacaacttctggtgattctcagcttctgataaacttctgatgaacttgcttaagatgacctt 16336392  T
1151 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
16336393 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 16336427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 863 - 1185
Target Start/End: Original strand, 18435523 - 18435847
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||| |    
18435523 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagtgtactggaggtagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctct 18435622  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||  ||||||||| || |||||||| |    
18435623 tt-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattga 18435721  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    ||| | ||  |||| |||||  ||||||| | |||||||||  |||||||  |||| ||  ||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||    
18435722 ataaccttcaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctagtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctagtggactagcttctgat 18435821  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||    
18435822 gacgtcaccacttcaggagcactttg 18435847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 26972390 - 26972086
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||| || |||| | |||||    
26972390 tcttgtcttgtagcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaaacatcc 26972294  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||    
26972293 aatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagcttta 26972194  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||  ||||||| | ||||||| |  |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |    
26972193 agtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgattttctgcttctgatgaacttgcttctaataaacttgcttctgatgacgtcaccatttcagga 26972094  T
1178 gcactttg 1185  Q
    ||| ||||    
26972093 gcaatttg 26972086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 138 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9934425 - 9934131
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||  ||||||||||    |   | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
9934425 ttgaattgtgttttctttttctctaaaagttcttcttctgataacacttcagaagctggttagaaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 9934326  T
235 gcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
9934325 gcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccctcgcacttcc 9934228  T
333 aaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||    
9934227 aaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtacgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagtcttc 9934131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 22802108 - 22802391
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| |    
22802108 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctct 22802207  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||| |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||| |  || |||||||| |    
22802208 tt-gaagaacaagcatccaatgcctttaaattctttcaaacttgtcgttgtttcacttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattga 22802306  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | | |||||||| ||| |||||||| | ||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
22802307 acaacctttgaagctttatgttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 22802391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 863 - 1183
Target Start/End: Original strand, 23284531 - 23284852
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| |    
23284531 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 23284630  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
23284631 tca-aggaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaataggcgttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattga 23284729  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    | | | |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||   ||| ||  |||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||    
23284730 acaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctagcgatcttctgcttctgat-gagatgcttctaatgaacttgcttctgat 23284828  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
23284829 gacatcatcacttcagaagcactt 23284852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 202 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12953849 - 12953586
Alignment:
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||||||||    
12953849 gcttctgatgtgatgttcagaattggatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaa 12953752  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagactt 394  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
12953751 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaattgctcaatactatc-tagtatgagactt 12953653  T
395 cacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
12953652 ctcaaa--tgctcaagcacgcaggctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaggcttctaat 12953586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 102; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 686 - 934
Target Start/End: Original strand, 18498557 - 18498804
Alignment:
686 tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
18498557 tatcatcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtccaaagagtcatt-gagttcctttgatcatccacca 18498655  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttg 884  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||    
18498656 gtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcttatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttattttg 18498754  T
885 tcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
18498755 tcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 18498804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 16265314 - 16265049
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||    
16265314 tcttgtcttgtagcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctcttt-gaagaacaagcatcc 16265216  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||| ||| || |||||||| || | | ||| |||| |||    
16265215 aatgcattcaaaacctttcaatctactcgttgcttcacttttccagtcctgtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagcttta 16265116  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
     |||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
16265115 tgttgcatctcttgacgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 16265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 447 - 931
Target Start/End: Original strand, 17047254 - 17047736
Alignment:
447 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcag 545  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||     |||||||| ||||||||||||||||||||     
17047254 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattatttgactttgaacacttgatatacaatcaa 17047353  T
546 tggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatcagttt 643  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||| | |||| || |||    
17047354 tggtgttctcaatacaatgtaataaaagactctcta----gaatttctaagatatatcaaatcaaaacagaaattcaaagtgctttttcagaaacaattt 17047449  T
644 -gacagagttttggcgcttttgaacttgt-atatgtctctatcttatcttcaagtcttcact-cctttatatagag-gtgtgaaagagacgttgagataa 739  Q
     | ||||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | ||||||||||||||      
17047450 tggcagagtttgtgcgctttt-aacttgtgatctgtctctat-ttatcttcaagtcttcacttcctttatatagagagagt-agagagacgttgagattt 17047546  T
740 tca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattca 838  Q
    ||  ||||   || |||||||||   || ||||||||| | ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
17047547 tcttgcac---tatagagtcgttgagaaacctttgatctttcaccattaaacttttgcctgatttggatgtagtcctttaaagaattaacttaaaattca 17047643  T
839 ttcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagag-tagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||| | |||||||| |||||||||||    
17047644 ttcctatcttgaaggaaca-aatctgcaggcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagagttcgtggaggtcgtggttgtaca 17047736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17573267 - 17573069
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       ||||||  |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |    
17573267 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaat 17573168  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17573167 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagc-aagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 17573069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 201 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 19453379 - 19452827
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    |||||||||||   || |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| | ||||||||||||    
19453379 tgcttctgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattataccggttccttccac 19453282  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgaga 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||     | ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||    
19453281 aaaccggaagtagtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaaaaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 19453182  T
392 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctg 490  Q
    |||||||||  ||||||||||| || ||||||  ||||   |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||||     
19453181 cttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagatacttcttttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaatcaagagacttcta 19453084  T
491 atcaaacaaagatacagagaattaagtttg-acttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaaga--ctctagactt-t 584  Q
     ||||||| |  |||| ||||    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||  ||||||||||      
19453083 ttcaaacagaattacacagaaaattgtttgtgtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcataatacaatgcaattgaaagactctctagacttaa 19452984  T
585 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt---tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgt--atatgtct 679  Q
    ||||||||||||| |||||||| |   || |||||||  || |||   |||  ||  | |||| |||||||| ||||||||| |||||||   |||||||    
19452983 gaatttctaagatatatcaaatgaacacaaaaattcaaagtacttttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgttatgtct 19452885  T
680 ctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagat 737  Q
    ||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
19452884 ct-gctgatcttcaagtcttcacccctttatatagagatgtgtagagagacgttgagat 19452827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 304
Target Start/End: Original strand, 18576114 - 18576283
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
18576114 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 18576210  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacg 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18576211 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacg 18576283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 880 - 1071
Target Start/End: Original strand, 12423246 - 12423435
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||| |||  ||||| |    
12423246 tcttgtcttatagcggagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatac 12423344  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttg 1071  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
12423345 aatgccttccaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcattc-ttagacgagtttgaatccattaaacagcttttg 12423435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 90; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 863 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 15531806 - 15531484
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |     
15531806 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaagacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tc 15531708  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| || ||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| || ||| |||| |    
15531707 tttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaataaccgttgttttactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattga 15531608  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    | | | ||| |||| |||||  |||||||   ||||||||| || |||||| |||| ||  | |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
15531607 acaacctttcaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactacaacttctggtgatcttatgattctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgat 15531509  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
     | ||||||||||||| | ||||||    
15531508 tatgtcatcacttcaggatcacttt 15531484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5521909 - 5521748
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
5521909 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 5521813  T
234 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5521812 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 5521748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 863 - 1183
Target Start/End: Original strand, 13602139 - 13602460
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||  ||| |||||||||| ||     
13602139 tgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacg-ttc 13602237  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||  | |||  |||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| || || |||||||| |    
13602238 ttcaaagaataagcatccaatgccttcaattcatttcaaaatagtggttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattga 13602337  T
1062 atagcttttgaagccttaagt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    | | | |||||||| ||||||  |||||| | |||||||||  |||||||  |||| || ||||| |||| |  | ||||||||||||||||||||||||    
13602338 acaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactatagcttcttgtgatcttcggcttttgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctgat 13602436  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
13602437 gacgtcatcacttcaggagcactt 13602460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 287 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 14070843 - 14070501
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat 379  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||     | |||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
14070843 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtataatcacaactgattacaactgctcaatact-t 14070745  T
380 caaaa--tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcag 476  Q
    ||| |  || ||||||||| ||   ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |     
14070744 caacaagtacgagacttcaaaa---tgctcaagcacacaa-caagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaa 14070649  T
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaaga 573  Q
    |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||    
14070648 gcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaaga 14070549  T
574 ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattc 620  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
14070548 ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgagtacagaaattc 14070501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 784 - 931
Target Start/End: Original strand, 25675196 - 25675342
Alignment:
784 agtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtctt 883  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
25675196 agtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtctt 25675294  T
884 gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25675295 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 25675342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 457
Target Start/End: Original strand, 17063680 - 17063935
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
17063680 tgcttctgatga--tgttcagaattagatatgcagcggaataagaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcagttatcctggttccttccac 17063775  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact------ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgaga 391  Q
    ||  ||||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||      |||||| || ||||||||| || ||||||||||| |  |||||||    
17063776 aatccggaagtagtcta----cccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctcacagattacaattgttcaatactatc-atgtatgaga 17063870  T
392 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 457  Q
    |||| ||||  ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
17063871 cttctcaaa--tgctcaaacacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 17063935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 693 - 1059
Target Start/End: Original strand, 15301997 - 15302363
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaaga--gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || ||| |  |||||||||||  |||||||||  ||||| |  |    
15301997 aagtattcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataaagtcgtttgaaa--ctttgatcaatcaccaatgat 15302094  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtctt 888  Q
    | ||||||| || ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||   || ||| ||||  | |||||||||||||||| || |||||||    
15302095 cttttgcctaatatggttattgtcctatgaaggatgaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcatagctgttatccttgtctt 15302193  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||  |||||||||| ||   || ||| |||||||||||| ||     
15302194 gtagcagagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttt 15302292  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt 1059  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||    
15302293 aaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccatt 15302363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 20113051 - 20112596
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataat-cagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  ||    
20113051 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaatttacagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgatc 20112954  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||  ||||| |   ||| || ||| ||  |||||| | ||||||| | |||||||||    
20112953 ttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatctattccaagtatgagggaaca-atgttgcagggagagctgttattcttgtcttg 20112855  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    | ||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||| ||||    
20112854 tcgcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgctttca 20112756  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt-aaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||  ||||| ||| || |||||||| ||  | ||||| |||| |||||  |||||    
20112755 aatcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgca 20112656  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    || | ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||    
20112655 tctcttgatgaacttcagcttcaggtgatctttagcttctgaagaacttgcttctgatga 20112596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 33352090 - 33351828
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | |||| |||  | |||||    
33352090 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc--tcttgaagaataaacatcc 33351993  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||  ||  ||| |||||||||||| | |||||  ||||||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||| | ||| ||||||||| || |||    
33351992 aatgtttttcaatcctttcaaaatag-ccttgctatacttttccagtcttctgcactc-ttagacgagtgtgaatccttgaaacagcttttgaggcttta 33351895  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||| ||||| |||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
33351894 agttgcatctcccgatgaaatgcagtttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 33351828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 875 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 14100608 - 14100369
Alignment:
875 tgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactag 974  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| | |||  ||    
14100608 tgttttcttgtcttgtagcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgc-tctttaaagaagaag 14100511  T
975 catccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaag 1074  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||  ||||| ||| || |||||||| || | | ||||||     
14100510 catccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtttcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaa 14100411  T
1075 ccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
    | |||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
14100410 ctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctgatga 14100369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 881 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 19066181 - 19065926
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||| || |||  ||||||||    
19066181 cttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatcca 19066083  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||         ||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||| | ||| |||| | || ||| | ||| |||||||||||| ||||    
19066082 atgcatt---------tcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaagctttaa 19065992  T
1081 gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | |||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||| ||||||||||||||||    
19065991 gatccatctcctgatgaactgcagcttctggtgatatacagcttctgatgaacttgcttctgatga 19065926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 693 - 1184
Target Start/End: Original strand, 21624898 - 21625386
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||  || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
21624898 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcatatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 21624995  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| | | | |  |||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| || |  | |||||| | |||| || | ||||||||    
21624996 cttttgcctgatatagttattatcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacgtcgt-tgcaggtagagctatttttcttgtctt 21625094  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||| |||||| |||    
21625095 gtagcacggacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgc-tctttgaagaacaagcatgcaatgccttc 21625193  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | ||||||||  ||||  |||||    
21625194 aaatgctttc-aaatagccgttgctttactcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgca 21625292  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    || | ||||||    || |||||| |||| ||  |||||||||  |  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
21625293 tctcctgatga--gacaacttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttatgatgaacttgcctctgatg-cgtcatcacttcaggagcacttt 21625386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1085 - 1185
Target Start/End: Original strand, 17381603 - 17381703
Alignment:
1085 catcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
17381603 catcccatgatgaactgcaggttctggtgatttttggcttttgataaacttgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcacttt 17381702  T
1185 g 1185  Q
    |    
17381703 g 17381703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 859 - 934
Target Start/End: Original strand, 6158316 - 6158391
Alignment:
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6158316 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6158391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 881 - 1186
Target Start/End: Original strand, 24116814 - 24117119
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| | ||  | |||| ||||||||    
24116814 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgc-tcttcaaagaacaagcatcca 24116912  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatag-cttttgaagcctta 1079  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  || | |||||||  ||  || || ||||||  || |||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||    
24116913 atgctttcaaatcctttcaaaataaccgctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagcttta 24117012  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||  |||||||   ||||||||| || |||||| |||| ||  |||||| |   |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
24117013 agtcttgcatcttctgatgaacttcatcttctggtgatctt--gcttctaaccgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcagga 24117110  T
1178 gcactttga 1186  Q
    |||||||||    
24117111 gcactttga 24117119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 918 - 1114
Target Start/End: Original strand, 19688789 - 19688984
Alignment:
918 gtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcac 1017  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
19688789 gtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcac 19688887  T
1018 ttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
    | ||||||| |||| ||||  || ||||||  | |||||||| || | | |||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
19688888 tcttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcgcatctcctgatgaacttcagcttctgatga 19688984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 692 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 14051731 - 14051425
Alignment:
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataat--cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||| |||  |    | |||||||  ||||| |  |    
14051731 caagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgtgaaattgccagcacgtc-aaagagttgttgtag---ccttgatcaatcaccaatgat 14051636  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||  |  ||||||  |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||    
14051635 cttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtctt 14051537  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | || |||||||||| || | | ||||| | |  |||||||||||  |||    
14051536 gtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtacgcttcgtac-aatgtactttgtcgactc-tctttgaaggataagcatccaatgacttc 14051439  T
989 aaattctttcaaaa 1002  Q
    |||||| |||||||    
14051438 aaattccttcaaaa 14051425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 881 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 12715583 - 12715318
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||   |||| ||    
12715583 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aataggcataca 12715485  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatag-cttttgaagcctta 1079  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||||| || |||||||| || || |||||||||| |||    
12715484 atgctttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagcttta 12715385  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| || |||||  |||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||    
12715384 agtcttgcatctcctgatgaactacaacttctagtgatctt--gcttctgatgaacttccttctgatga 12715318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 405 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 14052039 - 14051820
Alignment:
405 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |    
14052039 ctcaagcacacaa-caagagacatcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaatt 14051941  T
504 acagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagactt-tgaatttctaagatgt 599  Q
    ||| ||||    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |    
14051940 acacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatat 14051841  T
600 atcaaatcagtgcagaaattc 620  Q
    ||||||| ||| || ||||||    
14051840 atcaaatgagtacataaattc 14051820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 280 - 373
Target Start/End: Original strand, 14757752 - 14757848
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 373  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
14757752 ttatcatggttccttccacaattcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattacaaatgctcaa 14757848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 692 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 14070412 - 14070106
Alignment:
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataat--cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||  |    | |||||||  ||||| |  |    
14070412 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaaattgccagcacgtc-aaagagtcgttgtag---ccttgatcaatcaccaatgat 14070317  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||  ||||||| |||||  |  ||||||  |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||    
14070316 cttttgtctgatttggatgatgtcctatgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtctt 14070218  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | || |||||||||| || | | ||||| | |  |||||||||||  |||    
14070217 gtagcgtagaaaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtacgcttcgtac-aatgtactttgtcgactc-tctttgaaggataagcatccaatgacttc 14070120  T
989 aaattctttcaaaa 1002  Q
    |||||| |||||||    
14070119 aaattccttcaaaa 14070106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 975 - 1183
Target Start/End: Original strand, 25597558 - 25597767
Alignment:
975 catccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaag 1074  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||    
25597558 catccaatgccttcaaatcctttcgaaatagccgtcgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaag 25597657  T
1075 ccttaagt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt 1172  Q
    | ||||||  |||||  | ||||||||| || |||||| |||| ||  |||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
25597658 ctttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttatgatgagat-gcttctgatgaacttgcttcagatgacgtcatcactt 25597756  T
1173 cagaagcactt 1183  Q
    ||| |||||||    
25597757 caggagcactt 25597767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 844 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 25723059 - 25722973
Alignment:
844 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
25723059 atcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtaca 25722973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 201 - 343
Target Start/End: Original strand, 25678860 - 25679001
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
25678860 tgcttctgatgtgatgtttagaatcaaatatgcagcagaataaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacacgcaattatcctggttccttccaca 25678957  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 343  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25678958 aaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 25679001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 353
Target Start/End: Original strand, 15551392 - 15551471
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
15551392 aagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactaaaatca 15551471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 403 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 18027370 - 18027209
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||     
18027370 tgctcaagcacacaagcaagggacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaat 18027271  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaata 564  Q
     |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
18027270 -tacacagaaataagtttggtttgaacacttgatataaaatcagtggtgttcataatacaata 18027209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 897 - 1059
Target Start/End: Original strand, 18378316 - 18378477
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||   || |||  ||||||||||| ||||||| |||    
18378316 gacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaag-aacatgcatccaatgccttcaaatcctt 18378414  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt 1059  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||||||||| || ||||||||    
18378415 tcaaaatagttgttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccatt 18378477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 863 - 959
Target Start/End: Original strand, 17381488 - 17381585
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
17381488 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgct 17381585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 829 - 1000
Target Start/End: Original strand, 21235058 - 21235229
Alignment:
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||||    
21235058 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcttc-gcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaatatcagagtagtggaggtagtggtt 21235156  T
927 gtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||    
21235157 gtacacttcatacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaagaacaagcatcgaatgccttcaaatgctttcaa 21235229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 693 - 1115
Target Start/End: Original strand, 19623776 - 19624200
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||    ||||||||  ||||| |  |    
19623776 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaaga--tttgatcaatcaccaatgat 19623873  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| | ||| || |  ||||||| |||||  |   |||||| |||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||    
19623874 cttttgcctgatatggttattgtcctataaaggatcaatttcaaatccattctaagtatgaaggaacat-tgctgcaggcagagctgttattcttgtctt 19623972  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactt-tgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    |||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||  ||| |||||| |    || ||| | |||||||||| ||    
19623973 gtagcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaag-aacaatcatccaatgcttt 19624070  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgc 1085  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||  || || ||||||  || |||||| ||||||||||| || | | |||||||| |||||  ||||    
19624071 caaatcctttcagaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgc 19624170  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
19624171 atctcctgatgaacttcagcttctggtgat 19624200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1040 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 139374 - 139267
Alignment:
1040 tagacgaggttgaatc-cattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgct 1138  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
139374 tagacggggttaaatctcattaaacagcttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaacgacaatttctggtgatttttagcttctgataaacttgct 139275  T
1139 tctgatga 1146  Q
    ||||||||    
139274 tctgatga 139267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1040 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 147395 - 147288
Alignment:
1040 tagacgaggttgaatc-cattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgct 1138  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
147395 tagacggggttaaatctcattaaacagcttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaacgacaatttctggtgatttttagcttctgataaacttgct 147296  T
1139 tctgatga 1146  Q
    ||||||||    
147295 tctgatga 147288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 863 - 1059
Target Start/End: Original strand, 15987200 - 15987397
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||    |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |     
15987200 tgcaggcatagctgttatccttgtcctgtagtagagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tc 15987298  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaat-tctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt 1059  Q
    ||  | |||| |||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||  ||||||||| || ||||||||    
15987299 ttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcccttttaaaatagtcattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatt 15987397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 270
Target Start/End: Original strand, 3390779 - 3390884
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
3390779 attcttcttctgataaaacttcagaagtag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 3390875  T
262 aaacaaaga 270  Q
    | |||||||    
3390876 agacaaaga 3390884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 863 - 1186
Target Start/End: Original strand, 19086125 - 19086424
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |    
19086125 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctct 19086224  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || ||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
19086225 tcaaag-aacaagcatccaatgc----------tttcaaaatagtcgttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattga 19086313  T
1062 at-agcttttgaagccttaagt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 1158  Q
    || |||  |||| || ||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||  |||                |||||||||||||||||||    
19086314 atcagcccttga-gctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagct----------------ctgatgaacttgcttctga 19086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1039 - 1185
Target Start/End: Original strand, 22386928 - 22387076
Alignment:
1039 ttagacgaggttgaatccattaaatagct-tttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgc 1137  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||| ||||||||   |||||||||| |||||||| ||||     |||| |||| |||||||    
22386928 ttagaagaggttgaatccaataaacagctatttgaaactttaggttgcatcttctgatgaactgtagcttctggtgatacacagcttatgatgaacttgc 22387027  T
1138 ttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
22387028 ttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcaaaggcactttg 22387076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1185
Target Start/End: Original strand, 26589833 - 26589897
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
26589833 gcttctgatgaccttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactttg 26589897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 347
Target Start/End: Original strand, 3680459 - 3680552
Alignment:
255 aaaagaaaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
3680459 aaaagaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 3680552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 19065951 - 19065902
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19065951 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 19065902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1124 - 1185
Target Start/End: Original strand, 19482982 - 19483043
Alignment:
1124 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
19482982 tctgatgaacttgcttctgacgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcagaagcactttg 19483043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1185
Target Start/End: Original strand, 20635932 - 20635997
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
20635932 gcttctgatgaacttgcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttg 20635997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 320
Target Start/End: Original strand, 27720820 - 27720937
Alignment:
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
27720820 gcttctgatgtgatgttcaaaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagata--gacagaaacagttatactggttccttccacaa 27720917  T
301 cacggaagtagtccagtccc 320  Q
      ||||||||| ||||||||    
27720918 tccggaagtagcccagtccc 27720937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18027474 - 18027387
Alignment:
266 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
18027474 aaagacacatagcaattatcctgatttcttccacaatctggaagtagtccagtctcccttgcacttctaaggagatttcactataatc 18027387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Original strand, 21034409 - 21034476
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
21034409 tggttccttccacaatacagaagtagtccactcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21034476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 378
Target Start/End: Original strand, 21119103 - 21119285
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||| ||||| | || |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
21119103 tgcttatgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagag-agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccac 21119199  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta 378  Q
    |    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
21119200 atactggaagtagttcagtcccccttacacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta 21119285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 12347880 - 12347926
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12347880 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12347926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12716030 - 12715913
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
12716030 caagagacttctaatgctcaagcacacctgcaagagacttctaaattcaaacagaattacatagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 12715931  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
12715930 gtggtgttcacaatacaa 12715913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15478522 - 15478450
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 352  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15478522 ttatcttggttccttccacaatccggaagtagtccagt-ccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 15478450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 863 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 17316707 - 17316610
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
17316707 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 17316610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 17608247 - 17608198
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17608247 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttg 17608198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 687 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 31127672 - 31127623
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 736  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31127672 atctccaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 31127623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 10640345 - 10640297
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
10640345 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 10640297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 15478374 - 15478259
Alignment:
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatac 560  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||  |||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
15478374 atgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaat-tacaaagaaataagtttggtttgaacacttgctatacaatcaatggtgttcacaatac 15478276  T
561 aatacaataaagactct 577  Q
    || |||||  |||||||    
15478275 aaaacaattcagactct 15478259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 861 - 984
Target Start/End: Original strand, 19482717 - 19482840
Alignment:
861 tctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| |||    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||     
19482717 tctgcaggcagagctgttattcttgtcttttagtagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgc- 19482815  T
960 tttttgaggaactagcatccaatgc 984  Q
    |  ||||||||  ||||||||||||    
19482816 tccttgaggaataagcatccaatgc 19482840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24719525 - 24719437
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
24719525 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24719437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Original strand, 25929835 - 25929923
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
25929835 aaagacacaaagcaattatacaggttccttcaacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 25929923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1193
Target Start/End: Original strand, 26044569 - 26044628
Alignment:
1136 gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26044569 gcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 26044628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 13435242 - 13435325
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13435242 aaagacacaaagcaattatgcaggttccttccacaaaccggaagtagtcctttcccccttgcacttccaaggagagttcactat 13435325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19290121 - 19289957
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| |||   ||||||||||    || ||||||||||||||  ||| |||||||| |||| |||    
19290121 ttgaattgtgttttctttttctcagaaaattcttcttctcatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgca 19290022  T
235 gcggaa---agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||   | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
19290021 gcggaataaaaaacagagtagagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcatggttccttccac 19289957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1146
Target Start/End: Original strand, 21235248 - 21235363
Alignment:
1031 tgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgata 1130  Q
    ||||||  ||||||||| || |||||||| || | | ||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||     
21235248 tgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagctttatgttgcatctcctgatgaactgcagcttctagtgattttcagcttctgatg 21235347  T
1131 aacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||||||||||||||    
21235348 aacttgcttctgatga 21235363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 897 - 1036
Target Start/End: Original strand, 26943578 - 26943716
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||| | ||  | |||| |||||||||||| ||| ||| ||     
26943578 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgc-tcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaatccta 26943676  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    |  ||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
26943677 ttgaaatagcggttgcttcactcttctagtcttctgcaat 26943716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #188
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 28251388 - 28251326
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
28251388 cttgcttctgatgatcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactctgaacttcag 28251326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #189
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 34451592 - 34451545
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34451592 cttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 34451545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #190
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1182
Target Start/End: Original strand, 16877438 - 16877484
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
16877438 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcagaagcact 16877484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #191
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 17927171 - 17927237
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
17927171 ggttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 17927237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #192
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 17927581 - 17927627
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
17927581 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtttgaaagagacgttg 17927627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #193
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 18172391 - 18172345
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
18172391 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttg 18172345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #194
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20113429 - 20113347
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
20113429 aaagacacaaagcaattatacaggttacttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 20113347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #195
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 19289950 - 19289837
Alignment:
347 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 445  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| |    
19289950 ataatcacacatattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaa 19289854  T
446 agcaagagacttctaat 462  Q
    || ||||||||||||||    
19289853 aggaagagacttctaat 19289837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #196
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1184
Target Start/End: Original strand, 26943802 - 26943851
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
26943802 tgcttctgacgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 26943851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #197
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 925 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451596
Alignment:
925 ttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcca 1024  Q
    |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||   || ||   |||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||    
34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaag-aataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttca 34451689  T
1025 gtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    || |||||||||  ||||||||   |||||||||| || ||| |||||| | |||||  ||||||| | |||||||||  |||||||| ||||    
34451688 gtcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgat 34451596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #198
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14101208 - 14101148
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
14101208 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14101148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #199
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 15531976 - 15531936
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15531976 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 15531936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #200
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Original strand, 15551487 - 15551646
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||   || ||||| | |||  ||||||||||||  | ||||||||||||| | || |||||     
15551487 tgctcaagcacacaagcaagatacttcaaatactcaagcatagaaacaagaaatttcctatgctcaagcaccaaagcaagagacttctaaacagacaaat 15551586  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
     |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
15551587 -tacaaagaaataagtttggtttgaacaattgatatacaatcagtggtgttcataatacaa 15551646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #201
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 19066369 - 19066329
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19066369 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 19066329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #202
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19470907 - 19470955
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
19470907 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactttaggagcactt 19470955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #203
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 19833383 - 19833343
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19833383 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 19833343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #204
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 24116206 - 24116266
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
24116206 ggttccttccacaaaccagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24116266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #205
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 880 - 959
Target Start/End: Original strand, 26589584 - 26589664
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
26589584 tcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttcgtacagacgtactatgtcaacgct 26589664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #206
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Original strand, 29917407 - 29917467
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
29917407 gttccttccacaaaccggaagtagtctagtccccgttgcacttccaaggagagttcactat 29917467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #207
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 7751040 - 7750997
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
7751040 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactctgaacttcag 7750997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #208
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1092 - 1176
Target Start/End: Original strand, 21128406 - 21128492
Alignment:
1092 tgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcaga 1176  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |   ||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
21128406 tgatgaactgtagcttctggtgatataaagcttctgatgaactcgcttctgatgagcttttgcttctgatgacgtcatcacttcaga 21128492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #209
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 687 - 726
Target Start/End: Original strand, 25592409 - 25592448
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25592409 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 25592448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #210
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1066 - 1161
Target Start/End: Original strand, 26589763 - 26589858
Alignment:
1066 cttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    ||||||||  ||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||   | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
26589763 cttttgaaaacttgagttccatctcttgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttcagatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 26589858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #211
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1193
Target Start/End: Original strand, 27384824 - 27384867
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
27384824 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactctgaacttcag 27384867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #212
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1193
Target Start/End: Original strand, 27475237 - 27475280
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
27475237 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactctgaacttcag 27475280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #213
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1193
Target Start/End: Original strand, 27504736 - 27504779
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
27504736 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactctgaacttcag 27504779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #214
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Original strand, 30372716 - 30372823
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaa 365  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||  ||||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||    
30372716 agacacaagcaataatcttggttccttatacaatccggaagtagtccaatcccacttgcatttccaaggagattttcactataattacacaaaattacaa 30372815  T
366 atgctcaa 373  Q
     |||||||    
30372816 ttgctcaa 30372823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #215
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 10704895 - 10704849
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
10704895 atcttcaagttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 10704849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #216
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 12347471 - 12347537
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||    
12347471 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtccccattgcacttccaaggaaagttcactaaaatca 12347537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #217
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15395391 - 15395333
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 346  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
15395391 gttccttccacaatccggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcact 15395333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #218
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 18377821 - 18377883
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
18377821 ggttccttccacaaaccggaagtcagtccggtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 18377883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #219
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 18434919 - 18434977
Alignment:
289 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
18434919 ttccttccacaaatcggaagtactcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 18434977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #220
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Original strand, 18555640 - 18555701
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
18555640 ttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 18555701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #221
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 19085700 - 19085817
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
19085700 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 19085799  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
19085800 gtggtgttcacaatacaa 19085817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #222
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 19482131 - 19482193
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19482131 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19482193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #223
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 21234538 - 21234600
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21234538 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 21234600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #224
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 735
Target Start/End: Original strand, 23230980 - 23231026
Alignment:
689 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
23230980 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagatacgttgag 23231026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #225
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 24719100 - 24719054
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
24719100 atcttcaagtcttcactcctttatattgaggtttgaaagagacgttg 24719054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #226
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 25591979 - 25592061
Alignment:
266 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
25591979 aaagacacatagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 25592061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #227
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 880 - 958
Target Start/End: Original strand, 25594053 - 25594131
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgc 958  Q
    |||| |||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||    
25594053 tcttttcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgc 25594131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #228
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1184
Target Start/End: Original strand, 25800722 - 25800775
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25800722 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 25800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #229
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 31127839 - 31127801
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31127839 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 31127801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #230
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 12423446 - 12423495
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
12423446 gcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttg 12423495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #231
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 16265074 - 16265025
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
16265074 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcgccacttcaggagcactttg 16265025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #232
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 734
Target Start/End: Original strand, 16335923 - 16335964
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
16335923 aagtcttcactcctttatatagaggtgcgaaagagacgttga 16335964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #233
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 16528689 - 16528750
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
16528689 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16528750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #234
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18172990 - 18172925
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
18172990 gttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccgcttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18172925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #235
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 353
Target Start/End: Original strand, 18226811 - 18226876
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
18226811 gttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccgcttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18226876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #236
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 692 - 733
Target Start/End: Original strand, 19470463 - 19470504
Alignment:
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
19470463 caagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 19470504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #237
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 338
Target Start/End: Original strand, 19623336 - 19623409
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 338  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
19623336 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggag 19623409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #238
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1181
Target Start/End: Original strand, 19688974 - 19689019
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac 1181  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
19688974 gcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcatcacttcaggagcac 19689019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #239
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 450 - 562
Target Start/End: Original strand, 21034534 - 21034647
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtgg 548  Q
    |||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
21034534 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 21034633  T
549 tgttctcaatacaa 562  Q
    ||||| ||||||||    
21034634 tgttcgcaatacaa 21034647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #240
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 25788072 - 25788124
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
25788072 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 25788124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #241
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 562
Target Start/End: Original strand, 32335199 - 32335494
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agatta 362  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |   |||||    
32335199 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccggaaatagtcatgtcccctttgcatttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgatta 32335298  T
363 caaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaa 461  Q
    ||| |||||   |  || |||  | ||||||||   ||||| |||||||||| | |||||||   ||  |||||||||||| || |||| |||||||  |    
32335299 caattgctc--gagcataaaagcaagagacttc---aaactactcaagcacaaaagcaagaggtctcatatgctcaagcacaaacgcaatagacttccta 32335393  T
462 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatac 560  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| | |||||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
32335394 tgctcaagcacaaaagcaagagacttataatcaaacagaattacaaagaa-aatgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatac 32335492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #242
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 33351853 - 33351804
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
33351853 gcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaagagcactttg 33351804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #243
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9112318 - 9112267
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
9112318 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9112267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #244
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9122955 - 9122904
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
9122955 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9122904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #245
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 901 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 10640562 - 10640427
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtac-tttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttca 999  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  || | ||| ||||||| | ||  | |||| |||||| ||||| ||||||| ||||      
10640562 aaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttcaacgc-tcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttg 10640464  T
1000 aaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    || |||||||||||||||| |||  || |||||||||    
10640463 aattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaat 10640427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #246
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 12422621 - 12422705
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12422621 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcactcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 12422705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #247
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1173
Target Start/End: Complemental strand, 12715346 - 12715306
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 1173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
12715346 cttgcttctgatgaacttccttctgatgacgtcatcacttc 12715306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #248
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 12855394 - 12855445
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
12855394 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 12855445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #249
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 12865920 - 12865971
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
12865920 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 12865971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #250
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 15301594 - 15301654
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
15301594 ggttccttccacaaaccagaagtagacctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15301654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #251
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 17446310 - 17446155
Alignment:
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||    
17446310 aaactactcaagcacaacagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaatgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttatattcaaac 17446211  T
498 aaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    | |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
17446210 agaattacaaagaa-aatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtagtgttc 17446155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #252
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 19289206 - 19289146
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
19289206 ttgcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgaaacttcag 19289146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #253
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 19688576 - 19688616
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
19688576 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 19688616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #254
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 21624471 - 21624531
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
21624471 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21624531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #255
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 766
Target Start/End: Original strand, 23296516 - 23296596
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-gataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 766  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||    
23296516 atcttcaagtctttaatccattatatagtggtgtgagagagacgttgatgattttcagcacatcaaaagagtcgtttgaaa 23296596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #256
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 25593865 - 25593905
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
25593865 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 25593905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #257
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1183
Target Start/End: Original strand, 25675535 - 25675601
Alignment:
1121 gcttctgataaactt--gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
25675535 gcttctgatagacttctgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 25675601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #258
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1183
Target Start/End: Original strand, 25679611 - 25679677
Alignment:
1121 gcttctgataaactt--gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
25679611 gcttctgatagacttctgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 25679677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #259
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 29597615 - 29597731
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat-caaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||| || |||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
29597615 caagagacttttaatgttcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcag 29597714  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| ||||||||    
29597715 tggtgttcacaatacaa 29597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #260
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 33199700 - 33199751
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
33199700 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 33199751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #261
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 33352277 - 33352237
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
33352277 agtcttcactccttcatatagaggtgtgaaagagacgttga 33352237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #262
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 7763272 - 7763311
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
7763272 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 7763311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #263
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Original strand, 7811387 - 7811454
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||    
7811387 tggttccttccacaaaccggaagtagtccactcctcattgcacttataaggagatttcactaaaatca 7811454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #264
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 9717460 - 9717499
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
9717460 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 9717499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #265
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9933479 - 9933429
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
9933479 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 9933429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #266
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 10631721 - 10631760
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
10631721 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 10631760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #267
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10705064 - 10705025
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
10705064 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 10705025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #268
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 12422880 - 12422919
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12422880 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 12422919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #269
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 13601786 - 13601825
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13601786 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13601825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #270
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15395217 - 15395178
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15395217 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 15395178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #271
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 732
Target Start/End: Original strand, 15987030 - 15987069
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
15987030 aagtcttcactccttaatatagaggtgtgaaagagacgtt 15987069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #272
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16265682 - 16265643
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
16265682 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 16265643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #273
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17317055 - 17317016
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17317055 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 17317016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #274
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 18435158 - 18435197
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
18435158 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 18435197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #275
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19066787 - 19066510
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta--taatcacaaagattacaaatgctcaatact-atcaaa 383  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||  |   ||||||||||||||| |||| | |  |    
19066787 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatc--tgattacaaatgctcactactaaactta 19066690  T
384 atatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 482  Q
     |||||||||||   ||| ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||  | ||  || ||||||||||||| |||||||||||    |||| |    
19066689 gtatgagacttc---aaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaata 19066593  T
483 gacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||| ||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19066592 gacctcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 19066510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #276
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 351
Target Start/End: Original strand, 19470047 - 19470110
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 351  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
19470047 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttctaaggagagttcactataat 19470110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #277
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 19482370 - 19482409
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19482370 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 19482409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #278
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 347
Target Start/End: Original strand, 19625206 - 19625249
Alignment:
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
19625206 ggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19625249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #279
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 19625429 - 19625468
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19625429 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 19625468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #280
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20731236 - 20731197
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
20731236 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 20731197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #281
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 21234776 - 21234815
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21234776 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21234815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #282
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 21617862 - 21617901
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21617862 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21617901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #283
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22076937 - 22076898
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22076937 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22076898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #284
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 24719360 - 24719301
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 461  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
24719360 tgctcaagcccacacacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaa 24719301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #285
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 24729145 - 24729086
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 461  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
24729145 tgctcaagcccacacgcaagagtcttcgtatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaa 24729086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #286
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1102 - 1175
Target Start/End: Complemental strand, 25722799 - 25722722
Alignment:
1102 cagcttctgatgatttttggcttctgataaactt--gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcag 1175  Q
    |||||||||||||  | | |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
25722799 cagcttctgatgaaatgttgcttctgatagacttctgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcag 25722722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #287
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 25986471 - 25986521
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
25986471 tgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 25986521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #288
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 26589217 - 26589256
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
26589217 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 26589256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #289
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 26942055 - 26942094
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
26942055 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 26942094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #290
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 728
Target Start/End: Original strand, 26943383 - 26943418
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26943383 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 26943418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #291
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 761
Target Start/End: Original strand, 32335621 - 32335696
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||| || |||||||||||    
32335621 atcttcaagtcttcactcacttatatagaggtgtgagagagacgttgtagatttccagcacatcaaaagagtcgtt 32335696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #292
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 32543882 - 32543921
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
32543882 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 32543921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #293
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 10631513 - 10631575
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
10631513 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 10631575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #294
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 12952972 - 12952879
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||  ||||||||    
12952972 agcttctgatgaaatcttgcttctgatgaactttgcttctgatgaacttctgcttctgatgatgtaatcacttcagaggcacttgaaacttcag 12952879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #295
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 14052012 - 14051954
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
14052012 tgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 14051954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #296
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 15478145 - 15478099
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
15478145 atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagagatgttg 15478099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #297
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 15551776 - 15551822
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
15551776 atctttaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 15551822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #298
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 15954077 - 15954139
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
15954077 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagatcactat 15954139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #299
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 17380956 - 17381018
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
17380956 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 17381018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #300
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 17446014 - 17445969
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
17446014 atcttcaagtcttcactcctttatatagatgtgtgaaa-agacgttg 17445969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #301
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18172806 - 18172720
Alignment:
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
18172806 gcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaaaacaa 18172720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #302
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 562
Target Start/End: Original strand, 18226995 - 18227081
Alignment:
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
18226995 gcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaaaacaa 18227081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #303
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Original strand, 18498990 - 18499051
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
18498990 ttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgtaacttcag 18499051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #304
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19952340 - 19952282
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 344  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
19952340 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttca 19952282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #305
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 23006406 - 23006360
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
23006406 atcttaaagtcttcactcatttatatagaggtgtgagagagacgttg 23006360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #306
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 23781960 - 23782006
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
23781960 atcttaaagtcttcactcatttatatagaggtgtgagagagacgttg 23782006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #307
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 24728904 - 24728858
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
24728904 atcttcaagtcttcactcctttatattgaagcgtgaaagagacgttg 24728858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #308
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24729288 - 24729222
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac-ttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
24729288 gttccttccacaatccggaagtagtcttgtcccccttgcactttccaaggagagttcactaaaatca 24729222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #309
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 26588977 - 26589039
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
26588977 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 26589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #310
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1104 - 1184
Target Start/End: Original strand, 31572769 - 31572853
Alignment:
1104 gcttctgatgatttttggcttctgataaactt--gcttctgatgaacttg--cttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
31572769 gcttctgatgaaattctgcttctgatgaacttctgcttctgatgaacttctacttctgatgacgtcattacttcagaagcacttt 31572853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #311
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 139292 - 139243
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
139292 gcttctgataaacttgcttctgatgatgtcatcatttcaggagcactttg 139243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #312
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 147313 - 147264
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
147313 gcttctgataaacttgcttctgatgatgtcatcatttcaggagcactttg 147264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #313
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 10971350 - 10971298
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
10971350 cttgcttctgatgaccttctgcttctaatgacgtcatcacttcagaagcactt 10971298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #314
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12716193 - 12716132
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
12716193 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12716132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #315
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14052152 - 14052095
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 343  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
14052152 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttc 14052095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #316
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17304037 - 17303976
Alignment:
292 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
17304037 cttccacaaaccggaagtagtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcactacaatca 17303976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #317
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 901 - 934
Target Start/End: Original strand, 19625814 - 19625847
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19625814 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19625847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #318
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1148 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 19832914 - 19832877
Alignment:
1148 cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
19832914 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 19832877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #319
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 20029729 - 20029677
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20029729 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 20029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #320
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 20062480 - 20062428
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20062480 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 20062428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #321
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 21235338 - 21235387
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
21235338 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcgctacttcaggagcactttg 21235387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #322
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Original strand, 21617618 - 21617687
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
21617618 ttatactggttcattccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttcaaaggagagttcactat 21617687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #323
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23006769 - 23006561
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa--gattacaaatgctcaatactatcaaaat 385  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  |   |||||||| |||||||    | ||||      
23006769 gttccttccataatccggaagtagtcatgtcccccttccactttcaaggagagttcactaaaatcaatatctgattacaattgctcaagc--accaaagc 23006672  T
386 atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaga 484  Q
    | |||||||||   |||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||  |  |||||||    
23006671 aagagacttca---aactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagaga 23006575  T
485 cttctgatcaaaca 498  Q
    ||||| ||||||||    
23006574 cttctaatcaaaca 23006561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #324
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 498
Target Start/End: Original strand, 23781597 - 23781805
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa--gattacaaatgctcaatactatcaaaat 385  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  |   |||||||| |||||||    | ||||      
23781597 gttccttccataatccggaagtagtcatgtcccccttccactttcaaggagagttcactaaaatcaatatctgattacaattgctcaagc--accaaagc 23781694  T
386 atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaga 484  Q
    | |||||||||   |||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| || || |||||||||  ||||||||||||  |  |||||||    
23781695 aagagacttca---aactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagaga 23781791  T
485 cttctgatcaaaca 498  Q
    ||||| ||||||||    
23781792 cttctaatcaaaca 23781805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #325
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24729179 - 24729014
Alignment:
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||| |  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| | |||||    
24729179 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcccacacgcaagagtcttcgtatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaac 24729080  T
498 aaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    | |  |||| |||| || ||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||    
24729079 acaattacacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatgtacaatcaatgatgttcataatacaa 24729014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #326
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 562
Target Start/End: Original strand, 25595733 - 25595833
Alignment:
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatac 560  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| | ||| ||||  |||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
25595733 atgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaa-caaaattacacagaaaaatgtttgatttgaacacttgatatacaagcagtgatgttcacaatac 25595831  T
561 aa 562  Q
    ||    
25595832 aa 25595833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #327
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31720345 - 31720245
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattaca 364  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| || |  |||||  || ||||  |||||||||||||||| |||||||||    
31720345 agacacaagcaattatcctggttcattccacaacctggaagtagttcagtctccttatcacttagaatgagatttttcactataatcacacaagattaca 31720246  T
365 a 365  Q
    |    
31720245 a 31720245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #328
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9818031 - 9817970
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcaga 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||    
9818031 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcaga 9817970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #329
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 480
Target Start/End: Original strand, 10820696 - 10820728
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
10820696 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 10820728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #330
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1193
Target Start/End: Original strand, 11235870 - 11235945
Alignment:
1121 gcttctgataaactt-gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
11235870 gcttctgatgaactttgcttatgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgtaacttcag 11235945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #331
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 14100366 - 14100334
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
14100366 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 14100334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #332
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 14100790 - 14100750
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
14100790 aagtctttactcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 14100750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #333
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14883699 - 14883651
Alignment:
305 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
14883699 gaagtagtctggtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 14883651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #334
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14923863 - 14923703
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||| |||||| | ||||| |||| |||  ||||||||  |||||| ||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||| | ||||||||     
14923863 tgctcaatcacacaagaaagagacttcaaatattcaagcacacaagcaatagatttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaaa 14923764  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
     |||| | ||  | |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
14923763 ttacacataaagatgtttggttcgaacacttgatatactatcagtggtgttcacaatacaa 14923703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #335
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14923966 - 14923879
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcc-cccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||| || |||| |  |||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
14923966 aaagacacaaacaattatacatgttccttccacaatccggaagtagtc-attcctcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 14923879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #336
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1148 - 1184
Target Start/End: Original strand, 15302422 - 15302458
Alignment:
1148 cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15302422 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 15302458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #337
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16265502 - 16265462
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
16265502 aagtcttcactcctttatatagaggtatgaaagagacattg 16265462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #338
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 16915221 - 16915261
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
16915221 aagtcttcactcctttacatagaggtgtgaaagagatgttg 16915261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #339
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 17381320 - 17381360
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17381320 agtctttactcctttatatagaggtgtgaaagaggcgttga 17381360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #340
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 697 - 733
Target Start/End: Original strand, 19625609 - 19625645
Alignment:
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
19625609 cttcactcctttatgtagaggtgtgaaagagacgttg 19625645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #341
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1141 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 20730623 - 20730579
Alignment:
1141 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
20730623 tgatgaacttgcttctgatgacgtcactacttcaggagcactttg 20730579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #342
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 22076758 - 22076718
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
22076758 agtcttcactcctctatatagagatgtgaaagagacgttga 22076718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #343
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 22801937 - 22801977
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
22801937 aagtcttcacttctttatatagagatgtgaaagagacgttg 22801977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #344
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 24116625 - 24116665
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
24116625 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgcgagagacgttg 24116665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #345
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24471137 - 24471041
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc-cttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 373  Q
    ||||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| || |||||||    
24471137 ttatcatggttccttctacaatccgaaagtagtccagtcccctcttgcacttctaaggagattttcgctataaccacacaagattataattgctcaa 24471041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #346
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1176
Target Start/End: Complemental strand, 25686540 - 25686497
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcaga 1176  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
25686540 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcaga 25686497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #347
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1175
Target Start/End: Complemental strand, 25735380 - 25735322
Alignment:
1121 gcttctgataaactt--gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcag 1175  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
25735380 gcttctgatagacttctgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcag 25735322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #348
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 26972578 - 26972538
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
26972578 aagtcttcactcctttatatagacgtgtcaaagagacgttg 26972538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #349
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 30401422 - 30401363
Alignment:
1136 gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
30401422 gcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 30401363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #350
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 31931809 - 31931860
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
31931809 ttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 31931860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #351
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 34806983 - 34806932
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
34806983 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 34806932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #352
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 34817615 - 34817564
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
34817615 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 34817564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #353
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 7811631 - 7811670
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
7811631 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttaacaatacaa 7811670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #354
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Original strand, 12423059 - 12423098
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
12423059 agtcgtcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12423098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #355
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 726
Target Start/End: Original strand, 13144795 - 13144834
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
13144795 atcttcaggtattcactcctttatatagaggtgtgaaaga 13144834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #356
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 13601523 - 13601606
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
13601523 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13601606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #357
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1169
Target Start/End: Complemental strand, 14051283 - 14051248
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
14051283 ttgcttctgatggacttgcttctgatgacgtcatca 14051248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #358
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1169
Target Start/End: Complemental strand, 14069964 - 14069929
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
14069964 ttgcttctgatggacttgcttctgatgacgtcatca 14069929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #359
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 15301834 - 15301873
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
15301834 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 15301873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #360
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15532157 - 15532118
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
15532157 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacattacaa 15532118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #361
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1146 - 1185
Target Start/End: Original strand, 15954938 - 15954977
Alignment:
1146 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
15954938 aacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 15954977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #362
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 561
Target Start/End: Original strand, 16876525 - 16876560
Alignment:
526 aacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
16876525 aacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 16876560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #363
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 18925567 - 18925517
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
18925567 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 18925517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #364
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 19470285 - 19470324
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
19470285 ttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaa 19470324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #365
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 19688397 - 19688436
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
19688397 ttgaacacttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaa 19688436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #366
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19952103 - 19952064
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
19952103 ttgaacacttgatataaaatcagtggtgttcacaatacaa 19952064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #367
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 24116447 - 24116486
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
24116447 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaa 24116486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #368
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 734
Target Start/End: Original strand, 24398563 - 24398610
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
24398563 atcttcaagtattcactcctttatatagtggtgtgagagatacgttga 24398610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #369
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 30120070 - 30120020
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
30120070 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 30120020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #370
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 349
Target Start/End: Original strand, 32543644 - 32543707
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 349  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||    
32543644 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcattttcaaggagagttcactata 32543707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #371
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 7811803 - 7811849
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
7811803 atcttcaagtgctcactcatttatataaaggtgtgaaagagacgttg 7811849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #372
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Original strand, 8654052 - 8654101
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
8654052 tgcttctgatgagcttctgcttctaatgacgtcatcacttcagaagcact 8654101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #373
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1184
Target Start/End: Original strand, 13928577 - 13928611
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
13928577 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcacttt 13928611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #374
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 724
Target Start/End: Original strand, 16876701 - 16876731
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
16876701 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 16876731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #375
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1183
Target Start/End: Original strand, 16930823 - 16930857
Alignment:
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
16930823 ttgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 16930857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #376
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 353
Target Start/End: Original strand, 19875234 - 19875284
Alignment:
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
19875234 cggaagtagtcatgtccccctttcacttccaaggagagttcactaaaatca 19875284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #377
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 688 - 726
Target Start/End: Original strand, 25930267 - 25930305
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
25930267 tcttcaggtcttcactcctttatgtagaggtgtgaaaga 25930305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #378
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 26185164 - 26185230
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
26185164 ggttacttccacaatccggatgtagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatca 26185230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #379
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33352997 - 33352935
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
33352997 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatatcccccttgcacttccaaggagagttcactat 33352935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #380
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 354
Target Start/End: Original strand, 34659352 - 34659424
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 354  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
34659352 ttatactggttcctcccacaacacaagagtagtccagt-ccccttgtacttctaagg-gatttcactataatcac 34659424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #381
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9430 - 9397
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
9430 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 9397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #382
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1185
Target Start/End: Original strand, 4293114 - 4293166
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
4293114 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatttcttcagaggcactttg 4293166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #383
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 7375564 - 7375531
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
7375564 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 7375531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #384
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 7763031 - 7763092
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
7763031 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcccgtcccccttgcactttcaagaagagttcacta 7763092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #385
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 9717222 - 9717283
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
9717222 ggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagttcacta 9717283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #386
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 10402907 - 10402874
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
10402907 tgcttctgatgacgtcatcccttcagaagcactt 10402874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #387
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 11147038 - 11147005
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
11147038 tgcttctgatgacatcatcacttcagaagcactt 11147005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #388
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1192
Target Start/End: Original strand, 11206331 - 11206391
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaact--tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttca 1192  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
11206331 ttgcttctgatgaacttctgcttctgataacgtcattacttcagaggcacttgaaacttca 11206391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #389
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 339
Target Start/End: Original strand, 12041230 - 12041283
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 339  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
12041230 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 12041283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #390
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 12828064 - 12828116
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
12828064 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacatcatcacttcagaggcactt 12828116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #391
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 688 - 729
Target Start/End: Original strand, 15541787 - 15541828
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
15541787 tcttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaaaagac 15541828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #392
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 16960012 - 16960045
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
16960012 tgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 16960045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #393
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 18027083 - 18027042
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
18027083 atcttcaagtcttcattcctttatacagaggtatgaaagaga 18027042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #394
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 18826046 - 18825986
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||    
18826046 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcactacttcagaggcactttttacttcag 18825986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #395
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1158
Target Start/End: Original strand, 19482964 - 19483001
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 1158  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
19482964 gcttctgatgaacttgcatctgatgaacttgcttctga 19483001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #396
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 732
Target Start/End: Original strand, 19875625 - 19875670
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
19875625 atcttcaagtattcactcctttatatagaggtatgggagagacgtt 19875670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #397
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 696 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 19951920 - 19951883
Alignment:
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
19951920 tcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 19951883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #398
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1145 - 1174
Target Start/End: Complemental strand, 20112612 - 20112583
Alignment:
1145 gaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
20112612 gaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 20112583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #399
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 696 - 733
Target Start/End: Original strand, 20890835 - 20890872
Alignment:
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
20890835 tcttcactcctttaaaaagaggtgtgaaagagacgttg 20890872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #400
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21689580 - 21689533
Alignment:
307 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
21689580 agtagtccagtcccc-ttccacttccaagg-gatttcactataatcacaa 21689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #401
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 736
Target Start/End: Original strand, 26185503 - 26185552
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 736  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
26185503 atcttaaagtcttgaatcctttatatagaggtatgaaaaagacgttgaga 26185552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #402
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1180
Target Start/End: Original strand, 27373187 - 27373235
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
27373187 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagca 27373235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #403
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1180
Target Start/End: Original strand, 27463537 - 27463585
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
27463537 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagca 27463585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #404
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1180
Target Start/End: Original strand, 27506297 - 27506345
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
27506297 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagca 27506345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 691; Significance: 0; HSPs: 390)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 691; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 156 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 10755391 - 10754614
Alignment:
156 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagaga 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10755391 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagaga 10755292  T
256 aaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10755291 aaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcctttcacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 10755192  T
356 aagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
10755191 aagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagaactaagcaagagac 10755092  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
10755091 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctt 10754992  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
10754991 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcataaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttg 10754892  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    | |||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10754891 gagctttttaacttgtatatctctatatctcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 10754792  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10754791 gtcgtttgaaatcatttaatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 10754692  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10754691 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10754614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 671; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 30069209 - 30070046
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
30069209 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 30069308  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30069309 gcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 30069408  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
30069409 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 30069508  T
401 ac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30069509 aaatgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 30069608  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttct-aagatg 598  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
30069609 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttcttaagatg 30069708  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagt 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
30069709 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctctatcttcaatcttcaagt 30069808  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
30069809 cttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctatgc 30069908  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
30069909 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgttttgtcttgtagcgtg 30070008  T
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30070009 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30070046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 660; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 34772863 - 34772032
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
34772863 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 34772764  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34772763 cttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 34772664  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
34772663 acggaagtagtccagtcccccttgcactaccaaggagatttcactataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 34772564  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
34772563 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 34772464  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 601  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34772463 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 34772364  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttca 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
34772363 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctctcttttatcttcaagtcttca 34772264  T
702 ctcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgat 801  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
34772263 ctcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcatcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgat 34772164  T
802 ttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa 901  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
34772163 ttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-a 34772065  T
902 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
34772064 aaacagagtggtggaggtagtggttgtacactt 34772032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 660; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 34783808 - 34782977
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
34783808 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 34783709  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34783708 tttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 34783609  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
34783608 acggaagtagtccagtcccccttgcactaccaaggagatttcactataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 34783509  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
34783508 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 34783409  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 601  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34783408 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 34783309  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttca 701  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
34783308 caaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctctcttttatcttcaagtcttca 34783209  T
702 ctcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgat 801  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
34783208 ctcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgat 34783109  T
802 ttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa 901  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
34783108 ttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-a 34783010  T
902 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
34783009 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 34782977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 642; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 43043034 - 43043811
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
43043034 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 43043133  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43043134 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 43043233  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
43043234 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataagcaagagactt 43043333  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43043334 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaggaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 43043433  T
558 tacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
43043434 tacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 43043533  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 754  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
43043534 cgcttttgaacttg--tatgtctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaag 43043631  T
755 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43043632 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 43043731  T
855 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
43043732 acaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacactt 43043811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 631; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31419616 - 31418782
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
31419616 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 31419517  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
31419516 cttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagaagttatcctggttccttccacaac 31419417  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||     
31419416 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaag 31419317  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
31419316 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttctgatcaaacaaaa 31419217  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 601  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31419216 atacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 31419117  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt---atcttcaagtct 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||    
31419116 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctctgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtata--tctctatcttacaatcttcaagtct 31419019  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
31419018 tcactcctctatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaattctttgcct 31418919  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
31418918 gatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcataaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcaga 31418819  T
899 c-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31418818 caaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31418782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 625; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 5289915 - 5290716
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
5289915 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttatgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5290011  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5290012 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5290111  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
5290112 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 5290211  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
5290212 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 5290311  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5290312 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 5290411  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5290412 gtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 5290511  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
5290512 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 5290611  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
5290612 caaattcattaccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 5290711  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
5290712 cactt 5290716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 623; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22560357 - 22559557
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
22560357 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagtag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 22560261  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
22560260 cagcggaaaagaacaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttc 22560161  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
22560160 caaggagatttcactataatcataaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 22560061  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
22560060 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattgagtttgacttgaacact 22559961  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22559960 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 22559861  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22559860 tagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttatatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 22559761  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22559760 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 22559661  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22559660 aaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 22559561  T
931 actt 934  Q
    ||||    
22559560 actt 22559557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 620; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 27602758 - 27603558
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
27602758 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27602854  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27602855 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27602954  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
27602955 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 27603054  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
27603055 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 27603154  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27603155 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 27603254  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
27603255 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgt 27603354  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
27603355 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 27603454  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
27603455 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtat 27603554  T
931 actt 934  Q
    ||||    
27603555 actt 27603558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 620; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 27622107 - 27622907
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
27622107 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27622203  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27622204 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27622303  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
27622304 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcataaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 27622403  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
27622404 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 27622503  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27622504 ttatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 27622603  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27622604 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 27622703  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
27622704 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 27622803  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
27622804 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 27622903  T
931 actt 934  Q
    ||||    
27622904 actt 27622907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 619; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31449507 - 31448673
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
31449507 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgggttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 31449408  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaag-aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31449407 cttttgatgaaatgatcaaaattagatatgcagcggaaaataacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 31449308  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||     
31449307 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgatcaatactttctaagtatgagacttcacaaag 31449208  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
31449207 atgctcaaccacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagaacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 31449108  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 601  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31449107 atacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatataatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 31449008  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt---atcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||    
31449007 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgagagagttttggcgcttttgaacttgtata--tctctatcttacaatcttcaagtct 31448910  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
31448909 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaattctttgcct 31448810  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
31448809 gatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcaga 31448710  T
899 c-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31448709 caaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31448673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 614; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 5300486 - 5301292
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
5300486 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5300582  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5300583 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5300682  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
5300683 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 5300782  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
5300783 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 5300882  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5300883 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 5300982  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5300983 gtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 5301082  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
5301083 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 5301182  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt-----agcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtgg 924  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
5301183 caaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgctggcatggctgttgtcttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtgg 5301282  T
925 ttgtacactt 934  Q
    ||||||||||    
5301283 ttgtacactt 5301292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 598; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 14456919 - 14457752
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||    
14456919 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagt 14457018  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14457019 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 14457118  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
14457119 acggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 14457217  T
402 c--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
14457218 caatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 14457317  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgt 599  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
14457318 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgt 14457417  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
14457418 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttgtgta--tctctatcttatcttcaagtctt 14457515  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
14457516 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttaattatccaccagtgatcctttgcctg 14457615  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
14457616 atttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaga 14457715  T
899 ca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14457716 cagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14457752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 40391277 - 40390477
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
40391277 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40391181  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
40391180 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttacacttc 40391081  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
40391080 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 40390981  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
40390980 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 40390881  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40390880 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 40390781  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
40390780 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact--tatgtatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 40390683  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
40390682 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagct 40390583  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
40390582 tcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 40390483  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
40390482 acactt 40390477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 594; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20798592 - 20797816
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||   || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
20798592 aaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgctacggaaaagaacatagcagagaaa 20798493  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
20798492 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggatatttcactataatcacaaa 20798394  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20798393 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 20798294  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
20798293 ctactgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 20798194  T
558 tacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
20798193 tacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 20798094  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
20798093 cgcttttgaacttgtgtatctctatatgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagag 20797994  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 856  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20797993 tcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 20797894  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20797893 aaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgcagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20797816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 23407398 - 23406567
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||    
23407398 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcaaaagcagtttgtgaatg 23407299  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
23407298 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 23407200  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
23407199 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 23407100  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
23407099 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttttgatcaaacaaaa 23407000  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
23406999 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgta 23406900  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||    
23406899 tcaaatcagttcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgacgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttc 23406800  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
23406799 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctga 23406700  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
23406699 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtattgtcttgtagcgtggac- 23406601  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23406600 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 23406567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 1121210 - 1122043
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||  || |||||||||||   ||||||||    
1121210 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtg 1121309  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
1121310 cttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 1121408  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||||    
1121409 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 1121508  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
1121509 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 1121608  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
1121609 atacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgta 1121708  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||   ||||||||||||    
1121709 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatatctctctctacaatcttcaagtct 1121808  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
1121809 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcct 1121908  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
1121909 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 1122008  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1122009 c-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1122043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 14446306 - 14447140
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
14446306 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 14446405  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14446406 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 14446505  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
14446506 cacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaa 14446604  T
401 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14446605 acaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 14446704  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
14446705 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatg 14446804  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
14446805 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttgtgta--tctctatcttatcttcaagtct 14446902  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||    
14446903 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttaattatccaccagtgatcctttgcct 14447002  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
14447003 gatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtag 14447102  T
898 aca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14447103 acagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14447140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 40401913 - 40401139
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
40401913 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 40401817  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
40401816 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaaa 40401717  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40401716 gattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 40401617  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
40401616 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 40401517  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
40401516 tacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 40401417  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40401416 gcttttgaact--tatgtatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 40401319  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
40401318 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgta 40401219  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40401218 caaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 40401139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Original strand, 1108451 - 1109285
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||  || |||||||||||   |||||||    
1108451 atgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagt 1108550  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1108551 gcttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 1108649  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||    
1108650 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 1108749  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
1108750 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaaaagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaa 1108849  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
1108850 aatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgt 1108949  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||   |||||||||||    
1108950 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatatctctctctacaatcttcaagtc 1109049  T
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcc 797  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
1109050 ttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcc 1109149  T
798 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
1109150 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 1109249  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1109250 ac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1109285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 8522794 - 8521962
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
8522794 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 8522695  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
8522694 cttatgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 8522596  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
8522595 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 8522496  T
402 c-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
8522495 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcattaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaa 8522396  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgt 599  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
8522395 aatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgt 8522296  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||||||    
8522295 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtctt 8522196  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
8522195 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcatttgatcattcactagtaatcctttgcctg 8522096  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8522095 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 8521996  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8521995 -aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 8521962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 16003231 - 16004031
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
16003231 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 16003327  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16003328 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 16003427  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
16003428 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 16003527  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
16003528 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 16003627  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16003628 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 16003727  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
16003728 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 16003827  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16003828 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 16003927  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
16003928 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 16004027  T
931 actt 934  Q
    ||||    
16004028 actt 16004031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6131711 - 6130909
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
6131711 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttggttgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 6131615  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6131614 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 6131515  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
6131514 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 6131415  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
6131414 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 6131315  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6131314 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 6131215  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
6131214 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 6131115  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
6131114 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagct 6131015  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
6131014 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 6130915  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
6130914 acactt 6130909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Original strand, 40513360 - 40514130
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaac 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
40513360 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagac 40513457  T
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40513458 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 40513557  T
366 atgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 463  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40513558 ctgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 40513657  T
464 ctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
40513658 ctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaat 40513757  T
564 acaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 663  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
40513758 acagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttt 40513857  T
664 gaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 763  Q
    |||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40513858 gaacttatgtatctctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 40513957  T
764 aaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattc 862  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||    
40513958 aaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattc 40514057  T
863 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40514058 tgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 40514130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 37739874 - 37740708
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||    
37739874 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcttcttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagt 37739973  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37739974 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 37740073  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
37740074 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 37740172  T
402 ct--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
37740173 ctatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 37740272  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgt 599  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
37740273 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgt 37740372  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| | |||||||||||||    
37740373 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtacttctctatgtaatcttcaagtctt 37740472  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
37740473 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-gatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctg 37740571  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
37740572 atttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaga 37740671  T
899 ca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
37740672 cagaaaacagaatagtggaggtagtggttgtacactt 37740708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9347462 - 9346663
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
9347462 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9347366  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9347365 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9347266  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
9347265 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9347166  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||    
9347165 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacact 9347066  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9347065 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 9346966  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
9346965 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 9346866  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
9346865 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 9346766  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
9346765 aaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 9346667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22147442 - 22146641
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
22147442 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22147346  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22147345 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22147246  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
22147245 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 22147147  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
22147146 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22147047  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22147046 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 22146947  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
22146946 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 22146847  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
22146846 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagct 22146747  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22146746 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 22146647  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
22146646 acactt 22146641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 577; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 23363031 - 23362230
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
23363031 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 23362935  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23362934 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 23362835  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
23362834 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 23362735  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||    
23362734 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatatagagaattgagtttgaattgaacact 23362635  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23362634 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 23362535  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
23362534 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 23362435  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcc-tttgaagaattagctt 830  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
23362434 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttgaagaataagctt 23362335  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
23362334 caaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 23362235  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
23362234 cactt 23362230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9336875 - 9336076
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
9336875 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9336779  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9336778 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9336679  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
9336678 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9336579  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||    
9336578 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagatacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacact 9336479  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9336478 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 9336379  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
9336378 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 9336279  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
9336278 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 9336179  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
9336178 aaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 9336080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 36085383 - 36084582
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
36085383 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgaagaaatgatcagaatcagatatg 36085284  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
36085283 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36085185  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
36085184 caaggagatttcactataatcgcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 36085085  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
36085084 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 36084985  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36084984 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 36084885  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36084884 gtagaatcaaattgacagagttttggcgatttttaacttgtgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 36084785  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
36084784 ttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagctt 36084685  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
36084684 caaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcatgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 36084586  T
931 actt 934  Q
    ||||    
36084585 actt 36084582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 160 - 934
Target Start/End: Original strand, 37728616 - 37729392
Alignment:
160 aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaag 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37728616 aaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaag 37728715  T
260 aaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaaga 359  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
37728716 aaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-ga 37728814  T
360 ttacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37728815 ttacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 37728914  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
37728915 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 37729014  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
37729015 tacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggc 37729114  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| | ||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
37729115 gcttttgaacttatgtacttctctatgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-gatcagcacgtctaaagagt 37729213  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcac 856  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||    
37729214 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtac 37729313  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
37729314 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagaatagtggaggtagtggttgtacactt 37729392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22158025 - 22157224
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
22158025 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22157929  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22157928 cagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22157829  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
22157828 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 22157730  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
22157729 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22157630  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22157629 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 22157530  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
22157529 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 22157430  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
22157429 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagct 22157330  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22157329 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 22157230  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
22157229 acactt 22157224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 39353382 - 39352608
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
39353382 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcaaagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 39353286  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39353285 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 39353186  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39353185 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 39353086  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
39353085 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 39352986  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
39352985 tacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 39352886  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| | |||  || | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39352885 gcttttgaacttatgtatccctttctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 39352786  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
39352785 cgtttgaaattctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtaca 39352686  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39352685 aattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39352608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 19464925 - 19464092
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || || ||    
19464925 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatg 19464826  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
19464825 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 19464726  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||||    
19464725 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagactactcaaa 19464626  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
19464625 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 19464526  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
19464525 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgt 19464426  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||||||    
19464425 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgatagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtctt 19464326  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
19464325 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctg 19464227  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19464226 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 19464127  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
19464126 aaaaacagagtagtggacgtagtggttgtacactt 19464092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 15992669 - 15993469
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
15992669 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 15992765  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15992766 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcattccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 15992865  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15992866 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 15992965  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
15992966 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 15993065  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15993066 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 15993165  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
15993166 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagagccgtgaaagagacgt 15993265  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
15993266 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 15993365  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
15993366 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagattagtggaggtagtggttgtac 15993465  T
931 actt 934  Q
    ||||    
15993466 actt 15993469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 23307767 - 23306965
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
23307767 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 23307671  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23307670 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 23307571  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
23307570 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 23307471  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
23307470 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 23307371  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23307370 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 23307271  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23307270 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 23307171  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
23307170 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 23307071  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
23307070 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 23306971  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
23306970 acactt 23306965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 35227042 - 35226209
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |    
35227042 atgaaggttagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgatt 35226945  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35226944 gctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 35226846  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
35226845 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaa 35226747  T
401 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
35226746 acaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 35226647  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
35226646 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatg 35226547  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||    
35226546 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctcttttttatcttcaagtct 35226447  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
35226446 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcct 35226347  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
35226346 gatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtag 35226247  T
898 aca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35226246 acagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35226209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 19478955 - 19478122
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || || ||    
19478955 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatg 19478856  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
19478855 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 19478756  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||    
19478755 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgttcaatactctctaagtatgagactactcaaa 19478656  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
19478655 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 19478556  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
19478555 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgt 19478456  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||||||    
19478455 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttatagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtctt 19478356  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
19478355 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctg 19478257  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19478256 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 19478157  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
19478156 aaaaacagagtagtggacgtagtggttgtacactt 19478122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 35216457 - 35215625
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
35216457 tgaaggttagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 35216360  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35216359 ctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 35216261  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
35216260 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 35216162  T
402 c--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
35216161 caatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 35216062  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgt 599  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
35216061 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgt 35215962  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||    
35215961 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctcttttttatcttcaagtctt 35215862  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
35215861 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctg 35215762  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
35215761 atttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaga 35215662  T
899 ca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35215661 cagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35215625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31844884 - 31844079
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
31844884 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 31844788  T
234 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31844787 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 31844688  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac----tgctcaagcacacacgcaagagtctt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||    
31844687 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtctt 31844588  T
429 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
31844587 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaac 31844488  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31844487 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 31844388  T
629 ttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
31844387 ttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctgtctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaaga 31844288  T
727 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 826  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
31844287 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataa 31844188  T
827 gcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggt 925  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
31844187 gcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggt 31844088  T
926 tgtacactt 934  Q
    |||||||||    
31844087 tgtacactt 31844079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 105 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 23708395 - 23707563
Alignment:
105 caatgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||    
23708395 caatgaaggtga--aaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttga 23708300  T
200 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23708299 ttgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 23708201  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
23708200 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcaca 23708101  T
399 aaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaa 496  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
23708100 aaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaa 23708001  T
497 caaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaaga 596  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
23708000 caaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaaga 23707901  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagt 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||    
23707900 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctcttttatcttcaagt 23707801  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
23707800 cttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgc 23707701  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
23707700 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgta 23707602  T
897 gaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23707601 gacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 23707563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 36229661 - 36228860
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttt-----tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
36229661 ttgaattgtgttttctttctctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcaaaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 36229562  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
36229561 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36229463  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
36229462 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacatgcaagagtcttcca 36229363  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
36229362 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 36229263  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36229262 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgttaaaaactctagacttttgaatttccaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 36229163  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36229162 gtagaatcaaattgacagagttttgacgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 36229063  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
36229062 ttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagctt 36228963  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
36228962 caaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtggcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 36228864  T
931 actt 934  Q
    ||||    
36228863 actt 36228860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 14557355 - 14558157
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||    
14557355 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tg 14557451  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14557452 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14557551  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
14557552 caaggagatttcactttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 14557651  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
14557652 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 14557751  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14557752 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 14557851  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
14557852 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctcaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagac 14557951  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
14557952 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 14558051  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
14558052 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 14558151  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
14558152 acactt 14558157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 14567992 - 14568794
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||    
14567992 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tg 14568088  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14568089 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14568188  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
14568189 caaggagatttcactttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 14568288  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
14568289 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 14568388  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14568389 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 14568488  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
14568489 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctcaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagac 14568588  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
14568589 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 14568688  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
14568689 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 14568788  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
14568789 acactt 14568794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17607950 - 17607181
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
17607950 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 17607854  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
17607853 agacaaagacacaggcagttatactggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 17607755  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17607754 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 17607655  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
17607654 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 17607555  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
17607554 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 17607455  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17607454 ttttgaacttgtgta--tctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 17607357  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
17607356 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 17607257  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17607256 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 17607181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 23297199 - 23296397
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
23297199 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 23297103  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23297102 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 23297003  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
23297002 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 23296903  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
23296902 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 23296803  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23296802 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 23296703  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23296702 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 23296603  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
23296602 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcatttgaagaataaact 23296503  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
23296502 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 23296403  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
23296402 acactt 23296397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Original strand, 39490321 - 39491090
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
39490321 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 39490417  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39490418 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 39490517  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39490518 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 39490617  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
39490618 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 39490717  T
563 tacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttt 662  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
39490718 tacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttt 39490817  T
663 tgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 762  Q
    ||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39490818 tgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 39490917  T
763 gaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 862  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||    
39490918 gaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattc 39491017  T
863 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39491018 tgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39491090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Original strand, 39501511 - 39502280
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
39501511 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 39501607  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39501608 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 39501707  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39501708 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 39501807  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
39501808 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 39501907  T
563 tacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttt 662  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
39501908 tacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttt 39502007  T
663 tgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 762  Q
    ||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39502008 tgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 39502107  T
763 gaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 862  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||    
39502108 gaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattc 39502207  T
863 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39502208 tgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39502280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 42395936 - 42395101
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
42395936 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 42395837  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
42395836 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 42395738  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||     
42395737 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaag 42395638  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
42395637 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 42395538  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatac-----aataaagactctagac-tttgaatttctaag 595  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||    
42395537 atacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaag 42395438  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaag 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||    
42395437 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaag 42395338  T
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttg 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
42395337 tcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccaataatcctttg 42395238  T
796 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
42395237 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgt 42395138  T
896 ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
42395137 ggac-aaaacaga-tagtggaggtagtggttgtacactt 42395101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 565; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 36581897 - 36582698
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
36581897 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 36581993  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36581994 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36582093  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
36582094 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 36582193  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac-aaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
36582194 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 36582293  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36582294 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaggttgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 36582393  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
36582394 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 36582493  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
36582494 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 36582593  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
36582594 caaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 36582693  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
36582694 cactt 36582698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 33951138 - 33951941
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
33951138 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 33951234  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33951235 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 33951334  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
33951335 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 33951434  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
33951435 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 33951534  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33951535 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 33951634  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
33951635 tgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 33951734  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
33951735 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 33951834  T
830 tcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
33951835 tcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcgggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttg 33951934  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
33951935 tacactt 33951941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31349424 - 31348655
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
31349424 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 31349328  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
31349327 agacaaagacacagacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 31349229  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31349228 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 31349129  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
31349128 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 31349029  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
31349028 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaattgacagagttttggcgc 31348929  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31348928 ttttgaact--tatatatatctatctaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 31348831  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
31348830 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 31348731  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31348730 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31348655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 36688585 - 36687816
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
36688585 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 36688489  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
36688488 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 36688390  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36688389 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 36688290  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
36688289 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 36688190  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
36688189 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 36688090  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36688089 ttttgaact--tatttttctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 36687992  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
36687991 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 36687892  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36687891 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36687816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 36699151 - 36698382
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
36699151 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 36699055  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
36699054 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 36698956  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36698955 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 36698856  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
36698855 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 36698756  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
36698755 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 36698656  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36698655 ttttgaact--tatttttctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 36698558  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
36698557 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 36698458  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36698457 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36698382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 14041488 - 14040717
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
14041488 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 14041392  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
14041391 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 14041293  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14041292 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 14041193  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
14041192 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 14041093  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
14041092 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 14040993  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14040992 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 14040893  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
14040892 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 14040793  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14040792 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14040717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20552768 - 20551936
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
20552768 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 20552669  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
20552668 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 20552570  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
20552569 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 20552470  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
20552469 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaa 20552370  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgt 599  Q
     |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
20552369 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataaaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgt 20552270  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||||||    
20552269 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgacgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtctt 20552170  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
20552169 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcaagtctaaagagttgtttgaaatcatttgatcattcaccagtaatcctttgcctg 20552070  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20552069 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 20551970  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
20551969 -aaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20551936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 27471451 - 27470680
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27471451 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27471355  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27471354 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27471256  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27471255 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27471156  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
27471155 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 27471056  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
27471055 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 27470956  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27470955 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 27470856  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
27470855 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 27470756  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27470755 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27470680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 36592452 - 36593253
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||    
36592452 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tg 36592548  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36592549 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36592648  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
36592649 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 36592748  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac-aaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
36592749 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 36592848  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36592849 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaggttgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 36592948  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
36592949 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 36593048  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
36593049 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 36593148  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
36593149 caaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 36593248  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
36593249 cactt 36593253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17618565 - 17617795
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
17618565 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 17618469  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
17618468 agacaaagacacaggcagttatactggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 17618370  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17618369 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 17618270  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
17618269 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 17618170  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg-cg 658  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
17618169 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggtcg 17618070  T
659 cttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 758  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17618069 cttttgaacttgtgta--tctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 17617972  T
759 gtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 858  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | |||     
17617971 gtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa 17617872  T
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17617871 attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 17617795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31360038 - 31359269
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
31360038 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttatgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 31359942  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
31359941 agacaaagacacagacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 31359843  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31359842 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 31359743  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
31359742 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 31359643  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
31359642 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaattgacagagttttggcgc 31359543  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31359542 ttttgaact--tatatatatctatctaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 31359445  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
31359444 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 31359345  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31359344 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31359269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 9376831 - 9377602
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
9376831 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 9376927  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9376928 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 9377026  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9377027 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 9377126  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
9377127 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 9377226  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
9377227 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 9377326  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9377327 ttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 9377426  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
9377427 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 9377526  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9377527 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9377602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 14030935 - 14030164
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
14030935 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 14030839  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
14030838 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 14030740  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14030739 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 14030640  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
14030639 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttttaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 14030540  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
14030539 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 14030440  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14030439 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 14030340  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
14030339 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 14030240  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14030239 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14030164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 15693401 - 15694171
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
15693401 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 15693497  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
15693498 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 15693596  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15693597 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 15693696  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
15693697 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 15693796  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
15693797 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 15693896  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15693897 ttttaaacttatgtatctctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 15693996  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | ||| |    
15693997 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtaca-a 15694095  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15694096 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15694171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 24567980 - 24567210
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
24567980 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24567884  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24567883 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 24567785  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24567784 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 24567685  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24567684 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 24567585  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
24567584 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 24567485  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24567484 ttttaaacttatgtatctctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 24567385  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | ||| |    
24567384 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtaca-a 24567286  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24567285 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24567210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 24816255 - 24817026
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
24816255 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24816351  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24816352 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 24816450  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24816451 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 24816550  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24816551 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 24816650  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
24816651 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 24816750  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24816751 ttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 24816850  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
24816851 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 24816950  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24816951 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24817026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 24826843 - 24827614
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
24826843 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24826939  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24826940 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 24827038  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24827039 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 24827138  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24827139 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 24827238  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
24827239 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 24827338  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24827339 ttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 24827438  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
24827439 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 24827538  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24827539 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24827614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 27461052 - 27460281
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27461052 attcttcttctgataaaactttagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27460956  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27460955 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27460857  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27460856 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27460757  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
27460756 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 27460657  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
27460656 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 27460557  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27460556 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 27460457  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
27460456 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 27460357  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27460356 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27460281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22677006 - 22676236
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
22677006 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 22676910  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22676909 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 22676810  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22676809 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 22676710  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
22676709 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 22676610  T
562 atacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctt 661  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
22676609 atacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctt 22676510  T
662 ttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22676509 ttgaacttatgtat--ctctatcttgaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 22676412  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
22676411 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 22676312  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22676311 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22676236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22686897 - 22686127
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
22686897 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 22686801  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22686800 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 22686701  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22686700 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 22686601  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
22686600 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 22686501  T
562 atacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctt 661  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
22686500 atacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctt 22686401  T
662 ttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22686400 ttgaacttatgtat--ctctatcttgaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 22686303  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
22686302 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 22686203  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22686202 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22686127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 42043706 - 42042905
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
42043706 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 42043610  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42043609 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 42043510  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
42043509 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 42043410  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||    
42043409 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatcgaaca 42043310  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42043309 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 42043210  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
42043209 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttatgtatttttctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagac 42043110  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
42043109 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 42043010  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
42043009 tcaaattccttcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 42042911  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
42042910 acactt 42042905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 42054281 - 42053480
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
42054281 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 42054185  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42054184 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 42054085  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
42054084 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 42053985  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||    
42053984 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatcgaaca 42053885  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42053884 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 42053785  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
42053784 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttatgtatttttctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagac 42053685  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
42053684 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 42053585  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
42053584 tcaaattccttcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 42053486  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
42053485 acactt 42053480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 30226834 - 30227637
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
30226834 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 30226930  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30226931 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 30227030  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
30227031 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 30227130  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
30227131 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 30227230  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30227231 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 30227330  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgc--ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 727  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
30227331 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttttaacttatgtatttctctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagag 30227430  T
728 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattag 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
30227431 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaa 30227530  T
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
30227531 cttcaaattccttcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggtt 30227629  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
30227630 gtacactt 30227637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 30237361 - 30238164
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
30237361 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 30237457  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30237458 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 30237557  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
30237558 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 30237657  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
30237658 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 30237757  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30237758 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 30237857  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgc--ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 727  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
30237858 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttttaacttatgtatttctctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagag 30237957  T
728 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattag 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
30237958 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaa 30238057  T
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
30238058 cttcaaattccttcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggtt 30238156  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
30238157 gtacactt 30238164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6976698 - 6975928
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
6976698 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 6976602  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6976601 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 6976502  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6976501 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 6976402  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
6976401 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaagatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 6976302  T
562 atacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctt 661  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
6976301 atacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctt 6976202  T
662 ttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    || ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6976201 ttaaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 6976102  T
762 tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatatt 861  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |||    
6976101 tgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaatt 6976002  T
862 ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6976001 ctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6975928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6987188 - 6986418
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
6987188 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 6987092  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6987091 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 6986992  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6986991 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 6986892  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
6986891 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaagatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 6986792  T
562 atacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctt 661  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
6986791 atacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctt 6986692  T
662 ttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    || ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6986691 ttaaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 6986592  T
762 tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatatt 861  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |||    
6986591 tgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaatt 6986492  T
862 ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6986491 ctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6986418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17719808 - 17719038
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
17719808 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 17719712  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
17719711 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 17719613  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17719612 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 17719513  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
17719512 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacagta 17719413  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
17719412 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 17719313  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||  ||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17719312 ttttgaact--tatgtatctctataaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 17719215  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacat 858  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |||     
17719214 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaa 17719115  T
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17719114 attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 17719038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17730460 - 17729690
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
17730460 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 17730364  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
17730363 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 17730265  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17730264 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 17730165  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
17730164 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacagta 17730065  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
17730064 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 17729965  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||  ||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17729964 ttttgaact--tatgtatctctataaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 17729867  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacat 858  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |||     
17729866 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaa 17729767  T
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17729766 attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 17729690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15740859 - 15740087
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
15740859 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 15740763  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
15740762 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 15740664  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15740663 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 15740564  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
15740563 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 15740464  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
15740463 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 15740364  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15740363 ttttgaact--tatgtatctctatcttgaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 15740266  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcac 856  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | ||    
15740265 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtac 15740166  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15740165 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15740087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15770019 - 15769247
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
15770019 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 15769923  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
15769922 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 15769824  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15769823 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 15769724  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
15769723 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 15769624  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
15769623 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 15769524  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15769523 ttttgaact--tatgtatctctatcttgaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 15769426  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcac 856  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | ||    
15769425 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtac 15769326  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15769325 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15769247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 27204711 - 27203913
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||    
27204711 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgc 27204615  T
234 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27204614 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacagagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 27204515  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
27204514 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaa 27204415  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacactt 532  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
27204414 tgctcaaacactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 27204315  T
533 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 632  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27204314 gatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 27204215  T
633 agaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
27204214 agaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtgaaagagacgtt 27204116  T
733 gagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttca 832  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
27204115 gagataatcaacacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttca 27204016  T
833 aattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
27204015 aattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 27203916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 24808803 - 24808033
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
24808803 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24808707  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24808706 agacaaagacacatgcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 24808608  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24808607 acaactgctcaatacttttaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 24808508  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
24808507 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatg 24808408  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
24808407 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 24808308  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24808307 ttttaaacttatgtatatctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 24808208  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
24808207 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-a 24808109  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24808108 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24808033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 27041581 - 27042352
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27041581 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27041677  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27041678 agacaaatacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27041776  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27041777 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27041876  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
27041877 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 27041976  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
27041977 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttcgcgc 27042076  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27042077 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 27042176  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
27042177 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 27042276  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
27042277 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggtggtagtggttgtacactt 27042352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 929
Target Start/End: Original strand, 27052205 - 27052971
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27052205 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27052301  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27052302 agacaaatacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27052400  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27052401 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27052500  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
27052501 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 27052600  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
27052601 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 27052700  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27052701 ttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 27052800  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
27052801 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 27052900  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
27052901 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggtggtagtggttgta 27052971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Original strand, 21702432 - 21703268
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |    
21702432 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 21702530  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
21702531 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 21702629  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||    
21702630 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaa 21702729  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
21702730 aatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 21702829  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc-----tcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaa 594  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
21702830 aatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaa 21702929  T
595 gatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaa 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||    
21702930 gatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcactttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaa 21703029  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtccttt 794  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
21703030 gtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatccttt 21703128  T
795 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcg 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21703129 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcg 21703228  T
895 tggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21703229 tggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21703268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 24925501 - 24926279
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||    
24925501 aaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaa 24925600  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24925601 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 24925699  T
358 gattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
24925700 gattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtc 24925799  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
24925800 ttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 24925899  T
556 aatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt 654  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
24925900 aatacaatacgttagagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagtttt 24925999  T
655 ggcgcttttg-aacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 753  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
24926000 ggcgcttttttaacttgtatatatctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaa 24926099  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
24926100 gagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaagg 24926199  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24926200 cacaaattctgcaggcataggtgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24926279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 24982782 - 24983560
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
24982782 aaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttctgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagtggaaaagatcaaagcagagaaa 24982881  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24982882 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 24982980  T
358 gattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
24982981 gattacaaaatgctcaatactctctaagcatgagacttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtc 24983080  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
24983081 ttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 24983180  T
556 aatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt 654  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
24983181 aatacaatacgttagagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagtttt 24983280  T
655 ggcgcttttg-aacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 753  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
24983281 ggcgcttttttaacttgtatatatctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaa 24983380  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
24983381 gagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaagg 24983480  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24983481 cacaaattctgcaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24983560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 31834429 - 31833641
Alignment:
115 gagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgat 210  Q
    ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||    
31834429 gagaaaaacacaagaatggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgat 31834332  T
211 gaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt 309  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31834331 gaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt 31834233  T
310 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac----tgc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||     |||    
31834232 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgc 31834133  T
406 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatac 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
31834132 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 31834033  T
506 agagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaa 605  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31834032 agagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaa 31833933  T
606 tcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcact 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| | |||   |||||||||||||||||    
31833932 tcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgacgcttttgaacttatgtatatctgtctctacaatcttcaagtcttcact 31833833  T
704 cctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgattt 803  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
31833832 cctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgattt 31833733  T
804 gggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
31833732 gggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgt 31833641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 21705272 - 21706115
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
21705272 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 21705371  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
21705372 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 21705470  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatg-------ctcaatactatcaaaatatgagactt 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |  || ||||||||||    
21705471 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagactt 21705570  T
395 cacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatca 494  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
21705571 ctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatca 21705670  T
495 aacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc-----tcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaat 588  Q
    |||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
21705671 aacaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaatacaataaagactctagacttttgaat 21705770  T
589 ttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttat 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |   ||    
21705771 ttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtataatcaaattgacagagttttggcactttttaacttgtatatctctatctacaat 21705870  T
689 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||     
21705871 cttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaa 21705969  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 888  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
21705970 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 21706069  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21706070 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21706115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 39365375 - 39364685
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
39365375 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 39365279  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39365278 agaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 39365179  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39365178 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 39365079  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
39365078 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 39364979  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
39364978 tacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 39364879  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| | |||  || | |   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39364878 gcttttgaacttatgtatccctttctacaatcttcaagtcttcacttctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 39364779  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 851  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
39364778 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaa 39364685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 516; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 34063475 - 34062741
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
34063475 tgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagacaaaagaagaataa-gacacaaacagttatcctggttccttccaca 34063377  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
34063376 aaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 34063277  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac-a 498  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
34063276 aa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaa 34063178  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagat 597  Q
    || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
34063177 aaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagat 34063078  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaag 695  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||   ||||||||    
34063077 gtatcaaataagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatgactctatctttattcttcaag 34062978  T
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttg 795  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
34062977 tcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgaatagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttg 34062879  T
796 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
34062878 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgt 34062780  T
896 ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34062779 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 34062741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 34052912 - 34052080
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||| |  |||||||||||   ||  | ||    
34052912 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatgatacttcagaagcagtttggaaatg 34052813  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||     
34052812 cttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataaa-acacaaacagttatcctgattccttccacaaa 34052714  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
34052713 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 34052614  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac-aaa 500  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
34052613 -tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 34052515  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
34052514 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgt 34052415  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtc 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
34052414 atcaaataagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatgactctatctttattcttcaagtc 34052315  T
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcc 797  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
34052314 ttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgaatagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcc 34052216  T
798 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
34052215 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccaacttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtag 34052117  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
34052116 acaaaaatagactagtggaggtagtggttgtacactt 34052080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 17446005 - 17446835
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | ||    
17446005 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggagg-ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatg 17446103  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
17446104 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaatgatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 17446202  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
17446203 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 17446302  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
17446303 -tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 17446401  T
502 a-tacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttg--aatttctaagatg 598  Q
    | ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
17446402 aatacagggaaatatgtttgacttgaacactagatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgtgaatttctaagata 17446501  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |    |||||||||||    
17446502 tatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatctctctatctacattcttcaagtct 17446601  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
17446602 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgaatagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcct 17446700  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
17446701 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtaga 17446799  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17446800 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 17446835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20563277 - 20562461
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttc-ttttct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
20563277 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcgttttctctataaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 20563178  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||     
20563177 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaataaaagcaag--cacaagcagttatcctggttccttccacaaa 20563080  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
20563079 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 20562980  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
20562979 aatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaa 20562880  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20562879 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgt 20562780  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||||||    
20562779 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtctt 20562680  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
20562679 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcaagtctaaagagttgtttgaaatcatttgatcattcaccagtaatcctttgcctg 20562580  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
20562579 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga---------------aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcatggac 20562495  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20562494 -aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20562461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 17456621 - 17457451
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | ||    
17456621 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatg 17456719  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
17456720 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaatgatcaaagcagggaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccataaa 17456818  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
17456819 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacgataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 17456918  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
17456919 -tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagtaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 17457017  T
502 a-tacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttg--aatttctaagatg 598  Q
    | ||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||     
17457018 aatacaggggaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaatactctagactttgtgaatttctaagata 17457117  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |    |||||||||||    
17457118 tatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatctctctatctacattcttcaagtct 17457217  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
17457218 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgaatagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcct 17457316  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
17457317 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtata 17457415  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17457416 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 17457451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 23697706 - 23696988
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
23697706 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 23697610  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23697609 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 23697510  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
23697509 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcacgcacacacgcaagagtcttc 23697410  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
23697409 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 23697310  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23697309 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 23697210  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
23697209 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagac 23697110  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcc-tttgaagaattagc 828  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | |    
23697109 gttgaaataatcagcacgtctaaagagtcgttttgaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtggagtccttttaaagaaaaacc 23697010  T
829 ttcaaattcattcccatcttga 850  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
23697009 ttcaaattccttcccatcttga 23696988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 156 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 37407546 - 37406769
Alignment:
156 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagag 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||    
37407546 tctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcaacggaaaagatcaaagcagag 37407447  T
255 aaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 354  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37407446 aaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctcgttccttccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 37407348  T
355 aaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 454  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
37407347 aaagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagt 37407249  T
455 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
37407248 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatataatcagtggtgttc 37407150  T
554 tc-aatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagt 651  Q
     | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
37407149 acaaatataatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagt 37407050  T
652 tttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtcta 751  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||    
37407049 tttggcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcccttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgaataacacgtcta 37406950  T
752 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 851  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
37406949 aagagtcg-ttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattaattctcatcttgaa 37406851  T
852 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
37406850 ggaaca-attctgcaggcataactgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacactt 37406769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20625718 - 20624885
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
20625718 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaattcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgc 20625619  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
20625618 ttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 20625521  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
20625520 cggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 20625421  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||  ||||||||    
20625420 a-tgctcaagcacgcaggcaagaggcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcatgcatgcgagaggcttctattcaaacaa 20625322  T
500 agatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagat 597  Q
    | ||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
20625321 aaatacacagaaa-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactatagacttgagaatttctaagat 20625223  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaa 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||    
20625222 gtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaa 20625124  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctt 793  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||    
20625123 gtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagattttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttt 20625025  T
794 tgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagc 893  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
20625024 tgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatagctgttttcttgtcttgtagc 20624926  T
894 gtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
20624925 gtagacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacactt 20624885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 156 - 753
Target Start/End: Original strand, 43621254 - 43621853
Alignment:
156 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagag 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||    
43621254 tctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcaggtatgcagcggaaaagatcaaagcagag 43621353  T
255 aaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 354  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43621354 aaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacagatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 43621452  T
355 aaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagag 453  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43621453 aaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagag 43621552  T
454 acttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43621553 tcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 43621652  T
554 tcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtt 652  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
43621653 acaatacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagtt 43621752  T
653 ttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 752  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
43621753 ttggcgctttttaacttgtgtatttctatctacaatcttcaagtcttcaatcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaa 43621852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 107041 - 106239
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||   |||||||||| |  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
107041 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgc 106942  T
234 agcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
106941 agcggaataaaacagagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 106844  T
333 aaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  | ||||||||| || || |||| |||||    
106843 aaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--ttctcaagcacgcaggcgagagacttcc 106746  T
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||| ||||    ||||||||| ||||    
106745 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaaagt-gtttgactttgaac 106647  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgc 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
106646 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 106547  T
628 tttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 724  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
106546 tttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttc-aacttgtgttaatgtctcttaccaatcttcaagtctccactcctttatatagaggtgtgaaa 106448  T
725 gagacgttgagataatc-agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaa 823  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
106447 gagacgttgagattttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagga 106349  T
824 ttagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtg 923  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
106348 tcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctacaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagagtagtggaggtagtg 106250  T
924 gttgtacactt 934  Q
    |||||||||||    
106249 gttgtacactt 106239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20417854 - 20417022
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
20417854 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcttcttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 20417755  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacg 304  Q
    |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || | ||| || | ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||    
20417754 tctgatgtgatgttcagagtcagatatgcagcggaatgaaaatagaacagagaaaagaaagagagacataagcaattatcctggttccttccacaaaccg 20417655  T
305 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||      
20417654 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa-- 20417558  T
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||     
20417557 tgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaa 20417458  T
502 atacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgt 599  Q
     |||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
20417457 ttacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaatatgt 20417359  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagt 696  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||  |  ||||||||||    
20417358 atcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctatttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttttaacttgtgttgatatctcttgccaatcttcaagt 20417259  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttg 795  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || || ||||    
20417258 cttcactcctttatatagtagtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccaataatcttttg 20417160  T
796 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| || | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
20417159 cctgatttagatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctctcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgt 20417061  T
896 ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20417060 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20417022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Original strand, 7031762 - 7032268
Alignment:
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
7031762 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaaca 7031860  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
7031861 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 7031960  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 727  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
7031961 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtat--ctctatcttcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggcgtgaaagag 7032058  T
728 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattag 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
7032059 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataag 7032158  T
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac---aaaaacagagtagtggaggtagtgg 924  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
7032159 cttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaaaacagagtagtggaggtagtgg 7032258  T
925 ttgtacactt 934  Q
    ||||||||||    
7032259 ttgtacactt 7032268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 32753285 - 32754085
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
32753285 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 32753384  T
235 gcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    || ||| |||  |||| ||||||||||||  | |  |||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
32753385 gcagaatgaaaacagaacagagaaaagaaggaga--gacacaagcaattatcctgattccttccacaaactggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 32753482  T
333 aaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||    
32753483 aaggagatttccactaaaaatcacacagattacagatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcc 32753579  T
431 aatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaac 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||  | ||||||  ||||||    
32753580 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaa-aatgtttgattttgaac 32753678  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgc 627  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||     
32753679 acttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgt 32753778  T
628 tttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aa 723  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
32753779 tttatagaatcaaatttggcagagttttggcactttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatctt-aagtcttcactcctttatatagaggtgagtaa 32753876  T
724 agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaa 823  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
32753877 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatctaccattaatctttttcctgatttgggtgtagtcctatgaagga 32753975  T
824 ttagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtg 923  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
32753976 ttaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtg 32754074  T
924 gttgtacactt 934  Q
    |||||||||||    
32754075 gttgtacactt 32754085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 156 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 23393300 - 23392900
Alignment:
156 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagag 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||    
23393300 tctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgaaaaagatcaaagcagag 23393201  T
255 aaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 354  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23393200 aaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 23393102  T
355 aaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
23393101 aaagattacaaatgctcaatactctctaagtttgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaaagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagt 23393002  T
455 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttct 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
23393001 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacgcttgatatacaatcagtggtgttct 23392902  T
555 ca 556  Q
    ||    
23392901 ca 23392900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 138 - 462
Target Start/End: Original strand, 7031496 - 7031823
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
7031496 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 7031592  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7031593 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 7031692  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
7031693 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 7031792  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
7031793 atgctcaagcactaagcaagagacttctaat 7031823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 35543733 - 35543247
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 549  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35543733 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctgatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 35543634  T
550 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgac 646  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  |||| |    
35543633 gttcacaatacaatgcaataaaagactatagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggc 35543534  T
647 agagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 743  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||    
35543533 agatttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttt-tgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatctttag 35543436  T
744 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 843  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||      
35543435 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccacaagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcat 35543337  T
844 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || || ||||||||||||||||||||    
35543336 atcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatattgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtcgaggtagtggttgtacactt 35543247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Original strand, 13522737 - 13523224
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtgg 548  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
13522737 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtgg 13522836  T
549 tgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttga 645  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||     
13522837 tgttcacaatacaatgcaataaaagactccagacttgagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttgg 13522936  T
646 cagagttttggcgcttttgaacttgt-atatgtctctat-cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca 742  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |    
13522937 cagagtttaggcgctttt-aacttgtgatat-tgtctatgcagatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 13523034  T
743 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 842  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||    
13523035 gcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaagatcaacttcaaattcattcc 13523133  T
843 catcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
13523134 tatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 13523224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 268 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20215897 - 20215218
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 362  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
20215897 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 20215798  T
363 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||      
20215797 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 20215700  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac--aaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||  ||  ||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
20215699 atgctcaagcactaaagcaagagacttttattcaaacagaattatacagaaaatt--gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 20215602  T
558 tacaatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatc-agtttgacagag 650  Q
    |||||| ||||  |||||  ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  |||||||||  ||| | | |||| |||||    
20215601 tacaatgcaattgaaagactctctatacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgtgtgaaacaaatttggcagag 20215502  T
651 ttttggcgcttttgaacttgt--atatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacg 747  Q
    ||| ||||||||| |||||||     |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||    
20215501 tttgggcgctttt-aacttgttgtcttgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttgagatctttaagcacg 20215404  T
748 tctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatct 847  Q
    || | |||||| ||||| |  | ||||| |   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||    
20215403 tcaatagagtc-tttgagaaaccttgattaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatct 20215305  T
848 tgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
20215304 tgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 20215218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 460 - 934
Target Start/End: Original strand, 13533474 - 13533951
Alignment:
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |   ||| ||||    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
13533474 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaataacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcaatagtgttcacaat 13533573  T
559 acaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttg 655  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  |||| |||||||| |    
13533574 acaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagtttgg 13533673  T
656 gcgcttttgaacttgt-ata-tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaa 752  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||  |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||| |||  | |||||||||||    
13533674 gcgctttt-aacttgtgataatgtctctg-cagatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgcgatcttaagcacgtctaa 13533771  T
753 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 852  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||    
13533772 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaag 13533870  T
853 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
13533871 gaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 13533951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 461 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 20168661 - 20168188
Alignment:
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgact-tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
20168661 atgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactctgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 20168562  T
560 caatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttgg 656  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| |||||||||||    
20168561 caatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcagagttttgg 20168462  T
657 cgcttttgaacttgt-ata-tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaa 753  Q
     |||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||    
20168461 agctttt-aacttgtgataatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcatttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaa 20168364  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||    
20168363 gagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaggg 20168265  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
     ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||    
20168264 aaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtaca 20168188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 218 - 934
Target Start/End: Original strand, 40227964 - 40228694
Alignment:
218 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 315  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    |||||||||||    
40227964 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagaagagagaagaaaga--aagacacaagcaattatactggttccttccacaaactagaagtagtcca 40228061  T
316 gtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctca 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||    
40228062 gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctca 40228159  T
409 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacag 507  Q
    ||||| || ||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  ||||     
40228160 agcacgcaggcaagagactccctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacac 40228259  T
508 agaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtat 601  Q
    ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||   |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||    
40228260 agaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatataatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatat 40228359  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtata--tgtctctatcttatcttcaagtc 697  Q
    ||||| |   ||||||||||  |||||||||  ||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||     |||||||| || |||||||||||    
40228360 caaatgaacacagaaattcaaagtgctttgtgtgaaacaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgttgtcttgtctcta-ctgatcttcaagtc 40228457  T
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttg 795  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   |||| | ||| ||||    
40228458 ttcactcctttatatagagatgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaatggtcttttg 40228556  T
796 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
40228557 cctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgt 40228655  T
896 ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
40228656 agacacaagcagagtcatggaggtagtggttgtacactt 40228694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 14086695 - 14086428
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
14086695 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatcc 14086596  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaat-ccattaaatagcttttgaagcctt 1078  Q
    ||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
14086595 aatgcattcaaatcacttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagcctt 14086496  T
1079 aagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
14086495 aagttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtaatttttagcttttgataaacttgcttctgatga 14086428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 36096257 - 36095771
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtgg 548  Q
    |||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
36096257 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtgg 36096158  T
549 tgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttga 645  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||| ||  ||||     
36096157 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgattttgagaaacaaatttgg 36096058  T
646 cagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca 742  Q
    |||||||| | ||||||  | ||||||   ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |    
36096057 cagagtttggacgcttta-accttgtagtaatgtctctg-ctgatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 36095960  T
743 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 842  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
36095959 gcacgtctaaagattcgtt-gaga-cctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcc 36095862  T
843 catcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
36095861 tatcttgaaggaaca-attttgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 36095771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 36097714 - 36097228
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtgg 548  Q
    |||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
36097714 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtgg 36097615  T
549 tgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttga 645  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||| ||  ||||     
36097614 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgattttgagaaacaaatttgg 36097515  T
646 cagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca 742  Q
    |||||||| | ||||||  | ||||||   ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |    
36097514 cagagtttggacgcttta-accttgtagtaatgtctctg-ctgatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 36097417  T
743 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 842  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
36097416 gcacgtctaaagattcgtt-gaga-cctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcc 36097319  T
843 catcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
36097318 tatcttgaaggaaca-attttgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 36097228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Original strand, 42243662 - 42243966
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||     
42243662 tcttgtcttgtagcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctcttttaaggaacaaacatca 42243760  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||    
42243761 aatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttta 42243860  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagc 1179  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |  | || ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
42243861 agttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagtttttgataaatttgcttctgatgaccttgcatctgatgacgtcatcacttcaggagc 42243960  T
1180 actttg 1185  Q
    | ||||    
42243961 attttg 42243966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 863 - 1161
Target Start/End: Original strand, 33933230 - 33933532
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |    
33933230 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctct 33933329  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaat-ccatta 1060  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
33933330 tttgaggaacaagcatccaatgcgtttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttttgcaatccttagacgaggttgaatcccatta 33933429  T
1061 aatagc--ttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 1158  Q
    || | |  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
33933430 aacaacttttttgaagctttaagttgcatcctctgatgaactgcaacttatggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaactgtcttctga 33933529  T
1159 tga 1161  Q
    |||    
33933530 tga 33933532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 694 - 1162
Target Start/End: Original strand, 30742775 - 30743242
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
30742775 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 30742872  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||  | |||| ||||  | |||||| | ||||||| | |||||||||    
30742873 ctttgcctgatatggttattgtcctaagaagtatcaatttcaaatgcattcccattgtaaaggaacatcgt-tgcaggtagagctgtttttcttgtcttg 30742971  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||||||| ||||    
30742972 tagcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gaagaataaacatccaatgccttca 30743069  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||     
30743070 aatcctttcaaaataatcgttgctttgcctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaagttgcatct 30743169  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 1162  Q
    | |||||||||||| |||||  | ||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
30743170 cctgatgaactgcaacttctcgtaattctcagcttatgataaatttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 30743242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 464
Target Start/End: Original strand, 21420071 - 21420431
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
21420071 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgc 21420170  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||      
21420171 ttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcaacggaataaaacagagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaatc 21420268  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||    
21420269 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaattctctcttagtatgagacttctcaaa 21420368  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgc 464  Q
      || |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
21420369 --tggtcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgc 21420431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 268 - 934
Target Start/End: Original strand, 23477732 - 23478404
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 362  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
23477732 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 23477831  T
363 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||      
23477832 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 23477928  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  ||||  |||    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
23477929 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacactgaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcagaata 23478028  T
560 caatacaat--aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtag---aatcagtttgacagagtttt 654  Q
    |||| |||   |||||||||  |    ||||||||||||| |||||||| |   || ||||||   ||||||   ||   ||  | |||  ||||||||     
23478029 caatgcaaatgaaagactctcta----gaatttctaagatatatcaaatgaacacataaattctaagtgcttataagtgaaacaaattttgcagagtttg 23478124  T
655 ggcgcttttgaacttgta-tatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaa 752  Q
    ||||||||| |||||||  | |   ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||| |     
23478125 ggcgctttt-aacttgttgtcttgttctttttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaat 23478223  T
753 agagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 851  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| |||||  |||| || |  ||||||| |||||| ||||||||    
23478224 agagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctaagaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaa 23478321  T
852 ggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
23478322 ggaacat-ttctacaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 23478404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 863 - 1149
Target Start/End: Original strand, 11993851 - 11994137
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
11993851 tgcaggcatagctgtttttcttgttttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctct 11993950  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || |    
11993951 tt-gaagaacaagcatccaatgctttcaaatcccttcaaattagccgttgcttcactattccagtcttctgcaatccttagacgagtttgaatccgttga 11994049  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaact 1149  Q
    | | |||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
11994050 acatcttttgaaactttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaact 11994137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 694 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 29138749 - 29138260
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  ||   ||||||||| | || | ||||||||  ||||| |  ||    
29138749 agtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgttcg-aagcttttgatcaatcaccaatgatc 29138652  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||  ||||||||   ||||  |||| |  |||||||| || || || ||||||||||    
29138651 ctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacat-tgttgcaggcagagttgtttttcttgtcttg 29138553  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||||| |||  |||||||||||| |||     
29138552 tagcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgc-tctttgaagaataagcatccaatgccttct 29138454  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||     
29138453 aatccttccaaaatagttgttgctatac-tttccagtcttctgcaatc-ttagacgattttgaatctgttaaacagcttttgaaactttaagttgcatct 29138356  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    | ||||||||| || |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
29138355 cctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactacaggagcactttg 29138260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 789 - 934
Target Start/End: Original strand, 43621855 - 43621999
Alignment:
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 888  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
43621855 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 43621954  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43621955 gtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 43621999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 4886985 - 4887268
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
4886985 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctct 4887084  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||| || || |||||||| |    
4887085 tt-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttttgcaatcttaagacaagtttaaatccattga 4887183  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||| || ||||||||||||||||    
4887184 acaacttttgaagctttaagttgcatatcttgatgaactgcagcttctggtgattctcagcttctaatgaacttgcttctgatga 4887268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Original strand, 33022460 - 33022910
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |   |||||| |  |||   ||||||| ||||   |||||||||  ||||| |      
33022460 aagtcttcactcctttaaatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacattcaaaatagagtcgtctgaag--ctttgatcaatcaccaatga 33022557  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 888  Q
    || |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| || |||||||| |||| |   ||||||||    
33022558 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagcttt---cttgtctt 33022653  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||| |||    
33022654 gtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaaacatccaatgccttc 33022752  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||    
33022753 aaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttatgttgcatc 33022852  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
     | ||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
33022853 tcctgatgaactgcaaattctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 33022910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 127; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 462
Target Start/End: Original strand, 13522418 - 13522779
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||||    |||||||||    || |||||||    
13522418 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcgaaaatatcttcttctgatatcaattcagaagctggttgagagtgct 13522517  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
13522518 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaataaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 13522615  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||     
13522616 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcc 13522714  T
397 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
13522715 caaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 13522779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 685 - 1169
Target Start/End: Original strand, 32160552 - 32161036
Alignment:
685 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccac 782  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||    
32160552 ttatctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgcgatctttaagcacgtcaatagagtcgttctgaaaac--ttgatcaatcac 32160649  T
783 cagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-c 881  Q
    || |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  | | || |||| ||||||||||| ||||||| | |    
32160650 caatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctaagggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttc 32160748  T
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaa 981  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||| | |  |||||||||    
32160749 ttatcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgc-tctttgaaggataagcatccaa 32160847  T
982 tgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagct-tttgaagccttaa 1080  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||  |||||| |  |  | |||| ||  ||  |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| | |||     
32160848 tgccttcaaatcctttcaaattagctgttgctactatacttcagtctttcgctttctttagacgagtttgaatccattaaacaactatttgaaactttag 32160947  T
1081 gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    ||||||||   ||||||||| ||| ||||| |||| |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32160948 gttgcatcttctgatgaactacagtttctggtgatatacagcttctgatagacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 32161036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Original strand, 1914940 - 1915452
Alignment:
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||    |||||| || ||||    
1914940 aatgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 1915039  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagt 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||      
1915040 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaa 1915139  T
624 gtgcttt-gta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 718  Q
    ||||||| ||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
1915140 gtgcttttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtattgtctctg-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 1915237  T
719 gtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtccttt 817  Q
    |||| ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| |    
1915238 gtgatagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctat 1915336  T
818 gaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggag 917  Q
    |||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||    
1915337 gaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagttgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggag 1915435  T
918 gtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||    
1915436 gtagtggttgtacactt 1915452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 694 - 1162
Target Start/End: Original strand, 26758943 - 26759411
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |  |||   |||||||||||||   ||||||||  ||||| |  ||    
26758943 agtcttcactctattatatagaggtgtgaaagagacgctga-attttcagcacattaaaaatagagtcgtttgaaactttttgatcaatcaccaatgatc 26759041  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||  |||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||| | ||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
26759042 ctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcctattatgaaggaatattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 26759140  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||| ||| || |||  |||||||||||| ||||    
26759141 tagcagagacaaaat-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacttactatttcagcgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttca 26759238  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||     
26759239 aatccttccaaaatagtcgttgttatacttttccagtcttctgcaatctttaggcgaatttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaagttgcatct 26759338  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 1162  Q
    | ||||||||| || |||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
26759339 cctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgataaatttgcttctgatgaatttgcttctgatgac 26759411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 35544055 - 35543694
Alignment:
106 aatgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||    
35544055 aatgaaggtgagaaaaacacaagaaggggaggttgaattgtgttttctttttctcgtaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtg 35543956  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa---agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||| |||||   | || ||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
35543955 cttctgatgtgatgttcagaattagatacgcaacggaataaaaaatagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccaca 35543858  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact 393  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||    
35543857 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagact 35543759  T
394 tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 459  Q
    || ||||  ||||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
35543758 tcccaaa--tgctcaagcatgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 35543694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 721 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 23372848 - 23372631
Alignment:
721 gaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcc-tttga 819  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
23372848 gaaagagacgttgagataatcagcccgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgttcctttgcctgatttgggggtagtccttttga 23372749  T
820 agaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac-atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggag 917  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||  | || | ||| |  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
23372748 agaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaaatttttgaggcatggctgttgttttttcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggag 23372649  T
918 gtagt-ggttgtacactt 934  Q
    ||||| ||||||||||||    
23372648 gtagtgggttgtacactt 23372631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 15516933 - 15517215
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||| || |    
15516933 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactct 15517031  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
15517032 tt-gaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttga 15517130  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||   ||||||||| || |||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
15517131 acaacttttgaagctttaagttgcatcttctgatgaactacaacttctggtgattctcaacttctgataaacttgcttctgatga 15517215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 880 - 1114
Target Start/End: Original strand, 31117858 - 31118092
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||| || ||| || |||| |||||||    
31117858 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactcttt-gaagaacaagcatcc 31117956  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaa-tagcttttgaagcctt 1078  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||    
31117957 aatgccttcaaattctttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagcttt 31118056  T
1079 aagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
31118057 atgttgcatctcctgatgaactgcagcttctgatga 31118092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 3245784 - 3245333
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  |||   ||||||||||||| | |||||| |  ||||| |  ||    
3245784 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgtcagcacattcaaaatagagtcgtttgaaa-cttttgataaatcaccaatgatc 3245687  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    |||||||| || ||  | | ||||| ||||| || |  ||||||| | ||||||   |||||  ||||  | ||||| || ||||||| | |||||||||    
3245686 ctttgcctaatatgtttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatacgttcccaatgtgaagaaacattgt-tgcagacagagctgtttttcttgtcttg 3245588  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    |||    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||  |||||| ||||| ||      
3245587 tagtagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatcaaatgcctttc 3245489  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| || ||| ||||| ||||||||||||     
3245488 aattctttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatc-ttagacgagtttgaatccttgaaacagttttggaagctttaagttgcatct 3245390  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||| ||||||||||| ||||    
3245389 cctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctaatga 3245333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 792 - 934
Target Start/End: Original strand, 21414197 - 21414338
Alignment:
792 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgta 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
21414197 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 21414295  T
892 gcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21414296 gcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21414338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 679 - 1012
Target Start/End: Complemental strand, 11208342 - 11208011
Alignment:
679 tctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatca 777  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||    
11208342 tctattttatcttcacgtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagaactttaagcacgtcaatagagtcgttctgaagcctt-gatca 11208244  T
778 tccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgt 877  Q
      ||||| |  |  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||  || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
11208243 atcaccaatgattttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaagttcaaatccattcttattttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgt 11208145  T
878 tgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaact-agc 975  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||  |||  || |||    
11208144 ttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacata-gtactttgtcaacgctctttgaagg--ctgagc 11208048  T
976 atccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgc 1012  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
11208047 atccaatgcattcaaatctcttcaaaatagtcgttgc 11208011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 380
Target Start/End: Original strand, 13533176 - 13533456
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    |||||||||    || |||||||    
13533176 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctcgaaaaattcttcttctgatatcaattcagaagctggttgagagtgct 13533274  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
13533275 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 13533372  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
13533373 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc 13533456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 266 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 25112661 - 25111977
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 358  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
25112661 aaagacacaagcaattatacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 25112562  T
359 attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||    
25112561 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 25112465  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |    
25112464 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacctgatatacaatcagtggtgttcac 25112365  T
556 aatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgaca 647  Q
    |||||||| |||   |||||||||  |||| |  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   |||||||   ||  ||  |  ||  ||    
25112364 aatacaatgcaaatgaaagactctctagacgtaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaaattagca 25112265  T
648 gagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctc-tatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gca 745  Q
    |||||| |||||||||    ||||   |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  | | |||    
25112264 gagtttgggcgctttttggtttgt---tgtctcgtctctgatcttcaagtcttcactcctttataaagagatgtgaaagagtcgttgagatctttaagca 25112168  T
746 cgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 844  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||| | ||||| || |  ||||||| |||||| |    
25112167 cgtcaaaagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaaggatcacattcaaatccattccta 25112070  T
845 tcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    |  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
25112069 ttatgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgt 25111977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 266 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 25171752 - 25171068
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 358  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
25171752 aaagacacaagcaattatacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 25171653  T
359 attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||    
25171652 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 25171556  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |    
25171555 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacctgatatacaatcagtggtgttcac 25171456  T
556 aatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgaca 647  Q
    |||||||| |||   |||||||||  |||| |  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   |||||||   ||  ||  |  ||  ||    
25171455 aatacaatgcaaatgaaagactctctagacgtaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaaattagca 25171356  T
648 gagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctc-tatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gca 745  Q
    |||||| |||||||||    ||||   |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  | | |||    
25171355 gagtttgggcgctttttggtttgt---tgtctcgtctctgatcttcaagtcttcactcctttataaagagatgtgaaagagtcgttgagatctttaagca 25171259  T
746 cgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 844  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||| | ||||| || |  ||||||| |||||| |    
25171258 cgtcaaaagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaaggatcacattcaaatccattccta 25171161  T
845 tcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    |  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
25171160 ttatgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgt 25171068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 36096546 - 36096215
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    |  ||||||||||||||  ||| |||||||  |||| |||    
36096546 ttgaattgtgttttctttttctcggaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttaagagtgcttctgatgtgatgttcagaattggatacgca 36096447  T
235 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
36096446 gcggaataaaaacagagtagagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagttcagtcccccttgcacttcc 36096349  T
333 aaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 426  Q
    |||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |    
36096348 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagac 36096252  T
427 ttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
36096251 ttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 36096215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 36098003 - 36097672
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    |  ||||||||||||||  ||| |||||||  |||| |||    
36098003 ttgaattgtgttttctttttctcggaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttaagagtgcttctgatgtgatgttcagaattggatacgca 36097904  T
235 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
36097903 gcggaataaaaacagagtagagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagttcagtcccccttgcacttcc 36097806  T
333 aaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 426  Q
    |||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |    
36097805 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagac 36097709  T
427 ttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
36097708 ttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 36097672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 20168989 - 20168630
Alignment:
110 aaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttc 206  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||||||    
20168989 aaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcagaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggatgagagtgcttc 20168890  T
207 tgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacg 304  Q
    |||||  ||| ||| |||| |||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||    
20168889 tgatgtgatgttcaaaatccgatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacataagcaattatcctggttccttccacaaaccg 20168792  T
305 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||    
20168791 gaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttccca 20168693  T
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20168692 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 20168630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 28464681 - 28464240
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcc 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  |||  ||||||||||||  | |||||| |  ||||| |  |||    
28464681 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgtcagcacattcaaaaagagtcgtttgaag-cttttgataaatcaccaatgatcc 28464584  T
792 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgt 890  Q
    |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| | ||||||   |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||| |    
28464583 tttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttat 28464485  T
891 agcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaa 990  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  ||||||||||||          
28464484 agtagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgc------ 28464392  T
991 attctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatccc 1090  Q
       |||||||||||| ||||| |  ||||||  ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||| |    
28464391 ---ctttcaaaatagccgttgttatacttttttagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttgtatctc 28464296  T
1091 atgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
     ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||    
28464295 ctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatga 28464240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 863 - 1184
Target Start/End: Original strand, 17814931 - 17815251
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||| ||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| |    
17814931 tgcaggcagagctgttatccttgccttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctct 17815030  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || ||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
17815031 tcaaag-aacaagcatctaatgctttcaaatcctttcagaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattga 17815129  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    | ||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||    
17815130 acagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaaatttagcttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgctactgat 17815226  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
17815227 gacgtcatcacttcaggagcacttt 17815251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 431 - 933
Target Start/End: Complemental strand, 40033381 - 40032869
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||    
40033381 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 40033282  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagt 623  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||   || ||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||      
40033281 acttgatatacaattagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaatgactctctagacttaagaatttctaagatttatcaaatgaacacagaaattcaaa 40033182  T
624 gtgcttt-gta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 718  Q
    ||||||| ||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
40033181 gtgcttttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtattgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagatgt 40033084  T
719 gtg-aaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctt 816  Q
    ||| ||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| |||||     
40033083 gtgtaaagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtccta 40032985  T
817 tgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtgga 916  Q
    ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
40032984 tgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaagcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtgga 40032886  T
917 ggtagtggttgtacact 933  Q
    |||||||||||||||||    
40032885 ggtagtggttgtacact 40032869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 102; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 865 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 41566606 - 41566323
Alignment:
865 caggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttt 963  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||| ||     
41566606 caggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttc 41566507  T
964 tgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaat 1063  Q
      || ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |||    
41566506 aaag-aataaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaat 41566408  T
1064 agcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
41566407 agcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 41566323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 693 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 89766 - 89342
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
89766 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 89669  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||||||||| |   |||||| |||| |  |||||||| ||||||| | ||||||||    
89668 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacat-tgatgcaggcagagctgttattcttgtctt 89570  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| || | ||  | |||| ||||| |||||| |||    
89569 gtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgc-tcttcaaagaacaagcatgcaatgctttc 89471  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | |||||||||| |||||  |||||    
89470 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgca 89371  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    || | ||||||||| || |||||| ||||    
89370 tctcctgatgaactacaacttctggtgat 89342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 201 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 40033586 - 40033321
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||  || || |||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
40033586 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaatagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccac 40033489  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgaga 391  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||    
40033488 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 40033389  T
392 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
40033388 cttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 40033321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 541 - 931
Target Start/End: Original strand, 13404753 - 13405148
Alignment:
541 atcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-g 634  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |    
13404753 atcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttgtatg 13404852  T
635 aatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    || ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13404853 aaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtattgtctcta-cagatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgt 13404950  T
732 tgagataatc-agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||  |  |||||||| |||||||||||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||  ||||| || |  ||    
13404951 tgagatcttttagcacgtc-aaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtccaatgaaggatcaagtt 13405048  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
13405049 caaatccattcctttcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtac 13405147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 693 - 1114
Target Start/End: Original strand, 20550687 - 20551111
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  || || |  |    
20550687 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtaaatttccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcatcaatgat 20550784  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatct-tgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    | |||||||||| ||| | |  |||| ||||| || |  |||||||  ||||| || | |||||| ||||  | |||||| | ||||||| | |||||||    
20550785 cttttgcctgatatggttattttcctatgaaggatcaatttcaaatcgattccaatttgtgaaggaacatcgt-tgcaggaaaagctgtttttcttgtct 20550883  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||| ||    
20550884 tgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgc-tctttaaagaacaagcatccaatgcctt 20550981  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt-aaatagcttttgaagccttaag--ttg 1084  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| || || ||||| ||  | |||||||||| |||||  |||    
20550982 caaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttg 20551081  T
1085 catcccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||    
20551082 catctcctgatgaacttcagcttctgatga 20551111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 693 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 7746037 - 7745532
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  || || |  |    
7746037 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcatcaatgat 7745940  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||   || || ||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||    
7745939 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatagt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 7745841  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||    
7745840 gtagcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaagaacaagcatccaatgccttc 7745742  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||  || || | | || |||||||| || | | |||||||| |||||  || ||    
7745741 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttaca 7745642  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgat-----ttttg-------gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    || | ||||| ||| ||||||||  ||||     || ||       |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
7745641 tctcctgatgtacttcagcttcttgtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttcttatgaccttgcttctgatgacgtcgtcacttca 7745542  T
1175 gaagcacttt 1184  Q
    | ||||||||    
7745541 ggagcacttt 7745532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 694 - 1115
Target Start/End: Original strand, 10848567 - 10848979
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||| | |  ||    
10848567 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaaatg-tcagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcacaaatgatc 10848664  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||| ||||| ||||  ||||||| | ||||||   ||||   ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
10848665 ctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggattaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 10848763  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| ||| || |||  |||||| |||||         
10848764 tagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatctaatgc----- 10848857  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
        ||||||||||||  | |||   ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||     
10848858 ----ctttcaaaatagctgatgccatacttttccagttttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatct 10848953  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
10848954 catgatgaactgcagcttctggtgat 10848979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 880 - 1116
Target Start/End: Original strand, 9088950 - 9089175
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||    
9088950 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaagaattagcatcc 9089048  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    |||||         ||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| | |||    
9089049 aatgc---------cttccaaaatagtcgttgtaatacttttccagtcttcttcaatc-atagacgagtttgattcctttaaacagcttttgaaacttta 9089138  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatt 1116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
9089139 agttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatt 9089175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 863 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 35986406 - 35986093
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttc-gttcaaacgtactttgtcaacgctt 960  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||     
35986406 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacacttttgtacagacgtactatgtcaacgctc 35986307  T
961 ttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatta 1060  Q
    ||| || |||   ||||||||||| ||         ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | || ||| | |    
35986306 ttt-gaagaataggcatccaatgcatt---------tcaaaatagtcgttgccacacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagttagagtccttga 35986218  T
1061 aatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 1160  Q
    || | |||||||| | |||||||  ||| | |||||||||||| |||||| |||||    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
35986217 aacatcttttgaaactttaagttcaatctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgaattagcttctgatg 35986118  T
1161 acgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
35986117 acgtcatcacttcagaagcactttg 35986093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 84; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1008 - 1146
Target Start/End: Original strand, 5429991 - 5430130
Alignment:
1008 gttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatcc-attaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagct 1106  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
5429991 gttgcttcactttttcagtcttctgcaatccttaaacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaagttgcatctcctgatgaactgcagct 5430090  T
1107 tctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
5430091 tctggtgatttttaccttctgatgaacttgcttctgatga 5430130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 23413148 - 23412865
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtctt-gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |    
23413148 tgcaggcatagctgttatttttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctct 23413049  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   |  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||  || || ||| || |||||||| |    
23413048 tcaaaa-aacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaataatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattga 23412950  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | | |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
23412949 acaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 23412865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 694 - 1075
Target Start/End: Original strand, 26765292 - 26765672
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |  |||   |||||||||||||   ||||||||  ||||| |  ||    
26765292 agtcttcactctattatatagaggtgtgaaagagatgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaaactttttgatcaatcaccaatgatc 26765390  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||  |||  || |  ||||||| |||||||||   ||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
26765391 ctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 26765489  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||| || |||  |||||||||||| ||||    
26765490 tagctgagacaaaa-cagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatttcagcgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttca 26765587  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagc 1075  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| | ||||| ||||||||||||    
26765588 aatccttccaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttaggcgaatttgaat-cgttaaacagcttttgaagc 26765672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 882 - 1115
Target Start/End: Original strand, 21910539 - 21910773
Alignment:
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaa 981  Q
    ||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||||    
21910539 ttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaa 21910637  T
982 tgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag 1081  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||  ||||||||| || |||| ||| || ||| ||||| || |||||    
21910638 tgccttcaaatcctttcaaaataatcgttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaag 21910737  T
1082 --ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
      ||||||| | |||||||||  |||||||| ||||    
21910738 tcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgat 21910773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 268 - 460
Target Start/End: Original strand, 23487908 - 23488104
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 362  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||  ||||||    
23487908 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacgcagatta 23488007  T
363 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
23488008 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 23488104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 201 - 460
Target Start/End: Original strand, 1914734 - 1915000
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga---aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 297  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||  ||||||||||||    
1914734 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttcca 1914831  T
298 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgag 390  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||    
1914832 taaaccggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 1914931  T
391 acttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||||||||||  ||||| |||||  | ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
1914932 acttcacaaa--tgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1915000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 266 - 606
Target Start/End: Original strand, 32160102 - 32160454
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 358  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
32160102 aaagacacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 32160201  T
359 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| | |||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||    
32160202 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattactcaagcacacaggcaagagatttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 32160298  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
32160299 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 32160398  T
556 aatacaatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaat 606  Q
    |||||| | ||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
32160399 aatacagtgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaat 32160454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 880 - 1116
Target Start/End: Complemental strand, 25930312 - 25930086
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||  ||  |||||||    
25930312 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaaaaataagcatcc 25930214  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||| || |         ||| ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||    
25930213 aatgccttctaaat---------tagccgttgttatacttttccagtcttatgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttta 25930123  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatt 1116  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
25930122 agttgcatctcctgatgaattgcagcttctggtgatt 25930086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 694 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 13545855 - 13545531
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |   |||||  || |||  ||||||||||||   |||||||||  || || |  ||    
13545855 agtcttcactcctttatatagaggtttgaaagagacgttgtgaattgccagcaaatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaacattgatc 13545758  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttgtcttg 889  Q
     ||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| || ||||  ||||||||||    
13545757 tttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccatagtgaagggacatcat-tgcaggcagagttgtttatcttgtcttg 13545659  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||    
13545658 tagcagagacaaaaatagagtagtggaggtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgc-tctttgaagaacaagcatccaatgccttca 13545560  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcact 1018  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||    
13545559 aatcctttcaaagtagttgttgcttcact 13545531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 863 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 19536475 - 19536153
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |    
19536475 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctct 19536376  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactt-ttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatta 1060  Q
    |   || ||| | |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||   || || ||||||  || |||||| |||||||||||     
19536375 tcaaag-aacaaacatccaatgctttcaaatccattcaaaaaagtcgttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattg 19536277  T
1061 aatagcttttgaagccttaagt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 1158  Q
    || |||  ||||||| ||||||  |||||| | ||||||||| | ||||||   ||| ||  ||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||    
19536276 aacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttctgcttcttgcgatctt--gcttctgatgagat-gcttctgatgaacttacttctga 19536180  T
1159 tgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
19536179 tgacgtcatcacttcaggagcactttg 19536153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Original strand, 26784146 - 26784602
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||   ||||||||||||   |||||||||  ||||| |      
26784146 aagtcttcactcccttatacagaggtgtgaaagagacgttgtgaattcccagcacatcaaaataagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatga 26784243  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    || ||||||| || | | | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||| | || ||| |||| || |||||||| || |||| | |||||||    
26784244 tcttttgcctaatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagcatgtaggaacatttt-tgcaggcagagttgttattcttgtct 26784342  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    ||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || ||  |||||||| | | |     
26784343 tgtagcagacacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aataagcatccagttcttc 26784441  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt--tgc 1085  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  || || ||||||  || |||||| ||||||||||| || ||| ||| |||| |||| |  |||    
26784442 caaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgc 26784541  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||| | || |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
26784542 atctcctgctgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 26784602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 897 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 6512567 - 6512322
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||   |||||| ||||||| |||    
6512567 gacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagc---caatgccttcaaatcctt 6512472  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatga 1094  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||| || |||||| | || | | |||||||| |||||  ||||||| | |||    
6512471 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 6512372  T
1095 tgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||||| || |||||  |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
6512371 tgaactacaacttctagtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 6512322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 287 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 11208771 - 11208441
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat 379  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||     
11208771 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacaactgattacaactgctcaatacta- 11208673  T
380 caa--aatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcag 476  Q
    |||  | |||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||  |||||  | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |     
11208672 caactagtatgagacttcaaaa---tgctcaagcacaca-gcaagatacttcctttactcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaa 11208577  T
477 gcaagagacttctgatcaa--acaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaa 571  Q
    |||||||||||||  ||||  | ||   |||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||    
11208576 gcaagagacttctattcaaatagaattgtacagaaaatt--gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaa 11208479  T
572 ga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaat 606  Q
    ||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
11208478 gactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaat 11208441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 694 - 1031
Target Start/End: Original strand, 28139401 - 28139738
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  |     
28139401 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaattagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatt 28139498  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||| ||||  || |  |||||||  ||||||||   ||||  ||| ||  |||||||| ||||||| | |||||||||    
28139499 ctttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaaca-atgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 28139597  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | | ||| |||  |||||||||||  ||      
28139598 tagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgc-tctatgaagaataagcatccaatgtctttc 28139696  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattct 1031  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||    
28139697 aatcctttcaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttct 28139738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 881 - 1185
Target Start/End: Original strand, 21660194 - 21660489
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  | ||||||||   ||||||||    
21660194 cttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacg-atctttgaggactaagcatcca 21660292  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    ||||          ||| |||||||| |||||   |||||||| || |||||||||||||||||||| | || ||| | ||| |||||||||| | || |    
21660293 atgc---------atttgaaaatagttgttgccatacttttccggtcttctgcaatctttagacgagttagagtccttgaaacagcttttgaaactttga 21660383  T
1081 gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaac-ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagc 1179  Q
    |||  ||  |   |||||||| |||||||| ||||   |  |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
21660384 gttcaatttccaaatgaactgtagcttctggtgatacataacttctgatgacctagcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagatgc 21660483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 869 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 23392901 - 23392837
Alignment:
869 catagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23392901 catagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 23392837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 863 - 1011
Target Start/End: Complemental strand, 30116011 - 30115863
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |     
30116011 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tc 30115913  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttg 1011  Q
    ||||| |||  |||||| |||||  |  ||| ||||||||||||||||||    
30115912 tttgaagaataagcatcaaatgcccttcaatcctttcaaaatagtcgttg 30115863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24646646 - 24646542
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
24646646 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24646550  T
262 aaacaaag 269  Q
    | ||||||    
24646549 agacaaag 24646542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 859 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 39362510 - 39362434
Alignment:
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39362510 attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39362434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 881 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 35932161 - 35932016
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||| |||  ||||||||    
35932161 cttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacac-tctttgaagaataagcatcca 35932063  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    |||||         ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||    
35932062 atgcg---------tttcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaat 35932016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 882 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 21072394 - 21072241
Alignment:
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaa 981  Q
    ||||||||||||   |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || ||| |||||||||    
21072394 ttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaa 21072296  T
982 tgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||    
21072295 tgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaat 21072241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 693 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 21199346 - 21199046
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtctaaa-gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || ||||| || ||| ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  ||    
21199346 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtaattttcgagcacatcaaaaagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgatc 21199249  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttg 889  Q
     ||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||  |   |||||| ||||  | |||||||||||||||| || |||||  |    
21199248 tttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcaaagtatgaaggaacatcgt-tgcaggcatagctgttatccttgtccag 21199150  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    || ||| |||||||||||| ||||    
21199149 tagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaag-aacgagcatccaatgccttca 21199051  T
990 aattc 994  Q
    |||||    
21199050 aattc 21199046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 23391545 - 23391481
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23391545 gcttctggtgaacttgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 23391481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 20550432 - 20550547
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
20550432 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaagcagt 20550531  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
20550532 ggtgttcacaatacaa 20550547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 562
Target Start/End: Original strand, 33932622 - 33932921
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat--aatcacaaagatt 361  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  |   ||||    
33932622 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgcaatatct--gatt 33932719  T
362 acaaatgctcaatactatcaa---aatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctc--aagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||||||| |||||  ||   | || |||||||||   || ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||  || ||| || |||||||||    
33932720 acaaatgctcactacta--aatttactaagagacttca---aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctaaacac-aatcaagagact 33932813  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||| |||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| |  |||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
33932814 tctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaa-tatgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 33932912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 642609 - 642561
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
642609 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 642561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Original strand, 34637068 - 34637226
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||| ||| |||||||||  || ||||||| |||  |||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||     
34637068 tgctcaagcacacaagcaaaaaacttcaaatactcaagcacacaaacaagagatttcatatgctcaaacacaaaagcaagagacttctgaacaaacaaat 34637167  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
     |||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
34637168 -tacaaagaaatatgtttgg-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 34637226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 692 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 25097172 - 25096925
Alignment:
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgt----ctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagt 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| |      |||||||||||||||   |||||||||  ||||| |    
25097172 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacataaaagaaaagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaat 25097075  T
787 agtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt-gtcttgt 885  Q
      || |||||||||||||| | | ||| | |||||||| |  || |||| |||||| |   |||||| |||| |  ||||||||||||||||  ||||||    
25097074 gatcttttgcctgatttggttattgtcatatgaagaatcaattttaaatccattccaagtctgaaggaacat-tgttgcaggcatagctgttattcttgt 25096976  T
886 cttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    ||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25096975 cttgttgcagagac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 25096925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 692 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 25155142 - 25154895
Alignment:
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgt----ctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagt 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| |      |||||||||||||||   |||||||||  ||||| |    
25155142 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacataaaagaaaagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaat 25155045  T
787 agtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt-gtcttgt 885  Q
      || |||||||||||||| | | ||| | |||||||| |  || |||| |||||| |   |||||| |||| |  ||||||||||||||||  ||||||    
25155044 gatcttttgcctgatttggttattgtcatatgaagaatcaattttaaatccattccaagtctgaaggaacat-tgttgcaggcatagctgttattcttgt 25154946  T
886 cttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    ||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25154945 cttgttgcagagac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 25154895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26056271 - 26056184
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
26056271 aaagacacaaagcaattatcttggttccttccacaatccagaagtagtccagtcccccttgaacttccaatgatatttcactataatc 26056184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1180
Target Start/End: Original strand, 28139793 - 28139852
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
28139793 gcttctgataaacttacttctgatgaacttggttctgatgacgtcatcacttcaggagca 28139852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 10754426 - 10754365
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10754426 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 10754365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 562
Target Start/End: Original strand, 10848126 - 10848426
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta--taatcacaaagatt 361  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  |   ||||    
10848126 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatc--tgatt 10848223  T
362 acaaatgctcaatact-atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 459  Q
    ||||||||||| |||| | |  | || ||||||||   ||| ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||  | ||  || |||||||||| |    
10848224 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttc---aaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagactttt 10848320  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttg-acttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    | |||||||||||    ||||||||||||| |  |||||||||  |||| ||||    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
10848321 attgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 10848420  T
557 atacaa 562  Q
    ||||||    
10848421 atacaa 10848426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 347 - 462
Target Start/End: Original strand, 13403702 - 13403817
Alignment:
347 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-t 444  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||      
13403702 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacga 13403799  T
445 aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||||||||||||||||    
13403800 aagcaagagacttctaat 13403817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 23412893 - 23412843
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
23412893 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 23412843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 687 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 22586347 - 22586298
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 736  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
22586347 atcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttgaga 22586298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 25096710 - 25096661
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
25096710 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 25096661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 25154680 - 25154631
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
25154680 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 25154631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1185
Target Start/End: Original strand, 5430106 - 5430154
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
5430106 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcagaagcactttg 5430154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Original strand, 21659581 - 21659649
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
21659581 ttatactggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 21659649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 687 - 868
Target Start/End: Original strand, 23488303 - 23488483
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||   | |||||||| | ||||||||| |||||  | |||||||  |||||    
23488303 atcttcaagtcttcactcctttatatagaagtgtgaaagattcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcacca 23488400  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcagg 868  Q
     |  || | |||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||    
23488401 atgatcttctgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcagg 23488483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 35931929 - 35931881
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35931929 cttctgatgaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 35931881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 687 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 39799226 - 39799178
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
39799226 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgttgag 39799178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 694 - 959
Target Start/End: Original strand, 6499033 - 6499299
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | || ||| || ||  |||||||||||||   |||||||||  ||||| |  ||    
6499033 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattaccaacacatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatgatc 6499130  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt-gtcttgtcttg 889  Q
     ||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |   ||||||  ||| |  ||||||| ||||| ||  ||||||| ||    
6499131 tttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggatcat-tgttgcaggcgtagctattattcttgtcctg 6499229  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
6499230 tagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 6499299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 545
Target Start/End: Original strand, 12078357 - 12078502
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgct--caagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  |||||||  | ||||||||||| | | |||||||    
12078357 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgcttgcaagcacaaaagcaagagactt-ttaacaaacaa 12078455  T
500 aga-tacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    ||| || | |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
12078456 agattataaagaatattgtttgaattgaacacttgatatacaatcag 12078502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1092 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 21099648 - 21099558
Alignment:
1092 tgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
21099648 tgatgaactttagcttctggtgattttcagcttctgatgaggt-gcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 21099558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 26120178 - 26120103
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||| || |||||||||||    
26120178 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttgttgattgtcagcacttcaaaagagtcgtt 26120103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1175
Target Start/End: Complemental strand, 6512350 - 6512308
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcag 1175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6512350 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcag 6512308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7746478 - 7746396
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
7746478 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 7746396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 693 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 21100048 - 21099783
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| || ||  |||||||||||||   ||||||| |  ||||| |  |    
21100048 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgattaatcaccaatgat 21099951  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||  |   |||||| |||| |  |||| |||||| |||| | |||||| |    
21099950 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattctaagtatgaaggaacat-tgttgcaagcatagttgttatccttgtcct 21099852  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacg 957  Q
    |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||    
21099851 gtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacg 21099783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #203
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1092 - 1185
Target Start/End: Original strand, 23478546 - 23478640
Alignment:
1092 tgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaac-ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
23478546 tgatgaactgtagcttctggtgatatacagcttctgatgaacttgcttctgttgaactttgcttctgataacgtcatcacttcagagacactttg 23478640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #204
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 26056093 - 26056004
Alignment:
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa 567  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  |||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
26056093 gcaagagacttctaaacaaacaaat-tacacagaaataactttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaaaacaa 26056004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #205
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Original strand, 31117232 - 31117306
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 339  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
31117232 aaagacacaaagtagttatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 31117306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #206
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31589703 - 31589637
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
31589703 ggttcattccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 31589637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #207
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 3245358 - 3245309
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
3245358 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcactttagaagcactttg 3245309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #208
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6513193 - 6513128
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 351  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
6513193 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactataat 6513128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #209
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 863 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 9398908 - 9398811
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
9398908 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 9398811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #210
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 734
Target Start/End: Original strand, 15516762 - 15516803
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15516762 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 15516803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #211
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Original strand, 17447041 - 17447101
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
17447041 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttttagcttcag 17447101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #212
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 30115792 - 30115735
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
30115792 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcacttcaaacttcag 30115735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #213
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 33022885 - 33022934
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
33022885 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaaaagcactttg 33022934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #214
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13546283 - 13546223
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
13546283 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13546223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #215
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 13736477 - 13736437
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13736477 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13736437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #216
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 23413319 - 23413279
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23413319 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 23413279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #217
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 25930498 - 25930458
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25930498 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 25930458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #218
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1066 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 30115847 - 30115767
Alignment:
1066 cttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||| ||||||||||| ||||    
30115847 cttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctaatga 30115767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #219
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 31145978 - 31145938
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31145978 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 31145938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #220
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 643299 - 643184
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
643299 caagagacttctcatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagcttgaacatttgatatacaatcagt 643200  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
643199 ggtgttcacaatacaa 643184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #221
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9399377 - 9399318
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
9399377 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 9399318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #222
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 694 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 12353138 - 12352872
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   |||||| || ||  |||||||||||||   |||||||||  ||||| |  ||    
12353138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacattgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatgatc 12353041  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt-gtcttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| |   ||||| ||| | || |  ||||||| |||||| |   |||||| ||||  | || |||||||| ||||  ||||||| ||    
12353040 ttttgcctgatatggttactgtcctatgagggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgt-tgtaggcatagttgttattcttgtcctg 12352942  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
12352941 tagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 12352872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #223
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 399 - 563
Target Start/End: Original strand, 20567296 - 20567461
Alignment:
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  ||||  ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||    
20567296 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctttgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaaccaagagacttctaatcaaac 20567395  T
498 --aaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
      ||  ||| ||| |||   ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
20567396 agaataataaagaaaat---gtttgaggttgaacacttgatatacattcagtggtgttcacaatacaat 20567461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #224
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22586609 - 22586466
Alignment:
420 aagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtt 518  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||  |  |||||||||||| | |||||| |  |||| | ||  | |||    
22586609 aagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaaccaagagacttctaaacaaacacaattacacataaaaatgtt 22586510  T
519 tgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22586509 tgggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22586466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #225
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 863 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 23391778 - 23391656
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgctt 960  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |    
23391778 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtgcagatagtgattgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgc-t 23391680  T
961 ttttgaggaactagcatccaatgc 984  Q
      ||||||||  ||||||||||||    
23391679 ccttgaggaataagcatccaatgc 23391656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #226
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Original strand, 25740917 - 25740956
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25740917 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 25740956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #227
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 28465120 - 28464821
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta--taatcacaaagatt 361  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  |   ||||    
28465120 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatc--tgatt 28465023  T
362 acaaatgctcaatact-atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 459  Q
    ||||||||||| |||| | |  | || ||||||||    || || |||||||||   ||||||| ||||| ||||||  | ||  || ||||||||||||    
28465022 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttc----aaatgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttct 28464927  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttg-acttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    | |||||||||||    |||||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
28464926 attgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 28464827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #228
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 687 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 31589349 - 31589302
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
31589349 atcttcaagtcatcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgttga 31589302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #229
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 418 - 562
Target Start/End: Original strand, 16607020 - 16607166
Alignment:
418 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaag 516  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    |||||| ||||||  ||||||| |  |||| |||| || |    
16607020 gcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacaattgcaagatacttctattcaaacagaactacaaagaaatatg 16607119  T
517 tttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
16607120 tttgaggttgaacacttgatatacaatcaggggtgttcacaatacaa 16607166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #230
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 19536642 - 19536604
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19536642 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 19536604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #231
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25097610 - 25097528
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
25097610 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttccaaggagagttcacta 25097528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #232
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25155580 - 25155498
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
25155580 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttccaaggagagttcacta 25155498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #233
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26120583 - 26120517
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
26120583 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgtacttccaaggagaagtcactaaaatca 26120517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #234
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 35932790 - 35932490
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta--taatcacaaagatt 361  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||  |   ||||    
35932790 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatc--tgatt 35932693  T
362 acaaatgctcaatact-atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 459  Q
    ||||||||||| |||| | |  | || |||||||   |||| ||||||||||||   ||| ||| ||||| ||||||  | ||  || ||||||||||||    
35932692 acaaatgctcactactaaacttagtaagagactt---aaaattgctcaagcacaactgcaggagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttct 35932596  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    | |||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  || | ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
35932595 attgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattataaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 35932496  T
557 atacaa 562  Q
    ||||||    
35932495 atacaa 35932490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #235
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1186
Target Start/End: Complemental strand, 89352 - 89303
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
89352 cttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagtagcactttga 89303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #236
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 906 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 642837 - 642784
Alignment:
906 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
642837 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 642784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #237
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1143 - 1184
Target Start/End: Original strand, 4887250 - 4887291
Alignment:
1143 atgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
4887250 atgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 4887291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #238
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 11993265 - 11993326
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
11993265 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11993326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #239
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Original strand, 17457657 - 17457717
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
17457657 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttttagcttcag 17457717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #240
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 563
Target Start/End: Original strand, 23488061 - 23488178
Alignment:
447 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcag 545  Q
    ||||||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || |||||||||||||||||||||    
23488061 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcag 23488160  T
546 tggtgttctcaatacaat 563  Q
    |||||||| |||||||||    
23488161 tggtgttcacaatacaat 23488178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #241
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 687 - 736
Target Start/End: Original strand, 24019403 - 24019452
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 736  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
24019403 atcttcaggtcttcactcctttaaataaaggtgtgaaagagacgttgaga 24019452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #242
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 34771845 - 34771793
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
34771845 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 34771793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #243
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 34782790 - 34782738
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
34782790 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 34782738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #244
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1104 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 35543059 - 35542967
Alignment:
1104 gcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
35543059 gcttctgatgaaatcttgcttctgatgaactttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcataacttcagaggcacttgtaacttcag 35542967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #245
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 39362246 - 39362194
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39362246 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 39362194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #246
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 41566348 - 41566299
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
41566348 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgacatcacttcaggaacactttg 41566299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #247
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 42394914 - 42394862
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
42394914 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 42394862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #248
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 90185 - 90125
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
90185 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcacta 90125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #249
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 643046 - 643006
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
643046 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttg 643006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #250
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3246224 - 3246140
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagtag-tccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
3246224 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaacggaagtcggtcctgtcctccttgcacttccaaggagagttcactat 3246140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #251
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 7032456 - 7032507
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
7032456 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 7032507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #252
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 11993682 - 11993722
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
11993682 agtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttga 11993722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #253
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 20551114 - 20551162
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
20551114 tgcttctaatgagcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 20551162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #254
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 22000401 - 22000361
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
22000401 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 22000361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #255
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 23880860 - 23880900
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
23880860 aagtcttcactcctttatatagagctgtgaaagagacgttg 23880900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #256
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 349
Target Start/End: Original strand, 26764883 - 26764943
Alignment:
290 tccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 349  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
26764883 tccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactata 26764943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #257
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1184
Target Start/End: Original strand, 26784577 - 26784625
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
26784577 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatgacttcatgagcacttt 26784625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #258
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 28138958 - 28139042
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
28138958 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaaaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 28139042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #259
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 30742336 - 30742420
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
30742336 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaccaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagggttcactat 30742420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #260
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1185
Target Start/End: Original strand, 33933523 - 33933571
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
33933523 cttctgatgaacttgcttctgatgacgttatcacttgaggagcactttg 33933571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #261
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 35932345 - 35932309
Alignment:
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35932345 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 35932309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #262
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 39352420 - 39352369
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
39352420 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 39352369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #263
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 643461 - 643402
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
643461 gttccttctacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 643402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #264
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 2156626 - 2156591
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2156626 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 2156591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #265
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2156796 - 2156757
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2156796 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 2156757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #266
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 3245964 - 3245925
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
3245964 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 3245925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #267
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 4886637 - 4886676
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
4886637 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 4886676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #268
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 6498852 - 6498891
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
6498852 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 6498891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #269
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 9088583 - 9088622
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
9088583 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 9088622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #270
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12353393 - 12353279
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||| |||    
12353393 caagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaa-atgtttgagattgaacacttgatatacaattagt 12353295  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
12353294 ggtgttcacaatacaa 12353279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #271
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13546047 - 13546008
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13546047 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13546008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #272
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 15516584 - 15516623
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15516584 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 15516623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #273
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 689 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 17263077 - 17263030
Alignment:
689 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 736  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
17263077 cttcaagtcatcgctcctttatatagatgtgtgaaagagacgttgaga 17263030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #274
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 17814317 - 17814400
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
17814317 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgctcttccaaggagagttcacta 17814400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #275
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19537058 - 19536999
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
19537058 gttccttccacaaatcggaagtagtcatgtcctccttgcacttccaaggagagttcacta 19536999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #276
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21072835 - 21072720
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| |  |||||||||  |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||| |||    
21072835 caagagacttttaatgctcaagcacaactgcaagagacttatattcaaacaaaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaataagt 21072736  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
21072735 ggtgttcacaatacaa 21072720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #277
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21100225 - 21100186
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21100225 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21100186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #278
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21199599 - 21199484
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
21199599 caagagacttcttatgctcaagcacaattgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 21199500  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||  |||||||    
21199499 ggtgttcataatacaa 21199484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #279
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 21659826 - 21659865
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21659826 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21659865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #280
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 23880680 - 23880719
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
23880680 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 23880719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #281
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 880 - 959
Target Start/End: Original strand, 23881048 - 23881127
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||    
23881048 tcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgct 23881127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #282
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 25740725 - 25740764
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
25740725 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 25740764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #283
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 28139221 - 28139260
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
28139221 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 28139260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #284
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 29138928 - 29138889
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
29138928 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 29138889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #285
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 30070251 - 30070301
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
30070251 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 30070301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #286
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 31117493 - 31117532
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
31117493 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 31117532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #287
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 31146157 - 31146118
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
31146157 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 31146118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #288
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 31418576 - 31418526
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
31418576 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 31418526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #289
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Original strand, 31488042 - 31488081
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
31488042 agtcttcactcctttttatagaggtgtgaaagagacgttg 31488081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #290
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 34638070 - 34638109
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
34638070 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 34638109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #291
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 35986755 - 35986716
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
35986755 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 35986716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #292
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1183
Target Start/End: Original strand, 5301480 - 5301514
Alignment:
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5301480 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 5301514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #293
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 7746339 - 7746177
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat-caaacaaa 500  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||  | ||  || |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| | || |||||| |    
7746339 tgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttataatgctcaagcacaactgcaagagacttataattcaaacaga 7746240  T
501 gatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
      |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
7746239 attacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaa 7746177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #294
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Original strand, 13523426 - 13523487
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
13523426 ttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgtaacttcag 13523487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #295
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Original strand, 13534153 - 13534214
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
13534153 ttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgtaacttcag 13534214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #296
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13736656 - 13736618
Alignment:
524 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13736656 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13736618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #297
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 20567599 - 20567645
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
20567599 atcttcaagtctttactgctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 20567645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #298
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 20624715 - 20624631
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaactt--gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||  ||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
20624715 agcttctgatgaaattgtgcttctgatgaacttctgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 20624631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #299
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 21519974 - 21519925
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
21519974 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 21519925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #300
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22000811 - 22000729
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
22000811 aaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaaaccagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22000729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #301
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 23392205 - 23392088
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |  |||||||||  ||||  |||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
23392205 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 23392106  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| || |||||    
23392105 gtggtgttcacagtacaa 23392088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #302
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1184
Target Start/End: Original strand, 24926466 - 24926519
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
24926466 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttt 24926519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #303
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26766619 - 26766537
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
26766619 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcatttccaagaagagttcacta 26766537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #304
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 27203725 - 27203691
Alignment:
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27203725 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 27203691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #305
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 30742519 - 30742635
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| | |||  ||||||| |  |||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
30742519 caagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacatttgaattcaaacagaattacaaagaat-atgtttgagtttgaacacttgatatacaatca 30742617  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||| ||||| ||||||||    
30742618 gtgatgttcacaatacaa 30742635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #306
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 721
Target Start/End: Original strand, 34638242 - 34638276
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34638242 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 34638276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #307
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 734
Target Start/End: Original strand, 4886815 - 4886856
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
4886815 aagtcttcactcctttatatagaggtgtcagagagacgttga 4886856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #308
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 10848985 - 10849034
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
10848985 gcttatgatgaacttgcttttgatgatgtcatcacttcaggagcactttg 10849034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #309
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13736834 - 13736773
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13736834 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 13736773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #310
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 20797629 - 20797577
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
20797629 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 20797577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #311
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 21072582 - 21072541
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatata-gaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
21072582 aagtcttcactcctttatataggaggtgtgaaagagacgttg 21072541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #312
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 23880428 - 23880501
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
23880428 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccggatgtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 23880501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #313
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 901 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31815316 - 31815283
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31815316 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31815283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #314
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Original strand, 33022040 - 33022101
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
33022040 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttcactat 33022101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #315
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 36084395 - 36084343
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
36084395 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 36084343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #316
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39799601 - 39799536
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
39799601 gttccttccacaattcagaagtagccatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 39799536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #317
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 40390271 - 40390238
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40390271 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 40390238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #318
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 40400933 - 40400900
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40400933 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 40400900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #319
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 43043998 - 43044050
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
43043998 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcatttcagaagcactt 43044050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #320
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 4886317 - 4886401
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
4886317 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactat 4886401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #321
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 6130721 - 6130670
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
6130721 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 6130670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #322
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Original strand, 6498666 - 6498746
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 344  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
6498666 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccacggagagttca 6498746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #323
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 6512952 - 6512916
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
6512952 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 6512916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #324
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 698 - 734
Target Start/End: Original strand, 9088767 - 9088803
Alignment:
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
9088767 ttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttga 9088803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #325
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 367
Target Start/End: Original strand, 9823663 - 9823749
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 367  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||    
9823663 ttatactgattcctcccacaacacagaagtagtcca-acccccttgcactttcaagg-gatttcactatcatcacacatgattacaaat 9823749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #326
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12353556 - 12353496
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
12353556 gttccttccacaagccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12353496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #327
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 431 - 498
Target Start/End: Original strand, 13403755 - 13403823
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
13403755 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacgaaagcaagagacttctaatcaaaca 13403823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #328
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 14086881 - 14086841
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
14086881 agtcttcacttctttatatagatgtgtgaaagagacgttga 14086841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #329
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 20968623 - 20968683
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
20968623 ggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcctccttgcacttccaagcagagttcacta 20968683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #330
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21199762 - 21199702
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||    
21199762 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcactttcgaggagagttcacta 21199702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #331
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 21203989 - 21203949
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
21203989 aagtcttcactccattatatagatgtgtgaaagagacgttg 21203949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #332
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 21517624 - 21517592
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
21517624 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 21517592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #333
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Original strand, 21703441 - 21703491
Alignment:
1136 gcttctgatgaa---cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
21703441 gcttctgatgaaaaccttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 21703491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #334
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1184
Target Start/End: Original strand, 21910762 - 21910810
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
21910762 gcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcacttt 21910810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #335
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 22146453 - 22146402
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22146453 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 22146402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #336
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 22157036 - 22156985
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22157036 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 22156985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #337
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 462
Target Start/End: Original strand, 23589238 - 23589298
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 462  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
23589238 tgctcaagcacaaacgcaaaagtcttcctaagctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 23589298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #338
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Original strand, 23589500 - 23589544
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
23589500 atcttcaagtcttcgctcatttatatagaggtgtgaaagatacgt 23589544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #339
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1092 - 1180
Target Start/End: Original strand, 23881260 - 23881347
Alignment:
1092 tgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||  ||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
23881260 tgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgaggt-gcttctgatgaccttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagca 23881347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #340
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24495248 - 24495158
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctca 372  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||    
24495248 ttatactggttcctcccacaacacaagagtagtccagt-ccccttgcactttcaagg-gatttcattataatctcactgattacaattgctca 24495158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #341
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1184
Target Start/End: Original strand, 24983766 - 24983817
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
24983766 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttt 24983817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #342
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 26013259 - 26013310
Alignment:
321 ccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 373  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
26013259 ccttgcactttcaagg-gatttcactataatctcatagattacaaatgctcaa 26013310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #343
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 27460093 - 27460042
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
27460093 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 27460042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #344
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 27470492 - 27470441
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
27470492 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 27470441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #345
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 27623095 - 27623146
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
27623095 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 27623146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #346
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30116619 - 30116535
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
30116619 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcatttccaaggagagttcactat 30116535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #347
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 31117670 - 31117710
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
31117670 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagggacgttg 31117710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #348
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 31815095 - 31815044
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
31815095 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 31815044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #349
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 31843891 - 31843840
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
31843891 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 31843840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #350
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 33933062 - 33933102
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
33933062 agtcttcactcatttatatagaggtgtgagagagacgttga 33933102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #351
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 34051874 - 34051842
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
34051874 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 34051842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #352
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 34062535 - 34062503
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
34062535 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 34062503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #353
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35987016 - 35986932
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
35987016 aaagacacaagcagtttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcactaccaaggggagttcactat 35986932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #354
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 42243475 - 42243515
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
42243475 agtcttcactcctttatataaaggtgtgatagagacgttga 42243515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #355
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9398659 - 9398612
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||    
9398659 gcttctgatgaacttgatgttgatgacgtcatcacttcaggagcactt 9398612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #356
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9399138 - 9399099
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
9399138 ttgaacactttatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 9399099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #357
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 17814580 - 17814619
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
17814580 ttgaacacttgatatacaataagtggtgttcacaatacaa 17814619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #358
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 20562255 - 20562205
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20562255 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 20562205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #359
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23413758 - 23413679
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 344  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||    
23413758 aaagacacaaagcaattatacaggttccttacacaaaccggaagtagtcttgtccccctttcacttccaaggagagttca 23413679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #360
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 26765118 - 26765157
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
26765118 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 26765157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #361
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 26783969 - 26784008
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
26783969 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 26784008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #362
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 30116359 - 30116320
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
30116359 ttgaacacttgatatacaatcagtggtattcacaatacaa 30116320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #363
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1152 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 31448448 - 31448417
Alignment:
1152 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
31448448 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 31448417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #364
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1102 - 1193
Target Start/End: Original strand, 32754257 - 32754351
Alignment:
1102 cagcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||  | | |||||||||  |||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||    
32754257 cagcttctgatgaaatgttgcttctgatggactttgcttctgatgatcttctgcttctgatgacatcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 32754351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #365
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 39799398 - 39799359
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
39799398 ttgaacacttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaa 39799359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #366
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 15516347 - 15516409
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15516347 ggttcctaccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 15516409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #367
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 20168014 - 20167940
Alignment:
1121 gcttctgataaactt-gcttctgatgaact-tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||    
20168014 gcttctgatgaactttgcttctgatgacttctgcttctgatgacatcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 20167940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #368
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1180
Target Start/End: Complemental strand, 21198923 - 21198877
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
21198923 ttgcttctgatgagtttgcttctgatgacgtcatcgcttcaggagca 21198877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #369
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 367
Target Start/End: Original strand, 22747800 - 22747880
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 367  Q
    |||||||| ||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||    
22747800 tggttcctcccataacacaagagtagtccagtcccc-ttgcacttccaagg-gatttcactataataacataggattacaaat 22747880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #370
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 524 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 23413495 - 23413457
Alignment:
524 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
23413495 tgaacacttgatatacaatcactggtgttcacaatacaa 23413457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #371
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 23589095 - 23589161
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
23589095 ggttccttccataattcggaagtagttctgtcccccttgcacttccgaggatagttcactaaaatca 23589161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #372
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25097349 - 25097319
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
25097349 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 25097319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #373
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25155319 - 25155289
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
25155319 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 25155289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #374
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1151 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 25930081 - 25930047
Alignment:
1151 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
25930081 gcttctggtgacgtcatcacttcagaagcactttg 25930047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #375
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1131 - 1185
Target Start/End: Original strand, 31118092 - 31118146
Alignment:
1131 aacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
31118092 aacttgcttctagtggacttgcttatgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 31118146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #376
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 37406570 - 37406521
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
37406570 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcact 37406521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #377
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 1109491 - 1109524
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
1109491 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 1109524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #378
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 1122249 - 1122282
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
1122249 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 1122282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #379
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 8521756 - 8521723
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
8521756 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 8521723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #380
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 15993675 - 15993708
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
15993675 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 15993708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #381
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 16004237 - 16004270
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
16004237 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 16004270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #382
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 20551730 - 20551697
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20551730 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 20551697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #383
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 21706303 - 21706355
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
21706303 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcactttagaggcactt 21706355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #384
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 26783716 - 26783789
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
26783716 aagcaattatacaggttccttcaacaaaccggaagtagtattgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 26783789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #385
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 693 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 30116180 - 30116140
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
30116180 aagtcttcactcctttatatagcggtgt-aaagagacgttga 30116140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #386
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 696 - 733
Target Start/End: Original strand, 34637356 - 34637393
Alignment:
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
34637356 tcttcattcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 34637393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #387
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 36095601 - 36095520
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaact-tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
36095601 agcttctgatgaaatcttgcttctgatgaactttgcttctgatgacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcact 36095520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #388
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 36097058 - 36096977
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaact-tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
36097058 agcttctgatgaaatcttgcttctgatgaactttgcttctgatgacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcact 36096977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #389
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 36228673 - 36228621
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
36228673 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatggcgtcatcacttcagatgcactt 36228621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #390
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 43622197 - 43622249
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
43622197 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgttatcacttcagatgcactt 43622249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 655; Significance: 0; HSPs: 356)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6319388 - 6318551
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
6319388 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaat-cttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 6319290  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa------agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
6319289 gcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttc 6319190  T
296 cacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
6319189 cacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttc 6319090  T
396 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaa 495  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6319089 acaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaa 6318990  T
496 acaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaag 595  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6318989 acaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaag 6318890  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||    
6318889 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatctttaatcttcaag 6318790  T
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttg 795  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
6318789 tcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagaacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttg 6318690  T
796 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
6318689 cctgatttgagtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaggacacaaattatgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 6318590  T
896 ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6318589 ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6318551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 624; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 3220078 - 3220878
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
3220078 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 3220174  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3220175 cagcggaaaagaatagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 3220274  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
3220275 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 3220374  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
3220375 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaaacacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 3220474  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3220475 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 3220574  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
3220575 tagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttatatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 3220674  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
3220675 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 3220774  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
3220775 aaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 3220874  T
931 actt 934  Q
    ||||    
3220875 actt 3220878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 618; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 31214425 - 31215261
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
31214425 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 31214524  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
31214525 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacataagcagttatcctggttcattccacaac 31214624  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
31214625 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaa 31214724  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
31214725 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 31214824  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagact-ttgaatttctaagatgta 600  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
31214825 atacaaagaattaagtttgacttaaacacttgatatacaatcagtggtgttcgcaatacaatataataaagactctagactattgaatttctaagatgta 31214924  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagag---ttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtc 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| | |    ||||||||||    
31214925 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagtttttttggcgcttttgaacttgtgtatatctttctacagtcttcaagtc 31215024  T
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcc 797  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
31215025 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaagagttgtttgaaatcttttgatcatccaccaataatcctttgcc 31215124  T
798 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
31215125 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcataaattatgcaggcatagctgttgtcttgtcttatagcgtgg 31215224  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31215225 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31215261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 602; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 36077406 - 36078182
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36077406 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 36077505  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36077506 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-g 36077604  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36077605 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 36077704  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
36077705 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 36077804  T
557 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
36077805 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 36077904  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36077905 cgcttttgaact--tatatatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36078002  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 855  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
36078003 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 36078102  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36078103 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36078182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 602; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 36087992 - 36088768
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36087992 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 36088091  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36088092 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-g 36088190  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36088191 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 36088290  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
36088291 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 36088390  T
557 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
36088391 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 36088490  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36088491 cgcttttgaact--tatatatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36088588  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 855  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
36088589 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 36088688  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36088689 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36088768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 19128220 - 19128994
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
19128220 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 19128316  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19128317 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 19128416  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19128417 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 19128516  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
19128517 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 19128616  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
19128617 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 19128716  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||| ||||| | ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
19128717 gctttttaacttatgtatgtctattatttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcaacacgtctaaagagt 19128816  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
19128817 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtaca 19128916  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19128917 acttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19128994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 594; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20162101 - 20161264
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-----ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtg 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||     | |||||||||||||| |||||||||||   ||||    
20162101 atgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtg 20162002  T
199 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20162001 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 20161903  T
298 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 397  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |    
20161902 caaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc 20161803  T
398 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
20161802 aaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaac 20161703  T
498 aaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaaga 596  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
20161702 aaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaaga 20161603  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaa 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||    
20161602 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctctctcttcaatcttcaa 20161503  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtccttt 794  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
20161502 ttcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatccttt 20161403  T
795 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcg 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
20161402 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcg 20161303  T
895 tggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20161302 tggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20161264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 19138752 - 19139526
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
19138752 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 19138848  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19138849 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 19138948  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
19138949 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgctaagcaagagactt 19139048  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
19139049 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 19139148  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
19139149 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 19139248  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    | |||| ||||| | ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
19139249 gatttttaacttatgtatgtctattatttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcaacacgtctaaagagt 19139348  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
19139349 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtaca 19139448  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19139449 acttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19139526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 23470329 - 23469495
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || ||     
23470329 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattacttcttctgataatacttcagaagcagtttgagaa 23470230  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
23470229 agcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccaca 23470131  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
23470130 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 23470031  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
23470030 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaa 23469931  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatg 598  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
23469930 aaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatg 23469831  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||    
23469830 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtct 23469731  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
23469730 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtactcctttgcct 23469631  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23469630 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 23469531  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
23469530 caaaaacagaggagtggaggtagtggttgtacactt 23469495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 582; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 19224403 - 19225179
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
19224403 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 19224502  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19224503 agaagggcaaagacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 19224602  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
19224603 gattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 19224702  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
19224703 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 19224802  T
558 tacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
19224803 tacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 19224902  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
19224903 cgctttttaacttgtgtatctctatctactatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagag 19225002  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 856  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19225003 tcatttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgttgtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 19225102  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19225103 aaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19225179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 36292391 - 36293165
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
36292391 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 36292487  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36292488 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 36292587  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36292588 gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 36292687  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36292688 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 36292787  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
36292788 aatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 36292887  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36292888 gcgcttttgaact--tatatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 36292985  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |    
36292986 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgta 36293085  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36293086 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36293165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 36302994 - 36303768
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
36302994 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 36303090  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36303091 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 36303190  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36303191 gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 36303290  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36303291 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 36303390  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
36303391 aatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 36303490  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36303491 gcgcttttgaact--tatatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 36303588  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |    
36303589 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgta 36303688  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36303689 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36303768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 32089077 - 32088304
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
32089077 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 32088981  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32088980 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 32088881  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32088880 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 32088781  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
32088780 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 32088681  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
32088680 tacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 32088581  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32088580 gcttttgaacttatgtatttctatctattatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 32088481  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||    
32088480 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca 32088381  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32088380 -attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 32088304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 29076176 - 29076976
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
29076176 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 29076272  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29076273 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 29076372  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
29076373 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 29076471  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
29076472 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 29076571  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29076572 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 29076671  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
29076672 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagac 29076771  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
29076772 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 29076871  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
29076872 tcaaattccttcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 29076970  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
29076971 acactt 29076976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 32078504 - 32077731
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
32078504 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 32078408  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32078407 agaaagacaaagacacaagcagttatcatggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 32078308  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32078307 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 32078208  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
32078207 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 32078108  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
32078107 tacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 32078008  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32078007 gcttttgaacttatgtatttctatctattatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 32077908  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||    
32077907 cgtttgaaatcctttgattatccatcagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca 32077808  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32077807 -attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 32077731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 565; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 26110677 - 26111478
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
26110677 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaactgatcagagtcagat-tg 26110773  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26110774 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 26110873  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
26110874 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 26110973  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
26110974 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 26111073  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
26111074 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaactcagtgtgctttg 26111173  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
26111174 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 26111273  T
732 tgagataatcagcacgtc-taaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
26111274 tgagataattagcacgtcttaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 26111373  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
26111374 caaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggttgtggttgta 26111473  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
26111474 cactt 26111478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 13689404 - 13688601
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
13689404 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13689308  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
13689307 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttt 13689208  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
13689207 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 13689108  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
13689107 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 13689008  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13689007 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 13688908  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
13688907 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 13688808  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
13688807 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 13688708  T
830 tcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
13688707 tcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttg 13688608  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
13688607 tacactt 13688601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 3349429 - 3348661
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
3349429 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 3349333  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
3349332 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattaca 3349234  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3349233 actgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 3349134  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
3349133 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 3349034  T
563 tacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttt 662  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
3349033 tacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttt 3348934  T
663 tgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 762  Q
    ||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3348933 tgaacttatgtatctctgtctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 3348834  T
763 gaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 862  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||    
3348833 gaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattc 3348734  T
863 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3348733 tgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 3348661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 3360026 - 3359258
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
3360026 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 3359930  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
3359929 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattaca 3359831  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3359830 actgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 3359731  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
3359730 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 3359631  T
563 tacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttt 662  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
3359630 tacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttt 3359531  T
663 tgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 762  Q
    ||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3359530 tgaacttatgtatctctgtctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 3359431  T
763 gaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 862  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||    
3359430 gaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattc 3359331  T
863 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3359330 tgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 3359258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 30315511 - 30314731
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
30315511 aaaaatacttcttctgataaaactttagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 30315412  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30315411 agaaaagcaa-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtactccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 30315313  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
30315312 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccgatgctcaagcactaagcaagagtctt 30315213  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaaga-----gacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgtt 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30315212 ctaatgctcaagcacgcaggcaagataagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgtt 30315113  T
553 ctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagt 651  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
30315112 cacaatacaatacaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagt 30315013  T
652 tttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtcta 751  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
30315012 tttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtcta 30314913  T
752 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 851  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30314912 aagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 30314813  T
852 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30314812 ggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgaggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30314731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 18448816 - 18449616
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||| ||| || ||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
18448816 ttgaattgtgttttctttttcacttaaaaaatacttcttctgaaaaaactccagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tg 18448912  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
18448913 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccagaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 18449012  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
18449013 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcgcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 18449112  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
18449113 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 18449212  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18449213 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 18449312  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
18449313 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatatacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 18449412  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
18449413 tgagatagtcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 18449512  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
18449513 aaattcattcccattttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 18449612  T
931 actt 934  Q
    ||||    
18449613 actt 18449616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 251853 - 252654
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
251853 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 251949  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
251950 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 252049  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
252050 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 252149  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||    
252150 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattaaaca 252249  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
252250 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 252349  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
252350 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 252449  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
252450 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 252549  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
252550 tcaaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 252648  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
252649 acactt 252654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 849803 - 849002
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
849803 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 849707  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
849706 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 849607  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
849606 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 849507  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||    
849506 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattaaaca 849407  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
849406 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 849307  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
849306 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 849207  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
849206 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 849107  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
849106 tcaaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 849008  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
849007 acactt 849002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 19417821 - 19418597
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
19417821 aaaaattcttcttctgataaaacttcaaaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 19417920  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19417921 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 19418019  T
358 gattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
19418020 gattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtct 19418119  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
19418120 tctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 19418219  T
557 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
19418220 atacaatacgttaaagactgtagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 19418319  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 753  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
19418320 gcgctttttaacttgtat--gtctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaa 19418417  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19418418 gagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 19418517  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19418518 cacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19418597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 6150517 - 6151316
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-ctaaaaatt-cttcttctgataaac-cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||  |||||||||||   | ||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
6150517 ttgaattgtgttttctttttctcaatattacttcttctgataaaaacttcagaagcag--tttggttgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 6150613  T
235 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6150614 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 6150713  T
334 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
6150714 aggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 6150812  T
434 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttg 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
6150813 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 6150912  T
534 atatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta 633  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6150913 atatacaatcagtgatgttcacaatacaatgcagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta 6151012  T
634 gaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
6151013 gaatcaaattgtcagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 6151112  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
6151113 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 6151212  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
6151213 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 6151312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 9340619 - 9341390
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
9340619 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 9340715  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9340716 agacaaagacacagtcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 9340814  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9340815 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 9340914  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
9340915 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 9341014  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
9341015 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 9341114  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9341115 ttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 9341214  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
9341215 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 9341314  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9341315 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9341390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 9367763 - 9368534
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
9367763 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 9367859  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9367860 agacaaagacacagtcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 9367958  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9367959 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 9368058  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
9368059 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 9368158  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
9368159 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 9368258  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9368259 ttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 9368358  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
9368359 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 9368458  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9368459 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9368534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 44480566 - 44481337
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
44480566 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 44480662  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
44480663 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 44480761  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44480762 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 44480861  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
44480862 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 44480961  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
44480962 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 44481061  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
44481062 ttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataaacagcacgtctaaagagtcg 44481161  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
44481162 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 44481261  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44481262 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 44481337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 44491182 - 44491953
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
44491182 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 44491278  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
44491279 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 44491377  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44491378 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 44491477  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
44491478 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 44491577  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
44491578 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 44491677  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
44491678 ttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataaacagcacgtctaaagagtcg 44491777  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
44491778 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 44491877  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44491878 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 44491953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9857278 - 9856506
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
9857278 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaagga 9857182  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9857181 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 9857082  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 464  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9857081 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 9856982  T
465 tcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaata 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
9856981 tcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaata 9856882  T
565 caat-----aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
9856881 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcggtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 9856782  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9856781 ttttgaacttatgtatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 9856682  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |    
9856681 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 9856582  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
9856581 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacactt 9856506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 18157669 - 18158500
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |  ||  |    
18157669 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttaggaaag 18157768  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18157769 cttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 18157868  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
18157869 acggaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 18157968  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
18157969 -tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 18158067  T
502 a-tacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgt 599  Q
    | |||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
18158068 attacaggaaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgt 18158167  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |   |||||||||||||    
18158168 atcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtctt 18158267  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
18158268 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctg 18158366  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
18158367 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagagtggac 18158465  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18158466 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18158500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 19428396 - 19429174
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
19428396 aaaaattcttcttcggataaaacttctgaagcaatttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 19428495  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19428496 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 19428594  T
358 gattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
19428595 gattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtct 19428694  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
19428695 tctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcata 19428794  T
557 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
19428795 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 19428894  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 753  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
19428895 gcgctttttaacttgtat--gtctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaa 19428992  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19428993 gagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 19429092  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19429093 cacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19429174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 210989 - 210188
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
210989 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 210893  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
210892 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 210793  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
210792 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 210693  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||| || ||||    
210692 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagattgaattaaaca 210593  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
210592 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 210493  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
210492 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 210393  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
210392 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 210293  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
210292 tcaaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 210194  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
210193 acactt 210188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 241268 - 242069
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
241268 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 241364  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
241365 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 241464  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
241465 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 241564  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||    
241565 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattaaaca 241664  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
241665 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttaaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 241764  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
241765 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 241864  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
241865 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 241964  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
241965 tcaaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 242063  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
242064 acactt 242069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 724612 - 723811
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
724612 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 724516  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
724515 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 724416  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
724415 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 724316  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||| || ||||    
724315 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagattgaattaaaca 724216  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
724215 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 724116  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
724115 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 724016  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
724015 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 723916  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
723915 tcaaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 723817  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
723816 acactt 723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 6160472 - 6161271
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-ctaaaaatt-cttcttctgataaac-cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||  |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
6160472 ttgaattgtgttttctttttctcaatattacttcttctgataaaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgca 6160568  T
235 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6160569 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 6160668  T
334 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
6160669 aggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 6160767  T
434 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttg 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
6160768 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 6160867  T
534 atatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta 633  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6160868 atatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta 6160967  T
634 gaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
6160968 gaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 6161067  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
6161068 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 6161167  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
6161168 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggttgttgttttgttttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 6161267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 915
Target Start/End: Original strand, 43247771 - 43248553
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||||   | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
43247771 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttctgaagcag--tttgattgctcctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 43247867  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43247868 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 43247967  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
43247968 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 43248067  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
43248068 atgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 43248167  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43248168 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 43248267  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtc-tctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| || | | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
43248268 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctcttttctcaaatcttcaagccttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 43248367  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
43248368 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 43248467  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtgg 915  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
43248468 caaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtgg 43248553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 553; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 26120378 - 26121156
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
26120378 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacaaagcagagaaa 26120474  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26120475 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 26120574  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac---tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 454  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26120575 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 26120674  T
455 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttct 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
26120675 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttca 26120774  T
555 caatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt 654  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
26120775 caatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagtttt 26120874  T
655 ggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtc-taaa 753  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
26120875 ggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtcttaaa 26120974  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
26120975 gagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaatttattcccatcttgaacg 26121074  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26121075 tacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 26121156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 29086427 - 29087227
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
29086427 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 29086523  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29086524 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 29086623  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
29086624 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 29086722  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
29086723 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 29086822  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29086823 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 29086922  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
29086923 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagac 29087022  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
29087023 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 29087122  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
29087123 tcaaattccttcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 29087221  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
29087222 acactt 29087227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15792068 - 15791333
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15792068 tgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 15791970  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||    
15791969 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaa 15791870  T
400 aac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15791869 aaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 15791770  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
15791769 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatg 15791670  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| | | | ||||||||||||    
15791669 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgaatctctatctataatcttcaagtct 15791570  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
15791569 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatactcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcct 15791470  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
15791469 gatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaga 15791370  T
899 ca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15791369 cagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15791333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 16746412 - 16747246
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||   |||||     
16746412 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaa 16746511  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
16746512 tgcttccgatgaaattatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacaccagcagttattctggttccttccaca 16746610  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
16746611 aaatggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagattttactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 16746710  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
16746711 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaagactcttctgatcaaacaa 16746810  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatg 598  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
16746811 aaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatg 16746910  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagt 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||   ||||||||||    
16746911 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatatctctatctacaatcttcaagt 16747010  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||    
16747011 cttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgc 16747109  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
16747110 ctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtg 16747209  T
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16747210 gac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16747246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15781479 - 15780744
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15781479 tgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaagaacaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 15781381  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || || |||||||||||||||    
15781380 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcactataatcacaaagattgcaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaa 15781281  T
400 aac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15781280 aaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 15781181  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
15781180 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatg 15781081  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |  || ||| | | | ||||||||||||    
15781080 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagctttggcgcttttgaacttatgaatctctatctataatcttcaagtct 15780981  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
15780980 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatactcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcct 15780881  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
15780880 gatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaga 15780781  T
899 ca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15780780 cagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15780744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 911
Target Start/End: Original strand, 794623 - 795401
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
794623 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 794719  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
794720 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 794819  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
794820 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 794919  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||    
794920 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattaaaca 795019  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
795020 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttaaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 795119  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
795120 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 795219  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
795220 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 795319  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga-caaaaacagagta 911  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
795320 tcaaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagaccgaaaacagagta 795401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 515; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 18153150 - 18153980
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||   ||   |||||| |||||||||||||  |||||||||||   |  ||      
18153150 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgctttctttttctctcaaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagttttggaaa 18153249  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
18153250 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 18153348  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
18153349 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 18153448  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
18153449 a-tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 18153547  T
501 ga-tacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatg 598  Q
     | |||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18153548 aattacaggaaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttgtgaatttctaagatg 18153647  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||    
18153648 tatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtct 18153747  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
18153748 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagttg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcct 18153846  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18153847 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-att-tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 18153944  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18153945 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18153980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 164 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18769943 - 18769172
Alignment:
164 ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaa 262  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
18769943 ttctttttctgataatacttcagaagcagcttgggaatgcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaa 18769844  T
263 aacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatta 362  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
18769843 agcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcaatttcaaggagatttcaccataatcacaaagatta 18769745  T
363 caaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
     ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
18769744 aaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacagacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 18769645  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac-aaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
18769644 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 18769545  T
562 atacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgct 660  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
18769544 atgcaataaagactctagactttttaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcact 18769445  T
661 tttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgt 760  Q
    ||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||     
18769444 ttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaagagtcg- 18769346  T
761 ttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatat 860  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
18769345 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaat 18769246  T
861 tctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18769245 tctgcaggcatagctgttgtcttatcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18769172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 40214032 - 40213205
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||    
40214032 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgct 40213934  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
40213933 tctgatgtaataaccagaatcagatatgcagtggaaaagatcaaaacagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatc 40213835  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
40213834 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcagaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 40213735  T
404 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||    
40213734 gctcaagcacgcaggcaaaagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatattcaaacaaaaat 40213635  T
504 acagag-aattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtat 601  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
40213634 acagagaaaatatgtttgacttgaacacttgatatgcaatcagtggtgttcacaa-ataatgtaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtat 40213536  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtctt 699  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||    
40213535 caaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtata--tctctatcttcaatcttcaagtctt 40213438  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
40213437 cactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgagatgattagcaggtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctg 40213339  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||    
40213338 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatgactgttgtcttgtcttgtagtgtagac 40213240  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
40213239 aaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 40213205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 3842937 - 3843768
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
3842937 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgc 3843036  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
3843037 ttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 3843134  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta--taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||    
3843135 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa 3843233  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||    
3843234 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaa 3843331  T
500 agatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagat 597  Q
    |  |||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
3843332 aattacacagaaa-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagat 3843430  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaa 694  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||    
3843431 atatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaa 3843529  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||    
3843530 gtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttt 3843628  T
794 tgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagc 893  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
3843629 tgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagc 3843727  T
894 gtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3843728 gtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 3843768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Original strand, 20195697 - 20196203
Alignment:
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
20195697 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaaca 20195796  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20195797 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 20195896  T
629 ttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
20195897 ttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctctctcttcaatcttcaattcttcactcctttatatagaggcgtgaaaga 20195996  T
727 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 826  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20195997 gacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 20196096  T
827 gcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
20196097 gcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggtt 20196195  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
20196196 gtacactt 20196203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22167893 - 22167058
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||   ||| ||||||    || ||||||    
22167893 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggtttgaattgtgttttctttttctcaaaaaaattcttcttctggtatcactttagaagctggttgggagtgc 22167794  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||  ||| | ||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
22167793 ttctgatgtgatgtttagaatgagataagcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 22167696  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
22167695 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttc 22167597  T
396 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatca 494  Q
     ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
22167596 tcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatca 22167499  T
495 aacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttct 592  Q
    |||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||    
22167498 aacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttct 22167399  T
593 aagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatc 689  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |  |||    
22167398 aagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttt-tagaatcaaatttggaagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctacca-atc 22167302  T
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||     
22167301 ttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaa 22167203  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 888  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||    
22167202 tcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcaaagctgttatcttatctt 22167104  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||| |||||    ||| || |||||||||||||||||||||||    
22167103 gtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 22167058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 213 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22136619 - 22135893
Alignment:
213 aatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 310  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
22136619 aatgttcagaatcagataagcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagta 22136522  T
311 gtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||    
22136521 gtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttctcaaa--tg 22136425  T
405 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |  |    
22136424 ctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcaggcaggcgagagacttctaatcaaacagaatt 22136325  T
504 acagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtat 601  Q
    ||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||    
22136324 acacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatat 22136225  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |  ||||||||||||    
22136224 caaatcagtgcagaaattcagagtgcttt-tagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctacca-atcttcaagtct 22136128  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcc 797  Q
    |||||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
22136127 tcactcctttatatagtggtgagtagagacacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcc 22136029  T
798 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
22136028 tgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgagg 22135930  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||    ||| || |||||||||||||||||||||||    
22135929 acatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 22135893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 224 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20260363 - 20259652
Alignment:
224 tcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc 322  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
20260363 tcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaaga--aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccc 20260266  T
323 ttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgca 420  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||     
20260265 ttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcagtactcactag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcg 20260169  T
421 agagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagttt 519  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||  |||| ||||  | ||||    
20260168 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaaa-atgttt 20260070  T
520 gactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaa 617  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
20260069 gactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaa 20259970  T
618 ttcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatag 714  Q
    ||||  ||||||| || |||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
20259969 ttcaaagtgctttataaaatcaaatttggtagagttttggcgctttt-aacttgtgttaatatctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatag 20259871  T
715 aggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtc 813  Q
    ||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||    
20259870 aggtgagtaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaaaagtcgtt-gatttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtc 20259772  T
814 ctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagt 913  Q
    || ||||| || | |||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
20259771 ctatgaaggatcaactttgaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacacaaacagagtagt 20259673  T
914 ggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||    
20259672 ggaggtagtggttgtacactt 20259652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 224 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 21046993 - 21046282
Alignment:
224 tcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc 322  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
21046993 tcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaaga--aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccc 21046896  T
323 ttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgca 420  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||     
21046895 ttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcagtactcactag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcg 21046799  T
421 agagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagttt 519  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||  |||| ||||  | ||||    
21046798 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaaa-atgttt 21046700  T
520 gactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaa 617  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
21046699 gactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaa 21046600  T
618 ttcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatag 714  Q
    ||||  ||||||| || |||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
21046599 ttcaaagtgctttataaaatcaaatttggtagagttttggcgctttt-aacttgtgttaatatctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatag 21046501  T
715 aggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtc 813  Q
    ||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||    
21046500 aggtgagtaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaaaagtcgtt-gatttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtc 21046402  T
814 ctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagt 913  Q
    || ||||| || | |||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
21046401 ctatgaaggatcaactttgaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacacaaacagagtagt 21046303  T
914 ggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||    
21046302 ggaggtagtggttgtacactt 21046282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 403 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 7018954 - 7018416
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa----gagacttctgatcaaac 497  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    ||||||||| |||||||    
7018954 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgatcgagagacttctaatcaaac 7018855  T
498 aaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaag 595  Q
    | |  |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||    
7018854 ataattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaatgcaataaaaactctagacttaagaatttctaag 7018755  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttc 692  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |  ||||||    
7018754 atacatcaaatcagagcagaaattcaaattgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctacca-atcttc 7018657  T
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcc 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||     
7018656 aagtcttcactcctttatatagaggtgaatagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccaataatct 7018558  T
792 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgta 891  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
7018557 tttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcaaagctgttgtcttgtcttgta 7018459  T
892 gcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
7018458 gcgtagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7018416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 138 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13697515 - 13697185
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
13697515 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13697419  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
13697418 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttt 13697319  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
13697318 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 13697219  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13697218 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 13697185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Original strand, 9320546 - 9320851
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||    
9320546 tcttgtcttgtagcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctcttttgaagaataagcatcc 9320644  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatcc-attaaatagcttttgaagcctt 1078  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
9320645 aatgcgttcaaatcctttcaaaataattgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccaattaaacagcttttgaagcctt 9320744  T
1079 aagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
9320745 aagttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgacgtcaccactacagaag 9320844  T
1179 cactttg 1185  Q
    |||||||    
9320845 cactttg 9320851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 107 - 443
Target Start/End: Original strand, 20195395 - 20195739
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct-----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtg 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||     |||||| |||||||||||||| ||||||||| |   ||||    
20195395 atgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagaagtttgtg 20195494  T
199 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20195495 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 20195593  T
298 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 397  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |    
20195594 caaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc 20195693  T
398 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 443  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
20195694 aaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcac 20195739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 829 - 1161
Target Start/End: Original strand, 1237563 - 1237894
Alignment:
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
1237563 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttctcttgtagcagagacaacaacagagtagtggaggtagtggttg 1237661  T
928 tacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagta 1027  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| || |||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
1237662 tacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaaatatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccggtc 1237760  T
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctg 1127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
1237761 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaattgcagcttctggtaatttttggcttctg 1237860  T
1128 ataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
1237861 ataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatga 1237894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 880 - 1161
Target Start/End: Original strand, 24551251 - 24551531
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| || |||| |||||||    
24551251 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctcttt-gaagaacaagcatcc 24551349  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
24551350 aatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagcctta 24551449  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
24551450 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctggtgatttttggcttctgataaacttgcttctaatgaactcgcttatgatga 24551531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 694 - 1162
Target Start/End: Complemental strand, 15425515 - 15425046
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa-gagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||| ||||| |  |    
15425515 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcattcaccaatgat 15425418  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||||||||||| | ||||||||    
15425417 cctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtctt 15425319  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||||||| |||    
15425318 gtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gacgaataagcatccaatgccttc 15425220  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
15425219 aaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaagttgcatc 15425120  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 1162  Q
     | ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
15425119 tcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatgac 15425046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22211911 - 22211423
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtgg 548  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
22211911 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtgg 22211812  T
549 tgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttga 645  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||  ||||     
22211811 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaattagtgcagaaattcagattgcttttgagaatcaaatttgg 22211712  T
646 cagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca 742  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||| |  ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |    
22211711 cagagttttgatgctttt-aacttgtgttgatgtctctg-ctgatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattttta 22211614  T
743 gcacgtct-aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 841  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
22211613 gcacgtcttaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 22211515  T
842 ccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
22211514 ctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagggctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 22211423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 108 - 383
Target Start/End: Original strand, 23290312 - 23290593
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
23290312 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 23290411  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23290412 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 23290511  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
23290512 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaa 23290593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 45538631 - 45538348
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |    
45538631 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctct 45538532  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45538531 tt-gaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 45538433  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
45538432 acaacttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctggtgatttttggcttatgataaactcgcttctgatga 45538348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 694 - 1162
Target Start/End: Complemental strand, 15336450 - 15335981
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa-gagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  |    
15336450 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcagtcaccaatgat 15336353  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||||||||||| | ||||||||    
15336352 cctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtctt 15336254  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||||||| |||    
15336253 gtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gacgaataagcatccaatgccttc 15336155  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
15336154 aaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaagttgcatc 15336055  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 1162  Q
     | ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
15336054 tcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatgac 15335981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 694 - 1162
Target Start/End: Complemental strand, 15516819 - 15516350
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa-gagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  |    
15516819 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcagtcaccaatgat 15516722  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||||||||||| | ||||||||    
15516721 cctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtctt 15516623  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||||||| |||    
15516622 gtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gacgaataagcatccaatgccttc 15516524  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
15516523 aaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaagttgcatc 15516424  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 1162  Q
     | ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
15516423 tcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatgac 15516350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 523 - 934
Target Start/End: Original strand, 23370386 - 23370794
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23370386 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca 23370485  T
622 gtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 718  Q
      ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |  || ||||| |   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
23370486 aagtgctttatagaatcaaatttggcagagtttttgcgctttt-aacttgtgttgatatctcttttcaatcttcaagtcttcactcatttatatagaggt 23370584  T
719 gtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtccttt 817  Q
    | | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||      
23370585 gagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatctttttcctgatttgggtgtagtcctac 23370683  T
818 gaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggag 917  Q
    |||| || | |||  |||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
23370684 gaaggatcaactttgaattcattcctatcttaaaggaacat-ttctgtaggcagaggtgttgtcttgtcttgta-----gacaaaaacagagtagtggag 23370777  T
918 gtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||    
23370778 gtagtggttgtacactt 23370794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 742 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 23457530 - 23457339
Alignment:
742 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 841  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23457530 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtactcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 23457431  T
842 ccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23457430 ccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 23457339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 164; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 747 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 30325473 - 30325287
Alignment:
747 gtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatc 846  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30325473 gtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatc 30325374  T
847 ttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30325373 ttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgaggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30325287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 694 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 40845748 - 40845258
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaa-atcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |  |||   |||||||||||| ||  ||||||||  ||||| |  |    
40845748 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-gattgtcagcacattcaaaatagagtcgtttgaagat--tttgatcaatcaccaatgat 40845652  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  |||||||  |||| |||   ||||| ||||  | |||||||| || |||| | ||| ||||    
40845651 cctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatatattctcattgagaaggaacattgt-tgcaggcagagttgtttttcttctctt 40845553  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| || |||  |||||||||||| |||    
40845552 gtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttc 40845454  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||    
40845453 caatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcc-ttaaacaacttttgaagctttaagctgcatc 40845355  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
     | |||||||||  |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
40845354 tcctgatgaactatagcttctggtgagtcttagcttctgataaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 40845258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 901 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 24833210 - 24832965
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
24833210 aaaatagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcccttcaa 24833111  T
1001 aatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaat-ccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaac 1099  Q
    | ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
24833110 agtagccattgcttcactttt-cagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaac 24833012  T
1100 tgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
24833011 tgcagcttctggtgatttttagcttctaataaacttgcttctgatga 24832965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Original strand, 17797399 - 17797703
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||    
17797399 tcttgtcttatagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatcc 17797497  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||||| || | ||||||| || |||    
17797498 aatgccttcaattcctttcaaactagccgttgcatcacttttccagtcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggcttta 17797597  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagc 1179  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||    
17797598 agttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgaatttgcttctgatgacgtcaccatttcaggagc 17797697  T
1180 actttg 1185  Q
    ||||||    
17797698 actttg 17797703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23270806 - 23270531
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||  | |    
23270806 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcattttggaaat 23270707  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
23270706 gcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 23270608  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 377  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23270607 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 863 - 1162
Target Start/End: Original strand, 36105154 - 36105453
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| |    
36105154 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctct 36105253  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  | |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
36105254 tt-gaagaataaacatccaatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaa 36105352  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36105353 acagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactatagcttctggtgattttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 36105452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 159 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15999026 - 15998808
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
15999026 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctaatgaaatgatcagaatcagatatgtagcggaaaagatcaaagcagagaaa 15998927  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15998926 agaaaagcaa-gacacaagcagttattctggttccttctacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 15998828  T
358 gattacaaatgctcaatact 377  Q
    ||||||||||||||||||||    
15998827 gattacaaatgctcaatact 15998808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 693 - 1182
Target Start/End: Original strand, 19943024 - 19943516
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
19943024 aagtcttcactcctttatataacggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 19943121  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||  ||||| ||  |||||| ||||  | |||||||| ||||| || |||||||||    
19943122 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatctattccaattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctggttttcttgtctt 19943220  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||    
19943221 gtaggagagaccaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttc 19943320  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatag-cttttgaagccttaag--ttgc 1085  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||    
19943321 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgc 19943420  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
19943421 atctcctgatgaacttcagcttctagtgatctttagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttccgatgtcgtcatcacttcaggagcact 19943516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 108 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26735844 - 26735573
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | | |||| |||||||| |||   |||||||||||   ||  | ||    
26735844 tgaaggtgagaaaaacacaagaagagggggttgaattgtgttttctttttctctcaataaatacttcttcttatattacttcagaagcagtttggaaatg 26735745  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
26735744 cttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaac 26735646  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26735645 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat 26735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 694 - 1182
Target Start/End: Original strand, 22673568 - 22674056
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| || |||   ||||||||||||  | ||||||||  || || |  |     
22673568 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcatcaatgatt 22673665  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  |||||||  ||||||||   ||||| ||| ||  |||||| | ||||||| | |||||||||    
22673666 ctttgcctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaaggaaca-atgttgcaggaagagctgtttttcttgtcttg 22673764  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  |||||||||||  |||     
22673765 tagcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgtcttct 22673863  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||| ||||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||     
22673864 aatccttccaaaatagatgttgctatacttttctagtcttctgcaatctccagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaagttgcatct 22673963  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |  |||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22673964 ccggatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 22674056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 138; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 789 - 934
Target Start/End: Original strand, 1750194 - 1750339
Alignment:
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
1750194 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgttttgtctt 1750293  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1750294 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1750339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 138; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 792 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 23185489 - 23185135
Alignment:
792 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt--cttgtcttg 889  Q
    |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| || |||||| | ||||||| |  |||||||||    
23185489 tttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggaagagctgttttttcttgtcttg 23185391  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||  |||||||||||| ||||    
23185390 tagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttca 23185292  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| ||| ||||||||     
23185291 aatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttatgttgcatct 23185192  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
23185191 cctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 23185135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 132; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 268 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17519857 - 17519178
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 362  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
17519857 agacacaagcaattatactggttccttccaaaaaccggaagtagttcagttccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 17519758  T
363 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttcta 460  Q
    ||| || |||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||| ||||||||| |||| |||||||||    
17519757 caactgatcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctaaagcactaaagcaaaagacttcta 17519660  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
     |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| | ||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
17519659 -tgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 17519561  T
560 caatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagt 651  Q
    |||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  ||| |||   ||  ||  | |||| ||||||    
17519560 caatgcaattcaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgattttgtgtgaaacaaatttggcagagt 17519461  T
652 tttggcgcttttgaacttgtata--tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgt 748  Q
    || | ||||||| |||||||     |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | | ||||||    
17519460 ttggacgctttt-aacttgttgtcttgtctctg-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgt 17519363  T
749 ctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatctt 848  Q
    | | |||||||||   || |||| |||||   |||| |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||    
17519362 caatagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatctt 17519264  T
849 gaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17519263 gaaggaacat-ttctgcaggaagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 17519178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 132; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 478
Target Start/End: Original strand, 23363573 - 23363920
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||   ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
23363573 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 23363672  T
235 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||| | |  ||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
23363673 gcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaatcaattatcctagttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 23363770  T
333 aaggagattt-cact----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtct 427  Q
    |||||||||| ||||    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||| | || || |||| ||    
23363771 aaggagatttccactaaaaataatcacacagattacaaatgttcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcgcgcaggcgagagact 23363868  T
428 tccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggc 478  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
23363869 tccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 23363920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 127; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 266 - 934
Target Start/End: Original strand, 40002576 - 40003260
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaaa-ga 359  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     | | |||||||||  ||    
40002576 aaagacacaaacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagagttccattaagtttaatcacaactga 40002675  T
360 ttacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagactt 457  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
40002676 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca--aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 40002773  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    |  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
40002774 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtgatgttcaca 40002873  T
557 atacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacag 648  Q
     |||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  |||||||   ||  ||  | |||| |||    
40002874 gtacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgcttttgtgtgaaacaaatttggcag 40002973  T
649 agttttggcgcttttga-acttgtatatgtct---ctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-g 743  Q
    ||||| |||||||||   ||| ||   |||||   |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | | |    
40002974 agtttgggcgctttttttactagt---tgtctggtcacactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaag 40003070  T
744 cacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 842  Q
    ||| || | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  || |||| ||||||||| ||| |||||  |||||||||  ||||||| ||||||    
40003071 cacatcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatttggatgttgtcctaagaagaattacgttcaaatccattcc 40003168  T
843 catcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||    
40003169 tatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacagtcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 40003260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 125; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 138 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 7019255 - 7018897
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||   ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||    
7019255 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagcatcagatatgca 7019156  T
235 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
7019155 gcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccaatcccccttgcacttcc 7019058  T
333 aaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 426  Q
    |||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |    
7019057 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagac 7018961  T
427 ttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||    
7018960 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 7018897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 700 - 1185
Target Start/End: Original strand, 21932679 - 21933166
Alignment:
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |   |||||| || |||  |||||||||||||  |||||||||  ||||| |  || |||||    
21932679 cactcctttatatagagttatgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaaa--ctttgatcaatcaccaatgatcttttgc 21932776  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgt 895  Q
    ||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||||||      
21932777 ctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcag 21932875  T
896 ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattct 995  Q
     |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||| || |||| ||    
21932876 agacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctcttt-gaaaaacaagcatacaatgcctttaaatcct 21932974  T
996 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt--tgcatcccatg 1093  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || |||| || ||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| ||||||  |||||| | ||    
21932975 ttcaaaatagccgttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 21933074  T
1094 atgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
21933075 atgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgataaacttccttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 21933166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 693 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 30421792 - 30421354
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |  |||   ||||||||||||   |||||||||  ||||| |      
30421792 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacattcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatga 30421695  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    || |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| |  |||||| | ||||||| | |||||||    
30421694 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatcta-tgcaggaagagctgtttttcttgtct 30421596  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgag-gaactagcatccaatgcgt 986  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||  |  |||| |||||||||||| |    
30421595 tgttgcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaat-gtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgcct 30421497  T
987 tcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgca 1086  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||    
30421496 tcaaatccattcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttatgttgca 30421397  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
30421396 tcttctgatgaactgcagcttctggtgattttgagcttctgat 30421354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 523 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 23271655 - 23271239
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat-aaagactctagactttgaa-tttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattc 620  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||   |||||||||    
23271655 ttgaacacttgacatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctagacttaaaaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattc 23271556  T
621 agtgtgcttt--gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagag 716  Q
    |  |||||||  ||  ||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||||    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
23271555 aaagtgctttttgtgaaacaaatttgacagagtttgggcgctttt-aacttgttgtaatgtctcta-ctgatcttcaagttttcactcctttatatagag 23271458  T
717 gtgtg-aaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcc 814  Q
    ||| | | ||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||    
23271457 gtgggtagagagacgttaagatctttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagaacctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcc 23271359  T
815 tttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagt 913  Q
    | ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| |  |||||||||    
23271358 tatgaaggatcaaattcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaggcagagtagt 23271260  T
914 ggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| |||||||||||||||||    
23271259 ggaagtagtggttgtacactt 23271239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 863 - 1186
Target Start/End: Original strand, 39693494 - 39693818
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |    
39693494 tgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 39693593  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
39693594 tcaaag-aacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattga 39693692  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    | | | |||||||| |||||  ||||||| | |||||| || || |||||| |||| ||  |||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||    
39693693 acaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctacaacttctggtgatcttcagcttctgat-gacatgcttttgatgaacttgtttctgat 39693791  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||    
39693792 gacgtcatcacttcaggtgcactttga 39693818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 777 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6576712 - 6576554
Alignment:
777 atccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg 876  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||    
6576712 atccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctg 6576613  T
877 ttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6576612 ttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6576554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 166 - 324
Target Start/End: Original strand, 21547546 - 21547702
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
21547546 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 21547642  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21547643 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 21547702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 880 - 1160
Target Start/End: Original strand, 16207283 - 16207563
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||    
16207283 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatcc 16207381  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||    
16207382 aatgccttcaaatcctttcaaaatagtagttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagcttta 16207481  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 1160  Q
    ||  ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| ||| |||||| ||  |  |||||||||| |||||||||| ||||    
16207482 agtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctaat-gagatgcttctgataaacttgcttcagatg 16207563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 897 - 1159
Target Start/End: Original strand, 22663110 - 22663371
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  |||||||||||  ||| |||  ||    
22663110 gacaaaaatagagtagtggagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgtcttctaatcttt 22663208  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatg 1096  Q
     ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| | | |||    
22663209 ccaaaatagttgttgctatatttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctaatg 22663308  T
1097 aactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    |||| || |||||  |||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22663309 aactacaacttctagtgatcttcagcttctaataaacttgcttctgatgaacttgcatctgat 22663371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 460
Target Start/End: Original strand, 19460407 - 19460767
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||   ||| ||||||    || ||||||    
19460407 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaaaatcttcttctgatatcactttagaagctgtttgagagtgc 19460506  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||  ||| ||| |||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||     
19460507 ttctgatgtgatgttcaaaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcttggttcctttcacaaa 19460604  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||    
19460605 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttc 19460703  T
396 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
19460704 acaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttcta 19460767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 460
Target Start/End: Original strand, 19558085 - 19558445
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||   ||| ||||||    || ||||||    
19558085 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaaaatcttcttctgatatcactttagaagctgtttgagagtgc 19558184  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||  ||| ||| |||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||     
19558185 ttctgatgtgatgttcaaaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcttggttcctttcacaaa 19558282  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||    
19558283 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttc 19558381  T
396 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
19558382 acaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttcta 19558445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 431 - 761
Target Start/End: Original strand, 19460707 - 19461045
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||    
19460707 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 19460806  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat-aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||    
19460807 acttgatatactatcagtggtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtg 19460906  T
627 ctttgtagaatca-gtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-a 722  Q
    ||||  |||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
19460907 cttttgagaaacaagtttggcagagtttgggcactttttaacttgttgtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgta 19461005  T
723 aagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
     ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
19461006 gagagacgttgagatctttaagcacgtctaaagagtcgtt 19461045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 431 - 761
Target Start/End: Original strand, 19558385 - 19558723
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||    
19558385 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 19558484  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat-aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||    
19558485 acttgatatactatcagtggtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtg 19558584  T
627 ctttgtagaatca-gtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-a 722  Q
    ||||  |||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
19558585 cttttgagaaacaagtttggcagagtttgggcactttttaacttgttgtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgta 19558683  T
723 aagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
     ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
19558684 gagagacgttgagatctttaagcacgtctaaagagtcgtt 19558723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 898 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 23263768 - 23263483
Alignment:
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattcttt 997  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||    
23263768 acaaaaacatggtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgc-tctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttt 23263670  T
998 caaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaag-ccttaag--ttgcatcccatga 1094  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||| || |||| ||| || | | |||||||  ||||||  ||||||| | |||    
23263669 caaaatagtcattgtttcactcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctga 23263570  T
1095 tgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
23263569 tgaacttcagcttctgatgatctt--gcttctgat-gaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcgcttt 23263483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 107 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 22212230 - 22211869
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||    ||||||||| |  || ||||||    
22212230 atgaaggtgagaaaaacataagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctcagaaaattcttcttctgatatcaattcagaagctaggtgagagtgc 22212132  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||||||||     
22212131 ttctgatatgatgttcagaatcagatatgcaacggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaa 22212034  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||    
22212033 ccggaagtagtccagtcccctttgcactttcaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctc-tagtatgagacttc 22211935  T
396 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
     ||||  |||||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
22211934 ccaaa--tgctcaggcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 22211869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 694 - 1185
Target Start/End: Original strand, 43639572 - 43640055
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
43639572 agtcttcactactttatatagaggtgtgaaagagacgttgaaatg-tcagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatcatc 43639669  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| | ||||||   ||||   ||||  | |||||||| ||||||| || ||||||||    
43639670 ctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgt-tgcaggcagagctgttatccttgtcttg 43639768  T
890 tagcgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||| ||  ||  ||||| ||||||        
43639769 tagcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaaacgtaacatgtcaacgctcttt-gaaaaataagcattcaatgc---- 43639863  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
         ||||||||||||||||||    ||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||    
43639864 -----ctttcaaaatagtcgttgtcatacttttccagtcttttgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatc 43639958  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||     ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
43639959 tcatgatgaactgcatcttctggtgatacacagcttctgatgattttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttg 43640055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 23272049 - 23271689
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |  |||| |||||||||||||   |||| |||||    || ||||||    
23272049 atgaaggtgagaaaaacacaagaacggggggttgaattgtgttttctttttctcagaaaaatcttcttctgatatcacttccgaagctgtttgagagtgc 23271950  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||   ||| |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||  || |||||||||||||     
23271949 ttctgatatgatgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattaaactagttccttccacaaa 23271852  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| | |||||||||| |  | |||||||||||    
23271851 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatacta-cctagtatgagacttc 23271753  T
396 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
23271752 acaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 23271689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 693 - 1184
Target Start/End: Original strand, 16188772 - 16189263
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||| || |||  ||||||||||||  | ||||||||  |||||    |    
16188772 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcggcacatcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaacgat 16188870  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||   || || ||||| | |||||||| || |||| || |||||||    
16188871 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattaagagggaacatagt-tgcaggcagagttgttatccttgtctt 16188969  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||| |||    
16188970 gtagcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctta-gaagaataagcatccaatgccttc 16189068  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  || |||||| || ||||||||||| | | |||||||| |||||  |||||    
16189069 aaatcatttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgca 16189168  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    || | | ||||||| | ||||||| |||| ||  |||||| ||  |  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
16189169 tctcctaatgaacttcggcttctggtgatctt--gcttctaat-gagatacttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcactctaggagcacttt 16189263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Original strand, 6407703 - 6407958
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| || ||| ||||||||    
6407703 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaattagcatcc 6407801  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| |||         |||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||    
6407802 aatgccttc---------caaaatagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagcttta 6407891  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| ||||||    
6407892 agttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacaacttctgatgaacttgcttttgatga 6407958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 685 - 1013
Target Start/End: Complemental strand, 45568270 - 45567943
Alignment:
685 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccac 782  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||    
45568270 ttatctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttctgaaaac--ttgatcaatcac 45568173  T
783 cagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-c 881  Q
    || |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  ||| || |||| ||||||||||| ||||||| | |    
45568172 caatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattctgagggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttc 45568074  T
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaa 981  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||| | |  | |||||||    
45568073 ttgtcttatagcgtagacataaacagagtagtgaaggtagtggtcgtacacttcgtacagaagtactttgtcaacgc-tctttgaaggataatcatccaa 45567975  T
982 tgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgct 1013  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||    
45567974 tgccttcaaatcctttcaaattagccgttgct 45567943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 693 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 18121468 - 18121033
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  || || |  |    
18121468 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcatcaatgat 18121371  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||| ||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
18121370 cttttgactgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 18121272  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||  ||||||||| || ||| ||| || |||| |||||||||||| ||     
18121271 gtagcagagacagaaacagagtagttgaggtagtggt---acacttcgtacaattgtactttgttaatgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttt 18121176  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||| | |||||  |||||    
18121175 aaatcctttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgca 18121076  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    || | |||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||    
18121075 tctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgat 18121033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 14989643 - 14989369
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |    
14989643 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctct 14989544  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  |||||||||||| |||         |||| ||| ||||| |  ||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||    
14989543 tt-gaagaataagcatccaatgccttc---------caaattagccgttgttatacttttccaatcttcagcaatcttcagacgagtttgaatcctttaa 14989454  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
14989453 acggcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaattgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 14989369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 881 - 1146
Target Start/End: Original strand, 19156174 - 19156440
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| ||||||||    
19156174 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcca 19156272  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||   |||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||    
19156273 atgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaa 19156372  T
1081 --gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
       ||||||| | ||||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
19156373 ttcttgcatctcttgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 19156440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 693 - 1186
Target Start/End: Complemental strand, 20382756 - 20382264
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||| |||||||  |||||||||  ||||| |  |    
20382756 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcatttgaaa--ctttgatcaatcaccaatgat 20382659  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  || |||| ||||||||   || ||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||| ||||    
20382658 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttaaaatccattcccaatatgtaggaacattct-tgcaggcagagctgttattcttctctt 20382560  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    || ||   |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || ||| | |||||| | | |||    
20382559 gttgcagagacacaaactgattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaaacatccactactttc 20382461  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||  || ||| || ||||||   | |||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||  |||||    
20382460 aaatcctttcagaatagccgttgcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgca 20382361  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
20382360 tctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactttga 20382264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 918 - 1184
Target Start/End: Original strand, 33082872 - 33083136
Alignment:
918 gtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcac 1017  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
33082872 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 33082970  T
1018 ttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    | |||   | |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
33082971 tcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgat 33083070  T
1116 ttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
     ||  |||||||||  | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
33083071 ctt--gcttctgat-gagttgcttcagatgaacttgtttctaatgacgtcatcacttcaagagcacttt 33083136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 602894 - 602627
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||    
602894 tcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcc 602796  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| | || | | |||||||  |||    
602795 aatgctttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagtttta 602696  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||  ||||||  | |||||||||  |||||||  |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||    
602695 agtcttgcatttcctgatgaactttagcttcttgtgatctttagcttttgatgaacttgcttctgatga 602627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 863 - 1184
Target Start/End: Original strand, 29693274 - 29693596
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| ||||||   |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||||||| || |     
29693274 tgcaggcatagttgttatccttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagc-tc 29693372  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||  | |||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||||||    
29693373 ttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaatcctttcaaaatagtggttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaa 29693472  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    | ||  |||| ||| |||||  ||||||| | | ||||||| || ||| || |||| ||  |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
29693473 acagtctttggagctttaagtcttgcatctcctaatgaactacaacttatggtgatcttcagcttatgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgat 29693571  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
29693572 gacgtcatcacttcaggagcacttt 29693596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 881 - 1182
Target Start/End: Original strand, 24646316 - 24646617
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||   || ||  ||||||||    
24646316 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaag-aataagcatcca 24646414  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||  ||| || ||||||  ||||||||| || |||| ||| || | | |||||||| ||||    
24646415 atgcctgcaaatcctttcaaaatagctgttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaa 24646514  T
1081 gt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
     |  |||||| | |||||||||  |||||||| |||| ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24646515 ctcttgcatctcttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgataagat-gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 24646613  T
1179 cact 1182  Q
    ||||    
24646614 cact 24646617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 84; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 159 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27392207 - 27392104
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27392207 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 27392108  T
259 gaaa 262  Q
    ||||    
27392107 gaaa 27392104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 84; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 523 - 934
Target Start/End: Original strand, 29379191 - 29379609
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaaga--ctctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaa 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||    
29379191 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagattctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaa 29379290  T
618 ttcagtgtgctttgta-gaatcag--tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtata--tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatat 712  Q
    ||||  |||||||||  ||| ||   ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
29379291 ttcaaagtgctttgtgtgaaacaagatttgacagagtttgggcgctttt-aacttattttcttgtctcta-ctaatcttcaagtcttcactcctttatat 29379388  T
713 agaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtag 811  Q
    |||||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||   |||| |  ||  |||||||||||    || |    
29379389 agaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgagaaacctt-gatcaat-accaatgatctgttgcctgatttcaaagttg 29379486  T
812 tcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagt 910  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||| |||| || ||||||    
29379487 tcctatgaaggattatgttcaaatccattcctatcctgaaggaacat-ttctgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaatcagagt 29379585  T
911 agtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||||||||||||||||    
29379586 cgtggaggtagtggttgtacactt 29379609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 12758125 - 12757670
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
12758125 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 12758028  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtctt 888  Q
    | |||  ||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| ||||||||   || ||| ||||  | |||||||  ||||||| || |||||||    
12758027 cttttttctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattat-tgcaggcggagctgttatccttgtctt 12757929  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||| |||    
12757928 gtagtagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttc 12757830  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | ||| |||  |||||  |||||    
12757829 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgca 12757730  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    || | |||||||||  |||| ||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
12757729 tctcctgatgaactagagctactggtgatcttcagcttctgatcaacttgcttctgatga 12757670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 45568719 - 45568367
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 358  Q
    ||||||||| | | |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
45568719 aaagacacaggtaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 45568620  T
359 attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
45568619 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaaaagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 45568523  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||  ||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
45568522 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 45568423  T
556 aatacaatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaat 606  Q
    |||||||| ||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
45568422 aatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaat 45568367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1028 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 3598373 - 3598216
Alignment:
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctg 1127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||| |  |||||||    
3598373 ttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctg 3598274  T
1128 ataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
3598273 atgaacttgcttatgatgaccttgcttctgacgacgtcatcacttcaggagcactttg 3598216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 883 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 16681474 - 16681175
Alignment:
883 tgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaat 982  Q
    |||||||||||   |||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || ||| |||||| |||    
16681474 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtactagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatctaat 16681376  T
983 gcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag- 1081  Q
    || ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| ||||||||  ||||     
16681375 gccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagt 16681276  T
1082 -ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||  |||| ||  |||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
16681275 cttgcatctcctgatgaactttagcttctagtgatctt--gcttatgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagca 16681179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 523 - 931
Target Start/End: Original strand, 8031640 - 8032062
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaatt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||    
8031640 ttgaacacttgatatactatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctaaacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaatt 8031739  T
620 cagtgtgctttgta---------gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctt 707  Q
    ||  ||| ||| |          ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
8031740 caaagtgttttttttttttttatgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtattgtctctg-ctgatcttcaagtcttcactcctt 8031837  T
708 tatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgg 805  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   |||| |  || ||||||||||||||    
8031838 tatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcctgatttgg 8031936  T
806 gtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaaaaa 904  Q
     ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||| ||     
8031937 atgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaagcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaag 8032035  T
905 cagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
8032036 cagagtcgtggaggtagtggttgtaca 8032062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 403 - 937
Target Start/End: Original strand, 21540444 - 21540986
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | | |||||||||||  ||||||| |     
21540444 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagagacttctattcaaacagaa 21540543  T
502 atacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaag 595  Q
     |||| ||||    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||  ||||||  |||||||||||    
21540544 ttacacagaaaattgtttgagtttgaatacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctttagacttaagaatttctaag 21540643  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctc-tatcttatctt 691  Q
    || |||||||| |   |||||||||   |||||||   ||  ||  |  ||  |||||||| |||||||||    ||||   |||||| | ||| |||||    
21540644 atatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaaattagcagagtttgggcgctttttggtttgt---tgtctcgtttctgatctt 21540740  T
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  |    
21540741 caagttttcactcctttatattgagatgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgat 21540838  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| || |||||||| ||||||| | ||||||||    
21540839 cttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttatgcaggcagagctgtttttcttgtctt 21540937  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
21540938 gtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgt 21540986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 687 - 934
Target Start/End: Original strand, 28903244 - 28903490
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||| | ||||| |  |||||||   ||||    
28903244 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgctgtgaaacc--ttgatcaattacca 28903341  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 883  Q
     |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||    
28903342 atgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttctt 28903440  T
884 gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
28903441 gtcttgtagcgtagacaaaa-cagagtagtggagctagtggttgtacactt 28903490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 270 - 460
Target Start/End: Original strand, 29378961 - 29379157
Alignment:
270 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcaca-aagattac 363  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||  |||||||    
29378961 acacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacaccagattac 29379060  T
364 aaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    || ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
29379061 aactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 29379157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 907 - 1186
Target Start/End: Original strand, 17914463 - 17914742
Alignment:
907 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagt 1006  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
17914463 gagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 17914561  T
1007 cgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa--gttgcatcccatgatgaactgcag 1104  Q
     ||||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | |||||||||| ||||   ||||| | | | |||| || ||     
17914562 tgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaactcctaatgagctacaa 17914661  T
1105 cttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||||  |||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
17914662 cttctagtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcattacttcaagagcactttga 17914742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 287 - 562
Target Start/End: Original strand, 28902839 - 28903119
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tc 380  Q
    |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |    
28902839 ggttccttccacagatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacac 28902938  T
381 aaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 479  Q
      |  |||||||||    ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  | |||    
28902939 ctagcatgagactt---taaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttactcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 28903035  T
480 agagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
28903036 agagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 28903119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 863 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 17525921 - 17525600
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    |||| |||| |||||||| || |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |    
17525921 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctct 17525822  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt-a 1060  Q
    |   || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||  || |||||||| |    
17525821 tcaaag-aacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattga 17525723  T
1061 aatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 1158  Q
    |  | |||||||||  |||||  ||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||| ||  |||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||    
17525722 acaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcctgatgaactacagtttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgcttctgacgaacttgcttctga 17525626  T
1159 tgacgtc-atcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||    
17525625 tgatgtcaatcacttcaggagcactt 17525600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 897 - 1186
Target Start/End: Original strand, 17267468 - 17267754
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||||| || | ||  | |||| |||||| ||||| ||||||| |||    
17267468 gacaaaaactgagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgc-tcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaatcctt 17267566  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatga 1094  Q
    |||||||||  |||||||||||  | | || || ||||||  || |||||| ||||| ||||| || | | |||||||| |||||  ||||||| | |||    
17267567 tcaaaatagctgttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttga 17267665  T
1095 tgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
17267666 tgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgcttttgatgaacttgcttctaataacgtcatcacttcagaagcactttga 17267754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 201 - 462
Target Start/End: Original strand, 8031340 - 8031608
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| |||| |||  || ||||||| |||||||||||| | |  | |||||||| ||||  |||||||||||||    
8031340 tgcttctgatgtattgttcagaatctgatacgcagtggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--ggcacaagcaattatattggttccttccac 8031437  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgaga 391  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||    
8031438 gaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 8031537  T
392 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca-ct-aagcaagagacttctaat 462  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||   ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||    
8031538 cttcacaaa--tgctcaagcacgcagaaaagagacttcctttgctcaagcagctaaagcaagagacttctaat 8031608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 18151820 - 18151574
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || | ||||| |||  |||||||    
18151820 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgc-tctttgaagaataagcatcc 18151722  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    |||||         ||| |||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||          |||||||||| |||    
18151721 aatgc---------cttccaaattagtcgttgttatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatc----------cttttgaagcttta 18151641  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||||||||   |||||||||||| |||||| |||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
18151640 agttgcatcttctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 18151574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 968 - 1186
Target Start/End: Complemental strand, 20255652 - 20255436
Alignment:
968 gaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagct 1067  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| || |||||||| || |||     
20255652 gaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcc 20255553  T
1068 tttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtc 1165  Q
    ||||| || |||||  |||||||   | |||| ||  | |||||| |||| ||  |||||||||  |  | |||||||||||||| ||| ||||||||||    
20255552 tttgacgctttaagtcttgcatc---taatgagctttatcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatacttctgatgaacttccttatgatgacgtc 20255457  T
1166 atcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||||||||| ||||||||||    
20255456 atcacttcaggagcactttga 20255436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 270 - 1184
Target Start/End: Original strand, 21287756 - 21288659
Alignment:
270 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 362  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||    
21287756 acacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaacgagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 21287855  T
363 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||      
21287856 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagtacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcct 21287952  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| | ||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
21287953 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 21288052  T
560 caatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagt 651  Q
    |||| |||   |||||||||  ||||||  |||||||||| || |||||||| |   |||||||||   |||||||   |||  |  | |||  ||||||    
21288053 caatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaaaatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgctttaatgtaacacaattttagcagagt 21288152  T
652 tttggcgcttttgaacttgtatat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtct 750  Q
    || |||||||| ||| |||||||| |||||| |   | ||    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||   |||||| ||     
21288153 ttgggcgcttt-gaaattgtatattgtctctcttgaaactatgtgtcttcattcctttatatagaggtctgagagagacgttga-attgccagcacatca 21288250  T
751 aaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 849  Q
    | ||||||||| || ||||  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| | || |||   ||    
21288251 atagagtcgttctggaatc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgtttccaatgtg 21288348  T
850 aaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtact 948  Q
     |   ||||  | |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
21288349 cataaacattgtttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcaaagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgaact 21288448  T
949 ttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgagg 1048  Q
     |||||||||| ||| |||||   |||||||||| | ||         ||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
21288449 atgtcaacgctcttt-gaggagtaagcatccaatacatt---------tcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatctttaggcgagt 21288538  T
1049 ttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaac 1148  Q
    | || || || ||| |  ||||||| | || ||||  ||  | |||||||||||||||| || ||||              | ||  |||||||||||||    
21288539 tagagtcaatgaaacaaattttgaatctttgagttcaatttcctgatgaactgcagcttgtggtgat--------------acaca-gcttctgatgaac 21288623  T
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21288624 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 21288659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34275489 - 34275350
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
34275489 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 34275393  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacaca 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
34275392 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaca 34275350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 863 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 13430820 - 13430696
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |     
13430820 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacac-tc 13430722  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||    
13430721 tttgaagaataagcatccaatgcgtt 13430696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23580685 - 23580576
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
23580685 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgactgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 23580589  T
262 aaacaaagacaca 274  Q
    | |||||||||||    
23580588 agacaaagacaca 23580576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 880 - 1082
Target Start/End: Original strand, 17701722 - 17701923
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||| ||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||| ||||||| ||   ||||| ||||||||    
17701722 tcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaa-aggaattagcatcc 17701820  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||   | |||||||||  ||||||||| || ||| |||| || | | |||||||| |||    
17701821 aatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagcttta 17701920  T
1080 agt 1082  Q
    |||    
17701921 agt 17701923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1092 - 1185
Target Start/End: Original strand, 43774056 - 43774150
Alignment:
1092 tgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43774056 tgatgaactacagcttctggtgatacatagcttctgatgaacttgcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 43774150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 352
Target Start/End: Original strand, 12541041 - 12541118
Alignment:
275 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12541041 agcaattatcttggttccttccacaatccggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 12541118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15969618 - 15969520
Alignment:
243 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 342  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
15969618 aacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccggtcccccttgcacttccaaggagattt 15969521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 688 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 18321526 - 18321097
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| |  ||  |||||||||||||   |||||||||  |||||    
18321526 tctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacattaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcacca 18321429  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt-gtctt 883  Q
     || || |||||||||| ||| | | ||||| || || || |  ||||||| |||||| |   |||||| || | |  |||||||| |||||||  ||||    
18321428 ataatcttttgcctgatatggttcttgtcctatggaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaac-tttgttgcaggcagagctgttattctt 18321330  T
884 gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatg 983  Q
    |||||||||    |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||   ||  | |||| |||||||||||    
18321329 gtcttgtagtagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-ccttcaaagaacaagcatccaatg 18321231  T
984 cgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag-- 1081  Q
    |  |||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||   || |  ||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||      
18321230 ccctcaaatcctttgaaaatagctgttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtc 18321131  T
1082 ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
18321130 ttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgat 18321097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 403 - 563
Target Start/End: Original strand, 21298504 - 21298666
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||  | |||||||||||||  ||||||| |     
21298504 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcgagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 21298603  T
502 atacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
21298604 ttacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaat 21298666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 907 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 17441954 - 17441732
Alignment:
907 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagt 1006  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||   || ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
17441954 gagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aataagcatccaatgc-ttcaaatcctttcaaaatagt 17441857  T
1007 cgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcag 1104  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||  ||||| ||| || | |||||| || | | ||| |||| |||||  ||||||| | |||||||||  ||    
17441856 cgttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 17441757  T
1105 cttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    |||||| |||| ||  |||||||||    
17441756 cttctggtgatcttcagcttctgat 17441732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 881 - 1146
Target Start/End: Original strand, 21301000 - 21301255
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| | ||||||||   ||||||||    
21301000 cttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaggagtaagcatcca 21301098  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    ||||          ||||||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||| | || ||  | ||| |||||||||| | || |    
21301099 atgc---------atttcaaaatagccgttgccatacttttccaatcttctgcaatctttaggcgagttagagtcattgaaacagcttttgaaactttga 21301189  T
1081 gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||  ||  | ||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||    
21301190 gttcaatttcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgatga 21301255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24498857 - 24498761
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt--cactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
24498857 ttatcctggttccttccacaatccagaagtagtccagtcccccttgcatttcgaaggagattttccactataatcacacaagattacaattgctcaa 24498761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 880 - 1018
Target Start/End: Original strand, 18718978 - 18719115
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||| ||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||| ||   || ||| |||||||    
18718978 tcttgtcttttagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaag-aacaagcatcc 18719076  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcact 1018  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
18719077 aatgctttcaaatcctatcaaaatagtcgttgcttcact 18719115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Original strand, 17687372 - 17687479
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattaca 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||    
17687372 agacacaagcaattatcctggttccttacacaattcgg-agtagtcaagtctcccttgcacttccaaagagatttttcactataatcacataagattaca 17687470  T
365 aatgctcaa 373  Q
    | |||||||    
17687471 attgctcaa 17687479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 897 - 1146
Target Start/End: Original strand, 18679809 - 18680057
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| | ||  | |||| |||||||||||| ||||||| ||     
18679809 gacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgc-tcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccta 18679907  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatga 1094  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||  || || ||||||  ||||||||| ||||||||| | ||   | ||||||||  ||||  |||||||   |||    
18679908 tcaaaatagtcgttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatcttctga 18680007  T
1095 tgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||| || |||||||  |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
18680008 tgaaatgaagcttctagtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 18680057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1186
Target Start/End: Original strand, 18680029 - 18680082
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
18680029 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttga 18680082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 901 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 18722799 - 18722683
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||| ||   |  ||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
18722799 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaa-aataagcatctaatgccttcaaattctttcaa 18722701  T
1001 aatagtcgttgcttcact 1018  Q
    ||||||||||||||||||    
18722700 aatagtcgttgcttcact 18722683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 901 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 18731144 - 18731028
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||| ||   |  ||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
18731144 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaa-aataagcatctaatgccttcaaattctttcaa 18731046  T
1001 aatagtcgttgcttcact 1018  Q
    ||||||||||||||||||    
18731045 aatagtcgttgcttcact 18731028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 790 - 930
Target Start/End: Original strand, 19461051 - 19461190
Alignment:
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttg 889  Q
    |||||| |||||| || ||| ||||| ||||| || |  |||||||  ||||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
19461051 cctttgtctgattgggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatctattcctatattgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtctta 19461149  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
19461150 tagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtac 19461190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 790 - 930
Target Start/End: Original strand, 19558729 - 19558868
Alignment:
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttg 889  Q
    |||||| |||||| || ||| ||||| ||||| || |  |||||||  ||||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
19558729 cctttgtctgattgggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatctattcctatattgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtctta 19558827  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
19558828 tagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtac 19558868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 452 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19956949 - 19956838
Alignment:
452 agacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtg 550  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |  |||| |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
19956949 agacttcctatgctcaagcacgcaagcaagagacttctattcaaacataattacaaagaaatttgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtg 19956850  T
551 ttctcaatacaa 562  Q
    ||| ||||||||    
19956849 ttcacaatacaa 19956838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1011 - 1183
Target Start/End: Original strand, 22745594 - 22745767
Alignment:
1011 gcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt--tgcatcccatgatgaactgcagcttc 1108  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| ||||||  |||||| | |||||||||  ||||||    
22745594 gcttcacacttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttc 22745693  T
1109 tgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    || |||| ||  ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
22745694 tggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcatcacttcatgagcactt 22745767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 1210405 - 1210243
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc-ta-atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||  | |||| |||||||| | |||||||    
1210405 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatatgctcaagcacagaagcaaaagacttctaaacaaacaa 1210306  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |  |||| ||||  | |||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
1210305 aattacacagaaagatgtttggtttggacacttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaa 1210243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15934463 - 15934381
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
15934463 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15934381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 19942770 - 19942884
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtg 547  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||| | |||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
19942770 caagagacttctaatggtcaagcacaactgcaagagacttataatcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggtgaacacttgatatacaatcagtg 19942869  T
548 gtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||| ||||||||    
19942870 gtgttcacaatacaa 19942884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 1745368 - 1745417
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
1745368 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttg 1745417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15934277 - 15934132
Alignment:
419 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagt 517  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||    ||    
15934277 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacaaaattacaaagaaaattgt 15934178  T
518 ttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
15934177 ttgaggttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 15934132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 18151599 - 18151550
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
18151599 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 18151550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 901 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 18685550 - 18685434
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||| | ||  |  ||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
18685550 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgc-tcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaa 18685452  T
1001 aatagtcgttgcttcact 1018  Q
    |||||| |||||||||||    
18685451 aatagttgttgcttcact 18685434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 373
Target Start/End: Original strand, 24634749 - 24634847
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca---aagattacaaatgctcaa 373  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
24634749 ttatccaggtcccttccacaacccagaagtagtccagtctcccttgcccttccaaggagatttttcactataatcacacacaagattacaaattctcaa 24634847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18152295 - 18152148
Alignment:
419 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaa 515  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||        
18152295 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaatg 18152196  T
516 gtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
18152195 gtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 18152148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 488
Target Start/End: Original strand, 21298332 - 21298560
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 358  Q
    |||||||||  || |||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
21298332 aaagacacagacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 21298431  T
359 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||  |||||| | ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
21298432 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctacagcacaaaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 21298528  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
    ||   ||||||||||| || ||||||||||||    
21298529 tcctttgctcaagcacacaagcaagagacttc 21298560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 23800829 - 23800988
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||  |||||||| ||   |  || |||    
23800829 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttttgataacacttcagaaacaggttacgaatgc 23800928  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaa 262  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||    
23800929 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcgaaataaaatagagcagagaaaagaaa 23800988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 734
Target Start/End: Original strand, 12193697 - 12193744
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
12193697 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgttga 12193744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 734
Target Start/End: Original strand, 12438125 - 12438172
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
12438125 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgttga 12438172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14990681 - 14990563
Alignment:
447 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatc 543  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||  |||||||||  |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||    
14990681 gcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttatgaattcaaacaaaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatc 14990582  T
544 agtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||| ||||||||    
14990581 agtggtgttcacaatacaa 14990563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1104 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 15336007 - 15335931
Alignment:
1104 gcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
15336007 gcttctgatgacttt--gcttctgatgaccttgcttctgatcaccttgcttctgatgacgtcatcatttcagaagcact 15335931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1104 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 15425072 - 15424996
Alignment:
1104 gcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
15425072 gcttctgatgacttt--gcttctgatgaccttgcttctgatcaccttgcttctgatgacgtcatcatttcagaagcact 15424996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1104 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 15516376 - 15516300
Alignment:
1104 gcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
15516376 gcttctgatgacttt--gcttctgatgaccttgcttctgatcaccttgcttctgatgacgtcatcatttcagaagcact 15516300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 17917187 - 17917141
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17917187 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttg 17917141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 449 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18321773 - 18321659
Alignment:
449 aagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
18321773 aagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacataattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 18321674  T
548 gtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||| ||||||||    
18321673 gtgttcacaatacaa 18321659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 18557805 - 18557851
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
18557805 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 18557851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 19942585 - 19942667
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
19942585 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19942667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 29692846 - 29692963
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |  |||||||||  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
29692846 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 29692945  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
29692946 gtggtgttcacaatacaa 29692963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 567
Target Start/End: Original strand, 33052374 - 33052531
Alignment:
410 gcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacaga 508  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||   | ||||||||||||| | ||||||||  || | |    
33052374 gcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcaaaaatgcaagagacttctaaacaaacaaat-tataca 33052472  T
509 gaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa 567  Q
    ||| | ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
33052473 gaaatcagtttggattgaacatttgatgtacaatcagtggtgttcacaatacaaaacaa 33052531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 45539055 - 45538938
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
45539055 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 45538956  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
45538955 gtggtgttcacaatacaa 45538938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 13430570 - 13430521
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
13430570 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttg 13430521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 14989394 - 14989345
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
14989394 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactttaggagcactttg 14989345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 733
Target Start/End: Original strand, 17267258 - 17267303
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17267258 tctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 17267303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 19706874 - 19706947
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
19706874 aagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19706947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 559
Target Start/End: Original strand, 26832425 - 26832722
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa---gatt 361  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  | | |   ||||    
26832425 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaacaggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaagaaaatatctgatt 26832524  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaat---atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagactt 457  Q
    |||| |||||| | |||  ||| |   | ||||||||   ||||| ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
26832525 acaactgctcactgcta--aaactagcaagagacttc---aaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaagtcaagagactt 26832619  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    |  |||||||||||     |||||||||||||  ||||||| |  |||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
26832620 cctatgctcaagcaaaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtggtgttcaca 26832719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Original strand, 1744640 - 1744802
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaa 499  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| ||||||| ||     ||||||||||||| |  ||||||||    
1744640 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcatgaacataatcaagagacttctattgctcaatcaaaactgcaagagacttctcaattcaaacaa 1744739  T
500 agatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |  |||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
1744740 aattacaaagaat-atgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 1744802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 1744947 - 1744987
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1744947 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 1744987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 6407516 - 6407556
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6407516 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 6407556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 13430989 - 13430949
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13430989 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 13430949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14990099 - 14989952
Alignment:
419 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaa 515  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||        
14990099 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctattgatcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaatt 14990000  T
516 gtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14989999 gtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14989952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 14990422 - 14990382
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14990422 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 14990382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 18152007 - 18151967
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18152007 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 18151967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 19956700 - 19956660
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19956700 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 19956660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 20255873 - 20255833
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20255873 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 20255833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 22461999 - 22461959
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22461999 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 22461959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 22673149 - 22673233
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22673149 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22673233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 23263974 - 23263934
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23263974 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 23263934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #191
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23433693 - 23433607
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 373  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
23433693 tggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-tcccttgcacttccaagg-gatttcactataataacacatgattacaaatgctcaa 23433607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #192
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24679189 - 24679101
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
24679189 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatctggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24679101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #193
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 33082653 - 33082693
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33082653 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 33082693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #194
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 865 - 1036
Target Start/End: Original strand, 43644857 - 43645028
Alignment:
865 caggcatagctgttgtct-tgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttt 963  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| ||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||| | ||    
43644857 caggcatagttgttatctctgtcctgtagcagagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgc-tctt 43644955  T
964 tgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
      | |||| |||||||||||| ||||||||| ||  || ||| |||| ||||||| |||  || |||||||||    
43644956 caaagaacaagcatccaatgccttcaaattcatttgaattagccgtttcttcactcttctggtcttctgcaat 43645028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #195
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1169
Target Start/End: Complemental strand, 45567818 - 45567770
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
45567818 gcttctgatagacttgcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatca 45567770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #196
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1193
Target Start/End: Original strand, 1750528 - 1750590
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
1750528 cttgcttctgatgatcttctgcttctgatgacttcatcacttcagaagcactctgaacttcag 1750590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #197
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20383139 - 20383060
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 344  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
20383139 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagacttca 20383060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #198
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 22135709 - 22135647
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
22135709 cttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 22135647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #199
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16376114 - 16376048
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
16376114 ggtttcttccacaaaccggaagtagtcatgacccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatca 16376048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #200
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 17796954 - 17797070
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||  |  |||||  ||||||||||||||||||||||    
17796954 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacaaaattaca-agaaaaatatttgaggttgaacacttgatatacaatca 17797052  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    | ||||||| ||||||||    
17797053 gcggtgttcacaatacaa 17797070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #201
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 19153407 - 19153464
Alignment:
289 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
19153407 ttccttccacaa-actgaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19153464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #202
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19957139 - 19957053
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 351  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
19957139 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagccctatcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaat 19957053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #203
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 22166857 - 22166796
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
22166857 ttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 22166796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #204
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 937
Target Start/End: Original strand, 25163859 - 25164104
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||| || ||  |||||||||||||   |||||||||  || || |  |    
25163859 aagtcgtcactcctttatatagaggtgtgaaagagacattgtaaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcatcaatgat 25163956  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt-gtcttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |   |||||| |||| |  |||||||||| |||||  |||||||||    
25163957 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacat-tgttgcaggcataactgttattcttgtctt 25164055  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    |||||   |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
25164056 gtagcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgt 25164104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #205
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 43773491 - 43773553
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
43773491 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 43773553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #206
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1141 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 602647 - 602606
Alignment:
1141 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
602647 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 602606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #207
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1210471 - 1210399
Alignment:
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 373  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
1210471 cggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgattacaaatgctcaa 1210399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #208
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Original strand, 17687473 - 17687631
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc-tgatcaaacaaa 500  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||   |||||||||| |||  |||| |||||||  | |||||||||||| | | ||||||||    
17687473 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcatacaagcaagagatttcctatgcccaagcacaaaagcaagagacttcctaaacaaacaaa 17687572  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
      |||| ||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17687573 t-tacaaagaat-aagtttgg-ttgagaacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 17687631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #209
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19225366 - 19225418
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19225366 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19225418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #210
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 730
Target Start/End: Original strand, 19707296 - 19707333
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19707296 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 19707333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #211
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 427 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22462275 - 22462138
Alignment:
427 ttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-tt 524  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||| |   ||||||||||||  | ||||| |  |||| |||| || ||||||  ||    
22462275 ttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcatatgctcaagcacacctacaagagacttctatttaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggtt 22462176  T
525 gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
22462175 gaacacttgatatacaatcagtggtgttcaccatacaa 22462138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #212
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 6318380 - 6318330
Alignment:
1136 gcttctgatgaa---cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6318380 gcttctgatgaaaaccttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 6318330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #213
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 558
Target Start/End: Original strand, 12541134 - 12541289
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||| | || |||| |||| ||| ||||||||| | || |||| | |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||  | ||||||||     
12541134 tgctcaagcacaaaagctagagacttcaaatactcaagcacaatagaaagatatttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttcaaaacaaacaaat 12541233  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
     |||| | || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
12541234 -tacacaaaaataagtttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 12541289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #214
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 15780556 - 15780505
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
15780556 ttgcttctgatgaccttttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 15780505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #215
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 15791145 - 15791094
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
15791145 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 15791094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #216
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16681665 - 16681625
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
16681665 aagtcttgactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 16681625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #217
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 18449804 - 18449855
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
18449804 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 18449855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #218
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 18679603 - 18679643
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
18679603 aagtcttcagtcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18679643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #219
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 18685758 - 18685718
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
18685758 aagtcttcacccctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18685718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #220
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 18731352 - 18731312
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
18731352 aagtcttcacccctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18731312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #221
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19129164 - 19129215
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19129164 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19129215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #222
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19139714 - 19139765
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19139714 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19139765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #223
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 19156031 - 19156071
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19156031 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 19156071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #224
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19707735 - 19707783
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
19707735 tgcttctaatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactt 19707783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #225
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 22662436 - 22662520
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||  || |||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22662436 aaagacacaagcagtttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22662520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #226
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1183
Target Start/End: Original strand, 23783729 - 23783812
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
23783729 agcttctgatgaaatcttgcttctgatgaactttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 23783812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #227
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 24551064 - 24551104
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
24551064 agtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttga 24551104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #228
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 26111666 - 26111717
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
26111666 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 26111717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #229
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 26121344 - 26121395
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
26121344 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 26121395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #230
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 43248751 - 43248802
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
43248751 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 43248802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #231
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 45292625 - 45292665
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
45292625 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttga 45292665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #232
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 12193524 - 12193563
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12193524 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 12193563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #233
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 12437952 - 12437991
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12437952 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 12437991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #234
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13431160 - 13431121
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13431160 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13431121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #235
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 17701352 - 17701391
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17701352 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 17701391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #236
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Original strand, 17701530 - 17701569
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
17701530 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 17701569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #237
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Original strand, 17797211 - 17797250
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
17797211 agtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 17797250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #238
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 17928664 - 17928703
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17928664 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 17928703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #239
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Original strand, 18557421 - 18557487
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
18557421 tggtttcttccacaatccggaagtagtccactcccc-ttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18557487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #240
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 19707119 - 19707158
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19707119 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 19707158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #241
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 897 - 1036
Target Start/End: Original strand, 19707500 - 19707638
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||  | |||| | ||| |||||| ||||||||| |    
19707500 gacacaaactgagtagaggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacg-ttcttcaaagaacaaccattcaatgccttcaaattcat 19707598  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    |  || ||| |||||||||||| |||  || |||||||||    
19707599 ttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaat 19707638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #242
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20382933 - 20382894
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
20382933 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 20382894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #243
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 21932492 - 21932531
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21932492 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21932531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #244
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 23469271 - 23469228
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
23469271 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttaagcttcag 23469228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #245
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 568
Target Start/End: Original strand, 24634858 - 24634974
Alignment:
449 aagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtgg 548  Q
    ||||||||||  ||||||||||||    |||||| |||||| | ||||||||  |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
24634858 aagagacttcctatgctcaagcacaatagcaagatacttcttaacaaacaaat-tacaaagaat-aagtttgg-ttgaacacttgatatacaattagtgg 24634954  T
549 tgttctcaatacaatacaat 568  Q
    ||||| |||||||| |||||    
24634955 tgttcacaatacaaaacaat 24634974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #246
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 25163682 - 25163721
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
25163682 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 25163721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #247
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 365
Target Start/End: Original strand, 27739279 - 27739374
Alignment:
274 aagcagttatcctggttcc-ttccacaacacggaagtagtccagt-cccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaa 365  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
27739279 aagcaattatcctggttcctttccacaattcggaagtagttcagtccccccttgcagtttcaaagagattttcactataatcacataagattacaa 27739374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #248
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 30422180 - 30422117
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 349  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
30422180 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactata 30422117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #249
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 31215466 - 31215516
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
31215466 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 31215516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #250
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 33560833 - 33560699
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |  ||||||| |  ||||  |||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
33560833 caagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatca 33560734  T
545 gtggtgttctcaatacaataca-ataaagactcta 578  Q
    ||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||    
33560733 gtgatgttcacaatacaaatcagataaagactcta 33560699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #251
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 40845927 - 40845888
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
40845927 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 40845888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #252
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 43639392 - 43639431
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
43639392 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 43639431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #253
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 43644269 - 43644328
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||    
43644269 gttccttccacaatccggaagtagtcctgccccccttgcaattccaaggagagttcacta 43644328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #254
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 43644507 - 43644546
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
43644507 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 43644546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #255
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 43773730 - 43773769
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
43773730 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 43773769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #256
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 45292445 - 45292484
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
45292445 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 45292484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #257
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 562
Target Start/End: Original strand, 2810340 - 2810458
Alignment:
446 agcaagagacttctaa-tgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatc 543  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||    |||||||| || | |||||||| |  |||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||     
2810340 agcaagagacttcaaactgctcaagcacaactgcaagagagttataatcaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatt 2810439  T
544 agtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||| ||||||||    
2810440 agtggtgttcacaatacaa 2810458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #258
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 6576385 - 6576351
Alignment:
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6576385 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 6576351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #259
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 12541421 - 12541467
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
12541421 atcttcaagtcttctttcctttatatagaggtgtgaaagaggcgttg 12541467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #260
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 355
Target Start/End: Original strand, 13644660 - 13644728
Alignment:
285 ctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 355  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
13644660 ctggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-ccgcttgcactttcaagg-gatttcactataatcaca 13644728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #261
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 355
Target Start/End: Original strand, 13745085 - 13745153
Alignment:
285 ctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 355  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
13745085 ctggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-ccgcttgcactttcaagg-gatttcactataatcaca 13745153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #262
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 694 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 14989811 - 14989773
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
14989811 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgtt 14989773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #263
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 353
Target Start/End: Original strand, 17928475 - 17928525
Alignment:
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
17928475 cggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 17928525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #264
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1184
Target Start/End: Original strand, 18154205 - 18154239
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18154205 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 18154239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #265
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 460 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19506040 - 19505938
Alignment:
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||| ||| || | ||||||||||| | ||||||||  |||| ||||  | |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
19506040 aatgctcaaacacacaagtaagagacttctaaacaaacaaaattacatagaaagatgtttggtttaaacatttgatatacaatcagtggtgttcacaata 19505941  T
560 caa 562  Q
    |||    
19505940 caa 19505938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #266
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1131 - 1169
Target Start/End: Original strand, 21541186 - 21541224
Alignment:
1131 aacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
21541186 aacttgcttctgatgaactcgcttctgatgacgtcatca 21541224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #267
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 694 - 728
Target Start/End: Original strand, 22662906 - 22662940
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22662906 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 22662940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #268
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 408 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 24679024 - 24678970
Alignment:
408 aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc-actaagcaagagacttctaa 461  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||    
24679024 aagcacacacgcaagagtcttcctatgctcaagcaaaaaagcaagagacttctaa 24678970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #269
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 30422050 - 30421934
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    || |||||||||| |  |||||||||  |||| ||||  | ||||||  | ||||||||||||||||||||    
30422050 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcgagagacttctaaattcaaacaaaattacaaagaaa-atgtttgaggtcgaacacttgatatacaatca 30421952  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
30421951 gtggtgttcacaatacaa 30421934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #270
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 918 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 33560360 - 33560295
Alignment:
918 gtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgc 984  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
33560360 gtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgc-tctttgaagaattagcatccaatgc 33560295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #271
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33560994 - 33560932
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
33560994 ggttccttgcacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 33560932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #272
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14990257 - 14990196
Alignment:
289 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 349  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
14990257 ttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactata 14990196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #273
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 16436908 - 16436856
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
16436908 cttgcttctgatgatcttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 16436856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #274
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 553
Target Start/End: Original strand, 17879237 - 17879274
Alignment:
516 gtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
17879237 gtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 17879274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #275
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 18121725 - 18121618
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  |||||||||  |||  ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
18121725 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacaaaattact-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 18121627  T
545 gtggtgttc 553  Q
    |||||||||    
18121626 gtggtgttc 18121618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #276
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1177
Target Start/End: Original strand, 18719203 - 18719244
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
18719203 gcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 18719244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #277
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 18772050 - 18772123
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
18772050 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccagaagtagtcctgtccccctcgcacttccaaggagagttcacta 18772123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #278
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19418784 - 19418836
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19418784 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 19418836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #279
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19429361 - 19429413
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19429361 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 19429413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #280
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1148 - 1185
Target Start/End: Original strand, 22663375 - 22663412
Alignment:
1148 cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
22663375 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 22663412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #281
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 23185160 - 23185111
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||    
23185160 gcttctgatgaacttgcttctgatgacatcactacttcaggagcactttg 23185111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #282
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23192545 - 23192484
Alignment:
292 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
23192545 cttccacaattcggaagtagtcctgtcccccttgcctttccaaggagaattcactaaaatca 23192484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #283
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 23269721 - 23269688
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23269721 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 23269688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #284
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 25163429 - 25163502
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
25163429 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagacttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 25163502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #285
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 25850659 - 25850494
Alignment:
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||  ||  |||||| ||||  || |||||||||  | ||||||| ||||| | |||||    
25850659 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcataaacacaagagtcttcctatactcaagcacaaaagcaagagtcttctaaacaaac 25850560  T
498 aaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    | |  |||| | || || ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
25850559 acaattacacaaaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaataagtggtgttcacaatacaa 25850494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #286
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 688 - 733
Target Start/End: Original strand, 26832821 - 26832866
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
26832821 tcttcaggtctttagtcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 26832866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #287
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 901 - 934
Target Start/End: Original strand, 26833034 - 26833067
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26833034 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 26833067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #288
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 29692683 - 29692744
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
29692683 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 29692744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #289
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1148 - 1185
Target Start/End: Original strand, 36105454 - 36105491
Alignment:
1148 cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
36105454 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 36105491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #290
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40846163 - 40846106
Alignment:
292 cttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
40846163 cttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 40846106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #291
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Original strand, 43639155 - 43639215
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
43639155 gttccttccacaact-ggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 43639215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #292
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45539215 - 45539155
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
45539215 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagatttcacta 45539155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #293
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 688 - 724
Target Start/End: Original strand, 2810593 - 2810629
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 724  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
2810593 tcttcaagtattcactcctttatatagaggtgtgaaa 2810629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #294
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 3221066 - 3221117
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
3221066 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 3221117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #295
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15336867 - 15336807
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
15336867 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15336807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #296
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15425932 - 15425872
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
15425932 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15425872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #297
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15517236 - 15517176
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
15517236 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15517176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #298
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 16206620 - 16206703
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
16206620 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctg-cccccttgcacttccaaggagagttcactat 16206703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #299
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1186
Target Start/End: Complemental strand, 17441727 - 17441691
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
17441727 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttga 17441691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #300
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 17442359 - 17442319
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
17442359 ttgaacacttgatacacaatcagtggtgttcacaatacaat 17442319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #301
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18121887 - 18121827
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
18121887 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 18121827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #302
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 399 - 498
Target Start/End: Original strand, 18557517 - 18557617
Alignment:
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| ||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||    
18557517 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgttcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaac 18557616  T
498 a 498  Q
    |    
18557617 a 18557617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #303
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 563
Target Start/End: Original strand, 18679425 - 18679465
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
18679425 ttgaacacttgatatacaatgagtggtgttcacaatacaat 18679465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #304
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 563
Target Start/End: Original strand, 18718614 - 18718654
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
18718614 ttgaacacttgatatacaatgagtggtgttcacaatacaat 18718654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #305
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 562
Target Start/End: Original strand, 22662619 - 22662766
Alignment:
419 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaa 515  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||||| |||  ||||||| |  |||| ||||        
22662619 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctattactcaagcacaaatgcaagagacttttgaattcaaacagaattacaaagaaaatt 22662718  T
516 gtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
22662719 gtttgaagttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 22662766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #306
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 687 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 25850371 - 25850323
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 735  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
25850371 atcttcaagttttcactcctttatatagaaatgtgaaagatacgttgag 25850323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #307
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 45538800 - 45538760
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
45538800 agtcttcaatcctttatatagagatgtgaaagagacgttga 45538760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #308
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 734
Target Start/End: Original strand, 9320364 - 9320399
Alignment:
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
9320364 tcactcctttatatagaggtgagaaagagacgttga 9320399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #309
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15336628 - 15336589
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
15336628 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaaaatacaa 15336589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #310
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15425693 - 15425654
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
15425693 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaaaatacaa 15425654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #311
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15516997 - 15516958
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
15516997 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaaaatacaa 15516958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #312
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 16206908 - 16206947
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
16206908 ttgaacacttgatatacaatcagtggttttcacaatacaa 16206947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #313
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Original strand, 16207095 - 16207134
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
16207095 agtcttcagtcctttatatagaggtgtgaaagtgacgttg 16207134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #314
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17526272 - 17526233
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
17526272 ttgaacacttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaa 17526233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #315
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 373
Target Start/End: Original strand, 17879066 - 17879161
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag-gagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |  ||||| |||| ||  |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
17879066 ttatcctggttccttccacaatccggaagtaatccagtccccttgtcacttacaagagatttttcataataatcacacaagattacaattgctcaa 17879161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #316
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1174
Target Start/End: Complemental strand, 18730895 - 18730856
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
18730895 tgcttctgatcaacttgcttctgatgacgtcatcatttca 18730856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #317
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 18768966 - 18768916
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
18768966 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 18768916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #318
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 18772303 - 18772342
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
18772303 ttgaacacttgatatacaatcagcggtgttcacaatacaa 18772342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #319
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 19155854 - 19155893
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
19155854 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgctcacaatacaa 19155893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #320
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20256291 - 20256232
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
20256291 gttccttccacaaaccggaaatagtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcacta 20256232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #321
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 22211238 - 22211176
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaacttg--cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
22211238 cttgcttctgatgaacttctacttctgatgacgtcatcatttcagaggcacttgaaacttcag 22211176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #322
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 23264165 - 23264126
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
23264165 ttgagcacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 23264126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #323
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1193
Target Start/End: Original strand, 23380772 - 23380815
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
23380772 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 23380815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #324
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 23457115 - 23457072
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
23457115 tgcttctgataacgtcatcacttcagaagcactttaagcttcag 23457072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #325
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24498649 - 24498610
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
24498649 ttgaacacttgatatataatcagtggtgttcacaatacaa 24498610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #326
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 558
Target Start/End: Original strand, 24645942 - 24645977
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24645942 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 24645977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #327
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25850767 - 25850708
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
25850767 gttccttccacaatccggaagttgtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 25850708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #328
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 27739493 - 27739532
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
27739493 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgatcacaatacaa 27739532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #329
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 562
Target Start/End: Original strand, 36104811 - 36104846
Alignment:
527 acacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
36104811 acacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 36104846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #330
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 39693145 - 39693184
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
39693145 ttgaacacttgatatacaatcattggtgttcacaatacaa 39693184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #331
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12758538 - 12758456
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||   ||||||| |||||||    
12758538 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactgttaaggagagttcacta 12758456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #332
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 729
Target Start/End: Original strand, 17687759 - 17687801
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
17687759 atcttcaagtcttcattcctttatatagagatatgaaagagac 17687801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #333
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 452
Target Start/End: Original strand, 17879155 - 17879205
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaaga 452  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
17879155 tgctcaagcacacaagcaagagactttcaatgctcaagcacataagcaaga 17879205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #334
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 18679163 - 18679245
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
18679163 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacatccaaggacagttcacta 18679245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #335
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 18718352 - 18718434
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
18718352 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacatccaaggacagttcacta 18718434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #336
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 695 - 733
Target Start/End: Original strand, 18772478 - 18772516
Alignment:
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
18772478 gtcttcactcctttatatggaggtgtaaaagagacgttg 18772516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #337
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19506141 - 19506063
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 344  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||  |||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||    
19506141 aaagacacaagcaattatacaggttacttcgacaatccggaagtagtcatgttccacttgcacttccaaggagagttca 19506063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #338
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 19956256 - 19956222
Alignment:
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
19956256 ttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 19956222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #339
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 553
Target Start/End: Original strand, 22707941 - 22707971
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
22707941 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 22707971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #340
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Original strand, 23370995 - 23371056
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
23370995 ttgcttctgatgatcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcatttgaaacttcag 23371056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #341
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1151 - 1185
Target Start/End: Original strand, 24551536 - 24551570
Alignment:
1151 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
24551536 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 24551570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #342
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 39692907 - 39692969
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
39692907 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagtagagttcactat 39692969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #343
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 902 - 958
Target Start/End: Original strand, 1745158 - 1745215
Alignment:
902 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttcgttcaaacgtactttgtcaacgc 958  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||    
1745158 aaacagagtagtggaagtagttgttgtacactttcgtacagacgtactatgtcaacgc 1745215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #344
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Original strand, 3833174 - 3833234
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
3833174 tgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgtaacttcag 3833234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #345
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 3843952 - 3844004
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
3843952 cttgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 3844004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #346
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 354
Target Start/End: Original strand, 5825261 - 5825328
Alignment:
285 ctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 354  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||    
5825261 ctggttccttccacaacacatgagtagtccagt-cccctttcactttc-aggggatttcactataatcac 5825328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #347
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 688 - 733
Target Start/End: Original strand, 15598532 - 15598577
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
15598532 tcttcaagtcttcaatcctttatatagaggtagaaaagagacgttg 15598577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #348
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 16747469 - 16747502
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16747469 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 16747502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #349
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 345
Target Start/End: Original strand, 17796783 - 17796852
Alignment:
277 cagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 345  Q
    ||||||| | |||| |||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
17796783 cagttatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 17796852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #350
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1174
Target Start/End: Complemental strand, 18685328 - 18685291
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
18685328 cttctgatcaacttgcttctgatgacgtcatcatttca 18685291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #351
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 20161058 - 20161025
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20161058 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 20161025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #352
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 20196409 - 20196442
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20196409 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 20196442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #353
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 20259468 - 20259416
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
20259468 cttgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 20259416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #354
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 21046098 - 21046046
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
21046098 cttgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 21046046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #355
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 489
Target Start/End: Original strand, 28888788 - 28888873
Alignment:
405 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 489  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |  | |||||||||| || | |||||||| || |||||| ||||||    
28888788 ctcaagcacacatgcaagagacttccaatgctcaatcacaactgaaagagacttccaacgatcaagcacacaagcaagatacttct 28888873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #356
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 30325122 - 30325089
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
30325122 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 30325089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 646; Significance: 0; HSPs: 454)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 646; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 14746583 - 14745750
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
14746583 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaat-cttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 14746486  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14746485 gcttctgatgaaatgatcagaattagttatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 14746386  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
14746385 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 14746286  T
401 actgctcaa-gcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14746285 aatgctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 14746186  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatg 598  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
14746185 aaatacagagaattgagttttacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatg 14746086  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |   ||||||||||||    
14746085 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctgtctacaatcttcaagtct 14745986  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
14745985 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcct 14745886  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14745885 gatttgggtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 14745786  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
14745785 caaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 14745750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 624; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 5684938 - 5685738
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
5684938 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5685034  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5685035 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5685134  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
5685135 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagatttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 5685234  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
5685235 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcacaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 5685334  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5685335 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 5685434  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5685435 tagaatcaatttgacagagttttggtgcttttgaacttgtatatctctatctcatatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 5685534  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
5685535 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 5685634  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
5685635 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 5685734  T
931 actt 934  Q
    ||||    
5685735 actt 5685738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 622; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 20989073 - 20989872
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||| ||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
20989073 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaatacttcttctgacaaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgc 20989169  T
234 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20989170 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 20989269  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
20989270 aaggagatttcactataatcacaaagattacagatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 20989369  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacactt 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
20989370 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 20989469  T
533 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 632  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20989470 gatatacaatcagtgatgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 20989569  T
633 agaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
20989570 agaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatattcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 20989669  T
733 gagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttca 832  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
20989670 gagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgcagtcctttgaagaataagcttca 20989769  T
833 aattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
20989770 aattcattcccatcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 20989869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 616; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 9432683 - 9433483
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
9432683 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttaagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9432779  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9432780 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9432879  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
9432880 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9432979  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
9432980 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 9433079  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9433080 tgatattcaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 9433179  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9433180 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 9433279  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
9433280 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 9433379  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
9433380 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 9433479  T
931 actt 934  Q
    ||||    
9433480 actt 9433483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 616; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 21003889 - 21003089
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
21003889 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 21003793  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21003792 cagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21003693  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
21003692 caaggagatttcactataataacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 21003593  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
21003592 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 21003493  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21003492 tgatatacaatcagtgatgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 21003393  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
21003392 tagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatattcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggtgtgaaagagacgt 21003293  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
21003292 tgagataatcagcacgtctaaagattcgtttgaaatccattgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 21003193  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
21003192 aaattcattcccatcttgaaggtagaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 21003093  T
931 actt 934  Q
    ||||    
21003092 actt 21003089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 600; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 9443279 - 9444079
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
9443279 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcataagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9443375  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
9443376 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtacagtcccccttgcacttc 9443475  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
9443476 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9443575  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
9443576 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggaaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 9443675  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9443676 tgatattcaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 9443775  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
9443776 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgt 9443875  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
9443876 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 9443975  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
9443976 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaacacagagtagtggaggtagtggttgtac 9444075  T
931 actt 934  Q
    ||||    
9444076 actt 9444079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 600; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15889211 - 15888410
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
15889211 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcaaaatcagatatg 15889112  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
15889111 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 15889013  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15889012 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 15888913  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||    
15888912 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaattagtttgacttgaacact 15888813  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15888812 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 15888713  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
15888712 gtagaatcaatttgacagagttttggcgctttttaacttg--tgtgtctctatctactatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagaga 15888615  T
729 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 828  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15888614 cgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 15888515  T
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
15888514 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 15888416  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
15888415 acactt 15888410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Original strand, 3165185 - 3165953
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
3165185 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 3165283  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3165284 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 3165383  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 464  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
3165384 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgc 3165483  T
465 tcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaata 564  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
3165484 tcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaata 3165583  T
565 caataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 663  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
3165584 caattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttt 3165683  T
664 gaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 763  Q
     ||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
3165684 taacttgtgtatgtctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttg 3165783  T
764 aaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 863  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
3165784 aaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattct 3165883  T
864 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3165884 gcagacatacctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 3165953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 594; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 11004567 - 11005404
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa----ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||    | |||||||||||||| |||||||||||   || |    
11004567 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaaatccttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag 11004666  T
199 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11004667 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcaacggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 11004766  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
11004767 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcaca 11004865  T
399 aaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaa 496  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
11004866 aaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 11004965  T
497 caaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaaga 596  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
11004966 caaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaaga 11005065  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagt 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
11005066 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatatctctgttttatcttcaagt 11005165  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
11005166 cttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgc 11005265  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
11005266 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgta 11005365  T
897 gaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11005366 gacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11005404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 1367014 - 1367848
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaa-cacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaatt-cttcttctgataaac-cttcagaagcaaactgtga 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||   |||||    
1367014 tgaaggtgagaaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaaacttcagaagcagtttgtga 1367113  T
200 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
1367114 atgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccac 1367212  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 398  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
1367213 aaaatggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctca 1367312  T
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
1367313 aaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaaca 1367412  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagat 597  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
1367413 aaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagat 1367512  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||||    
1367513 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtc 1367612  T
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcc 797  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
1367613 ttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcc 1367712  T
798 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1367713 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 1367812  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1367813 ac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1367848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 1986982 - 1987760
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1986982 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 1987081  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
1987082 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-g 1987180  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1987181 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 1987280  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
1987281 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 1987380  T
557 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
1987381 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 1987480  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1987481 cgcttttgaacttgcgtatattcctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 1987580  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 855  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
1987581 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 1987680  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1987681 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1987760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 1997603 - 1998381
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1997603 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 1997702  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
1997703 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-g 1997801  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1997802 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 1997901  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
1997902 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 1998001  T
557 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
1998002 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 1998101  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1998102 cgcttttgaacttgcgtatattcctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 1998201  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 855  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
1998202 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 1998301  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1998302 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1998381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31117393 - 31116592
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
31117393 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 31117294  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
31117293 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 31117195  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
31117194 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 31117095  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
31117094 atgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 31116995  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
31116994 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 31116895  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
31116894 gtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaactagtgtatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 31116795  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
31116794 ttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 31116696  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31116695 caaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 31116596  T
931 actt 934  Q
    ||||    
31116595 actt 31116592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 42865211 - 42866047
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || |||    
42865211 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagag 42865310  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42865311 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 42865410  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
42865411 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 42865509  T
401 act--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
42865510 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 42865609  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
42865610 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatg 42865709  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
42865710 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgcgtatattcctattttatcttcaagtct 42865809  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||    
42865810 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcct 42865909  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
42865910 gatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtag 42866009  T
898 aca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42866010 acagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 42866047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 585; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 20490394 - 20491225
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||  || |||||||||||   ||||||||    
20490394 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtg 20490493  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
20490494 cttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 20490592  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
20490593 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 20490692  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
20490693 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 20490792  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
20490793 atacaatgaattaagtttgactcgaacacttgatatacaatcagtggggttcacaatacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgta 20490892  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||     ||||||||||||||    
20490893 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatgtctcactgcacaatcttcaagtcttc 20490992  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
20490993 actcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctga 20491092  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
20491093 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcatcttgaaggcacaaattttgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac- 20491191  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
20491192 aaaacagagtagtggaggtagtgattgtacactt 20491225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 585; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 42875895 - 42876673
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42875895 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 42875994  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
42875995 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-g 42876093  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42876094 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 42876193  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
42876194 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 42876293  T
557 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
42876294 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 42876393  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42876394 cgcttttgaacttgcgtatattcctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 42876493  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 855  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
42876494 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 42876593  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42876594 caacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 42876673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 37343645 - 37344419
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
37343645 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 37343741  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
37343742 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagatttcactataatcacaaa 37343841  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37343842 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 37343941  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
37343942 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 37344041  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
37344042 tacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 37344141  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37344142 gcttttgaacttatgtatctctctcttttatcttcaagtcttcacacctttatataagggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 37344241  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
37344242 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcttttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtaca 37344341  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37344342 aattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 37344419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6868106 - 6867306
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt----ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
6868106 ttgaattgtgttttctttttctcctaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 6868010  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6868009 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaggacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 6867910  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
6867909 caaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 6867810  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
6867809 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 6867710  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6867709 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 6867610  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
6867609 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 6867510  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
6867509 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaattctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 6867410  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
6867409 aaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 6867310  T
931 actt 934  Q
    ||||    
6867309 actt 6867306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 26700535 - 26699735
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
26700535 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 26700439  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26700438 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaggacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 26700339  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
26700338 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 26700239  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
26700238 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 26700139  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26700138 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 26700039  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
26700038 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 26699939  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
26699938 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 26699839  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
26699838 aaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 26699739  T
931 actt 934  Q
    ||||    
26699738 actt 26699735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 48711372 - 48710572
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
48711372 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 48711276  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48711275 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 48711176  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
48711175 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 48711076  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
48711075 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 48710976  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48710975 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 48710876  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
48710875 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 48710776  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
48710775 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 48710676  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
48710675 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 48710576  T
931 actt 934  Q
    ||||    
48710575 actt 48710572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 9084733 - 9085502
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
9084733 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 9084829  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9084830 agacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 9084929  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 461  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9084930 acaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 9085029  T
462 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
9085030 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatgca 9085129  T
562 atacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctt 661  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
9085130 atacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctt 9085229  T
662 ttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    |||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9085230 ttgaacttatgtatctctctctgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 9085329  T
762 tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatatt 861  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |||    
9085330 tgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-att 9085428  T
862 ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9085429 ctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9085502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 9094447 - 9095216
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
9094447 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 9094543  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9094544 agacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 9094643  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 461  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9094644 acaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 9094743  T
462 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
9094744 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatgca 9094843  T
562 atacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctt 661  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
9094844 atacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctt 9094943  T
662 ttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    |||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9094944 ttgaacttatgtatctctctctgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 9095043  T
762 tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatatt 861  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |||    
9095044 tgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-att 9095142  T
862 ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9095143 ctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9095216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 8002981 - 8002145
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||   || |||    
8002981 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttcagataaaacttcagaagcagtttgagag 8002882  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8002881 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 8002782  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||     
8002781 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaac 8002683  T
401 act--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
8002682 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 8002583  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
8002582 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatg 8002483  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||    
8002482 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctatcaaatcttcaagtct 8002383  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
8002382 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcct 8002283  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
8002282 gatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtag 8002183  T
898 aca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8002182 acagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 8002145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 8013626 - 8012790
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||   || |||    
8013626 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttcagataaaacttcagaagcagtttgagag 8013527  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8013526 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 8013427  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||     
8013426 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaac 8013328  T
401 act--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
8013327 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 8013228  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
8013227 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatg 8013128  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||    
8013127 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctatcaaatcttcaagtct 8013028  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
8013027 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcct 8012928  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
8012927 gatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtag 8012828  T
898 aca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8012827 acagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 8012790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6878738 - 6877938
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt----ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
6878738 ttgaattgtgttttctttttctcctaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 6878642  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6878641 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaggacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 6878542  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
6878541 caaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 6878442  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
6878441 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 6878342  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6878341 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 6878242  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
6878241 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 6878142  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
6878141 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaattctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 6878042  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
6878041 aaattcattcccaacttgaatgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 6877942  T
931 actt 934  Q
    ||||    
6877941 actt 6877938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 26654206 - 26653406
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
26654206 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 26654110  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26654109 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaggacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 26654010  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
26654009 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 26653910  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
26653909 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 26653810  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26653809 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 26653710  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
26653709 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatatatctctatcttttatcttcaagtcttcacttctttatatagaggcgtgaaagagacgt 26653610  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
26653609 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 26653510  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
26653509 aaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 26653410  T
931 actt 934  Q
    ||||    
26653409 actt 26653406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 8627366 - 8628168
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
8627366 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 8627462  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8627463 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 8627562  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
8627563 caaggagatttcactataatcacaaagattacatactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 8627662  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
8627663 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 8627762  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8627763 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 8627862  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 727  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
8627863 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact--tatgtatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagag 8627960  T
728 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattag 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
8627961 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataag 8628060  T
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
8628061 cttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggtt 8628160  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
8628161 gtacactt 8628168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 24931485 - 24930684
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
24931485 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24931389  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24931388 cagcggaaaagaacagaacagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24931289  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
24931288 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacaagcaagagtcttcc 24931189  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
24931188 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacac 24931089  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24931088 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 24930989  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24930988 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 24930889  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24930888 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 24930789  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
24930788 caaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 24930689  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
24930688 cactt 24930684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 468462 - 467662
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
468462 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 468366  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
468365 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttc 468266  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
468265 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 468166  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
468165 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 468066  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
468065 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 467966  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
467965 tagaatcaaattgacagagttttggtgcttttgaacttatgtatctctatttttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 467866  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
467865 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 467766  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
467765 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 467666  T
931 actt 934  Q
    ||||    
467665 actt 467662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 40042991 - 40042190
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
40042991 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40042895  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40042894 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 40042795  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
40042794 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 40042695  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
40042694 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 40042595  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40042594 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 40042495  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
40042494 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagac 40042395  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
40042394 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 40042295  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
40042294 tcaaattccttcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 40042196  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
40042195 acactt 40042190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 40053540 - 40052739
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
40053540 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40053444  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40053443 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 40053344  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
40053343 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 40053244  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
40053243 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 40053144  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40053143 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 40053044  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
40053043 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagac 40052944  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
40052943 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 40052844  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
40052843 tcaaattccttcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 40052745  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
40052744 acactt 40052739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 22099157 - 22099957
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
22099157 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22099253  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22099254 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22099353  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
22099354 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacgcatgcaagagtcttcca 22099453  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
22099454 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22099553  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22099554 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 22099653  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
22099654 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 22099753  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22099754 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 22099853  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22099854 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggttgtcgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 22099953  T
931 actt 934  Q
    ||||    
22099954 actt 22099957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 565; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 21770855 - 21770024
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || || ||    
21770855 tgaaggtaagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatg 21770756  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||     
21770755 cttctgatgaaataatcagaatcaggtatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gatacaagcagttatcctggttccttccacaaa 21770657  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
21770656 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 21770557  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
21770556 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 21770457  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
21770456 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatata 21770357  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |   |||||||||||||     
21770356 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttt 21770257  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
21770256 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctga 21770157  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
21770156 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggac- 21770058  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21770057 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21770024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 22088542 - 22089342
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
22088542 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22088638  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22088639 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22088738  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
22088739 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcatgcatgcaagagtcttcca 22088838  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
22088839 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22088938  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22088939 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 22089038  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
22089039 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 22089138  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22089139 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 22089238  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22089239 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatgactgtcgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 22089338  T
931 actt 934  Q
    ||||    
22089339 actt 22089342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 9169573 - 9170403
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||    
9169573 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtg 9169672  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa-cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
9169673 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaanatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaancagttatcctggttccttccacaaa 9169771  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||    
9169772 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 9169871  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
9169872 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaa 9169971  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
9169972 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgataaacaatcagtggtgttcacaatataatacgttaaagactctagacttttaaatttctaagatgta 9170071  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||    
9170072 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctctttc-aatcttcaagtcgtc 9170170  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
9170171 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcangtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcntttgcctga 9170270  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
9170271 tttgggtgtagtccttttaagaattagcttnaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtnttgtcttgtagcgtagac- 9170369  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9170370 agaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9170403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17961607 - 17960805
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| || ||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
17961607 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatactccttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 17961511  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17961510 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17961411  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
17961410 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 17961311  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
17961310 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 17961211  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17961210 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 17961111  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
17961110 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgtctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 17961011  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
17961010 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagct 17960911  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
17960910 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcatagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 17960811  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
17960810 acactt 17960805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 26294911 - 26294110
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
26294911 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 26294815  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26294814 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 26294715  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
26294714 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 26294615  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
26294614 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 26294515  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26294514 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 26294415  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26294414 gtagaatcaaattgacagagttttggcacttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 26294315  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
26294314 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatacaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaactt 26294215  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
26294214 caaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 26294115  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
26294114 cactt 26294110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 588630 - 589431
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||   |||||||||||   || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
588630 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 588729  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
588730 cagcggaaatgatcaaagcatagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 588828  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
588829 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 588928  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
588929 atgttcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaattatgtttgacttgaacact 589028  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
589029 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgttaaagactctaaacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 589128  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
589129 gtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 589228  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
589229 ttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcaatcaccagtgatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 589328  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
589329 caaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcctagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 589427  T
931 actt 934  Q
    ||||    
589428 actt 589431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 931
Target Start/End: Original strand, 24734170 - 24734969
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaa--aattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
24734170 ttgaattgtgttttctttttctctaaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24734266  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24734267 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24734366  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
24734367 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 24734466  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
24734467 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 24734566  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24734567 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 24734666  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
24734667 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagac 24734766  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
24734767 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 24734866  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
24734867 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 24734966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 931
Target Start/End: Original strand, 24744117 - 24744916
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaa--aattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
24744117 ttgaattgtgttttctttttctctaaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24744213  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24744214 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24744313  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
24744314 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 24744413  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
24744414 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 24744513  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24744514 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 24744613  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
24744614 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagac 24744713  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
24744714 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 24744813  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
24744814 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 24744913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17951001 - 17950199
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
17951001 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcaaaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 17950905  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17950904 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17950805  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
17950804 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 17950705  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
17950704 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 17950605  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17950604 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 17950505  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
17950504 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgtctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 17950405  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
17950404 gttgcgataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagct 17950305  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
17950304 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 17950205  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
17950204 acactt 17950199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 26390953 - 26390177
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
26390953 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 26390857  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26390856 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 26390757  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26390756 gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 26390657  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
26390656 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 26390557  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
26390556 aatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 26390457  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26390456 gcgcttttaaacttatgtatctctatctgaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 26390357  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |    
26390356 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgaattgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgta 26390257  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26390256 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 26390177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 26401595 - 26400819
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
26401595 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 26401499  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26401498 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 26401399  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26401398 gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 26401299  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
26401298 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 26401199  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
26401198 aatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 26401099  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26401098 gcgcttttaaacttatgtatctctatctgaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 26400999  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |    
26400998 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgaattgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgta 26400899  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26400898 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 26400819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 8616804 - 8617605
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
8616804 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 8616900  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
8616901 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccagaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 8617000  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
8617001 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttcc 8617100  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
8617101 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaatcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 8617200  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8617201 ttgatatacaatcagtagtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 8617300  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
8617301 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 8617400  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
8617401 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 8617500  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
8617501 caaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 8617600  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
8617601 cactt 8617605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 2706469 - 2705693
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
2706469 aaaaatacttcttctgataaaacttcataagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 2706373  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2706372 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 2706273  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2706272 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 2706173  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
2706172 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 2706073  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
2706072 aatacaaaacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 2705973  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||||||||| | ||  ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2705972 gcgcttttgaacttatgtacctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 2705873  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |    
2705872 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgta 2705773  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2705772 caaattctgcaggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2705693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 4222029 - 4222829
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 235  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
4222029 ttgaattgtgttttctttttctcaatattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtccgat-tgcag 4222125  T
236 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4222126 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcccggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4222225  T
335 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
4222226 ggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 4222324  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacactt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
4222325 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 4222424  T
533 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 632  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4222425 gatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 4222524  T
633 agaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact--tgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
4222525 agaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctatatgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 4222624  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
4222625 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 4222724  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
4222725 caaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 4222824  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
4222825 cactt 4222829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 167 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 2717065 - 2716297
Alignment:
167 ttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaac 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
2717065 ttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagac 2716969  T
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2716968 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 2716869  T
366 atgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 463  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
2716868 ctgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatggtcaagcactaagcaagagacttctaatg 2716769  T
464 ctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
2716768 ctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaaa 2716669  T
564 acaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 663  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
2716668 acagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttt 2716569  T
664 gaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 763  Q
    |||||| | ||  ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2716568 gaacttatgtacctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 2716469  T
764 aaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 863  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||    
2716468 aaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctcatcttgagtgtacaaattct 2716369  T
864 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2716368 gcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2716297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 9159174 - 9159948
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
9159174 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 9159273  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9159274 agaaaagcaa-gacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 9159372  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
9159373 gattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaggctt 9159472  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
9159473 ctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgataaacaatcagtggtgttcacaa 9159572  T
558 tacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    || |||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
9159573 tataatacgttaaagactctagacttttaaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 9159672  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
9159673 cgctttttaacttgtatatctctctttc-aatcttcaagtcgtcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagag 9159771  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 856  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
9159772 tcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagctttaaattcattcccatcttgaaggcac 9159871  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9159872 aaattctgcaggcatagctgttgttttgtcttgtagcgtagac-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9159948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Original strand, 30048970 - 30049738
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||     
30048970 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaag 30049069  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30049070 caa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacgaaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 30049168  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 464  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
30049169 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgc 30049268  T
465 tcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaata 564  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
30049269 tcaagcacgcatgcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaata 30049368  T
565 caataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 663  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
30049369 caataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttt 30049468  T
664 gaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 763  Q
     ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
30049469 taacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaagcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttg 30049567  T
764 aaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 863  Q
    |  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
30049568 agttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaatgaacat-ttct 30049666  T
864 gcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30049667 gcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30049738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 166314 - 167101
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
166314 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 166410  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
166411 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 166510  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
166511 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 166610  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
166611 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 166710  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||    
166711 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatc-------------aattcagtgtgctttg 166797  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
166798 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 166897  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
166898 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttc 166997  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
166998 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 167097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 176906 - 177693
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
176906 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 177002  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
177003 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 177102  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
177103 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 177202  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
177203 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 177302  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||    
177303 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatc-------------aattcagtgtgctttg 177389  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
177390 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 177489  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
177490 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttc 177589  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
177590 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 177689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 40055666 - 40054835
Alignment:
106 aatgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
40055666 aatgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaataattcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 40055567  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
40055566 cttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 40055468  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
40055467 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 40055368  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
40055367 atgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaa 40055268  T
502 atacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc-aatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatg 598  Q
    ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
40055267 atacacagaa-aaagtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatg 40055169  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||    
40055168 tatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctatgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtct 40055069  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
40055068 tcactcccttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcct 40054970  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
40054969 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttatgcaggcatggttgttgtcttgtcttgtagcgtaga 40054871  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40054870 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 40054835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 18440584 - 18441415
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||   |  || |||    
18440584 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgc 18440682  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
18440683 ttctgatgtgatgttcagaattagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 18440780  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||    
18440781 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa 18440880  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||     
18440881 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacag 18440978  T
500 agatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagat 597  Q
    | ||||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
18440979 aaatacacagaaagt-gtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagat 18441077  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaa 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||  |  ||||||||    
18441078 gtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatttctcttgccaatcttcaa 18441176  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtccttt 794  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||    
18441177 gtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatctttt 18441276  T
795 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcg 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
18441277 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcg 18441375  T
895 tggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18441376 tagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18441415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 386 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 455429 - 454880
Alignment:
386 atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagac 485  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
455429 atgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaaaagac 455330  T
486 ttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttg 585  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
455329 ttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaaaaaagactctagactttg 455230  T
586 aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct 685  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| | | |    
455229 aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggtgcttttgaacttatgtatctctattttt 455130  T
686 tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccag 785  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
455129 aatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttaagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccag 455030  T
786 tagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgt 885  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
455029 tgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgt 454930  T
886 cttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
454929 cttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 454880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 38404124 - 38403331
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |  || |||    
38404124 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaagttaggaatgc 38404025  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
38404024 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacatagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 38403927  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
38403926 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 38403827  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    | | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||    
38403826 a-tactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaa 38403728  T
500 agatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagat 597  Q
    ||||||||| ||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
38403727 agatacaga-aaaaatgtttgattttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagat 38403629  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgt----atatgtctctatcttatcttc 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||    |||| ||| | | | ||||||    
38403628 gtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttttaacttgtgttgatatctctttttttaatcttc 38403529  T
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcct 792  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |    
38403528 aagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatctt 38403430  T
793 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtag 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
38403429 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtag 38403331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 406 - 934
Target Start/End: Original strand, 11095744 - 11096274
Alignment:
406 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatac 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||    
11095744 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttataatgctcaagcacgcaggcgagagacttgtaatcaaacaaaaatac 11095843  T
506 agagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaa 605  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
11095844 agagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctggactttgaatttctaagatgtatcaaa 11095943  T
606 tcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactc 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||    
11095944 tcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctcacttttatcttcaagtcttcactc 11096043  T
705 ctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttg 804  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
11096044 ctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttg 11096143  T
805 ggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaa 903  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
11096144 ggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaa 11096243  T
904 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
11096244 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11096274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Original strand, 44280209 - 44280715
Alignment:
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
44280209 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaaca 44280308  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44280309 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 44280408  T
629 ttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
44280409 ttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctctctcttcaatcttcaattcttcactcctttatatagaggcgtgaaaga 44280508  T
727 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 826  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44280509 gacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 44280608  T
827 gcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
44280609 gcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggtt 44280707  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
44280708 gtacactt 44280715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 26210460 - 26209629
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
26210460 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 26210361  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
26210360 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaaagaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 26210263  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||    
26210262 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattcccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa 26210164  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||    
26210163 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggggagagactactattcaaacaa 26210066  T
500 agatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagat 597  Q
    |  |||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
26210065 aattacacagaaa-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttataagat 26209967  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaa 694  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||  ||||||||    
26209966 atatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttgacagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctttccaatcttcaa 26209868  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctt 793  Q
     |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||    
26209867 atctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttt 26209769  T
794 tgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagc 893  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
26209768 tgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagc 26209670  T
894 gtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
26209669 gtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 26209629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 181 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 3477175 - 3476421
Alignment:
181 cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag 279  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||     
3477175 cttcagaagctagttgggagggcttcttatgtaatgcacagaatcagatatgtagcggaataaaacagagtagagaaaagaaaga--aagacacaagcaa 3477078  T
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatact 377  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
3477077 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatact 3476978  T
378 atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcag 476  Q
     || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
3476977 ctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgcttaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 3476881  T
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactc 576  Q
    || |||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
3476880 gcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagcggtgttcacaatacaatgcaataaagactc 3476781  T
577 tagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat- 673  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |     
3476780 tagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttagcgctttt-aacttgtgtt 3476682  T
674 -atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctt 771  Q
     |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||    
3476681 gatgtctcttttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctt 3476583  T
772 tgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcat 871  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||     
3476582 tgatcatccaccattaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcag 3476484  T
872 agctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3476483 agctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 3476421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 280 - 934
Target Start/End: Original strand, 18418677 - 18419334
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatact 377  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
18418677 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatact 18418776  T
378 atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcag 476  Q
     ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
18418777 ctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 18418874  T
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagact 575  Q
    || |||| ||||| |||||||| | ||||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
18418875 gcgagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaaagt-gtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagact 18418973  T
576 ctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat 673  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
18418974 ctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgt 18419072  T
674 --atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctt 771  Q
      || |||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||||    
18419073 tgatttctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtttgagttcctt 18419172  T
772 tgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcat 871  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |     
18419173 tgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggaag 18419271  T
872 agctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18419272 agctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18419334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Original strand, 540798 - 541304
Alignment:
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaga-tacagagaattaagtttgacttgaac 528  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
540798 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgacttgaac 540897  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
540898 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 540997  T
629 ttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
540998 ttgtagattcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggcgtaaaagaga 541097  T
729 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 828  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
541098 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagc 541197  T
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
541198 ttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttg 541297  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
541298 tacactt 541304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 13681739 - 13682540
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||   |||||||||| |  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
13681739 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaattcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgc 13681838  T
234 agcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||     
13681839 agcagaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagacccc-ttgcacttcg 13681935  T
333 aaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||    
13681936 aaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcc 13682032  T
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaac 528  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||  |||  | ||||||| || |||    
13682033 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacaccgaa-aatgtttgactttaaac 13682131  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgc 627  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
13682132 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 13682231  T
628 tttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgt----atatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg- 721  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||    || |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |     
13682232 tttatagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatctgtctcta-ccaatcttcaagtcttcactcctttaaatagtggtgagt 13682329  T
722 aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaag 821  Q
    | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||    
13682330 agagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatattttgcctgatttgggtgtagtcttgtgaag 13682428  T
822 aattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtag 921  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
13682429 gattaacttcaaattcattcccattttgaaggaacat-ttctgcaggaatagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtag 13682527  T
922 tggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||    
13682528 tggttgtacactt 13682540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 15215735 - 15216536
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    ||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||| ||   |||||||||| |  || || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
15215735 ttgaattttgttttctttttctcaaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctagttgggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 15215834  T
235 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
15215835 gcggaataaaacagagtagagaaaagaaaga--aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 15215932  T
334 aggaga-tttcact--ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||    
15215933 aggagattttaactaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcc 15216029  T
431 aatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa--gatacagagaattaagtttgac-ttga 526  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||   ||||||| |||   ||||||| ||||    
15216030 aatgctaaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctattcaaacaaaattatacagaaaat---gtttgactttga 15216126  T
527 acacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgt 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
15216127 acacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 15216226  T
626 gctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg- 721  Q
    ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  || | ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
15216227 gctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatttgtcttttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagt 15216325  T
722 aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaag 821  Q
    | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||      
15216326 agagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcattcaccagtaatctattgcctgatttgggtgtagtcctatgaca 15216424  T
822 aattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtag 921  Q
     || | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
15216425 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaacagagtagtggaggtag 15216523  T
922 tggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||    
15216524 tggttgtacactt 15216536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Original strand, 4211724 - 4212230
Alignment:
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
4211724 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 4211822  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4211823 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 4211922  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 727  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
4211923 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctatatgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagag 4212022  T
728 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattag 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
4212023 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataag 4212122  T
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
4212123 cttcaaattcatttccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggtt 4212222  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
4212223 gtacactt 4212230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 141 - 934
Target Start/End: Original strand, 29589414 - 29590212
Alignment:
141 aattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcg 237  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||   ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
29589414 aattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctagtatcacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcg 29589513  T
238 gaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagga 337  Q
    |||  || |   ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29589514 gaataaaaa---cagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagga 29589608  T
338 gatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||| ||||     |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||    
29589609 gatttccactaagaaataatcacacagatcacaaatgctcaatactatctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcca 29589705  T
432 atgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaaca 529  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||| |||||    
29589706 atgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaaca 29589805  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
29589806 cttgatatacaataagtggtgttcacattacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgct 29589905  T
629 ttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaa 724  Q
    || ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |    
29589906 ttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatatctcttacaaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtaga 29590004  T
725 gagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 824  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
29590005 gagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcatatgaaggat 29590103  T
825 tagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 924  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
29590104 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtgg 29590202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12734980 - 12734247
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
12734980 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagccgaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccac 12734883  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||     
12734882 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttct 12734784  T
397 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaa 495  Q
    ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||||    
12734783 caaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagattcttctaaggctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaa 12734686  T
496 acaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttcta 593  Q
    |||||| |||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
12734685 acaaagttacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgagaatttcta 12734587  T
594 agatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttc 692  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||  |  ||||||    
12734586 agatgtatcaaataagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttggcagagtgttggcgctttt-aacttgttgatgtctcttgccaatcttc 12734488  T
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcc 791  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | | | ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||     
12734487 aagtcttcactcctttatatagtggtaagtagaaagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatct 12734389  T
792 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgta 891  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
12734388 cttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaatttattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagttgttgtcttgtcttata 12734290  T
892 gcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
12734289 gcgtagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacactt 12734247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 181 - 821
Target Start/End: Original strand, 48381651 - 48382297
Alignment:
181 cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag 279  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||     
48381651 cttcagaagctagttgagagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaa 48381748  T
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 377  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
48381749 ttatcctagttcctttcacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatact 48381848  T
378 atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcag 476  Q
     || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
48381849 ctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 48381947  T
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagact 575  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||| ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
48381948 gcaagaggcttctaatcaaacagaattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaagact 48382046  T
576 ctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca---gtttgacagagttttggcgcttttgaacttgt 671  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||| |||||||    
48382047 ctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttttggcagagttttggcgctttt-aacttgt 48382145  T
672 at--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 768  Q
     |  ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||  ||    
48382146 gttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcatgtctaaagagtcg-ttgagttc 48382244  T
769 ctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaag 821  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
48382245 ctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaag 48382297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 284; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 108 - 782
Target Start/End: Original strand, 8932954 - 8933631
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
8932954 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggg--ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 8933051  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
8933052 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 8933149  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||    
8933150 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa 8933248  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
8933249 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaa 8933346  T
500 agatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagat 597  Q
    |  |||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
8933347 aattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagat 8933445  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaag 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||  |  |||||||||    
8933446 gtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaattggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatatctcttgccaatcttcaag 8933544  T
696 tcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccac 782  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
8933545 tcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccac 8933631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 264; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 591 - 934
Target Start/End: Original strand, 9170863 - 9171204
Alignment:
591 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatct 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
9170863 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctctttca-atct 9170961  T
691 tcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
9170962 tcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcatgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatc 9171061  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt 890  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9171062 ctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt 9171161  T
891 agcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9171162 agcgtagac-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9171204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 138 - 459
Target Start/End: Original strand, 540532 - 540857
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
540532 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 540628  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
540629 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 540728  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
540729 caaggagatttcgctataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 540828  T
432 atgctcaagcac-taagcaagagacttct 459  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||    
540829 atgctcaagcacgcaggcaagagacttct 540857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 138 - 462
Target Start/End: Original strand, 4211460 - 4211785
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 235  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| ||   | ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
4211460 ttgaattgtgttttctttttctcaatattacttcttctgataaaacttcagaatcag--tttgattgtttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 4211556  T
236 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4211557 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4211656  T
335 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
4211657 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 4211755  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
4211756 tgctcaagcactaagcaagagacttctaat 4211785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 108 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 17064442 - 17064021
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaa-cacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||   |  |||||    
17064442 tgaaggtgagaaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctagaaaattcttcttctgaaaatactttagaagcaggttaggagtg 17064343  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
17064342 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 17064245  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
17064244 acggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 17064145  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||    
17064144 a-tgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaa 17064046  T
500 agatacagagaattaagtttgactt 524  Q
    | ||||||||||  | |||||||||    
17064045 aaatacagagaaaaatgtttgactt 17064021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 107 - 443
Target Start/End: Original strand, 44279907 - 44280251
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct-----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtg 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||     |||||| |||||||||||||| ||||||||| |   ||||    
44279907 atgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagaagtttgtg 44280006  T
199 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44280007 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 44280105  T
298 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 397  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |    
44280106 caaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc 44280205  T
398 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 443  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
44280206 aaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcac 44280251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 863 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 12174535 - 12174216
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
12174535 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaa-cagagtactaaaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctct 12174437  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaat-ccatta 1060  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
12174436 tttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccataa 12174337  T
1061 aatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 1160  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
12174336 aacagcttttgaag-cttaagttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttttgatg 12174238  T
1161 acgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
12174237 acgtcatcacttcaggagcact 12174216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 431 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 38594298 - 38593935
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgact-tgaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||  ||||||||   |||||    
38594298 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaaaaaagtttgataatgaac 38594199  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgc 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
38594198 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtacagaaattcaatgtgc 38594099  T
628 tttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaag 725  Q
    ||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
38594098 tttttggaatcaaattgacagagtttttgcgctttttaacttgtata--tctcaatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaag 38594001  T
726 agacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcct 792  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
38594000 agacgttgagatgattagcacgtctaaagagttg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcct 38593935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 107 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19986436 - 19986159
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||    
19986436 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggaggattgaattatgttttctttttctctcttaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtatgtaag 19986337  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19986336 tgcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 19986237  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19986236 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 19986159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 863 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 35952883 - 35952560
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
35952883 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctct 35952784  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatcc-atta 1060  Q
    || || |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
35952783 tt-gatgaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttcttcaatccttagacgaggttgaatcccatta 35952685  T
1061 aatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 1160  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
35952684 aacagcttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactgcaacttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgaatttgcttctgatg 35952585  T
1161 acgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
     |||||||||||||| | |||||||    
35952584 tcgtcatcacttcaggaacactttg 35952560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 24883007 - 24882501
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||    
24883007 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 24882908  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgc 627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||    
24882907 cttgatatacaatcagcggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaattagtgcagaaattcaaagtgc 24882808  T
628 tttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa- 723  Q
    |||  |||||||  |||| |||||||| || |||||| ||||||| |  |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||  | |     
24882807 ttttgagaatcaaatttggcagagtttgggtgctttt-aacttgtgttgatgtctct-tatgatcttcaagtcttcactcctttatatagtggttagtag 24882710  T
724 agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaa 823  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
24882709 agagacgttgagatctttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaagga 24882611  T
824 ttagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtg 923  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |  ||| || || |||||||||    
24882610 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgttgaggtagtg 24882512  T
924 gttgtacactt 934  Q
    |||||||||||    
24882511 gttgtacactt 24882501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 172; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 138 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 38594563 - 38594256
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
38594563 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaataaccagaatcagatgtgca 38594464  T
235 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
38594463 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 38594365  T
334 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||    
38594364 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaat 38594266  T
434 gctcaagcac 443  Q
    ||||||||||    
38594265 gctcaagcac 38594256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 167; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 268 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 8999694 - 8999014
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagatt 361  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||    
8999694 agacacaagcaattatactgattccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 8999595  T
362 acaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
8999594 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagaaacttcaaatgctcaagcactaaagcaagagacttcc 8999497  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
8999496 tatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 8999397  T
559 acaatacaat--aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt--gta-gaatcag-tttgacagagt 651  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||  ||| ||| ||  |||| ||||||    
8999396 acaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgtatgaaacaaatttggcagagt 8999297  T
652 tttggcgcttttgaacttgta-tatgtctctatctt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacg 747  Q
    || ||||||||| |||||||| ||| | |||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||     
8999296 ttgggcgctttt-aacttgtagtat-tgtctcccatgatcttcaagtcttcacttctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcaca 8999199  T
748 tctaaa-gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatc 846  Q
    || ||| |||| |||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||    
8999198 tccaaaagagttgttgagaaacctt-gatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatc 8999101  T
847 ttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
8999100 ttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatattgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 8999014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Original strand, 4821455 - 4821758
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||    
4821455 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctcttt-gaagaacaagcatcc 4821553  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||| |||    
4821554 aatgccttcaaat-ctttcaaaatagccgttgctccacttttctagtcttctgtaatctttagacgagtttgaatttgttaaacagcttttgaagcttta 4821652  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagc 1179  Q
    ||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
4821653 agttgtatctccggatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgacgaacttgcttctgatgaccttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagc 4821752  T
1180 actttg 1185  Q
    ||||||    
4821753 actttg 4821758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 11087870 - 11087124
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||||||| || | |||||||  |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||| ||||  |||||||||||||    
11087870 tgcttctgatgtaaagttcagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccac 11087773  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagac 392  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||    
11087772 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggcgatttccgctaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagac 11087673  T
393 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga 491  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||      
11087672 ttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctat 11087575  T
492 tcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactcta--gacttt-g 585  Q
    ||||||| |  |||  ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||  |||||  |    
11087574 tcaaacagaattacccagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatgcaatgcaattgaaagactctatagacttaag 11087475  T
586 aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttg-tatat-gtctct 681  Q
    |||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  |||||||||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||| | | | ||||||    
11087474 aatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgatgtcttgtctct 11087376  T
682 atcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatc 779  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||      
11087375 tt-tgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaa 11087278  T
780 caccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg 879  Q
     |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||| |||| |||| || |||||||| |||||||     
11087277 taccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaacat-ttatgcaggcagagctgtta 11087179  T
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
11087178 tcttgtcttgtagtgtagacacaagcagagtcatggaggtagtggttgtacactt 11087124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 138 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 457873 - 457618
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
457873 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 457777  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
457776 cagcgaaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttc 457677  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgag 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
457676 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgag 457618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 16112249 - 16111796
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataat--cagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   |  ||| || || |||  ||||||||||||   |||||||||  || || |  |    
16112249 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacattgtgaattttccagtacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcatcaatgat 16112152  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| |   ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| || |||||||    
16112151 cttttgcctgatatggttaatgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattatgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttccttgtctt 16112053  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||    
16112052 gtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttc 16111954  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||    
16111953 aatttcttccaaaaaagtcgttgcttcactttttccgtcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagctttaagttgcatc 16111854  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |  |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
16111853 ctctgatcaactgcagcttctggtgatttttatcttctaataaacttgcttctgatga 16111796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 770 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 19986058 - 19985894
Alignment:
770 tttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggc 869  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
19986058 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggc 19985959  T
870 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19985958 atagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19985894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 146; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 897 - 1114
Target Start/End: Original strand, 14426545 - 14426761
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||    
14426545 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 14426643  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatg 1096  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||    
14426644 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccattaaacagcttctgaagctttaagttgcatctcctgatg 14426743  T
1097 aactgcagcttctgatga 1114  Q
    ||||||| ||||||||||    
14426744 aactgcaccttctgatga 14426761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 108 - 335
Target Start/End: Original strand, 23643053 - 23643286
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||       |||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||    
23643053 tgaaggagagaaaaacgcaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagt 23643152  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
23643153 gcttttgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaatgacacaagcagttatcctggttccttccacaac 23643252  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23643253 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 23643286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 158 - 373
Target Start/End: Original strand, 11015240 - 11015463
Alignment:
158 taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa------agaacagagca 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||| |||||||    
11015240 taaaaatacttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagca 11015339  T
252 gagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataa 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
11015340 gagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagttcagttccccttgcacttccaaggagattttcactataa 11015439  T
351 tcacaaa-gattacaaatgctcaa 373  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
11015440 tcacaaatgattacaaatgctcaa 11015463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 159 - 375
Target Start/End: Original strand, 20967112 - 20967328
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa------agaacagagcag 252  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||||||||      ||| ||||||||    
20967112 aaaaaatcttattctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg------atgaactgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagcag 20967205  T
253 agaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20967206 agaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 20967305  T
353 acaaagattacaaatgctcaata 375  Q
    |||||||||||||||||||||||    
20967306 acaaagattacaaatgctcaata 20967328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 28622721 - 28622268
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   || ||||| |  |||   |||||||||||||  |||||||||  ||||| |  |    
28622721 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttgtgaatttccagcacattcaaaatagagtcgtttgaaa--ctttgatcaatcaccaatgat 28622624  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||| ||||| ||| | | ||||| ||||  || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
28622623 cttttgtctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 28622525  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||  ||| ||  ||| | |||||||||| |||    
28622524 gtagcagagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgcccttt-gaaaaacaaacatccaatgccttc 28622426  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||    
28622425 aaatcctttcaaattagccgttgcttcacttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaagttgcatc 28622326  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
28622325 tcctgatgaactgcagcttctggtgatttttagcttatgatgaacttgcttctgatga 28622268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 24883307 - 24882945
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||    
24883307 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctcgtaaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtg 24883209  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
24883208 cttctgatgtgatgttcataattagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcccggttccttccacaa 24883111  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagactt 394  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
24883110 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagactt 24883012  T
395 cacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
24883011 cccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 24882945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6170028 - 6169834
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt-----tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
6170028 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttctctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 6169929  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
6169928 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 6169834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 159 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25212707 - 25212471
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
25212707 aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcagaaaagatcaaagcagagaaa 25212608  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25212607 agaaaagtga-gacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 25212509  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
25212508 gattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttc 25212471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 159 - 310
Target Start/End: Original strand, 1775577 - 1775728
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1775577 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 1775676  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1775677 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 1775728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 127; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 829 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 48237130 - 48236814
Alignment:
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||| |||||| ||  |||||| |||| || |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
48237130 ttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttg 48237032  T
928 tacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagta 1027  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||  ||||||  |||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||     
48237031 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaataagcatctgatgccttcaaatcctttcaaacttgtcgttgcttcaccttttcagtc 48236933  T
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctg 1127  Q
    || ||||||  ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
48236932 ttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctg 48236833  T
1128 ataaacttgcttctgatga 1146  Q
    || ||||||||||||||||    
48236832 atgaacttgcttctgatga 48236814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 125; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Original strand, 9069543 - 9069849
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||  || || |||| ||||| |    
9069543 tcttgtcttgtagcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcctt-gaagaacaagcatac 9069641  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||  || ||||| || || | | |||||||| |||    
9069642 aatgcctttaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagcttta 9069741  T
1080 agtt--gcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||||  ||||| | ||||||| |  |||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
9069742 agttttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgtttctgataaacttgcttctgatgacgtcaccacttcagaa 9069841  T
1178 gcactttg 1185  Q
    ||||||||    
9069842 gcactttg 9069849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 125; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23304023 - 23303859
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
23304023 aaaaaatcttcttctgataaacctttagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaatagagcagagaaa 23303924  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc 322  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23303923 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc 23303859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 125; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 694 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 30945721 - 30945300
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   || ||| |  ||   |||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
30945721 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacattgtgaattgccaacacattcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatgat 30945624  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 888  Q
    | |||||||||| | | | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  ||| || |||| |  |||||||||||||| || |||||||||    
30945623 cttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattctgagggaacat-tgttgcaggcatagctgtttttcttgtctt 30945525  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||    
30945524 gtagctgagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaggaacaagcatccaatgccttc 30945426  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  ||||||||| || ||||| || || | | |||||||| ||||||||||||    
30945425 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaagttgcatc 30945326  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
     | |||||||||||||||||||||||    
30945325 tcctgatgaactgcagcttctgatga 30945300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 125; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 693 - 1144
Target Start/End: Complemental strand, 33692077 - 33691624
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   || ||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  || || | ||    
33692077 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcatcaatggt 33691980  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||  ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
33691979 cttttgcctgatatggttattgtcccatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 33691881  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || || ||     
33691880 gtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatctaacgccttt 33691782  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||| |  |||||    
33691781 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgca 33691682  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgat 1144  Q
    || | |||||||||  |||||||| |||||||   ||||| || ||||||||||||||    
33691681 tctcctgatgaactagagcttctggtgattttcaacttctaatgaacttgcttctgat 33691624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 125; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 159 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 45931025 - 45930881
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45931025 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 45930926  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45930925 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 45930881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 880 - 1184
Target Start/End: Original strand, 28409020 - 28409323
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||| |||| | |||||    
28409020 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaagaacaaacatcc 28409118  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| || | | ||||||||||||    
28409119 aatgccttcaaatcctttcaaaataattgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcctta 28409218  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
     |  ||||||| | |||||||||  |||||||| ||| | || |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
28409219 tgtcttgcatctcttgatgaactttagcttctggtgactgtt-gcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagga 28409316  T
1178 gcacttt 1184  Q
    |||||||    
28409317 gcacttt 28409323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 270 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 13175362 - 13174685
Alignment:
270 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagattaca 364  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||||    
13175362 acacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattaca 13175263  T
365 aatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    | |||||| |||||  |  | | ||||||||||||||  ||||||||||| || || | || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||    
13175262 actgctcagtactacacctagtctgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggctatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctat 13175165  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    ||||||||||  |   |||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
13175164 gctcaagcactaaattaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 13175065  T
562 atacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatc-agtttgacagagtttt 654  Q
    || ||||  |||||  ||||||||||   |||||||||||| |||||||| |   || |||||||   ||||||||  ||| | | |||| ||||||||     
13175064 atgcaattgaaagactctctagacttaacaatttctaagatatatcaaatgaacacaaaaattcaaaatgctttgtgtgaaacaaatttggcagagtttg 13174965  T
655 ggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtcta 751  Q
    ||||||||| ||||| | |   |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   | |||||||| |    
13174964 ggcgctttt-aacttattttcttgtctcta-ctgatcttcaagtcttctctcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaa 13174867  T
752 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 851  Q
     ||||||| |||| |  | |||||||   |||| |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||    
13174866 tagagtcg-ttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaa 13174768  T
852 ggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |  |||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| || || | || |||||| |||||||||||||||||||||||    
13174767 gtaacat-ttctgcatgcaaagctgtttttcttgtcttgtagtgtagagacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 13174685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 863 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 30944518 - 30944267
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |    
30944518 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctct 30944419  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| || ||||| || |    
30944418 tt-gaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttga 30944320  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
    | | | |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
30944319 acaacctttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctgatga 30944267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 863 - 1145
Target Start/End: Original strand, 44467027 - 44467312
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |     
44467027 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacac-tc 44467125  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt-a 1060  Q
    ||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
44467126 tttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattga 44467225  T
1061 aatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatg 1145  Q
    |  | |||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| |||||| || |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
44467226 acaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatg 44467312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Original strand, 8182911 - 8183214
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||| || |||  ||||||     
8182911 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagacgtattatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatca 8183009  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    | ||  ||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |  ||| | | ||||| |||| ||     
8183010 agtgtctttcaatcctttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaaacttttatacaactttttaagctttg 8183108  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagc 1179  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
8183109 agttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttttgatgaacttgcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagc 8183208  T
1180 actttg 1185  Q
    ||||||    
8183209 actttg 8183214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 693 - 1140
Target Start/End: Complemental strand, 23280324 - 23279875
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |   |||||| || |||  |||||||||||||  |||||||||  || || |  |    
23280324 aagtcttcactcctttatatagatgtgttaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaaa--ctttgatcaatcagcaatgat 23280227  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||||| | ||||||||    
23280226 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcatagctgtttttcttgtctt 23280128  T
889 gtagcgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    |||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||    
23280127 gtagcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaagaacaagcatccaatgcctt 23280029  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgc 1085  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||| || || |||||| | |||||| |||||||| |||||  ||||    
23280028 caaatcctttcaaactagccgttgctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctttaagtcttgc 23279930  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttc 1140  Q
    ||| | ||||||||| || |||||| |||||||   |||||||  ||||||||||    
23279929 atctcctgatgaactacaacttctggtgattttcaccttctgacgaacttgcttc 23279875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1251787 - 1251598
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
1251787 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 1251691  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1251690 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 1251598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 925 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 16543152 - 16542932
Alignment:
925 ttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcca 1024  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
16543152 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttcca 16543054  T
1025 gtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggctt 1124  Q
    || |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||  | ||    
16543053 gtcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcattatgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtgattttcagttt 16542954  T
1125 ctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
16542953 ctgatgaactttcttctgatga 16542932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 925 - 1146
Target Start/End: Original strand, 16622510 - 16622730
Alignment:
925 ttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcca 1024  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
16622510 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttcca 16622608  T
1025 gtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggctt 1124  Q
    || |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||  | ||    
16622609 gtcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcattatgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtgattttcagttt 16622708  T
1125 ctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
16622709 ctgatgaactttcttctgatga 16622730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 882 - 1146
Target Start/End: Original strand, 33605668 - 33605932
Alignment:
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaa 981  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||    
33605668 ttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgc-tctttgaagaacaagcatccaa 33605766  T
982 tgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatag-cttttgaagccttaa 1080  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||| || ||||| || || || |||||||||| |||     
33605767 tgccttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcaattttccagtcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagctttat 33605866  T
1081 gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || | | |||||||||    
33605867 gttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaattcgattctgatga 33605932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 159 - 315
Target Start/End: Original strand, 12220268 - 12220422
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
12220268 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 12220364  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12220365 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 12220422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 693 - 1162
Target Start/End: Complemental strand, 21283738 - 21283270
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaaga--gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || ||| |  ||||||||||   |||||||||  | ||| |  |    
21283738 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataaagtcgtttgaag--ctttgatcaatctccaatgat 21283641  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| |||||||| |  ||||||| |||||| ||   || || ||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||    
21283640 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaagaatcaatttcaaatccattccaattgagaggggacatagt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 21283542  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||| |||    
21283541 gtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaataacaagcatccaatgccttc 21283443  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  |||||    
21283442 aaatcctttcaaaatggacgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 21283343  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 1162  Q
    |  | ||||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||    
21283342 tatcctgatgaacttcaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatt-cttctgatgaacttgattctgatgac 21283270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 897 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 22578181 - 22577896
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| | |||| | ||| |||||| ||||||| |||    
22578181 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttt-aagaacaatcattcaatgccttcaaatcctt 22578083  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatga 1094  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||| || | | |||||||| |||||  ||||||| | |||    
22578082 tcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 22577983  T
1095 tgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||  || ||||||  |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
22577982 tgaacttcagcttctggtgatctt--gcctctgat-gagatgcttctgatgaccttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcacttt 22577896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 694 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 48063184 - 48062704
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
48063184 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgttgaaatgc-catcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 48063087  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||| ||||| ||||  ||||||| | ||||||   ||||   ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
48063086 ctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggattaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 48062988  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  ||||||||||||         
48062987 tagcagagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgc----- 48062894  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
        |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||  |||| | ||| |||| |||||| | | ||| | |||||||||| ||||||||||||     
48062893 ----ctttcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttcgacaatttctaggcgagtttgaattcttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatct 48062798  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
48062797 cttgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatggacttgcttctgatgaacttgcttctgatggcgtcatcacttcaggagcactt 48062704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 102; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 694 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 2265882 - 2265448
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |  |||   |||||||||||| |  ||| ||||  ||||| |  ||    
2265882 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagttgc-cagcacattcaaaatagagtcgtttgaagtt-tttaatcaatcaccaatgatc 2265785  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | ||| |  |||| || |  ||||||| |||||| ||   ||||| ||||  | |||||||||||||||| | |||||||||    
2265784 ctttgcctgatatggttattgtcgtaagaaggatcaatttcaaatgcattcctattaagaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtcttg 2265686  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  |||||  ||| | ||||    
2265685 tagcaaagacaaaa-cagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcattaaataccttca 2265588  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||     
2265587 aatccttccaaaatagccgttgctatactttttcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacagcttttaaagctttaagttgcatct 2265488  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    | ||||||||| || |||||| ||||| |  |||||||||    
2265487 cctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgat 2265448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 102; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 880 - 1186
Target Start/End: Complemental strand, 10883350 - 10883044
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || |||  ||||||    
10883350 tcttgtcttgtagcagagacgcaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaggcatcc 10883252  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||| | |||    
10883251 aatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaacttta 10883152  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||     |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
10883151 agtcttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgat-gggatgcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcgtcacttcagga 10883053  T
1178 gcactttga 1186  Q
    |||||||||    
10883052 gcactttga 10883044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 138 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22499524 - 22499347
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
22499524 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22499428  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagt 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22499427 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagt 22499347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 863 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 9709997 - 9709731
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||   ||||| |||||||||| |    
9709997 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctct 9709898  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
9709897 tt-gaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattga 9709799  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    | ||  |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
9709798 acaggctttgaagctttatgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgat 9709731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6045193 - 6044957
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||| ||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
6045193 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaattcttattctggtattacttcagaagctagttgggagtgc 6045095  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||      
6045094 ttcagatataatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcatggttccttccacaaac 6044997  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6044996 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 6044957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 4412771 - 4412060
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt--agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa- 357  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||      
4412771 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 4412672  T
358 gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||    
4412671 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagac 4412575  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttct 554  Q
    ||   ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  || | ||||    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||     
4412574 tttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattaaacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcaatggtgttca 4412475  T
555 caatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtag---aatcagtttgac 646  Q
    |||||||||||||   |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   ||||| ||  |   ||  | |||  |    
4412474 caatacaatacaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgctgtgatgtgaaacaatttttgc 4412375  T
647 agagttttggcgcttttgaacttgtatat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagc 744  Q
    ||||||| | ||||||| || |||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   | |||    
4412374 agagtttggacgcttttaaa-ttgtatattgtctctcattgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagaaagagtcgttgagatctttaagc 4412276  T
745 acgtc-taaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 842  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||  |||||||  ||||| |  || |||| ||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||| ||||| ||||    
4412275 acgtcagagagagtcgttctgaaatc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatttcgaattcgttcc 4412178  T
843 catcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaa 941  Q
    ||   | ||   ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||     
4412177 caatgtaaataaacattgtttgcaggcagagctgttttccttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacagttcgtacag 4412078  T
942 acgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||| ||  ||||||||||    
4412077 acgcacaatgtcaacgct 4412060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 829 - 1185
Target Start/End: Original strand, 15467846 - 15468202
Alignment:
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  | |||||| | ||||||| | |||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||| ||||||    
15467846 ttcaaatccattcccattttgaaggaacatcgt-tgcaggtaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaattcagagtagtggaggtaatggttg 15467944  T
928 tacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagta 1027  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||     
15467945 tacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtcgttgattcactcttccagtc 15468043  T
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttc 1125  Q
    ||||||| |   |||||||| || |||| ||| || | | |||||||| |||||  ||||||| | |||||||||  |||||||| | || ||  || ||    
15468044 ttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtaatcttcagcatc 15468143  T
1126 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||  |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
15468144 tgat-gagatgcatatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttg 15468202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 881 - 1186
Target Start/End: Original strand, 13880086 - 13880391
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||  |||||| |    
13880086 cttgtcttgtagcagagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aataagcatcta 13880184  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||  ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||     
13880185 atgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttat 13880284  T
1081 gt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
    ||  ||||   | |||||||||  ||||||| ||||| ||  ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
13880285 gtcttgcaattcctgatgaactagagcttctcatgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggag 13880383  T
1179 cactttga 1186  Q
    ||||||||    
13880384 cactttga 13880391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 880 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 16316734 - 16316433
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||| | ||  | |||| |||||||    
16316734 tcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgc-tcttcaaagaacaagcatcc 16316636  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||  || |||||||||  ||||||| | || |||||||| || | | |||||||| |||    
16316635 aatggcttcaaatcctttcaaaatagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagcttta 16316536  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||  ||||||||| ||||||||| || |||||| |||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
16316535 agtcttgcatcccctgatgaacttcaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcagga 16316439  T
1178 gcactt 1183  Q
    ||||||    
16316438 gcactt 16316433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 21695364 - 21695649
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |    
21695364 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 21695463  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || ||| |||||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||  || |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
21695464 tcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatcattttgaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattga 21695562  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | |||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
21695563 acaacttttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttatgatga 21695649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Original strand, 27871699 - 27871956
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||    
27871699 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaataagcatcc 27871798  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    |||||          ||||||||||| ||||||   ||| ||||||  ||||||||| | |||  ||  |||||||| | ||| | |||||||||| |||    
27871799 aatgc---------atttcaaaatagccgttgccatactattccagacttctgcaatttctaggtgaatttgaatccttgaaacaacttttgaagcttta 27871889  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
27871890 agttgcatttcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 27871956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 881 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 2913784 - 2913518
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| ||||||||    
2913784 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcca 2913686  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| | |||||| ||| || ||| |||| || ||| |||||||  ||||    
2913685 atgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaa 2913586  T
1081 g--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |  ||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||| ||   |||||||| ||||||||| ||||||    
2913585 gtcttgcatctcctgatgaactacagtttctggtgatcttcatcttctgatgaacttgcttttgatga 2913518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 897 - 1146
Target Start/End: Original strand, 15088518 - 15088768
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||  ||||||| |||    
15088518 gacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaag-aacaagcatccaatgtcttcaaatcctt 15088616  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatga 1094  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||| |  ||||||| | |||    
15088617 tcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctcctga 15088716  T
1095 tgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||| |  |||||||| |||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||    
15088717 tgaattagagcttctggtgatcttcagcttatgatgaacttgcttctgatga 15088768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 828 - 934
Target Start/End: Original strand, 8933634 - 8933739
Alignment:
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
8933634 cttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 8933732  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
8933733 tacactt 8933739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 880 - 1110
Target Start/End: Complemental strand, 15704666 - 15704447
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||         |||||||| |||||||||| ||| || |||  |||||||    
15704666 tcttgtcttgtagcagagacaaaa-cagagtagtggaagtagtggttgtaca---------aacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatcc 15704578  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||    
15704577 aatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttta 15704478  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctg 1110  Q
    |||| ||||   ||||||||| || ||||||    
15704477 agtttcatcttctgatgaactacaacttctg 15704447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 693 - 1185
Target Start/End: Original strand, 11319198 - 11319691
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
11319198 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 11319295  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||| | ||||| || |  ||||||| ||||||||   || ||| ||||  | ||||||||   ||||| || |||||||    
11319296 cttttgcctgatatggttattgtcatatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcaggactgttatccttgtctt 11319394  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||   |  |||  ||||||||||| |||    
11319395 gtagtagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaa-aacacgcatccaatgcattc 11319493  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt--tgca 1086  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||  |||||| || || |||||||| || | | |||||||| | ||||  ||||    
11319494 aaatcctttcaaaatagttgttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgca 11319593  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    || | |||||| || || |||||| |||| ||  ||||||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
11319594 tctcttgatgacctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttttaatgacgtcatcacttcaggagcactttg 11319691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 863 - 1169
Target Start/End: Complemental strand, 19711208 - 19710900
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |     
19711208 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgc-tc 19711110  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttc--cagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt 1059  Q
    ||||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||  |||| ||   |  |||||||||||| |||||||||||    
19711109 tttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgccac-cttttcttcagtctttcactctctttagacgagtttgaatccatt 19711011  T
1060 aaatagct-tttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 1158  Q
    ||| |||| |||||| | ||| ||||||||   ||||||||| ||| ||||| |||| |   | ||||||| || | |||||||||  ||||||||||||    
19711010 aaacagctatttgaaactttaggttgcatcttctgatgaactacagtttctggtgatatacagtttctgatgaaatagcttctgatagacttgcttctga 19710911  T
1159 tgacgtcatca 1169  Q
    |||||||||||    
19710910 tgacgtcatca 19710900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 693 - 1115
Target Start/End: Original strand, 24787935 - 24788358
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| | ||    
24787935 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaat-gt 24788031  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
      |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| || | || || ||||  | || ||||| |||| || | ||||||||    
24788032 attttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattccaatttagagggaacatcgt-tgtaggcagagctatttttcttgtctt 24788130  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  | | ||||| |||| |||| ||||||| |||    
24788131 gtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattc-tctttgaagaacaagcacccaatgccttc 24788229  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||| ||  || |||| ||| || | | |||||||| |||||  |||||    
24788230 aaatcctttcaaaatattcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 24788329  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    || | | ||||||| ||||||||| ||||    
24788330 tctcctaatgaacttcagcttctggtgat 24788358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 266 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 4433343 - 4432991
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 358  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||||  |    
4433343 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagtttcactaagtttaatcacaactg 4433244  T
359 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 456  Q
    ||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |    
4433243 attacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagaat 4433147  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    |   ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
4433146 ttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 4433047  T
556 aatacaatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaat 606  Q
    |||||||| | ||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
4433046 aatacaatgccattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaat 4432991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 863 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 12366943 - 12366623
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||| |    
12366943 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctct 12366844  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || |||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||  ||| ||||| || |||||||| |    
12366843 tcaaag-aacagacatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattga 12366745  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    | |||  ||||||| |||||  ||||| | | ||||||||| ||||||||| |||  ||  |||||||||  |  ||||| ||||||||||| |||||||    
12366744 acagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctgat-gagatgcttttgatgaacttgattctgat 12366648  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
12366647 gatgtcatcacttcaggagcacttt 12366623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 881 - 1143
Target Start/End: Complemental strand, 19339426 - 19339174
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  ||||||||    
19339426 cttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatcca 19339328  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||         ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||| | ||| || ||||||| | ||||    
19339327 atgcatt---------tcaaaatagtcgttgccacacttttccagtcttctgcaatctttaggcgagttagagtccttgaaacaggttttgaaactttaa 19339237  T
1081 gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctga 1143  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||||||||||    
19339236 gttcaatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttctga 19339174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 290
Target Start/End: Original strand, 24072028 - 24072183
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
24072028 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24072124  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggtt 290  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
24072125 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggtt 24072183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 881 - 1115
Target Start/End: Original strand, 21692269 - 21692504
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | ||  | |||| ||||||||    
21692269 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgc-tcttcaaagaacaagcatcca 21692367  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||  ||||| ||| || ||  |||| |||| |||||||||| ||||    
21692368 atgccttcaaatcctttcaaaacagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaa 21692467  T
1081 g--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    |  ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||    
21692468 gtcttgcatctcctaatgaacttcagcttctgatgat 21692504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 880 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 32264895 - 32264669
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  | |||||    
32264895 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtactggttgtacactctgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaataaacatcc 32264796  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||         ||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||| | ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||    
32264795 aatgcatt---------tcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaataacttttgaagcttta 32264705  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
32264704 agtcgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 32264669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 331608 - 331894
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  |    
331608 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgc--t 331705  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttc-aaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatta 1060  Q
    |||||| ||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||  || |||||  |||||||||| |    
331706 tttgagcaataagcatccaatgccttcagatcctttcaaaaatagctgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataa 331805  T
1061 aatagcttttgaagccttaagt-tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaac--ttgcttctgatga 1146  Q
    || | | |||||||| ||||||  ||||| | ||||| ||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| |||  |||||||||||||    
331806 aacaacctttgaagctttaagtccgcatctcctgatggacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttttgcttctgatga 331894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 828 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 38593921 - 38593816
Alignment:
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
38593921 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatgactgttatcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttg 38593823  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
38593822 tacactt 38593816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 863 - 1082
Target Start/End: Complemental strand, 13138090 - 13137871
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |    
13138090 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 13137991  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
13137990 tcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattga 13137892  T
1062 atagcttttgaagccttaagt 1082  Q
     || | |||||||| ||||||    
13137891 ttaacctttgaagctttaagt 13137871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 897 - 1026
Target Start/End: Original strand, 14193112 - 14193240
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||| ||| || |||| ||||| |||||| ||||||| |||    
14193112 gacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctcttt-gaagaacaagcattcaatgccttcaaatcctt 14193210  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagt 1026  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
14193211 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagt 14193240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 287 - 620
Target Start/End: Original strand, 602139 - 602481
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcaca-aagattacaaatgctcaatactat 379  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| |||||||||| |||||||||||      
602139 ggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacacaagattacaactgctcaatactta 602238  T
380 caaaa-tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagg 477  Q
     | || |||||||||||| |    |||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||  ||| ||||||||||  ||||||||||||  | |    
602239 aacaagtatgagacttcagat---tgctcaagcacaca-gcaagagacttcta-tgctcaaacacacaagtaagagacttcagatgctcaagcactaaag 602333  T
478 caagagacttctgat-caaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatac-aataa-aga 573  Q
    |||||||||||| || |||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||    
602334 caagagacttctaattcaaacagaattacatagaaaattgtttgaatttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaataacaga 602433  T
574 ctctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattc 620  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
602434 ctcttgactttagaatttctaagatttatcaaatgtgtacagaaattc 602481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 863 - 1115
Target Start/End: Original strand, 13302773 - 13303027
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |    
13302773 tgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctct 13302872  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||  ||||||||  || |||||||| |    
13302873 tcaaag-aacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattga 13302971  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    | | | |||||||| |||||  ||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||    
13302972 acaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaactacagcttctggtgat 13303027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 693 - 1182
Target Start/End: Original strand, 11792700 - 11793191
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || | ||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
11792700 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaatttccatcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 11792797  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||| || |||||  |   |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
11792798 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcatatccattcaaagtatgaaggaacattgt-tgcaggcaaagctgttattcttgtctt 11792896  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||  | |||| |||||| ||||| |||    
11792897 gtagcagagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tcttcaaagaacaagcatcaaatgctttc 11792995  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  |||||  ||||||||| || | |||||| || | | ||| |||| |||||  |||||    
11792996 aaatgctttcaaaatagtcgttgcttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgca 11793095  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgc-ttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||  |  || || |||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||    
11793096 tctcctgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgat-gagatgtttatgatgaacttgctttttaatgacgtcatcactttaggagcact 11793191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 881 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 24794891 - 24794788
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
24794891 cttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaggaataagcatcca 24794792  T
981 atgc 984  Q
    ||||    
24794791 atgc 24794788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 30025868 - 30026153
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |     
30025868 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tc 30025966  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||  | |||| |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||| ||  ||| |||||  | |||||||| |    
30025967 ttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaattcttttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattga 30026066  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
      ||| |||||||| |||||  ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
30026067 ccagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 30026153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 863 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 29935553 - 29935380
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |    
29935553 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctct 29935454  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    ||  || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||    
29935453 ttaaag-aacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaat 29935380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 689 - 956
Target Start/End: Original strand, 602553 - 602822
Alignment:
689 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc--agcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |   || ||||| ||||||||||| |   | |||| |||||  |||||     
602553 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaaattgttagtacgtc-aaagagtcgttgttgtagcctt-gatcaagcaccaa 602650  T
786 tagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttg 884  Q
    |  ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||   ||||||| |||||  |  |||| || |||| ||||||||||| ||||||| | ||||    
602651 tgatcctttgcctgatttggatatagtcctatgaagaattgatttcaaatccattctgaatttgagggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttg 602749  T
885 tcttgtagcgtggacaaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaac 956  Q
    || |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | | |||||||||    
602750 tcctgtagcgtagacaaagaacagagtagtggaggaagtggttgtacgcttcgtacaaatgcattttgtcaac 602822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 881 - 1082
Target Start/End: Original strand, 2500020 - 2500220
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||| || |||  ||||||||||||| || ||   ||||   ||||||||    
2500020 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggata-agcatcca 2500118  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| ||||    
2500119 atgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 2500218  T
1081 gt 1082  Q
    ||    
2500219 gt 2500220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 272 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1879018 - 1878923
Alignment:
272 acaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaa 365  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
1879018 acaagcaattatcctggttccttccacaattcggaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattttcactataatcacataagattacaa 1878923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 897 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 19237203 - 19237065
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||    
19237203 gacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgc-tctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 19237105  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||  || |||||||||    
19237104 tcaaagtagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaat 19237065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20327976 - 20327837
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
20327976 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 20327880  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacaca 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
20327879 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaca 20327837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 274
Target Start/End: Original strand, 22392645 - 22392784
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
22392645 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22392741  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacaca 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
22392742 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaca 22392784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22467924 - 22467785
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
22467924 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22467828  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacaca 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
22467827 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaca 22467785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 897 - 1110
Target Start/End: Original strand, 14425445 - 14425647
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||| |||  ||||||||||||          ||    
14425445 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatccaatgc---------att 14425534  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatg 1096  Q
    ||||||||| ||||||   |||| |||||| |||||||||  |||| |||| |||||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||    
14425535 tcaaaatagccgttgccatacttntccagtcttctgcaat-gttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatg 14425633  T
1097 aactgcagcttctg 1110  Q
    ||||  ||||||||    
14425634 aactntagcttctg 14425647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 863 - 1056
Target Start/End: Original strand, 1292993 - 1293176
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |     
1292993 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tc 1293091  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatcc 1056  Q
    ||||| |||  ||||||||||||         ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||    
1293092 tttgaagaataagcatccaatgc---------ctttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttttgcaat-tttagtcgagtttgaatcc 1293176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 872 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6044354 - 6044292
Alignment:
872 agctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6044354 agctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6044292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 881 - 1082
Target Start/End: Original strand, 13648711 - 13648911
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || | | ||||||||    
13648711 cttgtcttgtagcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-atcaagcatcca 13648809  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||  || |||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||  ||||||| | || |||||||| || | |||||||||| ||||    
13648810 atgtctttaaatcctttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaa 13648909  T
1081 gt 1082  Q
    ||    
13648910 gt 13648911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 880 - 1161
Target Start/End: Complemental strand, 48806056 - 48805785
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||    
48806056 tcttgtcttgtagcagagacaaaatcagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacgaacgtactatgtcaacgc-tctttgaagaaatagcatcc 48805958  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    |||||          ||||||| ||| ||||||   | |  |||||| || || ||| | ||| |||| | || ||| | ||| ||||||||||  |||     
48805957 aatgc---------atttcaaactagccgttgccatattcctccagtcttatgtaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaaaacttg 48805867  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
48805866 agttccatctcttgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttctgatgaactttcttctgatgaacttgcttctgatga 48805785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 881 - 1081
Target Start/End: Complemental strand, 13730851 - 13730652
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    ||||||||||| |   |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||  | |||| ||||||||    
13730851 cttgtcttgtaacagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tcttcaaagaacaagcatcca 13730753  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  ||| || ||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| ||||    
13730752 atgcattcaaatcttttcaaaatagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaa 13730653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 880 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 5000999 - 5000861
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    |||||||||||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| || ||  | |||| ||||| |    
5000999 tcttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacg-ttcttcaaagaacaagcattc 5000901  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactt 1019  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
5000900 aatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 5000861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 993 - 1184
Target Start/End: Original strand, 13692435 - 13692625
Alignment:
993 tctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt--tgcatccc 1090  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| || |||||||| || | | |||||||| ||||||  | ||||      
13692435 tctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatctt 13692534  T
1091 atgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
     |||||| ||  |||||||| |||| ||  |||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
13692535 ctgatgagctttagcttctggtgatctt--gcttctga-agagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcacttt 13692625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11572949 - 11572876
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 352  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
11572949 ttatcctggttccttccacattccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 11572876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37556130 - 37556005
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
37556130 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 37556034  T
233 cagcgg-aaagaacagagcagagaaaaga 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
37556033 cagcggaaaagaacagagcagagaaaaga 37556005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1122 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 48805809 - 48805745
Alignment:
1122 cttctgataaacttgcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48805809 cttctgatgaacttgcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 48805745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12223196 - 12223090
Alignment:
270 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaa 366  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||     
12223196 acacaagcaattatcctggtttcatccacaatccagaagtggtccagtcccccttgcacttctaaggagatttttcactataatcacacaagattacaat 12223097  T
367 tgctcaa 373  Q
    |||||||    
12223096 tgctcaa 12223090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 696 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 13018867 - 13018527
Alignment:
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcct 792  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  || |    
13018867 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagactttgtaaattgacagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgatctt 13018770  T
793 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgta 891  Q
    |||| |||||||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |   |||||| | ||  | ||||| | |||||||| | |||||| ||||    
13018769 ttgcttgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaaaattgt-tgcagtcgtagctgttattcttgtcctgta 13018671  T
892 gcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaa 991  Q
    ||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||  |  | | |||||||||||| |||||     
13018670 gcacagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaac 13018572  T
992 ttctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||    
13018571 ttcatttaaaatagtcgttgcttcactctcctagtcttctgcaat 13018527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1102 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 4429026 - 4428944
Alignment:
1102 cagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
4429026 cagcttctgatgaattt--gcttctgatgaacttgcttctgatgaactttgcttctgatgatgtcatcacttcagaagcattttg 4428944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 863 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 39284759 - 39284604
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtctt-gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |     
39284759 tgcaggcatagctgttatctttgtcctgtagtagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tc 39284661  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcact 1018  Q
    ||  | |||| | |||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||| ||||||    
39284660 ttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattcatttgaattagtcgttgtttcact 39284604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7488687 - 7488620
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
7488687 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttacacttccaaggagagttcactaaaatca 7488620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1125 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 24794690 - 24794631
Alignment:
1125 ctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24794690 ctgatgaacttgcttctgataaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 24794631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 4820839 - 4820921
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
4820839 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 4820921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16105733 - 16105624
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattac 363  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |  |||||||    
16105733 aaagacacaagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgccctccttgcacttctaaggagagttcactaaaatcaatatcagattac 16105634  T
364 aaatgctcaa 373  Q
    ||||||||||    
16105633 aaatgctcaa 16105624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19711807 - 19711733
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19711807 aagcaattatactggttccttccataaaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19711733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 863 - 1186
Target Start/End: Complemental strand, 21381624 - 21381324
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-cgttcaaacgtactttgtcaacgctt 960  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||| ||   ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||     
21381624 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgttgcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacattttcgtacagacgtactatgtcaacgctc 21381525  T
961 ttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatta 1060  Q
    ||| || |||   ||||||||||| ||         ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||| | |    
21381524 ttt-gaagaataggcatccaatgcatt---------tcaaaatagccgttgccacacttttccagtcttctgcaatctttaggcgagttagagtccttga 21381435  T
1061 aatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 1160  Q
    || | |||||||| |  ||||||  ||| | |||||||||||||||||||               ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
21381434 aacaacttttgaaactataagttcaatctcctgatgaactgcagcttctg--------------gtgatacac-agcttctgatgaactagcttctgatg 21381350  T
1161 acgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
21381349 acgtcatcacttcagaagcactttga 21381324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 2501735 - 2501662
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 352  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
2501735 ttatcctggttccttccataatttggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 2501662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13259198 - 13259125
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
13259198 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13259125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13266538 - 13266465
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
13266538 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13266465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 13880826 - 13880875
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
13880826 ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 13880875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 19339196 - 19339147
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
19339196 gcttctgatgaacttgcttctgaggacgtcatcacttcagaagcactttg 19339147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 874 - 934
Target Start/End: Original strand, 48382304 - 48382365
Alignment:
874 ctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
48382304 ctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacactt 48382365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 478 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2501600 - 2501517
Alignment:
478 caagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||| | ||||| ||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2501600 caagagacttctaaacaaacgaaattacaaagaat-aagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 2501517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 552
Target Start/End: Original strand, 13263274 - 13263421
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag--cactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |    
13263274 tgctcaagcacacaagcaaaagacttcaaattctcaagtacacta-gcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttct-atcaaacaga 13263371  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgtt 552  Q
      |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
13263372 t-tacaaagaat-aagtttgagatgaacacttgatatacaatcagaggtgtt 13263421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 880 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 16310084 - 16309961
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| | ||  | |||| |||||||    
16310084 tcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgc-tcttcaaagaacaagcatcc 16309986  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaata 1004  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||    
16309985 aatgccttcaaatcctttcaaaata 16309961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Original strand, 25806797 - 25806869
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
25806797 ttatcttggttccttccacaatccggaagtagtttagtccctcttgcacttccaacgagatttcactataatc 25806869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 567
Target Start/End: Original strand, 25806885 - 25807051
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctc--aagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||  ||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||  |  |||||||||||| | |||||||    
25806885 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaacaa 25806984  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa 567  Q
    |  || | |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||    
25806985 at-tataaagaaataagtttggtttgaacacttgatatacaatcagtgatgttcataatacaaaacaa 25807051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1184
Target Start/End: Original strand, 30026128 - 30026176
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
30026128 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 30026176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 950
Target Start/End: Original strand, 4494370 - 4494628
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |   || ||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
4494370 aagtcttccctcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 4494467  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | ||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| | ||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
4494468 ctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaaaatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 4494566  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtacttt 950  Q
    |||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||    
4494567 gtagcagagacaaaaagagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaattgtacttt 4494628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1068 - 1184
Target Start/End: Original strand, 14193242 - 14193359
Alignment:
1068 tttgaagccttaagt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtc 1165  Q
    |||||||| ||||||  |||||| | |||||||||  ||||| || |||| ||  |||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||    
14193242 tttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttatggtgatcttctgcttctgataagat-gcttatgatgaacttgcttctgatgacgtc 14193340  T
1166 atcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||| ||||||||    
14193341 atcacttcaggagcacttt 14193359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 7488275 - 7488229
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
7488275 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 7488229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12174961 - 12174844
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
12174961 caagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacataattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 12174862  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
12174861 gtggtgttcacaatacaa 12174844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 13302397 - 13302514
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
13302397 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 13302496  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
13302497 gtggtgttcacaatacaa 13302514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 15088085 - 15088202
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
15088085 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 15088184  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
15088185 gtggtgttcacaatacaa 15088202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15871832 - 15871754
Alignment:
275 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 352  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||    
15871832 agcaattatcctggttccttccacaatctggaagtagtccagtcccctttgtacttccaaggatattttcactataatc 15871754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16308087 - 16308041
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
16308087 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 16308041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16308492 - 16308426
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
16308492 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatca 16308426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 16411383 - 16411449
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
16411383 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 16411449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 1293185 - 1293234
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
1293185 gcttctgatgaacttgcttctgataacgtcatcacttcaggagcactttg 1293234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1028 - 1161
Target Start/End: Complemental strand, 4429117 - 4428984
Alignment:
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctg 1127  Q
    ||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||| |||||||||| | |||||||  ||| |  |||||||||||||||||| ||||     |||||||    
4429117 ttctgcaatttttaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaaactttaagttcaatctccagatgaactgcagcttctggtgataaacagcttctg 4429018  T
1128 ataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||    
4429017 atgaatttgcttctgatgaacttgcttctgatga 4428984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 7339821 - 7339772
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
7339821 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 7339772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 897 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 13730835 - 13730566
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||| |||||||  ||    
13730835 gacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgcattcaaatcttt 13730737  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatga 1094  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  ||| || ||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  ||||||| | ||     
13730736 tcaaaatagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagccttgcatctcctgg 13730637  T
1095 tgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||| ||  ||||| ||||||            |||      |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
13730636 tgagctttagcttatgatga------------gat------gcttctaatgaacttgtttatgatgacgtcatcacttcaggagcactt 13730566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1185
Target Start/End: Original strand, 14425659 - 14425707
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14425659 cttttgntgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 14425707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 562
Target Start/End: Original strand, 16472227 - 16472342
Alignment:
445 aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||| |||  |||||||| |||  | ||||||||||| | | ||||||||  |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
16472227 aagcaagagatttcccatgctcaaccacaaaagcaagagacttataa-caaacaaat-tacacagaaataagtttggtttgaacacttgatatacaatca 16472324  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
16472325 gtggtgttcacaatacaa 16472342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1138 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 19236931 - 19236886
Alignment:
1138 ttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19236931 ttctgacgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19236886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 567
Target Start/End: Original strand, 23125439 - 23125602
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||||| | ||||||||     
23125439 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttctaatgctcaagcccaaaagtaagagacttctaaacaaacaaa- 23125537  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa 567  Q
     |||| |||| || |||||  ||||||||||||||||  ||| |  |||||| |||||||| ||||    
23125538 ttacaaagaaatatgtttg-gttgaacacttgatatattatcggccgtgttcacaatacaaaacaa 23125602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 25687509 - 25687345
Alignment:
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||    ||||||||||| |  ||||||    
25687509 aaactactcaagcacaaatgcaagaggtttcctatgctcaagcacaactgcaagaggcttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttttattcaaac 25687410  T
498 aaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    | |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
25687409 ataattacaaagaaa-atgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcccaatacaa 25687345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 30945310 - 30945261
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
30945310 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 30945261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 1292443 - 1292527
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
1292443 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 1292527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 1292824 - 1292864
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1292824 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 1292864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 2266687 - 2266647
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2266687 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 2266647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1034 - 1110
Target Start/End: Complemental strand, 7339898 - 7339822
Alignment:
1034 aatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctg 1110  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
7339898 aatcattagacgagtttaaatccattaaacaatttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctg 7339822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 9098599 - 9098559
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9098599 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 9098559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 9099405 - 9099365
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9099405 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 9099365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Original strand, 11318757 - 11318837
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 344  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
11318757 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttca 11318837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 11792284 - 11792344
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
11792284 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11792344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 12174704 - 12174664
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12174704 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 12174664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 13260980 - 13260940
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13260980 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13260940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #219
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 14187063 - 14187123
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
14187063 ggttccttccacaaatcggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14187123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #220
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 14425241 - 14425281
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14425241 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 14425281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #221
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1185
Target Start/End: Original strand, 14426752 - 14426800
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
14426752 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 14426800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #222
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 940 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 16556755 - 16556664
Alignment:
940 aaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctg 1032  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||  |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
16556755 aaacgtactttttcaacgctcttt-gaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16556664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #223
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 940 - 1032
Target Start/End: Original strand, 16608907 - 16608998
Alignment:
940 aaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctg 1032  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||  |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
16608907 aaacgtactttttcaacgctcttt-gaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16608998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #224
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19237648 - 19237540
Alignment:
455 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||  |||||| ||  || | |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
19237648 cttcttatgctcaagcacataagcaagagacttctattcaaactaaattataaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 19237549  T
554 tcaatacaa 562  Q
     ||||||||    
19237548 acaatacaa 19237540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #225
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 19339612 - 19339572
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19339612 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 19339572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #226
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 27871511 - 27871551
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27871511 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 27871551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #227
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 32265083 - 32265043
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32265083 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 32265043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #228
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 39284500 - 39284452
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
39284500 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagtacttt 39284452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #229
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 863 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 41842468 - 41842372
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgc 958  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
41842468 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgc 41842372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #230
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 693 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 5001190 - 5001151
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5001190 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 5001151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #231
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 562
Target Start/End: Original strand, 5034880 - 5035039
Alignment:
405 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||  | |||||| ||||||   ||||||||  |    
5034880 ctcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaacacaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagatacttctagacaaacaaaatt 5034979  T
504 acagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    | | ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
5034980 atacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaataagtggtgttcacaatacaa 5035039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #232
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13261397 - 13261338
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
13261397 gttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13261338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #233
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 13472872 - 13472833
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13472872 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13472833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #234
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Original strand, 27871931 - 27871978
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
27871931 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactt 27871978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #235
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 48237269 - 48237230
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48237269 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 48237230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #236
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5001631 - 5001549
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
5001631 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 5001549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #237
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 10254700 - 10254654
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
10254700 atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 10254654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #238
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10883976 - 10883894
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
10883976 aaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 10883894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #239
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13173023 - 13172858
Alignment:
398 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaa 496  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| |  ||||||||||||  || |||||||||  | |||||||||||||  |||||    
13173023 aaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttccgatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatactcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaa 13172924  T
497 caaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    || |  |||| ||||  | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
13172923 cagaattacaaagaaa-atgtttgtggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaaaatacaa 13172858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #240
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 13302213 - 13302295
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
13302213 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggatagttcacta 13302295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #241
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 13645803 - 13645885
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
13645803 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccgtaagtagtcctgtcccccttgcacttccaagcagagttcacta 13645885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #242
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13731341 - 13731178
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctc--aagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaaca 498  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |  |||||||    
13731341 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctaaacac-aagcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaaca 13731243  T
499 aagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
     |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
13731242 gaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 13731178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #243
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1141 - 1183
Target Start/End: Original strand, 15088748 - 15088790
Alignment:
1141 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
15088748 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 15088790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #244
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15871637 - 15871583
Alignment:
508 agaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
15871637 agaaataagtttgggttgaacacttgatatacaatcagtgatgttctcaatacaa 15871583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #245
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16557211 - 16557094
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
16557211 caagagacttcgaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 16557112  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
16557111 gtggtgttcacaatacaa 16557094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #246
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 16608451 - 16608568
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
16608451 caagagacttcgaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 16608550  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
16608551 gtggtgttcacaatacaa 16608568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #247
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18362117 - 18362071
Alignment:
516 gtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
18362117 gtttgatttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 18362071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #248
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 28622980 - 28622863
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
28622980 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagacacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 28622881  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
28622880 gtggtgttcacaatacaa 28622863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #249
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28623142 - 28623080
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
28623142 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28623080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #250
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 418 - 558
Target Start/End: Original strand, 44466570 - 44466712
Alignment:
418 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaag 516  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||  ||||||  | || ||  ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||  | |    
44466570 gcaagagacttcaaatgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgctcttgaacacaatcaagagacttctgataaaacaaaattacaaagaaaaatg 44466669  T
517 tttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
44466670 tttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 44466712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #251
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 48063433 - 48063316
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
48063433 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 48063334  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
48063333 gtggtgttcacaatacaa 48063316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #252
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1102 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 4411910 - 4411828
Alignment:
1102 cagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| || |||||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
4411910 cagcttctgatgaattt--gcttctaatgaacttgcttctgataaactttgctcctaatgatgtcatcacttcagaagcactttg 4411828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #253
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 5826185 - 5826234
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
5826185 gcttctgatgaacttgcttctgatgacttcattacttcaggagcactttg 5826234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #254
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 487
Target Start/End: Original strand, 9802671 - 9802756
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagactt 487  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||    
9802671 tgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcacatgctcaagcacacaagcaagacactt 9802756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #255
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 13260547 - 13260498
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
13260547 tgcttatgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcacttt 13260498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #256
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1102 - 1183
Target Start/End: Original strand, 13303042 - 13303122
Alignment:
1102 cagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |  | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
13303042 cagcttctgatgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaagttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactt 13303122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #257
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 14745563 - 14745511
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
14745563 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 14745511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #258
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 24787735 - 24787796
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
24787735 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24787796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #259
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 48236839 - 48236790
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
48236839 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagtactttg 48236790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #260
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 589636 - 589687
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
589636 ttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 589687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #261
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 729
Target Start/End: Original strand, 2499830 - 2499866
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2499830 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 2499866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #262
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1184
Target Start/End: Original strand, 2500261 - 2500309
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
2500261 gcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcatgagcacttt 2500309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #263
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1138 - 1187
Target Start/End: Complemental strand, 3476215 - 3476164
Alignment:
1138 ttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaa 1187  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
3476215 ttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgaa 3476164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #264
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 4494113 - 4494229
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa-gagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||| |||||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
4494113 caagagacttcttatgctcaagcacaattgcaaagagacttctaatcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacagtcag 4494212  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| ||||||||    
4494213 tggtgttcacaatacaa 4494229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #265
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 5034669 - 5034729
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
5034669 ggttccttccacaatccggaggtagtcctgtcccccttggacttccaaggagaattcacta 5034729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #266
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 6867118 - 6867067
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
6867118 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 6867067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #267
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 6877750 - 6877699
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
6877750 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 6877699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #268
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 8182312 - 8182396
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
8182312 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 8182396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #269
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 729
Target Start/End: Original strand, 9069355 - 9069391
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9069355 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 9069391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #270
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9098166 - 9098118
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
9098166 tgcttctaatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactt 9098118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #271
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 9433671 - 9433722
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
9433671 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9433722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #272
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 9444267 - 9444318
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
9444267 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9444318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #273
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1184
Target Start/End: Original strand, 13648935 - 13648983
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13648935 gcttctgttgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 13648983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #274
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 13683388 - 13683428
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
13683388 aagtcttcactcctttatatagaggagtgaaagagacgttg 13683428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #275
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 13879522 - 13879606
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
13879522 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttctaaggagagttcactat 13879606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #276
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 15467710 - 15467750
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15467710 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaaagacgttg 15467750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #277
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 15704853 - 15704813
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15704853 agtctttactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 15704813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #278
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 16308349 - 16308289
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 462  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
16308349 tgctcaagcacacacgtaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagtaagagacttctaat 16308289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #279
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16314905 - 16314865
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
16314905 aagtcttcactcctttttatagaggtgtgaaagagacgttg 16314865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #280
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16316922 - 16316882
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
16316922 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttg 16316882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #281
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16317337 - 16317278
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
16317337 ggttccttccacaaacaggaagtagtcc-gtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16317278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #282
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 352
Target Start/End: Original strand, 16464376 - 16464461
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    |||||||||| ||| |||| || |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
16464376 aaagacacaaagcaattatactagttccttccataatctggaagtagtccagtcccccttgcaattccaaggaga--tcactataatc 16464461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #283
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19237818 - 19237758
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
19237818 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaatgagagttcacta 19237758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #284
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 20990060 - 20990111
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
20990060 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 20990111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #285
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 21002901 - 21002850
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
21002901 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 21002850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #286
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 21381792 - 21381752
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21381792 agtctccactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21381752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #287
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 21692081 - 21692121
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
21692081 aagtcttcactcctttatatagtggtgtgaaagagacgttg 21692121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #288
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 23264484 - 23264433
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
23264484 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 23264433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #289
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 24930496 - 24930445
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
24930496 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 24930445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #290
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 729
Target Start/End: Original strand, 28408832 - 28408868
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28408832 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 28408868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #291
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29936128 - 29936069
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
29936128 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 29936069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #292
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 30025698 - 30025738
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
30025698 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 30025738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #293
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 33605478 - 33605518
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
33605478 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagacacgttg 33605518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #294
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 37344607 - 37344658
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
37344607 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 37344658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #295
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 2499651 - 2499690
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2499651 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 2499690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #296
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 2913542 - 2913495
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
2913542 cttctgatgaacttgcttttgatgacgtcattacttcaggagcacttt 2913495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #297
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1016 - 1159
Target Start/End: Complemental strand, 4412013 - 4411870
Alignment:
1016 acttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    |||| |||||| ||||||||| | ||| |||| | || ||| | ||| |||||||||| | |||||||  ||| |  |||||||||||||||||| ||||    
4412013 acttctccagtcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaaactttaagttcaatctccagatgaactgcagcttctggtgat 4411914  T
1116 ttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
         ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
4411913 aaacagcttctgatgaatttgcttctaatgaacttgcttctgat 4411870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #298
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 4821098 - 4821137
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
4821098 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 4821137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #299
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 8182544 - 8182583
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
8182544 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 8182583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #300
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10883714 - 10883675
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
10883714 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 10883675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #301
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 11015575 - 11015614
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
11015575 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 11015614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #302
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 11319020 - 11319059
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
11319020 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 11319059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #303
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12222977 - 12222922
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactcta 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||||    
12222977 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttaacaatacaaaacaatttagactcta 12222922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #304
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13027521 - 13027406
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
13027521 caagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 13027422  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||  |||||||    
13027421 ggtgttcataatacaa 13027406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #305
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 13034204 - 13034169
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13034204 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 13034169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #306
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13034381 - 13034342
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13034381 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13034342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #307
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13261157 - 13261118
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13261157 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13261118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #308
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 901 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 13894154 - 13894020
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  || |||| |||| || ||||| | |||| | ||| |||||| ||||||| ||||  |    
13894154 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgc-tttttaaagaacaaacattcaatgccttcaaatccttttga 13894056  T
1001 aatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    | ||| |||||||||||| |||  || |||||||||    
13894055 attagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaat 13894020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #309
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 14187304 - 14187343
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14187304 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14187343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #310
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 14425070 - 14425109
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14425070 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14425109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #311
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 14426161 - 14426200
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14426161 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14426200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #312
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Original strand, 14426341 - 14426380
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
14426341 agtcttcactcctttatatggaggtgtgaaagagacgttg 14426380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #313
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 15467530 - 15467569
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15467530 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 15467569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #314
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15705032 - 15704993
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15705032 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 15704993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #315
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 16105341 - 16105306
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16105341 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 16105306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #316
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 16112506 - 16112392
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
16112506 caagagacttctactgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 16112407  T
545 gtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||| |||||    
16112406 gtggtgttcacaata 16112392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #317
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16315082 - 16315043
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
16315082 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 16315043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #318
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19193306 - 19193356
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
19193306 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 19193356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #319
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19711556 - 19711517
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19711556 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 19711517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #320
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21211326 - 21211267
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
21211326 gttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttgcaaggagagttcacta 21211267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #321
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21381972 - 21381933
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21381972 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21381933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #322
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22579758 - 22579719
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22579758 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22579719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #323
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 352
Target Start/End: Original strand, 23125356 - 23125423
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 352  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||    
23125356 tggttccttccacaatccggaagtagtccaatctcacttgcacttccaaggggattttcactataatc 23125423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #324
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 23280504 - 23280465
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
23280504 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 23280465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #325
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Original strand, 24788347 - 24788394
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
24788347 gcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 24788394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #326
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24795258 - 24795219
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
24795258 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 24795219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #327
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 27871331 - 27871370
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
27871331 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 27871370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #328
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 29935888 - 29935849
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
29935888 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 29935849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #329
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 30945903 - 30945864
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
30945903 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 30945864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #330
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 33692245 - 33692206
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
33692245 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 33692206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #331
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41843206 - 41843147
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
41843206 gttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 41843147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #332
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 44466446 - 44466529
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
44466446 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 44466529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #333
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Original strand, 331003 - 331089
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 350  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
331003 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctggcacttccaaggagagttcactataa 331089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #334
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 2499424 - 2499498
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
2499424 aagcatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagttcacta 2499498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #335
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 2501409 - 2501363
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
2501409 atcttcaagtattcattcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 2501363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #336
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2914231 - 2914114
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||| |    
2914231 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatta 2914132  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
2914131 gtggtgttcacaatacaa 2914114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #337
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 4493927 - 4494009
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
4493927 aaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtattcctgtcccccttgcacttcaaaggagagttcacta 4494009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #338
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1183
Target Start/End: Original strand, 5685926 - 5685960
Alignment:
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5685926 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 5685960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #339
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 729
Target Start/End: Original strand, 11015743 - 11015785
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
11015743 atcttcatgtcttcactcctttatatagaggtatgaaagagac 11015785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #340
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 13172725 - 13172679
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
13172725 atcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtgagagatacgttg 13172679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #341
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Original strand, 13682725 - 13682786
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
13682725 ttgcttctgatgaacttctgcttctaatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 13682786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #342
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 15087925 - 15087987
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
15087925 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactat 15087987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #343
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16310712 - 16310630
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
16310712 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcaattccatggagagttcacta 16310630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #344
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 694 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 16556953 - 16556915
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
16556953 agtctacactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 16556915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #345
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 694 - 732
Target Start/End: Original strand, 16608709 - 16608747
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
16608709 agtctacactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 16608747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #346
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 18056623 - 18056577
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
18056623 atctccaagtcttcactcctttatatagacgtgtgaaagagaagttg 18056577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #347
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 693 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 19237401 - 19237363
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
19237401 aagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgt 19237363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #348
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19340031 - 19339969
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
19340031 ggttccttccacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 19339969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #349
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 24882331 - 24882238
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||||    
24882331 agcttctgatgaaatcttgcttctgatgaactttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcaaaggcacttgtaacttcag 24882238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #350
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30946141 - 30946079
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
30946141 ggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 30946079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #351
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 32265341 - 32265224
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |  |||||||||  |||| ||||    ||||||  |||||| |||||||||||||||    
32265341 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacccttgatatacaatca 32265242  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
32265241 gtggtgttcacaatacaa 32265224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #352
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Original strand, 33604259 - 33604333
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 339  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
33604259 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttccacttccaaggaga 33604333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #353
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35954687 - 35954625
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
35954687 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 35954625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #354
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 48237623 - 48237561
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
48237623 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagaattcactat 48237561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #355
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 1368035 - 1368087
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
1368035 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 1368087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #356
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2914394 - 2914329
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 351  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
2914394 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactataat 2914329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #357
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 9160135 - 9160187
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
9160135 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 9160187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #358
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 9170590 - 9170642
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
9170590 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 9170642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #359
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 9171391 - 9171443
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
9171391 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 9171443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #360
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10257841 - 10257765
Alignment:
292 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcac-aaagattacaa 365  Q
    |||||||||  | |||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||    
10257841 cttccacaatccagaagtagtccaaacccccttgcacttccaaggacatttttcactataatcacaaaagattacaa 10257765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #361
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13034621 - 13034560
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
13034621 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13034560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #362
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 692 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16310273 - 16310232
Alignment:
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
16310273 caagtcatcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttg 16310232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #363
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16546118 - 16546057
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
16546118 ggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16546057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #364
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 16619544 - 16619605
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
16619544 ggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16619605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #365
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 21769837 - 21769785
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
21769837 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 21769785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #366
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 29935708 - 29935675
Alignment:
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29935708 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 29935675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #367
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 454692 - 454641
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
454692 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 454641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #368
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 467474 - 467423
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
467474 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 467423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #369
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 2705505 - 2705454
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
2705505 ttgcttctgatgatcttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 2705454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #370
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 2716109 - 2716058
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
2716109 ttgcttctgatgatcttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 2716058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #371
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 8182724 - 8182764
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
8182724 agtcttcactcctttatatagaggtgcgaaagagatgttga 8182764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #372
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 8617793 - 8617844
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
8617793 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 8617844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #373
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 8628356 - 8628407
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
8628356 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 8628407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #374
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 488
Target Start/End: Original strand, 9802671 - 9802727
Alignment:
433 tgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||    
9802671 tgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 9802727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #375
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 10883538 - 10883498
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
10883538 aagtcgtcactcctttatatagagttgtgaaagagacgttg 10883498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #376
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 11096462 - 11096513
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
11096462 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 11096513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #377
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 12367113 - 12367073
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
12367113 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaatagacgttg 12367073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #378
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13138701 - 13138617
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
13138701 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaacgagagttcactat 13138617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #379
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 14187484 - 14187524
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
14187484 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagatgttg 14187524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #380
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 347
Target Start/End: Original strand, 14425926 - 14425982
Alignment:
291 ccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
14425926 ccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcacta 14425982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #381
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 15088342 - 15088382
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
15088342 aagtcttcacttctttatatagagttgtgaaagagacgttg 15088382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #382
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 17950011 - 17949960
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
17950011 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 17949960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #383
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19328792 - 19328732
Alignment:
289 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19328792 ttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19328732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #384
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21284156 - 21284096
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
21284156 gttccttccacaaaccgggagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21284096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #385
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 347
Target Start/End: Original strand, 21691751 - 21691795
Alignment:
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
21691751 cggaagtagtcctgtcccccttgaacttccaaggagagttcacta 21691795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #386
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 22089530 - 22089581
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22089530 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 22089581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #387
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 22100145 - 22100196
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22100145 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 22100196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #388
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 22579582 - 22579542
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
22579582 aagtctttactcctttatatagagttgtgaaagagacgttg 22579542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #389
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 26290244 - 26290193
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
26290244 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 26290193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #390
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1141 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 32264658 - 32264614
Alignment:
1141 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
32264658 tgatgatctttcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 32264614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #391
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 33421104 - 33421188
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
33421104 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactat 33421188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #392
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 35953051 - 35953011
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
35953051 agtctttactcctttatatagaggtgtgaaagagacattga 35953011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #393
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 38593629 - 38593578
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
38593629 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcact 38593578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #394
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 39284929 - 39284889
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
39284929 aagtcttcactcctatatatagaggtttgaaagagacgttg 39284889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #395
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39285286 - 39285226
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
39285286 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtctcccttccacttccaaagagagttcacta 39285226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #396
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 48806662 - 48806384
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat--aatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caa 382  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||  |   |||||||||||||||||||||  |      
48806662 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaagaggagttcactatgtaatatct--gattacaaatgctcaatactaaactt 48806565  T
383 aatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 481  Q
    | ||||||||||||   || || |||||||||   ||||||| ||||| ||||||  | || | | ||||||||||||| |||||||||||    |||||    
48806564 agtatgagacttca---aattgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacattatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaag 48806468  T
482 agacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| |  ||||||| |  ||||  |||  | ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
48806467 agacttcttaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgatgttgaacacttgatatacaagcagtggtgttcacaatacaa 48806384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #397
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 1292644 - 1292683
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
1292644 ttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaa 1292683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #398
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 1878802 - 1878763
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
1878802 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacagtacaa 1878763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #399
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2266059 - 2266020
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2266059 ttgaacatttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 2266020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #400
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 6044105 - 6044055
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
6044105 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 6044055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #401
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 11572860 - 11572686
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  |||||||| |||  | |||||| |||||| | ||||||||     
11572860 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaatcacaaaagcaagacacttctaaacaaacaaa- 11572762  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactct 577  Q
     |||| | || ||||||||  ||||||| ||||||   ||||||| | |||| |||| ||| |||||  |||||||    
11572761 ttacacataaataagtttggtttgaacaattgataataaatcagttgagttcacaatgcaaaacaattcagactct 11572686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #402
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13138440 - 13138401
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
13138440 ttgaacacatgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13138401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #403
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13173132 - 13173065
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||| ||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
13173132 tggttcattccacaatctggaagaagtccactcccccttgcacttccaaggatagttcactaaaatca 13173065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #404
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 558
Target Start/End: Original strand, 13879785 - 13879820
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
13879785 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 13879820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #405
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 15888204 - 15888154
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
15888204 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcccttcagaagcactt 15888154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #406
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16105509 - 16105470
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
16105509 ttgaacacttgatatacaatgagtggtgttcacaatacaa 16105470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #407
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1138 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 16542955 - 16542908
Alignment:
1138 ttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
16542955 ttctgatgaactttcttctgatgacgtcaccacttcaagagcactttg 16542908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #408
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 18361937 - 18361894
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 736  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
18361937 aagtctttactcctttatatagaagtatgaaagagacgttgaga 18361894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #409
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19339792 - 19339753
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
19339792 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcataatacaa 19339753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #410
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 21691945 - 21691984
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
21691945 ttgaacacttgaaatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21691984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #411
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22579978 - 22579903
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
22579978 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactat 22579903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #412
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23280748 - 23280673
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
23280748 aagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttactat 23280673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #413
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 41842633 - 41842598
Alignment:
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
41842633 ttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttg 41842598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #414
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 41843044 - 41842941
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||| || |||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
41843044 caagagacttcttatcctcaagcacagctgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 41842945  T
547 ggtg 550  Q
    ||||    
41842944 ggtg 41842941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #415
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 48382569 - 48382619
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
48382569 tgcttctgatgaacttttgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 48382619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #416
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 1878616 - 1878570
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
1878616 atcttcaagtcttcattcctttatatagagatatgaaagagatgttg 1878570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #417
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2266296 - 2266234
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2266296 ggttccttccacaaaccggaagtcagccttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2266234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #418
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 7488448 - 7488418
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
7488448 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 7488418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #419
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 9069134 - 9069196
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
9069134 ggttctttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 9069196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #420
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9710586 - 9710524
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
9710586 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactat 9710524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #421
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 11572572 - 11572526
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
11572572 atcttcaaggcttcatttctttatatagaggtatgaaagagacgttg 11572526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #422
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12367280 - 12367250
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
12367280 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 12367250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #423
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 524 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13473040 - 13473002
Alignment:
524 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
13473040 tgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 13473002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #424
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 915 - 1036
Target Start/End: Original strand, 13880604 - 13880725
Alignment:
915 gaggtagtggttgtac-acttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgct 1013  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  || |||| |||||||| ||   || ||| |||||||| ||| ||||||| ||||  || |||||||||||    
13880604 gaggtagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaag-aacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgct 13880702  T
1014 tcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||    
13880703 tcactcttctagtcttctgcaat 13880725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #425
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 348
Target Start/End: Original strand, 15467316 - 15467354
Alignment:
310 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15467316 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagaattcactat 15467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #426
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16315343 - 16315262
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||    
16315343 aaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtagtcatg-cccccttgcacttccaaggagaattcacta 16315262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #427
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 553
Target Start/End: Original strand, 16411617 - 16411647
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
16411617 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 16411647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #428
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 732
Target Start/End: Original strand, 16411783 - 16411825
Alignment:
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
16411783 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtatgtgagagacgtt 16411825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #429
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 16412523 - 16412569
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||    
16412523 atcttcaagtcttcattcctttatatagaggaattaaagagacgttg 16412569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #430
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16557371 - 16557309
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
16557371 ggttccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcactat 16557309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #431
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 16608291 - 16608353
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
16608291 ggttccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcactat 16608353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #432
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 468
Target Start/End: Original strand, 20094640 - 20094706
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaa 468  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||    
20094640 tgctcaagcacacaaacaagagtctttcaatgctcgagcacacaagcaatagacttctaatactcaa 20094706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #433
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 25201475 - 25201426
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
25201475 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcact 25201426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #434
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Original strand, 30049944 - 30049993
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
30049944 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacctcatcacttcagaagcact 30049993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #435
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1180
Target Start/End: Complemental strand, 31116405 - 31116356
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
31116405 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcaaaagca 31116356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #436
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1143 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 33691640 - 33691598
Alignment:
1143 atgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
33691640 atgaacttgcttctgataacgtcaccacttcaggagcactttg 33691598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #437
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1180
Target Start/End: Original strand, 167289 - 167337
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
167289 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagca 167337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #438
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1180
Target Start/End: Original strand, 177881 - 177929
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
177881 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagca 177929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #439
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1151 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 2265456 - 2265423
Alignment:
1151 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2265456 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 2265423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #440
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 8933924 - 8933976
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
8933924 cttgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 8933976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #441
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 516 - 553
Target Start/End: Original strand, 9065113 - 9065150
Alignment:
516 gtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
9065113 gtttgaattgaacacttgatatacaatcagtgatgttc 9065150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #442
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9261638 - 9261605
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
9261638 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 9261605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #443
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Original strand, 9802571 - 9802624
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc 321  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||    
9802571 agacacaaacaattatcctggttgcttccataatccggaagtagtccagtcccc 9802624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #444
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12367533 - 12367460
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||   |||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||||||    
12367533 aagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtagttatgtcccccttgcacttccaaggaaagttcacta 12367460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #445
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 880 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 13260792 - 13260735
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    ||||||||||||||   |||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
13260792 tcttgtcttgtagcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgt 13260735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #446
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15705291 - 15705218
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaagga 337  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
15705291 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaagga 15705218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #447
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 523 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 16317099 - 16317070
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgtt 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
16317099 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgtt 16317070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #448
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 17960599 - 17960566
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
17960599 tgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 17960566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #449
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 19985706 - 19985654
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
19985706 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatcacgtcatctcttcagaagcactt 19985654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #450
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 20491431 - 20491464
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20491431 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 20491464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #451
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 26209445 - 26209393
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
26209445 cttgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 26209393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #452
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 29590396 - 29590448
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
29590396 cttgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 29590448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #453
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 30944277 - 30944228
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||    
30944277 gcttctgatgaacgtgcttctgatggcttcaccacttcaggagcactttg 30944228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #454
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 44280921 - 44280954
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
44280921 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 44280954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 639; Significance: 0; HSPs: 366)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 639; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 35012289 - 35013085
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
35012289 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatactttttctgataaaacttcataagcaatttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 35012387  T
233 cagcggaaag-aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35012388 cagcggaaaggaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 35012487  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
35012488 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 35012587  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
35012588 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 35012687  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35012688 tgatatacaatcagtggtgttc-----acaatacaataaggactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 35012782  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35012783 tagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaaattgtatatctctatattttatctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 35012882  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
35012883 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 35012982  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35012983 aaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 35013082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 622; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 51630065 - 51629231
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaa--aattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   || ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
51630065 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaatcttcagaagcagactgagagtg 51629966  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51629965 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 51629866  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
51629865 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac 51629766  T
403 --tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
51629765 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 51629666  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgta 600  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
51629665 aatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgta 51629566  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||  ||||||||||||    
51629565 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact--tatgtatctctatcttaaatcttcaagtct 51629468  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
51629467 tcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcct 51629368  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
51629367 gatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaga 51629268  T
899 ca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51629267 cagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 51629231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 613; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 47619417 - 47618582
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||    
47619417 atgaaggttagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagattgagagt 47619318  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47619317 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 47619218  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
47619217 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 47619119  T
402 c--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
47619118 caatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 47619019  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgt 599  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
47619018 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgt 47618919  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
47618918 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctatcttatcttcaagtctt 47618819  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
47618818 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctg 47618719  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
47618718 atttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaga 47618619  T
899 ca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47618618 cagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 47618582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 611; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 51657327 - 51656492
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaa--aattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   || ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
51657327 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaatcttcagaagcagactgagagt 51657229  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51657228 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 51657129  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
51657128 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaa 51657029  T
401 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
51657028 acaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 51656929  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
51656928 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatg 51656829  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagt 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||  ||||||||||    
51656828 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact--tatgtatctctatcttaaatcttcaagt 51656731  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
51656730 cttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgc 51656631  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
51656630 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgta 51656531  T
897 gaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51656530 gacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 51656492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 608; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 19187201 - 19188001
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
19187201 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatactttttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 19187297  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19187298 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19187397  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
19187398 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19187497  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
19187498 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 19187597  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19187598 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 19187697  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19187698 tagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctcacttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 19187797  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
19187798 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagtaagcttc 19187897  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
19187898 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 19187997  T
931 actt 934  Q
    ||||    
19187998 actt 19188001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 47608778 - 47607974
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47608778 ttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagattgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 47608679  T
233 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47608678 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 47608579  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
47608578 aaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 47608480  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
47608479 aatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 47608380  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47608379 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 47608280  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
47608279 gtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 47608180  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
47608179 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaactt 47608080  T
831 caaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
47608079 caaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 47607980  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
47607979 acactt 47607974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 604; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 19178322 - 19179122
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
19178322 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 19178418  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19178419 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19178518  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
19178519 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19178618  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
19178619 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 19178718  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19178719 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 19178818  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19178819 tagaatcaaattgacagagttttgacgctttttaacttgtgtatctctcacttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 19178918  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
19178919 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagtaagcttc 19179018  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
19179019 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 19179118  T
931 actt 934  Q
    ||||    
19179119 actt 19179122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 4177278 - 4178078
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
4177278 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 4177374  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4177375 cagtggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 4177474  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
4177475 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 4177574  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
4177575 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 4177674  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
4177675 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 4177774  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
4177775 tagaatcaaattgacagagttttggtgcttttgaacttatgtatctctctcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 4177874  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
4177875 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 4177974  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
4177975 aaattcattcccatcttgaacgtacaaattttgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 4178074  T
931 actt 934  Q
    ||||    
4178075 actt 4178078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 5973144 - 5973926
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
5973144 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 5973243  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5973244 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 5973343  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
5973344 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcactaagcaagagtctt 5973443  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
5973444 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatgcaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 5973543  T
558 tacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
5973544 tacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 5973643  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag------ataatcagcacgtct 750  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      ||||| |||||||||    
5973644 cgctttttaacttgtgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattataattagcacgtct 5973743  T
751 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5973744 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 5973843  T
851 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
5973844 aggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggcagtggttgtacactt 5973926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 585; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 3171008 - 3171786
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3171008 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 3171107  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
3171108 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-g 3171206  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3171207 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 3171306  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
3171307 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 3171406  T
557 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
3171407 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 3171506  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3171507 cgcttttgaacttgcgtatattcctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 3171606  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 855  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
3171607 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 3171706  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3171707 caacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 3171786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 585; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 3181610 - 3182388
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3181610 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 3181709  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
3181710 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-g 3181808  T
359 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3181809 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 3181908  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
3181909 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 3182008  T
557 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
3182009 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 3182108  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3182109 cgcttttgaacttgcgtatattcctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 3182208  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 855  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
3182209 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 3182308  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3182309 caacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 3182388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 155109 - 154333
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
155109 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 155011  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
155010 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 154911  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
154910 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtct 154811  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
154810 tctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 154711  T
557 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
154710 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttg 154611  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
154610 gcgctttttaacttgtgtatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 154511  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
154510 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggca 154411  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
154410 caaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttatacactt 154333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 35649537 - 35648734
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
35649537 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 35649441  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35649440 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 35649341  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
35649340 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 35649241  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
35649240 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 35649141  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35649140 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 35649041  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
35649040 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 35648941  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
35648940 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 35648841  T
830 tcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
35648840 tcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttg 35648741  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
35648740 tacactt 35648734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 5832550 - 5833382
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
5832550 tgaaggttagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 5832647  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5832648 ctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 5832746  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
5832747 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 5832845  T
402 c--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
5832846 caatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 5832945  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgt 599  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
5832946 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgt 5833045  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
5833046 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctatcttatcttcaagtctt 5833145  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
5833146 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctg 5833245  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
5833246 atttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaga 5833345  T
899 ca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5833346 cagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5833382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 5843152 - 5843984
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
5843152 tgaaggttagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 5843249  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5843250 ctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 5843348  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
5843349 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 5843447  T
402 c--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
5843448 caatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 5843547  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgt 599  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
5843548 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgt 5843647  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
5843648 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctatcttatcttcaagtctt 5843747  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
5843748 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctg 5843847  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
5843848 atttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaga 5843947  T
899 ca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5843948 cagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5843984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 7690308 - 7689503
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7690308 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 7690209  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||| ||| || || ||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7690208 cagcgaaaaagatcaaagcagagaaaatagaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 7690110  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact---gctcaagcacacacgcaagagtctt 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
7690109 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactaatgctcaagcacacacgcaagagtctt 7690010  T
429 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
7690009 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaac 7689910  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgc 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7689909 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgc 7689810  T
628 tttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgt-gaaaga 726  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
7689809 tttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcatagaaaga 7689710  T
727 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 826  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7689709 gacgttgagataattagcacgtctaaagagccgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 7689610  T
827 gcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
7689609 gcttcaaattcattcacatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggtt 7689511  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
7689510 gtacactt 7689503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12898799 - 12898027
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
12898799 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcaccttgtg--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 12898703  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12898702 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 12898603  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12898602 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 12898503  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
12898502 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 12898403  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
12898402 tacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggc 12898303  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12898302 gcttttgaact--tatgtatctctgtttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 12898205  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||    
12898204 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtaca 12898105  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12898104 aattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12898027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 12729910 - 12730710
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
12729910 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgtttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12730006  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
12730007 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacgacacggaagtagttcagtcccccttgcacttc 12730106  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12730107 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12730206  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
12730207 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12730306  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12730307 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 12730406  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12730407 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctcactttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 12730506  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
12730507 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 12730606  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12730607 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 12730706  T
931 actt 934  Q
    ||||    
12730707 actt 12730710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 12740503 - 12741303
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
12740503 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgtttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12740599  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
12740600 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacgacacggaagtagttcagtcccccttgcacttc 12740699  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12740700 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12740799  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
12740800 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12740899  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12740900 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 12740999  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12741000 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctcactttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 12741099  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
12741100 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 12741199  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12741200 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 12741299  T
931 actt 934  Q
    ||||    
12741300 actt 12741303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 21863050 - 21863824
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
21863050 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagca--ctttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 21863146  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21863147 agaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 21863246  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21863247 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 21863346  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
21863347 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 21863446  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
21863447 tacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 21863546  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21863547 gcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 21863646  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||    
21863647 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtaca 21863746  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21863747 aattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaaacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21863824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 33083924 - 33084725
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
33083924 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttatgatgaaatgatcagagtcagat-tg 33084020  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33084021 cagcggaaaagaacagaacagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 33084120  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
33084121 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 33084220  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
33084221 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 33084320  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33084321 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 33084420  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
33084421 gtagaatcaaattgacagagttttggcacttttgaacttatgtatctctatctcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 33084520  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
33084521 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 33084620  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
33084621 caaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcatagacagaaaatagagtagtggaggtagtggttgta 33084720  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
33084721 cactt 33084725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 21877155 - 21877930
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
21877155 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagca--ctttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 21877251  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21877252 agaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 21877351  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21877352 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 21877451  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatc-aaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
21877452 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 21877551  T
557 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
21877552 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 21877651  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21877652 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 21877751  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 856  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
21877752 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 21877851  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21877852 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21877930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 35405205 - 35404435
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaac 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
35405205 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagac 35405108  T
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35405107 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 35405008  T
366 atgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 463  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35405007 ctgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 35404908  T
464 ctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
35404907 ctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacagt 35404808  T
564 acaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 663  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
35404807 acagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagtatcaaattgacagagttttggcgctttt 35404708  T
664 gaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 763  Q
    |||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
35404707 gaacttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagtacgtctaaagagtcgtttg 35404608  T
764 aaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattc 862  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||    
35404607 aaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattc 35404508  T
863 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35404507 tgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35404435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 10998628 - 10997828
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
10998628 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 10998532  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
10998531 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccggtcccccttgcacttc 10998432  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
10998431 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 10998332  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
10998331 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 10998232  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10998231 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 10998132  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
10998131 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 10998032  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
10998031 tgagataatcagcacttctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 10997932  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
10997931 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 10997832  T
931 actt 934  Q
    ||||    
10997831 actt 10997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12615160 - 12614360
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
12615160 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12615064  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
12615063 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttc 12614964  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12614963 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12614864  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
12614863 atgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12614764  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12614763 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaaaactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 12614664  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12614663 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 12614564  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
12614563 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 12614464  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12614463 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 12614364  T
931 actt 934  Q
    ||||    
12614363 actt 12614360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12624625 - 12623825
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
12624625 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaatcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12624529  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
12624528 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttc 12624429  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12624428 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12624329  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
12624328 atgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12624229  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12624228 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 12624129  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12624128 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 12624029  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
12624028 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 12623929  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12623928 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 12623829  T
931 actt 934  Q
    ||||    
12623828 actt 12623825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 38094437 - 38095240
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
38094437 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 38094533  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38094534 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 38094633  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
38094634 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 38094733  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
38094734 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 38094833  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38094834 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 38094933  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
38094934 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatttttctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 38095033  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
38095034 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaact 38095133  T
830 tcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
38095134 tcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttg 38095233  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
38095234 tacactt 38095240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 38105062 - 38105865
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
38105062 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 38105158  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38105159 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 38105258  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
38105259 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 38105358  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
38105359 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 38105458  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38105459 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 38105558  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
38105559 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatttttctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 38105658  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
38105659 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaact 38105758  T
830 tcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
38105759 tcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttg 38105858  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
38105859 tacactt 38105865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Original strand, 7506696 - 7507465
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
7506696 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 7506792  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7506793 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 7506892  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7506893 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 7506992  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
7506993 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 7507092  T
563 tacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttt 662  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
7507093 tacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttt 7507192  T
663 tgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgt 760  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7507193 tgaact--tatgtatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgt 7507290  T
761 ttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatat 860  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||    
7507291 ttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaat 7507390  T
861 tctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7507391 tctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7507465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Original strand, 7517293 - 7518062
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
7517293 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 7517389  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7517390 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 7517489  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7517490 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 7517589  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
7517590 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 7517689  T
563 tacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttt 662  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
7517690 tacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttt 7517789  T
663 tgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgt 760  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7517790 tgaact--tatgtatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgt 7517887  T
761 ttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatat 860  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||    
7517888 ttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaat 7517987  T
861 tctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7517988 tctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7518062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 4251389 - 4250609
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaac-cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaa 256  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
4251389 aaaaatacttcttctgataaaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaa 4251290  T
257 aagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4251289 aagaaaagcaa-gacacaagcagttatcatggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 4251191  T
357 agattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc----acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaaga 452  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4251190 agattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaaga 4251091  T
453 gacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgtt 552  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4251090 gtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgtt 4250991  T
553 ctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagt 651  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
4250990 cataatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagt 4250891  T
652 tttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtcta 751  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
4250890 tttggcgctttttaacttctgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagatgttgagataattagcacgtcta 4250791  T
752 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 851  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4250790 aagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 4250691  T
852 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4250690 ggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4250609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 5640488 - 5639754
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5640488 tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 5640390  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
5640389 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 5640290  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
5640289 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 5640190  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgt 599  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
5640189 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatat 5640090  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   |||||||||||||    
5640089 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgttttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctcttttttcaatcttcaagtctt 5639990  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
5639989 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctg 5639890  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||    
5639889 atttgggtgtagtcctttgaagaatacgcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagac 5639790  T
900 a-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5639789 agaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5639754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 36247822 - 36247021
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
36247822 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 36247726  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36247725 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36247626  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
36247625 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 36247526  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
36247525 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 36247426  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36247425 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 36247326  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
36247325 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttctgtatttctctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagac 36247226  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
36247225 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaatt 36247126  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
36247125 tcaaattccttcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 36247027  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
36247026 acactt 36247021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 36237249 - 36236474
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
36237249 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 36237153  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36237152 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 36237053  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36237052 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 36236953  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36236952 ttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 36236853  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
36236852 aatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 36236753  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36236752 gcgctttttaacttctgtatttctctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 36236653  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||  | |    
36236652 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaatttcaaattccttcccatcttgagtgta 36236553  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36236552 ca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36236474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 5651078 - 5650311
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
5651078 cttcttctgaaaaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 5650982  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5650981 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 5650882  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 464  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5650881 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 5650782  T
465 tcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaata 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
5650781 tcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaata 5650682  T
565 caataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttg 664  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
5650681 cagtaaagaccctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttg 5650582  T
665 aacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttga 764  Q
    ||||| | ||| ||| | |   |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5650581 aacttatgtatctcttttttcaatcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttga 5650482  T
765 aatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctg 864  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
5650481 aatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatacgcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctg 5650382  T
865 caggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5650381 caggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5650311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20442193 - 20441361
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |    
20442193 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgagaat 20442094  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
20442093 gcttctgatgtaatgataagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaagcaa-gacaaaagcagttatcctggttccttccacaa 20441995  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
20441994 atcggaagtagtccactcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 20441895  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
20441894 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttataatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 20441795  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20441794 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaaaatacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgt 20441695  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||||||    
20441694 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggtgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtctt 20441595  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
20441594 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgataagcacgtctaaagagtcg-ttgaattcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctg 20441496  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
20441495 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgtaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggac 20441396  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20441395 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20441361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 35638881 - 35638082
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||| ||||| || ||   | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
35638881 ttgaattgtgttttcttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcataatcag--tttgattgcttctgataaaatgatcagagtcagat-tgc 35638785  T
234 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
35638784 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttcc 35638685  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35638684 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 35638585  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacactt 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
35638584 tgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat-cagagaattgagtttgaattgaacactt 35638486  T
533 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 632  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35638485 gatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagacttttaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 35638386  T
633 agaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
35638385 agaatcaaattgaccgagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgtt 35638286  T
733 gagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttca 832  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
35638285 gagataatcagcaggtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttca 35638186  T
833 aattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35638185 aattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 35638086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 2537898 - 2538698
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
2537898 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 2537994  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2537995 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 2538094  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
2538095 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 2538193  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
2538194 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 2538293  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
2538294 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcta 2538393  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
2538394 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctatattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 2538493  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
2538494 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaataagct 2538593  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| |  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
2538594 tcaaattcattcccatcttgagtgtaca-aaactgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 2538692  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
2538693 acactt 2538698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 39194916 - 39194138
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
39194916 aaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 39194817  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttcc-ttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
39194816 agaaaagcaa-gacacaaacagttatcctggttcccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccagctagatttcactacaatcacaa 39194718  T
357 agattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 454  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
39194717 agattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagt 39194618  T
455 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttct 554  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
39194617 cttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttca 39194518  T
555 caatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttt 653  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
39194517 caatacaatacgttagagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttt 39194418  T
654 tggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 753  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
39194417 tggcgctttttaacttgtatatatctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaa 39194318  T
754 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
39194317 gagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 39194218  T
854 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39194217 cacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39194138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18382780 - 18381948
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||   || || |    
18382780 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatatttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 18382681  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
18382680 gcttctgatgtaacgaccagaatcagatatgcagcggaaatgatcaaagcagagaaaataagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 18382582  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
18382581 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 18382482  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac-aa 499  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
18382481 a-tgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 18382383  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt--tgaatttctaagat 597  Q
    | |||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
18382382 aaatacagggaaacatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactttagactttgtgaatttctaagat 18382283  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtc 697  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | |  ||||||||||    
18382282 atatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctatattcttcaagtc 18382183  T
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcc 797  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
18382182 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattaacacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccactagtaatcctttgcc 18382084  T
798 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
18382083 tgatttggatgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtag 18381985  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18381984 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18381948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 17956571 - 17957402
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||    
17956571 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgct 17956670  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |    
17956671 tctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaaacagttatcctagttccttccacaaatc 17956769  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
17956770 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 17956869  T
404 gctc-aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaga 502  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
17956870 gctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctgttcaaacaaaaa 17956969  T
503 tacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc-aatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgt 599  Q
    |||||||||  | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
17956970 tacagagaa-aatgtttgatcttgaatacttgatatacaatcagtggtgttcacaaatacaatgtaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgt 17957068  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc-ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||| | ||  ||||||||||||    
17957069 atcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagggttttggcgcttttttaacttgtatgtctctatctccaatcttcaagtct 17957168  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
17957169 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaaatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcttccaccagtaattctttgcct 17957267  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||    
17957268 gatatgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatggttgttttcttgtcttgtagtgtaga 17957366  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
17957367 caaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacactt 17957402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 314 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 148879 - 148258
Alignment:
314 cagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagca 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  ||||||||||    
148879 cagtcctccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagca 148780  T
413 cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaat 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||    
148779 cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaat 148680  T
513 taagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtg 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
148679 taagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtg 148580  T
612 cagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttata 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
148579 cagaaattcagtgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttata 148480  T
712 tagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtag 811  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
148479 tagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaattctttgcctgatttgggtgtag 148380  T
812 tcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagta 911  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
148379 tcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagta 148281  T
912 gtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
148280 gtggaggtagtgattgtacactt 148258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 39586301 - 39587132
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||   |||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | |    
39586301 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttgaaaat 39586400  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
39586401 gcttttgatgtaatgaccataatcaaatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaaccagttatcctggttcattccataa 39586499  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
39586500 aacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 39586599  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
39586600 a-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttttaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttatgatcaaacaaa 39586698  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     ||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
39586699 aataccatgaaataagtttgatttgaacacttgatatactatcagtggtgttcacaatacaatacgatacagactctagacttttgaatttctaagatat 39586798  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |    ||||||||||||    
39586799 atcaaattagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacattcttcaagtctt 39586898  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
39586899 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctg 39586997  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
39586998 atttgagtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtgga 39587096  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39587097 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39587132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 385 - 934
Target Start/End: Original strand, 4166872 - 4167422
Alignment:
385 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaga 484  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4166872 tatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaga 4166971  T
485 cttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt 584  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
4166972 cttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagacttt 4167071  T
585 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatc 684  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |     
4167072 gaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggtgcttttgaacttatgtatctctctctt 4167171  T
685 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
4167172 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccacca 4167271  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttg 884  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||| |||    
4167272 gtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctattgttttg 4167371  T
885 tcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4167372 tcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4167422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20196537 - 20195737
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
20196537 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctgattaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 20196438  T
235 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
20196437 gcggaataaaatagagcagagaaaagaaaagtga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 20196339  T
334 aggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
20196338 aggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaa 20196240  T
433 tgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaga-tacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| | |||||||||  | |||||| ||||||||    
20196239 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaaatacagagaaa-atgtttgaattgaacac 20196141  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
20196140 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctt 20196041  T
630 tgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    | ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
20196040 tttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgtgaaaga 20195942  T
727 gacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatta 826  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
20195941 gacgttgagatttt-agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatca 20195844  T
827 gcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
20195843 acttcaaattcattcccatcttgatggaaca-attctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggtt 20195745  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
20195744 gtacactt 20195737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 447 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 23580857 - 23580370
Alignment:
447 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
23580857 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 23580759  T
547 ggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgac 646  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23580758 ggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgac 23580659  T
647 agagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcac 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
23580658 agagttttggcgcttttgaacttgtatatctctatctcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcac 23580559  T
747 gtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatc 846  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
23580558 gtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatc 23580459  T
847 ttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23580458 ttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 23580370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 142 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 11195908 - 11195111
Alignment:
142 attgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg 238  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |  ||  |||||| |||   || ||||||||||||| |||||||    
11195908 attgtgttttctttttctctaaaaaatcttcttctgataacacttcagaagcagattaggaaagcttctaatgtggtgttcagaatcagatacgcagcgg 11195809  T
239 aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 338  Q
    | | ||||||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11195808 ataaaacagagcagagaaaagaaagcga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 11195711  T
339 attt-cactataa-tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgct 436  Q
    |||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
11195710 attttcattaaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgat 11195612  T
437 caagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttga 534  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
11195611 caagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaa-atgtttgactttgaacacttga 11195513  T
535 tatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta 633  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
11195512 tatactatcagtggtgttatcaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttatgagaagtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgcttttta 11195413  T
634 gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
11195412 gaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttaccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 11195314  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||    
11195313 ttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttgagtgtagtcctttgaaggatcaactt 11195214  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
11195213 caaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtaatggttgtac 11195115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 406 - 934
Target Start/End: Original strand, 47194896 - 47195424
Alignment:
406 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatac 505  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
47194896 tcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatac 47194995  T
506 agagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaa 604  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
47194996 aatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatatatcaa 47195095  T
605 atcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactc 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |    |||||||||||||||||    
47195096 atcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctacattcttcaagtcttcactc 47195195  T
705 ctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttg 804  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
47195196 ctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatccttcgcctgatttg 47195294  T
805 ggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa 903  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||    
47195295 ggtgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaa 47195393  T
904 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
47195394 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 47195424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 674808 - 675609
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||   ||| |||||| |  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
674808 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtattactttagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgc 674907  T
234 agcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
674908 agcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 675005  T
333 aaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    ||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||    
675006 aaggagatttccacaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcc 675102  T
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||| | ||  | ||||||||| ||||    
675103 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaacgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacataaa-atgtttgactttgaac 675201  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgc 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
675202 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaattagtgcagaaattcaaagtgc 675301  T
628 tttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa- 723  Q
    ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |     
675302 tttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactgctttatatagaggtgagtag 675400  T
724 agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaa 823  Q
    | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
675401 aaagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaagga 675499  T
824 ttagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtg 923  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
675500 tcaacttcaaattcattcccattttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtg 675598  T
924 gttgtacactt 934  Q
    |||||||||||    
675599 gttgtacactt 675609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 198 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 14388910 - 14388170
Alignment:
198 gagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 296  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||| ||||    
14388910 gagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttcattcc 14388813  T
297 acaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagactt 394  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
14388812 acaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagactt 14388713  T
395 cacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga-t 492  Q
    | ||||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |    
14388712 ctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttcttaat 14388614  T
493 caaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaattt 590  Q
    |||||| |  |||| | ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
14388613 caaacagaattacacaaaaa-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaattt 14388515  T
591 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca-gtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatctta 687  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||  |  |    
14388514 ctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttgtaatcaagtttggcagagttttagcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaa 14388416  T
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagt 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
14388415 tcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagt 14388317  T
787 agtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtc 886  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
14388316 aatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtc 14388218  T
887 ttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
14388217 ttgtagcgtagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14388170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18311850 - 18311016
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      ||| || |||||||||| ||   |||||||||| |  || |||||    
18311850 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctttaagaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgagagtg 18311751  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||  ||||||||||||     
18311750 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctaattccttccacaaa 18311653  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
18311652 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 18311553  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||    
18311552 aa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaaca 18311454  T
499 aagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaaga 596  Q
     |  |||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||| |||||    
18311453 taattacacagaaa-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaggactctaaacttaagaatttttaaga 18311355  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttca 693  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||  |  |||||||    
18311354 tatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggtgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttca 18311256  T
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcct 792  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||| || |    
18311255 agtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagtttctttgatcattcaccagtaatctt 18311157  T
793 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtag 892  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
18311156 ttgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggtagagctgttgtcttgtcttgtag 18311058  T
893 cgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
18311057 cgtagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18311016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 181 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 41133416 - 41132659
Alignment:
181 cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag 279  Q
    |||||||||| |  || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||     
41133416 cttcagaagctagttgggagtacttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaa 41133319  T
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatact 377  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
41133318 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatact 41133219  T
378 atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcag 476  Q
     || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
41133218 ctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 41133122  T
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagat---acagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaag 572  Q
    || |||||||||| |||||||| | ||   ||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
41133121 gcgagagacttctaatcaaacataaattacacagaaaatt--gtttgactttgaactcttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaag 41133024  T
573 actctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttg 670  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
41133023 actctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttg 41132925  T
671 tat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaa 766  Q
    | |  ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | | ||| |||||||||||| || ||      
41132924 tgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagattttaaagcatgtctaaagagtcatt-gagt 41132826  T
767 tcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 866  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||    
41132825 tcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccattttgaaggaacag-ttctgca 41132727  T
867 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
41132726 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacactt 41132659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9051036 - 9050532
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||    
9051036 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagagaaatatttttgacttgaaca 9050937  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaa-tacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgc 627  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
9050936 cttgatatacaatcagtggtgttcacaaatacaatgtaattatgactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgc 9050837  T
628 tttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 727  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
9050836 tttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaagtgtgaaagag 9050737  T
728 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattag 827  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
9050736 acgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgaattcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaaatag 9050638  T
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
9050637 cttcaaattcattaccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 9050539  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
9050538 tacactt 9050532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22610757 - 22610018
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
22610757 tgcttctgatgtgatgttcataatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctcgttccttccac 22610660  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagac 392  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||    
22610659 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactttctag-tatgagac 22610561  T
393 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga 491  Q
    ||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
22610560 ttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaggagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaa 22610463  T
492 tcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaattt 590  Q
    ||||||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
22610462 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaattt 22610363  T
591 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatctta 687  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  |    
22610362 ctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaa 22610264  T
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagt 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||    
22610263 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccatcagt 22610165  T
787 agtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtc 886  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||| | ||| || |  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||||    
22610164 aatcttttgcctgatttgagtgtagtcctataaaggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatattgtc 22610066  T
887 ttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||| |||||    ||| || |||||||||||||||||||||||    
22610065 ttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 22610018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 532 - 934
Target Start/End: Original strand, 21894963 - 21895365
Alignment:
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21894963 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 21895062  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
21895063 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatatat--ctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 21895160  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
21895161 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 21895260  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
21895261 caaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 21895360  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
21895361 cactt 21895365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 108 - 565
Target Start/End: Original strand, 7677173 - 7677637
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||||     ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||   || || |    
7677173 tgaaggtgagaaaaacacaaaaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgagaat 7677272  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcct-ggttccttccaca 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
7677273 gcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcattggttccttccaca 7677371  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
7677372 aaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacgaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 7677471  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
7677472 aaatgctcaaacacacacgcaagagttttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaa 7677571  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatac 565  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
7677572 aaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatac 7677637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 579 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 35401565 - 35401208
Alignment:
579 gactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtc 678  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
35401565 gactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatc 35401466  T
679 tctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcat 778  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
35401465 tctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagtacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattat 35401366  T
779 ccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgt 877  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||    
35401365 ccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgt 35401266  T
878 tgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35401265 tgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35401208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 138 - 583
Target Start/End: Original strand, 12944571 - 12945020
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||   |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
12944571 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttctaataatacgtcagaagcaggttaggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgc 12944670  T
234 agcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
12944671 agcagaataaaacagagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 12944768  T
333 aaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||| ||| ||    
12944769 aaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tactcaagcacgcaggcaagagacttaca 12944867  T
432 atgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
12944868 atgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaacac 12944967  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt 583  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
12944968 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagactt 12945020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 138 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 23581140 - 23580816
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
23581140 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagattcagat-tg 23581044  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23581043 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 23580944  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
23580943 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttcca 23580844  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
23580843 atgctcaagcactaagcaagagacttct 23580816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 268 - 934
Target Start/End: Original strand, 23926421 - 23927096
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagatt 361  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||    
23926421 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 23926520  T
362 acaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||||  |  | ||||||||||| |||   |||||||| || || ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||     
23926521 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttctcaat--tgctcaaggacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 23926618  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
23926619 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacagt 23926718  T
559 acaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttga-cagagttttg 655  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  || | ||||||||||    
23926719 acaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttagcagagttttg 23926818  T
656 gcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaa 752  Q
     ||||||| ||||||| |  || ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||| ||    
23926819 acgctttt-aacttgtgttgatatctctatcag-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtccaa 23926916  T
753 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 852  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| || |  ||||||| |||||| |||||||||    
23926917 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaag 23927015  T
853 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
23927016 gaacat-ttctgtaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacatactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 23927096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 5928935 - 5929741
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||   ||||||||||    || ||||||||||||||  ||| ||| |||| |||| ||    
5928935 ttgaattgtgttttctttttctcctaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgcttctgatgtgatgttcaaaatctgatacgc 5929034  T
234 agcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    |||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
5929035 agcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggtttcttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttc 5929132  T
332 caaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 425  Q
    ||||||||||| |||||     |||||||| |||||| || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||     
5929133 caaggagattttcactaagaaataatcacacagatta-aactgctcaatactacctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagaga 5929228  T
426 cttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-ct 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| | ||    ||||||  |    
5929229 cttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacaaaaaattgtttgagtt 5929328  T
524 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattc 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   |||||||||    
5929329 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattc 5929428  T
621 agtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgt--atatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagagg 717  Q
    |  |||||||  |||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
5929429 acagtgcttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtaatgtctcta-gtgatcttcaagtcttcattcctttatatagggg 5929526  T
718 tgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctt 816  Q
    |||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||| |  | |||||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| |||||     
5929527 tgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagaaaccttgatca-ataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtccta 5929624  T
817 tgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtgga 916  Q
    ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
5929625 tgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctggtgtcttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtgga 5929723  T
917 ggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||    
5929724 ggtagtggttgtacactt 5929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 46181429 - 46180923
Alignment:
431 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||    
46181429 aatgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 46181330  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgc 627  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
46181329 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 46181230  T
628 tttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa- 723  Q
    |||  |||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||  | |     
46181229 ttttgagaatcaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctct-tgatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtaagtag 46181132  T
724 agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaa 823  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
46181131 agagacgttgagatctttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaagga 46181033  T
824 ttagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtg 923  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||| |  ||| || ||||||||||||    
46181032 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaagacacactcagggtcgtggaggtagtg 46180934  T
924 gttgtacactt 934  Q
    |||||||||||    
46180933 gttgtacactt 46180923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20884412 - 20883926
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 549  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20884412 agagaattccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 20884313  T
550 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgac 646  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||| |    
20884312 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttggc 20884213  T
647 agagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 743  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||   | ||    
20884212 agagttttggcgctttt-aacttgtgttgatttctctacca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagacttttag 20884115  T
744 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 843  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
20884114 cacgtccaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatctgttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 20884016  T
844 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||| | | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| || |||||||||||||    
20884015 atcttgaaggaaga-attctgctggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagctaatggttgtacactt 20883926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Original strand, 35039964 - 35040415
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||   |||||||||  ||||| | |||    
35039964 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatggtc 35040060  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
     |||| ||||| | | | | ||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| || |  | |||||||| |||| || | |||||||||    
35040061 ttttgtctgatatagttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacgtcgt-tgcaggcagagctttttttcttgtcttg 35040159  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||    
35040160 tagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gaagatcaagcatccaatgctttca 35040258  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
35040259 aatcctttcaaaatagtcgttgctttacttttctagtcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagccttaagttgcatcc 35040358  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35040359 catgatgaattgcagcttctggtgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 35040415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 108 - 356
Target Start/End: Original strand, 13223382 - 13223637
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaa--attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
13223382 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaatcttcagaagcagactgagag 13223481  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13223482 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 13223581  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13223582 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 13223637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 523 - 934
Target Start/End: Original strand, 20798689 - 20799102
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
20798689 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattca 20798788  T
622 gtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 718  Q
      ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
20798789 aagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 20798887  T
719 gtg-aaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctt 816  Q
    | | | |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
20798888 gagtagagagacgttgagaattat-agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtccta 20798985  T
817 tgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtgga 916  Q
    |  || || | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||    ||| || |||||    
20798986 tagaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttattttgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtgga 20799084  T
917 ggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||    
20799085 ggtagtggttgtacactt 20799102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 880 - 1161
Target Start/End: Complemental strand, 2327536 - 2327255
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
2327536 tcttgtcttgtagcagagacaaaaccagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttttgaggaacaagcatcc 2327437  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||    
2327436 aatgcgttcgaatcctttcaaaatagtttttgcttcactttttcagtcatctgcaatctttagacgagtttgaatctattaaacaacttttgaagcttta 2327337  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
2327336 agttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttttgatga 2327255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 201 - 488
Target Start/End: Original strand, 47194632 - 47194919
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
47194632 tgcttctgatgtaataatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccaca 47194730  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
47194731 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 47194830  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||    
47194831 aa-tgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgatcaagcacataggcaagagtcttc 47194919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 166 - 396
Target Start/End: Original strand, 16710229 - 16710457
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaac 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
16710229 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagac 16710326  T
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16710327 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 16710426  T
366 atgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||    
16710427 ctgctcaatactttctaagtatgagacttca 16710457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 159 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9750038 - 9749843
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9750038 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 9749939  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 354  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9749938 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 9749843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 694 - 1161
Target Start/End: Complemental strand, 25448849 - 25448380
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  || || |  |     
25448849 agtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcatcaatgatt 25448752  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
25448751 ctttgcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttg 25448653  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||||||| ||||    
25448652 tagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttca 25448554  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||     
25448553 aatcctttcaaaatagtcgctgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatct 25448454  T
1090 catgatgaact--gcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
      |||||||||  |||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
25448453 tctgatgaactgcgcagcttctagtgattctcagcttctgataaacttgcttttgatgaactggcttctaatga 25448380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 159 - 356
Target Start/End: Original strand, 36099927 - 36100124
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36099927 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttatgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 36100026  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36100027 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 36100124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 166 - 377
Target Start/End: Original strand, 4717527 - 4717736
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
4717527 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 4717623  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4717624 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 4717723  T
365 aatgctcaatact 377  Q
    | |||||||||||    
4717724 actgctcaatact 4717736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 694 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 22427641 - 22427151
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||| |  |||   ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
22427641 agtcttcacttctttatatagagatgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacattcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 22427544  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | ||||| |||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||| ||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
22427543 cttttgcttgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcaaagctgtttttcttgtctt 22427445  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||    
22427444 gtagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaag-aacaagcatccaatgccttc 22427346  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||| ||| || ||  |||||||| ||| ||||||||    
22427345 aaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagctttatgttgcatc 22427246  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
     | |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
22427245 tcctgatgaactggagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctggtagacttgcttctgatgacatcaccacttcaggagcactt 22427151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 693 - 1166
Target Start/End: Complemental strand, 22465093 - 22464619
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
22465093 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 22464996  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| || |||||||| ||||||| | ||||||||    
22464995 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 22464897  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||    
22464896 gtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttc 22464798  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt-aaatagcttttgaagccttaagttgcat 1087  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| || ||||| || ||  | |||||||||| ||| ||| |||    
22464797 aaatcatttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttttgaagctttatgttacat 22464698  T
1088 cccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtca 1166  Q
    | | |||||||||| ||| |||| |||||||  |||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
22464697 ctcctgatgaactgtagcatctggtgattttcagcttcttatgaacttgcttctggtggacttgcttctgatgacgtca 22464619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 159 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24049315 - 24049120
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
24049315 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 24049219  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24049218 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 24049120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 243 - 934
Target Start/End: Original strand, 28379329 - 28380033
Alignment:
243 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 342  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
28379329 aacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagattt 28379426  T
343 -cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 435  Q
     |||||     |||||||| ||||||||| || |||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||  |||    
28379427 tcactaagtaataatcacacagattacaactgttcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacaaacaagagacttcctttgc 28379524  T
436 tcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttg 533  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| | ||    |||||| || |||||||||    
28379525 tcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacaaaaaattgtttgagtttgaacacttg 28379624  T
534 atatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||   || ||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||| ||     || |||||||  |||||    
28379625 atatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaatgactctctagacttaagaatttctaagatttatcagatagacacataaattcaaagtgct 28379724  T
629 tt-gta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaact--tgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa 723  Q
    || ||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |  |  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
28379725 tttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaatttgttgtat-tgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagatgtgtgta 28379822  T
724 -agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaag 821  Q
     ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| |||||    
28379823 gagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaag 28379921  T
822 aattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtag 921  Q
     || |  |||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||     
28379922 gatcacgttcaaatcaattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaattagagtcgtggaggtac 28380020  T
922 tggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||    
28380021 tggttgtacactt 28380033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 138 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36551381 - 36551159
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
36551381 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 36551285  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36551284 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36551185  T
332 caaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
36551184 caaggagatttcactataatcacaaa 36551159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 694 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 48570514 - 48570024
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  |||||    ||    
48570514 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgtcagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaacgatc 48570417  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||  ||    |||||||  ||||||||   ||||  ||||  | |||||||||||||||| | |||||| ||    
48570416 ctttgcctgatatggttattgtccttagaaagatcgatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattat-tgcaggcatagctgtttttcttgtcctg 48570318  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  |||||||||||| ||      
48570317 tagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgcctttt 48570219  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||     
48570218 aatccttccaaaatagtcgttgttatacttttctagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaaactttaagttgcatct 48570120  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
48570119 cctgatgaattacagcttctggtgattctcagcttctgataaaattgcttatgatgaacttgtttctgatgacgtcatcatttcaggagcactttg 48570024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 268 - 937
Target Start/End: Original strand, 17370400 - 17371083
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatt 361  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||    
17370400 agacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtcgagtccccattgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 17370499  T
362 acaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||     
17370500 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcc 17370596  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
     ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||| | |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
17370597 tatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaatagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 17370696  T
559 acaatacaat--aaagactcta--gacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagag 650  Q
    ||||| |||   ||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   |||| ||   ||  ||  | |||  |||||    
17370697 acaatgcaaatgaaagactctatagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcatttatgtgaaacaaattttgcagag 17370796  T
651 ttttggcgcttttgaacttgtatatgtctc---tatctt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gca 745  Q
    ||| ||||||||| | |||||   ||||||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||    
17370797 tttgggcgcttttta-cttgt---tgtctcgtgtctcttgatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagtcgttgagatctttaagca 17370892  T
746 cgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 844  Q
    |||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |    
17370893 cgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattccta 17370990  T
845 tcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    || |||||| |||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17370991 tcatgaaggaacat-ttctgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 17371083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 447 - 934
Target Start/End: Original strand, 44200559 - 44201049
Alignment:
447 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcag 545  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||| |  |||| | ||    |||||| || |||||||||||||||||||||    
44200559 gcaagagacttcatatgctcaagcactaaagcaagagatttctaatcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcag 44200658  T
546 tggtgttctcaatacaatacaa-taaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt-tgtagaatcagtt 642  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||  | ||    
44200659 tggtgttcacaatacaatgcaaggaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttatgtgaaacaattt 44200758  T
643 tgacagagttttggcgcttttgaacttgt--atatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataa 739  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||      
44200759 tggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcattcctttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct 44200856  T
740 tcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcat 839  Q
    | ||||||||||||||||||||   || ||||||||||   |||| |  || ||| |||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||    
44200857 taagcacgtctaaagagtcgttgagaaacctttgatca-ataccaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctatgaaagatcaagttcaaatccat 44200955  T
840 tcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
44200956 tcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcaaagttgttatcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 44201049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 138; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 268 - 934
Target Start/End: Original strand, 22018690 - 22019374
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagatta 362  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||| ||||||    
22018690 agacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggatattttcactaagtttaatcacacagatta 22018789  T
363 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||      
22018790 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagacacttcctttgctcaagcactaaagaaagagacttcct 22018887  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca--- 556  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
22018888 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 22018987  T
557 -atacaatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt---tgtagaatcagtttgaca 647  Q
     ||||||| ||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   || |||||||  ||||||   |||  ||  | |||| ||    
22018988 tatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgatcacaaaaattcaaagtgcttttgtgtgaaacaaatttggca 22019087  T
648 gagttttggcgcttttgaacttg-tat-atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagc 744  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   | |||    
22019088 gagtttgggcgctttt-aacttgttatcttgtctct-gctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagc 22019185  T
745 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 844  Q
    ||||| | ||||||| |||| |  | |||||||   |||| |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |    
22019186 acgtcaatagagtcg-ttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattccta 22019284  T
845 tcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
22019285 tcttgaaggaacat-ttctgcaggaagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 22019374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 19171115 - 19170376
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    |||||||||||   || |||||||  |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||  |||||||||||||    
19171115 tgcttctgatgtgttgttcagaataggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccac 19171018  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgaga 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||    
19171017 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 19170918  T
392 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctg 490  Q
    |||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||     
19170917 cttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19170821  T
491 atcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttg-aacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagactttgaa 587  Q
     ||||||| |  |||| | ||    |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||  |    |||    
19170820 ttcaaacagaattacacaaaaaattgtttgagttttaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctcta----gaa 19170725  T
588 tttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt-tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtata--tgtctctatc 684  Q
    |||||||||| |||||||| | | |||||||||   ||| || |||  ||  | |||| || ||||| ||||||||| |||||||     ||||||| |     
19170724 tttctaagatatatcaaatgaatacagaaattctaagtgtttatgtgaaacaaatttggcaaagtttgggcgctttt-aacttgttgtcttgtctct-ta 19170627  T
685 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtctaa-agagtcgtt-tgaaatcctttgatcatcca 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||| || || ||||| ||| ||||| |  |||||||  ||    
19170626 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgagatcttttagcacttcaaatagagtagttgtgaaacc--ttgatcaatca 19170529  T
782 ccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt- 880  Q
    ||| |  || ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |     
19170528 ccaatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaacgaacat-ttctgcaggcagagctgttttt 19170430  T
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
19170429 cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 19170376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 863 - 1185
Target Start/End: Original strand, 21702780 - 21703101
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |     
21702780 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tc 21702878  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||| |||  ||||| ||||||  |  ||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||    
21702879 tttgaagaataagcattcaatgcccttcaatcctttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttctgcaatc-ttagacgagtttgaatccttgaa 21702977  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
21702978 acaaattttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 21703077  T
1162 cgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
     ||||||||||||| |||||||||    
21703078 tgtcatcacttcaggagcactttg 21703101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 694 - 1183
Target Start/End: Original strand, 46088786 - 46089266
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  |||   |||||| |||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
46088786 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaaatg-tcagcacattcaaaatagagtcgattgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 46088883  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||| ||||  || |  ||||||| | ||||||   ||||   ||||  | |||||||| ||||||| || |||||| |    
46088884 ctttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgt-tgcaggcagagctgttatccttgtctag 46088982  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  ||||||||||||         
46088983 tagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgc----- 46089076  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
        |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||     
46089077 ----ctttcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttgcatct 46089172  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||      ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
46089173 catgatgaactgcagcttctggtgatacacaacttatgatgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 46089266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25218198 - 25218042
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25218198 tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 25218100  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25218099 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 25218042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 129; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 693 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 22600466 - 22599974
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    | ||||  || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||  |  |    
22600466 aagtcttcactcctttttatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgctagcatatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcacccattat 22600369  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||  || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| || |||| | ||||||||    
22600368 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagttgtttttcttgtctt 22600270  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||    
22600269 gtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttc 22600171  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||| || || |||||||| || ||| |||||||| |||||  |||||    
22600170 aaatcctttcaaaatagtcgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgca 22600071  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    || | |||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
22600070 tctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgat-gagatgcttctgataaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcacttt 22599974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 125; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 431 - 931
Target Start/End: Original strand, 28473756 - 28474262
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||    
28473756 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 28473855  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgt 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||    
28473856 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaacgt 28473955  T
626 gctttgtagaatcagttt-gacagagttttggcgcttttgaacttgtata--tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 722  Q
    |||||  |||| || ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    |||||| | || |||||||||||||||||||||| || |||||||||     
28473956 gcttttgagaaacaattttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtagcattgtctcca-ctgatcttcaagtcttcactcctttttagagaggtgtgt 28474053  T
723 a-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaa 820  Q
    | | |||| ||||||   | | ||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||    
28474054 agaaagacattgagacctttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagaacctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaa 28474152  T
821 gaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggta 920  Q
    | || |  ||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| || |||||| |||||||||    
28474153 ggatcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgcagacacaagcagagtcgtggaggta 28474251  T
921 gtggttgtaca 931  Q
    |||||||||||    
28474252 gtggttgtaca 28474262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Original strand, 2834485 - 2834938
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |  ||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
2834485 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattagtagcacatcaaaaaagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 2834582  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||  || |  ||||||| |||||||||  |||||  ||||  | ||||| || ||||||| | ||||||||    
2834583 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagtaacatcgt-tgcagacagagctgtttttcttgtctt 2834681  T
889 gtagcgtggacaaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||    
2834682 gtagcagagacaaagaacagagtagtggaggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacg-ttctttgaagaacaagcatccaatgcctt 2834780  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcat 1087  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||||||| ||||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||    
2834781 caaatcctttcaaattagccgttgcttcactttttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaagttgcat 2834880  T
1088 cccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||  |||||||||||||||    
2834881 ctcccgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctaat-gacttgcttctgatga 2834938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 46181730 - 46181367
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||    ||||| |||||||||||||   ||||||||||    || |||||    
46181730 tgaaggtgagaaaaacacaagaagagggg-ttgaattgtgttttctttttctcgtaaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtg 46181632  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaa-cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
46181631 cttctgatgtgatgttcagaattatatatgcagcggaatagaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaa 46181534  T
301 cacggaagtagtccagtc-ccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact 393  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||    
46181533 atcggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagact 46181435  T
394 tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    || ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
46181434 tcccaaa--tgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 46181367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 294 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9051143 - 9050994
Alignment:
294 tccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact 393  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
9051143 tccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagact 9051044  T
394 tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 443  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
9051043 tctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 9050994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 159 - 303
Target Start/End: Original strand, 10256336 - 10256480
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 258  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10256336 aaaaatccttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 10256435  T
259 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10256436 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 10256480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 34256238 - 34255320
Alignment:
269 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatt 361  Q
    |||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||  ||||    
34256238 gacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaagtagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 34256139  T
362 acaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttcta 460  Q
    |||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||     
34256138 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacagcaagagacttctt 34256042  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
34256041 atgctcaagcactaaagcaagagacttcttatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 34255942  T
560 caatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtag---aatcagtttgacagagt 651  Q
    ||||||| |  || ||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   ||||||||  |   ||| | |||  ||||||    
34255941 caatacagttgaaggactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgctttgatgtgaaataatttttgcagagt 34255842  T
652 tttggcgcttttgaacttgtatatgtctct-atcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc--agcacgt 748  Q
    ||||||||||| ||| | ||||  |||||| |    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   ||||| |    
34255841 tttggcgcttt-gaattggtatgagtctcttaaaaaatcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttgagattttttaagcacat 34255743  T
749 ctaaagagtcgtttgaaatcctttgatca-tccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatct 847  Q
    | | |||||||||||||   ||||||| | | ||||  |  ||| ||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| | ||||||       
34255742 c-agagagtcgtttgaag--ctttgataagttcacccttgatccgttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatg 34255646  T
848 tgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgta 946  Q
    || |   ||||  | |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||  |    
34255645 tgtataaacattgtttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacagttcgtacatactca 34255546  T
947 ctttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatcttta-gacg 1045  Q
    |  |||||||||| ||| |||||   |||||||||||| ||         ||||| ||||||||| |  ||||| | ||| |||||||||||||  |  |    
34255545 caatgtcaacgctcttt-gaggataaagcatccaatgcttt---------tcaaactagtcgttg-tcaactttccaagtcttctgcaatctttctggtg 34255457  T
1046 aggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatg 1145  Q
    || |||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||| |||  ||||| | |||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
34255456 agcttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaggttg-atcttatgataatctgcagcttctggtgaactt--gcttctgataaacttgcttctgatg 34255360  T
1146 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
34255359 aacttgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactttg 34255320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 115 - 299
Target Start/End: Original strand, 5234525 - 5234715
Alignment:
115 gagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttc-ttttct-----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctg 208  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||| || |||||||||||   || |||||||||||    
5234525 gagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgatgaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctg 5234624  T
209 atgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5234625 atgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 5234715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 398 - 934
Target Start/End: Original strand, 19037499 - 19038045
Alignment:
398 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaa 496  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
19037499 aaaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 19037598  T
497 caaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt---gaattt 590  Q
    || |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||       ||||||    
19037599 cagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatactataagtggtgttcacaataaaatgcaattgaaagactctagaaaaaaaagaattt 19037698  T
591 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgt-atat-gtctctatctt 686  Q
    ||||||| ||||||||||    |||||||||  ||||||| | |||| ||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||     
19037699 ctaagatatatcaaatcaacaaagaaattcaaagtgctttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttatattgtctcta-ctg 19037796  T
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   ||||    
19037797 atctgcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaatacca 19037895  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 883  Q
     |  || |||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||    
19037896 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctataaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttctt 19037994  T
884 gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||  |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19037995 gtcttgtagcgcagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 19038045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 268 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 26548979 - 26548299
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagatta 362  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||    ||||    
26548979 agacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcactcttatta 26548880  T
363 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||      
26548879 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcagtcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 26548782  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
26548781 atgctcaagcactaaaccaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgattttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 26548682  T
560 caatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt---tgtagaatcagtttgacagagt 651  Q
    |||| ||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   | ||||||||  ||||||   |||  ||  | |||||||||||    
26548681 caatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacactgaaattcaaagtgcttttctgtgaaacaaatttgacagagt 26548582  T
652 tttggcgcttttgaacttg-tatat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgt 748  Q
    || | ||||||| |||||| | | |  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   | |||||||    
26548581 ttggacgctttt-aacttgttgtctcttctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgt 26548484  T
749 ctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatct 847  Q
    | | |||||| || |||||  | || || |  ||||| |  || |||||||||||||| ||  ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||    
26548483 caatagagtccttgtgaaa--ccttaattaaacaccaatgatcttttgcctgatttggatgctgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatct 26548386  T
848 tgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| | |||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||| |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
26548385 tgaaagaacat-ttatgcagacagagctgtttatcctgtcttgtagcgtagacagaggcagtgtcgtggaggtagtggttgtacactt 26548299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 32786222 - 32785767
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||| | |  |||   ||| ||||||||   |||||||||  || || |      
32786222 aagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttgtgaattgtcagcgcattcaaaatagagccgtttgaag--ctttgatcaatcatcaatga 32786125  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    || |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| || |||| ||| ||||||| | |||||||    
32786124 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaagcagagctgtttttcttgtct 32786026  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    | |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||| ||    
32786025 tttagcggagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaag-aacaagcatccaatgcctt 32785927  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgc 1085  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||| | || | | |||||||| |||||  ||||    
32785926 caaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgc 32785828  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||| ||||||||||| || |||||  |||||||  |||||| || ||||||||||| ||||    
32785827 atctcatgatgaactacaacttctagtgattttcagcttctaatgaacttgcttctaatga 32785767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 450 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867068
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 549  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtagt 20867284  T
550 gttctcaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgac 646  Q
    |||| ||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| | |||| |    
20867283 gttcacaatacaatgcagtaaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggc 20867184  T
647 agagttttggcgcttttgaacttgt--atatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcag 743  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||    || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||    
20867183 agagttttggcactttt-aacttgtggtgatttctcta-ccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttag 20867086  T
744 cacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    |||||| |||||||||||    
20867085 cacgtccaaagagtcgtt 20867068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 44821641 - 44821376
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| || |||  ||||| |    
44821641 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactcttt-gaagaataagcatac 44821543  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    || || ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||    
44821542 aaagccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttctacaaaccttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttta 44821443  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
44821442 agttgcatctcctgatgaactacagcttatggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatga 44821376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 45071478 - 45071117
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||||    
45071478 tgaaggtgagaaaaacataagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcagaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggatgagagtgct 45071379  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||||||||      
45071378 tctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaac 45071281  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||     
45071280 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatacta-cgtagtatgagacttcc 45071182  T
397 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
45071181 caaa--tgctcaagcacgcaggctagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 45071117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 693 - 1129
Target Start/End: Original strand, 1900141 - 1900579
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
1900141 aagtcttcattcctttatatagaggtgcgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 1900238  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| ||| |||||  |||||| | ||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
1900239 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccatccccattgtgaaggaatattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 1900337  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| ||| || |||| ||||| |||||| ||     
1900338 gtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcattcaatgccttt 1900436  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |||| | |||||||| |||||  |||||    
1900437 aaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgca 1900536  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    || | |||||||||  | ||||||  ||| ||| |||||||||    
1900537 tctcctgatgaactagatcttctggcgatctttagcttctgat 1900579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 418 - 934
Target Start/End: Original strand, 22654989 - 22655515
Alignment:
418 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaag 516  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |    
22654989 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattg 22655088  T
517 tttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagt 610  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| | |||||| |      
22655089 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatctcaaataaac 22655188  T
611 gcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtct-ctatcttatcttcaagtcttcactcct 706  Q
     ||||||||||  |||||||   ||  ||  | |||| |||||||| ||||||||| ||||||| | | ||| || | ||||||||||||||||||||||    
22655189 acagaaattcaaagtgcttttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgt-tgtctcttcttttttatcttcaagtcttcactcct 22655286  T
707 ttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc--agcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgattt 803  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |   |||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  || ||||||||||||    
22655287 ttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatcttttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcagtcaccaatgatcttttgcctgattt 22655384  T
804 gggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaa 902  Q
    || ||| |||||  |||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||| |    
22655385 ggatgttgtcctaagaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagaactgtttttcttgtcttgtagcgtagacaca 22655483  T
903 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||    
22655484 agcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 22655515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 880 - 1184
Target Start/End: Original strand, 2268515 - 2268815
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |    
2268515 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgacgaacaagcattc 2268613  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||   ||||||| ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||| || |||||||| || | | ||||||||||||    
2268614 aatgccttcaaatcatttcaaaata---gttgcttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcctta 2268710  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||  ||||||| | | |||||||  |||||||  ||||| || |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
2268711 agtcttgcatctcctaatgaactttagcttctagtgattgtt-gcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagga 2268808  T
1178 gcacttt 1184  Q
    |||||||    
2268809 gcacttt 2268815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 880 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 14263548 - 14263312
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatc 978  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||| || |||    
14263548 tcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgc-tctttgaggaacaagtatc 14263450  T
979 caatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatcc-attaaatag-cttttgaagcc 1076  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||| ||||||| | || ||||| ||| || ||  ||||||||||    
14263449 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgttttgcttctccagtcttctgcaatccttagacgggatttaatccaattgaacagttttttgaagcc 14263350  T
1077 ttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
14263349 ttaagttgcatcacatgatgaactgctgcttctgatga 14263312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 693 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 33256635 - 33256145
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
33256635 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 33256538  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||  | |  |||| ||||| || |  ||||||| || | |||   || ||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
33256537 cttttgcctgatatgattattttcctatgaaggatcaatttcaaatccaattccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcagagctgttattcttgtctt 33256439  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||   || ||| |||||||||||| |||    
33256438 gtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaag-aacaagcatccaatgccttc 33256340  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  |||||    
33256339 aaatccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 33256240  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    || | || ||||||  |||||||| |||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
33256239 tctcctgttgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgataatgtcatcacttcaggagcacttt 33256145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 693 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 33276807 - 33276317
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
33276807 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 33276710  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||  | |  |||| ||||| || |  ||||||| || | |||   || ||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
33276709 cttttgcctgatatgattattttcctatgaaggatcaatttcaaatccaattccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcagagctgttattcttgtctt 33276611  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||   || ||| |||||||||||| |||    
33276610 gtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaag-aacaagcatccaatgccttc 33276512  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  |||||    
33276511 aaatccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 33276412  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    || | || ||||||  |||||||| |||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
33276411 tctcctggtgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgataatgtcatcacttcaggagcacttt 33276317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 403 - 934
Target Start/End: Original strand, 22642392 - 22642933
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |     
22642392 tgctcaagcactcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 22642491  T
502 atacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaag 595  Q
     |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  |||||||||||    
22642492 ttacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaag 22642591  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt----at 688  Q
    || |||||||| |   ||||||||||  |||||||   ||  ||  | |||| |||||||| ||||||||| |||||||   ||||||| ||||    ||    
22642592 atatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgcttttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgt---tgtctct-tctttttgat 22642686  T
689 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc--agcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  |   || ||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||     
22642687 cttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagtggttgagatcttttaagaacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaa 22642784  T
786 tagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttg 884  Q
    |  || ||||||| |||||| ||| |||||  |||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||  |||||    
22642785 tgatcttttgccttatttggatgttgtcctaagaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagaactgtttatcttg 22642883  T
885 tcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
22642884 tcttgtaccgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 22642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 880 - 1183
Target Start/End: Original strand, 35401792 - 35402094
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatc 978  Q
    ||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||| || |||| ||||||    
35401792 tcttgtcttgtagcagagacaaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatc 35401890  T
979 caatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctt 1078  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| ||||| || |||||||| || ||  |||||||| ||    
35401891 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagcttt 35401990  T
1079 aag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaga 1176  Q
    |||  |||||||   ||||||    ||||||||| |||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
35401991 aagtcttgcatcttctgatga--gacagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgaggtcatcacttcagg 35402087  T
1177 agcactt 1183  Q
    |||||||    
35402088 agcactt 35402094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 898 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 39201070 - 39200823
Alignment:
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattcttt 997  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||  ||||||| ||||    
39201070 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttt 39200972  T
998 caaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatga 1097  Q
    |||| ||| |||||||||||| || |||| |||||||||  ||| | ||| || |||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| | | ||||    
39200971 caaactagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttacatgagattaaatccattgaacagcttttgaagctttatgttgcatctcctaatga 39200872  T
1098 actgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||||||||| || |||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||    
39200871 actgcagcttttggtgattttcagcttttgatgaacttgcttttgatga 39200823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 693 - 1114
Target Start/End: Original strand, 2266885 - 2267306
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   || ||||  || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
2266885 aagtcttcactcctttatatagatgtgtgaaaaagacgttgtgaatttccagcaaatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 2266982  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||  || |  ||||||| |||| ||||  |||||| |||| || ||||| || ||||||| | ||||||||    
2266983 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctt-tgcagacaaagctgtttttcttgtctt 2267081  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  | |||||| ||||||| ||| || |||| | |||||||||| |||    
2267082 gtagtagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctcttt-gaagaacaaacatccaatgccttc 2267180  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| ||| ||||||||    
2267181 aaattctttcaaactagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttatgttgcatc 2267280  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
     | |||||||||| ||||||||||||    
2267281 tcctgatgaactgtagcttctgatga 2267306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 880 - 1174
Target Start/End: Original strand, 10250970 - 10251253
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||| || |||  |||||||    
10250970 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaaaactcttt-gaagaataagcatcc 10251068  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| |||         |||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||    
10251069 aatgccttc---------caaattagccgttgttatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttta 10251158  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
10251159 agttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcatagcttctgatgaacttgctttcgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttca 10251253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 45683687 - 45683793
Alignment:
1 gatgaggcagatgcagtagaacaaagtgatgaaggtactatttttcatttagtgtgtctaacaaagatcattattgccattaccgccataaagtggatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45683687 gatgaggcagatgcagtagaacaaagtgatgaaggtactattattcatttagtgtgtctaacaaagatcattattgccattaccgccataaagtggatac 45683786  T
101 acatcaa 107  Q
    |||||||    
45683787 acatcaa 45683793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 449 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 52351217 - 52350731
Alignment:
449 aagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtg 547  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||| || |||||||||||||||||||||||    
52351217 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtg 52351118  T
548 gtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatcag-tt 642  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||| | |||| ||  ||    
52351117 gtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgagaaacaaatt 52351018  T
643 tgacagagttttggcgcttttgaacttgtata--tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataa 739  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||  |  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |      
52351017 tggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgaattgtctctaa-taatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgttgagagacgttgagttct 52350920  T
740 tca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattca 838  Q
    | | ||||||| |||||||| ||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| ||    
52350919 ttaagcacgtc-aaagagtcattgagaaacctt-gatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatcca 52350823  T
839 ttcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
52350822 ttcctaacttgaagggacat-ttctgcaggcagagctattatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtaca 52350731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 102; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 693 - 1185
Target Start/End: Original strand, 38282363 - 38282855
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |       
38282363 aagtattcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgac 38282460  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||| ||| |||| || | ||| ||||    
38282461 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaagcagagctatttttcttatctt 38282559  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| ||||| |||||| ||     
38282560 gtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcattcaatgccttt 38282657  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  |||||    
38282658 aaatcctttcaaaatacccgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 38282757  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    || | |||||||||  ||||| || |||| ||| || ||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
38282758 tctcctgatgaactagagcttttggtgatctttagcatctgat-gagatgcttctgataaacttgcttctgatgaggtcattacttcaggagcactttg 38282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 693 - 1129
Target Start/End: Original strand, 29215592 - 29216029
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||| |  |  |||   ||||||||||||   |||||||||  ||||| |      
29215592 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagaattttcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatga 29215689  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    || |||||||||| ||| | | ||||| | ||| || |  |||||||  ||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||| ||    
29215690 tcttttgcctgatatggttattgtcctataaaggatcaatttcaaatatattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgcct 29215788  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| | |||| ||| || |||| |||||||||||| ||    
29215789 tgtagcagagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctcttt-gaagaacaagcatccaatgcctt 29215887  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcat 1087  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||||| || ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
29215888 caaatcctttcaaactagccgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagttgcat 29215987  T
1088 cccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    | | ||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||    
29215988 ctcctgatgaattgcaacttctggtgattttcagcttctgat 29216029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 880 - 1172
Target Start/End: Original strand, 22153841 - 22154133
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||  | |||| | |||||    
22153841 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tcttcaaagaacaatcatcc 22153939  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||    
22153940 aatgctttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta 22154039  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt 1172  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||   ||||| ||  |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
22154040 agtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctacttcttat-gagatgcttctaaggaacttgcttctaatgacgtcatcactt 22154133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 433 - 1161
Target Start/End: Complemental strand, 7745634 - 7744906
Alignment:
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacact 531  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||||  |||||||| |  |||| ||||    ||||||  |||||||||    
7745634 tgctcaagcacacagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagtcttcctatcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacact 7745535  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||      ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||    
7745534 tgatatacaatcaggggtgttcacaatacaatgcaatgaaga------acttaagaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattctaagtgcttt 7745441  T
631 gta---gaatcagtttgac-agagttttggcgcttttgaac-ttgta-tatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 724  Q
      |   ||| || ||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  || |||| |   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
7745440 tgatgtgaaacaatttcaatagagttttggcgctttttaaaattgttgtaagtcttttaatgatcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 7745341  T
725 gagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaga 822  Q
    |||||||||||||  | | |||| || | |||||  || ||||| ||||  || ||| |||| |  ||| ||| ||||||||| |||  |||| |||||     
7745340 gagacgttgagatccttaagcacatc-agagagtgattctgaaa-ccttgaataatc-accattgatccattgtctgatttggttgttttcctatgaagg 7745244  T
823 attagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtag 921  Q
    || |  ||||||| |||||   |  ||| || |||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||  | ||| | |||||||||||||||||    
7745243 atcaagttcaaatccattcttgttctgagggaacat-ttctgcaggcaaagctgtttttcttgtcatgtagcgaaggcaatagcagagtagtggaggtag 7745145  T
922 tggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactttt 1021  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||  ||||   |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||   |||||| | ||| |    
7745144 tggttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctttgaaggata-agcatcaaatgcattcaaatcctttcaaattaactgttgctactcttct 7745046  T
1022 ccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttgg 1121  Q
     |||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |  || ||||||||   ||||||||||||||||||| |||| | |||    
7745045 tcagtcttatgcactctttagatgagtttgaatccattaaacaacttttgaaactgtaggttgcatcttctgatgaactgcagcttctggtgatatatgg 7744946  T
1122 cttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    |||||||| ||   |||||| || ||||||||||||||||    
7744945 cttctgatgaaacagcttctaataaacttgcttctgatga 7744906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 138 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19088037 - 19087862
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
19088037 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaccttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tg 19087941  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19087940 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 19087862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 863 - 1059
Target Start/End: Original strand, 36134156 - 36134351
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |     
36134156 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tc 36134254  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt 1059  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| ||| || ||||||||    
36134255 tttgaagaacaagcatccaatgc-ttcaaatcctttcaaaatagttgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccatt 36134351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 450 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 45071159 - 45070902
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttg-aacacttgatatacaatcagtgg 548  Q
    |||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
45071159 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttttaacacttgatatacaatcagtgg 45071060  T
549 tgttctcaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttga 645  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| | ||||     
45071059 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaggaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttgg 45070960  T
646 cagagttttggcgcttttgaacttgt-at-atgtctctatcttatcttcaagtcttcact 703  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||    
45070959 cagagttttggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcact 45070902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 90; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 28492500 - 28492233
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    |||||||| |||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||    
28492500 tcttgtctagtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaag-aacaagcatcc 28492402  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||  || |||||||| || | | |||||||| |||    
28492401 aatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta 28492302  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| || ||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
28492301 agtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgaagatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 28492233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 431 - 930
Target Start/End: Original strand, 20251301 - 20251808
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||    
20251301 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 20251400  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactcta--gacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagt 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||      
20251401 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctatagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaa 20251500  T
624 gtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtg 719  Q
    || ||||||  ||| ||  ||||  ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
20251501 gttctttgtgtgaaacaaatttggtagagtttgggcgctttt-aacttgttgtattgtctctg-ctgatcttcaagtctttactcctttatatagaggtg 20251598  T
720 tgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtccttt 817  Q
    || | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| |    
20251599 tgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctat 20251696  T
818 gaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggag 917  Q
    |||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||| || |||||| ||||||    
20251697 gaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgttttgtagcatagacacaagcagagtcgtggag 20251795  T
918 gtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||    
20251796 gtagtggttgtac 20251808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 829 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 23036676 - 23036322
Alignment:
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaa--cagagtagtggaggtagtggt 925  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||  || ||||| ||||||||||||    
23036676 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaaacaaagtagaggaggtagtggt 23036578  T
926 tgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 1025  Q
    |||||||||||| |||  || ||||||  ||||| ||| || |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||    
23036577 tgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcacttttttag 23036479  T
1026 tattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggct 1123  Q
    | ||||||| | |||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||   ||||||    ||||||||| |||| ||  |||    
23036478 tcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagcttctggtgatcttcagct 23036381  T
1124 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
23036380 tctgat-gagatgcttctgatgaaattgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactt 23036322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 863 - 1116
Target Start/End: Original strand, 30572163 - 30572415
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |    
30572163 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaaacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctct 30572262  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    | | || ||  | |||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| | ||    
30572263 tctaag-aataaacatccaatgcttttcaatcctttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatc-tcagacgagtttgaatccttgaa 30572360  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatt 1116  Q
    | |||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||    
30572361 acagctattgaagctttaagttgtatctcctgatgaactgcaacttctggtgatt 30572415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 729 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 45070900 - 45070700
Alignment:
729 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 828  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |    
45070900 cgttgagatcttaagcacgtctaaagaatcgtt-gagttcctttgatcattcaccactaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaac 45070802  T
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||    
45070801 ttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgt 45070703  T
929 aca 931  Q
    |||    
45070702 aca 45070700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 863 - 1047
Target Start/End: Complemental strand, 16235410 - 16235226
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| || |    
16235410 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaaggagtagtggaggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactct 16235311  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgag 1047  Q
    || ||| ||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
16235310 ttggag-aacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgtttagacgag 16235226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 881 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 20954568 - 20954265
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   || | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||   || ||  ||| ||||    
20954568 cttgtcttgtagcagagaaacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aataagcctcca 20954470  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| ||||    
20954469 atgctttcaaatcctttcaaaatggccattgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaa 20954370  T
1081 gt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
    ||  |||||| | |||||||||  |||||||| |||| ||  ||||||||| |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
20954369 gtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgaatctgatgacgtcatcacttcaggag 20954271  T
1179 cacttt 1184  Q
    ||||||    
20954270 cacttt 20954265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 488
Target Start/End: Original strand, 22642220 - 22642448
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 359  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||  ||    
22642220 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagagtttcactaagtttaatcacaactga 22642319  T
360 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 457  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
22642320 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactcaagcaagagactt 22642417  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
    |  ||||||||||||  | ||||||||||||    
22642418 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22642448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 912 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19717540 - 19717809
Alignment:
912 gtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttg 1011  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
19717540 gtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccgatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttg 19717638  T
1012 cttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatc-ccatgatgaactgcagcttc 1108  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||  || |||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||  ||||||    
19717639 cttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccat-atgaactttagcttc 19717737  T
1109 tgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    || |||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
19717738 tggtgatctt--gcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcactt 19717809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 201 - 460
Target Start/End: Original strand, 20251096 - 20251361
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||||||| | || |||||||  |||| ||||||||  || || |||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
20251096 tgcttctgatgtattgttcagaattggatacgcagcggagtaaaaatagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccac 20251193  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgaga 391  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||    
20251194 aaaccggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 20251293  T
392 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||  ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
20251294 ctt--caaaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 20251361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 289
Target Start/End: Original strand, 11958360 - 11958514
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
11958360 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 11958456  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggt 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
11958457 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggt 11958514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 829 - 1146
Target Start/End: Original strand, 10757354 - 10757671
Alignment:
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| || ||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| |||| |||||||| || |||||||||    
10757354 ttcaaattcattccaagtatgaaggaaca-atgctgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttg 10757452  T
928 tacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagta 1027  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||   || ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||   |     
10757453 tacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaag-aacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgatt 10757551  T
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccatt-aaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggctt 1124  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||    
10757552 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttttgatgatctt--gctt 10757649  T
1125 ctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||| |||||||| |||||||    
10757650 ctgatgaacttgctcctgatga 10757671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 881 - 1047
Target Start/End: Original strand, 1577852 - 1578017
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| ||   || ||| ||||||||    
1577852 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaag-aacaagcatcca 1577950  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgag 1047  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
1577951 atgctttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgag 1578017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 901 - 1181
Target Start/End: Complemental strand, 21204998 - 21204726
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||          ||||||    
21204998 aaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaagaattaacatccaatgc---------atttcaa 21204909  T
1001 aatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagctttt-gaagccttaagttgcatcccatgatgaac 1099  Q
    ||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||| | ||| |||| | || ||| | ||| | |||||  || | ||||||| |||| | ||||||||    
21204908 aatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacaacttttaaaaactttaagttccatctcttgatgaac 21204809  T
1100 tgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaac-ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac 1181  Q
    ||||||||||| ||||      |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
21204808 tgcagcttctggtgatacacaacttctgatgaacttgcttctgacgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac 21204726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 880 - 1186
Target Start/End: Original strand, 12284407 - 12284729
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || ||| |||||||    
12284407 tcttgtcttgtagcagagacacaaactgattagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcc 12284505  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  || || ||||||  || |||||| ||||||||||| || | | ||||||||  ||    
12284506 aatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctcta 12284605  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat-----ttttg----------gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 1162  Q
    ||  |||||||   ||||||||| ||||||||| ||||     || ||          ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
12284606 agtcttgcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 12284705  T
1163 gtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
12284706 gtcatcacttcagaagcactttga 12284729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 343
Target Start/End: Original strand, 19037299 - 19037441
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
19037299 tgcttctgatgtattgttcagaatcagatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccac 19037396  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 343  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
19037397 aaatcggaagtagtccagtccaccttgcacttccaaggagatttc 19037441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 881 - 1047
Target Start/End: Complemental strand, 22201831 - 22201666
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||    
22201831 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcata-gaacaagcatcca 22201733  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgag 1047  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||  |||||||||    
22201732 atgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgag 22201666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 687 - 931
Target Start/End: Original strand, 21543820 - 21544064
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||    
21543820 atcttcaagtcttcattcctttatatagtgatgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcacca 21543917  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 883  Q
     |  || |||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |  ||||||| |||||| | |||||||| |||| |||| |||||| ||||||| | |||    
21543918 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctataaagaatcatgttcaaatccattcctaacttgaaggaacat-ttctacaggcagagctgtttttctt 21544016  T
884 gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
21544017 gtcttgtagcgtagacaaaagcaaagtagtggaggtagtggtcgtaca 21544064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 308 - 462
Target Start/End: Original strand, 28473660 - 28473818
Alignment:
308 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||||     
28473660 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatactacctag-tatgagacttcacaaa- 28473757  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
     ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
28473758 -tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 28473818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 523 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 24029145 - 24028751
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaataca--ataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaatt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
24029145 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagtttaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaatt 24029046  T
620 cagtgtgctt---tgtagaatcagtttga-cagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt---atcttcaagtcttcactcctttatat 712  Q
    ||  ||||||   ||| ||| || ||| | |||||||| |||||||||  | ||||   ||||| | ||||    |||||||||||||||||||||||||    
24029045 caaagtgcttttatgt-gaaacaattttagcagagtttgggcgctttttcaattgt---tgtctgtctcttgagttcttcaagtcttcactcctttatat 24028950  T
713 agaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgta 810  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   | |||||||| | ||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |  || |||||| ||||||| |||     
24028949 agaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcaccaatgatcttttgccagatttggatgtt 24028852  T
811 gtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagct-gttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagag 909  Q
    || || | ||| || |  |||||||  ||||  | |||||||| |||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||    
24028851 gttctataaaggatcacgttcaaatctattcataacttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagag 24028753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 201 - 343
Target Start/End: Original strand, 23058886 - 23059028
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||  ||| ||||||||||||||    
23058886 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaactatactggttccttccac 23058983  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 343  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
23058984 aaaccggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttc 23059028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 882 - 1183
Target Start/End: Original strand, 48704190 - 48704504
Alignment:
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaa 981  Q
    ||||||||||||   |||| |||  |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||  | |||| ||||||||     
48704190 ttgtcttgtagcagagacataaattgagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacg-ttcttcaaagaacaagcatccag 48704288  T
982 tgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag 1081  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| |  ||| ||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||    
48704289 tgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaag 48704388  T
1082 --ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat-----ttttg-------gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcat 1167  Q
      |||||||   |||||||||  |||||||| ||||     || ||       ||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
48704389 tcttgcatcttctgatgaactttagcttctggtgatctagcttctgatgagatgcttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatgacgtcat 48704488  T
1168 cacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||| |||||||    
48704489 cacttcaggagcactt 48704504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 864 - 984
Target Start/End: Original strand, 37642215 - 37642335
Alignment:
864 gcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgctttt 962  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |    
37642215 gcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgc-tct 37642313  T
963 ttgaggaactagcatccaatgc 984  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
37642314 ttgaagaattagcatccaatgc 37642335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 903 - 1082
Target Start/End: Original strand, 7309826 - 7310003
Alignment:
903 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaa 1002  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || |||||||||  || |||| |||||||||||| ||||||| | | |||||    
7309826 aacagagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgctttt--gaagaacgagcatccaatgccttcaaatccctacaaaa 7309923  T
1003 tagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt 1082  Q
    |   |||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||   |||||||||| || |||||||||||| ||||||    
7309924 tgaccgttgcttcactcttatagtcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagctttaagt 7310003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23160880 - 23160800
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23160880 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga 23160800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 863 - 1185
Target Start/End: Original strand, 42284594 - 42284891
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
42284594 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcataatagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctct 42284693  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  |||||||||||| ||         ||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||| | ||    
42284694 tt-gaagaaaaagcatccaatgcatt---------tcaaaatagtcgt-gccacaattttccagtcttctgcaatctttaggcgagttagagtccttgaa 42284782  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    | ||||||||||   |||||||  |||   ||||||||||||||||||| ||||              | ||  ||||||||||||||||||||||||||    
42284783 acagcttttgaaaatttaagttcaatcttctgatgaactgcagcttctggtgat--------------acaca-gcttctgatgaacttgcttctgatga 42284867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 874 - 934
Target Start/End: Original strand, 12946818 - 12946878
Alignment:
874 ctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12946818 ctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12946878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 403 - 578
Target Start/End: Original strand, 31358825 - 31358999
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  |||||||||| |  | ||||||||||||| | ||||||||     
31358825 tgctcaagcacacaagcaaaaaacttcaaattctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcgcaaaagcaagagacttctaaacaaacaaat 31358924  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactcta 578  Q
     |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
31358925 -tacaaagaaataagtttgg-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaaaacaattgagactcta 31358999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21215400 - 21215100
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat--aatcacaaagatt 361  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||  |   ||||    
21215400 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggaattcactatgtaatatct--gatt 21215303  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaa-tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 459  Q
    ||||||||||| ||||| |   | || |||||||||   || ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||  | ||  || ||||||||||||    
21215302 acaaatgctcactactaaccttagtaagagacttca---aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctccggaacacaatcaagagacttct 21215206  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    | |||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
21215205 attgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacaaaaatacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 21215106  T
557 atacaa 562  Q
    ||||||    
21215105 atacaa 21215100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1042 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 19170287 - 19170140
Alignment:
1042 gacgaggttgaatccattaaatagctt--ttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgctt 1139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |   |  |||||||   |||||||||| |||||||| |||| |   ||||||||| |||||||||    
19170287 gacgaggttgaatccaataaatagcttgtttgaaactccagattgcatcttctgatgaactgtagcttctggtgatataaagcttctgatgaacttgctt 19170188  T
1140 ctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19170187 ctgatgaacttttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttg 19170140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 403 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19965825 - 19965760
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaa 468  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
19965825 tgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaggagacttctaatgctcaa 19965760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23975558 - 23975486
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
23975558 ttatcatggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagatttaactataatc 23975486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 268
Target Start/End: Original strand, 34190138 - 34190238
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
34190138 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 34190234  T
265 caaa 268  Q
    ||||    
34190235 caaa 34190238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46687728 - 46687603
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
46687728 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 46687632  T
233 cagcgg-aaagaacagagcagagaaaaga 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
46687631 cagcggaaaagaacagagcagagaaaaga 46687603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 881 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 21121159 - 21121057
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||  ||||||||    
21121159 cttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatcca 21121061  T
981 atgc 984  Q
    ||||    
21121060 atgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Original strand, 21541164 - 21541243
Alignment:
269 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 347  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21541164 gacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacta 21541243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 406 - 559
Target Start/End: Original strand, 8698357 - 8698510
Alignment:
406 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagata 504  Q
    ||||||||||| | || || |||| ||| ||||||||| || |||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||   ||||||||  ||    
8698357 tcaagcacacaagaaaaagacttcaaatactcaagcacaaaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaacaaat-ta 8698455  T
505 cagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
8698456 caaagaattaagtttcgtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 8698510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 863 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 21135274 - 21135180
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaac 956  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
21135274 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaac 21135180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1102 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 17024855 - 17024774
Alignment:
1102 cagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
17024855 cagcttctgatgatcttcagcttctggtgatgttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgttatcacttcagaagcactt 17024774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 347 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 20884483 - 20884370
Alignment:
347 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 445  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||| |    
20884483 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagaattccaatgctcaagcactaa 20884387  T
446 agcaagagacttctaat 462  Q
    |||||||||||||||||    
20884386 agcaagagacttctaat 20884370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 687 - 766
Target Start/End: Original strand, 20909199 - 20909279
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||| || ||||||||||||||||    
20909199 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgttgattgccagcacatcaaaagagtcgtttgaaa 20909279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 880 - 984
Target Start/End: Original strand, 23024772 - 23024875
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |  ||||||||  |||||||    
23024772 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgc-tccttgaggaataagcatcc 23024870  T
980 aatgc 984  Q
    |||||    
23024871 aatgc 23024875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 462
Target Start/End: Original strand, 44200443 - 44200604
Alignment:
309 tagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||      
44200443 tagttcagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa-- 44200539  T
403 tgctcaagca----cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||||||||    | |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
44200540 tgctcaagcatgcgcgcacgcaagagacttcatatgctcaagcactaaagcaagagatttctaat 44200604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 897 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 21191944 - 21191806
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| | ||  | |||| |||||||||||| ||||||| |||    
21191944 gacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgc-tcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 21191846  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    |  || |||  ||||||||||| |||  || |||||||||    
21191845 ttgaattagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaat 21191806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 2819849 - 2819728
Alignment:
445 aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||  |||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
2819849 aagcaaaagatttccaatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaat-tacaaagaaatatgtttggtttgaacacttgatatacaatca 2819751  T
545 gtggtgttctcaatacaatacaa 567  Q
    ||||||||| || ||||| ||||    
2819750 gtggtgttcacagtacaaaacaa 2819728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16233824 - 16233552
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa--gattacaaatgctcaatactatcaaaat 385  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |   |||||||  |||||||  | | |||||     
16233824 gttccttccacaatccggaagtagtcttgtcccccttgcgcttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgattacagttgctcaa--cca-caaaac 16233728  T
386 atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaga 484  Q
    | |||||||||   |||| || || |||| | |||||||  |||| |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||| |    
16233727 aagagacttca---aactactaaatcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagaaa 16233631  T
485 cttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||| | |||||| |  |||| |||| || ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
16233630 cttctaaacaaacacaattacatagaaatatgtttgaggttgaacacttgacatactatcagtggtgttcacaatacaa 16233552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22202434 - 22202376
Alignment:
289 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
22202434 ttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 22202376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 399 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17025551 - 17025386
Alignment:
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||  ||||||    
17025551 aaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaac 17025452  T
498 aaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    | |  ||||  |||  | ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
17025451 agaattacaaggaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 17025386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 21120928 - 21120879
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21120928 gcttctgatgaatttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 21120879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1193
Target Start/End: Original strand, 21984811 - 21984868
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
21984811 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcaattcaaacttcag 21984868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 23024984 - 23025033
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23024984 gcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 23025033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1141 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 2327260 - 2327216
Alignment:
1141 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2327260 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 2327216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7745752 - 7745595
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatca 381  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |    
7745752 ggttccttccacaaaccggaagtagccatgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaaaaataatcacacagattacaattgctcaatactacaa 7745653  T
382 -aaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 443  Q
     || |||||||||||       |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
7745652 caagtatgagacttc----ctttgctcaagcacaca-gcaagagacttcctatgctcaagcac 7745595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1105 - 1185
Target Start/End: Original strand, 19215792 - 19215872
Alignment:
1105 cttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||| |   ||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
19215792 cttctgatgatctgcagcttctggtgaatttgcttctgatgaatttgcttctgatgacgacatcacttcagaagcactttg 19215872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 21135023 - 21134975
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
21135023 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcatttcagaagcactttg 21134975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 900 - 984
Target Start/End: Original strand, 21984600 - 21984683
Alignment:
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgc 984  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||  ||||||||||||    
21984600 aaaaaaagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatccaatgc 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 10756966 - 10757081
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
10756966 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 10757065  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
10757066 ggtgttcacaatacaa 10757081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1039 - 1161
Target Start/End: Original strand, 17371167 - 17371290
Alignment:
1039 ttagacgaggttgaatccattaaatagct-tttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgc 1137  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | || |||||| | | | ||||||||   |||||||||| |||||||| |||| |   |||||||||| ||||||    
17371167 ttagaagaggttgaatccaataaacaactatttgaaacttcaggttgcatcttttgatgaactgtagcttctggtgatatgcagcttctgatagacttgc 17371266  T
1138 ttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
17371267 ttctgatgaacttgcttctgatga 17371290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 26280633 - 26280474
Alignment:
405 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    |||||||||| | |||||||  |||  |||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||   ||||||||  |    
26280633 ctcaagcacaaaagcaagagatttcttatgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaacaaaatt 26280534  T
504 acagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
26280533 acacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagaggtgttcacgatacaa 26280474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 352
Target Start/End: Original strand, 31358730 - 31358809
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
31358730 aagcaattatcctggttccttccacaatctagaagtagtccaatcccccctgcacttccaaggagattttcactataatc 31358809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 562
Target Start/End: Original strand, 7309175 - 7309475
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa---gatta 362  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||   | |   |||||    
7309175 aaagacacaagcaattatataggttccttccacaaatcggaagtagtactgtcccccttgcacttctaaggagagttcactaaaatgtaatatctgatta 7309274  T
363 caaatgctcaatact-atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 460  Q
    |||||||||| | || | |  |  | ||||||||    || ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||    
7309275 caaatgctcactgctaaacttagcaagagacttc----aaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagaacacaatcaagagacttcta 7309370  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
7309371 atgttcaagcacaaatgcaagagacttctaaattcaaacagaattacacagaaaattgtctgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacat 7309470  T
558 tacaa 562  Q
    |||||    
7309471 tacaa 7309475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 18130300 - 18130254
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
18130300 atcttcaagtcttcactcctatatatagaggtgtgaaagagacgttg 18130254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 52351335 - 52351269
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 334  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
52351335 agacacaagcaattatactggttccttctacaaaccggaagtagtccagtcccccctgcacttccaa 52351269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 901 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 17025039 - 17024923
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||| ||||||| | ||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||  |    
17025039 aaaacaaagaagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgc-tctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttga 17024941  T
1001 aatagtcgttgcttcact 1018  Q
    | ||||||||||||||||    
17024940 attagtcgttgcttcact 17024923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 863 - 959
Target Start/End: Original strand, 19215578 - 19215675
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||    
19215578 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaatcacactatgtcaacgct 19215675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 352
Target Start/End: Original strand, 22639682 - 22639762
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatc 352  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
22639682 aagcaattatcctatttccttccacaacctggaagtagtccagttccccttgcacttcaaaggagatttttcactataatc 22639762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 25449097 - 25448961
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
25449097 caagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagatttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatca 25448998  T
545 gtggtgttctcaatacaataca-ataaagactctaga 580  Q
    ||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||    
25448997 gtggtgttcacaatacaaatcagataaagactctaga 25448961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 10250783 - 10250823
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10250783 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 10250823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 12283800 - 12283860
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
12283800 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12283860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 12624839 - 12624799
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12624839 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12624799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12625255 - 12625195
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
12625255 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12625195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 21135443 - 21135403
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21135443 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21135403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 21205156 - 21205116
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21205156 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21205116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21205574 - 21205296
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat--aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaa 383  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||  |   ||||||||||||||| ||||| |       
21205574 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatct--gattacaaatgctcactactaacctt 21205477  T
384 a-tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 481  Q
    | || |||||||||   || ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||  | ||  || ||||||||||||| |||||||||||    |||||    
21205476 agtaagagacttca---aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctccggaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaag 21205380  T
482 agacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| |  |||||||||  |||| ||||  | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21205379 agacttcttaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacccttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21205296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 563
Target Start/End: Original strand, 21543566 - 21543698
Alignment:
433 tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacac 530  Q
    |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||    
21543566 tgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 21543665  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
21543666 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaat 21543698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 21984392 - 21984432
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21984392 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21984432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22428040 - 22427980
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
22428040 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22427980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22601306 - 22601219
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
22601306 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaat-cggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 22601219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 882 - 934
Target Start/End: Original strand, 23064935 - 23064987
Alignment:
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
23064935 ttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 23064987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 863 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 26702243 - 26702151
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtca 954  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
26702243 tgcaggcatagctgttattcttgtcttgtagcagagacacatactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtca 26702151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Original strand, 26703073 - 26703233
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||| |  | |||||||| ||   ||||||||||||  | ||||||||||| | | ||||||||     
26703073 tgctcaaacacacaagcaagagacttcaaatactcaagcgcacatgcaagagattttctatgctcaagcacaaaagcaagagacttataaacaaacaaaa 26703172  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
     |||| | ||  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
26703173 ttacatataaagatgtttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 26703233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 897 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 12613893 - 12613756
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| | ||  | |||| |||| ||||||| |||||| ||||    
12613893 gacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgc-tcttcaaagaacaagcaaccaatgctttcaaa-tctt 12613796  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    |  || ||| |||||||||||| |||  || |||||||||    
12613795 ttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaat 12613756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 16235152 - 16235105
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
16235152 gcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 16235105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18897131 - 18897017
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||  |||| ||||  |||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
18897131 caagagactttttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaa-caaaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 18897033  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
18897032 ggtgttcacaatacaa 18897017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Original strand, 21029019 - 21029066
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
21029019 gcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactt 21029066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 28492258 - 28492211
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
28492258 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttgaggagcactt 28492211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 52351250 - 52351174
Alignment:
385 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
52351250 tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 52351174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 562
Target Start/End: Original strand, 2834230 - 2834343
Alignment:
452 agacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtgg 548  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
2834230 agacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacacaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 2834329  T
549 tgttctcaatacaa 562  Q
    ||||| ||||||||    
2834330 tgttcacaatacaa 2834343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 342
Target Start/End: Original strand, 8698265 - 8698327
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 342  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
8698265 ttatcctcgttccttccacaatccagaagtagtctagtccccattgcacttccaaggagattt 8698327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 9346563 - 9346609
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
9346563 atcttcaactcttcactcctttatatagaggtgtgaaggagacgttg 9346609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1174
Target Start/End: Original strand, 17371265 - 17371319
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaac-ttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
17371265 gcttctgatgaacttgcttctgatgaactttgcttctaatgacgtcatcacttca 17371319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21121766 - 21121488
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat--aatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caa 382  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||  |   ||||||||||||||| |||||  |      
21121766 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatct--gattacaaatgctcactactaaactt 21121669  T
383 aatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctc--aagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 480  Q
    | || |||||||||   || ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||  || ||| || ||||||||||||| |||||||||||    ||||    
21121668 agtaagagacttca---aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctaaacac-aatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaa 21121573  T
481 gagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| |  ||||||  |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21121572 gagacttcttaattcaaacggaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21121488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 562
Target Start/End: Original strand, 22639779 - 22639934
Alignment:
405 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||   |||| |||||||  | |||  |||||||  | |||| |||  |    
22639779 ctcaagcacacaagcaagagacttcaaatgctcaagcacaaaagcaagagactttctatgcacaagcacaaaagcagaagacttcctaacaaataaat-t 22639877  T
504 acagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22639878 acaaagaat-aagtttgg-ttaaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22639934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #214
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 23054158 - 23054204
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
23054158 atcttcaagtcttcactcctttgtatagagatgtgaaagagacgttg 23054204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #215
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26702845 - 26702771
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
26702845 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 26702771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #216
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44824461 - 44824399
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
44824461 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 44824399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #217
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 562
Target Start/End: Original strand, 48703741 - 48703859
Alignment:
446 agcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat-caaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatc 543  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||    
48703741 agcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatc 48703840  T
544 agtggtgttctcaatacaa 562  Q
    | |||||||| | ||||||    
48703841 aatggtgttcacgatacaa 48703859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #218
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 4250422 - 4250370
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
4250422 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 4250370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #219
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1128 - 1169
Target Start/End: Complemental strand, 7744924 - 7744883
Alignment:
1128 ataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
7744924 ataaacttgcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatca 7744883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #220
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1138 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 12613633 - 12613588
Alignment:
1138 ttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
12613633 ttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 12613588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #221
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 418 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14264002 - 14263854
Alignment:
418 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaatta 514  Q
    ||||||| ||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||       
14264002 gcaagagacttcctatgctcctgaactaagtcaagagacttctattgctcaagcacaaaagcaagagacttctcaattcaaacagaattacaaagaaaat 14263903  T
515 agtttgact-tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
     ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14263902 tgtttgagactgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14263854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #222
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 734
Target Start/End: Original strand, 21702610 - 21702651
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
21702610 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttga 21702651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #223
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23037206 - 23037145
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
23037206 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 23037145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #224
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 1577223 - 1577307
Alignment:
266 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
1577223 aaagacacagagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttcactat 1577307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #225
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 2268327 - 2268367
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
2268327 aagtcttcactccattatatagaggtgtgaaagagacgttg 2268367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #226
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 4167610 - 4167661
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
4167610 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 4167661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #227
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 5639566 - 5639515
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
5639566 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 5639515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #228
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 5650123 - 5650072
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
5650123 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 5650072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #229
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 12284219 - 12284259
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12284219 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12284259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #230
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16235580 - 16235540
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
16235580 aagtcttcactcctttatatggaggtgtgaaagagacgttg 16235540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #231
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18130537 - 18130434
Alignment:
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac--ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||  | ||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
18130537 atgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaaatgtttgaggtttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaat 18130438  T
559 acaa 562  Q
    ||||    
18130437 acaa 18130434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #232
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Original strand, 18614301 - 18614361
Alignment:
293 ttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
18614301 ttccacaatccggaagtagtccactcccccttgaacttccaaggagaattcactaaaatca 18614361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #233
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19179311 - 19179362
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19179311 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19179362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #234
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 19188171 - 19188222
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19188171 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19188222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #235
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 20441174 - 20441123
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
20441174 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 20441123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #236
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 21121347 - 21121307
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21121347 agtctacactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21121307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #237
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1175
Target Start/End: Complemental strand, 21191720 - 21191680
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcag 1175  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21191720 tgcttcagatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcag 21191680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #238
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 21192149 - 21192109
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
21192149 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 21192109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #239
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21192594 - 21192506
Alignment:
261 aaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
21192594 aaaagaaagacacaaagcaattatactggttccttcaacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21192506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #240
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 21214960 - 21214920
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21214960 agtcttaactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21214920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #241
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 22202020 - 22201980
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22202020 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttg 22201980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #242
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 562
Target Start/End: Original strand, 23024171 - 23024449
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat--aatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caa 382  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  |   ||||||||||||||| |||||  |      
23024171 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatct--gattacaaatgctcactactaaactt 23024268  T
383 aatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 481  Q
    | ||||||| ||||   || ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||  | ||  || ||||||||||||| |||||||||||    |||||    
23024269 agtatgagaattca---aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaag 23024365  T
482 agacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| |  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
23024366 agacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 23024449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #243
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1193
Target Start/End: Original strand, 23927268 - 23927327
Alignment:
1136 gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
23927268 gcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 23927327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #244
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24211262 - 24211201
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcaga 222  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
24211262 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcaga 24211201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #245
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25449260 - 25449196
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 350  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
25449260 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactataa 25449196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #246
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 26702413 - 26702373
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
26702413 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaaagacgttg 26702373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #247
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 863 - 1018
Target Start/End: Original strand, 30893058 - 30893213
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |     
30893058 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagtagagacacaaacttagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgc-ta 30893156  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcact 1018  Q
    ||  | |||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
30893157 ttcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcctttcaaaatagcctttgcttcact 30893213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #248
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 33084913 - 33084964
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
33084913 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 33084964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #249
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 35013273 - 35013324
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
35013273 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 35013324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #250
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 36133742 - 36133858
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat-caaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| || |||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
36133742 caagagacttctaatgctcaagcacaactacaagagacttctaattcaaacagaattacatagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacattcag 36133841  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| ||||||||    
36133842 tggtgttcacaatacaa 36133858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #251
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 36133985 - 36134025
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
36133985 aagtcttcactcctttatatagaggtgtggaagagacgttg 36134025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #252
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 578
Target Start/End: Original strand, 37640627 - 37640683
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaataca-ataaagactcta 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||    
37640627 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaaatcagataaagactcta 37640683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #253
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 42284425 - 42284465
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
42284425 agtcttcactcctttatatagagttgtgaaagagacgttga 42284465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #254
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2327898 - 2327859
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2327898 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 2327859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #255
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 461
Target Start/End: Original strand, 9346299 - 9346358
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 461  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
9346299 tgctcaagcatacacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttctaa 9346358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #256
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 10250603 - 10250642
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
10250603 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 10250642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #257
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 10756803 - 10756862
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
10756803 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 10756862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #258
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12669883 - 12669814
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 351  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12669883 ttatactggttcctcccacaacacaatagtagtccagt-ccccttgcacttccaagga-atttcactataat 12669814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #259
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14293146 - 14293107
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14293146 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14293107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #260
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 18517451 - 18517404
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
18517451 atcttcaagtcttcactcatttatatagagatgtgaaagaggcgttga 18517404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #261
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18517622 - 18517583
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
18517622 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 18517583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #262
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 688 - 731
Target Start/End: Original strand, 18614707 - 18614750
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
18614707 tcttcacgtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgt 18614750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #263
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22202196 - 22202157
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22202196 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22202157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #264
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22427800 - 22427761
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22427800 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22427761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #265
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22465507 - 22465452
Alignment:
292 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
22465507 cttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22465452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #266
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22600901 - 22600826
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22600901 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22600826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #267
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 23036969 - 23036930
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
23036969 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 23036930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #268
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 30892711 - 30892750
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
30892711 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 30892750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #269
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 33256812 - 33256773
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
33256812 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 33256773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #270
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 33276984 - 33276945
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
33276984 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 33276945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #271
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 35039783 - 35039822
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
35039783 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 35039822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #272
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 38282181 - 38282220
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
38282181 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 38282220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #273
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 44824224 - 44824185
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
44824224 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 44824185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #274
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 46180738 - 46180676
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
46180738 cttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgtaacttcag 46180676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #275
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 48570693 - 48570654
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
48570693 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 48570654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #276
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1183
Target Start/End: Original strand, 4178266 - 4178300
Alignment:
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4178266 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 4178300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #277
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 10250367 - 10250429
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
10250367 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 10250429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #278
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16235848 - 16235732
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||| |    
16235848 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatta 16235750  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
16235749 gtggtgttcacaatacaa 16235732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #279
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 17018370 - 17018416
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
17018370 atcttcaagttttcactcctttatatagacgtgtaaaagagacgttg 17018416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #280
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 18381741 - 18381707
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18381741 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 18381707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #281
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 20110239 - 20110193
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
20110239 atcttaaagtcttcactcctttatatagagttatgaaagagacgttg 20110193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #282
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1193
Target Start/End: Original strand, 20799271 - 20799364
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaacttg-cttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
20799271 agcttctgatgaaatcttgcttctgatgaactttacttctgatgatcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 20799364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #283
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1138 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 20883719 - 20883662
Alignment:
1138 ttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
20883719 ttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 20883662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #284
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 460
Target Start/End: Original strand, 21543566 - 21543624
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
21543566 tgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 21543624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #285
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 21544237 - 21544287
Alignment:
1136 gcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
21544237 gcttctgatgaactttgcttctgatgatgtcatcacttcagaggcactttg 21544287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #286
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 21983974 - 21984036
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
21983974 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 21984036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #287
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 23935379 - 23935333
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
23935379 atcttcaagtcttcattcttttatatagaggtatgaaagagacgttg 23935333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #288
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 562
Target Start/End: Original strand, 27858295 - 27858397
Alignment:
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||  |||| | ||  | ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
27858295 atgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaaattacacaaaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaata 27858394  T
560 caa 562  Q
    |||    
27858395 caa 27858397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #289
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28493005 - 28492924
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
28493005 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctatcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 28492924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #290
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 46088528 - 46088645
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
46088528 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 46088627  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||  |||||||    
46088628 gtggtgttcataatacaa 46088645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #291
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 148071 - 148019
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
148071 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 148019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #292
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2328137 - 2328076
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
2328137 ggttccttccacaaattggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2328076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #293
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 730
Target Start/End: Original strand, 10757219 - 10757256
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
10757219 aagtcttcactcctttatacagaggtgtgaaagagacg 10757256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #294
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 14263737 - 14263696
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
14263737 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaagagacgttga 14263696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #295
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 700 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 18896872 - 18896839
Alignment:
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18896872 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18896839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #296
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 561
Target Start/End: Original strand, 19215153 - 19215268
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
19215153 caagagacttctattgctcaagcacaattgcaagagacttctcaattcaaacagaattacaaagaat-atgtttgagtttgaacacttgatatacaatca 19215251  T
545 gtggtgttctcaataca 561  Q
    ||| ||||| |||||||    
19215252 gtgatgttcacaataca 19215268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #297
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 701 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 21206909 - 21206876
Alignment:
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21206909 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21206876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #298
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1180
Target Start/End: Complemental strand, 23580182 - 23580134
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
23580182 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 23580134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #299
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1138 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 26701981 - 26701936
Alignment:
1138 ttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
26701981 ttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcatgagcactt 26701936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #300
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1152 - 1193
Target Start/End: Original strand, 30572421 - 30572462
Alignment:
1152 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
30572421 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttaaacttcag 30572462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #301
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 2268070 - 2268186
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat-caaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| || |||||| |  |||| | ||  | ||||||  |||||||||||||||||||| ||    
2268070 caagagacttctaatgctcaagcacaacttcaagagacttctaattcaaacagaattacacataaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaattag 2268169  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| ||||||||    
2268170 tggtgttcacaatacaa 2268186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #302
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 7309615 - 7309655
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
7309615 aagtcttcactcctttaaatagaggtgagaaagagacgttg 7309655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #303
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 12614172 - 12614121
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
12614172 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 12614121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #304
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 12623637 - 12623586
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
12623637 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 12623586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #305
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 12897839 - 12897788
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
12897839 ttgcttctgatgaccttttgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 12897788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #306
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 901 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 18896672 - 18896636
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
18896672 aaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 18896636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #307
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 729
Target Start/End: Original strand, 21028590 - 21028626
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
21028590 aagtcatcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 21028626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #308
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 863 - 959
Target Start/End: Original strand, 21028760 - 21028856
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| ||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | |||  ||||||||||| ||||    
21028760 tgcaggcatagttgtattcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgct 21028856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #309
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 21864012 - 21864063
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
21864012 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 21864063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #310
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 21878118 - 21878169
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
21878118 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 21878169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #311
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 22153653 - 22153693
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22153653 aagttttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttg 22153693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #312
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 30571994 - 30572034
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
30571994 agtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacattga 30572034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #313
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 30892889 - 30892929
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
30892889 aagtcttcattcctttacatagaggtgtgaaagagacgttg 30892929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #314
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1185
Target Start/End: Original strand, 37642477 - 37642513
Alignment:
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
37642477 ttgcttctaatgacgtcatcacttcagaagcactttg 37642513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #315
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1141 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 39200843 - 39200799
Alignment:
1141 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
39200843 tgatgaacttgcttttgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 39200799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #316
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 562
Target Start/End: Original strand, 42284019 - 42284297
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat--aatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caa 382  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||  |   ||||||||||||||| |||||  |      
42284019 ggttccttccacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatct--gattacaaatgctcactactaaactt 42284116  T
383 aatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 481  Q
    | ||||||||||||   || ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||  | ||  || ||||||||||||| |||||||||||    |||||    
42284117 agtatgagacttca---aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaag 42284213  T
482 agacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| |  ||||||| |  ||||  |||  | ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
42284214 agacttctaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 42284297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #317
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 44824045 - 44824005
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
44824045 agtcttcactcctttatatagaagtttgaaagagacgttga 44824005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #318
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 45070527 - 45070435
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaact-tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
45070527 agcttctgatgaaattttgcttcttatgaactttgcttctgatgtcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 45070435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #319
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 1577483 - 1577522
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
1577483 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaaaatacaa 1577522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #320
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1153 - 1184
Target Start/End: Original strand, 7310060 - 7310091
Alignment:
1153 ttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
7310060 ttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 7310091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #321
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 7689295 - 7689245
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
7689295 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 7689245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #322
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 12284042 - 12284081
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
12284042 ttgaacacttgatatacaatcagtggtattcacaatacaa 12284081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #323
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12625016 - 12624977
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
12625016 ttgaacacttaatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 12624977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #324
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 17025246 - 17025207
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
17025246 aagtcttcacttatttatatagaggtgtgaaagagacgtt 17025207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #325
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 18515612 - 18515651
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
18515612 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaacacaa 18515651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #326
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 19717140 - 19717179
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
19717140 ttgaacacttgatatgcaatcagtggtgttcacaatacaa 19717179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #327
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 558
Target Start/End: Original strand, 21028412 - 21028447
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
21028412 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 21028447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #328
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 21702431 - 21702470
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
21702431 ttgaacacttgatgtacaatcagtggtgttcacaatacaa 21702470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #329
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 23036790 - 23036751
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
23036790 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagaaacgtt 23036751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #330
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 26280346 - 26280271
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-gataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||| || |||||||||||    
26280346 atctttaagtcttcactcctttattttgaggtgtgagagatacgttgaggattgtcagcacatcaaaagagtcgtt 26280271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #331
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 345
Target Start/End: Original strand, 26702970 - 26703049
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 345  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||    
26702970 aaagacacaagcaattatacaagttccttccacaatctggaagtagttctgtccctcttgcacttccaaagagagttcac 26703049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #332
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 28492863 - 28492824
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
28492863 ttgaacacttgatatacaatcagcggtgttcacaatacaa 28492824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #333
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 30571814 - 30571853
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
30571814 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaa 30571853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #334
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 32786402 - 32786363
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
32786402 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcgcaatacaa 32786363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #335
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 36133569 - 36133644
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| || || | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
36133569 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttagccctggcccccttgcacttccaaggagagttcactat 36133644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #336
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 48570951 - 48570868
Alignment:
267 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
48570951 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 48570868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #337
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 48703642 - 48703701
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||    
48703642 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgcccccattgcacttccaaggagagttcacta 48703701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #338
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1182
Target Start/End: Original strand, 2267296 - 2267342
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||    
2267296 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcactacttcaggagcact 2267342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #339
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 2819607 - 2819561
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
2819607 atcttcaaatcttcatttctttatatagaggtatgaaagagacgttg 2819561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #340
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1147 - 1185
Target Start/End: Original strand, 2834924 - 2834962
Alignment:
1147 acttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
2834924 acttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 2834962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #341
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 9050325 - 9050276
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
9050325 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcact 9050276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #342
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 346
Target Start/End: Original strand, 9346157 - 9346215
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 346  Q
    |||||||||||||  || ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
9346157 gttccttccacaatccgtaagtagtcatgtcccctttgcacttccaaggagagttcact 9346215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #343
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 17017969 - 17018035
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
17017969 ggttccttccataaatcagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcgctaaaatca 17018035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #344
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867341
Alignment:
421 agagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 20867341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #345
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21684659 - 21684593
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
21684659 ggttccttccacaattcggaagtagccatgtcccccttgcaattccaagtagaattcactaaaatca 21684593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #346
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 21702193 - 21702255
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
21702193 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctatccctcttgcacttccaaggagagttcactat 21702255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #347
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 561
Target Start/End: Original strand, 23053988 - 23054026
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
23053988 ttgaacgcttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 23054026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #348
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 26280605 - 26280547
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 460  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    
26280605 tgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 26280547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #349
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 373
Target Start/End: Original strand, 27858155 - 27858241
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 373  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |  |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
27858155 ggttccttccacaattcggaagtagtcttg--ccccttacacttccaaggagagttcactaaaatcaaaatttgattacaaatgctcaa 27858241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #350
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1148 - 1186
Target Start/End: Original strand, 30893314 - 30893352
Alignment:
1148 cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
30893314 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagtactttga 30893352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #351
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 31359111 - 31359157
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||    
31359111 atcttcaagtcttcattcatttatatagatgtatgaaagagacgttg 31359157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #352
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 38281763 - 38281825
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
38281763 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactat 38281825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #353
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 154127 - 154094
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
154127 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 154094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #354
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 5974133 - 5974166
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
5974133 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 5974166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #355
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 12730916 - 12730949
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
12730916 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 12730949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #356
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 12741509 - 12741542
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
12741509 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 12741542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #357
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14293326 - 14293265
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagta-gtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
14293326 ggttccttccacaaaccggaaataagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14293265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #358
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18130650 - 18130613
Alignment:
316 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
18130650 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18130613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #359
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 21895571 - 21895604
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
21895571 tgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 21895604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #360
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 22609816 - 22609783
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22609816 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 22609783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #361
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 26576987 - 26577020
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
26576987 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 26577020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #362
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 694 - 736
Target Start/End: Original strand, 26703351 - 26703395
Alignment:
694 agtcttcactcctttata--tagaggtgtgaaagagacgttgaga 736  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
26703351 agtcttcacttctttatatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 26703395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #363
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1180
Target Start/End: Complemental strand, 30291932 - 30291884
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
30291932 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagca 30291884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #364
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 39193951 - 39193899
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
39193951 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttaagatgcactt 39193899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #365
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 39587319 - 39587371
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
39587319 cttgcttctgatgaccttctgcttccgatgacgtcatcacttcagaggcactt 39587371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #366
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Original strand, 46088368 - 46088429
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
46088368 gttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 46088429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 630; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 630; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 7756 - 6926
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||     ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||| ||    
7756 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtattttctttttctctctaaaaattcttcttctaataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 7657  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
7656 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 7558  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
7557 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttgactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaa 7458  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
7457 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 7358  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7357 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaattagtggtgttctcaatacaaaacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 7258  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct-tatcttcaagtcttc 700  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||    
7257 caaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgta--tctctatctcaatcttcaagtcttc 7160  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
7159 actcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaaacctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgg 7060  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7059 tttgggtgtagtcctttaaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 6960  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6959 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 619; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 619; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 14023 - 14800
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
14023 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaagtgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 14121  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14122 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 14221  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
14222 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 14321  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
14322 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 14421  T
558 tacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
14422 tacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttgg 14521  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14522 cgcttttgaacttgtatatctctatatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 14621  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 856  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
14622 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtac 14721  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
14722 aaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 594; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 54995 - 54164
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||  || |||||||||||   ||||||||    
54995 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtg 54896  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
54895 cttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 54797  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
54796 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 54697  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
54696 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 54597  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
54596 atacaatgaattaactttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgta 54497  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct-tatcttcaagtctt 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||  |||||||||||||    
54496 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctcact-tctcaatcttcaagtctt 54398  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
54397 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctg 54298  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
54297 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcatggac 54198  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
54197 -aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 54164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 694 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 5915 - 5424
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  |||||    ||    
5915 agtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaacgatc 5818  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    |||||| |||| ||| | | ||||  ||||| || || || |||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||| | ||||||| | |||||||||    
5817 ctttgcttgatatggttattgtccaatgaaggatcagtttaaaatgcattcccatagtgaaggaacatcat-tgcaggtagagctgtttttcttgtcttg 5719  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||| || |||  |||||| ||||| ||||    
5718 tagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctcttt-gaagaataagcatcaaatgccttca 5620  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |||| |||||||     
5619 aatcctttcaaaatagttgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaatctttaaattgcatct 5520  T
1090 catgatgaa---ctgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
      |||||||   | |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||    
5519 tctgatgaacagcagcagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaccttgcttctgat---gtcatcacttcaggagcactttg 5424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 14988 - 15039
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
14988 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 15039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 81015 - 81054
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
81015 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 81054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 80775 - 80835
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||| |||||||    
80775 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcctcattgtacttccaaggagagttcacta 80835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 6094 - 6056
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaataca 561  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
6094 ttgaatacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 6056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 609; Significance: 0; HSPs: 349)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 609; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 160 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 30489618 - 30488842
Alignment:
160 aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaag 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30489618 aaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagactgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaag 30489519  T
260 aaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaaga 359  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30489518 aaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaaga 30489419  T
360 ttacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30489418 ttacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcaaaagactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 30489319  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
30489318 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatactgagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 30489219  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
30489218 caatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgc 30489119  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30489118 ttttgaacttatgtatatctctatataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 30489019  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacat 858  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||   | |||     
30489018 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcgttcccatcttgagttgtacaa 30488919  T
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30488918 attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30488842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 29243657 - 29244431
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
29243657 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 29243753  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29243754 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 29243853  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
29243854 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagaaagagactt 29243953  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
29243954 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 29244053  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
29244054 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 29244153  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||| ||||| | ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29244154 gctttttaacttatgtatatctgtcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 29244253  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
29244254 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtaca 29244353  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29244354 acttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29244431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 29254236 - 29255010
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
29254236 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 29254332  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
29254333 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataataacaaa 29254432  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29254433 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 29254532  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
29254533 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 29254632  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
29254633 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 29254732  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||| ||||| | ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29254733 gctttttaacttatgtatatctgtcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 29254832  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
29254833 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtaca 29254932  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29254933 acttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29255010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 600; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 16768352 - 16769152
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
16768352 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 16768448  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16768449 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 16768548  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
16768549 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 16768648  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
16768649 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 16768748  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16768749 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 16768848  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
16768849 tagaatcaatttgacagagttttgacgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatataaaggcgtgaaagagacgt 16768948  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
16768949 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattattcaccagtaatactttgcctgatttgggtgtggtcctttgaagaataagcttc 16769048  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
16769049 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatgactgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 16769148  T
931 actt 934  Q
    ||||    
16769149 actt 16769152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 35262965 - 35263801
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa--ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
35262965 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 35263064  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35263065 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 35263164  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
35263165 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 35263263  T
401 act--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
35263264 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 35263363  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
35263364 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatg 35263463  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
35263464 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctattttatcttcaagtct 35263563  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
35263564 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcct 35263663  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
35263664 gatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtag 35263763  T
898 aca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35263764 acagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35263801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 35273590 - 35274426
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa--ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
35273590 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 35273689  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35273690 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 35273789  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
35273790 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 35273888  T
401 act--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
35273889 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 35273988  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
35273989 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatg 35274088  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
35274089 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctattttatcttcaagtct 35274188  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
35274189 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcct 35274288  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
35274289 gatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtag 35274388  T
898 aca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35274389 acagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35274426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 43082063 - 43082856
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
43082063 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 43082159  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43082160 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 43082259  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
43082260 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 43082359  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
43082360 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 43082459  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43082460 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgactttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 43082559  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
43082560 tagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttatgtatctctatattttatcttcaag-------tcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 43082652  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
43082653 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 43082752  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
43082753 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagactagtggaggtagtggttgtac 43082852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 43092672 - 43093465
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
43092672 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 43092768  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43092769 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 43092868  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
43092869 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 43092968  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
43092969 atgctcaagcactaagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 43093068  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43093069 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 43093168  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
43093169 tagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttatgtatctctatattttatcttcaag-------tcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 43093261  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
43093262 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 43093361  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
43093362 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatgactgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagactagtggaggtagtggttgtac 43093461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 7006627 - 7005826
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatat 231  Q
    |||||||||||||||||||   ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
7006627 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 7006531  T
232 gcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 330  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7006530 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 7006431  T
331 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
7006430 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 7006331  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
7006330 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacac 7006231  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7006230 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 7006131  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7006130 gtagaatcaaattgatagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 7006031  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
7006030 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 7005931  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
7005930 caaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 7005831  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
7005830 cactt 7005826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 27220755 - 27221591
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa--ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
27220755 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 27220854  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27220855 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 27220954  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
27220955 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 27221053  T
401 act--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
27221054 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 27221153  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
27221154 aaaatatagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatg 27221253  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||    
27221254 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatatctctgttttatcttcaagtct 27221353  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
27221354 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcct 27221453  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
27221454 gatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtag 27221553  T
898 aca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27221554 acagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27221591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 35252356 - 35253192
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa--ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
35252356 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 35252455  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35252456 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 35252555  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
35252556 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 35252654  T
401 act--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
35252655 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 35252754  T
499 aagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatg 598  Q
    || |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
35252755 aaaatacagagaattgagttgaatttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatg 35252854  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
35252855 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctattttatcttcaagtct 35252954  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
35252955 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcct 35253054  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
35253055 gatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtag 35253154  T
898 aca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35253155 acagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35253192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 11389602 - 11388828
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
11389602 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 11389506  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11389505 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 11389406  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11389405 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 11389306  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
11389305 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 11389206  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
11389205 tacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 11389106  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11389105 gcttttgaacttatgtatctctctcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 11389006  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||    
11389005 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca 11388906  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11388905 aattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11388828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 24339197 - 24338423
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
24339197 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 24339101  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24339100 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 24339001  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24339000 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 24338901  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
24338900 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 24338801  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
24338800 tacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 24338701  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
24338700 gcttttgaacttatgtatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcatgtctaaagagt 24338601  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
24338600 cgtttgaaatcctttgattatccatcagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtaca 24338501  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24338500 aattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24338423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 2560921 - 2561698
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
2560921 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 2561019  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
2561020 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaa 2561119  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
2561120 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 2561219  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
2561220 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaaatttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 2561319  T
558 tacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
2561320 tacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttga 2561419  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 754  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
2561420 cgctttttaacctgtgtatgtctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaag 2561519  T
755 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 854  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
2561520 agtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccactttgaaggc 2561619  T
855 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2561620 acaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2561698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 24328527 - 24327753
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
24328527 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 24328431  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24328430 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 24328331  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24328330 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 24328231  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
24328230 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 24328131  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
24328130 tacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 24328031  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
24328030 gcttttgaacttatgtatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcatgtctaaagagt 24327931  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
24327930 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtaca 24327831  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24327830 aattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24327753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 1100014 - 1099214
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
1100014 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 1099918  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1099917 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 1099818  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
1099817 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 1099718  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
1099717 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 1099618  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1099617 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 1099518  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
1099517 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 1099418  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
1099417 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttc 1099318  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
1099317 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 1099218  T
931 actt 934  Q
    ||||    
1099217 actt 1099214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17858255 - 17857456
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
17858255 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatg-tcagagtcagat-tg 17858160  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17858159 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17858060  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
17858059 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatattttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 17857960  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
17857959 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 17857860  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17857859 tgatatacaatcagtgatgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 17857760  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
17857759 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgtctccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 17857660  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17857659 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 17857560  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
17857559 aaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 17857460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 34477337 - 34478137
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
34477337 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 34477433  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34477434 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 34477533  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
34477534 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 34477633  T
431 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
34477634 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacac 34477733  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34477734 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 34477833  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
34477834 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 34477933  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
34477934 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaactt 34478033  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
34478034 caaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 34478132  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
34478133 cactt 34478137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22915683 - 22914883
Alignment:
138 ttgaattgtgttttct-tttct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||| |||||    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
22915683 ttgaattgtgttttctatttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22915587  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22915586 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22915487  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
22915486 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 22915387  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
22915386 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22915287  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22915286 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 22915187  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
22915186 tagaatcaaattgacagagttttggcgtttttgaacttatgtatctctatatacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 22915087  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22915086 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 22914987  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22914986 aaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 22914887  T
931 actt 934  Q
    ||||    
22914886 actt 22914883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22961151 - 22960351
Alignment:
138 ttgaattgtgttttct-tttct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||| |||||    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
22961151 ttgaattgtgttttctatttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22961055  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22961054 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22960955  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
22960954 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 22960855  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
22960854 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22960755  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22960754 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 22960655  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
22960654 tagaatcaaattgacagagttttggcgtttttgaacttatgtatctctatatacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 22960555  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22960554 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 22960455  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22960454 aaattcattctcatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 22960355  T
931 actt 934  Q
    ||||    
22960354 actt 22960351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 4219890 - 4220692
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
4219890 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 4219986  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4219987 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 4220086  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
4220087 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactactcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 4220186  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
4220187 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 4220286  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4220287 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 4220386  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
4220387 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgtctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 4220486  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
4220487 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 4220586  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
4220587 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 4220686  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
4220687 acactt 4220692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 40250602 - 40251403
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
40250602 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40250698  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40250699 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 40250798  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
40250799 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 40250898  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
40250899 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 40250998  T
532 tga-tatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40250999 tgattatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 40251098  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
40251099 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 40251198  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
40251199 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 40251298  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
40251299 caaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 40251398  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
40251399 cactt 40251403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9763586 - 9762789
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
9763586 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 9763490  T
234 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9763489 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 9763390  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
9763389 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaaatatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 9763290  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacactt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
9763289 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 9763190  T
533 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 632  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9763189 gatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 9763090  T
633 agaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
9763089 aaaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgt-tttaatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtgaaagagacgtt 9762992  T
733 gagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttca 832  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
9762991 gagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttca 9762892  T
833 aattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
9762891 aattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 9762792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 11395993 - 11395191
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
11395993 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 11395897  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11395896 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 11395797  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
11395796 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 11395697  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
11395696 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 11395597  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11395596 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 11395497  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
11395496 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcttgaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagac 11395397  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
11395396 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 11395297  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
11395296 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 11395197  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
11395196 acactt 11395191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 11406309 - 11405507
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
11406309 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 11406213  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11406212 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 11406113  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
11406112 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 11406013  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
11406012 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 11405913  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11405912 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 11405813  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
11405812 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcttgaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagac 11405713  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
11405712 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 11405613  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
11405612 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 11405513  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
11405512 acactt 11405507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18393458 - 18392656
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
18393458 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 18393362  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18393361 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 18393262  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
18393261 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 18393162  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
18393161 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 18393062  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18393061 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 18392962  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
18392961 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatttctctcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 18392862  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
18392861 gttgagatagtcagcacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaact 18392762  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
18392761 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 18392662  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
18392661 acactt 18392656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 565; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 40221741 - 40222542
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
40221741 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40221837  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
40221838 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttc 40221937  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
40221938 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtataagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 40222037  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
40222038 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 40222137  T
532 tga-tatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40222138 tgattatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 40222237  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
40222238 gtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 40222337  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
40222338 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctt 40222437  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
40222438 caaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 40222537  T
930 cactt 934  Q
    |||||    
40222538 cactt 40222542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 4209298 - 4210100
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
4209298 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 4209394  T
233 cagcggaaag-aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4209395 cagcggaaaggaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 4209494  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
4209495 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 4209594  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
4209595 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 4209694  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4209695 tgatatataatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 4209794  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
4209795 tagaatcaaattgacagagttttgacgcttttgaacttatgtatctctgtctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 4209894  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
4209895 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 4209994  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
4209995 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 4210094  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
4210095 acactt 4210100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9774122 - 9773325
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
9774122 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 9774026  T
234 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9774025 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 9773926  T
333 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
9773925 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 9773826  T
433 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacactt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
9773825 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 9773726  T
533 gatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 632  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9773725 gatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt 9773626  T
633 agaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
9773625 aaaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgt-tttaatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtgaaagagacgtt 9773528  T
733 gagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttca 832  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
9773527 gagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttca 9773428  T
833 aattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
9773427 aattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 9773328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 32217281 - 32218083
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
32217281 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 32217377  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32217378 cagcggaaaagaacagagcaaagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 32217477  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
32217478 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 32217577  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
32217578 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 32217677  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32217678 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 32217777  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
32217778 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 32217877  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
32217878 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 32217977  T
830 tcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
32217978 tcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 32218077  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
32218078 acactt 32218083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 10277009 - 10277780
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
10277009 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 10277105  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
10277106 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 10277204  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10277205 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 10277304  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
10277305 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 10277404  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
10277405 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttggcgc 10277504  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10277505 ttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 10277604  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
10277605 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 10277704  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10277705 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10277780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 21173290 - 21172486
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||   |||||||||||   || || |||||||||||  |||| ||||||||||||||    
21173290 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgtgatgaccagaatcagatatg 21173191  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21173190 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21173091  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
21173090 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 21172991  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||    
21172990 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaaca 21172891  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21172890 cttgatatacaatcagtggtgttcacaacacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 21172791  T
629 ttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
21172790 ttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagaga 21172691  T
729 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 828  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21172690 cgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 21172591  T
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 928  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
21172590 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaagcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt 21172492  T
929 acactt 934  Q
    ||||||    
21172491 acactt 21172486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 24415873 - 24415042
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |    
24415873 tgaaggtgagaaaaacacaagaaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaat 24415774  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
24415773 gcttctattgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 24415675  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
24415674 aacggaagttgtccagtcacccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 24415575  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
24415574 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 24415475  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
24415474 aatacaaagagataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgt 24415375  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |   |||||||||||||    
24415374 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctatctacaatcttcaagtctt 24415275  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
24415274 cactccttcatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcattcaccagtaatcatttgcctg 24415176  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24415175 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 24415076  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24415075 -aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24415042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 36252637 - 36251863
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
36252637 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcaaagtcagat-tgcagcggaaaagaacaaagcagagaaa 36252541  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36252540 agaaagacaatgacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 36252441  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36252440 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgtaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 36252341  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
36252340 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 36252241  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
36252240 cacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 36252141  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36252140 gctttttaacttatgtatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 36252041  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||    
36252040 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtaca 36251941  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36251940 aattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36251863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 163 - 934
Target Start/End: Original strand, 10266432 - 10267203
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
10266432 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 10266528  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 361  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
10266529 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 10266627  T
362 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10266628 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 10266727  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
10266728 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 10266827  T
560 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
10266828 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacaaagttttggcgc 10266927  T
660 ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 759  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10266928 ttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 10267027  T
760 tttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
10267028 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaa 10267127  T
860 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10267128 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10267203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 553; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9908984 - 9908181
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
9908984 ttgaattgtgttttcttttactcttaaaaaatacttcttctgataaaactccagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tg 9908888  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
9908887 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttacacttc 9908788  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac---tgctcaagcacacacgcaagagtctt 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
9908787 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtctt 9908688  T
429 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
9908687 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaac 9908588  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9908587 acttcatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 9908488  T
629 ttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
9908487 ttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagaga 9908388  T
729 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
9908387 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagc 9908288  T
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
9908287 ttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttg 9908188  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
9908187 tacactt 9908181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 28722168 - 28721336
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaat-tcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |   ||||| |    
28722168 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagtagtttgtgaat 28722069  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
28722068 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgaaaaagatcaaagcagagaaaagaaaggcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 28721970  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
28721969 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattgcaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 28721870  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
28721869 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaaaggcttctgatcaaacaaa 28721770  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     |||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
28721769 aatacaatgatataagtttgacttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatataatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgt 28721670  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||||||    
28721669 atcaaatcagtgcaaaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtctt 28721570  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
28721569 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctg 28721470  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28721469 atttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 28721370  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28721369 -aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28721336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 43354457 - 43355231
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
43354457 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 43354553  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
43354554 agaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa- 43354652  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43354653 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 43354752  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
43354753 ttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 43354852  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
43354853 aatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 43354952  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43354953 gcgcttttaaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 43355052  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |    
43355053 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgta 43355152  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43355153 ca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 43355231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 34790970 - 34790236
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
34790970 tgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaccagcagttatcctggttccttccaca 34790872  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||    
34790871 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaa 34790772  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
34790771 aaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 34790672  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgt 599  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
34790671 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgt 34790572  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| | |   |||||||||||||    
34790571 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgaatctctttcttcaatcttcaagtctt 34790472  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
34790471 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctg 34790372  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||    
34790371 atttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgaagac 34790272  T
900 a-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34790271 agaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 34790236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Original strand, 43344842 - 43345616
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
43344842 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 43344938  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
43344939 agaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa- 43345037  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 455  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43345038 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 43345137  T
456 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
43345138 ttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 43345237  T
556 aatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 655  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
43345238 aatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 43345337  T
656 gcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43345338 gcgcttttaaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 43345437  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  | |    
43345438 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcatttccatcttgagtgta 43345537  T
856 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43345538 ca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 43345616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9898396 - 9897593
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||   | ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||    
9898396 ttgaattgtgttttcttttactcttaaaaaatacttcttctgataaaactccagaagcag--tttgattgcttatgatgaaatgatcagagacagat-tg 9898300  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
9898299 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccataacacggaagtagttcagtcccccttgcacttc 9898200  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac---tgctcaagcacacacgcaagagtctt 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
9898199 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtctt 9898100  T
429 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||    
9898099 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttaagttgaac 9898000  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9897999 acttcatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 9897900  T
629 ttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
9897899 ttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagaga 9897800  T
729 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagc 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
9897799 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagc 9897700  T
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
9897699 ttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttg 9897600  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
9897599 tacactt 9897593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18769755 - 18768926
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||  | ||    
18769755 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggaaatg 18769656  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||     
18769655 cttttgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggtttcttccacaaa 18769557  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||    
18769556 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctctctaagtatgagacttctcaaaa 18769457  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
18769456 -tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 18769358  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
18769357 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgta 18769258  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||    
18769257 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttc 18769158  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
18769157 actcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctga 18769059  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
18769058 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac- 18768960  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18768959 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18768926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 201 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 34805113 - 34804379
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
34805113 tgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaccagcagttatcctggttccttccaca 34805015  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||    
34805014 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaa 34804915  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
34804914 aaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 34804815  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgt 599  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
34804814 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgt 34804715  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| | |   |||||||||||||    
34804714 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgaatctctttcttcaatcttcaagtctt 34804615  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
34804614 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcaccacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctg 34804515  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||    
34804514 atttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgaagac 34804415  T
900 a-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34804414 agaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 34804379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 39170882 - 39170114
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
39170882 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcaacggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 39170786  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
39170785 caaacacacatgcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattaca 39170687  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 462  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39170686 actgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 39170587  T
463 gctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
39170586 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 39170487  T
563 tacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttt 662  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
39170486 tacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttt 39170387  T
663 tgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 762  Q
    | ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39170386 taaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 39170287  T
763 gaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 862  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||    
39170286 gaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattc 39170187  T
863 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39170186 tgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39170114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 167 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 28732689 - 28731930
Alignment:
167 ttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaac 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||  |    
28732689 ttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaaggatcagaatcagatatgcagcgaaaaagatcaaagcagagaaaagaaaggc 28732590  T
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 365  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28732589 aa-gacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 28732491  T
366 atgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgct 465  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
28732490 atgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgct 28732391  T
466 caagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatac 565  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
28732390 caagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatataatac 28732291  T
566 aataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttg 664  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
28732290 gttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttt 28732191  T
665 aacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttga 764  Q
    ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
28732190 aacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttga 28732091  T
765 aatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctg 864  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
28732090 aatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctg 28731991  T
865 caggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
28731990 caggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggtt 28731930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 26866450 - 26867280
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |||    
26866450 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgc 26866549  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
26866550 ttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaa 26866648  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
26866649 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 26866747  T
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac-aaag 501  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
26866748 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatcctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 26866847  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
26866848 atacagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgta 26866947  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc-ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | |   |||||||||||||    
26866948 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttttaacttgtatatatctatctacaatcttcaagtctt 26867047  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
26867048 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccaacaatcctttgcctg 26867146  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26867147 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 26867245  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
26867246 aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 26867280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 24428407 - 24427667
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
24428407 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctaataaaactttagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 24428308  T
233 cagcgga-aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
24428307 cagcggacaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24428209  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
24428208 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 24428109  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||    
24428108 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagagataagtttgacttgaacact 24428009  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24428008 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 24427909  T
631 gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24427908 gtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacg 24427809  T
731 ttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 830  Q
    || |||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24427808 ttaagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgactgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctt 24427710  T
831 caaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatag 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
24427709 caaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatag 24427667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 26879039 - 26879869
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |||    
26879039 tgaagatgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgc 26879138  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga-aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
26879139 ttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggataagatcaaagcagaaaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaa 26879237  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
26879238 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 26879336  T
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac-aaag 501  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||     
26879337 tgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagttttctaatgctcaagcacgtaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 26879436  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgta 600  Q
    ||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
26879437 atatagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgta 26879536  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc-ttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| | |   |||||||||||||    
26879537 tcaaataagtgcagaaattcagtgtgctttgttgaatcaaattgacagagttttgacgcttttttaacttgtatatatctatctacaatcttcaagtctt 26879636  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| | ||||||| |||    
26879637 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcattcaccagcaatcctttgtctg 26879735  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26879736 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac 26879834  T
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
26879835 aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 26879869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 38586940 - 38586107
Alignment:
106 aatgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||   || || ||    
38586940 aatgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaatcagtttgggaatg 38586841  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
38586840 cttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttcattccacaaa 38586742  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact--tcacaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| ||    
38586741 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaagtgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 38586642  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
38586641 aaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttatgttcaaacaa 38586542  T
500 agatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc-aatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaaga 596  Q
    | ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
38586541 aaatacagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaaatataatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaaga 38586443  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagt 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||    
38586442 tgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagt 38586343  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgc 796  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
38586342 cttcactcccttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgc 38586244  T
797 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtg 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
38586243 ctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttttagcgta 38586145  T
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38586144 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 38586107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 27979231 - 27978402
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || ||||    
27979231 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataatacttcagaagcagttttggaatgct 27979132  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
27979131 tctgatgtaatgaacagaattagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcttggttccttccacaaatc 27979033  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
27979032 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 27978934  T
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaga 502  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
27978933 tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaaa 27978834  T
503 tacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
27978833 tacagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatgta 27978735  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtct 698  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| | |   ||||| |||   ||||||||||||    
27978734 tcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgacgctttt-aacttatgttgatctctgtctacaatcttcaagtct 27978636  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
27978635 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcct 27978537  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
27978536 gatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtaga 27978438  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27978437 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27978402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 28065760 - 28064931
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || ||||    
28065760 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataatacttcagaagcagttttggaatgct 28065661  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| | |||||||||||||  |    
28065660 tctgatgtaatgaacagaattagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcatagttccttccacaaatc 28065562  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
28065561 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 28065463  T
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaga 502  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
28065462 tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaaa 28065363  T
503 tacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgta 600  Q
    |||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
28065362 tacagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgta 28065264  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatct--tatcttcaagtct 698  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| | |   ||||| |||   ||||||||||||    
28065263 tcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgacgctttt-aacttatgttgatctctgtctacaatcttcaagtct 28065165  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
28065164 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcct 28065066  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
28065065 gatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtaga 28064967  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28064966 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28064931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 734
Target Start/End: Original strand, 4099223 - 4099822
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
4099223 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 4099319  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4099320 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 4099419  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
4099420 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 4099519  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
4099520 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 4099619  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4099620 tgatattcaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 4099719  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
4099720 tagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgt 4099819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 36785619 - 36784824
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
36785619 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 36785520  T
235 gcggaaaga-acagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
36785519 gcggaataacacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 36785422  T
334 aggagattt-cactat-aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
36785421 aggagattttcactaagaatcacaaaaattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttcca 36785323  T
432 atgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaaca 529  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||    
36785322 atggtcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaa-atgtttgactttgaaca 36785224  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
36785223 cttgatatactaacagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgct 36785124  T
629 ttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaag 725  Q
    || ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
36785123 ttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctgaccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaag 36785025  T
726 agacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatt 825  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | ||     
36785024 agacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcatttgagggatc 36784925  T
826 agcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 925  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
36784924 aacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggc-------ttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 36784833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 968323 - 967522
Alignment:
139 tgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    ||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | ||   |||||||||| |  || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
968323 tgaattgtgttttctttttctcttaaaaattcttcttccggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgca 968224  T
235 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
968223 gcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 968126  T
334 aggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||    
968125 aggagatttgctctaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcca 968028  T
432 atgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaaca 529  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||| ||||  | ||||||||| |||||    
968027 atgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaaa-atgtttgactttgaaca 967929  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||    
967928 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcatatcagtgcagaaattcaaagtgct 967829  T
629 ttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-a 724  Q
    || ||||||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
967828 ttatagaatcaaatttggcagagttttgacgctttt-aacttgtgttgatgtctcttaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaga 967730  T
725 gagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 824  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
967729 gagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgacggat 967631  T
825 tagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 924  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
967630 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 967532  T
925 ttgtacactt 934  Q
    ||||||||||    
967531 ttgtacactt 967522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 24274404 - 24275235
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
24274404 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgc 24274503  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||      
24274504 ttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaaga--aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 24274601  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||| ||||    
24274602 cggaagtagtccagtccccctcgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactcactag-tatgagacttctcaaa 24274700  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
24274701 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaa 24274798  T
500 agatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagat 597  Q
    |  |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
24274799 aattacacagaat-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagat 24274897  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaa 694  Q
     ||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||    
24274898 atatcaaatcagtgcagaaattaaaagtgttttatagaatcaaatttggcagaattttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaa 24274996  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctt 793  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||    
24274997 gtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttt 24275095  T
794 tgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagc 893  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | || |  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
24275096 tgcctgatttgggtgtagtcctatgacggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagc 24275194  T
894 gtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24275195 atagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24275235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 22763029 - 22763864
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||       || ||||    
22763029 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggtaaggaatgct 22763128  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
22763129 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaca 22763226  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||| || | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
22763227 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttacactaagaaataatc-cacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttca 22763325  T
397 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaa 495  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
22763326 caaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttccaatcaa 22763423  T
496 acaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttcta 593  Q
    |||||  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
22763424 acaaaattacacagaaa-atgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttcta 22763522  T
594 agatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatat-gtctct-atcttatct 690  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| |||  || |    
22763523 agatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtgctttatagaatcaaatttgacagagtttaggcgctttt-aacttgtatgttgtctcttatca-attt 22763620  T
691 tcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc-agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     
22763621 tcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatcctttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccaataa 22763719  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 888  Q
    || |||||||||||||| |||  |||| ||| | || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||    
22763720 tcttttgcctgatttggatgttctcctatgacggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggtagagctggtgtcttgtctt 22763818  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22763819 gtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22763864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 22773734 - 22774568
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||  |||||||||        || ||||    
22773734 tgaaggtgagaaaaacacaagaagagggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaattcttcttctgataacacttcagaagttggtaaggaatgct 22773833  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
22773834 tctgatgtgatgttcagaattagatatgcagcggaataaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcatttatcctggttccttccacaaacc 22773931  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 397  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
22773932 ggaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcac 22774030  T
398 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaa 496  Q
    |||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
22774031 aaa--tgctcaagcacacaggaaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaattaaa 22774128  T
497 caaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaa 594  Q
    ||||  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
22774129 caaaattacacagaaa-atgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaa 22774227  T
595 gatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatat-gtctct-atcttatctt 691  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| |||  |||||    
22774228 gatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtgctttatagaatcaaatttgacagagtttaggcgctttt-aacttgtatgttgtctcttatca-atctt 22774325  T
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc-agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |    
22774326 caagtcttcactcctttatatagaggttagtagagagacgttgagatcctttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaat 22774424  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttg 889  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
22774425 cttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttg 22774523  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
22774524 tagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22774568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 506 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 21650979 - 21650551
Alignment:
506 agagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaa 605  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21650979 agagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaa 21650880  T
606 tcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcc 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
21650879 tcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaacttgtgtatctctatattttatcttcaagtcttcactcc 21650780  T
706 tttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgg 805  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
21650779 tttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgg 21650680  T
806 gtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaa 904  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
21650679 gtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaa 21650581  T
905 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
21650580 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21650551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 19355723 - 19356529
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||   ||||||||||    || ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||     
19355723 ttgaattgtgttttctttttctcgtaaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgagatgttcagaattagatatgt 19355822  T
234 agcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    |||||||  ||  |||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
19355823 agcggaataaaagcagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggtttcttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19355920  T
332 caaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 425  Q
    |||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||  |||  ||||||||||| || |||||||     
19355921 caaggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcctaaa--tgctcaagcacgcaggcaagaga 19356017  T
426 cttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt 524  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||||||    
19356018 cttccaatgctcaggcactaaagcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt 19356117  T
525 gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcag-aaattca 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
19356118 gaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagtaaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaaattca 19356217  T
622 gtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgt 720  Q
      |||||||  |||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |   | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
19356218 aagtgcttttgagaatcaaatttggtagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatttctctttgatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtga 19356316  T
721 g-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttga 819  Q
    | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |    
19356317 gtagagagacgttgagatctttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccatcagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataa 19356415  T
820 agaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggt 919  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||| | |  ||| || ||||||||    
19356416 aggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtaacgaggagacactcagggtcgtggaggt 19356514  T
920 agtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||    
19356515 agtggttgtacactt 19356529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 138 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 21651325 - 21650975
Alignment:
138 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
21651325 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 21651229  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21651228 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21651129  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
21651128 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 21651030  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaga 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
21651029 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagaga 21650975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 107 - 639
Target Start/End: Original strand, 1041527 - 1042063
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| |    |||||||||| |  || |||||    
1041527 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtgttacttcagaagctagttgggagtg 1041625  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
1041626 cttatgatgtaatgtttagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaat 1041723  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||    
1041724 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcttatagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaa 1041823  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    |  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
1041824 a--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttataatgctcaagcacacaggcgagaggcttctaatcaaaca 1041921  T
499 aagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaaga 596  Q
    |  ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
1041922 acaatacacagaa-aaagtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaaga 1042020  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
1042021 tgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatca 1042063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 523 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 17969641 - 17969228
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17969641 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca 17969542  T
622 gtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 718  Q
      ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
17969541 aagtgctttatagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 17969443  T
719 gtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtccttt 817  Q
    | | ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |    
17969442 gagtaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctat 17969344  T
818 gaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggag 917  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
17969343 gaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggat 17969245  T
918 gtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||    
17969244 gtagtggttgtacactt 17969228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 28712007 - 28711553
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |  |||   ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
28712007 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtaaattgtcagcacattcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 28711910  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| | | | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
28711909 cttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 28711811  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
     ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||    
28711810 ttagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttc 28711712  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
28711711 aaattcattcgaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagttgcatc 28711612  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatga-tttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
28711611 ccattatgaactgcagcttctggtgattttttggcttctgataaacttgcttctgatga 28711553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 243 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20647325 - 20646626
Alignment:
243 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 342  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20647325 aacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaggcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 20647228  T
343 c-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgct 436  Q
    | ||||     |||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |  |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||    
20647227 ccactaagaaataatcacacagattacaactgcttaatactacctag-tatgagacttcc--aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 20647131  T
437 caagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttga 534  Q
    ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||  | | |||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||    
20647130 caagcactaaatcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttga 20647031  T
535 tatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca--gtgtgctt 629  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||  ||    
20647030 tatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgttttt 20646931  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact--tgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-aga 726  Q
    |||  ||  | |||| |||||||| ||||||||| |  |  ||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
20646930 tgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaatttgttgtct-tgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagaga 20646833  T
727 gacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatt 825  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||     
20646832 gacgttgagatctttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagaacctttgatcatccaccagtaatcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatc 20646734  T
826 agcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 925  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||    
20646733 aagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttt-tgcaggcagagctgttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggt 20646635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 19498517 - 19498010
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||    
19498517 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaagttgtttgagtttgaac 19498418  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat-aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||    
19498417 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcacagtg 19498318  T
627 ctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa 723  Q
    ||||  |||||||  |||| |||||||| |||| |||| ||||||| |  |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
19498317 cttttgagaatcaaatttggcagagtttgggcgttttt-aacttgtgttgatgtctct-taaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagta 19498220  T
724 -agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaga 822  Q
     ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||     
19498219 gagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcatgatttgggtgtagtcctatgaagg 19498121  T
823 attagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagt 922  Q
    || |  |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
19498120 atcaagttcaaattcattcctatcttaaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagagtagacacaaacagagtagtggaggtagt 19498022  T
923 ggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||    
19498021 ggttgtacactt 19498010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 156 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 17971068 - 17970626
Alignment:
156 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcaga 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
17971068 tctaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagcaga 17970969  T
254 gaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataat 351  Q
    || |||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
17970968 gagaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataat 17970871  T
352 cacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaa 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
17970870 cacacagattacaaatgctcaatactaac-tagtatgaaacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaa 17970774  T
451 gagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggt 549  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||| ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
17970773 gagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggt 17970675  T
550 gttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagat 597  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
17970674 gttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagat 17970626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 28701350 - 28701045
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| || |||| |||||||    
28701350 tcttgtcttgtagcagggacaaaaacaaagtagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgcccttt-gaagaacaagcatcc 28701252  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
28701251 aatgccttcaaatcctttcaaaatatctgttgctttacttttccagtcttctgcaatcttaagacgaggttgaatctattaaacagcttttgaagcctta 28701152  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatga-tttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||    
28701151 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctggtgattttttggcttctgataaacttgtttctgatgaactcacttctgatgatgtcaccacttcaggag 28701052  T
1179 cactttg 1185  Q
    |||||||    
28701051 cactttg 28701045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 696 - 1161
Target Start/End: Complemental strand, 30557626 - 30557160
Alignment:
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcct 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   |||| |||||||  | ||| ||||  ||||| |  || |    
30557626 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagttgtttgaag-cttttaatcaatcaccaatgatcat 30557529  T
793 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgta 891  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||  |||| || |  ||||||| | |||||||  |||||| ||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||    
30557528 ttgcctgatatggttgttgtcctaagaaggatcaatttcaaatgctttcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgta 30557430  T
892 gcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaa 991  Q
    ||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
30557429 gcagagacaaaat-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgtgttcaaa 30557331  T
992 ttctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaat-ccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatccc 1090  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||     
30557330 ttctttcaaaatagtcgatgcttcactttttcagtcctctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaatttttgaagccttaagttgcatcct 30557231  T
1091 atgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
30557230 ctgatgaactgcagcttctggtgatatttagcttctgatgaacttgcttctgatgaactcgcttttgatga 30557160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Original strand, 6392426 - 6392879
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag---agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||| |  |||    |||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
6392426 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccaacacattcaaaataaagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 6392523  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
     ||||||| || ||| ||| |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| |||| || | |||||||||    
6392524 atttgcctaatatggttgttgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctatttttcttgtcttg 6392622  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
6392623 tagcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttca 6392721  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatc-cattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
6392722 aatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagccttaagatgcatc 6392821  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |  |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
6392822 ctctgatgaactgcaacttatggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatga 6392879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 19313544 - 19313036
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||    ||||||||| ||||    
19313544 aatgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaac 19313445  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||    
19313444 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtg 19313345  T
627 ctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa 723  Q
    ||||  |||| ||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |    
19313344 cttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtagtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactttcttatatagaggtgtgta 19313247  T
724 -agagacgttgagataatcagcacgtct-aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaag 821  Q
     ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||    
19313246 gagagacgttgagatcttaagcacgtcttaaagagtcgtt-gagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaag 19313148  T
822 aattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtag 921  Q
     || | ||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||| |||    
19313147 gatcaacttcaaattcatttctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacactcagagttgtggagatag 19313049  T
922 tggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||    
19313048 tggttgtacactt 19313036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 19300537 - 19300029
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||||| ||||    
19300537 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaac 19300438  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||  |||    
19300437 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgtagaaattcaaagtg 19300338  T
627 ctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa 723  Q
    ||||  |||| ||  |||| || ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||      
19300337 cttttgagaaacaaatttggcaaagtttgggcgctttt-aacttgtagtaatgtctcta-ctgatcttcaagtattcacttttttatatagaggtgtgtg 19300240  T
724 -agagacgttgagataatcagcacgtct-aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaag 821  Q
     ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||    
19300239 gagagacgttgagatcttaagcacgtcttaaagagtcgtt-gagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaag 19300141  T
822 aattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtag 921  Q
     || | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| |  |||||| ||||||||||    
19300140 gataaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtctggtagcgtagacacactcagagttgtggaggtag 19300042  T
922 tggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||    
19300041 tggttgtacactt 19300029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 108 - 413
Target Start/End: Original strand, 30794187 - 30794497
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||   |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||   || || |||    
30794187 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatgc 30794286  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
30794287 ttctgatgaaaagatcagaataagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaat 30794385  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
30794386 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 30794485  T
402 ctgctcaagcac 413  Q
     |||||||||||    
30794486 atgctcaagcac 30794497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 694 - 1185
Target Start/End: Original strand, 33074018 - 33074509
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  |     
33074018 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatt 33074115  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||  ||||||| |  |||||||  |||||||    ||||  ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
33074116 ctttgcctgatatggttattgtcctaagaagaatcaatttcaaatgtattcccactgagaagaaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 33074214  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||||| |||  |||||| ||||| |||     
33074215 tagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtattatgtcaacg-ttttttgaagaataagcatctaatgccttcc 33074313  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    |||   | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||     
33074314 aatctgtccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagttttaagttgcatct 33074413  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    | ||||||||| || |||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
33074414 cctgatgaactacaacttctagtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 33074509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 147; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Original strand, 22802440 - 22802741
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||  ||||||     
22802440 tcttgtcttgtagcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctcttt-gaagaataagcatca 22802537  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
     |||| ||||||| |||||||||||| | |||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
22802538 tatgccttcaaatcctttcaaaatagccattgctttacctttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaatagcttttgaatcttta 22802637  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagc 1179  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |  ||  ||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
22802638 agttgcatctcctgatgaactgcaggttctgataaactt--gcttctgatgaattttcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagc 22802735  T
1180 actttg 1185  Q
    ||||||    
22802736 actttg 22802741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 147; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 31801195 - 31800743
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  ||   ||||||||||| || | ||||||||  ||||| |  ||    
31801195 agtctttactccgttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttg-aagcttttgatcaatcaccaatgatc 31801098  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| | | |||||  |||  || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||| || ||||||||||    
31801097 ttttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 31800999  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| || | | |||||||||| ||||    
31800998 tagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgc-tctttgaagatcaaacatccaatgctttca 31800900  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||    
31800899 aatcctttcaaaatagttgttgtttcacttttccagtcttctgcaataaatagacgagtttggatccactaagcagcttttgaagctttaagttgcatcc 31800800  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
31800799 catgatgaactgcagtttctggtgattatttgcttctgataaacttgcttctgatga 31800743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 916 - 1162
Target Start/End: Complemental strand, 45087269 - 45087022
Alignment:
916 aggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttc 1015  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
45087269 aggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgag-aataagcatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 45087171  T
1016 acttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaat-ccattaaatagc-ttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatg 1113  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||    
45087170 acttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaactttttgaagctttaagttgcatcctctgatgaactgtagcttctagtg 45087071  T
1114 atttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 1162  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
45087070 atatttagcttctgataaacttgcttcttatgaacttgcttctggtgac 45087022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 269 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 23393412 - 23392494
Alignment:
269 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta---taatcacaa-agattac 363  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||  ||||||    
23393412 gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagttaatcacaactgattac 23393313  T
364 aaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaa 461  Q
    || ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |    
23393312 aactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttccta 23393216  T
462 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatac 560  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23393215 tgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatac 23393116  T
561 aatacaa--taaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt---tgtagaatcagtttgacagagtt 652  Q
    ||| |||   |||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   ||||||   |||  ||  | |||  || ||||    
23393115 aatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaattttgcaaagtt 23393016  T
653 ttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt---atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgt 748  Q
    | ||||||||| |||||||   ||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||    
23393015 tgggcgctttt-aacttgt---tgtctcgttcttttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgt 23392920  T
749 ctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatct 847  Q
    | | | ||||||| |||||||  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||| | ||      
23392919 caataaagtcgttgtgaaatc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccatttctattc 23392822  T
848 tgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgta 946  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||   |||    
23392821 tgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcattgtcttgtagcagagacaaacttagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacagttgta 23392723  T
947 ctttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacga 1046  Q
    ||  |||||||| | |||||| |   ||||||||||||          ||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||| ||| | ||| |||    
23392722 ctaggtcaacgc-tctttgagaagaaagcatccaatgc---------atttcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgtaatttctaggcga 23392633  T
1047 ggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaac-ttgcttctgatg 1145  Q
    | | || ||| | ||| | |||||||| | || ||||  ||    |||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||| ||||||||||||    
23392632 gttagagtccttgaaacaacttttgaaactttgagttcaatttactgatgaactgtagcttctgatgaactt--gcttctgatgaactttgcttctgatg 23392535  T
1146 aa-cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
23392534 aattttgcttctgatgacgtcatcactttagaggcactttg 23392494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 863 - 1161
Target Start/End: Complemental strand, 31328104 - 31327806
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |     
31328104 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgc-tc 31328007  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || |    
31328006 tttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaatagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttga 31327907  T
1062 atagc-ttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 1160  Q
    | | | ||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
31327906 acaactttttgaaactttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaactagcttatgatg 31327807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 863 - 1161
Target Start/End: Complemental strand, 31334825 - 31334527
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |     
31334825 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgc-tc 31334728  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || |    
31334727 tttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaatagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttga 31334628  T
1062 atagc-ttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 1160  Q
    | | | ||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
31334627 acaactttttgaaactttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaactagcttatgatg 31334528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 897 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 35744104 - 35743819
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||||| |||||| ||||||| |||    
35744104 gacaaaaactgagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaattagcattcaatgccttcaaatcctt 35744006  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatg 1096  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||  ||||| | ||||||| || |||||||||||| | |||||    
35744005 ccaaaatagtcgttgctatacttttccaatattctgcaatctttagacgt--ttgagtctgttaaacaacttttgacgctttaagttgcatctcctgatg 35743908  T
1097 aactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
35743907 aactacagcttctggtgattttcagcttccgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcactttaagagcactttg 35743819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 129; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 881 - 1186
Target Start/End: Original strand, 23234987 - 23235292
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||   || ||  ||||||||    
23234987 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaag-aataagcatcca 23235085  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||    
23235086 atgccttcaaattctttcaaaatagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaa 23235185  T
1081 g--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
    |  ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
23235186 gtcttgcatctcatgatgaactagagcttctggtgattttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggag 23235284  T
1179 cactttga 1186  Q
    ||||||||    
23235285 cactttga 23235292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 829 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 31801059 - 31800719
Alignment:
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
31801059 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttg 31800961  T
928 tacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagta 1027  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || || | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
31800960 tacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctcttt-gaagatcaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcacttttccagtc 31800862  T
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctg 1127  Q
    |||||||||   |||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
31800861 ttctgcaataaatagacgagtttggatccactaagcagcttttgaagctttaagttgcatcccatgatgaactgcagtttctggtgattatttgcttctg 31800762  T
1128 ataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||               || ||||||||||| |||||||||    
31800761 ataaacttgcttctgatga---------------cgccatcacttcaggagcactttg 31800719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 127; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 693 - 1185
Target Start/End: Original strand, 22317384 - 22317879
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  |||||||||||||  |||||||||  ||||| |  |    
22317384 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaaa--ctttgatcaatcaccaatgat 22317481  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | ||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
22317482 ctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 22317580  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    | |||   || |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||     
22317581 gcagcagagataaaaactgaatagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttt 22317679  T
989 aaattctttcaaaa-tagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt--tgc 1085  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||  ||||| ||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||  |||    
22317680 aaatcctttcaaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgc 22317779  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||| | ||||||| |  |||||||| |||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
22317780 atctcttgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgtacttgcttatgatgaacttgcttatgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 22317879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 694 - 1161
Target Start/End: Complemental strand, 34322244 - 34321777
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
34322244 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 34322147  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  |||||||  || |||||   ||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
34322146 ttttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgtatacccattgagaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 34322048  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| || |||  || ||||||||| ||      
34322047 tagcagaaacaaaaatagagtagtgaagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagaatccaatgcctttc 34321949  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||     
34321948 aatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccaggcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaggctttaagttgcatct 34321849  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    | ||||||| | ||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
34321848 cctgatgaattacagcttctagtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttatgatga 34321777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 761 - 934
Target Start/End: Original strand, 4099819 - 4099993
Alignment:
761 ttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatat 860  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||    
4099819 ttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaat 4099918  T
861 tctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4099919 tctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4099993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 19313843 - 19313482
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||||    
19313843 tgaaggtgagaaaaacacaagaagtgagggttgaattgtgttttctttttctcagaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgct 19313744  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||  | ||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||      
19313743 tctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaa--aaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 19313646  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| |||||| || |||||||||||| | |  |||||||||||     
19313645 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattataactgctcaatactaccgag-tatgagacttcc 19313547  T
397 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||  ||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
19313546 caaa--tgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 19313482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 6574435 - 6573978
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   || ||| |  |||   ||||||||||||   |||||||||  ||||| |      
6574435 aagttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccaacacattcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatga 6574338  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    || |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| || |||||||| ||||||| | ||||| |    
6574337 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgttt 6574239  T
888 tgtagcgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaac-gtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcg 985  Q
    ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||     
6574238 tgtagcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaaacatccaatgcc 6574140  T
986 ttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat-ctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttg 1084  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || |||| ||| || | | |||||||| ||| ||||    
6574139 ttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttatgttg 6574040  T
1085 catcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||   |||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
6574039 catcttctgatgaactgcaacttctagtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 6573978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 19303278 - 19302918
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||||    
19303278 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcagaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgct 19303179  T
205 tctgatgaaatgatcagaa-tcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||  ||| |||||| || |||| |||||||||  | ||||| | ||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||     
19303178 tctgatgtgatgttcagaaatcggatacgcagcggaataaaaacagtgtagagaaaa--aaaagagagacacaagcaattatcctggttccctccacaaa 19303081  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||    
19303080 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttc 19302982  T
396 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
19302981 acaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19302918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 269 - 934
Target Start/End: Original strand, 1083368 - 1084047
Alignment:
269 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaag-att 361  Q
    |||||||||| |||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||   |||    
1083368 gacacaagcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaacttatt 1083467  T
362 acaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttct 459  Q
    |||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||     
1083468 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 1083564  T
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
     ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
1083565 tatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacatttgatatacaatcaatggtgttcacaat 1083664  T
559 acaatacaataaaga----ctctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagag 650  Q
    ||||| |||   |||    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   |||||||   ||  ||  | |||  |||||    
1083665 acaatgcaaatgagagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaatttagcagag 1083764  T
651 ttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtc 749  Q
    ||||||||||||| || ||||     | | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||||||    
1083765 ttttggcgctttt-aatttgttgtcttgtgtcttttatcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtc 1083863  T
750 taaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 849  Q
     | |||||||||   || |||| |||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  ||    
1083864 aatagagtcgttgtgaagcctt-gatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctg 1083962  T
850 aaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
1083963 aaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 1084047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 198 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 19498725 - 19498457
Alignment:
198 gagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttc 295  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||  | ||||||| | ||| || | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
19498725 gagtgcttctgatgtgatgttcaaaatctgatatgcagcggaataaaaacagagtaaagagaaaagaaagagagacacaagcagttatactggttccttc 19498626  T
296 cacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatga 389  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||    
19498625 cacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatga 19498527  T
390 gacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
19498526 gacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 881 - 1186
Target Start/End: Original strand, 30666969 - 30667274
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || | | ||||||||    
30666969 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-atcaagcatcca 30667067  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| ||||    
30667068 atgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaa 30667167  T
1081 --gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
       ||||||| | ||||||||| || ||||||||  | ||  |||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
30667168 ttcttgcatctcctgatgaactacaacttctgatattcttcagcttctgat-gagatgcttctgacgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggag 30667266  T
1179 cactttga 1186  Q
    ||||||||    
30667267 cactttga 30667274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 829 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 20152198 - 20151890
Alignment:
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||| || |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||         |||    
20152198 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg---------ttg 20152109  T
928 tacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagta 1027  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||     
20152108 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcacttttccagtc 20152010  T
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa-gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttct 1126  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | |||||||||| |||| |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||    
20152009 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaatgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgattttcagcttct 20151910  T
1127 gataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||| |||||| |||||||||    
20151909 gatgaacttgtttctgatga 20151890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 863 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 22188241 - 22187920
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||| |    
22188241 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctct 22188142  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || ||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
22188141 tcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatctattcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattga 22188043  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    | ||| |||||||| |||||  ||||||  | ||||||||| || |||||| |||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
22188042 acagcctttgaagctttaagtcttgcatgtcctgatgaacttcaacttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgat 22187944  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
22187943 gacgtcatcacttcaggagcactt 22187920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 863 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 22785794 - 22785482
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    || ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||| |    
22785794 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagtagagataaagacagagtagtggagatagtggttatacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctct 22785695  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  ||||||||||||         ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||  | | ||    
22785694 tt-gaagaataagcatccaatgc---------ctttcaaaatagtcgttgctatacatttccagttttctgcaat-tttaggcgagtttgaaatcttgaa 22785606  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
22785605 atagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgtagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatga 22785506  T
1162 cgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
     ||||||||||||  |||||||||    
22785505 tgtcatcacttcaagagcactttg 22785482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 269 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 24802293 - 24801814
Alignment:
269 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 362  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||  |||||    
24802293 gacacatgcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacaaagtttaatcacaactgatta 24802194  T
363 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | |||||||||||| ||   |||||| |||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||      
24802193 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaaa---tgctcatgcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 24802097  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24802096 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 24801997  T
560 caatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta---gaatcagtttgacagagt 651  Q
    |||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   ||||||| ||   ||| ||  ||  ||||||    
24801996 caatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaca-cagaaattctaagtgcttt-tatgtgaaacaaatttgcagagt 24801899  T
652 tttggcgcttttgaacttgta-tatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 737  Q
    |||||||||||| |||||||  | |   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
24801898 tttggcgctttt-aacttgttgtcttgttcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagat 24801814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 693 - 1175
Target Start/End: Original strand, 38781189 - 38781671
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
38781189 aagtcttcactcctttatatatagttgtgatagagacgttgtgaattgacagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 38781286  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||| ||||| ||  | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
38781287 cttttgtctgatatgattattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaagggacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 38781385  T
889 gtagcgtggacaaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgtt 987  Q
    |||||   ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||| | ||| |||||| ||    
38781386 gtagcagagacaaaaaatagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaatcattcaatgcctt 38781484  T
988 caaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgc 1085  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||| || |||| ||| || | | |||||||| |||||  ||||    
38781485 caaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgc 38781584  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcag 1175  Q
    ||||  ||||||    || |||||| |||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38781585 atcctctgatga--gacatcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcag 38781671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 302
Target Start/End: Original strand, 20221058 - 20221199
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
20221058 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 20221154  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20221155 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 20221199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 863 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 10009889 - 10009569
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||||||| ||     
10009889 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacg-ttc 10009791  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttc-cagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatta 1060  Q
    ||  | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||   || || ||||||  || |||||| |||||||||||     
10009790 ttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattg 10009691  T
1061 aatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 1158  Q
    || |||  ||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
10009690 aacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttt--cttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctga 10009594  T
1159 tgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
10009593 tgacgtcatcacttcaggagcactt 10009569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 28551226 - 28550784
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
28551226 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 28551129  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||| |||||  || | | ||||| ||||| || |  ||||||| | ||||||   |||||  ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
28551128 ctttgtctgatacggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatgcgttcccaatgtgaagaaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 28551030  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||  ||||||||||||         
28551029 tagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatccaatgc----- 28550936  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
        ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||| |  |||| |||||||     
28550935 ----ctttcaaaatagttgtttctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggttttaaattgcatct 28550841  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||| ||||||||| ||||||    
28550840 cctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttatgatga 28550784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 1587171 - 1586898
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
1587171 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaa-cagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctct 1587073  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || ||| |||||||||||||         |||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
1587072 tt-gaagaattagcatccaatgc---------ctttcaaaatagccgttgtaatactttttcagtcttctgcaatcttcagatgagtttgaatcctttaa 1586983  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | |||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||    
1586982 acaacttttgaagctttaagttccatctcctgatgaactccagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgtttctgatga 1586898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Original strand, 44840226 - 44840665
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
44840226 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaaatg-tcggcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 44840323  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| | ||||||   ||||   ||||  | |||||||| ||||| | || |||||||     
44840324 ttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgt-tgcaggcagagctggtatccttgtctta 44840422  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  ||||||||||||         
44840423 tagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgc----- 44840516  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
        |||||||||||||||||||   |||||| |||| | ||||||| || || |||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||     
44840517 ----ctttcaaaatagtcgttgccatactttttcagtct-ctgcaatgtt-aggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttgcatct 44840610  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||||||    
44840611 cttgatgaactgcagcttctgatgaattt--gcttctgatgatcttgcttctgatga 44840665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 688 - 1186
Target Start/End: Original strand, 24575821 - 24576334
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-gataatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| || || |||  ||||||||||||   |||||||||  |||||    
24575821 tctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgttgatttccagaacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcacca 24575918  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 883  Q
     |  || ||| || ||| ||| | | ||||||||||| || |  ||||||| ||||||||   ||  || ||||  | |||||||| ||||||| | |||    
24575919 atgatctttttccggatatggttattgtcctttgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtgggaacattgt-tgcaggcagagctgttattctt 24576017  T
884 gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatg 983  Q
    ||||||||||   |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||   | |||| | || ||||||    
24576018 gtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttca-acgaacaaacaaccaatg 24576116  T
984 cgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaa-tccattaaatagcttttgaagccttaagt 1082  Q
    | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| || || |||||| || | | |||||||| ||||||    
24576117 cctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagt 24576216  T
1083 --tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttt--------tg----gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatc 1168  Q
      |||||| | | |||||||  |||||||| |||| ||        ||    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
24576217 attgcatctcctaatgaactttagcttctggtgatcttgcttatgatgatatgcttctgatgaactagcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatc 24576316  T
1169 acttcagaagcactttga 1186  Q
    ||||||||||||||||||    
24576317 acttcagaagcactttga 24576334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 24815260 - 24814912
Alignment:
269 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 362  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
24815260 gacacaaacaattataccggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 24815161  T
363 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||||||      
24815160 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 24815064  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24815063 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 24814964  T
560 caatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaat 606  Q
    |||| ||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
24814963 caatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaat 24814912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 881 - 1164
Target Start/End: Complemental strand, 25037379 - 25037096
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||   || ||| | ||||||    
25037379 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaag-aacaaacatcca 25037281  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||| |||||||||  || ||| || ||||||||||| || | | |||||||| ||||    
25037280 atgctttcaaatcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaa 25037181  T
1081 g--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgt 1164  Q
    |  ||||||| | ||||||||| || |||||| |||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
25037180 gtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgt 25037096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 881 - 1164
Target Start/End: Complemental strand, 25041486 - 25041203
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||   || ||| | ||||||    
25041486 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaag-aacaaacatcca 25041388  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||| |||||||||  || ||| || ||||||||||| || | | |||||||| ||||    
25041387 atgctttcaaatcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaa 25041288  T
1081 g--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgt 1164  Q
    |  ||||||| | ||||||||| || |||||| |||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
25041287 gtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgt 25041203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 698 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 13964282 - 13963832
Alignment:
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtccttt 794  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  |||||    || |||    
13964282 ttcactcctttatatggaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaacgatctttt 13964185  T
795 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagc 893  Q
    ||||||| ||| | | ||||| | ||| || |  ||||||| ||||||||   || ||| ||||  | |||||||  ||||||| || ||||||||||||    
13964184 gcctgatatggttcttgtcctctaaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcggagctgttatccttgtcttgtagc 13964086  T
894 gtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaatt 993  Q
       |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||| ||||||||    
13964085 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatt 13963987  T
994 ctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa--gttgcatccca 1091  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| ||||   |||||||       
13963986 ctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctac 13963887  T
1092 tgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||||||||  |||||||  |||| |||  |||||||  ||||||||||||||||    
13963886 tgatgaactagagcttctagtgatctttaacttctgaggaacttgcttctgatga 13963832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 902 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 20568849 - 20568567
Alignment:
902 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaa 1001  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
20568849 aaactgagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 20568751  T
1002 atagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaac 1099  Q
    || || ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||  || ||| ||| |||| |||||  ||||||| | ||||||||    
20568750 attgttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 20568651  T
1100 tgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    | ||||||||| |||| ||   ||||| ||  |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||    
20568650 tacagcttctggtgatcttgaacttcttat-gagatgcttctgatgaacttgcttcaaatgacgtcatcacctcatgagcacttt 20568567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 880 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 21537369 - 21537067
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   |  | | |||||||    
21537369 tcttgtcttgtagcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaa-agcaagcatcc 21537271  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||| |||| ||||| || |||||||| || | | |||||||| |||    
21537270 aatgcctccaaaacctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta 21537171  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| || |||||  |||| |||  ||||||||  |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |    
21537170 agtcttgcatctcctgatgaacttcatcttctagtgatctttaacttctgat-gaggtgcttctggtgagcttgcttctgatgacgtcattacttcagga 21537072  T
1178 gcact 1182  Q
    |||||    
21537071 gcact 21537067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 907 - 1115
Target Start/End: Original strand, 25829140 - 25829349
Alignment:
907 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagt 1006  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
25829140 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 25829238  T
1007 cgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcag 1104  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | ||||||||  ||||  ||||||| | |||||||||  ||    
25829239 cgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaactttag 25829338  T
1105 cttctgatgat 1115  Q
    |||||| ||||    
25829339 cttctggtgat 25829349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 863 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 24850805 - 24850483
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||| |    
24850805 tgcaggcaaagctgttattcttgtcttgtagcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctct 24850706  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||| |||||   |||||||| || |||||||| |    
24850705 tcaaag-aacaagcatccaatgctttgaaatcctttcaaaatattcgttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattga 24850607  T
1062 atagc-ttttgaagccttaagt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 1158  Q
    | | | ||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||| |||| |||| |||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||    
24850606 acaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgtacttcagcatctggtgatctttagcttctgatgaggt-gcttctgatgaacttgcttctga 24850508  T
1159 tgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
     |||||||| ||||||| |||||||    
24850507 cgacgtcattacttcaggagcactt 24850483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 798 - 934
Target Start/End: Original strand, 22779811 - 22779946
Alignment:
798 tgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
22779811 tgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtag 22779909  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
22779910 acaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22779946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 243 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 38033518 - 38033296
Alignment:
243 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 342  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
38033518 aacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatactggttccttccacaaaccagaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagattt 38033421  T
343 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgct 436  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| || |||||  ||||    
38033420 ccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttca-aaaaatgctcaagcacgcaggcaaaagacttcctttgct 38033323  T
437 caagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
38033322 caagcactaaagcaagagacttctaat 38033296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 902 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 9015467 - 9015188
Alignment:
902 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaa 1001  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
9015467 aaactgagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaa 9015371  T
1002 atagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaac 1099  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||| || || |||||||| || | | |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||    
9015370 atagttgttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 9015271  T
1100 tgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |  || |||||  ||| ||  |||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
9015270 tttagtttctg-ggatcttctgcttctgat-gagttgtttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcacttt 9015188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 31968164 - 31967909
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||| |||  |||||||    
31968164 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatcc 31968066  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    |||||          |||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |||||||| | ||| | ||||||| || |||    
31968065 aatgc---------atttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttatgcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaggcttta 31967976  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||     ||||| || ||||||||||||||||    
31967975 agttgcatcttctgatgaactgcagcttctggtgattcacaacttcttatgaacttgcttctgatga 31967909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 863 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 22776427 - 22776186
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |     
22776427 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tc 22776329  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||| |||  ||||||||||||         |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||  |||| || | ||    
22776328 tttgaagaataagcatccaatgc---------ctttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttttgcaat-tttaggcgagtctgaaaccttgaa 22776239  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
    | | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
22776238 acaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctgatga 22776186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 863 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 22781805 - 22781564
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |     
22781805 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tc 22781707  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||| |||  ||||||||||||         |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||  |||| || | ||    
22781706 tttgaagaataagcatccaatgc---------ctttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttttgcaat-tttaggcgagtctgaaaccttgaa 22781617  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatga 1114  Q
    | | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
22781616 acaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctgatga 22781564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 24377062 - 24377347
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |     
24377062 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgc-tc 24377160  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt-a 1060  Q
    ||  | |||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||   ||| || | || |||||||| |    
24377161 ttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaaacctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaat-gctaggcgtgattaaatccattga 24377259  T
1061 aatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |  | |||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
24377260 acaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatgaactttcttctgatga 24377347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 863 - 1115
Target Start/End: Original strand, 19540377 - 19540631
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||| ||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |     
19540377 tgcaggcagagctgttattcttgccttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgc-tc 19540475  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||| | |||| |||||||||| | ||||||  ||||| |||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||  ||||| ||| || |||||||| |    
19540476 tttaaagaacaagcatccaataccttcaaaacctttcgaaatagccgttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattga 19540575  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    | | | |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
19540576 acaacatttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaacttcagcttctggtgat 19540631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 693 - 1186
Target Start/End: Original strand, 40782268 - 40782754
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   || ||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  || || |  |    
40782268 aagtattcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaatagagtcgtttgaat--ctttgatcaatcatcaatgat 40782365  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||   || ||| ||||  | |||||| | ||||||| || |||||||    
40782366 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggtagagctgttatccttgtctt 40782464  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| ||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || ||| | |||||||||| |||    
40782465 gtagcagagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaaacatccaatgctttc 40782563  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt--tgca 1086  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||  || || ||||||  || |||||| ||||||||||| ||     |||  |||  |||||  ||||    
40782564 aaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaaa----ttt--agctctaagtcttgca 40782657  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    || | ||||||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
40782658 tctcctgatgaaatttagcttctggtgatctt--gcttctgatgaaat-gcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttga 40782754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5028036 - 5027893
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
5028036 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5027940  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagca 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
5027939 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagca 5027893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 880 - 1082
Target Start/End: Complemental strand, 18377027 - 18376826
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||| ||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| |||||||    
18377027 tcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcc 18376929  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||  | | |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||    
18376928 aatgccttcaaatcctttcaaaatagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta 18376829  T
1080 agt 1082  Q
    |||    
18376828 agt 18376826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 282
Target Start/End: Original strand, 38207597 - 38207744
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
38207597 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 38207693  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagtta 282  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
38207694 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagtta 38207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 40332048 - 40332322
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtct-tgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| ||  |||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |     
40332048 tgcaggcagagctgttatccgtgtcttgtagcagagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tc 40332146  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatcc-atta 1060  Q
    ||||| |||  ||||||||||||         |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |  |    
40332147 tttgaagaataagcatccaatgc---------ctttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatcctagaa 40332236  T
1061 aatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |  ||||||  |||| ||  ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||| ||||||||| ||||||    
40332237 agcagctttgaaagctttgggttacatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttatgatga 40332322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 285 - 462
Target Start/End: Original strand, 22754871 - 22755054
Alignment:
285 ctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta 378  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||    
22754871 ctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaacttctcaacacta 22754970  T
379 -tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
      |  | |||||||||||||| |  |||| |||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
22754971 cacctagtatgagacttcacaga--tgcttaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 22755054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 873 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 28374595 - 28374534
Alignment:
873 gctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28374595 gctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28374534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 882 - 1059
Target Start/End: Original strand, 30621197 - 30621373
Alignment:
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaa 981  Q
    |||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || | | | |||||||    
30621197 ttgtgttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-atcaaacatccaa 30621295  T
982 tgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt 1059  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| || ||||||||    
30621296 tgccttcaaatcctttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccatt 30621373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 882 - 1059
Target Start/End: Original strand, 30623818 - 30623994
Alignment:
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaa 981  Q
    |||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || | | | |||||||    
30623818 ttgtgttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-atcaaacatccaa 30623916  T
982 tgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt 1059  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| || ||||||||    
30623917 tgccttcaaatcctttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccatt 30623994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 693 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 23595875 - 23595535
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaa-gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||   |||||| || ||| ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  ||    
23595875 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttataaattgccagcacatcaaaaagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgatc 23595778  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |   |||||| ||||  | ||||||||||||||||  ||||||| ||    
23595777 ttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgttaatcttgtcctg 23595679  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||  ||  || |||| || ||||||||| ||||    
23595678 tagcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc--ttcaga-gaacaagaatccaatgccttca 23595582  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    ||||| ||  || |||||||||||||||| |||  || |||||||||    
23595581 aattcatttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaat 23595535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 792 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 24814792 - 24814647
Alignment:
792 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgt 890  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
24814792 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 24814694  T
891 agcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
24814693 agcgtagaaaaaagcggagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 24814647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38040677 - 38040538
Alignment:
243 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 342  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
38040677 aacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagattt 38040580  T
343 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta 378  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
38040579 ccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta 38040538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 447 - 932
Target Start/End: Original strand, 22755009 - 22755497
Alignment:
447 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcag 545  Q
    ||||||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||    |||||| || |||||||||||||| ||||||    
22755009 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaatagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatataaaatcag 22755108  T
546 tggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt---tgtagaatca 639  Q
     ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||    ||   |  |    
22755109 cggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgcttctaagtgacacaa 22755208  T
640 gtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-ta 738  Q
     |||| |||||||| |||||| || |||||||   ||| ||| |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||       
22755209 atttggcagagtttgggcgctatt-aacttgttgttgtgtctct-gaatcttcaaatctttactcctttatatagaggttgaaaagagacgttgggacct 22755306  T
739 atcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattca 838  Q
     | |||||||||||||||||| |||| | || |||||||  ||||| |  || |||| ||||||||| | | ||| | ||||| || |  ||||||| ||    
22755307 ttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagaacc-ttgatcagtcaccaatgatcttttgtctgatttggatattgtcatatgaaggatcaagttcaaatcca 22755404  T
839 ttcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 932  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| || ||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
22755405 ttcctatcttgaaggaacat-ttctgcagacagagctgttatacttgtcttgtagcgcagac-aaaacagagtagtggaagtagtggtcgtacac 22755497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 968 - 1180
Target Start/End: Original strand, 22260472 - 22260683
Alignment:
968 gaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagct 1067  Q
    |||| |||||||| | | ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | ||    
22260472 gaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaact 22260571  T
1068 tttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtc 1165  Q
    ||||| || |||||  ||||||| | |||||| ||  | |||||| |||| ||   ||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
22260572 tttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttaacttctggtgatctt--ccttctgat-gagatgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtc 22260668  T
1166 atcacttcagaagca 1180  Q
    |||||||||| ||||    
22260669 atcacttcaggagca 22260683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 693 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 23184612 - 23184345
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaa-gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||   |||||| || ||| ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  ||    
23184612 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttataaattgccagcacatcaaaaagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgatc 23184515  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |   |||||| ||||  | ||||||||||||||||  ||||||| ||    
23184514 ttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgttaatcttgtcctg 23184416  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgctt 960  Q
    ||||   |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||    
23184415 tagcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctt 23184345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Original strand, 22682798 - 22682871
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 352  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
22682798 ttatcctgtttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 22682871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 869 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 24425635 - 24425571
Alignment:
869 catagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
24425635 catagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24425571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14794523 - 14794452
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
14794523 ttatcctggttccttcaacaattcggaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagatttcactataatc 14794452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19321093 - 19321021
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19321093 ttatcatggttccttccacaattcggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatc 19321021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 286 - 553
Target Start/End: Original strand, 24843578 - 24843847
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaatactatcaaa 383  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |   ||||||||||||||| | |  |||||    
24843578 tggttccttccacaaaccggaagtagtccactccaccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatttgattacaaatgctcactgc--tcaaa 24843675  T
384 at---atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 479  Q
    ||   | ||||||||   |||||  |||||||||   |||||||  |||  ||||||||| ||  || |||||||||||  ||||||||||||   ||||    
24843676 atagcaagagacttc---aaactaatcaagcacaactgcaagagatttcttatgctcaagaacaaaatcaagagacttcctatgctcaagcacaacggca 24843772  T
480 agagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    ||||||||||  ||||||| |  |||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
24843773 agagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 24843847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 903 - 1146
Target Start/End: Original strand, 3277032 - 3277265
Alignment:
903 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaa 1002  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| || |||  |||||||||||| |||         ||||     
3277032 aacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttc---------caaat 3277121  T
1003 tagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgc 1102  Q
    ||| ||||| |  |||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||| | ||||| | |||||||||| ||||||| |||| | | ||||||| |    
3277122 tagccgttgttatactttttcagtcttctgcaatcttcagacaagtttgaattctttaaacaacttttgaagctttaagttccatctcctaatgaactcc 3277221  T
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    |||||||  |||||    ||||||||| ||||||||||| ||||    
3277222 agcttctagtgattcccagcttctgatgaacttgcttctaatga 3277265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 343
Target Start/End: Original strand, 22615176 - 22615315
Alignment:
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||| | || |||||||  |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  || ||||| | |||| ||||||| ||||||||     
22615176 ttctgatgtattgttcagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gatacaagaaattatactggttcattccacaaa 22615273  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 343  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22615274 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 22615315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21911473 - 21911311
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa-tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||    
21911473 tgctcaagcacactagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacaaa 21911374  T
501 gatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
      |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
21911373 attacacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatacccaatcagtggtgttcacaatacaa 21911311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 692 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 39037952 - 39037684
Alignment:
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||  || ||  |||||||||||||   |||||||||  | ||| |      
39037952 caagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcaaatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcgccaatga 39037855  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 887  Q
    || |||| ||||| ||| | | ||||| ||||  || |  |||||||||||||  |   |||||| ||||  | |||||||||||||||| | ||||||     
39037854 tcttttgtctgatatggttattgtcctatgaacgatcaatttcaaattcattctaagtatgaaggaacatcgt-tgcaggcatagctgttatccttgtca 39037756  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
39037755 tgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 39037684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 880 - 984
Target Start/End: Original strand, 14581494 - 14581597
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||  |||||||    
14581494 tcttgtcttgtagcagagacaaaatcagagaagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatcc 14581592  T
980 aatgc 984  Q
    |||||    
14581593 aatgc 14581597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 39037521 - 39037474
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39037521 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 39037474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 687 - 732
Target Start/End: Original strand, 44880954 - 44880999
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44880954 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 44880999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24851389 - 24851329
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
24851389 ggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24851329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 901 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 26619201 - 26619067
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||| || |   | |||  ||||| |||||| ||||||||||||  |    
26619201 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacg-ttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttga 26619103  T
1001 aatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||    
26619102 aatagttgttgcttcattcttccagtcttctgcaat 26619067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 15671157 - 15671053
Alignment:
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatac 560  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||||| | ||||||||  |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
15671157 atgctcaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaacaaat-taca-agaaataagtttggattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatac 15671060  T
561 aatacaa 567  Q
    || ||||    
15671059 aaaacaa 15671053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 20567920 - 20567966
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
20567920 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaatgagacgttg 20567966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21537934 - 21537852
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
21537934 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21537852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 21845934 - 21845980
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21845934 atcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 21845980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 880 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 22455111 - 22455029
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgctttt 962  Q
    ||||||| ||||||   |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
22455111 tcttgtcatgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttt 22455029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 28140502 - 28140444
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
28140502 tgcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgacttcag 28140444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 250
Target Start/End: Original strand, 28226921 - 28227036
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
28226921 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 28227017  T
233 cagcgg-aaagaacagagc 250  Q
    |||||| ||||||||||||    
28227018 cagcggaaaagaacagagc 28227036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 355
Target Start/End: Original strand, 8684995 - 8685062
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 355  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
8684995 tggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-ccccttgcacttccaagg-gatttcactataatcaca 8685062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 22776196 - 22776147
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
22776196 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactttg 22776147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 22781574 - 22781525
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
22781574 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactttg 22781525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 881 - 1018
Target Start/End: Original strand, 24779323 - 24779459
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||  ||||| ||||||| || ||   || ||| | |||||     
24779323 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaag-aacaaacatccg 24779421  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcact 1018  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
24779422 atgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 24779459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 26619685 - 26619548
Alignment:
427 ttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-tt 524  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |||| |||| || ||||||  ||    
26619685 ttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcatatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggtt 26619586  T
525 gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
26619585 gaacacttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaa 26619548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 28550809 - 28550760
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
28550809 gcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 28550760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 685 - 737
Target Start/End: Original strand, 1089149 - 1089201
Alignment:
685 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 737  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
1089149 ttatcttcaggtcttcactcctttatatagaggagtgaaagagtcgttgagat 1089201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 1587340 - 1587300
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1587340 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 1587300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 9015677 - 9015637
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9015677 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 9015637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14794438 - 14794307
Alignment:
431 aatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||  | | |||| |||||| | ||||||||  |||| | || ||||||||  ||||| |    
14794438 aatgctcaagcacacaagtaagagacttcaaatactcaagcacaaaagtaagatacttctaaacaaacaaat-tacacacaaataagtttggtttgaaaa 14794340  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14794339 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14794307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 16587596 - 16587512
Alignment:
406 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 489  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| || | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
16587596 tcaagcacacaaacaagagacttccaatgctcaatcacaaatgaaacagacttccaatgctcaagcacgcatgcaagagacttct 16587512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 19114875 - 19114915
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19114875 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 19114915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 22257575 - 22257635
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
22257575 ggttccttccacaaatcggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22257635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 553
Target Start/End: Original strand, 22382859 - 22383125
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaatactatcaaaa 384  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||  |   |||||||| | ||||  |  || |||     
22382859 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtccccctggctcttccaaggagagttcactaaaatcaatatcggattacaatttctca--agcataaaag 22382956  T
385 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagag 483  Q
     | ||||||||   ||||| |||||||||| | ||||||   |||| |||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||    
22382957 caagagacttc---aaactactcaagcacaaaagcaagacgtttcctatgctcaagcacaaacacaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagag 22383053  T
484 acttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga--cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||| |||||||| |  |||| | || |  ||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
22383054 acttctaatcaaacagaattacacaaaaatttgtttgagggttgaacacttgatatactatcagtgttgttc 22383125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 22455297 - 22455257
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22455297 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 22455257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 22785962 - 22785922
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22785962 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 22785922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 761
Target Start/End: Original strand, 24157629 - 24157701
Alignment:
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||||    
24157629 ttcaagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttgttgattgtcagcacatcaaaagagtcgtt 24157701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 24850975 - 24850935
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24850975 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 24850935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 40331879 - 40331919
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40331879 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 40331919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 41122027 - 41121987
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41122027 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 41121987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 687 - 761
Target Start/End: Original strand, 22383266 - 22383341
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaagagtcgtt 761  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||    
22383266 atcttcaagtcttcacttatttatatagaggtgtaaaagagacgttgtagattttcagcacatcaaaagagtcgtt 22383341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 513 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 22525324 - 22525269
Alignment:
513 taagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat 568  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
22525324 taagtttgggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaaaacaat 22525269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1105 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 23184225 - 23184147
Alignment:
1105 cttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
23184225 cttctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 23184147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1105 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 23595482 - 23595404
Alignment:
1105 cttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
23595482 cttctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 23595404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 690 - 733
Target Start/End: Original strand, 24843992 - 24844035
Alignment:
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24843992 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 24844035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28141327 - 28141268
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
28141327 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 28141268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 28701521 - 28701482
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28701521 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 28701482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 865 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 41121856 - 41121765
Alignment:
865 caggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaa 955  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||    
41121856 caggcatagctgttattcttgtcctgtagcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaa 41121765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10010500 - 10010418
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
10010500 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttacactttcaaggagagttcacta 10010418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 695 - 733
Target Start/End: Original strand, 18702533 - 18702571
Alignment:
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18702533 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18702571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 22271918 - 22271964
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
22271918 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtttgagagagacgttg 22271964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #186
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 24376458 - 24376540
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
24376458 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttctaaggagagttcacta 24376540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #187
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 731
Target Start/End: Original strand, 24376895 - 24376933
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24376895 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 24376933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #188
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 24575571 - 24575688
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
24575571 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 24575670  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
24575671 gtggtgttcacaatacaa 24575688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #189
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 559
Target Start/End: Original strand, 25918265 - 25918363
Alignment:
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| |  |||||||  |||| ||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
25918265 atgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaataaacaaaattacatagaaggatgtttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 25918363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #190
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 38780931 - 38781048
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
38780931 caagagacttctaatgctcaagcacaactacaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaaggtttgaggttgaacacttgatatacaatca 38781030  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
38781031 gtggtgttcacaatacaa 38781048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #191
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 688 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 10010065 - 10010020
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10010065 tctttaagttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 10010020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #192
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1180
Target Start/End: Complemental strand, 18376786 - 18376741
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
18376786 tgcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagca 18376741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #193
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 688 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 18431252 - 18431207
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
18431252 tcttcaggtcttcactcctttatatagatgtgtgaaagagacgttg 18431207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #194
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1092 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 19297516 - 19297423
Alignment:
1092 tgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaact-tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
19297516 tgatcaactgtagcttctgatgaaattttgcttctgatgaactttgcttctgatgacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 19297423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #195
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 19300551 - 19300477
Alignment:
385 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
19300551 tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19300477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #196
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 449 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20152564 - 20152449
Alignment:
449 aagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
20152564 aagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgatgttgaacacttgatatacaatcag 20152466  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| ||||||||    
20152465 tggtgttcacaatacaa 20152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #197
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 353
Target Start/End: Original strand, 21845537 - 21845602
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
21845537 gttccttccacaatcgagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21845602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #198
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 399 - 562
Target Start/End: Original strand, 22271619 - 22271784
Alignment:
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||     ||||||||||| |  ||||||    
22271619 aaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcttatgcccaagcataactgcaagagacttatattcaaac 22271718  T
498 aaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    | |  |||| | || || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22271719 agaattacatataaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22271784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #199
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 897 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 28140723 - 28140603
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||| || |||  ||||| |||||||||| ||   || ||| |||||||||||  ||||||| |||    
28140723 gacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgttttcaaatcctt 28140625  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcact 1018  Q
    |||||||||| |||||||||||    
28140624 tcaaaatagttgttgcttcact 28140603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #200
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 1586923 - 1586875
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
1586923 gcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcatgagcacttt 1586875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #201
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9897405 - 9897354
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
9897405 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9897354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #202
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9907993 - 9907942
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
9907993 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9907942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #203
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10899235 - 10899171
Alignment:
289 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
10899235 ttccttccacaatccgaaagtagtccactcctccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 10899171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #204
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17418285 - 17418219
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 354  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
17418285 tggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-ccccttgcgcttccaagga-atttcactataatcac 17418219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #205
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 17857268 - 17857217
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
17857268 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 17857217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #206
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 18702114 - 18702174
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
18702114 ggttccttccacaaaccgaaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 18702174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #207
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 20070712 - 20070661
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
20070712 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 20070661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #208
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 20152308 - 20152268
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20152308 aagttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 20152268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #209
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 20236791 - 20236842
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
20236791 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 20236842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #210
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 20569059 - 20569019
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
20569059 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttg 20569019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #211
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 21537559 - 21537519
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
21537559 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 21537519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #212
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 22271504 - 22271564
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
22271504 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttggacttcaaaggagagttcacta 22271564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #213
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 24327565 - 24327514
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
24327565 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 24327514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #214
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 24779165 - 24779205
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
24779165 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgtaagagacgttg 24779205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #215
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 25189189 - 25189229
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
25189189 aagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttg 25189229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #216
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 907 - 959
Target Start/End: Original strand, 25189404 - 25189456
Alignment:
907 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||    
25189404 gagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgct 25189456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #217
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 25828536 - 25828595
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
25828536 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctg-cccccttgcacttccaaggagagttcacta 25828595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #218
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1184
Target Start/End: Original strand, 25829338 - 25829386
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
25829338 gcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 25829386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #219
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26655408 - 26655322
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 367  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
26655408 ttatactggttcctcccacaacacaggagtggtccagt-ccccttgcactttcaagg-gatttcactataatcacacatgattacaaat 26655322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #220
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 28140911 - 28140871
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
28140911 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 28140871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #221
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 31328450 - 31328410
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
31328450 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaat 31328410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #222
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 31335171 - 31335131
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
31335171 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaat 31335131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #223
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 40222730 - 40222781
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
40222730 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 40222781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #224
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 40251591 - 40251642
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
40251591 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 40251642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #225
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 44839785 - 44839869
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
44839785 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagaattcactat 44839869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #226
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 6081589 - 6081639
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
6081589 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 6081639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #227
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1146 - 1185
Target Start/End: Original strand, 6392864 - 6392903
Alignment:
1146 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
6392864 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 6392903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #228
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 6574615 - 6574576
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
6574615 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 6574576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #229
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10010237 - 10010198
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
10010237 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 10010198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #230
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 14581171 - 14581210
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14581171 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14581210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #231
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1102 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 17969057 - 17968963
Alignment:
1102 cagcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||  | | |||||||||  |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
17969057 cagcttctgatgaaatcttgcttctgatggactttgcttctgatgatcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 17968963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #232
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18431425 - 18431386
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
18431425 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 18431386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #233
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 18702354 - 18702393
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
18702354 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 18702393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #234
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21548860 - 21548821
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagactt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
21548860 caagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagagactt 21548821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #235
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 354
Target Start/End: Original strand, 21822976 - 21823041
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 354  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
21822976 ggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-cccattgcacttccaagg-gatttcactataatcac 21823041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #236
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 461
Target Start/End: Original strand, 21845679 - 21845738
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 461  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||    
21845679 tgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaaaagacttctaa 21845738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #237
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 21845771 - 21845810
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21845771 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21845810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #238
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22188590 - 22188551
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22188590 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22188551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #239
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22786142 - 22786103
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22786142 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22786103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #240
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 22802083 - 22802122
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22802083 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22802122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #241
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 24376719 - 24376758
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
24376719 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 24376758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #242
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26367133 - 26367074
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
26367133 gttccttccacaaatcgaaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 26367074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #243
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 28551406 - 28551367
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
28551406 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 28551367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #244
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 31801375 - 31801336
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
31801375 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 31801336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #245
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 40331722 - 40331761
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
40331722 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 40331761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #246
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 44840046 - 44840085
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
44840046 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 44840085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #247
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 19539768 - 19539850
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
19539768 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaaatagtcctgtcccgcttgaacttccaaggagagttcacta 19539850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #248
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20569235 - 20569197
Alignment:
524 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
20569235 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 20569197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #249
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 22317127 - 22317243
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
22317127 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 22317225  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||| ||| ||||||||    
22317226 gtggttttcacaatacaa 22317243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #250
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 398 - 567
Target Start/End: Original strand, 22682882 - 22683051
Alignment:
398 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaa 496  Q
    |||| |||||||||||||| || |||| |||  ||| |||||||||  || ||||||| |||  |||||||| |||  | ||||||||||||  | ||||    
22682882 aaaaatgctcaagcacacaagctagagacttaaaatactcaagcacacaaccaagagatttcctatgctcaaacacaaaagcaagagacttccaaacaaa 22682981  T
497 caaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa 567  Q
    ||||  |||| | || ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
22682982 caaat-tacacataaataagtttggtttaaacacttgatatacaataagtggtgttcagaatacaaaacaa 22683051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #251
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 695 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 26619406 - 26619372
Alignment:
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26619406 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 26619372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #252
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Original strand, 26867487 - 26867536
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
26867487 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 26867536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #253
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Original strand, 26880076 - 26880125
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
26880076 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 26880125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #254
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 30557885 - 30557769
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
30557885 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 30557787  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| | ||||||||    
30557786 gtggtgtccacaatacaa 30557769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #255
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1143 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 31967927 - 31967885
Alignment:
1143 atgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
31967927 atgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttg 31967885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #256
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 694 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 31968351 - 31968317
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31968351 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 31968317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #257
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 36251675 - 36251641
Alignment:
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36251675 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 36251641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #258
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 40781828 - 40781910
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||    
40781828 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaataagagttcacta 40781910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #259
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 6574003 - 6573954
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
6574003 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcactactttaggagcactttg 6573954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #260
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 18768739 - 18768687
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
18768739 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 18768687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #261
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21911554 - 21911489
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||    
21911554 gttcattccacaatccggaagtagtcctgtcctccttgcacttccaaggagagtttactaaaatca 21911489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #262
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 525 - 562
Target Start/End: Original strand, 22257817 - 22257854
Alignment:
525 gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22257817 gaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22257854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #263
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Original strand, 24275437 - 24275497
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
24275437 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 24275497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #264
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 24414855 - 24414803
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
24414855 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 24414803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #265
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 353
Target Start/End: Original strand, 24838480 - 24838545
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
24838480 gttccttccacaaatcggaagttgttatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24838545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #266
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27766213 - 27766146
Alignment:
305 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 373  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
27766213 gaagtagtccagtcccc-ttacacttccaagga-atttcactataatcacactagattacaattgctcaa 27766146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #267
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 43083063 - 43083096
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43083063 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 43083096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #268
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 43093672 - 43093705
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43093672 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 43093705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #269
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1148 - 1185
Target Start/End: Original strand, 44840652 - 44840689
Alignment:
1148 cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
44840652 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 44840689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #270
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 563
Target Start/End: Original strand, 1088980 - 1089020
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
1088980 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaat 1089020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #271
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 7005638 - 7005587
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
7005638 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcactttagaagcactt 7005587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #272
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 689 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 15670932 - 15670888
Alignment:
689 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
15670932 cttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagatacgttg 15670888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #273
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18431664 - 18431604
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||    
18431664 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtccccgttgcacttccaatgagagttcacta 18431604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #274
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 19540207 - 19540247
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
19540207 aagtcttcactcctttatatagaggtatgaaagaaacgttg 19540247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #275
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 21172281 - 21172230
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
21172281 ttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacatcatcacttcagatgcactt 21172230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #276
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 22257992 - 22258032
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
22257992 aagtcttcagtcctttatgtagaggtgtgaaagagacgttg 22258032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #277
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 22802253 - 22802293
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
22802253 agtcttcactcctttatatatagttgtgaaagagacgttga 22802293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #278
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 22914695 - 22914644
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22914695 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 22914644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #279
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 22960163 - 22960112
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22960163 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 22960112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #280
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 559
Target Start/End: Original strand, 23234620 - 23234656
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
23234620 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 23234656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #281
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 24338235 - 24338184
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
24338235 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcactttagaagcactt 24338184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #282
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 373
Target Start/End: Original strand, 27939418 - 27939516
Alignment:
277 cagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 373  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  | |||||||||||| || || |  |||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
27939418 cagttatcctggttccgtccacaatccggaagtagtcca-actcccttgcacttcgaacgatatttttcactataatcacagacgattacaattgctcaa 27939516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #283
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 28141165 - 28141049
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat-caaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
28141165 caagagacttttaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacatttgatatacaatcag 28141066  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| ||||||||    
28141065 tggtgttcacaatacaa 28141049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #284
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 28374310 - 28374278
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
28374310 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 28374278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #285
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 29244619 - 29244670
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
29244619 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgatgtcatcacttcagaagcactt 29244670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #286
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 29255198 - 29255249
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
29255198 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgatgtcatcacttcagaagcactt 29255249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #287
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 32218271 - 32218322
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
32218271 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 32218322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #288
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 34790048 - 34789997
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
34790048 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 34789997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #289
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 34804191 - 34804140
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
34804191 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 34804140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #290
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 38033264 - 38033205
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctaga 580  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||    
38033264 ttgaacacttgaaatacaatcagtggtgttcacaatataatgcaattgaaagactctaga 38033205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #291
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39038367 - 39038307
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
39038367 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccgcttgcacttccaaggagagttcacta 39038307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #292
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 13964466 - 13964431
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
13964466 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 13964431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #293
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13964700 - 13964641
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 345  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
13964700 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 13964641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #294
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15671281 - 15671234
Alignment:
306 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
15671281 aagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 15671234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #295
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 19540030 - 19540069
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
19540030 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcataatacaa 19540069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #296
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 900 - 931
Target Start/End: Original strand, 20568134 - 20568165
Alignment:
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
20568134 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 20568165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #297
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20569499 - 20569416
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
20569499 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctagcacttccaaggagagttcacta 20569416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #298
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21537738 - 21537699
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
21537738 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaa 21537699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #299
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22455475 - 22455436
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
22455475 ttgaacacttgatatacaatcagtggtcttcacaatacaa 22455436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #300
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 733
Target Start/End: Original strand, 22683156 - 22683211
Alignment:
679 tctatctta-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||    
22683156 tctatcttaatcttcaagtcttcattcatttatataaaggtatgaaagagacgttg 22683211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #301
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 22764069 - 22764119
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttg--cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22764069 tgcttctgatgaacttctacttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 22764119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #302
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 23184789 - 23184750
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
23184789 ttgaacacttgatatacaatcagcggtgttcacaatacaa 23184750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #303
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23185023 - 23184968
Alignment:
292 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
23185023 cttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 23184968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #304
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 23596052 - 23596013
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
23596052 ttgaacacttgatatacaatcagcggtgttcacaatacaa 23596013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #305
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23596286 - 23596231
Alignment:
292 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
23596286 cttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 23596231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #306
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 347
Target Start/End: Original strand, 27296835 - 27296874
Alignment:
308 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
27296835 gtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 27296874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #307
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 27978180 - 27978138
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
27978180 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcacttt-aacttcag 27978138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #308
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 28064709 - 28064667
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
28064709 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcacttt-aacttcag 28064667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #309
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1146 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 28711568 - 28711529
Alignment:
1146 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
28711568 aacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 28711529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #310
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1151 - 1186
Target Start/End: Original strand, 30621437 - 30621472
Alignment:
1151 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
30621437 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttga 30621472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #311
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1151 - 1186
Target Start/End: Original strand, 30624058 - 30624093
Alignment:
1151 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
30624058 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttga 30624093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #312
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 477 - 559
Target Start/End: Original strand, 44880734 - 44880817
Alignment:
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    |||||||||||||  ||||||| |  |||| |||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
44880734 gcaagagacttctattcaaacataattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatgcaatcagtggtgttcacaata 44880817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #313
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 45087469 - 45087430
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
45087469 ttgaacacttgatatacaatcagtagtgttcacaatacaa 45087430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #314
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6574823 - 6574761
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
6574823 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtttactat 6574761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #315
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 10898838 - 10898792
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
10898838 atctttaagtcttcaatcatttatatagaagtgtgaaagagacgttg 10898792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #316
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 10899010 - 10898980
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
10899010 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 10898980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #317
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1151 - 1185
Target Start/End: Original strand, 14581685 - 14581719
Alignment:
1151 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
14581685 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 14581719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #318
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 19320722 - 19320676
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
19320722 atcttcaagttttcattcctttatatagaggtatgaaagatacgttg 19320676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #319
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1192
Target Start/End: Original strand, 19356715 - 19356776
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttca 1192  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||    
19356715 cttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcaaaggcacttataacttca 19356776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #320
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 20646441 - 20646367
Alignment:
1121 gcttctgataaactt-gcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
20646441 gcttctgatgaactttgcttctgatgagttttgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgaaacttcag 20646367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #321
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21770359 - 21770295
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    |||||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
21770359 tggttcctcccacaacatgggagtaatccagtcccc-ttgcacttctaag-agatttcactataatc 21770295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #322
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22782341 - 22782279
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
22782341 ggttccatccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 22782279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #323
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22786381 - 22786319
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||    
22786381 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgtacttccaaggagagtttactat 22786319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #324
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 22801845 - 22801907
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
22801845 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagtgttcactat 22801907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #325
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24441203 - 24441173
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
24441203 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 24441173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #326
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 24575395 - 24575469
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
24575395 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagccagtcctctcccctttgcacttccaaggagagttcacta 24575469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #327
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 524 - 562
Target Start/End: Original strand, 27939600 - 27939638
Alignment:
524 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
27939600 tgaacacttgatattcaatcagtggtgttcacaatacaa 27939638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #328
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 27939766 - 27939812
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
27939766 atcttcaagtctttattcctttatatagtggtatgaaagagacgttg 27939812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #329
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28701938 - 28701876
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
28701938 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 28701876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #330
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34322658 - 34322596
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
34322658 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagagttcactat 34322596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #331
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1184
Target Start/End: Original strand, 38631184 - 38631218
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
38631184 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 38631218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #332
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 967319 - 967259
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
967319 tgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgtaacttcag 967259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #333
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1180
Target Start/End: Complemental strand, 1099026 - 1098978
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
1099026 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagca 1098978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #334
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1180
Target Start/End: Original strand, 4100181 - 4100229
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
4100181 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagca 4100229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #335
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9762583 - 9762550
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
9762583 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 9762550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #336
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9773119 - 9773086
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
9773119 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 9773086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #337
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1180
Target Start/End: Original strand, 16777251 - 16777299
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
16777251 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagca 16777299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #338
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 19497825 - 19497773
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
19497825 cttgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 19497773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #339
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1182
Target Start/End: Original strand, 19540632 - 19540680
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19540632 cttgcttctgatgaggt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 19540680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #340
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 20151915 - 20151866
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||    
20151915 gcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcactatttcaggagcactttg 20151866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #341
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 863 - 931
Target Start/End: Original strand, 22258162 - 22258231
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
22258162 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #342
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1138 - 1175
Target Start/End: Original strand, 22272367 - 22272404
Alignment:
1138 ttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcag 1175  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
22272367 ttctgatgaacttgtttctaatgacgtcatcacttcag 22272404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #343
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Original strand, 22316967 - 22317028
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
22316967 gttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 22317028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #344
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 693 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 24441027 - 24440986
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
24441027 aagtcttcactccttcatatagaagtgtgaaagatacgttga 24440986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #345
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 339
Target Start/End: Original strand, 25188772 - 25188825
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 339  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
25188772 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 25188825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #346
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 28721149 - 28721097
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
28721149 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcactccagatgcactt 28721097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #347
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 28731737 - 28731685
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
28731737 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcactccagatgcactt 28731685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #348
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30558049 - 30557988
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
30558049 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 30557988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #349
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 525 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 35744463 - 35744426
Alignment:
525 gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
35744463 gaacactcgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 35744426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 583; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 41267 - 40493
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
41267 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 41171  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41170 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 41071  T
358 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 457  Q
    |||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41070 gattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 40971  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
40970 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 40871  T
558 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 657  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
40870 tacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 40771  T
658 gcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 757  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40770 gcttttgaacttatgtatatctctatttaatcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 40671  T
758 cgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 857  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||    
40670 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtaca 40571  T
858 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40570 aattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 40493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 33773 - 32944
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
33773 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctataaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 33675  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
33674 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcatttatcctggttccttccacaaa 33576  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
33575 acggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 33476  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||     
33475 atacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaa 33376  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 600  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
33375 atacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactataaacttttgaatttctaagatgta 33276  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||    
33275 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttc 33176  T
701 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctga 800  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
33175 actcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctga 33077  T
801 tttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 900  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
33076 tttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac- 32978  T
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32977 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 32944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 968 - 1184
Target Start/End: Original strand, 30296 - 30508
Alignment:
968 gaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagct 1067  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||| || | |     
30296 gaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatctattgaacatcc 30395  T
1068 tttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtc 1165  Q
    |||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | || ||||||  ||| ||  ||||||||      ||||||| |||||| ||||||||||||| |     
30396 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctga------tgcttcttatgaacctgcttctgatgacttt 30489  T
1166 atcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||| ||||||||    
30490 atcacttcaggagcacttt 30508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 880 - 959
Target Start/End: Original strand, 9888 - 9967
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
9888 tcttgtcctgtagcagagacacaaacatagtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 9967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 729
Target Start/End: Original strand, 9701 - 9737
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
9701 aagtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagac 9737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 8253 - 8292
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
8253 ttgaacacttaatatacaatcagtggtgttcccaatacaa 8292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 32721 - 32688
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
32721 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 32688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 40287 - 40254
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
40287 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 40254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 579; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 30546 - 31348
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
30546 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 30642  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30643 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 30742  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
30743 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 30842  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
30843 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 30942  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30943 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 31042  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 727  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31043 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttaaact--tatgtatctctatcttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagag 31140  T
728 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattag 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
31141 acgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaa 31240  T
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggtt 926  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
31241 cttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggtt 31340  T
927 gtacactt 934  Q
    ||||||||    
31341 gtacactt 31348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 43397 - 42561
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||    
43397 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagt 43298  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
43297 gcttctgatgaaattatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa-gaaaagcaa-gacacaagcagttatcttggttccttccacaa 43200  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat-gctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| || || |||||||||||| ||    
43199 aacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaacgcttaatactctctaagtatgagacttcaaaa 43100  T
400 aac----tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaa 495  Q
    ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
43099 aaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggccagaggcttctgatcaa 43000  T
496 acaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaa 594  Q
    ||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
42999 acaaaaataccaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaa 42900  T
595 gatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaa 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||    
42899 gatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagtttcggcgctttttaacttgtgtatctctttctacaatcttcaa 42800  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtccttt 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
42799 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaggagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccaataatccttt 42700  T
795 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcg 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
42699 gcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgatgtcttgtcttgtagcg 42600  T
895 tggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
42599 aggac-aaaacagagtagtggaggtagtcgttgtacactt 42561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26848 - 26711
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26848 ttgaattgtgttttctttttctctcttaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 26749  T
233 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaaga 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
26748 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaaga 26711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 572; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 7682 - 6882
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||| | ||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
7682 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcctttgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 7586  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
7585 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttt 7486  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
7485 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactgtctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 7386  T
432 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
7385 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgatcaagcacgcaggcaagaaacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 7286  T
532 tgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 631  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7285 tgatatacaatcagtgatgttcacaatacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttg 7186  T
632 tagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 731  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7185 tagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 7086  T
732 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttc 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
7085 tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttc 6986  T
832 aaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 930  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
6985 aaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 6886  T
931 actt 934  Q
    ||||    
6885 actt 6882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 6676 - 6643
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6676 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 6643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 564; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Original strand, 7375 - 8178
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
7375 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 7471  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7472 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 7571  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
7572 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 7671  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
7672 caatgctcaagcactaagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 7771  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7772 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 7871  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
7872 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 7971  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
7972 gttgagatagtcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 8071  T
830 tcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
8072 tcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttg 8171  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
8172 tacactt 8178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 37800 - 36997
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
37800 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 37704  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37703 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 37604  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
37603 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 37504  T
430 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
37503 caatgctcaagcactaagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 37404  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37403 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 37304  T
630 tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
37303 tgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagac 37204  T
730 gttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagct 829  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
37203 gttgagatagtcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaact 37104  T
830 tcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
37103 tcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttg 37004  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
37003 tacactt 36997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 789 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 47778 - 47631
Alignment:
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtct 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
47778 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtct 47679  T
888 tgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47678 tgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 47631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 564; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 37607 - 36775
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |    
37607 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaatcagtttgtgaat 37508  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
37507 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 37409  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
37408 aacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 37309  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
37308 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 37209  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgt 599  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
37208 aatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatat 37109  T
600 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||||||    
37108 atcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtctt 37009  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctg 799  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
37008 cactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctg 36910  T
800 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
36909 atttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtgga 36811  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36810 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 36552 - 36518
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
36552 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttt 36518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 560; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 158 - 934
Target Start/End: Original strand, 11798 - 12572
Alignment:
158 taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaa 256  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
11798 taaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaa 11894  T
257 aagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11895 aagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 11994  T
357 agattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 456  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11995 agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 12094  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
12095 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 12194  T
557 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
12195 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 12294  T
657 cgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 756  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12295 cgcttttgaacttatgtatctctgtttttaatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12393  T
757 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 856  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
12394 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 12493  T
857 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12494 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagagtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Original strand, 12760 - 12811
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
12760 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 12811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 546; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 3092 - 2259
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||   |||||||||||   || || |    
3092 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaat 2994  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2993 gcttatgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagattaaagcagagaaaagaaaggcaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 2894  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||    
2893 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 2794  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
2793 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaa 2694  T
500 agatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatg 598  Q
    | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
2693 aaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatg 2594  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtct 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||    
2593 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtct 2494  T
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
2493 tcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaagagtcgtttgtaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcct 2394  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 898  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
2393 gattttggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatctgcaagcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtgga 2294  T
899 caaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2293 c-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 2071 - 2021
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
2071 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 2021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 542; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 11478 - 10642
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |    
11478 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 11380  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
11379 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 11281  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||    
11280 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaa 11181  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
11180 aatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 11081  T
501 gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatac-----aataaagactctagac-tttgaatttctaa 594  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||    
11080 aatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaa 10981  T
595 gatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaa 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||    
10980 gatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcactttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaa 10881  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtccttt 794  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
10880 gtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatccttt 10782  T
795 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcg 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10781 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcg 10682  T
895 tggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10681 tggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 8638 - 7795
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
8638 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 8539  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
8538 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 8440  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat-------actatcaaaatatgagactt 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |  || ||||||||||    
8439 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagactt 8340  T
395 cacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatca 494  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
8339 ctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatca 8240  T
495 aacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatac-----aataaagactctagac-tttgaat 588  Q
    |||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||| |||||||    
8239 aacaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaatacaataaagactctagacttttgaat 8140  T
589 ttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttat 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |   ||    
8139 ttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtataatcaaattgacagagttttggcactttttaacttgtatatctctatctacaat 8040  T
689 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||     
8039 cttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaa 7941  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 888  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
7940 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 7841  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7840 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 10469 - 10419
Alignment:
1136 gcttctgatgaa---cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
10469 gcttctgatgaaaaccttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 10419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 7607 - 7555
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
7607 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcactttagaggcactt 7555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 639
Target Start/End: Original strand, 2073 - 2610
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||    
2073 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaattcttccactgataaaccttcagaagcagattgtgagtg 2172  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
2173 cttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttattctggttccttgcacaac 2272  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
2273 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaccaagattacaaatgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 2372  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
2373 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactatgcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 2472  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 601  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2473 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtat 2572  T
602 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2573 caaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca 2610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 743 - 934
Target Start/End: Original strand, 2824 - 3014
Alignment:
743 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 842  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
2824 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcc 2923  T
843 catcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
2924 catcttgagggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtattggttgtacactt 3014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 3202 - 3254
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
3202 cttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 12958 - 12156
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || |||||||||||  ||| ||||||| | |||||||    
12958 ttgaattctgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaattatatatgca 12859  T
235 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
12858 gcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 12761  T
334 aggagattt-cactat-aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 431  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
12760 aggagattttcactaagaatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttcca 12662  T
432 atgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaaca 529  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||    
12661 atgctcaaggactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaa-atgtttgactttgaaca 12563  T
530 cttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgct 628  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
12562 cttgatattctatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctgagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgct 12463  T
629 ttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaag 725  Q
    || ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
12462 ttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttaatgtctctggccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaag 12364  T
726 agacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatt 825  Q
    ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
12363 agacgttgaaatttttagcacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatc 12264  T
826 agcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 925  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12263 aacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcggagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 12165  T
926 tgtacactt 934  Q
    |||||||||    
12164 tgtacactt 12156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 828 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 16092 - 15987
Alignment:
828 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
16092 cttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcggagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgtaggtagtggttg 15994  T
928 tacactt 934  Q
    |||||||    
15993 tacactt 15987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 11952 - 11902
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
11952 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactt 11902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 4681 - 5511
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
4681 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgc 4780  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
4781 ttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 4878  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||    
4879 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccacaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa 4977  T
401 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 499  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||    
4978 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaa 5075  T
500 agatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagat 597  Q
    | ||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
5076 aaatacacagaaa-atgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagat 5174  T
598 gtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaa 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||    
5175 gtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaa 5273  T
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtccttt 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||    
5274 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatctttt 5372  T
795 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcg 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
5373 gcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcg 5471  T
895 tggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
5472 tagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacactt 5511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Original strand, 13110 - 13170
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
13110 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgaaacttcag 13170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1193
Target Start/End: Original strand, 5696 - 5758
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
5696 cttgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgaaacttcag 5758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 57656 - 56822
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||   |  || ||     
57656 tgaaggtgagaaaaacacaagaagagggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgt 57557  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
57556 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 57459  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||    
57458 ccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgatacttctcaa 57359  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaaca 498  Q
    || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  | |||||    
57358 aa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaatgcaagagtcttctaatgcacaagcacgcaggcgagaggcttctattaaaaca 57260  T
499 aagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaaga 596  Q
    || ||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||    
57259 aaaatacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttgagtaattctaaga 57161  T
597 tgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttca 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||| |   |||||||    
57160 tgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttgacagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatatctcttttcaatcttca 57062  T
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcct 792  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |    
57061 agtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatctt 56963  T
793 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtag 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
56962 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtag 56864  T
893 cgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
56863 cgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 56822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Original strand, 32452 - 32737
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |    
32452 tgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 32551  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
32552 tcaaag-aacaagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattga 32650  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | ||  |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| ||  || || |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
32651 acagtctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaagttgtggtgatctttagcttctgatgaacttacttctgatga 32737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 887 - 1169
Target Start/End: Complemental strand, 464 - 182
Alignment:
887 ttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgt 986  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| | |  |||||||||||| |    
464 ttgtagcgaagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgc-tctttgaaggataagcatccaatgcct 366  T
987 tcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagct-tttgaagccttaagttgc 1085  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |  |  |  ||| ||  ||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||    
365 tcaaatcctttcaaattagccgttgctactttactttagtctttcgctctctttagacgagtttgaatccattaaacagctatttgaaactttaggttgc 266  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    |||   ||||||| | ||| ||||| |||| |   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
265 atcttctgatgaagtacagtttctggtgatatacagcttctgatagacttgcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatca 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 881 - 1129
Target Start/End: Original strand, 49318 - 49567
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| ||||||||    
49318 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcca 49416  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||  ||||||||| || |||||||| || |   |||||||| ||||    
49417 atgccttcaaatcctttcaaaatagtagttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaa 49516  T
1081 g--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgat 1129  Q
    |  ||||||| | ||||||||| || |||||| |||| ||  |||||||||    
49517 gacttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 49567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 1142 - 790
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 358  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
1142 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 1043  T
359 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| | ||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
1042 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattactcaagcacacagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 946  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    ||  ||||||||||||  |   |||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
945 tcctatgctcaagcactaaattaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 846  T
556 aatacaatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaat 606  Q
    |||||||| ||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
845 aatacaatgcaattgaaagaatctctagacttaagaatttctaagatatatgaaat 790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 686 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 691 - 464
Alignment:
686 tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacc 783  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||    
691 tatctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttctgaaaac--ttgatcaatcacc 594  T
784 agtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtct 882  Q
    | |  || ||||||||||||   ||| ||||| | ||| || |  ||||||| |||||| ||  ||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||    
593 aatgatcgtttgcctgatttacttgttgtcctataaaggatcaagttcaaatccattcctattctgagggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttct 495  T
883 tgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagt 913  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
494 tgtcttgtagcgtagacataaacagagtagt 464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 31943 - 32026
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
31943 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 32026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 48698 - 48772
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
48698 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 48772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 32282 - 32322
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
32282 aagtattcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 32322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 49129 - 49169
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
49129 aagtcttcactcctttacatagaggtgtgaatgagacgttg 49169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1192
Target Start/End: Complemental strand, 56617 - 56558
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttca 1192  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
56617 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgaaacttca 56558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 181 - 934
Target Start/End: Original strand, 34997 - 35753
Alignment:
181 cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag 279  Q
    |||||||||| |  || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||     
34997 cttcagaagctagttgggagtgcttttgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaa 35094  T
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaat 374  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||| |||||    
35095 ttatcctggttccttccacaaaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttctactaaaaataatcacacagattacaaatgttcaat 35194  T
375 actatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacg 473  Q
    ||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
35195 actctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacg 35291  T
474 caggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaaga 573  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |  |||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
35292 caggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaatagttagacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaga 35391  T
574 ctctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgt 671  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||||    
35392 ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttagcgctttt-aacttgt 35490  T
672 at--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 768  Q
     |  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||    
35491 gttgatgtctctacca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgactaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttc 35588  T
769 ctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcagg 868  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
35589 ctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcagg 35687  T
869 catagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35688 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Original strand, 35956 - 36016
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||    
35956 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacatcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 36016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 39887 - 40718
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |   | ||||    
39887 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttagaaatgct 39986  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 303  Q
    ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
39987 tctaatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaacc 40084  T
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||     
40085 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa- 40183  T
402 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
     ||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||    
40184 -tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctattcaaacaaa 40282  T
501 gatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatg 598  Q
     ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
40283 aatacagagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaatatg 40381  T
599 tatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||| |||| ||||||||||| | ||||||| |  ||||||||  |  |||||||||    
40382 tatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagaattttggcgcttct-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaag 40480  T
696 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttg 795  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |     ||| |     ||||  |||||||||||||||||| || || ||||    
40481 tcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttaaaaaaaaaaaaaaaaaaattgagttcctttgatcatccaccaataatcttttg 40580  T
796 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
40581 cctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgt 40679  T
896 ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40680 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 40718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 280 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 10984 - 10331
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 377  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
10984 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatact 10885  T
378 atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcag 476  Q
     ||  | ||||||||||| || |  ||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
10884 ctcttagtatgagacttctcaga--tgctcaagcacgcaggtgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 10787  T
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagact 575  Q
    || |||| |||||  ||||| ||| ||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||    
10786 gcgagaggcttctattcaaataaaaatacacagaa-aatgtttgacattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaattct 10688  T
576 ctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat 673  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
10687 ctagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgt 10589  T
674 --atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctt 771  Q
      || |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||  |||||    
10588 tgatatctcttggcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacatctaaagagtcg-ttgagttcctt 10490  T
772 tgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcat 871  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||     
10489 tgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttaaaggaacat-ttctgcaggcag 10391  T
872 agctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
10390 agctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtaca 10331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 10124 - 10064
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
10124 tgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgaaacttcag 10064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 934
Target Start/End: Original strand, 15110 - 15945
Alignment:
106 aatgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||    
15110 aatgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattttgttttcttcttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatg 15209  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
15210 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcaacggaatgaaaacagaacagagaaaag--aaagaaagacacaagcaattattctggttccttccacaa 15307  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 398  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||    
15308 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctcttagtatgagacttctca 15407  T
399 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 497  Q
    ||  |||| |||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
15408 aa--tgctgaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatggtcaagcacgcaggcgagaggcttctgatcaaac 15505  T
498 aaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaag 595  Q
    |||  |||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||    
15506 aaaattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatataatgcaacaaagactctagacttaagaatttctaag 15604  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatctt 691  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| | | |||  |||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||| | | |||||    
15605 atatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttgagaaacaaatttagcagagttttgacgctttt-aacttgtgttcatgtctctctttaatctt 15703  T
692 caagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||  | || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||    
15704 caagtctttactcctttaaatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagaacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatc 15802  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt 890  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
15803 ttttgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttctaattcattcctttcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagatgttgtcttgtcttgt 15901  T
891 agcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15902 agcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Original strand, 6959 - 7019
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
6959 tgcttctgatgaacttctgcttctgttgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 7019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 309; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 280 - 934
Target Start/End: Original strand, 1554 - 2210
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatact 377  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
1554 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatact 1653  T
378 atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcag 476  Q
      | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
1654 cactag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 1750  T
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactc 576  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
1751 gcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaagactc 1850  T
577 tagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat- 673  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |     
1851 tagacttaagaatttctaagatatatcaaatccgtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttagcgctttt-aacttgtgtt 1949  T
674 -atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctt 771  Q
     |||| | | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  |||||    
1950 gatgtttttttttaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgagtaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctt 2048  T
772 tgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcat 871  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||     
2049 tgatcattcaccattaatcttttgcctaatttgggtgtagtcctgtgacggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcag 2147  T
872 agctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
2148 agctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Original strand, 2413 - 2473
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
2413 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 2473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 7)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 156 - 934
Target Start/End: Original strand, 127077 - 127862
Alignment:
156 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa---agaacagagcag 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||  ||    
127077 tctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaaacagattag 127176  T
253 agaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta---- 347  Q
    ||| |||||| | |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        
127177 agagaagaaagaga--gacacgagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaa 127274  T
348 -taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 445  Q
     ||||| || ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
127275 ataatc-cacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 127371  T
446 a-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatc 543  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| | ||  | |||||| || |||||||||||||||||||    
127372 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatcaaacaaaattacacataaa-atgtttgagtttgaacacttgatatacaatc 127470  T
544 agtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtt 642  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |    
127471 agtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaat 127570  T
643 tga-cagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctta--tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagata 738  Q
    | | |||||||||| ||||||| ||||| | | ||  | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||     
127571 ttagcagagttttgacgctttt-aacttctgt-tgattgtctcttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatt 127668  T
739 atcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattca 838  Q
     | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| ||    
127669 tttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcgtttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatcca 127767  T
839 ttcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
127768 ttcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 127862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 523 - 934
Target Start/End: Original strand, 140608 - 141021
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
140608 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca 140707  T
622 gtgtgctttgtagaatcagtttga-cagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctta--tcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 718  Q
    | |||||||  |||||||  || | |||||||||| ||||||| |||||||  |||  | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
140708 gagtgcttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgctttt-aacttgtg-atgattgtctcttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 140805  T
719 gtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtccttt 817  Q
    | | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
140806 gagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtccttt 140904  T
818 -gaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtgga 916  Q
     |||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
140905 tgaaggatcaacttcaaactcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgga 141003  T
917 ggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||    
141004 ggtagtggttgtacactt 141021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 108 - 621
Target Start/End: Original strand, 15984 - 16508
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      | |||| |||||||||||||   ||||||||||  | || |||||    
15984 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggcttgaattgtgttttctttttctctttgaaaaatcttcttctgatattacttcagaagctgattgggagtg 16083  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
16084 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggcataaaaatagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaa 16181  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
      ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
16182 accggaactagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaagataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttc 16281  T
396 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc-tgatc 493  Q
     ||||  ||||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
16282 tcaaa--tgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcttaatc 16379  T
494 aaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactt-tgaatttc 591  Q
    ||||| |  |||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
16380 aaacagaattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaagactctcgacttaagaatttc 16478  T
592 taagatgtatcaaatcagtgcagaaattca 621  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
16479 taagatatatcaaatcagtgcagaaattca 16508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 694 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 215810 - 215319
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   |||||||||||| |  ||||||||  ||||| |  ||    
215810 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaagtt-tttgatcaatcaccaatgatc 215713  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| | | |||||  |||  || |  ||||||| ||||||||   |||| | ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
215712 ttttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccaatgtgaaagaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 215614  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||    
215613 tagcagagacgaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttca 215515  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||     
215514 aatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagttttaagttgcatct 215415  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
215414 cctgataaactgcagcttctggtgattttcggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtctccacttcatgagcactttg 215319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 523 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 8107 - 7693
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaatt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   || |||||    
8107 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaagtgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacataaatt 8008  T
620 cagtgtgctttgtagaatcag---tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtata--tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatag 714  Q
    ||  |||||||  ||   ||    |||| |||||||| || |||||| |||||||     | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
8007 caaagtgcttttgagtgacacaaatttggcagagtttaggagctttt-aacttgttgtcttatctcta-ctaatcttcaagtcttcactcctttatatag 7910  T
715 aggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtc 813  Q
    |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||  |||| |  || |||||||||||||| ||| |||    
7909 aggtgtgaaagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcg-ttgagaacctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtc 7811  T
814 ctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtag 912  Q
    || ||||| || |  |||||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |  |||||| |    
7810 ctatgaagcatcaagttcaaattcattcatatcttgaatgaacat-ttctgcaggcagagctgttatacttgtcttgtagcgcagacacactcagagtcg 7712  T
913 tggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||||||||||||||||||    
7711 tggaggtagtggttgtaca 7693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1186
Target Start/End: Original strand, 128047 - 128101
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
128047 ttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttga 128101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1186
Target Start/End: Original strand, 141224 - 141277
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
141224 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcacaggcactttga 141277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 294; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 195 - 934
Target Start/End: Original strand, 18679 - 19466
Alignment:
195 tgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaa-cagagcagag-aaaagaaaaacaaagacacaagc-agttatcctggtt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
18679 tgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaatcaaagtagagaaaaagaaaagcaaagacacaagcgagttatcctggtt 18778  T
291 ccttccacaacacggaagtagt-ccagt-cccccttgcacttccaaggagatttcactataatc-acaaagatta--caaatgctc-aatactatcaaaa 384  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| |||||| || ||     
18779 ccttccacaaatcggaagtagtcccagtccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaacaaagattaacaaaatgctctaatactctctaag 18878  T
385 tatgagacttcacaaaa---ctgctcaagcacacacgcaagagtcttcc--aatgctcaagc-actaag-caagagacttctaat-gctcaagcacgcag 476  Q
    ||||||| ||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||    
18879 tatgagatttctcaaaaattatgctcaagcacacacgcaagagtcttcccaaatgctcaagcaactaagacaagagtcttctaatagctcaagcacacag 18978  T
477 gc-aagagacttctgatcaaac-aaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgat-atacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaaga 573  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||    
18979 gcaaagaggcttctgatcaaacaaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgataatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgttagaga 19078  T
574 ctctag-ac-tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtg-cagaaattcagtgtgc-tttgtagaatc--agtttgacagag-ttttggcg---ctttt 663  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||    ||||    
19079 ctctagtacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgacagaaattcagtgtgcttttgtagaatcaaaatttgacagagtttttggcgtctttttt 19178  T
664 gaacttgtatatgtctctatcttatc-ttcaa--gtc-ttcactcc---tttatat-agaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 755  Q
     ||||||||||| ||| | |   ||| |||||  ||| ||||||||   || |||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
19179 taacttgtatatatctatctacaatctttcaaaggtctttcactcccttttaatataaaaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 19278  T
756 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcc-tttgaagaa-ttagcttcaaattcattcccatcttgaagg 853  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
19279 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttgaggaatttaacttcaaattcattcccatcttgaagg 19378  T
854 cacatattc----tgcaggcat-agctgttgtcttgtcttgtagcgt--ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||| ||||    |  |||||| || |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19379 cacaaattcggtgtcgaggcataaggtgttgtcttgtcttgtagcgttggaacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 202 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 17756 - 16985
Alignment:
202 gcttctgatgaaatgatca-gaatcagatatgcagcggaaa--gaa-cagagcagag--aaaagaaaaacaaagaca-caag-cagttatcctggttcct 293  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||   |||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
17756 gcttctgatgaaatgatcaagaatcagatatgcagtggaaaaagaatcaaagcagaagaaaaagaaagacaagaacaacaagacagttatcctggttcct 17657  T
294 tccacaac-acggaagtagtccagtccccc-ttgcactt-ccaaggag-atttcactat--aatcacaaa-gattac--aaatgct-caatactatcaaa 383  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||   ||||||| ||||||| || ||    
17656 tccacaaatacggaagtagtccagtccccccttgcactttccaaggagtatttcactattaaatcacaaaagattaacaaaatgctacaatactctctaa 17557  T
384 atatgagacttc---acaaaactgctcaag-cacacacgcaa-gagtcttccaatgct-caagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagg 477  Q
      ||||||||||   | ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
17556 gcatgagacttctacaaaaaatagctcaagtcacacacgcaaagagtcttccaatgctacaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacagg 17457  T
478 caagagacttctgat--caaacaaagatacagagaattaag-tttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc-aatacaatacaataaaga 573  Q
    |||||| ||||||||   ||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  || |||    
17456 caagaggcttctgatacaaaacaaaaatacaatgaaataagttttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaaatacaatacgttagaga 17357  T
574 ctctagac-tttgaatttct-aagatgtatcaaatc-agtg-cagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagtttt-ggcg--cttttga 665  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||   |||| |    
17356 ctctagacttttgaatttctaaagatgtatcaaatcaagtgtcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaaattgacagagttttgggcgtctttttta 17257  T
666 acttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaag-agtcgtttg 763  Q
    |||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
17256 acttgtatatatctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttgagattgattagcacgtctaaagtagtcgtttg 17157  T
764 aaa-tcctttgatcatccaccag-tagtcctttgcctgatttgggtgta-gtcctttgaagaattagcttcaaa--ttcattcccatc-ttgaaggcaca 857  Q
    ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||    
17156 aaattcctttgatcattcaccagttaatcctttgcctgatttgggtgtaggtcctttgaggaattaacttcaaaatttcattcccatctttgaaggcaca 17057  T
858 tattc-tg---caggcatagctgttgtcttgtcttgtagcg-tggacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 924  Q
     |||| ||    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
17056 aattcgtgtacgaggcataggtgttgtcttgtcttgtagcgttggacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 16985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 4)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 108 - 934
Target Start/End: Original strand, 28854 - 29691
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    |||||||||    || |||||||    
28854 tgaaggtgagaaaaatacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaattcttcttctgatatcaattcagaagcttggtgagagtgct 28953  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa---agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||   | |||| || |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
28954 tctgatatgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaaacaaagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 29051  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 395  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||    
29052 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac-atctag-tatgagacttc 29149  T
396 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatca 494  Q
     ||||  ||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||    
29150 ccaaa--tgctcaagcacgcaggagagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgcttaggcacgcaggcgagagacttctaatca 29247  T
495 aacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat-aaagactctagacttt-gaatttct 592  Q
    |||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||    
29248 aacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaagtgtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttct 29347  T
593 aagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatc 689  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |  |||    
29348 aagatatatcaaatcagcgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttttggcactttt-aacttgtattgatgtctcta-ccaatc 29445  T
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagta 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |  | |||||||| ||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
29446 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattttttagcacgtccaaacagttg-ttgagttcctttgatcatccaccagta 29544  T
788 gtcctttgcctgatttgggtgtagtcct-ttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtc 886  Q
     || |||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
29545 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctattgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtc 29643  T
887 ttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
29644 ttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 29691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1193
Target Start/End: Original strand, 29861 - 29955
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaactt--gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
29861 agcttctgatgaaatcttgcttctgatgaacttttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 29955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 36635 - 36583
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
36635 cttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactt 36583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 25817 - 25899
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
25817 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 25899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 8)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 460 - 934
Target Start/End: Original strand, 175062 - 175540
Alignment:
460 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaat---cagtggtgttctca 556  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||    
175062 aatgctcaagcacgtaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaataatcagtgatgttcaca 175161  T
557 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 654  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
175162 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagacattcaaggtgctttgtagaatcaaatttgacagagtttt 175261  T
655 ggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 752  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
175262 ggcgctttt-aacttgtgttgatatctcttgccaatcttaaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 175360  T
753 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 852  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
175361 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcagcttcaaattcattcccatcttgaag 175459  T
853 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | |||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
175460 gaacat-ttctgcaaacaaagctgttgtcttgtcctgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 175540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 201 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 41130 - 40388
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||| ||||| | || |||||||| |||| ||||||||  | ||||||| || ||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
41130 tgcttatgatgtattgttcagaatctgatacgcagcggagtaaaacagagtagcgaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccaca 41033  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagac 392  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||| ||  |  | ||||||||    
41032 aaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatattacacctagtatgagac 40933  T
393 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga 491  Q
    ||||||||  |||||||||||  | ||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |    
40932 ttcacaaa--tgctcaagcacgtaggcaagagacttcctttgctcaagcaataaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaa 40835  T
492 tcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaa 587  Q
    ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||    
40834 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatactatcagtggttttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaa 40735  T
588 tttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag---tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtata--tgtctcta 682  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||  ||   ||    |||| |||||||| ||||||||| |||||||     ||||||||    
40734 tttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgcttttgagtgacacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtcttgtctcta 40636  T
683 tcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatcca 781  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |    
40635 -ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggttgtagagagacgttgagacctttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagaacctttgatcattta 40538  T
782 ccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt- 880  Q
    ||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |     
40537 ccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcaaagctgttata 40439  T
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    ||||||||||||||  |||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
40438 cttgtcttgtagcgaagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 40388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 201 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 59674 - 58934
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||| ||||| | || |||||||| |||| ||||||||  | ||||||| ||||| |||||| | |  ||||||| || |||| |||||||||||||||    
59674 tgcttttgatgtattgttcagaatctgatacgcagcggagtaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaaacaattatactggttccttccaca 59577  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact 393  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||||||||||||||||||| |  | |||||||||    
59576 aaccagaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatacta-cctagtatgagact 59478  T
394 tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat 492  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  |    
59477 tcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctatt 59380  T
493 caaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagactt-tgaat 588  Q
    |||||| |  |||| | ||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||    
59379 caaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtgatgtttacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaat 59280  T
589 ttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgt--atatgtctctat 683  Q
    ||||||||| ||||||||||   || |||||||  |||||||   ||   |  | |||| |||||||| ||||||||| |||||||     | ||||||     
59279 ttctaagatatatcaaatcaacacaaaaattcaaagtgcttttgagtgacacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtcttatctcta- 59182  T
684 cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccac 782  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  ||    
59181 ctgatcttaaagtcttcactcctttatatagaggttttagagagacgttgagacctttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagaacctttgatcatttac 59083  T
783 cagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-c 881  Q
    || |  || |||||||||||||| ||| ||| | ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |    
59082 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatac 58984  T
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    |||||| |||| |   ||| || |||| | |||||||||||| |||||||    
58983 ttgtctcgtagtgcaaacacaagcagattcgtggaggtagtgattgtaca 58934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 138 - 413
Target Start/End: Original strand, 174796 - 175074
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||  |||||||||||   |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
174796 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttccgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 174895  T
235 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
174896 gcggaataaaacagagcagaggaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 174993  T
334 aggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcac 413  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
174994 aggagattttcactaaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcac 175074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 40200 - 40126
Alignment:
1121 gcttctgataaactt-gcttctgatgaact-tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
40200 gcttctgatgaactttgcttctgatgagttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgaaacttcag 40126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41263 - 41191
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tctaaaaattcttcttctgata 177  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||    
41263 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaaatcttcttctgata 41191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1185
Target Start/End: Original strand, 175744 - 175796
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
175744 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatttcttcagaggcactttg 175796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1185
Target Start/End: Original strand, 180656 - 180708
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
180656 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatttcttcagaggcactttg 180708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 591 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 13989 - 13648
Alignment:
591 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatct 690  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||  |||     
13989 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtgaaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctccaatcc 13890  T
691 tcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||    
13889 tcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattaccacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatc 13791  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt 890  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
13790 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggaata-attatgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt 13692  T
891 agcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
13691 agcgtggacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 13648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 13136 - 13087
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
13136 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcataagcact 13087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 13441 - 13392
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
13441 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcaaaagcact 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 623 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 52457 - 52143
Alignment:
623 tgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 722  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52457 tgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgacactttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 52358  T
723 aagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaga 822  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52357 aagagacgttgagatgattaacacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcatcagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaga 52258  T
823 attagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagc----gtggacaaaaacagagtagtggagg 918  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |||    || ||||||||||||||||||||||    
52257 attagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttatgcaggcagagctgttatcttgtcttgcagcgtaggtagacaaaaacagagtagtggagg 52159  T
919 tagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||    
52158 tagtggttgtacactt 52143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 190; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 29324 - 28836
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 549  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29324 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 29225  T
550 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgac 646  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||| |    
29224 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaattagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttggc 29125  T
647 agagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc-a 742  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  |    
29124 agagtttgggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctg-ctgatcttcgagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttta 29027  T
743 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 842  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
29026 gcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 28928  T
843 catcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagg-tagtggttgtacactt 934  Q
     ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || || |||| ||||||||||||||||    
28927 aatcttaaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtagaggatagtggttgtacactt 28836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 29613 - 29282
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||    ||||||||| |  || ||| |||||||||   ||| ||||||||| |||||||    
29613 ttgaattgtgttttctttttctcataaaattcttcttctgatatcaattcagaagctagttgagagcgcttctgatatgatgttcagaatcatatatgca 29514  T
235 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    ||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
29513 gcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttcc 29416  T
333 aaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 426  Q
    || ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||  || || |||| |    
29415 aatgagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcatgcatgctagagac 29319  T
427 ttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
29318 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 29282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 412133 - 411983
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
412133 aaaaatacttcttctgataaaactccagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 412037  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtag 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
412036 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtag 411983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 408061 - 408010
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
408061 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 408010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 184; Significance: 5e-99; HSPs: 7)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 59817 - 59332
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa--gatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtg 547  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |   ||||||||||| |||||||| |  || ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
59817 agagacttccaatgctcaagcactaaaaaaagagacttctaatcaaacagaatgacacaaaaaatt--gtttgacttgaacacttgatatacaatcagtg 59720  T
548 gtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttg 644  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||    
59719 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttg 59620  T
645 acagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc 741  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |     
59619 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgttgatgtctct-tctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattttt 59522  T
742 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 841  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
59521 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttaggtgtagtcctatgaaggatgaacttcaaattcattc 59423  T
842 ccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||| || |||||| || |||||||||||||    
59422 ctatcttgaagg-aca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagggtcgtggagataatggttgtacactt 59332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Original strand, 142894 - 143340
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||| ||||||   |||||||||  ||||| |  |    
142894 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcatttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 142991  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgt-ctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | || | |||    
142992 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttttttttctt 143090  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||         |||||||  ||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||     
143091 gtagcatagacaaaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt---------gtacttttccaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttt 143180  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  || |||||| || |||||||| |||||| ||| |||| || ||  |||||    
143181 aaatccttccaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaatagcctttcaagctttgagtcttgca 143280  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    || | ||||||| |  |||||||  |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
143281 tctcgtgatgaaatagagcttctagtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 143340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 562
Target Start/End: Original strand, 63881 - 64027
Alignment:
419 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaa 515  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||| |||     
63881 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaaga-ttat 63979  T
516 gtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
63980 gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 64027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 562
Target Start/End: Original strand, 46207 - 46353
Alignment:
419 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaa 515  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||| |||     
46207 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaaga-ttat 46305  T
516 gtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
46306 ctttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcataatacaa 46353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 384 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 59852 - 59775
Alignment:
384 atatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
59852 atatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaaaaaagagacttctaat 59775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 59146 - 59085
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
59146 ttgctcctgatgaacttctgcttctgatgacgtcataacttcagaggcacttgtaacttcag 59085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 46044 - 46105
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
46044 ggttccttctacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 46105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 179; Significance: 5e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 477 - 931
Target Start/End: Original strand, 961 - 1418
Alignment:
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gac 574  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||    
961 gcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaacaaaagac 1060  T
575 tctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta 672  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
1061 tctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttgacagagtttgggcgctttt-aacttgta 1159  T
673 t--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcc 769  Q
       |||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||    
1160 gtaatgtctct-tataatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagattttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcc 1257  T
770 tttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggc 869  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| | ||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
1258 tttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggc 1356  T
870 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||    
1357 agagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtaca 1418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 477 - 931
Target Start/End: Original strand, 1576 - 2033
Alignment:
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gac 574  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||    
1576 gcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaacaaaagac 1675  T
575 tctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta 672  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
1676 tctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttgacagagtttgggcgctttt-aacttgta 1774  T
673 t--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcc 769  Q
       |||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||    
1775 gtaatgtctct-tataatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagattttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcc 1872  T
770 tttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggc 869  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| | ||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
1873 tttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggc 1971  T
870 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 931  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||    
1972 agagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtaca 2033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 462
Target Start/End: Original strand, 612 - 976
Alignment:
106 aatgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc--ta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||    
612 aatgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttcttttccttagaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtg 710  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa----agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||    | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
711 cttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcggaataacaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccac 808  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagac 392  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | |||||||     
809 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagaa 907  T
393 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    | | ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
908 tgcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgttcaaggactaaagcaagagacttctaat 976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1193
Target Start/End: Original strand, 2206 - 2298
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaact-tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||    
2206 agcttctgatgaaattttgcttctgatgaactttgcttctgatgacttctgcttctgatgatgtcattacttcagaagcacttaaaacttcag 2298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 176; Significance: 3e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 108 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8941 - 8650
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||   ||||| ||    
8941 tgaaggtaagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaaaaaacttcagaagcagtttgtgaatg 8842  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
8841 cttc-gatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 8743  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagactt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
8742 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagactt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 859 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 8178 - 8103
Alignment:
859 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8178 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 8103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 7916 - 7865
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
7916 cttgcttctgatgagcttctgcttctgacgacgtcatcacttcagaagcact 7865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 168; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Original strand, 23220 - 23455
Alignment:
166 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
23220 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 23316  T
265 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23317 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 23416  T
365 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 403  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
23417 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaact 23455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 165; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 108 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 1
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt-----tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||| ||     ||||||||| ||||||||||  || |||||||||||   ||||||||    
289 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcattatctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtg 190  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
189 cttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaataaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 91  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgaga 391  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
90 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 161; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 515 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 2800 - 2601
Alignment:
515 agtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcag 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2800 agtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaaaacaataaagactctcgactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcag 2701  T
615 aaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt--atcttcaagtcttcactcctttatat 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||    
2700 aaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatctctgtttttttaatcttcaagtcttcactcctttatat 2601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 159; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 218 - 934
Target Start/End: Original strand, 61040 - 61771
Alignment:
218 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 315  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
61040 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtcca 61137  T
316 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctca 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||| || ||||||||||||  |  | ||||||||||| ||||  ||||||    
61138 gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattataactgctcaatactacacctagtatgagacttcgcaaa--tgctca 61235  T
409 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac--taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagataca 506  Q
    ||||| || ||||||| |||||  |||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  ||||    
61236 agcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacaaaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattaca 61335  T
507 gagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgta 600  Q
     ||||    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||    
61336 cagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatata 61435  T
601 tcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttgt--atatgtctctatcttatcttcaagt 696  Q
    |||||| |   |||||| |||  |||||||||  ||| | | |||| |||||||| || |||||| |||||||     |||||||| || ||||||||||    
61436 tcaaatgaacacagaaagtcaaagtgctttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggtgctttt-aacttgttgtcttgtctcta-ctgatcttcaagt 61533  T
697 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttg 795  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||| ||||||||| |||| |  | |||||||   |||| |  || ||||    
61534 cttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcg-ttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttg 61632  T
796 cctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcg 894  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
61633 cctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttttgtaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcg 61731  T
895 tggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
61732 tagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 61771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 154; Significance: 4e-81; HSPs: 5)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 321 - 1
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | |    
321 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaat 222  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
221 gcctctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaataataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 123  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
122 cacggaagtagtccagtcccccttgcaattccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 23  T
401 actgctcaagcacacacgcaaga 423  Q
    | |||||||||||| | ||||||    
22 a-tgctcaagcacataggcaaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 27573 - 27290
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |     
27573 tgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgc-tc 27475  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||| || | |||||||||||| ||| ||| || |||||||||  ||||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||| || ||| |||| |    
27474 tttgaagagcaagcatccaatgccttcgaatcctatcaaaatagctgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattga 27375  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | | | |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| |||| |||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
27374 acaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcatctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 27290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 27318 - 27266
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
27318 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttg 27266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28181 - 28098
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
28181 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 28098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 27743 - 27703
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
27743 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 27703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 153; Significance: 2e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 450 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 10317 - 9912
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 549  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10317 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 10218  T
550 gttctcaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgaca 647  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||  | |||| ||    
10217 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaggaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaacaaatttggca 10118  T
648 gagttttggcgcttttgaacttgt-at-atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 744  Q
    |||||| ||  ||||| ||||||| || |||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||    
10117 gagtttgggtactttt-aacttgtgataatgtttcta-ctgatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 10020  T
745 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 844  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
10019 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttagatgcagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 9921  T
845 tcttgaagg 853  Q
    |||||||||    
9920 tcttgaagg 9912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 217 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 10524 - 10275
Alignment:
217 atcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcc 314  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  | |||| || |||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
10524 atcagattcagatacgcagcggaataaaaacaaagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtcc 10427  T
315 agtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctca 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||    
10426 agtcccccttgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctca 10330  T
409 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
10329 agcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 10275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 9757 - 9696
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
9757 ttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgaaacttcag 9696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 153; Significance: 2e-80; HSPs: 8)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 220 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 476051 - 475322
Alignment:
220 agaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
476051 agaatcagatacgcagcggattaacaacagagtagagagaagaaagagaaa--cacaagcaattatactggttccttccacaaactggaagtagtccagt 475954  T
318 cccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||    
475953 cccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagc 475856  T
412 acacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagaga 510  Q
    || ||  |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||| | |  |||| |||    
475855 acgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaaagaattacacaga 475756  T
511 attaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaa 604  Q
    |    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||    
475755 aaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaa 475656  T
605 atcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttg-tatat-gtctctatctt-atcttcaagtctt 699  Q
    || |   || |||||||  |||||||||  ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| | |||| | | | |||||  | || |||||||||||||    
475655 atgaacacataaattcaaagtgctttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-atcttgatgtcttgtctcactattgatcttcaagtctt 475557  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||    
475556 cactcctttatatagtggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttaagaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcct 475458  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||  || ||||| ||||| || |  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |    
475457 gatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtag 475359  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
475358 acacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 475322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 220 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 482571 - 481842
Alignment:
220 agaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
482571 agaatcagatacgcagcggattaacaacagagtagagagaagaaagagaaa--cacaagcaattatactggttccttccacaaactggaagtagtccagt 482474  T
318 cccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||    
482473 cccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagc 482376  T
412 acacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagaga 510  Q
    || ||  |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||| | |  |||| |||    
482375 acgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaaagaattacacaga 482276  T
511 attaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaa 604  Q
    |    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||    
482275 aaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaa 482176  T
605 atcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttg-tatat-gtctctatctt-atcttcaagtctt 699  Q
    || |   || |||||||  |||||||||  ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| | |||| | | | |||||  | || |||||||||||||    
482175 atgaacacataaattcaaagtgctttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-atcttgatgtcttgtctcactattgatcttcaagtctt 482077  T
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcct 798  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||   |||| |  || |||||||    
482076 cactcctttatatagtggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttaagaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcct 481978  T
799 gatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttgtcttgtagcgtgg 897  Q
    |||||||  || ||||| ||||| || |  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |    
481977 gatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtag 481879  T
898 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
481878 acacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 481842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 138 - 373
Target Start/End: Original strand, 100034 - 100272
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
100034 ttgaattgtgttttgtttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgca 100133  T
235 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 333  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
100134 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 100232  T
334 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
100233 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 100272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 767 - 934
Target Start/End: Original strand, 117148 - 117314
Alignment:
767 tcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 866  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
117148 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attttgca 117246  T
867 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
117247 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagcggaggtagtggttgtacactt 117314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 523 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 157117 - 156698
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaa 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||    
157117 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaa 157018  T
618 -ttcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatata 713  Q
     ||||  |||||||   ||  ||  | |||| |||||||| ||||||||| |||||||     | ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
157017 attcaaagtgcttttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtcttgtcactctgatcttcaagtcttcactcctttatata 156919  T
714 gaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtag 811  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| |    
156918 gaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttg 156821  T
812 tcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagt 910  Q
    |||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||| |||  |  || |||    
156820 tcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtatcgtagacgcacgcatagt 156722  T
911 agtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     |||||||||||||||||||||||    
156721 cgtggaggtagtggttgtacactt 156698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 373
Target Start/End: Original strand, 111786 - 111874
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 373  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
111786 ggttccttccacaatccgaaagtagtcctgtctcccttgtacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgattacaaatgctcaa 111874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 347500 - 347448
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
347500 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 347448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 117537 - 117570
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
117537 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 117570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 151; Significance: 3e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 78492 - 78227
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || ||  |||||||    
78492 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgtaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaag-aataagcatcc 78394  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||    
78393 aatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagcttta 78294  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |  | ||||||| ||||||||||||||||    
78293 agctgcatctcatgatgaactacagcttctggtgattctcagattctgatgaacttgcttctgatga 78227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1138 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 78250 - 78203
Alignment:
1138 ttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
78250 ttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttg 78203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2510 - 2433
Alignment:
270 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||| | |||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||  ||| |||||||||||||| |||| |||||||    
2510 acacaagaaattatacaggttccttccacaatccggaagtagacctatcctccttgcacttccaatgagagttcacta 2433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 78680 - 78639
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
78680 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaagagactttga 78639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 150; Significance: 1e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 694 - 1161
Target Start/End: Complemental strand, 7054 - 6586
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||   |||||| |  ||   |||||||||||||    |||||| |  ||||| |  ||    
7054 agtcttcactcctttatatataggtgtgagagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaagctttttgattaatcaccaatgatc 6956  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| | |||||||   ||||| ||||  | |||| ||| ||||| || |||||| |||    
6955 ctttgcctgatatggttatcgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccattgcgaaggaacatcgt-tgcatgcagagctgtttttcttgtgttg 6857  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||||| ||||    
6856 tagcagagacaaaaatagagtactggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgc-tctttgaagaacaagcatccaatgccttca 6758  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||     
6757 aatcttttcaaaatagtcggtgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatct 6658  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
6657 cctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaactagcttttgatga 6586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 6866 - 6547
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    |||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||||    
6866 tcttgtgttgtagcagagacaaaaatagagtactggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttt-gaagaacaagcatcc 6768  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |||    
6767 aatgccttcaaatcttttcaaaatagtcggtgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttta 6668  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgctt---------------ctgatgacgt 1164  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||               ||||||||||    
6667 agttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaactagcttttgatgaacttgctcctgatgacgt 6568  T
1165 catcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||| |||| ||||    
6567 catcacttcaggagcattttg 6547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7473 - 7412
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
7473 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 7412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 149; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 450 - 934
Target Start/End: Original strand, 447 - 934
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtgg 548  Q
    |||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
447 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtgg 546  T
549 tgttctcaatacaatacaataaa-gactctagactttg-aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttga 645  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||| ||  ||||     
547 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaggaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttgg 646  T
646 cagagttttggcgcttttgaacttgt-at-atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca 742  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||   | |    
647 caaagttttggcgctttt-aacttgtgatgatgtctctg-cagatcttcaagtcttcactccttt-tatagaggtgtgtagagagacgttgagaccttta 743  T
743 g-cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 841  Q
      |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
744 aacacgtccaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 842  T
842 ccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    | ||||||  || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
843 ctatcttgtgggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcaaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 138 - 462
Target Start/End: Original strand, 152 - 489
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat----- 229  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||         
152 ttgaattgtgttttctttttctcctaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagattcata 251  T
230 -atgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgc 326  Q
     | |||||||||  | |||| || ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
252 tacgcagcggaataaaaacatagtagagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgc 349  T
327 acttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgca 420  Q
    |||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||     
350 acttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcg 446  T
421 agagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
447 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 147; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 138 - 364
Target Start/End: Original strand, 1627 - 1856
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
1627 ttgaattgtgttttcttttactctcaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcag-ct-tgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 1723  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
1724 cagcggaaaagaacagagaagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 1823  T
332 caaggagatttcactataatcacaaagattaca 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
1824 caaggagatttcactataatcacaaagattaca 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 147; Significance: 7e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 516 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 38458 - 38120
Alignment:
516 gtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagactttgaatt-tctaagatgtatcaaatcagtgca 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||||    
38458 gtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaaaaatgtctaagatatatcaaatcagtgca 38359  T
614 gaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttat 710  Q
    ||||||||  |||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||    
38358 gaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctg-ctgatcttcaagtcatcattcctttat 38261  T
711 atagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgt 809  Q
    ||| ||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
38260 ataaaggtgagtagagagacgttgagatctttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgt 38162  T
810 agtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 851  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
38161 agtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 38120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 38813 - 38487
Alignment:
138 ttgaattgtgttttc-ttttct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||   ||||||||||    || || || |||||||| |||| | |||||  ||||||     
38813 ttgaattgtgttttccttttctcaaaaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagattgattctgatgtaatgtttagaattggatatgt 38714  T
234 agcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    |||||||  | |||||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||    
38713 agcggaataaaaacagatcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccgtaagtagtccagttccccttgcacttc 38616  T
332 caaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 425  Q
    ||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||     
38615 caaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtataagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagaga 38519  T
426 cttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 457  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
38518 ctt-caatgctcaagcactaaagcaagagactt 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 146; Significance: 3e-76; HSPs: 7)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 897 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 764 - 548
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||    
764 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 666  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatg 1096  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||    
665 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccatcaaacagcttctgaagctttaagttgcatctcctgatg 566  T
1097 aactgcagcttctgatga 1114  Q
    ||||||| ||||||||||    
565 aactgcaccttctgatga 548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 897 - 1110
Target Start/End: Complemental strand, 1864 - 1662
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||| |||  ||||||||||||          ||    
1864 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatccaatgc---------att 1775  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatg 1096  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||    
1774 tcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaat-gttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatg 1676  T
1097 aactgcagcttctg 1110  Q
    ||||| ||||||||    
1675 aactgtagcttctg 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1144 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 1643 - 1602
Alignment:
1144 tgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1643 tgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 557 - 509
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
557 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 968 - 929
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
968 agtcttcactcctttatattgaggtgtgaaagagacgttg 929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 1148 - 1109
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
1148 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 1109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1383 - 1327
Alignment:
291 ccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
1383 ccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaagtagagttcacta 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 146; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 641 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 13158 - 12865
Alignment:
641 tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagat 737  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||    
13158 tttggcagagttttggcgctttt-agcttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgggat 13060  T
738 aatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattc 837  Q
      | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
13059 ttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggttgtagtcctttgaagtatcaacttcaaattc 12961  T
838 attcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||| |||||||||| |||| || | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12960 attcctatcttgaaggaacatttttt-catgcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 145; Significance: 1e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 863 - 1162
Target Start/End: Original strand, 3271 - 3570
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| |    
3271 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctct 3370  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  | |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
3371 tt-gaagaataaacatccaatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaa 3469  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3470 acagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactatagcttctggtgattttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 3569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1148 - 1185
Target Start/End: Original strand, 3571 - 3608
Alignment:
1148 cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
3571 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 3608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3143
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
3103 agtcttcacttctttaaatagaggtgtgaaagagacgttga 3143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 562
Target Start/End: Original strand, 2928 - 2963
Alignment:
527 acacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2928 acacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 2963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 145; Significance: 1e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 770 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 6423 - 6259
Alignment:
770 tttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggc 869  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
6423 tttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatctttaaggcacaaattttgcaggc 6324  T
870 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6323 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7228 - 7052
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa--ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||  | |||||||||||||| |||||||||||   |||||     
7228 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaa 7130  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||    
7129 tgcttctgatgaaatgatcagaatcacatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagc-aagacacaagca 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 6037 - 6004
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
6037 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 6004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 145; Significance: 1e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Original strand, 355 - 862
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||||| ||||    
355 aatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaacataattacacagaaaattgtttgactttgaac 454  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||    
455 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctaaacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtg 554  T
627 ctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa 723  Q
    ||||  |||| ||  |||  |||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |    
555 cttttgagaaacaaattttgcagagtttgggcgctttt-aacttgtagtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactttcttatatataggtgtgta 652  T
724 -agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaga 822  Q
     ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||||     
653 gagagacgttgagatcttaagcacgtttaaagagtcgtt-gagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgtagtcctatgaagg 751  T
823 attagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagt 922  Q
    || | ||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||||||||    
752 atcaacttcaaaatcattcctatcttgaaggaaca-attctacaggcagagctgctatcttgtcttgtagtgtagacacgctcagagttgtggaggtagt 850  T
923 ggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||    
851 ggttgtacactt 862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 431 - 934
Target Start/End: Original strand, 4735 - 5242
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||||| ||||    
4735 aatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaacataattacacagaaaattgtttgactttgaac 4834  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtg 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||    
4835 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctaaacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtg 4934  T
627 ctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa 723  Q
    ||||  |||| ||  |||  |||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |    
4935 cttttgagaaacaaattttgcagagtttgggcgctttt-aacttgtagtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactttcttatatataggtgtgta 5032  T
724 -agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaga 822  Q
     ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||||     
5033 gagagacgttgagatcttaagcacgtttaaagagtcgtt-gagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgtagtcctatgaagg 5131  T
823 attagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagt 922  Q
    || | ||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||||||||    
5132 atcaacttcaaaatcattcctatcttgaaggaaca-attctacaggcagagctgctatcttgtcttgtagtgtagacacgctcagagttgtggaggtagt 5230  T
923 ggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||    
5231 ggttgtacactt 5242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 460
Target Start/End: Original strand, 4436 - 4795
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||||    
4436 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcggaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgct 4535  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||  ||| |||||||| |||| ||||| |||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||      
4536 tctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcagaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcttggttccttccacaaac 4633  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||     ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||     
4634 cagaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcc 4732  T
397 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
4733 caaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttcta 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 460
Target Start/End: Original strand, 53 - 415
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||   ||||| |||||||||||||   ||||||||||    || ||||    
53 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctttaaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagt 152  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||| |||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
153 gcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcagaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcttggttccttccaca 250  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact 393  Q
    |  | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||     ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||    
251 aaccagaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatacta-cctagtatgagact 349  T
394 tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    || ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
350 tcccaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttcta 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 144; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 159 - 356
Target Start/End: Original strand, 4169 - 4364
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
4169 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 4265  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4266 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 4364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 144; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 159 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 155893 - 155682
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||| ||||||| || ||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
155893 aaaaatacttcttttgataaaactccagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 155797  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
155796 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 155697  T
358 gattacaaatgctca 372  Q
    |||||||| ||||||    
155696 gattacaactgctca 155682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 143; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 780 - 934
Target Start/End: Original strand, 1 - 155
Alignment:
780 caccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg 879  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
1 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaatttattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttg 100  T
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
101 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 378 - 411
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
378 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 142; Significance: 6e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 107 - 355
Target Start/End: Original strand, 1271 - 1524
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||   || || |    
1271 atgagggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctataaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaat 1370  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
1371 gcttatgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 1469  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 355  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1470 aacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 901 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 7261 - 6978
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||| |||  |||||||||||| ||| ||| ||| |||    
7261 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacg-ttgtttgaagaataagcatccaatgctttccaatccttccaa 7163  T
1001 aatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaact 1100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
7162 aatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgggtttgaatccttcaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaact 7063  T
1101 gcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
     ||||||||| |||||    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
7062 acagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgataacattgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 6978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 7471 - 7431
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7471 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 7431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 7650 - 7611
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
7650 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 7611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Original strand, 2709 - 2759
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
2709 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 2759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 587 - 934
Target Start/End: Original strand, 58170 - 58517
Alignment:
587 atttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atgtctctat 683  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |    
58170 atttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgtttatgtctct-t 58267  T
684 cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccac 782  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
58268 atgatcttcaagtcttcgctcctttatatagaggtgagtagagatacgttgagatctttagcacgactaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccac 58366  T
783 cagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtct 882  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||    
58367 cagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatct 58465  T
883 tgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||| ||||| |   || || |||||||||||||||||||||||    
58466 tgtcttgtagcgaggacacacttagggtcgtggaggtagtggttgtacactt 58517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 462
Target Start/End: Original strand, 57776 - 58107
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||    |||| |||| |  || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
57776 ttgaattgtgttttctttttctcctaaaattcttcttctgatatcaattcaaaagctagttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 57875  T
235 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 332  Q
    ||||||  | |||| || |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
57876 gcggaataaaaacaaagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccataaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 57973  T
333 aaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 426  Q
    |||||||||| ||||     ||||||||| |||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||   | || |||| |    
57974 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattataactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcatgtaggcgagagac 58070  T
427 ttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
58071 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 58107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 450 - 547
Target Start/End: Original strand, 58065 - 58162
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtg 547  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
58065 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtg 58162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1193
Target Start/End: Original strand, 58702 - 58764
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
58702 cttgcttttgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgtaacttcag 58764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 140; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 163 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 61327 - 61136
Alignment:
163 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
61327 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 61231  T
262 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
61230 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 61136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 140; Significance: 1e-72; HSPs: 7)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 693 - 1186
Target Start/End: Original strand, 212154 - 212644
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
212154 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 212251  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | ||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| ||||    |||||||| ||||||| | ||||||||    
212252 ctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacat----tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 212347  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||  | |||| |||||||||||| |||    
212348 gtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tcttcaaagaacaagcatccaatgctttc 212446  T
989 aaattc-tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgc 1085  Q
    |||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||  |||     
212447 aaatccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttgg 212546  T
1086 atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||| | ||||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
212547 atctcctgatgaagtttagcttctgatgatctt--gcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttg 212643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 431 - 931
Target Start/End: Original strand, 60751 - 61257
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||    
60751 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 60850  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgt 625  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  ||    
60851 acttgatatactatcagtggtgttcacaaaacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatttatcaaatgaacacagaaattcaaagt 60950  T
626 gctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 721  Q
    |||||||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
60951 gctttgtatgaaacaaatttggcagagtttaggcgctttttaacttgtcgtattgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtg 61049  T
722 aaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaa 820  Q
    | ||||||||||||||   | |||||||| ||||||||| |||| |  | |||||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||    
61050 agagagacgttgagatctttaagcacgtc-aaagagtcg-ttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaa 61147  T
821 gaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggta 920  Q
    | || |  ||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||    
61148 ggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggta 61246  T
921 gtggttgtaca 931  Q
    |||||||||||    
61247 gtggttgtaca 61257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 201 - 462
Target Start/End: Original strand, 60545 - 60813
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga---aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 297  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||||||||||    
60545 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttcca 60642  T
298 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgag 390  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||    
60643 caaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 60742  T
391 acttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
60743 acttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 60813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 968 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 6237 - 6025
Alignment:
968 gaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagct 1067  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||| || | |     
6237 gaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatctattgaacatcc 6138  T
1068 tttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtc 1165  Q
    |||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | || ||||||  ||| ||  ||||||||      ||||||| |||||| ||||||||||||| |     
6137 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctga------tgcttcttatgaacctgcttctgatgacttt 6044  T
1166 atcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||| ||||||||    
6043 atcacttcaggagcacttt 6025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 246133 - 246084
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
246133 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 246084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1039 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 246215 - 246108
Alignment:
1039 ttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgct 1138  Q
    |||| |||| |||||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||    ||||||||| ||||||||    
246215 ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgct 246116  T
1139 tctgatga 1146  Q
    ||||||||    
246115 tctgatga 246108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 211736 - 211796
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
211736 gttccttccacaaaccggaagtcattcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 211796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 140; Significance: 1e-72; HSPs: 17)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 694 - 1185
Target Start/End: Original strand, 211198 - 211685
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
211198 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 211295  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
     ||| |||||| ||| | | |||||   ||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
211296 attttcctgatatggttattgtcctaataaggataaatttcaaatgcattcccat--tgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 211392  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  |||||| ||||| || |    
211393 tagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatcaaatgcattaa 211491  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||     
211492 aatccttacaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaagctgcatct 211591  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    | |||||| || ||||||||||| |  ||  ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
211592 cctgatgagctacagcttctgataaactt--gcttctgatgaacttgcgtctgaggaccttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactttg 211685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 881 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 377684 - 377383
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||||| || | ||  | |||| ||||||||    
377684 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgc-tcttcaaagaacaagcatcca 377586  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||  ||||    
377585 atgccttcaaatcctttcaatatagtcgttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaa 377486  T
1081 g--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
    |  ||||||| | |||||||||  | |||||| |||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
377485 gtcttgcatctcctgatgaactataacttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggag 377387  T
1179 cact 1182  Q
    ||||    
377386 cact 377383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 863 - 1183
Target Start/End: Original strand, 220205 - 220525
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||   | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| |    
220205 tgcaggcatagctgttatccttgtcttttagcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 220304  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   |  ||| |||||||||||| ||||||||| ||  || ||| |||||||||||| | |  || |||||||||  ||||||||| || || ||| | |    
220305 tcaaat-aacaagcatccaatgc-ttcaaattcatttgaattagccgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatga 220402  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgc--atcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    | ||| |||||||| ||||||  |  ||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||    
220403 acagcctttgaagctttaagtctctcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggt-gcttctgatgaacttgcttctgat 220501  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
220502 gacgtcattacttcaggagcactt 220525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Original strand, 87788 - 87855
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
87788 tggttccttccacaatccggaagtagttcactcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 87855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 902 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 244388 - 244256
Alignment:
902 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaa 1001  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||| | ||  | |||| |||||||||||  ||||||| ||||  ||    
244388 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgc-tcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaa 244290  T
1002 atagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaa 1035  Q
     |||| ||||||||||| |||  || ||||||||    
244289 ttagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaa 244256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 244870 - 244734
Alignment:
427 ttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-tt 524  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| |  |||| |||| || ||||||  ||    
244870 ttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagagttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggtt 244771  T
525 gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
244770 gaa-acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 244734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 220035 - 220075
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
220035 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 220075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 211018 - 211057
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
211018 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 211057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 219597 - 219679
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
219597 aaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaaatcggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 219679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 245034 - 244952
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
245034 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcgtgtcccccttgcactttcaaggagggttcacta 244952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 526 - 562
Target Start/End: Original strand, 88027 - 88063
Alignment:
526 aacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
88027 aacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 88063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 244595 - 244555
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
244595 aagtcttcacttctttatatagaggtttgaaagagacgttg 244555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 219858 - 219897
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
219858 ttgaacacttgatatacaatcagcggtgttcacaatacaa 219897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 378038 - 377999
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
378038 ttgaacacttgacatacaatcagtggtgttcacaatacaa 377999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 378277 - 378218
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||    
378277 gttccttccacaaactggaagtagtcatgccccccttgcacttccaaggagagttcacta 378218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1141 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 244118 - 244076
Alignment:
1141 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
244118 tgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcatgagcactt 244076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 354
Target Start/End: Original strand, 382181 - 382245
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 354  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
382181 gttccttccacaacacaggagtagtccact-ccccttgcagttctaa-gagatttcactataatcac 382245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 137; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 694 - 1108
Target Start/End: Complemental strand, 2012 - 1598
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||  |||   || |||||||||  | |||||||   ||||| |  ||    
2012 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-atttccaacacgttcaaaatagaatcgtttgaag-cttttgatctatcaccaatgatc 1915  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||||||||||| | |||||||||    
1914 ttttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtcttg 1816  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| || |||| | |||||| ||| ||||    
1815 tagcagagacaaaaacagagcagtgaaggtagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctcttt-gaagaacaatcatccagtgccttca 1717  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||     
1716 aatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcaagtcttctgcaatatttaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgagttgcatct 1617  T
1090 catgatgaactgcagcttc 1108  Q
    | |||||||||||||||||    
1616 cctgatgaactgcagcttc 1598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 497 - 448
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
497 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttaaggagcactttg 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 137; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 268 - 1162
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 1521
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 362  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  |||||    
2424 agacacaaacaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacactgatta 2325  T
363 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
2324 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcatgcatgcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaggcttcta 2227  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
     |||||||||||  | |||||||||||||  ||||| | |  |||| | ||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
2226 -tgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaatagaattacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 2128  T
560 caatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagt 651  Q
    |||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   || |||||||  || ||||   ||  ||  | |||| ||||||    
2127 caatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacaaaaattcaaagtacttttgtgtgaaacaaatttggcagagt 2028  T
652 tttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtc 749  Q
    || ||||||||| |||||||     | | | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | |||||||    
2027 ttgggcgctttttaacttgttgtcttgtatctcttcatcttcaaatcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttgagatctttaagcacgtc 1928  T
750 taaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 849  Q
     | |||||||||   || |||| |||||   | || |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||||    
1927 aatagagtcgttgagaaacctt-gatcaaatatcaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttg 1829  T
850 aaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtact 948  Q
    |||| |||| || |  ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||    
1828 aaggaacattttttt-aggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtaaactt--------cgtact 1738  T
949 ttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgc-gttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttc--cagtattctgcaatctttagacg 1045  Q
    |||||||| | ||||||| | || |||| |||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||  ||||||||  |||| ||  ||  ||||| ||||    
1737 ttgtcaactc-tttttgaaggacaagcacccaatgcttttcaaatcccttcaaattagtcgttgc--cacttttcttcagtctttcgctttctttggacg 1641  T
1046 aggttgaatccattaaatagct-tttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaac-ttgcttctga 1143  Q
    ||| |||||||| |||| |||| |||||| | ||| ||||||||   |||||||||  |||||||| ||||     ||||||||| ||| ||||||||||    
1640 aggctgaatccaataaacagctatttgaaactttaggttgcatcttctgatgaactatagcttctggtgatacacagcttctgatgaactttgcttctga 1541  T
1144 tgaac-ttgcttctgatgac 1162  Q
    ||||| ||||||||||||||    
1540 tgaactttgcttctgatgac 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 363 - 1
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||  |||||||| |    |  || |||    
363 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggaggttgaattgtgttttctttttctttaaaaaattcttcttctgataacacttcagaaactggttaggattgc 264  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||     
263 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagtggaataaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttctttccacaaa 166  T
302 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
165 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaa 66  T
400 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgct 465  Q
    |  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
65 a--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttctaatgct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 134; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 266 - 934
Target Start/End: Original strand, 4474 - 5156
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaa-ga 359  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||  ||    
4474 aaagacagaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacaactga 4573  T
360 ttacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagactt 457  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
4574 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca--aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcattaaagcaagagactt 4671  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    |  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
4672 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattatttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 4771  T
557 atacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacag 648  Q
    ||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||| | |||||||| |   ||||||||||  |||||||   ||  ||  | | ||  ||    
4772 atacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagctatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgcttttgtgtgaaacaaatctggtag 4871  T
649 agttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacg 747  Q
    ||||| |||| |||| |||||||     | ||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||   ||||||||    
4872 agtttgggcgttttt-aacttgttgtcttgtcacaccgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgggagagtcgttgagatctttcagcacg 4970  T
748 tctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatc 846  Q
    || | ||||||||| |||||  | |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |  ||||||| |||||| |||    
4971 tcaatagagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcaccaatggtcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcatgttcaaatccattcctatc 5068  T
847 ttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||    
5069 ttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacacgcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 5156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 880 - 1175
Target Start/End: Original strand, 22661 - 22957
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||| || ||| || |||  |||||||    
22661 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactcttt-gaagaataagcatcc 22759  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||||| |||    
22760 aatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta 22859  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcag 1175  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| |||| |||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
22860 agtcttgcatctcctgatgaactacagcctctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctggtggacttgattctgatgacgtcatcacttcag 22957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 730
Target Start/End: Original strand, 22473 - 22509
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 730  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22473 agtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacg 22509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 129; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4700 - 4437
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || || |    
4700 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaat 4601  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
4600 gcttctgatgaaattatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaagcaa-gacacaaacagttatcatggttccttccacaa 4502  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 365  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4501 atcggaaatagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 4437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 863 - 1145
Target Start/End: Original strand, 9122 - 9403
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |     
9122 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacacagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tc 9220  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||| |||  |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| || ||| |||||||| ||||    
9221 tttgaagaataagcatccaatgccttctaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctgcaatcttt-gatgagtttgaatccgttaa 9319  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatg 1145  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
9320 acagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatg 9403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 8953 - 8993
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8953 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 522 - 562
Target Start/End: Original strand, 8773 - 8813
Alignment:
522 cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
8773 cttgaacacttgatatataatcagtggtgttcacaatacaa 8813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 266 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 21127 - 20449
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-ga 359  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||  ||    
21127 aaagacacatacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagtgtttcactaagtttaatcacaactga 21028  T
360 ttacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagactt 457  Q
    |||||| | ||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
21027 ttacaactactcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 20931  T
458 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctca 556  Q
    |  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| | ||    |||||| || |||||  | |||||||||||||||||||| ||    
20930 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacaaaaaattgtttgagtttgaacaaataatatacaatcagtggtgttcaca 20831  T
557 atacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacag 648  Q
    ||||||| |||   |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||| | |||||||   ||  ||  |  ||  |||    
20830 atacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctgagtgcttttatgtgaaacaaaattagcag 20731  T
649 agttttggcgcttttgaacttgtatatgtctc-tatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcac 746  Q
    ||||| |||||| || | |||||   |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||    
20730 agtttgggcgctcttta-cttgt---tgtctcgtatttgatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagtcgttgagatctttaagcac 20635  T
747 gtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 845  Q
    |||   ||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||    
20634 gtcagtagagtcgttgtgaaa--cattgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctat 20537  T
846 cttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20536 cttgaagg-acat-ttctacaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 20279 - 20229
Alignment:
1136 gcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
20279 gcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactttg 20229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 125; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 52606 - 52370
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||| | |||||||| |||||| |||||||||||   | |||||    
52606 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctcttaaataatcttcttcagataaatcttcagaagcagtttatgagt 52508  T
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52507 gcttctgatgaattgatcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 52408  T
301 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52407 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 52370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 124; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 201 - 608
Target Start/End: Original strand, 32282 - 32700
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga---aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 297  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||  ||||||||||||    
32282 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttcca 32379  T
298 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgag 390  Q
    |||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |  |||||| ||||||||||||  |  | ||||||    
32380 caaaccggaagtagttcagtccccctggcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaatttacaactgctcaatactacacctagtatgag 32479  T
391 acttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 489  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||    
32480 acttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 32577  T
490 gatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa--taaagactctagactt-tg 585  Q
     |||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||  |    
32578 aatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctagacttaag 32677  T
586 aatttctaagatgtatcaaatca 608  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
32678 aatttctaagatatatcaaatca 32700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 880 - 934
Target Start/End: Original strand, 9281 - 9335
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9281 tcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 9335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 120; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 1879 - 1197
Alignment:
269 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 362  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
1879 gacacatgcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 1780  T
363 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | || |||||||||   || ||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||      
1779 caactgctcaatactacacctagtacgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 1683  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
1682 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacagtcagtggtgttcagaata 1583  T
560 caatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagt 651  Q
    |||| ||||  |||||||||  ||||||  |||||||||||||  ||||||| |    ||||||||   |||||||   ||  ||  | |||  ||||||    
1582 caatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatacatcaaatgaacatagaaattcttagtgcttttgtgtgaaacaaattttgcagagt 1483  T
652 tttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctta----tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcac 746  Q
    || ||||||||| |||||||   ||||||  |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||    
1482 ttgggcgctttt-aacttgt---tgtctcgttcttactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcac 1387  T
747 gtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 845  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||    
1386 gtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctat 1289  T
846 cttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
      |||||| |||| ||||||||||| | ||||| | |||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
1288 tatgaaggaacat-ttctgcaggcagaactgtttttcttgtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 1197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 120; Significance: 8e-61; HSPs: 7)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 90369 - 89916
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    | | ||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
90369 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgctaccacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 90272  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    |  || |||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||  ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
90271 ctatttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagaaacatcat-tgcaggcaaagctgtttttcttgtctt 90173  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||    
90172 gtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctcttt-gaagaacaagcatccaatgccttc 90074  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatc 1088  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| || ||| |||| |  | | |||||||| ||||||||||||    
90073 aaatcctttcaaaatagccgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaagttgcatc 89974  T
1089 ccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
89973 tcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 89916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 95 - 161
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
95 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 89941 - 89892
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
89941 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 89892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 553
Target Start/End: Original strand, 329 - 359
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
329 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 732
Target Start/End: Original strand, 495 - 537
Alignment:
690 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
495 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtatgtgagagacgtt 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 1235 - 1281
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||    
1235 atcttcaagtcttcattcctttatatagaggaattaaagagacgttg 1281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 90763 - 90725
Alignment:
310 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
90763 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 90725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 117; Significance: 5e-59; HSPs: 8)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 880 - 1162
Target Start/End: Complemental strand, 99331 - 99053
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||   || |||  |||||||    
99331 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcagcgcttt---gaagaataagcatcc 99235  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||    
99234 aatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccggtcatctgcaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttta 99136  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 1162  Q
    |||||||   | ||||||||| || |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
99135 agttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttacttttgatgac 99053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 897 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 19581 - 19297
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||| ||   || ||| |||||||||||| || |||| |||    
19581 gacacaaactgagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgcttttaaatcctt 19483  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatga 1094  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||| |||  || |||||||| || | |||||||||| |||||  ||||||| | | |    
19482 tcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcctca 19383  T
1095 tgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||| || |||||| |||| ||  |||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
19382 tgaactacaacttctggtgatctt--gcttcttat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgttatcacttcaggagcactt 19297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 29585 - 29631
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
29585 atcttcaagtcttcacacctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 29631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20201 - 20141
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
20201 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 20141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 99823 - 99660
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaa 499  Q
    ||||||||||||   ||||||| |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||  |||||||     
99823 tgctcaagcacaacggcaagagacttctattgctcaagcacaattgcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaatagacttctgaattcaaacag 99724  T
500 agatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |  |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
99723 aattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 99660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19960 - 19921
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19960 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 19921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 29413 - 29452
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
29413 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 29452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 99518 - 99478
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
99518 agtcttcactcctttatatatacgtgtgaaagagacgttga 99478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 1686 - 1004
Alignment:
269 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 362  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
1686 gacacatgcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 1587  T
363 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | || |||||||||   || ||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||      
1586 caactgctcaatactacacctagtacgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 1490  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||  | | |||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
1489 atgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacagtcagtggtgttcagaata 1390  T
560 caatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagt 651  Q
    |||| ||||  |||||||||  ||||||  |||||||||||||  ||||||| |    ||||||||   |||||||   ||  ||  | |||  ||||||    
1389 caatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatacatcaaatgaacatagaaattcttagtgcttttgtgtgaaacaaattttgcagagt 1290  T
652 tttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctta----tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcac 746  Q
    || ||||||||| |||||||   ||||||  |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||    
1289 ttgggcgctttt-aacttgt---tgtctcgttcttactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcac 1194  T
747 gtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 845  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||    
1193 gtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctat 1096  T
846 cttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
      |||||| |||| ||||||||||| | ||||| | |||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
1095 tatgaaggaacat-ttctgcaggcagaactgtttttcttgtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 1004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 8)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 863 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 25809 - 25496
Alignment:
863 tgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
25809 tgcaggcagagctgcttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttt 25710  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  |||||||||||| ||         ||||||||   |||||   ||||||||||| || |||||| | ||| |||| |||||||| | ||    
25709 tt-gaagaataagcatccaatgcatt---------tcaaaatatctgttgccatacttttccagtcttttgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaa 25620  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    | | |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
25619 acaacttttgaaactttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttctgatgaagttgcttctgatgaacttgcttctgatga 25520  T
1162 cgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
25519 cgtcatcacttcaggagcactttg 25496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 35117 - 34674
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |  ||   ||||||||||| || | ||||||||  ||||| |  ||    
35117 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaaat-ctcatcacattcaaaatagagtcgtttg-aagcttttgatcagtcaccattgatc 35020  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagct-gttgtcttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||| | ||| || |  ||||||| | ||||||   ||||   |||| |  |||||||| ||||  || ||||||||||    
35019 ctttgcctgatatggttattgtcctataaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacat-tgttgcaggcaaagctatttttcttgtcttg 34921  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||| |||  ||||||||||||         
34920 tagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatccaatgc----- 34827  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
         |||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||| | ||| |||| |||||||| | ||| | |||||||| | ||||||||||||     
34826 ----atttcaaaatattcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaaactttaagttgcatct 34731  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | ||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||| ||||||||||||||||    
34730 cctgaagaactgcagcttctagtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgatga 34674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 880 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 34930 - 34650
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| || |||  |||||||    
34930 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatcc 34832  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||         |||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||| | ||| |||| |||||||| | ||| | |||||||| | |||    
34831 aatgcatt---------tcaaaatattcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaaacttta 34741  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagc 1179  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||              | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
34740 agttgcatctcctgaagaactgcagcttctagtgat--------------acaca-gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagc 34656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1174
Target Start/End: Complemental strand, 36058 - 36019
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36058 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 36019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 699 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 25973 - 25938
Alignment:
699 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25973 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 25938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 36501 - 36455
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
36501 atcttcaagtcttcacttgtttatatagaggtgtgagagagacgttg 36455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35499 - 35415
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
35499 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 35415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 35297 - 35258
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
35297 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacagtacaa 35258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 115; Significance: 8e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 694 - 1146
Target Start/End: Original strand, 60601 - 61053
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaagag--tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || ||| ||  |||||||||   ||||||| |  || || |  ||    
60601 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagattcgtttgaag--ctttgattaatcatcaatgatc 60698  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
    ||||||||||| ||| | |  ||||  |||| || |  |||||||  ||||||||   ||||| ||||  | |||||||| ||||||| | | |||||||    
60699 ctttgcctgatatggttattttcctaagaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcatgtcttg 60797  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||| ||||| |||||| |||     
60798 tagaagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaacaagcattcaatgccttcc 60896  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcc 1089  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||     
60897 aatccttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagttttaagttgcatct 60996  T
1090 catgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | ||||||||| || |||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
60997 cctgatgaactacaacttctggtgattctcaacttctgataaacttgcttctgatga 61053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1146 - 1185
Target Start/End: Original strand, 61038 - 61077
Alignment:
1146 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
61038 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 61077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 113; Significance: 1e-56; HSPs: 7)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 863 - 1162
Target Start/End: Complemental strand, 22275 - 21976
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||      
22275 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctca 22176  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    || || |||  |||||||||||| ||| ||| |||  || ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
22175 tt-gaagaataagcatccaatgccttccaatccttcaaagatagtcgttgctatacttctccagtcttctgcaatctttagacgagttttaatcctttaa 22077  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    | | |||||||| | ||||||||||||   | ||||||| || |||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22076 acaacttttgaacctttaagttgcatcttctaatgaactacaacttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 21977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Original strand, 9545 - 9809
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| | ||||  |||  |||||||    
9545 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgc-tgtttgtagaataagcatcc 9643  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    |||||  |  ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||||| | ||| | |||||||||| |||    
9644 aatgcccttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatactttcccagtcttctgcaatc-ttagacaagtttgaatccttgaaacaacttttgaagcttta 9742  T
1080 agttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    |||| |||| ||||||||||||||||    
9743 agttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttatgatgaacttgcttctgatga 9809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 693 - 1146
Target Start/End: Original strand, 18828 - 19283
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||    ||||||||  ||||| |  |    
18828 aagtcttcactcctttatatataggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaaga--tttgatcaatcaccaatgat 18925  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | ||||||||||  || | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||   ||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||| ||||    
18926 cttttgcctgatacggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgcgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttttctt 19024  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||  ||||||| ||| || |||| |||||| ||||| ||     
19025 gtagcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctcttt-gaagaacaagcatcaaatgccttt 19123  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||  || |||||| || |||||||| || ||| ||| |||| |||||  ||| |    
19124 aaatccttccaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgta 19223  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    || | ||||||| |  |||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
19224 tcacctgatgaaatagagcttctggtgatcttcaacttctgataaacttgcttctgatga 19283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 22444 - 22404
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22444 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 22404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 18648 - 18687
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
18648 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 18687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22623 - 22584
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22623 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 18411 - 18473
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
18411 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactat 18473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 112; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 266 - 1100
Target Start/End: Complemental strand, 38839 - 37991
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 358  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
38839 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacatccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 38740  T
359 attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | ||||| ||||||   || | |||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
38739 attacaactgctcaatactacacctagtatgacacttca---aatttctcaggcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 38643  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    |   ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |    
38642 ttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaattagtggtgttcac 38543  T
556 aatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgaca 647  Q
     ||||||| |||   |||||||||  || |||  ||||||||||||| |||||||  |   || ||||||   |||||||   |||  |  | |||  ||    
38542 tatacaatgcaaatgaaagactctctagccttaagaatttctaagatatatcaaaggaacacataaattctaagtgcttttatgtaacacaattttagca 38443  T
648 gagttttggcgcttttgaacttgtatat-gtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gca 745  Q
    |||||| ||||||||| || |||||| | ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||    
38442 gagtttgggcgcttttaaa-ttgtatcttgtctctcattgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagca 38344  T
746 cgtctaaagagtcgttt-gaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 844  Q
    |||| | |||||| ||| ||||||  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |    
38343 cgtcaatagagtctttttgaaatc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattccta 38246  T
845 tcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaac 943  Q
    | |||| || |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
38245 ttttgatggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacggac 38148  T
944 gtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttc--cagtattctgcaatcttta 1041  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||| ||  ||  ||||||    
38147 gtactttgtcaacgc-tctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcattgc--caattttcttcagtctttcgctttcttta 38051  T
1042 gacgaggttgaatccattaaatagct-tttgaagccttaagttgcatcccatgatgaact 1100  Q
    |||||  |||||||| |||||||||| ||| || | ||| |||||||| | |||||||||    
38050 gacgaatttgaatcctttaaatagctatttaaaactttaggttgcatctcctgatgaact 37991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 111; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 331
Target Start/End: Original strand, 21200 - 21430
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaatt-cttcttctgataaac-cttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||   |||||     
21200 tgaaggtgtgaaaaacacaagaacggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaaacttcagaagcagtttgtgaa 21299  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
21300 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccaca 21398  T
300 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 331  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||    
21399 aatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 829 - 1139
Target Start/End: Original strand, 7639 - 7948
Alignment:
829 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 927  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||  | |||||||||||||||||||||    
7639 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaa--ctgagtagtggaggtagtggttg 7735  T
928 tacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagta 1027  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||| |||  | ||| |||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||     
7736 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaaaatagtcgtggcttcactcttccagtc 7834  T
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttc 1125  Q
    || ||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||    
7835 ttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgatcttcagcttc 7934  T
1126 tgataaacttgctt 1139  Q
    |||| |||||||||    
7935 tgatgaacttgctt 7948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 525 - 562
Target Start/End: Original strand, 7443 - 7480
Alignment:
525 gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
7443 gaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 7480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 110; Significance: 8e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 880 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 36901 - 36599
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| || |||  || ||| |||||||    
36901 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaag-aacaagcatcc 36803  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||| || ||| |||| |  ||| |||||||| |||    
36802 aatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagcttta 36703  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36702 agtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgat-gagatgcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagga 36604  T
1178 gcact 1182  Q
    |||||    
36603 gcact 36599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 880 - 1182
Target Start/End: Original strand, 42104 - 42406
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| || |||  || ||| |||||||    
42104 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaag-aacaagcatcc 42202  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||| || ||| |||| |  ||| |||||||| |||    
42203 aatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagcttta 42302  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
42303 agtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgat-gagatgcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagga 42401  T
1178 gcact 1182  Q
    |||||    
42402 gcact 42406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 37499 - 37412
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
37499 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgctcttccaaggagagtttactaaaatc 37412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 108; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 5674 - 5331
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||   ||||||||||    || || ||||    
5674 atgaaggtgagaaaaacacaaga-gggggggttgaattgtgttttctttttctcgaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttgggaatgct 5576  T
205 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
5575 tctgatgtgatgttcagaatcatatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 5478  T
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||     
5477 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctc-tagtatgagacttcc 5379  T
397 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 446  Q
    ||||  | ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
5378 caaa--ttctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 5331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 105; Significance: 8e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 881 - 1186
Target Start/End: Complemental strand, 18746 - 18441
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    ||||||||||| |   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||  | |||| || |||||    
18746 cttgtcttgtaccagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgc-tcttcaaagaacaagtatcca 18648  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||    
18647 atgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaa 18548  T
1081 --gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
       |||  || | ||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
18547 atcttgtgtctcctgatgaactgcagcttctggtgatcttcagcttatgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgag 18449  T
1179 cactttga 1186  Q
    ||||||||    
18448 cactttga 18441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19354 - 19292
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
19354 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcatccttgcacttccaaggagagttcactat 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 523 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 19115 - 19078
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatac 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
19115 ttgaacacttgatatacagtcagtggtgttcacaatac 19078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 102; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 880 - 1186
Target Start/End: Complemental strand, 5073 - 4767
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| | |  || ||| | |||||    
5073 tcttgtcttgtagcagggacaaaaacatggtaatggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaag-aacaaacatcc 4975  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| ||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||    
4974 aatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtcgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta 4875  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaa 1177  Q
    ||  |||||||   |||||||||  |||||||| |||| ||  |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
4874 agtcttgcatcttctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttatgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcagga 4776  T
1178 gcactttga 1186  Q
    |||||||||    
4775 gcactttga 4767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 102; Significance: 5e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 138 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10379 - 10201
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
10379 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 10283  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtc 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10282 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtc 10201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 9253 - 9220
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9253 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 5823 - 5776
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
5823 gcttctgatgaacttacttctgaagacgtcattactttagaagcactt 5776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 98; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 201 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1790 - 1525
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  ||| |||||| |  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
1790 tgcttctgatgtattgttcagaatctaatacgcagcgcagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccac 1693  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagac 392  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||    
1692 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagac 1594  T
393 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
1593 ttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 1525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 431 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1116
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaac 528  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||    
1587 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 1488  T
529 acttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgt 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||    
1487 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgagagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagt 1388  T
626 gctttgt-agaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaacttg-tata-tgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 721  Q
    |||||||  ||| | | |||| |||||||| ||| ||||| |||||| | || |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
1387 gctttgtgtgaaacaaatttggcagagtttaggcactttt-aacttgttgtactgtctct-gctgatcttcaagtcttcactcctttttatagaggtgtg 1290  T
722 -aaagagacgttgagat-aatcagcacgt-ctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttg 818  Q
     | ||||||||||||||   | ||||||| | ||||||||| |||| |  | |||||||   |||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||    
1289 tagagagacgttgagatctttaagcacgtccaaaagagtcg-ttgagaaaccttgatca-ataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatg 1192  T
819 aagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgt 895  Q
    ||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
1191 aaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcagacagagctgttatcttgtcttgtagcgt 1116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 96; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 17714 - 17929
Alignment:
107 atgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||  | ||||||| |||| || |||||||||||   |||||     
17714 atgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaattaatcttcttttgatcaatcttcagaagcagtttgtgat 17813  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 299  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17814 tgcttctgatgaattgttcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 17913  T
300 acacggaagtagtcca 315  Q
    ||||||||||||||||    
17914 acacggaagtagtcca 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 96; Significance: 2e-46; HSPs: 5)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 863 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 21115 - 20795
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||| |||| |     
21115 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgc-tc 21017  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| || |||| ||| |    
21016 tttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatgaccgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattga 20917  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    | | | |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| || ||| || |||| ||  |||||| ||  |  ||||||||||||||||| |||||||    
20916 acaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcaacttttggtgatcttcagcttctaat-gagatgcttctgatgaacttgtttctgat 20818  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
20817 gacgtcatcacttcaggagcact 20795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21544 - 21429
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
21544 caagagacttctaatgctcaagcccaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagt 21445  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
21444 ggtgttcacaatacaa 21429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 21285 - 21245
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21285 aagttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 21245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2544 - 2427
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaa-cacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  |||| |||||||||||||||||    
2544 caagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttttgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagtgaaacacttgatatacaatca 2445  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
2444 gtggtgttcacaatacaa 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 2287 - 2246
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
2287 aagtcttcacacctttatatagagatgtgaaagagacgttga 2246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 95; Significance: 7e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 880 - 1146
Target Start/End: Original strand, 9954 - 10219
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||| ||   || |   |||||||    
9954 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaag-agtaagcatcc 10052  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctta 1079  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||    
10053 aatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagcttta 10152  T
1080 ag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| || |||||  |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
10153 agtcttgcatctcctgatgaacttcaacttcttgtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 10219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Original strand, 10191 - 10241
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
10191 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 10241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 9766 - 9806
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9766 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 9806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 9343 - 9404
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
9343 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttacaaggagagttcacta 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 94; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 302
Target Start/End: Original strand, 17772 - 17913
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
17772 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 17868  T
258 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17869 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 17913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 93; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 558 - 808
Target Start/End: Original strand, 16349 - 16601
Alignment:
558 tacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttg 655  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||  |||| ||||||||||    
16349 tacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtactttttagaatcaaatttggcagagttttg 16448  T
656 gcgcttttgaacttgtat--atgtctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaa 752  Q
    | |||||| ||||||| |  || |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||| ||    
16449 gtgctttt-aacttgtgttgatatctctaccat-tcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcaaa 16546  T
753 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtg 808  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
16547 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttgggtg 16601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 92; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 881 - 1193
Target Start/End: Original strand, 12195 - 12507
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||  ||||||||    
12195 cttgtcttgtagcagagacacaatctgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aataagcatcca 12293  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| |||||||| ||||    
12294 atgctttcaaattctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaa 12393  T
1081 g--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
    |  |||  || | |||||||||  |||||||| ||||  |   ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
12394 gtcttgtgtctcctgatgaactagagcttctggtgatcctcaacttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcagctcaggag 12492  T
1179 cactttgaacttcag 1193  Q
    |||||| | ||||||    
12493 cacttttatcttcag 12507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 89; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 325
Target Start/End: Original strand, 7054 - 7274
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa--ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||  | |||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
7054 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggg--ttgaattgtgttttctttttctctaaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 7151  T
203 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 301  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
7152 cttttgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 7250  T
302 acggaagtagtccagtcccccttg 325  Q
     |||||||||||||||||||||||    
7251 tcggaagtagtccagtcccccttg 7274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 89; Significance: 3e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 687 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 18127 - 17878
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc--agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacc 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |   |||||||||| | ||||||| || | ||||||||||| ||||    
18127 atcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgtagagagacgttgagatcttttaagcacgtctataaagtcgtt-gagaacctttgatcattcacc 18029  T
784 agtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tct 882  Q
    | |  || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||    
18028 attgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttatct 17930  T
883 tgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17929 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 17878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 694 - 1038
Target Start/End: Complemental strand, 3043 - 2700
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagtc 790  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |  ||    
3043 agtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attctcagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 2946  T
791 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 889  Q
     |||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  |||||||  || |||||   ||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
2945 atttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgtatccccattgagaaggaacattat-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 2847  T
890 tagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttca 989  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||| |||   ||||||||||| |||     
2846 tagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacac-tctttgaagaatacgcatccaatgctttcc 2748  T
990 aattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatct 1038  Q
    ||  ||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
2747 aa-ccttccaaaatagtcgttgcaatacttttccagtcttctgcaatct 2700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 449 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 3298 - 3183
Alignment:
449 aagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    |||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||| |  |||||||||  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
3298 aagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacaaaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcag 3200  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| ||||||||    
3199 tggtgttcacaatacaa 3183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3421 - 3337
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
3421 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 3337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 87; Significance: 4e-41; HSPs: 10)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 863 - 1184
Target Start/End: Original strand, 59983 - 60303
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |    
59983 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctct 60082  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| || |||||||| |    
60083 tcaaag-aacaagcatccaatggcttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattga 60181  T
1062 atagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 1159  Q
    | | | |||||||| |||||  |||||||   |||||||||  |||||||| |||| ||  |||||| ||  |  ||||||| |||||||||| ||||||    
60182 acatcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttcttat-gagatgcttctaatgaacttgcatctgat 60278  T
1160 gacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||    
60279 gacgtcatcacatcaggagcacttt 60303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 693 - 1110
Target Start/End: Original strand, 7723 - 8142
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||| || || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
7723 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcaggacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 7820  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtctt-gtctt 888  Q
    | ||||| |||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |   || ||| ||||  |  ||||||| ||||||| |||| |||||    
7821 cttttgcatgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcctagtatgtaggaacattgta-gcaggcagagctgttatctttgtctt 7919  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
    |||||   |||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || ||| |||||||||||  |||    
7920 gtagcagagacacaaacttcgtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgaattc 8018  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || |||||| || |||||||| || | | |||||||| |||||  |||||    
8019 aaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgca 8118  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctg 1110  Q
    || | |||||||||  ||||||||    
8119 tctcctgatgaactttagcttctg 8142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 151761 - 151714
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
151761 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 151714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 59813 - 59853
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
59813 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 59853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1186
Target Start/End: Original strand, 115759 - 115810
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
115759 tgcttctgataaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactttga 115810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 59459 - 59519
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||    
59459 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtaccccttgcacttccaaggagagttcacta 59519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1148 - 1184
Target Start/End: Original strand, 8148 - 8184
Alignment:
1148 cttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
8148 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 8184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 446 - 562
Target Start/End: Original strand, 59556 - 59675
Alignment:
446 agcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaat 542  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||| ||||||||||||    
59556 agcaagagacttctaattctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacaattgatatacaat 59655  T
543 cagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||| ||||||||    
59656 cagtggtgttcacaatacaa 59675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 7544 - 7583
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
7544 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 7583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 7283 - 7364
Alignment:
266 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||  || |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
7283 aaagacacatagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtagtcctatcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 86; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 403 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 4511 - 3942
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |     
4511 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 4412  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaa-cacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactct--agacttt-gaatttctaag 595  Q
     |||| ||||    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||  ||||||  |||||||||||    
4411 ttacatagaaaattgtttgagtttaaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaag 4312  T
596 atgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt---gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttga----acttgtatatgtctct-atctta 687  Q
    || |||||||| |   |||||||||   |||||||   ||  ||  | |||  |||||||| || ||||||      ||||||   ||||||| || | |    
4311 atatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaattttgcagagtttgggtgcttttttttttacttgt---tgtctctcatttga 4215  T
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||| | | ||||||| ||||| |  |||||||  || ||     
4214 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaataaagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcagcaa 4117  T
786 tagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttg 884  Q
    |  |  |||||||||||||| ||| ||| | ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||| | ||||||| | ||||    
4116 tgatattttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaactt-ttctgcaggtagagctgtttttcttg 4018  T
885 tcttgtagcgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||    
4017 tcttgtagcgtagacgaaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgct 3942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 85; Significance: 6e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 863 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 17909 - 17636
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |    
17909 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctct 17810  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||  ||||   ||||||||||||         |||||||||||| |||||||  ||||||  ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||    
17809 ttgaaggata-agcatccaatgc---------ctttcaaaatagacgttgctatacttttgtagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatccttgaa 17721  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| || |||||||| |||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
17720 acagcttttgaagctttaagttgtatctcctgatgaattgaagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 17636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 17661 - 17612
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
17661 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcactttg 17612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 18078 - 18038
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
18078 agtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 18038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18258 - 18202
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaataca-ataaagactcta 578  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||    
18258 ttgaacacttgatatataatcagtggtgttcacaatacaaatcagataaagactcta 18202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 84; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 450 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 806
Alignment:
450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 549  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
997 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 898  T
550 gttctcaatacaatacaataa-agactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca 639  Q
     ||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
897 tttcacaatacaatgcaataatatactttagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatca 806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 304 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1117 - 955
Alignment:
304 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |    
1117 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttccc 1019  T
398 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 462  Q
    |||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
1018 aaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 84; Significance: 3e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 693 - 1115
Target Start/End: Original strand, 1457 - 1881
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaaga--gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |   |||||| || ||| |  ||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
1457 aagtcttcactcctttatatagatgtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataaagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 1554  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||   || || ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
1555 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 1653  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttc 988  Q
     ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| ||   || |   |||||||||||| |||    
1654 ctagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-agtaagcatccaatgctttc 1752  T
989 aaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgca 1086  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||| || | | |||||||| |||||  |||||    
1753 aaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 1852  T
1087 tcccatgatgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    || | ||||||||| ||||||||| ||||    
1853 tctcctgatgaacttcagcttctggtgat 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 1201 - 1317
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat-caaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
1201 caagagacttcaaatgctcaagcacgactgcaagagacttctaattcaaacagaattacatagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcag 1300  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| ||||||||    
1301 tggtgttcacaatacaa 1317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1180
Target Start/End: Original strand, 1870 - 1914
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagca 1180  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
1870 gcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagca 1914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 83; Significance: 1e-38; HSPs: 6)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 907 - 1174
Target Start/End: Original strand, 487 - 754
Alignment:
907 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagt 1006  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||   || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
487 gagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 585  T
1007 cgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcag 1104  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||| ||| || | | ||||| || |||||  ||||||| | |||||| ||  ||    
586 cgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttag 685  T
1105 cttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    |||||| |||| ||  |||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
686 cttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 429
Target Start/End: Original strand, 5760 - 5927
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 359  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
5760 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 5859  T
360 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 429  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
5860 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttc 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 272 - 312
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
272 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 606
Target Start/End: Original strand, 5901 - 6051
Alignment:
462 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatac 560  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
5901 tgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatac 6000  T
561 aatacaa--taaagactc--tagactt-tgaatttctaagatgtatcaaat 606  Q
    ||| |||   ||||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
6001 aatgcaaatgaaagactctatagacttaagaatttctaagatatatcaaat 6051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 721
Target Start/End: Original strand, 6124 - 6165
Alignment:
680 ctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 721  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
6124 ctatctgatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtg 6165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 95 - 134
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
95 ttgaacacttgatatacagtcagtggtgttcacaatacaa 134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 83; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 687 - 956
Target Start/End: Original strand, 7076 - 7346
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  || ||||  |||||    
7076 atcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttcatcaatcacca 7173  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 883  Q
     |  |  |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||| ||||||| | |||    
7174 atgatattttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaactt-ttctgcaggcagagctgtttttctt 7272  T
884 gtcttgtagcgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaac 956  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||    
7273 gtcttgtagcgtagacaaaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatatgtactttgtcaac 7346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 378
Target Start/End: Original strand, 16338 - 16442
Alignment:
280 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaa 373  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||    
16338 ttatactggttccttccacaaaccggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaa 16437  T
374 tacta 378  Q
    |||||    
16438 tacta 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 83; Significance: 1e-38; HSPs: 8)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 880 - 1118
Target Start/End: Complemental strand, 10234 - 9994
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||  |  ||| |||||||    
10234 tcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaa-aacaagcatcc 10136  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt-aaatagcttttgaagcctt 1078  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||   ||||| ||| || |||||||| ||  | |||||||||| ||    
10135 aatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagcttt 10036  T
1079 aag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttt 1118  Q
    |||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||    
10035 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatttt 9994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 880 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 14898 - 14819
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
14898 tcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 14819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 10421 - 10386
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
10421 aagtcttcactcctttatacagaggtgtgaaagaga 10386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10676 - 10561
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||| |||||| | |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||| || |    
10676 caagagacttctgatgctcaagcacaactacaagagacttctaatcaaagataattacaaagaaaaatgtttgagtttgaacacttgatatacaaccatt 10577  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
10576 ggtgttcacaatacaa 10561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 15085 - 15050
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
15085 aagtcttcactcctttatacagaggtgtgaaagaga 15050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15340 - 15225
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||| |||||| | |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||| || |    
15340 caagagacttctgatgctcaagcacaactacaagagacttctaatcaaagataattacaaagaaaaatgtttgagtttgaacacttgatatacaaccatt 15241  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
15240 ggtgttcacaatacaa 15225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10861 - 10791
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 335  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
10861 aaagacacaatgcaattatacaggttccttccacaaaccaaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaag 10791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15525 - 15455
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 335  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
15525 aaagacacaatgcaattatacaggttccttccacaaaccaaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaag 15455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 82; Significance: 4e-38; HSPs: 16)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 973 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 65462 - 65290
Alignment:
973 agcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttga 1072  Q
    ||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||    
65462 agcatccaatgccctttaatcctttcaaaatagtcgtttctatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatccttgaaatagcttttga 65364  T
1073 agccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
65363 agctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 65290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 973 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 144507 - 144335
Alignment:
973 agcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttga 1072  Q
    ||||||||||||  |  ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||    
144507 agcatccaatgccctttaatcctttcaaaacagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatccttgaaatagcttttga 144409  T
1073 agccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
144408 agctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 144335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 860 - 1109
Target Start/End: Complemental strand, 165093 - 164843
Alignment:
860 ttctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgc 958  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
165093 ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgc 164994  T
959 ttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccat 1058  Q
     | ||||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |  |  | |||| ||  ||  |||||||||||| ||||||||||    
164993 -tctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgctactatactacagtctttcgctttctttagacgagtttgaatccat 164895  T
1059 taaatagct-tttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttct 1109  Q
    |||| |||| |||||| | ||| ||||||||   ||||||||| ||| ||||    
164894 taaacagctatttgaaactttaggttgcatctactgatgaactacagtttct 164843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 266 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 165386 - 165146
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 358  Q
    ||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||  ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| |    
165386 aaagacacaggcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcactcctgtctcccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaaatg 165287  T
359 attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | | ||||||||    
165286 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggaaagagact 165190  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    ||  ||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||    
165189 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaa 165146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 687 - 732
Target Start/End: Original strand, 59349 - 59394
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
59349 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 59394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 65718 - 65678
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
65718 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 65678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 144763 - 144723
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
144763 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 144723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1169
Target Start/End: Complemental strand, 164816 - 164768
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
164816 gcttctgatagacttggttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 164768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 65976 - 65859
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
65976 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatca 65877  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
65876 gtggtgttcacaatacaa 65859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 145021 - 144904
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
145021 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatca 144922  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
144921 gtggtgttcacaatacaa 144904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1174
Target Start/End: Complemental strand, 65315 - 65277
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 1174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
65315 gcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttca 65277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 553
Target Start/End: Original strand, 59060 - 59208
Alignment:
406 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagata 504  Q
    ||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||| |  ||    
59060 tcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaatgcaagatacttcctatgctcaaccacaaaagcaagagacttctaatcaaacagaatta 59159  T
505 cagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    || ||||  | ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
59160 caaagaa-aatgtttgaggttgaacatttgacatacaatcagtggtgttc 59208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 351
Target Start/End: Original strand, 251037 - 251114
Alignment:
275 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataat 351  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
251037 agcaattattctggttccttccacaatctggaagtagtcaaatctcccttgcactttcaaggagattttcactataat 251114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 58944 - 59010
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
58944 ggtttcttccacaattcggaagtagtcatgtccctcttgcatttccaaggagagttcactaaaatca 59010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 66136 - 66074
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
66136 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttccacttccaaggagagttcactat 66074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 526 - 567
Target Start/End: Original strand, 251224 - 251265
Alignment:
526 aacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa 567  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
251224 aacatttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaaaacaa 251265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 81; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 863 - 1082
Target Start/End: Original strand, 14615 - 14834
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |    
14615 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctct 14714  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
14715 tcaaagta-caagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattga 14813  T
1062 atagcttttgaagccttaagt 1082  Q
    | | | |||||||| ||||||    
14814 acaacctttgaagctttaagt 14834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 14445 - 14485
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14445 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 14485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1123 - 1186
Target Start/End: Original strand, 14889 - 14952
Alignment:
1123 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
14889 ttctaatgaactagcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcgtcacttcatgagcactttga 14952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 81; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 882 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 87724 - 87433
Alignment:
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaa 981  Q
    ||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| || ||| | ||||||||    
87724 ttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacagacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaatttgcatccaa 87626  T
982 tgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag 1081  Q
    ||| ||         ||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||| | ||| | || | || ||| | ||| |||||||||| | |||||    
87625 tgcatt---------tcaaaatagtcgttgccatactttttcagtcttctgcaatttctaggcaagttagagtccttgaaacagcttttgaaactttaag 87535  T
1082 ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac 1181  Q
    ||  ||| | |||| |||| ||| |||||||||  ||  |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
87534 ttcaatctcctgataaactacagtttctgatgaactt--gcttttgatgaacttgcttatgatgaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac 87437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 88171 - 88054
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
88171 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgacgttgaacacttgatatacaatca 88072  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| | ||||||    
88071 gtggtgttcacgatacaa 88054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 87913 - 87873
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
87913 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaggcgttga 87873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 78; Significance: 1e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 897 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 26084 - 25798
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||  ||||| ||||||| || ||   || ||| |||||||||||| ||||||| |||    
26084 gacacaaactgagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttcaaatcctt 25986  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatga 1094  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| || |||||||| || | | ||||| || |||||  ||||||| | |||    
25985 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcctga 25886  T
1095 tgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||| ||  |||||||| |||| ||  |||||||||  |  || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
25885 tgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgtttttcatgaacgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 25798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 968 - 1059
Target Start/End: Complemental strand, 44743 - 44652
Alignment:
968 gaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt 1059  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| || ||||||||    
44743 gaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttccagtcttctacaatacttagacgagattaaatccatt 44652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Original strand, 53439 - 53500
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
53439 ttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaaacactttgaacttcag 53500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 26289 - 26249
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26289 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 26249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 77; Significance: 4e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 863 - 1082
Target Start/End: Original strand, 1657 - 1876
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |    
1657 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 1756  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    |   || | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||| |    
1757 tcaaagta-caagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattga 1855  T
1062 atagcttttgaagccttaagt 1082  Q
    | | | |||||||| ||||||    
1856 acaacctttgaagctttaagt 1876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 1487 - 1527
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1487 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 1527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1123 - 1186
Target Start/End: Original strand, 1931 - 1994
Alignment:
1123 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
1931 ttctaatgaactagcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttga 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 76; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 863 - 1185
Target Start/End: Original strand, 7348 - 7661
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |     
7348 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgc-tc 7446  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaa 1061  Q
    ||||| ||| |||||||||||||          ||||||| ||| ||||||  |||| || |||| ||||| ||| | ||| |||| | || ||| | ||    
7447 tttgatgaattagcatccaatgc---------atttcaaactagccgttgccacactctttcagtcttctgtaatttctaggcgagttagagtccttgaa 7537  T
1062 atagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    | | ||||||||  ||| |||| |||| | |||||||||  |||||||| ||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |    
7538 acaacttttgaaaacttgagttccatctcttgatgaactaaagcttctggtgatacatagcttctgatgaacttgcttctgatgaactaacttctgataa 7637  T
1162 cgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||| ||||| || ||||||||    
7638 cgtcattacttcggaggcactttg 7661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 76; Significance: 2e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 881 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 5815 - 5514
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||  | |||| ||||||||    
5815 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tcttaaaagaacaagcatcca 5717  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaa 1080  Q
    |||| |||| || ||||||||||||  |||||| |||| ||||| | |||| ||||  || |||||| || |||||||| || | | ||||||||  |||    
5716 atgccttcatatcctttcaaaatagatgttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaa 5617  T
1081 g--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaag 1178  Q
    |  ||||||| | ||||||||| ||||||| | |||| ||  |||||| |   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
5616 gtcttgcatctcctgatgaacttcagcttcaggtgatctt--gcttct-agtgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggag 5520  T
1179 cacttt 1184  Q
    ||||||    
5519 cacttt 5514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 6004 - 5964
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6004 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 5964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 6261 - 6144
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
6261 caagagacttttaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaagttgaacacttgatatacaatca 6162  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
6161 gtggtgttcacaatacaa 6144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6434 - 6359
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
6434 aagcaattatacaggttccttccacaaaatggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 6359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 75; Significance: 6e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 926 - 1116
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8151
Alignment:
926 tgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 1025  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||  |||||| |||||  |  ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
7963 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatcgaatgcaattcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccag 8061  T
1026 tattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatt 1116  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||    
8062 tcttctgcaatctt-agacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttacatcttctgatgaactgcagcttctggtgatt 8151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1028 - 1116
Target Start/End: Original strand, 1 - 88
Alignment:
1028 ttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatt 1116  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||    
1 ttctgcaatctt-agacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttacatcttctgatgaactgcagcttctggtgatt 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1140 - 1185
Target Start/End: Original strand, 97 - 142
Alignment:
1140 ctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
97 ctgatgtacgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1140 - 1185
Target Start/End: Original strand, 8160 - 8205
Alignment:
1140 ctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
8160 ctgatgtacgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 8205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 73; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 968 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 825 - 610
Alignment:
968 gaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagct 1067  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || ||| |||| || ||      
825 gaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcagtgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagtc 726  T
1068 tttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtc 1165  Q
    |||||||  |||||  ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
725 tttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtc 629  T
1166 atcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||||| ||||||||    
628 atcacttcaggagcacttt 610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 72; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13360 - 13208
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||     
13360 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctttctaaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgaa 13261  T
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcag 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
13260 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcag 13208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 880 - 1110
Target Start/End: Original strand, 103556 - 103788
Alignment:
880 tcttgtcttgtagc-gtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatc 978  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||    
103556 tcttgtcttgtagcagaagaaaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaagaacaagcatc 103654  T
979 caatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagcctt 1078  Q
    |||||| || | ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |  || ||| |||| || | | ||| |||| ||    
103655 caatgccttaatatcatttcaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagcttt 103754  T
1079 aag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctg 1110  Q
    |||  ||||||| | ||||||||| |||||||||    
103755 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 103788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 103369 - 103408
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
103369 aagtcttcactcctt-atatagaggtgtgaaagagacgttg 103408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 70; Significance: 6e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 488
Target Start/End: Original strand, 11091 - 11315
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatt-----tcactataatcacaaagatta 362  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||| | |||||||| ||||||    
11091 agacacaagcaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagattttcactcagtttaatcacacagatta 11190  T
363 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| |||||||||| |  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||      
11191 caactgctcaataccacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaatagacttcct 11287  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
     |||||||||||  | ||||||||||||    
11288 ttgctcaagcactaaagcaagagacttc 11315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 687 - 934
Target Start/End: Original strand, 11553 - 11799
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||    
11553 atctttaagtcttcactcctttgtatagaggtgtgaaagagttgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcacca 11650  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 883  Q
     |  || ||| ||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||| ||||||| | |||    
11651 atgatcttttacctgatttggtagttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggatca-attctgcaggcagagctgtttttctt 11749  T
884 gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
11750 atcttgtagcgtagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttttacactt 11799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 403 - 563
Target Start/End: Original strand, 11259 - 11421
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||  | |||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | |||| ||||||||  ||||||| |     
11259 tgctcaagcactaaagcaatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaatagacttctattcaaacagaa 11358  T
502 atacagagaattaagtttgactt-gaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
     |||| ||||    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
11359 ttacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatgcaatcagtggtgttcacaatacaat 11421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1141 - 1185
Target Start/End: Original strand, 11975 - 12019
Alignment:
1141 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
11975 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttg 12019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 68; Significance: 9e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 688 - 1001
Target Start/End: Complemental strand, 2117 - 1803
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccag 785  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||| || | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||     
2117 tctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacatcaatagagtcgttctgaaaac--ttgatcaatcaccaa 2020  T
786 tagtcctttgcctgatttgggt-gtagtcctttgaagaattagc-ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ct 882  Q
    |  || ||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |   ||||||| |||||| ||  ||| || |||| ||||||||||| ||||||| | ||    
2019 tgatcttttgcctaatttgggttgttgtcctatgaaggatcaaagttcaaatccattcctattctgagggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttct 1921  T
883 tgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaat 982  Q
    ||||||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||| | |  ||||||||||    
1920 tgtcttgtaacatagacataaacaaagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgc-tctttgaaggataagcatccaat 1822  T
983 gcgttcaaattctttcaaa 1001  Q
    || ||||||| ||||||||    
1821 gccttcaaatcctttcaaa 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 270 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 2534 - 2338
Alignment:
270 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 362  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  || |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||    
2534 acacaggcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 2435  T
363 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
2434 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcta 2338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 447 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 2381 - 2216
Alignment:
447 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgact-tgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    |||||| | ||||||||||||||||||||||    
2381 gcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtgtgaacacttgatatacaatcag 2282  T
546 tggtgttctcaatacaatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaat 606  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
2281 tggtgttcacaacacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaat 2216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 68; Significance: 9e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 860 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 15769 - 15567
Alignment:
860 ttctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgc 958  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
15769 ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggagatagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgc 15670  T
959 ttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttc--cagtattctgcaatctttagacgaggttgaatcc 1056  Q
     | |||||   |  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||  |||| ||  ||  |||||||||||| ||||||||    
15669 -tctttgaaagataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagccgttgc--cacttttcttcagtctttcgctttctttagacgagtttgaatcc 15573  T
1057 attaaa 1062  Q
    ||||||    
15572 attaaa 15567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 231 - 2
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 358  Q
    ||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
231 aaagagacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 132  T
359 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | | ||| |||||   ||| ||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
131 attacaactgctcaatactacacctagtttgacacttc---aaattgctcaagcacacagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 35  T
457 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 489  Q
    ||  ||||||||||||  | |||||||||||||    
34 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1169
Target Start/End: Complemental strand, 15503 - 15455
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 1169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15503 gcttctgatagacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 15455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 59 - 1
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
59 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 65; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 685 - 937
Target Start/End: Original strand, 16745 - 16997
Alignment:
685 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccac 782  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||    
16745 ttatcttcaggttttcactcctttatatagaggtgtgaaagattcgttgaggtctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcac 16842  T
783 cagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-c 881  Q
    || |  || ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| || |||||||| ||||||| | |    
16843 caatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttatgcaggcagagctgtttttc 16941  T
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
16942 ttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgt 16997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 563
Target Start/End: Original strand, 9325 - 9631
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 358  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | | ||||    |||||||||  |    
9325 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtataactaagcttaatcacaactg 9424  T
359 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagact 456  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||  || |||||||||    
9425 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagactccctttgctcaagcacacagacaagagact 9521  T
457 tctaatgctcaagcac--gcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 553  Q
    ||  ||||||||||||    | |||||||||||||  |||||||    |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
9522 tcctatgctcaagcactaaaaagcaagagacttctattcaaacagtattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatataccatcagtggtgttc 9621  T
554 tcaatacaat 563  Q
     || ||||||    
9622 acagtacaat 9631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 65; Significance: 6e-28; HSPs: 6)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Original strand, 19923 - 20147
Alignment:
269 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 362  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
19923 gacacatgcaattatactggttccttccacaaactggaagtagtccagttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 20022  T
363 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||| |      
20023 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaagcaagagacttccttttctcaagcactaaagcaagagactccct 20119  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
     | |||||||||||||||||||||||||    
20120 tttctcaagcacgcaggcaagagacttc 20147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 433 - 821
Target Start/End: Original strand, 10250 - 10645
Alignment:
433 tgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgactt-gaacac 530  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||     ||||| || ||||||    
10250 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattatttgagtttgaacac 10349  T
531 ttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaagactcta--gacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgt 625  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||   |||||  ||||||||||||| |||||||| |   || ||||||  |||    
10350 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaattcaaatgaaagactctcttgacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacataaattctatgt 10449  T
626 gcttt---gtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatgtctctatctt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 721  Q
    |||||   ||  ||  | |||  |||||||| ||||||||| | |||||   ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10450 gcttttatgtgaaacaaattttgcagagtttgggcgcttttta-cttgt---tgtctcatttttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 10545  T
722 aaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccagtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttga 819  Q
    |||||| | |||||||   | |||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| |||    
10546 aaagagtcattgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaatc--ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatga 10643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 685 - 737
Target Start/End: Original strand, 20410 - 20462
Alignment:
685 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
20410 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagat 20462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 563
Target Start/End: Original strand, 20123 - 20283
Alignment:
405 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||  |  |    
20123 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaactgaatt 20222  T
504 acagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    ||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
20223 acacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatttgtggtgttcacaatacaat 20283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 460
Target Start/End: Original strand, 10250 - 10308
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
10250 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 10308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 460
Target Start/End: Original strand, 20151 - 20209
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
20151 tgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 20209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 65; Significance: 6e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 488
Target Start/End: Original strand, 34977 - 35201
Alignment:
268 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagatta 362  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||    
34977 agacacaggcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtagtccagtttcccttgcacttccaaggagattttcactaagtttaatcacacagatta 35076  T
363 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||       
35077 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactttct 35173  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||    
35174 atgctcaagcactaaagcaagagacttc 35201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 403 - 563
Target Start/End: Original strand, 35145 - 35307
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |     
35145 tgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 35244  T
502 atacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
     |||| | ||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
35245 ttacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaat 35307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Original strand, 35442 - 35491
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
35442 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttg 35491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 882 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 2815 - 2573
Alignment:
882 ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaa 981  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||             |||||||||    
2815 ttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgcta------------agcatccaa 2728  T
982 tgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaag 1081  Q
    ||| ||         ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||| | ||| |    
2727 tgcttt---------tcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaaactttagg 2638  T
1082 ttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||||  | ||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||    
2637 ttgcatttcctgatgaactgcagtttctggtgatttacagcttctgatgaacttgcttctgatga 2573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 2598 - 2551
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
2598 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 2551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 201 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2065 - 1882
Alignment:
201 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 298  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||| |||| ||| || |||||||    
2065 tgcttctgatgtgttgttcagaatcagatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatactgttttcttccac 1968  T
299 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta 378  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
1967 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatacta 1882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 63; Significance: 9e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 881 - 1059
Target Start/End: Original strand, 13557 - 13734
Alignment:
881 cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcca 980  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||| ||   || ||| | ||||||    
13557 cttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaaacatcca 13655  T
981 atgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt 1059  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||| || ||||||||    
13656 atgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatt 13734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1108 - 1184
Target Start/End: Original strand, 13823 - 13899
Alignment:
1108 ctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||||||  ||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
13823 ctgatgagctttagcttctggtgatcttgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcattacttcaggagcacttt 13899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 729
Target Start/End: Original strand, 13368 - 13404
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13368 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 13404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 13191 - 13230
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13191 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 63; Significance: 9e-27; HSPs: 5)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 908 - 1082
Target Start/End: Original strand, 15130 - 15303
Alignment:
908 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtc 1007  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
15130 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaag-aacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 15228  T
1008 gttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagt 1082  Q
    | ||||||||| |||  || |||||||||  ||||||||| || |||||||| |  ||| |||||||| ||||||    
15229 gatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagt 15303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 14914 - 14954
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14914 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 14954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 14475 - 14557
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
14475 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcacta 14557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1183
Target Start/End: Original strand, 15328 - 15374
Alignment:
1137 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15328 cttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 15374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 14736 - 14775
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
14736 ttgaacacttgatatacaatcagtggcgttcacaatacaa 14775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 63; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 82857 - 82714
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
82857 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 82761  T
233 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagca 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
82760 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagca 82714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 81950 - 81899
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
81950 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 81899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 7)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1018 - 1146
Target Start/End: Complemental strand, 23551 - 23424
Alignment:
1018 ttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgattt 1117  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||     
23551 ttttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattc 23453  T
1118 ttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
       ||||||||| ||||||||| ||||||    
23452 acagcttctgatgaacttgcttttgatga 23424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 880 - 1022
Target Start/End: Complemental strand, 25525 - 25384
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatcc 979  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||| |||  |  ||||    
25525 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacac-tctttgaagaataactatcc 25427  T
980 aatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttc 1022  Q
    |||||  |  ||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
25426 aatgcccttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttc 25384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16469 - 16385
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
16469 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 16385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 880 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15865 - 15811
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
15865 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 15811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 23449 - 23400
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
23449 gcttctgatgaacttgcttttgatgacgttatcacttcaggagcactttg 23400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 693 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 16052 - 16012
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
16052 aagtcttcactcctttatatagcggtgt-aaagagacgttga 16012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 693 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 25712 - 25672
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
25712 aagtcttcactcctttatatagcggtgt-aaagagacgttga 25672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 7234 - 7010
Alignment:
269 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 362  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
7234 gacacaaacaattataccggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 7135  T
363 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 460  Q
    ||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||      
7134 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 7038  T
461 atgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||    
7037 atgctcaagcactaaagcaagagacttc 7010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 792 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 6736 - 6591
Alignment:
792 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgt 890  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
6736 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 6638  T
891 agcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
6637 agcgtagaaaaaagcggagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 6591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 403 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 7066 - 6856
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |     
7066 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 6967  T
502 atacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaat--aaaga--ctctagactt-tgaatttctaag 595  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||  |||||  ||||||||||  |||||||||||    
6966 ttacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtgttgttcacattacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaag 6867  T
596 atgtatcaaat 606  Q
    || ||||||||    
6866 atatatcaaat 6856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 60; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 863 - 934
Target Start/End: Original strand, 7375 - 7446
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7375 tgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Original strand, 18558 - 18646
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||    
18558 aaagacacaaagcaattatagtggttccttccacaatccggaagtggtccactcctccttgcactttcaaagagagttcactaaaatca 18646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 267
Target Start/End: Original strand, 8611 - 8743
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
8611 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 8707  T
233 cagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaa 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
8708 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaa 8743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 55; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 102 - 20
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 347  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
102 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacta 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 55; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 262
Target Start/End: Original strand, 17688 - 17815
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
17688 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 17784  T
233 cagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaa 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
17785 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaa 17815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 53; Significance: 8e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 863 - 1018
Target Start/End: Original strand, 9923 - 10078
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| |     
9923 tgcaggcatagctgttatccttgtcttgtagcagcgacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgc-tc 10021  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcact 1018  Q
    ||  | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||  || ||| ||||||||||||    
10022 ttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaattcatttgaattagccgttgcttcact 10078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 728
Target Start/End: Original strand, 9752 - 9787
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9752 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 9787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 562
Target Start/End: Original strand, 9501 - 9615
Alignment:
449 aagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtg 547  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
9501 aagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtg 9600  T
548 gtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||| ||||||||    
9601 gtgttcacaatacaa 9615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1139 - 1184
Target Start/End: Original strand, 10199 - 10243
Alignment:
1139 tctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
10199 tctgatgaacttgat-ctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 10243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 53; Significance: 8e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1185
Target Start/End: Original strand, 923 - 987
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
923 gcttctggtgaacttgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 863 - 984
Target Start/End: Original strand, 690 - 812
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaa-acagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgctt 960  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |    
690 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtgcagatagtgattgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgc-t 788  T
961 ttttgaggaactagcatccaatgc 984  Q
      ||||||||  ||||||||||||    
789 ccttgaggaataagcatccaatgc 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 263 - 380
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |  |||||||||  ||||  |||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
263 caagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 362  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| || |||||    
363 gtggtgttcacagtacaa 380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1193
Target Start/End: Original strand, 163511 - 163604
Alignment:
1103 agcttctgatgatttttggcttctgataaactt-gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||    
163511 agcttctgatgaaatcttgcttctgatgaactttgcttctgatggacttctgcttctgatgacgtcattatttcagaggcacttgaaacttcag 163604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 52; Significance: 3e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 403 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 4011 - 3844
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa-tgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||| | | |||||| |    
4011 tgctcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacataagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttataaacaaacaca 3912  T
501 gatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatacaa 567  Q
      |||| ||||| | ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
3911 attacacagaataatgtttgagattgaacacttaatatacaatcagcggtgttcacaatacaaaacaa 3844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 732
Target Start/End: Original strand, 2451 - 2496
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
2451 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaaagacgtt 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 3720 - 3672
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
3720 atcttcaagtcttcactcctttatatagatgtgtgaaagatacgttgag 3672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4106 - 4027
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
4106 aagcaattatacaggttccttacacaatccagaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 4027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 52; Significance: 3e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 562
Target Start/End: Original strand, 13542 - 13701
Alignment:
405 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||  | ||||||| ||    
13542 ctcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcttatgctcaagtacacaagcaagagacttctattaaaacaaaaat 13641  T
504 acagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    | | |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
13642 ataaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgctcacaatacaa 13701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 698 - 733
Target Start/End: Original strand, 40441 - 40476
Alignment:
698 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40441 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 40476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 897 - 1036
Target Start/End: Original strand, 40639 - 40777
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctt 996  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  || |||| ||||||| | ||  | |||| | ||||  |||| |||||||||||    
40639 gacataaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgc-tcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattctt 40737  T
997 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaat 1036  Q
    |  || ||| |||||||||||| |||  || |||||||||    
40738 ttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaat 40777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 880 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 1755 - 1701
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1755 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1479
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
1528 tgcttctgatgagcttatgcttctgatgacgtcattacttcagaagcact 1479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 7)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 4625 - 4464
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa-tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 500  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||||| | |||||| |    
4625 tgctcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcaccaaagcaagagacttctaaacaaacaca 4526  T
501 gatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
      |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
4525 attaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 4464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 1833 - 1792
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1833 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 1792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6880 - 6815
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 339  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
6880 aagcaattatacaggttcctttcacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 6815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2790 - 2731
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
2790 gttccttccacaatccggaagtagtcatgtccccctttcacttccaaggagagttcacta 2731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 4332 - 4285
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
4332 atcttcaagtcttcactcctttatacagaggtgtgagagatacgttga 4285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8318 - 8279
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 442  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
8318 tgctcaagcacacaagcaagaggcttccaatgctcaagca 8279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 8331 - 8261
Alignment:
420 aagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 489  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  || | |||||||||||    
8331 aagagacttccaatgctcaagcacacaagcaagaggcttccaatgctcaagcatacaagaaagagacttct 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 50; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 973 - 1186
Target Start/End: Original strand, 9872 - 10084
Alignment:
973 agcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttga 1072  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||  |||  ||||||||| || ||||||||||| |    ||||    
9872 agcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttggtcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttga 9971  T
1073 agccttaagt--tgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcac 1170  Q
    ||| |||| |  |||||| |  |||||||| ||||||||| |||| ||  |||| |||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
9972 agctttaaatcttgcatctccagatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttatgatgagat-gcttctgattaacttgcttctgatgacgtcatcac 10068  T
1171 ttcagaagcactttga 1186  Q
    ||||| ||||||||||    
10069 ttcaggagcactttga 10084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 688 - 733
Target Start/End: Original strand, 7617 - 7662
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
7617 tctttaagtcttcactcctttatacagaggtgtgaaagagacgttg 7662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 19645 - 19594
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19645 ttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 320
Target Start/End: Original strand, 10238 - 10355
Alignment:
202 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 300  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
10238 gcttctgatgtgatgttcaaaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagata--gacagaaacagttatactggttccttccacaa 10335  T
301 cacggaagtagtccagtccc 320  Q
      ||||||||| ||||||||    
10336 tccggaagtagcccagtccc 10355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 443
Target Start/End: Original strand, 13934 - 14068
Alignment:
314 cagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-------taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||  ||||  |||    
13934 cagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaatcaataatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttatcaaa--tgc 14030  T
406 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 443  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
14031 tcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcac 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 488
Target Start/End: Original strand, 14026 - 14084
Alignment:
431 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 488  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
14026 aatgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 14084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1185
Target Start/End: Original strand, 11601 - 11665
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
11601 gcttttgatgaacttgcttctgatgaactagcttctgatgacgtcattacttcagaagcactttg 11665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1067 - 1161
Target Start/End: Original strand, 11532 - 11626
Alignment:
1067 ttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 1161  Q
    |||||||  ||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||   | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
11532 ttttgaaaacttgagttccatctcttgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttatgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatga 11626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 48; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1184
Target Start/End: Complemental strand, 9278 - 9215
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
9278 gcttctgatgaactttcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 47; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 237
Target Start/End: Original strand, 5271 - 5404
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaa-attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||   |  || |||    
5271 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgc 5370  T
204 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcg 237  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
5371 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcg 5404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 47; Significance: 3e-17; HSPs: 9)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 974 - 1145
Target Start/End: Original strand, 39503 - 39676
Alignment:
974 gcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaa 1073  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| || || |||   |||||||| || |||||||| || ||| ||||||    
39503 gcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaacagcctttgaa 39602  T
1074 gccttaa--gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatg 1145  Q
    || ||||   ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
39603 gctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatg 39676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 974 - 1145
Target Start/End: Original strand, 137563 - 137736
Alignment:
974 gcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaa 1073  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| || || |||   |||||||| || |||||||| || ||| ||||||    
137563 gcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaacagcctttgaa 137662  T
1074 gccttaa--gttgcatcccatgatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatg 1145  Q
    || ||||   ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
137663 gctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatg 137736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 693 - 956
Target Start/End: Original strand, 37199 - 37463
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |   ||||||||| |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
37199 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttttgaattgccagcacgtcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 37296  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||| ||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||   | || ||||  | ||||||||  | |||| | ||||||||    
37297 cttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaatcgatagggaacatcgt-tgcaggcagggatgtttttcttgtctt 37395  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaac 956  Q
    |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||    
37396 gtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 693 - 956
Target Start/End: Original strand, 135259 - 135523
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |   ||||||||| |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |    
135259 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttttgaattgccagcacgtcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 135356  T
790 cctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 888  Q
    | |||| ||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||   | || ||||  | ||||||||  | |||| | ||||||||    
135357 cttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaatcgatagggaacatcgt-tgcaggcagggatgtttttcttgtctt 135455  T
889 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaac 956  Q
    |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||    
135456 gtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1182
Target Start/End: Original strand, 159309 - 159356
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
159309 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 159356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 558
Target Start/End: Original strand, 158653 - 158764
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||  ||||||| |  |||| |||| |  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
158653 caagagacttcctatgctcaagcacacaagaaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaaaacttgatatacaatcagt 158752  T
547 ggtgttctcaat 558  Q
    ||||||| ||||    
158753 ggtgttcacaat 158764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 158906 - 158946
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
158906 aagtcttcactcctttatatagaggtatgaaagagatgttg 158946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1186
Target Start/End: Original strand, 39652 - 39702
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||    
39652 gcttctgatgaacttgcttctgatgtcgttatgacttcaagagcactttga 39702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1186
Target Start/End: Original strand, 137712 - 137762
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttga 1186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||    
137712 gcttctgatgaacttgcttctgatgtcgttatgacttcaagagcactttga 137762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 47; Significance: 3e-17; HSPs: 6)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 268572 - 268618
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
268572 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 268618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 693 - 929
Target Start/End: Original strand, 84191 - 84429
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||| | |  ||   ||||||||||||||  |||||||||  ||||| |      
84191 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaatatccagcgcattcaaaatagagtcgtttgaaa--ctttgatcaatcaccaatga 84288  T
789 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtct 887  Q
    || |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| || ||| ||  |||||| ||||  | |||||||| ||||| || ||||||||    
84289 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccaatccaattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtct 84387  T
888 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    |||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
84388 tgtagtagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgta 84429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 268162 - 268228
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
268162 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctattccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 268228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 84011 - 84050
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
84011 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 84050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 268400 - 268439
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
268400 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 268439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 83759 - 83834
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||| |||| | ||| ||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
83759 aagcaattatacaggtaccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 83834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 901 - 1110
Target Start/End: Complemental strand, 926 - 727
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaa 1000  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||| |||  |||||||||| |          ||||||    
926 aaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatccaatac---------atttcaa 837  T
1001 aatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaact 1100  Q
    |||||  |||||   ||||||| ||| ||||||||| | |||||||| | || ||| | ||| |||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||    
836 aatagctgttgccatacttttctagtcttctgcaatttatagacgagttagagtccttgaaacagcttttgaaactttaagtttcatctcctgatgaact 737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 1133 - 1093
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1133 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 1093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1136 - 1179
Target Start/End: Complemental strand, 716 - 673
Alignment:
1136 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagc 1179  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
716 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcactacagaagc 673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 1313 - 1277
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaata 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
1313 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 1277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 123 - 1
Alignment:
138 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |  || |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
123 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--ttagattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27  T
233 cagcgg-aaagaacagagcagagaaa 257  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
26 cagcggaaaagaacagagcagagaaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 45; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 687 - 935
Target Start/End: Original strand, 9698 - 9946
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtcta-aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 784  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| || | ||||||||||||||   |||||||||  |||||    
9698 atctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaataagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcacca 9795  T
785 gtagtcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 883  Q
     |  || |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| ||||||    ||| ||  |||| |  |||||||| ||||||| | |||    
9796 atgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccatgtttgtagaaacat-tgttgcaggcagagctgttttcctt 9894  T
884 gtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttc 935  Q
    || |||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
9895 gttttgtagcagagataaaaacagagtagtgcaggtagtggttgtacacttc 9946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 9263 - 9345
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
9263 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 9345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 45; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Original strand, 7591 - 7749
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||| ||| |||||| ||  |||||||| | |||  |||||||||||   | ||||||||||||| | ||||||||     
7591 tgctcaagcgcacaagcaagatacttcaaatactcaagtacacaagcaagaaatttcctatgctcaagcataaaagcaagagacttctaaacaaacaaat 7690  T
502 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
      ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
7691 c-acacagaaataagtttga-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 7749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 7878 - 7924
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
7878 atcttcaagtctttattcccttatatagaggtatgaaagagacgttg 7924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9740 - 9630
Alignment:
266 aaagacac-aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agatta 362  Q
    |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||   |||||    
9740 aaagacacgaagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagtagtcctgtcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgatta 9641  T
363 caaatgctcaa 373  Q
    |||||||||||    
9640 caaatgctcaa 9630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1184
Target Start/End: Original strand, 74806 - 74869
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 1184  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
74806 gcttatgatgaacttgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcaacacttcaggagcacttt 74869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 73961 - 74022
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
73961 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 74022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 74378 - 74418
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
74378 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 74418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 902 - 962
Target Start/End: Original strand, 74588 - 74648
Alignment:
902 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgctttt 962  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||    
74588 aaacaaagtagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgctttt 74648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2525 - 2443
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 356  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
2525 aagcaattatacaggttccttccacaattcggaagtagtcctgtcctccttgcacttccaaggagagttcactaaaattacaa 2443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 688 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 2067
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
2112 tcttcatgtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgttg 2067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2285 - 2246
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
2285 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacagtacaa 2246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1139 - 1185
Target Start/End: Original strand, 8511 - 8557
Alignment:
1139 tctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
8511 tctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 8557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 24010 - 24072
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
24010 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 24072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 32106 - 32060
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
32106 atcttcaagtcttcactcctttaaatagaggtgtgaaagagacgttg 32060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32517 - 32457
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
32517 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcatttccaaggagagttcacta 32457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 900 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31890 - 31856
Alignment:
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31890 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 4)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 43776 - 43719
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
43776 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcac-ttgaacttcag 43719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 901 - 992
Target Start/End: Complemental strand, 44024 - 43934
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaat 992  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || |||| ||||||| | ||  ||||||  ||||||||||| |||||||    
44024 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgc-tcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaat 43934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 44233 - 44193
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
44233 aagtcttgactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 44193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 44382 - 44342
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaat 563  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
44382 ttgaacacttgataaacaatcagtggtgttcacaatacaat 44342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 76625 - 76691
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
76625 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatca 76691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 553
Target Start/End: Original strand, 76757 - 76863
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagttt-gacttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |||| |||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
76757 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttcgggttgaacacttgatatacaatcagt 76856  T
547 ggtgttc 553  Q
    || ||||    
76857 ggcgttc 76863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 1198 - 1153
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
1198 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1331
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
1370 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 1331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1604 - 1538
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
1604 ggttccttcaacaatctggaagtagtcttgtcacccatgcacttccaaggagagttcactataatca 1538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 863 - 1015
Target Start/End: Original strand, 5974 - 6126
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgcttt 961  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| ||||||   |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| |     
5974 tgcaggcatagatgttattcttgtcctgtagcagagacacaaatagagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgc-tc 6072  T
962 tttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttc 1015  Q
    ||  | |||| |||||||||||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||    
6073 ttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagttgttgcttc 6126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1175
Target Start/End: Original strand, 6229 - 6270
Alignment:
1134 ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcag 1175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6229 ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcag 6270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 695 - 729
Target Start/End: Original strand, 5807 - 5841
Alignment:
695 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5807 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 5841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1193
Target Start/End: Original strand, 22249 - 22322
Alignment:
1121 gcttctgataaacttgcttctgatgaactt-gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
22249 gcttctgatgaagttgcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcattacttcagaggcacttgaaacttcag 22322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0774
Description:

Target: scaffold0774; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 6216 - 6141
Alignment:
1121 gcttctgataaactt-gcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
6216 gcttctgattaactttgcttctgatgaacttatgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 6141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 5804 - 5844
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5804 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 5844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 880 - 932
Target Start/End: Original strand, 5991 - 6043
Alignment:
880 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 932  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
5991 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 5625 - 5664
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
5625 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 5664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 2306 - 2266
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2306 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 2266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2479 - 2440
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2479 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 2440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 911 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 2090 - 2042
Alignment:
911 agtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
2090 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 2042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2747 - 2688
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||    
2747 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtgccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 2688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 223 - 107
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgat-caaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||| |  |||| ||||  | ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
223 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaaatgtttgaagttgaacaattgatatacaatcag 124  T
546 tggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||| ||||||||    
123 tggtgttcacaatacaa 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 396 - 321
Alignment:
274 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
396 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggatagttcactat 321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 733
Target Start/End: Original strand, 5426 - 5466
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5426 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 562
Target Start/End: Original strand, 5202 - 5288
Alignment:
477 gcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||  ||||||| |  |||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
5202 gcaagagacttctattcaaacataattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgtgcacaatacaa 5288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 22396 - 22457
Alignment:
286 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
22396 tggttccttccacaatccgagagtagtccactcccccttgcactttcaaggagagttcacta 22457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 901 - 937
Target Start/End: Original strand, 5633 - 5669
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 937  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
5633 aaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 5669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16860 - 16800
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
16860 ggttccttccacaaaccggaagtagtcacgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 897 - 1146
Target Start/End: Original strand, 15795 - 16044
Alignment:
897 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaac-gtactttgtcaacgcttttttgaggaactagcatccaatgcgttcaaattct 995  Q
    |||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||| ||   || ||| |||||||||||| ||||| | ||    
15795 gacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatccaatgccttcaagtcct 15893  T
996 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccatt-aaatagcttttgaagccttaag--ttgcatcccat 1092  Q
    ||||||||| | | |||||||||  ||  || || ||||||  || |||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| |||||  ||||||| | |    
15894 ttcaaaataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagtcttgcatctcct 15993  T
1093 gatgaactgcagcttctgatgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1146  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |   | ||||||| ||||||||||||||||    
15994 gatgaactttagcttctgatgagat---ggttctgatgaacttgcttctgatga 16044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1138 - 1193
Target Start/End: Original strand, 16021 - 16076
Alignment:
1138 ttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||    
16021 ttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcatgagcacttttgacttcag 16076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 16444 - 16410
Alignment:
700 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16444 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 16410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 5)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 5637 - 5597
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5637 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 5597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 995 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 5345 - 5225
Alignment:
995 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtattctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaatagcttttgaagccttaagttgcatcccatga 1094  Q
    |||||||||||  |||||  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||| | ||| |||||||||| |  ||||||  ||| | |||    
5345 tttcaaaatagctgttgccacacatttccagtcttctgcaatctttaggcgagttagagtccttaaaacagcttttgaaactataagttcaatctcctga 5246  T
1095 tgaactgcagcttctgatgat 1115  Q
    |||||||||||||||| ||||    
5245 tgaactgcagcttctggtgat 5225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 5817 - 5778
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
5817 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 5778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1151 - 1185
Target Start/End: Complemental strand, 5219 - 5185
Alignment:
1151 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 1185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5219 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 5185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6000 - 5939
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
6000 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcacta 5939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2111 - 2056
Alignment:
292 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
2111 cttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1193
Target Start/End: Complemental strand, 4332 - 4289
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
4332 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactctgaacttcag 4289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 687 - 734
Target Start/End: Original strand, 19863 - 19910
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
19863 atcttcaagtcttcacttctttagatagaggtgtgaaagagacgttga 19910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 353
Target Start/End: Original strand, 19473 - 19523
Alignment:
303 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
19473 cggaagtagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 19523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 562
Target Start/End: Original strand, 144405 - 144564
Alignment:
405 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagat 503  Q
    |||||||||| | |||||||  |||| ||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |  |    
144405 ctcaagcacaaatgcaagagatttcctatgctgaagaactaaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaatt 144504  T
504 acagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
144505 acaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcattggtgtccacaatacaa 144564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 144285 - 144345
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
144285 ggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttctaaggagagttcacta 144345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 688 - 733
Target Start/End: Original strand, 144698 - 144743
Alignment:
688 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
144698 tcttcaggtcttcactcctttttatagaggtgcgaaagagacgttg 144743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 863 - 929
Target Start/End: Original strand, 2951 - 3016
Alignment:
863 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 929  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
2951 tgcaggcagagctgtttt-ttgtcttgtagcagggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgta 3016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 2599 - 2638
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2599 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 2638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 2361 - 2423
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2361 ggttccttccacaaaccggaagttagtactgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 733
Target Start/End: Original strand, 2781 - 2820
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
2781 agtcttcactcctttgtatagaggtgtgaaagagatgttg 2820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 12280 - 12362
Alignment:
159 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa 241  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| |||   || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
12280 aaaaatacttcttctgataatacttcagacgcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaa 12362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 510 - 393
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||| |  |||||||||  |||| ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
510 caagagacttgtaatgctcaagcacaactgcaagagaattctaaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 411  T
545 gtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||| ||||||||    
410 gtggtgttcacaatacaa 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 671 - 611
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 346  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
671 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 279 - 318
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
279 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaaaatacaa 318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 4866 - 4829
Alignment:
438 aagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgca 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4866 aagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgca 4829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0314
Description:

Target: scaffold0314; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 20627 - 20575
Alignment:
1133 cttgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
20627 cttgcttctgatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 20575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 562
Target Start/End: Original strand, 11554 - 11855
Alignment:
266 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta--taatcacaaagatt 361  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||  |   ||||    
11554 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactaagtaatatc--tgatt 11651  T
362 acaaatgctcaatactatcaa--aatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 458  Q
    ||||||||||| |||||  ||  | || ||||||||   ||| ||||||||||||    |||||| ||||| ||||||  | ||  || |||||||||||    
11652 acaaatgctcactactaaaaattagtaagagacttc---aaattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttc 11748  T
459 taatgctcaagcacgcaggcaagagacttctga--tcaaacaaagatacagagaattaagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 555  Q
    || |||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| |  |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
11749 tattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgataaacaatcagtggtgttcac 11848  T
556 aatacaa 562  Q
    |||||||    
11849 aatacaa 11855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 694 - 734
Target Start/End: Original strand, 11996 - 12036
Alignment:
694 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
11996 agtcctcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttga 12036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1657 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1657
Description:

Target: scaffold1657; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 562
Target Start/End: Original strand, 1384 - 1498
Alignment:
448 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaagatacagagaattaagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 546  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||  | |||||| | |||| ||||||||||  |||| |||| || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
1384 caagagacctcta-tgctcaaccacataagcaagaaaattctaatcaaacaaaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatctacaatcagt 1482  T
547 ggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||| ||||||||    
1483 ggtgttcacaatacaa 1498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Original strand, 1558 - 1643
Alignment:
108 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagca 191  Q
    ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
1558 tgaaggtgagaaaaacacaaga-gggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagca 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 5801 - 5840
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
5801 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 5840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4011 - 3925
Alignment:
266 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||    
4011 aaagacacagagcaattatcttggttccttgcacaatccggaagtagttcagtccct-ttgcacttccaatgagatttcactgtaatc 3925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 3624 - 3582
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 729  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
3624 atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagagac 3582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 901 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 417 - 384
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
417 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 5811 - 5850
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
5811 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 5850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 693 - 728
Target Start/End: Original strand, 3021 - 3056
Alignment:
693 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3021 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 3056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 2610 - 2671
Alignment:
287 ggttccttccacaacac-ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
2610 ggttccttccacaaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttacaaggagagttcacta 2671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 378
Target Start/End: Original strand, 1191 - 1310
Alignment:
266 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 358  Q
    |||||||||  || |||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
1191 aaagacacagacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 1290  T
359 attacaaatgctcaatacta 378  Q
    ||||||| ||||||||||||    
1291 attacaactgctcaatacta 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 901 - 959
Target Start/End: Original strand, 1323 - 1381
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||    
1323 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgct 1381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 701 - 761
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
701 ggttctttccacaaaccgaaagtagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 901 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 30
Alignment:
901 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcaaacgtactttgtcaacgct 959  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||    
88 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgct 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 710 - 650
Alignment:
287 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 347  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
710 ggttctttccacaaaccgaaagtagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0795 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0795
Description:

Target: scaffold0795; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1183
Target Start/End: Original strand, 37 - 71
Alignment:
1149 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37 ttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 71  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 900 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 35233 - 35199
Alignment:
900 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35233 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 34993 - 34943
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
34993 tgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 34943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 353
Target Start/End: Original strand, 3689 - 3754
Alignment:
288 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 353  Q
    |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
3689 gttccttccacaatccggaagtagtcttctcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaatca 3754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 562
Target Start/End: Original strand, 3770 - 3931
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaag 501  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||  ||| |||||||||  |||||| ||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||||| | |||||| |     
3770 tgctcaatcacacaagcaagagacttaaaatactcaagcacacaagcaaaagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacacaa 3869  T
502 atacagagaattaag-tttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
     |||| || |  ||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
3870 ttacacaggaaaaatatttggattgaacacttgatatacagtcagtggtgttcacaatacaa 3931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 726
Target Start/End: Original strand, 4061 - 4100
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 726  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
4061 atctttaagtattcactcctttatatagaggtgtgaaaga 4100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Original strand, 165 - 225
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
165 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgatgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 27160 - 27193
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27160 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 27193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1193
Target Start/End: Original strand, 15286 - 15346
Alignment:
1135 tgcttctgatgaactt--gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgaacttcag 1193  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
15286 tgcttctgatgaacttctgcttctaatgacgtcatcacttcagaggcacttgaaacttcag 15346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Original strand, 17387 - 17495
Alignment:
268 agacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag-gagatttcactataatcaca-aagattaca 364  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||||| |  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||    
17387 agacacaagcaatttatcctggttctttccacaatccggaagcagtctagtccccttgtcacttacaagagatttttcactataatcacacaagattaca 17486  T
365 aatgctcaa 373  Q
    | |||||||    
17487 attgctcaa 17495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1135 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 4864 - 4816
Alignment:
1135 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
4864 tgcttttgatgaacttgcttttgatgacgttatcacttcaggagcactt 4816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0683 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:

Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 577
Target Start/End: Original strand, 9 - 64
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatac-aatacaataaagactct 577  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||    
9 ttgaacacttgatatactatcagtggtgttcacaatacgaataaaatacagactct 64  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 513 - 560
Target Start/End: Original strand, 5001 - 5048
Alignment:
513 taagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatac 560  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
5001 taagtttggtttgaaaacttgatatacaatcagtggtgttcacaatac 5048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 5178 - 5224
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 733  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
5178 atcttcaagtcttcattcctttatatagagatatgaaagaaacgttg 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 562
Target Start/End: Original strand, 31356 - 31395
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaa 562  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
31356 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 31395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 734
Target Start/End: Original strand, 31528 - 31575
Alignment:
687 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 734  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
31528 atctttaagtcttcactcatttatatagaggtgtgagagatacgttga 31575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17087 - 17000
Alignment:
266 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 352  Q
    |||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||   | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||    
17087 aaagacacaaagcaattatactgatttcttccacaatctgaaagtagtccaatctcctttgcacttccaaggagatttcattataatc 17000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1339 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1339
Description:

Target: scaffold1339; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 483
Target Start/End: Original strand, 1755 - 1836
Alignment:
403 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagag 483  Q
    |||| ||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||    
1755 tgcttaagaacacaagcaagcgacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagactttttatgctcaagcacacaagcaagag 1836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 2251 - 2218
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
2251 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 2218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1026 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1026
Description:

Target: scaffold1026; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 523 - 560
Target Start/End: Original strand, 2702 - 2739
Alignment:
523 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatac 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
2702 ttgaacacttgatatacaatcagtgctgttcacaatac 2739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Original strand, 5013 - 5046
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
5013 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactt 5046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0374 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0374
Description:

Target: scaffold0374; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 17187 - 17154
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
17187 tgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcactt 17154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 19035 - 19002
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
19035 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 19002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1183
Target Start/End: Complemental strand, 28429 - 28396
Alignment:
1150 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 1183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
28429 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactt 28396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University