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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1326R-Insertion-19 (Length: 1030)

Name: NF1326R-Insertion-19
Description: NF1326R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1326R-Insertion-19
NF1326R-Insertion-19
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (25-901)||(44407578-44408455)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 606; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 606; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 44408455 - 44407578
Alignment:
Q  25 acatcaaatcacaaaagagaatctaacttagctcatggagtatgcattatgccccccacatacacacaacaaaacttagtactgtaattttatgaggtga 124  Q
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T  44408455 acatcaaatcacaaaagagaatctaacttagcccatggagtatgcattatgccccccacatacacacaacaaaacttagtactgtaattttatgaggtg- 44408357  T
Q  125 ggtgaggtccctctttctttctctt----tctatctctcactcaccaattattatagtcattcatgcttcaacaaaacatctttcgtcctcttatgaaaa 220  Q
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T  44408356 ----aggtccctctttctttctctttctatctatctctcactcaccaattattatag----tcatgcttcaacaaaacatctttcgtcctcttatg-aaa 44408266  T
Q  221 aacttcctcacttagtcagacgcatgcttaatttaaagcttctactttttctcttcttgaaaacacaattagatgaactgaacactttgcatgg------ 314  Q
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T  44408265 aacttcatcacttagtcagacgcatgcttaatttaaagcttctactttttctcttcttgaaaacacaattagatgaactgaacactttgcatggtacctg 44408166  T
Q  315 ----------tattcaatatccaatcatttatgtcatgttattttatacgtttaattattttaaaataaattttacatatagcgtaccaatctcnnnnnn 404  Q
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T  44408165 gctaaaatgatattcaatatccaatcatttatgtcatgttattttatacgtttaattattttaaaataaattttacatattgcgtaccaatctcaaaaaa 44408066  T
Q  405 nntattctaaagcgtttttcttagatgaattaactttgttcattc------------ataattacttacacgaaatgggaattcagtttactttctgtct 492  Q
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T  44408065 aatattctaaagcgtttttcttagatggattaactttgttcattcataagtgtttcaataattacttacatgaaatgggagttcagtttactttccgtct 44407966  T
Q  493 caattagattttaaactttgattataatgatgatgcaagttttatgacaaaccaacttaaaattgtagttaaaatgttatcataaaactattcgtttatt 592  Q
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T  44407965 caattagattttaaactttgattataatgatgatgcaagttttatgacaaaccaactt-aaattgtagttaaaatgttatcataaaactattcatttatt 44407867  T
Q  593 tctttccctcactactttttagctaaattagatgtacttttcgtctttttattttactgtacttttcctctgtgtgtaaacgcaagcagaattatttttt 692  Q
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T  44407866 tctttccctcactactttttagctaaattagatgtacttttcgtctttttattttactttacttttcctctgtgtgtaaacgcaagcagaa--------- 44407776  T
Q  693 gattgcatttatggacatagaaatttgaactaaatgaacacatattgtgattatggtttggaaaatgtttgttgtacactcattcgagtgtataaagttt 792  Q
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T  44407775 ------------ggacatagaaatttgaactaaatgtacacatattgtgattatggtttggaaaatgtttgttgtacactcattcgagtgtataaagttt 44407688  T
Q  793 caaagaaaaagaaatgtgatagtttgatgatgtcgtataaaaagagatgggataagatgagatgttaaataagcgt-gaaatatgaaagtatacaaatat 891  Q
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T  44407687 caaagaaaaagaaatgtgatagtttgatgatgtcgtataaaaagagatgggataagatgagatgttaaataagcgtggaaatatgaaagtatacaaatat 44407588  T

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