View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1326_low_38 (Length: 227)

Name: NF1326_low_38
Description: NF1326
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1326_low_38
NF1326_low_38
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (1-198)||(26509003-26509200)
chr7 (1-198)||(16443299-16443497)
chr7 (1-198)||(26663206-26663403)
chr7 (1-198)||(26678398-26678595)
chr7 (1-198)||(16047956-16048154)
chr7 (1-198)||(31083917-31084115)
chr7 (7-198)||(16511749-16511941)
chr7 (1-198)||(26441889-26442086)
chr7 (1-198)||(26519452-26519649)
chr7 (1-198)||(45393864-45394061)
chr7 (1-173)||(16744814-16744986)
chr7 (1-198)||(11447533-11447730)
chr7 (1-160)||(26313157-26313317)
chr7 (1-198)||(4138539-4138736)
chr7 (1-198)||(24585830-24586027)
chr7 (1-198)||(26268380-26268576)
chr7 (1-160)||(31557698-31557858)
chr7 (1-160)||(4206058-4206217)
chr7 (1-147)||(5154758-5154904)
chr7 (1-198)||(10848228-10848426)
chr7 (1-160)||(26596338-26596498)
chr7 (1-147)||(2779919-2780065)
chr7 (1-160)||(31130579-31130738)
chr7 (4-147)||(10910247-10910390)
chr7 (1-147)||(3451926-3452072)
chr7 (1-147)||(5165059-5165205)
chr7 (1-147)||(11418097-11418243)
chr7 (1-147)||(2161247-2161392)
chr7 (1-147)||(22148563-22148709)
chr7 (1-147)||(22152790-22152936)
chr7 (1-147)||(22208705-22208851)
chr7 (1-128)||(39206458-39206585)
chr7 (1-128)||(45737995-45738122)
chr7 (1-198)||(5140631-5140828)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (32-198)||(27623108-27623274)
chr6 (1-198)||(30551358-30551555)
chr6 (1-198)||(34457864-34458061)
chr6 (32-198)||(27283763-27283929)
chr6 (1-198)||(28214092-28214289)
chr6 (1-198)||(27064125-27064322)
chr6 (4-198)||(22928236-22928431)
chr6 (1-147)||(27209574-27209720)
chr6 (1-147)||(27239508-27239654)
chr6 (1-198)||(29579658-29579855)
chr6 (1-160)||(4539137-4539296)
chr6 (1-147)||(16756496-16756642)
chr6 (2-147)||(24299140-24299285)
chr6 (4-128)||(24870402-24870526)
chr6 (1-160)||(13517572-13517731)
chr6 (1-147)||(29508096-29508242)
chr6 (1-147)||(33369808-33369954)
chr6 (1-170)||(4779563-4779732)
chr6 (1-198)||(27355461-27355658)
chr6 (1-120)||(15405909-15406028)
chr6 (1-120)||(15417696-15417815)
chr6 (1-160)||(27200859-27201018)
chr6 (1-160)||(27248215-27248374)
chr6 (1-147)||(14138779-14138925)
chr6 (4-142)||(27031701-27031839)
chr6 (1-142)||(4764442-4764583)
chr6 (1-198)||(26666015-26666212)
chr6 (1-198)||(26771986-26772183)
chr6 (1-142)||(27025822-27025963)
chr6 (1-147)||(26792491-26792637)
chr6 (1-147)||(26927427-26927573)
chr6 (1-147)||(27014399-27014545)
chr6 (1-198)||(16680783-16680980)
chr6 (1-160)||(27491800-27491960)
chr6 (1-160)||(4531956-4532115)
chr6 (1-147)||(13292323-13292470)
chr6 (1-171)||(16937384-16937554)
chr6 (1-149)||(26109779-26109928)
chr6 (1-147)||(29556231-29556377)
chr6 (1-198)||(8899055-8899252)
chr6 (1-128)||(28167188-28167315)
chr6 (1-90)||(20131252-20131341)
chr6 (1-90)||(22201529-22201618)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-198)||(29835974-29836171)
chr8 (1-198)||(28355326-28355523)
chr8 (1-198)||(12086102-12086299)
chr8 (1-198)||(22139538-22139736)
chr8 (4-198)||(19694740-19694935)
chr8 (1-198)||(22074302-22074500)
chr8 (1-198)||(19681107-19681304)
chr8 (1-198)||(31483245-31483442)
chr8 (4-198)||(19654719-19654914)
chr8 (1-198)||(33265371-33265568)
chr8 (4-198)||(16260562-16260757)
chr8 (1-147)||(2130658-2130804)
chr8 (1-147)||(15774250-15774396)
chr8 (1-147)||(33249039-33249185)
chr8 (1-128)||(18716177-18716304)
chr8 (1-128)||(18797404-18797531)
chr8 (1-198)||(31361179-31361377)
chr8 (32-198)||(44567631-44567797)
chr8 (2-142)||(14569836-14569976)
chr8 (1-142)||(21341560-21341702)
chr8 (1-160)||(19201757-19201917)
chr8 (3-147)||(27602305-27602449)
chr8 (2-120)||(19910558-19910676)
chr8 (1-171)||(9361282-9361451)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (1-198)||(1906924-1907122)
chr4 (1-198)||(54840048-54840245)
chr4 (1-198)||(15234475-15234673)
chr4 (1-198)||(21976361-21976558)
chr4 (1-198)||(20331846-20332043)
chr4 (1-198)||(31119921-31120118)
chr4 (1-198)||(5012538-5012735)
chr4 (1-198)||(24585782-24585980)
chr4 (1-198)||(15379649-15379847)
chr4 (1-198)||(33667212-33667409)
chr4 (1-198)||(40099044-40099241)
chr4 (1-198)||(30760421-30760618)
chr4 (1-160)||(27156737-27156896)
chr4 (1-147)||(14752927-14753073)
chr4 (2-147)||(17019737-17019882)
chr4 (4-128)||(14671717-14671841)
chr4 (1-198)||(15276037-15276235)
chr4 (1-160)||(5701224-5701383)
chr4 (1-147)||(6576544-6576691)
chr4 (1-147)||(36323748-36323894)
chr4 (1-147)||(36337957-36338103)
chr4 (1-198)||(14105201-14105398)
chr4 (1-128)||(39857342-39857469)
chr4 (1-157)||(18794054-18794208)
chr4 (1-148)||(34182368-34182515)
chr4 (1-147)||(24119349-24119496)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (1-198)||(21696588-21696786)
chr2 (1-198)||(3789089-3789286)
chr2 (1-198)||(13930010-13930207)
chr2 (1-198)||(19409883-19410080)
chr2 (1-198)||(37932023-37932220)
chr2 (1-198)||(39896715-39896912)
chr2 (1-198)||(27396980-27397178)
chr2 (1-198)||(16822737-16822934)
chr2 (1-198)||(16898546-16898743)
chr2 (1-198)||(21670572-21670769)
chr2 (1-198)||(34268322-34268520)
chr2 (1-198)||(16168124-16168321)
chr2 (1-198)||(27810349-27810546)
chr2 (1-198)||(32056398-32056595)
chr2 (1-198)||(34297795-34297992)
chr2 (1-198)||(254051-254248)
chr2 (1-198)||(9343386-9343583)
chr2 (1-198)||(37679297-37679494)
chr2 (1-198)||(37694562-37694759)
chr2 (1-198)||(37945264-37945461)
chr2 (1-198)||(22921543-22921740)
chr2 (1-198)||(34868280-34868477)
chr2 (1-173)||(11628584-11628756)
chr2 (1-198)||(12593460-12593657)
chr2 (1-198)||(19449811-19450010)
chr2 (1-147)||(23117471-23117617)
chr2 (1-198)||(39045281-39045479)
chr2 (4-147)||(20844590-20844733)
chr2 (1-147)||(28888929-28889075)
chr2 (1-160)||(31882955-31883114)
chr2 (4-128)||(27427875-27428000)
chr2 (1-198)||(27782869-27783066)
chr2 (2-147)||(12662165-12662311)
chr2 (1-128)||(37384371-37384498)
chr2 (1-147)||(12710023-12710169)
chr2 (1-198)||(40240169-40240366)
chr2 (1-128)||(27123216-27123343)
chr2 (1-160)||(34161525-34161684)
chr2 (1-147)||(31868208-31868354)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (1-198)||(15752169-15752366)
chr5 (1-198)||(30036079-30036276)
chr5 (1-198)||(22895059-22895257)
chr5 (1-198)||(33523037-33523234)
chr5 (4-198)||(23898527-23898723)
chr5 (1-198)||(37761627-37761824)
chr5 (1-198)||(40466860-40467057)
chr5 (1-160)||(31819732-31819891)
chr5 (1-198)||(32589586-32589783)
chr5 (1-160)||(6880984-6881143)
chr5 (1-198)||(3796186-3796383)
chr5 (1-198)||(13318137-13318334)
chr5 (1-198)||(18494079-18494276)
chr5 (1-198)||(25206941-25207139)
chr5 (1-198)||(25271097-25271295)
chr5 (5-198)||(11330287-11330480)
chr5 (1-198)||(30175121-30175318)
chr5 (1-160)||(37351975-37352134)
chr5 (2-147)||(24976528-24976673)
chr5 (1-160)||(9324154-9324314)
chr5 (1-160)||(26487064-26487224)
chr5 (1-160)||(33881797-33881956)
chr5 (1-160)||(12138853-12139012)
chr5 (4-147)||(24608929-24609072)
chr5 (1-160)||(28953106-28953265)
chr5 (1-160)||(37745660-37745819)
chr5 (1-147)||(9544039-9544185)
chr5 (1-147)||(23726921-23727067)
chr5 (1-198)||(5644453-5644650)
chr5 (1-198)||(13435980-13436177)
chr5 (1-142)||(22992452-22992593)
chr5 (1-198)||(28655898-28656095)
chr5 (3-142)||(23632659-23632798)
chr5 (1-160)||(30158711-30158870)
chr5 (1-160)||(34623190-34623349)
chr5 (2-147)||(30941314-30941459)
chr5 (1-128)||(8658804-8658931)
chr5 (1-147)||(31438141-31438287)
chr5 (32-198)||(43084907-43085073)
chr5 (1-142)||(18121745-18121886)
chr5 (1-198)||(18368841-18369038)
chr5 (1-147)||(15652072-15652218)
chr5 (1-147)||(24730653-24730799)
chr5 (1-142)||(11556043-11556184)
chr5 (1-114)||(13180128-13180241)
chr5 (1-147)||(2517749-2517895)
chr5 (1-147)||(33299220-33299366)
chr5 (1-128)||(41681408-41681537)
chr5 (1-147)||(33784166-33784312)
chr5 (1-147)||(37664815-37664961)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (1-198)||(24334786-24334983)
chr3 (1-198)||(17978403-17978600)
chr3 (1-198)||(18231802-18231999)
chr3 (1-198)||(10649681-10649877)
chr3 (1-198)||(16422794-16422992)
chr3 (1-198)||(6536195-6536392)
chr3 (1-160)||(28109415-28109575)
chr3 (4-198)||(15886195-15886390)
chr3 (1-198)||(19701004-19701202)
chr3 (1-198)||(29658419-29658616)
chr3 (1-198)||(47030066-47030263)
chr3 (2-198)||(4690262-4690459)
chr3 (1-198)||(5602765-5602962)
chr3 (1-198)||(51788632-51788829)
chr3 (1-198)||(5020321-5020518)
chr3 (1-198)||(5589808-5590005)
chr3 (1-198)||(28345781-28345978)
chr3 (1-160)||(5717703-5717862)
chr3 (1-160)||(5728613-5728772)
chr3 (1-160)||(5763596-5763755)
chr3 (1-147)||(18285831-18285977)
chr3 (1-147)||(18301132-18301278)
chr3 (1-198)||(20570308-20570505)
chr3 (1-198)||(31957908-31958105)
chr3 (1-198)||(32297241-32297438)
chr3 (2-142)||(8282936-8283076)
chr3 (1-198)||(16617942-16618141)
chr3 (1-147)||(4728265-4728411)
chr3 (1-147)||(5658773-5658919)
chr3 (1-147)||(6208534-6208680)
chr3 (1-147)||(11103836-11103982)
chr3 (1-147)||(22381055-22381201)
chr3 (1-147)||(29142229-29142375)
chr3 (1-147)||(31029718-31029864)
chr3 (1-147)||(35887399-35887545)
chr3 (1-180)||(15367870-15368051)
chr3 (1-198)||(16404244-16404441)
chr3 (1-142)||(18337268-18337409)
chr3 (1-149)||(22864316-22864464)
chr3 (1-149)||(22879375-22879523)
chr3 (1-147)||(4340151-4340297)
chr3 (1-147)||(5473628-5473774)
chr3 (1-147)||(18057907-18058053)
chr3 (1-160)||(17970332-17970492)
chr3 (4-147)||(4790109-4790252)
chr3 (1-198)||(22041016-22041215)
chr3 (1-147)||(4423557-4423703)
chr3 (1-147)||(32445791-32445937)
chr3 (1-198)||(10402762-10402959)
chr3 (1-120)||(15734591-15734710)
chr3 (1-147)||(4630420-4630566)
chr3 (1-198)||(21681330-21681527)
chr3 (3-160)||(8218273-8218430)
chr3 (1-128)||(20072693-20072820)
chr3 (1-160)||(28027919-28028078)
chr3 (1-128)||(48472590-48472717)
chr3 (1-157)||(18249369-18249525)
chr3 (33-147)||(7079867-7079981)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (1-198)||(20333828-20334026)
chr1 (1-198)||(20467433-20467631)
chr1 (1-198)||(51644872-51645069)
chr1 (1-198)||(16201442-16201640)
chr1 (1-198)||(10951742-10951939)
chr1 (4-198)||(21891164-21891359)
chr1 (1-198)||(28591731-28591928)
chr1 (1-147)||(14692328-14692474)
chr1 (1-147)||(14695010-14695156)
chr1 (1-147)||(14697694-14697840)
chr1 (1-198)||(3647797-3647994)
chr1 (1-137)||(14700375-14700511)
chr1 (1-160)||(41786745-41786903)
chr1 (1-147)||(10969344-10969490)
chr1 (1-128)||(28156425-28156552)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (1-198)||(419-617)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-198)||(14590-14787)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (1-198)||(25981-26179)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (1-198)||(2305-2502)
scaffold0322 (1-198)||(12697-12896)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (22-180)||(27959-28118)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-198)||(2588-2785)
scaffold0159 (72-198)||(18456-18582)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (1-198)||(10566-10764)
scaffold0143 (2-147)||(33971-34116)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (4-147)||(24388-24531)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-173)||(16249-16421)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-160)||(8352-8511)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (2-147)||(4028-4173)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (1-142)||(9072-9214)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (2-147)||(40032-40181)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-147)||(12715-12861)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (81-147)||(6741-6807)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26509003 - 26509200
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509003 tagtggctcgtgctacattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 26509102  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  26509103 acttgctgggggtagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagatatcgcatctgtggt 26509200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16443299 - 16443497
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  16443299 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggagccatggctgagggcaggtagctatgca 16443398  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  16443399 acttgctggggatagaatctcggaagactctgctggggataatgccgtcattgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtggatgttgcatctgtggt 16443497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26663206 - 26663403
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  26663206 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 26663305  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  26663306 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 26663403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26678398 - 26678595
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  26678398 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 26678497  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  26678498 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 26678595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16048154 - 16047956
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16048154 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataaagtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 16048055  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  16048054 acttgctggggatagaatctcggaagactctgttggggataatgccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggtgtactgtggatgtcacatttgtggt 16047956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 31083917 - 31084115
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31083917 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaaca 31084016  T
Q  101 acttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  31084017 acttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatgtcagcgctgggtatgtcgtagatatcgcatctgtggt 31084115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 198
Target Start/End: Original strand, 16511749 - 16511941
Alignment:
Q  7 ctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgc 106  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  16511749 ctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgc 16511848  T
Q  107 tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||    
T  16511849 tggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccgtcattgccgggcatttcagtgctggatgtatcgtggatgtcgcatctgtggt 16511941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26442086 - 26441889
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||    
T  26442086 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgca 26441987  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  26441986 acttgctggggatagaatcttgagagaccccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtactgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 26441889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26519649 - 26519452
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||  ||    
T  26519649 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgca 26519550  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| || |||||||||||    
T  26519549 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 26519452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45394061 - 45393864
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  45394061 tagtggctcatgctatattacacattcttgggaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 45393962  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    |||| | ||||||||||||||    
T  45393961 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtcctgggtaagttgtaaacatcgcatctgtggt 45393864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 16744814 - 16744986
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  16744814 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgacggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 16744913  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggt 173  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16744914 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggt 16744986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11447730 - 11447533
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||  ||    
T  11447730 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgca 11447631  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    |||||| || |||||||||||    
T  11447630 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgccgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 11447533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 26313157 - 26313317
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  26313157 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaaca 26313256  T
Q  101 acttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26313257 acttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcat 26313317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 4138539 - 4138736
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||  ||    
T  4138539 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggcaggtatgca 4138638  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    |||| | ||||||||||||||    
T  4138639 acttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtactgggtaagttgtaaacatcgcatctgtggt 4138736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24585830 - 24586027
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||    
T  24585830 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgaaggcaggtagatatgca 24585929  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    |||| | ||||||||||||||    
T  24585930 acttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtactgggtaagttgtaaacatcgcatctgtggt 24586027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26268380 - 26268576
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| || ||  ||    
T  26268380 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaccta-ggctgagggcaggcaggtatgca 26268478  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  26268479 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtactgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 26268576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 31557698 - 31557858
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||| |||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31557698 tagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatggcgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtaaaca 31557797  T
Q  101 acttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31557798 acttgcttggggatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcat 31557858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4206217 - 4206058
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||  ||    
T  4206217 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgccggaaccatggccgagggcaggtaggtatgca 4206118  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4206117 acttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcat 4206058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5154904 - 5154758
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5154904 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 5154805  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  5154804 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 5154758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10848426 - 10848228
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||| |||| || | |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |     
T  10848426 tagtggctcgcgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggttgctacgcg 10848327  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||    
T  10848326 acttgctggggacagaatctcggaagactctgctggagataatgccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggtgtactgtggatgttgcatatgtggt 10848228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26596498 - 26596338
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaacca-tggctgagggcaggtagctaatc 99  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||  |    
T  26596498 tagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaatagctgagggcaggtagatatgc 26596399  T
Q  100 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  26596398 aacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcat 26596338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2780065 - 2779919
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  2780065 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgca 2779966  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  2779965 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 2779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31130738 - 31130579
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaacc-atggctgagggcaggtagctaatc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  31130738 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccaatggctgagggcaggtagctatgc 31130639  T
Q  100 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  31130638 aacttgctggggatagaatcttgagagactttactgggga-aatgccgttgtgctgggcat 31130579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 10910247 - 10910390
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10910247 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaact 10910346  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  10910347 tgctgaggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 10910390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3452072 - 3451926
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  3452072 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccaaggctgagggcaggtaggtatgca 3451973  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  3451972 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 3451926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5165205 - 5165059
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  5165205 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgca 5165106  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | ||| ||||||| ||||    
T  5165105 acttgctggggatagagtcttgggagactctactagggataatgccg 5165059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 11418097 - 11418243
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  11418097 tagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgca 11418196  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  11418197 acttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 11418243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2161392 - 2161247
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  2161392 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggca-gtagctatgca 2161294  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  2161293 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 2161247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22148709 - 22148563
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  ||    
T  22148709 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgca 22148610  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22148609 actggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22148563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22152936 - 22152790
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  ||    
T  22152936 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgca 22152837  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22152836 actggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22152790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22208851 - 22208705
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  ||    
T  22208851 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgca 22208752  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22208751 actggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22208705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 39206458 - 39206585
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  39206458 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgca 39206557  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39206558 acttgctgaggatagaatcttgggagac 39206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45738122 - 45737995
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  45738122 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgca 45738023  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45738022 atttgctggggatagaatcttgggagac 45737995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 5140631 - 5140828
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  | | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |    
T  5140631 tagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcattgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgta 5140730  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||| | |||||  |||| | |  ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  5140731 acttgctggggataaagtcttgagagactccaacggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcaatgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 5140828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Original strand, 27623108 - 27623274
Alignment:
Q  32 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 131  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623108 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccagaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 27623207  T
Q  132 actggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  27623208 actggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagatatcgcatctgtggt 27623274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 30551358 - 30551555
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  30551358 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgca 30551457  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  30551458 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 30551555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 34457864 - 34458061
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  34457864 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 34457963  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  34457964 acttgctggagatagagtcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacatcgcatctgtggt 34458061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Original strand, 27283763 - 27283929
Alignment:
Q  32 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 131  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  27283763 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttactggggatagaattctggaagacccg 27283862  T
Q  132 actggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||    
T  27283863 actggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtacgtcgtagatatcgcatctatggt 27283929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28214289 - 28214092
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28214289 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctataca 28214190  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||    
T  28214189 acttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacatcgcatctgtggt 28214092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27064322 - 27064125
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||  |     
T  27064322 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggctgagggcaggcaagtatgcg 27064223  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  | |||| || |||||||||||    
T  27064222 acttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttatagacattgcatctgtggt 27064125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 22928236 - 22928431
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22928236 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacatcgttgggagatgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaact 22928335  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt-tatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||   ||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  22928336 tgctggggatagaatctcggaagactctactagggataatgccgtcgttgccgggcatttcagtgccgggtgtaccgtggatgtcgcatctatggt 22928431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27209720 - 27209574
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27209720 tagtggctcgtgctagattacatattccagtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 27209621  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  27209620 acttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 27209574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 27239508 - 27239654
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27239508 tagtggctcgtgctagattacatattccagtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 27239607  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  27239608 acttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 27239654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29579855 - 29579658
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |   ||    
T  29579855 tagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtgtgca 29579756  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  29579755 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggagaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 29579658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 4539137 - 4539296
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  4539137 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 4539236  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4539237 acttgctggggatagaatctcgagagactttactggggataatgccgttgtgctgggcat 4539296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16756642 - 16756496
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16756642 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 16756543  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  16756542 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 16756496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 24299140 - 24299285
Alignment:
Q  2 agtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaa 101  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24299140 agtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaa 24299239  T
Q  102 cttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24299240 cttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24299285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24870526 - 24870402
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24870526 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaact 24870427  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  24870426 tgctggggatagaatctcggaagac 24870402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 13517572 - 13517731
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||  ||    
T  13517572 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgca 13517671  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  13517672 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcat 13517731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29508242 - 29508096
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |    
T  29508242 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgta 29508143  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||    
T  29508142 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataacgccg 29508096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 33369808 - 33369954
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  33369808 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 33369907  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  33369908 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 33369954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4779732 - 4779563
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| || ||  ||    
T  4779732 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgca 4779633  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctg 170  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4779632 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctg 4779563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27355461 - 27355658
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  27355461 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgca 27355560  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |||||| || |||||||||||    
T  27355561 acttgctggggatagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 27355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 15405909 - 15406028
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15405909 tagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgca 15406008  T
Q  101 acttgctggggatagaatct 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15406009 acttgctggggatagaatct 15406028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 15417696 - 15417815
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15417696 tagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgca 15417795  T
Q  101 acttgctggggatagaatct 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15417796 acttgctggggatagaatct 15417815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27201018 - 27200859
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||| |||| |||| || ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27201018 tagtggctcgagctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 27200919  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  27200918 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacaccgttgtgctgggcat 27200859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 27248215 - 27248374
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||| |||| |||| || ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27248215 tagtggctcgagctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 27248314  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  27248315 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacaccgttgtgctgggcat 27248374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 14138779 - 14138925
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  14138779 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 14138878  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  14138879 actcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 14138925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27031839 - 27031701
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  27031839 tggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaact 27031740  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 142  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||    
T  27031739 tgctggggataggatctcggaagactctactgggaataa 27031701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4764583 - 4764442
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  4764583 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 4764484  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||    
T  4764483 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataa 4764442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26666015 - 26666212
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||  || || ||  ||    
T  26666015 tagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgca 26666114  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| || |||||||||||    
T  26666115 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 26666212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26771986 - 26772183
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||  || || ||  ||    
T  26771986 tagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgca 26772085  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| || |||||||||||    
T  26772086 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 26772183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27025963 - 27025822
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||  ||    
T  27025963 tagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagttatgca 27025864  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||    
T  27025863 acttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataa 27025822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26792637 - 26792491
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  26792637 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 26792538  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  26792537 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 26792491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26927573 - 26927427
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  26927573 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccaaggctgaggatagatagctaatca 26927474  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||| |||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  26927473 actcgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 26927427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27014545 - 27014399
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |     
T  27014545 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcg 27014446  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  27014445 actcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 27014399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16680980 - 16680783
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |    
T  16680980 tagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgta 16680881  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  16680880 acttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcaatgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 16680783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27491960 - 27491800
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||| |||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27491960 tagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggaccatggctgagggcaggtaggtaaaca 27491861  T
Q  101 acttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27491860 acttgcttggggatagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgttgtgctgggcat 27491800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4532115 - 4531956
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  4532115 tagtggctcgagctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggctggtagctatgca 4532016  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4532015 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccgttgtgctgggcat 4531956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 13292323 - 13292470
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag-ctaatc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||  |    
T  13292323 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagtctatgc 13292422  T
Q  100 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  13292423 aacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 13292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 16937384 - 16937554
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  | | || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||        
T  16937384 tagtggctcgtgctatattacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtg 16937483  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgg 171  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16937484 acttgctggggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgg 16937554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 26109779 - 26109928
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgtt-gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatc 99  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  26109779 tagtggctcgtgctatgttacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 26109878  T
Q  100 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||| ||||||    
T  26109879 aacttgctggggatagaatctcgagagactttactggggataatgccgtt 26109928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29556377 - 29556231
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||    
T  29556377 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctttttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagataggcatgca 29556278  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  29556277 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 29556231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 8899055 - 8899252
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |    
T  8899055 tagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgta 8899154  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||    |||||| || |||||||||||    
T  8899155 acttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccattgtgttgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 8899252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28167315 - 28167188
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  28167315 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgca 28167216  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28167215 acttgctggggatagagtcttgggagac 28167188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 20131341 - 20131252
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagg 90  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20131341 tagtggctcgtgctatatcacacattcctggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcagg 20131252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 22201529 - 22201618
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagg 90  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22201529 tagtggctcgtgctatatcacacattcctggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcagg 22201618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29836171 - 29835974
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  29836171 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 29836072  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  29836071 acttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 29835974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 28355326 - 28355523
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  28355326 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 28355425  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  28355426 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 28355523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 12086102 - 12086299
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  12086102 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctataca 12086201  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||    
T  12086202 acttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacatcgcatctgtggt 12086299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22139736 - 22139538
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  22139736 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctataca 22139637  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||| | | | |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  22139636 acttgctggggacagaatctcggaagactctactggggataatgtcgtcattaccgggcatttcagtgccgggtgtaccgtggatgtcgcatctgtggt 22139538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19694935 - 19694740
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19694935 tggctcgtgttatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaact 19694836  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||||    
T  19694835 tgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccgtcattgccgggcatttcagtgctggatgtaccgtggatgtcgcatctatggt 19694740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 22074302 - 22074500
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22074302 tagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgca 22074401  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  22074402 acttgctggggatagaatctcggaagactctgctggagataatgccgtcatcgctgggcatttaagtgttgggtgtactgtggatgttgcatctgtggt 22074500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19681304 - 19681107
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||  ||    
T  19681304 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgca 19681205  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| || |||||||||||    
T  19681204 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 19681107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 31483245 - 31483442
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  31483245 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 31483344  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  31483345 atttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtactgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 31483442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 19654719 - 19654914
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  19654719 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaact 19654818  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||| ||||| | | | |||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||    
T  19654819 tgctggggatagaatctcggaaggctctactgggaataatgccgtcattaccgggcatttcagtgccgggtgtatcgtggatgtcgcatctgtggt 19654914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33265568 - 33265371
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  33265568 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaaatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 33265469  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  33265468 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcaaagctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 33265371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16260757 - 16260562
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  16260757 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaact 16260658  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||| ||||| | | | |||||||||||||  |||||||  || ||| |||||||||||||    
T  16260657 tgctggggatagaatctcggaaggctctactgggaataatgccgtcattaccgggcatttcagtgtcgggtgtatcgtggatgtcgcatctgtggt 16260562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 2130658 - 2130804
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  2130658 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgca 2130757  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  2130758 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 2130804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15774396 - 15774250
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  15774396 tagtggctcgtgctacattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgca 15774297  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  15774296 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 15774250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33249185 - 33249039
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  33249185 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagctatgca 33249086  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  33249085 acttgctggggatagaatcttggaagactctactgggaataatgccg 33249039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18716304 - 18716177
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18716304 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 18716205  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18716204 acttgctggggatagaatcttgggagac 18716177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18797531 - 18797404
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18797531 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 18797432  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18797431 acttgctaaggatagaatcttgggagac 18797404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31361377 - 31361179
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  31361377 tagtggctcgtgctatattacacattctcggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 31361278  T
Q  101 acttgct-ggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||| ||||||| | |||||  |||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  31361277 acttgctgggggataaagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcaacgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 31361179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44567797 - 44567631
Alignment:
Q  32 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||       
T  44567797 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagacttt 44567698  T
Q  132 actggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  44567697 actggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcaaagctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 44567631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14569976 - 14569836
Alignment:
Q  2 agtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaa 101  Q
    |||||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14569976 agtggctcgtgctatactacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaa 14569877  T
Q  102 cttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 142  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  14569876 ctcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataa 14569836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 21341560 - 21341702
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21341560 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 21341659  T
Q  101 acttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 142  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  21341660 acttgcttgaggatagaatctcggaagactctactgggaataa 21341702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 19201757 - 19201917
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||    
T  19201757 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacagctgagggcaggtaactaaaca 19201856  T
Q  101 acttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19201857 acttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcat 19201917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 27602305 - 27602449
Alignment:
Q  3 gtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaac 102  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  27602305 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagctgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaac 27602404  T
Q  103 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||  |||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  27602405 ttgctaaggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 27602449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 120
Target Start/End: Original strand, 19910558 - 19910676
Alignment:
Q  2 agtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaa 101  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  19910558 agtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaa 19910657  T
Q  102 cttgctggggatagaatct 120  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  19910658 cttgctgaggatagaatct 19910676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 9361451 - 9361282
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||   |    
T  9361451 tagtggctcgtgctatattacacattcttgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgg-accatagctgagggccggtaggtatgta 9361353  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgg 171  Q
    ||| |||||||||||| |||||  |||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9361352 actggctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgg 9361282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1907122 - 1906924
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  1907122 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgca 1907023  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1907022 acttgctggggatagaatctcggaaggctctactggggataatgccgtcattgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtggatgtcgcatctgtggt 1906924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 54840245 - 54840048
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  54840245 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 54840146  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  54840145 acttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 54840048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15234673 - 15234475
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  15234673 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgca 15234574  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  15234573 acttgctggggatagaatctcggaagactctgctggggataatgccgtcatcgctgggcattttagtgctgggtgtactgtggatgttgcatctgtggt 15234475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21976558 - 21976361
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  21976558 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgca 21976459  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  21976458 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 21976361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20331846 - 20332043
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  20331846 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 20331945  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  20331946 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 20332043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 31119921 - 31120118
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  31119921 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgca 31120020  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||| | || |||||||||||    
T  31120021 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtaaacattgcatctgtggt 31120118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5012735 - 5012538
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  5012735 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtaggtatgca 5012636  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  5012635 acttgctggggatagaatcttgagagacccgactggggataacaccattgtgctgggcatgtcagcgctgggtatgtcgtagatatcgcatctgtggt 5012538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24585782 - 24585980
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  24585782 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgca 24585881  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  24585882 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccgtcattgccgggcatttcagtgctgggtatgttgtagatatcgcatctgtggt 24585980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15379649 - 15379847
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15379649 tagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgca 15379748  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  15379749 acttgctggggatagaatctcggaagactctgctggagataatgccgtcatcgctgggcattttagtgttgggtgtactgtggatgttgcatctgtggt 15379847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 33667212 - 33667409
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||  ||    
T  33667212 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgca 33667311  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| || |||||||||||    
T  33667312 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 33667409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 40099044 - 40099241
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  40099044 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 40099143  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  40099144 acttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 40099241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30760618 - 30760421
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||  ||    
T  30760618 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgca 30760519  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| || |||||||||||    
T  30760518 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 30760421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 27156737 - 27156896
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  27156737 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 27156836  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  27156837 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcat 27156896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 14752927 - 14753073
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  14752927 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 14753026  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  14753027 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 14753073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17019882 - 17019737
Alignment:
Q  2 agtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaa 101  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  17019882 agtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaa 17019783  T
Q  102 cttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  17019782 cttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 17019737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14671841 - 14671717
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  14671841 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaact 14671742  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  14671741 tgctggggatagaatctcggaagac 14671717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15276037 - 15276235
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  15276037 tagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgttgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcg 15276136  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |  || | |||||  |||| || ||| |||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  15276137 acttgctggggacagaatctcggaagactccgctagagataataccgtcatcgctaggcatttcagtgttaggtgtactgtggatgttgcatctgtggt 15276235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 5701383 - 5701224
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  5701383 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgca 5701284  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||| || |||||| ||||||||||    
T  5701283 acttgctggagatagaatcttggaagactttaccggggacaatgccgttgtgctgggcat 5701224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6576691 - 6576544
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctcttt-ggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  6576691 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctcttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaagtatgc 6576592  T
Q  100 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  6576591 aacttgctggggatagaatctcggaagactccactggggataatgccg 6576544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 36323748 - 36323894
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  36323748 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgca 36323847  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  36323848 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 36323894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 36337957 - 36338103
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  36337957 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgca 36338056  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  36338057 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 36338103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14105398 - 14105201
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||   |    
T  14105398 tagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggtcggtaggtatgta 14105299  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||| || |||||||||||    
T  14105298 acttgctggggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctggatatgttgtagacattgcatctgtggt 14105201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39857469 - 39857342
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  39857469 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaattcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 39857370  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39857369 acttgctggggatagaatctcggaagac 39857342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 18794054 - 18794208
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |    
T  18794054 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgta 18794153  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctggg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| ||||||||| |||||||    
T  18794154 acttgctggggatagagtcttg--agactccaccggggaaaacgccgttgtgctggg 18794208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 34182368 - 34182515
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  34182368 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgca 34182467  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 148  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||| |||||    
T  34182468 acttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataatgccgt 34182515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24119496 - 24119349
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattc-ctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||  |    
T  24119496 tagtggctcgtgctatattacacattctcggaaaatcctctttggagatgacatcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccagtagatatgc 24119397  T
Q  100 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24119396 aacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24119349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 21696588 - 21696786
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21696588 tagtggctcgtgcaatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 21696687  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21696688 acttgctggggatagaatctcggaaggctctactggggataatgccgtcattgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtggatgtcgcatctgtggt 21696786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3789286 - 3789089
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3789286 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 3789187  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  3789186 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 3789089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 13930010 - 13930207
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13930010 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaaca 13930109  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  13930110 acttgctggagatagaatcttgggagacctgactggggagaacgccgttgtgctgggcatttcagtgttgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 13930207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19409883 - 19410080
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19409883 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 19409982  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  19409983 tcttgctggggatagaatcttggaagaccccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 19410080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37932220 - 37932023
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  37932220 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 37932121  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  37932120 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 37932023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39896912 - 39896715
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  39896912 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 39896813  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||    
T  39896812 acttgctggggatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtggatatcgcatctgtggt 39896715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27397178 - 27396980
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27397178 tagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 27397079  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  27397078 acttgctggggatagaatctcggaagactccgctggggataatgccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggtgtactgtggatgttgcatctgtggt 27396980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16822737 - 16822934
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  16822737 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgca 16822836  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  16822837 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 16822934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16898743 - 16898546
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  16898743 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgca 16898644  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  16898643 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 16898546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 21670572 - 21670769
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  21670572 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 21670671  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  21670672 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 21670769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 34268322 - 34268520
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34268322 tagtggctcgtgctatgttacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 34268421  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || || | ||| | ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  34268422 acttgctggggatagaatctcggaagactctactggggataatgctgtcattgccgagcatttcagtgctgggtgtaccgtggatgtcgcacctgtggt 34268520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16168321 - 16168124
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  16168321 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 16168222  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  16168221 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 16168124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27810546 - 27810349
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  27810546 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 27810447  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  27810446 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 27810349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32056595 - 32056398
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  32056595 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgca 32056496  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  32056495 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 32056398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34297992 - 34297795
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  34297992 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 34297893  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  34297892 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 34297795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 254051 - 254248
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  254051 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatataca 254150  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  254151 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctggacatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 254248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 9343386 - 9343583
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  9343386 tagtgactcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 9343485  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  9343486 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 9343583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 37679297 - 37679494
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  37679297 tagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 37679396  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  37679397 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 37679494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 37694562 - 37694759
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  37694562 tagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 37694661  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  37694662 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 37694759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 37945264 - 37945461
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  37945264 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 37945363  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  37945364 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgttgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 37945461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 22921543 - 22921740
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  22921543 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 22921642  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  22921643 acttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 22921740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34868477 - 34868280
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||  ||    
T  34868477 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgca 34868378  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| || |||||||||||    
T  34868377 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 34868280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 11628584 - 11628756
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  11628584 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 11628683  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11628684 acttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctaggcatttcagtgctgggt 11628756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12593657 - 12593460
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||    
T  12593657 tagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgca 12593558  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  12593557 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 12593460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19449811 - 19450010
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc-taatc 99  Q
    |||||||||| |||| || | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  19449811 tagtggctcgcgctatatcacacattcttagaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgc 19449910  T
Q  100 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19449911 aacttgctggggatagaatctcggaagactccgctggagataataccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggtgtactgtggatgtcgcatctgtggt 19450010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23117617 - 23117471
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23117617 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggaggcgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 23117518  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  23117517 acttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 23117471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 39045281 - 39045479
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  39045281 tagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 39045380  T
Q  101 ac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| | |  |||||| || |||||||||||    
T  39045381 actttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcattccagtgctggatatgttgtagacattgcatctgtggt 39045479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20844733 - 20844590
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20844733 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcatctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaact 20844634  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  20844633 tgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 20844590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28889075 - 28888929
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28889075 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgca 28888976  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  28888975 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 28888929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31883114 - 31882955
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  31883114 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgca 31883015  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||| || |||||| ||||||||||    
T  31883014 acttgctggagatagaatcttggaagactttaccggggacaatgccgttgtgctgggcat 31882955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 27427875 - 27428000
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaat-caac 102  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27427875 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcttatgcaac 27427974  T
Q  103 ttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||    
T  27427975 ttgctggggacagaatctcggaagac 27428000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27783066 - 27782869
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |    
T  27783066 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgatgtcgttggtagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgta 27782967  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||| || |||||| ||||    
T  27782966 acttgctggggatagaatcttgagagactccactgggaaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtactgggtatgttgtagacattgcatctatggt 27782869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12662311 - 12662165
Alignment:
Q  2 agtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaa 101  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  12662311 agtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaa 12662212  T
Q  102 cttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  12662211 cttgcttgaggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 12662165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37384498 - 37384371
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  37384498 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaattcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 37384399  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37384398 acttgctggggatagaatctcggaagac 37384371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 12710023 - 12710169
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |     
T  12710023 tagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcc 12710122  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  12710123 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 12710169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40240366 - 40240169
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |    
T  40240366 tagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgta 40240267  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||  | || | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  40240266 acttgctggggatagagtcttgagacactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcaatgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 40240169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27123343 - 27123216
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  27123343 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgca 27123244  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27123243 acttgctggggatagaatcttgggagac 27123216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 34161684 - 34161525
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||  ||    
T  34161684 tagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgca 34161585  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||| || |||||||    
T  34161584 acttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgttgggcat 34161525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 31868208 - 31868354
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||   |    
T  31868208 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtaggtatgaa 31868307  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  31868308 acttgatggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 31868354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15752169 - 15752366
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15752169 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 15752268  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  15752269 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 15752366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30036276 - 30036079
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30036276 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 30036177  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  30036176 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 30036079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22895257 - 22895059
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  22895257 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagatagctatgca 22895158  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22895157 acttgctggggatagaatctcggaagactctactggggatgatgccatcattgttgggcatttcagtgctgggtgtactgtggatattgcatctgtggt 22895059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33523234 - 33523037
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  33523234 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgca 33523135  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  33523134 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 33523037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23898723 - 23898527
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23898723 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaact 23898624  T
Q  104 tgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  23898623 tgcttggggatagaatctcggaagactctactggggataatgccgtcattgccgggcatttcagtgccgggtgtaccgtggatgtcgcatctgtggt 23898527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37761824 - 37761627
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  37761824 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctgtgca 37761725  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  37761724 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 37761627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 40466860 - 40467057
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  40466860 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 40466959  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  40466960 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 40467057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 31819732 - 31819891
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  31819732 tagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 31819831  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31819832 acttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgttgtgctgggcat 31819891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 32589586 - 32589783
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  32589586 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatataca 32589685  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  32589686 acttgctggagatagaatcttgggagacctgactggggagaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 32589783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6881143 - 6880984
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  6881143 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 6881044  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6881043 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataacgccgttgtgctgggcat 6880984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3796383 - 3796186
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||  ||    
T  3796383 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgca 3796284  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||  ||||||||||    
T  3796283 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacatttcatctgtggt 3796186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 13318137 - 13318334
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| || ||  ||    
T  13318137 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgca 13318236  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  13318237 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagatatcgcatctgtggt 13318334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 18494079 - 18494276
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||    
T  18494079 tagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggccagtagctatgca 18494178  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  18494179 acttgctggggatagaatcttgggagactctaccggggaaaacgccgttgtgctgagcatttcaatgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 18494276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25207139 - 25206941
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  25207139 tagtggctcgtgctacattacacattcctgggaatcctctttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgca 25207040  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| | ||| | ||| |||||||||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  25207039 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgaggataatgtcgtcactgccgggcatttcaatgccgggtgtaccgtggatgtcgcatctgtggt 25206941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25271295 - 25271097
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  25271295 tagtggctcgtgctacattacacattcctgggaatcctctttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgca 25271196  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| | ||| | ||| |||||||||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  25271195 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgaggataatgtcgtcactgccgggcatttcaatgccgggtgtaccgtggatgtcgcatctgtggt 25271097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11330480 - 11330287
Alignment:
Q  5 ggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaactt 104  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |||||    
T  11330480 ggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaactt 11330381  T
Q  105 gctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  11330380 gctggggatagagtcttgagagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 11330287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30175318 - 30175121
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  30175318 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 30175219  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  30175218 acttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 30175121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 37351975 - 37352134
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  37351975 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 37352074  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37352075 acttgctggggatagaatctcgagagactttactggggataatgccgttgtgctgggcat 37352134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24976673 - 24976528
Alignment:
Q  2 agtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaa 101  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  24976673 agtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaa 24976574  T
Q  102 cttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24976573 cttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24976528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9324314 - 9324154
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  9324314 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaaca 9324215  T
Q  101 acttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9324214 acttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcat 9324154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26487224 - 26487064
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  26487224 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaaca 26487125  T
Q  101 acttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26487124 acttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcat 26487064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33881956 - 33881797
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||  ||    
T  33881956 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgca 33881857  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  33881856 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcat 33881797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12139012 - 12138853
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||  ||    
T  12139012 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgca 12138913  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12138912 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcat 12138853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24609072 - 24608929
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  24609072 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaact 24608973  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24608972 tgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24608929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 28953106 - 28953265
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28953106 tagtggctcgtgctatattacatattcttgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgca 28953205  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28953206 tcttgctggggacagaatctcggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcat 28953265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 37745660 - 37745819
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  37745660 tagtggctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 37745759  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||   |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  37745760 actcgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacaccgttgtgctgggcat 37745819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 9544039 - 9544185
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  9544039 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 9544138  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  9544139 actcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 9544185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23727067 - 23726921
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23727067 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgca 23726968  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  23726967 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 23726921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5644650 - 5644453
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  5644650 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 5644551  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||  || |||||||||  || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    |||||| || |||||||||||    
T  5644550 acttgctgtagacagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 5644453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 13435980 - 13436177
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||  ||    
T  13435980 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcattgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgca 13436079  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  13436080 acttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgttgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 13436177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 22992452 - 22992593
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22992452 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 22992551  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 142  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||    
T  22992552 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataa 22992593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28656095 - 28655898
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||  ||    
T  28656095 tagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagtcaaggctgagggcaggtaggtatgca 28655996  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| || |||||||||||    
T  28655995 ccttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 28655898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23632798 - 23632659
Alignment:
Q  3 gtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaac 102  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  23632798 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaac 23632699  T
Q  103 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  23632698 ttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataa 23632659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30158870 - 30158711
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||  ||    
T  30158870 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgaggataggtaggtatgca 30158771  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  30158770 acttgctggagatagaatcttggaagacttgactggggaaaatgccgttgtgctgggcat 30158711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 34623349 - 34623190
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||  ||    
T  34623349 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgggggcaggtaggtatgca 34623250  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34623249 acttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcat 34623190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30941459 - 30941314
Alignment:
Q  2 agtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaa 101  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  30941459 agtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaa 30941360  T
Q  102 cttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  30941359 cttgctgaggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 30941314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 8658804 - 8658931
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8658804 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgctgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 8658903  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  8658904 acttgctggaaatagaatctcggaagac 8658931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31438287 - 31438141
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||    
T  31438287 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaagtatgca 31438188  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  31438187 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 31438141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 43085073 - 43084907
Alignment:
Q  32 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  43085073 aaatcctctctggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactcc 43084974  T
Q  132 actggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  43084973 accggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 43084907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 18121745 - 18121886
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  18121745 tagtggctcgtgctatatcacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgca 18121844  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 142  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||    
T  18121845 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataa 18121886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 18368841 - 18369038
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  | | || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |    
T  18368841 tagtggctcgtgctatattacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgta 18368940  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||| || |||||||||||    
T  18368941 acttgctggggatagagccttgagagactccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctggatatgttgtagacattgcatctgtggt 18369038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 15652072 - 15652218
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  15652072 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgatgtcgttgggagacgtgtcgaaaccaaggctgagggcaggtagctatgca 15652171  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  15652172 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 15652218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24730799 - 24730653
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |     
T  24730799 tagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcc 24730700  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  24730699 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 24730653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11556184 - 11556043
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  11556184 tagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgca 11556085  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 142  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||    
T  11556084 acttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataa 11556043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 13180128 - 13180241
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  13180128 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgca 13180227  T
Q  101 acttgctggggata 114  Q
    ||| ||||||||||    
T  13180228 actcgctggggata 13180241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2517895 - 2517749
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||  ||    
T  2517895 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccacggctgagggcaggcaggtatgca 2517796  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||    
T  2517795 acttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggataatgccg 2517749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33299366 - 33299220
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||  ||    
T  33299366 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggcggagggccggtagctatgca 33299267  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| | |||||| |||| ||||    
T  33299266 acttgctggggatagaatatcgggagactctactgggaataatgccg 33299220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41681537 - 41681408
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaa--tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaat 98  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||      
T  41681537 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatgactgagggcaggtaactatg 41681438  T
Q  99 caacttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41681437 caacttgctggggatagaatctcggaagac 41681408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33784312 - 33784166
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   | ||||||| ||||||||  ||    
T  33784312 tagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaagttgagggccggtagctatgca 33784213  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  33784212 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 33784166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 37664815 - 37664961
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  || || ||  ||    
T  37664815 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccaaggctgagggtgggcaggtatgca 37664914  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||| |||||||    
T  37664915 acttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggaaaacgccg 37664961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24334983 - 24334786
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24334983 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 24334884  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  24334883 tcttgctggggatagaatcttggaagaccccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 24334786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17978403 - 17978600
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  17978403 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgca 17978502  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  17978503 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 17978600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18231999 - 18231802
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  18231999 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgca 18231900  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  18231899 tcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 18231802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10649877 - 10649681
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  10649877 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 10649778  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  10649777 acttgctggggatagaatcttggaaga-cttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 10649681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16422992 - 16422794
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  16422992 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgca 16422893  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| | ||| ||| ||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  16422892 acttgcaggggatagaatctcggaagactctactggggataatgccgtcattgccgggtattccagtgccgggtgtaccgtggatgtcgcatctgtggt 16422794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6536195 - 6536392
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6536195 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 6536294  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||| || ||||||||||||||    
T  6536295 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtactgggtacgttgtggacatcgcatctgtggt 6536392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 28109415 - 28109575
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28109415 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaaca 28109514  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagaccc-gactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28109515 acttgctggagatagaatcttggaaaaccctgactggggaaaacgccgttgtgctgggcat 28109575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 15886195 - 15886390
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  15886195 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatct 15886294  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||  || ||| |||||||||||||    
T  15886295 tgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccgtcattgccgggcatttctgtgctggatgtatcgtggatgtcgcatctgtggt 15886390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19701202 - 19701004
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  19701202 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcttctttggagataacgccattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctataca 19701103  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  19701102 acttgctggggatagaatctcggaagactctactggggataatgccgtcattgccgggcctttcagtgccgggtgtactgtggatgtcgtatctgtggt 19701004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 29658419 - 29658616
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  29658419 tagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgttggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 29658518  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  29658519 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 29658616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47030263 - 47030066
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  47030263 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 47030164  T
Q  101 ac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  47030163 actttgctggagatagaatcttggaagactccactggggaaaacgccgttgtgctgggca-ttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 47030066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4690459 - 4690262
Alignment:
Q  2 agtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaa 101  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  4690459 agtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaa 4690360  T
Q  102 cttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||  || ||| |||||||||||||    
T  4690359 cttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccgtcattgctgggcatttcagtgccggatgtatcgtggatgtcgcatctgtggt 4690262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 5602765 - 5602962
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  5602765 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 5602864  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  5602865 acttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 5602962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 51788829 - 51788632
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||  ||    
T  51788829 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgca 51788730  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| || |||||||||||    
T  51788729 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 51788632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5020518 - 5020321
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  5020518 tagtggctcgtgctatattacacattctcggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 5020419  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  5020418 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcaaagctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 5020321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 5589808 - 5590005
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  5589808 tagtgactcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtaggtatgca 5589907  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| | |  |||||| || |||||||||||    
T  5589908 acttgctagagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgcgctgggcatttcagtgctggatatgttgtagacattgcatctgtggt 5590005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28345978 - 28345781
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  28345978 tagtggctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 28345879  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  28345878 acttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 28345781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 5717862 - 5717703
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  5717862 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 5717763  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  5717762 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcat 5717703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 5728772 - 5728613
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  5728772 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 5728673  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  5728672 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcat 5728613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 5763596 - 5763755
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  5763596 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 5763695  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  5763696 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcat 5763755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 18285831 - 18285977
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  18285831 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 18285930  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  18285931 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 18285977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 18301132 - 18301278
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  18301132 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 18301231  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  18301232 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 18301278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20570308 - 20570505
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||   |    
T  20570308 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgaggaccggtaggtatgta 20570407  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  20570408 acttgctggggatagaatcttgagagactccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtactgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 20570505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 31957908 - 31958105
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  31957908 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 31958007  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  31958008 acttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacaccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 31958105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32297438 - 32297241
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||    
T  32297438 tagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgca 32297339  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || || ||||||||    
T  32297338 actcgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcctctgtggt 32297241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 8282936 - 8283076
Alignment:
Q  2 agtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaa 101  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  8282936 agtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaa 8283035  T
Q  102 cttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  8283036 cttgctggggatagaatctcggaagactctactgggtataa 8283076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16617942 - 16618141
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc-taatc 99  Q
    |||| |||||||||| || | |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  16617942 tagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgc 16618041  T
Q  100 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  16618042 aacttgctggggatagaatctcggaagactccgctggggataatgctgtcatcgctgggcatttcagtgttgggtgtactgtggatgttgcatctgtggt 16618141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4728411 - 4728265
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  4728411 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 4728312  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  4728311 acttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 4728265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5658919 - 5658773
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5658919 tagtggctcgtgctatattacaccttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 5658820  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  5658819 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 5658773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6208680 - 6208534
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6208680 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 6208581  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  6208580 acttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 6208534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 11103836 - 11103982
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  11103836 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 11103935  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  11103936 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 11103982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 22381055 - 22381201
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22381055 tagtggctcgtgctatattatactttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 22381154  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  22381155 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 22381201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 29142229 - 29142375
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29142229 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 29142328  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  29142329 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 29142375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 31029718 - 31029864
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  31029718 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggtagctatgca 31029817  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  31029818 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 31029864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35887545 - 35887399
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  35887545 tagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 35887446  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  35887445 acttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataatgccg 35887399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15368051 - 15367870
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc-taatc 99  Q
    |||||||||| |||| || | |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |    
T  15368051 tagtggctcgcgctacatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggttgagggcgggtagcatatgc 15367952  T
Q  100 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgt 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15367951 aacttgctggggatagaatctcggaagactctgctggggataatgccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggtgtactgt 15367870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16404244 - 16404441
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  16404244 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgca 16404343  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |||||| || |||||||||||    
T  16404344 acttgctggggatagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 16404441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18337409 - 18337268
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  18337409 tagtggctcgtgctatattatactttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccctggctgagggcaggtagctacgca 18337310  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||    
T  18337309 acttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataa 18337268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 22864316 - 22864464
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22864316 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 22864415  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||    
T  22864416 acttgctggggatagaatcttgggagactttactggggaaaacgccgtt 22864464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 22879375 - 22879523
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22879375 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 22879474  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||    
T  22879475 acttgctggggatagaatcttgggagactttactggggaaaacgccgtt 22879523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 4340151 - 4340297
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  4340151 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgca 4340250  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  4340251 acttgctggggatagaatcttgggagactctactggggataatgccg 4340297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5473774 - 5473628
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  5473774 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 5473675  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  5473674 actcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 5473628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18058053 - 18057907
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18058053 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgca 18057954  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  18057953 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 18057907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 17970332 - 17970492
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17970332 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacatattggaaccatggctgagggcaggtaactaaaca 17970431  T
Q  101 acttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17970432 acttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcat 17970492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 4790109 - 4790252
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  4790109 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaact 4790208  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||  |||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  4790209 tgctaaggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 4790252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22041215 - 22041016
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc-taatc 99  Q
    |||| |||||||||| || | |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  22041215 tagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgc 22041116  T
Q  100 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||  | || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  22041115 aacttgctggggatagaatctcggaagactccgctggagataatacagtcatcgctgggcatttcagtgttgggtgtactgtggatgttgcatctgtggt 22041016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4423703 - 4423557
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  4423703 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgca 4423604  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  4423603 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 4423557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32445937 - 32445791
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  32445937 tagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 32445838  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  32445837 acttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 32445791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10402959 - 10402762
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||   |    
T  10402959 tagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgggggccggtaggtatgta 10402860  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  10402859 acttgctggggatagagtcttgagagaccccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 10402762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 15734591 - 15734710
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  15734591 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggttgagggcaggtagctatgca 15734690  T
Q  101 acttgctggggatagaatct 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15734691 acttgctggggatagaatct 15734710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4630566 - 4630420
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  4630566 tagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcatgtagctatgca 4630467  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  4630466 acttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 4630420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21681527 - 21681330
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |    
T  21681527 tagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgta 21681428  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| |  | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  21681427 acttgctggggatagagtcttgagagactccgccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcaatgctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 21681330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8218430 - 8218273
Alignment:
Q  3 gtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaac 102  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |||    
T  8218430 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaac 8218331  T
Q  103 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||| |||||| |||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8218330 ttgctggagatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgttgtgctgggcat 8218273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20072820 - 20072693
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  20072820 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgca 20072721  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20072720 acttgctggggatagaatcttgggagac 20072693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28028078 - 28027919
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| ||  ||    
T  28028078 tagtggctcgtgctacattacacattcttggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtaggtatgca 28027979  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28027978 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcat 28027919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 48472717 - 48472590
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  48472717 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgca 48472618  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48472617 acttgctggggatagaatcttgggagac 48472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18249525 - 18249369
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |    
T  18249525 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgta 18249426  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctggg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| ||||||||| |||||||    
T  18249425 acttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctggg 18249369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7079981 - 7079867
Alignment:
Q  33 aatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 132  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  7079981 aatcttctctggggataacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcta 7079882  T
Q  133 ctggggataacgccg 147  Q
    ||||| |||| ||||    
T  7079881 ctgggaataatgccg 7079867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20333828 - 20334026
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  20333828 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggcaggtagctatgca 20333927  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20333928 acttgctggggatagaatctcagaagactctgctggggataatgccatcactgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtggatgtcgcatctgtggt 20334026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20467631 - 20467433
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  20467631 tagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacatatcggaaccatggctgagggtaggtagctatgta 20467532  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||    
T  20467531 acttgctggggatagaatctcggaagactctgctggggataatgccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggtgtactatggatgttgcatctgtggt 20467433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 51645069 - 51644872
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  51645069 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgca 51644970  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    |||||| || |||||||||||    
T  51644969 acttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtactgggtacgttgtagacattgcatctgtggt 51644872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16201442 - 16201640
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  16201442 tagtggctcatgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacaccgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgca 16201541  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||| | || |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16201542 acttgctgggggtagaatctcggaagactctactggggataatgtcgtcattgttgggcatttatgtgctgggtgtactgtggatgtcgcatctgtggt 16201640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10951939 - 10951742
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  10951939 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagctaaaca 10951840  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    |||| | ||||||||||||||    
T  10951839 acttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtactgggtaagttgtaaacatcgcatctgtggt 10951742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 21891164 - 21891359
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  21891164 tggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatct 21891263  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||| | | | |||||||||||||| || ||||  || ||| |||||||||||||    
T  21891264 tgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccgtcattaccgggcatttcagtgccggatgtatcgtggatgtcgcatctgtggt 21891359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28591928 - 28591731
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |    
T  28591928 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggctggtaggtatgta 28591829  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||| || |||||||||||    
T  28591828 acttgctagggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctggatatgttgtagacattgcatctgtggt 28591731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 14692328 - 14692474
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  14692328 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgca 14692427  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  14692428 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 14692474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 14695010 - 14695156
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  14695010 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgca 14695109  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  14695110 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 14695156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 14697694 - 14697840
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  14697694 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgca 14697793  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  14697794 acttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 14697840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3647994 - 3647797
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |    
T  3647994 tagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgta 3647895  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||| || || ||||||||    
T  3647894 acttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcaatgctgggtatgttgtagacattgcgtctgtggt 3647797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 14700375 - 14700511
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  14700375 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgca 14700474  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 137  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  14700475 acttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 14700511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 41786745 - 41786903
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||    
T  41786745 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggcaggtatgca 41786844  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  41786845 acttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggataatgccg-gatgctgggcat 41786903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10969490 - 10969344
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |     
T  10969490 tagtgactcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcc 10969391  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  10969390 acttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 10969344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28156552 - 28156425
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  28156552 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgca 28156453  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28156452 acttgctggggatagaatcttgggagac 28156425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 617 - 419
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  617 tagtgtctcgtgctatattacacattcccggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggttgagggcaggtagctatgca 518  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  517 acctgctggggatagaatctcggaagactctgctggggataatgccgttatcgttgggcatttcagtgctgggtgtactgtggatgttgcatctgtggt 419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14787 - 14590
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14787 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctataca 14688  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||    
T  14687 acttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacatcgcatctgtggt 14590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 25981 - 26179
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25981 tagtggctcatgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaagca 26080  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| |||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26081 acttgctggggaaagaatctcggaagactccgctggagataataccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggtgtactgtggatgttgcatctgtggt 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2502 - 2305
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||  ||    
T  2502 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccaaagctgagggcaggtagatataca 2403  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  2402 acttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgttgtgctgggcatttcagggctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 2305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12896 - 12697
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |    
T  12896 tagtggctcgtgctacattacacatccctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggccgagggcaggtagctatgaa 12797  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgact-ggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||| |  || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  12796 acttgttgcggatagaatctcggaagactctgctgggggataatgccgtcattgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtggatgttgcatctgtggt 12697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28118 - 27959
Alignment:
Q  22 acattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctggggatagaatctt 121  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  28118 acattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatataacttgctggggatagaatctc 28019  T
Q  122 ggaagacccgactggggataacgccgttat-gctgggcatttcagtgctgggtgtactgt 180  Q
    ||||||| |  |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28018 ggaagactccgctggggataatgccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggtgtactgt 27959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 2588 - 2785
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  2588 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgca 2687  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| || | |||||||||    
T  2688 acttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgtatctgtggt 2785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18582 - 18456
Alignment:
Q  72 aaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgg 171  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18582 aaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgg 18483  T
Q  172 gtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    || |  |||||| || | |||||||||    
T  18482 gtatgttgtagacattgtatctgtggt 18456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10764 - 10566
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcct-gtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  10764 tagtggctcgtgctatattacacatttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgc 10665  T
Q  100 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggtgtactgtagatatcgcatctgtggt 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |  |||||| || |||||||||||    
T  10664 aacttgctggaaatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcaaagctgggtatgttgtagacattgcatctgtggt 10566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 34116 - 33971
Alignment:
Q  2 agtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaa 101  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  34116 agtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaa 34017  T
Q  102 cttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  34016 cttgctgaggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 33971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 24388 - 24531
Alignment:
Q  4 tggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaact 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24388 tggctcgtgctatattacacattcctggaaattctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaact 24487  T
Q  104 tgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24488 tgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16421 - 16249
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   |    
T  16421 tagtggctcgtgttatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgta 16322  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcatttcagtgctgggt 173  Q
    ||| |||||||||||| |||||  |||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16321 actggctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatttcagtgctgggt 16249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 8352 - 8511
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  8352 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgca 8451  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgctgggcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||| || |||||| ||||||||||    
T  8452 acttgctggagatagaatcttggaagactttaccggggacaatgccgttgtgctgggcat 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 4028 - 4173
Alignment:
Q  2 agtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaa 101  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  4028 agtggctcgtgctatattacacattcttggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctaagggcaggtagctatgcaa 4127  T
Q  102 cttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  4128 cttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 4173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 9072 - 9214
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  9072 tagtggctcgtgctatattacacattcctggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagccatgca 9171  T
Q  101 acttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 142  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  9172 acttgcttgaggatagaatctcggaagactctactgggaataa 9214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 40032 - 40181
Alignment:
Q  2 agtggctcgtgctagattatacatt-cctgtaaa-tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctga-gggcaggtagctaat 98  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40032 agtggctcgtgctatattacacatttcctggaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggggcaggtagttaat 40131  T
Q  99 -caacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  40132 gcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 40181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12861 - 12715
Alignment:
Q  1 tagtggctcgtgctagattatacattcctgtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  12861 tagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgca 12762  T
Q  101 acttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  12761 acttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataatgccg 12715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6807 - 6741
Alignment:
Q  81 tgagggcaggtagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 147  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  6807 tgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 6741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University