View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13310_low_1 (Length: 1236)

Name: NF13310_low_1
Description: NF13310
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13310_low_1
NF13310_low_1
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (14-788)||(43562653-43563428)
chr7 (89-787)||(44955642-44956326)
chr7 (818-1220)||(43563430-43563834)
chr7 (196-398)||(26171608-26171804)
chr7 (1004-1074)||(44954914-44954984)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (89-767)||(36430576-36431256)
chr8 (1040-1220)||(36431633-36431813)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (89-464)||(43975892-43976267)
chr1 (581-776)||(43975592-43975787)
chr1 (1027-1220)||(43974741-43974934)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (216-374)||(16224928-16225083)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (292-394)||(43637824-43637926)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 719; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 719; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 788
Target Start/End: Original strand, 43562653 - 43563428
Alignment:
Q  14 gacatcatcgatagtgactgattagtaatcaacttaaacttgaaatttggtataaaaatgtgagtgaaaagaggttaccttattgaaattccaaattttg 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43562653 gacatcatcgatagtaactgattagtaatcaacttaaacttgaaatttggtataaaaatgtgagtgaaaagaggttaccttgttgaaattccaaattttg 43562752  T
Q  114 agaacagttgttttgtcaaatagagaatttttgaaaagacaatctctagtaggaagaggaaaatgtatgcatttggggattgtaccatcaggtaacacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43562753 agaacagttgttttgtcaaatagagaatttttgaaaagacaatctctagtaggaagaggaaaatgtatgcatttggggattgtaccatcaggtaacacaa 43562852  T
Q  214 gtttcttaatcaaatcaaagtcatgagagccaacactatcactcaaataaattggaccaccacaaatagctcttgaaccagcatgaaatttagcacaaac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43562853 gtttcttaatcaaatcaaagtcatgagagccaacactatcactcaaataaattggaccaccacaaatagctcttgaaccagcatgaaatttagcacaaac 43562952  T
Q  314 atggttagattggaacatgtcccaatcaggtcgaatcatttgtcccatccataagctattgtaggaacaatgaatcatgtgtacaccttgtaaccaaaaa 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43562953 atggttagattggaacatgtcccaatcaggtcgaatcatttgtcccatccataagctattgtaggaacaatgaatcatgtgtacaccttgtaaccagaaa 43563052  T
Q  414 gctcccattggatcaccattaggatcttggaaccaaaagtcgtcccctacacataaaaattgcaacctttttataaataa-cannnnnnngcttgcatat 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |       ||||||||||    
T  43563053 gctcccattggatcaccattaggatcttggaaccaaaagtcgtcccctacacataaaaattgcaacctttttgtaaataataatttttttgcttgcatat 43563152  T
Q  513 gtatgtatgaatgaataaagaaaatattaaaattcattgatcccgtgcttatatattgcttaatgcttaccaactcttcccaaggaaacttgatgtgttc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43563153 gtatgtatgaatgaataaagaaaatatcaaaattcattgatcccgtgcttatatattgcttaatgcttaccaactcttcccaacgaaacttgatgtgttc 43563252  T
Q  613 caaggaagaagaagtcgttacactgttgcatgctagcaatgattccatttccattaaaattcttagcaatggattttgtcagcccttcatagtaagcttt 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43563253 caaggaagaagaagtcgttacactgttgcatgctagcaatgattccatttccattaaaattcttagcaatggattttgtcagcccttcatagtaagcttt 43563352  T
Q  713 tgcaaggtcaactctgcctccatatttatcacacacatattcaagacactgcatacaaataaaataatgattatta 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43563353 tgcaaggtcaactctgcctccatatttatcacacacatattcaagacactgcatacaaataaaataatgattatta 43563428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 44956326 - 44955642
Alignment:
Q  89 taccttattgaaattccaaattttgagaacagttgttttgtcaaatagagaatttttgaaaagacaatctctagtaggaagaggaaaatgtatgcatttg 188  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  44956326 taccttgttgaagttccaaattttgagaacaattgttttgtcaaatagaggatatttgaaaagacagtctgtagtaggaagaggaaaatgtatgcatttt 44956227  T
Q  189 gggattgtaccatcaggtaacacaagtttcttaatcaaatcaaagtcatgagagccaacactatcactcaaataaattggaccaccacaaatagctcttg 288  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44956226 ggaattgtaccatcagggaacacgagtttcttaatcagatcaaagtcatgaaagccaacatcatcactcaaataaattggaccaccacaaatagctcttg 44956127  T
Q  289 aaccagcatgaaatttagcacaaacatggttagattggaacatgtcccaatcaggtcgaatcatttgtcccatccataagctattgtaggaacaatgaat 388  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44956126 agccagcatgaaatttagcacaaatatggtccgactgaaacatgtcccaatcaggtcgaatcatttgtcccatccataagctattataggaacaatgaat 44956027  T
Q  389 catgtgtacaccttgtaaccaaaaagctcccattggatcaccattaggatcttggaaccaaaagtcgtcccctacacataaaaattgcaacctttttata 488  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||   ||| |     
T  44956026 catgtgaacacattgtaaccaaaaagctcccattggatcaccattaggatcttggaaccaaaagtcgtcccttgcacacaaaaatcacaac---tttttg 44955930  T
Q  489 aataacannnnnnngcttgcatatgtatgtatgaatgaataaagaaaatattaaaattcattgatcccgtgcttatatattgcttaatgcttaccaactc 588  Q
    || | ||         || |||||||||||||||||||  ||| | || |  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44955929 aacaccat--------ttacatatgtatgtatgaatga--aaaaataacaacaaaattcattgatcatgtgcttgtatattgcttattgcttaccaactc 44955840  T
Q  589 ttcccaaggaaacttgatgtgttccaaggaagaagaagtcgttacactgttgcatgctagcaatgattccatttccattaaaattcttagcaatggattt 688  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  44955839 ttcccatggaaacttgctttgttccaaggaagaaaaagtcattgcactgttgcatgctagcaatgattccatttccattaaagttcttggcaatggattt 44955740  T
Q  689 tgtcagcccttcatagtaagcttttgcaaggtcaactctgcctccatatttatcacacacatattcaagacactgcatacaaataaaataatgattatt 787  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  44955739 tgttaacccttcatagtaagctttggcaaggtcaactctgcctccatatttatcacacacatattcaagacactgcata-aaaaaaaatagtgattatt 44955642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 818 - 1220
Target Start/End: Original strand, 43563430 - 43563834
Alignment:
Q  818 ttaatttgtttattcatattgcaaaaagcttacaaactcttaactggnnnnnnnnnnnnnnngtggaagaaaccaaaccaccccatcgaaattggtaccc 917  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43563430 ttaatttgtttattcatattgcaaaaagcttacagactcttaactggtttttaattttttttgtggaagaaaccaaaccaccccatcgaaattggtacct 43563529  T
Q  918 agagaattgaacacgagaccttgagatgttcac--ttcaaagtcccaagccactccacgaggcaaacccaagtgggtttctaacccgttataatattcct 1015  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43563530 agagaattgaacacgagaccttaagatgaacacacttcaaagtcccaagccactccacgaggcaaacccaagtgggtttctaaccagttataatattcct 43563629  T
Q  1016 aatagcaatgaaaaggaaaataacattagaaaactcacatgaatgacgtcaattttgactccggtgacaccagattcagcaagataagagtgtatggagt 1115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43563630 aatagcaatgaaaaggaaaataacattagaaaactcacatgaatgacgtcaattttgactccggtgacaccagattcagcaagataagagtgcatggagt 43563729  T
Q  1116 catacaagtcactggcttgattaggatcaactagcccaattgaaccttctaaaactttaaccacggcaagatcttccattgttccatcaaggccaggtga 1215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43563730 catacaagtcactggcttgattaggatcaactagcccaattgaaccttccaaaactttaaccacggcaagatcttccattgttccatcaagaccaggtga 43563829  T
Q  1216 aagtt 1220  Q
    |||||    
T  43563830 aagtt 43563834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26171804 - 26171608
Alignment:
Q  196 taccatcaggtaacacaagtttcttaatcaaatcaaagtcatgagagccaacactatcactcaaataaattggaccaccacaaatagctcttgaaccagc 295  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26171804 taccatcagggaaaacaagcttcttaatcagatcaaaggcatgagagccaacattatcattcaaataaactggaccaccacagatagctcttgaacctgc 26171705  T
Q  296 atgaaatttagcacaaacatggttagattggaacatgtcccaatcaggtcgaatcatttgtcccatccataagctattgtaggaacaatgaatcatgtgt 395  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |   | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |    
T  26171704 atgaaatttggcacaaatatgtt---actggaacatgtcccaatcaggttgaatcaattgtcccatccataagctatt---cgaacaatgaatcatgttt 26171611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1004 - 1074
Target Start/End: Complemental strand, 44954984 - 44954914
Alignment:
Q  1004 tataatattcctaatagcaatgaaaaggaaaataacattagaaaactcacatgaatgacgtcaattttgac 1074  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44954984 tatattatttctaatagctatgaaaagaaaattgaaattagaaaactcacatgaatgacatcaactttgac 44954914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 89 - 767
Target Start/End: Original strand, 36430576 - 36431256
Alignment:
Q  89 taccttattgaaattccaaattttgagaacagttgttttgtcaaatagagaatttttgaaaagacaatctctagtaggaagaggaaaatgtatgcatttg 188  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  36430576 taccttgttgaagttccagattttgaggacagaggtttggtcaaatagagggttcttgaaaaggcaatctcttgttggaaggggaaaatgtatgcactta 36430675  T
Q  189 gggattgtaccatcaggtaacacaagtttcttaatcaaatcaaagtcatgagagccaacactatcactcaaataaattggaccaccacaaatagctcttg 288  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36430676 ggaattgtaccatcagggaaaacaagcttcttaatcagatcaaagtcatgagagccaacattatcactcaaataaactggaccaccacagatagctcttg 36430775  T
Q  289 aaccagcatgaaatttagcacaaacatggttagattggaacatgtcccaatcaggtcgaatcatttgtcccatccataagctattgtaggaacaatgaat 388  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36430776 aacctgcatgaaatttggcacaaatatggtctgattggaacatgtcccaatcaggttgaatcatttgtcccatccataagctattgtaggaacaatgaat 36430875  T
Q  389 catgtgtacaccttgtaaccaaaaagctcccattggatcaccattaggatcttggaaccaaaagtcgtcccctacacataaaaa-ttgcaacctttttat 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||  ||   |    
T  36430876 catgtgtacaccttgtaaccaaaaaactcccattgaatcaccattaggatcttggaaccaaaagtcatcccctacaaaaaaaaagttgtaactattagtt 36430975  T
Q  488 aaataaca-nnnnnnngcttgcatatgtatgtatgaatgaataaagaaaatattaaaattcattgatcccgtgcttatatat---tgcttaatgcttacc 583  Q
     ||||| |        |||||||||||| || |||||| ||||   ||||||  ||| ||||||||| |  || || || ||   |||||||||||||||    
T  36430976 taataaaatattttttgcttgcatatgtgtgaatgaataaata---aaaatagcaaagttcattgatactatgtttgtacattggtgcttaatgcttacc 36431072  T
Q  584 aactcttcccaaggaaacttgatgtgttccaaggaagaagaagtcgttacactgttgcatgctagcaatgattccatttccattaaaattcttagcaatg 683  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36431073 aactctccccatggaaacttgctttgttccaaggaagaaaaagtcattgcattgttgcatgctagcaataattccacttccattgaaattcttagcaatg 36431172  T
Q  684 gattttgtcagcccttcatagtaagcttttgcaaggtcaactctgcctccatatttatcacacacatattcaagacactgcata 767  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  36431173 gattttgtcaacccttcgtaataagctttagcaaggttaactctgcctccatattcatcacaaacatatttaagagtctgcata 36431256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1040 - 1220
Target Start/End: Original strand, 36431633 - 36431813
Alignment:
Q  1040 attagaaaactcacatgaatgacgtcaattttgactccggtgacaccagattcagcaagataagagtgtatggagtcatacaagtcactggcttgattag 1139  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||| ||    
T  36431633 attagagaactcacatgaatgacatcaactttgactcctgtgacaccagattcagcaagaaaagagtgcatggaatcataaaagtcactgacatgatcag 36431732  T
Q  1140 gatcaactagcccaattgaaccttctaaaactttaaccacggcaagatcttccattgttccatcaaggccaggtgaaagtt 1220  Q
    ||| |||||||||||||| |||||  | ||  ||||| || |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36431733 gatgaactagcccaattgcacctttgacaatgttaacaacagcaagatcatgcattgtcccatcaaggccaggtgaaagtt 36431813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 89 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 43976267 - 43975892
Alignment:
Q  89 taccttattgaaattccaaattttgagaacagttgttttgtcaaatagagaatttttgaaaagacaatctctagtaggaagaggaaaatgtatgcatttg 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||    
T  43976267 taccttgttgaagttccaaattttgagaacagttttttgatcaaatagagggtttttgaaaagacaatctctagttggaagagcaaaatgtgtgcatctg 43976168  T
Q  189 gggattgtaccatcaggtaacacaagtttcttaatcaaatcaaagtcatgagagccaacactatcactcaaataaattggaccaccacaaatagctcttg 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43976167 gggattgtaccatcagggaacacaagcttcttaatcaaatcaaagtcatgagagccaacattatcactcaaataaattggaccaccacaaatagctcttg 43976068  T
Q  289 aaccagcatgaaatttagcacaaacatggttagattggaacatgtcccaatcaggtcgaatcatttgtcccatccataagctattgtaggaacaatgaat 388  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43976067 aacctgcatgatatttggcacaaatatggtctgattgaaacatgtcccaatcaggttgaatcatttgtcccatccataagctattgtaggaacaatgaat 43975968  T
Q  389 catgtgtacaccttgtaaccaaaaagctcccattggatcaccattaggatcttggaaccaaaagtcgtcccctaca 464  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| | | || ||||||||| |||||||||    
T  43975967 catgtgtagcccttgtaaccaaaaagctcccattggatcatcttcaggaccattgacccaaaagtcatcccctaca 43975892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 581 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 43975787 - 43975592
Alignment:
Q  581 accaactcttcccaaggaaacttgatgtgttccaaggaagaagaagtcgttacactgttgcatgctagcaatgattccatttccattaaaattcttagca 680  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  43975787 accagctcttcccatggaaacttgctttgttccaaggaagaaaaagtcattacattgctgcatgctagcaatgattccacttccattaaaattcttgaca 43975688  T
Q  681 atggattttgtcagcccttcatagtaagcttttgcaaggtcaactctgcctccatatttatcacacacatattcaagacactgcatacaaataaaa 776  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||    
T  43975687 atggatttagtcaacccttcatagtaagctttggcaaggtcaactctgcctccatattcatcacacacatattcaagagtctgcataacaataaaa 43975592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1027 - 1220
Target Start/End: Complemental strand, 43974934 - 43974741
Alignment:
Q  1027 aaaggaaaataacattagaaaactcacatgaatgacgtcaattttgactccggtgacaccagattcagcaagataagagtgtatggagtcatacaagtca 1126  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  43974934 aaagaaaaataaaattaaaaaactcacatgcatgacatcaactttgactcctgtgataccagattcagcaagataagagtgcatggaatcataaaagtca 43974835  T
Q  1127 ctggcttgattaggatcaactagcccaattgaaccttctaaaactttaaccacggcaagatcttccattgttccatcaaggccaggtgaaagtt 1220  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43974834 atggcttgatcaggatgaactagcccaattgcacctttgacaatgttaaccacagcaagatcttccattgttccatcaaggccaggtgaaagtt 43974741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 89; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 216 - 374
Target Start/End: Original strand, 16224928 - 16225083
Alignment:
Q  216 ttcttaatcaaatcaaagtcatgagagccaacactatcactcaaataaattggaccaccacaaatagctcttgaaccagcatgaaatttagcacaaacat 315  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  16224928 ttcttaatcagattaaaggcatgagagccaacattatcactcaaataaactggaccaccacagatagctcttgaacctgcatgaaatttggcacaaatat 16225027  T
Q  316 ggttagattggaacatgtcccaatcaggtcgaatcatttgtcccatccataagctattg 374  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||||    
T  16225028 ggtcttattggaacatgtcccaatcaggttga---atttgtcctatccataagctattg 16225083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 394
Target Start/End: Original strand, 43637824 - 43637926
Alignment:
Q  292 cagcatgaaatttagcacaaacatggttagattggaacatgtcccaatcaggtcgaatcatttgtcccatccataagctattgtaggaacaatgaatcat 391  Q
    |||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||| | || |  | ||||||||||||||| || |||| |||||| | |||    
T  43637824 cagcatgaaattcagaacaagcatgatgagattggaacatgtcccaatctggttgtataaaatttcccatccataagctgttataggcacaatgcaccat 43637923  T
Q  392 gtg 394  Q
    |||    
T  43637924 gtg 43637926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University