View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13315_low_1 (Length: 828)

Name: NF13315_low_1
Description: NF13315
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13315_low_1
NF13315_low_1
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (9-810)||(8294821-8295622)
chr6 (10-810)||(33256132-33256933)
[»] scaffold0428 (1 HSPs)
scaffold0428 (10-810)||(250-1051)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (346-725)||(905052-905428)
chr8 (309-718)||(895178-895581)
chr8 (13-170)||(894876-895033)
chr8 (13-139)||(905641-905767)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (176-335)||(46720649-46720808)
chr3 (38-132)||(46720520-46720614)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (507-618)||(10265669-10265786)
chr2 (539-618)||(10253077-10253157)
chr2 (481-571)||(10241733-10241823)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 770; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 770; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 810
Target Start/End: Original strand, 8294821 - 8295622
Alignment:
Q  9 cataggtccaaccggataaacactaggtttctctctatcttgaagaacccttatgacttccggttccaaatcagtgaaagtattcataataacaccatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8294821 cataggtccaaccggataaacactaggtttctctctatcttgaagaacccttatgacttccggttccaaatcagtgaaagtattcataataacaccatca 8294920  T
Q  109 aacaatgataatttttgacacacatcaagaattgatttgtaggcatcacttgatctttcacagataaacgggtcgggaagctctttgatatggagaggaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8294921 aacaatgataatttttgacacacatcaagaattgatttgtaggcatcacttgatctttcacagataaacgggtcgggaagctctttgatatggagaggaa 8295020  T
Q  209 tagaaaaaccaggaatatttactgtttcataacttgattctaagaactgagttgatgcagcttcatcaaggtttggaatagtgagaaataaagagaataa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295021 tagaaaaaccaggaatatttactgtttcataacttgatcctaagaactgagttgatgcagcttcatcaaggtttggaatagtgagaaataaagagaataa 8295120  T
Q  309 aacagctccagaggaaaagaaaaggtatgataaaaggttgaaatgtttagcaacatcatgtgcatcggttgaaaacatgctgaaaactaaagcaactagg 408  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295121 aacagctcctgaggaaaagaaaaggtatgataaaaggttgaaatgtttcgcaacatcatgtgcatcggttgaaaacatgctgaaaactaaagcaactagg 8295220  T
Q  409 cgagtttttgaaaggagtgattttacttcttcatgaagaaatggaatagagtgtttcactatgagtttcatctgtgttgcaggatcaagattatgtggaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295221 cgagtttttgaaaggagtgattttacttcttcataaagaaatggaatagagtgtttcactatgagtttcatctgtgttgcaggatcaagattatgtggaa 8295320  T
Q  509 ggtcttcaatgttgacttggggaagaacaatgaagttcatgtttggtggaagagtgttcaagatggattgcatggaaggagttagtggaccaagtgtggg 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295321 ggtcttcaatgttgacttggggaagaacaatgaagttcatgtttggtggaagagtgttcaagatggattgcatggaaggagttagtggaccaagtgtggg 8295420  T
Q  609 aatgaggaatgtgatatggtattcattgtgattttggagtaatagtttagcaaactcaactagtggaatcaaatggctcaatccaggtgaaggaaccata 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295421 aatgaggaatgtgatatggtattcattgtgattttggagtaatagtttagcaaactcaactagtggaatcaaatggctcaatccaggtgaaggaaccata 8295520  T
Q  709 acaatgcatgtctttttctccatgcttgtaattgaatttgagatggatgatgaaaaacaaagtatttttgtaagatggatatctcctagagatgctttta 808  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8295521 gcaatgcatgtctttttctccatgcatgtaattgaatttgacatggatgatgaaaaacaaagtatttttgtaagatggatatctcctaaagatgctttta 8295620  T
Q  809 ta 810  Q
    ||    
T  8295621 ta 8295622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 33256933 - 33256132
Alignment:
Q  10 ataggtccaaccggataaacactaggtttctctctatcttgaagaacccttatgacttccggttccaaatcagtgaaagtattcataataacaccatcaa 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  33256933 ataggtccaaccggaaaaacactaggtttctctctgtcttgaagtacccttacggcttccagttccaaattactgaaagtattgattataacaccatcaa 33256834  T
Q  110 acaatgataatttttgacacacatcaagaattgatttgtaggcatcacttgatctttcacagataaacgggtcgggaagctctttgatatggagaggaat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33256833 acaatgacgatttttgacacacatcaaggattgatttgtaggtatcacttgatctttcacagttaaacgggtctggaagctctttgacatggaaaggaat 33256734  T
Q  210 agaaaaaccaggaatatttactgtttcataacttgattctaagaactgagttgatgcagcttcatcaaggtttggaatagtgagaaataaagagaataaa 309  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33256733 agaaaaaccaggaacatttaccatttcataacttgatcctaagaactgagtagatgcagcatcatcgaggtttggaagagtgagaaagaaagagaataaa 33256634  T
Q  310 acagctccagaggaaaagaaaaggtatgataaaaggttgaaatgtttagcaacatcatgtgcatcggttgaaaacatgctgaaaactaaagcaactaggc 409  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  33256633 acagctcctgaagaaaagaaaaggtaagacaaaaggttgaaatgtttagctacatcgtgtgcatcggttgaaaacatgctgcaaactaaagcaacaaggt 33256534  T
Q  410 gagtttttgaaaggagtgattttacttcttcatgaagaaatggaatagagtgtttcactatgagtttcatctgtgttgcaggatcaagattatgtggaag 509  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33256533 tagtttttgaaagaagtgattttacttcttcatgaagaaatggaatagagtgtttcactatgagtttcatttgtgttgaaggttcaagattatgtggaag 33256434  T
Q  510 gtcttcaatgttgacttggggaagaacaatgaagttcatgtttggtggaagagtgttcaagatggattgcatggaaggagttagtggaccaagtgtggga 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33256433 gtcttcaatgttgacttggggaagaacagtgaagttcatgtttggtggaagtgtgttcaagattgattgcatggaaggagttagtggaccaagtgtggga 33256334  T
Q  610 atgaggaatgtgatatggtattcattgtgattttggagtaatagtttagcaaactcaactagtggaatcaaatggctcaatccaggtgaaggaaccataa 709  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33256333 atgaggaatgtgatatggtactcattgtgatgttggagtaatagttttgcaaactcaacttgtggaatcaaatggctcaatccaggtgaaggaaccatag 33256234  T
Q  710 caatgcatgtctttttctccatgct-tgtaattgaatttgagatggatgatgaaaaacaaagtatttttgtaagatggatatctcctagagatgctttta 808  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||||||||||||   |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  33256233 caatgcatgttttgttctccatgatatgtaattcaatttgagatggcaaatgaaaaacaagatatctttgtaagatggatatctcttgaagatggtttta 33256134  T
Q  809 ta 810  Q
    ||    
T  33256133 ta 33256132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0428 (Bit Score: 542; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0428
Description:

Target: scaffold0428; HSP #1
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 1051 - 250
Alignment:
Q  10 ataggtccaaccggataaacactaggtttctctctatcttgaagaacccttatgacttccggttccaaatcagtgaaagtattcataataacaccatcaa 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  1051 ataggtccaaccggaaaaacactaggtttctctctgtcttgaagtacccttacggcttccagttccaaattactgaaagtattgattataacaccatcaa 952  T
Q  110 acaatgataatttttgacacacatcaagaattgatttgtaggcatcacttgatctttcacagataaacgggtcgggaagctctttgatatggagaggaat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  951 acaatgacgatttttgacacacatcaaggattgatttgtaggtatcacttgatctttcacagttaaacgggtctggaagctctttgacatggaaaggaat 852  T
Q  210 agaaaaaccaggaatatttactgtttcataacttgattctaagaactgagttgatgcagcttcatcaaggtttggaatagtgagaaataaagagaataaa 309  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  851 agaaaaaccaggaacatttaccatttcataacttgatcctaagaactgagtagatgcagcatcatcgaggtttggaagagtgagaaagaaagagaataaa 752  T
Q  310 acagctccagaggaaaagaaaaggtatgataaaaggttgaaatgtttagcaacatcatgtgcatcggttgaaaacatgctgaaaactaaagcaactaggc 409  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  751 acagctcctgaagaaaagaaaaggtaagacaaaaggttgaaatgtttagctacatcgtgtgcatcggttgaaaacatgctgcaaactaaagcaacaaggt 652  T
Q  410 gagtttttgaaaggagtgattttacttcttcatgaagaaatggaatagagtgtttcactatgagtttcatctgtgttgcaggatcaagattatgtggaag 509  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  651 tagtttttgaaagaagtgattttacttcttcatgaagaaatggaatagagtgtttcactatgagtttcatttgtgttgaaggttcaagattatgtggaag 552  T
Q  510 gtcttcaatgttgacttggggaagaacaatgaagttcatgtttggtggaagagtgttcaagatggattgcatggaaggagttagtggaccaagtgtggga 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  551 gtcttcaatgttgacttggggaagaacagtgaagttcatgtttggtggaagtgtgttcaagattgattgcatggaaggagttagtggaccaagtgtggga 452  T
Q  610 atgaggaatgtgatatggtattcattgtgattttggagtaatagtttagcaaactcaactagtggaatcaaatggctcaatccaggtgaaggaaccataa 709  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  451 atgaggaatgtgatatggtactcattgtgatgttggagtaatagttttgcaaactcaacttgtggaatcaaatggctcaatccaggtgaaggaaccatag 352  T
Q  710 caatgcatgtctttttctccatgct-tgtaattgaatttgagatggatgatgaaaaacaaagtatttttgtaagatggatatctcctagagatgctttta 808  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||||||||||||   |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  351 caatgcatgttttgttctccatgatatgtaattcaatttgagatggcaaatgaaaaacaagatatctttgtaagatggatatctcttgaagatggtttta 252  T
Q  809 ta 810  Q
    ||    
T  251 ta 250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 346 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 905428 - 905052
Alignment:
Q  346 ttgaaatgtttagcaacatcatgtgcatcggttgaaaacatgctgaaaactaaagcaactaggcgagtttttgaaaggagtgattttacttcttcatgaa 445  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |  || | ||||| ||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||| || |    
T  905428 ttgaattgtttagcaacttcatgtgcatcggttgagaatagaccaaagattaaagaaacaaggttagttttggaaatgagtgattttacttcttcttgta 905329  T
Q  446 gaaatggaatagagtgtttcactatgagtttcatctgtgttgcaggatcaagatta---tgtggaaggtcttcaatgttgacttggggaagaacaatgaa 542  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||   | |||||||| ||      | ||||| ||||||||||||||    
T  905328 gaaatggaatagaatgtttcacaatgagtttcatttgtgttgcaggttcaagattaatctctggaaggtgtt------ttacttgaggaagaacaatgaa 905235  T
Q  543 gttcatgtttggtggaagagtgttcaagatggattgcatggaaggagttagtggaccaagtgtgggaatgaggaatgtgatatggtattcattgtgattt 642  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||    |||||| |||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||||| |  | |||||||||| | |    
T  905234 ttctatgtttgggggaagagtgttcaagacttgttgcattgaaggagtaagaggacaaagtgttggaatgatgaatgtgacaatgaattcattgtgttgt 905135  T
Q  643 tggagtaatagtttagcaaactcaactagtggaatcaaatggctcaatccaggtgaaggaaccataacaatgcatgtcttttt 725  Q
    || |||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  905134 tgaagtaattgtttggcaaattcaacttgtggaattaaatggctaagtccaggggaaggaaccatagcaatgtatgttttttt 905052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 309 - 718
Target Start/End: Original strand, 895178 - 895581
Alignment:
Q  309 aacagctccagaggaaaagaaaaggtatgataaaaggttgaaatgtttagcaacatcatgtgcatcggttgaaaacatgctgaaaactaaagcaactagg 408  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||  | | ||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||| | ||||| ||| |||    
T  895178 aacagctcctgaggcatagaaaaggtaagaagacaagttaaattgtttggcaacttcatatgcatctgttgaaaatatactgaagattaaagaaacaagg 895277  T
Q  409 cgagtttttgaaaggagtgattttacttcttcatgaagaaatggaatagagtgtttcactatgagtttcatctgtgttgcaggatcaagattatgtggaa 508  Q
      |||||| |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  | ||| |||    
T  895278 ttagttttggaaatgagtgatttaacttcttgttgaagaaatggaatagaatgtttcacaatgagtttcatttgtgctgcaggatcatggctttgttgaa 895377  T
Q  509 ggtcttcaatgttgacttggggaagaacaatgaagttcatgtttggtggaagagtgttcaagatggattgcatggaaggagttagtggaccaagtgtggg 608  Q
      | ||      | ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    |||||| |||||||| || |||  |||||| ||    
T  895378 tatttt------ttacttgaggaagaagaatgaagtctatgtttggtggaagattgttcaagacttgttgcattgaaggagtaagaggagaaagtgttgg 895471  T
Q  609 aatgaggaatgtgatatggtattcattgtgattttggagtaatagtttagcaaactcaactagtggaatcaaatggctcaatccaggtgaaggaaccata 708  Q
    ||||| |||||||| |  | |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  895472 aatgatgaatgtgacaatgaattcattgtgatgttgaagtaattgtttggcaaattcaacttgtggaattaaatggcttagtccaggggaaggaaccata 895571  T
Q  709 acaatgcatg 718  Q
     |||||||||    
T  895572 gcaatgcatg 895581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 894876 - 895033
Alignment:
Q  13 ggtccaaccggataaacactaggtttctctctatcttgaagaacccttatgacttccggttccaaatcagtgaaagtattcataataacaccatcaaaca 112  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |    
T  894876 ggtcccactggataaaaacaaggtttctctttttcttgaagaagccttatgacctcaggttccaaatcattgaaagtgtttatgataacaccatcaacta 894975  T
Q  113 atgataatttttgacacacatcaagaattgatttgtaggcatcacttgatctttcaca 170  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |   |||||||||||||||    
T  894976 atgagaatttttgacacacatcaagaaatgatttgtactctaaacttgatctttcaca 895033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 905767 - 905641
Alignment:
Q  13 ggtccaaccggataaacactaggtttctctctatcttgaagaacccttatgacttccggttccaaatcagtgaaagtattcataataacaccatcaaaca 112  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | || |||| ||||||||  |    
T  905767 ggtcccactggataaacacaaggtttctctttttcttgaagaacccttataacatctggctccaaatcagtgaaagtgctgattataaaaccatcaacta 905668  T
Q  113 atgataatttttgacacacatcaagaa 139  Q
    |||  | ||||||||| || |||||||    
T  905667 atgtgagtttttgacaaacttcaagaa 905641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 335
Target Start/End: Original strand, 46720649 - 46720808
Alignment:
Q  176 acgggtcgggaagctctttgatatggagaggaatagaaaaaccaggaatatttactgtttcataacttgattctaagaactgagttgatgcagcttcatc 275  Q
    ||||||| | ||| ||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  46720649 acgggtctgaaagatctttgacatggaatggaatagaaaaactaggaacatttactgtttcataatttgattcgaagaactgagttgaagcaacttcatc 46720748  T
Q  276 aaggtttggaatagtgagaaataaagagaataaaacagctccagaggaaaagaaaaggta 335  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  46720749 aaggtttggaatagtgagaaacaaagagaataaaacagctactgaggacaagaaaaggta 46720808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 132
Target Start/End: Original strand, 46720520 - 46720614
Alignment:
Q  38 tctctctatcttgaagaacccttatgacttccggttccaaatcagtgaaagtattcataataacaccatcaaacaatgataatttttgacacaca 132  Q
    ||||||| |||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46720520 tctctctctctctaagtacccttatggcttccagttccaaatcagtgaaagtattcataataacaccatcaaacaatgataattttggacacaca 46720614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 507 - 618
Target Start/End: Original strand, 10265669 - 10265786
Alignment:
Q  507 aaggtcttcaatgtt-gacttggggaagaacaatgaagttcatgtttggtggaagagtgttcaagatgga-----ttgcatggaaggagttagtggacca 600  Q
    ||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     || ||||||| || | ||||||| |    
T  10265669 aaggtattcaatgtttgatttgtggaagaacaatgaagttcatgtttggtgggagagtcttcaagatggagttcattacatggaaagattgagtggacaa 10265768  T
Q  601 agtgtgggaatgaggaat 618  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10265769 agtgtgggaatgaggaat 10265786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 539 - 618
Target Start/End: Original strand, 10253077 - 10253157
Alignment:
Q  539 tgaagttcatgtttggtggaagagtgttcaagatgga-ttgcatggaaggagttagtggaccaagtgtgggaatgaggaat 618  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10253077 tgaagctcatgtttggtgagagagtaatcaagatggggttgcatggaaggagtgagtggaccaagtgtgggaatgaggaat 10253157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 481 - 571
Target Start/End: Original strand, 10241733 - 10241823
Alignment:
Q  481 tgtgttgcaggatcaagattatgtggaaggtcttcaatgttgacttggggaagaacaatgaagttcatgtttggtggaagagtgttcaaga 571  Q
    ||||| ||||| |||||| | | |||||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10241733 tgtgtcgcaggttcaagaatctctggaaggtcttcaatgttggtttgtggaagaatagtgaagttcatgtttggtgggagagtattcaaga 10241823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University