View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF13354_high_4 (Length: 460)
Name: NF13354_high_4
Description: NF13354
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF13354_high_4 |
 |  |
|
| [»] scaffold0006 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0189 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0662 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0702 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0238 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1480 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0069 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0005 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35818780 - 35818426
Alignment:
| Q |
5 |
aatattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaaga |
104 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
35818780 |
aatattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttagga |
35818681 |
T |
 |
| Q |
105 |
aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaac |
204 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35818680 |
aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaac |
35818581 |
T |
 |
| Q |
205 |
tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata |
304 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35818580 |
tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
35818481 |
T |
 |
| Q |
305 |
cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818480 |
cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
35818426 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 38363804 - 38364150
Alignment:
| Q |
13 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg |
112 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38363804 |
gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatg |
38363903 |
T |
 |
| Q |
113 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38363904 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcc |
38364003 |
T |
 |
| Q |
213 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa |
312 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38364004 |
caccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaa |
38364103 |
T |
 |
| Q |
313 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38364104 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
38364150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37392897 - 37392548
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37392897 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat |
37392798 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392797 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
37392698 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37392697 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
37392598 |
T |
 |
| Q |
310 |
caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37392597 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaatacac |
37392548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32661283 - 32660935
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32661283 |
agggtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatat |
32661184 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32661183 |
gtttggttagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
32661084 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcaccctttt-ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc |
310 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32661083 |
ccacccttttcccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcc |
32660984 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32660983 |
tatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
32660935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38133090 - 38132739
Alignment:
| Q |
9 |
ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
38133090 |
ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaa |
38132991 |
T |
 |
| Q |
109 |
tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38132990 |
tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgagaacttta |
38132891 |
T |
 |
| Q |
209 |
ttctcacccttttccttgggaaatt-ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat |
307 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38132890 |
ttcccacccttttccttgggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat |
38132791 |
T |
 |
| Q |
308 |
tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38132790 |
ttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
38132739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16313863 - 16313509
Alignment:
| Q |
5 |
aatattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaaga |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16313863 |
aatattaagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttagga |
16313764 |
T |
 |
| Q |
105 |
aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaac |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16313763 |
aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaac |
16313664 |
T |
 |
| Q |
205 |
tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata |
304 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16313663 |
tttattcccaccatttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatata |
16313564 |
T |
 |
| Q |
305 |
cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16313563 |
cattcctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
16313509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18726967 - 18726621
Alignment:
| Q |
14 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18726967 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattaattggaatataaagatgaaaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt |
18726868 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
18726867 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatttccatctccatgagaactttattccc |
18726768 |
T |
 |
| Q |
214 |
acccttttccttgggaaatt-ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
18726767 |
acccttttccttgggaaatttttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccta |
18726668 |
T |
 |
| Q |
313 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18726667 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
18726621 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 357
Target Start/End: Original strand, 7930961 - 7931306
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7930961 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
7931060 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7931061 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
7931160 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
7931161 |
ccacccttttccttgggaaattttttctattctcaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttataacaaacatatacatatacatttct |
7931260 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
357 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7931261 |
atcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
7931306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 12710365 - 12710714
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| |
|
|
| T |
12710365 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaagaaatgtaggaaaaat |
12710464 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
209 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12710465 |
atgtttcgttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat |
12710564 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12710565 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattt |
12710664 |
T |
 |
| Q |
310 |
caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12710665 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
12710714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 25837628 - 25837980
Alignment:
| Q |
7 |
tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaa |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25837628 |
tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaa |
25837727 |
T |
 |
| Q |
107 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25837728 |
aatatgtttggttagctttataatattcctatgaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
25837827 |
T |
 |
| Q |
207 |
tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
306 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
25837828 |
tattgccacccttttttttgggaaaatttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattttgtaaacttgtaacaaacataggcatgtaca |
25837927 |
T |
 |
| Q |
307 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25837928 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
25837980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 356
Target Start/End: Original strand, 18297836 - 18298178
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14 |
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113 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18297836 |
ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt |
18297935 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18297936 |
ttggttagctttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattccc |
18298035 |
T |
 |
| Q |
214 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat |
313 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18298036 |
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18298135 |
T |
 |
| Q |
314 |
cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
356 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18298136 |
cattttattcccgagaatcaaaaattataacttgaaacaaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 26061860 - 26062213
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6 |
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Q |
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|
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atattaagggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttgtaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaa |
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T |
 |
| Q |
106 |
aaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaact |
205 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26061960 |
aaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaact |
26062059 |
T |
 |
| Q |
206 |
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305 |
Q |
| |
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|
|
| T |
26062060 |
ttattcccaccctttttcttgggaatttttttctattcccagggacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggaatatac |
26062159 |
T |
 |
| Q |
306 |
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359 |
Q |
| |
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|
|
| T |
26062160 |
atttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
26062213 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 24 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1554692 - 1554356
Alignment:
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24 |
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122 |
Q |
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|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
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tttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatggttggttagt |
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T |
 |
| Q |
123 |
tttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttc |
222 |
Q |
| |
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| T |
1554592 |
tttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaaattatgtatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccacccttttc |
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T |
 |
| Q |
223 |
cttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt |
322 |
Q |
| |
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| T |
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cttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttatt |
1554393 |
T |
 |
| Q |
323 |
cccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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cccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 12 - 360
Target Start/End: Original strand, 3049731 - 3050079
Alignment:
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Q |
| |
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| T |
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agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcataggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattcgaaggaatttagaaaaaatat |
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T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
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|
| T |
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gtttggttatctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc |
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T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
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ccacccttttctttggaaatttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct |
3050030 |
T |
 |
| Q |
312 |
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360 |
Q |
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| T |
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atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacgcaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26602286 - 26601941
Alignment:
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12 |
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111 |
Q |
| |
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| T |
26602286 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattgctagaaataacattccttgaaacataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
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T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
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| T |
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gtttggttagctttataatattccttggaaccataaaaatagggattataatagctaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc |
26602087 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
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ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttata-ccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct |
26601988 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
358 |
Q |
| |
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| T |
26601987 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataatttgaaacaaacaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 42755592 - 42755936
Alignment:
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114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca |
214 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
42755692 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattccca |
42755791 |
T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc |
314 |
Q |
| |
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| T |
42755792 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacaaaggaataaattttagtaaacttgtaactaacataggcatatacatttctatc |
42755891 |
T |
 |
| Q |
315 |
attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42755892 |
attttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10896560 - 10896219
Alignment:
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17 |
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Q |
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|
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|
|
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10896560 |
gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttg |
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T |
 |
| Q |
117 |
gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacc |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10896460 |
gttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc |
10896361 |
T |
 |
| Q |
217 |
cttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcat |
316 |
Q |
| |
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||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |
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| T |
10896360 |
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10896262 |
T |
 |
| Q |
317 |
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359 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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10896261 |
tttattcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 84 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41228990 - 41228716
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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tttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatt |
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T |
 |
| Q |
184 |
tattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaact |
283 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41228890 |
tattct-atctccataggaactttattcccacccttttcctcgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaact |
41228792 |
T |
 |
| Q |
284 |
tgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41228791 |
tgtaacaaacgtaggcatatacattcctaccattttattcccgggaattaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5020837 - 5020492
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114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca |
214 |
Q |
| |
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| T |
5020737 |
tggttaactttataatattc-tgggaatcataaaaatatggattataataggtaa-ctacttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattccca |
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T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat---tcca |
311 |
Q |
| |
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| T |
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cccttttccttgggaaaatttttctattcacagaaacattttatacccgagagtaaactttagtaaacttgtaagaaacatatgcatatatattcctcct |
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T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atcattttattcccatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21137476 - 21137133
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Q |
| |
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|||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |
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|
| T |
21137476 |
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T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca |
214 |
Q |
| |
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tggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatacggattataataggtaa-ctacatatgaatttattctcatctccacgagaactttatttcca |
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T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc |
314 |
Q |
| |
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| T |
21137278 |
ccattttctttggaaaaatatttatattcccacaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatt |
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T |
 |
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315 |
attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca |
360 |
Q |
| |
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||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
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| T |
21137178 |
attttattctcaggaatcaacaaatataacttcaaacaaacacaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 55 - 356
Target Start/End: Original strand, 35394156 - 35394456
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| |
|
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| T |
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aacattccttgaaatataaagatgagaattttattccaaggtatttaagaaaaatatgtttggttaactttataatattcctatgaaccataaaaataag |
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T |
 |
| Q |
155 |
gattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatt |
254 |
Q |
| |
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| T |
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gattataataggtaa-ctatatatgagtttgttcccatctccttaggaactttattcccaccatttttcttggaaatttttttctattacgtagaacatt |
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ttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
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Q |
| |
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| T |
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T |
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355 |
ca |
356 |
Q |
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|| |
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35394455 |
ca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33444969 - 33444628
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Q |
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33444969 |
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33444870 |
T |
 |
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114 |
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213 |
Q |
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T |
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| Q |
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313 |
Q |
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33444674 |
T |
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| Q |
314 |
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359 |
Q |
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33444673 |
cattttattctcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
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Target Start/End: Complemental strand, 29421839 - 29421493
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108 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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208 |
Q |
| |
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tatatttgattaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa-ctacatataaatttattctcatctccatgggaacttta |
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T |
 |
| Q |
209 |
ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt |
308 |
Q |
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| T |
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ttcccaccattttctttgggaaaatttttctattcccagaaatattttatacccgagaataaaatttaataaacttgtaacaaacataaacatatatatt |
29421542 |
T |
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309 |
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357 |
Q |
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tctatcattttattctcatgaatcaacaaatataatttgaaacaaacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 69 - 359
Target Start/End: Original strand, 7317156 - 7317442
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Q |
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T |
 |
| Q |
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268 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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359 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Original strand, 15226688 - 15227029
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111 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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211 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
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| T |
15226887 |
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T |
 |
| Q |
312 |
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355 |
Q |
| |
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|| ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19161088 - 19160807
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Q |
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T |
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tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
| |
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|
| T |
19160988 |
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19160890 |
T |
 |
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cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
295 |
Q |
| |
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|
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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40197404 - 40197223
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T |
 |
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Q |
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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 356
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attaagggtgtgtttgtttcaagtttgccaaatttatttctaggaataacattccttgaaatatatagatgtaaattttattccaaggtatttagaaaaa |
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T |
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207 |
Q |
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T |
 |
| Q |
208 |
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307 |
Q |
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attcctaccaatttctttgaaaaaatatttatattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaacaaacttgtaacaaacataggcatgtatgt |
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T |
 |
| Q |
308 |
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Q |
| |
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| || |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 354
Target Start/End: Original strand, 41432464 - 41432804
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccca-tctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
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| T |
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tttgcttaacattataatattcttgggagccataaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttattctcaatctccatgggaactttattt |
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T |
 |
| Q |
212 |
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311 |
Q |
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T |
 |
| Q |
312 |
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354 |
Q |
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atcattttattcccaggaatccacgaatataacttaaaacaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 51 - 286
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T |
 |
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Q |
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aaaatagagattttaataggt-atctatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattctcacccttttctttaggaaaaattttctattccca |
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T |
 |
| Q |
247 |
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286 |
Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
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Query Start/End: Original strand, 13 - 304
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Q |
| |
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T |
 |
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209 |
Q |
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atgcttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagatattataataggt-aactatttatgaattt------atccccatgggaactttat |
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T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata |
304 |
Q |
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tcccaccctttttcttggaaatttttttctattctgaagaacattttatattcggaaataaaatttaataaaatcgtaacaaacatagatatata |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
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 |
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gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
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 |
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tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
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355 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
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tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt |
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| T |
37982035 |
tgtttgcttaacattataatatttatgggaaccataaaaatagggattataacaagt-aattacatataaatttattctcattttcataggaactttatt |
37981937 |
T |
 |
| Q |
211 |
ctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaac |
293 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| ||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37981936 |
tccacccttttcctt--gatttttttttaattcccaagaacgttttatatccaagaat-aaattttgtaaacttgaaacaaac |
37981857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 205 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40197232 - 40197081
Alignment:
| Q |
205 |
tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata |
304 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40197232 |
tttattcccacctttttccttgaaattttttttctattcccagaaacattttatatcaaagaataaattttagtaaacttataacaaacataaacatata |
40197133 |
T |
 |
| Q |
305 |
cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
356 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40197132 |
catttctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
40197081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33533743 - 33533585
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| | ||| |
|
|
| T |
33533743 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttgtcaaatttattcctaggaatattattcctttgaatataaagatgtgaattttattccaatgtatttagaataaag |
33533644 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta |
168 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | |||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33533643 |
atgtttgattaacattatgatattctcaagaaccttaaaaataggaattataataggta |
33533585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 12649859 - 12650137
Alignment:
| Q |
14 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt--aagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| || |||| |||||||||| ||| |||| || ||||| || |
|
|
| T |
12649859 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctacgaataacaatccttgtaatacaatgatgtgaattttatttcaaattatttaaaaaaaaaagat |
12649958 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | || | |||||||||| ||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12649959 |
gtttgattaacattataatattcttaggaacttaaaaaatagagattataataggt-agttacatgtgaatttattttcattttcatgggaactttattc |
12650057 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
292 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| | || ||||||||| ||| ||| ||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12650058 |
ccactattttctttgcgtaa-attttctatttccatgaatattttatacacagaaataaaatttaataatcttgtaacaaa |
12650137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 25899381 - 25899532
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| || |
|
|
| T |
25899381 |
agggtgtgtttgtttcaagtgtaacaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattctaaggtatttagaaaaaagat |
25899480 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
25899481 |
gtttggttgacattata--attccaaggaaccttaaaaatatggaatataatag |
25899532 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 359
Target Start/End: Original strand, 25899548 - 25899701
Alignment:
| Q |
205 |
tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
25899548 |
tttattctcaccattttctttggaaaaacttttctattccgaggaacattt-atacccggaaataaaatttaataaacttgcaacaaacatagacacatg |
25899646 |
T |
 |
| Q |
305 |
cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25899647 |
catttttatgattttattcccaggaatctacaaatataatttgaaacaaacacac |
25899701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Original strand, 38437377 - 38437519
Alignment:
| Q |
213 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |
|
|
| T |
38437377 |
cacccttttctttgggaaaaattttctattctcaggaacgttttatacccgaaaataaaattttgtaaacttgtaacaaacatagatatatgtattccta |
38437476 |
T |
 |
| Q |
313 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38437477 |
tcgttttattttcaggaatatacaaatataacttaaaacaaac |
38437519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14764111 - 14763969
Alignment:
| Q |
180 |
aatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta |
279 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14764111 |
aatttattatcatcttcatgtgaactttattcccacctttttcattga-attttttttctattctcatgaacattttatacccgtgaataaaatttagta |
14764013 |
T |
 |
| Q |
280 |
aacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattc |
323 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||| || ||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
14764012 |
aacttgaaacaaacatatgcatgtatatttctatcattttattc |
14763969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 35394076 - 35394139
Alignment:
| Q |
8 |
attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatat |
71 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35394076 |
attaagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcttagtaataacattctttggaatat |
35394139 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 34672083 - 34672207
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatat--aaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
34672083 |
agggtgtgtttgttttaagtttatcaaatttatttttagaaataacagtccttgaaatataaaaagatggaaattttatactaaggtttttagaaaaaat |
34672182 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattc |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34672183 |
atttttggttaactttataatattc |
34672207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Original strand, 38437203 - 38437353
Alignment:
| Q |
15 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
38437203 |
gtgtgtttgtttcaagtttattaaattcattcttaaaaataatattttttt-aatataaggatgagaattttattccaagatatttagaaaaaagatgtt |
38437301 |
T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg |
166 |
Q |
| |
|
|| ||| | || | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38437302 |
tgtttaacactacagtatttctgggaaccataaaaataggaattataatagg |
38437353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 37124073 - 37124194
Alignment:
| Q |
14 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatt--taagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || |
|
|
| T |
37124073 |
ggtgtgtttattttaagtttatcaaatttattgttaaaaataacaatatttggaatataaagatgagaattttatt-caaggtattcaaaaaaaaaaaat |
37124171 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattc |
134 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37124172 |
gtttcgttaactttataatattc |
37124194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 359
Target Start/End: Original strand, 34672289 - 34672403
Alignment:
| Q |
245 |
caggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataac |
344 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
34672289 |
caggaacattttatatctgagaataaaatttattaaacttgtaataaatgtaagcatatatatttttatcattttattttcaggaatcaacaaatacaac |
34672388 |
T |
 |
| Q |
345 |
ttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |
|
|
| T |
34672389 |
ttcaaacaaacacac |
34672403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 41229017 - 41228976
Alignment:
| Q |
13 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaat |
54 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41229017 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattccaaggaat |
41228976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 359
Target Start/End: Original strand, 8635664 - 8635703
Alignment:
| Q |
320 |
attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8635664 |
attcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
8635703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32901858 - 32901787
Alignment:
| Q |
224 |
ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
296 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32901858 |
ttgggaaaattttcctattcccagaaacattttata-ccatgaataaatttttttaaacttgtgacaaacata |
32901787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 81)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 46666431 - 46666778
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
46666431 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatat |
46666530 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666531 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
46666630 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
46666631 |
ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcca |
46666730 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666731 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
46666778 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20260434 - 20260088
Alignment:
| Q |
13 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20260434 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaagaaatttaggaaaaatatg |
20260335 |
T |
 |
| Q |
113 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260334 |
tttgcttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcc |
20260235 |
T |
 |
| Q |
213 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20260234 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaa |
20260135 |
T |
 |
| Q |
313 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260134 |
tcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
20260088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 9115561 - 9115907
Alignment:
| Q |
13 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9115561 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatg |
9115660 |
T |
 |
| Q |
113 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115661 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcc |
9115760 |
T |
 |
| Q |
213 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |
|
|
| T |
9115761 |
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9115860 |
T |
 |
| Q |
313 |
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359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115861 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
9115907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 52630494 - 52630843
Alignment:
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109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat |
52630593 |
T |
 |
| Q |
110 |
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209 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
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atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat |
52630693 |
T |
 |
| Q |
210 |
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309 |
Q |
| |
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| T |
52630694 |
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52630793 |
T |
 |
| Q |
310 |
caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52630794 |
ctatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 14788442 - 14788793
Alignment:
| Q |
8 |
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107 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
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attaagggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttatttcaaggaatttaggcaaa |
14788541 |
T |
 |
| Q |
108 |
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207 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14788542 |
atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
14788641 |
T |
 |
| Q |
208 |
attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat |
307 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14788642 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaatataatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat |
14788741 |
T |
 |
| Q |
308 |
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359 |
Q |
| |
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||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
14788742 |
tcctattattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac |
14788793 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 25789487 - 25789833
Alignment:
| Q |
13 |
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112 |
Q |
| |
|
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| T |
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gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatg |
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T |
 |
| Q |
113 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcc |
25789686 |
T |
 |
| Q |
213 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa |
312 |
Q |
| |
|
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| T |
25789687 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttcta |
25789786 |
T |
 |
| Q |
313 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
25789787 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 8331735 - 8332084
Alignment:
| Q |
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109 |
Q |
| |
|
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| T |
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taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaagaatttaggaaaaat |
8331834 |
T |
 |
| Q |
110 |
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209 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat |
8331934 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8331935 |
tcccacccttttccttgaaattttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgcaacaaacataggcatatacattc |
8332034 |
T |
 |
| Q |
310 |
caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
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|
|
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8332035 |
caatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9832216 - 9831871
Alignment:
| Q |
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Q |
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gtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattcctcggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt |
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T |
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| Q |
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214 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccca |
9832017 |
T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc |
314 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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cccttttccttgggaaaatttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatc |
9831917 |
T |
 |
| Q |
315 |
attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca |
360 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attttattcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca |
9831871 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 2430223 - 2430566
Alignment:
| Q |
15 |
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114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
2430223 |
gtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacgttccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaattatgtt |
2430322 |
T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
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tggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataagtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccca |
2430421 |
T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc |
314 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2430422 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatc |
2430521 |
T |
 |
| Q |
315 |
attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2430522 |
attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
2430566 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Original strand, 36361506 - 36361851
Alignment:
| Q |
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agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36361506 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaaaatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
36361605 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
36361606 |
gtttggttagctttataatattcctatgaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttactctcatctccatgggaactttattc |
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T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36361706 |
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36361804 |
T |
 |
| Q |
312 |
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358 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36361805 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
36361851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 39930181 - 39930527
Alignment:
| Q |
13 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattctttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg |
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T |
 |
| Q |
113 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattcc |
39930380 |
T |
 |
| Q |
213 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |
|
|
| T |
39930381 |
cacccttttccttggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttcta |
39930480 |
T |
 |
| Q |
313 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39930481 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
39930527 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12190528 - 12190179
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaagaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat |
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T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12190428 |
atgtttggttagctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttat |
12190329 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
12190328 |
tcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatgtacattc |
12190229 |
T |
 |
| Q |
310 |
caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12190228 |
ctatcattttattcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 32824644 - 32824992
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32824644 |
agggtgtgtttgtttcaaatttacgaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
32824743 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
32824744 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattc |
32824843 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttcc-ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32824844 |
ccacccttttcctttgggaaattttttctattcccaggaacaatttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcc |
32824943 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32824944 |
tattattttatttccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 6911208 - 6911563
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Q |
| |
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T |
 |
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112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
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Q |
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T |
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6911507 |
T |
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359 |
Q |
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| T |
6911508 |
acattcttatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1597694 - 1597344
Alignment:
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9 |
ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa |
108 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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208 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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308 |
Q |
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1597395 |
T |
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| Q |
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359 |
Q |
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| T |
1597394 |
cctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
1597344 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51445424 - 51445083
Alignment:
| Q |
16 |
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115 |
Q |
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| T |
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51445325 |
T |
 |
| Q |
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215 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
216 |
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315 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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358 |
Q |
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ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Original strand, 39329347 - 39329678
Alignment:
| Q |
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113 |
Q |
| |
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ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaataaaa--------------ttccaaggaatttagaaaaaatatgt |
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T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
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| T |
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ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc |
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T |
 |
| Q |
214 |
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313 |
Q |
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| T |
39329533 |
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39329632 |
T |
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| Q |
314 |
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359 |
Q |
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| T |
39329633 |
cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 2632576 - 2632922
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
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| T |
2632576 |
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T |
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| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
2632676 |
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T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
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| T |
2632776 |
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2632874 |
T |
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| Q |
312 |
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359 |
Q |
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| T |
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attattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50191113 - 50190767
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
| |
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| T |
50191113 |
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T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
50191013 |
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50190915 |
T |
 |
| Q |
212 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
50190914 |
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50190815 |
T |
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| Q |
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359 |
Q |
| |
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| T |
50190814 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38965027 - 38964683
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| Q |
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112 |
Q |
| |
|
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| T |
38965027 |
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38964928 |
T |
 |
| Q |
113 |
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212 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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38964828 |
T |
 |
| Q |
213 |
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312 |
Q |
| |
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| T |
38964827 |
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38964728 |
T |
 |
| Q |
313 |
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| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38964727 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
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Target Start/End: Complemental strand, 3572841 - 3572567
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Q |
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|
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ttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaattt |
3572742 |
T |
 |
| Q |
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284 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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attcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaactt |
3572642 |
T |
 |
| Q |
285 |
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359 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3572641 |
gtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5806625 - 5806293
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Q |
| |
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| T |
5806625 |
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5806526 |
T |
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| Q |
112 |
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211 |
Q |
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| T |
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gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatttccatctccatgggaacttta--- |
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T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5806428 |
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5806341 |
T |
 |
| Q |
312 |
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359 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5806340 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
5806293 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5518852 - 5518506
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| Q |
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agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
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5518852 |
agggtctgtttgtttgaagtttaccaaatttattcattggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttaggaaaaatat |
5518753 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
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| T |
5518752 |
gttcggttaactttataacattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa-ctatatataaatttattctcatctccatgggaactttattc |
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T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
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| T |
5518653 |
ccacctttttccttgggaaaatttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttct |
5518554 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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| T |
5518553 |
atcattttattcctgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
5518506 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4683718 - 4683376
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Q |
| |
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tgtgattgtttcaagtttatcaaatttatttctaagaataacattttttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgttt |
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T |
 |
| Q |
116 |
ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac |
215 |
Q |
| |
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| T |
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ggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgggaactttattc-ccc |
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T |
 |
| Q |
216 |
ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca |
315 |
Q |
| |
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| T |
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ccttttttttgggaaattttttctattcctaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaatttgtaacaaacataggcatatacattcctatca |
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T |
 |
| Q |
316 |
ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 35187181 - 35187526
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gtgtgtttgtttcaaagtttaccaaatttattcttaggaataatatttcttgaaatataaagatggaaattttattctaaagaatttaggaaatatatgt |
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T |
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114 |
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213 |
Q |
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T |
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313 |
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35187480 |
T |
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359 |
Q |
| |
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| T |
35187481 |
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35187526 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48916368 - 48916024
Alignment:
| Q |
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Q |
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| T |
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gtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcttaggaataacattccttagaatataaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaaatatgt |
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T |
 |
| Q |
114 |
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213 |
Q |
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| T |
48916268 |
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T |
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| Q |
214 |
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313 |
Q |
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| T |
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48916070 |
T |
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| Q |
314 |
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359 |
Q |
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| T |
48916069 |
cattttattctctggaatcaacaaatataacttgaaataaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 13653581 - 13653917
Alignment:
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Q |
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| T |
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gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaatttttatttcaaggtatttggaaaaaatatgtttgg |
13653680 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
218 |
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317 |
Q |
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| T |
13653780 |
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13653879 |
T |
 |
| Q |
318 |
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355 |
Q |
| |
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| T |
13653880 |
ttattctcaggaatcaacaaatttaacttgaaacaaac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 69 - 359
Target Start/End: Original strand, 6978550 - 6978840
Alignment:
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Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
169 |
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268 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
269 |
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359 |
Q |
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| T |
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aaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32202660 - 32202333
Alignment:
| Q |
14 |
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113 |
Q |
| |
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| T |
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ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgt |
32202561 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
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| T |
32202560 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc |
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T |
 |
| Q |
214 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat |
313 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
314 |
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359 |
Q |
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| T |
32202378 |
cattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 37436966 - 37436630
Alignment:
| Q |
14 |
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113 |
Q |
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| T |
37436966 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaagaataacattccttggaatataaatatggaaattttatttcaaggtgtttaggaaaaatatgt |
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T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
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| T |
37436866 |
ttggttaactttataatattcttaggaaccataaaaataaggattataatagat-aactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattctc |
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T |
 |
| Q |
214 |
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313 |
Q |
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| T |
37436767 |
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T |
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314 |
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352 |
Q |
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| T |
37436668 |
cattttattctcgtgaatcaacaaatataacatgaaaca |
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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 27 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 52699799 - 52699472
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Q |
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caagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaataagtttgcttaacatta |
52699700 |
T |
 |
| Q |
127 |
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226 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
227 |
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326 |
Q |
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| T |
52699600 |
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T |
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| Q |
327 |
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355 |
Q |
| |
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52699500 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 29091395 - 29091736
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Q |
| |
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| T |
29091395 |
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T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
29091495 |
gtttggttaactttataatattactaggaaccataaaaatagggtttataataggt-aactatgtgtaaatttat-----tctccatgggaactttattc |
29091588 |
T |
 |
| Q |
212 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
29091589 |
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29091688 |
T |
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312 |
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359 |
Q |
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| T |
29091689 |
atcattttattatcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 49823203 - 49822919
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Q |
| |
|
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|
| T |
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taacattccttggaatataaagatgggaattttattccatggaatttagaaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctaggaaccataaaaatag |
49823104 |
T |
 |
| Q |
154 |
ggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacat |
253 |
Q |
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| T |
49823103 |
ggattataataggtaaattatttatgaatttattatcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattctcag------ |
49823010 |
T |
 |
| Q |
254 |
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353 |
Q |
| |
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| T |
49823009 |
---------------aaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 47031582 - 47031758
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| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
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| T |
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agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
47031681 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc |
188 |
Q |
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| T |
47031682 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Original strand, 47037324 - 47037527
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255 |
Q |
| |
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| T |
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attataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattt |
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T |
 |
| Q |
256 |
tatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
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| T |
47037424 |
tataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
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T |
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356 |
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359 |
Q |
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acac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 308
Target Start/End: Original strand, 46960347 - 46960646
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8 |
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106 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
107 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
206 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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207 |
tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
306 |
Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 47677368 - 47677712
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Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #38
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Target Start/End: Complemental strand, 24116683 - 24116339
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Q |
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T |
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359 |
Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #39
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Target Start/End: Complemental strand, 1228225 - 1227936
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Q |
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T |
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212 |
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T |
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| Q |
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303 |
Q |
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Target: chr1; HSP #40
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T |
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355 |
Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #41
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214 |
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T |
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Q |
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Q |
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1007763 |
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Q |
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Q |
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Q |
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T |
 |
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209 |
Q |
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| T |
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T |
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| T |
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 |
| Q |
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Q |
| |
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ctatcgttttattttcgggaacctatgaatataacttgtaacaaaca |
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T |
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Q |
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| T |
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31806901 |
T |
 |
| Q |
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314 |
Q |
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| T |
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31806803 |
T |
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358 |
Q |
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| T |
31806802 |
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T |
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Target: chr1; HSP #46
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gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt |
114 |
Q |
| |
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| T |
48462258 |
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T |
 |
| Q |
115 |
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214 |
Q |
| |
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| T |
48462357 |
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48462455 |
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 |
| Q |
215 |
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235 |
Q |
| |
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T |
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Q |
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T |
 |
| Q |
109 |
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208 |
Q |
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T |
 |
| Q |
209 |
ttctcacccttttccttgggaaattttttctattccca-ggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat |
307 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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308 |
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355 |
Q |
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tcctatcattttattttcaagaatctacgaatataacttgaaacaaac |
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Target: chr1; HSP #48
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
113 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
213 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa |
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Q |
| |
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cacccttttctttaggaaaacatttctattcc-aggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatgtattttta |
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 |
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tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Q |
| |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
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| T |
11014626 |
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11014527 |
T |
 |
| Q |
276 |
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354 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11014526 |
attaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattcccaggaatctacatatataacttgaaacaaa |
11014448 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 13521053 - 13521390
Alignment:
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tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg |
117 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13521053 |
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13521151 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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| | | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |
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| T |
13521152 |
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13521249 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatt |
317 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||| |
|
|
| T |
13521250 |
ttttctttgggaaattttttctattcccaagaacattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacagacatgtatatttctatcatt |
13521349 |
T |
 |
| Q |
318 |
ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
13521350 |
gta-tcccaaaaatctacaaatataattagaaacaaacacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
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280 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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19083186 |
T |
 |
| Q |
281 |
acttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19083185 |
acttataacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataatttgaaacaaacacac |
19083107 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
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Query Start/End: Original strand, 181 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19131173 - 19130995
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| Q |
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280 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atttattctcatatgcctggaaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaa |
19131074 |
T |
 |
| Q |
281 |
acttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19131073 |
acttataacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataatttgaaacaaacacac |
19130995 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
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Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 29769230 - 29769526
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107 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
29769230 |
gtgtgtttgttttaagtttactaaatttattcttatatgaataataacattctttggaatataaagatgtgaattttatttcaagatatttagaagaaaa |
29769329 |
T |
 |
| Q |
108 |
ata-tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
206 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||| | |||||||||| | ||||||| || ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
29769330 |
aaaatgtttagttaacattataatatttcaaggaaccttagaaacatagattataataggtaat-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactt |
29769428 |
T |
 |
| Q |
207 |
tattctcacccttttccttg-ggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat |
303 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29769429 |
tattcccaccctttttctttaggaaaattgttctattgccaggaacattttatgtcaaagaataaaatttagtaattttgtaacaaacatagacatat |
29769526 |
T |
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Target: chr1; HSP #54
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Query Start/End: Original strand, 139 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20505213 - 20504995
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238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||| |||| || |||||| |
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|
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gaaccataaaaatagggattataatatgtagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaagctttattttcacctttttctttggtaatttttttt |
20505115 |
T |
 |
| Q |
239 |
t---attcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaac |
335 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| | | |||| || |
|
|
| T |
20505114 |
tcttattcccaggaatattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattctcagaaatctac |
20505015 |
T |
 |
| Q |
336 |
aattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
|| ||||| || |||||||| |
|
|
| T |
20505014 |
aaatataatttaaaacaaac |
20504995 |
T |
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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 49627295 - 49627454
Alignment:
| Q |
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108 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||| | |||| |
|
|
| T |
49627295 |
taaggatgtgtttgtttcaaatttaccaaatttatttttaagaataacatttcttggaatataaagatgggaattttattgtagagtatttaaaagaaaa |
49627394 |
T |
 |
| Q |
109 |
tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
49627395 |
aatgtttggttaacattataatatttcaaagaaccataaaaatatggattataataggta |
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T |
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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 3939220 - 3939486
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8 |
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107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
3939220 |
attatgggtgtgtttgttttaagtttatcaaatatatttttaggaataacattctttggaatataaaaaagtgaattttattttaagatatttaaaaaaa |
3939319 |
T |
 |
| Q |
108 |
atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
207 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||| | |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
3939320 |
acatgtttgattaacattataatattttaaggaa-cttaaaaatatagattataataggt-aaccatgtatgaatttattctcatcttaatggaaacttg |
3939417 |
T |
 |
| Q |
208 |
attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttag |
277 |
Q |
| |
|
|||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || |||| || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
3939418 |
attcctacactttt-ctttggaatttttttctattcccaataatatttcatttccaggaataaaatttag |
3939486 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 188
Target Start/End: Original strand, 1007566 - 1007669
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183 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1007566 |
tttattccaaagtatttaggaaaaatatgtttgattaactttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataggt-aactatttatgaatt |
1007664 |
T |
 |
| Q |
184 |
tattc |
188 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
1007665 |
tattc |
1007669 |
T |
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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 235 - 358
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235 |
tttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaa |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
52186172 |
tttctattcccagaaacattttatcgtcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatatagacatatatatttctatcattttattataagaaatcaa |
52186073 |
T |
 |
| Q |
335 |
caattataacttgaaacaaacaca |
358 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52186072 |
caaatataacttgaaacaaacaca |
52186049 |
T |
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Target: chr1; HSP #59
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ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcc |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13440230 |
ttataatattccatggaactttaagaatatggattataataggtagt-tacatatgaatttattctcatcttcatggaaactttatttccacccttttct |
13440328 |
T |
 |
| Q |
224 |
ttgggaaatttt-ttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt |
322 |
Q |
| |
|
|||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| || ||| | |||||| |||| |
|
|
| T |
13440329 |
ttggaatttttttttctattctcaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaaaattctaacaaacatagtcatttatatttctatcattgtatt |
13440428 |
T |
 |
| Q |
323 |
ccc |
325 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
13440429 |
ccc |
13440431 |
T |
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Target: chr1; HSP #60
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| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
37261540 |
taaggatgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttatgattaacattcattggaatataaatatgtgaattttattcttagatatttagaaaaaag |
37261639 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
169 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37261640 |
atgtttggttaatattataatattccaaagaacgttaaaaatatggattataataggtaa |
37261699 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 45771815 - 45771937
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| Q |
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agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt--aagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |
|
|
| T |
45771815 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcccatgaataacctttcttggaacataaaggtgagaattttattccaaggtatttagaaaaaaaag |
45771914 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatat |
132 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
45771915 |
atgtttgtttaacattataatat |
45771937 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 14 - 222
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ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19923810 |
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19923711 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||| |||| |||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
19923710 |
ttgtttaacattataatgtttttgagaaccaaaaaagtagggattataataggt-aattacacatgaatttgttccaatcttcatgaaaactttactctc |
19923612 |
T |
 |
| Q |
214 |
acccttttc |
222 |
Q |
| |
|
||| ||||| |
|
|
| T |
19923611 |
accattttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
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14 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaa |
93 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52186344 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
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176 |
tatgaatttattcccatctccatgggaacttt-attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatt |
274 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| | || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
37261734 |
tatgaatttattcatatcttcgtgagaacttttattctcaaccttttttttgggaaattttttctattcccaaaaagattttatgtc-gggaataaaatt |
37261832 |
T |
 |
| Q |
275 |
tagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| ||| || ||| | || ||||||||| | |||||| | | ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37261833 |
taataaacttgtaacaaacatatgcatgtatatttctataattttattctcaggaatctatgaatataatttgaaacaaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37726805 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
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28 |
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127 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| || ||| |||| |||| |
|
|
| T |
45813727 |
aagtttatcaaatttattcttaggaataacattcattgaaatataaagatgtgaattttattttaaggtatttagaaaaaagatattttgttaagattat |
45813628 |
T |
 |
| Q |
128 |
aatattcctaggaaccataaaaata |
152 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
45813627 |
aatattccaaagaaccttaagaata |
45813603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 359
Target Start/End: Original strand, 19094020 - 19094183
Alignment:
| Q |
196 |
catgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
295 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19094020 |
catgggaactttattcccacagttttctttgggaatgttatttcattatcaggaacattttatatctagaaataaaatttaataaacttgcaacaaacat |
19094119 |
T |
 |
| Q |
296 |
agacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|| || | ||| | |||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19094120 |
aggaatgcatatttccatcattctatttccaggaatttacaaatataacttgaaacaaacacac |
19094183 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37336699 - 37336514
Alignment:
| Q |
105 |
aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaac |
204 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | || ||| |
|
|
| T |
37336699 |
aaaacatgtttggttaacattttaatattttaagaaaccataaaaatagagattataataggtaat-tatacatgaatttattctctccttcgtgaaaac |
37336601 |
T |
 |
| Q |
205 |
tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaa |
291 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||| |||| || |||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37336600 |
tttattcccactctattctttggaaagaaatttctattcccaataatattttatatctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaa |
37336514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13048578 - 13048461
Alignment:
| Q |
52 |
aataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaat |
151 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
13048578 |
aataacatttcttggaacataaagaaaggaattttatgctaaggtatttaaagaaaatatgtttgcttaacatgataatattctcaggaacactaaaaat |
13048479 |
T |
 |
| Q |
152 |
agggattataataggtaa |
169 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13048478 |
aaggattataataggtaa |
13048461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13053575 - 13053458
Alignment:
| Q |
52 |
aataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaat |
151 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
13053575 |
aataacatttcttggaacataaagaaaggaattttatgctaaggtatttaaagaaaatatgtttgcttaacatgataatattctcaggaacactaaaaat |
13053476 |
T |
 |
| Q |
152 |
agggattataataggtaa |
169 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13053475 |
aaggattataataggtaa |
13053458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 49824067 - 49824022
Alignment:
| Q |
17 |
gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattcc |
62 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49824067 |
gtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattcc |
49824022 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 52186262 - 52186170
Alignment:
| Q |
127 |
taatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttt |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
52186262 |
taatattcttagaaaccataaaaatagaaattataataggt-aactatgtagaaatttattcacatctcaatgtgaacttaattcccacccttt |
52186170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33702524 - 33702381
Alignment:
| Q |
180 |
aatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatttta-tacccgggaataaaatttagt |
278 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| | || |||| | | ||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
33702524 |
aatttattctcatcgtcatgggaattttattctcacctttttattcgggaaattttttctattccctgaaaaatttaattccccaaaaataaaatttaat |
33702425 |
T |
 |
| Q |
279 |
aaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt |
322 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
33702424 |
aaatttgtaacaaacttaagaatatatatttctatcattttatt |
33702381 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 44
Target Start/End: Original strand, 6978518 - 6978552
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttat |
44 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6978518 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttat |
6978552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 285
Target Start/End: Original strand, 11077963 - 11078051
Alignment:
| Q |
197 |
atgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttg |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11077963 |
atgggaactttatgttcaccttttttttttggaaaatttttctattcccaaaaacatgttatatccagaaataaaatttaataaacttg |
11078051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 298
Target Start/End: Original strand, 37726920 - 37727033
Alignment:
| Q |
181 |
atttattcccatctccatgggaactttattctcaccctttt--ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagt |
278 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
37726920 |
atttattcccatctc-atggaaactttactctcacccttttttctttgggaaaatatttgtatt-----gaacattttatatagagaaataaaatttaga |
37727013 |
T |
 |
| Q |
279 |
aaacttgtaacaaacataga |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37727014 |
aaacttgtaacaaacataga |
37727033 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 297
Target Start/End: Original strand, 52276877 - 52276926
Alignment:
| Q |
246 |
aggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
52276877 |
aggaacattttatatccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaatatag |
52276926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 47
Target Start/End: Original strand, 1007539 - 1007573
Alignment:
| Q |
13 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcc |
47 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1007539 |
gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcc |
1007573 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 296
Target Start/End: Original strand, 3939515 - 3939547
Alignment:
| Q |
264 |
ggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3939515 |
ggaataaaatttagcaaacttgtaacaaacata |
3939547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16257189 - 16257010
Alignment:
| Q |
180 |
aatttattcccatctccatgggaacttt-attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagt |
278 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
16257189 |
aatttatttccatcttcatggaaacttttattccaaccattttcgatgggaatatttttct-ttcctaagaatcttttatacctaagaataaaatttaat |
16257091 |
T |
 |
| Q |
279 |
aaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || || || ||| || |||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16257090 |
aaacttgtaaaaaacattgaaatgtatatttttatgattttattccaagaaatatacaaatataacttcaaacaaacacac |
16257010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 41967537 - 41967465
Alignment:
| Q |
19 |
gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattcc |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| || | | ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41967537 |
gtttgtttcaagtttacaaaatataatattgggaataattttcctaggaatataaggatcagaattttattcc |
41967465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35488542 - 35488191
Alignment:
| Q |
8 |
attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35488542 |
attatgggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaa |
35488443 |
T |
 |
| Q |
108 |
atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
35488442 |
atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaacttt |
35488343 |
T |
 |
| Q |
208 |
attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat |
307 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35488342 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
35488243 |
T |
 |
| Q |
308 |
tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35488242 |
tccaatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
35488191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 11329711 - 11330062
Alignment:
| Q |
8 |
attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11329711 |
attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaa |
11329810 |
T |
 |
| Q |
108 |
atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11329811 |
atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
11329910 |
T |
 |
| Q |
208 |
attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat |
307 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11329911 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
11330010 |
T |
 |
| Q |
308 |
tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11330011 |
ttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
11330062 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45265401 - 45265050
Alignment:
| Q |
8 |
attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa |
107 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45265401 |
attaagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaa |
45265302 |
T |
 |
| Q |
108 |
atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45265301 |
atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaacttt |
45265202 |
T |
 |
| Q |
208 |
attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat |
307 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
45265201 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttataacaaacataggcatatacat |
45265102 |
T |
 |
| Q |
308 |
tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45265101 |
tccaatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
45265050 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 27248010 - 27248362
Alignment:
| Q |
7 |
tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaa |
106 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27248010 |
tattaaggatgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttagaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaa |
27248109 |
T |
 |
| Q |
107 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27248110 |
aatatgtttggttagctttataatattcctatgaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
27248209 |
T |
 |
| Q |
207 |
tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
306 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27248210 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagtaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
27248309 |
T |
 |
| Q |
307 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
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| T |
27248310 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
27248362 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Original strand, 45045352 - 45045695
Alignment:
| Q |
16 |
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115 |
Q |
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| T |
45045352 |
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45045451 |
T |
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116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
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45045551 |
T |
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| Q |
216 |
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315 |
Q |
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| T |
45045552 |
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45045651 |
T |
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316 |
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359 |
Q |
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| T |
45045652 |
ttttattcccgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac |
45045695 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 33378554 - 33378911
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
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| T |
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taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaat |
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T |
 |
| Q |
110 |
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209 |
Q |
| |
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| T |
33378654 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
33378753 |
T |
 |
| Q |
210 |
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301 |
Q |
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| T |
33378754 |
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33378853 |
T |
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| Q |
302 |
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359 |
Q |
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| T |
33378854 |
atacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
33378911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 44565767 - 44566114
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
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|
| T |
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agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
44565866 |
T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
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| T |
44565867 |
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44565966 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
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| T |
44565967 |
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44566066 |
T |
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| Q |
312 |
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359 |
Q |
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| T |
44566067 |
atcattttatttccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27214203 - 27213857
Alignment:
| Q |
13 |
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112 |
Q |
| |
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| T |
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gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatg |
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T |
 |
| Q |
113 |
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212 |
Q |
| |
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| T |
27214103 |
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27214004 |
T |
 |
| Q |
213 |
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312 |
Q |
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| T |
27214003 |
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27213904 |
T |
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| Q |
313 |
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359 |
Q |
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| T |
27213903 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
27213857 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Original strand, 48341086 - 48341430
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
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|
| T |
48341086 |
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48341184 |
T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
48341185 |
gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
48341284 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
48341285 |
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48341383 |
T |
 |
| Q |
312 |
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358 |
Q |
| |
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| T |
48341384 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 43948965 - 43949314
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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43949064 |
T |
 |
| Q |
110 |
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209 |
Q |
| |
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|
|
| T |
43949065 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttat |
43949164 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
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| T |
43949165 |
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43949264 |
T |
 |
| Q |
310 |
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359 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
43949265 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 48313842 - 48314191
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48313842 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacatttcttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaat |
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T |
 |
| Q |
110 |
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209 |
Q |
| |
|
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|
| T |
48313942 |
atgtttggttagctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttat |
48314041 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
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|
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| T |
48314042 |
tcccaccattttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttctaacaaacataggcatatacattc |
48314141 |
T |
 |
| Q |
310 |
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359 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
48314142 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
48314191 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25924989 - 25924642
Alignment:
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108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
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ttaagggtgtgtttgtttcatgtttaccaaatttattcctaagaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaa |
25924890 |
T |
 |
| Q |
109 |
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208 |
Q |
| |
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| T |
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tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctctatgggaacttta |
25924790 |
T |
 |
| Q |
209 |
ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt |
308 |
Q |
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| T |
25924789 |
ttcccacccttttcctggggaaattttttctattcccaggaacattttatacaaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatt |
25924690 |
T |
 |
| Q |
309 |
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356 |
Q |
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| T |
25924689 |
tctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
25924642 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9947342 - 9946992
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| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaa |
108 |
Q |
| |
|
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taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttgtaatataaagatgggaattttattccaaggaatgtagaaaaaaa |
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T |
 |
| Q |
109 |
tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta |
208 |
Q |
| |
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| T |
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tatgtttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttaatctcatctccatgggaacttta |
9947143 |
T |
 |
| Q |
209 |
ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt |
308 |
Q |
| |
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| T |
9947142 |
ttcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatt |
9947043 |
T |
 |
| Q |
309 |
ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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9947042 |
cctatcattttattcccgggaatcaaaaattataactttaaacaaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 45448665 - 45449009
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13 |
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Q |
| |
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 |
| Q |
113 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
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| T |
45448765 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataatagataaactatttatgaatttattcccctctctatgggaactttattcc |
45448864 |
T |
 |
| Q |
213 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa |
312 |
Q |
| |
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| T |
45448865 |
caccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatctacattccta |
45448964 |
T |
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| Q |
313 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
357 |
Q |
| |
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| T |
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tcattttattcccgagaatcaaaaattataacttgaaacaaacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34930814 - 34930467
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14 |
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| |
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ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
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| T |
34930714 |
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34930615 |
T |
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214 |
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312 |
Q |
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| T |
34930614 |
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34930515 |
T |
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| Q |
313 |
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359 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
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| T |
34930514 |
tcattttattcccaggaatcaacaattataactttgaaacaaacacac |
34930467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38396714 - 38396370
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38396714 |
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38396616 |
T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38396615 |
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38396516 |
T |
 |
| Q |
212 |
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311 |
Q |
| |
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|
| T |
38396515 |
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38396416 |
T |
 |
| Q |
312 |
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357 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38396415 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttggaacaaacac |
38396370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28904539 - 28904188
Alignment:
| Q |
8 |
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107 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28904539 |
attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaa |
28904440 |
T |
 |
| Q |
108 |
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207 |
Q |
| |
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|
|
| T |
28904439 |
atatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
28904340 |
T |
 |
| Q |
208 |
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307 |
Q |
| |
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| T |
28904339 |
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28904240 |
T |
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| Q |
308 |
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359 |
Q |
| |
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| T |
28904239 |
ttctatcattttattctcgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac |
28904188 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 50 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8419900 - 8419591
Alignment:
| Q |
50 |
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149 |
Q |
| |
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|
| T |
8419900 |
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8419801 |
T |
 |
| Q |
150 |
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249 |
Q |
| |
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| T |
8419800 |
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8419701 |
T |
 |
| Q |
250 |
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349 |
Q |
| |
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| T |
8419700 |
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8419601 |
T |
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359 |
Q |
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| T |
8419600 |
acaaacacac |
8419591 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27419571 - 27419226
Alignment:
| Q |
14 |
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113 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27419571 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacatttcttggaatataaagatgggaattttattccaaagaatttagaaaaaatatgt |
27419472 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
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|
| T |
27419471 |
ttggttagctttataatattcctagggaccataaaaatagagattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc |
27419372 |
T |
 |
| Q |
214 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat |
313 |
Q |
| |
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| T |
27419371 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctat |
27419272 |
T |
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| Q |
314 |
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359 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
27419271 |
cattttattcccgggaatcagcaattataacttgaaacaaacacac |
27419226 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Original strand, 38543920 - 38544263
Alignment:
| Q |
17 |
gtgtttgtttcaa-gtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt |
115 |
Q |
| |
|
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|
| T |
38543920 |
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38544019 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
38544020 |
ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccac |
38544119 |
T |
 |
| Q |
216 |
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315 |
Q |
| |
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| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |
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| T |
38544120 |
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38544219 |
T |
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| Q |
316 |
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359 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
38544220 |
ttttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 25097796 - 25098138
Alignment:
| Q |
18 |
tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattcctt-ggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25097796 |
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T |
 |
| Q |
117 |
gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacc |
216 |
Q |
| |
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|
| T |
25097896 |
gttagctttataatattcctaggaaccataaatatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc |
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T |
 |
| Q |
217 |
cttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcat |
316 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |
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| T |
25097996 |
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25098095 |
T |
 |
| Q |
317 |
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359 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
25098096 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 39553910 - 39554252
Alignment:
| Q |
18 |
tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa-tatgtttg |
116 |
Q |
| |
|
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|
| T |
39553910 |
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39554009 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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|
| T |
39554010 |
gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc |
39554109 |
T |
 |
| Q |
217 |
cttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcat |
316 |
Q |
| |
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| T |
39554110 |
cttttccttgggaaattttttctattctcaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcat |
39554209 |
T |
 |
| Q |
317 |
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359 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
39554210 |
tttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
39554252 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 58 - 359
Target Start/End: Original strand, 40212657 - 40212958
Alignment:
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attcctaggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggat |
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T |
 |
| Q |
158 |
tataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatttta |
257 |
Q |
| |
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|
|
| T |
40212757 |
tataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacatttta |
40212856 |
T |
 |
| Q |
258 |
tacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
357 |
Q |
| |
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|
|
| T |
40212857 |
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40212956 |
T |
 |
| Q |
358 |
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359 |
Q |
| |
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|| |
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| T |
40212957 |
ac |
40212958 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 40 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9814535 - 9814220
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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tttattcctaggaataacatttcttggaatataaagatgacaattttattctaaggaatttaggaaaaatatgtttgattagctttataatattcctagg |
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T |
 |
| Q |
140 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttct |
239 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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aaccataaaaatagagattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttct |
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T |
 |
| Q |
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attcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaatt |
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Q |
| |
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| T |
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attcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaac----acatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaatt |
9814240 |
T |
 |
| Q |
340 |
ataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
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| T |
9814239 |
ataacttgaaacaaacacac |
9814220 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41632711 - 41632366
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9 |
ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa |
108 |
Q |
| |
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| T |
41632711 |
ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattc-----aataacattcctttgaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaa |
41632617 |
T |
 |
| Q |
109 |
tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta |
208 |
Q |
| |
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| T |
41632616 |
tatgtttggttagctttataatattcctatgaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaacttta |
41632517 |
T |
 |
| Q |
209 |
ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt |
308 |
Q |
| |
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||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
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| T |
41632516 |
ttcccaccctttttcttgggaaattttttctattcctaagaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaataaacataggcatatacatt |
41632417 |
T |
 |
| Q |
309 |
ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
41632416 |
tctatcattttattctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
41632366 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 360
Target Start/End: Original strand, 44819981 - 44820324
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17 |
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Q |
| |
|
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|
| T |
44819981 |
gtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttaaaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatatttg |
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T |
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216 |
Q |
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T |
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316 |
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44820280 |
T |
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360 |
Q |
| |
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| T |
44820281 |
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44820324 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48160926 - 48160593
Alignment:
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8 |
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107 |
Q |
| |
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|
| T |
48160926 |
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T |
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| Q |
108 |
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207 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
208 |
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307 |
Q |
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T |
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| Q |
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359 |
Q |
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| T |
48160644 |
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48160593 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37534447 - 37534102
Alignment:
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115 |
Q |
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T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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315 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
316 |
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362 |
Q |
| |
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| T |
37534148 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30686336 - 30685994
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| Q |
16 |
tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt |
115 |
Q |
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| T |
30686336 |
tgtgtttgttttaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgaaaattttattgcaaggtatttaggaaaaatatgttt |
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T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
216 |
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315 |
Q |
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| T |
30686137 |
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30686038 |
T |
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| Q |
316 |
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359 |
Q |
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| T |
30686037 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 122 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16825593 - 16825356
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Q |
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T |
 |
| Q |
222 |
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321 |
Q |
| |
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| T |
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16825394 |
T |
 |
| Q |
322 |
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359 |
Q |
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||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
16825393 |
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16825356 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 18823890 - 18824215
Alignment:
| Q |
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117 |
Q |
| |
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|
| T |
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tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattctaaggtatttaggaaaaatatgtttgg |
18823989 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
218 |
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316 |
Q |
| |
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| T |
18824073 |
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18824172 |
T |
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| Q |
317 |
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359 |
Q |
| |
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| T |
18824173 |
tttattcccaaaaatcaacaaatacaacttgaaacaaacacac |
18824215 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6656819 - 6656476
Alignment:
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111 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
6656819 |
gggtgtgtttctttcaagtttactaaatttattcttaggaataaacattccttggaatagaaatatgagaattttattccaaggtatttggaaaaaatat |
6656720 |
T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
6656719 |
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6656621 |
T |
 |
| Q |
212 |
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311 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
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| T |
6656620 |
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6656522 |
T |
 |
| Q |
312 |
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358 |
Q |
| |
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|||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
6656521 |
atca-tttatttccaaaaatcaacaaatataacttgaaacaaacaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 45722876 - 45723169
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| || |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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206 |
Q |
| |
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|
| T |
45722967 |
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T |
 |
| Q |
207 |
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306 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |
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| T |
45723066 |
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45723165 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31922077 - 31921811
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taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatg--agaattttattccaaggaatttaagaaaa |
107 |
Q |
| |
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| T |
31922077 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattaccatgaataacattctttggaatataaatatgggagaattttattccaaggtatttagaaaaa |
31921978 |
T |
 |
| Q |
108 |
atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
207 |
Q |
| |
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| T |
31921977 |
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31921881 |
T |
 |
| Q |
208 |
attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttag |
277 |
Q |
| |
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| T |
31921880 |
attcccacccttttctttggaaatttttttctattcccacaaacattttatactcaggaataaaatttag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 139 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25045838 - 25045620
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238 |
Q |
| |
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gaaccatgaaaatatggattataatatgtaat-tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttacgaaaatttttc |
25045740 |
T |
 |
| Q |
239 |
tattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaat |
338 |
Q |
| |
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| T |
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tattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatatattcctatcttttta-tccccagaatcaacaaa |
25045641 |
T |
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| Q |
339 |
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359 |
Q |
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| T |
25045640 |
tataacttgaaacaaacacac |
25045620 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41684354 - 41684024
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115 |
Q |
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T |
 |
| Q |
116 |
ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac |
215 |
Q |
| |
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| T |
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ggttaattttataatatttataggaaccataaaaatagagattataataggtaa-ctacatataaatttattttcatctccatgagaactttattcccac |
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T |
 |
| Q |
216 |
ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca |
315 |
Q |
| |
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| T |
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tcttttctttgggcaaaattttctattcccaagaacatcttatatccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatttctatca |
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T |
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316 |
ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
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| T |
41684067 |
tattattctcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
41684024 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 45440637 - 45440977
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| |
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gtgtgtttgtttca-gtttaccaaatttattcatagtaataacatttcttagaatata--gatgtaaattttattccaagatatttaa-aaaaagatgtt |
45440732 |
T |
 |
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tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca |
214 |
Q |
| |
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| T |
45440733 |
tgattaacattataatattccaagtaaccttaaaactagggattataataggtaat-tatacatgatttttttcccatctccatgagaactttattccca |
45440831 |
T |
 |
| Q |
215 |
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313 |
Q |
| |
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45440832 |
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45440931 |
T |
 |
| Q |
314 |
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359 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45440932 |
gattttattcccaagaatctacaattataacttgaaacaaacacac |
45440977 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 359
Target Start/End: Original strand, 11000488 - 11000772
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173 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
11000488 |
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11000585 |
T |
 |
| Q |
174 |
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273 |
Q |
| |
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|
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| T |
11000586 |
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11000685 |
T |
 |
| Q |
274 |
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359 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11000686 |
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11000772 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40385974 - 40385692
Alignment:
| Q |
14 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt |
113 |
Q |
| |
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| T |
40385974 |
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40385875 |
T |
 |
| Q |
114 |
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213 |
Q |
| |
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|
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| T |
40385874 |
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40385776 |
T |
 |
| Q |
214 |
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296 |
Q |
| |
|
||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40385775 |
accatttctttttgggatattttttctattcccagaaacattttatagacaggaataaaattcagtaaacttctaacaaacata |
40385692 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5543479 - 5543191
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| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |
|
|
| T |
5543479 |
agggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttctaagaatatcattatttgaaacataaagatgagaattttattc-aaggtatttagaaaaaagat |
5543381 |
T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
5543380 |
gtttgcttaacattataatgttcccgggaaccataaaaatatggattataataggtaat-tacacatgaatttgttcccatcttcatgggaactttattc |
5543282 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttcctt-gggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacat |
301 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5543281 |
ccactatttttctttgggaaaaaatttctattcccaagaaagttttatacgagagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacat |
5543191 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22156520 - 22156248
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| Q |
19 |
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118 |
Q |
| |
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||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || |||||| ||||||| | |
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| T |
22156520 |
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22156422 |
T |
 |
| Q |
119 |
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218 |
Q |
| |
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|| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22156421 |
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22156323 |
T |
 |
| Q |
219 |
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292 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22156322 |
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22156248 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22212435 - 22212163
Alignment:
| Q |
19 |
gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggt |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
22212435 |
gtttgtttcaaatttatcaaatttatttttaggaataacattttttggaatataaagataagaattttattctaaggtatata-gaaaaaaatgtttgtt |
22212337 |
T |
 |
| Q |
119 |
tagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccct |
218 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
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| T |
22212336 |
taacagtataatattcacgagaaccataaaaatatggattataatatgtaat-tacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctaccct |
22212238 |
T |
 |
| Q |
219 |
tttccttgggaaatttttt-ctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
292 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22212237 |
tttctttgggaaatttttttctattcccaggaacgttttatacgcgggattaaaatttattaaacttgtaacaaa |
22212163 |
T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 126 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6656457 - 6656225
Alignment:
| Q |
126 |
ataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcctt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
6656457 |
ataatattcttaggaaccaaaaaaatacagattataataggtaa-ctatttatgattttattcccatctccatggaaactttatttccaccctttttatt |
6656359 |
T |
 |
| Q |
226 |
gggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattccc |
325 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
6656358 |
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6656260 |
T |
 |
| Q |
326 |
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360 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6656259 |
aaaaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaca |
6656225 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43446229 - 43445890
Alignment:
| Q |
13 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg |
112 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43446229 |
gggtttgtttgtttaaagtgtaccaaattgatttctatgaataacatttatcggaatataaagataggaattttattttaaggtattta-gaaaaatatg |
43446131 |
T |
 |
| Q |
113 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||| | |||||||||||| || || | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43446130 |
tttggttaacattataatattctaaagaacattaaagataggaaatataataggtaat-tacacataattttattctcatctccatgagaactttattcc |
43446032 |
T |
 |
| Q |
213 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa |
312 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | |
|
|
| T |
43446031 |
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43445932 |
T |
 |
| Q |
313 |
tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
354 |
Q |
| |
|
| ||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43445931 |
taattttattcgcaagaatctataaatataacttgaaacaaa |
43445890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 38529012 - 38528772
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||| |
|
|
| T |
38529012 |
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38528914 |
T |
 |
| Q |
152 |
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251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || || || ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38528913 |
agggattataatatgcaat-tacacataaatttattctcatcttcatgagaactttattctcacctttttctttg--atatttattctattcccaataac |
38528817 |
T |
 |
| Q |
252 |
attttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38528816 |
attttatacccaagaataaaatctagtaaacttgtaacaaacata |
38528772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17276510 - 17276355
Alignment:
| Q |
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taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
17276510 |
taagggtgtgtttgtttcaattttacaaaatttatttctaggaataacattccttggaatatatagatgtaaattttattccaagatatttagaaaaaag |
17276411 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttgg-ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
164 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
17276410 |
atgtttggtttaacattataatattccaagaaaccttaaaaataaggattacaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 31598449 - 31598598
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16 |
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115 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
31598449 |
tgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttttgggaataacatttcttggaatataaagataggaattttatttcaaggtatttaaaaaaaagatgttt |
31598548 |
T |
 |
| Q |
116 |
ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag |
165 |
Q |
| |
|
| ||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31598549 |
gtttaacattataatatacctgggaatcataaaaataggatttataatag |
31598598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47246366 - 47246070
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58 |
attccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggga |
156 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||||| | ||||| ||||||||| | | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
47246366 |
attctttggaatataaa-atgtgaattttattcaaaagtatttagaaaaaaagatgtttggtcaacattataatactcctag--accttaaaaataggga |
47246270 |
T |
 |
| Q |
157 |
ttataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatttt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
47246269 |
ttataatagatagtttacacatgaatttattctcatattcatgggaactttattctcacccttttcttttaaaaaaaatt-caattcctaagaacatttt |
47246171 |
T |
 |
| Q |
257 |
atacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc--aatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
354 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47246170 |
atacctgagaataaaattcagtaaacttgtaacaaacatagaaatatatatttctatatcattttatttctaagaatctacaaatataatttgaaacaaa |
47246071 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43569966 - 43569773
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178 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
43569966 |
aattttattctaaggtatttaacaaaaatatatgtttgattaactttataatatttttagaaatcataaaaatagggattataatagataat-tatttat |
43569868 |
T |
 |
| Q |
179 |
gaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaat |
273 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43569867 |
gaatttatttacatcctcatgtgaattttattcccaccctttttcttaggtaaatttttatatttcgaagaatattttatacccgggaataaaat |
43569773 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 64
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| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattcctt |
64 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16916236 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattcctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
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322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
10902779 |
ttttttctattcccaaaaacattttatatccaaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
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| Q |
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Q |
| |
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||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||| | || ||| |
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| T |
10902971 |
cttgggatataaagatgtgaattttagcccaaggtatttatgaaaaagatgtttggttaacattataatattcattggaaccttaaaaatatgaatcata |
10902872 |
T |
 |
| Q |
162 |
ataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10902871 |
ataggcagtttacacatgaatttattctcatcttcatgtgaactttattc |
10902822 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 359
Target Start/End: Original strand, 45723211 - 45723276
Alignment:
| Q |
294 |
atagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45723211 |
ataggcatatatattcctatcattttattctcgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
45723276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 55
Target Start/End: Original strand, 40212626 - 40212669
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaata |
55 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40212626 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaata |
40212669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 323
Target Start/End: Original strand, 30871130 - 30871221
Alignment:
| Q |
232 |
ttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattc |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || || ||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
30871130 |
ttttttctattcccacaaacatttgatatccgaaaataaaacttaataaacttgtaacaaacataaaaatgtatatttctatcattttattc |
30871221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 292
Target Start/End: Original strand, 31598623 - 31598679
Alignment:
| Q |
235 |
tttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31598623 |
tttctattcc-aggaacgttttataccttgtaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
31598679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Original strand, 30870944 - 30871074
Alignment:
| Q |
19 |
gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggt |
118 |
Q |
| |
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| T |
30870944 |
gtttgtttcaaatttactaaatttattcttaagaataacattctttaaaatataa--aagtgaattttattttaaagtatttaaaaaaatgatgttcggt |
30871041 |
T |
 |
| Q |
119 |
tagctttataatattcctaggaaccataaaaata |
152 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||| ||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
30871042 |
taacattataatatt-ctatgaaccttaaaaata |
30871074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4765909 - 4765562
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4765909 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatat |
4765810 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
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|
| T |
4765809 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
4765710 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4765709 |
ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcct |
4765610 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765609 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
4765562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22936263 - 22935914
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22936263 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat |
22936164 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
209 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22936163 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
22936064 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22936063 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
22935964 |
T |
 |
| Q |
310 |
caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22935963 |
caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
22935914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29543364 - 29543017
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29543364 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatat |
29543265 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29543264 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc |
29543165 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29543164 |
ccaccctttttcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
29543065 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29543064 |
atcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
29543017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 18411931 - 18412278
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18411931 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
18412030 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412031 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc |
18412130 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18412131 |
ccacctttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct |
18412230 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412231 |
atcattttattcccaggaatcaataattataacttgaaacaaacacac |
18412278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19065859 - 19065507
Alignment:
| Q |
7 |
tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaa |
106 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19065859 |
tattatggatgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaa |
19065760 |
T |
 |
| Q |
107 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065759 |
tatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaatatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
19065660 |
T |
 |
| Q |
207 |
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306 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19065659 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
19065560 |
T |
 |
| Q |
307 |
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359 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065559 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
19065507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 15 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11856001 - 11855658
Alignment:
| Q |
15 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11856001 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtt |
11855902 |
T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca |
214 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
11855901 |
tggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattccca |
11855802 |
T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc |
314 |
Q |
| |
|
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|
| T |
11855801 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatc |
11855702 |
T |
 |
| Q |
315 |
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358 |
Q |
| |
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||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11855701 |
attttattctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
11855658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12970879 - 12970532
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12970879 |
agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
12970780 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12970779 |
gtttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattc |
12970680 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
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| T |
12970679 |
ccacccttttccttaagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct |
12970580 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12970579 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
12970532 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Original strand, 28602271 - 28602624
Alignment:
| Q |
5 |
aatattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaaga |
104 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
28602271 |
aatactaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttagga |
28602370 |
T |
 |
| Q |
105 |
aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaac |
204 |
Q |
| |
|
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|
| T |
28602371 |
aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccatacaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaac |
28602470 |
T |
 |
| Q |
205 |
tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata |
304 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
28602471 |
tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattctcagaaacattttata-ccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
28602569 |
T |
 |
| Q |
305 |
cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28602570 |
cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
28602624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 556053 - 555708
Alignment:
| Q |
14 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
556053 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt |
555954 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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313 |
Q |
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555754 |
T |
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359 |
Q |
| |
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555753 |
cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
555708 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14207170 - 14206823
Alignment:
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Q |
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T |
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| Q |
112 |
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211 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
212 |
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311 |
Q |
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14206871 |
T |
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| Q |
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359 |
Q |
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| T |
14206870 |
atcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
14206823 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 357
Target Start/End: Original strand, 6091434 - 6091782
Alignment:
| Q |
9 |
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108 |
Q |
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T |
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| Q |
109 |
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208 |
Q |
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T |
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| Q |
209 |
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308 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
309 |
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Q |
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| T |
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tatatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8646735 - 8646412
Alignment:
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Q |
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T |
 |
| Q |
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Q |
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T |
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| Q |
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Q |
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T |
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| Q |
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340 |
Q |
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8646436 |
ttttattcccgggaatcaacaatta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 27481082 - 27481426
Alignment:
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114 |
Q |
| |
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gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtt |
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T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca |
214 |
Q |
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| T |
27481182 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataatatgtaaactatttatgaatttattctcatcttcatgggaactttattccca |
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T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc |
314 |
Q |
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| T |
27481282 |
cccttttccttgggaaatattttttattctcaggaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatc |
27481381 |
T |
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| Q |
315 |
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359 |
Q |
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| T |
27481382 |
attttatttccaaaaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Original strand, 8406616 - 8406959
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
8406716 |
gtttggttagctttataatattccaaggaaccaaaaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
8406815 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
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| T |
8406816 |
ccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagcaaacttgtaacaaatataggcatgtacattcct |
8406915 |
T |
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| Q |
312 |
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355 |
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8406916 |
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T |
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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 359
Target Start/End: Original strand, 32535658 - 32536006
Alignment:
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110 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |
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| T |
32535658 |
aagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttaatccaaggaatttaggaaaaata |
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T |
 |
| Q |
111 |
tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt |
210 |
Q |
| |
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| T |
32535758 |
tgtttggttagctttataatattctcaggaaccataaaaataggggttataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt |
32535857 |
T |
 |
| Q |
211 |
ctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc |
310 |
Q |
| |
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| T |
32535858 |
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32535957 |
T |
 |
| Q |
311 |
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359 |
Q |
| |
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| T |
32535958 |
tatcattttattcctgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac |
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T |
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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
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Target Start/End: Original strand, 36703654 - 36703943
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Q |
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ataaagatgagaattttattccaaagaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccatcaaaatagggattataataggtaa |
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T |
 |
| Q |
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Q |
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| T |
36703754 |
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36703853 |
T |
 |
| Q |
270 |
aaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
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| T |
36703854 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Original strand, 27480735 - 27481069
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ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt |
113 |
Q |
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27480735 |
ggtgtgtttattttaagtttaccaaatttatttttaggaataatatttcttgaaatataaagatgagaattttatttcaaggtatttagaaaaaatatgc |
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T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
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| T |
27480835 |
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27480933 |
T |
 |
| Q |
214 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat |
313 |
Q |
| |
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| T |
27480934 |
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27481032 |
T |
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| Q |
314 |
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350 |
Q |
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| T |
27481033 |
cattttattctcaaaaatcaacaaatataacttgaaa |
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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 6930362 - 6930713
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109 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
209 |
Q |
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atgtttggttaactttataatattcctagaaaccttacagatagagattataatagataa-ctagatataaatttatttccatcttcatgggaactttat |
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T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat-- |
307 |
Q |
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tcccacaattttctttgggaaattttt-ctattcccaataatattttatatccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatat |
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T |
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| Q |
308 |
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359 |
Q |
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atttctatcattttattctcaggaatcaacaaatataacttgaaataaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42012530 - 42012181
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T |
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| Q |
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tt----tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta |
208 |
Q |
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| T |
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ttataataggtaactatataatactccttggaaccataaaaatatggattataataggtaa-ctatataagaatttattctgatctccatgtgaacttta |
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T |
 |
| Q |
209 |
ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt |
308 |
Q |
| |
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| T |
42012331 |
ttcccacccttttccttcggaaattttttctattcctaggaacattttatactcgagaataaaatttagtaaatttgtaacaaacatagacatatgtatt |
42012232 |
T |
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| Q |
309 |
ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
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| T |
42012231 |
tctatcattttattcccgagaatcaacaaatatagcttcaaacaaacacac |
42012181 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 296
Target Start/End: Original strand, 1664456 - 1664736
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Q |
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| T |
1664456 |
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T |
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214 |
Q |
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T |
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296 |
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1664736 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 359
Target Start/End: Original strand, 20962373 - 20962659
Alignment:
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171 |
Q |
| |
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| T |
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20962471 |
T |
 |
| Q |
172 |
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271 |
Q |
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| T |
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20962571 |
T |
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| Q |
272 |
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359 |
Q |
| |
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| T |
20962572 |
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20962659 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43347243 - 43346897
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
| |
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| T |
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43347144 |
T |
 |
| Q |
112 |
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| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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311 |
Q |
| |
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| T |
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43346945 |
T |
 |
| Q |
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359 |
Q |
| |
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| T |
43346944 |
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43346897 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 164
Target Start/End: Original strand, 36703506 - 36703656
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| Q |
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113 |
Q |
| |
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|
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| T |
36703506 |
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36703605 |
T |
 |
| Q |
114 |
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164 |
Q |
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|
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| T |
36703606 |
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36703656 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26637370 - 26637045
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| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
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| T |
26637370 |
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26637271 |
T |
 |
| Q |
112 |
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210 |
Q |
| |
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| T |
26637270 |
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26637176 |
T |
 |
| Q |
211 |
ctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc |
310 |
Q |
| |
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| T |
26637175 |
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26637094 |
T |
 |
| Q |
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359 |
Q |
| |
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| T |
26637093 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 17251534 - 17251854
Alignment:
| Q |
10 |
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108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||| |
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| T |
17251534 |
taagggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattccta-caataacatttcttggaatataaggataggaatttttttccaaggtatttagataaaaa |
17251632 |
T |
 |
| Q |
109 |
tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta |
208 |
Q |
| |
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||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |
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| T |
17251633 |
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17251730 |
T |
 |
| Q |
209 |
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308 |
Q |
| |
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| T |
17251731 |
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17251830 |
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 |
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332 |
Q |
| |
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| |||||||||||| | |||||| |
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| T |
17251831 |
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17251854 |
T |
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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35348858 - 35348534
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125 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || | | ||||| |||||| ||| | || |
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| T |
35348858 |
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35348759 |
T |
 |
| Q |
126 |
ataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcctt |
225 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |
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| T |
35348758 |
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35348660 |
T |
 |
| Q |
226 |
gggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattccc |
325 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| |
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| T |
35348659 |
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T |
 |
| Q |
326 |
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355 |
Q |
| |
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| |||| || ||||||| ||||||||||| |
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gaaaatctacgattataa-ttgaaacaaac |
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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
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Target Start/End: Complemental strand, 31583404 - 31583123
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115 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||| |||| ||||| |||||| || || |
|
|
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31583306 |
T |
 |
| Q |
116 |
ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac |
215 |
Q |
| |
|
| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
31583305 |
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T |
 |
| Q |
216 |
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300 |
Q |
| |
|
| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
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Target Start/End: Complemental strand, 40276011 - 40275766
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| | || || | ||||||||||||| |||||||| |
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T |
 |
| Q |
204 |
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303 |
Q |
| |
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|||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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40275813 |
T |
 |
| Q |
304 |
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350 |
Q |
| |
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||| || ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |
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40275812 |
gtatttttataattttattcccaaaaatctacaaatataacttgaaa |
40275766 |
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Q |
| |
|
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|
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28429450 |
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T |
 |
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111 |
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152 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| || |||| |||||||| |
|
|
| T |
28429550 |
tgtttggttaacattataatattctcagaaaccttaaaaata |
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T |
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114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |
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|
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16721029 |
tgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacattcattggaatataaaaatgtgaattttattcaaagatatttaaaaaaatatatatgtt |
16720930 |
T |
 |
| Q |
115 |
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134 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
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tgattatcattataatattc |
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109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||| |
|
|
| T |
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taagggtgtgtttggttcaagtgtaccaaatt-atttttaggaataacattttttggaatataaagatagaaattttattctaaagtatttaaaaaaaat |
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T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
169 |
Q |
| |
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||||||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |
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|
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--gtttggttaacattttaatattccaaggaaccttaaaaatatggtatataataggtaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
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16 |
tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt--aagaaaaatatgt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||| |||| |
|
|
| T |
36978478 |
tgtgtttgtttcaagtttattaaatttatttataggaataacattctttagaatataaatatgagaattttattttaaggtatttaaaaaaaaaacatgt |
36978379 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaacc-ataaaaatagggattataataggta |
168 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36978378 |
ttagttagcattataatattcacaggagcctgaaaaaatagggattataaaaggta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 296
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tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
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30899470 |
tttattctcacccttttctttggaaaattgtttctattcccaagaatattttatatccaggaataaaatttagaaaacttgtaacatacata |
30899561 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
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T |
 |
| Q |
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caaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
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Q |
| |
|
|||||||| |||| | ||| | || |||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19089789 |
caaacataaacatgcatatttctatttttttattcccaggaatttacgaatataacttaaaacaaac |
19089723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 301
Target Start/End: Original strand, 28023719 - 28023844
Alignment:
| Q |
177 |
atgaatttattcccatctccatgggaa-ctttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattt |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
28023719 |
atgaatttattctcatcttcgtgagaaactttattctcacccttttgtttgagaaattttttctattcccaaacacattttatatgtgagaataaaattt |
28023818 |
T |
 |
| Q |
276 |
agtaaacttgtaacaaacatagacat |
301 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28023819 |
aatgaacttgtaacaaatatagacat |
28023844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Original strand, 20962286 - 20962348
Alignment:
| Q |
16 |
tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatg |
78 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20962286 |
tgtgtttgttttaagtttatcaaatttattcataggaataacattccttggaacataaagatg |
20962348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 152
Target Start/End: Original strand, 30899327 - 30899463
Alignment:
| Q |
16 |
tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcct-aggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
30899327 |
tgtgtttgtttcaagtttacaaaatttattgttaagaaataacattttttgaaatataaagatgagaaatttatt-caatgtatttagaaaaaagatgtt |
30899425 |
T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaata |
152 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
30899426 |
tggttaactttattatattctcacgaaccttaaaaata |
30899463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 40276587 - 40276514
Alignment:
| Q |
14 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttat |
88 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
40276587 |
ggtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcttggtaataacattcctt-gaatataaagatgataaatttat |
40276514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15200676 - 15200552
Alignment:
| Q |
230 |
aattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccggga |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |
|
|
| T |
15200676 |
aattttttctat-cccagaaacattttatgcctgagaataaaatttaataaatttataacaaacatagacatatatatttatatcattttattttcaaaa |
15200578 |
T |
 |
| Q |
330 |
atcaacaattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15200577 |
atctataaatataacttgaaacaaac |
15200552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 322
Target Start/End: Original strand, 28429617 - 28429733
Alignment:
| Q |
205 |
tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || || || ||||||| ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |
|
|
| T |
28429617 |
tttattctcacccttttctttcgggaaatttttctgctcc-atgaatgttttatattcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcatgta |
28429715 |
T |
 |
| Q |
305 |
cattccaatcattttatt |
322 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
28429716 |
tatttctatcattttatt |
28429733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41783749 - 41783624
Alignment:
| Q |
232 |
ttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaat |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| || |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
41783749 |
ttttttctattttcagaaacattttatatccgagaataaaatttagtaaacttataacaaacatatgcgtgtacatttttatgattttaatcccaagaat |
41783650 |
T |
 |
| Q |
332 |
caacaattataacttgaaacaaacac |
357 |
Q |
| |
|
| | || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41783649 |
ctataaatataacttgaaataaacac |
41783624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3913327 - 3913206
Alignment:
| Q |
232 |
ttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaat |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||| | ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
3913327 |
ttttttctattcctaa-aacattttatacctgg-aataaaatttagtaaatttgtaataaacatacacatgtatatttctatcgttttattcccaagaat |
3913230 |
T |
 |
| Q |
332 |
caacaattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
| || | |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3913229 |
ctacgaatataacttgaaataaac |
3913206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19090016 - 19089898
Alignment:
| Q |
16 |
tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattc-cttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| || |
|
|
| T |
19090016 |
tgtgtttgattcaaatttaccaaatttatttttaagaataatattttcttagaacataaagatgagaattctattccaaggtatatagaaaaaatatatt |
19089917 |
T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatatt |
133 |
Q |
| |
|
|| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
19089916 |
tgtttaacattataatatt |
19089898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 27079308 - 27079206
Alignment:
| Q |
13 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| || ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27079308 |
gggtgtgtttctttccggtttaccaaatttagttgaaggaatagcattcatttgaacataaagatggaaattttattctaaggtatttaa-aaaaatatg |
27079210 |
T |
 |
| Q |
113 |
tttg |
116 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
27079209 |
tttg |
27079206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36978269 - 36978210
Alignment:
| Q |
263 |
gggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt |
322 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
36978269 |
gggaataaaattttgtaagtttgtaacaaacatagacatatatatttctatcattttatt |
36978210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16720321 - 16720277
Alignment:
| Q |
252 |
attttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16720321 |
attttatacccgataataaaatttagtaaacttgcaacaaacata |
16720277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Original strand, 27901697 - 27901760
Alignment:
| Q |
28 |
aagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattcc |
91 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27901697 |
aagtttacaaaatttattcttaagaacaacattctttagaatataaagatatgaattttattcc |
27901760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 6696864 - 6696755
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataa-cattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaata |
110 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| || || ||||||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
6696864 |
agggtgcgtttgtttcatggatacacaatttattcctaggaattatctttccctggaatataaaggtgtgatttttattcctaggaaaatatgaaaaaag |
6696765 |
T |
 |
| Q |
111 |
tgtttggtta |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
6696764 |
tgtttggtta |
6696755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 346694 - 346347
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
346694 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
346595 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
346594 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
346495 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
346494 |
ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcct |
346395 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
346394 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
346347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 6171513 - 6171860
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6171513 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
6171612 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6171613 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
6171712 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6171713 |
ccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct |
6171812 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6171813 |
atcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
6171860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42675015 - 42674663
Alignment:
| Q |
7 |
tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaa |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42675015 |
tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacatttcttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttaggaaa |
42674916 |
T |
 |
| Q |
107 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42674915 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactt |
42674816 |
T |
 |
| Q |
207 |
tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
306 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
42674815 |
tattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatgcccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
42674716 |
T |
 |
| Q |
307 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42674715 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
42674663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 4559279 - 4559628
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4559279 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaagaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat |
4559378 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4559379 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
4559478 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4559479 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
4559578 |
T |
 |
| Q |
310 |
caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4559579 |
caatcattttattcttgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
4559628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14777847 - 14777500
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
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14777500 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 37192242 - 37192591
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109 |
Q |
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T |
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T |
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T |
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359 |
Q |
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| T |
37192542 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Original strand, 17965707 - 17966052
Alignment:
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14 |
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113 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
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T |
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| T |
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| T |
17966007 |
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T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 11071327 - 11071674
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| Q |
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111 |
Q |
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| T |
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311 |
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359 |
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T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 360
Target Start/End: Original strand, 2050586 - 2050936
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10 |
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Q |
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209 |
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| Q |
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309 |
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T |
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360 |
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T |
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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21737761 - 21737402
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T |
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| Q |
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| Q |
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299 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9734190 - 9733848
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216 |
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316 |
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| T |
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9733891 |
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359 |
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| T |
9733890 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5770458 - 5770115
Alignment:
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Q |
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| Q |
113 |
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212 |
Q |
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| T |
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5770259 |
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213 |
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312 |
Q |
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| T |
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356 |
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5770158 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41729479 - 41729132
Alignment:
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agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
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Q |
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T |
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| Q |
112 |
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211 |
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| T |
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gtttggttagctttataatattcctagtaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattc |
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T |
 |
| Q |
212 |
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311 |
Q |
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| T |
41729279 |
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41729180 |
T |
 |
| Q |
312 |
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359 |
Q |
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| T |
41729179 |
atcattttattcccgggaataaaaaattataacttgaaacaaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 638318 - 638660
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113 |
Q |
| |
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ggtgtgtttgatttaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt |
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T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
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ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattc-c |
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T |
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| Q |
214 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat |
313 |
Q |
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| T |
638517 |
ccccttttccttgggaaattttttatattcctaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacctgtaacaaacatagacatatacattcctat |
638616 |
T |
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| Q |
314 |
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357 |
Q |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 37533675 - 37534021
Alignment:
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12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
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gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
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Q |
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gtttggttagctttata-tattcctgggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
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212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
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ccacccttttttttgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcct |
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T |
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atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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37533974 |
atcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
37534021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28312042 - 28311701
Alignment:
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15 |
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114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28312042 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcataggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttaggaaaaatatgtt |
28311943 |
T |
 |
| Q |
115 |
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214 |
Q |
| |
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|
|
| T |
28311942 |
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28311844 |
T |
 |
| Q |
215 |
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314 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
28311843 |
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28311744 |
T |
 |
| Q |
315 |
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357 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28311743 |
attttattcccgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacac |
28311701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 37233155 - 37233496
Alignment:
| Q |
15 |
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114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37233155 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttaggaaaaatatgtt |
37233254 |
T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca |
214 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37233255 |
tggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaataaggattataataggtaa-ctatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccca |
37233353 |
T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc |
314 |
Q |
| |
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|
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| T |
37233354 |
cccttttccttgggaacgattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatgttcctatc |
37233453 |
T |
 |
| Q |
315 |
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357 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37233454 |
attttattcccgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacac |
37233496 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 2521434 - 2521744
Alignment:
| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2521434 |
aggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaa |
2521533 |
T |
 |
| Q |
149 |
aatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccagg |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2521534 |
aatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaattttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagg |
2521633 |
T |
 |
| Q |
249 |
aacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttga |
348 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2521634 |
aacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattttcgggaatcaacaattataacttga |
2521733 |
T |
 |
| Q |
349 |
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359 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
2521734 |
aacaaacacac |
2521744 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 40951208 - 40950861
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40951208 |
agggtatgtttgtttcaaatttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgaaaattttattccaaagaatttaggaaaaatat |
40951109 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
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|
|
| T |
40951108 |
gtttggttagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc |
40951009 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
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|
| T |
40951008 |
ccacccttttccttggaaatttttttgtattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataagcatatatatttct |
40950909 |
T |
 |
| Q |
312 |
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359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
40950908 |
atcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
40950861 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 26309993 - 26310335
Alignment:
| Q |
16 |
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115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
26309993 |
tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaatagcattccttggaatataaagatgggaattttattacaagaaatttaggaaaaatatggtt |
26310092 |
T |
 |
| Q |
116 |
ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac |
215 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26310093 |
ggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccac |
26310192 |
T |
 |
| Q |
216 |
ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaac--atagacatatacattccaat |
313 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
26310193 |
ccttttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttctaacaaacatatagacatatacatttctat |
26310292 |
T |
 |
| Q |
314 |
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356 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26310293 |
cattttattcccgggaatcaacaattataactttaaacaaaca |
26310335 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Original strand, 41750276 - 41750598
Alignment:
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37 |
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136 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41750276 |
aaatttattcctaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttatttcaaggaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcct |
41750375 |
T |
 |
| Q |
137 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttt |
236 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
41750376 |
aagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
41750475 |
T |
 |
| Q |
237 |
tctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaaca |
336 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
41750476 |
tctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcctaggaatcaaca |
41750575 |
T |
 |
| Q |
337 |
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359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41750576 |
attataacttgaaacaaacacac |
41750598 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20426830 - 20426485
Alignment:
| Q |
13 |
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112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20426830 |
gggtgtgtttgtttaaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttatttcaatgtatttagaaaaaatatg |
20426731 |
T |
 |
| Q |
113 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20426730 |
tttggttaactttataatattcctaccaaccataaaaatagagattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatctccataggaactttattct |
20426632 |
T |
 |
| Q |
213 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa |
312 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20426631 |
cacccttttccttgggaaaaattttctattcccaggaacattttatatccggggataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataaattccta |
20426532 |
T |
 |
| Q |
313 |
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359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20426531 |
tcattttattcccgggaatcaacaaatataatttgaaacaaacacac |
20426485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 36 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34357023 - 34356702
Alignment:
| Q |
36 |
caaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcc |
135 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34357023 |
caaatttattcttaggaatagcattccttggaatataa-gataggaattttattccaagaaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcc |
34356925 |
T |
 |
| Q |
136 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaatttt |
235 |
Q |
| |
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|
|
| T |
34356924 |
taggaaccataaaaatagagattataataggaaaattatttatgaatttattcccat-tccgtgggaactttattcccaccattttccttgggaaatttt |
34356826 |
T |
 |
| Q |
236 |
ttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaac |
335 |
Q |
| |
|
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|
| T |
34356825 |
ttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatatacatttctatcattttattcccgggaatcaac |
34356726 |
T |
 |
| Q |
336 |
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359 |
Q |
| |
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|
| T |
34356725 |
aattataacttgaaacaaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27358303 - 27357965
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119 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || |
|
|
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tttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataacatttattggaatataaagatgagaattttatttcaaggtatttagcaaaaatatgtttgatt |
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T |
 |
| Q |
120 |
agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt |
219 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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aaatttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatctctatgggaactttattcccaccctt |
27358105 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatttt |
319 |
Q |
| |
|
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|
|
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ttccttgggtaaatttttctattcccatgaatattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatccctatcatttt |
27358005 |
T |
 |
| Q |
320 |
attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27358004 |
atacctgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 45408981 - 45409319
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20 |
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119 |
Q |
| |
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tttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataacatttattggaatataaagatgagaattttattccaaggtatttagcaaaaatatgtttgatt |
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T |
 |
| Q |
120 |
agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt |
219 |
Q |
| |
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| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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| T |
45409081 |
aaatttataatatttctaggaaccataaaaataaggattataataggtaa-ctatttatgaatttatttccatctccatgggaactttattcccaccctt |
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T |
 |
| Q |
220 |
ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatttt |
319 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |
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ttccttgggtaaatttttctattcccatgaatattttatacccggtaataaaatttagtaaacttgtaaaaaacataggcatatacattcctatcatttt |
45409279 |
T |
 |
| Q |
320 |
attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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|| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 65 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39995435 - 39995133
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65 |
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| |
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|
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ggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatt--------tt |
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| |
|
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257 |
atacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
356 |
Q |
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T |
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359 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
39995135 |
cac |
39995133 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 292
Target Start/End: Original strand, 23943885 - 23944165
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111 |
Q |
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| T |
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T |
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211 |
Q |
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| T |
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T |
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212 |
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292 |
Q |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
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114 |
Q |
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T |
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Q |
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13760891 |
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261 |
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13760892 |
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T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18714005 - 18713660
Alignment:
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111 |
Q |
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| T |
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T |
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112 |
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211 |
Q |
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| T |
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18713807 |
T |
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| Q |
212 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
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18713707 |
T |
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358 |
Q |
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| T |
18713706 |
atcattttattaccatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacaca |
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T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
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Target Start/End: Original strand, 45693909 - 45694253
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Q |
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| T |
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45694008 |
T |
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| Q |
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209 |
Q |
| |
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| T |
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45694107 |
T |
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| Q |
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309 |
Q |
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| T |
45694108 |
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45694207 |
T |
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355 |
Q |
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T |
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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 14832536 - 14832877
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Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
115 |
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214 |
Q |
| |
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| T |
14832636 |
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14832734 |
T |
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| Q |
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314 |
Q |
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| T |
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14832834 |
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357 |
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14832835 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 3902182 - 3902521
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114 |
Q |
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T |
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| Q |
115 |
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214 |
Q |
| |
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| T |
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3902380 |
T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc |
314 |
Q |
| |
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|| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||| |
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| T |
3902381 |
ccattttctttgggaatttttttctattcccaggaacattttaaacctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgtctatatatttctatc |
3902480 |
T |
 |
| Q |
315 |
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355 |
Q |
| |
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3902481 |
attttattctcaggaaagaacaaatataacttgaaacaaac |
3902521 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
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Target Start/End: Original strand, 1988073 - 1988380
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Q |
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|
|
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| Q |
151 |
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250 |
Q |
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1988173 |
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1988271 |
T |
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251 |
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350 |
Q |
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1988371 |
T |
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359 |
Q |
| |
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|
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| T |
1988372 |
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1988380 |
T |
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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 40569740 - 40570089
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111 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
112 |
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208 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
209 |
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308 |
Q |
| |
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|
|
| T |
40569939 |
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40570038 |
T |
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309 |
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359 |
Q |
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|
| T |
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T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #35
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaac---tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt |
210 |
Q |
| |
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| T |
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ttggttgactttataatattccaaggaaccttaaaaataaggattatattaggtaaacaaacatatataattttactctcatcttcatgagaactttatt |
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T |
 |
| Q |
211 |
ctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaac---attttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat |
307 |
Q |
| |
|
| |||| ||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
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| T |
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39819713 |
T |
 |
| Q |
308 |
tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
357 |
Q |
| |
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| || |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
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tttcatgattttattttcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
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Target Start/End: Original strand, 7007307 - 7007642
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Q |
| |
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 |
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112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
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Q |
| |
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T |
 |
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212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| | |
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| T |
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T |
 |
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312 |
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359 |
Q |
| |
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|||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |
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|
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atcattttatccccaagaatcaacaaatataacttgaaataaacacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41298255 - 41297983
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agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt |
219 |
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| |
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T |
 |
| Q |
220 |
ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
296 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||| |||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41298059 |
tgctttgggaaattttttttatttctaaaaacattttatatccgggaataaaatttaataaacttgtaacatacata |
41297983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5003182 - 5002843
Alignment:
| Q |
14 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| |
|
|
| T |
5003182 |
ggtgtgtttgtttaaaatttaccaaatttatttataggaataacattccttggaatataaagatgcgaattttattccaaggtatttggataaaagatgt |
5003083 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
|
||||||| | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
5003082 |
ttggttaacattttaatattttcaggaaccataaaaatatggattataataggt-agttacacatgaattgattcatatcttcatggaaactttattccc |
5002984 |
T |
 |
| Q |
214 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat |
313 |
Q |
| |
|
||| | ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| || | | | || |
|
|
| T |
5002983 |
accatattctttggaattttttttctattcccagaaacattttata-cttggaataaaatttagcaaacttgtaacaaatatatgcatgtatacttctat |
5002885 |
T |
 |
| Q |
314 |
cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5002884 |
cattttattcttagaaatctacaaatataacttgaaacaaac |
5002843 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 4875506 - 4875840
Alignment:
| Q |
20 |
tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaatatgtttggt |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| | |
|
|
| T |
4875506 |
tttgtttcaagtttgtcaaatttattcttaggaataatattctttggaatataaagatgtgaattttattccaatgtatttagaaaaaaatatgttttct |
4875605 |
T |
 |
| Q |
119 |
tagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccct |
218 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4875606 |
taacattataatatgccgaggaaccataaaaatagggattataatatgt-aattacatatgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccg |
4875704 |
T |
 |
| Q |
219 |
tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattt |
318 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||| ||||| | |||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||| |
|
|
| T |
4875705 |
tttctttgggattttttttttattctcgagaacgttttata-ttgaaaataaaatttagcaaacttgtaacaaacataaacaaatttatttctatcattt |
4875803 |
T |
 |
| Q |
319 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
|||| || || | |||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4875804 |
tatttccaaaaagctacaaatataacttaaaacaaac |
4875840 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11763577 - 11763374
Alignment:
| Q |
154 |
ggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacat |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
11763577 |
ggattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatcttcatggaaactttattcccacctttttcctttggaaattttttctattcccagaaatat |
11763479 |
T |
 |
| Q |
254 |
tttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaa |
353 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
11763478 |
tttatgtccgagaataaaatttagtaaatttataacaaacatagacatatatattcctatcatttcattcccgaaaaacaacaaatataacttgaaa-aa |
11763380 |
T |
 |
| Q |
354 |
acacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
11763379 |
acacac |
11763374 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11763737 - 11763597
Alignment:
| Q |
24 |
tttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagct |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
11763737 |
tttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggtatctagaaaaaatatgtttgattaatt |
11763638 |
T |
 |
| Q |
124 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11763637 |
ttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataata |
11763597 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 346
Target Start/End: Original strand, 14253412 - 14253578
Alignment:
| Q |
180 |
aatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta |
279 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14253412 |
aatttattctcatcttcatgaaaattttattcacacccttttctttgagaaattttttctattcccataaacattttatactcgggaataaaatttagta |
14253511 |
T |
 |
| Q |
280 |
aacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataactt |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14253512 |
aacttgtaacaaacatagacatatatatttctatcattttattcccgagaatcaacaaatataactt |
14253578 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 13790018 - 13790221
Alignment:
| Q |
18 |
tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt-aagaaaaatatgtttg |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| || ||||| ||||||| |
|
|
| T |
13790018 |
tgtttgtttcaagtttatcaaatttatttgtaggaataacattccttgaaatatatagatgtaaattttattctaaggtatttaaaaaaaaagatgtttg |
13790117 |
T |
 |
| Q |
117 |
gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatt-tatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac |
215 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13790118 |
attaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaa--tattacatgattttattcccatctccatgggaactttattcccac |
13790215 |
T |
 |
| Q |
216 |
cctttt |
221 |
Q |
| |
|
| |||| |
|
|
| T |
13790216 |
cgtttt |
13790221 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 301
Target Start/End: Original strand, 13539399 - 13539679
Alignment:
| Q |
20 |
tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtt |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| || |
|
|
| T |
13539399 |
tttgtttcaagtttaccaaatttatttttggtgataacatttcttggaacataaagatgagaattttattctaaaatatttagaaaaaagatgtttgctt |
13539498 |
T |
 |
| Q |
120 |
agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt |
219 |
Q |
| |
|
| | ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
13539499 |
aacattatagtattctcagaaaccataaaaataaggattataatagat-aattacacatgaatctattcccatgttcatgggaactttattcccactagt |
13539597 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacat |
301 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13539598 |
ttctgtgagaaattttttccattcccataaacattttatacctgcgaataaaatttaataaatttgtaacaaacatagacat |
13539679 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 205 - 359
Target Start/End: Original strand, 6571602 - 6571756
Alignment:
| Q |
205 |
tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata |
304 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6571602 |
tttattcctaccctttttcttgggaaattttttatattccccggaacattttatacctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
6571701 |
T |
 |
| Q |
305 |
cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
6571702 |
tattcctatcattttatttccggaaatcaacaaatataactttaaacaaatacac |
6571756 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3254437 - 3254284
Alignment:
| Q |
16 |
tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3254437 |
tgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttttaggaataacattctttggaatataaaaatgagaattttattctaaggtatttagaaaaaatatgttt |
3254338 |
T |
 |
| Q |
116 |
ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
169 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
3254337 |
ggttaacttcataatattcctagaaaccataaaaataagggttataataagtaa |
3254284 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 359
Target Start/End: Original strand, 25454968 - 25455093
Alignment:
| Q |
234 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
25454968 |
ttttctattcccaggaacattttatactcgagaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatgtatttttatgattttattctcaggaatct |
25455067 |
T |
 |
| Q |
334 |
acaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25455068 |
acaaatataacttgaaacaaacacac |
25455093 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 356
Target Start/End: Original strand, 1623206 - 1623448
Alignment:
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
1623206 |
gtttgattaactttatattattcgtaggaaccataaaaatagagattataattggtaa-ctacatatgaatttattctcatattcattgaaactttattc |
1623304 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
| || | ||| |||| ||| ||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
1623305 |
ccgccatgttctttggaaaaatttctctgtactcaggaacattttataaccgggaatcaaatttaataaactcgtaac-aacatagacatatatatttct |
1623403 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
356 |
Q |
| |
|
|| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
1623404 |
attattttactcttaggaatcaacaaatataatttaaaacaaaca |
1623448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 322
Target Start/End: Original strand, 4684945 - 4685211
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| Q |
53 |
ataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaata |
152 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||| | |||||||| || | ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4684945 |
ataacattctttagaacataaagatgagaattttattcctaggtatttagtaaaaatatatttgcttaacattataata-tcttcggatccataaaaata |
4685043 |
T |
 |
| Q |
153 |
gggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttg-ggaaattttttctattcccagg-aa |
250 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
4685044 |
tgaattataataggt----tacacatgaatttgttcccatcttcatgggaactttattcacacccttttctttgatttttttttttctattgccaggaaa |
4685139 |
T |
 |
| Q |
251 |
cattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt |
322 |
Q |
| |
|
| |||||||| | | ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
4685140 |
cgttttatactctgaaataaaatttaataaatttataacaaacataaacatgtatatttctatcattttatt |
4685211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 25724744 - 25725033
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9 |
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107 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| || || || ||||||||| || |||| | |||| |
|
|
| T |
25724744 |
ttaaggggctgtttgtttcaagtttactagatttattcccaagaataactttccttggaatttaaggaatgggagttttattcctagatattttaaaaaa |
25724843 |
T |
 |
| Q |
108 |
atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
207 |
Q |
| |
|
| |||||||||| || |||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||||| || ||| |||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
25724844 |
agttgtttggttaatattgtaatattcttggaaaccattataatagggaggttaataggtagttacacta-gaaattattctcatcttcatgagaacttt |
25724942 |
T |
 |
| Q |
208 |
attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaa-tttagtaaacttgtaacaaacatag |
297 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
25724943 |
attcccacccttttctttgggaaactttttctattcccagaaacattttatacccagcaataaaattttaataaacctgcaacaaacatag |
25725033 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Original strand, 1623078 - 1623188
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16 |
tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
1623078 |
tgtgtttgtttcaattttactaaatttattcctagtaataacatttcttggaatataaagatgagaattttatttcaa-gtatttagaaaatatatgttt |
1623176 |
T |
 |
| Q |
116 |
ggttagctttat |
127 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |
|
|
| T |
1623177 |
ggttaactttat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
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110 |
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209 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37851678 |
atgtttagttaacattataatatttttaggaatcataaaaatatgaattataataggtagt-tacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttat |
37851776 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttggga--aattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
37851777 |
tctcaccattttctttggaattttttttttctattcctagaaacattttatacccgaaaataaaa-ttagtaaacttctagcaaacata |
37851864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 248 - 359
Target Start/End: Original strand, 24499400 - 24499509
Alignment:
| Q |
248 |
gaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttg |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24499400 |
gaacattttataccatggaataaaatttagtaaacttataacaaacatag--atatatatttctatcattttatttctatgaatcaacaaatataacttg |
24499497 |
T |
 |
| Q |
348 |
aaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
24499498 |
aaacaaacacac |
24499509 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8868842 - 8868670
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| Q |
180 |
aatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta |
279 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
8868842 |
aatttatacccatcttcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaa-tattccta-tcccaggaacattttctacctaggaataaaatttacta |
8868745 |
T |
 |
| Q |
280 |
aacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| |||| ||| | |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8868744 |
atcctgtaacaaacataagaatatgtatttctatcaatttattcctaggaatctacaa-aataacttgaaacaaac |
8868670 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 73
Target Start/End: Original strand, 2521381 - 2521434
Alignment:
| Q |
20 |
tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataa |
73 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2521381 |
tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataa |
2521434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3254245 - 3254142
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| Q |
180 |
aatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaatt-ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagt |
278 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
3254245 |
aatttattctcatcttcatgggaactttattcccaccatttcctttgggaaaaaattttctattcccagaaacattttgtacgcgagaataaaatttagt |
3254146 |
T |
 |
| Q |
279 |
aaac |
282 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
3254145 |
aaac |
3254142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 89
Target Start/End: Original strand, 14253254 - 14253325
Alignment:
| Q |
18 |
tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttatt |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14253254 |
tgtttgttttaaatttaccaaatttatttttaggaataacattctttggaatataaggatgagaattttatt |
14253325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14403419 - 14403235
Alignment:
| Q |
177 |
atgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctat---tcccaggaacattttatacccgggaataaaat |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
14403419 |
atgaatttattctcacc-ccatgaaaactttattcacaccattttctttggtaaaatttttctttctatttcaggaacattttatacctgagaataaaat |
14403321 |
T |
 |
| Q |
274 |
ttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| ||| ||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14403320 |
ttattaaacttgtaataaatgtaggcatgtatatttttatcattttatttccaggaatcaacaaatacaacttcaaacaaacacac |
14403235 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 516572 - 516463
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| Q |
180 |
aatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta |
279 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| || |
|
|
| T |
516572 |
aatttattctcatcttcacgggaattttattctcaccattttctttgg-aatttttttatattcccaaaaacattttatacccagaaataaaatttacta |
516474 |
T |
 |
| Q |
280 |
aacttgtaaca |
290 |
Q |
| |
|
|| || ||||| |
|
|
| T |
516473 |
aaattataaca |
516463 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 358
Target Start/End: Original strand, 13760941 - 13761013
Alignment:
| Q |
286 |
taacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
358 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13760941 |
taacaaacataggtacatatattcctatcattttattcccgaaaatcaataattataacttgaaacaaacaca |
13761013 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 89
Target Start/End: Original strand, 25444916 - 25444999
Alignment:
| Q |
6 |
atattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttatt |
89 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25444916 |
atatttagggtgtgtatgttttaagtttgtcaaatttattttaaggaataacattttttggaatataaagatgataattttatt |
25444999 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1723324 - 1723230
Alignment:
| Q |
265 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| || || || ||| | |||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1723324 |
gaataaaatttaataaacttgtaacaaacattgaaatgtatatttccatcattttattcatggaaatatacaaacataacttgaaacaaacacac |
1723230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 322
Target Start/End: Original strand, 25625328 - 25625418
Alignment:
| Q |
232 |
ttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt |
322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
25625328 |
ttttttctattcccatgaacattttatacctcagaataaaatctagtaaatttgcaacaaacctagacattcatatttctatcattttatt |
25625418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14403555 - 14403431
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaa--gatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| | |||| |||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
14403555 |
agggtgagtttgttttaagtttatcaaatttatttttagaaataacagttcttgaaatataaaaagatggaaattttatactaaggtttttagaaaaaat |
14403456 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattc |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14403455 |
atttttggttaactttataatattc |
14403431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 93
Target Start/End: Original strand, 45212662 - 45212735
Alignment:
| Q |
20 |
tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaa |
93 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45212662 |
tttgttttaaatttatcaaatttatttttaggaattacattctttgaaatgtaaagatgagaattttattccaa |
45212735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 149
Target Start/End: Original strand, 14253345 - 14253413
Alignment:
| Q |
81 |
aattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
14253345 |
aattttattccaaaatatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatatttttaggaaacataaaa |
14253413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 93
Target Start/End: Original strand, 10390559 - 10390627
Alignment:
| Q |
23 |
gtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaa |
93 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10390559 |
gtttcaagtttaccaaatttattctta-gaattatattccttggaacataaa-atgagaactttattccaa |
10390627 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36590924 - 36590862
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatata |
72 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36590924 |
taagagtgagtttgttttaagtttactaaatttatttttaggaataacattcgttggaatata |
36590862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 240
Target Start/End: Original strand, 14137038 - 14137153
Alignment:
| Q |
124 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcc |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
14137038 |
ttataatattcccaacaaccataaaaatagagattttaataagtaat-tacatatgaatttattctcgtcttcatgagaactttattcttaacctttttt |
14137136 |
T |
 |
| Q |
224 |
ttgggaaattttttcta |
240 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
14137137 |
ttgagaaaatttttcta |
14137153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 46
Target Start/End: Original strand, 1498878 - 1498909
Alignment:
| Q |
15 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattc |
46 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1498878 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattc |
1498909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8868980 - 8868938
Alignment:
| Q |
20 |
tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattcc |
62 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
8868980 |
tttgtttcaagtttactaaatttattcctacgaataactttcc |
8868938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8476657 - 8476310
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8476657 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
8476558 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476557 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
8476458 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
8476457 |
ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacaggcatatacattcca |
8476358 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476357 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
8476310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 26848744 - 26849091
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26848744 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
26848843 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26848844 |
gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttattc |
26848943 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26848944 |
ccacccttttccttaggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct |
26849043 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26849044 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
26849091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11239471 - 11239122
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11239471 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat |
11239372 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239371 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
11239272 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
|
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| T |
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11239172 |
T |
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359 |
Q |
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| T |
11239171 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
11239122 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 40907986 - 40908334
Alignment:
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109 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
110 |
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209 |
Q |
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| T |
40908086 |
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40908184 |
T |
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| Q |
210 |
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309 |
Q |
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| T |
40908185 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
40908284 |
T |
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| Q |
310 |
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359 |
Q |
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| T |
40908285 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
40908334 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 47115202 - 47114859
Alignment:
| Q |
16 |
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115 |
Q |
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| T |
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47115103 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
47115102 |
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47115003 |
T |
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| Q |
216 |
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315 |
Q |
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| T |
47115002 |
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47114903 |
T |
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| Q |
316 |
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359 |
Q |
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| T |
47114902 |
ttttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33218262 - 33217917
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
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| T |
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agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
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T |
 |
| Q |
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211 |
Q |
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| T |
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gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattc |
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T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
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T |
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Q |
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atcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 48340108 - 48339760
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
110 |
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209 |
Q |
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| T |
48340008 |
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T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
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| T |
48339908 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccatgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattt |
48339809 |
T |
 |
| Q |
310 |
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358 |
Q |
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48339808 |
atatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6231850 - 6231503
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
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T |
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| Q |
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211 |
Q |
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| T |
6231750 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
6231651 |
T |
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| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
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| T |
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6231551 |
T |
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| Q |
312 |
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359 |
Q |
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| T |
6231550 |
atcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31611330 - 31611004
Alignment:
| Q |
16 |
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115 |
Q |
| |
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|
| T |
31611330 |
tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttatgaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgttt |
31611231 |
T |
 |
| Q |
116 |
ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac |
215 |
Q |
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| T |
31611230 |
ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattcccac |
31611131 |
T |
 |
| Q |
216 |
ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca |
315 |
Q |
| |
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| T |
31611130 |
cctttttcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca |
31611031 |
T |
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| Q |
316 |
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342 |
Q |
| |
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31611030 |
ttttattcccgggaatcaacaattata |
31611004 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20414812 - 20414467
Alignment:
| Q |
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113 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
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| T |
20414712 |
ttgattagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc |
20414613 |
T |
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| Q |
214 |
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313 |
Q |
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| T |
20414612 |
acccttttccttgggaatttttttttatttccaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaatttataacaaacataggcatatacattccaat |
20414513 |
T |
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| Q |
314 |
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359 |
Q |
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| T |
20414512 |
cattttattcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Original strand, 1098923 - 1099267
Alignment:
| Q |
14 |
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113 |
Q |
| |
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ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt |
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T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
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| T |
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ttggctagctttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaa-tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc |
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T |
 |
| Q |
214 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat |
313 |
Q |
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| T |
1099122 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagggatatacatttctat |
1099221 |
T |
 |
| Q |
314 |
cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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| T |
1099222 |
cattttattcccgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28124779 - 28124438
Alignment:
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117 |
Q |
| |
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tgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggattaacattccttggaatataaatatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttgg |
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T |
 |
| Q |
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ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccc |
217 |
Q |
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ttagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataatatgtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccc |
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T |
 |
| Q |
218 |
ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatt |
317 |
Q |
| |
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| T |
28124579 |
ttttccttgggaaattttttatattccgaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataacaaacataggcatatacattcctatcatt |
28124480 |
T |
 |
| Q |
318 |
ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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| T |
28124479 |
ttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
28124438 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 44952030 - 44952377
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111 |
Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcc-taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt |
210 |
Q |
| |
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| T |
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gtttggttaactttataatattccttaggaa-cataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttatt |
44952228 |
T |
 |
| Q |
211 |
ctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc |
310 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
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| T |
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cccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttc |
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T |
 |
| Q |
311 |
aatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
44952329 |
tatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9320797 - 9320450
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Target: chr3; HSP #15
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T |
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Target: chr3; HSP #16
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209 |
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Q |
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20297812 |
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Target: chr3; HSP #17
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Q |
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T |
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Target: chr3; HSP #18
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T |
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209 |
Q |
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309 |
Q |
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T |
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311 |
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acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat |
313 |
Q |
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T |
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cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
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T |
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211 |
Q |
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28770458 |
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28770360 |
T |
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| Q |
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311 |
Q |
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| T |
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28770260 |
T |
 |
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359 |
Q |
| |
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|
| T |
28770259 |
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28770212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26849492 - 26849164
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14 |
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113 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26849492 |
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T |
 |
| Q |
114 |
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213 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | |
|
|
| T |
26849392 |
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26849294 |
T |
 |
| Q |
214 |
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312 |
Q |
| |
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||| |||| ||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |
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| T |
26849293 |
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26849204 |
T |
 |
| Q |
313 |
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355 |
Q |
| |
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|||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
26849203 |
tcattttattatcggtaat---caaatataacttgaaacaaac |
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T |
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Target: chr3; HSP #27
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Target Start/End: Original strand, 19532939 - 19533130
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
184 |
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276 |
Q |
| |
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|||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19533038 |
tattcccatctccaaggaaactttattcccacccttttccttggaaaaaaatttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattta |
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T |
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Target: chr3; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 48 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1247212 - 1246912
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Q |
| |
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| T |
1247212 |
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1247113 |
T |
 |
| Q |
148 |
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247 |
Q |
| |
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| T |
1247112 |
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1247016 |
T |
 |
| Q |
248 |
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347 |
Q |
| |
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| T |
1247015 |
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1246916 |
T |
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| Q |
348 |
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351 |
Q |
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| T |
1246915 |
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1246912 |
T |
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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
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Target Start/End: Original strand, 27822994 - 27823343
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Q |
| |
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27822994 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattctttcgaacataaatatgagaattttattttaaggtatttagaaaaaaaaaa |
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T |
 |
| Q |
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208 |
Q |
| |
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| T |
27823094 |
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T |
 |
| Q |
209 |
ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt |
308 |
Q |
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| T |
27823193 |
ttcccacccttttctttgggaaaattttcctatttcgatgaacgttttatactcgggaataaaatttagtaaacttatagcaaacatagacatttatatt |
27823292 |
T |
 |
| Q |
309 |
ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |
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| T |
27823293 |
tctatcattttattcccataaatttatgaatataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 24783934 - 24784274
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
115 |
tggtt-agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
|
||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| || || || | ||||||||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
24784034 |
tggttaaactttagaatattccaaggaaccttaaaaataaagattataataggt-aattacacataattttattcccatcttcatgggaactttattcat |
24784132 |
T |
 |
| Q |
214 |
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313 |
Q |
| |
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| T |
24784133 |
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24784228 |
T |
 |
| Q |
314 |
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359 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aattttattccaaaaaatctacaattataacttaaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 40584336 - 40584670
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114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca |
214 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| | || || | |||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
40584436 |
tggttaacattataatattccaaggaaccttaaaaataggaaatataataggt-gattacacataattttattcccatctccatgggaactttattccca |
40584534 |
T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc |
314 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
40584535 |
ccattttctttggaaaaacttttctat----------attttatatccgaaaataaaatttaataaacttgtagaaaacatagacatatgcatttttatg |
40584624 |
T |
 |
| Q |
315 |
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360 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| |
|
|
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attttattctcaggaatctacaaatataacttaaaacaaatacaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12931287 - 12930945
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113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||| | || |||||| |||| |||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
12931287 |
ggtgtgtttgtttcaagtgtaccaaatttattcctaaaagtaacattctttataacataaagataaaaaaattattctaaggtatttaaaaaaaagatgt |
12931188 |
T |
 |
| Q |
114 |
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212 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||| | ||||| | |||||||| ||| |||||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
12931187 |
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12931089 |
T |
 |
| Q |
213 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa |
312 |
Q |
| |
|
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|
| T |
12931088 |
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T |
 |
| Q |
313 |
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358 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12930989 |
tgattttattcccaacaatctacaa-tataacttgaaacaaacaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38140710 - 38140425
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Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || || ||||| ||||||| | |
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|
| T |
38140710 |
gtttgtttcaattttataaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaaggtgtgaattttattccaaggtatatagaaaaaagatgtttgat |
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T |
 |
| Q |
119 |
tagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccct |
218 |
Q |
| |
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|| | ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
38140610 |
taacattataatattcctgggaacctaaaaaataaggattataatagg-aaattacacatgaacttattctcatcttcat-ggaactttattctcaccct |
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T |
 |
| Q |
219 |
tttccttgggaaattttttctattcccaggaac--attttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata |
304 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38140512 |
tttctttggaaaaaaatttctattcctaggaacatattttatactcgtcaataaattatagtaaacttataacaaacattgacatata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
169 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
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atgtttggttaacttcatagtattccaaagaaccttaaaaataaggattataataggtaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 62 - 359
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Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
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T |
 |
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ataggtaa--actatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttata |
259 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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ataggtaactactacgtatgaatttactctcatcttcatgggaactttattcccaccattttctttggaaaaaattttctattccaagaaacattttata |
2565561 |
T |
 |
| Q |
260 |
cccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||| |
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|
| T |
2565560 |
cccggaaat-aaatttaacaaacttgtaacaaacacaggtatatatatttctattattttattcctaagaatcaacaaatataacttaaaacgaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 358
Target Start/End: Original strand, 32071261 - 32071508
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203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| | || |
|
|
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T |
 |
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ctttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || |||| | |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
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ctttattctcgcccttttctttaagaaaatctttctatttccatgaacatttcataccc-aaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat----atat |
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T |
 |
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acattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
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Q |
| |
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| ||| | ||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
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| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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49216126 |
T |
 |
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117 |
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216 |
Q |
| |
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| T |
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49216225 |
T |
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217 |
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237 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
49216226 |
cttttctttgggaaatttttt |
49216246 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33647992 - 33647705
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taaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaa |
170 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
33647992 |
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33647893 |
T |
 |
| Q |
171 |
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270 |
Q |
| |
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|| ||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||| |||||| |||| || |||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |
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|
| T |
33647892 |
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33647794 |
T |
 |
| Q |
271 |
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359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | | | ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33647793 |
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33647705 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
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Target Start/End: Original strand, 18460582 - 18460750
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19 |
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118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
18460582 |
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18460681 |
T |
 |
| Q |
119 |
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189 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18460682 |
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18460750 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 18460827 - 18460953
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178 |
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277 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18460827 |
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18460926 |
T |
 |
| Q |
278 |
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304 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18460927 |
taaacttgtaacaaacatagacatata |
18460953 |
T |
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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
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16 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
6927817 |
tgtgtttgttttaagtttatcaaatttattactaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggtattta |
6927902 |
T |
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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
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Target Start/End: Complemental strand, 33650357 - 33650217
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| Q |
18 |
tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||| |
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|
| T |
33650357 |
tgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttatgaataacattatttgaaatctaaagatgagaattttattctaaggtattgaataaaaaaatgtttgc |
33650258 |
T |
 |
| Q |
118 |
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158 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
33650257 |
ttaacattataatattctcggaaaccataaaaatagagatt |
33650217 |
T |
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Target: chr3; HSP #43
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Target Start/End: Original strand, 32070994 - 32071080
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100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32070994 |
ggtgggtttgttttaaatttatcaaatttattcctatgaataacatttcttggaatataaagatgagaattttattccaaggtattt |
32071080 |
T |
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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28693782 - 28693428
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109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |
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|
| T |
28693782 |
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28693683 |
T |
 |
| Q |
110 |
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209 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
28693682 |
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28693585 |
T |
 |
| Q |
210 |
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302 |
Q |
| |
|
| | |||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28693584 |
tcccccacccttttcttttctttgagaaaatttttctattctcaggatcgttttatactcatgaataaaatttaattgacttataacaaacataagcata |
28693485 |
T |
 |
| Q |
303 |
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359 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28693484 |
catatttttatttttttattctcgggaatctatgaatataacttgaaacaaacacac |
28693428 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 359
Target Start/End: Original strand, 27093763 - 27094085
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24 |
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123 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||| | |
|
|
| T |
27093763 |
tttcatgtttatcaaatttattcttaaaaataatattccttagaatataaagatgtgaattttatttcaaggtatt-aagaaaaagatgtttgattaaca |
27093861 |
T |
 |
| Q |
124 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcc |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || || | ||||||||||| |||| || | ||||||||| ||| || ||| | |
|
|
| T |
27093862 |
atataatattccaaggaacattaaaaatagg--------tagttacac-----acgaatttattccaatctacaaga-aactttattttcaaccattttc |
27093947 |
T |
 |
| Q |
224 |
ttgggaaatttt-ttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca-ttttat |
321 |
Q |
| |
|
| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
27093948 |
tctggatttttttttctattcccataaacattttatacccgagaataagatatagtaaacttataacaaacataggcatatatatttcaatcattttttt |
27094047 |
T |
 |
| Q |
322 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
27094048 |
ttccgggaacctacacatataacttaaaacaaatacac |
27094085 |
T |
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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
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Target Start/End: Original strand, 45826687 - 45826845
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200 |
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299 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
45826687 |
ggaacttttttcccatccttttctttgtgaatgttcttctattcccaggaacattttatatcatgaaataaaatttaataaacttgtaa-aaacatatga |
45826785 |
T |
 |
| Q |
300 |
atatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|| | ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45826786 |
atgcagatttctatcattttattccctggaatctacaacgataacttgaaacaaacacac |
45826845 |
T |
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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6832079 - 6832016
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tctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacat |
301 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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6832079 |
tctattcccaggaatattttatacctgg-aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacat |
6832016 |
T |
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Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 303
Target Start/End: Original strand, 13642860 - 13643083
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177 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | |||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||||||||||| || | | |
|
|
| T |
13642860 |
gagaattttatttcaatgtattttaaaaaaatctgtttggttaactttataatatt-caaggaaccttacaaatagagattataataggt-aattccaca |
13642957 |
T |
 |
| Q |
178 |
tgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattta- |
276 |
Q |
| |
|
| | ||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||| ||| |
|
|
| T |
13642958 |
taattttattctcattttcatggaaactttattc-caccattttttttggaaaaacttttctattcctaagaacattttataatcaagaacaaaaattag |
13643056 |
T |
 |
| Q |
277 |
gtaaacttgtaacaaacatagacatat |
303 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13643057 |
gttaacttgtaacaaacatagacatat |
13643083 |
T |
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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
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Target Start/End: Original strand, 29512631 - 29512705
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| Q |
229 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
29512631 |
aaattttttctattccgatgaacattttatactcaggaataaaatttagtaaacttgaaacaaacgtaggcatat |
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T |
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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
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Target Start/End: Complemental strand, 43715371 - 43715310
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298 |
acatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43715371 |
acatatacatttctatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
43715310 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
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ttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagac--atatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaaca |
352 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |
|
|
| T |
39932631 |
ttatatccgggaataaaatttagtaaacttataacaaacataaacatatatacatttctatcattttattcccatgaatttatgaatataacttgaaaca |
39932532 |
T |
 |
| Q |
353 |
aac |
355 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
39932531 |
aac |
39932529 |
T |
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Target: chr3; HSP #52
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14 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
31267694 |
ggtgtgtttgttttaagtttatcggatttatttttaggaataacatttcttaaaatataaagatgtgaatttcattttaaggtatttagaaaaaagatgt |
31267595 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta |
168 |
Q |
| |
|
|| || | | |||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31267594 |
ttagtcaacattataatatttccataaactttaaaaataaggattataataggta |
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T |
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382 |
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422 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25351447 |
gttactcaagaatctgtaaaaaggaaaagttactcaagaat |
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T |
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69 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2566524 |
tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttcttgaaataatattccttggaat |
2566471 |
T |
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47 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19532909 |
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235 |
tttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaa |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||| | ||| ||||||||| |||| | |
|
|
| T |
28139846 |
tttctattcccaagaacgttttatatccgaaaataaaatttactaatcttgtaacaaacataagcatgtatatttctatctttttattcctaagaatata |
28139747 |
T |
 |
| Q |
335 |
caattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28139746 |
cgaatataacttgaaacaaac |
28139726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 45826064 - 45826120
Alignment:
| Q |
17 |
gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataa |
73 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
45826064 |
gtgtttgtttccagtttactagatttattcctaggaataactttcctgggaatataa |
45826120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 55435726 - 55435652
Alignment:
| Q |
17 |
gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattcc |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
55435726 |
gtgtttgtttcaagtttactagatttattcttgtgaataactttcccgggaatataaagatgggagttttattcc |
55435652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 322
Target Start/End: Original strand, 33497768 - 33497889
Alignment:
| Q |
202 |
aactttattctcacccttttccttgggaaattttttct-attcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagaca |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||| || ||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |
|
|
| T |
33497768 |
aactttattctcacccttttctttaggatttttttttttattctcatgaacattttgtatcctagaataaaatttaataaatttgtaacaaatataagca |
33497867 |
T |
 |
| Q |
301 |
tatacattccaatcattttatt |
322 |
Q |
| |
|
| || ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
33497868 |
tgtatatttctatcattttatt |
33497889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 26085442 - 26085517
Alignment:
| Q |
15 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattc |
90 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26085442 |
gtgtgttcgtttcaagtttactaaatttatttttagaaataagattctttcgaacataaagatatgaattttattc |
26085517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Original strand, 44533943 - 44534009
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaaga |
76 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||| |||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
44533943 |
taagggtgtgtttgtttaaagtttactaaatttattcttatgaatgttattcttgggaatataaaga |
44534009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9320441 - 9320405
Alignment:
| Q |
300 |
atatacattccaatcattttattcccgggaatcaaca |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9320441 |
atatacattcctatcattttattcccgagaatcaaca |
9320405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 275
Target Start/End: Original strand, 12108215 - 12108298
Alignment:
| Q |
191 |
atctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattt |
275 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12108215 |
atcttcatgagaattttattctcactattttt-ttgggaaattttttctattcctaaaaatattttatatccgagaataaaattt |
12108298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 359
Target Start/End: Original strand, 29512704 - 29512748
Alignment:
| Q |
315 |
attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29512704 |
attttattcccagaaattaaaaattataacttgaaacaaacacac |
29512748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27763246 - 27762901
Alignment:
| Q |
14 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27763246 |
ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt |
27763147 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27763146 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc |
27763047 |
T |
 |
| Q |
214 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat |
313 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27763046 |
acccttttccttgggaaatattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaat |
27762947 |
T |
 |
| Q |
314 |
cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27762946 |
cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
27762901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 55968351 - 55968002
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
55968351 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaat |
55968252 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55968251 |
atgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
55968152 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
55968151 |
tcccaccctttttcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacagagacatatacattc |
55968052 |
T |
 |
| Q |
310 |
caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55968051 |
caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
55968002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13230338 - 13229991
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13230338 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
13230239 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230238 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
13230139 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
13230138 |
ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttct |
13230039 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230038 |
atcattttattcccgggaataaaaaattataacttgaaacaaacacac |
13229991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39730642 - 39730295
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39730642 |
agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
39730543 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39730542 |
gtttggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgtgaactttattc |
39730443 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39730442 |
ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcct |
39730343 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39730342 |
atcattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac |
39730295 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41859398 - 41859049
Alignment:
| Q |
9 |
ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41859398 |
ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttatttcaaggaatttaggaaaaa |
41859299 |
T |
 |
| Q |
109 |
tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41859298 |
tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta |
41859199 |
T |
 |
| Q |
209 |
ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt |
308 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41859198 |
ttcccacccttttccttgggaaat-ttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatt |
41859100 |
T |
 |
| Q |
309 |
ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41859099 |
ccaatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
41859049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48519233 - 48518893
Alignment:
| Q |
19 |
gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggt |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
48519233 |
gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgtgaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggt |
48519134 |
T |
 |
| Q |
119 |
tagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccct |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48519133 |
tagctttataatattcctaggaaccataaaaataggtattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
48519034 |
T |
 |
| Q |
219 |
tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattt |
318 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48519033 |
tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
48518934 |
T |
 |
| Q |
319 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48518933 |
tattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac |
48518893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 42773672 - 42774021
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42773672 |
taagggcgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctagaaataacattccttggagtataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat |
42773771 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42773772 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
42773871 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42773872 |
tcccacccttttccttgggaaattttttttatccccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
42773971 |
T |
 |
| Q |
310 |
caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42773972 |
caatcattttattcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
42774021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6280270 - 6279923
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6280270 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcataggaataacattccttggaatataaaaataggaattttattccaaggaatttatgaaaaatat |
6280171 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6280170 |
atttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattc |
6280071 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6280070 |
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T |
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312 |
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359 |
Q |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
6279970 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
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111 |
Q |
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T |
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| Q |
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211 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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311 |
Q |
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48879251 |
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48879350 |
T |
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| Q |
312 |
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359 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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48879351 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
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Target Start/End: Original strand, 43722986 - 43723337
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8 |
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Q |
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attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaagaatttaggaaaa |
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T |
 |
| Q |
108 |
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207 |
Q |
| |
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atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaacttt |
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T |
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| Q |
208 |
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307 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
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attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
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T |
 |
| Q |
308 |
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359 |
Q |
| |
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| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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ttctatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
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Target Start/End: Complemental strand, 45748144 - 45747798
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
| |
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| T |
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agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatat |
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T |
 |
| Q |
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211 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
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ccccccttttccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct |
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T |
 |
| Q |
312 |
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Q |
| |
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atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Target: chr4; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 35999412 - 35999759
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
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35999711 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
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atcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 25932165 - 25932514
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| |
|
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T |
 |
| Q |
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209 |
Q |
| |
|
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|
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atgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
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T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattt |
25932464 |
T |
 |
| Q |
310 |
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Q |
| |
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| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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ctatcattttattcctaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 355
Target Start/End: Original strand, 45595992 - 45596337
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Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
209 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttat |
45596191 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
|
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|
| T |
45596192 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattt |
45596291 |
T |
 |
| Q |
310 |
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355 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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ctatcattttattcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaac |
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Target: chr4; HSP #15
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Target Start/End: Original strand, 40435628 - 40435973
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T |
 |
| Q |
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ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
214 |
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313 |
Q |
| |
|
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acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctat |
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T |
 |
| Q |
314 |
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Q |
| |
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Target: chr4; HSP #16
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agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt |
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
220 |
ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatttt |
319 |
Q |
| |
|
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|
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ttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcatttt |
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T |
 |
| Q |
320 |
attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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|
|
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attccc-ggaatcaacaat--taacttaaaacaaacacac |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
207 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
208 |
attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat |
307 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
308 |
tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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18405287 |
ttctataattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Target: chr4; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 23686513 - 23686860
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111 |
Q |
| |
|
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 |
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gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
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Q |
| |
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|
| T |
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gtttggttagttttataatattcctaggaaccataaaaatatgaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
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T |
 |
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212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
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| T |
23686713 |
ccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaatattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttct |
23686812 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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| T |
23686813 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Target: chr4; HSP #19
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110 |
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209 |
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T |
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309 |
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T |
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359 |
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936150 |
caatcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
936199 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 47670086 - 47670435
Alignment:
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109 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
110 |
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209 |
Q |
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| T |
47670186 |
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T |
 |
| Q |
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309 |
Q |
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47670385 |
T |
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359 |
Q |
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| T |
47670386 |
ctatcattttatttccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41744568 - 41744222
Alignment:
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Q |
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T |
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| Q |
114 |
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213 |
Q |
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| T |
41744468 |
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T |
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| Q |
214 |
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312 |
Q |
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41744269 |
T |
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| Q |
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359 |
Q |
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41744268 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39835656 - 39835309
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Q |
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T |
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| Q |
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211 |
Q |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
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39835357 |
T |
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| Q |
312 |
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359 |
Q |
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atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Original strand, 8321971 - 8322308
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Q |
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T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
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| T |
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gtttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc |
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T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
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| T |
8322171 |
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8322270 |
T |
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| Q |
312 |
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349 |
Q |
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atcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34049904 - 34049599
Alignment:
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Q |
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T |
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| Q |
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Q |
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T |
 |
| Q |
254 |
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353 |
Q |
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34049605 |
T |
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| Q |
354 |
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359 |
Q |
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34049604 |
acacac |
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T |
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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 27555149 - 27555483
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Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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207 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
208 |
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307 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
308 |
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359 |
Q |
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| T |
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tcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
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Target Start/End: Original strand, 27942465 - 27942814
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Q |
| |
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ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacatttttaggaatataaatatgagaattttatttcaaggaatttagaaaaaatatgt |
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T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
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| T |
27942565 |
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T |
 |
| Q |
214 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgta------acaaacatagacatatacat |
307 |
Q |
| |
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| T |
27942665 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataataaacataaacatagacatatacat |
27942764 |
T |
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| Q |
308 |
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357 |
Q |
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| T |
27942765 |
tcctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 18931482 - 18931826
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Q |
| |
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gtgtgtttgttttaagtttatcaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatagaaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt |
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T |
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| Q |
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214 |
Q |
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| T |
18931582 |
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18931681 |
T |
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| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc |
314 |
Q |
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| T |
18931682 |
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18931781 |
T |
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| Q |
315 |
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359 |
Q |
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attttattcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Target: chr4; HSP #28
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Target Start/End: Original strand, 32953249 - 32953596
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111 |
Q |
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agggtatgtttgtttcaagtttatctaatttatttctagaaataatattcattggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
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T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
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| T |
32953449 |
ccaccattttccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaagataggcatatacattcct |
32953548 |
T |
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312 |
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359 |
Q |
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atcattttgttcctgggaatcaacaattataacttgagacaaacacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
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T |
 |
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agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt |
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Q |
| |
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| T |
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agctttataatattcctaggaacaaaaaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctt |
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T |
 |
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220 |
ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt |
308 |
Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 359
Target Start/End: Original strand, 39498590 - 39498898
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Q |
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T |
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250 |
Q |
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T |
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350 |
Q |
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T |
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39498890 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 359
Target Start/End: Original strand, 39501929 - 39502237
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Q |
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| T |
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39502028 |
T |
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| Q |
151 |
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250 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
251 |
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350 |
Q |
| |
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| T |
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39502228 |
T |
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| Q |
351 |
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359 |
Q |
| |
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39502229 |
caaacacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 104 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25916290 - 25916037
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203 |
Q |
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T |
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| Q |
204 |
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303 |
Q |
| |
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| T |
25916190 |
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T |
 |
| Q |
304 |
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359 |
Q |
| |
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| T |
25916092 |
acattcctatcattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac |
25916037 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
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Target Start/End: Original strand, 48873747 - 48873978
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111 |
Q |
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T |
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| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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212 |
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243 |
Q |
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ccacccttttccttgggaaattttttctattc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31938217 - 31937871
Alignment:
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112 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
113 |
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212 |
Q |
| |
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| T |
31938117 |
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31938019 |
T |
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| Q |
213 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
31938018 |
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31937919 |
T |
 |
| Q |
312 |
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359 |
Q |
| |
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| T |
31937918 |
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T |
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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Original strand, 7258691 - 7259031
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112 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
113 |
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212 |
Q |
| |
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| T |
7258791 |
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T |
 |
| Q |
213 |
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312 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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355 |
Q |
| |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 51968500 - 51968850
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106 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
51968500 |
tatttagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttcgtacgtaaagatgagaattttattccaaggtatatagaaaa |
51968599 |
T |
 |
| Q |
107 |
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206 |
Q |
| |
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| T |
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aagatgtttgtttaacattataatatttctgagaaccataaaaataaggattataat--gt-aattacatatgaaattatttccatcttcatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
207 |
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305 |
Q |
| |
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| T |
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51968796 |
T |
 |
| Q |
306 |
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359 |
Q |
| |
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||| | ||| |||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||||||| |
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atttctatctttttattcccagaaatttacgaatataacttgaaacaaacacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 52469427 - 52469734
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Q |
| |
|
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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213 |
Q |
| |
|
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T |
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| Q |
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313 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
314 |
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Q |
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|
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cattttatt |
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Target: chr4; HSP #38
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Target Start/End: Original strand, 30415743 - 30415975
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T |
 |
| Q |
226 |
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
326 |
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359 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30415942 |
gggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
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| |
|
|||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
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T |
 |
| Q |
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tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
|
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| T |
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38414229 |
T |
 |
| Q |
310 |
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359 |
Q |
| |
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| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| |
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38414230 |
ctatcattttattccc--gaatcaacaaatataactttagacaaacacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
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Q |
| |
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T |
 |
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tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
| |
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|||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |
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tttgcttaatattataatatttttgggaaccataaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttatttccatctctatcagaactttattcc |
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T |
 |
| Q |
213 |
ca-cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
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caccccttttctttgggaatttttttatatttccagaaatattttata-ctaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatgtatattccc |
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T |
 |
| Q |
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323 |
Q |
| |
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atcgttttattc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
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Q |
| |
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T |
 |
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tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
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Q |
| |
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tttggataactttgtaatattcctaggaaccataaaaataaggattataacaggt-aactatatatgaatttattcccatctccatgagaattttattcc |
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T |
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cacccttttccttgggaaa |
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Q |
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Target: chr4; HSP #42
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Target Start/End: Complemental strand, 47426567 - 47426269
Alignment:
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13 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg |
112 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
47426567 |
gggtgtgattgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacat---------------gatgggaattttattcaaaggtatttagaaaaaatata |
47426483 |
T |
 |
| Q |
113 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
47426482 |
tttggttaactttataatattcctaggaacc-------tagggattataataggt-aactatttatgaatttattttcatcttcatgggaactttattgc |
47426391 |
T |
 |
| Q |
213 |
caccc-ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat-acattcc |
310 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
47426390 |
cacccttttttcttgataatatttttctatttccaggaacattttatatcaagaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataatattca |
47426291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Original strand, 30790275 - 30790518
Alignment:
| Q |
13 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
30790275 |
gggtgtgtttgtttcaagtttagcaaatttatttctaggagtaacattc-ttggaatataaagatgagaaatttattccaaagtatttaaaaaaaagatg |
30790373 |
T |
 |
| Q |
113 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || || || | |||||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30790374 |
tttggttaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagaatttataataattacac-----ataattttatttccatcttcatggaaactttattcc |
30790468 |
T |
 |
| Q |
213 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc |
262 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30790469 |
catccttttcattggaaaaacttttctattctcagaaacattttataccc |
30790518 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 101 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36858636 - 36858380
Alignment:
| Q |
101 |
aagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
36858636 |
aagaaaaatatgtttgtttaacattataatattcccggaaaccataaaaatagggattataatatgtaat-tacatatgaaattattctcatcttcatgg |
36858538 |
T |
 |
| Q |
201 |
gaactttattctcacccttttccttgggaaatttttt---ctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36858537 |
gaactttattcccacccttttatttg--aattttttttttctattctcaggaacattttatacccgggcataaaatttagtaaacttgtaacaaacataa |
36858440 |
T |
 |
| Q |
298 |
acatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
| || |||| | ||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36858439 |
gc--atgcatttctatctttttattcttgggaatctaagaatataacttgaaacaaacacac |
36858380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 205 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10400961 - 10400810
Alignment:
| Q |
205 |
tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata |
304 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10400961 |
tttattcccaccaatttctttgggaaattttttctatttccaggaatattttatacccaagaataaaatttagtaaacttgtaataaacatagacatata |
10400862 |
T |
 |
| Q |
305 |
cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
356 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10400861 |
catttctatcattttattcccaaaaatcaacaaatataacttgaaacaaaca |
10400810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37014724 - 37014451
Alignment:
| Q |
20 |
tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtt |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37014724 |
tttgtttcaagtttacaaaatttattcctaagaataatattttttggaatataaagatgcgaattttattcgaagatatttagaaaaaagatgtttggtt |
37014625 |
T |
 |
| Q |
120 |
agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt |
219 |
Q |
| |
|
| | |||||||||| | || || | |||||||| | |||||| || | ||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
37014624 |
aacattataatatttc-agaaatcttaaaaataagaattatagtaag-aaattacacatgaatttattctcatcttcatgagaactttatttccactctt |
37014527 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
295 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37014526 |
ttctttgggaaattttttctattcctatgaacatgttatacctggatataaaatttaataaactcataacaaacat |
37014451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 124 - 359
Target Start/End: Original strand, 18405592 - 18405826
Alignment:
| Q |
124 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcc |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18405592 |
ttataatatttctaggaaccataaaaatagagattataataggtaat-tacacatggatttattcccatcttaatgagaactttattcccacccttttct |
18405690 |
T |
 |
| Q |
224 |
ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattc |
323 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
18405691 |
ttaggaaaaattttctattcctaggaacattttatacctagaaataaaattttgtaaacttgtaacaaacatagatatgtatatttatatcgttttattc |
18405790 |
T |
 |
| Q |
324 |
ccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||| |||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18405791 |
tcggaaatctctgaatataacttaaaacaaacacac |
18405826 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10401126 - 10400973
Alignment:
| Q |
15 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |
|
|
| T |
10401126 |
gtgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttctggaaataacattctttgaagtataaaaatgagaattttattccaagatatatagaaaaaacatgtt |
10401027 |
T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
169 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10401026 |
tggttag-tttataatattcctcggaaccataaaaataaggattataataggtaa |
10400973 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 304
Target Start/End: Original strand, 48059804 - 48060073
Alignment:
| Q |
35 |
ccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaatatgtttggttagctttataatatt |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| | | | ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48059804 |
ccaaatttattcttacgaataatattttttagaatataatgatgagaattttatttcgatgtatttagaaaaaaatatgtttaattaattttataatatt |
48059903 |
T |
 |
| Q |
134 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaatt |
233 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
48059904 |
tctaggaattataaaaataagaattataataggtaat-tatatatgaatttatttatatttttatgagaactttattcccaccattttatttgggaaatt |
48060002 |
T |
 |
| Q |
234 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48060003 |
ttttctattcccataaatattttatatccaaaaataaaatttaataaactcgtaacaaacataaacatata |
48060073 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 38413902 - 38414015
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
38413902 |
agggcgtgtttgtttcaagtttaccaaatttaattttagaaataacattccttggaatataaagatgagaatttaattccaaggtatttagaaaaaatat |
38414001 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagcttt |
125 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |
|
|
| T |
38414002 |
gtttggttaacttt |
38414015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24805397 - 24805088
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| Q |
55 |
aacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaa------ |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
24805397 |
aacattccttggaacataaagatgtgaattttactttaaggtatttagaaaaaagatgtttgcttaacattataatattactgggaaccataaaccataa |
24805298 |
T |
 |
| Q |
149 |
-aatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc-acccttttccttgggaaattttttctattccca |
246 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24805297 |
aaatagggaatataataggtaat-tacacatggatttattcccatattcatgggaactttattttccaccattttctttgtgaaattttttctattccca |
24805199 |
T |
 |
| Q |
247 |
ggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataactt |
346 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||||||| | | |||| || | ||||||| |
|
|
| T |
24805198 |
a-aatgttttattcccgaaaataaaatttagtaaatttgtaacaaacataaacatgtatatttttttcgttttattctcagaaatctacgaaaataactt |
24805100 |
T |
 |
| Q |
347 |
gaaacaaacaca |
358 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
24805099 |
gaaacaaacaca |
24805088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 355
Target Start/End: Original strand, 44309497 - 44309829
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| Q |
22 |
tgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttag |
121 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44309497 |
tgtttgaagtttactaaatttatttttaagaataatatttcttagaacataaagatgagaatttaatttcaaagtgtttaggaaaaatatgtatggttaa |
44309596 |
T |
 |
| Q |
122 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctttt |
221 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| || || ||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44309597 |
cattataatattctcgagaatactaaaaatagggattataacagataat-tacacattaataaattttcatattcatgggaactttattcccaccctttt |
44309695 |
T |
 |
| Q |
222 |
ccttgggaaatttttt-ctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatttta |
320 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||| |||||| | |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
44309696 |
ctttaggaaatttttttctattctctagaacgttttatactagg-aataaaatttagtaaccttgtaacaaacatagacatgcatatttctatcgtttta |
44309794 |
T |
 |
| Q |
321 |
ttcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
|| | | |||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44309795 |
ttttcagaaatctacgaatataacttgaaacaaac |
44309829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 359
Target Start/End: Original strand, 26165156 - 26165437
Alignment:
| Q |
80 |
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175 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | ||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
26165156 |
gaattttattctaaagtatttagaaaaaaagatgtttggttaatattataatatttcaaagaaccttaaaaatagggaatataataataggtaat-tata |
26165254 |
T |
 |
| Q |
176 |
tatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattt |
275 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
26165255 |
cataattttattctcatcttaatgggaactttattctcactattttctttatgaaaacttttctattctaag-aacattttatattcatgaataaaattt |
26165353 |
T |
 |
| Q |
276 |
agtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26165354 |
agtaaacttgtaacaaacataaacatgtgcatttttatgattttattctcaggaatctacaaatataacatgaaacaaacacac |
26165437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 36860104 - 36860027
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| Q |
13 |
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90 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
36860104 |
gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaacataaaaatggaaattttattc |
36860027 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Original strand, 18094073 - 18094259
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atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
209 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18094073 |
atgtttagttaacattataatatttttaggaatcataaaaatatgaattataataggtagt-tacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttat |
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T |
 |
| Q |
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tctcacccttttccttggga--aattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
18094172 |
tctcaccattttctttggaattttttttttctattcctagaaacattttatacccgaaaataaaa-ttagtaaacttctagcaaacata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Original strand, 18405127 - 18405217
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10 |
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| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |
|
|
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18405217 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12276075 - 12275953
Alignment:
| Q |
197 |
atgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| | ||||| || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12276075 |
atgggaattttattcccaccttttcttttgggaaaatatttctttttccaagaacattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
12275976 |
T |
 |
| Q |
297 |
gacatatacattccaatcatttt |
319 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
12275975 |
aacatatatatttctatcatttt |
12275953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25916362 - 25916302
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttc-aagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatat |
71 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25916362 |
agggtgtgtttgtttctaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatat |
25916302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 120
Target Start/End: Original strand, 52413959 - 52414061
Alignment:
| Q |
18 |
tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg |
117 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
52413959 |
tgtttgcttcaaatttaccaaatttattcttagaaataacaacccttggaatataaagatgtgaattttatttcaagcgaattagaaaaaatatgtttgg |
52414058 |
T |
 |
| Q |
118 |
tta |
120 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
52414059 |
tta |
52414061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34237480 - 34237424
Alignment:
| Q |
301 |
tatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
357 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34237480 |
tatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
34237424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32384650 - 32384492
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaa |
203 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||| |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
32384650 |
aaaagtatgtttgcttaacattataatattcctggaaaccataaaattagggattataataggt-aattgcacataaatttgttccaatctttatgggaa |
32384552 |
T |
 |
| Q |
204 |
ctttattctcacccttttccttgggaaa-ttttttctattcccaggaacattttataccc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
32384551 |
ttttattcccacccttttctttgggaaatttttttctgtttccatgaacgttttataccc |
32384492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22654638 - 22654515
Alignment:
| Q |
202 |
aactttattctcacccttttccttggga--aattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagac |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| || ||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
22654638 |
aactttattcccaccctttttttttggagaaagtttttctattcgcaataacattttttacccgagaataaaaattagttaacttgtaataaacataggc |
22654539 |
T |
 |
| Q |
300 |
atatacattccaatcattttattc |
323 |
Q |
| |
|
|| || ||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
22654538 |
atgtatatttctatcattttattc |
22654515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 163
Target Start/End: Original strand, 37296473 - 37296580
Alignment:
| Q |
50 |
ggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccat-aaa |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||| | ||| |
|
|
| T |
37296473 |
ggaataacattccttggaatataaatatgtgaattttattccaagga-------aaaaaaatgtttggttaacattagaatatccctaagaaccttaaaa |
37296565 |
T |
 |
| Q |
149 |
aatagggattataat |
163 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37296566 |
aatagagattataat |
37296580 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9327342 - 9327247
Alignment:
| Q |
265 |
gaataaaatttagtaaacttgtaa-caaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
9327342 |
gaataaaatttagtaaacttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataacttgaaataaaaacac |
9327247 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9374101 - 9374006
Alignment:
| Q |
265 |
gaataaaatttagtaaacttgtaa-caaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
9374101 |
gaataaaatttagtaaacttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataacttgaaataaaaacac |
9374006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12276260 - 12276178
Alignment:
| Q |
11 |
aagggtgtg-tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaa |
93 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
12276260 |
aagggtgtgatttgtttcaagtttactaaatttatttataggaataacatt-ttttgaatataaagatgtgaattttatttcaa |
12276178 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 359
Target Start/End: Original strand, 36860106 - 36860190
Alignment:
| Q |
274 |
ttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36860106 |
ttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatttatatcattttatt-taagaaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
36860190 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Original strand, 14796295 - 14796439
Alignment:
| Q |
18 |
tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg |
117 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
14796295 |
tgtttattttaagtttgtcaaatttatttttaggaataatattttttagaatataaagatgtgaattttattttaaagtatttagaaaaaagatgtttgt |
14796394 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataa |
162 |
Q |
| |
|
||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14796395 |
ttaacattatgatatttttaggaaccttaaaaataaagattataa |
14796439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Original strand, 54478495 - 54478555
Alignment:
| Q |
236 |
ttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
296 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54478495 |
ttctatttccaataacattttatacccatgaatgaaatttagtaaacttataacaaacata |
54478555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 120
Target Start/End: Original strand, 54478366 - 54478437
Alignment:
| Q |
49 |
aggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtta |
120 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54478366 |
aggaatagcatttcttgaaatataaatatgtgaattttattctaaggtatttagaaaaaagatgtttggtta |
54478437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9297236 - 9297144
Alignment:
| Q |
201 |
gaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
295 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9297236 |
gaactttattctcaca-ttttctttgcgaaagtttttctattccgcaaaacattttacatttggga-taaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
9297144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9382379 - 9382297
Alignment:
| Q |
265 |
gaataaaatttagtaaacttgtaa-caaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataactt |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9382379 |
gaataaaatttagtaaatttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataactt |
9382297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 1316741 - 1317087
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1316741 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
1316840 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1316841 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattc |
1316940 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1316941 |
ccacccttttccttgggaaa-tttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcca |
1317039 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1317040 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
1317087 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 2657422 - 2657769
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2657422 |
agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
2657521 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657522 |
gtttggttaactttataatattcctagtaatcataaaaatatggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
2657621 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2657622 |
ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcct |
2657721 |
T |
 |
| Q |
312 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657722 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
2657769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7053927 - 7053572
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7053927 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaatatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatat |
7053828 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053827 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
7053728 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatt--------ttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat |
303 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7053727 |
ccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatat |
7053628 |
T |
 |
| Q |
304 |
acattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053627 |
acattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
7053572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 18897640 - 18897989
Alignment:
| Q |
9 |
ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18897640 |
ttaagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaa |
18897739 |
T |
 |
| Q |
109 |
tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897740 |
tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta |
18897839 |
T |
 |
| Q |
209 |
ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt |
308 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18897840 |
tttccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatatacatt |
18897939 |
T |
 |
| Q |
309 |
ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
358 |
Q |
| |
|
| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897940 |
tctatcactttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
18897989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 14170740 - 14171082
Alignment:
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15 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14170740 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtt |
14170839 |
T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
14170840 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttatt-ccatctccatgggaactttattccca |
14170938 |
T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
14170939 |
cccttttcctt-ggaaattttttctattcccaggaacattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatagattcctatc |
14171037 |
T |
 |
| Q |
315 |
attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14171038 |
attttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac |
14171082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Original strand, 16968649 - 16968989
Alignment:
| Q |
14 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16968649 |
ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt |
16968748 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
16968749 |
ttggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattccc |
16968848 |
T |
 |
| Q |
214 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
16968849 |
acccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatagattcctat |
16968948 |
T |
 |
| Q |
314 |
cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16968949 |
cattttattctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
16968989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Original strand, 8029025 - 8029297
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8029025 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattccaagaaatttaggaaaaatat |
8029124 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8029125 |
gtttggttggctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
8029224 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaactt |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8029225 |
ccacccttttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaactt |
8029297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 124 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7344320 - 7344085
Alignment:
| Q |
124 |
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223 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7344320 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcc |
7344221 |
T |
 |
| Q |
224 |
ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattc |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7344220 |
ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcatatacattcctatcattttattc |
7344121 |
T |
 |
| Q |
324 |
ccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7344120 |
tcggaaatttacaattataatttgaaacgaacacac |
7344085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10246465 - 10246259
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10246465 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat |
10246366 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10246365 |
gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
10246266 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcaccct |
218 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
10246265 |
ccaccct |
10246259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6706103 - 6705767
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
6706103 |
taagggtatgtttgtttcaagtttaccaattttatttctaggaataacattccttgaaatataaagatgagaattttattctaaggtatttagaaaaaat |
6706004 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
209 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6706003 |
atatttggttaactttataatattcctaagaactataaaaacagg------------taaa-tacatatgaaattattctcatctccatgggaactttat |
6705917 |
T |
 |
| Q |
210 |
tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
309 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6705916 |
tcccacccttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatatattt |
6705817 |
T |
 |
| Q |
310 |
caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6705816 |
ctaccattttattccaatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
6705767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 346179 - 345833
Alignment:
| Q |
9 |
ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
346179 |
ttaagggtgtgtttgttttaaatttaccaaatttatttt---gattag--ttctttggaatataaagatgagaattttattctaagacatttagaaaaaa |
346085 |
T |
 |
| Q |
109 |
tatgtttggttagctttataatattcct-aggaa-ccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
206 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
346084 |
gatgtttgcttaacattataacattcctgaggaaaccataaaaataggaattttaatagg-aaattactcatgaatttattctcatctccattggaactt |
345986 |
T |
 |
| Q |
207 |
tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
306 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
345985 |
tattcccacccttttctttgggaaaaattttctattcctaaaaacgttttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgta |
345886 |
T |
 |
| Q |
307 |
ttccaatcatttta-ttcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
358 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||| || | |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
345885 |
ttcctatcattttatttcctaggaatctacgaatataacttaaaacaaacaca |
345833 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14781955 - 14781685
Alignment:
| Q |
15 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
14781955 |
gtgtgtttgtttcat-tttaccaaatttattcctgggaataacattcattggaacataaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaagatgtt |
14781857 |
T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca |
214 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
14781856 |
tgcttaacattataatattcctgggaaccataaaagtaggatttataataggt-aattactcatgaatttattcccatctcc----taactt-----cca |
14781767 |
T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
296 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14781766 |
cccttttcttttggaaaaaatttctattcccatgagcattttatacctaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
14781685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7344827 - 7344723
Alignment:
| Q |
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127 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7344827 |
aagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaatatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttat |
7344728 |
T |
 |
| Q |
128 |
aatat |
132 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
7344727 |
aatat |
7344723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 273 - 359
Target Start/End: Original strand, 8029316 - 8029402
Alignment:
| Q |
273 |
tttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8029316 |
tttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
8029402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21008322 - 21008208
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21008322 |
tgtttgtttcaagtttattaaatttatttttatgaataacatttcttggaatataaagatgagaattttattccaaggcatttagaaaaaatatgtttgg |
21008223 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttagctttataatat |
132 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21008222 |
ttaactttataatat |
21008208 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 184 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10849961 - 10849785
Alignment:
| Q |
184 |
tattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcctt-gggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaac |
282 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||| |
|
|
| T |
10849961 |
tattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttacacccaggaagaaaagttactaaac |
10849862 |
T |
 |
| Q |
283 |
ttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| | ||| | | | |||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10849861 |
ttgtaactaatataggaagatataattctatcattttattcccaggaatctataaaaataacttgaaacaaacacac |
10849785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9762387 - 9762232
Alignment:
| Q |
14 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaatatg |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
9762387 |
ggtgtgtttgtttcaagtttaccaagtttattattaggaataacattccttggattataaatatgtgaattttattcaaaggtatttagataaaaagatg |
9762288 |
T |
 |
| Q |
113 |
tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta |
168 |
Q |
| |
|
|||| || | ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9762287 |
attgggtaacattataatattctcatgaaccttaaaaataaagattataataggta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21008208 - 21008035
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| Q |
176 |
tatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattt |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| || | | ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
21008208 |
tatgaatttattcccatctctatgagaactttattccca-cctttttgtttgaattttttttctattcccaagaacatttcatgttcgggaataaaattt |
21008110 |
T |
 |
| Q |
276 |
agtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaa |
350 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21008109 |
agtaaacctgtaacaaatagaggcatatatatttttatcattttattcccagaaatcaacaaatataacttgaaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 268
Target Start/End: Original strand, 8314614 - 8314873
Alignment:
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Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |
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|
| T |
8314614 |
taagggtacgtttgttttaagtttatcaaatttattcctagaattaacattacttgcaatatacacatgtaaattttattctaagatatttagaaaaaaa |
8314713 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccca-tctccatgggaacttta |
208 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8314714 |
atgtttagttaacattataataattcaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaat-tacatttgaatttattctcaatcttcatggaaacttta |
8314812 |
T |
 |
| Q |
209 |
ttctca-cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaat |
268 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8314813 |
ttctcatcattttttttttggaaaaattttctattgccagaaacattttatatacgggaat |
8314873 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11570136 - 11570071
Alignment:
| Q |
9 |
ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaa |
74 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11570136 |
ttaatggtgtctttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaa |
11570071 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 359
Target Start/End: Original strand, 3869391 - 3869574
Alignment:
| Q |
175 |
ttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct---cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaa |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
3869391 |
ttatgaatttattctcatcttcgtgggaactttattctcaccaccattttctttgggaaaacttttctattccattgaacattttatgcc----aataaa |
3869486 |
T |
 |
| Q |
272 |
atttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||| | ||| | |||||||| ||| ||| | ||| | |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3869487 |
atttaatgaacatttaacaaacgtagtaatacatatttctatcattttattcccagaaatctacaaaaataacttgaaacaaacacac |
3869574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 12328062 - 12328216
Alignment:
| Q |
9 |
ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa |
108 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
12328062 |
ttaagggtctgtctgtttcaaatttaccaaatttatttctagtaataacatt-ctttgaatataaagatgtgaatttcatt-caatgtatttagaaaaga |
12328159 |
T |
 |
| Q |
109 |
tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta |
168 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12328160 |
gatgtttgattaacgttataatattctaaggaacctt---aatagggtttataataggta |
12328216 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9760497 - 9760376
Alignment:
| Q |
234 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || | | | |||||||||||| | || || |
|
|
| T |
9760497 |
ttttctattctcatgaacattttatatcctgaaataaaatttagtaaacttataacaaaaataggcatgtataattcgatcattttattctcaagagtct |
9760398 |
T |
 |
| Q |
334 |
acaattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9760397 |
acaaagataacttgaaacaaac |
9760376 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 296
Target Start/End: Original strand, 8314885 - 8314919
Alignment:
| Q |
262 |
cgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8314885 |
cgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
8314919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10246258 - 10246224
Alignment:
| Q |
325 |
cgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10246258 |
cgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
10246224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Original strand, 3869218 - 3869295
Alignment:
| Q |
12 |
agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttatt |
89 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3869218 |
agggggtgtttgtttcaagtttagtagatttattcccaagaataactttcctggaaatataaggatgagagttttatt |
3869295 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 201644 - 201994
Alignment:
| Q |
8 |
attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa |
107 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
201644 |
attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattctaaggaatttaggaaaa |
201743 |
T |
 |
| Q |
108 |
atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201744 |
atatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaacttt |
201842 |
T |
 |
| Q |
208 |
attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat |
307 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
201843 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaatattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
201942 |
T |
 |
| Q |
308 |
tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201943 |
tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
201994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 143342 - 143678
Alignment:
| Q |
19 |
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117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
143342 |
gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaatttttatttcaaggtatttggaaaaaatatgtttgg |
143441 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccc |
217 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
143442 |
ttaactttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaa-ctacatatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacca |
143540 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatt |
317 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
143541 |
ttttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtatacatatatatttctatcatt |
143640 |
T |
 |
| Q |
318 |
ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
143641 |
ttattctcaggaatcaacaaatttaacttgaaacaaac |
143678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 325
Target Start/End: Original strand, 119051 - 119355
Alignment:
| Q |
18 |
tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg |
117 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
119051 |
tgtttgctttaagtttaccaaatttattcttaaaaataacattcattggaatataaagatgtgaattttatttca-gatatttagaaaaaaggtgtttgg |
119149 |
T |
 |
| Q |
118 |
ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccc |
217 |
Q |
| |
|
| | | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| | || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
119150 |
tgaacactataatattccccggaaccttaagaatagggattataataggtagt-tacacatga-tttattctcatctgcctgaaaactttatttccaccc |
119247 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatt |
317 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| |
|
|
| T |
119248 |
ttttctttggaaaaaattttctattcccaggaacattttatactcatgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcatt |
119347 |
T |
 |
| Q |
318 |
ttattccc |
325 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
119348 |
gtattccc |
119355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29298 - 28957
Alignment:
| Q |
15 |
gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29298 |
gtgtgtttattttaagtttatcaaatttattcctatgaataacattttttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgtt |
29199 |
T |
 |
| Q |
115 |
tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
29198 |
tggttagctttataatattcctaggaattataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattccca |
29099 |
T |
 |
| Q |
215 |
cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
29098 |
cccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatc |
28999 |
T |
 |
| Q |
315 |
attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
356 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28998 |
attttattcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
28957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0662 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:
Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 4186 - 4537
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
4186 |
taagggtgtgtttgtttcaagtgcaccaaatttattcctatgaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggtatttaggaaaaaa |
4285 |
T |
 |
| Q |
110 |
a-tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa----actatttatgaatttattcccatctccatgggaac |
204 |
Q |
| |
|
| ||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4286 |
aatgtttcgttaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggaatataataggtaattacactattaat---tttattttcatctccatgggaac |
4382 |
T |
 |
| Q |
205 |
tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata |
304 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4383 |
tttattcccaccattttctttgagaaaacttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
4482 |
T |
 |
| Q |
305 |
cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4483 |
tatttttataattttattcctagaaatctacaaatataacttgaaacaaacacac |
4537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0702 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:
Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3916 - 3567
Alignment:
| Q |
10 |
taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
3916 |
taagggtgtgtttgtttcaagtgcaccaaatttattcctatgaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggtatttaggaaaaaa |
3817 |
T |
 |
| Q |
110 |
a-tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta |
208 |
Q |
| |
|
| ||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3816 |
aatgtttcgttaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggaatataataggtaat-tacacataattttattttcatctccatgggaacttta |
3718 |
T |
 |
| Q |
209 |
ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt |
308 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
3717 |
ttcccaccattttctttgagaaaacttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatt |
3618 |
T |
 |
| Q |
309 |
ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3617 |
tttataattttattcctagaaatctacaaatataacttgaaacaaacacac |
3567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0238 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0238
Description:
Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23517 - 23302
Alignment:
| Q |
139 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttc |
238 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
23517 |
gaaccttaaaaatagggattataataggtagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccaccgttttctttggaaaaaaattta |
23419 |
T |
 |
| Q |
239 |
tattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaat |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| | | |||| |||| |
|
|
| T |
23418 |
tattcccaggaatattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctataattttattctcagaaatctacaaa |
23319 |
T |
 |
| Q |
339 |
tataacttgaaacaaac |
355 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| |
|
|
| T |
23318 |
tataatttaaaacaaac |
23302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0238; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23675 - 23604
Alignment:
| Q |
18 |
tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattc |
90 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23675 |
tgtttattttaagtttaccaaatttatttttaagaataatatttcttggaatataaaaatg-gaattttattc |
23604 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1480 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1480
Description:
Target: scaffold1480; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 556 - 387
Alignment:
| Q |
190 |
catctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaac |
289 |
Q |
| |
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| T |
556 |
catcttcatgggaactttattcccacaattttctttgggaatgttatttcattcccaggaacattttatatttaggaataaaatttaataaacttgcaac |
457 |
T |
 |
| Q |
290 |
aaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
359 |
Q |
| |
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|||||||| || | ||| | |||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
456 |
aaacataggaatgcatatttccatcattctatttccaggaatttacaaagataacttgaaacaaacacac |
387 |
T |
 |
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Target: scaffold0069; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 21961 - 21854
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| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
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| T |
21961 |
catcttcatgggaactttattcccacaattttttttgggaatgttatttcatacccaggaacattttatatctaggaataaaatttaataaacttgcaac |
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T |
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| Q |
290 |
aaacatag |
297 |
Q |
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aaacatag |
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T |
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18 |
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117 |
Q |
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| T |
43436 |
tgtttattttaagtttgtcaaatttatttttaggaataatattttttagaatataaagatgtgaattttattttaaagtatttagaaaaaagatgtttgt |
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T |
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| Q |
118 |
ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataa |
162 |
Q |
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| T |
43336 |
ttaacattatgatatttttaggaaccttaaaaataaagattataa |
43292 |
T |
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