View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13354_high_4 (Length: 460)

Name: NF13354_high_4
Description: NF13354
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13354_high_4
NF13354_high_4
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (5-359)||(35818426-35818780)
chr8 (13-359)||(38363804-38364150)
chr8 (10-359)||(37392548-37392897)
chr8 (12-359)||(32660935-32661283)
chr8 (9-359)||(38132739-38133090)
chr8 (5-359)||(16313509-16313863)
chr8 (14-359)||(18726621-18726967)
chr8 (12-357)||(7930961-7931306)
chr8 (10-359)||(12710365-12710714)
chr8 (7-359)||(25837628-25837980)
chr8 (14-356)||(18297836-18298178)
chr8 (6-359)||(26061860-26062213)
chr8 (24-359)||(1554356-1554692)
chr8 (12-360)||(3049731-3050079)
chr8 (12-358)||(26601941-26602286)
chr8 (15-359)||(42755592-42755936)
chr8 (17-359)||(10896219-10896560)
chr8 (84-359)||(41228716-41228990)
chr8 (15-359)||(5020492-5020837)
chr8 (15-360)||(21137133-21137476)
chr8 (55-356)||(35394156-35394456)
chr8 (14-359)||(33444628-33444969)
chr8 (13-357)||(29421493-29421839)
chr8 (69-359)||(7317156-7317442)
chr8 (12-355)||(15226688-15227029)
chr8 (14-295)||(19160807-19161088)
chr8 (10-191)||(40197223-40197404)
chr8 (8-356)||(43871971-43872318)
chr8 (15-354)||(41432464-41432804)
chr8 (51-286)||(6805698-6805936)
chr8 (13-304)||(31117587-31117874)
chr8 (12-355)||(16218949-16219290)
chr8 (14-293)||(37981857-37982134)
chr8 (205-356)||(40197081-40197232)
chr8 (10-168)||(33533585-33533743)
chr8 (14-292)||(12649859-12650137)
chr8 (12-165)||(25899381-25899532)
chr8 (205-359)||(25899548-25899701)
chr8 (213-355)||(38437377-38437519)
chr8 (180-323)||(14763969-14764111)
chr8 (8-71)||(35394076-35394139)
chr8 (12-134)||(34672083-34672207)
chr8 (15-166)||(38437203-38437353)
chr8 (14-134)||(37124073-37124194)
chr8 (245-359)||(34672289-34672403)
chr8 (13-54)||(41228976-41229017)
chr8 (320-359)||(8635664-8635703)
chr8 (224-296)||(32901787-32901858)
[»] chr1 (81 HSPs)
chr1 (12-359)||(46666431-46666778)
chr1 (13-359)||(20260088-20260434)
chr1 (13-359)||(9115561-9115907)
chr1 (10-359)||(52630494-52630843)
chr1 (8-359)||(14788442-14788793)
chr1 (13-359)||(25789487-25789833)
chr1 (10-359)||(8331735-8332084)
chr1 (15-360)||(9831871-9832216)
chr1 (15-359)||(2430223-2430566)
chr1 (12-358)||(36361506-36361851)
chr1 (13-359)||(39930181-39930527)
chr1 (10-359)||(12190179-12190528)
chr1 (12-359)||(32824644-32824992)
chr1 (12-359)||(6911208-6911563)
chr1 (9-359)||(1597344-1597694)
chr1 (16-358)||(51445083-51445424)
chr1 (14-359)||(39329347-39329678)
chr1 (12-359)||(2632576-2632922)
chr1 (12-359)||(50190767-50191113)
chr1 (13-357)||(38964683-38965027)
chr1 (85-359)||(3572567-3572841)
chr1 (12-359)||(5806293-5806625)
chr1 (12-359)||(5518506-5518852)
chr1 (16-359)||(4683376-4683718)
chr1 (15-359)||(35187181-35187526)
chr1 (15-359)||(48916024-48916368)
chr1 (19-355)||(13653581-13653917)
chr1 (69-359)||(6978550-6978840)
chr1 (14-359)||(32202333-32202660)
chr1 (14-352)||(37436630-37436966)
chr1 (27-355)||(52699472-52699799)
chr1 (12-359)||(29091395-29091736)
chr1 (54-359)||(49822919-49823203)
chr1 (12-188)||(47031582-47031758)
chr1 (156-359)||(47037324-47037527)
chr1 (8-308)||(46960347-46960646)
chr1 (13-359)||(47677368-47677712)
chr1 (12-359)||(24116339-24116683)
chr1 (15-303)||(1227936-1228225)
chr1 (58-355)||(30240782-30241075)
chr1 (16-296)||(38519127-38519405)
chr1 (205-359)||(1007663-1007817)
chr1 (11-141)||(25473977-25474107)
chr1 (11-356)||(17475326-17475659)
chr1 (15-358)||(31806759-31807093)
chr1 (15-235)||(48462258-48462475)
chr1 (12-355)||(9011167-9011511)
chr1 (15-359)||(13931886-13932218)
chr1 (176-354)||(11014448-11014626)
chr1 (18-359)||(13521053-13521390)
chr1 (181-359)||(19083107-19083285)
chr1 (181-359)||(19130995-19131173)
chr1 (15-303)||(29769230-29769526)
chr1 (139-355)||(20504995-20505213)
chr1 (10-168)||(49627295-49627454)
chr1 (8-277)||(3939220-3939486)
chr1 (84-188)||(1007566-1007669)
chr1 (235-358)||(52186049-52186172)
chr1 (124-325)||(13440230-13440431)
chr1 (10-169)||(37261540-37261699)
chr1 (12-132)||(45771815-45771937)
chr1 (14-222)||(19923603-19923810)
chr1 (14-93)||(52186265-52186344)
chr1 (176-355)||(37261734-37261913)
chr1 (12-66)||(37726805-37726859)
chr1 (28-152)||(45813603-45813727)
chr1 (196-359)||(19094020-19094183)
chr1 (105-291)||(37336514-37336699)
chr1 (52-169)||(13048461-13048578)
chr1 (52-169)||(13053458-13053575)
chr1 (17-62)||(49824022-49824067)
chr1 (127-220)||(52186170-52186262)
chr1 (180-322)||(33702381-33702524)
chr1 (10-44)||(6978518-6978552)
chr1 (197-285)||(11077963-11078051)
chr1 (181-298)||(37726920-37727033)
chr1 (246-297)||(52276877-52276926)
chr1 (13-47)||(1007539-1007573)
chr1 (264-296)||(3939515-3939547)
chr1 (180-359)||(16257010-16257189)
chr1 (19-91)||(41967465-41967537)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (8-359)||(35488191-35488542)
chr7 (8-359)||(11329711-11330062)
chr7 (8-359)||(45265050-45265401)
chr7 (7-359)||(27248010-27248362)
chr7 (16-359)||(45045352-45045695)
chr7 (10-359)||(33378554-33378911)
chr7 (12-359)||(44565767-44566114)
chr7 (13-359)||(27213857-27214203)
chr7 (12-358)||(48341086-48341430)
chr7 (10-359)||(43948965-43949314)
chr7 (10-359)||(48313842-48314191)
chr7 (9-356)||(25924642-25924989)
chr7 (10-359)||(9946992-9947342)
chr7 (13-357)||(45448665-45449009)
chr7 (14-359)||(34930467-34930814)
chr7 (12-357)||(38396370-38396714)
chr7 (8-359)||(28904188-28904539)
chr7 (50-359)||(8419591-8419900)
chr7 (14-359)||(27419226-27419571)
chr7 (17-359)||(38543920-38544263)
chr7 (18-359)||(25097796-25098138)
chr7 (18-359)||(39553910-39554252)
chr7 (58-359)||(40212657-40212958)
chr7 (40-359)||(9814220-9814535)
chr7 (9-359)||(41632366-41632711)
chr7 (17-360)||(44819981-44820324)
chr7 (8-359)||(48160593-48160926)
chr7 (16-362)||(37534102-37534447)
chr7 (16-359)||(30685994-30686336)
chr7 (122-359)||(16825356-16825593)
chr7 (18-359)||(18823890-18824215)
chr7 (13-358)||(6656476-6656819)
chr7 (7-310)||(45722876-45723169)
chr7 (10-277)||(31921811-31922077)
chr7 (139-359)||(25045620-25045838)
chr7 (16-359)||(41684024-41684354)
chr7 (15-359)||(45440637-45440977)
chr7 (81-359)||(11000488-11000772)
chr7 (14-296)||(40385692-40385974)
chr7 (12-301)||(5543191-5543479)
chr7 (19-292)||(22156248-22156520)
chr7 (19-292)||(22212163-22212435)
chr7 (126-360)||(6656225-6656457)
chr7 (13-354)||(43445890-43446229)
chr7 (52-296)||(38528772-38529012)
chr7 (10-164)||(17276355-17276510)
chr7 (16-165)||(31598449-31598598)
chr7 (58-355)||(47246070-47246366)
chr7 (81-273)||(43569773-43569966)
chr7 (10-64)||(16916182-16916236)
chr7 (232-322)||(10902689-10902779)
chr7 (62-211)||(10902822-10902971)
chr7 (294-359)||(45723211-45723276)
chr7 (12-55)||(40212626-40212669)
chr7 (232-323)||(30871130-30871221)
chr7 (235-292)||(31598623-31598679)
chr7 (19-152)||(30870944-30871074)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (12-359)||(4765562-4765909)
chr5 (10-359)||(22935914-22936263)
chr5 (12-359)||(29543017-29543364)
chr5 (12-359)||(18411931-18412278)
chr5 (7-359)||(19065507-19065859)
chr5 (15-358)||(11855658-11856001)
chr5 (12-359)||(12970532-12970879)
chr5 (5-359)||(28602271-28602624)
chr5 (14-359)||(555708-556053)
chr5 (12-359)||(14206823-14207170)
chr5 (9-357)||(6091434-6091782)
chr5 (16-340)||(8646412-8646735)
chr5 (15-359)||(27481082-27481426)
chr5 (12-355)||(8406616-8406959)
chr5 (11-359)||(32535658-32536006)
chr5 (70-359)||(36703654-36703943)
chr5 (14-350)||(27480735-27481069)
chr5 (10-359)||(6930362-6930713)
chr5 (15-359)||(42012181-42012530)
chr5 (15-296)||(1664456-1664736)
chr5 (72-359)||(20962373-20962659)
chr5 (12-359)||(43346897-43347243)
chr5 (14-164)||(36703506-36703656)
chr5 (12-359)||(26637045-26637370)
chr5 (10-332)||(17251534-17251854)
chr5 (28-355)||(35348534-35348858)
chr5 (16-300)||(31583123-31583404)
chr5 (104-350)||(40275766-40276011)
chr5 (12-152)||(28429450-28429591)
chr5 (18-134)||(16720910-16721029)
chr5 (10-169)||(35602968-35603124)
chr5 (16-168)||(36978323-36978478)
chr5 (205-296)||(30899470-30899561)
chr5 (189-355)||(19089723-19089889)
chr5 (177-301)||(28023719-28023844)
chr5 (16-78)||(20962286-20962348)
chr5 (16-152)||(30899327-30899463)
chr5 (14-88)||(40276514-40276587)
chr5 (230-355)||(15200552-15200676)
chr5 (205-322)||(28429617-28429733)
chr5 (232-357)||(41783624-41783749)
chr5 (232-355)||(3913206-3913327)
chr5 (16-133)||(19089898-19090016)
chr5 (13-116)||(27079206-27079308)
chr5 (263-322)||(36978210-36978269)
chr5 (252-296)||(16720277-16720321)
chr5 (28-91)||(27901697-27901760)
chr5 (12-120)||(6696755-6696864)
[»] chr2 (71 HSPs)
chr2 (12-359)||(346347-346694)
chr2 (12-359)||(6171513-6171860)
chr2 (7-359)||(42674663-42675015)
chr2 (10-359)||(4559279-4559628)
chr2 (12-359)||(14777500-14777847)
chr2 (10-359)||(37192242-37192591)
chr2 (14-359)||(17965707-17966052)
chr2 (12-359)||(11071327-11071674)
chr2 (10-360)||(2050586-2050936)
chr2 (8-359)||(21737402-21737761)
chr2 (17-359)||(9733848-9734190)
chr2 (13-356)||(5770115-5770458)
chr2 (12-359)||(41729132-41729479)
chr2 (14-357)||(638318-638660)
chr2 (12-359)||(37533675-37534021)
chr2 (15-357)||(28311701-28312042)
chr2 (15-357)||(37233155-37233496)
chr2 (49-359)||(2521434-2521744)
chr2 (12-359)||(40950861-40951208)
chr2 (16-356)||(26309993-26310335)
chr2 (37-359)||(41750276-41750598)
chr2 (13-359)||(20426485-20426830)
chr2 (36-359)||(34356702-34357023)
chr2 (20-359)||(27357965-27358303)
chr2 (20-359)||(45408981-45409319)
chr2 (65-359)||(39995133-39995435)
chr2 (12-292)||(23943885-23944165)
chr2 (15-261)||(13760692-13760938)
chr2 (12-358)||(18713660-18714005)
chr2 (10-355)||(45693909-45694253)
chr2 (15-357)||(14832536-14832877)
chr2 (15-355)||(3902182-3902521)
chr2 (51-359)||(1988073-1988380)
chr2 (12-359)||(40569740-40570089)
chr2 (14-357)||(39819414-39819763)
chr2 (12-359)||(7007307-7007642)
chr2 (20-296)||(41297983-41298255)
chr2 (14-355)||(5002843-5003182)
chr2 (20-355)||(4875506-4875840)
chr2 (154-359)||(11763374-11763577)
chr2 (24-164)||(11763597-11763737)
chr2 (180-346)||(14253412-14253578)
chr2 (18-221)||(13790018-13790221)
chr2 (20-301)||(13539399-13539679)
chr2 (205-359)||(6571602-6571756)
chr2 (16-169)||(3254284-3254437)
chr2 (234-359)||(25454968-25455093)
chr2 (112-356)||(1623206-1623448)
chr2 (53-322)||(4684945-4685211)
chr2 (9-297)||(25724744-25725033)
chr2 (16-127)||(1623078-1623188)
chr2 (110-296)||(37851678-37851864)
chr2 (248-359)||(24499400-24499509)
chr2 (180-355)||(8868670-8868842)
chr2 (20-73)||(2521381-2521434)
chr2 (180-282)||(3254142-3254245)
chr2 (18-89)||(14253254-14253325)
chr2 (177-359)||(14403235-14403419)
chr2 (180-290)||(516463-516572)
chr2 (286-358)||(13760941-13761013)
chr2 (6-89)||(25444916-25444999)
chr2 (265-359)||(1723230-1723324)
chr2 (232-322)||(25625328-25625418)
chr2 (12-134)||(14403431-14403555)
chr2 (20-93)||(45212662-45212735)
chr2 (81-149)||(14253345-14253413)
chr2 (23-93)||(10390559-10390627)
chr2 (10-72)||(36590862-36590924)
chr2 (124-240)||(14137038-14137153)
chr2 (15-46)||(1498878-1498909)
chr2 (20-62)||(8868938-8868980)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (12-359)||(8476310-8476657)
chr3 (12-359)||(26848744-26849091)
chr3 (10-359)||(11239122-11239471)
chr3 (10-359)||(40907986-40908334)
chr3 (16-359)||(47114859-47115202)
chr3 (12-357)||(33217917-33218262)
chr3 (10-358)||(48339760-48340108)
chr3 (12-359)||(6231503-6231850)
chr3 (16-342)||(31611004-31611330)
chr3 (14-359)||(20414467-20414812)
chr3 (14-359)||(1098923-1099267)
chr3 (18-359)||(28124438-28124779)
chr3 (12-359)||(44952030-44952377)
chr3 (13-359)||(9320450-9320797)
chr3 (12-359)||(24574289-24574644)
chr3 (10-359)||(20297513-20297862)
chr3 (11-340)||(46359673-46360002)
chr3 (10-346)||(10822733-10823068)
chr3 (15-359)||(43132159-43132502)
chr3 (12-353)||(53165733-53166073)
chr3 (15-305)||(43718986-43719271)
chr3 (7-359)||(31435925-31436276)
chr3 (14-359)||(12228258-12228601)
chr3 (14-237)||(29512324-29512546)
chr3 (13-359)||(28770212-28770557)
chr3 (14-355)||(26849164-26849492)
chr3 (84-276)||(19532939-19533130)
chr3 (48-351)||(1246912-1247212)
chr3 (13-359)||(27822994-27823343)
chr3 (15-359)||(24783934-24784274)
chr3 (15-360)||(40584336-40584670)
chr3 (14-358)||(12930945-12931287)
chr3 (19-304)||(38140425-38140710)
chr3 (10-169)||(6832114-6832273)
chr3 (62-359)||(2565462-2565749)
chr3 (104-358)||(32071261-32071508)
chr3 (17-237)||(49216027-49216246)
chr3 (71-359)||(33647705-33647992)
chr3 (19-189)||(18460582-18460750)
chr3 (178-304)||(18460827-18460953)
chr3 (16-101)||(6927817-6927902)
chr3 (18-158)||(33650217-33650357)
chr3 (14-100)||(32070994-32071080)
chr3 (10-359)||(28693428-28693782)
chr3 (24-359)||(27093763-27094085)
chr3 (200-359)||(45826687-45826845)
chr3 (237-301)||(6832016-6832079)
chr3 (78-303)||(13642860-13643083)
chr3 (229-303)||(29512631-29512705)
chr3 (298-359)||(43715310-43715371)
chr3 (255-355)||(39932529-39932631)
chr3 (14-168)||(31267540-31267694)
chr3 (382-422)||(25351447-25351487)
chr3 (16-69)||(2566471-2566524)
chr3 (10-47)||(19532909-19532946)
chr3 (235-355)||(28139726-28139846)
chr3 (17-73)||(45826064-45826120)
chr3 (17-91)||(55435652-55435726)
chr3 (202-322)||(33497768-33497889)
chr3 (15-90)||(26085442-26085517)
chr3 (10-76)||(44533943-44534009)
chr3 (300-336)||(9320405-9320441)
chr3 (191-275)||(12108215-12108298)
chr3 (315-359)||(29512704-29512748)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (14-359)||(27762901-27763246)
chr4 (10-359)||(55968002-55968351)
chr4 (12-359)||(13229991-13230338)
chr4 (12-359)||(39730295-39730642)
chr4 (9-359)||(41859049-41859398)
chr4 (19-359)||(48518893-48519233)
chr4 (10-359)||(42773672-42774021)
chr4 (12-359)||(6279923-6280270)
chr4 (12-359)||(48879051-48879398)
chr4 (8-359)||(43722986-43723337)
chr4 (12-359)||(45747798-45748144)
chr4 (12-359)||(35999412-35999759)
chr4 (10-359)||(25932165-25932514)
chr4 (10-355)||(45595992-45596337)
chr4 (14-359)||(40435628-40435973)
chr4 (20-359)||(50672910-50673245)
chr4 (8-359)||(18405236-18405586)
chr4 (12-359)||(23686513-23686860)
chr4 (10-359)||(935850-936199)
chr4 (10-359)||(47670086-47670435)
chr4 (14-359)||(41744222-41744568)
chr4 (12-359)||(39835309-39835656)
chr4 (12-349)||(8321971-8322308)
chr4 (54-359)||(34049599-34049904)
chr4 (8-359)||(27555149-27555483)
chr4 (14-357)||(27942465-27942814)
chr4 (15-359)||(18931482-18931826)
chr4 (12-359)||(32953249-32953596)
chr4 (20-308)||(34238007-34238295)
chr4 (51-359)||(39498590-39498898)
chr4 (51-359)||(39501929-39502237)
chr4 (104-359)||(25916037-25916290)
chr4 (12-243)||(48873747-48873978)
chr4 (13-359)||(31937871-31938217)
chr4 (13-355)||(7258691-7259031)
chr4 (7-359)||(51968500-51968850)
chr4 (16-322)||(52469427-52469734)
chr4 (126-359)||(30415743-30415975)
chr4 (110-359)||(38414032-38414277)
chr4 (13-323)||(38394634-38394943)
chr4 (13-231)||(36858135-36858351)
chr4 (13-332)||(47426269-47426567)
chr4 (13-262)||(30790275-30790518)
chr4 (101-359)||(36858380-36858636)
chr4 (205-356)||(10400810-10400961)
chr4 (20-295)||(37014451-37014724)
chr4 (124-359)||(18405592-18405826)
chr4 (15-169)||(10400973-10401126)
chr4 (35-304)||(48059804-48060073)
chr4 (12-125)||(38413902-38414015)
chr4 (55-358)||(24805088-24805397)
chr4 (22-355)||(44309497-44309829)
chr4 (80-359)||(26165156-26165437)
chr4 (13-90)||(36860027-36860104)
chr4 (110-296)||(18094073-18094259)
chr4 (10-101)||(18405127-18405217)
chr4 (197-319)||(12275953-12276075)
chr4 (12-71)||(25916302-25916362)
chr4 (18-120)||(52413959-52414061)
chr4 (301-357)||(34237424-34237480)
chr4 (104-262)||(32384492-32384650)
chr4 (202-323)||(22654515-22654638)
chr4 (50-163)||(37296473-37296580)
chr4 (265-359)||(9327247-9327342)
chr4 (265-359)||(9374006-9374101)
chr4 (11-93)||(12276178-12276260)
chr4 (274-359)||(36860106-36860190)
chr4 (18-162)||(14796295-14796439)
chr4 (236-296)||(54478495-54478555)
chr4 (49-120)||(54478366-54478437)
chr4 (201-295)||(9297144-9297236)
chr4 (265-346)||(9382297-9382379)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (12-359)||(1316741-1317087)
chr6 (12-359)||(2657422-2657769)
chr6 (12-359)||(7053572-7053927)
chr6 (9-358)||(18897640-18897989)
chr6 (15-359)||(14170740-14171082)
chr6 (14-354)||(16968649-16968989)
chr6 (12-284)||(8029025-8029297)
chr6 (124-359)||(7344085-7344320)
chr6 (12-218)||(10246259-10246465)
chr6 (10-359)||(6705767-6706103)
chr6 (9-358)||(345833-346179)
chr6 (15-296)||(14781685-14781955)
chr6 (28-132)||(7344723-7344827)
chr6 (273-359)||(8029316-8029402)
chr6 (18-132)||(21008208-21008322)
chr6 (184-359)||(10849785-10849961)
chr6 (14-168)||(9762232-9762387)
chr6 (176-350)||(21008035-21008208)
chr6 (10-268)||(8314614-8314873)
chr6 (9-74)||(11570071-11570136)
chr6 (175-359)||(3869391-3869574)
chr6 (9-168)||(12328062-12328216)
chr6 (234-355)||(9760376-9760497)
chr6 (262-296)||(8314885-8314919)
chr6 (325-359)||(10246224-10246258)
chr6 (12-89)||(3869218-3869295)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (8-359)||(201644-201994)
scaffold0006 (19-355)||(143342-143678)
scaffold0006 (18-325)||(119051-119355)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (15-356)||(28957-29298)
[»] scaffold0662 (1 HSPs)
scaffold0662 (10-359)||(4186-4537)
[»] scaffold0702 (1 HSPs)
scaffold0702 (10-359)||(3567-3916)
[»] scaffold0238 (2 HSPs)
scaffold0238 (139-355)||(23302-23517)
scaffold0238 (18-90)||(23604-23675)
[»] scaffold1480 (1 HSPs)
scaffold1480 (190-359)||(387-556)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (190-297)||(21854-21961)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (18-162)||(43292-43436)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35818780 - 35818426
Alignment:
5 aatattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
35818780 aatattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttagga 35818681  T
105 aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35818680 aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaac 35818581  T
205 tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
35818580 tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata 35818481  T
305 cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35818480 cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 35818426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 38363804 - 38364150
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
38363804 gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatg 38363903  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
38363904 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcc 38364003  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
38364004 caccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaa 38364103  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38364104 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 38364150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37392897 - 37392548
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
37392897 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 37392798  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37392797 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 37392698  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
37392697 tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattc 37392598  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
37392597 ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaatacac 37392548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32661283 - 32660935
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
32661283 agggtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatat 32661184  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32661183 gtttggttagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 32661084  T
212 tcaccctttt-ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc 310  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
32661083 ccacccttttcccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcc 32660984  T
311 aatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
32660983 tatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 32660935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38133090 - 38132739
Alignment:
9 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
38133090 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaa 38132991  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
38132990 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgagaacttta 38132891  T
209 ttctcacccttttccttgggaaatt-ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38132890 ttcccacccttttccttgggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 38132791  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
38132790 ttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 38132739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16313863 - 16313509
Alignment:
5 aatattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaaga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
16313863 aatattaagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttagga 16313764  T
105 aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
16313763 aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaac 16313664  T
205 tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
16313663 tttattcccaccatttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatata 16313564  T
305 cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
16313563 cattcctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 16313509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18726967 - 18726621
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
18726967 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattaattggaatataaagatgaaaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 18726868  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
18726867 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatttccatctccatgagaactttattccc 18726768  T
214 acccttttccttgggaaatt-ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
18726767 acccttttccttgggaaatttttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccta 18726668  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18726667 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 18726621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 357
Target Start/End: Original strand, 7930961 - 7931306
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
7930961 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 7931060  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7931061 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 7931160  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |     
7931161 ccacccttttccttgggaaattttttctattctcaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttataacaaacatatacatatacatttct 7931260  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
7931261 atcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 7931306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 12710365 - 12710714
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||    
12710365 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaagaaatgtaggaaaaat 12710464  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
12710465 atgtttcgttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat 12710564  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
12710565 tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattt 12710664  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12710665 ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 12710714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 25837628 - 25837980
Alignment:
7 tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
25837628 tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaa 25837727  T
107 aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
25837728 aatatgtttggttagctttataatattcctatgaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactt 25837827  T
207 tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca 306  Q
    ||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
25837828 tattgccacccttttttttgggaaaatttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattttgtaaacttgtaacaaacataggcatgtaca 25837927  T
307 ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25837928 ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 25837980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 356
Target Start/End: Original strand, 18297836 - 18298178
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
18297836 ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 18297935  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
18297936 ttggttagctttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattccc 18298035  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
18298036 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctat 18298135  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 356  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
18298136 cattttattcccgagaatcaaaaattataacttgaaacaaaca 18298178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 26061860 - 26062213
Alignment:
6 atattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
26061860 atattaagggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttgtaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaa 26061959  T
106 aaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaact 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26061960 aaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaact 26062059  T
206 ttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatac 305  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
26062060 ttattcccaccctttttcttgggaatttttttctattcccagggacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggaatatac 26062159  T
306 attccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
26062160 atttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 26062213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 24 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1554692 - 1554356
Alignment:
24 tttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaa-gatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
1554692 tttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatggttggttagt 1554593  T
123 tttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
1554592 tttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaaattatgtatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccacccttttc 1554493  T
223 cttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt 322  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
1554492 cttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttatt 1554393  T
323 cccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1554392 cccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 1554356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 12 - 360
Target Start/End: Original strand, 3049731 - 3050079
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
3049731 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcataggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattcgaaggaatttagaaaaaatat 3049830  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
3049831 gtttggttatctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 3049930  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
3049931 ccacccttttctttggaaatttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 3050030  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
3050031 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacgcaca 3050079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26602286 - 26601941
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
26602286 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattgctagaaataacattccttgaaacataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 26602187  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
26602186 gtttggttagctttataatattccttggaaccataaaaatagggattataatagctaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 26602087  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
26602086 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttata-ccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 26601988  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
26601987 atcattttattcccgggaatcaacaattataatttgaaacaaacaca 26601941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 42755592 - 42755936
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
42755592 gtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatatgaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatatt 42755691  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
42755692 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattccca 42755791  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||    
42755792 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacaaaggaataaattttagtaaacttgtaactaacataggcatatacatttctatc 42755891  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
42755892 attttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 42755936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10896560 - 10896219
Alignment:
17 gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
10896560 gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttg 10896461  T
117 gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacc 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
10896460 gttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc 10896361  T
217 cttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcat 316  Q
    ||||| ||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
10896360 ctttttctt-gatttttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaatttgtaacaaacataggcatatacatttctatcat 10896262  T
317 tttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10896261 tttattcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 10896219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 84 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41228990 - 41228716
Alignment:
84 tttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatt 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41228990 tttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatt 41228891  T
184 tattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaact 283  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41228890 tattct-atctccataggaactttattcccacccttttcctcgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaact 41228792  T
284 tgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
41228791 tgtaacaaacgtaggcatatacattcctaccattttattcccgggaattaacaattataacttgaaacaaacacac 41228716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5020837 - 5020492
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
5020837 gtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttaggaataacattctttggaatataaagatgataattttattctaaggtatttaggaaaaatatgtt 5020738  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
5020737 tggttaactttataatattc-tgggaatcataaaaatatggattataataggtaa-ctacttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattccca 5020640  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat---tcca 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| ||   |||     
5020639 cccttttccttgggaaaatttttctattcacagaaacattttatacccgagagtaaactttagtaaacttgtaagaaacatatgcatatatattcctcct 5020540  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
5020539 atcattttattcccatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 5020492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21137476 - 21137133
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||    
21137476 gtgtgtttgtttttagtttatcaaatttattactag-aataacattttttggaatataaagatgagaattttattttaaggtatttaaaaaaaatatgtt 21137378  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  ||    
21137377 tggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatacggattataataggtaa-ctacatatgaatttattctcatctccacgagaactttatttcca 21137279  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    || ||||| |||| ||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||     
21137278 ccattttctttggaaaaatatttatattcccacaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatt 21137179  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca 360  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
21137178 attttattctcaggaatcaacaaatataacttcaaacaaacacaca 21137133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 55 - 356
Target Start/End: Original strand, 35394156 - 35394456
Alignment:
55 aacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagg 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
35394156 aacattccttgaaatataaagatgagaattttattccaaggtatttaagaaaaatatgtttggttaactttataatattcctatgaaccataaaaataag 35394255  T
155 gattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatt 254  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| |   |||||||    
35394256 gattataataggtaa-ctatatatgagtttgttcccatctccttaggaactttattcccaccatttttcttggaaatttttttctattacgtagaacatt 35394354  T
255 ttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||    
35394355 ttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttctttcattttattctcgtgaatcaataaatataacttgaaacaaa 35394454  T
355 ca 356  Q
    ||    
35394455 ca 35394456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33444969 - 33444628
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
33444969 ggtgtgtttgtttcaagtttactgaatttattcataagaataacatttcatggaatataaagatgaaaattttatttcaaggtatttagaaaaaatatgt 33444870  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||||| |||||  |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| |    
33444869 ttggttaactttataatattcctagcaatcatacaaatagtgattctaataggt-aactacatatgaaatta-tctcatcttcatgggaactttattccc 33444772  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   ||    
33444771 accattttctttgggcaattttttctattcccaagaacattttata-ccgggaataaaatttagt-aacttgtaacaaacatagacatatatatttttat 33444674  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
33444673 cattttattctcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 33444628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29421839 - 29421493
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaa-tataaagatgagaatt---ttattccaaggaatttaagaaaaa 108  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||   |||||| |||| |||||  |||||    
29421839 gggtgtgtttgttttaa-tttacgaaatttattcctatgaataacattatttggaaatataaagatgaaaattgttttattctaaggtatttagaaaaaa 29421741  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
29421740 tatatttgattaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa-ctacatataaatttattctcatctccatgggaacttta 29421642  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
29421641 ttcccaccattttctttgggaaaatttttctattcccagaaatattttatacccgagaataaaatttaataaacttgtaacaaacataaacatatatatt 29421542  T
309 ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
     | |||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
29421541 tctatcattttattctcatgaatcaacaaatataatttgaaacaaacac 29421493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 69 - 359
Target Start/End: Original strand, 7317156 - 7317442
Alignment:
69 tataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta 168  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
7317156 tataaagatgtgaattttattctaaggtatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctag-aaccatgaaaatagggattataataggta 7317254  T
169 aactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaat 268  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||    
7317255 a-ctatttacgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaaatttttcta-tcctaggaacactttatatcc-ggaat 7317351  T
269 aaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||   |  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
7317352 aaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcctatcattttatttttgaaaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 7317442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Original strand, 15226688 - 15227029
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||    
15226688 agggtgcgtttgtttcaattttaccaaatttattattaggaataactttccttggaatataaagatgagaattttatttcaaggtatttagaaaaaatat 15226787  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
15226788 gtttggttaactttataaaaatccaaggaaccttaaaaatagggattataataggt-aattccacataattttattctcatcttcatgggaactttattc 15226886  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||       
15226887 ccacccttttctttggg-aatcttttctattcgcaggaatattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatgtatttat 15226985  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    || |||||||||   |||||| || | |||||||||||||||||    
15226986 atgattttattcagaggaatctacgaatataacttgaaacaaac 15227029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19161088 - 19160807
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| | |||||||||    
19161088 ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattctcaagaataacattctttggaatataaagatgagaaatttatttcagggtatttagaaaaaaatatg 19160989  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||     
19160988 tttggttagcattataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaat-tacatatgaattcattctcatctccatgacaactttattcc 19160890  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat 295  Q
    |||||||||| |||| |  |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
19160889 cacccttttctttggaattttttttatattcccaagaatattttatacacgggaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacat 19160807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40197404 - 40197223
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
40197404 taagggtttgtttgcttcaagtttaccaaatttattcctaggaataatattctttggaatataaagatgggaattttattctaaggaatttaggaaaaat 40197305  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccca 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40197304 atgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccca 40197223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43872318 - 43871971
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||  ||||    
43872318 attaagggtgtgtttgtttcaagtttgccaaatttatttctaggaataacattccttgaaatatatagatgtaaattttattccaaggtatttagaaaaa 43872219  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    | ||||||||||| | ||||||| || | |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||   ||| |||||||||||||||||  |||||||    
43872218 agatgtttggttaacattataatgtttcaaggaacctcaaaaatagggattataataggtaat-tatacgtgattttattcccatctccatatgaacttt 43872120  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    ||||  |||  |||| |||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||  |    
43872119 attcctaccaatttctttgaaaaaatatttatattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaacaaacttgtaacaaacataggcatgtatgt 43872020  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 356  Q
    |   || |||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||    
43872019 ttttatgattttatttccaagaatctataattataacttgaaacaaaca 43871971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 354
Target Start/End: Original strand, 41432464 - 41432804
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat--g 112  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||  |    
41432464 gtgtgtttgttttaagtttatcaaatttatttttaggaataacatttcttgaaacataaagatggaaattttattccaaggcatttaaaaaaaatatatg 41432563  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccca-tctccatgggaactttattc 211  Q
    |||| ||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||     
41432564 tttgcttaacattataatattcttgggagccataaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttattctcaatctccatgggaactttattt 41432662  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||| || ||||||  |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||     
41432663 ccaccctttttctagggaaaaattttctattcccataaacgttttatacc-gggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatgtgtattcct 41432761  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa 354  Q
    |||||||||||||| |||||| || | |||||||| |||||||    
41432762 atcattttattcccaggaatccacgaatataacttaaaacaaa 41432804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6805936 - 6805698
Alignment:
51 gaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaagg----aatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccata 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
6805936 gaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaaggtatatatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcccaggaaccatg 6805837  T
147 aaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattccca 246  Q
    ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
6805836 aaaatagagattttaataggt-atctatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattctcacccttttctttaggaaaaattttctattccca 6805738  T
247 ggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgt 286  Q
     |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
6805737 agaacatattatactcgggaataaaatttagtaaacttgt 6805698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31117874 - 31117587
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt---aagaaaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||   || ||| ||    
31117874 gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatatttaggaataacattcattggaatataaagatgagaattttatttcaaagtatttagaaaaaaatat 31117775  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||    
31117774 atgcttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagatattataataggt-aactatttatgaattt------atccccatgggaactttat 31117682  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    || ||||||||| ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||    
31117681 tcccaccctttttcttggaaatttttttctattctgaagaacattttatattcggaaataaaatttaataaaatcgtaacaaacatagatatata 31117587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16219290 - 16218949
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||    
16219290 agggtgtgtttgttttaagtttatccaatttattcctaggaataacgttccttggaacttaaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaagat 16219191  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||    || |||||||||||||| ||||||||  ||||||    
16219190 gtttggttaacattataatattcttgggaaccatgaaaatggggattataataggt-aattacacgtggatttattcccatcttcatgggaagattattc 16219092  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     || ||||||| ||||| || |||| |||||||   |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |     
16219091 cca-ccttttctttggggaaattttactattcctgagaacgttttaaaccccggaataaaatctagtaaacttgtaacaaacataggcatacatatttct 16218993  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    ||| |||||||||| | || | || | ||||| |||||||||||    
16218992 atcgttttattcccagaaaactacgaatataatttgaaacaaac 16218949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37982134 - 37981857
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaa-ttttattccaaggaattt--aagaaaaata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || ||||| |    
37982134 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattcctt-gaacataaagatgagaatttttattccaaggtatttaaaaaaaaaaga 37982036  T
111 tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 210  Q
    |||||| ||| | ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| | || || ||  ||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
37982035 tgtttgcttaacattataatatttatgggaaccataaaaatagggattataacaagt-aattacatataaatttattctcattttcataggaactttatt 37981937  T
211 ctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaac 293  Q
      |||||||||||||  ||  ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||  |||| |||||| ||||||||| |||||||    
37981936 tccacccttttcctt--gatttttttttaattcccaagaacgttttatatccaagaat-aaattttgtaaacttgaaacaaac 37981857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 205 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40197232 - 40197081
Alignment:
205 tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    ||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
40197232 tttattcccacctttttccttgaaattttttttctattcccagaaacattttatatcaaagaataaattttagtaaacttataacaaacataaacatata 40197133  T
305 cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 356  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
40197132 catttctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 40197081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33533743 - 33533585
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  | |||     
33533743 taagggtgtgtttgtttcaagtttgtcaaatttattcctaggaatattattcctttgaatataaagatgtgaattttattccaatgtatttagaataaag 33533644  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta 168  Q
    ||||||| ||| | |||| ||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
33533643 atgtttgattaacattatgatattctcaagaaccttaaaaataggaattataataggta 33533585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 12649859 - 12650137
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt--aagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| || |||| |||||||||| |||   ||||  || ||||| ||    
12649859 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctacgaataacaatccttgtaatacaatgatgtgaattttatttcaaattatttaaaaaaaaaagat 12649958  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||| ||| | ||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||||| |  ||  | ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
12649959 gtttgattaacattataatattcttaggaacttaaaaaatagagattataataggt-agttacatgtgaatttattttcattttcatgggaactttattc 12650057  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaa 292  Q
     |||  ||||| ||| | ||  ||||||||| ||| ||| ||||||||| | | ||||||||||| ||| |||||||||||    
12650058 ccactattttctttgcgtaa-attttctatttccatgaatattttatacacagaaataaaatttaataatcttgtaacaaa 12650137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 25899381 - 25899532
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||  ||||| ||    
25899381 agggtgtgtttgtttcaagtgtaacaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattctaaggtatttagaaaaaagat 25899480  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag 165  Q
    ||||||||  | |||||  ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||    
25899481 gtttggttgacattata--attccaaggaaccttaaaaatatggaatataatag 25899532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 359
Target Start/End: Original strand, 25899548 - 25899701
Alignment:
205 tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
25899548 tttattctcaccattttctttggaaaaacttttctattccgaggaacattt-atacccggaaataaaatttaataaacttgcaacaaacatagacacatg 25899646  T
305 cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||   || ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
25899647 catttttatgattttattcccaggaatctacaaatataatttgaaacaaacacac 25899701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Original strand, 38437377 - 38437519
Alignment:
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |    
38437377 cacccttttctttgggaaaaattttctattctcaggaacgttttatacccgaaaataaaattttgtaaacttgtaacaaacatagatatatgtattccta 38437476  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    || |||||||  | |||||  |||| |||||||| ||||||||    
38437477 tcgttttattttcaggaatatacaaatataacttaaaacaaac 38437519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14764111 - 14763969
Alignment:
180 aatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta 279  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |||  |  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
14764111 aatttattatcatcttcatgtgaactttattcccacctttttcattga-attttttttctattctcatgaacattttatacccgtgaataaaatttagta 14764013  T
280 aacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattc 323  Q
    |||||| ||||||||||  ||| || ||| | ||||||||||||    
14764012 aacttgaaacaaacatatgcatgtatatttctatcattttattc 14763969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 35394076 - 35394139
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatat 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
35394076 attaagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcttagtaataacattctttggaatat 35394139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 34672083 - 34672207
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatat--aaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||  |||||||  |||||||| | ||||  ||||  ||||||    
34672083 agggtgtgtttgttttaagtttatcaaatttatttttagaaataacagtccttgaaatataaaaagatggaaattttatactaaggtttttagaaaaaat 34672182  T
110 atgtttggttagctttataatattc 134  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
34672183 atttttggttaactttataatattc 34672207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Original strand, 38437203 - 38437353
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||  ||||| |||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||    
38437203 gtgtgtttgtttcaagtttattaaattcattcttaaaaataatattttttt-aatataaggatgagaattttattccaagatatttagaaaaaagatgtt 38437301  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagg 166  Q
    || ||| |  || | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
38437302 tgtttaacactacagtatttctgggaaccataaaaataggaattataatagg 38437353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 37124073 - 37124194
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatt--taagaaaaatat 111  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   || ||||| ||    
37124073 ggtgtgtttattttaagtttatcaaatttattgttaaaaataacaatatttggaatataaagatgagaattttatt-caaggtattcaaaaaaaaaaaat 37124171  T
112 gtttggttagctttataatattc 134  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
37124172 gtttcgttaactttataatattc 37124194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 359
Target Start/End: Original strand, 34672289 - 34672403
Alignment:
245 caggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataac 344  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||  ||  |||||| |||   |||||||||||  | ||||||||||| || |||    
34672289 caggaacattttatatctgagaataaaatttattaaacttgtaataaatgtaagcatatatatttttatcattttattttcaggaatcaacaaatacaac 34672388  T
345 ttgaaacaaacacac 359  Q
    || ||||||||||||    
34672389 ttcaaacaaacacac 34672403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 41229017 - 41228976
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaat 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
41229017 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattccaaggaat 41228976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 359
Target Start/End: Original strand, 8635664 - 8635703
Alignment:
320 attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8635664 attcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 8635703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32901858 - 32901787
Alignment:
224 ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||  ||||||||| |||||||||    
32901858 ttgggaaaattttcctattcccagaaacattttata-ccatgaataaatttttttaaacttgtgacaaacata 32901787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 81)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 46666431 - 46666778
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
46666431 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatat 46666530  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46666531 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 46666630  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
46666631 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcca 46666730  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46666731 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 46666778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20260434 - 20260088
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
20260434 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaagaaatttaggaaaaatatg 20260335  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
20260334 tttgcttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcc 20260235  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
20260234 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaa 20260135  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
20260134 tcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 20260088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 9115561 - 9115907
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
9115561 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatg 9115660  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
9115661 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcc 9115760  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
9115761 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttcta 9115860  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9115861 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 9115907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 52630494 - 52630843
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
52630494 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 52630593  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
52630594 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat 52630693  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52630694 tcccacccttttctttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 52630793  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
52630794 ctatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 52630843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 14788442 - 14788793
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||    
14788442 attaagggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttatttcaaggaatttaggcaaa 14788541  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14788542 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 14788641  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14788642 attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaatataatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 14788741  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
14788742 tcctattattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac 14788793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 25789487 - 25789833
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
25789487 gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatg 25789586  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
25789587 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcc 25789686  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
25789687 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttcta 25789786  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25789787 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 25789833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 8331735 - 8332084
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
8331735 taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaagaatttaggaaaaat 8331834  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
8331835 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat 8331934  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
8331935 tcccacccttttccttgaaattttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgcaacaaacataggcatatacattc 8332034  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
8332035 caatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 8332084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9832216 - 9831871
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9832216 gtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattcctcggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 9832117  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
9832116 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccca 9832017  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
9832016 cccttttccttgggaaaatttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatc 9831917  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca 360  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9831916 attttattcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca 9831871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 2430223 - 2430566
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
2430223 gtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacgttccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaattatgtt 2430322  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
2430323 tggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataagtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccca 2430421  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
2430422 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatc 2430521  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2430522 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 2430566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Original strand, 36361506 - 36361851
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
36361506 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaaaatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 36361605  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
36361606 gtttggttagctttataatattcctatgaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttactctcatctccatgggaactttattc 36361705  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
36361706 -cccccttttccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 36361804  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36361805 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 36361851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 39930181 - 39930527
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
39930181 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattctttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 39930280  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
39930281 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattcc 39930380  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
39930381 cacccttttccttggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttcta 39930480  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39930481 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 39930527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12190528 - 12190179
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
12190528 taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaagaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 12190429  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
12190428 atgtttggttagctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttat 12190329  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
12190328 tcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatgtacattc 12190229  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
12190228 ctatcattttattcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 12190179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 32824644 - 32824992
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
32824644 agggtgtgtttgtttcaaatttacgaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 32824743  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
32824744 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattc 32824843  T
212 tcacccttttcc-ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc 310  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
32824844 ccacccttttcctttgggaaattttttctattcccaggaacaatttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcc 32824943  T
311 aatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
32824944 tattattttatttccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 32824992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 6911208 - 6911563
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
6911208 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatat 6911307  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
6911308 gtttggttagctttttaatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattc 6911407  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaa--------cattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat 303  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
6911408 ccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatat 6911507  T
304 acattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
6911508 acattcttatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 6911563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1597694 - 1597344
Alignment:
9 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
1597694 ttaaaggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaa 1597595  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
1597594 tatgtttggttaactttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaacttta 1597495  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
1597494 ttcccaccctttttcttggaaaaatttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatt 1597395  T
309 ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
1597394 cctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 1597344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51445424 - 51445083
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
51445424 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatatatagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgttt 51445325  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
51445324 ggttacctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccac 51445225  T
216 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||    
51445224 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttata-ctaagaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacatttatatca 51445126  T
316 ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51445125 ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 51445083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Original strand, 39329347 - 39329678
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||              ||||||||||||||  ||||||||||    
39329347 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaataaaa--------------ttccaaggaatttagaaaaaatatgt 39329432  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
39329433 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 39329532  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39329533 accctttttcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 39329632  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39329633 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 39329678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 2632576 - 2632922
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||    
2632576 agggtgtatttgtttcaagtttactaaatttatttctaggaataacattccttagaatataaatatgggaattttattccagcgaatttaggaaaaatat 2632675  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
2632676 gtttggttaactttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgggaactttattc 2632775  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
2632776 -caccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 2632874  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2632875 attattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 2632922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50191113 - 50190767
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
50191113 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttagaatataaagatgagaattttatttcgaggaatttaggaaaaatat 50191014  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
50191013 gtttgattagctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatt-ccatcttcatgggaactttattc 50190915  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
50190914 ccacctttttccttgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtaggcatatacattcct 50190815  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
50190814 agcattttatttccggaaattaacaattatatcttgaaacaaacacac 50190767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38965027 - 38964683
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||     
38965027 gggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaatatatc 38964928  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
38964927 tttggatagctttataatattcctaataaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattccaatctccatgggaactttattcc 38964828  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |    
38964827 caccctttctcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaatttttgtaaacttgtaacaaacataagcatatacatttcta 38964728  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38964727 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 38964683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3572841 - 3572567
Alignment:
85 ttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaattt 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3572841 ttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaattt 3572742  T
185 attcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaactt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
3572741 attcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaactt 3572642  T
285 gtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3572641 gtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 3572567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5806625 - 5806293
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
5806625 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 5806526  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       
5806525 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatttccatctccatgggaacttta--- 5806429  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    || |||||||||| |     
5806428 --------ttccttggaaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaa----aggcatatacatttct 5806341  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5806340 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 5806293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5518852 - 5518506
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
5518852 agggtctgtttgtttgaagtttaccaaatttattcattggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttaggaaaaatat 5518753  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
5518752 gttcggttaactttataacattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa-ctatatataaatttattctcatctccatgggaactttattc 5518654  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |     
5518653 ccacctttttccttgggaaaatttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttct 5518554  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
5518553 atcattttattcctgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 5518506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4683718 - 4683376
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
4683718 tgtgattgtttcaagtttatcaaatttatttctaagaataacattttttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgttt 4683619  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
4683618 ggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgggaactttattc-ccc 4683520  T
216 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca 315  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
4683519 ccttttttttgggaaattttttctattcctaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaatttgtaacaaacataggcatatacattcctatca 4683420  T
316 ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
4683419 ttttatttctgggaatcaacaattataaattgaaacaaagacac 4683376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 35187181 - 35187526
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaa-gtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||| ||||||    
35187181 gtgtgtttgtttcaaagtttaccaaatttattcttaggaataatatttcttgaaatataaagatggaaattttattctaaagaatttaggaaatatatgt 35187280  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |    
35187281 ttggttagttttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaacttattcttatctccatgggaactttattccc 35187380  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
35187381 acccttctccttgggaaattttttctattcccacgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctat 35187480  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
35187481 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaaaaaacacac 35187526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48916368 - 48916024
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaatatgt 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
48916368 gtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcttaggaataacattccttagaatataaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaaatatgt 48916269  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
48916268 ttggttaactttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggcaa-ctacatatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 48916170  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
48916169 atccttatctttgggaaattttttctattcccatgaacattttatacccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctat 48916070  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
48916069 cattttattctctggaatcaacaaatataacttgaaataaacacac 48916024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 13653581 - 13653917
Alignment:
19 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaatttt-attccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||   ||||||||||||||    
13653581 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaatttttatttcaaggtatttggaaaaaatatgtttgg 13653680  T
118 ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccc 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
13653681 ttaactttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaa-ctacatatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacca 13653779  T
218 ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatt 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||    
13653780 ttttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtatacatatatatttctatcatt 13653879  T
318 ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
13653880 ttattctcaggaatcaacaaatttaacttgaaacaaac 13653917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 69 - 359
Target Start/End: Original strand, 6978550 - 6978840
Alignment:
69 tataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
6978550 tataaagatgagaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggta 6978649  T
169 aactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaat 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||    
6978650 aactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattccctgaaacattttatacgaaggaat 6978749  T
269 aaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6978750 aaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 6978840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32202660 - 32202333
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
32202660 ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgt 32202561  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
32202560 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 32202461  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||| |||||||                   |||||||||| | ||    
32202460 acccttttccttgggaaattttttctattcccataaacattttataccaaggattaaattttagta------------------gcatatacatttctat 32202379  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32202378 cattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 32202333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 37436966 - 37436630
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||  |||| |||||||||||    
37436966 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaagaataacattccttggaatataaatatggaaattttatttcaaggtgtttaggaaaaatatgt 37436867  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
37436866 ttggttaactttataatattcttaggaaccataaaaataaggattataatagat-aactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattctc 37436768  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
37436767 acccttttctttgggaaa-attttctattctcagtaacattttatatccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatacattcctat 37436669  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaaca 352  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||    
37436668 cattttattctcgtgaatcaacaaatataacatgaaaca 37436630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 27 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 52699799 - 52699472
Alignment:
27 caagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagcttta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||| | |||    
52699799 caagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaataagtttgcttaacatta 52699700  T
127 taatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttg 226  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
52699699 taatattcctgggaaccatgaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttctttg 52699601  T
227 ggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccg 326  Q
    |||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||     
52699600 ggaaaaatgttctattcccaggaacgttttatacccgggaataaaattcagtaaacttgtaacaaacataggcatgtgtattcctatcattttattccca 52699501  T
327 ggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||    
52699500 ggaatctacgaatataacttgaaacaaac 52699472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 29091395 - 29091736
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||    
29091395 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttaaaatataaagatgggaattttattccaaggtatttataaaaaatat 29091494  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||     ||||||||||||||||||||    
29091495 gtttggttaactttataatattactaggaaccataaaaatagggtttataataggt-aactatgtgtaaatttat-----tctccatgggaactttattc 29091588  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       
29091589 ccacctttttttttgggaaattttttctattccgatgaacattttttactcgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatatattttt 29091688  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
29091689 atcattttattatcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 29091736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 49823203 - 49822919
Alignment:
54 taacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatag 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
49823203 taacattccttggaatataaagatgggaattttattccatggaatttagaaaaaatatgtttggttaggtttataatattcctaggaaccataaaaatag 49823104  T
154 ggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacat 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||          
49823103 ggattataataggtaaattatttatgaatttattatcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattctcag------ 49823010  T
254 tttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaa 353  Q
                   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
49823009 ---------------aaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaa 49822925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 47031582 - 47031758
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
47031582 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 47031681  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47031682 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc 47031758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Original strand, 47037324 - 47037527
Alignment:
156 attataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47037324 attataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattt 47037423  T
256 tatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47037424 tataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 47037523  T
356 acac 359  Q
    ||||    
47037524 acac 47037527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 308
Target Start/End: Original strand, 46960347 - 46960646
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||    
46960347 attaagggtgtgtttgtttcaaatttatcaaatttattcctaggaataacattctttggaatataaagatgagaaatttattccaagatatttagaaaaa 46960446  T
107 aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 206  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||   |  | ||||||  ||||| |||||||||||    
46960447 aagatgtttggttaacattataatattccaatgaaccttaaaaatagagtttataataggt-aattacacacaattttatt-tcatcttcatgggaactt 46960544  T
207 tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca 306  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
46960545 tattcccacccttttcattgggaaaacttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatgca 46960644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 47677368 - 47677712
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
47677368 gggtgtgtttatttaaagtttatgaaatttattcttaggaataaaatttcttggaatataaagatgagaattttattccaagatatttaaaaaaaatatg 47677467  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||   || | ||||||||||||| ||||||||||||||||     
47677468 tttggttaactttgtaatattctaaggaaccttaaaaatagggattataatatgt-aattacacataattttattcccatcttcatgggaactttattcc 47677566  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    || ||||| | ||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||  |||   |    
47677567 catcctttcctttgggaaaacttttctattcaatggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaatttataacaaacacaaacatatgtattttta 47677666  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||    
47677667 tgattttattccc-ggaatccacaaatataacgggaaacaaacacac 47677712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24116683 - 24116339
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| ||    
24116683 agggtgtgtttgttttaagtttaacaaatttattcttaagaataacattccttagaatataaagatgagaattttatttcaaggtatatagaaaaaagat 24116584  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||| ||| | ||| ||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||| || ||   || ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
24116583 gtttgcttaacattaaaatatttttggaaaccataaaaataggaattataataggt-aattacacataaatatattctcatcttcatgggagctttattc 24116485  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     | |||||||| ||||||| | |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |     
24116484 cctcccttttctttgggaattcttttttatttacaggaacgttttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtgacaaacataaacatat--atttct 24116387  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||| |||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
24116386 atcgttttattctcaggaatctacaaatataacctgaaacaaacacac 24116339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1228225 - 1227936
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt--aagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
1228225 gtgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttctatgaataaccttccttggaatataaagatgagaattttattccaaagaatttagaaaaaaaatatg 1228126  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |  || | |||||||  |||| ||||||||||||||||     
1228125 tttggtgaactttataatatttcaaggaaccttaaaaatagggattataataggt-aattctacataattttattctaatcttcatgggaactttattcc 1228027  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat 303  Q
    |  ||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
1228026 cgaccttttctttcggaaatcttttctattccaagaaacattttatacctgaaaataaaatttaataaacttgtaacaagcataggcatat 1227936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 355
Target Start/End: Original strand, 30240782 - 30241075
Alignment:
58 attccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggat 157  Q
    |||||||| |||||||| |||  |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
30240782 attccttgaaatataaaaatggaaattttattccaaata-tttaa-aaaaatatgtttggttaactttataatattcctaagaaccataaaagtagggat 30240879  T
158 tataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatttta 257  Q
    ||||||||||||  ||  ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||    
30240880 tataataggtaat-tacatataaatttattctcatcttcatgagaactttattctcactcttttctttgggaatttttttctattcccaataacttttta 30240978  T
258 tacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||    
30240979 ttcc-gggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttattaccaaaaatcaacaaatataacttgaaacaaac 30241075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 38519405 - 38519127
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||    
38519405 tgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattcgtaggaataacattttttggaacataaaaatgaaaattttattccaatgtatttagaaaaaagatgttt 38519306  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc-a 214  Q
    | ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||| |  | |||||||||||||||| | |    
38519305 gtttaacattataatattcttggaaaccataaaaatagggattataataggtaatttatacatgaattt-ttcctaatttcatgggaactttattcccaa 38519207  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
     ||||||| |||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38519206 accttttctttgggaaaatttttc--ttcccaaaaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 38519127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 205 - 359
Target Start/End: Original strand, 1007663 - 1007817
Alignment:
205 tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
1007663 tttattctcaccctttttcttggtaaaatttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacctagacatata 1007762  T
305 cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
1007763 tattcatatcattttattctcgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 1007817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Original strand, 25473977 - 25474107
Alignment:
11 aagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
25473977 aagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaagaatttaggaaaaata 25474076  T
111 tgtttggttagctttataatattcctaggaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
25474077 tgtttggttagctttataatattccaaggaa 25474107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17475659 - 17475326
Alignment:
11 aagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaat 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||| | |||||     
17475659 aagggtgtgttcgtttcaagtttatcaaatttattcctaagaataacattctatggaaaataaaaatggaaattttattccaaggtatttagaaaaaaag 17475560  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||| ||| | |||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||        || || ||     |||||| ||||||||| || ||||||||||    
17475559 atgtttgcttaacattatgatattcccgggaactataaaaataggtatt--------tacacaat-----aatttactcccatctctattggaactttat 17475473  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
17475472 tcccactcttttctttgggaaattttatttattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataacaaacataaacatatatattt 17475373  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 356  Q
    | ||| |||||||  |||||| | |  | ||||||||| ||||||||    
17475372 ctatcgttttattttcgggaacctatgaatataacttgtaacaaaca 17475326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31807093 - 31806759
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||    
31807093 gtgtgtttatttcaagttgatcaaatttatttctaagaataatatttcttggaacataaagatgaaaattttattctaaggtatttagaaaaaatatgtt 31806994  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    || ||| | ||||||||||    ||||||||||||||      |||||||| |||  ||   |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||    
31806993 tgcttaacattataatatttgcgggaaccataaaaat------tataatagataat-tacacatgaatttgttctcatcttcatgggaactttatttcca 31806901  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| || ||| | |||    
31806900 cccttttatttgggaatttttttctattcccaggaacgttttatgttcgagaataaaatttagtaaac--gtaacaaacataagcatgtatatttctatc 31806803  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
31806802 attttattctcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacaca 31806759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 48462258 - 48462475
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||    
48462258 gtgtatttgttttaagtttatcaaatttatttttatgaataacattctttggagtataaagatgagaattatattccaaata-tttagaaaaaatatgtt 48462356  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||    
48462357 tggttaactttataatatttgtaggaaccataaaaataaggattataataggt-aactatttatgaatttattcccaattccatgggaactttataccca 48462455  T
215 cccttttccttgggaaatttt 235  Q
     |||||| ||| |||||||||    
48462456 tcctttt-cttcggaaatttt 48462475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9011511 - 9011167
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt---aagaaaaa 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||| || | ||||   || |||||    
9011511 agggtgtgtttgttttaagtttatcaaatttatttttaggaataatattcctcggaacataaagatgaaaattttcttctaaagtatttagaaaaaaaaa 9011412  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||||| |  ||||| |||||| | ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
9011411 aatgtttgcttaacattataatattcctggagaccat-aaaataagaattataatagg-aaattactcatgaatttattcccaccactatgggaacttta 9011314  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattccca-ggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    |||  ||||||||| ||||||||  ||||| |||| || | ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
9011313 ttccgacccttttctttgggaaaaattttcgattctcacgaaaccttttata-ccgaaaataaaatttagtaaacttgtaataaacatagacatgtatat 9011215  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    ||| |||||||||||  |  ||||| || | |||||||||||||||||    
9011214 tcctatcattttattttcaagaatctacgaatataacttgaaacaaac 9011167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13932218 - 13931886
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta--agaaaaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||| ||||| ||| |  | |||||||||    
13932218 gtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttcaaggaataacattcattgaaatataaagatggaaactttatttcaaggtattcagaaaaaaaatatg 13932119  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    ||||||||  |||||| |||     |||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||   || | ||||||      | |||||||| |||||||     
13932118 tttggttaattttatagtat-----ggaaccttaaaaatagg-attataataggtaat-tacacataattttatt------ttcatgggaaatttattcc 13932032  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||   |    
13932031 cacccttttctttaggaaaacatttctattcc-aggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatgtattttta 13931933  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||||  |||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
13931932 tgattttattcctaggaatctacaaatataacttcaaacaaacacac 13931886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 11014626 - 11014448
Alignment:
176 tatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||| || | || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||    
11014626 tatgaatttattctcatcttcatgagaactttatttccacccttttcttttgaaatttttttctattcccagaaacattttatatccgtgaatataattt 11014527  T
276 agtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa 354  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
11014526 attaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattcccaggaatctacatatataacttgaaacaaa 11014448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 13521053 - 13521390
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg 117  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||  |||||  ||||| |    
13521053 tgtttgatttaagtttaccaaatttattcttaaaaataacattcactagaatataaagatgtgaattttatttcaagta-tttagaaaaaaggtgtttcg 13521151  T
118 ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccc 217  Q
    | | |  |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||  ||   ||    ||| ||||||| |||||   ||| |||||||||  |||||    
13521152 tgaacactataatattccccggaaccttaagaatagggattataataaatagt-tacacctga-tttattctcatctttctggaaactttatttccaccc 13521249  T
218 ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatt 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||    
13521250 ttttctttgggaaattttttctattcccaagaacattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacagacatgtatatttctatcatt 13521349  T
318 ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     || ||||   |||| |||| ||||| | |||||||||||||    
13521350 gta-tcccaaaaatctacaaatataattagaaacaaacacac 13521390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19083285 - 19083107
Alignment:
181 atttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaa 280  Q
    |||||||| ||| | | ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
19083285 atttattctcatatgcctggaaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaa 19083186  T
281 acttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||   |||| || | ||||| |||||||||||||||    
19083185 acttataacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataatttgaaacaaacacac 19083107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19131173 - 19130995
Alignment:
181 atttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaa 280  Q
    |||||||| ||| | | ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
19131173 atttattctcatatgcctggaaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaa 19131074  T
281 acttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||   |||| || | ||||| |||||||||||||||    
19131073 acttataacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataatttgaaacaaacacac 19130995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 29769230 - 29769526
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctagg-----aataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta--agaaaa 107  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||       |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||  ||||||    
29769230 gtgtgtttgttttaagtttactaaatttattcttatatgaataataacattctttggaatataaagatgtgaattttatttcaagatatttagaagaaaa 29769329  T
108 ata-tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 206  Q
    | | ||||| |||| | |||||||||| | ||||||| || ||| |  |||||||||||||||  ||   |||||||||||  ||||| ||||| |||||    
29769330 aaaatgtttagttaacattataatatttcaaggaaccttagaaacatagattataataggtaat-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactt 29769428  T
207 tattctcacccttttccttg-ggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat 303  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| || ||||||| |||||||||||||||  |   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
29769429 tattcccaccctttttctttaggaaaattgttctattgccaggaacattttatgtcaaagaataaaatttagtaattttgtaacaaacatagacatat 29769526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20505213 - 20504995
Alignment:
139 gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   ||   |||||||||||  ||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||     
20505213 gaaccataaaaatagggattataatatgtagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaagctttattttcacctttttctttggtaatttttttt 20505115  T
239 t---attcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaac 335  Q
    |   ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| | | |||| ||    
20505114 tcttattcccaggaatattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattctcagaaatctac 20505015  T
336 aattataacttgaaacaaac 355  Q
    || ||||| || ||||||||    
20505014 aaatataatttaaaacaaac 20504995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 49627295 - 49627454
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaaga-aaaa 108  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |  | |||||| | ||||    
49627295 taaggatgtgtttgtttcaaatttaccaaatttatttttaagaataacatttcttggaatataaagatgggaattttattgtagagtatttaaaagaaaa 49627394  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta 168  Q
     ||||||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||    
49627395 aatgtttggttaacattataatatttcaaagaaccataaaaatatggattataataggta 49627454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 3939220 - 3939486
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||  |||  |||||| ||||    
3939220 attatgggtgtgtttgttttaagtttatcaaatatatttttaggaataacattctttggaatataaaaaagtgaattttattttaagatatttaaaaaaa 3939319  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    | ||||||| ||| | ||||||||||   ||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||  |||| |||||     
3939320 acatgtttgattaacattataatattttaaggaa-cttaaaaatatagattataataggt-aaccatgtatgaatttattctcatcttaatggaaacttg 3939417  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttag 277  Q
    ||||  || ||||| ||| |||| |||||||||||||||  || |||| ||  || ||||||||||||||    
3939418 attcctacactttt-ctttggaatttttttctattcccaataatatttcatttccaggaataaaatttag 3939486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 188
Target Start/End: Original strand, 1007566 - 1007669
Alignment:
84 tttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatt 183  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
1007566 tttattccaaagtatttaggaaaaatatgtttgattaactttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataggt-aactatttatgaatt 1007664  T
184 tattc 188  Q
    |||||    
1007665 tattc 1007669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 235 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 52186172 - 52186049
Alignment:
235 tttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaa 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||    | ||||||    
52186172 tttctattcccagaaacattttatcgtcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatatagacatatatatttctatcattttattataagaaatcaa 52186073  T
335 caattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
52186072 caaatataacttgaaacaaacaca 52186049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 325
Target Start/End: Original strand, 13440230 - 13440431
Alignment:
124 ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcc 223  Q
    ||||||||||||  |||||  ||| |||| |||||||||||||||   ||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||     
13440230 ttataatattccatggaactttaagaatatggattataataggtagt-tacatatgaatttattctcatcttcatggaaactttatttccacccttttct 13440328  T
224 ttgggaaatttt-ttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt 322  Q
    |||| |  |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| || ||| | |||||| ||||    
13440329 ttggaatttttttttctattctcaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaaaattctaacaaacatagtcatttatatttctatcattgtatt 13440428  T
323 ccc 325  Q
    |||    
13440429 ccc 13440431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 37261540 - 37261699
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  ||  |||||  |||||     
37261540 taaggatgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttatgattaacattcattggaatataaatatgtgaattttattcttagatatttagaaaaaag 37261639  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa 169  Q
    |||||||||||   |||||||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
37261640 atgtttggttaatattataatattccaaagaacgttaaaaatatggattataataggtaa 37261699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 45771815 - 45771937
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt--aagaaaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||     
45771815 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcccatgaataacctttcttggaacataaaggtgagaattttattccaaggtatttagaaaaaaaag 45771914  T
110 atgtttggttagctttataatat 132  Q
    ||||||| ||| | |||||||||    
45771915 atgtttgtttaacattataatat 45771937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19923810 - 19923603
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||  ||||||||||    
19923810 ggtgtgtttgttttaagttcatcaaatttatttttagaaataacatttcttagaacataaagatgagaattttattctaagatatttagaaaaaatatgt 19923711  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||| ||| | ||||||| ||  |  |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||| |||| |||| ||||  ||||||| ||||    
19923710 ttgtttaacattataatgtttttgagaaccaaaaaagtagggattataataggt-aattacacatgaatttgttccaatcttcatgaaaactttactctc 19923612  T
214 acccttttc 222  Q
    ||| |||||    
19923611 accattttc 19923603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 52186344 - 52186265
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaa 93  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52186344 ggtgtatttgttttaagtttaccaaatttattttaaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaa 52186265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 355
Target Start/End: Original strand, 37261734 - 37261913
Alignment:
176 tatgaatttattcccatctccatgggaacttt-attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatt 274  Q
    |||||||||||||  |||| | || ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||  | ||||||||||||    
37261734 tatgaatttattcatatcttcgtgagaacttttattctcaaccttttttttgggaaattttttctattcccaaaaagattttatgtc-gggaataaaatt 37261832  T
275 tagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    || |||||||||||||||||||  ||| || ||| | || ||||||||| | |||||| |  | ||||| |||||||||||    
37261833 taataaacttgtaacaaacatatgcatgtatatttctataattttattctcaggaatctatgaatataatttgaaacaaac 37261913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Original strand, 37726805 - 37726859
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttgg 66  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
37726805 agggtgtgtttgtttcaagttcactaaatttattcctaggaataacattccttgg 37726859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 45813727 - 45813603
Alignment:
28 aagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||  ||||| || ||| ||||   ||||    
45813727 aagtttatcaaatttattcttaggaataacattcattgaaatataaagatgtgaattttattttaaggtatttagaaaaaagatattttgttaagattat 45813628  T
128 aatattcctaggaaccataaaaata 152  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||    
45813627 aatattccaaagaaccttaagaata 45813603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 359
Target Start/End: Original strand, 19094020 - 19094183
Alignment:
196 catgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat 295  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||  || ||  |||  ||||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
19094020 catgggaactttattcccacagttttctttgggaatgttatttcattatcaggaacattttatatctagaaataaaatttaataaacttgcaacaaacat 19094119  T
296 agacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||  ||  | ||| | |||||| |||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||    
19094120 aggaatgcatatttccatcattctatttccaggaatttacaaatataacttgaaacaaacacac 19094183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37336699 - 37336514
Alignment:
105 aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaac 204  Q
    |||| ||||||||||| | || |||||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||| |  || | ||  |||    
37336699 aaaacatgtttggttaacattttaatattttaagaaaccataaaaatagagattataataggtaat-tatacatgaatttattctctccttcgtgaaaac 37336601  T
205 tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaa 291  Q
    ||||||| ||| || ||| |||| ||    ||||||||||||  || |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
37336600 tttattcccactctattctttggaaagaaatttctattcccaataatattttatatctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaa 37336514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13048578 - 13048461
Alignment:
52 aataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaat 151  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||| ||| | | |||||||||  ||||||  |||||||    
13048578 aataacatttcttggaacataaagaaaggaattttatgctaaggtatttaaagaaaatatgtttgcttaacatgataatattctcaggaacactaaaaat 13048479  T
152 agggattataataggtaa 169  Q
    | ||||||||||||||||    
13048478 aaggattataataggtaa 13048461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13053575 - 13053458
Alignment:
52 aataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaat 151  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||| ||| | | |||||||||  ||||||  |||||||    
13053575 aataacatttcttggaacataaagaaaggaattttatgctaaggtatttaaagaaaatatgtttgcttaacatgataatattctcaggaacactaaaaat 13053476  T
152 agggattataataggtaa 169  Q
    | ||||||||||||||||    
13053475 aaggattataataggtaa 13053458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 49824067 - 49824022
Alignment:
17 gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattcc 62  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
49824067 gtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattcc 49824022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 52186262 - 52186170
Alignment:
127 taatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttt 220  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||||    
52186262 taatattcttagaaaccataaaaatagaaattataataggt-aactatgtagaaatttattcacatctcaatgtgaacttaattcccacccttt 52186170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33702524 - 33702381
Alignment:
180 aatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatttta-tacccgggaataaaatttagt 278  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| | || |||| | | |||   ||||||||||| |    
33702524 aatttattctcatcgtcatgggaattttattctcacctttttattcgggaaattttttctattccctgaaaaatttaattccccaaaaataaaatttaat 33702425  T
279 aaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt 322  Q
    ||| ||||||||||| ||   ||||| ||| | |||||||||||    
33702424 aaatttgtaacaaacttaagaatatatatttctatcattttatt 33702381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 44
Target Start/End: Original strand, 6978518 - 6978552
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttat 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6978518 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttat 6978552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 285
Target Start/End: Original strand, 11077963 - 11078051
Alignment:
197 atgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttg 285  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||    
11077963 atgggaactttatgttcaccttttttttttggaaaatttttctattcccaaaaacatgttatatccagaaataaaatttaataaacttg 11078051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 298
Target Start/End: Original strand, 37726920 - 37727033
Alignment:
181 atttattcccatctccatgggaactttattctcaccctttt--ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagt 278  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||| | ||| ||||     ||||||||||||    | ||||||||||||     
37726920 atttattcccatctc-atggaaactttactctcacccttttttctttgggaaaatatttgtatt-----gaacattttatatagagaaataaaatttaga 37727013  T
279 aaacttgtaacaaacataga 298  Q
    ||||||||||||||||||||    
37727014 aaacttgtaacaaacataga 37727033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 297
Target Start/End: Original strand, 52276877 - 52276926
Alignment:
246 aggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag 297  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
52276877 aggaacattttatatccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaatatag 52276926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 47
Target Start/End: Original strand, 1007539 - 1007573
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcc 47  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
1007539 gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcc 1007573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 296
Target Start/End: Original strand, 3939515 - 3939547
Alignment:
264 ggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
3939515 ggaataaaatttagcaaacttgtaacaaacata 3939547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16257189 - 16257010
Alignment:
180 aatttattcccatctccatgggaacttt-attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagt 278  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||  ||| |||||  ||||||  ||||||| |||| | |||  |||||||||   |||||||||||| |    
16257189 aatttatttccatcttcatggaaacttttattccaaccattttcgatgggaatatttttct-ttcctaagaatcttttatacctaagaataaaatttaat 16257091  T
279 aaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||| |||||| || || || |||   || ||||||||||  | |||  |||| |||||||| ||||||||||||    
16257090 aaacttgtaaaaaacattgaaatgtatatttttatgattttattccaagaaatatacaaatataacttcaaacaaacacac 16257010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 41967537 - 41967465
Alignment:
19 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattcc 91  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |  | |||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
41967537 gtttgtttcaagtttacaaaatataatattgggaataattttcctaggaatataaggatcagaattttattcc 41967465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35488542 - 35488191
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
35488542 attatgggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaa 35488443  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
35488442 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaacttt 35488343  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
35488342 attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat 35488243  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
35488242 tccaatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 35488191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 11329711 - 11330062
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
11329711 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaa 11329810  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11329811 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 11329910  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
11329911 attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat 11330010  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11330011 ttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 11330062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45265401 - 45265050
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
45265401 attaagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaa 45265302  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
45265301 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaacttt 45265202  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
45265201 attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttataacaaacataggcatatacat 45265102  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
45265101 tccaatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 45265050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 27248010 - 27248362
Alignment:
7 tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27248010 tattaaggatgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttagaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaa 27248109  T
107 aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27248110 aatatgtttggttagctttataatattcctatgaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 27248209  T
207 tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
27248210 tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagtaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca 27248309  T
307 ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27248310 ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 27248362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Original strand, 45045352 - 45045695
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
45045352 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataatattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgttt 45045451  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
45045452 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccac 45045551  T
216 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
45045552 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatca 45045651  T
316 ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
45045652 ttttattcccgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac 45045695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 33378554 - 33378911
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
33378554 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaat 33378653  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33378654 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 33378753  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaa--------cattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacat 301  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
33378754 tcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat 33378853  T
302 atacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33378854 atacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 33378911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 44565767 - 44566114
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
44565767 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 44565866  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
44565867 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 44565966  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
44565967 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacatagacatatacattcct 44566066  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
44566067 atcattttatttccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 44566114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27214203 - 27213857
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
27214203 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatg 27214104  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
27214103 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaacagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcc 27214004  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
27214003 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttcta 27213904  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27213903 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 27213857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Original strand, 48341086 - 48341430
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
48341086 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagagg-gaattttattccaaggaatttatgaaaaatat 48341184  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48341185 gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 48341284  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
48341285 ccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttata-ccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 48341383  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48341384 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 48341430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 43948965 - 43949314
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
43948965 taagggtgtatttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 43949064  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
43949065 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttat 43949164  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
43949165 tcccacccttttccttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattt 43949264  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43949265 ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 43949314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 48313842 - 48314191
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
48313842 taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacatttcttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaat 48313941  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
48313942 atgtttggttagctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttat 48314041  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
48314042 tcccaccattttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttctaacaaacataggcatatacattc 48314141  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48314142 ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 48314191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25924989 - 25924642
Alignment:
9 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
25924989 ttaagggtgtgtttgtttcatgtttaccaaatttattcctaagaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaa 25924890  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
25924889 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctctatgggaacttta 25924790  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
25924789 ttcccacccttttcctggggaaattttttctattcccaggaacattttatacaaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatt 25924690  T
309 ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 356  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25924689 tctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 25924642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9947342 - 9946992
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||    
9947342 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttgtaatataaagatgggaattttattccaaggaatgtagaaaaaaa 9947243  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
9947242 tatgtttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttaatctcatctccatgggaacttta 9947143  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
9947142 ttcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatt 9947043  T
309 ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
9947042 cctatcattttattcccgggaatcaaaaattataactttaaacaaacacac 9946992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 45448665 - 45449009
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
45448665 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctatgaataacattccttggaatataaagatgggaattttattctaaagaatttaggaaaaatatg 45448764  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
45448765 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataatagataaactatttatgaatttattcccctctctatgggaactttattcc 45448864  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
45448865 caccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatctacattccta 45448964  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
45448965 tcattttattcccgagaatcaaaaattataacttgaaacaaacac 45449009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34930814 - 34930467
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
34930814 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatatgt 34930715  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
34930714 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 34930615  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaac-aaacatagacatatacattccaa 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
34930614 accctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaaacataggcatatacatttcta 34930515  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataac-ttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
34930514 tcattttattcccaggaatcaacaattataactttgaaacaaacacac 34930467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38396714 - 38396370
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
38396714 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaatagcattcattggaatataa-gataggaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 38396616  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
38396615 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccgtgggaactttattc 38396516  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
38396515 ccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatatacattcct 38396416  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
38396415 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttggaacaaacac 38396370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28904539 - 28904188
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
28904539 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaa 28904440  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28904439 atatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 28904340  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    |||| ||||||||| |||   || |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28904339 attcccaccctttttcttataaatttttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 28904240  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
28904239 ttctatcattttattctcgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac 28904188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 50 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8419900 - 8419591
Alignment:
50 ggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8419900 ggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaa 8419801  T
150 atagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccagga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8419800 atagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagga 8419701  T
250 acattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaa 349  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8419700 acattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaa 8419601  T
350 acaaacacac 359  Q
    ||||||||||    
8419600 acaaacacac 8419591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27419571 - 27419226
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
27419571 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacatttcttggaatataaagatgggaattttattccaaagaatttagaaaaaatatgt 27419472  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
27419471 ttggttagctttataatattcctagggaccataaaaatagagattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 27419372  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
27419371 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctat 27419272  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
27419271 cattttattcccgggaatcagcaattataacttgaaacaaacacac 27419226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Original strand, 38543920 - 38544263
Alignment:
17 gtgtttgtttcaa-gtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
38543920 gtgtttgtttcaaagtttactaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaagaaatttaggaaaaatatgttt 38544019  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
38544020 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccac 38544119  T
216 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca 315  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
38544120 catttttcttgagaaattttttctattcccagaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacctgtaataaacataggcatatacattcctatca 38544219  T
316 ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38544220 ttttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 38544263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 25097796 - 25098138
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattcctt-ggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttg 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
25097796 tgtttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataatatttttttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttg 25097895  T
117 gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
25097896 gttagctttataatattcctaggaaccataaatatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc 25097995  T
217 cttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcat 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
25097996 cttttccttaggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatgggcatatacattcctatcat 25098095  T
317 tttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
25098096 tttattcccgaaaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac 25098138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 39553910 - 39554252
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa-tatgtttg 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
39553910 tgtttgtttgaagtttatcaaatttattcttagtaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaaatatttttg 39554009  T
117 gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
39554010 gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc 39554109  T
217 cttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
39554110 cttttccttgggaaattttttctattctcaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcat 39554209  T
317 tttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39554210 tttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 39554252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 58 - 359
Target Start/End: Original strand, 40212657 - 40212958
Alignment:
58 attccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggat 157  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40212657 attcctaggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggat 40212756  T
158 tataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatttta 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40212757 tataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacatttta 40212856  T
258 tacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
40212857 taccccggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgcgaatcaacaattataacttgaaacaaacac 40212956  T
358 ac 359  Q
    ||    
40212957 ac 40212958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 40 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9814535 - 9814220
Alignment:
40 tttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
9814535 tttattcctaggaataacatttcttggaatataaagatgacaattttattctaaggaatttaggaaaaatatgtttgattagctttataatattcctagg 9814436  T
140 aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttct 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
9814435 aaccataaaaatagagattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttct 9814336  T
240 attcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaatt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
9814335 attcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaac----acatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaatt 9814240  T
340 ataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||    
9814239 ataacttgaaacaaacacac 9814220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41632711 - 41632366
Alignment:
9 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
41632711 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattc-----aataacattcctttgaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaa 41632617  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
41632616 tatgtttggttagctttataatattcctatgaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaacttta 41632517  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
41632516 ttcccaccctttttcttgggaaattttttctattcctaagaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaataaacataggcatatacatt 41632417  T
309 ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
41632416 tctatcattttattctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 41632366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 360
Target Start/End: Original strand, 44819981 - 44820324
Alignment:
17 gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
44819981 gtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttaaaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatatttg 44820080  T
117 gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
44820081 gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggactataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc 44820180  T
217 cttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| | |||||    
44820181 cttttccttgggaaattttttctgttccgaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacatgtaacaaacacatacaaatacatttctatcat 44820280  T
317 tttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca 360  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
44820281 tttattcctgaaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca 44820324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48160926 - 48160593
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
48160926 attaggggtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaa 48160827  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48160826 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 48160727  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48160726 attcccaccattttcctt-ggaaattttttctcttccca-----------------ggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 48160645  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48160644 tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 48160593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37534447 - 37534102
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
37534447 tgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctagaaataacattccttggaatataaagatgagaattttatttcaaggtatttaggaaaaatatgttt 37534348  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
37534347 ggttaactttataatattcttaggaactataataatagggattataataagt-aactatttatgaatttattcacatctccatgggaactttattcccac 37534249  T
216 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||   || |    
37534248 ccttttccttgggaaattttttctattcccataaatattttatacccggaaataaaagttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatgtttttatga 37534149  T
316 ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacaag 362  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
37534148 ttttatttccaggaatctacaattataacatgaaacaaacacacaag 37534102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30686336 - 30685994
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
30686336 tgtgtttgttttaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgaaaattttattgcaaggtatttaggaaaaatatgttt 30686237  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
30686236 ggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagcgattataataagt-aactatttatgaatttattcccatctccctaggaactttattcccac 30686138  T
216 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca 315  Q
    | |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||   || |    
30686137 ctttttccttggaattttttttctattcccatgaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatgtttttatga 30686038  T
316 ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
30686037 ttttattccaacgaatctacaattataacttgaaacaaacacac 30685994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 122 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16825593 - 16825356
Alignment:
122 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctttt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
16825593 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 16825494  T
222 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttat 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
16825493 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 16825394  T
322 tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
16825393 tcctaggaattaacaattataacttgaaacaaacacac 16825356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 18823890 - 18824215
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
18823890 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattctaaggtatttaggaaaaatatgtttgg 18823989  T
118 ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccc 217  Q
    ||| |||||||||||||               ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
18823990 ttaactttataatattc---------------atagggattataataggtaat-tatttatgaatttattcccatctccatgg-aactttattcccacct 18824072  T
218 ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca-ttccaatcat 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || | |||||    
18824073 ttttccttgggaaaatttttctattcccaaaaacattttatacccgggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatatattttctatcat 18824172  T
317 tttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||    
18824173 tttattcccaaaaatcaacaaatacaacttgaaacaaacacac 18824215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6656819 - 6656476
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataa-cattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||    
6656819 gggtgtgtttctttcaagtttactaaatttattcttaggaataaacattccttggaatagaaatatgagaattttattccaaggtatttggaaaaaatat 6656720  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
6656719 gttttgttaactttataatatttctaagaaccaaaaaaatatagattataataggt-aactatttatgactttattcccatctccatgggaactttattc 6656621  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||   ||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||      
6656620 ccatatttttcattgggaaaacttttctattcccagaaacattttatactcgaaaat-aaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcat 6656522  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    |||| |||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||    
6656521 atca-tttatttccaaaaatcaacaaatataacttgaaacaaacaca 6656476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 45722876 - 45723169
Alignment:
7 tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaa 106  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||       ||    
45722876 tattaagggtgtctttatttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttgaaatataaagatggaaattttattcca--gaa-------aa 45722966  T
107 aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 206  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | |||||||||||    
45722967 aatatgtttaattaactttataatattcctagaaatcataaaaatatggattataataggtaa-ctatttatgaatttatttctattttcatgggaactt 45723065  T
207 tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca 306  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
45723066 tattcccaccatttttcttgggaaaatttttctattcccaagaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtgacaaacataggcatatata 45723165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31922077 - 31921811
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatg--agaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||  ||||    
31922077 taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattaccatgaataacattctttggaatataaatatgggagaattttattccaaggtatttagaaaaa 31921978  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
31921977 atatgtatggttaactttataatatttctaggaaccataaaaatagacattataatagg---actatatatgaatttattctcatctctatgggaacttt 31921881  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttag 277  Q
    |||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
31921880 attcccacccttttctttggaaatttttttctattcccacaaacattttatactcaggaataaaatttag 31921811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 139 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25045838 - 25045620
Alignment:
139 gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttc 238  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||    
25045838 gaaccatgaaaatatggattataatatgtaat-tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttacgaaaatttttc 25045740  T
239 tattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaat 338  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||     
25045739 tattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatatattcctatcttttta-tccccagaatcaacaaa 25045641  T
339 tataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||    
25045640 tataacttgaaacaaacacac 25045620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41684354 - 41684024
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||| || ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||| ||           |||||||||||    
41684354 tgtgtttgtttcatggttaccaaacttattcttatgaataacattatttgaaatataaatatgagaattt-attcgaa-----------aaaatatgttt 41684267  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
    |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||    
41684266 ggttaattttataatatttataggaaccataaaaatagagattataataggtaa-ctacatataaatttattttcatctccatgagaactttattcccac 41684168  T
216 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca 315  Q
     |||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||    
41684167 tcttttctttgggcaaaattttctattcccaagaacatcttatatccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatttctatca 41684068  T
316 ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
41684067 tattattctcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 41684024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 45440637 - 45440977
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||  ||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||    
45440637 gtgtgtttgtttca-gtttaccaaatttattcatagtaataacatttcttagaatata--gatgtaaattttattccaagatatttaa-aaaaagatgtt 45440732  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    || ||| | |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
45440733 tgattaacattataatattccaagtaaccttaaaactagggattataataggtaat-tatacatgatttttttcccatctccatgagaactttattccca 45440831  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata-cattccaat 313  Q
    |   |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||   ||   ||    
45440832 ctactttctttgggaaaatttttatattccgaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatgttttttat 45440931  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
45440932 gattttattcccaagaatctacaattataacttgaaacaaacacac 45440977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 359
Target Start/End: Original strand, 11000488 - 11000772
Alignment:
81 aattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaa-------ccataaaaatagggattataataggtaaacta 173  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||  | ||     
11000488 aattttattccaagatatttaagaaaa-tatgttaggttaactttataatattcctaagaagtaagaaccataaaaatagggattataataggcga-ctt 11000585  T
174 tttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaat 273  Q
      ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
11000586 catatgaatttattctcatatgcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaaatttttctattcccaagaatattttatacccgggaataaaat 11000685  T
274 ttagtaaacttgtaacaaacatagac-atatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||   ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
11000686 ttagtaaacttgtaacaaacataggctatatatatttatatcattttatttccaggaatcaacatatataacttgaaacaaacacac 11000772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40385974 - 40385692
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| || |    
40385974 ggtgtgtctctttcaagtgtatcaaatttattcttagtaataacattttttggaatataaagatgagaattttattttaaggtatttaaaaaaaagatat 40385875  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||   |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||| |    
40385874 ttggttaacattataatattcctaagaaccataaaaatatggattataataggt-agttacacatgagtttatttccatcttaatgggaactttattccc 40385776  T
214 acccttt-tccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    ||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
40385775 accatttctttttgggatattttttctattcccagaaacattttatagacaggaataaaattcagtaaacttctaacaaacata 40385692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5543479 - 5543191
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||    
5543479 agggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttctaagaatatcattatttgaaacataaagatgagaattttattc-aaggtatttagaaaaaagat 5543381  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
5543380 gtttgcttaacattataatgttcccgggaaccataaaaatatggattataataggtaat-tacacatgaatttgttcccatcttcatgggaactttattc 5543282  T
212 tcacccttttcctt-gggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacat 301  Q
     |||  |||| ||| ||||||   |||||||||||| |||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
5543281 ccactatttttctttgggaaaaaatttctattcccaagaaagttttatacgagagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacat 5543191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22156520 - 22156248
Alignment:
19 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggt 118  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || |||||| ||||||| |    
22156520 gtttgtttcaaatttatcaaatttatttttaggaataacattttttggaatataaagataagaattttattctaaggtatata-gaaaaaaatgtttgtt 22156422  T
119 tagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccct 218  Q
    || |  ||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||  |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||  |||||    
22156421 taacagtataatattcacgagaaccataaaaatatggattataatatgtaat-tacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctaccct 22156323  T
219 tttccttgggaaatttttt-ctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
22156322 tttctttgggaaatttttttctattcccaggaacgttttatacgcgggattaaaatttattaaacttgtaacaaa 22156248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22212435 - 22212163
Alignment:
19 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggt 118  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || |||||| ||||||| |    
22212435 gtttgtttcaaatttatcaaatttatttttaggaataacattttttggaatataaagataagaattttattctaaggtatata-gaaaaaaatgtttgtt 22212337  T
119 tagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccct 218  Q
    || |  ||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||  |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||  |||||    
22212336 taacagtataatattcacgagaaccataaaaatatggattataatatgtaat-tacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctaccct 22212238  T
219 tttccttgggaaatttttt-ctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
22212237 tttctttgggaaatttttttctattcccaggaacgttttatacgcgggattaaaatttattaaacttgtaacaaa 22212163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 126 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6656457 - 6656225
Alignment:
126 ataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcctt 225  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  ||    
6656457 ataatattcttaggaaccaaaaaaatacagattataataggtaa-ctatttatgattttattcccatctccatggaaactttatttccaccctttttatt 6656359  T
226 gggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattccc 325  Q
    ||||||  ||||||||| |||| || ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||    
6656358 gggaaaacttttctatttccagaaatattttatactcgaaaat-aaatttagtaaacttataacaaacataggtatatatattcatatcattttatttcc 6656260  T
326 gggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca 360  Q
       ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
6656259 aaaaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaca 6656225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43446229 - 43445890
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
43446229 gggtttgtttgtttaaagtgtaccaaattgatttctatgaataacatttatcggaatataaagataggaattttattttaaggtattta-gaaaaatatg 43446131  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||| | |||||||||||  | ||||  |||| ||||| | ||||||||||||  ||   || | ||||||| |||||||||| |||||||||||     
43446130 tttggttaacattataatattctaaagaacattaaagataggaaatataataggtaat-tacacataattttattctcatctccatgagaactttattcc 43446032  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||   |    
43446031 caccattttctttgggaaaacttttttattctcatgaacattttatattcgagaataaaatttagtaaacttataacaaatataggcatatacattttta 43445932  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa 354  Q
    | ||||||||| |  ||||| | || ||||||||||||||||    
43445931 taattttattcgcaagaatctataaatataacttgaaacaaa 43445890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 38529012 - 38528772
Alignment:
52 aataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaat 151  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||   |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||  || |||  |||||||    
38529012 aataacatttcttggaatataaaaatgtaaattttatttcaacttatttaaaaaaaa-atgtttggttaacattataatattctgagaaactttaaaaat 38528914  T
152 agggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaac 251  Q
    ||||||||||||| | ||  ||   || ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||  | |||| |||||||||||  |||    
38528913 agggattataatatgcaat-tacacataaatttattctcatcttcatgagaactttattctcacctttttctttg--atatttattctattcccaataac 38528817  T
252 attttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
38528816 attttatacccaagaataaaatctagtaaacttgtaacaaacata 38528772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17276510 - 17276355
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||  |||||     
17276510 taagggtgtgtttgtttcaattttacaaaatttatttctaggaataacattccttggaatatatagatgtaaattttattccaagatatttagaaaaaag 17276411  T
110 atgtttgg-ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata 164  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||    
17276410 atgtttggtttaacattataatattccaagaaaccttaaaaataaggattacaata 17276355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 31598449 - 31598598
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
31598449 tgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttttgggaataacatttcttggaatataaagataggaattttatttcaaggtatttaaaaaaaagatgttt 31598548  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatag 165  Q
    | ||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
31598549 gtttaacattataatatacctgggaatcataaaaataggatttataatag 31598598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47246366 - 47246070
Alignment:
58 attccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggga 156  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||||| | ||||| ||||||||| | | |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||    
47246366 attctttggaatataaa-atgtgaattttattcaaaagtatttagaaaaaaagatgtttggtcaacattataatactcctag--accttaaaaataggga 47246270  T
157 ttataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatttt 256  Q
    ||||||||| ||   ||   |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||   || | ||||| | |||||||||    
47246269 ttataatagatagtttacacatgaatttattctcatattcatgggaactttattctcacccttttcttttaaaaaaaatt-caattcctaagaacatttt 47246171  T
257 atacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc--aatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa 354  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |   ||||||||||| |   ||||| |||| ||||| ||||||||||    
47246170 atacctgagaataaaattcagtaaacttgtaacaaacatagaaatatatatttctatatcattttatttctaagaatctacaaatataatttgaaacaaa 47246071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43569966 - 43569773
Alignment:
81 aattttattccaaggaatttaagaaaaatat--gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttat 178  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
43569966 aattttattctaaggtatttaacaaaaatatatgtttgattaactttataatatttttagaaatcataaaaatagggattataatagataat-tatttat 43569868  T
179 gaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaat 273  Q
    |||||||||  ||||  |||| ||| ||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||    
43569867 gaatttatttacatcctcatgtgaattttattcccaccctttttcttaggtaaatttttatatttcgaagaatattttatacccgggaataaaat 43569773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16916236 - 16916182
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattcctt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16916236 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattcctt 16916182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10902779 - 10902689
Alignment:
232 ttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt 322  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||    
10902779 ttttttctattcccaaaaacattttatatccaaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttatt 10902689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10902971 - 10902822
Alignment:
62 cttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattata 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||| | || |||    
10902971 cttgggatataaagatgtgaattttagcccaaggtatttatgaaaaagatgtttggttaacattataatattcattggaaccttaaaaatatgaatcata 10902872  T
162 ataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||| |   ||   |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
10902871 ataggcagtttacacatgaatttattctcatcttcatgtgaactttattc 10902822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 359
Target Start/End: Original strand, 45723211 - 45723276
Alignment:
294 atagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
45723211 ataggcatatatattcctatcattttattctcgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 45723276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 55
Target Start/End: Original strand, 40212626 - 40212669
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaata 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40212626 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaata 40212669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 323
Target Start/End: Original strand, 30871130 - 30871221
Alignment:
232 ttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattc 323  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || || ||| | ||||||||||||    
30871130 ttttttctattcccacaaacatttgatatccgaaaataaaacttaataaacttgtaacaaacataaaaatgtatatttctatcattttattc 30871221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 292
Target Start/End: Original strand, 31598623 - 31598679
Alignment:
235 tttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaa 292  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
31598623 tttctattcc-aggaacgttttataccttgtaataaaatttagtaaacttgtaacaaa 31598679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Original strand, 30870944 - 30871074
Alignment:
19 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggt 118  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||  | | ||||||||||  || | |||||| ||||  ||||| |||    
30870944 gtttgtttcaaatttactaaatttattcttaagaataacattctttaaaatataa--aagtgaattttattttaaagtatttaaaaaaatgatgttcggt 30871041  T
119 tagctttataatattcctaggaaccataaaaata 152  Q
    || | |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
30871042 taacattataatatt-ctatgaaccttaaaaata 30871074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4765909 - 4765562
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
4765909 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatat 4765810  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4765809 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 4765710  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
4765709 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 4765610  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4765609 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 4765562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22936263 - 22935914
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
22936263 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 22936164  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22936163 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 22936064  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
22936063 tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc 22935964  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22935963 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 22935914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29543364 - 29543017
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
29543364 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatat 29543265  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
29543264 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 29543165  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29543164 ccaccctttttcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 29543065  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
29543064 atcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 29543017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 18411931 - 18412278
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
18411931 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 18412030  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
18412031 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 18412130  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
18412131 ccacctttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 18412230  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
18412231 atcattttattcccaggaatcaataattataacttgaaacaaacacac 18412278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19065859 - 19065507
Alignment:
7 tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaa 106  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
19065859 tattatggatgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaa 19065760  T
107 aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19065759 tatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaatatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 19065660  T
207 tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19065659 tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca 19065560  T
307 ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19065559 ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 19065507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 15 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11856001 - 11855658
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
11856001 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtt 11855902  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
11855901 tggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattccca 11855802  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
11855801 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatc 11855702  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
11855701 attttattctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 11855658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12970879 - 12970532
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
12970879 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 12970780  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
12970779 gtttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattc 12970680  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
12970679 ccacccttttccttaagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 12970580  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12970579 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 12970532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Original strand, 28602271 - 28602624
Alignment:
5 aatattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
28602271 aatactaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttagga 28602370  T
105 aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaac 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28602371 aaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccatacaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaac 28602470  T
205 tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
28602471 tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattctcagaaacattttata-ccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata 28602569  T
305 cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28602570 cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 28602624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 556053 - 555708
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
556053 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 555954  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
555953 ttggttagctttataatattcctaggaaccatcaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattccc 555854  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
555853 acccttttccttgggaaattttttctattccctggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctat 555754  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
555753 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 555708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14207170 - 14206823
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
14207170 agggtgtgtttgtttcaagtttacaaaatttattcctaggaataacattcattggaatataaagatgagaattttatttcaaggaatttaggaaaaatat 14207071  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14207070 gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 14206971  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
14206970 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttct 14206871  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
14206870 atcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 14206823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 357
Target Start/End: Original strand, 6091434 - 6091782
Alignment:
9 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
6091434 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaa 6091533  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
6091534 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaacttta 6091633  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
6091634 ttcccactcttttccttgggaaaatttttctattcccaagaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatt 6091733  T
309 ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6091734 tatatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 6091782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8646735 - 8646412
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
8646735 tgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttaggaaaattatgttt 8646636  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
8646635 ggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccac 8646537  T
216 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
8646536 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataaccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatca 8646437  T
316 ttttattcccgggaatcaacaatta 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
8646436 ttttattcccgggaatcaacaatta 8646412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 27481082 - 27481426
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27481082 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtt 27481181  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
27481182 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataatatgtaaactatttatgaatttattctcatcttcatgggaactttattccca 27481281  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
27481282 cccttttccttgggaaatattttttattctcaggaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatc 27481381  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
27481382 attttatttccaaaaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac 27481426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Original strand, 8406616 - 8406959
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
8406616 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 8406715  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8406716 gtttggttagctttataatattccaaggaaccaaaaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 8406815  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||     
8406816 ccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagcaaacttgtaacaaatataggcatgtacattcct 8406915  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
8406916 atcattttattctcgaaaatcaacaattataacttgaaacaaac 8406959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 359
Target Start/End: Original strand, 32535658 - 32536006
Alignment:
11 aagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
32535658 aagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttaatccaaggaatttaggaaaaata 32535757  T
111 tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32535758 tgtttggttagctttataatattctcaggaaccataaaaataggggttataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 32535857  T
211 ctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc 310  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
32535858 cccacccttttccttaggaaattttttctattcccaataacattttataccaagaaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttc 32535957  T
311 aatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
32535958 tatcattttattcctgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac 32536006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 70 - 359
Target Start/End: Original strand, 36703654 - 36703943
Alignment:
70 ataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
36703654 ataaagatgagaattttattccaaagaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccatcaaaatagggattataataggtaa 36703753  T
170 actatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaata 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
36703754 actatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaata 36703853  T
270 aaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
36703854 aattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttattcccgataatcaacaattataacttgaaacaaacacac 36703943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Original strand, 27480735 - 27481069
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||     
27480735 ggtgtgtttattttaagtttaccaaatttatttttaggaataatatttcttgaaatataaagatgagaattttatttcaaggtatttagaaaaaatatgc 27480834  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
27480835 ttggttaactttataatatttctatgaaccataaaaatagaaattataataggt-agctatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattctc 27480933  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    | |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
27480934 a-ccttttccttggaaaaaattttctattcccatgaacattttatacacaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatacatattcctat 27481032  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaa 350  Q
    |||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||    
27481033 cattttattctcaaaaatcaacaaatataacttgaaa 27481069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 6930362 - 6930713
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||    
6930362 taagggtgtgtttgttttaagtttatcaaatttattcatatgaataacattccttgaaatatcaagatgagaattttattttaaggtatttaaaaaaaat 6930461  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||||| ||| |||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
6930462 atgtttggttaactttataatattcctagaaaccttacagatagagattataatagataa-ctagatataaatttatttccatcttcatgggaactttat 6930560  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat-- 307  Q
    || |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||  || |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||      
6930561 tcccacaattttctttgggaaattttt-ctattcccaataatattttatatccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatat 6930659  T
308 --tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
      | | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
6930660 atttctatcattttattctcaggaatcaacaaatataacttgaaataaacacac 6930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42012530 - 42012181
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg-- 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||   |||||||||      
42012530 gtgtgtttgtttcaagtttactaaatttatttttaggaataacattttttggaataaaaagatgggaattttgttctaaggtatttggaaaaaatatgga 42012431  T
113 tt----tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
    ||    | | || || ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
42012430 ttataataggtaactatataatactccttggaaccataaaaatatggattataataggtaa-ctatataagaatttattctgatctccatgtgaacttta 42012332  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
42012331 ttcccacccttttccttcggaaattttttctattcctaggaacattttatactcgagaataaaatttagtaaatttgtaacaaacatagacatatgtatt 42012232  T
309 ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
42012231 tctatcattttattcccgagaatcaacaaatatagcttcaaacaaacacac 42012181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 296
Target Start/End: Original strand, 1664456 - 1664736
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||    
1664456 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctgagaataatatttcttgaaatataaagatgagaattttatttcaaggtatttagaaaaaatatgtt 1664555  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| || |||| ||    
1664556 tggttaactttataatattcttatgaaccataaaaatagggattataataggt-aactacatataaatttattctcatctccatgggaatttaattccca 1664654  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    ||| |||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||||||||    
1664655 cccgtttctttgggaaaaaatttctattctcaggaacattttatagctggtaataaaatttagtcaatttgtaacaaacata 1664736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 359
Target Start/End: Original strand, 20962373 - 20962659
Alignment:
72 aaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaac 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
20962373 aaagatgggaattttattccaaggcatttaaaaaaaatatgtttgcttaacattataatatttctgggaaccataaaaataggaattataatagg-aaat 20962471  T
172 tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaa 271  Q
    || | || ||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
20962472 tactcattaatttattctcatctccatgagaactttactcccacccttttccttgggaaaaattttctattcccagaaacgttttatatccgagaataaa 20962571  T
272 atttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||| ||||||||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||||||    
20962572 atttagtaaacttgtaacaaacataggcacgtgtattcctatcattttattcccaagaatctacgaatataacttgaaacaaacacac 20962659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43347243 - 43346897
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||| |     
43347243 agggtgtgtttgtttcaagttttcgaaatttattcttaggaataacatttattggaatataaagatgagaagtttattctaaggtatttagaaaaaaaaa 43347144  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||   || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
43347143 gtttggttaacaatgtaatattcgaaggaaccttaaaaatagggattaaaataggtaat-tacgcataattttattctcatcttcatgggaactttattc 43347045  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||| |||| |||  ||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||       
43347044 ccacccttttcattggaaaaacttttctattgccagaaacaatttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacatacatatgtattttt 43346945  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    || ||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
43346944 atgattttattttcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacacac 43346897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 164
Target Start/End: Original strand, 36703506 - 36703656
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
36703506 ggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattcataggaataacattccttggaatttaaagatgagaattttatttcaaggaatttaggaaaaatatgt 36703605  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36703606 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata 36703656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26637370 - 26637045
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |    
26637370 agggtgtgtttatttcaagtttatcaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttagaaaaaatgt 26637271  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccata-aaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||  | ||||||||||| ||| ||||| |||||||        
26637270 gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaaatatggattataataggt-agttacatttgaatttattctcatatccataggaactt---- 26637176  T
211 ctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc 310  Q
     |||||||||||  |  ||||||||||||||| |||                 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |    
26637175 -tcacccttttctctcagaaattttttctatttcca-----------------ggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatatagacatatataattc 26637094  T
311 aatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
26637093 tatcattttattcccattaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 26637045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 17251534 - 17251854
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||| | |||||    
17251534 taagggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattccta-caataacatttcttggaatataaggataggaatttttttccaaggtatttagataaaaa 17251632  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
     ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |  ||   |||||||||||  ||||| ||||| |||||||    
17251633 gatgtttggttaacattttaatattccta-gaaccataaaaatagggattataatatat-agttacacatgaatttattttcatcttcatggaaacttta 17251730  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||| || | ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| || |||    
17251731 ttcccatcattttctttgggaaattttttctattatcatgaacattttatactcgagaataaaatttagtaaaattataacaaacataaacatgtatatt 17251830  T
309 ccaatcattttattcccgggaatc 332  Q
     | |||||||||||| | ||||||    
17251831 tctatcattttattctcaggaatc 17251854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35348858 - 35348534
Alignment:
28 aagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta--agaaaaatatgtttggttagcttt 125  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  |  | ||||| ||||||  ||| | ||    
35348858 aagtttatcaaatttattcttaagaataacattcattggaacataaagatgagaattttattttaaggtatacagaaaaaaaaaatgtttttttaacatt 35348759  T
126 ataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcctt 225  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
35348758 ataatattcccgggaaccataaaaatatgaattataataggtaat-tacatgtgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttcttt 35348660  T
226 gggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattccc 325  Q
    ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||    
35348659 gggaaa-attttctattcccaaaaacattttataccc-aaaatacaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatt-ctatctttttattccc 35348563  T
326 gggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    |  |||| || ||||||| |||||||||||    
35348562 gaaaatctacgattataa-ttgaaacaaac 35348534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31583404 - 31583123
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||  ||| ||||| ||||  ||||| |||||| || ||     
31583404 tgtgtttgttttaagtttactaaatttatttctacgaataacattctttgaaacataaagatggaaatattatttcaagatattta-gaaaaaaatattg 31583306  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
    | ||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||| ||| ||||||   |||||||||||||| |||    
31583305 gtttaacattataatattctcaggaaccgtaaaaatagggattataataggtact-tacatatgaatt-atttccatctttgtgggaactttattcccac 31583208  T
216 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagaca 300  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31583207 ctttttctttggaaaattttttctattcctgggaacgttttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagaca 31583123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40276011 - 40275766
Alignment:
104 aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaa 203  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||   || | ||||||||||||| ||||||||    
40276011 aaaaagatgtttggttaatattataatattccatggaaccttaaaaatagggattttaataggttat-tagagataattttattcccatcttcatgggaa 40275913  T
204 ctttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat 303  Q
    |||||||| || | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
40275912 ctttattcccatcattttctttgggaaaacttttctattcccaggaatatttcatatctgggaataaaatttagcaaacttgtaacaaacatagacatat 40275813  T
304 acattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaa 350  Q
      |||   || |||||||||||   |||| |||| ||||||||||||    
40275812 gtatttttataattttattcccaaaaatctacaaatataacttgaaa 40275766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 152
Target Start/End: Original strand, 28429450 - 28429591
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt-aagaaaaata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| || ||||| |    
28429450 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctagaaataacattccttgaaatataaagatgtgaattttattccaaagtatttaaaaaaaaaga 28429549  T
111 tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaata 152  Q
    |||||||||| | |||||||||||  || |||| ||||||||    
28429550 tgtttggttaacattataatattctcagaaaccttaaaaata 28429591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16721029 - 16720910
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa---atatgtt 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||| ||||   |||||||    
16721029 tgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacattcattggaatataaaaatgtgaattttattcaaagatatttaaaaaaatatatatgtt 16720930  T
115 tggttagctttataatattc 134  Q
    || ||| | |||||||||||    
16720929 tgattatcattataatattc 16720910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35603124 - 35602968
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||| || | |||||| ||||||    
35603124 taagggtgtgtttggttcaagtgtaccaaatt-atttttaggaataacattttttggaatataaagatagaaattttattctaaagtatttaaaaaaaat 35603026  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa 169  Q
      ||||||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
35603025 --gtttggttaacattttaatattccaaggaaccttaaaaatatggtatataataggtaa 35602968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36978478 - 36978323
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt--aagaaaaatatgt 113  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||  || ||||| ||||    
36978478 tgtgtttgtttcaagtttattaaatttatttataggaataacattctttagaatataaatatgagaattttattttaaggtatttaaaaaaaaaacatgt 36978379  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaacc-ataaaaatagggattataataggta 168  Q
    || |||||| |||||||||||  |||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
36978378 ttagttagcattataatattcacaggagcctgaaaaaatagggattataaaaggta 36978323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 296
Target Start/End: Original strand, 30899470 - 30899561
Alignment:
205 tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
30899470 tttattctcacccttttctttggaaaattgtttctattcccaagaatattttatatccaggaataaaatttagaaaacttgtaacatacata 30899561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19089889 - 19089723
Alignment:
189 ccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaa 288  Q
    |||||| |||| ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||    
19089889 ccatcttcatgagaactttatacccatcattttctttgggaaattttttctattcccaaaaacgttttatactcaagaataaaatttaataaacttataa 19089790  T
289 caaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    |||||||| ||||  | ||| | ||  |||||||||| |||||  || | |||||||| ||||||||    
19089789 caaacataaacatgcatatttctatttttttattcccaggaatttacgaatataacttaaaacaaac 19089723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 301
Target Start/End: Original strand, 28023719 - 28023844
Alignment:
177 atgaatttattcccatctccatgggaa-ctttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattt 275  Q
    |||||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||   | |||||||||||    
28023719 atgaatttattctcatcttcgtgagaaactttattctcacccttttgtttgagaaattttttctattcccaaacacattttatatgtgagaataaaattt 28023818  T
276 agtaaacttgtaacaaacatagacat 301  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||    
28023819 aatgaacttgtaacaaatatagacat 28023844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Original strand, 20962286 - 20962348
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatg 78  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
20962286 tgtgtttgttttaagtttatcaaatttattcataggaataacattccttggaacataaagatg 20962348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 152
Target Start/End: Original strand, 30899327 - 30899463
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcct-aggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||| | |||||  ||||| |||||    
30899327 tgtgtttgtttcaagtttacaaaatttattgttaagaaataacattttttgaaatataaagatgagaaatttatt-caatgtatttagaaaaaagatgtt 30899425  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaata 152  Q
    |||||| |||||| ||||||  | ||||| ||||||||    
30899426 tggttaactttattatattctcacgaaccttaaaaata 30899463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 40276587 - 40276514
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttat 88  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
40276587 ggtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcttggtaataacattcctt-gaatataaagatgataaatttat 40276514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15200676 - 15200552
Alignment:
230 aattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccggga 329  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||  |   |    
15200676 aattttttctat-cccagaaacattttatgcctgagaataaaatttaataaatttataacaaacatagacatatatatttatatcattttattttcaaaa 15200578  T
330 atcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    ||| | || |||||||||||||||||    
15200577 atctataaatataacttgaaacaaac 15200552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 322
Target Start/End: Original strand, 28429617 - 28429733
Alignment:
205 tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    |||||||||||||||||| || || || |||||||  ||| | |||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
28429617 tttattctcacccttttctttcgggaaatttttctgctcc-atgaatgttttatattcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcatgta 28429715  T
305 cattccaatcattttatt 322  Q
     ||| | |||||||||||    
28429716 tatttctatcattttatt 28429733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41783749 - 41783624
Alignment:
232 ttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaat 331  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||||||   || |||||| ||||  ||||    
41783749 ttttttctattttcagaaacattttatatccgagaataaaatttagtaaacttataacaaacatatgcgtgtacatttttatgattttaatcccaagaat 41783650  T
332 caacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    | | || |||||||||||| ||||||    
41783649 ctataaatataacttgaaataaacac 41783624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3913327 - 3913206
Alignment:
232 ttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaat 331  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||| | ||| ||||||||||  ||||    
3913327 ttttttctattcctaa-aacattttatacctgg-aataaaatttagtaaatttgtaataaacatacacatgtatatttctatcgttttattcccaagaat 3913230  T
332 caacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    | || | |||||||||||| ||||    
3913229 ctacgaatataacttgaaataaac 3913206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19090016 - 19089898
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattc-cttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||  || |||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||| ||    
19090016 tgtgtttgattcaaatttaccaaatttatttttaagaataatattttcttagaacataaagatgagaattctattccaaggtatatagaaaaaatatatt 19089917  T
115 tggttagctttataatatt 133  Q
    || ||| | ||||||||||    
19089916 tgtttaacattataatatt 19089898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 27079308 - 27079206
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||| |   ||||||| ||||| || ||| |||||||||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||    
27079308 gggtgtgtttctttccggtttaccaaatttagttgaaggaatagcattcatttgaacataaagatggaaattttattctaaggtatttaa-aaaaatatg 27079210  T
113 tttg 116  Q
    ||||    
27079209 tttg 27079206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36978269 - 36978210
Alignment:
263 gggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt 322  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
36978269 gggaataaaattttgtaagtttgtaacaaacatagacatatatatttctatcattttatt 36978210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16720321 - 16720277
Alignment:
252 attttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
16720321 attttatacccgataataaaatttagtaaacttgcaacaaacata 16720277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Original strand, 27901697 - 27901760
Alignment:
28 aagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattcc 91  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
27901697 aagtttacaaaatttattcttaagaacaacattctttagaatataaagatatgaattttattcc 27901760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 6696864 - 6696755
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataa-cattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaata 110  Q
    |||||| |||||||||| |  |||  ||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||  || ||||||      
6696864 agggtgcgtttgtttcatggatacacaatttattcctaggaattatctttccctggaatataaaggtgtgatttttattcctaggaaaatatgaaaaaag 6696765  T
111 tgtttggtta 120  Q
    ||||||||||    
6696764 tgtttggtta 6696755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 346694 - 346347
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
346694 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 346595  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
346594 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 346495  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
346494 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 346395  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
346394 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 346347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 6171513 - 6171860
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
6171513 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 6171612  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6171613 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 6171712  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
6171713 ccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 6171812  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6171813 atcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 6171860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42675015 - 42674663
Alignment:
7 tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
42675015 tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacatttcttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttaggaaa 42674916  T
107 aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
42674915 aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactt 42674816  T
207 tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca 306  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
42674815 tattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatgcccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca 42674716  T
307 ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42674715 ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 42674663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 4559279 - 4559628
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
4559279 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaagaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 4559378  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4559379 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 4559478  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
4559479 tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc 4559578  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4559579 caatcattttattcttgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 4559628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14777847 - 14777500
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
14777847 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 14777748  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
14777747 gtttggttagctttataatattcctaggaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaattttattc 14777648  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
14777647 ccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcca 14777548  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
14777547 atcattttattcccgggaatcaacaattataaattgaaacaaacacac 14777500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 37192242 - 37192591
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
37192242 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 37192341  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
37192342 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccaatctccatggaaactttat 37192441  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
37192442 tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacatagacatatacattt 37192541  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37192542 ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 37192591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Original strand, 17965707 - 17966052
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
17965707 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 17965806  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
17965807 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattccc 17965906  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17965907 accctttttcatgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgggaataaaatttggtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 17966006  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17966007 cattttattatcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 17966052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 11071327 - 11071674
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
11071327 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcataggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 11071426  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
11071427 gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattc 11071526  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
11071527 ccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 11071626  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
11071627 atcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 11071674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 360
Target Start/End: Original strand, 2050586 - 2050936
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
2050586 taagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 2050685  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2050686 atgtttggttagctttataatattcctaggaatcataaaaataggaattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 2050785  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
2050786 tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattc 2050885  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca 360  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2050886 ctatcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca 2050936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21737761 - 21737402
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
21737761 attaaggatgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaatatgggaattttattccaaggaatttatgaaaa 21737662  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21737661 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 21737562  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatt--------ttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagac 299  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21737561 attcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagac 21737462  T
300 atatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21737461 atatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 21737402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9734190 - 9733848
Alignment:
17 gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttg 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
9734190 gtgtttgttttaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttg 9734091  T
117 gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacc 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9734090 gttggctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc 9733991  T
217 cttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
9733990 cttttccttgggaaattttttttattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcat 9733891  T
317 tttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9733890 tttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 9733848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5770458 - 5770115
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
5770458 gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 5770359  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
5770358 tttggttagctttataatattcctagcaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcc 5770259  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
5770258 caccatttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccta 5770159  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
5770158 tcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 5770115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41729479 - 41729132
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
41729479 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 41729380  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
41729379 gtttggttagctttataatattcctagtaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattc 41729280  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
41729279 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatctggcaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatccattcct 41729180  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
41729179 atcattttattcccgggaataaaaaattataacttgaaacaaacacac 41729132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 638318 - 638660
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
638318 ggtgtgtttgatttaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 638417  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
638418 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattc-c 638516  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
638517 ccccttttccttgggaaattttttatattcctaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacctgtaacaaacatagacatatacattcctat 638616  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
638617 cattttatttccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacac 638660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 37533675 - 37534021
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
37533675 agggtgtgtttgtttcaagtttactaaatttatttctaggaataacattccttggaataaaaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaattat 37533774  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37533775 gtttggttagctttata-tattcctgggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 37533873  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
37533874 ccacccttttttttgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcct 37533973  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
37533974 atcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 37534021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28312042 - 28311701
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
28312042 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcataggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttaggaaaaatatgtt 28311943  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
28311942 tggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaa-ctatttatgaatttattcccatctccacgggaactttattccca 28311844  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
28311843 cccttttccttgggaaagattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattcagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcctatc 28311744  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
28311743 attttattcccgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacac 28311701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 37233155 - 37233496
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
37233155 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttaggaaaaatatgtt 37233254  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
37233255 tggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaataaggattataataggtaa-ctatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccca 37233353  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||    
37233354 cccttttccttgggaacgattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatgttcctatc 37233453  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
37233454 attttattcccgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacac 37233496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 2521434 - 2521744
Alignment:
49 aggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2521434 aggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaa 2521533  T
149 aatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccagg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2521534 aatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaattttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagg 2521633  T
249 aacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttga 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
2521634 aacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattttcgggaatcaacaattataacttga 2521733  T
349 aacaaacacac 359  Q
    |||||||||||    
2521734 aacaaacacac 2521744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 40951208 - 40950861
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
40951208 agggtatgtttgtttcaaatttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgaaaattttattccaaagaatttaggaaaaatat 40951109  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
40951108 gtttggttagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 40951009  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |     
40951008 ccacccttttccttggaaatttttttgtattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataagcatatatatttct 40950909  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
40950908 atcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 40950861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 26309993 - 26310335
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||    
26309993 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaatagcattccttggaatataaagatgggaattttattacaagaaatttaggaaaaatatggtt 26310092  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
26310093 ggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccac 26310192  T
216 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaac--atagacatatacattccaat 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||    
26310193 ccttttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttctaacaaacatatagacatatacatttctat 26310292  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
26310293 cattttattcccgggaatcaacaattataactttaaacaaaca 26310335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Original strand, 41750276 - 41750598
Alignment:
37 aaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
41750276 aaatttattcctaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttatttcaaggaatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcct 41750375  T
137 aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttt 236  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
41750376 aagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt 41750475  T
237 tctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaaca 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
41750476 tctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcctaggaatcaaca 41750575  T
337 attataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||    
41750576 attataacttgaaacaaacacac 41750598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20426830 - 20426485
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||  |||||||||    
20426830 gggtgtgtttgtttaaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttatttcaatgtatttagaaaaaatatg 20426731  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
20426730 tttggttaactttataatattcctaccaaccataaaaatagagattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatctccataggaactttattct 20426632  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
20426631 cacccttttccttgggaaaaattttctattcccaggaacattttatatccggggataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataaattccta 20426532  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
20426531 tcattttattcccgggaatcaacaaatataatttgaaacaaacacac 20426485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 36 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34357023 - 34356702
Alignment:
36 caaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcc 135  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34357023 caaatttattcttaggaatagcattccttggaatataa-gataggaattttattccaagaaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcc 34356925  T
136 taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaatttt 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
34356924 taggaaccataaaaatagagattataataggaaaattatttatgaatttattcccat-tccgtgggaactttattcccaccattttccttgggaaatttt 34356826  T
236 ttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
34356825 ttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatatacatttctatcattttattcccgggaatcaac 34356726  T
336 aattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
34356725 aattataacttgaaacaaacacac 34356702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27358303 - 27357965
Alignment:
20 tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtt 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||    
27358303 tttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataacatttattggaatataaagatgagaattttatttcaaggtatttagcaaaaatatgtttgatt 27358204  T
120 agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt 219  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
27358203 aaatttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatctctatgggaactttattcccaccctt 27358105  T
220 ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatttt 319  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
27358104 ttccttgggtaaatttttctattcccatgaatattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatccctatcatttt 27358005  T
320 attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
27358004 atacctgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 27357965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 45408981 - 45409319
Alignment:
20 tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtt 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||    
45408981 tttgttttaagtttaccaaatttattcctaggaataacatttattggaatataaagatgagaattttattccaaggtatttagcaaaaatatgtttgatt 45409080  T
120 agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt 219  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
45409081 aaatttataatatttctaggaaccataaaaataaggattataataggtaa-ctatttatgaatttatttccatctccatgggaactttattcccaccctt 45409179  T
220 ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatttt 319  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
45409180 ttccttgggtaaatttttctattcccatgaatattttatacccggtaataaaatttagtaaacttgtaaaaaacataggcatatacattcctatcatttt 45409279  T
320 attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
45409280 atacttgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 45409319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 65 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39995435 - 39995133
Alignment:
65 ggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata 164  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39995435 ggaatataaagatggaaattttattccaaggaatttatgaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata 39995336  T
165 ggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatt--------tt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
39995335 ggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcatttt 39995236  T
257 atacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 356  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39995235 atatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 39995136  T
357 cac 359  Q
    |||    
39995135 cac 39995133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 292
Target Start/End: Original strand, 23943885 - 23944165
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||  ||||||||    
23943885 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattgtaaagaatttagaaaaaatat 23943984  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
23943985 gtttggttacctttataatattcctaggaaccataaaaataaagattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 23944084  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaa 292  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
23944085 ccacccttttcgttgagaaattttttctattcccaggaacattttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaa 23944165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 261
Target Start/End: Original strand, 13760692 - 13760938
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
13760692 gtgtgtttgtttcaagtttgccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgtt 13760791  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
13760792 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccca 13760891  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
13760892 cccttttccttgggaaattttttctattcccataaacattttatacc 13760938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18714005 - 18713660
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||    
18714005 agggtgtgtttgattcaagcttaccaaatttatttataggaataacattccttggaatataaagatgagaatattattccaagatatttagaaaaaatat 18713906  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
18713905 gtttggttaactttataatattcctatgaaccataaaaatagggtttataataggtta-ctacgtataaatttatttccatctccatgggaactttattc 18713807  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||       
18713806 ccacccttttctttgggaaattttttttattaccaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttat 18713707  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
18713706 atcattttattaccatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacaca 18713660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 355
Target Start/End: Original strand, 45693909 - 45694253
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||     
45693909 taaggatgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaacataaagatgagaattttattccaaggcattttaaaaaaaa 45694008  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||| || | |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
45694009 atgtttgcttaacattataatattcctgggaaccataaaaataggaattataattgc-aaattactcatgaatttattttcatctccatgggaactttat 45694107  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
45694108 tcccacccttttccttgggaaaaattttctattcccatgaacgttttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgtattc 45694207  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    | |||||||||||||| | |||| || | |||||||||||||||||    
45694208 ctatcattttattcccagaaatctacgaatataacttgaaacaaac 45694253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 14832536 - 14832877
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||  |||||||||||    
14832536 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttccaagaataacattccttaaaatataaagatgataattttattcctagatatttagaaaaaatatgtt 14832635  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||    
14832636 tggttagctttataatattcctatgaaccataaaaataaggattataatagg-aaattacgtataaatttattctcatctcaatgagaactttattccca 14832734  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | |||    
14832735 cccttttctttgggaaaatttttctattcccaagaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttttaacaaacataggcatatatatttctatc 14832834  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
14832835 attttattcctaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacac 14832877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 3902182 - 3902521
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||||    
3902182 gtgtgtttgtttcaagtttaccatatttatttttaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaagatatttagaaaaaatatgtt 3902281  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
3902282 tggttaactttataatattcacaggaaccataaaaatagggattataataggt-aactatatatgaatttattctcatctccaagggaactttattccca 3902380  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||| | |||    
3902381 ccattttctttgggaatttttttctattcccaggaacattttaaacctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgtctatatatttctatc 3902480  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    ||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||    
3902481 attttattctcaggaaagaacaaatataacttgaaacaaac 3902521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 51 - 359
Target Start/End: Original strand, 1988073 - 1988380
Alignment:
51 gaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaa 150  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
1988073 gaataacattccttagaatataaatatgagaattttattccaagatttttgggaaaaatatgtttggttaactttataatattccttggaaccaaaaaaa 1988172  T
151 tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
1988173 tagggattataataggtaa-ctatataagaatttattctcatctccatggaaactttattcccacccttttccttgagaaaatttttctattcccaagaa 1988271  T
251 cattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaa 350  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||    
1988272 cattttatatccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatgtatatttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataacttcaaa 1988371  T
351 caaacacac 359  Q
    |||||||||    
1988372 caaacacac 1988380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 40569740 - 40570089
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||  ||||| ||    
40569740 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatatatatatgtaaattttattccaaggtatttagaaaaaagat 40569839  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaa---cttta 208  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| ||||||||||   |||||    
40569840 gtttggttaacattataatgttccaaggaacctcaaaaatagggattataataggt-aattatacatgattttattcccatttccatgggaacttcttta 40569938  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||  ||    
40569939 ttcccaccattttctttgggaaaaattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaacaaacttgtaacaaacataggcatgtatgtt 40570038  T
309 ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
       || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
40570039 tttatgattttattcccaggaatctacaattataacttgaaacaaacacac 40570089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 39819414 - 39819763
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||    
39819414 ggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattcataggaataacattctttggaatataaagatggaaattttattcccaggtatttagaaaaaatatgt 39819513  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaac---tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 210  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    || ||| | |||| || ||||| |||| ||||||||||    
39819514 ttggttgactttataatattccaaggaaccttaaaaataaggattatattaggtaaacaaacatatataattttactctcatcttcatgagaactttatt 39819613  T
211 ctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaac---attttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    | |||| ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
39819614 cccaccattttctttggaaatttttttcaattcccaggaacattattatatacccgggaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatgtat 39819713  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    |   || ||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||    
39819714 tttcatgattttattttcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacac 39819763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 7007307 - 7007642
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||||||||    
7007307 agggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttattattaggaataacatttcttgaaatataaagatgagaattttattctaaagtatttagaaaaaatat 7007406  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
7007407 gtttggttaactttataatattcctaagaaccattaaaatagggagtataataggt-aactacatatgaatttattctcatctccatggtaattttattc 7007505  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| ||||| |||||||  ||||| ||||  ||  ||||||||         | ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||| |     
7007506 ccaccattttctttgggaa--tttttttattatcaataacatttt---------agtaaaatttagtaaacttgtatgaaacattgacaaatatatttcc 7007594  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
7007595 atcattttatccccaagaatcaacaaatataacttgaaataaacacac 7007642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41298255 - 41297983
Alignment:
20 tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtt 119  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     | |||||| ||||| ||||||| ||    
41298255 tttgttttaagtatatcaaatttatttttaggaataacattcattggaatataaagatgagaattttatttt---gtatttaaaaaaaagatgtttgttt 41298159  T
120 agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt 219  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
41298158 aacattataatattccaaggaaccataagaatagagattataataggtaat-tataaatgaatatattctcatcttcatgagaactttattcacaccctt 41298060  T
220 ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    | | |||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
41298059 tgctttgggaaattttttttatttctaaaaacattttatatccgggaataaaatttaataaacttgtaacatacata 41297983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5003182 - 5002843
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    |||| ||||    
5003182 ggtgtgtttgtttaaaatttaccaaatttatttataggaataacattccttggaatataaagatgcgaattttattccaaggtatttggataaaagatgt 5003083  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||||| | || |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||   ||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||| |    
5003082 ttggttaacattttaatattttcaggaaccataaaaatatggattataataggt-agttacacatgaattgattcatatcttcatggaaactttattccc 5002984  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    ||| | ||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| || | | | ||    
5002983 accatattctttggaattttttttctattcccagaaacattttata-cttggaataaaatttagcaaacttgtaacaaatatatgcatgtatacttctat 5002885  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    ||||||||||   | |||| |||| |||||||||||||||||    
5002884 cattttattcttagaaatctacaaatataacttgaaacaaac 5002843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 4875506 - 4875840
Alignment:
20 tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaatatgtttggt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||  |    
4875506 tttgtttcaagtttgtcaaatttattcttaggaataatattctttggaatataaagatgtgaattttattccaatgtatttagaaaaaaatatgttttct 4875605  T
119 tagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccct 218  Q
    || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||     
4875606 taacattataatatgccgaggaaccataaaaatagggattataatatgt-aattacatatgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccg 4875704  T
219 tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattt 318  Q
    |||| ||||||  |||||| ||||| |  |||| |||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||| | |||||||    
4875705 tttctttgggattttttttttattctcgagaacgttttata-ttgaaaataaaatttagcaaacttgtaacaaacataaacaaatttatttctatcattt 4875803  T
319 tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    |||| ||   || | |||| |||||||| ||||||||    
4875804 tatttccaaaaagctacaaatataacttaaaacaaac 4875840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11763577 - 11763374
Alignment:
154 ggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacat 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
11763577 ggattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatcttcatggaaactttattcccacctttttcctttggaaattttttctattcccagaaatat 11763479  T
254 tttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaa 353  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  || |||||| |||||||||||| ||    
11763478 tttatgtccgagaataaaatttagtaaatttataacaaacatagacatatatattcctatcatttcattcccgaaaaacaacaaatataacttgaaa-aa 11763380  T
354 acacac 359  Q
    ||||||    
11763379 acacac 11763374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11763737 - 11763597
Alignment:
24 tttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||  |    
11763737 tttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggtatctagaaaaaatatgtttgattaatt 11763638  T
124 ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
11763637 ttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataata 11763597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 346
Target Start/End: Original strand, 14253412 - 14253578
Alignment:
180 aatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta 279  Q
    ||||||||| ||||| ||||  || ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
14253412 aatttattctcatcttcatgaaaattttattcacacccttttctttgagaaattttttctattcccataaacattttatactcgggaataaaatttagta 14253511  T
280 aacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataactt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
14253512 aacttgtaacaaacatagacatatatatttctatcattttattcccgagaatcaacaaatataactt 14253578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 13790018 - 13790221
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt-aagaaaaatatgtttg 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||    
13790018 tgtttgtttcaagtttatcaaatttatttgtaggaataacattccttgaaatatatagatgtaaattttattctaaggtatttaaaaaaaaagatgtttg 13790117  T
117 gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatt-tatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
13790118 attaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaa--tattacatgattttattcccatctccatgggaactttattcccac 13790215  T
216 cctttt 221  Q
    | ||||    
13790216 cgtttt 13790221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 301
Target Start/End: Original strand, 13539399 - 13539679
Alignment:
20 tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||  ||||| ||||||| ||    
13539399 tttgtttcaagtttaccaaatttatttttggtgataacatttcttggaacataaagatgagaattttattctaaaatatttagaaaaaagatgtttgctt 13539498  T
120 agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt 219  Q
    | | ||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||||| | || ||   |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||   |    
13539499 aacattatagtattctcagaaaccataaaaataaggattataatagat-aattacacatgaatctattcccatgttcatgggaactttattcccactagt 13539597  T
220 ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacat 301  Q
    |||  || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
13539598 ttctgtgagaaattttttccattcccataaacattttatacctgcgaataaaatttaataaatttgtaacaaacatagacat 13539679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 205 - 359
Target Start/End: Original strand, 6571602 - 6571756
Alignment:
205 tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
6571602 tttattcctaccctttttcttgggaaattttttatattccccggaacattttatacctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata 6571701  T
305 cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
6571702 tattcctatcattttatttccggaaatcaacaaatataactttaaacaaatacac 6571756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3254437 - 3254284
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
3254437 tgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttttaggaataacattctttggaatataaaaatgagaattttattctaaggtatttagaaaaaatatgttt 3254338  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa 169  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||    
3254337 ggttaacttcataatattcctagaaaccataaaaataagggttataataagtaa 3254284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 359
Target Start/End: Original strand, 25454968 - 25455093
Alignment:
234 ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatca 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   || ||||||||| | ||||||     
25454968 ttttctattcccaggaacattttatactcgagaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatgtatttttatgattttattctcaggaatct 25455067  T
334 acaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
25455068 acaaatataacttgaaacaaacacac 25455093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 356
Target Start/End: Original strand, 1623206 - 1623448
Alignment:
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||    
1623206 gtttgattaactttatattattcgtaggaaccataaaaatagagattataattggtaa-ctacatatgaatttattctcatattcattgaaactttattc 1623304  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     | || | ||| |||| ||| ||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |     
1623305 ccgccatgttctttggaaaaatttctctgtactcaggaacattttataaccgggaatcaaatttaataaactcgtaac-aacatagacatatatatttct 1623403  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 356  Q
    || |||||| ||   ||||||||||| ||||| || |||||||||    
1623404 attattttactcttaggaatcaacaaatataatttaaaacaaaca 1623448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 322
Target Start/End: Original strand, 4684945 - 4685211
Alignment:
53 ataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaata 152  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| |||| ||| | |||||||| || | ||| |||||||||||    
4684945 ataacattctttagaacataaagatgagaattttattcctaggtatttagtaaaaatatatttgcttaacattataata-tcttcggatccataaaaata 4685043  T
153 gggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttg-ggaaattttttctattcccagg-aa 250  Q
     | ||||||||||||    ||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||      ||||||||||| ||||| ||    
4685044 tgaattataataggt----tacacatgaatttgttcccatcttcatgggaactttattcacacccttttctttgatttttttttttctattgccaggaaa 4685139  T
251 cattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt 322  Q
    | |||||||| | | ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| || ||| | |||||||||||    
4685140 cgttttatactctgaaataaaatttaataaatttataacaaacataaacatgtatatttctatcattttatt 4685211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 25724744 - 25725033
Alignment:
9 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaaga-tgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| || || || ||||||||| ||  |||| | ||||    
25724744 ttaaggggctgtttgtttcaagtttactagatttattcccaagaataactttccttggaatttaaggaatgggagttttattcctagatattttaaaaaa 25724843  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    |  ||||||||||   || |||||||| | | |||||| | ||||||||   |||||||||       || ||| |||||| ||||| |||| |||||||    
25724844 agttgtttggttaatattgtaatattcttggaaaccattataatagggaggttaataggtagttacacta-gaaattattctcatcttcatgagaacttt 25724942  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaa-tttagtaaacttgtaacaaacatag 297  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| ||||| || |||||||||||    
25724943 attcccacccttttctttgggaaactttttctattcccagaaacattttatacccagcaataaaattttaataaacctgcaacaaacatag 25725033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Original strand, 1623078 - 1623188
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||| ||||||||    
1623078 tgtgtttgtttcaattttactaaatttattcctagtaataacatttcttggaatataaagatgagaattttatttcaa-gtatttagaaaatatatgttt 1623176  T
116 ggttagctttat 127  Q
    ||||| ||||||    
1623177 ggttaactttat 1623188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Original strand, 37851678 - 37851864
Alignment:
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||   ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
37851678 atgtttagttaacattataatatttttaggaatcataaaaatatgaattataataggtagt-tacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttat 37851776  T
210 tctcacccttttccttggga--aattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    ||||||| ||||| |||| |    ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
37851777 tctcaccattttctttggaattttttttttctattcctagaaacattttatacccgaaaataaaa-ttagtaaacttctagcaaacata 37851864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 248 - 359
Target Start/End: Original strand, 24499400 - 24499509
Alignment:
248 gaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttg 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| | ||||||||||| |   |||||||||| |||||||||    
24499400 gaacattttataccatggaataaaatttagtaaacttataacaaacatag--atatatatttctatcattttatttctatgaatcaacaaatataacttg 24499497  T
348 aaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||    
24499498 aaacaaacacac 24499509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8868842 - 8868670
Alignment:
180 aatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta 279  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||    
8868842 aatttatacccatcttcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaa-tattccta-tcccaggaacattttctacctaggaataaaatttacta 8868745  T
280 aacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    | | |||||||||||||   ||||  ||| | |||| ||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||    
8868744 atcctgtaacaaacataagaatatgtatttctatcaatttattcctaggaatctacaa-aataacttgaaacaaac 8868670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 73
Target Start/End: Original strand, 2521381 - 2521434
Alignment:
20 tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataa 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2521381 tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataa 2521434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3254245 - 3254142
Alignment:
180 aatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaatt-ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagt 278  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||    
3254245 aatttattctcatcttcatgggaactttattcccaccatttcctttgggaaaaaattttctattcccagaaacattttgtacgcgagaataaaatttagt 3254146  T
279 aaac 282  Q
    ||||    
3254145 aaac 3254142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 89
Target Start/End: Original strand, 14253254 - 14253325
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttatt 89  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
14253254 tgtttgttttaaatttaccaaatttatttttaggaataacattctttggaatataaggatgagaattttatt 14253325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14403419 - 14403235
Alignment:
177 atgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctat---tcccaggaacattttatacccgggaataaaat 273  Q
    |||||||||||| || | |||||  |||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||| |   |  ||||||||||||||||| | |||||||||    
14403419 atgaatttattctcacc-ccatgaaaactttattcacaccattttctttggtaaaatttttctttctatttcaggaacattttatacctgagaataaaat 14403321  T
274 ttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||| ||||||||||| |||  ||| ||| || |||   ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
14403320 ttattaaacttgtaataaatgtaggcatgtatatttttatcattttatttccaggaatcaacaaatacaacttcaaacaaacacac 14403235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 516572 - 516463
Alignment:
180 aatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta 279  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||    
516572 aatttattctcatcttcacgggaattttattctcaccattttctttgg-aatttttttatattcccaaaaacattttatacccagaaataaaatttacta 516474  T
280 aacttgtaaca 290  Q
    || || |||||    
516473 aaattataaca 516463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 358
Target Start/End: Original strand, 13760941 - 13761013
Alignment:
286 taacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
13760941 taacaaacataggtacatatattcctatcattttattcccgaaaatcaataattataacttgaaacaaacaca 13761013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 89
Target Start/End: Original strand, 25444916 - 25444999
Alignment:
6 atattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttatt 89  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
25444916 atatttagggtgtgtatgttttaagtttgtcaaatttattttaaggaataacattttttggaatataaagatgataattttatt 25444999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1723324 - 1723230
Alignment:
265 gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || || || ||| | ||||||||||||  || |||  ||||  ||||||||||||||||||||    
1723324 gaataaaatttaataaacttgtaacaaacattgaaatgtatatttccatcattttattcatggaaatatacaaacataacttgaaacaaacacac 1723230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 322
Target Start/End: Original strand, 25625328 - 25625418
Alignment:
232 ttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttatt 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||  | ||| | |||||||||||    
25625328 ttttttctattcccatgaacattttatacctcagaataaaatctagtaaatttgcaacaaacctagacattcatatttctatcattttatt 25625418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14403555 - 14403431
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaa--gatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | |||| ||||||||  ||||  |||||||| | ||||  ||||  ||||||    
14403555 agggtgagtttgttttaagtttatcaaatttatttttagaaataacagttcttgaaatataaaaagatggaaattttatactaaggtttttagaaaaaat 14403456  T
110 atgtttggttagctttataatattc 134  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
14403455 atttttggttaactttataatattc 14403431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 93
Target Start/End: Original strand, 45212662 - 45212735
Alignment:
20 tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaa 93  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
45212662 tttgttttaaatttatcaaatttatttttaggaattacattctttgaaatgtaaagatgagaattttattccaa 45212735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 149
Target Start/End: Original strand, 14253345 - 14253413
Alignment:
81 aattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaa 149  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||    
14253345 aattttattccaaaatatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatatttttaggaaacataaaa 14253413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 93
Target Start/End: Original strand, 10390559 - 10390627
Alignment:
23 gtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
10390559 gtttcaagtttaccaaatttattctta-gaattatattccttggaacataaa-atgagaactttattccaa 10390627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36590924 - 36590862
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatata 72  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
36590924 taagagtgagtttgttttaagtttactaaatttatttttaggaataacattcgttggaatata 36590862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 240
Target Start/End: Original strand, 14137038 - 14137153
Alignment:
124 ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcc 223  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||  ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| | ||||||      
14137038 ttataatattcccaacaaccataaaaatagagattttaataagtaat-tacatatgaatttattctcgtcttcatgagaactttattcttaacctttttt 14137136  T
224 ttgggaaattttttcta 240  Q
    ||| |||| ||||||||    
14137137 ttgagaaaatttttcta 14137153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 46
Target Start/End: Original strand, 1498878 - 1498909
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
1498878 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattc 1498909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8868980 - 8868938
Alignment:
20 tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattcc 62  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
8868980 tttgtttcaagtttactaaatttattcctacgaataactttcc 8868938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8476657 - 8476310
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
8476657 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 8476558  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8476557 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 8476458  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
8476457 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacaggcatatacattcca 8476358  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8476357 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 8476310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 26848744 - 26849091
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
26848744 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 26848843  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
26848844 gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttattc 26848943  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
26848944 ccacccttttccttaggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 26849043  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26849044 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 26849091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11239471 - 11239122
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
11239471 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 11239372  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11239371 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 11239272  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
11239271 tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattt 11239172  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11239171 ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 11239122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 40907986 - 40908334
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
40907986 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 40908085  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
40908086 atgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttat 40908184  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
40908185 tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc 40908284  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40908285 ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 40908334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 47115202 - 47114859
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
47115202 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgttt 47115103  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
47115102 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccac 47115003  T
216 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca 315  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
47115002 ccttttccttgggaatttttttttatttccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatca 47114903  T
316 ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
47114902 ttttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 47114859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33218262 - 33217917
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
33218262 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 33218163  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
33218162 gtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattc 33218063  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
33218062 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttaataaatttgtaacaaacataggcatatacattcct 33217963  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
33217962 atcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacac 33217917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 48340108 - 48339760
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
48340108 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttagaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaat 48340009  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48340008 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 48339909  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
48339908 tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccatgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattt 48339809  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
48339808 atatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 48339760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6231850 - 6231503
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
6231850 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttgaaatataaagataggaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 6231751  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6231750 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 6231651  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
6231650 ccaccattttcattgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 6231551  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6231550 atcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 6231503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31611330 - 31611004
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
31611330 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttatgaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgttt 31611231  T
116 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
31611230 ggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattcccac 31611131  T
216 ccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca 315  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31611130 cctttttcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca 31611031  T
316 ttttattcccgggaatcaacaattata 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
31611030 ttttattcccgggaatcaacaattata 31611004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20414812 - 20414467
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
20414812 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaagaatttaggaaaaatatgt 20414713  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
20414712 ttgattagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 20414613  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
20414612 acccttttccttgggaatttttttttatttccaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaatttataacaaacataggcatatacattccaat 20414513  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
20414512 cattttattcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 20414467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Original strand, 1098923 - 1099267
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
1098923 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 1099022  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
1099023 ttggctagctttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaa-tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 1099121  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||    
1099122 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagggatatacatttctat 1099221  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
1099222 cattttattcccgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac 1099267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28124779 - 28124438
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
28124779 tgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggattaacattccttggaatataaatatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttgg 28124680  T
118 ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccc 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
28124679 ttagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataatatgtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccc 28124580  T
218 ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatt 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
28124579 ttttccttgggaaattttttatattccgaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataacaaacataggcatatacattcctatcatt 28124480  T
318 ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
28124479 ttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 28124438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 44952030 - 44952377
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
44952030 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 44952129  T
112 gtttggttagctttataatattcc-taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
44952130 gtttggttaactttataatattccttaggaa-cataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttatt 44952228  T
211 ctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
44952229 cccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttc 44952328  T
311 aatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44952329 tatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 44952377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9320797 - 9320450
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattcc-aaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
9320797 gggtgtgtttgtttcaagtttatgaaatttattcataggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattcctaaggaatttaggaaaaatat 9320698  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
9320697 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggatcataataagtaaactatttatgaatttatttccatctccatgggaactttattc 9320598  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||     
9320597 ccacctttttccttaggaaattttttctattcccaggaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagtatatacattcct 9320498  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9320497 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 9320450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 24574289 - 24574644
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
24574289 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcataggaataacattccttgaaatataaagatgagaattttattccaaggaatttatgaaaaatat 24574388  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
24574389 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 24574488  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaa--------cattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat 303  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24574489 ccaccatttttcttgggaaattttttctatttccagaaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatat 24574588  T
304 acattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24574589 acattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 24574644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 20297513 - 20297862
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
20297513 taagggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttattcttaggaataacattctttggaatataaagatgggaattttatttcaaggaatttaggaaaaat 20297612  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20297613 atgtttggttgactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 20297712  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
20297713 tcccacccttttccttggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattt 20297812  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20297813 ctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 20297862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 46359673 - 46360002
Alignment:
11 aagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
46359673 aagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaata 46359772  T
111 tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46359773 tgtttggttagctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt 46359872  T
211 ctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcc 310  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
46359873 cccacccttttccttgggaaatattttctattcacaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcc 46359972  T
311 aatcattttattcccgggaatcaacaatta 340  Q
     |||||||||||||  | ||||||||||||    
46359973 tatcattttattccaagaaatcaacaatta 46360002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10823068 - 10822733
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
10823068 taagggtgtgtttgtttcaagtttagcaaatttatttctaggaataacattccttacaatataaagatgagaattttattccaaggtatttaggaaaaat 10822969  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
10822968 atgtttggttaactttataatattcttaggaaccatacaaatagggattattatagat-aactatttatgattttattcccatctccatgaaaactttat 10822870  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
10822869 tcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaattttttttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacactt 10822770  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataactt 346  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
10822769 ctatcattttattcccggaaatcaacaaatataactt 10822733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43132502 - 43132159
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
43132502 gtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggtatttaggaaaaatatgtt 43132403  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||    
43132402 tggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggt-aactatttatgaatttaatctcatctccgtgggaactctattccca 43132304  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||     
43132303 cccttttccttgggaaaaaatttatattctcaggtacattttatacatgaaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatatattcctatt 43132204  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
43132203 attttattctcgagaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 43132159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 53166073 - 53165733
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||    
53166073 agggtgtgtttgtttcaagtttatccaatttatttctaagaataacattccttgaaatataaagatgggtattttattccaaggtatttaggaaaaatat 53165974  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
53165973 gtttggttaaccttataatattcctaggaatcataaaaatagatattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 53165875  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||     
53165874 ccaccctttttcttggaaaaaattttctattcccagaaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatatatattcct 53165775  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaa 353  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
53165774 atcattttatttatgggaatcaacaaatataacttgaaacaa 53165733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43719271 - 43718986
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
43719271 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagttgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtt 43719172  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||     |||||||||||||| |||||||| ||    
43719171 tggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataagtaaattatttatgaatt-----ccatctccatgggatctttattccca 43719077  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatac 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
43719076 cccttttccttgggaaattttttctattctcaggaacattttatgccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacatagatatatac 43718986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31436276 - 31435925
Alignment:
7 tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaa 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| || ||  |||    
31436276 tattaaaggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctggaaataacattctttagaatataaagataggaattttattccaaggtatatagaaaa 31436177  T
107 aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 206  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  |  |||||||||| |||||||||||||||||    
31436176 aacatgtttggttagttttataatatttcttggaatcataaaaataaggattataataggtaa-ctacattagaatttattctcatctccatgggaactt 31436078  T
207 tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca 306  Q
    ||||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
31436077 tattcccaccaatttctttgggaaaatttttctattttcaggaacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca 31435978  T
307 ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    || | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
31435977 tttctatcattttattctcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 31435925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12228601 - 12228258
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
12228601 ggtgtgtttgttacaagtttatcaaatttattcttgggaataacattatttgaaatataaagatgagaattttattctaaggtatttaaaaaaaatatgt 12228502  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||| | |||||||||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
12228501 ttggttagttttatgatattcttaggaatcataaaaataagtattataatagat-aactacatatgattttattctcatctccatgggaactttattctc 12228403  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    | ||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | ||    
12228402 a-ccttttctttggaaatttttttctattcccagaaacattttgtacccgagaataaaatttagtaaacttgtaataaacataggcatatatatttctat 12228304  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||||  || ||||||||||||    
12228303 cattttattcgcaggaattaacaactatattttaaaacaaacacac 12228258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 29512324 - 29512546
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||    
29512324 ggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattcctaggaataacattccttagaatataaagatgggaattttatttcaagaaatttaggaaaaatacgt 29512423  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |    
29512424 ttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatt-ccatctctatgggaactttatttcc 29512522  T
214 acccttttccttgggaaatttttt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
29512523 acccttttccttgggaaatttttt 29512546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28770557 - 28770212
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat-at 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||    
28770557 gggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaacataatgatgagaattttattccaaggtatata-gaaaaatgat 28770459  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||| ||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||    
28770458 gtttgtttaacgttataatattatcgggaaccataaaaatagggattataataggtaat-tacatatgaaatcattcccatcttcatgagaactttattc 28770360  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| ||||| |||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| |     
28770359 ccaccattttctttgggaaaatttttctattgctaggaacgttttatacccaggaatcaaatttagtaaacttgtaccaaacatagacatgcatatttct 28770260  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||| |||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||    
28770259 atctttttattcccaggaatctacgaatataacttgaaagaaacacac 28770212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26849492 - 26849164
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
26849492 ggtgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttttaggaataatatttcttggaatataaagatggaaattttatttcaaggtatttagaaaaaatatgt 26849393  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| |    
26849392 ttggttaactttataatattcataggaaccataaaaatagagattataataggt-aactatttatgaatttattctcatctctgtaggaactttattccc 26849294  T
214 acccttttccttggga-aattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    ||| |||| ||| | |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
26849293 accatttttctttgaatttttttttctattcccagaaactttttatacccggg----------agtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttcta 26849204  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    ||||||||||  ||| |||   ||| |||||||||||||||||    
26849203 tcattttattatcggtaat---caaatataacttgaaacaaac 26849164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 84 - 276
Target Start/End: Original strand, 19532939 - 19533130
Alignment:
84 tttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatt 183  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
19532939 tttattccaaggtatttaggaaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaa-ctatttatgaatt 19533037  T
184 tattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattta 276  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19533038 tattcccatctccaaggaaactttattcccacccttttccttggaaaaaaatttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattta 19533130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1247212 - 1246912
Alignment:
48 taggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataa 147  Q
    |||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || || ||||    
1247212 taggaataacattttttagaataaatagatgagaattttattctaaagtattcgagaaaaatatgtttggttaactctataatactccttggtactataa 1247113  T
148 aaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccag 247  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
1247112 aaatatggattataatagataa-ctatataagaatttattccgatctccatgtgaact--attcccacctttttccttcggaaattttttctattaccag 1247016  T
248 gaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttg 347  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||     
1247015 gaacattttattcttgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatatgtatttctatcattttattcccgagaatcaacaaatatagcttc 1246916  T
348 aaac 351  Q
    ||||    
1246915 aaac 1246912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 27822994 - 27823343
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta----agaaaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||    | |||||    
27822994 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattctttcgaacataaatatgagaattttattttaaggtatttagaaaaaaaaaa 27823093  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
     || |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||  ||   |||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||    
27823094 aatatttgcttaacattataatattcctagaaatcataaaaatatggattataacaggtaat-tacacatgaatttgttctcatcttcatgagaatttta 27823192  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| | | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||    
27823193 ttcccacccttttctttgggaaaattttcctatttcgatgaacgttttatactcgggaataaaatttagtaaacttatagcaaacatagacatttatatt 27823292  T
309 ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     | ||||||||||||||   |||  |  | |||||||||||||||||||||    
27823293 tctatcattttattcccataaatttatgaatataacttgaaacaaacacac 27823343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 24783934 - 24784274
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
24783934 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcataagaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggtatttaaaaaaaatatgtt 24784033  T
115 tggtt-agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||   || | ||||||||||||| ||||||||||||||||      
24784034 tggttaaactttagaatattccaaggaaccttaaaaataaagattataataggt-aattacacataattttattcccatcttcatgggaactttattcat 24784132  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    || ||||| ||| | |||   ||| |||||  | ||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||   ||    
24784133 acactttt-ctttgaaaaaactttatattcttatgaatattttata-ttaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaac--tgacatatgtatttttat 24784228  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     ||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
24784229 aattttattccaaaaaatctacaattataacttaaaacaaacacac 24784274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 40584336 - 40584670
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
40584336 gtgtgtttgtttcaagtgtaacaaatttattcctaagaataacattccttcaaatataaagataggaattttatttcaaggtatttaaaaaaaagatgtt 40584435  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||  | ||   || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
40584436 tggttaacattataatattccaaggaaccttaaaaataggaaatataataggt-gattacacataattttattcccatctccatgggaactttattccca 40584534  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    || ||||| |||| |||  ||||||||          |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||   ||     
40584535 ccattttctttggaaaaacttttctat----------attttatatccgaaaataaaatttaataaacttgtagaaaacatagacatatgcatttttatg 40584624  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaca 360  Q
    ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||| |||||    
40584625 attttattctcaggaatctacaaatataacttaaaacaaatacaca 40584670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12931287 - 12930945
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||  || |||||||| | ||  |||||| |||| |||||| ||||| ||||    
12931287 ggtgtgtttgtttcaagtgtaccaaatttattcctaaaagtaacattctttataacataaagataaaaaaattattctaaggtatttaaaaaaaagatgt 12931188  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaac-cataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    ||| |||   |||||||||| | |||||  | |||||||| ||| ||||||||||||  ||   || | |||||||||||||| |||||||||||||||     
12931187 ttgattaaaattataatatttcaaggaaatcttaaaaataaggaatataataggtaat-tacacataattttattcccatctctatgggaactttattcc 12931089  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    |||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |    
12931088 caccattttctttgagaaaacttttctattcccataaacattttata-ccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagccatatgcattttta 12930990  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||    
12930989 tgattttattcccaacaatctacaa-tataacttgaaacaaacaca 12930945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38140710 - 38140425
Alignment:
19 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggt 118  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||| |    
38140710 gtttgtttcaattttataaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaaggtgtgaattttattccaaggtatatagaaaaaagatgtttgat 38140611  T
119 tagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccct 218  Q
    || | ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||   ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
38140610 taacattataatattcctgggaacctaaaaaataaggattataatagg-aaattacacatgaacttattctcatcttcat-ggaactttattctcaccct 38140513  T
219 tttccttgggaaattttttctattcccaggaac--attttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    |||| |||| |||   |||||||||| ||||||  ||||||||| ||  |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||    
38140512 tttctttggaaaaaaatttctattcctaggaacatattttatactcgtcaataaattatagtaaacttataacaaacattgacatata 38140425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6832273 - 6832114
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
6832273 taagggtgtgtttgtttcaaatttaccaaatttattcctaagaataacattacttggaatataaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaat 6832174  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa 169  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
6832173 atgtttggttaacttcatagtattccaaagaaccttaaaaataaggattataataggtaa 6832114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2565749 - 2565462
Alignment:
62 cttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattata 161  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||          |||||    
2565749 cttgaaatacaaagatgagaattttatttcaaggtatttaa-aaaaatatgtttagttaactttataatattcatatgaaccata----------ttata 2565661  T
162 ataggtaa--actatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttata 259  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||  ||||||||||| || |||||||||||    
2565660 ataggtaactactacgtatgaatttactctcatcttcatgggaactttattcccaccattttctttggaaaaaattttctattccaagaaacattttata 2565561  T
260 cccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| ||| | || ||||||||||   |||||||||| |||||||| |||| |||||||    
2565560 cccggaaat-aaatttaacaaacttgtaacaaacacaggtatatatatttctattattttattcctaagaatcaacaaatataacttaaaacgaacacac 2565462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 358
Target Start/End: Original strand, 32071261 - 32071508
Alignment:
104 aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaa 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||  ||||||||| ||||||||| | ||    
32071261 aaaaatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaataaagattataataggt-aactacatacaaatttattctcatctccat-gtaa 32071358  T
204 ctttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat 303  Q
    |||||||||| |||||||| ||  |||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
32071359 ctttattctcgcccttttctttaagaaaatctttctatttccatgaacatttcataccc-aaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat----atat 32071453  T
304 acattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    | ||| | |||||||||||    | |||||| || |||||||| |||||||||||    
32071454 atatttctatcattttatttttagaaatcaataaatataacttcaaacaaacaca 32071508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 49216027 - 49216246
Alignment:
17 gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttg 116  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
49216027 gtgtttgttttaagttttccaaaattattcttaggaataatgttccttggaatataaagatgggaattttattccaaggtatttagaaaaaatatgtttg 49216126  T
117 gttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacc 216  Q
    |||| | |||||| ||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||| || |    || | |||||| ||||||  |||| ||||||||||| |||    
49216127 gttaaccttataaaattccaaagaaccttaaaaatatagattataataggt-aattccacataattttattaccatctttatggaaactttattcttacc 49216225  T
217 cttttccttgggaaatttttt 237  Q
    |||||| ||||||||||||||    
49216226 cttttctttgggaaatttttt 49216246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33647992 - 33647705
Alignment:
71 taaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaa 170  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||| ||||||| |||   |||||||||||     ||||||||||||||  |||||||||| |||     
33647992 taaagatgagaattttattgtaaggtattgaataaaaagatgtttgcttaatattataatattctcgaaaaccataaaaatagaaattataatagataat 33647893  T
171 ctatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataa 270  Q
     ||    ||||||||||| ||||| || || |||||||||  ||| |||||| |||| || |||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||    
33647892 -tacacgtgaatttattctcatcttcaaggaaactttatttccactcttttctttggaaatttttttatattctcagaaacgttttatacccaggaataa 33647794  T
271 aatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | | | ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||    
33647793 aatttagtaaacttgtaacaaacatagagatgtatatttctaacgttttattcccgagaatctacgaatattacttgaaacaaacacac 33647705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 18460582 - 18460750
Alignment:
19 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggt 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||||||    
18460582 gtttgtttcaagtttatcaaatttatttctacgaataacatttttcgaaatataaagatgagaatttgattacaaggtatttaaaagaaatatatttggt 18460681  T
119 tagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcc 189  Q
    || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||    
18460682 taactttataatattcata-gaaccataaaaacagggattataatcggt-aactacatatgaatttattcc 18460750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 178 - 304
Target Start/End: Original strand, 18460827 - 18460953
Alignment:
178 tgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttag 277  Q
    ||||||||||  |||||||| | ||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
18460827 tgaatttattttcatctccaagagaactttatttccaccattttctttgggaaaatttttctattcccagaaacattttataccaaagaataaaatttag 18460926  T
278 taaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
18460927 taaacttgtaacaaacatagacatata 18460953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 6927817 - 6927902
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
6927817 tgtgtttgttttaagtttatcaaatttattactaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggtattta 6927902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33650357 - 33650217
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||     
33650357 tgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttatgaataacattatttgaaatctaaagatgagaattttattctaaggtattgaataaaaaaatgtttgc 33650258  T
118 ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggatt 158  Q
    ||| | |||||||||||   | |||||||||||||| ||||    
33650257 ttaacattataatattctcggaaaccataaaaatagagatt 33650217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 100
Target Start/End: Original strand, 32070994 - 32071080
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattt 100  Q
    |||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
32070994 ggtgggtttgttttaaatttatcaaatttattcctatgaataacatttcttggaatataaagatgagaattttattccaaggtattt 32071080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28693782 - 28693428
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||  | ||  |||||     
28693782 taagggtgtgtttgtttcaaatttactaaatttattcctagaaataattttccttgaaactttaagatgagaattttatttcaaggtttatagaaaaaag 28693683  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||  ||| | |||||||||| |  | |||||||||||||   ||||||||| |  |||||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||    
28693682 atgtttatttaacattataatatttccggaaaccataaaaataaaaattataata-gacaactacatatgaa-atattctcatcttcatgagaactttat 28693585  T
210 t--ctcacc-----cttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacata 302  Q
    |  | ||||     |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |  |||||||||||| |  |||| |||||||||||  ||||    
28693584 tcccccacccttttcttttctttgagaaaatttttctattctcaggatcgttttatactcatgaataaaatttaattgacttataacaaacataagcata 28693485  T
303 tacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     | |||   ||  |||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||    
28693484 catatttttatttttttattctcgggaatctatgaatataacttgaaacaaacacac 28693428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 359
Target Start/End: Original strand, 27093763 - 27094085
Alignment:
24 tttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagct 123  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||| |     
27093763 tttcatgtttatcaaatttattcttaaaaataatattccttagaatataaagatgtgaattttatttcaaggtatt-aagaaaaagatgtttgattaaca 27093861  T
124 ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcc 223  Q
     ||||||||||| ||||||  ||||||||||        ||| || ||     | ||||||||||| |||| || |  ||||||||| ||| || ||| |    
27093862 atataatattccaaggaacattaaaaatagg--------tagttacac-----acgaatttattccaatctacaaga-aactttattttcaaccattttc 27093947  T
224 ttgggaaatttt-ttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatca-ttttat 321  Q
    |  |||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| |    
27093948 tctggatttttttttctattcccataaacattttatacccgagaataagatatagtaaacttataacaaacataggcatatatatttcaatcattttttt 27094047  T
322 tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||| | |||  |||||||| ||||||| ||||    
27094048 ttccgggaacctacacatataacttaaaacaaatacac 27094085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 359
Target Start/End: Original strand, 45826687 - 45826845
Alignment:
200 ggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagac 299  Q
    |||||||| ||| || ||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||| |||||||       
45826687 ggaacttttttcccatccttttctttgtgaatgttcttctattcccaggaacattttatatcatgaaataaaatttaataaacttgtaa-aaacatatga 45826785  T
300 atatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||  | ||| | |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
45826786 atgcagatttctatcattttattccctggaatctacaacgataacttgaaacaaacacac 45826845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6832079 - 6832016
Alignment:
237 tctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacat 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6832079 tctattcccaggaatattttatacctgg-aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacat 6832016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 303
Target Start/End: Original strand, 13642860 - 13643083
Alignment:
78 gagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactattta 177  Q
    |||||||||||| ||| | |||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||||||||||| || |    |    
13642860 gagaattttatttcaatgtattttaaaaaaatctgtttggttaactttataatatt-caaggaaccttacaaatagagattataataggt-aattccaca 13642957  T
178 tgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattta- 276  Q
    | | ||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||| ||||  |||| |||  ||||||||||| | ||||||||||||  |  ||| |||| |||     
13642958 taattttattctcattttcatggaaactttattc-caccattttttttggaaaaacttttctattcctaagaacattttataatcaagaacaaaaattag 13643056  T
277 gtaaacttgtaacaaacatagacatat 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
13643057 gttaacttgtaacaaacatagacatat 13643083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 303
Target Start/End: Original strand, 29512631 - 29512705
Alignment:
229 aaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat 303  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
29512631 aaattttttctattccgatgaacattttatactcaggaataaaatttagtaaacttgaaacaaacgtaggcatat 29512705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43715371 - 43715310
Alignment:
298 acatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43715371 acatatacatttctatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 43715310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 39932631 - 39932529
Alignment:
255 ttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagac--atatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaaca 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||  |  | ||||||||||||||    
39932631 ttatatccgggaataaaatttagtaaacttataacaaacataaacatatatacatttctatcattttattcccatgaatttatgaatataacttgaaaca 39932532  T
353 aac 355  Q
    |||    
39932531 aac 39932529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31267694 - 31267540
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  |||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||| |||  |||| |||||  ||||| ||||    
31267694 ggtgtgtttgttttaagtttatcggatttatttttaggaataacatttcttaaaatataaagatgtgaatttcattttaaggtatttagaaaaaagatgt 31267595  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta 168  Q
    || || | | |||||||||| | |  |||  |||||||| |||||||||||||||    
31267594 ttagtcaacattataatatttccataaactttaaaaataaggattataataggta 31267540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 422
Target Start/End: Original strand, 25351447 - 25351487
Alignment:
382 gttactcaagaatctgtaaaaaggaaaagttactcaagaat 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25351447 gttactcaagaatctgtaaaaaggaaaagttactcaagaat 25351487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 2566524 - 2566471
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaat 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||    
2566524 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttcttgaaataatattccttggaat 2566471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 47
Target Start/End: Original strand, 19532909 - 19532946
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcc 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19532909 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcc 19532946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28139846 - 28139726
Alignment:
235 tttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaa 334  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| || ||| | ||| |||||||||   ||||  |    
28139846 tttctattcccaagaacgttttatatccgaaaataaaatttactaatcttgtaacaaacataagcatgtatatttctatctttttattcctaagaatata 28139747  T
335 caattataacttgaaacaaac 355  Q
    | | |||||||||||||||||    
28139746 cgaatataacttgaaacaaac 28139726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 45826064 - 45826120
Alignment:
17 gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataa 73  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
45826064 gtgtttgtttccagtttactagatttattcctaggaataactttcctgggaatataa 45826120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 55435726 - 55435652
Alignment:
17 gtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattcc 91  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||    
55435726 gtgtttgtttcaagtttactagatttattcttgtgaataactttcccgggaatataaagatgggagttttattcc 55435652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 322
Target Start/End: Original strand, 33497768 - 33497889
Alignment:
202 aactttattctcacccttttccttgggaaattttttct-attcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagaca 300  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  |||||| | |||| || ||||||||| || ||  |||||||||||| |||| |||||||||| |||  ||    
33497768 aactttattctcacccttttctttaggatttttttttttattctcatgaacattttgtatcctagaataaaatttaataaatttgtaacaaatataagca 33497867  T
301 tatacattccaatcattttatt 322  Q
    | || ||| | |||||||||||    
33497868 tgtatatttctatcattttatt 33497889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 26085442 - 26085517
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattc 90  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |||| || ||| ||||||||  |||||||||||    
26085442 gtgtgttcgtttcaagtttactaaatttatttttagaaataagattctttcgaacataaagatatgaattttattc 26085517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Original strand, 44533943 - 44534009
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaaga 76  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||   |||| | ||||||||||||    
44533943 taagggtgtgtttgtttaaagtttactaaatttattcttatgaatgttattcttgggaatataaaga 44534009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9320441 - 9320405
Alignment:
300 atatacattccaatcattttattcccgggaatcaaca 336  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
9320441 atatacattcctatcattttattcccgagaatcaaca 9320405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 275
Target Start/End: Original strand, 12108215 - 12108298
Alignment:
191 atctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattt 275  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||||||||    
12108215 atcttcatgagaattttattctcactattttt-ttgggaaattttttctattcctaaaaatattttatatccgagaataaaattt 12108298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 359
Target Start/End: Original strand, 29512704 - 29512748
Alignment:
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||    
29512704 attttattcccagaaattaaaaattataacttgaaacaaacacac 29512748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27763246 - 27762901
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
27763246 ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 27763147  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
27763146 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattccc 27763047  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
27763046 acccttttccttgggaaatattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaat 27762947  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27762946 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 27762901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 55968351 - 55968002
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
55968351 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaat 55968252  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55968251 atgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 55968152  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
55968151 tcccaccctttttcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacagagacatatacattc 55968052  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55968051 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 55968002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13230338 - 13229991
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
13230338 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 13230239  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13230238 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 13230139  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
13230138 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttct 13230039  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
13230038 atcattttattcccgggaataaaaaattataacttgaaacaaacacac 13229991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39730642 - 39730295
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
39730642 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 39730543  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
39730542 gtttggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgtgaactttattc 39730443  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
39730442 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcct 39730343  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
39730342 atcattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac 39730295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41859398 - 41859049
Alignment:
9 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
41859398 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttatttcaaggaatttaggaaaaa 41859299  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41859298 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 41859199  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
41859198 ttcccacccttttccttgggaaat-ttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatt 41859100  T
309 ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
41859099 ccaatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 41859049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48519233 - 48518893
Alignment:
19 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
48519233 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgtgaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggt 48519134  T
119 tagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccct 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
48519133 tagctttataatattcctaggaaccataaaaataggtattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct 48519034  T
219 tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
48519033 tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt 48518934  T
319 tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
48518933 tattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac 48518893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 42773672 - 42774021
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
42773672 taagggcgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctagaaataacattccttggagtataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 42773771  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42773772 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 42773871  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
42773872 tcccacccttttccttgggaaattttttttatccccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc 42773971  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
42773972 caatcattttattcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 42774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6280270 - 6279923
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
6280270 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcataggaataacattccttggaatataaaaataggaattttattccaaggaatttatgaaaaatat 6280171  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
6280170 atttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattc 6280071  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
6280070 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcat 6279971  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6279970 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 6279923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 48879051 - 48879398
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||    
48879051 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaatattattccaaggaatgtaggaaaaatat 48879150  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48879151 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 48879250  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
48879251 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttct 48879350  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48879351 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 48879398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 43722986 - 43723337
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
43722986 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaagaatttaggaaaa 43723085  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
43723086 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaacttt 43723185  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
43723186 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat 43723285  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43723286 ttctatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 43723337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45748144 - 45747798
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
45748144 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatat 45748045  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
45748044 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataat-ggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 45747946  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
45747945 ccccccttttccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct 45747846  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45747845 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 45747798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 35999412 - 35999759
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
35999412 agggtttgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaagaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 35999511  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35999512 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 35999611  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
35999612 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttct 35999711  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
35999712 atcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 35999759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 25932165 - 25932514
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
25932165 taagggtgtgtttgtttcaagtttcccaaatttattcctaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 25932264  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25932265 atgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 25932364  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
25932365 tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattt 25932464  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
25932465 ctatcattttattcctaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 25932514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 355
Target Start/End: Original strand, 45595992 - 45596337
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
45595992 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 45596091  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
45596092 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttat 45596191  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
45596192 tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattt 45596291  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
45596292 ctatcattttattcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaac 45596337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Original strand, 40435628 - 40435973
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
40435628 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 40435727  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
40435728 ttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattccc 40435827  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
40435828 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctat 40435927  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40435928 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 40435973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50673245 - 50672910
Alignment:
20 tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtt 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
50673245 tttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttgaaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtttggtt 50673146  T
120 agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
50673145 agctttataatattcctaggaaccataaaa-tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctt 50673047  T
220 ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
50673046 ttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcatttt 50672947  T
320 attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
50672946 attccc-ggaatcaacaat--taacttaaaacaaacacac 50672910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18405586 - 18405236
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||    
18405586 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattctcaggaatttaggaaaa 18405487  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18405486 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaacttt 18405387  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
18405386 attctcacccttttcctt-ggaaattttttttattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat 18405288  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18405287 ttctataattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 18405236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 23686513 - 23686860
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
23686513 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttgaaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 23686612  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23686613 gtttggttagttttataatattcctaggaaccataaaaatatgaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 23686712  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |     
23686713 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaatattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttct 23686812  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23686813 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 23686860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 935850 - 936199
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||    
935850 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaagaataacatttcttggaatataaagataggaattttattccaaagaatttaggaaaaat 935949  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
935950 atgtttggttagctttataatattcctaggaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttat 936049  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
936050 tcccaccctttttcttgtgaaattttttctattcccaggaacattttatgcccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagggatatatattc 936149  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
936150 caatcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 936199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 47670086 - 47670435
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
47670086 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaat 47670185  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
47670186 atatttggttatctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatcttcatggaaactttat 47670285  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
47670286 ttccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattt 47670385  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
47670386 ctatcattttatttccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 47670435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41744568 - 41744222
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
41744568 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattcattggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 41744469  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
41744468 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactaattatgaatttattctcatctccataggaactttattccc 41744369  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc-cgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
41744368 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaagaaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttcta 41744269  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
41744268 tcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaataaacacac 41744222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39835656 - 39835309
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
39835656 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctatgaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 39835557  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
39835556 gtttggttaactttataatattcctagaaatcataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctaatctccatgggaactttattc 39835457  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||       
39835456 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatacatttat 39835357  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39835356 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 39835309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Original strand, 8321971 - 8322308
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
8321971 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattacaaggaatttaggaaaaatat 8322070  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
8322071 gtttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattc 8322170  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
8322171 ccacccttttccttggaaatttttttctattcccaagaatattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttct 8322270  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaa 349  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
8322271 atcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaa 8322308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34049904 - 34049599
Alignment:
54 taacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatag 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
34049904 taacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgtttggttagctttataatattccaaggaaccataaaaatag 34049805  T
154 ggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacat 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
34049804 ggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaattttttctattcccaggaacat 34049705  T
254 tttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaa 353  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
34049704 tttataccctggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaa 34049605  T
354 acacac 359  Q
    ||||||    
34049604 acacac 34049599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 27555149 - 27555483
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
27555149 attaagggtgtgtttgtttcaagtttactaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaa 27555248  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27555249 atatgtttggttagctttat-atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 27555347  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||                ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27555348 attcccacccttttccttgggaaattttt----------------ttttatacccgcgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 27555431  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
27555432 tcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 27555483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 27942465 - 27942814
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
27942465 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacatttttaggaatataaatatgagaattttatttcaaggaatttagaaaaaatatgt 27942564  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |    
27942565 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatttcaatgggaactttattccc 27942664  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgta------acaaacatagacatatacat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      | ||||||||||||||||||    
27942665 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataataaacataaacatagacatatacat 27942764  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27942765 tcctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 27942814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 18931482 - 18931826
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18931482 gtgtgtttgttttaagtttatcaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaagatagaaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 18931581  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
18931582 tggttagctttataatattcctatgaactataaaaatagggattataataggaaaattatttataaatttattcccatctccatgggaactttattccca 18931681  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
18931682 ccatttttcttggaaatttttttctattcccaggaacattttatacacgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatatacattcctatc 18931781  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
18931782 attttattcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 18931826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 32953249 - 32953596
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
32953249 agggtatgtttgtttcaagtttatctaatttatttctagaaataatattcattggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 32953348  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
32953349 gtttggttagctttataatatttcaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattc 32953448  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
32953449 ccaccattttccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaagataggcatatacattcct 32953548  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
32953549 atcattttgttcctgggaatcaacaattataacttgagacaaacacac 32953596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34238295 - 34238007
Alignment:
20 tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtt 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34238295 tttgtttcaagtttatcaaatttattcataggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtt 34238196  T
120 agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
34238195 agctttataatattcctaggaacaaaaaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctt 34238096  T
220 ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
34238095 ttccttgggaaattgtttctattcccaagaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatt 34238007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 359
Target Start/End: Original strand, 39498590 - 39498898
Alignment:
51 gaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39498590 gaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatatttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaa 39498689  T
151 tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||    
39498690 tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgagaactttatttccacccttttccttggaattttttttctattcccatgaa 39498789  T
251 cattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaa 350  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
39498790 cattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaa 39498889  T
351 caaacacac 359  Q
    |||||||||    
39498890 caaacacac 39498898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 359
Target Start/End: Original strand, 39501929 - 39502237
Alignment:
51 gaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39501929 gaataacattccttggaatataaagatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatatttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaa 39502028  T
151 tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||    
39502029 tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgagaactttatttccacccttttccttggaattttttttctattcccatgaa 39502128  T
251 cattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaa 350  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
39502129 cattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaa 39502228  T
351 caaacacac 359  Q
    |||||||||    
39502229 caaacacac 39502237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 104 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25916290 - 25916037
Alignment:
104 aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaa 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
25916290 aaaaatatgtttgattagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaa 25916191  T
204 ctttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
25916190 ctttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc--at 25916093  T
304 acattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
25916092 acattcctatcattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac 25916037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 48873747 - 48873978
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||    
48873747 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaatattattccaaggaatgtaggaaaaatat 48873846  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48873847 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 48873946  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattc 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
48873947 ccacccttttccttgggaaattttttctattc 48873978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31938217 - 31937871
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
31938217 gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcataggaataacattccttggaatttaaagatgaaaattttattccaaggtatttaggaaaaatatg 31938118  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
31938117 tttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggt-aactgtttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcc 31938019  T
213 caccc-ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||  ||       
31938018 caccctttttccttggaaaattttttttattcccaagaacattttatatttgggaataaaatttaataaacttctaacaaacatatgcatgtatgttttt 31937919  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    || ||||||||  |   |||| ||||||||||||||||||||||||||    
31937918 atgattttattttcaaaaatctacaattataacttgaaacaaacacac 31937871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Original strand, 7258691 - 7259031
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |  |||| |||    
7258691 gggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattctcaggaataacattccttggaatataaatatgggaattttattccaaggtatttgaataaaagatg 7258790  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
7258791 tttggttaacattttaatattccaaggaaccataaaaattaggactataataagtagt-tacaaatgaatttattcccatattcatgggaactttattcc 7258889  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaa 312  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | |    
7258890 cactcttttcttttggaaattttttctattcccaggaacattttatacgcggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacaaagacatgtatatt-cta 7258988  T
313 tcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    |||||||||||   |||||| || | |||||||||||||||||    
7258989 tcattttattctaaggaatctaccaatataacttgaaacaaac 7259031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 51968500 - 51968850
Alignment:
7 tattaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||    
51968500 tatttagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttcgtacgtaaagatgagaattttattccaaggtatatagaaaa 51968599  T
107 aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 206  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||  || || ||  |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
51968600 aagatgtttgtttaacattataatatttctgagaaccataaaaataaggattataat--gt-aattacatatgaaattatttccatcttcatgggaactt 51968696  T
207 tattctcaccc-ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatac 305  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |     
51968697 tattcccaccctttttctttgggaaacattttctattcccaggaacgttttatactcaagaataaaatttagcaaacttgtaacaaacataggcatgcat 51968796  T
306 attccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||| | ||| |||||||||| | |||  || | |||||||||||||||||||||    
51968797 atttctatctttttattcccagaaatttacgaatataacttgaaacaaacacac 51968850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 52469427 - 52469734
Alignment:
16 tgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattcctt-ggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||   ||||| | ||||| ||||    
52469427 tgtgtttgttttaagttaatcaaatttattcttaggaataacattcctttggaatataaagattgaaattttataccaaaatatttagaaaaaaacatgt 52469526  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
52469527 ttggttagctttataatattcctatgaaccataaatatagagattataataggtaa-ctatattggaatttatttccatctccatgggaactttattccc 52469625  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    |||  ||||||||| |||   |||||||||| || ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||    
52469626 accaatttccttggaaaaaaatttctattcctagaaacattttattgccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacatagacatatgcaattctat 52469725  T
314 cattttatt 322  Q
    |||||||||    
52469726 cattttatt 52469734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 126 - 359
Target Start/End: Original strand, 30415743 - 30415975
Alignment:
126 ataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcctt 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||  |||| || ||||||| |||| ||||| ||    
30415743 ataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaat-tatttatgaaattattttcatctttatggaaattttattcccaccattttcttt 30415841  T
226 gggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattccc 325  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  |    
30415842 gggaaattttttctattccaaagaacattttatatttgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacagacatatatattcctatcattttattatc 30415941  T
326 gggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
30415942 gggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 30415975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 110 - 359
Target Start/End: Original strand, 38414032 - 38414277
Alignment:
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
38414032 atgtttgggtaactttataatattcttagaaaccataaaaataggaattataataggtaa-ctacatatgaatttattaccatctccatgagaactttat 38414130  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||     
38414131 tcccacccttttccttgggaaattttttatattcccggaaacattttata-catggaataaaatttagtaaacttattacaaacatagacatgtatattt 38414229  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||    
38414230 ctatcattttattccc--gaatcaacaaatataactttagacaaacacac 38414277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 323
Target Start/End: Original strand, 38394634 - 38394943
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||    
38394634 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaagactaatatttcttagaacataaatatgagaattttatttcaaggtatttagaaaaaagatg 38394733  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||| |||   ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||     
38394734 tttgcttaatattataatatttttgggaaccataaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttatttccatctctatcagaactttattcc 38394832  T
213 ca-cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
    || |||||||| ||||||| |||||| |||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||     
38394833 caccccttttctttgggaatttttttatatttccagaaatattttata-ctaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatgtatattccc 38394931  T
312 atcattttattc 323  Q
    ||| ||||||||    
38394932 atcgttttattc 38394943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 36858135 - 36858351
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
36858135 gggtgtgcttgttacaagtttataaaatttattcttaagaataacattccttgtaatacacagatgggaatttcattc-aaggtatttaagaaaaatatg 36858233  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
36858234 tttggataactttgtaatattcctaggaaccataaaaataaggattataacaggt-aactatatatgaatttattcccatctccatgagaattttattcc 36858332  T
213 cacccttttccttgggaaa 231  Q
    |||||||||| ||||||||    
36858333 cacccttttctttgggaaa 36858351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47426567 - 47426269
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||               |||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||     
47426567 gggtgtgattgtttcaagtttaccaaatttatttttaggaataacat---------------gatgggaattttattcaaaggtatttagaaaaaatata 47426483  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||      
47426482 tttggttaactttataatattcctaggaacc-------tagggattataataggt-aactatttatgaatttattttcatcttcatgggaactttattgc 47426391  T
213 caccc-ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat-acattcc 310  Q
    ||||| |||| ||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
47426390 cacccttttttcttgataatatttttctatttccaggaacattttatatcaagaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataatattca 47426291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Original strand, 30790275 - 30790518
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| |||    
30790275 gggtgtgtttgtttcaagtttagcaaatttatttctaggagtaacattc-ttggaatataaagatgagaaatttattccaaagtatttaaaaaaaagatg 30790373  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct 212  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||  || ||     || | |||||| |||||| ||||| ||||||||||     
30790374 tttggttaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagaatttataataattacac-----ataattttatttccatcttcatggaaactttattcc 30790468  T
213 cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc 262  Q
    || ||||||| |||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
30790469 catccttttcattggaaaaacttttctattctcagaaacattttataccc 30790518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 101 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36858636 - 36858380
Alignment:
101 aagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgg 200  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||| |||||| ||||| |||||    
36858636 aagaaaaatatgtttgtttaacattataatattcccggaaaccataaaaatagggattataatatgtaat-tacatatgaaattattctcatcttcatgg 36858538  T
201 gaactttattctcacccttttccttgggaaatttttt---ctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag 297  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||  || ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
36858537 gaactttattcccacccttttatttg--aattttttttttctattctcaggaacattttatacccgggcataaaatttagtaaacttgtaacaaacataa 36858440  T
298 acatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     |  || |||| | ||| ||||||||  ||||||| |  | |||||||||||||||||||||    
36858439 gc--atgcatttctatctttttattcttgggaatctaagaatataacttgaaacaaacacac 36858380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 205 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10400961 - 10400810
Alignment:
205 tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
10400961 tttattcccaccaatttctttgggaaattttttctatttccaggaatattttatacccaagaataaaatttagtaaacttgtaataaacatagacatata 10400862  T
305 cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 356  Q
    |||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
10400861 catttctatcattttattcccaaaaatcaacaaatataacttgaaacaaaca 10400810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37014724 - 37014451
Alignment:
20 tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtt 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||  ||||| ||||||||||    
37014724 tttgtttcaagtttacaaaatttattcctaagaataatattttttggaatataaagatgcgaattttattcgaagatatttagaaaaaagatgtttggtt 37014625  T
120 agctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctt 219  Q
    | | |||||||||| | || || | |||||||| | |||||| || | ||| ||   |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||| |||    
37014624 aacattataatatttc-agaaatcttaaaaataagaattatagtaag-aaattacacatgaatttattctcatcttcatgagaactttatttccactctt 37014527  T
220 ttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||  |||||||||| ||||||  ||||||||||    
37014526 ttctttgggaaattttttctattcctatgaacatgttatacctggatataaaatttaataaactcataacaaacat 37014451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 124 - 359
Target Start/End: Original strand, 18405592 - 18405826
Alignment:
124 ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcc 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||     
18405592 ttataatatttctaggaaccataaaaatagagattataataggtaat-tacacatggatttattcccatcttaatgagaactttattcccacccttttct 18405690  T
224 ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattc 323  Q
    || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||   ||| ||||||||    
18405691 ttaggaaaaattttctattcctaggaacattttatacctagaaataaaattttgtaaacttgtaacaaacatagatatgtatatttatatcgttttattc 18405790  T
324 ccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     ||| ||||    | |||||||| ||||||||||||    
18405791 tcggaaatctctgaatataacttaaaacaaacacac 18405826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10401126 - 10400973
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||  || ||  ||||| |||||    
10401126 gtgtgtttgttttaagtttaccaaatttatttctggaaataacattctttgaagtataaaaatgagaattttattccaagatatatagaaaaaacatgtt 10401027  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa 169  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
10401026 tggttag-tttataatattcctcggaaccataaaaataaggattataataggtaa 10400973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 304
Target Start/End: Original strand, 48059804 - 48060073
Alignment:
35 ccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaatatgtttggttagctttataatatt 133  Q
    |||||||||||| || |||||| |||  || |||||||| ||||||||||||||| | | | ||||| | ||||||||||||  |||  |||||||||||    
48059804 ccaaatttattcttacgaataatattttttagaatataatgatgagaattttatttcgatgtatttagaaaaaaatatgtttaattaattttataatatt 48059903  T
134 cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaatt 233  Q
     |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||   || |  ||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||    
48059904 tctaggaattataaaaataagaattataataggtaat-tatatatgaatttatttatatttttatgagaactttattcccaccattttatttgggaaatt 48060002  T
234 ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    |||||||||||||  || |||||||| ||   ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
48060003 ttttctattcccataaatattttatatccaaaaataaaatttaataaactcgtaacaaacataaacatata 48060073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 38413902 - 38414015
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
38413902 agggcgtgtttgtttcaagtttaccaaatttaattttagaaataacattccttggaatataaagatgagaatttaattccaaggtatttagaaaaaatat 38414001  T
112 gtttggttagcttt 125  Q
    ||||||||| ||||    
38414002 gtttggttaacttt 38414015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24805397 - 24805088
Alignment:
55 aacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaa------ 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||| |||||  ||||| ||||||| ||| | |||||||||| || |||||||||||          
24805397 aacattccttggaacataaagatgtgaattttactttaaggtatttagaaaaaagatgtttgcttaacattataatattactgggaaccataaaccataa 24805298  T
149 -aatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc-acccttttccttgggaaattttttctattccca 246  Q
     |||||||| ||||||||||||  ||   ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
24805297 aaatagggaatataataggtaat-tacacatggatttattcccatattcatgggaactttattttccaccattttctttgtgaaattttttctattccca 24805199  T
247 ggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataactt 346  Q
      ||  |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||    || |||||||| | | |||| || |  |||||||    
24805198 a-aatgttttattcccgaaaataaaatttagtaaatttgtaacaaacataaacatgtatatttttttcgttttattctcagaaatctacgaaaataactt 24805100  T
347 gaaacaaacaca 358  Q
    ||||||||||||    
24805099 gaaacaaacaca 24805088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 355
Target Start/End: Original strand, 44309497 - 44309829
Alignment:
22 tgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttag 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  || |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||| ||||||     
44309497 tgtttgaagtttactaaatttatttttaagaataatatttcttagaacataaagatgagaatttaatttcaaagtgtttaggaaaaatatgtatggttaa 44309596  T
122 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccctttt 221  Q
    | |||||||||||    |||   |||||||||||||||||| || |||  ||   || |||  |||  ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
44309597 cattataatattctcgagaatactaaaaatagggattataacagataat-tacacattaataaattttcatattcatgggaactttattcccaccctttt 44309695  T
222 ccttgggaaatttttt-ctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatttta 320  Q
    | || ||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| | ||| |||||    
44309696 ctttaggaaatttttttctattctctagaacgttttatactagg-aataaaatttagtaaccttgtaacaaacatagacatgcatatttctatcgtttta 44309794  T
321 ttcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    ||  | | |||| || | |||||||||||||||||    
44309795 ttttcagaaatctacgaatataacttgaaacaaac 44309829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 359
Target Start/End: Original strand, 26165156 - 26165437
Alignment:
80 gaattttattccaaggaattta-agaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata---ggtaaactatt 175  Q
    ||||||||||| || | ||||| | ||||| |||||||||||   |||||||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||   |||||  |||     
26165156 gaattttattctaaagtatttagaaaaaaagatgtttggttaatattataatatttcaaagaaccttaaaaatagggaatataataataggtaat-tata 26165254  T
176 tatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattt 275  Q
     || | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||  ||||||||||  || |||||||||||  |  |||||||||||    
26165255 cataattttattctcatcttaatgggaactttattctcactattttctttatgaaaacttttctattctaag-aacattttatattcatgaataaaattt 26165353  T
276 agtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||   || ||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
26165354 agtaaacttgtaacaaacataaacatgtgcatttttatgattttattctcaggaatctacaaatataacatgaaacaaacacac 26165437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 36860104 - 36860027
Alignment:
13 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattc 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
36860104 gggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaacataaaaatggaaattttattc 36860027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Original strand, 18094073 - 18094259
Alignment:
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||   ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
18094073 atgtttagttaacattataatatttttaggaatcataaaaatatgaattataataggtagt-tacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttat 18094171  T
210 tctcacccttttccttggga--aattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    ||||||| ||||| |||| |    ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
18094172 tctcaccattttctttggaattttttttttctattcctagaaacattttatacccgaaaataaaa-ttagtaaacttctagcaaacata 18094259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Original strand, 18405127 - 18405217
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| |||||    
18405127 taagggtgtgtttgttttaagtttgccaaatttattcttaggaataacattccttgaaatataaagatgggaa-tgtattccaaggtattta 18405217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12276075 - 12275953
Alignment:
197 atgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||   |||||||| | ||||| || ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
12276075 atgggaattttattcccaccttttcttttgggaaaatatttctttttccaagaacattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 12275976  T
297 gacatatacattccaatcatttt 319  Q
     ||||||| ||| | ||||||||    
12275975 aacatatatatttctatcatttt 12275953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25916362 - 25916302
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttc-aagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatat 71  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25916362 agggtgtgtttgtttctaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatat 25916302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 120
Target Start/End: Original strand, 52413959 - 52414061
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg 117  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||  ||||||||||||||    
52413959 tgtttgcttcaaatttaccaaatttattcttagaaataacaacccttggaatataaagatgtgaattttatttcaagcgaattagaaaaaatatgtttgg 52414058  T
118 tta 120  Q
    |||    
52414059 tta 52414061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34237480 - 34237424
Alignment:
301 tatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 357  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34237480 tatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac 34237424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32384650 - 32384492
Alignment:
104 aaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaa 203  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| || |    || ||||| |||| ||||  |||||||    
32384650 aaaagtatgtttgcttaacattataatattcctggaaaccataaaattagggattataataggt-aattgcacataaatttgttccaatctttatgggaa 32384552  T
204 ctttattctcacccttttccttgggaaa-ttttttctattcccaggaacattttataccc 262  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||    
32384551 ttttattcccacccttttctttgggaaatttttttctgtttccatgaacgttttataccc 32384492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22654638 - 22654515
Alignment:
202 aactttattctcacccttttccttggga--aattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagac 299  Q
    |||||||||| |||||||||  || |||  || ||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |    
22654638 aactttattcccaccctttttttttggagaaagtttttctattcgcaataacattttttacccgagaataaaaattagttaacttgtaataaacataggc 22654539  T
300 atatacattccaatcattttattc 323  Q
    || || ||| | ||||||||||||    
22654538 atgtatatttctatcattttattc 22654515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 163
Target Start/End: Original strand, 37296473 - 37296580
Alignment:
50 ggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccat-aaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||       ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||| | |||    
37296473 ggaataacattccttggaatataaatatgtgaattttattccaagga-------aaaaaaatgtttggttaacattagaatatccctaagaaccttaaaa 37296565  T
149 aatagggattataat 163  Q
    ||||| |||||||||    
37296566 aatagagattataat 37296580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9327342 - 9327247
Alignment:
265 gaataaaatttagtaaacttgtaa-caaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
9327342 gaataaaatttagtaaacttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataacttgaaataaaaacac 9327247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9374101 - 9374006
Alignment:
265 gaataaaatttagtaaacttgtaa-caaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
9374101 gaataaaatttagtaaacttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataacttgaaataaaaacac 9374006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12276260 - 12276178
Alignment:
11 aagggtgtg-tttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaa 93  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| |||    
12276260 aagggtgtgatttgtttcaagtttactaaatttatttataggaataacatt-ttttgaatataaagatgtgaattttatttcaa 12276178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 359
Target Start/End: Original strand, 36860106 - 36860190
Alignment:
274 ttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
36860106 ttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatttatatcattttatt-taagaaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 36860190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Original strand, 14796295 - 14796439
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg 117  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||||||||  ||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||  || | |||||  ||||| |||||||     
14796295 tgtttattttaagtttgtcaaatttatttttaggaataatattttttagaatataaagatgtgaattttattttaaagtatttagaaaaaagatgtttgt 14796394  T
118 ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataa 162  Q
    ||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||  ||||||||    
14796395 ttaacattatgatatttttaggaaccttaaaaataaagattataa 14796439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Original strand, 54478495 - 54478555
Alignment:
236 ttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
54478495 ttctatttccaataacattttatacccatgaatgaaatttagtaaacttataacaaacata 54478555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 120
Target Start/End: Original strand, 54478366 - 54478437
Alignment:
49 aggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggtta 120  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||    
54478366 aggaatagcatttcttgaaatataaatatgtgaattttattctaaggtatttagaaaaaagatgtttggtta 54478437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9297236 - 9297144
Alignment:
201 gaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat 295  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||    ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
9297236 gaactttattctcaca-ttttctttgcgaaagtttttctattccgcaaaacattttacatttggga-taaaatttagtaaacttgtaacaaacat 9297144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9382379 - 9382297
Alignment:
265 gaataaaatttagtaaacttgtaa-caaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataactt 346  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||    ||||||||||| ||||||||    
9382379 gaataaaatttagtaaatttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataactt 9382297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 1316741 - 1317087
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
1316741 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 1316840  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
1316841 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattc 1316940  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
1316941 ccacccttttccttgggaaa-tttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcca 1317039  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1317040 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 1317087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 2657422 - 2657769
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
2657422 agggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 2657521  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2657522 gtttggttaactttataatattcctagtaatcataaaaatatggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 2657621  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcca 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
2657622 ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcct 2657721  T
312 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2657722 atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 2657769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7053927 - 7053572
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
7053927 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcttaggaataacattccttggaatataaatatgggaattttattccaaggaatttatgaaaaatat 7053828  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7053827 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 7053728  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatt--------ttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatat 303  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
7053727 ccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatat 7053628  T
304 acattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7053627 acattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 7053572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 18897640 - 18897989
Alignment:
9 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
18897640 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaa 18897739  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18897740 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 18897839  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
18897840 tttccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatatacatt 18897939  T
309 ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
     | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18897940 tctatcactttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 18897989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 14170740 - 14171082
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
14170740 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttatttctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgtt 14170839  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
14170840 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttatt-ccatctccatgggaactttattccca 14170938  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
14170939 cccttttcctt-ggaaattttttctattcccaggaacattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatagattcctatc 14171037  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
14171038 attttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacac 14171082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Original strand, 16968649 - 16968989
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
16968649 ggtgtgtttgtttcaagtttatcaaatttatttctaggaataacattctttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaggaaaaatatgt 16968748  T
114 ttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctc 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
16968749 ttggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattccc 16968848  T
214 acccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
16968849 acccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatagattcctat 16968948  T
314 cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa 354  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
16968949 cattttattctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaa 16968989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Original strand, 8029025 - 8029297
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
8029025 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatggaaattttattccaagaaatttaggaaaaatat 8029124  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8029125 gtttggttggctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 8029224  T
212 tcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaactt 284  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
8029225 ccacccttttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaactt 8029297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 124 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7344320 - 7344085
Alignment:
124 ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
7344320 ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcc 7344221  T
224 ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
7344220 ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcatatacattcctatcattttattc 7344121  T
324 ccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     ||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||    
7344120 tcggaaatttacaattataatttgaaacgaacacac 7344085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10246465 - 10246259
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
10246465 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattccaaggaatttaggaaaaatat 10246366  T
112 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10246365 gtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc 10246266  T
212 tcaccct 218  Q
     ||||||    
10246265 ccaccct 10246259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6706103 - 6705767
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||    
6706103 taagggtatgtttgtttcaagtttaccaattttatttctaggaataacattccttgaaatataaagatgagaattttattctaaggtatttagaaaaaat 6706004  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat 209  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||            |||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
6706003 atatttggttaactttataatattcctaagaactataaaaacagg------------taaa-tacatatgaaattattctcatctccatgggaactttat 6705917  T
210 tctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc 309  Q
    || |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
6705916 tcccacccttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatatattt 6705817  T
310 caatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    | | |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||    
6705816 ctaccattttattccaatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac 6705767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 346179 - 345833
Alignment:
9 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa 108  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||     || ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  |||||    
346179 ttaagggtgtgtttgttttaaatttaccaaatttatttt---gattag--ttctttggaatataaagatgagaattttattctaagacatttagaaaaaa 346085  T
109 tatgtttggttagctttataatattcct-aggaa-ccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt 206  Q
     ||||||| ||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||    
346084 gatgtttgcttaacattataacattcctgaggaaaccataaaaataggaattttaatagg-aaattactcatgaatttattctcatctccattggaactt 345986  T
207 tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca 306  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
345985 tattcccacccttttctttgggaaaaattttctattcctaaaaacgttttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgta 345886  T
307 ttccaatcatttta-ttcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca 358  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||| || | |||||||| |||||||||||    
345885 ttcctatcattttatttcctaggaatctacgaatataacttaaaacaaacaca 345833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14781955 - 14781685
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||    
14781955 gtgtgtttgtttcat-tttaccaaatttattcctgggaataacattcattggaacataaagatgagaattttattccaaggtatttagaaaaaagatgtt 14781857  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    || ||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||     |||||      ||    
14781856 tgcttaacattataatattcctgggaaccataaaagtaggatttataataggt-aattactcatgaatttattcccatctcc----taactt-----cca 14781767  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    |||||||| || |||||   |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
14781766 cccttttcttttggaaaaaatttctattcccatgagcattttatacctaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 14781685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7344827 - 7344723
Alignment:
28 aagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttggttagctttat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
7344827 aagtttatcaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaatatgagaattttattctaaggaatttaggaaaaatatgtttggttagctttat 7344728  T
128 aatat 132  Q
    |||||    
7344727 aatat 7344723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 273 - 359
Target Start/End: Original strand, 8029316 - 8029402
Alignment:
273 tttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8029316 tttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 8029402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21008322 - 21008208
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg 117  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
21008322 tgtttgtttcaagtttattaaatttatttttatgaataacatttcttggaatataaagatgagaattttattccaaggcatttagaaaaaatatgtttgg 21008223  T
118 ttagctttataatat 132  Q
    ||| |||||||||||    
21008222 ttaactttataatat 21008208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 184 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10849961 - 10849785
Alignment:
184 tattcccatctccatgggaactttattctcacccttttcctt-gggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaac 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| |||||    
10849961 tattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttacacccaggaagaaaagttactaaac 10849862  T
283 ttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||| || ||||  | ||| | | | |||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
10849861 ttgtaactaatataggaagatataattctatcattttattcccaggaatctataaaaataacttgaaacaaacacac 10849785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9762387 - 9762232
Alignment:
14 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaattta-agaaaaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||| |||    
9762387 ggtgtgtttgtttcaagtttaccaagtttattattaggaataacattccttggattataaatatgtgaattttattcaaaggtatttagataaaaagatg 9762288  T
113 tttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta 168  Q
     |||| || | |||||||||||  | ||||| ||||||||  ||||||||||||||    
9762287 attgggtaacattataatattctcatgaaccttaaaaataaagattataataggta 9762232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21008208 - 21008035
Alignment:
176 tatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattt 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||  || | |  ||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||    
21008208 tatgaatttattcccatctctatgagaactttattccca-cctttttgtttgaattttttttctattcccaagaacatttcatgttcgggaataaaattt 21008110  T
276 agtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaa 350  Q
    ||||||| ||||||||| | || |||||| |||   |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
21008109 agtaaacctgtaacaaatagaggcatatatatttttatcattttattcccagaaatcaacaaatataacttgaaa 21008035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 268
Target Start/End: Original strand, 8314614 - 8314873
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| | |||  |||||||||| |||  |||||  |||||     
8314614 taagggtacgtttgttttaagtttatcaaatttattcctagaattaacattacttgcaatatacacatgtaaattttattctaagatatttagaaaaaaa 8314713  T
110 atgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccca-tctccatgggaacttta 208  Q
    |||||| |||| | |||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  | ||||||||||| || ||| ||||| |||||||    
8314714 atgtttagttaacattataataattcaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaat-tacatttgaatttattctcaatcttcatggaaacttta 8314812  T
209 ttctca-cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaat 268  Q
    |||||| |  ||||  || |||||  ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||    
8314813 ttctcatcattttttttttggaaaaattttctattgccagaaacattttatatacgggaat 8314873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11570136 - 11570071
Alignment:
9 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaa 74  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11570136 ttaatggtgtctttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaa 11570071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 359
Target Start/End: Original strand, 3869391 - 3869574
Alignment:
175 ttatgaatttattcccatctccatgggaactttattct---cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaa 271  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||  |||||||||||   ||||||||||| ||    ||||||    
3869391 ttatgaatttattctcatcttcgtgggaactttattctcaccaccattttctttgggaaaacttttctattccattgaacattttatgcc----aataaa 3869486  T
272 atttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||| | ||| | |||||||| |||  ||| | ||| | |||||||||||||| | |||| ||||  ||||||||||||||||||||    
3869487 atttaatgaacatttaacaaacgtagtaatacatatttctatcattttattcccagaaatctacaaaaataacttgaaacaaacacac 3869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 12328062 - 12328216
Alignment:
9 ttaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaa 108  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| | |||||  ||| |    
12328062 ttaagggtctgtctgtttcaaatttaccaaatttatttctagtaataacatt-ctttgaatataaagatgtgaatttcatt-caatgtatttagaaaaga 12328159  T
109 tatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta 168  Q
     ||||||| ||| | |||||||||||  ||||||| |   ||||||| ||||||||||||    
12328160 gatgtttgattaacgttataatattctaaggaacctt---aatagggtttataataggta 12328216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9760497 - 9760376
Alignment:
234 ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatca 333  Q
    |||||||||| || |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || | | | |||||||||||| |  || ||     
9760497 ttttctattctcatgaacattttatatcctgaaataaaatttagtaaacttataacaaaaataggcatgtataattcgatcattttattctcaagagtct 9760398  T
334 acaattataacttgaaacaaac 355  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
9760397 acaaagataacttgaaacaaac 9760376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 296
Target Start/End: Original strand, 8314885 - 8314919
Alignment:
262 cgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8314885 cgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata 8314919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10246258 - 10246224
Alignment:
325 cgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10246258 cgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 10246224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Original strand, 3869218 - 3869295
Alignment:
12 agggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttatt 89  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||    
3869218 agggggtgtttgtttcaagtttagtagatttattcccaagaataactttcctggaaatataaggatgagagttttatt 3869295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 201644 - 201994
Alignment:
8 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
201644 attaagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgggaattttattctaaggaatttaggaaaa 201743  T
108 atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
201744 atatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaacttt 201842  T
208 attctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
201843 attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaatattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat 201942  T
308 tccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
201943 tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 201994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 143342 - 143678
Alignment:
19 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaatttt-attccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||   ||||||||||||||    
143342 gtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaatttttatttcaaggtatttggaaaaaatatgtttgg 143441  T
118 ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccc 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
143442 ttaactttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaa-ctacatatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacca 143540  T
218 ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatt 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||    
143541 ttttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtatacatatatatttctatcatt 143640  T
318 ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac 355  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
143641 ttattctcaggaatcaacaaatttaacttgaaacaaac 143678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 325
Target Start/End: Original strand, 119051 - 119355
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg 117  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||  |||||  |||||||    
119051 tgtttgctttaagtttaccaaatttattcttaaaaataacattcattggaatataaagatgtgaattttatttca-gatatttagaaaaaaggtgtttgg 119149  T
118 ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcaccc 217  Q
    | | |  |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||   |||| ||||||| ||||| | ||  |||||||||  |||||    
119150 tgaacactataatattccccggaaccttaagaatagggattataataggtagt-tacacatga-tttattctcatctgcctgaaaactttatttccaccc 119247  T
218 ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcatt 317  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||    
119248 ttttctttggaaaaaattttctattcccaggaacattttatactcatgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcatt 119347  T
318 ttattccc 325  Q
     |||||||    
119348 gtattccc 119355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29298 - 28957
Alignment:
15 gtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtt 114  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
29298 gtgtgtttattttaagtttatcaaatttattcctatgaataacattttttggaatataaagataggaattttattccaaggaatttagaaaaaatatgtt 29199  T
115 tggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
29198 tggttagctttataatattcctaggaattataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattccca 29099  T
215 cccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatc 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
29098 cccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatc 28999  T
315 attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca 356  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
28998 attttattcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaaca 28957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0662 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:

Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 4186 - 4537
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||     
4186 taagggtgtgtttgtttcaagtgcaccaaatttattcctatgaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggtatttaggaaaaaa 4285  T
110 a-tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa----actatttatgaatttattcccatctccatgggaac 204  Q
    | ||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||| ||   ||||||  |||||||||||||||    
4286 aatgtttcgttaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggaatataataggtaattacactattaat---tttattttcatctccatgggaac 4382  T
205 tttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatata 304  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
4383 tttattcccaccattttctttgagaaaacttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata 4482  T
305 cattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
     |||   || ||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||    
4483 tatttttataattttattcctagaaatctacaaatataacttgaaacaaacacac 4537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3916 - 3567
Alignment:
10 taagggtgtgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||     
3916 taagggtgtgtttgtttcaagtgcaccaaatttattcctatgaataacattccttggaatataaagataggaattttattccaaggtatttaggaaaaaa 3817  T
110 a-tgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttta 208  Q
    | ||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||   || | ||||||  |||||||||||||||||||    
3816 aatgtttcgttaacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggaatataataggtaat-tacacataattttattttcatctccatgggaacttta 3718  T
209 ttctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatt 308  Q
    ||| |||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
3717 ttcccaccattttctttgagaaaacttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatt 3618  T
309 ccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
       || ||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||    
3617 tttataattttattcctagaaatctacaaatataacttgaaacaaacacac 3567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23517 - 23302
Alignment:
139 gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||   |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||| |||| |||   |||     
23517 gaaccttaaaaatagggattataataggtagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccaccgttttctttggaaaaaaattta 23419  T
239 tattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaat 338  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| | | |||| ||||     
23418 tattcccaggaatattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctataattttattctcagaaatctacaaa 23319  T
339 tataacttgaaacaaac 355  Q
    ||||| || ||||||||    
23318 tataatttaaaacaaac 23302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23675 - 23604
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattc 90  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
23675 tgtttattttaagtttaccaaatttatttttaagaataatatttcttggaatataaaaatg-gaattttattc 23604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1480 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1480
Description:

Target: scaffold1480; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 556 - 387
Alignment:
190 catctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaac 289  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||  || ||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| |||    
556 catcttcatgggaactttattcccacaattttctttgggaatgttatttcattcccaggaacattttatatttaggaataaaatttaataaacttgcaac 457  T
290 aaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac 359  Q
    ||||||||  ||  | ||| | |||||| |||| || |||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
456 aaacataggaatgcatatttccatcattctatttccaggaatttacaaagataacttgaaacaaacacac 387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21961 - 21854
Alignment:
190 catctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaac 289  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||  |||||||  || ||  || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||    
21961 catcttcatgggaactttattcccacaattttttttgggaatgttatttcatacccaggaacattttatatctaggaataaaatttaataaacttgcaac 21862  T
290 aaacatag 297  Q
    ||||||||    
21861 aaacatag 21854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 43436 - 43292
Alignment:
18 tgtttgtttcaagtttaccaaatttattcctaggaataacattccttggaatataaagatgagaattttattccaaggaatttaagaaaaatatgtttgg 117  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||||||||  ||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||  || | |||||  ||||| |||||||     
43436 tgtttattttaagtttgtcaaatttatttttaggaataatattttttagaatataaagatgtgaattttattttaaagtatttagaaaaaagatgtttgt 43337  T
118 ttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataa 162  Q
    ||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||  ||||||||    
43336 ttaacattatgatatttttaggaaccttaaaaataaagattataa 43292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University