View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1335_low_52 (Length: 250)

Name: NF1335_low_52
Description: NF1335
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1335_low_52
NF1335_low_52
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (36-216)||(45235921-45236101)
chr8 (49-216)||(27932282-27932449)
chr8 (49-216)||(29108874-29109041)
chr8 (49-216)||(24870076-24870242)
chr8 (38-216)||(1063365-1063543)
chr8 (36-216)||(32302916-32303097)
chr8 (36-216)||(17220573-17220748)
chr8 (36-216)||(11255060-11255236)
chr8 (50-216)||(24927819-24927985)
chr8 (59-212)||(34776945-34777098)
chr8 (36-195)||(2075907-2076066)
chr8 (36-214)||(39445630-39445799)
chr8 (36-196)||(4230791-4230951)
chr8 (36-197)||(28977185-28977346)
chr8 (36-216)||(1012474-1012655)
chr8 (36-216)||(20399448-20399628)
chr8 (36-216)||(34139304-34139483)
chr8 (36-216)||(17469112-17469291)
chr8 (36-216)||(24568796-24568974)
chr8 (48-216)||(43113678-43113845)
chr8 (138-216)||(40248423-40248501)
chr8 (36-121)||(40248494-40248579)
chr8 (39-150)||(35215364-35215474)
chr8 (60-218)||(14186205-14186358)
chr8 (36-157)||(29089567-29089685)
chr8 (36-211)||(36131974-36132147)
chr8 (49-159)||(34021348-34021456)
chr8 (49-115)||(31325134-31325199)
chr8 (156-215)||(30481474-30481533)
chr8 (157-201)||(9642418-9642462)
chr8 (161-208)||(27056615-27056662)
chr8 (163-215)||(29918590-29918642)
chr8 (185-216)||(2075863-2075894)
chr8 (89-152)||(4594274-4594336)
chr8 (170-216)||(37961014-37961060)
chr8 (163-215)||(8545402-8545454)
chr8 (96-152)||(40789483-40789538)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (36-216)||(7314700-7314880)
chr2 (36-216)||(12193879-12194059)
chr2 (36-216)||(13705413-13705593)
chr2 (49-218)||(10920515-10920684)
chr2 (38-216)||(45256682-45256860)
chr2 (36-216)||(8915989-8916169)
chr2 (49-216)||(24414184-24414351)
chr2 (36-216)||(37106556-37106729)
chr2 (49-216)||(37999353-37999520)
chr2 (36-216)||(36128158-36128339)
chr2 (36-216)||(13830593-13830773)
chr2 (49-218)||(10208480-10208649)
chr2 (36-216)||(30846802-30846983)
chr2 (36-216)||(42798040-42798221)
chr2 (36-216)||(9632243-9632423)
chr2 (49-216)||(45115428-45115595)
chr2 (36-177)||(18106181-18106322)
chr2 (49-216)||(6027941-6028108)
chr2 (36-216)||(31942238-31942417)
chr2 (36-143)||(37472854-37472961)
chr2 (36-216)||(44746161-44746341)
chr2 (36-216)||(14540643-14540818)
chr2 (49-216)||(19104893-19105059)
chr2 (36-156)||(16226839-16226958)
chr2 (49-112)||(16105488-16105551)
chr2 (157-208)||(22900772-22900823)
chr2 (160-208)||(15546725-15546773)
chr2 (71-150)||(30978795-30978873)
chr2 (36-99)||(37319799-37319862)
chr2 (89-152)||(38342657-38342719)
chr2 (71-152)||(4427794-4427874)
chr2 (90-134)||(17598816-17598859)
chr2 (80-152)||(26755631-26755703)
chr2 (163-215)||(30696908-30696960)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (36-216)||(18354132-18354312)
chr1 (36-216)||(45866237-45866417)
chr1 (36-216)||(17092011-17092191)
chr1 (36-215)||(40087516-40087695)
chr1 (38-216)||(17134806-17134984)
chr1 (36-216)||(24236813-24236993)
chr1 (36-216)||(50426713-50426887)
chr1 (36-190)||(42707908-42708062)
chr1 (36-216)||(19572564-19572743)
chr1 (36-216)||(42439722-42439902)
chr1 (49-216)||(36187272-36187439)
chr1 (36-216)||(23966729-23966910)
chr1 (36-216)||(29936273-29936453)
chr1 (36-196)||(39616160-39616320)
chr1 (36-212)||(3628041-3628219)
chr1 (36-195)||(5180902-5181061)
chr1 (36-216)||(28297790-28297971)
chr1 (36-216)||(34610930-34611110)
chr1 (36-216)||(49250825-49251005)
chr1 (49-216)||(51421728-51421895)
chr1 (36-216)||(34060077-34060251)
chr1 (56-216)||(16408823-16408979)
chr1 (36-196)||(24710715-24710875)
chr1 (53-216)||(29871337-29871499)
chr1 (36-216)||(44615527-44615707)
chr1 (36-216)||(44792862-44793042)
chr1 (36-216)||(9982942-9983121)
chr1 (36-195)||(20774489-20774649)
chr1 (36-216)||(12494868-12495047)
chr1 (36-216)||(49741059-49741238)
chr1 (123-216)||(13390357-13390450)
chr1 (53-216)||(34673334-34673496)
chr1 (49-218)||(16433217-16433379)
chr1 (50-139)||(13020559-13020648)
chr1 (49-174)||(35936911-35937035)
chr1 (113-216)||(23490823-23490926)
chr1 (39-154)||(44632250-44632364)
chr1 (89-215)||(2514678-2514804)
chr1 (157-214)||(34085213-34085270)
chr1 (36-85)||(13390306-13390355)
chr1 (164-215)||(16903508-16903559)
chr1 (92-157)||(24159994-24160058)
chr1 (96-152)||(12718904-12718959)
chr1 (89-157)||(36616797-36616864)
chr1 (89-153)||(38733902-38733965)
chr1 (36-107)||(23493497-23493568)
chr1 (164-214)||(10778621-10778671)
chr1 (48-133)||(8679669-8679753)
chr1 (186-215)||(23058473-23058502)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (36-219)||(35311679-35311861)
chr5 (36-218)||(17853343-17853524)
chr5 (36-216)||(4582975-4583155)
chr5 (36-216)||(28045511-28045691)
chr5 (49-218)||(42987530-42987699)
chr5 (36-216)||(3564780-3564960)
chr5 (38-216)||(1218615-1218791)
chr5 (36-216)||(22694954-22695134)
chr5 (36-216)||(29246004-29246184)
chr5 (49-216)||(4920695-4920862)
chr5 (36-216)||(12834627-12834808)
chr5 (36-216)||(40517662-40517842)
chr5 (36-216)||(12866604-12866785)
chr5 (36-216)||(15890063-15890242)
chr5 (59-216)||(6092571-6092728)
chr5 (36-216)||(5908741-5908921)
chr5 (36-212)||(13402061-13402235)
chr5 (49-216)||(6155971-6156138)
chr5 (49-216)||(30996466-30996632)
chr5 (50-216)||(6369566-6369732)
chr5 (36-217)||(27302787-27302965)
chr5 (51-207)||(27088414-27088568)
chr5 (49-178)||(20973576-20973705)
chr5 (36-216)||(12447238-12447417)
chr5 (36-199)||(3573081-3573243)
chr5 (36-219)||(38006519-38006701)
chr5 (40-216)||(2985008-2985183)
chr5 (36-216)||(30115340-30115519)
chr5 (36-216)||(35194042-35194221)
chr5 (36-182)||(33862271-33862415)
chr5 (53-219)||(8453423-8453587)
chr5 (36-216)||(2412779-2412958)
chr5 (36-121)||(10126964-10127049)
chr5 (50-216)||(18206888-18207054)
chr5 (157-216)||(10127058-10127117)
chr5 (51-158)||(42717742-42717849)
chr5 (100-212)||(33420388-33420498)
chr5 (81-152)||(2681096-2681166)
chr5 (71-152)||(20634050-20634130)
chr5 (71-152)||(20650164-20650244)
chr5 (117-181)||(15564573-15564637)
chr5 (89-152)||(34259148-34259210)
chr5 (186-216)||(20973549-20973579)
chr5 (186-215)||(28569075-28569104)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (36-216)||(31752318-31752498)
chr4 (36-216)||(48459343-48459523)
chr4 (49-216)||(47550406-47550573)
chr4 (36-216)||(47239438-47239618)
chr4 (36-216)||(39046815-39046994)
chr4 (49-216)||(32585363-32585531)
chr4 (36-216)||(6382325-6382506)
chr4 (36-216)||(5902667-5902847)
chr4 (36-216)||(7608832-7609012)
chr4 (36-187)||(42774623-42774774)
chr4 (36-216)||(31918611-31918792)
chr4 (48-216)||(21423735-21423903)
chr4 (49-216)||(44317409-44317577)
chr4 (49-216)||(43893103-43893270)
chr4 (49-216)||(11122922-11123089)
chr4 (36-216)||(11027934-11028115)
chr4 (39-216)||(19534321-19534497)
chr4 (36-216)||(26564694-26564873)
chr4 (38-216)||(6482088-6482266)
chr4 (36-216)||(1724363-1724542)
chr4 (36-216)||(42299653-42299832)
chr4 (79-216)||(55826676-55826814)
chr4 (36-196)||(4766389-4766546)
chr4 (36-216)||(37348986-37349165)
chr4 (36-167)||(425686-425816)
chr4 (48-201)||(7985189-7985342)
chr4 (49-218)||(12825512-12825680)
chr4 (54-137)||(15987372-15987455)
chr4 (53-216)||(28695195-28695357)
chr4 (36-206)||(13770518-13770687)
chr4 (37-218)||(39188379-39188557)
chr4 (39-216)||(32596237-32596413)
chr4 (36-216)||(37107274-37107453)
chr4 (79-197)||(13015323-13015446)
chr4 (36-121)||(53906429-53906514)
chr4 (36-150)||(9230146-9230262)
chr4 (138-216)||(53906358-53906436)
chr4 (161-214)||(10302071-10302124)
chr4 (157-216)||(15987315-15987374)
chr4 (36-143)||(29755456-29755562)
chr4 (54-169)||(39375160-39375272)
chr4 (80-152)||(18423474-18423545)
chr4 (163-215)||(33516126-33516178)
chr4 (117-152)||(16216793-16216828)
chr4 (157-198)||(43309468-43309509)
chr4 (36-84)||(13015557-13015605)
chr4 (163-215)||(42907875-42907927)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (36-216)||(17885326-17885506)
chr7 (36-200)||(37182136-37182300)
chr7 (36-216)||(38139844-38140025)
chr7 (36-216)||(16866030-16866210)
chr7 (52-216)||(44734409-44734573)
chr7 (49-216)||(7779882-7780049)
chr7 (49-216)||(30650505-30650672)
chr7 (36-216)||(45885817-45885997)
chr7 (49-216)||(37196050-37196217)
chr7 (36-218)||(17851715-17851897)
chr7 (36-216)||(45379967-45380148)
chr7 (50-218)||(25979967-25980135)
chr7 (36-212)||(41741506-41741681)
chr7 (36-211)||(44794084-44794259)
chr7 (36-187)||(44985981-44986130)
chr7 (36-216)||(12980238-12980418)
chr7 (36-216)||(18125280-18125460)
chr7 (36-216)||(39316856-39317036)
chr7 (49-216)||(21702533-21702700)
chr7 (36-216)||(35074330-35074511)
chr7 (36-216)||(43507294-43507486)
chr7 (36-196)||(24753037-24753196)
chr7 (53-216)||(3920417-3920579)
chr7 (50-216)||(41103528-41103697)
chr7 (36-205)||(25905489-25905659)
chr7 (78-216)||(44658501-44658639)
chr7 (49-216)||(39456067-39456232)
chr7 (36-216)||(18825924-18826103)
chr7 (49-216)||(37579137-37579303)
chr7 (36-216)||(38152763-38152928)
chr7 (80-216)||(16811635-16811770)
chr7 (36-214)||(27850380-27850556)
chr7 (36-216)||(45708917-45709094)
chr7 (36-216)||(2630625-2630805)
chr7 (106-215)||(3226999-3227108)
chr7 (36-216)||(5376947-5377126)
chr7 (44-214)||(46127237-46127403)
chr7 (138-216)||(10072429-10072507)
chr7 (39-216)||(24425246-24425421)
chr7 (57-216)||(26622834-26622992)
chr7 (36-216)||(16078875-16079054)
chr7 (36-216)||(25782959-25783138)
chr7 (64-216)||(26004526-26004675)
chr7 (49-206)||(23328484-23328641)
chr7 (36-115)||(3227696-3227775)
chr7 (36-121)||(10072350-10072436)
chr7 (36-115)||(26004673-26004752)
chr7 (157-214)||(8906643-8906700)
chr7 (76-152)||(21750665-21750740)
chr7 (161-214)||(5565361-5565414)
chr7 (168-208)||(10995894-10995934)
chr7 (157-203)||(27896540-27896586)
chr7 (168-214)||(33841071-33841117)
chr7 (137-182)||(3274765-3274810)
chr7 (80-152)||(18683857-18683928)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (36-216)||(20086865-20087044)
chr3 (36-215)||(29842164-29842343)
chr3 (36-215)||(48390870-48391048)
chr3 (38-216)||(22535893-22536071)
chr3 (36-216)||(34025810-34025990)
chr3 (36-216)||(39728527-39728707)
chr3 (36-212)||(43582434-43582609)
chr3 (36-216)||(44172482-44172662)
chr3 (36-216)||(44179182-44179362)
chr3 (36-216)||(44252603-44252783)
chr3 (48-216)||(44639143-44639310)
chr3 (51-216)||(17146202-17146367)
chr3 (36-215)||(34154274-34154449)
chr3 (50-216)||(23580698-23580863)
chr3 (36-216)||(49579920-49580100)
chr3 (36-202)||(10823759-10823925)
chr3 (49-218)||(44106842-44107011)
chr3 (36-216)||(6738446-6738626)
chr3 (36-216)||(29284192-29284372)
chr3 (36-216)||(39655325-39655505)
chr3 (36-216)||(44953487-44953667)
chr3 (49-216)||(52198023-52198191)
chr3 (36-216)||(52572465-52572645)
chr3 (49-216)||(7469830-7469997)
chr3 (49-200)||(49025550-49025701)
chr3 (36-216)||(4557357-4557536)
chr3 (36-216)||(34119515-34119692)
chr3 (45-205)||(30682687-30682846)
chr3 (36-216)||(53631761-53631940)
chr3 (89-216)||(23154116-23154242)
chr3 (53-216)||(42758248-42758410)
chr3 (49-154)||(48306650-48306755)
chr3 (36-216)||(4016096-4016275)
chr3 (36-216)||(31126847-31127026)
chr3 (53-216)||(54317018-54317180)
chr3 (36-216)||(19111592-19111770)
chr3 (36-171)||(23547069-23547204)
chr3 (36-181)||(41937089-41937233)
chr3 (36-210)||(830866-831039)
chr3 (149-216)||(48305693-48305760)
chr3 (127-182)||(23910330-23910385)
chr3 (155-216)||(23546994-23547055)
chr3 (157-205)||(30616344-30616392)
chr3 (38-157)||(14208260-14208377)
chr3 (117-152)||(1772538-1772573)
chr3 (161-207)||(10043343-10043389)
chr3 (169-215)||(30904868-30904914)
chr3 (71-152)||(23330033-23330113)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (36-216)||(32853700-32853880)
chr6 (49-216)||(10142570-10142737)
chr6 (49-216)||(12141254-12141421)
chr6 (51-216)||(24225569-24225734)
chr6 (36-216)||(10188125-10188305)
chr6 (36-216)||(27534540-27534720)
chr6 (49-216)||(5863435-5863602)
chr6 (36-216)||(2367182-2367362)
chr6 (36-216)||(3483975-3484155)
chr6 (72-219)||(27738664-27738811)
chr6 (36-203)||(14032413-14032579)
chr6 (45-216)||(12309444-12309608)
chr6 (36-216)||(12678146-12678324)
chr6 (36-212)||(14505943-14506118)
chr6 (49-216)||(24602908-24603074)
chr6 (36-216)||(7393939-7394118)
chr6 (92-216)||(32053000-32053124)
chr6 (45-215)||(14254824-14254993)
chr6 (36-216)||(30816114-30816296)
chr6 (138-216)||(32532498-32532576)
chr6 (76-216)||(11762342-11762481)
chr6 (36-121)||(32532420-32532505)
chr6 (36-147)||(14410954-14411064)
chr6 (45-147)||(14245113-14245214)
chr6 (50-111)||(32052927-32052988)
chr6 (155-215)||(20349039-20349099)
chr6 (165-216)||(15498309-15498360)
chr6 (117-152)||(9458234-9458269)
chr6 (177-216)||(14410907-14410946)
chr6 (186-215)||(28079749-28079778)
chr6 (163-215)||(256545-256597)
chr6 (155-215)||(34346058-34346118)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (36-197)||(4113-4275)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
scaffold0519 (36-216)||(10157-10333)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (36-215)||(197380-197558)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (36-216)||(14632-14811)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (36-216)||(33250-33429)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (49-216)||(90467-90633)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (36-182)||(6263-6408)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (36-156)||(32642-32761)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (36-150)||(36012-36128)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (36-204)||(33440-33611)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (36-113)||(14299-14376)
scaffold0014 (137-169)||(14268-14300)
[»] scaffold1630 (1 HSPs)
scaffold1630 (36-102)||(1479-1545)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (81-152)||(16847-16917)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 45235921 - 45236101
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45235921 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 45236020  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45236021 aataacataacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatggatatgggttcggggtgggtacctatata 45236101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 27932282 - 27932449
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27932282 tcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat 27932381  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27932382 atcaacataaaataattttttacatttgggacggatatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 27932449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29109041 - 29108874
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29109041 tcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatatgacat 29108942  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29108941 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacatatata 29108874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24870242 - 24870076
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24870242 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttt-attaacatgacaattatcaaacaaattaacatgacat 24870144  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24870143 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggctcggggtgggtacctatata 24870076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 1063365 - 1063543
Alignment:
Q  38 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 137  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1063365 caacaatacgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcgtttaaatatcaatggtaatttttatcaacatgacaattatcaaacaaaa 1063464  T
Q  138 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1063465 taacaagacatatcaacataaagtaattttttacacttgggatggatttgggtatgagttcggggtgggtacttatata 1063543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 32302916 - 32303097
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32302916 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 32303015  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32303016 aataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 32303097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 17220573 - 17220748
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17220573 tccaccaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 17220672  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  17220673 aataacatgacatatcaacataaagtaatcttttacatttgggacgggtatg-----gggttcggggtgggtacctatata 17220748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11255236 - 11255060
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |   | ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11255236 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatgac---ggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaa 11255140  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11255139 aataacat-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatata 11255060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Original strand, 24927819 - 24927985
Alignment:
Q  50 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 149  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24927819 cactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacata 24927918  T
Q  150 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24927919 tccacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 24927985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 212
Target Start/End: Original strand, 34776945 - 34777098
Alignment:
Q  59 atttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataa 158  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34776945 atttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataa 34777044  T
Q  159 aataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34777045 aataattttttacatttgggatggatttgggtatgggttcggggtgggtaccta 34777098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2076066 - 2075907
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2076066 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 2075967  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatggg 195  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2075966 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatggg 2075907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39445799 - 39445630
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39445799 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgatcatt-aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 39445701  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 214  Q
    |||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39445700 aataacatgacatatctac--------attttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctata 39445630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4230951 - 4230791
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4230951 tccaacaataagctcacttttacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 4230852  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 196  Q
    |||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4230851 aataacataatgtatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggt 4230791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28977346 - 28977185
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28977346 tccaacaataagttcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 28977247  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggtt 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  28977246 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtgtgggtt 28977185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 1012474 - 1012655
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||    |||||||||||||    
T  1012474 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtacttttta-taacacagcaattatcaaacaa 1012572  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata--attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1012573 aataacatggcatatcaacataaagtagttttttttgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 1012655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 20399448 - 20399628
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatc-aaaca 134  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||  ||| |    
T  20399448 tccagcaagatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttggttggtcctttaaatatcaatgctagtttttat-aacacgacaattatataaaaa 20399546  T
Q  135 aaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20399547 aaataacatggtatatcaacataaaataattttttgcattcgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtatctatata 20399628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 34139304 - 34139483
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  34139304 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttgtttactcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaa 34139402  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||   |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34139403 aataacatggtctatcaacataaagtaatttttttgcattcgggacgggtttgggtat-ggttcggggtgggtacctatata 34139483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 17469112 - 17469291
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||| |||| |  |||||||||||||    
T  17469112 tccaacaatatgttcactttaaaattttttagacccattgatttagtttctcctttaaatatcaatggtagcttttat-aacaaggcaattatcaaacaa 17469210  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||| | || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17469211 aataacatggcatatcaacataaagtagttttctgcagttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatata 17469291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 24568796 - 24568974
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||    |||||||||||||    
T  24568796 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagttttta-taacacatcaattatcaaacaa 24568894  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24568895 aataac-tgacatatcaacataaagtagttttctccattcgggacggatttgagtatgggttcggggtggatacctatata 24568974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43113845 - 43113678
Alignment:
Q  48 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 147  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||| |||    
T  43113845 ttcactttaacatttgttataccgattgatttagttgctccttcaaatatcaatgatagtttttat-aacacgacaattatctaacaaaataacataaca 43113747  T
Q  148 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| || || |||| | |||| | ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43113746 tatcaacatgaagtagttttctgcattcgagacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatata 43113678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40248501 - 40248423
Alignment:
Q  138 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40248501 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatatgggtatgggttcgggatgggtacctatata 40248423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 40248579 - 40248494
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatga 121  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40248579 tccaacaatattctcactttaacatttgttagactgaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatga 40248494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 150
Target Start/End: Original strand, 35215364 - 35215474
Alignment:
Q  39 aacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  35215364 aacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctccattaaatatcaagggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaat 35215462  T
Q  139 aacatgacatat 150  Q
    |||||| |||||    
T  35215463 aacatggcatat 35215474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 218
Target Start/End: Original strand, 14186205 - 14186358
Alignment:
Q  60 tttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaa 159  Q
    ||||||||||  | ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||     |||| ||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14186205 tttgttagaccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagttt-----aacacgactgttatcaaacaaaataacatggcatattaacataaa 14186299  T
Q  160 ataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 218  Q
     ||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14186300 ttaattttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcagggtgagtacctatatatc 14186358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 157
Target Start/End: Original strand, 29089567 - 29089685
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  | | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  29089567 tccaacaatatgtttactttaa-atttgttagacccattaatttagttgctcctttaaatatcaatgatag-ttttaataacacaataattatcaaacaa 29089664  T
Q  136 aataacatgacatatcaacata 157  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  29089665 aataacat-acataccaacata 29089685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36132147 - 36131974
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||||||| ||| || | ||||| ||| |  ||||||| | |||| || ||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  36132147 tccagcaatatgctcattttaacatttgtttgaccgattaatttaattgcttctttaaattttaatggtaatttttat-aacacggcaattatcaaacaa 36132049  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||    
T  36132048 aataacatgacatat-aacataaaataactttctgcattcgggacggatttgtgtatgagttcggggtggatacct 36131974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 159
Target Start/End: Original strand, 34021348 - 34021456
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34021348 tcactttaacatttgttagattaattgatttcgttgctcctttaaatatcaatagtagttttta-tataatgacaattatcaaacaaaataacat-acat 34021445  T
Q  149 atcaacataaa 159  Q
    |||||||||||    
T  34021446 atcaacataaa 34021456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 115
Target Start/End: Original strand, 31325134 - 31325199
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta 115  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31325134 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatc-tttaaatatcaatggtagtttttatta 31325199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30481533 - 30481474
Alignment:
Q  156 taaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30481533 taaattaattttttacattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatat 30481474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9642462 - 9642418
Alignment:
Q  157 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9642462 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggg 9642418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27056662 - 27056615
Alignment:
Q  161 taattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggta 208  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  27056662 taattttttacatttgggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggta 27056615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 29918590 - 29918642
Alignment:
Q  163 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||    
T  29918590 attttttacatttgggacgggtttgtgtatggtttcggggtgggtacatatat 29918642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 216
Target Start/End: Original strand, 2075863 - 2075894
Alignment:
Q  185 atgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2075863 atgggtatgggttcggggtgggtacctatata 2075894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4594336 - 4594274
Alignment:
Q  89 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4594336 tttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 4594274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37961060 - 37961014
Alignment:
Q  170 acatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  37961060 acatttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgtgtacctatata 37961014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8545454 - 8545402
Alignment:
Q  163 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    ||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8545454 attttctacatttgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtatctatat 8545402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 152
Target Start/End: Original strand, 40789483 - 40789538
Alignment:
Q  96 atcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40789483 atcaatgaaagttcttat-atcatgatagttatcaaaccaaataacatgacatatca 40789538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7314880 - 7314700
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7314880 tccaacaatatgcccactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgatatttatcaaacaa 7314781  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7314780 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtgtgggtatgggttcggggtgggaacctatata 7314700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12194059 - 12193879
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12194059 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatgtagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 12193960  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||    
T  12193959 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatggatatggattcgaggtgggtatctatata 12193879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13705593 - 13705413
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13705593 tccaacaatacgctcactttaacatttgttatacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 13705494  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13705493 aataacatgacatatcaacataaagtaatttttcacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatata 13705413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Original strand, 10920515 - 10920684
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10920515 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 10920614  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10920615 atcaacataaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtggatacctatatatc 10920684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 45256682 - 45256860
Alignment:
Q  38 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 137  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45256682 caacaatacgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaa 45256781  T
Q  138 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45256782 taacaagacatatcaaaataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacttatata 45256860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8916169 - 8915989
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8916169 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttaatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 8916070  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8916069 aataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatata 8915989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24414351 - 24414184
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24414351 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 24414252  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24414251 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 24414184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 37106556 - 37106729
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37106556 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 37106655  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37106656 aataacat-atatatcaacataaagtaattttttacatttgggac------gggtatgggttcggagtgggtacctatata 37106729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 37999353 - 37999520
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37999353 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgattctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 37999452  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37999453 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacttatata 37999520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36128339 - 36128158
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36128339 tccaacaataagttcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 36128240  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36128239 aataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatata 36128158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 13830593 - 13830773
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13830593 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttatttacatgacaattatcaaacaa 13830692  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13830693 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacaggtttgagtatgggttcggggtgggtacttatata 13830773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10208649 - 10208480
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10208649 tcactttcacatttgtaagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 10208550  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 218  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10208549 attaacataaagtaattttttacatttgggactggtttgagtatgggttcggggtaggtacctatatatc 10208480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 30846802 - 30846983
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30846802 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 30846901  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30846902 aataacataacatatcaacataaagtagtttttttacaattgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 30846983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42798221 - 42798040
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42798221 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 42798122  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42798121 aataacataacatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacaggtttgtgtatgggttcggggtgggtacttatata 42798040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 9632243 - 9632423
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  9632243 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaa 9632342  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9632343 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatata 9632423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 45115428 - 45115595
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45115428 tcactttaacatttattagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat 45115527  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45115528 atcaacataatgtaattttttacatttgggatgggtttaactatgggttcgggatgggtacctatata 45115595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18106322 - 18106181
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18106322 tccaacaataagttcactttcacatttgttagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 18106223  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgg 177  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106222 aataacataatgtatcaacataaaataattttttacatttgg 18106181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6028108 - 6027941
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| | |    
T  6028108 tcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggctt 6028009  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6028008 atcaacataaaatacttttctgcattcaggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 6027941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31942417 - 31942238
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  31942417 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgactgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaa 31942319  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| || |||| | |||||| ||| | | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31942318 aataacatggcatatcagcataaagtagttttctgcatttgtgacaggtttggttatgggtttggggtgggtacttatata 31942238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37472961 - 37472854
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37472961 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 37472862  T
Q  136 aataacat 143  Q
    ||||||||    
T  37472861 aataacat 37472854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44746341 - 44746161
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||| ||    
T  44746341 tccaacaatatgctcactctaacatttgttagacggaataatttatttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataaccattacaatgatcaaataa 44746242  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| ||| |  |||||||| ||||||    
T  44746241 aataacatggcatatcaagataaagtgattttctacatttgggacgggtttgagtatgagtttgaagtgggtacatatata 44746161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 14540643 - 14540818
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||     |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  14540643 tccagcaatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttaaatatcg----tagtttttat-aacacgacaattatcaaacaa 14540737  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| | || |||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  14540738 aataacatgacatatcaacataaagtaattttctacgttcgggacggatttgagtatggattccgagtgggtgcctatata 14540818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19105059 - 19104893
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||     
T  19105059 tcactttaacatttgttagaccgatcgatttagttgctcttttaaatatcgatagtagtttttat-aacacggcaattattaaacaaaataacatgacac 19104961  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
     |||||||||| ||||||| | |||| ||||||| | || |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  19104960 gtcaacataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgagtatggattcgaggtggatacctatata 19104893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16226958 - 16226839
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  16226958 tccaacaatatattcactttaacatttcttagaccaattgatttagttgctaatttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaataa 16226860  T
Q  136 aataacatgacatatcaacat 156  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  16226859 aataacatgacaaatcaacat 16226839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 112
Target Start/End: Original strand, 16105488 - 16105551
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagttttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  16105488 tcactttaacatttgttagacataatgatttagttgatctgtgaaatatcaatggtaattttta 16105551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 208
Target Start/End: Original strand, 22900772 - 22900823
Alignment:
Q  157 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggta 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22900772 aaaataattttttacgtttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggta 22900823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 208
Target Start/End: Original strand, 15546725 - 15546773
Alignment:
Q  160 ataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggta 208  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  15546725 ataattttttacatttgggaagggtatgggtatgggttcagggtgggta 15546773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 150
Target Start/End: Original strand, 30978795 - 30978873
Alignment:
Q  71 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatat 150  Q
    |||| ||| ||||| || ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30978795 gaataattcagttgctcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 30978873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Original strand, 37319799 - 37319862
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatca 99  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||    
T  37319799 tccagcaatatgttcattttaacatttgttagaccgattgatttagttgctactttaaatatca 37319862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 38342719 - 38342657
Alignment:
Q  89 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38342719 tttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 38342657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 152
Target Start/End: Original strand, 4427794 - 4427874
Alignment:
Q  71 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    |||| ||| ||||| || |||||  |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4427794 gaataattaagttgctcctttaaccatcaatgaaagttcttat-atcatgatagttatcaaaccaaataacatgacatatca 4427874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Original strand, 17598816 - 17598859
Alignment:
Q  90 ttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaaca 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17598816 ttaaatatcaatgattgttttta-taacatgacaattatcaaaca 17598859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 152
Target Start/End: Original strand, 26755631 - 26755703
Alignment:
Q  80 agttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26755631 agttgctcctttaactatcaatgaaagttctttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatggcatatca 26755703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 30696908 - 30696960
Alignment:
Q  163 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30696908 attttttacatttgggataggtttgggtatgagttcggggtgggtacatatat 30696960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18354312 - 18354132
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18354312 tccaacaatatgttcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 18354213  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  18354212 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtatgggtatcggttcggggtgggaacttatata 18354132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45866417 - 45866237
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45866417 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 45866318  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45866317 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgagtttggggtgggtacctatata 45866237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17092191 - 17092011
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17092191 tccaacaatatgttcactttaacatttattagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 17092092  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  17092091 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggcatgggttcggggtgagtgcctatata 17092011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40087695 - 40087516
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40087695 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 40087596  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40087595 aataacatgatatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggtacctatat 40087516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 17134806 - 17134984
Alignment:
Q  38 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17134806 caacaatatgttcactttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaa 17134905  T
Q  138 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17134906 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatatgggacgagtatgggtatgggttcggggatggtacctatata 17134984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24236993 - 24236813
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | || |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24236993 tccaacaataagtccactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 24236894  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24236893 aataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatata 24236813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50426887 - 50426713
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50426887 tccaacaatatgctcactttaacatttgtaagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 50426788  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50426787 aataacatgacatatcaacataaagtaaatttttacatttgggac------gggtatgggttcggggtgggtacctatata 50426713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42708062 - 42707908
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42708062 tccaacaatatgctcactttaacatctgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 42707963  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42707962 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggt 42707908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19572743 - 19572564
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19572743 tccaccaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaa-tatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 19572645  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19572644 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 19572564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42439902 - 42439722
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42439902 tccaacaataagctcactttaacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 42439803  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42439802 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgagtttggatatgggttcggggtgggtacctatata 42439722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36187439 - 36187272
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36187439 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 36187340  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36187339 atcaacataaaataactttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatata 36187272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 23966729 - 23966910
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23966729 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatactttaaatatcaatagtagtttttataaacatgacaattatcaaacaa 23966828  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23966829 aataacataacatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 23966910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 29936273 - 29936453
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  29936273 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaa 29936372  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29936373 aataacattacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 29936453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 196
Target Start/End: Original strand, 39616160 - 39616320
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39616160 tccaacaatatgctcactttaacatctgttagacggaatgatttaactgatcatttaaatatcaatggtaatttttattaacatgataattagcaaacaa 39616259  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39616260 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgggt 39616320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3628219 - 3628041
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3628219 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatattaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 3628120  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataa--ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3628119 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttttacatttgggactggaatgagtatgggttcggggtgggtaccta 3628041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 5180902 - 5181061
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5180902 tccaacaatatgctcactttaaaatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 5181001  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatggg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  5181002 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttggaacgggtatgggtttggg 5181061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 28297790 - 28297971
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28297790 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 28297889  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28297890 aataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 28297971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 34610930 - 34611110
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34610930 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 34611029  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34611030 aataatataacatatcaacataaagtagtattttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatata 34611110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49251005 - 49250825
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49251005 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatcaacatgacaattatcaaacaa 49250906  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  49250905 aatagcataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtggatacctatata 49250825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 51421728 - 51421895
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51421728 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatagcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacat 51421827  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51421828 atcaacatagagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatata 51421895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34060251 - 34060077
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34060251 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggttgtttttattaacatgacaattatcaaacaa 34060152  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34060151 aataacat-acatatcaacataaagtaatttttttacaattgggac------gggtatgggttcggagtgggtacctatata 34060077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 16408823 - 16408979
Alignment:
Q  56 aacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaaca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  16408823 aacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat----aca 16408918  T
Q  156 taaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| | | | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16408919 taaagtaattttttacatttggagcgggtttagctatgggttcggggtcggtacctatata 16408979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 196
Target Start/End: Original strand, 24710715 - 24710875
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24710715 tccaacaataagctcattttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 24710814  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 196  Q
    |||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  24710815 aataacataatgtatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggt 24710875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29871499 - 29871337
Alignment:
Q  53 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29871499 tttaatatttgttagaccgattgatgtagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacatgggaattatcaaacaaaataacatgacatatca 29871401  T
Q  153 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29871400 acataaaataattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcagggtgggtacctatata 29871337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44615707 - 44615527
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  44615707 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagttttta-taacacgacaattatcaaacaa 44615609  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||  ||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44615608 aataacatggcatatcaagataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatata 44615527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 44792862 - 44793042
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  44792862 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagttttta-taacacgacaattatcaaacaa 44792960  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||  ||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44792961 aataacatggcatatcaagataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatata 44793042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9983121 - 9982942
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  9983121 tccagcaatatgctcactttaacatttgttagaccgattaatttagttgctcctttgaatatcaatggtagttttgat-aacatgagaattatcaaacaa 9983023  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| | |||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9983022 aataacatgatatattaacataaagtaattttctgcattcgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 9982942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 20774489 - 20774649
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20774489 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaataaaagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 20774588  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatggg 195  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20774589 aataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatggg 20774649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 12494868 - 12495047
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||| |  |||||| ||||||    
T  12494868 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgataaatttagttgctcctttaaatatcagtggtagtttttat-aacacgccaattataaaacaa 12494966  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | || |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12494967 aataacatgtcatgtcaacatatagtagttttctacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtacctatata 12495047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49741238 - 49741059
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  49741238 tccaacaatatgttcactttaacatttgttaaaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaa 49741140  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |||| | |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49741139 aataacataacatattaacataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 49741059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 216
Target Start/End: Original strand, 13390357 - 13390450
Alignment:
Q  123 aattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13390357 aattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctatata 13390450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34673496 - 34673334
Alignment:
Q  53 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34673496 tttaacatttgttagaccggttgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 34673398  T
Q  153 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||| || |||| | | || || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34673397 acataaagtagttttcttcgttcggaacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 34673334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16433379 - 16433217
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |     | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16433379 tcactttaatatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataat----acaattatcaaacaaaataacatgacat 16433284  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 218  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||  || | |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16433283 atcaacataaagtaattttctgcatttggggtgggtttgggtatgggttcgg---gggtacctatatatc 16433217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 139
Target Start/End: Original strand, 13020559 - 13020648
Alignment:
Q  50 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaata 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13020559 cactttaatatttgttagacggaatgatttagttgatactttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 13020648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35937035 - 35936911
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35937035 tcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttgt-aacacggaaattatcaaacaaaataacatgacat 35936937  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatt 174  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35936936 atcaacataaagtaattttctacatt 35936911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23490926 - 23490823
Alignment:
Q  113 ttaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 212  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  23490926 ttaagatgacaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaattagttttttacatttgggacgggttttggtatgggttcggggtgggtaccta 23490827  T
Q  213 tata 216  Q
    ||||    
T  23490826 tata 23490823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44632364 - 44632250
Alignment:
Q  39 aacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat 138  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  44632364 aacaatatgatcactttaacatttgttagacctattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacgacaattgtcaaacaaaat 44632266  T
Q  139 aacatgacatatcaac 154  Q
    || ||| |||||||||    
T  44632265 aatatggcatatcaac 44632250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 215
Target Start/End: Original strand, 2514678 - 2514804
Alignment:
Q  89 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat-atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatg 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||| | | |     
T  2514678 tttaaatatcaatggtagtttttatta-cacggcaattatcaaacaaaataacatgacatgttcaacataaaataattttatgcattcgggacagattta 2514776  T
Q  188 ggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    ||||||  |||||||||| || ||||||    
T  2514777 ggtatgtattcggggtggatatctatat 2514804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 34085213 - 34085270
Alignment:
Q  157 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34085213 aaaataattttttacatttaggacgagtatgggtatgggttcggggtgggtacatata 34085270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Original strand, 13390306 - 13390355
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttga 85  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13390306 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacgaaatgatttagttga 13390355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 16903508 - 16903559
Alignment:
Q  164 ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16903508 ttttttacattcgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatat 16903559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24160058 - 24159994
Alignment:
Q  92 aaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacata 157  Q
    |||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24160058 aaatatcaatgacaatttttat-aatatgacaattatcaaatcaaataacatgacatatcaacata 24159994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12718959 - 12718904
Alignment:
Q  96 atcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12718959 atcaatgaaagttcttat-atcatgataattatcaaaccaaataacatgacatatca 12718904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Original strand, 36616797 - 36616864
Alignment:
Q  89 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacata 157  Q
    |||||||||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36616797 tttaaatatcaacgacaatttttat-aacttgacaattatcaaaccaaataacatgacataacaacata 36616864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 153
Target Start/End: Original strand, 38733902 - 38733965
Alignment:
Q  89 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 153  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  38733902 tttaaatatcaatgacaatttttat-aacatgacaattatcaaaccaaataacatagcatatcaa 38733965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23493568 - 23493497
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagt 107  Q
    |||||||| | | ||||||  |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23493568 tccaacaataagctcacttccacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagt 23493497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10778671 - 10778621
Alignment:
Q  164 ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 214  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  10778671 ttttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtggatatctata 10778621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8679753 - 8679669
Alignment:
Q  48 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaac 133  Q
    |||||||||||||||  | |||  ||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||    
T  8679753 ttcactttaacatttccttgactaaatgatttgattgctcctttaaatatcaatgataattttta-taacatgatgatcatcaaac 8679669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 215
Target Start/End: Original strand, 23058473 - 23058502
Alignment:
Q  186 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23058473 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 23058502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 219
Target Start/End: Original strand, 35311679 - 35311861
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35311679 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 35311778  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35311779 aataacat-acatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggagtgggtacctatatatct 35311861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17853524 - 17853343
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17853524 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 17853425  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17853424 aataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtatctatatatc 17853343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 4582975 - 4583155
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4582975 tccaacaatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 4583074  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4583075 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggggtgggaacctatata 4583155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 28045511 - 28045691
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatt-aacatgataattatcaaaca 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  28045511 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatttaacataacaattataaaaca 28045610  T
Q  135 aaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28045611 aaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-gggtgggtacctatata 28045691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42987699 - 42987530
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42987699 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 42987600  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42987599 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatc 42987530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3564960 - 3564780
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3564960 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 3564861  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggt-gggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  3564860 aataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttggaacgggtatggatatgggttcggagtagggtacctatata 3564780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 1218615 - 1218791
Alignment:
Q  38 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 137  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1218615 caacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagttttt-ttaacatgacaattatcaaacaaaa 1218713  T
Q  138 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1218714 taacat-acaaatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtacctatata 1218791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22695134 - 22694954
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22695134 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatatagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 22695035  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22695034 aataacattacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctctata 22694954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29246184 - 29246004
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  29246184 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgattcattaaatatcaatggtagtgtttattaacataacaattatcaaacaa 29246085  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29246084 aataacatgacataccaacataaaataattttttacatttgggatgggtatgggtatgggtttggggtgggtacctatata 29246004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 4920695 - 4920862
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4920695 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 4920794  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4920795 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatata 4920862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12834808 - 12834627
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12834808 tccaccaatatgctcactttaacatttgttagacgtaacgatttaattgatcattcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 12834709  T
Q  136 aataacat-gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12834708 aataacatagacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtaggtacctatata 12834627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 40517662 - 40517842
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40517662 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 40517761  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40517762 aataacataacatatcaacataaaataattttttacctttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtaactatata 40517842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12866785 - 12866604
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12866785 tccaccaatatgctcactttaacatttgttagacgtaacaatttaattgatcattcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 12866686  T
Q  136 aataacat-gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12866685 aataacatagacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgcggtgggtacctatata 12866604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 15890063 - 15890242
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||    
T  15890063 tccaccaatatgttcactttaacatttgttagacgtaattatttaattgatccttcaaatatcaatggtagttttcattaatatgacaattatcaaataa 15890162  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15890163 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-gggtgggtacctatata 15890242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6092728 - 6092571
Alignment:
Q  59 atttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataa 158  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6092728 atttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataa 6092629  T
Q  159 aataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6092628 agtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 6092571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5908921 - 5908741
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5908921 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 5908822  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  5908821 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgtgtacatatata 5908741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13402235 - 13402061
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13402235 tccaacaatatgctcattttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 13402136  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  13402135 aataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatcggt-tgggttcggagtgggtaccta 13402061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6156138 - 6155971
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6156138 tcactttaacatttgttagacggaatgatttatttgctcctttaaatatcaatgatattttttattaccatgacaattatcaaacaaaataacatgtcat 6156039  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6156038 ataaacataaagtaattttcaacatttgtgacggttttgggtatgggttcggggtgggtacatatata 6155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 30996466 - 30996632
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  30996466 tcactttaacatt-gttagacggaatgatttatttgatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatggcat 30996564  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30996565 atcaacttaaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtgtgtgttcggggtgggtacctatata 30996632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Original strand, 6369566 - 6369732
Alignment:
Q  50 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  6369566 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaacatcaacggtagttttcattaacatgataattatcaaacaaaataacacgacgca 6369665  T
Q  150 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6369666 tcaacataaagtaattttttacattttggacgggttaaagtatgggttcggggtgggtacatatata 6369732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27302965 - 27302787
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |   | |||||||| |||||||||||||    
T  27302965 tccaacaatatgatcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtacgt---agtaacatgacaattatcaaacaa 27302869  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatat 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27302868 aataacatgacatattaacataaagtaattttttacgtttgggacgtgtatgactatggattcggggtgggtacctatatat 27302787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 51 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27088568 - 27088414
Alignment:
Q  51 actttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatat 150  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27088568 actttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacataacaattatcaaacaaaataacat-acatat 27088471  T
Q  151 caacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27088470 caacataaaataattttctacattcgagacgggtttgggtatgggttcggggtgggt 27088414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20973705 - 20973576
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20973705 tcactttaatattttttagacggaatgatttagttgatactttacatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataccatgacat 20973606  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttggg 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20973605 atcaacataaagtaattttttacatttggg 20973576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 12447238 - 12447417
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||  || |||||||  || || |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  12447238 tccaacaatatattcactttaacatttgttagatcgattgatttaactgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaa 12447336  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12447337 aataacatgacatattaacataaagtagttttctatatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatata 12447417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 199
Target Start/End: Original strand, 3573081 - 3573243
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||     
T  3573081 tccagcaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttgaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacag 3573179  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | || |||||||||||    
T  3573180 aataacatgacatatcaacataaaataattttctacattcgggaggggtttgagtatgggttcg 3573243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38006701 - 38006519
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| || | ||  ||||||||||||    
T  38006701 tccaacaatatgctcgttttaacaattgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 38006603  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38006602 aataacatgacatattaacataaattaattttcaacattcgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 38006519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 216
Target Start/End: Original strand, 2985008 - 2985183
Alignment:
Q  40 acaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaata 139  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||    
T  2985008 acaatatgctcactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacaacaattatcaaataaaata 2985106  T
Q  140 acatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||| | | ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  2985107 acatgacatatcaatataaaataattttctatattcgagacagatttgggtatggtttcgggatgagtacctatata 2985183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 30115340 - 30115519
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| |||| | |||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  30115340 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagactgatcgatttagttgctcctttaaatataaatggtggtttttat-aacacggcaattatcaaacaa 30115438  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  30115439 aataacatagcatatcaacataaaataattttatgcattcgggacgggtttgaatatgggttcgggatgggtaccaatata 30115519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35194221 - 35194042
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  35194221 tccagcaatatgttcactttaacattttttagaccaattgatttagtttattctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacagcaattatcaaacaa 35194123  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35194122 aataacatagcatattaacataaagtaattttctacattcgggacgggtttgagtatgagtttggggtgggtacctatata 35194042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33862415 - 33862271
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  33862415 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagccc-attgatttagttggtcatttaaatatcaatcgtagtttttac-aacatgacaattatcaaacaa 33862318  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgg 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  33862317 aataacatggcatatcaacataaaatagttttctgcattcgggacgg 33862271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8453587 - 8453423
Alignment:
Q  53 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| |    
T  8453587 tttaacatttgtttgaccgaatgatttagttactcctttaaatatcaatggtaattttta-taacatgacaattattaaacaaaataac--gacatatta 8453491  T
Q  153 acataaaataattttttacatttgggacg-gttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 219  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||  || |||||| ||||||||||||||    
T  8453490 acataaactaattttctacatttgggacgagttttgagtatgactttggggtgtgtacctatatatct 8453423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2412958 - 2412779
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| | ||  | |||||||||||||    
T  2412958 tccaacaatatgctcactttaatatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaattgtagtttttatga-cacaacaattatcaaacaa 2412860  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||  ||||||  | ||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  2412859 aataacatgacatatcaatataaagtaattttctgcatacgggacgagtttgggtattggttcaggatgggtacatatata 2412779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Original strand, 10126964 - 10127049
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatga 121  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10126964 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatga 10127049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Original strand, 18206888 - 18207054
Alignment:
Q  50 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataa-ttatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||| |||| |  || |||| ||||||||||||||| |||    
T  18206888 cactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattagtagtttttat-aacacggcaaattattaaacaaaataacatggcat 18206986  T
Q  149 atcaacata-aaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18206987 atcaacatagaagtaattttctacattcgggacgggtttgaatatgggttc-gggtgggtacctatata 18207054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 10127058 - 10127117
Alignment:
Q  157 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127058 aaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 10127117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 42717849 - 42717742
Alignment:
Q  51 actttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatc-aaacaaaataacatgacata 149  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||     
T  42717849 actttaacatttgttagaccggttgatttagtttctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacgacaattatcaaaacaaaatatcatggcatg 42717751  T
Q  150 tcaacataa 158  Q
    |||||||||    
T  42717750 tcaacataa 42717742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33420498 - 33420388
Alignment:
Q  100 atgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcg 199  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| | |||||||||||||     
T  33420498 atgatagtttttat-aacacgacaattatcaaataaaataacatgacatatcaatataaaat-attttctacattcaagacgggtttgggtatgggttca 33420401  T
Q  200 gggtgggtaccta 212  Q
    |  ||||||||||    
T  33420400 gaatgggtaccta 33420388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 152
Target Start/End: Original strand, 2681096 - 2681166
Alignment:
Q  81 gttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2681096 gttgatcctttaactatcaatgaaagttcttattt-catgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 2681166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 152
Target Start/End: Original strand, 20634050 - 20634130
Alignment:
Q  71 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    |||| |||| |||| || ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20634050 gaataatttggttgttcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 20634130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 152
Target Start/End: Original strand, 20650164 - 20650244
Alignment:
Q  71 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    |||| |||| |||| || ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20650164 gaataatttggttgttcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 20650244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 181
Target Start/End: Original strand, 15564573 - 15564637
Alignment:
Q  117 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacg 181  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  15564573 catgacaattttcaaaaaaaataacatgacatatcaatgtaaagtaattttctacattcgggacg 15564637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Original strand, 34259148 - 34259210
Alignment:
Q  89 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34259148 tttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 34259210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20973579 - 20973549
Alignment:
Q  186 tgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20973579 tgggtatgggttcggggtgggtacctatata 20973549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28569104 - 28569075
Alignment:
Q  186 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28569104 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 28569075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 31752318 - 31752498
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31752318 tccagcaatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcattgttagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 31752417  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31752418 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggaacctatata 31752498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 48459343 - 48459523
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48459343 tccaacaatatgctcactttaacattttttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 48459442  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48459443 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 48459523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47550573 - 47550406
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47550573 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 47550474  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47550473 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 47550406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47239618 - 47239438
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47239618 tccagcaatatgctcactttaacatttgataaatgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 47239519  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  47239518 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtatgggtatgggttcagggtgggaacctatata 47239438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 39046815 - 39046994
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39046815 tccaacaatatgctcattttaacatttgttagacggaatgatttagttaatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 39046914  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39046915 aataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggagtgggtacctatata 39046994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 32585363 - 32585531
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgat-agtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32585363 tcactttaacaattgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgattagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagaca 32585462  T
Q  148 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32585463 tataaacataaagtaagtttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatata 32585531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6382506 - 6382325
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6382506 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 6382407  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6382406 aataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 6382325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5902847 - 5902667
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5902847 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 5902748  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5902747 aataagataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 5902667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 7608832 - 7609012
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7608832 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatgacagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 7608931  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608932 aataacataacatatcaacatagagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 7609012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 187
Target Start/End: Original strand, 42774623 - 42774774
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42774623 tccaacaatatgttcattttaacatttgttagaaggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 42774722  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42774723 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacattttggacgggtatg 42774774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31918792 - 31918611
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31918792 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 31918693  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31918692 aataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtaactatata 31918611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Original strand, 21423735 - 21423903
Alignment:
Q  48 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 147  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  21423735 ttcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataaca 21423834  T
Q  148 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21423835 tatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgtgtatgggtttggggtgggtacctatata 21423903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 44317409 - 44317577
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44317409 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatcgtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 44317508  T
Q  149 atcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44317509 atcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 44317577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 43893103 - 43893270
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43893103 tcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 43893202  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  43893203 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgaattcggggtggatacctatata 43893270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11123089 - 11122922
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||    
T  11123089 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtactttttattaacatgacaattataaaacaaaataacaaaacat 11122990  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11122989 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatata 11122922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 11027934 - 11028115
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11027934 tccaacaataagatcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatataaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 11028033  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11028034 aataacataacatatcaatataaagtaatttttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatata 11028115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Original strand, 19534321 - 19534497
Alignment:
Q  39 aacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat 138  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  19534321 aacaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttagatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaat 19534419  T
Q  139 aacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19534420 aacatgacatatcaacataaaataattttctacattcgtgacgggtttgggtatgagttcgaggtgggtacctatata 19534497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 26564694 - 26564873
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||    
T  26564694 tccaacaatatgttcactttaacatttgtttgaccgattgatttagttgttccgttaaatatcaatgatagtttttat-aacacggcagttatcaaacaa 26564792  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    | |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26564793 actaacatgacatatcaacataaagtagttttctgcatttgggacgggtttgggtatggtttcggggtgggtacctatata 26564873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6482266 - 6482088
Alignment:
Q  38 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  6482266 caacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgttagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaa 6482168  T
Q  138 taacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6482167 taacatggcatatcaatataaattagtttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatata 6482088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1724542 - 1724363
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||    ||||||| |||||    
T  1724542 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatctaacaa 1724444  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1724443 aataacatgacatatcaacataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 1724363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 42299653 - 42299832
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  42299653 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagagaggatgatttagttgctcatttaaatatcaacagtagtttttattaacaagacaattatcaaacaa 42299752  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  42299753 aataacatggcatatcaacataaagt-actttttatatttgggacgtgtttgagtatgggttcagggtgggtacctatata 42299832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 55826814 - 55826676
Alignment:
Q  79 tagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgg 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  55826814 tagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacgtgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgg 55826715  T
Q  178 gacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55826714 gacgggtttggatatgggttcggggtgggtacctatata 55826676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4766546 - 4766389
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagt-ttttattaacatgataattatcaaaca 134  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  4766546 tccaacaatatgtttactttaacatttgttagaggtaatgatttagtttatcctttaaatatcaatgatagttttttattaacatgacaattatcaaata 4766447  T
Q  135 aaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||| |||| || |||||    
T  4766446 aaataacataacatatcaacataaagta----tttacatttgggacgggtatgagtttgggt 4766389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 37348986 - 37349165
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||| | |||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  37348986 tccagcaatatgctcactttaagatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaacggtagtttttat-aacgcgagaattatcaaacaa 37349084  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37349085 aataacatggcatatcaacataaaataattttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtggatacctatata 37349165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 167
Target Start/End: Original strand, 425686 - 425816
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  425686 tccagcaatatgttcactttaagatttgttagaccgattgatttagttgttcttttaaatatcaatggtagttttta-taacatgacaattatcaaacaa 425784  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataatttt 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  425785 aataacatggcatatcaacataaagtaatttt 425816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7985342 - 7985189
Alignment:
Q  48 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  7985342 ttcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcatttaaatatcaacggtagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgact 7985243  T
Q  148 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggg 201  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  7985242 tatcaacataaaatacttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggg 7985189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12825680 - 12825512
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12825680 tcactttaatatttattagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaattttagtttttat-aacacgataattatcaaacaaaataacatgatat 12825582  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 218  Q
    ||||||||||| ||||||| | || | ||||| | | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  12825581 atcaacataaagtaattttctgcactcgggacaggtttgggtataggttcagggtgggtacgtatatatc 12825512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15987455 - 15987372
Alignment:
Q  54 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15987455 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaa 15987372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28695357 - 28695195
Alignment:
Q  53 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  28695357 tttaacatttgttaaaccgaatgatttagttgctcctttaaatattaatgatagttttta-taacgtgacaattatcaaataaaataacattgcatatca 28695259  T
Q  153 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||  |||||  || ||||| ||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28695258 acataaagcaatttcctatatttgagacgagtttgggtatgagttcggggtgagtacctatata 28695195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13770687 - 13770518
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || || |||||| |||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  13770687 tccaacaatatgttcactttaacatttgtttgaccgattgatttagttgctccttcaaatattaatggtcgtttttat-aacacggtaattatcaaacaa 13770589  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtggg 206  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  13770588 aataacatggcttattaacataaaatagttttatgcattcgggacgggtttgagtatgagttcggggtggg 13770518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Original strand, 39188379 - 39188557
Alignment:
Q  37 ccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaa 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||||||  ||||| || | ||||||||||||    
T  39188379 ccaacaatatgttcactttaacatttgttagaacgattgatttagttttttctttaaatataaatggtagttttt--taacacgacagttatcaaacaaa 39188476  T
Q  137 ataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |  | |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39188477 ataacatgacatatcaacataaaacaattttatgcattcgggatgagtttggacatgggtttggggt-ggtacctatatatc 39188557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32596413 - 32596237
Alignment:
Q  39 aacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat 138  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  32596413 aacaatatgctcactttaaaatttgttagacttaatgatttagttgttccttcaaatattaatgctagtttttat-aacatgacaattatcaaaccaaat 32596315  T
Q  139 aacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | |||   | |||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  32596314 gacatggtatatcaacataaaataattttctacattcgagacaagtttgggtatgagtttgaggtggggacctatata 32596237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 37107274 - 37107453
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  37107274 tccagcaatatgctcattttaatatttgtcagaccgattgatttagttgcttctttaaataccaatggtagtttttat-aacatggcaattatcaaacaa 37107372  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||    | | |||||   |||||||||||||||||||||    
T  37107373 aataacatgacatatcaacataaagtaattttctgcattcgggatatattttggtataaattcggggtgggtacctatata 37107453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13015446 - 13015323
Alignment:
Q  79 tagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta-----acatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 173  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||| |     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015446 tagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacatgaaaatgaaaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 13015347  T
Q  174 ttgggacggttatgggtatgggtt 197  Q
    | | ||||| | || |||||||||    
T  13015346 tcgagacgggtttgagtatgggtt 13015323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 53906514 - 53906429
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatga 121  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53906514 tccaacaatacgttcactttaacatttgttagaaggaatgatttagttgatccattaaatatcaatagtagtttttattaacatga 53906429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 150
Target Start/End: Original strand, 9230146 - 9230262
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcacttt-aacatttgttagacggaatgatttagttgatct--tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaa 132  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||    
T  9230146 tccaacaatatgttcacttttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacagttatcaaa 9230244  T
Q  133 caaaataacatgacatat 150  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9230245 caaaataacatgacatat 9230262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 53906436 - 53906358
Alignment:
Q  138 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  53906436 taacatgacatatcaacatgaagtaattttttacatttgggacgagtttagatatgggttcggggtgggtacctatata 53906358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Original strand, 10302071 - 10302124
Alignment:
Q  161 taattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10302071 taattttttacatttgggacggatatgggtatgggttcggggtgggtacatata 10302124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15987374 - 15987315
Alignment:
Q  157 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15987374 aaaataattttttatatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatata 15987315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29755562 - 29755456
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||  |  |||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||    
T  29755562 tccaacaatatactcattttaacatttgttagatcgattgatttagttacttctttaaatatcaatggtagtgttta-taacacggtaattatcaaacaa 29755464  T
Q  136 aataacat 143  Q
    ||||||||    
T  29755463 aataacat 29755456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 169
Target Start/End: Original strand, 39375160 - 39375272
Alignment:
Q  54 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 153  Q
    |||||||||||| ||  || | ||||||||| || ||||||||| | || |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39375160 ttaacatttgttcgattgatttatttagttgttcctttaaatattagtggtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataacatgac--atcaa 39375256  T
Q  154 cataaaataatttttt 169  Q
    | |||| |||||||||    
T  39375257 cgtaaagtaatttttt 39375272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 152
Target Start/End: Original strand, 18423474 - 18423545
Alignment:
Q  80 agttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18423474 agttgctcctttaactatcaatgaaagtttttat-atcaagatagttatcaaaccaaataacatgacatatca 18423545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33516178 - 33516126
Alignment:
Q  163 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33516178 attttttacatttgagacgggtttgggtataggttcggggtgggtacttatat 33516126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16216828 - 16216793
Alignment:
Q  117 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16216828 catgataattatcaaaccaaataacatgacatatca 16216793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Original strand, 43309468 - 43309509
Alignment:
Q  157 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttc 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  43309468 aaaataattttttacatttgagacaggtatgggtatgggttc 43309509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 13015605 - 13015557
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg 84  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13015605 tccaataatatgttcactttaacatctgttagaccgaataatttagttg 13015557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 42907875 - 42907927
Alignment:
Q  163 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    ||||| |||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42907875 attttctacattcgggacgagtttgggtatgggctcggggtgggtacctatat 42907927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 17885326 - 17885506
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17885326 tccaacaatatgttcactttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattgacatgacaattatcaaacaa 17885425  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17885426 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggttggaacctatata 17885506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Original strand, 37182136 - 37182300
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37182136 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacacaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 37182235  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37182236 aataacatgacatatcaacataagataattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgg 37182300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38140025 - 38139844
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38140025 tccaacaatacgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 38139926  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataatt-ttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38139925 aataacatgacatatcaatataaaataatttttttacatttgagacgggtttggttatgggttcggggtgggtacttatata 38139844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 16866030 - 16866210
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16866030 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttaatcatttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 16866129  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16866130 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 16866210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44734573 - 44734409
Alignment:
Q  52 ctttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatc 151  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44734573 ctttaatatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaataaaataacatgacatatc 44734474  T
Q  152 aacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44734473 aacataaagtaattttttacatttgggacggatatgtgtatgggttcggggtgggtacctatata 44734409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 7779882 - 7780049
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7779882 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 7779981  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7779982 atcaacataaaataaatttttacatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatata 7780049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 30650505 - 30650672
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30650505 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacat 30650604  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30650605 atcaacataaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 30650672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45885997 - 45885817
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45885997 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgattaagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 45885898  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45885897 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggattttggtatgggttcggggtgggtacctatata 45885817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37196217 - 37196050
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  37196217 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttatatatcaatggtagtttttattaacatgacagttatcaaacaaaataacataacat 37196118  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37196117 atcaacataaagtaattttttacatttatgacgggtttgggtatggattcggggtgggtagctatata 37196050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 17851715 - 17851897
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17851715 tccaacaaaaagctcactttcacatttattagataaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 17851814  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17851815 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatc 17851897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 45379967 - 45380148
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45379967 tccaacaatacgctcactttaacatttgttagacgaactgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 45380066  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45380067 aataacatgacatgtcaacataaagtaatttttttacatttgggacgagtttaggtatgggttcggggtgggtacctatata 45380148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25980135 - 25979967
Alignment:
Q  50 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25980135 cactttaacatttgttagacggaatgatttatttaatcctttaaatatcaatgtaagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatt 25980036  T
Q  150 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  25980035 tcaacataaaataattttttacatttggaaaggatttgggtatgagtttggggtgggtacatatatatc 25979967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41741681 - 41741506
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41741681 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccgttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 41741582  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  41741581 aataacatgacatatcagtataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttc-gggtgggtaccta 41741506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44794259 - 44794084
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44794259 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaagtatcaatggtagtttttagtaacatgacaattatcaaacaa 44794160  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacct 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44794159 aataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacct 44794084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44986130 - 44985981
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44986130 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44986031  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatg 187  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44986030 aataacat-acatatcaacat-aaataattttttacatttgggacgggtatg 44985981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 12980238 - 12980418
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  12980238 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacgaaaattatcaaacaa 12980336  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12980337 aataacatggcatatcaacataaaatattttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 12980418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18125460 - 18125280
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18125460 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgattctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 18125361  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18125360 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgcgttcggggtgggtacctatata 18125280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 39316856 - 39317036
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39316856 tccaccaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaatcgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 39316955  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||| ||| ||||||    
T  39316956 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgagacggatatgggtatgagttcaggatggatacatatata 39317036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 21702533 - 21702700
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21702533 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatataaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 21702632  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702633 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggttggggtatgggttcggggtgggtacctatata 21702700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 35074330 - 35074511
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35074330 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 35074429  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35074430 aataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggttgggtacctatata 35074511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 43507294 - 43507486
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaa---- 131  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||        
T  43507294 tccaacaatatgctcactttaaaatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaa 43507393  T
Q  132 --------acaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43507394 aataacatacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtataggtatgggttcagggtgggtgcctatata 43507486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 196
Target Start/End: Original strand, 24753037 - 24753196
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24753037 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcttt-aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 24753135  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24753136 aataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggt 24753196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Original strand, 3920417 - 3920579
Alignment:
Q  53 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3920417 tttaacatttgttagaccgattcatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacatggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 3920515  T
Q  153 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3920516 acataaaataattttctacattcgggacagttttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 3920579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Original strand, 41103528 - 41103697
Alignment:
Q  50 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatca---atgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgac 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  41103528 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcatcaatggtaatttgtattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagag 41103627  T
Q  147 atatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41103628 atatcaacataaaataattttttacatttaggacgggtttatgtatgggttcggggtgggtacttatata 41103697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 205
Target Start/End: Original strand, 25905489 - 25905659
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | |||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25905489 tccaacaataagctcaccttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 25905588  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggt-tatgggtatgggttcggggtgg 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  25905589 aataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgatgtttgggtatgagttcggggtgg 25905659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44658639 - 44658501
Alignment:
Q  78 ttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgg 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44658639 ttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaatatttttttacatttgg 44658540  T
Q  178 gacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
     |||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44658539 tacgggtttgggtatgggttcgggataggtacctatata 44658501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39456232 - 39456067
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39456232 tcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttccaatatcaatggtaatttttattaccatggcaattatcaaacaaaataacatgacat 39456133  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39456132 atcaacataaagtaa-tttttacatttgggacgggtatgagtat-ggttcggggtgggtacctatata 39456067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18826103 - 18825924
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  18826103 tccaataatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcttttatatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaa 18826005  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18826004 aataacatggcatatcaacgtaaaataattttctgtatttgggatgggtttgggtacgggttcggggtgggtacctatata 18825924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 37579137 - 37579303
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  37579137 tcactttaacatttgttagatggattgatttagttgctcatttaaatatcaatgataatttttat-aacatgacaattatcaaacaaaataacatggcat 37579235  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    | ||||||||| ||||||| | |||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37579236 agcaacataaagtaattttctgcatttgagacagctttgggtataggttcggggtgggtacctatata 37579303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 38152763 - 38152928
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||               |||||||||||||    
T  38152763 tccaacaatacgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttagatatcaatggtagt---------------aattatcaaacaa 38152847  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38152848 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatata 38152928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 216
Target Start/End: Original strand, 16811635 - 16811770
Alignment:
Q  80 agttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttggga 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16811635 agttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataatatatcaacataaagtaattttttacatttggga 16811734  T
Q  180 cggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16811735 cggctttgggtatgggttc-gggtgggtatctatata 16811770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27850556 - 27850380
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  27850556 tccaacaatatgctca-tttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgaaagtttttat-aacacgacaattatcaaacaa 27850459  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 214  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27850458 aataacatgacatatcatcgtaaagtaattttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctata 27850380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45709094 - 45708917
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45709094 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaatatgacaattatcaaacaa 45708995  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45708994 aataatataacatatcaacataaagta---ttttacattttggacgggtttaggtatgagttcggggtgggtacctatata 45708917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2630805 - 2630625
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| | |  |||||||||||||    
T  2630805 tccaacaatatgttcactttaacatttgatagaccgattgatttagttgctcatttaaatatcaatggtagttttta-taatacggcaattatcaaacaa 2630707  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2630706 aataacatggcatatcaacataaagtagtttttttgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatata 2630625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3227108 - 3226999
Alignment:
Q  106 gtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgg 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  3227108 gtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggatgtgtatgagtatgggttcggggtgg 3227009  T
Q  206 gtacctatat 215  Q
    ||||||||||    
T  3227008 gtacctatat 3226999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 5376947 - 5377126
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  5376947 tccaacaatatgctcattttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaa 5377045  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5377046 aattacatgatatatcaacataaagtaattttctgcattcgggacagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 5377126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 46127403 - 46127237
Alignment:
Q  44 aatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacat 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  46127403 aatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagttatta-taacacgacaatgatcaaacaaaataacat 46127305  T
Q  144 gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 214  Q
    |||||||   |||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||| | |||| |||||||||||||    
T  46127304 gacatat---cataaaataattttctgcatttgggacgggtttgagtatgagatcggtgtgggtacctata 46127237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 216
Target Start/End: Original strand, 10072429 - 10072507
Alignment:
Q  138 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10072429 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 10072507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Original strand, 24425246 - 24425421
Alignment:
Q  39 aacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat 138  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  24425246 aacaatatgctcactttaacatttgttagaccggttgatttatttg-tcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgataattatcaaacagaat 24425343  T
Q  139 aacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| | |||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  24425344 aacatggcatatcaacatatagtaattttatgcatttggaacgggtttggaaatggggtcagggtgggtacctatata 24425421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 216
Target Start/End: Original strand, 26622834 - 26622992
Alignment:
Q  57 acatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacat 156  Q
    ||||||||| |||  | ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26622834 acatttgtttgaccaattgatttaattgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacaacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacat 26622932  T
Q  157 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26622933 aaaataattttttgcattcgaaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 26622992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 16078875 - 16079054
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  16078875 tccaacaatatgttcactttaacattttttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaagggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaa 16078973  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |  |||   ||||  | ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  16078974 aataacatggcatatcaacgtaaagtaattttctgtattcatgacgagtttgggtataggtttggggtgggcacctatata 16079054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25783138 - 25782959
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||| ||| || || ||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  25783138 tccaacaatgtgctcactttaatatttattataccgattgatttagttgctcctttaaatattgatgatagtttttat-aacactgcaattatcaaacaa 25783040  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25783039 aataatatgagatattaacataaagtaattttctgcattcgggacggattttggtatgagttcggggtgggtacctatata 25782959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26004675 - 26004526
Alignment:
Q  64 ttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataa 163  Q
    |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26004675 ttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aagaagacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaa 26004577  T
Q  164 ttttttacatttgggacg-gttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||| | |||| ||| || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26004576 ttttctgcattcggggcgagtt---ggtatgggttcggggtgggtatctatata 26004526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 206
Target Start/End: Original strand, 23328484 - 23328641
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    |||||||| ||||| |||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||    
T  23328484 tcactttagcatttattagaccgattgatttagttattcctttaaatatcaatgataattttta-tagcacgacaattatcaaacaaaataacaagacat 23328582  T
Q  149 atcaacat-aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtggg 206  Q
     ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  23328583 gtcaacataaaaataattttctccattcgggacgggtttgggtataggatcggggtggg 23328641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 3227775 - 3227696
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta 115  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3227775 tccaacaatatgctcacttcaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttatta 3227696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Original strand, 10072350 - 10072436
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatag-tttttattaacatga 121  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10072350 tccaacgatatgctcactttaacatttgttaggcggaatgatttagttgatcatttaattatcaatggtagttttttattaacatga 10072436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26004752 - 26004673
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta 115  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26004752 tccaacaatatgctcattttaacatttgttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatggtagtttttatta 26004673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8906700 - 8906643
Alignment:
Q  157 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 214  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8906700 aaaataattttttacatttggaacaggtatggatatgggttcggggtgggtacatata 8906643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 152
Target Start/End: Original strand, 21750665 - 21750740
Alignment:
Q  76 atttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21750665 atttagttggtcttttaactatcaatgaaagttcatat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 21750740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5565414 - 5565361
Alignment:
Q  161 taattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 214  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5565414 taattttttacatttgggatgtgtatgggtatgggttaggggtgggtacatata 5565361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10995934 - 10995894
Alignment:
Q  168 ttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggta 208  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10995934 ttacatttggaacgggtatgggtatgggttcggggtgggta 10995894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27896586 - 27896540
Alignment:
Q  157 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggt 203  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27896586 aaaataattttttatattcgggacgggtatgggtatgagttcggggt 27896540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 214
Target Start/End: Original strand, 33841071 - 33841117
Alignment:
Q  168 ttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 214  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  33841071 ttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgagtacatata 33841117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3274810 - 3274765
Alignment:
Q  137 ataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  3274810 ataacatgacatatcaacataatgtaattttctacattcgggacgg 3274765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 152
Target Start/End: Original strand, 18683857 - 18683928
Alignment:
Q  80 agttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | || |||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18683857 agttgatcatttaactatcaatgaaaattcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatggcatatca 18683928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 20086865 - 20087044
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  20086865 tccaacaatatgcccactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaagcaa 20086964  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20086965 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagta-gggttcggggtgggtacctatata 20087044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Original strand, 29842164 - 29842343
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29842164 tccaacaatatgctcacttcaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 29842263  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29842264 aataacatgacaaatcaacataaagtaattttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatat 29842343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48391048 - 48390870
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48391048 tccaacaatatgttcacttcaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagttttt-ttaacatgacaattatcaaacaa 48390950  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48390949 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacgttcgggacgggtatgggtatgggttcaggatgggtacctatat 48390870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22536071 - 22535893
Alignment:
Q  38 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 137  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22536071 caacaatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaa 22535972  T
Q  138 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22535971 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttaggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggtgcctgtata 22535893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 34025810 - 34025990
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34025810 tccaacaatatgctccctttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaa 34025909  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  34025910 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtggaaacctatata 34025990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 39728527 - 39728707
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  39728527 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttaatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacagaacaattatcaaacaa 39728626  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39728627 aataacattacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 39728707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Original strand, 43582434 - 43582609
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43582434 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatatcaatggtagtttttatttacatgataattatcaaacaa 43582533  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  43582534 aataacatgacatatcaatataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttc-gggtgggtaccta 43582609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 44172482 - 44172662
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44172482 tccaacaatacgctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44172581  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44172582 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 44172662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 44179182 - 44179362
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44179182 tccaacaatacgctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44179281  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44179282 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 44179362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 44252603 - 44252783
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44252603 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44252702  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44252703 aataacataacatatcaacataaagtagttttttatatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 44252783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Original strand, 44639143 - 44639310
Alignment:
Q  48 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 147  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44639143 ttcactttcacatttgttagata-aatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 44639241  T
Q  148 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44639242 tatcaacataaaataattttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 44639310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17146367 - 17146202
Alignment:
Q  51 actttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatat 150  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17146367 actttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatat 17146268  T
Q  151 caacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17146267 caacataaagtaattttttacatttgggaagggtttgtgtatgggttcggggtggatacctatata 17146202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Original strand, 34154274 - 34154449
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34154274 tccaacaatatgttcactttaatatttgttagacataatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 34154373  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    ||||     ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34154374 aata-----acatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 34154449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Original strand, 23580698 - 23580863
Alignment:
Q  50 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23580698 cactttaacatttgttatacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acata 23580796  T
Q  150 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23580797 tcaacataaaataattttttacatttgggataagtgtgggtatgggttcggagtgggtacctatata 23580863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 49579920 - 49580100
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  49579920 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaatcatcaaacaa 49580019  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49580020 aataacataacatatcaatataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcgaggtgggtacctatata 49580100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10823925 - 10823759
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10823925 tccaacaataagttcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 10823826  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcgggg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  10823825 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggagaggtttgggtatgggttcgggg 10823759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44107011 - 44106842
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44107011 tcactttcacatttgtaagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 44106912  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 218  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44106911 attaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtagatacctatatatc 44106842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6738626 - 6738446
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6738626 tccaccaatatgctcactttaacatctgttagacataatgatttaattgatccttccaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 6738527  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  6738526 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatggatttggggtgggtacctatata 6738446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 29284192 - 29284372
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29284192 tccaacaataagctcactttcacatttgttaaacaaaattatttagttgatcttttaaatattaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 29284291  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29284292 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatctgggacgggtttgggtatgggttcgggctgggtacctatata 29284372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39655505 - 39655325
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39655505 tccaacaataagctcactttcacatttgttagagaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 39655406  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39655405 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgagacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatata 39655325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44953667 - 44953487
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44953667 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44953568  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44953567 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgagtatgagttcggggtgagtacctatata 44953487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 52198023 - 52198191
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat-aacatgaca 147  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||    
T  52198023 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataaacatagca 52198122  T
Q  148 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52198123 tatcaacgtaaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 52198191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 52572465 - 52572645
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52572465 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatactttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 52572564  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  52572565 aataacataacatattaacataaagtaattttttacatttgggacgggcttgagtatggattcggggtgggtccctatata 52572645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7469997 - 7469830
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7469997 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacat 7469898  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||| ||||||| || | ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7469897 atccacataaagtagtgttttacatttgggacgggtttgtgtatgggttcggggtgggtacctatata 7469830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Original strand, 49025550 - 49025701
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  49025550 tcactttcacatttattagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacataacaattatcaaacaaaataacataacat 49025649  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcgg 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  49025650 atcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgg 49025701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4557536 - 4557357
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  4557536 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaa 4557438  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4557437 aataacatgacatatcaacataaagtaattttctgcattcgggatagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 4557357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 34119515 - 34119692
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  34119515 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcatttcaatatcaatgttagttttta-taacacgacaattatcaaacaa 34119613  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||  ||| |||||||||| ||| || |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34119614 aata--atggcatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 34119692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 205
Target Start/End: Original strand, 30682687 - 30682846
Alignment:
Q  45 atgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30682687 atgttcactttaacatttgttagaacgaatgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacatgaccattatcaaacaaaataacatg 30682785  T
Q  145 acatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgg 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| | || |||| |||||| |||||    
T  30682786 acatatcaacataaagtaattttctacattcaggacgggtttgagtataggttcgaggtgg 30682846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 53631761 - 53631940
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  53631761 tccaacaatatgctcactttatcatttgttagaccgatcgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaa 53631859  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53631860 aataacatggcatatcaacataaagtaattttctagattcgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtacctatata 53631940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23154242 - 23154116
Alignment:
Q  89 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgg 188  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||     
T  23154242 tttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggataggtatga 23154144  T
Q  189 gtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23154143 gtatgggttcggagtgggtacctatata 23154116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Original strand, 42758248 - 42758410
Alignment:
Q  53 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42758248 tttaacatttgttagaccggttgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aacatggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 42758346  T
Q  153 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||| ||||||| | | || ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42758347 acataaagtaattttcttcgttcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgcatacctatata 42758410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 48306755 - 48306650
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  48306755 tcactttaatatttgttagacggaatgatttagttgatactttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaattaacatgacaa 48306656  T
Q  149 atcaac 154  Q
    ||||||    
T  48306655 atcaac 48306650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4016275 - 4016096
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||| ||  |||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  4016275 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcgatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaa 4016177  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| | |||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4016176 aataacatgacatatcaacataaggtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggagtgggtacctatata 4016096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31127026 - 31126847
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||    
T  31127026 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttat-aatacgacaattatcaaacaa 31126928  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  || |||| | |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31126927 aataacatggcatatcaacacaatgtagttttctgcatttgggacgagtttgggtatgagttcggggtggatacctatata 31126847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Original strand, 54317018 - 54317180
Alignment:
Q  53 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54317018 tttaacatttgttagacatgttgatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 54317116  T
Q  153 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||| ||||||| | | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54317117 acataaagtaattttcttcgtttgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtacctatata 54317180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 19111592 - 19111770
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  19111592 tccaacaatatgatcactttaacatttgttataccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgaaaattatcaaacaa 19111690  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| | |||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19111691 aataacatgacatat-aacataaagtaattttctacattttgtacgggtttgggcatgggtttagggtgggtacttatata 19111770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23547204 - 23547069
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23547204 tccaacaataagctcactttcacatttgttaaacaaaattatttagttgatcctttaaatataaatgctagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 23547105  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttac 171  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  23547104 aataacataacatattaacataaagtagttttttac 23547069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41937233 - 41937089
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  41937233 tccaacaacatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcatttcaatatcaatgttagtcttta-taacacgacaattatcaaacaa 41937135  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacg 181  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| || |||| | |||||| ||||    
T  41937134 aataatatgacatgtcaacacaaagtagttttctgcatttgagacg 41937089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 210
Target Start/End: Original strand, 830866 - 831039
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||||||    
T  830866 tccagcaatatgctcacgttaacattttttagaccaattgatttagtttctccttaaaatatcaatgatagtttttat-aagacggcaattatcaaacaa 830964  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacc 210  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  830965 aataacatagcatattaacataaagtaattttctgcattcgggacgaatttgggtatgggttcagggtgggtacc 831039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48305760 - 48305693
Alignment:
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48305760 atcaacataaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatata 48305693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23910385 - 23910330
Alignment:
Q  127 atcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23910385 atcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttctacattcgggacgg 23910330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23547055 - 23546994
Alignment:
Q  155 ataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23547055 ataaagtagttttttacatttgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 23546994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30616392 - 30616344
Alignment:
Q  157 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30616392 aaaataattttttacgtttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgg 30616344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 14208260 - 14208377
Alignment:
Q  38 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 137  Q
    |||||| || |||| ||||||||||  | ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  14208260 caacaatattttcattttaacatttccttgactgaatgattttgttgctcctttaaatatcaatgaca-ttttta-taacatgacaattatcaaaccaaa 14208357  T
Q  138 taacatgacatatcaacata 157  Q
    ||||||   |||||||||||    
T  14208358 taacatagtatatcaacata 14208377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1772573 - 1772538
Alignment:
Q  117 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1772573 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 1772538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10043389 - 10043343
Alignment:
Q  161 taattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggt 207  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10043389 taattttttatattcgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggt 10043343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30904914 - 30904868
Alignment:
Q  169 tacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30904914 tacattcgagacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatat 30904868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 152
Target Start/End: Original strand, 23330033 - 23330113
Alignment:
Q  71 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    |||| ||||||||| || ||||| ||||||| | |||| |||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23330033 gaataatttagttgctcgtttaactatcaataaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccgaataacatgacatatca 23330113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 32853700 - 32853880
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32853700 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 32853799  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32853800 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 32853880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10142737 - 10142570
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10142737 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 10142638  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10142637 atcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatata 10142570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 12141254 - 12141421
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  12141254 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgttagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacgt 12141353  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12141354 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 12141421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Original strand, 24225569 - 24225734
Alignment:
Q  51 actttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatat 150  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24225569 actttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatat 24225668  T
Q  151 caacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24225669 caacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggcatgggttcggggtgggtacctatata 24225734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10188305 - 10188125
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10188305 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcgaacaa 10188206  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10188205 aataacataatatatcaacataaaataattttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 10188125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 27534540 - 27534720
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27534540 tccaacaataagttcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgattctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 27534639  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27534640 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatggattcggggtgggtacctatata 27534720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5863602 - 5863435
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5863602 tcactttcacattttttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacataacat 5863503  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5863502 atcaacataaaatatttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtatctatata 5863435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 2367182 - 2367362
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2367182 tccaacaataagctcactttaacatttgttagacaaaatgatttagtttatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 2367281  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2367282 aataacataacatatccacataaagtaattttttccatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 2367362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3484155 - 3483975
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  3484155 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatgaaacaa 3484056  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3484055 aataacataacatatccacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 3483975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 219
Target Start/End: Original strand, 27738664 - 27738811
Alignment:
Q  72 aatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttac 171  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27738664 aatgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcatacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttac 27738763  T
Q  172 atttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 219  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27738764 atttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatatct 27738811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 203
Target Start/End: Original strand, 14032413 - 14032579
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  14032413 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aacacaacaattatcaaacaa 14032511  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14032512 aataacatgacatatcaacataaagtaattttatgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggt 14032579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 216
Target Start/End: Original strand, 12309444 - 12309608
Alignment:
Q  45 atgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatg 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||       || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12309444 atgtttactttaacatttgttagacgaaatgatttaattgcccctttaaatatcaatgatagt-------aatatgacaattatcaaacaaaataacatg 12309536  T
Q  145 acatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12309537 acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatcggttcggggtgggtacatatata 12309608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12678324 - 12678146
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  12678324 tccagcaatatgctcactttaac-tttattagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgataatttttat-aacacgacaattatcaaacaa 12678227  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12678226 aataacatgacatatcaatataaaataattttctcaattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatata 12678146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Original strand, 14505943 - 14506118
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  14505943 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttat-aacacgacaattatcaaacaa 14506041  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 212  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  14506042 aataacgtgacatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacgggtttaagtatgggttcggggtgggtaccta 14506118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24603074 - 24602908
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| ||     
T  24603074 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgtcaattatcaaacaaaataacatggcac 24602976  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24602975 atcaacataaagtaattttctacattcgtgatgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatata 24602908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7394118 - 7393939
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7394118 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatgttagttttta-taacacggtaattatcaaacaa 7394020  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||  ||| |  | || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7394019 aataatatgatataccaacataaaataaatttatgcattcaggatgagtttgagtatgggttcggggtggatacctatata 7393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 216
Target Start/End: Original strand, 32053000 - 32053124
Alignment:
Q  92 aaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggta 191  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  32053000 aaatatcattgtaagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtatttttttacattttggacgggtttgggta 32053099  T
Q  192 tgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||    
T  32053100 tgggtttggggtgggtacatatata 32053124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 14254824 - 14254993
Alignment:
Q  45 atgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta-acatgataattatcaaacaaaataacat 143  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  14254824 atgttgactttaacatttattagaccgaatgatttaatcgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacatca-aatt-tcaaacaaaataacat 14254921  T
Q  144 gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14254922 gacatatcaacataaagttattatttgcatttgggacgaatttgggtatgggttcatggtgggtacctatat 14254993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 30816114 - 30816296
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||    
T  30816114 tccaacaatatgtacactttaacatttgttagaccgattgatttaggtgctcctttaaatgtcaatggtagttttta-taacacggcaattatccaacaa 30816212  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata---attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||    |||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30816213 aataacatcacatatcaacataaagtagtttttttttgcattcgggacgggtttggatatgggttcggggtgggttcctatata 30816296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 216
Target Start/End: Original strand, 32532498 - 32532576
Alignment:
Q  138 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32532498 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 32532576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 216
Target Start/End: Original strand, 11762342 - 11762481
Alignment:
Q  76 atttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacattt 175  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11762342 atttagttgctcctataaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatataacaaaataacatggcatatcaacataaagtaattttctacattt 11762440  T
Q  176 gggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  11762441 gggatgggtttgggtatgagttcggggtggacacctatata 11762481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Original strand, 32532420 - 32532505
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatga 121  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32532420 tccaataatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttggtcctttaaatatcattggtagtttttattaacatga 32532505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14411064 - 14410954
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  14411064 tccagcaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgatggttttta-taacacgacaattatcaaacaa 14410966  T
Q  136 aataacatgaca 147  Q
    ||||||| ||||    
T  14410965 aataacacgaca 14410954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Original strand, 14245113 - 14245214
Alignment:
Q  45 atgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatg 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  14245113 atgttcactttaacatttattagaccgaatgatttagtcgctcctttaaatattaatggtagttttta-taacacgacaattttcaaacaaaataacatg 14245211  T
Q  145 aca 147  Q
    |||    
T  14245212 aca 14245214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 111
Target Start/End: Original strand, 32052927 - 32052988
Alignment:
Q  50 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagttttt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  32052927 cactttaacatttgttagacggaatgatttatttaatcctttaaatatcaatgtaagttttt 32052988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Original strand, 20349039 - 20349099
Alignment:
Q  155 ataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20349039 ataaattaattttttacatttgcaacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatat 20349099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Original strand, 15498309 - 15498360
Alignment:
Q  165 tttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15498309 tttttacatttgggacgggtttgggtgtgggttcgggatgggtacctatata 15498360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 152
Target Start/End: Original strand, 9458234 - 9458269
Alignment:
Q  117 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9458234 catgataattatcaaaccaaataacatgacatatca 9458269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14410946 - 14410907
Alignment:
Q  177 ggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14410946 ggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 14410907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28079778 - 28079749
Alignment:
Q  186 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28079778 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 28079749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 256597 - 256545
Alignment:
Q  163 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    ||||| ||||||| ||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  256597 attttctacatttaggaggggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatat 256545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34346118 - 34346058
Alignment:
Q  155 ataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34346118 ataaattaattttctacattcggaacggatttgggtatagattcggggtgggtacctatat 34346058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Original strand, 4113 - 4275
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4113 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 4212  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  4213 aataacatgacatatcaacataaagtattttttttacatttgggacgagtttgggtatgggtt 4275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 10157 - 10333
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |   | ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10157 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatgac---ggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaa 10253  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10254 aataacat-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatata 10333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 197558 - 197380
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  197558 tccagcaaaatgctcactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacaaggtaattatcaaacaa 197460  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| | ||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  197459 aataacatggcatatcaacataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgggtatagattcggtttgggtacctatat 197380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 14632 - 14811
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  14632 tccagcaatatgctcactttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttac-aacacaataattatcaaacaa 14730  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  14731 aataatatatcatatcaacattaaataattttctacatttgggacgagtttgggtatgtgttcaaggtgggtacctatata 14811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 33250 - 33429
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  33250 tccaacaatatgtttactttaacaattgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatcgtagtttttat-aacacaacaattaccaaacaa 33348  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| || |||| | |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33349 aataacatggcatgtcaacataaagtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatata 33429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 90467 - 90633
Alignment:
Q  49 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 148  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||| || ||||    |||||| ||||||||||||||| |||    
T  90467 tcactttaatatttgttagaccgattgatttatttgctcctttaaatatcaatggttgttttaat-aacacatcaattattaaacaaaataacatggcat 90565  T
Q  149 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 216  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||  | || |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  90566 atcaacataaaataattttctgcattcaggacgaatttgtgtatgggttcggggagggtaccaatata 90633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 182
Target Start/End: Original strand, 6263 - 6408
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||| |||||| || |||||| || || || || ||||||||||    
T  6263 tccagcaatatgttcactttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatttcaatggtaattttta-tagcacgacaactatcaaacaa 6361  T
Q  136 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgg 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||    
T  6362 aataacatggcatatcaacataaagtaactttctgcatttgagacgg 6408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32761 - 32642
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||  |||    
T  32761 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgatc-attaaatatcactggtagtttttattaccatgaccattatcactcaa 32663  T
Q  136 aataacatgacatatcaacat 156  Q
    ||| ||||||| |||| ||||    
T  32662 aatcacatgacctatctacat 32642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 150
Target Start/End: Original strand, 36012 - 36128
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcacttt-aacatttgttagacggaatgatttagttgatct--tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaa 132  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||    
T  36012 tccaacaatatgttcacttttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacagttatcaaa 36110  T
Q  133 caaaataacatgacatat 150  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36111 caaaataacatgacatat 36128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 204
Target Start/End: Original strand, 33440 - 33611
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaa-ca 134  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  33440 tccaacaatatgttcactttaatatttgttacaccgactgatttaattgcttctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgaaaattatcaaatca 33538  T
Q  135 ---aaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtg 204  Q
       |||||||||| ||||||| |||||| || |||| | |||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  33539 aataaataacatggcatatcatcataaagtagttttctgcatttgtgacgggtttggttatgggtttggggtg 33611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14376 - 14299
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttat 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  14376 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttaattgttcctttaaatatcaatggtagtttttat 14299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14300 - 14268
Alignment:
Q  137 ataacatgacatatcaacataaaataatttttt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14300 ataacatgacatatcaacataaaatagtttttt 14268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1630 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1630
Description:

Target: scaffold1630; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Original strand, 1479 - 1545
Alignment:
Q  36 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatg 102  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1479 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatg 1545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 152
Target Start/End: Original strand, 16847 - 16917
Alignment:
Q  81 gttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 152  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16847 gttggtcttttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgataattatcaaaccaaataacatggcatatca 16917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University