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Alignment Overview

Query: NF13366_low_18 (Length: 491)

Name: NF13366_low_18
Description: NF13366
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13366_low_18
NF13366_low_18
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (12-472)||(41764668-41765140)
chr7 (12-296)||(29173639-29173922)
chr7 (12-279)||(31520519-31520786)
chr7 (12-268)||(32592996-32593251)
chr7 (15-297)||(48928057-48928356)
chr7 (12-268)||(26980422-26980678)
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chr7 (75-268)||(35353287-35353480)
chr7 (12-275)||(18797426-18797706)
chr7 (72-272)||(37703283-37703483)
chr7 (18-268)||(9355615-9355882)
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chr7 (72-272)||(17842369-17842569)
chr7 (72-272)||(37110050-37110250)
chr7 (72-268)||(37347197-37347393)
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chr7 (72-268)||(46480918-46481114)
chr7 (72-301)||(24211917-24212147)
chr7 (88-266)||(44411331-44411509)
chr7 (12-268)||(15612548-15612821)
chr7 (72-264)||(32820846-32821038)
chr7 (72-275)||(4583095-4583298)
chr7 (72-275)||(23111368-23111571)
chr7 (72-266)||(10359005-10359199)
chr7 (72-272)||(27283920-27284122)
chr7 (12-268)||(6546618-6546891)
chr7 (12-227)||(12165851-12166074)
chr7 (75-268)||(32432631-32432824)
chr7 (12-275)||(10481704-10481984)
chr7 (72-297)||(5657240-5657466)
chr7 (12-272)||(7334893-7335169)
chr7 (72-268)||(8861461-8861657)
chr7 (12-268)||(21991735-21991999)
chr7 (12-268)||(15672548-15672824)
chr7 (12-251)||(11071305-11071558)
chr7 (72-268)||(26587881-26588069)
chr7 (12-264)||(22687338-22687599)
chr7 (72-264)||(25691337-25691529)
chr7 (101-272)||(37704387-37704558)
chr7 (21-186)||(38053586-38053751)
chr7 (81-260)||(43925286-43925459)
chr7 (12-163)||(38258644-38258812)
chr7 (72-186)||(43686216-43686330)
chr7 (12-202)||(33688117-33688324)
chr7 (72-264)||(44598842-44599034)
chr7 (112-266)||(34361967-34362123)
chr7 (15-152)||(48928469-48928623)
chr7 (184-297)||(38258867-38258980)
chr7 (12-82)||(37704256-37704326)
chr7 (12-82)||(10359206-10359277)
chr7 (72-126)||(37704333-37704387)
chr7 (12-82)||(43686139-43686209)
chr7 (16-82)||(44413371-44413437)
chr7 (12-82)||(44598765-44598835)
chr7 (12-81)||(27421373-27421442)
chr7 (12-82)||(4583018-4583088)
chr7 (12-82)||(8861384-8861454)
chr7 (12-82)||(32432551-32432621)
chr7 (12-81)||(5657474-5657543)
chr7 (15-82)||(25691536-25691603)
chr7 (32-82)||(26588076-26588126)
chr7 (15-69)||(27283846-27283900)
chr7 (12-74)||(32821053-32821115)
chr7 (12-57)||(17842603-17842648)
chr7 (12-57)||(23111289-23111334)
chr7 (12-69)||(24211840-24211897)
chr7 (12-57)||(37109971-37110016)
chr7 (140-203)||(27421219-27421282)
chr7 (72-124)||(27421313-27421365)
chr7 (21-81)||(46481122-46481182)
chr7 (23-76)||(43925211-43925264)
chr7 (222-298)||(12166215-12166291)
chr7 (21-57)||(37703515-37703551)
[»] chr1 (71 HSPs)
chr1 (13-268)||(14758162-14758425)
chr1 (12-264)||(11742155-11742407)
chr1 (12-279)||(15168216-15168500)
chr1 (13-264)||(2959869-2960137)
chr1 (12-251)||(16415766-16416022)
chr1 (72-272)||(37451482-37451682)
chr1 (12-263)||(27227273-27227541)
chr1 (72-296)||(32216252-32216476)
chr1 (12-298)||(34012135-34012433)
chr1 (72-298)||(19899521-19899748)
chr1 (12-272)||(15383053-15383331)
chr1 (15-264)||(27563692-27563958)
chr1 (12-275)||(8222248-8222528)
chr1 (12-264)||(47279309-47279578)
chr1 (12-264)||(7078850-7079119)
chr1 (12-268)||(31621331-31621609)
chr1 (72-299)||(46931606-46931834)
chr1 (72-275)||(10922924-10923127)
chr1 (12-264)||(4330401-4330670)
chr1 (12-268)||(30254543-30254816)
chr1 (72-264)||(238300-238492)
chr1 (72-264)||(48353740-48353931)
chr1 (16-277)||(40884937-40885216)
chr1 (72-272)||(23999544-23999745)
chr1 (72-272)||(28564562-28564760)
chr1 (72-272)||(32267231-32267431)
chr1 (12-257)||(25160752-25161015)
chr1 (12-269)||(9902836-9903110)
chr1 (12-301)||(27532732-27533036)
chr1 (12-272)||(51128979-51129254)
chr1 (12-304)||(15752149-15752458)
chr1 (12-268)||(27266984-27267255)
chr1 (72-272)||(27763089-27763290)
chr1 (72-268)||(47682277-47682473)
chr1 (12-268)||(38823334-38823607)
chr1 (15-264)||(3535055-3535312)
chr1 (12-228)||(30326775-30327008)
chr1 (16-266)||(10181792-10182060)
chr1 (72-272)||(28769850-28770050)
chr1 (72-299)||(22170908-22171135)
chr1 (72-246)||(1359740-1359914)
chr1 (12-275)||(42721159-42721435)
chr1 (71-259)||(3309349-3309538)
chr1 (12-264)||(33725398-33725656)
chr1 (72-272)||(39393581-39393781)
chr1 (12-251)||(41926283-41926532)
chr1 (12-223)||(37618729-37618948)
chr1 (120-268)||(1547516-1547664)
chr1 (89-279)||(21289817-21290004)
chr1 (12-210)||(18422771-18422986)
chr1 (110-268)||(31962851-31963010)
chr1 (72-189)||(38759730-38759847)
chr1 (12-147)||(48620757-48620900)
chr1 (12-82)||(32216175-32216245)
chr1 (12-82)||(47682480-47682550)
chr1 (12-82)||(238499-238569)
chr1 (12-81)||(39393503-39393573)
chr1 (21-82)||(1547408-1547469)
chr1 (12-69)||(28769772-28769829)
chr1 (12-73)||(3309267-3309329)
chr1 (12-69)||(10922847-10922904)
chr1 (12-69)||(28564780-28564837)
chr1 (12-69)||(32267154-32267211)
chr1 (12-69)||(46931531-46931588)
chr1 (208-268)||(48620922-48620982)
chr1 (12-70)||(22170831-22170889)
chr1 (15-69)||(23999470-23999524)
chr1 (12-69)||(19899768-19899825)
chr1 (12-69)||(27763310-27763367)
chr1 (12-57)||(37451405-37451450)
chr1 (232-268)||(38759847-38759883)
[»] chr3 (81 HSPs)
chr3 (12-268)||(11357169-11357425)
chr3 (12-275)||(43975673-43975949)
chr3 (12-262)||(22451083-22451350)
chr3 (72-273)||(46297545-46297746)
chr3 (12-268)||(52040710-52040983)
chr3 (12-279)||(48355056-48355340)
chr3 (12-296)||(26941020-26941321)
chr3 (15-297)||(33378544-33378843)
chr3 (12-264)||(53228944-53229213)
chr3 (12-272)||(40936106-40936365)
chr3 (12-264)||(22622510-22622779)
chr3 (12-268)||(33698268-33698541)
chr3 (12-268)||(39282767-39283040)
chr3 (12-272)||(42505859-42506136)
chr3 (12-272)||(44186301-44186562)
chr3 (74-268)||(40552047-40552241)
chr3 (72-268)||(1089886-1090081)
chr3 (72-305)||(21009552-21009786)
chr3 (72-272)||(54505999-54506200)
chr3 (72-268)||(4015652-4015847)
chr3 (72-275)||(24707896-24708099)
chr3 (11-268)||(2008047-2008327)
chr3 (72-268)||(37157899-37158096)
chr3 (72-272)||(3362447-3362647)
chr3 (12-268)||(14586468-14586731)
chr3 (12-268)||(37203182-37203456)
chr3 (72-272)||(47481714-47481915)
chr3 (12-264)||(29099470-29099730)
chr3 (12-268)||(44891612-44891885)
chr3 (72-264)||(7327274-7327466)
chr3 (72-272)||(25579931-25580131)
chr3 (12-268)||(22445853-22446125)
chr3 (12-264)||(32373585-32373853)
chr3 (72-228)||(34133127-34133283)
chr3 (12-227)||(46994490-46994722)
chr3 (72-266)||(4761438-4761632)
chr3 (72-272)||(27480142-27480350)
chr3 (84-275)||(51212558-51212743)
chr3 (12-268)||(21193721-21193995)
chr3 (12-275)||(3654980-3655263)
chr3 (12-268)||(29163933-29164190)
chr3 (72-268)||(11356946-11357134)
chr3 (74-272)||(24488745-24488944)
chr3 (75-268)||(36012333-36012528)
chr3 (72-211)||(54828546-54828685)
chr3 (15-228)||(38591816-38592046)
chr3 (72-268)||(20373051-20373228)
chr3 (12-268)||(11466939-11467198)
chr3 (90-261)||(50475021-50475199)
chr3 (12-186)||(43348372-43348563)
chr3 (72-195)||(45174698-45174821)
chr3 (12-82)||(27480370-27480440)
chr3 (72-195)||(11835494-11835611)
chr3 (85-193)||(53811597-53811701)
chr3 (12-82)||(51212972-51213042)
chr3 (12-82)||(35844441-35844512)
chr3 (12-82)||(24488953-24489023)
chr3 (12-82)||(34133050-34133120)
chr3 (12-82)||(46297753-46297823)
chr3 (12-69)||(20373300-20373357)
chr3 (12-83)||(45174620-45174692)
chr3 (12-69)||(4761653-4761710)
chr3 (12-83)||(53176169-53176240)
chr3 (11-66)||(54828708-54828763)
chr3 (15-81)||(1089811-1089877)
chr3 (12-82)||(4015575-4015645)
chr3 (12-81)||(11835619-11835689)
chr3 (210-272)||(35844577-35844639)
chr3 (12-66)||(37157822-37157876)
chr3 (12-70)||(24708118-24708178)
chr3 (12-76)||(3362368-3362434)
chr3 (12-74)||(40552258-40552320)
chr3 (12-69)||(21009806-21009863)
chr3 (12-71)||(36012252-36012312)
chr3 (12-71)||(25579854-25579913)
chr3 (72-135)||(35844519-35844581)
chr3 (12-70)||(7327485-7327543)
chr3 (72-110)||(53176246-53176284)
chr3 (241-294)||(13498678-13498731)
chr3 (234-279)||(34133312-34133357)
chr3 (12-57)||(47481637-47481682)
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (12-268)||(24886228-24886484)
chr5 (12-264)||(14409123-14409378)
chr5 (12-268)||(22980917-22981190)
chr5 (12-279)||(33908357-33908640)
chr5 (12-268)||(699274-699547)
chr5 (12-268)||(31786424-31786697)
chr5 (12-222)||(1428983-1429196)
chr5 (12-272)||(31705386-31705663)
chr5 (72-275)||(2888216-2888419)
chr5 (12-268)||(35511260-35511528)
chr5 (12-268)||(7208642-7208915)
chr5 (12-264)||(38528019-38528288)
chr5 (72-275)||(5830093-5830296)
chr5 (72-296)||(40133586-40133810)
chr5 (16-268)||(12910483-12910752)
chr5 (12-268)||(22255306-22255579)
chr5 (72-272)||(35504566-35504766)
chr5 (12-268)||(32563273-32563537)
chr5 (72-296)||(36866963-36867187)
chr5 (72-275)||(36860625-36860828)
chr5 (72-268)||(15992318-15992514)
chr5 (72-272)||(17157805-17158005)
chr5 (12-275)||(22973853-22974133)
chr5 (72-278)||(35826254-35826458)
chr5 (74-268)||(8437168-8437362)
chr5 (12-268)||(42342855-42343118)
chr5 (12-264)||(8466868-8467119)
chr5 (72-267)||(8741664-8741860)
chr5 (72-268)||(19120060-19120256)
chr5 (12-268)||(22019756-22020020)
chr5 (41-264)||(25669739-25669969)
chr5 (12-264)||(9200357-9200617)
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chr5 (12-275)||(27318259-27318538)
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scaffold0017 (12-69)||(154649-154706)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
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[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (32-216)||(100894-101058)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 12 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 41765140 - 41764668
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||    
41765140 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatca 41765041  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
41765040 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagattttgcaagcattactggatgaattattattg 41764941  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  || ||| |||    
41764940 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatttcccgactccaccgtagaaactc 41764841  T
295 ccattaattaatggatagaatnnnnnnnnttgactacaataaatgtatgtatgatatcttttaggaaaatgctaagaagtgttcacttactctagactag 394  Q
    |||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||    
41764840 ccattaattaattgatagaataaaaaaaattgactacaataaatgtatgtatgatatcttttaagaaaatgctaagaagtgttcacttact-----ctag 41764746  T
395 aatgcatgtactaagatttttaagnnnnnnnggctagtgatagatttacccaatcatggcaagcaagtatgaaatgat 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41764745 aatgcatgtactaagatttttaagaaaaaaatgctagtgatagatttacccaatcatggcaagcaagtatgaaatgat 41764668  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 29173639 - 29173922
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 111  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
29173639 atcatcaattcatcaaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgttacacttaagactatcacataatatcatcaactc 29173738  T
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
29173739 tgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatgaatcagtaatc 29173837  T
212 aacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctccc 296  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  || |||||||||    
29173838 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcatcgtagaagctccc 29173922  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31520786 - 31520519
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 111  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
31520786 atcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactc 31520687  T
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||     
31520686 tatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaatt 31520587  T
212 aacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
31520586 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaact 31520519  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32593251 - 32592996
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
32593251 atcatcaattcatcagattatcaaaactgcatttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaacta 32593152  T
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
32593151 tgtttgcatgttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaaatattactagataaattactatggatcattaatcagcaatc 32593052  T
212 aacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
32593051 aacaattt-aaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 32592996  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 48928356 - 48928057
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatcacat 97  Q
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48928356 atcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcat 48928257  T
98 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
48928256 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatc 48928157  T
198 attaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctccca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||    
48928156 attaatcaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacatttagatcaaaattaatttttttaaaaaagtcaattttctaactgcaccgtagaagctccca 48928057  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 26980422 - 26980678
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
26980422 atcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactc 26980521  T
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
26980522 tatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaattattgttgatcattaatcggtaatc 26980621  T
212 aacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
26980622 aacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 26980678  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12390689 - 12390409
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |     
12390689 atcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaagtgtaacacttaagact--cacataatatcatcaactcagc 12390592  T
115 ttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaac 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||  ||    
12390591 ttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaccattactagatgaattactatttatcattaatcagtaattgac 12390492  T
215 aatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctccca 297  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||  || ||||||||||    
12390491 aatttaaaaatgaaataaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgacttcaccgtagaagctccca 12390409  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 268
Target Start/End: Original strand, 35353287 - 35353480
Alignment:
75 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcat 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
35353287 tgtaacacttaagactatctcataatatcatcaactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcat 35353386  T
175 tactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
35353387 tactagatgaatcactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 35353480  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 18797426 - 18797706
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||                 |||||||||||||||||||    
18797426 atcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatca 18797525  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
18797526 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 18797625  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
18797626 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttct 18797706  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37703483 - 37703283
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||     
37703483 aagtgtaccacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaa 37703384  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
37703383 cattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatt 37703284  T
272 t 272  Q
    |    
37703283 t 37703283  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9355882 - 9355615
Alignment:
18 aattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatcacataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||                 |||| |||||||||||||    
9355882 aattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataat 9355783  T
101 atcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
9355782 atcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcatt 9355683  T
201 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
9355682 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 9355615  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31579126 - 31578853
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||                 |||||||||||||||||||    
31579126 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacaccctataaagtgtaacacttaagactatca 31579027  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
31579026 cataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 31578927  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
31578926 atcattaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacaataaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 31578853  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17842569 - 17842369
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
17842569 aagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 17842470  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
17842469 cattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttccaaaaaagtcaatt 17842370  T
272 t 272  Q
    |    
17842369 t 17842369  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 37110050 - 37110250
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
37110050 aagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 37110149  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||    
37110150 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttccaaaaaaatcaatt 37110249  T
272 t 272  Q
    |    
37110250 t 37110250  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 37347197 - 37347393
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
37347197 aagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaag 37347296  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
37347297 cattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtca 37347393  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 30055626 - 30055903
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||                 ||||||||||||||||||||    
30055626 atcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatca 30055725  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
30055726 cataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 30055825  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
30055826 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaattt 30055903  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 46481114 - 46480918
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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46481114 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcattaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaa 46481015  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
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46481014 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaataaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtca 46480918  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 301
Target Start/End: Original strand, 24211917 - 24212147
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||    
24211917 aagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaag 24212016  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
24212017 cattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 24212116  T
271 tttctaactccagtgtggaagctcccattaa 301  Q
    || || ||| ||  || ||||||| ||||||    
24212117 ttcctgactgcaccgtagaagctctcattaa 24212147  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44411509 - 44411331
Alignment:
88 actatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaatt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
44411509 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 44411410  T
188 aatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagt 266  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
44411409 aatattgaccattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatgaaacattaagatcataattaacctttccaaaaaagt 44411331  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15612821 - 15612548
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||    
15612821 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 15612722  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
15612721 catgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttg 15612622  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
15612621 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttaaaaaaagtca 15612548  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32821038 - 32820846
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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32821038 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 32820939  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
32820938 cattactagatgaattactattaatcattcatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaaa 32820846  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 275
Target Start/End: Original strand, 4583095 - 4583298
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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4583095 aagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaag 4583194  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
4583195 cattactggatgaattactattaatcatgaatcagtcatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaatt 4583294  T
272 ttct 275  Q
    ||||    
4583295 ttct 4583298  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 275
Target Start/End: Original strand, 23111368 - 23111571
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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23111368 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaaatcaaagatgttgaaag 23111467  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||    
23111468 cattactagaagaattactattgatcataaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaagttaacttttttaaaaaagtcagtt 23111567  T
272 ttct 275  Q
    ||||    
23111568 ttct 23111571  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10359199 - 10359005
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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10359199 aagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaagattttgcaag 10359100  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagt 266  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
10359099 cattactaaatgatttactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgatcaaaattaactttttcaaaaaagt 10359005  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 27283920 - 27284122
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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27283920 aagtgtaacacttaaaactatcacataatattatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 27284019  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaat-gaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttc-aaaaaagtcaa 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
27284020 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaatcttttcaaaaaaagtcaa 27284119  T
270 ttt 272  Q
    |||    
27284120 ttt 27284122  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 6546618 - 6546891
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                 |||| | |||||    
6546618 atcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataacacttaatattatca 6546717  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||    
6546718 catgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgaggcaagcattactagatgaattactattg 6546817  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
6546818 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 6546891  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 12165851 - 12166074
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||      |||  ||    ||||||||||||    
12165851 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcacataatatc 12165950  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
12165951 agcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 12166050  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatga 227  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
12166051 cagtaatcaacaatttaaaaatga 12166074  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 268
Target Start/End: Original strand, 32432631 - 32432824
Alignment:
75 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
32432631 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgcatattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaagcat 32432730  T
175 tactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||    
32432731 tactagatgaattattattaatcatgaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaacttttttaaaaaagtca 32432824  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 10481704 - 10481984
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
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10481704 atcatcaattcatcagattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 10481803  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
10481804 cataatatcatcaactctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagtatccgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattg 10481903  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
10481904 atcgttaatcagtaattaacaatttaaaaataaattaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttct 10481984  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5657466 - 5657240
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
5657466 aagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 5657367  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacatt-aagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||   | |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| |    
5657366 cattactagatgaattactattgatcattaatgagtaatcaaaaatttaaaaatgaataaatcattaaagattaaaattaactttttcaaaaatgtcagt 5657267  T
271 tttctaactccagtgtggaagctccca 297  Q
    ||  ||||| || ||| ||||||||||    
5657266 ttcataactgcattgtagaagctccca 5657240  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 7334893 - 7335169
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||                 |||||| |||||    
7334893 atcatcaactcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacagagtgtaacacttaagattatca 7334992  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
7334993 gataatatcatcaacta-gtttgaatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatta 7335091  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
7335092 atcattaatcagaaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaattt 7335169  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 8861461 - 8861657
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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8861461 aagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcatg 8861560  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
8861561 cattactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacactaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 8861657  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 21991735 - 21991999
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||    
21991735 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 21991834  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||     |||||||||| |||||    
21991835 catgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagca-----agatgaattactattg 21991929  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||| | |    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
21991930 atcatcatt----aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaccttttcaaaaaagtca 21991999  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15672824 - 15672548
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact-----------------taagactatca 94  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||    
15672824 atcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatca 15672725  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaata---gtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaata 191  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||   |||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
15672724 cataatatcatcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattacta 15672625  T
192 ttgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||    
15672624 ttgatcatgcatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaggttaaaattaattttttcaaaaaagtca 15672548  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 11071305 - 11071558
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa-----------------cacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                 ||||||||| |||||    
11071305 atcatcaattcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagattatca 11071404  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
11071405 cataatatcatcaactttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattg 11071501  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaa 251  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||    
11071502 atcattaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa 11071558  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26588069 - 26587881
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||        ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| |    
26588069 aagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactctgtt--------aaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcagg 26587978  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
26587977 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 26587881  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 22687338 - 22687599
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca-----------------cttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                 || |||||||||     
22687338 atcatcaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatct 22687437  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| ||||        || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
22687438 catgatatcaacaactctgtt--------aaggatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaatagatgaattactattg 22687529  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
22687530 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcatacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 22687599  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25691529 - 25691337
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||  | |||||||| ||| || ||||||     
25691529 aagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaataacacatgtaagttcaaaatgttgcaaa 25691430  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
25691429 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaattttttaaaaaa 25691337  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 272
Target Start/End: Original strand, 37704387 - 37704558
Alignment:
101 atcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcatt 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
37704387 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaattactattgatcatt 37704486  T
201 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||   ||| |||||||||||||||    
37704487 aattagtaatcaacaatttacaaatgaatcaaacattaaaatcaagattagtttttccaaaaaagtcaattt 37704558  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 38053586 - 38053751
Alignment:
21 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcat 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
38053586 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatactttgttataagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttggat 38053685  T
121 gttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaat 186  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||    
38053686 gttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattatttgatgaat 38053751  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 260
Target Start/End: Original strand, 43925286 - 43925459
Alignment:
81 acttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactag 180  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       ||||||||| ||||||||||||||||    
43925286 acttaatacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatac------gtccaagatgttgcaagcattactag 43925379  T
181 atgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaa 260  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||    
43925380 atgaattactattaatcatgaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaa 43925459  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 38258644 - 38258812
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||                 ||||||||||||||||||||    
38258644 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 38258743  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagat 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
38258744 cataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagat 38258812  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 43686216 - 43686330
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
43686216 aagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaag 43686315  T
172 cattactagatgaat 186  Q
    ||||||| |||||||    
43686316 cattactggatgaat 43686330  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33688324 - 33688117
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt-----------------aagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||                  ||||||||||    
33688324 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacactccataaagtgtaacattcaagactatca 33688225  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
     || |||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
33688224 tatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattg 33688125  T
195 atcattaa 202  Q
    ||||||||    
33688124 atcattaa 33688117  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Original strand, 44598842 - 44599034
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||| || ||||    
44598842 aagtgtaacacctaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatgttacaag 44598941  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatc---agcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||   |  |||||||||||| |||||||| | | | ||||||| ||||||||  |||||||||||    
44598942 cattactagatgaa--actattgatcattaatcaataataatcaacaattt-aaaatgaatcaatcgttaagattaaaattaattttttcaaaaaa 44599034  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34362123 - 34361967
Alignment:
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||     
34362123 tgtttgcatgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattacttttgatcattaatcagtcatt 34362024  T
212 aacaatttaaaaatgaaccgaacatt-aaga-tcaaaattaaccttttcaaaaaagt 266  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||    
34362023 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagatttaaaattaactttttcaaaaaagt 34361967  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 48928623 - 48928469
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatcacat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||                 ||||||||||| |||    
48928623 atcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcat 48928524  T
98 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
48928523 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgt 48928469  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Original strand, 38258867 - 38258980
Alignment:
184 aattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccag 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||     
38258867 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagttttctgactgcac 38258966  T
284 tgtggaagctccca 297  Q
     || ||||||||||    
38258967 cgtagaagctccca 38258980  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 37704256 - 37704326
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
37704256 atcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 37704326  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10359277 - 10359206
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaa-tctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
10359277 atcatcaattcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 10359206  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 126
Target Start/End: Original strand, 37704333 - 37704387
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
37704333 aagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa 37704387  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 43686139 - 43686209
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
43686139 atcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 43686209  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 44413437 - 44413371
Alignment:
16 tcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
44413437 tcaattcatcaaattaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 44413371  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 44598765 - 44598835
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
44598765 atcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac 44598835  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 27421442 - 27421373
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 81  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
27421442 atcataaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 27421373  T

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Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 4583018 - 4583088
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
4583018 atcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 4583088  T

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Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 8861384 - 8861454
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
8861384 atcatcaattaatcagattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 8861454  T

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Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 32432551 - 32432621
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
32432551 atcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaagtgtaacac 32432621  T

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Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5657543 - 5657474
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 81  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
5657543 atcatcaattcatcatattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaaca 5657474  T

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Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25691603 - 25691536
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||||| |||||||| | | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
25691603 atcaattcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 25691536  T

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Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26588076
Alignment:
32 acaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 26588076  T

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Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 27283846 - 27283900
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
27283846 atcaatttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgtt 27283900  T

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Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 32821115 - 32821053
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag 74  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
32821115 atcatcaattcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaag 32821053  T

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Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 17842648 - 17842603
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
17842648 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataatttta 17842603  T

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Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Original strand, 23111289 - 23111334
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 57  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
23111289 atcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaatttta 23111334  T

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Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 24211840 - 24211897
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||    
24211840 atcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 24211897  T

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Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Original strand, 37109971 - 37110016
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
37109971 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataatttta 37110016  T

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Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27421282 - 27421219
Alignment:
140 aaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||    
27421282 aaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatgttacaagatgaaataatattgatcattaat 27421219  T

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Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27421365 - 27421313
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgtta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||||    
27421365 aagtgtaacacttaagactatcgtatgatatcagcaactctgtttgcatgtta 27421313  T

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Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 46481182 - 46481122
Alignment:
21 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 81  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
46481182 tcatcagattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtgtaaca 46481122  T

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Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 76
Target Start/End: Original strand, 43925211 - 43925264
Alignment:
23 atcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtg 76  Q
    |||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
43925211 atcagactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtg 43925264  T

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Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 298
Target Start/End: Original strand, 12166215 - 12166291
Alignment:
222 aaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctcccat 298  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||  | ||| |||||| |||||||||||    
12166215 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttagaaaagtcagtttcatgactgcagtgtagaagctcccat 12166291  T

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Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 37703551 - 37703515
Alignment:
21 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 57  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
37703551 tcatcagattaataagactacacttaatctaatttta 37703515  T

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Target: chr1 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 71)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 14758162 - 14758425
Alignment:
13 tcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac--------ttaagactatcacataatatca 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||    
14758162 tcatcaattcattagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaattaagactatcgcataatatca 14758261  T
105 tcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
14758262 tcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 14758361  T
205 agcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
14758362 aacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 14758425  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11742407 - 11742155
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||     
11742407 atcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaattaagactatcacatgatatcagcaactc 11742308  T
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
11742307 tctttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 11742208  T
212 aacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
11742207 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 11742155  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 279
Target Start/End: Original strand, 15168216 - 15168500
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||                 |||||||||||| |||||     
15168216 atcatcaattcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacttaaggctatcg 15168315  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
15168316 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaagatgttgcaagcattattagatgaattactattg 15168415  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||    
15168416 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctaact 15168500  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 2959869 - 2960137
Alignment:
13 tcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acacttaagactatcac 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||                 |||||||||||||||||    
2959869 tcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaagactatcac 2959968  T
96 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattga 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
2959969 ataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 2960068  T
196 tcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
2960069 tcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 2960137  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 16415766 - 16416022
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||                 ||||||||||||    
16415766 atcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatattgtaatacttaagactatca 16415865  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
16415866 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattg 16415965  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaa 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
16415966 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 16416022  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 37451482 - 37451682
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||     
37451482 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaa 37451581  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
37451582 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttcaaaaaagtcaatt 37451681  T
272 t 272  Q
    |    
37451682 t 37451682  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27227541 - 27227273
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||    
27227541 atcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatca 27227442  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
27227441 catgatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 27227342  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaa 263  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
27227341 atcattaatcagtaatcaaccatttaaaaatgaattaaacattaatatcaaaattaacttttccaaaaa 27227273  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 296
Target Start/End: Original strand, 32216252 - 32216476
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
32216252 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaag 32216351  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
32216352 cattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 32216451  T
272 ttctaactccagtgtggaagctccc 296  Q
    |||| ||| ||  || |||||||||    
32216452 ttctgactgcaccgtagaagctccc 32216476  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34012433 - 34012135
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact----------taagac--tatcacataa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||           ||| ||  ||||||||||    
34012433 atcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacactatcacataa 34012334  T
100 tatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcat 199  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
34012333 tatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcat 34012234  T
200 taatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctcccat 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||| ||  || |||||||||||    
34012233 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcccat 34012135  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19899748 - 19899521
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
19899748 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcaccaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 19899649  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |    
19899648 cattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagt 19899549  T
271 tttctaactccagtgtggaagctcccat 298  Q
    || |||||| || ||| |||||||||||    
19899548 ttcctaactgcactgtagaagctcccat 19899521  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 15383053 - 15383331
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||                 |||||||||||| |||||||    
15383053 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatca 15383152  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
15383153 cataatatcatcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 15383252  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatg-aaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
15383253 attattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaattt 15383331  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27563958 - 27563692
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa-----------------cacttaagactatcacat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||                 ||||||||||||||| ||    
27563958 atcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccacaaagaggaacacttaagactatcatat 27563859  T
98 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 197  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
27563858 aatttcatcaactctgtttgcatgttaaagatgcaaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattaatattgatc 27563759  T
198 attaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
27563758 attaatcagtaatcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaa 27563692  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 8222248 - 8222528
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
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8222248 atcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatca 8222347  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
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195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatg-aaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 47279309 - 47279578
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa-----------------gtgtaacacttaagactatca 94  Q
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47279309 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcccataaagtgtaacacttaagactatca 47279408  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
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195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
47279509 atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 47279578  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7079119 - 7078850
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
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95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
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195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
7078919 atcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 7078850  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31621609 - 31621331
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa----------------cacttaagactatcac 95  Q
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31621609 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaataccccagaagtgtgacacttaagactatcgc 31621510  T
96 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaa-----agatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaat 190  Q
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31621509 ataatatcaacaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaatatgttgcaagcattagtagatgaactact 31621410  T
191 attgatcattaatcagcaatcaacaattta-aaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
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31621409 attgatcattaatcatcaatcaacaatttaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 31621331  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 299
Target Start/End: Original strand, 46931606 - 46931834
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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46931606 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 46931705  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
46931706 cattactagatgaatatattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 46931805  T
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46931806 ttccttactgcaccgtagaagctcccatt 46931834  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 72 - 275
Target Start/End: Original strand, 10922924 - 10923127
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
10923024 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaagagtcagtt 10923123  T
272 ttct 275  Q
    ||||    
10923124 ttct 10923127  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 4330401 - 4330670
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acacttaagactatca 94  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||    
4330401 atcatcaatttatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatca 4330500  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||    
4330501 cataatatcatcaactctttttgcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaattacaattg 4330600  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
4330601 atcattaatcagtaatcaacaatataaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttccaaaaaa 4330670  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 30254543 - 30254816
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
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30254543 atcatcaattcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacaccctataaagtgtaacacttaagactgtca 30254642  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
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30254643 cataataacatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 30254742  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
30254743 attattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 30254816  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 238492 - 238300
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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238492 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgtaagtccaagatgttgcaag 238393  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
238392 cattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatcaactttttcaaaaaa 238300  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Original strand, 48353740 - 48353931
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
48353740 aagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaag 48353838  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
48353839 cattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 48353931  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Original strand, 40884937 - 40885216
Alignment:
16 tcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatcacata 98  Q
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40884937 tcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacacttaagactatcgcata 40885036  T
99 atatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatca 198  Q
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40885037 atatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatca 40885136  T
199 ttaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaa-ttaaccttttcaaaaaagtcaattttctaa 277  Q
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40885137 ttaattagcaatcaataattcaaaaatgaatcgaatattaaggttaaaagttaacatttttaaaaaagtcaattttctaa 40885216  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 23999544 - 23999745
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
23999544 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 23999643  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
23999644 cattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaggtcaat 23999743  T
271 tt 272  Q
    ||    
23999744 tt 23999745  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28564760 - 28564562
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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28564760 aagtgtaacacttaa--ctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaaa 28564663  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
28564662 cattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatt 28564563  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 32267231 - 32267431
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||  |||| ||||||||| |||||||    
32267231 aagtgtaacactcaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgtaggtccaagatgttgcaag 32267330  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
32267331 cattactagatgaattactattgaacattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaatt 32267430  T
272 t 272  Q
    |    
32267431 t 32267431  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 257
Target Start/End: Original strand, 25160752 - 25161015
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
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25160752 atcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtataacacttaaaactatca 25160851  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
25160852 cataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactatatgaattactattg 25160951  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatg-aaccgaacattaagatcaaaattaacctttt 257  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
25160952 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaacctttt 25161015  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9903110 - 9902836
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acacttaagactatca 94  Q
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9903110 atcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatca 9903011  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
9903010 cataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaagtccaagatgctgcaagcactactagatgaattactattg 9902911  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaa 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
9902910 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaa 9902836  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27533036 - 27532732
Alignment:
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    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |                 ||||||||||    
27533036 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcaagactatca 27532938  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
27532937 catgatatcagcaattctgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 27532838  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
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27532837 atcattaatcagtaatcaacaa-ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaagctc 27532739  T
295 ccattaa 301  Q
    |||||||    
27532738 ccattaa 27532732  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 51128979 - 51129254
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
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51128979 atcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaactatca 51129078  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
51129079 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 51129178  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||    
51129179 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagtattaaaat--aaattaactttttcaaaaaagtcaattt 51129254  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 304
Target Start/End: Original strand, 15752149 - 15752458
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
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15752149 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagagtatca 15752248  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| |||||    
15752249 cataatatcattaactctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgtaagtccaagaagttgcaatttttactagatgaattactattg 15752348  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||| ||| ||  || |||||||    
15752349 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttttaaaaaatcaattttctgactgcaccgtagaagctc 15752448  T
295 ccattaatta 304  Q
    |||| |||||    
15752449 ccataaatta 15752458  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27267255 - 27266984
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||                 ||||||||||||    
27267255 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaatc-taccttgttttgagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatca 27267157  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
27267156 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 27267057  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    || ||||||||  |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
27267056 ataattaatcaataatcaataatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaa-cttttccaaaaagtca 27266984  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27763290 - 27763089
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
27763290 aagtgtaatacttaagactatcacataatataatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagttcaagatgttgcaag 27763191  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
27763190 cattactagataaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaatgtcaat 27763091  T
271 tt 272  Q
    ||    
27763090 tt 27763089  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47682473 - 47682277
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
47682473 aagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaag 47682374  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
47682373 cattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaaagaattaaacattaagattaaaattaacttgttcaaaaaagtca 47682277  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 38823334 - 38823607
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||                 |||||||||||||||||||    
38823334 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacacccaacaaagtgtaacacttaagactatca 38823433  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||    
38823434 catgatatcagcaactctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattg 38823533  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
38823534 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaacaaatattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtca 38823607  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 264
Target Start/End: Original strand, 3535055 - 3535312
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagactatcacata----atatcatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||      |||  || ||| ||    |||||| |    
3535055 atcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttacatgatatcagc 3535154  T
107 aactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcag 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
3535155 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaa 3535254  T
207 caatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||    
3535255 caatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaactaactttttaaaaaaa 3535312  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30327008 - 30326775
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||                 |||||||||||| |||||||    
30327008 atcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatca 30326909  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
30326908 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 30326809  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaa 228  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
30326808 atcatcaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaa 30326775  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10182060 - 10181792
Alignment:
16 tcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatcacata 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||    
10182060 tcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacata 10181961  T
99 atatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatat-gtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 197  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| ||  |||||||  | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
10181960 atatcatcaactctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtaccttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgaac 10181861  T
198 attaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagt 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
10181860 attaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagt 10181792  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 28769850 - 28770050
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||     
28769850 aagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcacctctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaa 28769949  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||    
28769950 cattgctagatgaattactattgatcattaattaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcaatt 28770049  T
272 t 272  Q
    |    
28770050 t 28770050  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 299
Target Start/End: Original strand, 22170908 - 22171135
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |   |||||||| ||||| ||||||     
22170908 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttgcaaa 22171007  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
22171008 cattattagataaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtt 22171107  T
272 ttctaactccagtgtggaagctcccatt 299  Q
    |||||| | ||  || ||||||||||||    
22171108 ttctaattgcaccgtagaagctcccatt 22171135  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1359914 - 1359740
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||| || |||||||    
1359914 aagtgtaacacttaagattatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaatgttgcaag 1359815  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaa 246  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
1359814 cattactggatgaattactatcgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaa 1359740  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 42721159 - 42721435
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa-----------------cacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                 ||||||||| |||||    
42721159 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtataacacttaagattatca 42721258  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||    
42721259 cgtaatatcatcaactttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgtaagtccaagatgttgcaattattactagattaattactattg 42721355  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||    
42721356 atcattaatgagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttttaaaaaa-tcaattttct 42721435  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 259
Target Start/End: Original strand, 3309349 - 3309538
Alignment:
71 taagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||    
3309349 taagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacccgtaagtccaagatattgcaa 3309448  T
171 gcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaaga-tcaaaattaaccttttca 259  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||||| ||||||    
3309449 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatttagatttaaaattaactttttca 3309538  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33725656 - 33725398
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||     
33725656 atcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacatttaagactatcg 33725557  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| || |||||| ||||||            |||||    
33725556 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatgttgcaaacattac------------tattg 33725469  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatt-taaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
33725468 atcattaatcagcaatcaacaattaaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaataaactttttcaaaaaa 33725398  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 39393581 - 39393781
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||| |||||||| ||||||     
39393581 aagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaaatccaagatgttgcaaa 39393680  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||    
39393681 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaaaattaaaattaacttttttaaaaaagtcaatt 39393780  T
272 t 272  Q
    |    
39393781 t 39393781  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 41926283 - 41926532
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact----------taagact-atcacataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||          ||| ||| || | |||||    
41926283 atcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttattaaataat 41926382  T
101 atcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcatt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
41926383 atcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt-caagcattactagatgaattactattgatcatt 41926481  T
201 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaa 251  Q
    ||| |  ||||||  |||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||    
41926482 aattaataatcaatgatttaaaattgaatcaaacattaaaatcataattaa 41926532  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37618948 - 37618729
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac----ttaagactatcac----ataatatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||     | |||  || |||    ||||||||    
37618948 atcatcaattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacatcccataaagtgtaacactcatataatatc 37618849  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
37618848 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattgaccattaat 37618749  T
204 cagcaatcaacaatttaaaa 223  Q
    ||  ||||||||||||||||    
37618748 caataatcaacaatttaaaa 37618729  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Original strand, 1547516 - 1547664
Alignment:
120 tgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaattt 219  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
1547516 tgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagtaatcaacaattt 1547615  T
220 aaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
1547616 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagtca 1547664  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 279
Target Start/End: Original strand, 21289817 - 21290004
Alignment:
89 ctatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaatta 188  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |  | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
21289817 ctatcacataatatca---actctgtttgcatattaaagatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaatta 21289913  T
189 atattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| |||| |||||    
21289914 ttattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttctaaaaaagtcagttttttaact 21290004  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 210
Target Start/End: Original strand, 18422771 - 18422986
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttta-----------------agtgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||                 ||||||||||||||||||||||    
18422771 atcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 18422870  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
18422871 cataatatcatcacctccgtttgcatgttaaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtccaagatgttgcaagcattgctagatgaattactattg 18422970  T
195 atcattaatcagcaat 210  Q
    ||||||||||| ||||    
18422971 atcattaatcaacaat 18422986  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 268
Target Start/End: Original strand, 31962851 - 31963010
Alignment:
110 tatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaa 209  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||    
31962851 tatgtttgcatgttaaagaaatcaacgataaaataatatatgtaagtttaagatgttgcaagcattattagatgaactactattgatcattaatcggtaa 31962950  T
210 tcaacaa-tttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
31962951 tcaacaattttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 31963010  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 189
Target Start/End: Original strand, 38759730 - 38759847
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
38759730 aagtgtaacacttgagactatcagataatatcaccaactatgtttgcatgttaaaggtgtcaactataaaataatatatgtaactccaagatgttgcaag 38759829  T
172 cattactagatgaattaa 189  Q
    ||||||||||| ||||||    
38759830 cattactagattaattaa 38759847  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Original strand, 48620757 - 48620900
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac----ttaag----actatcacataatatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      |||    ||  |||||| |||||    
48620757 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcacatgatatc 48620856  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagta 147  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
48620857 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgaataaatagta 48620900  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 32216175 - 32216245
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
32216175 atcatcaattcattagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 32216245  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 47682550 - 47682480
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||    
47682550 atcatcaattcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaacac 47682480  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 238569 - 238499
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
238569 atcaacaattaatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac 238499  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 39393503 - 39393573
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaaca 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
39393503 atcataaattcatcagattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaaca 39393573  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Original strand, 1547408 - 1547469
Alignment:
21 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
1547408 tcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 1547469  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 28769772 - 28769829
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
28769772 atcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgtt 28769829  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Original strand, 3309267 - 3309329
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaa 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
3309267 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaa 3309329  T

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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 10922847 - 10922904
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||    
10922847 atcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgtt 10922904  T

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Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 28564837 - 28564780
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||    
28564837 atcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgtt 28564780  T

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Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 32267154 - 32267211
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
32267154 atcatcaacccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgtt 32267211  T

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Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 46931531 - 46931588
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||    
46931531 atcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 46931588  T

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Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 268
Target Start/End: Original strand, 48620922 - 48620982
Alignment:
208 aatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
48620922 aatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtca 48620982  T

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Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 70
Target Start/End: Original strand, 22170831 - 22170889
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttt 70  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
22170831 atcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgttt 22170889  T

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Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 23999470 - 23999524
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||    
23999470 atcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 23999524  T

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Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19899825 - 19899768
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||    
19899825 atcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgtt 19899768  T

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Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 27763367 - 27763310
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||    
27763367 atcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagtt 27763310  T

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Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Original strand, 37451405 - 37451450
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 57  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
37451405 atcatcaatttatcatattaacaagactacacttaatctaatttta 37451450  T

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Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 268
Target Start/End: Original strand, 38759847 - 38759883
Alignment:
232 aacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
38759847 aacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 38759883  T

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Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 81)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11357425 - 11357169
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
11357425 atcatcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactc 11357326  T
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
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11357325 tgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 11357226  T
212 aacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
11357225 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtca 11357169  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43975949 - 43975673
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact----------taagactatcacataata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||           ||| |||||| |||||||    
43975949 atcatcaattcatcagattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacactatcgcataata 43975850  T
102 tcatcaactatgtt---tgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatca 198  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43975849 tcatcaactatgttgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatca 43975750  T
199 ttaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||    
43975749 ttaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaagattaattttttcaaaagagtcagttttct 43975673  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 22451083 - 22451350
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                 ||||||| |||| ||||||     
22451083 atcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacaccccagtaagtgtaacatttaacactatcg 22451182  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
22451183 tataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattg 22451282  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaa 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
22451283 atcattaatcagcaatcaaaaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaa 22451350  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46297746 - 46297545
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
46297746 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaag 46297647  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
46297646 cattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 46297547  T
272 tt 273  Q
    ||    
46297546 tt 46297545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 52040983 - 52040710
Alignment:
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52040983 atcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatagtgtaacacttaagactatca 52040884  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||    
52040883 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaatgattattg 52040784  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
52040783 atcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtca 52040710  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 279
Target Start/End: Original strand, 48355056 - 48355340
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa-----------------gtgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||                 |||||||||||||||||||||    
48355056 atcatcaactcatcagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacataccacaaagtgtaacacttaagactatca 48355155  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
48355156 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattattattg 48355255  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
48355256 atcattaatcagtaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctaact 48355340  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26941321 - 26941020
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||                 |||||||||||| |||||||    
26941321 atcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctcataaagtgtaacacttaaaactatca 26941222  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
26941221 tataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 26941122  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  || |||||||    
26941121 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcgttaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccgtagaagctc 26941022  T
295 cc 296  Q
    ||    
26941021 cc 26941020  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33378843 - 33378544
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatcacat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||| |||    
33378843 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaagaagtgtaatacttaagactatcgcat 33378744  T
98 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
33378743 aatctcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatc 33378644  T
198 attaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctccca 297  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||| ||  || ||||||||||    
33378643 attaatcaataatcaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccca 33378544  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 53229213 - 53228944
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaac-----------------acttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||                 ||||||||||||||    
53229213 atcatcaattcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaactccccacaaagtgtaacacttaagactatca 53229114  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
53229113 catagtatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattg 53229014  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
53229013 atcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 53228944  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 40936106 - 40936365
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||     
40936106 atcatctattcatcagattaacaagaatacacttaatataattttatccaacttt-ttttaagtgtaacacttaagactatcacatgatattagcaactc 40936204  T
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||    
40936205 cgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagataaattactattgatcattaatcggtaatc 40936304  T
212 aacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||||||| || | | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
40936305 aacaatttaaaaataaatcaatcattaagattgaaattaactttttcaaaaaagtcaattt 40936365  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22622779 - 22622510
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||                 ||||||||||||    
22622779 atcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatca 22622680  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
22622679 cataatatcatcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 22622580  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
22622579 atcattaatcagtaatcaactatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 22622510  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 33698268 - 33698541
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||     
33698268 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcg 33698367  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
33698368 catgatatcggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactagatgaattaatattg 33698467  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
33698468 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcagtcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 33698541  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 39282767 - 39283040
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||                 |||||||||||||||||||    
39282767 atcatccattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 39282866  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||     
39282867 cataatatcatcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaatccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactatta 39282966  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
39282967 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 39283040  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42506136 - 42505859
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||                 ||||||||||||||||||||    
42506136 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 42506037  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
42506036 cataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 42505937  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
42505936 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaattt 42505859  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 44186562 - 44186301
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaaga-ctatcacataatatcatcaact 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   | | ||||||||| |||||| |||||    
44186562 atcatcaattcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccacaactatcacatgatatcaacaact 44186463  T
111 atgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaat 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
44186462 ctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttgcaagcattactagataaattactattgatcattaatcagtaat 44186363  T
211 caacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
44186362 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacattttcgaaaaaatcaattt 44186301  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 74 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40552241 - 40552047
Alignment:
74 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagca 173  Q
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40552241 gtgtaacacttaggattgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccatgatgttgcaagca 40552142  T
174 ttactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
40552141 ttactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 40552047  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 1089886 - 1090081
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||    
1089886 aagtgtaacacttaagactatcacataacatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaag 1089984  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
1089985 cattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 1090081  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21009786 - 21009552
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||    
21009786 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacaatatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaag 21009687  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| |    
21009686 cattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttttaaaaaagtcagt 21009587  T
271 tttctaactccagtgtggaagctcccattaattaa 305  Q
    || || ||| ||  || ||| ||||||||||||||    
21009586 ttcctgactgcaccgtagaaactcccattaattaa 21009552  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 54505999 - 54506200
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
54505999 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatctactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaag 54506098  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
54506099 cattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaat 54506198  T
271 tt 272  Q
    ||    
54506199 tt 54506200  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 4015652 - 4015847
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
4015652 aagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaact-tgtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 4015750  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
4015751 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 4015847  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24708099 - 24707896
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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24708099 aagtgtaacacttaaaacaatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgcaag 24708000  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||    
24707999 cattattagataaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcaatt 24707900  T
272 ttct 275  Q
    ||||    
24707899 ttct 24707896  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Original strand, 2008047 - 2008327
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11 catcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
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2008047 catcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgtacactccacaaagtgtaacacttaagactatca 2008146  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
2008147 catgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaaataatattg 2008246  T
195 atcattaatcag-------caatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||        ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
2008247 atcattaatcagtaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 2008327  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 37157899 - 37158096
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72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactat-gtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || | ||||    
37157899 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaatatgtcgcaa 37157998  T
171 gcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
37157999 gcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 37158096  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 3362447 - 3362647
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |  |||||||| || |||||||    
3362447 aagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtacttagaagtccaatatgttgcaag 3362546  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
3362547 cattactggatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcaatt 3362646  T
272 t 272  Q
    |    
3362647 t 3362647  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14586731 - 14586468
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagactatcac----ataatatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||      |||  || |||    || |||||    
14586731 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcgtatgatatc 14586632  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
14586631 aacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacg-gtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattactactgatcattaat 14586533  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
14586532 cagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagtca 14586468  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 37203182 - 37203456
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatca 94  Q
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37203182 atcatcaattcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 37203281  T
95 cataatatcatcaactat-gtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatatt 193  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||  |||    
37203282 cataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaagtccaatatatcgcaagcattactagatgaattaccatt 37203381  T
194 gatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
37203382 gatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 37203456  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 47481714 - 47481915
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
47481714 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttcaagatgttgcaag 47481813  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
47481814 cattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaat 47481913  T
271 tt 272  Q
    ||    
47481914 tt 47481915  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 29099470 - 29099730
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aag----actatcacataatatc 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||      |||    ||| |||||| |||||    
29099470 atcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaactttcacatgatatc 29099569  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
29099570 agcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaat 29099669  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||    
29099670 cagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaactttttcaaaaaa 29099730  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 44891612 - 44891885
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||    
44891612 atcatcaattaatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatca 44891711  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
44891712 catgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactgttg 44891811  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
44891812 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtca 44891885  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7327466 - 7327274
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||    
7327466 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaag 7327367  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
7327366 cattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttttaaaaaa 7327274  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 25579931 - 25580131
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  | ||| || ||||| |||||||    
25579931 aagtgtaacacttaagactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaagatattgcaag 25580030  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||    
25580031 cattactagatgaattactattgatcattaatccgcaatcaacaatttaaaaatgaaccaatcattaagattaagattaacttttttaaaaaagtcaatt 25580130  T
272 t 272  Q
    |    
25580131 t 25580131  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22446125 - 22445853
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactta----------------agactatcac 95  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |                |||||||||     
22446125 atcatcaattcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacactcacaatgtataacactcaagactatcat 22446026  T
96 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattga 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
22446025 ataatatcatcaactatttttgcatattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaatgttgcaagtattactggatgaattactattga 22445926  T
196 tcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
22445925 tcattaatcagtaatcaacaatttaaatatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtca 22445853  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 32373585 - 32373853
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca-----------------cttaagactatca 94  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||    
32373585 atcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtgacacttaagactatca 32373684  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
32373685 catgatatcagcaactctgtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattg 32373784  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||   | || |||||| ||||||||| |||||||||||    
32373785 atcattaatcagtaatcaacaattt-aaaatgaattcatcaataagattaaaattaactttttcaaaaaa 32373853  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 34133127 - 34133283
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
34133127 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 34133226  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaa 228  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
34133227 cattactagatgaattactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaa 34133283  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46994722 - 46994490
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||                 ||||||||||||||||||||    
46994722 atcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacgccccacaaaatgtaacacttaagactatca 46994623  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
46994622 cataatatcatcaattatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattactattg 46994523  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatga 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
46994522 atcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatga 46994490  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4761632 - 4761438
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||| || ||||||     
4761632 aagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgttgcaaa 4761533  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagt 266  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
4761532 cattaccagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaacaatttgaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaaagt 4761438  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27480350 - 27480142
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactat----gtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagat---- 163  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||        
27480350 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgtta 27480251  T
164 tttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaa 263  Q
     || ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||| |||||    
27480250 attacaaacattactagatgaattactattgattattaatcagcgatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagaacaaaattatatttttaaaaaa 27480151  T
264 agtcaattt 272  Q
    | |||||||    
27480150 aatcaattt 27480142  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 51212743 - 51212558
Alignment:
84 taagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatg 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
51212743 taaggctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 51212644  T
184 aattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
51212643 aattactattgatcattaattaaaaatcaacaatttaaaaatgaa------attaagatcaaaattaactttttcaaaaatgtcagttttct 51212558  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 21193721 - 21193995
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt------------------aagactatc 93  Q
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94 acataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatatt 193  Q
    | || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||   |||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||    
21193821 atatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaatagtagccgtaagttcaagatgttgcaaccattactaaatgaattactatt 21193920  T
194 gatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
21193921 gattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 21193995  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3655263 - 3654980
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12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
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3655263 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacaccacaaaatgtaacacttaaaactatca 3655164  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactag--atgaattaatat 192  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||| |||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||    
3655163 catgatatcatcagctctgtttgcatgttaaagattccatcgataaaataacacatataagtccaagatgttgcaagcattactagatatgaattactat 3655064  T
193 tgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaat-gaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
3655063 tgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaacattttcaaaaaaatcagttttct 3654980  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 29163933 - 29164190
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12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatc 103  Q
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29163933 atcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcacatgatatc 29164032  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||       
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204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
        |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
29164130 ----aatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttttagaaaagtca 29164190  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11357134 - 11356946
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72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
11357134 aagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaag 11357035  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||        ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
11357034 catt--------aattactattcatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatccaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 11356946  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24488944 - 24488745
Alignment:
74 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| |||||| |||||||||    
24488944 gtgtaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtgtcagtaagttcaagatgttgcaagca 24488845  T
174 ttactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaa-aaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| |||||  |||||| |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||||||    
24488844 ttactagatgcattactattaatcatgaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaactttttaaataaaagtcaattt 24488745  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 268
Target Start/End: Original strand, 36012333 - 36012528
Alignment:
75 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactat-gtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagca 173  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| ||  ||||||||    
36012333 tgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagca 36012432  T
174 ttactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaa-ttaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||    
36012433 ttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaatttaactttttcaaaaaagtca 36012528  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 54828685 - 54828546
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72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
54828685 aagtgtaacacttaaaactatcaaataatatcatcaactatgtttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 54828586  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
54828585 cattactagataaattactattgatcattaatcagtaatc 54828546  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Original strand, 38591816 - 38592046
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa-----------------cacttaagactatcacat 97  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||                 ||||||||||||||||||    
38591816 atcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccccacaaaacgtgacacttaagactatcacat 38591915  T
98 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 197  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||| ||||||||    
38591916 aatatcatcaaatctatttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatccaagatgttgcaagcattattaaacaaattactattgatc 38592015  T
198 attaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaa 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
38592016 attaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaa 38592046  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20373228 - 20373051
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||                
20373228 aagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatataagtcca------------ 20373141  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
           |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
20373140 -------agatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 20373051  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 11466939 - 11467198
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatca 94  Q
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11466939 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatca 11467038  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||  || ||||| ||||| ||||||       ||||||||||| |||||    
11467039 catgatatcaacaactctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctgcaagtctaagatgttgcaa-------tagatgaattactattg 11467131  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||       ||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
11467132 atcatt-------aatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagaataaaattaactttttcaaaaaagtca 11467198  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 261
Target Start/End: Original strand, 50475021 - 50475199
Alignment:
90 tatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaa 189  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
50475021 tatcatataatatcatcaaatctgtttgcatattaaagatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattag 50475120  T
190 tattg-------atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaa 261  Q
    |||||       |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||    
50475121 tattgatcattaatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaaatttttcaaa 50475199  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Original strand, 43348372 - 43348563
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca-----------------cttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||    
43348372 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagactatca 43348471  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaat 186  Q
    ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
43348472 catgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattactaaatgaat 43348563  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 195
Target Start/End: Original strand, 45174698 - 45174821
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||    
45174698 aagtgtaacacttaagactataatatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaacggtaagtccaagatgttgcaag 45174797  T
172 cattactagatgaattaatattga 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
45174798 cattactagatgaattactattga 45174821  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 27480440 - 27480370
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
27480440 atcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 27480370  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11835611 - 11835494
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||      |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||     
11835611 aagtgtaacaattaagactatcacatgatatcatcaactctatttgcatg------atgttaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaaa 11835518  T
172 cattactagatgaattaatattga 195  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
11835517 cattactaaatgaattactattga 11835494  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 53811701 - 53811597
Alignment:
85 aagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
53811701 aagactatcacataatatcatcaact----ttgcatgttaaagataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatga 53811606  T
185 attaatatt 193  Q
    |||| ||||    
53811605 attactatt 53811597  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 51213042 - 51212972
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
51213042 atcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacac 51212972  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 35844441 - 35844512
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
35844441 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacac 35844512  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 24489023 - 24488953
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
24489023 atcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacac 24488953  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 34133050 - 34133120
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
34133050 atcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 34133120  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 46297823 - 46297753
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
46297823 atcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacac 46297753  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20373357 - 20373300
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
20373357 atcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 20373300  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 83
Target Start/End: Original strand, 45174620 - 45174692
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaacact 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
45174620 atcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacact 45174692  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4761710 - 4761653
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12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
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4761710 atcatcaactcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 4761653  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 83
Target Start/End: Original strand, 53176169 - 53176240
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12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact 83  Q
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53176169 atcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacact 53176240  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 54828763 - 54828708
Alignment:
11 catcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacctt 66  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
54828763 catcatcaattcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctacctt 54828708  T

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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 81
Target Start/End: Original strand, 1089811 - 1089877
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 81  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
1089811 atcaatttatcagatcaacaggactacattaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 1089877  T

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Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 4015575 - 4015645
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  | ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
4015575 atcatcaattcatcatattaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 4015645  T

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Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 11835689 - 11835619
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaat-tttaccctaccttgttttaagtgtaaca 81  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
11835689 atcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaaca 11835619  T

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Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 272
Target Start/End: Original strand, 35844577 - 35844639
Alignment:
210 tcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
35844577 tcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattt 35844639  T

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Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Original strand, 37157822 - 37157876
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacctt 66  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
37157822 atcatcaatttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacctt 37157876  T

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Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24708178 - 24708118
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcac--ttaatctaattttaccctaccttgttt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
24708178 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttttgatctaattttatcctaccttgttt 24708118  T

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Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Original strand, 3362368 - 3362434
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcact--taatctaattttaccctaccttgttttaagtg 76  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
3362368 atcatcaattcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtg 3362434  T

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Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 40552320 - 40552258
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag 74  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | || |||||| ||||    
40552320 atcatcaattcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataag 40552258  T

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Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21009863 - 21009806
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||||    
21009863 atcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgtt 21009806  T

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Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Original strand, 36012252 - 36012312
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgtttt 71  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
36012252 atcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgtttt 36012312  T

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Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Original strand, 25579854 - 25579913
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt 71  Q
    ||||||| || || |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
25579854 atcatcagtttattagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttt 25579913  T

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Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 135
Target Start/End: Original strand, 35844519 - 35844581
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
35844519 aagtgtaacacttaaga-tatcacatgatatcagtaactttgtttccatgttaaagatgtcaac 35844581  T

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Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 7327543 - 7327485
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttt 70  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||| |||    
7327543 atcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttcttt 7327485  T

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Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 110
Target Start/End: Original strand, 53176246 - 53176284
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
53176246 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaact 53176284  T

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Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Original strand, 13498678 - 13498731
Alignment:
241 atcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||    
13498678 atcaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttctgactacactgtagaagctc 13498731  T

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Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 279
Target Start/End: Original strand, 34133312 - 34133357
Alignment:
234 cattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
34133312 cattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaact 34133357  T

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Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Original strand, 47481637 - 47481682
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 57  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||    
47481637 atcatcaattcatcatgttaacaagactacacttaatataatttta 47481682  T

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Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 24886228 - 24886484
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 111  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
24886228 atcatcaactcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactc 24886327  T
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
24886328 tgtttgcatgttaaagattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatc 24886427  T
212 aacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
24886428 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 24886484  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14409378 - 14409123
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca---cttaagactatcacataatatcatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||    
14409378 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaactactcttaagactatcgcataatatcatcaa 14409279  T
109 ctatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagca 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
14409278 ctatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattactattgatcattattcagca 14409179  T
209 atcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||    
14409178 atcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaattaaaattaaatttttcaaaaaa 14409123  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 22980917 - 22981190
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||    
22980917 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatca 22981016  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
22981017 cataatatcataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaatcattactagatgaattattattg 22981116  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
22981117 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttttaaaaagtca 22981190  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 279
Target Start/End: Original strand, 33908357 - 33908640
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa-----------------gtgtaacacttaagactatca 94  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||                 ||||||||||||||||||||     
33908357 atcatcaattattcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcg 33908456  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
33908457 cataatatcgtcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat-aattactattg 33908555  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
33908556 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctaact 33908640  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 699274 - 699547
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact-----------------taagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||                 |||||||||||    
699274 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccacaaagtgtaatacttaagactatca 699373  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
699374 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 699473  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
699474 attattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtca 699547  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31786697 - 31786424
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||                 |||| |||||||    
31786697 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaaactatca 31786598  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
31786597 cataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 31786498  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
31786497 ttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 31786424  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1429196 - 1428983
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
1429196 atcatcaattcatcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactt 1429097  T
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaa-- 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||      
1429096 tatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaata 1428997  T
210 -tcaacaatttaaa 222  Q
     |||||||||||||    
1428996 ttcaacaatttaaa 1428983  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31705663 - 31705386
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||                 ||||||||||||||| ||||    
31705663 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcacaaaatgtaacacttaagaccatca 31705564  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
31705563 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtacatataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 31705464  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
31705463 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttcaaaaaagtcaattt 31705386  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2888419 - 2888216
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| || ||||    
2888419 aagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaag 2888320  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
2888319 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaatt 2888220  T
272 ttct 275  Q
    ||||    
2888219 ttct 2888216  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35511528 - 35511260
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact----------taagac--tatcacataa 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||           ||| ||  ||||||||||    
35511528 atcaccaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacactatcacataa 35511429  T
100 tatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcat 199  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
35511428 tatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcat 35511329  T
200 taatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
35511328 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 35511260  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7208915 - 7208642
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa-----------------gtgtaacacttaagactatca 94  Q
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7208915 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaacgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatca 7208816  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
7208815 cataatattttcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagtattactagatgaattattattg 7208716  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
7208715 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttaaaaaaagtca 7208642  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38528288 - 38528019
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||                 ||||||||||||    
38528288 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 38528189  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
38528188 cataatatcatcaaatctatttacatgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 38528089  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
38528088 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 38528019  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 275
Target Start/End: Original strand, 5830093 - 5830296
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
5830093 aagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 5830192  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatg-aaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||    
5830193 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaa-cttttccaaaatgtcaat 5830291  T
271 tttct 275  Q
    |||||    
5830292 tttct 5830296  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 296
Target Start/End: Original strand, 40133586 - 40133810
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
40133586 aagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaag 40133685  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
40133686 cattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaatt 40133785  T
272 ttctaactccagtgtggaagctccc 296  Q
    |||| ||| ||  || |||||||||    
40133786 ttctgactgcaccgtagaagctccc 40133810  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 12910483 - 12910752
Alignment:
16 tcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatcacata 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||                 ||||||| |||||||||||||||    
12910483 tcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacata 12910582  T
99 atatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatca 198  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
12910583 atatcatcaactctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgaaca 12910682  T
199 ttaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
12910683 ttaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtca 12910752  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 22255306 - 22255579
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||                 |||||||||||| ||||| |    
22255306 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacaccacacaaagtgtaacacttaaaactatta 22255405  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
22255406 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagccttactagatgaattactattg 22255505  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
22255506 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaaagtca 22255579  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 35504566 - 35504766
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
35504566 aagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 35504665  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
35504666 tattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattgactttttcaaaaaagtcaatt 35504765  T
272 t 272  Q
    |    
35504766 t 35504766  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 32563273 - 32563537
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||  ||    |||||| |||||    
32563273 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccacaaagtgtaacactcacatgatatc 32563372  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
32563373 agcaactctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagaattactagataaattattattgatcattaat 32563472  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
32563473 cagcaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtca 32563537  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 296
Target Start/End: Original strand, 36866963 - 36867187
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||     
36866963 aagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaaa 36867062  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
36867063 cattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcaatt 36867162  T
272 ttctaactccagtgtggaagctccc 296  Q
    |||| ||| ||  || |||||||||    
36867163 ttctgactgcaccgtagaagctccc 36867187  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 275
Target Start/End: Original strand, 36860625 - 36860828
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
36860625 aagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaag 36860724  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
36860725 cattactaaatgaattactattaatcatgaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcaatt 36860824  T
272 ttct 275  Q
    ||||    
36860825 ttct 36860828  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15992514 - 15992318
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||    
15992514 aagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaag 15992415  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
15992414 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 15992318  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17158005 - 17157805
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||    
17158005 aagtgtaacacttaagaccatcacataatattatcaactctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaag 17157906  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||    
17157905 cattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaacttgactttttcaaaaaagtcaatt 17157806  T
272 t 272  Q
    |    
17157805 t 17157805  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22974133 - 22973853
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||                 |||||||||||||||||| |    
22974133 atcatcaactcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatta 22974034  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
22974033 cataatattatcaactctgtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 22973934  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||    
22973933 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttaaaaaaaatcagttttct 22973853  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35826458 - 35826254
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
35826458 aagtgtaacccttaagattatca--taatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 35826361  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||    
35826360 cattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaaaaccagtt 35826261  T
272 ttctaac 278  Q
    |||||||    
35826260 ttctaac 35826254  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 268
Target Start/End: Original strand, 8437168 - 8437362
Alignment:
74 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagca 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| || ||    
8437168 gtgtaacacttaagattatcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgaaaaca 8437267  T
174 ttactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
8437268 ttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 8437362  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 42342855 - 42343118
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||      |||  ||    |||||| |||||    
42342855 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttac-ttgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacactcacatgatatc 42342953  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
42342954 atcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaat 42343053  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
42343054 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtca 42343118  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 8466868 - 8467119
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||     
8466868 atcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaaatgtaacacttaagactatcatatgatatcaccaactc 8466967  T
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
    ||||| ||| |||||| ||  |||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
8466968 tgtttacatattaaaggtgt-aacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatc 8467066  T
212 aacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| |  ||||||||| |||| ||||||    
8467067 aacagtttaaaaatgaatcaaacattaaaaataaaattaactttttaaaaaaa 8467119  T

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Target: chr5; HSP #28
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Target Start/End: Complemental strand, 8741860 - 8741664
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8741860 aagtgtaacacttaagactatcacatgattatgagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttgcaa 8741761  T
171 gcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtc 267  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
8741760 gcatcactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtc 8741664  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 19120060 - 19120256
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19120060 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctcaaagtctaagatgttgcaag 19120159  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
19120160 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 19120256  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
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Target Start/End: Original strand, 22019756 - 22020020
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    ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||         ||  ||  |||||| |||||    
22019756 atcatcacttcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtataacactcacatgatatc 22019855  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22019856 agcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgtaagcattactagatgaattactattgatcattaat 22019955  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
22019956 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 22020020  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
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Target Start/End: Original strand, 25669739 - 25669969
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41 cacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt---aagacta----tcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgcca 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||  ||    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
25669739 cacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaagtgtaacactcacatgatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtca 25669838  T
134 acgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaa 233  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
25669839 acgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 25669938  T
234 cattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||    
25669939 cattaaaattaaaattaactttttcaaaaaa 25669969  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 9200357 - 9200617
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12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatc 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     |||  ||    |||||| |||||    
9200357 atcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattccacaaagtgtaacactcacatgatatc 9200456  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
9200457 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 9200556  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||| || ||||||||  |||||||||||    
9200557 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaatttaaaattaaaattaattttttcaaaaaa 9200617  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 5837756 - 5837952
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72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  || ||||||||||| |||||||    
5837756 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctgcaagtccaagatgttgcaag 5837855  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
5837856 cattactagatgaattactgttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttcaaaaaagtca 5837952  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27318538 - 27318259
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
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27318538 atcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 27318439  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |  |||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||    
27318438 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtaca--taagtttaagatgttgcaaacattactatatgaattactattg 27318341  T
195 atcattaatcagcaatcaacaa-tttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
27318340 atcattaatcaaaaatcaacaattttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttct 27318259  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 27330428 - 27330705
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||                 |||||||||||     
27330428 atcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcg 27330527  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
27330528 catgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 27330627  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
27330628 atcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaacaagtcaattt 27330705  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23116273 - 23116008
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||                 ||||||||||||    
23116273 atcatcaattcatcagattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 23116174  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||        | | |||||    
23116173 cataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattac--------tgactattg 23116082  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
23116081 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 23116008  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Original strand, 35934097 - 35934289
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||   ||||||||||||| |||||||    
35934097 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaag 35934196  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||| |||||||||||    
35934197 cattactagttgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgattcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaa 35934289  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 39572943 - 39573208
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca-----------------cttaagactatca 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                 ||  |||||||||    
39572943 atcataaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacactcgagactatca 39573042  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| ||||        ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
39573043 catgatatcaacaactctgtt--------aaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 39573134  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
39573135 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 39573208  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13956332 - 13956104
Alignment:
76 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcatt 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||    
13956332 gtaacacttaagactatcatataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgcaagcatt 13956233  T
176 actagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || |    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||    
13956232 actagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt--aactttttcaaacattaaaatcaaaattaacattttcaaaaaaatcagctttct 13956135  T
276 aactccagtgtggaagctcccattaattaat 306  Q
     ||| ||  || ||||||| | |||||||||    
13956134 gactgcaccgtagaagctctctttaattaat 13956104  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Original strand, 25889584 - 25889767
Alignment:
85 aagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatga 184  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
25889584 aagattatgacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatga 25889683  T
185 attaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
25889684 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttccagaaaagtca 25889767  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30969375 - 30969106
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||                 ||||||||||||    
30969375 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatca 30969276  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| | ||||| ||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||||     
30969275 catgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctataagttcaagatgctgcaagtattactagatgagttactatta 30969176  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||| ||||||    
30969175 atcattaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttaaaaaa 30969106  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 7693354 - 7693618
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatc 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||      |||  ||    |||||| ||||     
7693354 atcatcaattcattagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcacatgatatt 7693453  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
7693454 agcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaat 7693553  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||    
7693554 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttagaaaagtca 7693618  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23954840 - 23954542
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
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23954840 atcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatca 23954741  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||      | ||||||| ||||||||| |||||    
23954740 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaataatatttgtaagtgcaagat-----gaacattacttgatgaattactattg 23954647  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||   | |||||||    
23954646 atcatt-------aatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaagctc 23954554  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25500977 - 25500708
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||                 ||||||  ||||    
25500977 atcatcaattcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagatcatca 25500878  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||    
25500877 catgatatcagcaactttctttagatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaaatactgttg 25500778  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||| |||||||||||    
25500777 atcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaatactaagattaaaattaactttttcaaaaaa 25500708  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43308703 - 43308427
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagactatcacataa-----tat 102  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||      |||  || ||| |||     |||    
43308703 atcatcaactcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccctgaaaagtgtaacacttaagactatat 43308604  T
103 catcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaa 202  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||| || || || ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
43308603 catcaactcttcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 43308504  T
203 tcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
43308503 tcagaaatcaacaatttaaaaacgaatcaaatactaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaact 43308427  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Original strand, 15724689 - 15724881
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||| || |||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||| || ||| |||    
15724689 aagtgtatcaattaagactatcatatgatatcaacaactttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgtaagtccaaaatattgtaag 15724788  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||| |||||||||||    
15724789 cattactagatgaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagttaaaattaactttttcaaaaaa 15724881  T

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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21088740 - 21088535
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| |||||||| ||| |||    
21088740 aagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataacatctgtaaatccaagatgttgtaag 21088641  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaa-ccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||    ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||   ||||  ||||||||| |    
21088640 cattactagatgaattactattaatcatgaat---aaataatcaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaagttaatttttttttaaaaagtcagt 21088544  T
271 tttctaact 279  Q
    |||||||||    
21088543 tttctaact 21088535  T

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Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28416470 - 28416329
Alignment:
127 gatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatg 226  Q
    |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
28416470 gatgccaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattacttgatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaaag 28416371  T
227 aaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    || | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
28416370 aatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 28416329  T

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Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14919579 - 14919317
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaac-----------------acttaagactatca 94  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||                 ||||||||||||||    
14919579 atcatcaactcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacctcacaaattgtaatacttaagactatca 14919480  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| |||    |||||||||||| |||||| |      ||||||||| | ||||    
14919479 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaattgta----taagtccaagatattgcaatc------agatgaatt-acattg 14919391  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
14919390 atcattaatcagaaatctaaaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtca 14919317  T

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Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Original strand, 43254154 - 43254256
Alignment:
170 agcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
43254154 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcaa 43254253  T
270 ttt 272  Q
    |||    
43254254 ttt 43254256  T

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Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 268
Target Start/End: Original strand, 26269069 - 26269206
Alignment:
131 ccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaacc 230  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||  ||||| ||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
26269069 ccaaggataaaatagtacctgtaagtttaagatgttgtaagcaatactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaacc 26269168  T
231 gaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
     | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
26269169 aatcattaagattaaaattaactttttcataaaagtca 26269206  T

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Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6824530 - 6824329
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa-----------------gtgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||                 |||||||||||||||||||||    
6824530 atcatcaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 6824431  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||    
6824430 caagatat-agcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaa-gataaaacaatacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgagatactattg 6824333  T
195 atca 198  Q
    ||||    
6824332 atca 6824329  T

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Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 130
Target Start/End: Original strand, 26268275 - 26268333
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
26268275 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatg 26268333  T

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Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 35934019 - 35934090
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatcta-attttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
35934019 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 35934090  T

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Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 26268198 - 26268268
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
26268198 atcatcaattcatcagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 26268268  T

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Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 28416578 - 28416508
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||    
28416578 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacac 28416508  T

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Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 36866886 - 36866956
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
36866886 atcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 36866956  T

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Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 40133509 - 40133579
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
40133509 atcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 40133579  T

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Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Original strand, 5837679 - 5837746
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 79  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
5837679 atcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaa 5837746  T

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Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 8741937 - 8741867
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
8741937 atcatcaattcatcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacac 8741867  T

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Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Original strand, 19119984 - 19120046
Alignment:
13 tcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
19119984 tcatcaattcatcagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagt 19120046  T

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Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 5112364 - 5112297
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 79  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
5112364 atcatcaattcattaaattaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa 5112297  T

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Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 15724612 - 15724682
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
15724612 atcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacac 15724682  T

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Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13956413 - 13956368
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
13956413 atcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaatttta 13956368  T

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Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21088817 - 21088748
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 81  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
21088817 atcaacaattcatcatactaacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaaca 21088748  T

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Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Original strand, 35504489 - 35504541
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacc 64  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
35504489 atcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcctacc 35504541  T

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Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15992591 - 15992532
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||| |||    
15992591 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctaccttgattt 15992532  T

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Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28003073 - 28002772
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                 |||| |||||||    
28003073 atcatcaattcatcggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaaaactatca 28002974  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
28002973 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgctaacattactagatgaattactattg 28002874  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||    
28002873 atcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcagtgtagaagctc 28002774  T
295 cc 296  Q
    ||    
28002773 cc 28002772  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33816526 - 33816330
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||     
33816526 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagttcatgtaagtccaagatgttgcaaa 33816427  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
33816426 cattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 33816330  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 279
Target Start/End: Original strand, 32579573 - 32579854
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatcacat 97  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||                 |||||||||||  ||    
32579573 atcagttcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaagacctcagaaagtgtaactcttaagactatcttat 32579672  T
98 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
32579673 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatc 32579772  T
198 attaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
32579773 attaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttttctaact 32579854  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 3042820 - 3043020
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||    
3042820 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaacatgttgcaag 3042919  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
3042920 cattactagatgaattagtattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatt 3043019  T
272 t 272  Q
    |    
3043020 t 3043020  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 25184237 - 25184517
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||                 ||||||||||||||||||||    
25184237 atcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatca 25184336  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
25184337 cataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 25184436  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
25184437 atcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttct 25184517  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35021122 - 35020817
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||    
35021122 atcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 35021023  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaatta----at 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    ||    
35021022 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattactatat 35020923  T
191 attgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaa 290  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||| ||  || |||    
35020922 attgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaagagtcagttttctgactacaccgtagaa 35020823  T
291 gctccc 296  Q
    ||||||    
35020822 gctccc 35020817  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36493699 - 36493499
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
36493699 aagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatattgcaag 36493600  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
36493599 cattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcaatt 36493500  T
272 t 272  Q
    |    
36493499 t 36493499  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5048052 - 5047781
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa----------------cacttaagactatcac 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||    
5048052 atcatcaattcatgagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccgcaaaatgtaacacttaagactatcac 5047953  T
96 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattga 195  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
5047952 atgatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagttttactagataaattattattga 5047853  T
196 tcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtc 267  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
5047852 tcagtaatcaacaataaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtc 5047781  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 37775791 - 37776059
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||      |||  ||    |||||| |||||    
37775791 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcacatgatatc 37775890  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
37775891 agcaactttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 37775990  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||    
37775991 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattgaaattaacttttttaaaaaagtcaattt 37776059  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 297
Target Start/End: Original strand, 6864236 - 6864461
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
6864236 aagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaag 6864335  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
6864336 cattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 6864435  T
272 ttctaactccagtgtggaagctccca 297  Q
    |||| ||| ||  || ||||||||||    
6864436 ttctgactgcaccgtagaagctccca 6864461  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19089540 - 19089237
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttta-----------------agtgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||                 ||||||||||||||||||||||    
19089540 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatca 19089441  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
19089440 cataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 19089341  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||| || |||||||||||||||| || ||| ||  || |||||||    
19089340 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctc 19089241  T
295 ccat 298  Q
    ||||    
19089240 ccat 19089237  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 33341522 - 33341795
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||    
33341522 atcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatca 33341621  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
33341622 catgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcattactagatgaattactattg 33341721  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||    
33341722 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaatttttttaaaaaagtca 33341795  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37663828 - 37663551
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||                 ||||||||||||||||||||    
37663828 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 37663729  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
37663728 cataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 37663629  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||    
37663628 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttattaaaaaagtcaattt 37663551  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 1815425 - 1815704
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||    
1815425 atcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 1815524  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||    
1815525 cataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacattactagatgaattacaattg 1815624  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
1815625 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa-cttttttaaaaagtcaattttct 1815704  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 47253941 - 47254137
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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47253941 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaag 47254040  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
47254041 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 47254137  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 55477978 - 55477722
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
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55477978 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaacaccccacaacgtgtaacactgaagactatca 55477879  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
55477878 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatta 55477779  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaa 251  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
55477778 atcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 55477722  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30002710 - 30002418
Alignment:
21 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatcatcaactat 112  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||      |||  ||    |||||| |||||| ||||| |    
30002710 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcacatgatatcagcaactct 30002611  T
113 gtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatca 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
30002610 gtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaataa 30002511  T
213 acaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctcccattaattaa 305  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||  || ||||||||||| ||||||    
30002510 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcaatttcataactgcaccgtagaagctcccataaattaa 30002418  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 879635 - 879355
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||                 ||||||||||||    
879635 atcatcaactcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacatttaagactatca 879536  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
879535 cataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattg 879436  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
879435 atcattaataagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttttaaaaagtcagttttct 879355  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 7703710 - 7703906
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||    
7703710 aagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaag 7703809  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
7703810 cattactagatgaattactatttatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 7703906  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7152214 - 7152011
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
7152214 aagtataacacttaatactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagattttgcaag 7152115  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||    
7152114 cattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaaataactttttcaaaaaagtcagtt 7152015  T
272 ttct 275  Q
    ||||    
7152014 ttct 7152011  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19440735 - 19440432
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12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
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19440735 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacaccccacaacgtgtaacccttaagtttataa 19440636  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
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19440635 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 19440536  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
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19440535 atcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctc 19440436  T
295 ccat 298  Q
    ||||    
19440435 ccat 19440432  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25701144 - 25700859
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca------------------cttaagactatc 93  Q
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25701144 atcatcaattcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagattatc 25701045  T
94 acataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatatt 193  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
25701044 acataacatcatcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagtatccgtaaatctaagattttgcaagcattgttagatgaattactatt 25700945  T
194 gatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
25700944 gatcattaatcaataatgtacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctaact 25700859  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 268
Target Start/End: Original strand, 49376170 - 49376364
Alignment:
74 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagca 173  Q
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49376170 gtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgaaagca 49376269  T
174 ttactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
49376270 ttactaaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaagaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 49376364  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34361502 - 34361305
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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34361502 aagtgtaacacttaaagctatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaag 34361403  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
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34361402 cattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 34361305  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 55241115 - 55240919
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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55241115 aagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaa 55241016  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
55241015 cattactagataaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaatttttcaaaaaagtca 55240919  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 50697365 - 50697639
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
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50697365 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacaccacacaaagtgcaacacttaagactatca 50697464  T
95 cataatatcatcaactatgtttgca-tgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatatt 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
50697465 cataatatcatcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaattccaagatgttgtaagcattactagatgaattactatt 50697564  T
194 gatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||    
50697565 gatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaaaagtca 50697639  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 23761196 - 23761468
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
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23761196 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatc-taccttgttttaagtgtaacacctcataaagtgtcacatttaagactatcg 23761294  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
23761295 catgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattg 23761394  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
23761395 atcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 23761468  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32912590 - 32912393
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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32912590 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 32912491  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
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32912490 cattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatgaattttttcaaaaaagtca 32912393  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 46888238 - 46887972
Alignment:
18 aattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact----------------taagactatcacataata 101  Q
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46888238 aattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaacgtaacacttagactatcacataata 46888139  T
102 tcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcatta 201  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
46888138 tcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcatta 46888039  T
202 atcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
46888038 atcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 46887972  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 17167914 - 17168110
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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17167914 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 17168013  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||  |||||||||||||||    
17168014 catcactagatgaattactatttatcattaattagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttcaaaaaagtca 17168110  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 17173491 - 17173687
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
17173491 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 17173590  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||  |||||||||||||||    
17173591 catcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttcaaaaaagtca 17173687  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 268
Target Start/End: Original strand, 37287932 - 37288126
Alignment:
75 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcat 174  Q
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37287932 tgtaacacttaagactagcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcat 37288031  T
175 tactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaaga-tcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
37288032 tattagatgaattactattgagcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatttaaaattaactttttcaaaaaagtca 37288126  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Original strand, 50764921 - 50765115
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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50764921 aagtgaaacactcaatattatcacatgatatcagcaactatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 50765020  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagt 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
50765021 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagt 50765115  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 81 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34948096 - 34947925
Alignment:
81 acttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactag 180  Q
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34948096 acttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactag 34947997  T
181 atgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaac 252  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
34947996 atgaaatactattgatcgttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 34947925  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29584210 - 29584010
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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29584210 aagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaag 29584111  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
29584110 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaacaagtcaatt 29584011  T
272 t 272  Q
    |    
29584010 t 29584010  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 32592217 - 32592486
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagactatcac----ataatatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||      |||  || |||    || || ||    
32592217 atcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcatatgatttc 32592316  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
32592317 agcaactttgtttgcatgttaaagatgtctacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgaaagcattactaaatgaattactattgatcgttaat 32592416  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatttt 273  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
32592417 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttt 32592486  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 17272088 - 17272365
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
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17272088 atcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcg 17272187  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
17272188 catgatatcagcaactctatttgcatattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 17272287  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
17272288 atcattaatcggtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaataagtcaattt 17272365  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 99 - 268
Target Start/End: Original strand, 39400236 - 39400405
Alignment:
99 atatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatca 198  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
39400236 atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatgactattgatca 39400335  T
199 ttaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
39400336 ttaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 39400405  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 9139369 - 9139624
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12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagactatcacataatatcatca 107  Q
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9139369 atcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagataa--- 9139465  T
108 actatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagc 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||      
9139466 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagacgaattactattgatcattaatcaat 9139565  T
208 aatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||   |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
9139566 aatc--taatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtca 9139624  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 4598117 - 4598379
Alignment:
13 tcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatca 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||      |||  ||    |||||| ||||||    
4598117 tcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcctgc-ttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcacatgatatca 4598215  T
105 tcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatc 204  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
4598216 gcaactctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatgttgcaagcattattagattaattactattgatcattaatc 4598315  T
205 agcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
4598316 agcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacattttacaaaaagtca 4598379  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 26896288 - 26896489
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtcc-aagattttgcaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||| || || ||||||    
26896288 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatgatcaagtctatttgcatgttaaa-atttcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatgttgcaa 26896386  T
171 gcattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaa 269  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
26896387 acattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaa 26896486  T
270 ttt 272  Q
    |||    
26896487 ttt 26896489  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Original strand, 4205216 - 4205381
Alignment:
103 catcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaa 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||    
4205216 catcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaa 4205315  T
203 tcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    | || |||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||    
4205316 taagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagtca 4205381  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 133 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025381
Alignment:
133 aacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccga 232  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 35025416  T
233 acattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
35025415 acattaa-atcaaaattaactttttcataaaagtca 35025381  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 42199853 - 42200131
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||                 ||||||||||||||||||||    
42199853 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatca 42199952  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagta-tatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaat-taatat 192  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     
42199953 cataatatcataaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaataataccttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactac 42200052  T
193 tgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
42200053 tgttcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacatcaaaatc-aaattaactttttcaaaaaggtcaattt 42200131  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 257
Target Start/End: Original strand, 27396740 - 27397000
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca-----------------cttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||                 |||||||| |||     
27396740 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtcacacttaagaccatcg 27396839  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || | |||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
27396840 catgatatcagcaacgctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacctataagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattg 27396939  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaacctttt 257  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||    
27396940 atcattaat--gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 27397000  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46884116 - 46883932
Alignment:
75 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcat 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||    
46884116 tgtaacacttaa-actatcacataatatcataaattttgtttgcatgttaaaaattccaaagataaaatagtat--gtaagtcc--gatgttgcaagcat 46884022  T
175 tactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| || ||||||||  |||||||||||    
46884021 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaaaa 46883932  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4934289 - 4934026
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||    
4934289 atcatcatttcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatca 4934190  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |           || ||||| |||||| ||||||||||  ||||     
4934189 tataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacct-----------atgttgcacgcattaatagatgaatttctatta 4934101  T
195 atcattaatcagcaatcaacaa-tttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
4934100 atcattaatcagtaatcaaaaattttaaaaataaattaaacattaagatcaaaattaacttgttcaaaaaagtca 4934026  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 186
Target Start/End: Original strand, 38011981 - 38012169
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca-----------------cttaagactatcacat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||    
38011981 atcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccagaaagtgtaacgcttaagactatcacat 38012080  T
98 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaat 186  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
38012081 aatatcatcaactatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatattactagatgaat 38012169  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 268
Target Start/End: Original strand, 23431834 - 23431952
Alignment:
150 tgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaatt 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||| || ||||||    
23431834 tgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgcatcaaacattaaaattaaaatt 23431933  T
250 aaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||| |||||||||||||||    
23431934 aactttttcaaaaaagtca 23431952  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 264
Target Start/End: Original strand, 38012568 - 38012655
Alignment:
177 ctagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
38012568 ctagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 38012655  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35025606 - 35025531
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagta 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
35025606 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagta 35025531  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 33816620 - 33816550
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
33816620 atcatcaatttatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 33816550  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 7703642 - 7703704
Alignment:
21 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact 83  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
7703642 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacact 7703704  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Original strand, 47253873 - 47253934
Alignment:
21 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
47253873 tcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 47253934  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 36493775 - 36493708
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 79  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
36493775 atcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa 36493708  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 17167837 - 17167907
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
17167837 atcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 17167907  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 17173414 - 17173484
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
17173414 atcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 17173484  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 34948184 - 34948114
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||    
34948184 atcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacac 34948114  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29584287 - 29584222
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgt 77  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
29584287 atcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgt 29584222  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 35025674 - 35025618
Alignment:
21 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgt 77  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
35025674 tcatcagattaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgt 35025618  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 54499325 - 54499254
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
54499325 atcatcaattcatcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacac 54499254  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 55241191 - 55241122
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12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
55241191 atcatcaatttatcagat-aagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 55241122  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 175
Target Start/End: Original strand, 56050171 - 56050234
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112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcatt 175  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
56050171 tgtttgcatgttaaagacttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 82
Target Start/End: Original strand, 39398049 - 39398103
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28 attaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
39398049 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacac 39398103  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 6864159 - 6864216
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||    
6864159 atcatcaatttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgtt 6864216  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 32912667 - 32912610
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||    
32912667 atcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 32912610  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 50764854 - 50764905
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctac 63  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||    
50764854 atcatcaattcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctac 50764905  T

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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Original strand, 3042743 - 3042797
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacctt 66  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||||    
3042743 atcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcatacctt 3042797  T

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Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Original strand, 49376091 - 49376136
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||    
49376091 atcatcaattcatcagattaacaagattacgcttgatctaatttta 49376136  T

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Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7007000 - 7006744
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 111  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||     
7007000 atcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacttaagaatatcacatgatatcagcaactc 7006901  T
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
7006900 tgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaatcagtaatc 7006801  T
212 aacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
7006800 aacaatttaaaaatgaatcaaacattatgattaaaattaactttttcaaaaaagtca 7006744  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 279
Target Start/End: Original strand, 41465625 - 41465909
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||     
41465625 atcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacttaagactatcg 41465724  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||    
41465725 cataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactatatgaattactattg 41465824  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
41465825 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaattgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctaact 41465909  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 296
Target Start/End: Original strand, 26357781 - 26358002
Alignment:
75 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcat 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
26357781 tgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaatgtgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatttttaagtccaagatgttgcaagcat 26357880  T
175 tactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttc 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
26357881 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttc 26357980  T
275 taactccagtgtggaagctccc 296  Q
    ||||| || ||| |||||||||    
26357981 taactgcaatgtagaagctccc 26358002  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 297
Target Start/End: Original strand, 41960964 - 41961266
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||                 ||||||||||||| |||||    
41960964 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagattatca 41961063  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
41961064 cataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 41961163  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| ||  || |||||||    
41961164 atcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaattcagtttcctgactgcaccgtagaagctc 41961263  T
295 cca 297  Q
    |||    
41961264 cca 41961266  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 296
Target Start/End: Original strand, 4167123 - 4167347
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
4167123 aagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaag 4167222  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
4167223 cattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaatt 4167322  T
272 ttctaactccagtgtggaagctccc 296  Q
    |||| ||| ||  || |||||||||    
4167323 ttctgactgcaccgtagaagctccc 4167347  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Original strand, 35959097 - 35959294
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    ||||||| |||||||    
35959097 aagtgtaacagttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgt----ccaagatgttgcaag 35959192  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
35959193 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatt 35959292  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43648324 - 43648047
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||                 ||||||||||||    
43648324 atcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagactatca 43648225  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |  |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||    
43648224 cataatatcatcaactttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgtaagtccaagatgtcgcaaacattactagatgaattactattg 43648125  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
43648124 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaattt 43648047  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2325380 - 2325156
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
2325380 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaag 2325281  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
2325280 cattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaaaatcaatt 2325181  T
272 ttctaactccagtgtggaagctccc 296  Q
    |||| ||| ||  || |||||||||    
2325180 ttctgactgcaccgtagaagctccc 2325156  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11366383 - 11366179
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
11366383 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 11366284  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||    
11366283 cattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcaat 11366184  T
271 tttct 275  Q
    |||||    
11366183 tttct 11366179  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18494359 - 18494087
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa----------------cacttaagactatcac 95  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||                ||||||||||||||||    
18494359 atcatcaattcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaaacctcacaaagagtcacacttaagactatcac 18494260  T
96 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattga 195  Q
    || |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||    
18494259 atgatatcaacgactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcattactagatgaattgctattga 18494160  T
196 tcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
18494159 tcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 18494087  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19289325 - 19289118
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| ||  |||||||||||||| |||||||    
19289325 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaagtccaagatattgcaag 19289226  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
19289225 cattactagatgaattactattgatcattaatcagaaattaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 19289126  T
272 ttctaact 279  Q
    | ||||||    
19289125 tcctaact 19289118  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Original strand, 44913865 - 44914060
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
44913865 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 44913964  T
172 cattactag---atgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||| |||   |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
44913965 cattattagaaaatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 44914060  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43770918 - 43770654
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||  ||    |||||| |||||    
43770918 atcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcacatgatatc 43770819  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
43770818 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaat 43770719  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
     || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
43770718 tagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 43770654  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33660447 - 33660183
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagactatcac----ataatatc 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      |||  || |||    || |||||    
33660447 atcatcaattcattagattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacccacatgatatc 33660348  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
33660347 agcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 33660248  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||    
33660247 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcagaaaagtca 33660183  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 257
Target Start/End: Original strand, 4763832 - 4764017
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
4763832 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaag 4763931  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaacctttt 257  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
4763932 cattactagttgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 4764017  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 3177140 - 3177336
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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3177140 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgtaagtccaagatattacaag 3177239  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||    
3177240 cattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacaatttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagtca 3177336  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 276
Target Start/End: Original strand, 37905832 - 37906116
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37905832 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccccacaaagtgtaacacttaaaactat 37905931  T
93 cacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatat 192  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    
37905932 cgcataatatcattaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatgttgcaagaattactggatgaattactat 37906031  T
193 tgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatg-aaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttcta 276  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
37906032 tgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaattttcta 37906116  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33709234 - 33709042
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72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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33709234 aagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgtaaatccaagatgttgcaag 33709135  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||    
33709134 cattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaa 33709042  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 4478493 - 4478717
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttt-accctaccttgttttaagt------------gtaacacttaagactatcacata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||            |||||||||||| |||||||||     
4478493 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacacaaagtgtaacacttaagtctatcacatg 4478592  T
99 atatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatca 198  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
4478593 atatcaccaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatca 4478692  T
199 ttaatcagcaatcaacaatttaaaa 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
4478693 ttaatcagtaatcaacaatttaaaa 4478717  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19500914 - 19500739
Alignment:
75 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcat 174  Q
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19500914 tgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaagatgttgcaagcat 19500815  T
175 tactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaatta 250  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
19500814 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaatta 19500739  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27350018 - 27349794
Alignment:
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    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||      |||  ||    |||||| |||||    
27350018 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcacatgatatc 27349919  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
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27349918 aggaactctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 27349819  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaa 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
27349818 cagtaatcaacaatttaaaaatgaa 27349794  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 31861976 - 31862249
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
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31861976 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaattatca 31862075  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || || || ||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||||    
31862076 cataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatattgtagacattactagatgaattactattg 31862175  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
31862176 atcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 31862249  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39167442 - 39167168
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------ttaagactatcacataat 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||            | |  |||||||||||||    
39167442 atcatcaattcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacaactatcacataat 39167343  T
101 atcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcatt 200  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||| || ||     
39167342 atcatcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaattgttgctagcattactagatgaattactattaattatg 39167243  T
201 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
39167242 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttct 39167168  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 5881663 - 5881922
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatc 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |    |||  ||    |||||| |||||    
5881663 atcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattt-atcataccttgttttaagtgtaatacctcacaaagtgtaacactcacatgatatc 5881761  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
5881762 aacaattttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattatt 5881861  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
5881862 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcataaaa 5881922  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29242217 - 29241956
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact-----------------taagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                  |||||||||||    
29242217 atcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatca 29242118  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||       | |||||||||||||||| |||||    
29242117 cataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaagtccaagat-------gaattactagatgaattactattg 29242025  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaa 263  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
29242024 aacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaa 29241956  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31570813 - 31570514
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acacttaagactatca 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||                 |||||||||||| |||    
31570813 atcatgaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactgtca 31570714  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
31570713 catgatatcaacaactctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattgctagatgaattactattg 31570614  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | | |||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||  | ||| |||||| |||||||    
31570613 atcattaatcagtaatcaaatatttaaaaatgaatcaatcattaaaatgaaaattaactttttaaaaaaagtcagtttcatgactgcagtgtagaagctc 31570514  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 206
Target Start/End: Original strand, 19313975 - 19314182
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact----------taagactatcacataata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||| |||    
19313975 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactatcacatgata 19314074  T
102 tcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgt---aagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatca 198  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
19314075 tcagcaactatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 19314174  T
199 ttaatcag 206  Q
    ||||||||    
19314175 ttaatcag 19314182  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33551065 - 33550800
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
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33551065 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta-cg 33550967  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  || |||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||    
33550966 tataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacttgaaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaataactattg 33550867  T
195 a----tcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaacctttt 257  Q
    |    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
33550866 attatttattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 33550800  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4264079 - 4263926
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatca-cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaa 170  Q
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4264079 aagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatataagttcaagatgttgcaa 4263980  T
171 gcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaa 224  Q
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4263979 gcattactagatgaaataatattgatcattgatcagtaatcaacaatttaaaaa 4263926  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Original strand, 45327844 - 45328025
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||                 ||||||| ||||||||||     
45327844 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacataagactatcg 45327943  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcatta 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
45327944 cataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatta 45328025  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 279
Target Start/End: Original strand, 13711671 - 13711867
Alignment:
83 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagat 182  Q
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13711671 ttaagactatgacatgatatcagcaactctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaaacaatactagat 13711770  T
183 gaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | |||| | || ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||    
13711771 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaatcatttaaattaaaattaattttttcaaaaaagacaattttataact 13711867  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19424707 - 19424415
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
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19424707 atcatcaattcatcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacatttaagactatca 19424608  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||              ||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
19424607 catgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagat--------------agtacctgcaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 19424522  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| ||  || |||||||    
19424521 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttgatgactgcaccgtagaagctc 19424422  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 206
Target Start/End: Original strand, 44286150 - 44286284
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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44286150 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaag 44286249  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcag 206  Q
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44286250 cattgttagatgaattactattgatcattaatcag 44286284  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17071816 - 17071648
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||                 ||||||||||||||||||||    
17071816 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 17071717  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagat 163  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
17071716 cataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagat 17071648  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41051260 - 41051112
Alignment:
113 gtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatca 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||    
41051260 gtttgcatgttaaa-atgccaaggataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaattgttattgatcattaatcaataatca 41051162  T
213 acaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaa 262  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||  |||||||||    
41051161 acaattcaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaattttttcaaaa 41051112  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17054175 - 17054007
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||                 |||||||||||| |||||||    
17054175 atcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaanactatca 17054076  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagat 163  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
17054075 cataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaaggttccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagat 17054007  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Original strand, 36642189 - 36642293
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||| |||||||    
36642189 aagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagttcaagatgttgcaag 36642288  T
172 catta 176  Q
    |||||    
36642289 catta 36642293  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Original strand, 33902317 - 33902407
Alignment:
174 ttactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
33902317 ttactagatgaattattattgattattaatctgtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaa 33902407  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18258289 - 18258197
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagatt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  || ||||| ||||||    
18258289 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatcccaacgataaaatagtaactgcaagtctaagatt 18258197  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18257453 - 18257344
Alignment:
159 aagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||   |  ||||| || ||||||||| |||||    
18257453 aagatgttgcaagcattactagatgaattattatttatcattaatcagtaatcgacaattttaaaatgaataaattattaatattaaaattaactttttc 18257354  T
259 aaaaaagtca 268  Q
    | ||||||||    
18257353 acaaaagtca 18257344  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 268
Target Start/End: Original strand, 45328028 - 45328087
Alignment:
209 atcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
45328028 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 45328087  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 3177063 - 3177133
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
3177063 atcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacac 3177133  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 4167046 - 4167116
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
4167046 atcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 4167116  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41463849 - 41463779
Alignment:
75 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatag 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
41463849 tgtaacatttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 44286073 - 44286143
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
44286073 atcataaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac 44286143  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 44913787 - 44913857
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
44913787 atcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacac 44913857  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 36642110 - 36642182
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa--ttttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
36642110 atcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 36642182  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41463512 - 41463400
Alignment:
152 taagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaa 251  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
41463512 taagtctaagatgttgtaaacattaatagataaattactattgatcattaatcaataattaataatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaa 41463413  T
252 ccttttcaaaaaa 264  Q
    | |||| ||||||    
41463412 ctttttaaaaaaa 41463400  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 33709299 - 33709241
Alignment:
24 tcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
33709299 tcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 33709241  T

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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 4264153 - 4264093
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt 75  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
4264153 atcaattcatcatattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagt 4264093  T

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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Original strand, 4763758 - 4763813
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttt 70  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
4763758 atcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgttt 4763813  T

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Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Original strand, 33902190 - 33902252
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
33902190 atcatcagttcatcagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaag 33902252  T

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Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2325448 - 2325395
Alignment:
21 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag 74  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
2325448 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaag 2325395  T

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Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19289402 - 19289345
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
19289402 atcatcaactcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgtt 19289345  T

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Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Original strand, 26357704 - 26357759
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttt 70  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||    
26357704 atcaattcatcatattaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgttt 26357759  T

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Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Original strand, 35959023 - 35959077
Alignment:
14 catcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
35959023 catcaattcatcatattaacaagactgcacttaatataa-tttatcctaccttgtt 35959077  T

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Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Original strand, 13711588 - 13711633
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
13711588 atcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaatttta 13711633  T

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Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 124
Target Start/End: Original strand, 33902267 - 33902319
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgtta 124  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
33902267 aagtgtaacacttaatagtatcacataatatcattaactctgtttccatgtta 33902319  T

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Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 19501818 - 19501760
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  |||| |||||||    
19501818 atcatcaattcatcagattaacaa-actacatttaatctaattttattctactttgtttt 19501760  T

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Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11366460 - 11366403
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| | || ||||||    
11366460 atcatcaattcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgtt 11366403  T

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Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17054005 - 17053960
Alignment:
200 taatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaa 245  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
17054005 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 17053960  T

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Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17071646 - 17071601
Alignment:
200 taatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaa 245  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
17071646 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 17071601  T

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Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258296
Alignment:
29 ttaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacac 18258296  T

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Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 33906335 - 33906634
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||                 |||||||||||||||||||     
33906335 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaaaaagtgtaacacttaagactatcg 33906434  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
33906435 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 33906534  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || ||| |||||||    
33906535 atcattaatcagcaatca--aatttaaaaatgaatcgaatagtaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcactgtagaagctc 33906632  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16446942 - 16446669
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||                 ||||||||||||    
16446942 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatca 16446843  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
16446842 cataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 16446743  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
16446742 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatctaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 16446669  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 34895090 - 34895386
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact----------taagac--tatcacataa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||           ||| ||  ||||||||||    
34895090 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacactatcacataa 34895189  T
100 tatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcat 199  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
34895190 tatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcat 34895289  T
200 taatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctccc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||  || |||||||||    
34895290 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaatttcctaactgcaccgtagaagctccc 34895386  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1149699 - 1149422
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
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1149699 atcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 1149600  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
1149599 cataatattatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 1149500  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
1149499 atcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaattt 1149422  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43643662 - 43643382
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
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43643662 atcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatca 43643563  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
43643562 cataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 43643463  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
43643462 atcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttct 43643382  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132480
Alignment:
14 catcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttta----------------agtgtaacacttaagactatcacat 97  Q
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4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgtttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcacat 4132651  T
98 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
4132650 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatc 4132551  T
198 attaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
4132550 attaatttgtaatcaacaatttaaaaatgaattacacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtca 4132480  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27082905 - 27082636
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
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27082905 atcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccccgcaaagtgtaacacttaagactatca 27082806  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |     
27082805 cataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactactt 27082706  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
27082705 atcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 27082636  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37970586 - 37970313
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
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37970586 atcatcaattcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 37970487  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
37970486 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactgttg 37970387  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
37970386 atcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 37970313  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 74 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7890945 - 7890751
Alignment:
74 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagca 173  Q
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7890945 gtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagca 7890846  T
174 ttactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
7890845 ttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 7890751  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8803807 - 8803606
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
8803807 aagtgtaacacttaatactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 8803708  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
8803707 cattaccagatgaatatactattgatcattaatcagtaatgaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaat 8803608  T
271 tt 272  Q
    ||    
8803607 tt 8803606  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23854421 - 23854229
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || || ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
23854421 aagtgtaacacttaagacaatcacataatatcatcaactctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 23854322  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
23854321 cattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 23854229  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 38644101 - 38644374
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||                 |||||||| ||||||||||    
38644101 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccataaagtgtaacactcaagactatca 38644200  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
     || |||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
38644201 tatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 38644300  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
38644301 atcattaatcagtaatcaaaaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 38644374  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 16222986 - 16223242
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa-----------------gtgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||                 ||||||||||||||| |||||    
16222986 atcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacaccccaaaaagtgtaacacttaagagtatca 16223085  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
16223086 cataatatcatcaactttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 16223185  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaa 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
16223186 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaa 16223242  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35459778 - 35459494
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca-----------------cttaagactatca 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||                 ||||||||||| |    
35459778 atcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttataaatgtaacatcccacagattataacacttaagactatta 35459679  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | || || ||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
35459678 cataatatcatcaattctgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaaacattactagatgaattactattg 35459579  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
35459578 atcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctaact 35459494  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 272
Target Start/End: Original strand, 11727227 - 11727425
Alignment:
75 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
11727227 tgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatgttgcaagcat 11727326  T
175 tactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa-gtcaattt 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||    
11727327 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttttaaaaaatgtcaattt 11727425  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 297
Target Start/End: Original strand, 1205127 - 1205352
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
1205127 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 1205226  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
1205227 tattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcagcaatttaaaaatgaatcaaacaacaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaatt 1205326  T
272 ttctaactccagtgtggaagctccca 297  Q
    |||| ||| ||  || ||||||||||    
1205327 ttctgactacaccgtagaagctccca 1205352  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5300013 - 5299740
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||                 |||||| |||||    
5300013 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagattatca 5299914  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
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5299913 aatgatatcagcaattttgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatta 5299814  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
5299813 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 5299740  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 40862619 - 40862820
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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40862619 aagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 40862718  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaattt-aaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
40862719 cattactagatgaattactatttgtcataaatcagtaatcgacaatttaaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaactttttcaaaaaagtcaat 40862818  T
271 tt 272  Q
    ||    
40862819 tt 40862820  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1953978 - 1953786
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
1953978 aagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagattttgcaag 1953879  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
1953878 cattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaa 1953786  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34952098 - 34951851
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 111  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||         | ||| |||||| |||||     
34952098 atcatcaattcatcaaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacact---------cgcatgatatcagcaactc 34952008  T
112 tgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatc 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
34952007 tgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaattactattgatcattaatcagtaatc 34951908  T
212 aacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
34951907 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtca 34951851  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 465965 - 466224
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465965 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcacata-tatc 466063  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
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466064 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 466163  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
466164 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttattcaaaaaa 466224  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 35859160 - 35859330
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98 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 197  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
35859160 aatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 35859259  T
198 attaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
35859260 attaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 35859330  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36694956 - 36694764
Alignment:
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36694956 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaatccaagatgttgcaag 36694857  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||| || | |||||||| || |||| |||| |||||||||||    
36694856 catcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaa 36694764  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 44869697 - 44869893
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||    
44869697 aagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagatattgcaag 44869796  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
44869797 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaaccaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtca 44869893  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6098581 - 6098331
Alignment:
16 tcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatcacata 98  Q
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6098581 tcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacata 6098482  T
99 atatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtata-----tgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatatt 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
6098481 atatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaatacaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 6098382  T
194 gatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatca 244  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
6098381 gatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatca 6098331  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 279
Target Start/End: Original strand, 12587812 - 12587989
Alignment:
102 tcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcatta 201  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
12587812 tcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 12587911  T
202 atcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||    
12587912 atcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttctctaact 12587989  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10555269 - 10554991
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaa---------------gactatcaca 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| | |               ||||||||||    
10555269 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaacacctcacaaaacgtaacacttgactatcaca 10555170  T
97 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaatt--aatattg 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||    
10555169 taatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattacactattg 10555070  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaa-ccttttcaaaaaagtcaattttct 275  Q
    |||||||   || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
10555069 atcatta---agtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttttcaaaaaagtcaattttct 10554991  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31933953 - 31933680
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||                 |||||||||||| | |||||    
31933953 atcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataataccgcacaaagtgtaacacttaaaattatca 31933854  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||  |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||    
31933853 cataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatattgcagacattactagatgaattattattg 31933754  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
31933753 atcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtca 31933680  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1149906 - 1149756
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||    
1149906 aagtgtaacacttaagac----acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaag 1149811  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatg 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
1149810 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 1149756  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 12876309 - 12876506
Alignment:
72 aagtgtaacacttaa-gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaa 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||     
12876309 aagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacag 12876408  T
171 gcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||| ||||| || | |||||||| || |||| |||| |||| ||||||||||    
12876409 gcattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacagtttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaacttttttaaaaaagtca 12876506  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30654573 - 30654381
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
30654573 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 30654474  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||    
30654473 cattactaaatgaatatattattgatcattaatcagtaattaacaattt-aaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 30654381  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 9864348 - 9864504
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
9864348 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgcaag 9864447  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaa 228  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
9864448 cattactagatgaataactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaa 9864504  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39099182 - 39098917
Alignment:
16 tcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acacttaagactatcacata 98  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||                 ||||||||||||||| |||     
39099182 tcaattcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccctgttttaagtgtaacatcccacaaagtatcacacttaagactatcgcatg 39099083  T
99 atatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatca 198  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
39099082 atatcagcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtatatgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 39098983  T
199 ttaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||| |  |||||| |||||||||||| | | |||||||| || ||||||||  |||| ||||||    
39098982 ttaattaataatcaataatttaaaaatgcatcaaacattaaaattaaaattaatttttttaaaaaa 39098917  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 272
Target Start/End: Original strand, 18259321 - 18259479
Alignment:
114 tttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaa 213  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || ||||||    
18259321 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcagtaatgagtaatcaa 18259420  T
214 caatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
18259421 caatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 18259479  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24823336 - 24823194
Alignment:
120 tgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaattt 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
24823336 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaattt 24823237  T
220 aaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaa 262  Q
    |||||| || | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
24823236 aaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaa 24823194  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 272
Target Start/End: Original strand, 33198057 - 33198202
Alignment:
127 gatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatg 226  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
33198057 gatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg 33198156  T
227 aaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    || | | ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
33198157 aatcaatcattaagattaagattaactttttcaaaaaagtcaattt 33198202  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Original strand, 7998417 - 7998553
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttt-accctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
7998417 atcatcaatacatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacacttaatactatcacataatatcaacaact 7998516  T
111 atgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagta 147  Q
     |||||  || ||||||||||||||||| ||||||||    
7998517 ctgtttctatattaaagatgccaacgataaaatagta 7998553  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Original strand, 41362723 - 41362818
Alignment:
173 attactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
41362723 attactagatgaattactattgatcattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtca 41362818  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 13307823 - 13307936
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||   |||||| |||||| |||||||    
13307823 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaa-atgtcaacgataaaatagtacccgtaagttcaagatgttgcaag 13307921  T
172 cattactagatgaat 186  Q
    |||||| ||||||||    
13307922 cattacaagatgaat 13307936  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 41911055 - 41910985
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
41911055 atcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 41910985  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1150172 - 1150102
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
1150172 atcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacac 1150102  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 296
Target Start/End: Original strand, 43025974 - 43026099
Alignment:
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaac-cttttcaaaaaagtcaat 270  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||    
43025974 cattattagataaattactattgatcatgaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttcaaaaaaatcaat 43026073  T
271 tttctaactccagtgtggaagctccc 296  Q
    || |||||  |||| | |||||||||    
43026074 ttcctaaccgcagtttagaagctccc 43026099  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
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Target Start/End: Original strand, 43025905 - 43025968
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75 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgat 138  Q
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43025905 tgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgtcaacgat 43025968  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 9864271 - 9864341
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12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
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9864271 atcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 9864341  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 11727147 - 11727217
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12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
11727147 atcatcaattcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 11727217  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 36695033 - 36694963
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12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
36695033 atcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 36694963  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 41362638 - 41362707
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12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||    
41362638 atcatcaattcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaaca 41362707  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41910978 - 41910907
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaata 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
41910978 aagtgtaacacttaatactatcacatgatatcaccaactctgtttgcatgttaaagatg-caacgataaaata 41910907  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1954053 - 1953987
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 81  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
1954053 atcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaaca 1953987  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Original strand, 1205050 - 1205112
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag 74  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
1205050 atcatcagttcatcatattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaag 1205112  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Original strand, 12876232 - 12876294
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag 74  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
12876232 atcatcaattcatcagattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaag 12876294  T

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Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 30654650 - 30654588
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag 74  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
30654650 atcatcacttcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaag 30654588  T

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Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 44869620 - 44869686
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgt 77  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
44869620 atcatcaatttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgt 44869686  T

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Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 193
Target Start/End: Original strand, 34463704 - 34463792
Alignment:
102 tcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatatt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | |||||||   || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
34463704 tcatcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacctataagtcc---atgttgcaagcattactaaatgaattactatt 34463792  T

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Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 7891024 - 7890962
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||| ||||| ||||    
7891024 atcatcaattcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataag 7890962  T

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Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8803884 - 8803827
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||    
8803884 atcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 8803827  T

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Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Original strand, 43025825 - 43025886
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa 73  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||    
43025825 atcatcaattcatcagactaagaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaa 43025886  T

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Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Original strand, 13307749 - 13307797
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctac 63  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
13307749 atcaattcatcagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctac 13307797  T

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Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 279
Target Start/End: Original strand, 9864533 - 9864578
Alignment:
234 cattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaact 279  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
9864533 cattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaact 9864578  T

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Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 272
Target Start/End: Original strand, 13307939 - 13307979
Alignment:
232 aacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
13307939 aacattaagattaaaattaactttttcaaaatagtcaattt 13307979  T

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Target: chr6 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7235092 - 7234783
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatcacat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||| |||    
7235092 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacgcttaagactatcgcat 7234993  T
98 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
7234992 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatc 7234893  T
198 attaat---cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagctc 294  Q
    ||||||   || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| ||  ||  ||||||    
7234892 attaatcaacaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaatcattttcctgactacaccgtaaaagctc 7234793  T
295 ccattaatta 304  Q
    ||||||||||    
7234792 ccattaatta 7234783  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Original strand, 20768283 - 20768511
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||    
20768283 aagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaag 20768382  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
20768383 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatt 20768482  T
272 ttctaactccagtgtggaagctcccatta 300  Q
    | || ||| ||  || |||||||||||||    
20768483 tcctgactgcaccgtagaagctcccatta 20768511  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 33618958 - 33619234
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacct-tgt-------tttaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||       |  |||||| |||||||||| |||| |||||||||    
33618958 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccagtgtaacaccctagaagtgtgacacttaagagtatcgcataatatc 33619057  T
104 atcaactatgtttgcatgtta-----aagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
33619058 atcaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 33619157  T
199 tta---atcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
33619158 ttaatgatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagattaaaattaactttttaaaaaaagtcaattt 33619234  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3879922 - 3879730
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
3879922 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaag 3879823  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
3879822 cattactagatgaattactattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 3879730  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6091243 - 6090941
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaa-gactatc 93  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||                 |||||||||||| |||||||    
6091243 atcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaacaaagtgtaacacttaaagactatc 6091144  T
94 acataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatatt 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
6091143 acataatatcatcaactctgtttgcatattaaagattcaaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 6091044  T
194 gatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattttctaactccagtgtggaagct 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||| ||  || ||||||    
6091043 gatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtaagttttctgactgcaccgtagaagct 6090944  T
294 ccc 296  Q
    |||    
6090943 ccc 6090941  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 1946035 - 1946233
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||    
1946035 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaag 1946134  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaac-cttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
1946135 cattattagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttcaaaaaagtca 1946233  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33893063 - 33892799
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||      |||  ||    |||||| |||||    
33893063 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacaccccacaaagtgtaacactcacatgatatc 33892964  T
104 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 203  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
33892963 agcaactcagtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattactattgatcattaat 33892864  T
204 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
33892863 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaggttaaaattaactttttcaaaaaagtca 33892799  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Original strand, 5627592 - 5627785
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
5627592 aagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 5627691  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaa 264  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||  |||| ||||||    
5627692 cattactaggtgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaatttttttaaaaaa 5627785  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 8513357 - 8513618
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttt-accctaccttgttttaa-----------gtgtaacacttaagactatcacataa 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| | |||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| |    
8513357 atcatcaattcatcatattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttttaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 8513456  T
100 tatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcat 199  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
8513457 tatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaagtccaaaatcttgcaagcattactagatgaattactattgatcat 8513556  T
200 taatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
    |       ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
8513557 t-------aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtca 8513618  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4318805 - 4318626
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4318805 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtacgggaaagtccaagatgttgcaag 4318706  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaa 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || | |||||||| || ||||||||    
4318705 cattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaa 4318626  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Original strand, 29182365 - 29182556
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||    
29182365 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaag 29182464  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagt 266  Q
     ||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
29182465 tattactagatgaat---tactgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagactaaaattaactttttcaaaaaagt 29182556  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21017095 - 21016916
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||      ||| ||| ||||| |||||||    
21017095 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaata------gtacgtctaagatgttgcaag 21017002  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaacctttt 257  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||    
21017001 cattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttataaatgaatcaaatattaagattaaaattaacttttt 21016916  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 261
Target Start/End: Original strand, 6089032 - 6089286
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttt-accctaccttgttttaa-----------gtgtaacacttaagactatcacataa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||| | |||||||||||||||           || ||||||||||||||||||||| |    
6089032 atcatcaattcatcagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttttaacactctacaaggtataacacttaagactatcacatga 6089131  T
100 tatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcat 199  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
6089132 tatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcat 6089231  T
200 taatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaa 261  Q
    |       ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||  ||||||||    
6089232 t-------aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaattttttcaaa 6089286  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7054704 - 7054559
Alignment:
124 aaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaa 222  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
7054704 aaagattccaacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaa 7054605  T
223 aatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
     ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
7054604 gatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 7054559  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 15491739 - 15491809
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
15491739 atcatcaattcatcagattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 15491809  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 30353341 - 30353256
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtc 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
30353341 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 30353256  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 4318883 - 4318812
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
4318883 atcatcaattcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 4318812  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7055275 - 7055205
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
7055275 atcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacac 7055205  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7055198 - 7055140
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatg 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
7055198 aagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagatg 7055140  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 20768208 - 20768275
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
20768208 atcattaattcatcagattaacaagatt--acttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaaca 20768275  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 21017172 - 21017102
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
21017172 atcatcaattcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacac 21017102  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 30353418 - 30353349
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 81  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
30353418 atcatcaattcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaaca 30353349  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 3879999 - 3879938
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa 73  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
3879999 atcatcaattcatcagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaa 3879938  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Original strand, 29182287 - 29182339
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacc 64  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||    
29182287 atcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctacc 29182339  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33724117 - 33724062
Alignment:
197 cattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaac 252  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
33724117 cattaatcattaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 33724062  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 5627518 - 5627572
Alignment:
15 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||    
5627518 atcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 5627572  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 1945958 - 1946015
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||    
1945958 atcatgaattcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 1946015  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 6)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 408490 - 408223
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||                 ||||||||||||    
408490 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtggaacacttaagactatca 408391  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
408390 cacaatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 408291  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaa 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||  |||||||||    
408290 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaa 408223  T

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Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 260
Target Start/End: Original strand, 335 - 517
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||| |||||||    
335 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac------gtccaagatgttgcaag 428  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaa 260  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||    
429 cattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaa 517  T

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Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 94056 - 93894
Alignment:
100 tatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcat 199  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
94056 tatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcat 93957  T
200 taatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaa 263  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
93956 taatcactaatcaacaattt-aaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaa 93894  T

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Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 258 - 328
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
258 atcatcaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacac 328  T

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Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 94444 - 94374
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 82  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
94444 atcatcaattcatgagattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacac 94374  T

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Target: scaffold0002; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 94367 - 94331
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
94367 aagtgtaacacttaagactattacataatatcatcaa 94331  T

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Target: scaffold0291 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8288
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||                 ||||||||||||||||||||    
8011 atcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 8110  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
8111 cataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 8210  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaattt 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
8211 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaattt 8288  T

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Target: scaffold0318 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 266
Target Start/End: Original strand, 12033 - 12303
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||                 |||||||||||     
12033 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcg 12132  T
95 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattg 194  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
12133 catgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 12232  T
195 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagt 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
12233 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaat-aatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagt 12303  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 146000 - 145799
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||    
146000 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtccaagatgttgcaag 145901  T
172 cattactagatgaat-taatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaat 270  Q
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145900 cattactaaatgaatatacaattgatcattaatcagtaataaaaaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaat 145801  T
271 tt 272  Q
    ||    
145800 tt 145799  T

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Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 146077 - 146020
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
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146077 atcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 146020  T

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Target: scaffold0061 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 44158 - 44353
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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44158 aagtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaag 44256  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
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44257 cattactgaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttcaaaaaagtca 44353  T

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Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Original strand, 44081 - 44126
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 57  Q
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44081 atcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataatttta 44126  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 154629 - 154434
Alignment:
72 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaag 171  Q
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154629 aagtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaag 154531  T
172 cattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
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154530 cattactgaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttcaaaaaagtca 154434  T

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Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 154706 - 154649
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 69  Q
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154706 atcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgtt 154649  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 267408 - 267673
Alignment:
12 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa-----------------gtgtaacacttaa-gactatc 93  Q
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267408 atcatcaattcattagattagcaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaagactatc 267507  T
94 acataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatatt 193  Q
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267508 acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgctgcaagaattactagatgaatta----- 267602  T
194 gatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 268  Q
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267603 ----accaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtca 267673  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 216
Target Start/End: Original strand, 100894 - 101058
Alignment:
32 acaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa--gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 129  Q
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100894 acaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaactgtgtaacactt--------cacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 100985  T
130 gccaacgatgaaatagtatatgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaa 216  Q
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100986 tccaacg------------atgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgcattacta--gatcattaatcagtaatcaacaa 101058  T

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