View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13382_high_5 (Length: 676)

Name: NF13382_high_5
Description: NF13382
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13382_high_5
NF13382_high_5
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (21-349)||(21628047-21628375)
chr7 (43-346)||(21714108-21714411)
chr7 (27-349)||(21704565-21704887)
chr7 (21-348)||(21788152-21788479)
chr7 (21-349)||(21651991-21652319)
chr7 (414-639)||(21681249-21681476)
chr7 (21-349)||(21763987-21764312)
chr7 (27-294)||(21646720-21646987)
chr7 (417-642)||(21627746-21627972)
chr7 (28-349)||(21725818-21726139)
chr7 (21-349)||(21808063-21808394)
chr7 (21-271)||(21745532-21745782)
chr7 (27-349)||(21771883-21772205)
chr7 (21-299)||(15713595-15713873)
chr7 (21-299)||(21681622-21681900)
chr7 (532-642)||(21740671-21740781)
chr7 (43-349)||(21664017-21664326)
chr7 (21-349)||(21785325-21785656)
chr7 (418-557)||(21991458-21991596)
chr7 (513-633)||(21704307-21704426)
chr7 (21-207)||(21623257-21623443)
chr7 (22-349)||(21992092-21992431)
chr7 (414-642)||(21689035-21689256)
chr7 (415-571)||(21622745-21622893)
chr7 (414-642)||(21791645-21791866)
chr7 (418-642)||(21713825-21714048)
chr7 (424-490)||(21791512-21791578)
chr7 (43-292)||(21689392-21689641)
chr7 (414-490)||(21639468-21639544)
chr7 (414-490)||(21663875-21663951)
chr7 (415-490)||(21651859-21651934)
chr7 (424-490)||(21788002-21788068)
chr7 (414-490)||(21704425-21704499)
chr7 (568-640)||(21651734-21651806)
chr7 (21-292)||(21791990-21792261)
chr7 (573-642)||(21784566-21784635)
chr7 (582-642)||(21663698-21663758)
chr7 (574-642)||(21725571-21725639)
chr7 (290-349)||(21741028-21741087)
chr7 (577-632)||(21784691-21784746)
chr7 (574-632)||(21771645-21771703)
chr7 (586-641)||(21991408-21991463)
chr7 (453-490)||(21771759-21771796)
chr7 (453-490)||(21785163-21785200)
chr7 (590-641)||(21622693-21622744)
chr7 (579-617)||(21787911-21787949)
chr7 (453-490)||(21725694-21725731)
chr7 (556-642)||(21639321-21639404)
chr7 (608-642)||(21791419-21791453)
chr7 (453-489)||(21740895-21740931)
[»] scaffold0182 (4 HSPs)
scaffold0182 (110-349)||(25232-25471)
scaffold0182 (574-642)||(34209-34277)
scaffold0182 (291-349)||(34456-34514)
scaffold0182 (453-490)||(34332-34369)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21628375 - 21628047
Alignment:
Q  21 ttaaatttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctat 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  21628375 ttaaatttaaaacatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagttcctctggaataagtccaatgttttctat 21628276  T
Q  121 gtattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgc 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||   ||||| |    
T  21628275 gtattttgatgcccacacaagcttgtacttctctcctatgttcagatttgtactgccatgatggataggacctattgacacaaacttgggtgagtaatac 21628176  T
Q  221 acctcaaaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgtagctgcacaaatt 320  Q
      | |||||  | ||  |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | || || || ||||||||    
T  21628175 ttcccaaaatcttttttatttctgagatgatcggccaccctttgtatctttggtcgtgcatttcggggtgtttgctttgaattttttaactccacaaatt 21628076  T
Q  321 tttctttaatagtttgggatgccatcatt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21628075 tttctttaatagtttgggatgccatcatt 21628047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 43 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21714411 - 21714108
Alignment:
Q  43 aaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctatgtattttgatgcccacataagc 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21714411 aaaatgacccttcagttcatcaatgttatctgcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtgtctggtgttttctatgtattttgctgcccacataagt 21714312  T
Q  143 ttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgcacctcaaaacttgttcgatttt 242  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||   |||||||  ||||||| |||||| ||||     
T  21714311 ttgtacttctctcctttcttcagatttggattgtcatgatggataggacctaatgacacaaacttgggtgagtaatgcttctcaaaatttgttctatttc 21714212  T
Q  243 tgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgtagctgcacaaatttttctttaatagtttgggatgc 342  Q
    ||| | | ||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21714211 tgaaacggtcaaccaccctttgtatcttcggtcgtgaattttggggtgtttgcattgatttttgtagctccacaaatttttctttaatagtttgggatgc 21714112  T
Q  343 catc 346  Q
    ||||    
T  21714111 catc 21714108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21704887 - 21704565
Alignment:
Q  27 ttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctatgtattt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21704887 ttaaaacatcatcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatctgcaatctttttgtgtagttcctctggaataagtccggtgttttctatgtattt 21704788  T
Q  127 tgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgcacctca 226  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||   |||||||  ||||    
T  21704787 tgctgcccacataagcttgtacttctctcctaacttcagagttggattgtcatgatggataggacctatcgacactaacttgggtgagtaatgctgctca 21704688  T
Q  227 aaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgtagctgcacaaatttttctt 326  Q
    ||  || ||| | || ||||||  |||  |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| | || || ||  |||||||||||||    
T  21704687 aagttttttctacttctgagatactcttgcaccctttgtatctttggtcgtgcatttggaggtgtttgctttgaattttttaactcgacaaatttttctt 21704588  T
Q  327 taatagtttgggatgccatcatt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21704587 taatagtttgggatgccatcatt 21704565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21788479 - 21788152
Alignment:
Q  21 ttaaatttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctat 120  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||| ||    
T  21788479 ttaaagttaaaacatcgtcgccaaaatgacccttcagttcatcaatgttatctgcaatctttttgtgcagatcctctggaatgtgtccagtgttttcgat 21788380  T
Q  121 gtattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgc 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||   |||||||    
T  21788379 gtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaacttcaaatttgtgttgtcatgatggataggacctaccgacaacaacttgggcgagtaatgc 21788280  T
Q  221 acctcaaaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgtagctgcacaaatt 320  Q
      ||||||  || ||| |||| ||||||  |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  21788279 ttctcaaagttttttctatttctgagatactctgccaccctttgtattttcggtcgtgaattttggggtgtttgctttgatttttgtaactccacaaatt 21788180  T
Q  321 tttctttaatagtttgggatgccatcat 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21788179 tttcattaatagtttgggatgccatcat 21788152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21652319 - 21651991
Alignment:
Q  21 ttaaatttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctat 120  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||  |||||||||||||  | |||||| ||||||  | | ||||||||||    
T  21652319 ttaaagttaaaacatcgtcgctaaaatgaccctttagttcgttaattttatcggcaatctttttgtgtcgatcctctagaataaagccgttgttttctat 21652220  T
Q  121 gtattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgc 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||  |||||||     
T  21652219 gtattttgctgcccacataagcttatactcctctcctggtttcatatttgtattgtcatgatggataggacctattgaaacaaacttgggggtgtaatgt 21652120  T
Q  221 acctcaaaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgtagctgcacaaatt 320  Q
      ||||||| |  ||| |||| ||||||  | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  21652119 ttctcaaaattgtttctatttctgagatactgtggcaccctttgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgatttttgtagttccacaaatt 21652020  T
Q  321 tttctttaatagtttgggatgccatcatt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21652019 tttctttaatagtttgggatgccatcatt 21651991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 414 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 21681476 - 21681249
Alignment:
Q  414 gggctcagtgtagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgcttcnnnnnnn--tgttacacttcac 511  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          | | |||||||||    
T  21681476 gggctcagggtagtgctttagtttttcatgctctcaaacctttacctaataaacaagataagtaaatatgcttgcttaaaaaaaaaatctcacacttcac 21681377  T
Q  512 tttaatatattttttatacctgtcctctttgttactaaagtaacttgtcctcagagcaaactatataatgtccataactttactcaatggacaagaaaag 611  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21681376 tttaatagattttttatacctgtcctctttgctactaaagcaacttgtcctcagaacaaactatataatgtctatcactttactcaatggacaagaaaag 21681277  T
Q  612 taaaattcatggaaaaaggatcattgct 639  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  21681276 taaaattcatggaaattggatctttgct 21681249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21764312 - 21763987
Alignment:
Q  21 ttaaatttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctat 120  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  21764312 ttaaagttaaaacatcatcgctaaaacgacccttcagttcatcgatgttatcagcaatcttttggtgtagttcctctggattaagtgcggtgttttctat 21764213  T
Q  121 gtattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgc 220  Q
    ||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||| |||    
T  21764212 gtattctgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacttcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtgc 21764113  T
Q  221 acctcaaaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgtagctgcacaaatt 320  Q
      | | ||| |||      || || | | || || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  21764112 ttccccaaatttgacatccttctgcggtaatatggcaccctttgtatcttgggtcgtgaattttggggtgtttgctttga---ttgtagctccacaaatt 21764016  T
Q  321 tttctttaatagtttgggatgccatcatt 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21764015 tttctttaagagtttgggatgccatcatt 21763987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21646987 - 21646720
Alignment:
Q  27 ttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctatgtattt 126  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    |||   ||  |||||||  ||||||||    
T  21646987 ttaaaacgtcgtcgctaaaatgacccttcagttcatcaatgttatctacaatctttttgtgtagatccttcttaattcttcccgtgtttttgatgtattt 21646888  T
Q  127 tgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgcacctca 226  Q
    || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||| |||||    
T  21646887 tgctgcccacataagcttgtatttctctcctatcttcagctttggattgtcatgatggataggacctattgacaccaacttgggggtgtaatgctcctca 21646788  T
Q  227 aaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttg 294  Q
    ||  |||||| |||| ||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21646787 aattttgttctatttctgagatactgtggcaccctttgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttg 21646720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 417 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 21627972 - 21627746
Alignment:
Q  417 ctcagtgtagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgcttcnnnnnnn-tgttacacttca-cttt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         | |||||||||| ||||    
T  21627972 ctcagtgtagtgctttagattttcatgctctcaaacctttacctaatgagcaagataagtaaatatgcttgcttaaaacaaaatcttacacttcaacttt 21627873  T
Q  515 aatatattttttatacctgtcctctttgttactaaagtaacttgtcctcagagcaaactatataatgtccataactttactcaatggacaagaaaagtaa 614  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21627872 aatcaattttt-atacctgtcctcttcactgctaaagtaacttgtcctcagaacaaactatataatgtccatcactttactcaacggacaagaaaagtaa 21627774  T
Q  615 aattcatggaaaaaggatcattgctttt 642  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21627773 aattcatggaaataggatcgttgctttt 21627746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21726139 - 21725818
Alignment:
Q  28 taaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctatgtatttt 127  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  21726139 taaaacatcgtcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtgtccggtgttttctatgtatttt 21726040  T
Q  128 gatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgcacctcaa 227  Q
    | |||||||||||| ||| ||| |||| |||   |||||||||  || | |||||| |||||||| | ||||||  |||| ||   |||||||  |||||    
T  21726039 gctgcccacataagtttgtactactctgctaatatcagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaa 21725940  T
Q  228 aacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgtagctgcacaaatttttcttt 327  Q
    |  || ||| |||| |||||   | |  |||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  21725939 agttttttctatttctgagagactttagcaccctttgtatcttcggtcttgaattttgggatatttgctttgatttttgtagttccacaaatttttcttt 21725840  T
Q  328 aatagtttgggatgccatcatt 349  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  21725839 aatagtttcggatgccatcatt 21725818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 349
Target Start/End: Original strand, 21808063 - 21808394
Alignment:
Q  21 ttaaatttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctat 120  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||  | | ||||||||||    
T  21808063 ttaaagttaaaacatcgtcgccaaaatgacccttcagttcatcgatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctagaataaagccgctgttttctat 21808162  T
Q  121 gtattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgc 220  Q
    |||||| |  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||   |||||||    
T  21808163 gtatttcgcagaccacataagcttgtacttctctcctaacttcagatttatatttccatgatggataggacctattgataccaacttgggtgagtaatgc 21808262  T
Q  221 acctcaaaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgtagctgcacaaatt 320  Q
      ||||| | |||||| |||| ||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||| |||||  |    
T  21808263 ttctcaagatttgttctatttctgagatactcagccaccctttgtatctttggtcgtgaattttggggtatttgatttgaattttttagctccacaatct 21808362  T
Q  321 tttctttaa---tagtttgggatgccatcatt 349  Q
    ||| || ||   ||||||||||| ||||||||    
T  21808363 ttttttcaagggtagtttgggattccatcatt 21808394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21745782 - 21745532
Alignment:
Q  21 ttaaatttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctat 120  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |  | |  || || || |     
T  21745782 ttaaagttaaaacatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagatcgtgtggattgtggcctgtattctcgag 21745683  T
Q  121 gtattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgc 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||    
T  21745682 gtattttgctgcccacataagcttatactcttctcctgtctttagatttggattgtcatgatggataggacctaatgacaccaacttgggtgagtaatgc 21745583  T
Q  221 acctcaaaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatcttt 271  Q
      ||||||| |||||| |||| ||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  21745582 ttctcaaaatttgttctatttatgagatggtctaccaccctttgtatcttt 21745532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21772205 - 21771883
Alignment:
Q  27 ttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctatgtattt 126  Q
    |||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||   || | | ||||||||||||||    
T  21772205 ttaaaacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttattttctatgtattt 21772106  T
Q  127 tgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgcacctca 226  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||| |||   |||||||||  || | |||||| |||||||| | ||||||  |||| ||   |||||||  ||||    
T  21772105 tgctgcccacataagtttgtacttctctgctaatatcagatttgtgttatgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctca 21772006  T
Q  227 aaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgtagctgcacaaatttttctt 326  Q
    ||  || ||| |||| |||||   | |  |||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  21772005 aagttttttctatttctgagagactttagcaccctttgtatcttcggtcttgaattttggggtatttgctttgatttttgtagttccacaaatttttctt 21771906  T
Q  327 taatagtttgggatgccatcatt 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  21771905 taatagtttcggatgccatcatt 21771883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15713873 - 15713595
Alignment:
Q  21 ttaaatttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctat 120  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  |||||||  ||    
T  15713873 ttaaagttaaaacatcgtcactaaaatgacacttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgcagttcctctagaatgcttccagtgtttttgat 15713774  T
Q  121 gtattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgc 220  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||   |||||||    
T  15713773 gtattttgccgcccacataagcttgtacttctcccctgactttagatttgtattgtcatgatggatagggcctattgaaaccaacttaggtgcgtaatgc 15713674  T
Q  221 acctcaaaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttg 299  Q
    | |||| || || | |  ||| ||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15713673 atctcataatttttactttttctgagatagcctggcaccctttgtatctttggtcgtgaactttggggtgtttgctttg 15713595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21681900 - 21681622
Alignment:
Q  21 ttaaatttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctat 120  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  || |||| | ||||   ||  |||||||  ||    
T  21681900 ttaaagttaaaacatcgtcgctaaaatggcccttcaattcatcaatgttatcagcaatttttttgtatagatccttttgaatgcttccagtgtttttgat 21681801  T
Q  121 gtattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgc 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||  ||||||||    
T  21681800 gtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactttagatctgtattgccatgatggataggacctattgacacaaacttggggctgtaatgc 21681701  T
Q  221 acctcaaaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttg 299  Q
     ||| |||  |||||| |||||||| ||    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21681700 tccttaaattttgttctatttttgacataccgtggcaccctttgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgatttg 21681622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 532 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 21740781 - 21740671
Alignment:
Q  532 tgtcctctttgttactaaagtaacttgtcctcagagcaaactatataatgtccataactttactcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaaaagga 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21740781 tgtcctctttgttactaaagtaacttgtcctcataacaaactatataatgtccatcactttactcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaaaagga 21740682  T
Q  632 tcattgctttt 642  Q
    |||||||||||    
T  21740681 tcattgctttt 21740671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21664326 - 21664017
Alignment:
Q  43 aaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctatgtattttgatgcccacataagc 142  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||  |||| | ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21664326 aaaatgacccttcagttcatcgatgttatcaaaaatctttttgtgtagatcccgtggattgagtcttgtattttcaatgtattttgctgcccacataagc 21664227  T
Q  143 ttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgcacctcaaaacttgttcgatttt 242  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| | |||||  ||||| ||   ||||| |  ||||||  || |||  |||     
T  21664226 ttgtacttccctcctaacttcagatctgtattgccatgatggataggacctattgacaggaacttgggtgagtaatacttctcaaagttttttctgtttc 21664127  T
Q  243 tgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgtagctgcacaaatttttctttaa---tagtttggga 339  Q
    ||||||  | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| ||||| ||||| || ||   ||||||||||    
T  21664126 tgagattgtgtggcaccctttgtatctttggtcgtgaactttggggtatttgctttgaattttctagctccacaatttttttttcaagggtagtttggga 21664027  T
Q  340 tgccatcatt 349  Q
    ||||||||||    
T  21664026 tgccatcatt 21664017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21785656 - 21785325
Alignment:
Q  21 ttaaatttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctat 120  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||   |||| |  | |   | || || |     
T  21785656 ttaaagttaaaacatcatcgctaaaatgacccttcagttcattaatgttatcggcaatctttttgtgtagatcgcgtggattgcggcctatattctcgag 21785557  T
Q  121 gtattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgc 220  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||   |||||||    
T  21785556 gtattttgcggcccacataagcttgtacttctctcctgtcttcagatttggattgtcatgatggataggacctattgacactaacttgggtgagtaatgc 21785457  T
Q  221 acctcaaaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgtagctgcacaaatt 320  Q
      ||||||  || | | |||| | ||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||| ||    
T  21785456 ttctcaaagtttttcctatttcttagatactcttgcaccctttgtatctttggtcgtgaattttggggtatttgctttgaattttctagctccacaattt 21785357  T
Q  321 tttctttaa---tagtttgggatgccatcatt 349  Q
    ||| || ||   |||||||||||| |||||||    
T  21785356 ttttttcaagggtagtttgggatgtcatcatt 21785325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 418 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 21991596 - 21991458
Alignment:
Q  418 tcagtgtagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgcttcnnnnnnntgttacacttcactttaat 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  21991596 tcagtgtagtgctttagattttcattctctcgaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt-aaaaaaatgttacacttcactttaat 21991498  T
Q  518 atattttttatacctgtcctctttgttactaaagtaactt 557  Q
    | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  21991497 agattttttatacttgtcctctttactactaaagtaactt 21991458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 513 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 21704426 - 21704307
Alignment:
Q  513 ttaatatattttttatacctgtcctctttgttactaaagtaacttgtcctcagagcaaactatataatgtccataactttactcaatggacaagaaaagt 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21704426 ttaatatattttttatacctgtcctctttgttactaaagtaacttgtcctcagaacaaa-tatataatgtccatcactttactcaatgtacaagaaaagt 21704328  T
Q  613 aaaattcatggaaaaaggatc 633  Q
    |||||||  ||||| ||||||    
T  21704327 aaaattctcggaaacaggatc 21704307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21623443 - 21623257
Alignment:
Q  21 ttaaatttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctat 120  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||   |||    |||||||||||  ||    
T  21623443 ttaaagttaaaacatcgtcactaaaatgacccttcagttcatcaatattatcagcaatcttgttgtgcatatccttctgaacttttctggtgtttttgat 21623344  T
Q  121 gtattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaactt 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21623343 gtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaacttcagatttgtattgccatgatggataggacctattgacaccaactt 21623257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21992431 - 21992092
Alignment:
Q  22 taaatttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctatg 121  Q
    |||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||   |||| ||||||  |  ||||| |||    
T  21992431 taaagttaaaacatcgtcactaaaatgacccttcagttcatcaatgttatcgataatctttttgtgtagatcgcatggattaagtcctgcattttcgatg 21992332  T
Q  122 tattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagat---------ttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaa 212  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||         ||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| || ||      
T  21992331 tattttgctgcccacgtaagcttgtacttctctcctaacttcagatttgcattgcttgtattgccatgatggataggacctattgacaccaatttgggtg 21992232  T
Q  213 tgtaatgcacctcaaaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgtagctg 312  Q
     ||| |||  ||||||   | ||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | || |||||     
T  21992231 agtagtgcttctcaaagtcttttctatttttgagatactctgccaccctttgtatctgtgttcgtgaattttggggtatttgctttgaattttctagctc 21992132  T
Q  313 cacaaatttttctttaa---tagtttgggatgccatcatt 349  Q
    ||||| |||||||| ||    |||||||||||||||||||    
T  21992131 cacaattttttcttcaagggaagtttgggatgccatcatt 21992092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 414 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 21689256 - 21689035
Alignment:
Q  414 gggctcagtgtagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgcttcnnnnnnntgttacactt-cact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| ||||    
T  21689256 gggctcagtgtagtgctttagattttcatgctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt----aaaatattacacttccact 21689161  T
Q  513 ttaatatattttttatacctgtcctctttgttactaaagtaacttgtcctcagagcaaactatataatgtccataactttactcaatggacaagaaaagt 612  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||| || | |||||    | |||||  |||| |||||||||  |||||||||    
T  21689160 ttaa-atgatttttatacctgtcctcttcactgctaaagtaacttgttctcggaacgaacta---cacgtccaccacttaactcaatggggaagaaaagt 21689065  T
Q  613 aaaattcatggaaaaaggatcattgctttt 642  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  21689064 aaaattcatggaaaagggatatttgctttt 21689035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 415 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 21622893 - 21622745
Alignment:
Q  415 ggctcagtgtagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgcttcnnnnnnntgttacacttcacttt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||        | | ||||||||||||    
T  21622893 ggctcagtgtagtgctttagattttcatgctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaa--------cctttaaaaaaatctcacacttcacttt 21622802  T
Q  515 aatatattttttatacctgtcctctttgttactaaagtaacttgtcctcagagcaaa 571  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21622801 aatagattttttatacctgtcctcttttttactaaagtaacttgtcctcagaacaaa 21622745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 414 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 21791866 - 21791645
Alignment:
Q  414 gggctcagtgtagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgcttcnnnnnnntgttacactt-cact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| ||||    
T  21791866 gggctcagtgtagtgctttagattttcatgctttcaaacctttacctactgaacaagataagtaaatatgcttgctt----aaaatattacacttccact 21791771  T
Q  513 ttaatatattttttatacctgtcctctttgttactaaagtaacttgtcctcagagcaaactatataatgtccataactttactcaatggacaagaaaagt 612  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||| || | |||||    | |||||  | || |||||||||| |||||||||    
T  21791770 ttaat-tgatttttatacctgtcctcttcactgctaaagtaacttgttctcggaacgaacta---cacgtccaccagttaactcaatggagaagaaaagt 21791675  T
Q  613 aaaattcatggaaaaaggatcattgctttt 642  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  21791674 aaaattcatggaaaagggatatttgctttt 21791645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 418 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 21714048 - 21713825
Alignment:
Q  418 tcagtgtagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgcttcnnnnnnntgt--tacacttc-acttt 514  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||        | |  || | ||| |||||    
T  21714048 tcagtgtagtgctttaaattttcatgctctcaaacctttacctaatgaacaagttaagtaaatctgctttcttaaaaaaactatcttaaatttcgacttt 21713949  T
Q  515 aatatattttttatacctgtcctctttgttactaaagtaacttgtcctcagagcaaactatataatgtccataactttactcaatggacaagaaaagtaa 614  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||   | |||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21713948 aataaattttt-atacttgtcctcttcactgctaaagtaacttgtcctcggaacgaactatat---gtccaccgctttactcaatggacaagaaaagtaa 21713853  T
Q  615 aattcatggaaaaaggatcattgctttt 642  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21713852 aattcatggaaaaaagatctttgctttt 21713825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21791578 - 21791512
Alignment:
Q  424 tagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 490  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21791578 tagtgctttagattttcatgctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 21791512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21689641 - 21689392
Alignment:
Q  43 aaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcc-tctggaataagtctggtgttttctatgtattttgatgcccacataag 141  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||   ||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21689641 aaaatgacccttcagtttatcaatgttatcaacaatgtttttgtgtagatccctctg-aatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataag 21689543  T
Q  142 cttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgcacctcaaaacttgttcgattt 241  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |  |||| ||||||||||||||||   ||||| |||| ||||  | ||||||  ||||||  ||  || ||||    
T  21689542 cttgtacttctctcctaactttagagatttattgccatgatggataggaccttttgacatcaacctcggggtctaatgcttctcaaatttttctctattt 21689443  T
Q  242 ttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtt 292  Q
     ||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21689442 ctgagatactcttgcaccctttgtatctttggtcgtgaactttcgggtgtt 21689392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 414 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21639544 - 21639468
Alignment:
Q  414 gggctcagtgtagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 490  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639544 gggctcagtgtagtgctttaaattttcatgctcttgaaactttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 21639468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 414 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21663951 - 21663875
Alignment:
Q  414 gggctcagtgtagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 490  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21663951 gggctcactgtactgctttggattttttttctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 21663875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21651934 - 21651859
Alignment:
Q  415 ggctcagtgtagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 490  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21651934 ggctcagtgtagtgctctagatttccatgctcacaaacctttacctaattaacaagataagtaaatatgcttgctt 21651859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21788068 - 21788002
Alignment:
Q  424 tagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 490  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21788068 tagtgctttagtttttcatgctctcaaacctttacctaatgaacaagataactaaatatgcttgctt 21788002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 414 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21704499 - 21704425
Alignment:
Q  414 gggctcagtgtagtgctttagattttcattctctcaaacctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 490  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21704499 gggctcagcgtagtgctttagtttttcattctc--aaacctttacctaatgaacaagataactaaatatgcttgctt 21704425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 568 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 21651806 - 21651734
Alignment:
Q  568 caaactatataatgtccataactttactcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaaaaggatcattgctt 640  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21651806 caaactatataatgtctaccactttactcaatggacaagaaatgtaaaattcatggaaaaaggatctttgctt 21651734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21792261 - 21791990
Alignment:
Q  21 ttaaatttaaaacatcctcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagttcctctggaataagtctggtgttttctat 120  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||| || |   ||||   |   || ||||  ||    
T  21792261 ttaaagttaaaacatcatcgctaaaacgatccttcagcgtatcaatgttatcggcaatctttttgtgcagatctttcagaatgctttcagtttttttgat 21792162  T
Q  121 gtattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcggaatgtaatgc 220  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || | || |||||||||| ||||| | ||| || ||| | || |||||||||    
T  21792161 gtattctgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactccagatctgtactgccatgatggatgggacctattgatacaaaccttgggatgtaatgc 21792062  T
Q  221 acctcaaaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtt 292  Q
      ||||||| ||  ||  ||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  21792061 ttctcaaaattttctctctttctgagatactctgccaccctttgtatctttggttttgaacttgggggtgtt 21791990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 573 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 21784635 - 21784566
Alignment:
Q  573 tatataatgtccataactttactcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaaaaggatcattgctttt 642  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  21784635 tatataatgtccatcactttactcattggacaagaaaagtaaaattcacggaaaaaggatatttgctttt 21784566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 582 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 21663758 - 21663698
Alignment:
Q  582 tccataactttactcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaaaaggatcattgctttt 642  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21663758 tccatcactttgctcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaataggatcattgctttt 21663698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 574 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 21725639 - 21725571
Alignment:
Q  574 atataatgtccataactttactcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaaaaggatcattgctttt 642  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||    
T  21725639 atataatgtccatcactttactcattggacaagaaaagtaaaattcacagaaaaaggatatttgctttt 21725571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21741087 - 21741028
Alignment:
Q  290 gtttgctttgattgttgtagctgcacaaatttttctttaatagtttgggatgccatcatt 349  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21741087 gtttgctttaatttttgtagctccacaattttttctttaatagtttgggatgccatcatt 21741028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 577 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 21784746 - 21784691
Alignment:
Q  577 taatgtccataactttactcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaaaaggat 632  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21784746 taatgttcatcactttactcaatggacaagaaaagtaaaattcacggaaaaaggat 21784691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 574 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 21771703 - 21771645
Alignment:
Q  574 atataatgtccataactttactcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaaaaggat 632  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21771703 atataatgtccatcactttactcattggacaagaaaagtaaaattcacagaaaaaggat 21771645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 21991463 - 21991408
Alignment:
Q  586 taactttactcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaaaaggatcattgcttt 641  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  21991463 taactttactcaatagacaagaaaagtgaaattcatggaaaaaggatatttgcttt 21991408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21771796 - 21771759
Alignment:
Q  453 ctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21771796 ctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 21771759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21785200 - 21785163
Alignment:
Q  453 ctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21785200 ctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 21785163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 590 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 21622744 - 21622693
Alignment:
Q  590 tttactcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaaaaggatcattgcttt 641  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21622744 tttactcgatggacaagaaaagtaaaattcatggaaatagtatctttgcttt 21622693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 21787949 - 21787911
Alignment:
Q  579 atgtccataactttactcaatggacaagaaaagtaaaat 617  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21787949 atgtccatcactttactcaatggacaagaaaagtaaaat 21787911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21725731 - 21725694
Alignment:
Q  453 ctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21725731 ctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcgtgctt 21725694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 556 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 21639404 - 21639321
Alignment:
Q  556 ttgtcctcagagcaaactatataatgtccataactttactcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaaaaggatcattgctttt 642  Q
    ||||||||| | ||||||||||   |||||  ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  21639404 ttgtcctcataacaaactatat---gtccaccactttactcaatgtacaaaataagtaaaattaatgaaaaaaggatctttgctttt 21639321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 608 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 21791453 - 21791419
Alignment:
Q  608 aaagtaaaattcatggaaaaaggatcattgctttt 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21791453 aaagtaaaattcatggaaaaaggatctttgctttt 21791419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21740931 - 21740895
Alignment:
Q  453 ctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgct 489  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21740931 ctttacctattgaagaagataagtaaatatgcttgct 21740895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25471 - 25232
Alignment:
Q  110 gtgttttctatgtattttgatgcccacataagcttgaacttctctcctatcttcagatttggattgtcatgatggataggaccaaatgacaccaacttcg 209  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  25471 gtgttttctatgtattctgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacttcagatttttattgtcatgatggataggacctattgacaccaacttgg 25372  T
Q  210 gaatgtaatgc-acctcaaaacttgttcgatttttgagatgatctgtcaccctctgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgattgttgta 308  Q
    |  |||| | |  |||| ||| ||| |   ||| || | | || || |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25371 gtttgtagtacttcctc-aaatttggtatctttctgcggtaatatgccaccctttgtatcttgggtggtgaattttggggtgtttgctttgatttttgta 25273  T
Q  309 gctgcacaaatttttctttaatagtttgggatgccatcatt 349  Q
    ||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25272 gctcctcaattttttctttaagagtttgggctgccatcatt 25232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 574 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 34277 - 34209
Alignment:
Q  574 atataatgtccataactttactcaatggacaagaaaagtaaaattcatggaaaaaggatcattgctttt 642  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||    
T  34277 atataatgtccatcactttactcattggacaagaaaagtaaaattcacagaaaaaggatatttgctttt 34209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34514 - 34456
Alignment:
Q  291 tttgctttgattgttgtagctgcacaaatttttctttaatagtttgggatgccatcatt 349  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34514 tttgctttgatttttgtagttccacaaatttttctttaatagtttcggatgccatcatt 34456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 34369 - 34332
Alignment:
Q  453 ctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcttgctt 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34369 ctttacctaatgaacaagataagtaaatatgcgtgctt 34332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University