View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13386_low_29 (Length: 354)

Name: NF13386_low_29
Description: NF13386
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13386_low_29
NF13386_low_29
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (22-347)||(49523566-49523886)
chr4 (22-347)||(42981052-42981374)
chr4 (22-347)||(41761097-41761418)
chr4 (22-347)||(43519870-43520192)
chr4 (22-347)||(41781954-41782276)
chr4 (22-347)||(35403038-35403352)
chr4 (22-347)||(52867527-52867851)
chr4 (22-347)||(11255300-11255624)
chr4 (22-347)||(51012367-51012681)
chr4 (22-347)||(48646115-48646429)
chr4 (22-347)||(54386581-54386895)
chr4 (22-340)||(11602110-11602424)
chr4 (83-221)||(43507791-43507929)
chr4 (79-201)||(320105-320227)
chr4 (79-201)||(4172945-4173067)
chr4 (79-201)||(33265144-33265266)
chr4 (87-216)||(834481-834610)
chr4 (87-216)||(5438331-5438460)
chr4 (23-219)||(2692747-2692934)
chr4 (27-164)||(27383062-27383199)
chr4 (58-164)||(44973441-44973547)
chr4 (58-195)||(50132443-50132587)
chr4 (27-164)||(9590877-9591014)
chr4 (58-164)||(4613973-4614079)
chr4 (240-282)||(2692712-2692754)
chr4 (78-160)||(10767218-10767300)
chr4 (27-164)||(44557596-44557732)
chr4 (47-143)||(7150015-7150111)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (22-347)||(42942226-42942548)
chr8 (22-347)||(5036891-5037213)
chr8 (22-347)||(33708180-33708502)
chr8 (22-347)||(41041954-41042276)
chr8 (22-301)||(22272713-22272989)
chr8 (22-347)||(38547667-38547981)
chr8 (22-347)||(8609177-8609490)
chr8 (22-346)||(40339051-40339372)
chr8 (22-347)||(13282837-13283150)
chr8 (22-347)||(27691606-27691920)
chr8 (22-346)||(13485479-13485793)
chr8 (64-347)||(13107743-13108015)
chr8 (22-344)||(9672550-9672861)
chr8 (22-275)||(26239853-26240099)
chr8 (22-347)||(7744501-7744815)
chr8 (22-273)||(41825113-41825342)
chr8 (79-216)||(601053-601190)
chr8 (79-201)||(29237754-29237876)
chr8 (79-216)||(35509975-35510112)
chr8 (79-201)||(33761923-33762045)
chr8 (79-206)||(15306825-15306952)
chr8 (79-206)||(15487194-15487321)
chr8 (31-174)||(11788754-11788897)
chr8 (37-164)||(17808043-17808170)
chr8 (27-148)||(11720922-11721043)
chr8 (28-164)||(10268813-10268949)
chr8 (27-164)||(15143590-15143727)
chr8 (312-347)||(22272978-22273013)
chr8 (23-164)||(11032085-11032226)
chr8 (28-164)||(32823256-32823391)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (22-347)||(30939779-30940101)
chr7 (22-347)||(23905622-23905944)
chr7 (22-347)||(35692720-35693042)
chr7 (22-347)||(46438880-46439202)
chr7 (22-347)||(27665416-27665737)
chr7 (22-347)||(37114898-37115212)
chr7 (22-347)||(38473493-38473810)
chr7 (22-301)||(29995910-29996186)
chr7 (22-303)||(48851741-48852018)
chr7 (79-342)||(66570-66831)
chr7 (22-282)||(47385638-47385895)
chr7 (22-219)||(24227893-24228091)
chr7 (28-192)||(6603985-6604149)
chr7 (22-192)||(39858741-39858910)
chr7 (129-347)||(37792404-37792618)
chr7 (22-192)||(13168539-13168708)
chr7 (22-192)||(45359778-45359947)
chr7 (79-216)||(35402810-35402947)
chr7 (230-346)||(34776332-34776448)
chr7 (230-346)||(13168720-13168836)
chr7 (230-346)||(39858613-39858729)
chr7 (212-347)||(6604146-6604279)
chr7 (22-119)||(37795437-37795534)
chr7 (22-119)||(37795765-37795862)
chr7 (49-130)||(34776499-34776580)
chr7 (269-346)||(45360013-45360090)
chr7 (27-164)||(367142-367278)
chr7 (23-195)||(25972289-25972468)
chr7 (27-164)||(7402314-7402451)
chr7 (230-278)||(45359959-45360007)
chr7 (47-164)||(13035143-13035260)
chr7 (239-346)||(24227792-24227901)
chr7 (22-148)||(17199915-17200040)
chr7 (27-148)||(23965407-23965528)
chr7 (312-347)||(22154619-22154654)
chr7 (312-347)||(22210534-22210569)
chr7 (312-347)||(29995886-29995921)
chr7 (60-148)||(6057813-6057901)
chr7 (58-148)||(31914422-31914512)
chr7 (154-192)||(34776460-34776498)
chr7 (312-340)||(47385587-47385615)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (22-347)||(3012823-3013144)
chr1 (22-347)||(45045851-45046174)
chr1 (22-347)||(51895535-51895857)
chr1 (22-347)||(4855336-4855651)
chr1 (22-344)||(46582961-46583273)
chr1 (22-347)||(2870031-2870353)
chr1 (22-342)||(33600526-33600843)
chr1 (22-347)||(26224923-26225235)
chr1 (22-347)||(34777507-34777821)
chr1 (22-303)||(37344784-37345064)
chr1 (22-298)||(25277776-25278051)
chr1 (22-347)||(27087724-27088041)
chr1 (22-347)||(15104886-15105200)
chr1 (22-282)||(52643060-52643318)
chr1 (22-192)||(31238005-31238176)
chr1 (22-192)||(50555606-50555775)
chr1 (79-212)||(20944295-20944428)
chr1 (79-216)||(8168759-8168896)
chr1 (212-347)||(6818086-6818218)
chr1 (64-192)||(6818215-6818343)
chr1 (212-347)||(31237876-31238008)
chr1 (230-304)||(50555520-50555594)
chr1 (37-158)||(35009289-35009411)
chr1 (41-164)||(42559444-42559567)
chr1 (60-195)||(43869650-43869792)
chr1 (27-148)||(23172477-23172598)
chr1 (27-142)||(35479087-35479202)
chr1 (315-346)||(50555474-50555505)
chr1 (313-347)||(25277723-25277757)
chr1 (313-347)||(37345078-37345112)
chr1 (78-160)||(47264866-47264948)
chr1 (132-164)||(35009452-35009484)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (22-347)||(44275586-44275908)
chr3 (22-347)||(17515762-17516084)
chr3 (22-347)||(21349146-21349468)
chr3 (22-347)||(2660665-2660988)
chr3 (35-346)||(43765585-43765894)
chr3 (23-347)||(23292539-23292861)
chr3 (22-347)||(46198172-46198494)
chr3 (22-347)||(7884263-7884576)
chr3 (22-347)||(41978189-41978502)
chr3 (22-347)||(44794659-44794973)
chr3 (22-347)||(35905098-35905415)
chr3 (22-347)||(51685052-51685365)
chr3 (22-304)||(2225586-2225856)
chr3 (22-282)||(54898878-54899126)
chr3 (37-303)||(53190278-53190532)
chr3 (22-347)||(48830194-48830508)
chr3 (22-347)||(42279948-42280261)
chr3 (22-285)||(610052-610312)
chr3 (22-192)||(27898613-27898782)
chr3 (122-347)||(30599577-30599791)
chr3 (22-192)||(2377472-2377641)
chr3 (79-216)||(53093464-53093601)
chr3 (22-347)||(46112928-46113241)
chr3 (79-201)||(46309570-46309692)
chr3 (22-197)||(24845352-24845523)
chr3 (79-201)||(38192716-38192838)
chr3 (208-346)||(27898485-27898620)
chr3 (230-346)||(2377653-2377769)
chr3 (60-195)||(5134038-5134180)
chr3 (23-164)||(41624661-41624802)
chr3 (60-195)||(5126783-5126925)
chr3 (27-164)||(22219661-22219798)
chr3 (27-164)||(54093502-54093639)
chr3 (22-148)||(7589868-7589994)
chr3 (87-136)||(28626932-28626981)
chr3 (312-347)||(54899152-54899187)
chr3 (74-144)||(35863049-35863119)
chr3 (312-340)||(24845543-24845571)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (22-347)||(17696658-17696980)
chr2 (22-347)||(39455611-39455933)
chr2 (22-347)||(42518603-42518926)
chr2 (22-346)||(40560675-40560997)
chr2 (22-304)||(2767386-2767664)
chr2 (22-345)||(44709129-44709449)
chr2 (22-347)||(14388472-14388785)
chr2 (22-344)||(6797959-6798276)
chr2 (22-192)||(19907778-19907947)
chr2 (41-192)||(39664281-39664432)
chr2 (22-192)||(37645928-37646098)
chr2 (79-216)||(6784718-6784855)
chr2 (230-346)||(39664152-39664269)
chr2 (230-346)||(19907650-19907766)
chr2 (203-347)||(16763573-16763719)
chr2 (27-164)||(40151295-40151432)
chr2 (23-151)||(14000800-14000928)
chr2 (49-163)||(26584356-26584470)
chr2 (22-74)||(16763517-16763569)
chr2 (113-164)||(4046813-4046864)
chr2 (312-340)||(37646100-37646128)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (22-301)||(7372376-7372652)
chr6 (22-347)||(20523818-20524141)
chr6 (22-347)||(32438450-32438766)
chr6 (22-303)||(32517319-32517599)
chr6 (22-347)||(6899926-6900240)
chr6 (22-347)||(7050199-7050513)
chr6 (22-347)||(10568841-10569156)
chr6 (107-290)||(18643855-18644035)
chr6 (22-192)||(11355664-11355834)
chr6 (234-347)||(11355850-11355963)
chr6 (149-216)||(21091709-21091776)
chr6 (58-148)||(25170896-25170986)
chr6 (312-347)||(7372352-7372387)
chr6 (27-162)||(30640454-30640589)
chr6 (28-148)||(31209695-31209815)
chr6 (312-347)||(21091613-21091648)
chr6 (313-347)||(32517613-32517647)
chr6 (22-54)||(9399100-9399132)
chr6 (78-158)||(29114039-29114119)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (22-347)||(24540561-24540883)
chr5 (22-304)||(2853722-2854001)
chr5 (22-347)||(7268284-7268599)
chr5 (22-347)||(28820826-28821134)
chr5 (92-347)||(8540172-8540425)
chr5 (50-347)||(21841470-21841755)
chr5 (22-304)||(18624413-18624692)
chr5 (22-257)||(17574759-17574981)
chr5 (22-192)||(30467790-30467961)
chr5 (22-192)||(12737561-12737730)
chr5 (22-192)||(12800384-12800553)
chr5 (22-192)||(2180231-2180400)
chr5 (170-347)||(32135204-32135378)
chr5 (79-216)||(42472909-42473046)
chr5 (230-346)||(12800565-12800681)
chr5 (230-346)||(12737742-12737858)
chr5 (230-346)||(2180412-2180528)
chr5 (249-347)||(30465007-30465105)
chr5 (47-195)||(19997580-19997729)
chr5 (58-163)||(15457980-15458085)
chr5 (178-257)||(17576937-17577012)
chr5 (183-257)||(17575631-17575701)
chr5 (47-148)||(9221238-9221339)
chr5 (27-164)||(27076234-27076371)
chr5 (32-77)||(34328064-34328109)
chr5 (312-347)||(2853638-2853673)
chr5 (22-70)||(8540127-8540174)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (31-347)||(3745-4058)
scaffold0058 (31-347)||(4917-5230)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (22-347)||(8702-9023)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (22-347)||(107955-108269)
[»] scaffold0345 (2 HSPs)
scaffold0345 (22-192)||(17-187)
scaffold0345 (234-347)||(203-316)
[»] scaffold1454 (1 HSPs)
scaffold1454 (22-97)||(1706-1781)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 49523566 - 49523886
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49523566 ataaacaaacatcaatgaggggtcctactccacaaaatccaactgctcttggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 49523665  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  49523666 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 49523765  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||    
T  49523766 tgt-----agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttatttttttggctatgtaa 49523860  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  49523861 tgacttatgaacatcaaatatatgac 49523886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 42981052 - 42981374
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42981052 ataaacaaacaccgttgaggggttctgctccacaaaatccaactgcttctggagttattagagttccaaatccaaattacaggacatccgcttctactca 42981151  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  42981152 accccaaaacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttggact 42981251  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       | ||||||||    
T  42981252 tgttt---agtttatgcttttttggacatgtaattacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttgactatgtaa 42981348  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  42981349 tgacttatgaacatcaaatatatgac 42981374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41761418 - 41761097
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41761418 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccac-aaatccaactgctcctgaagttattagagttccaaatccaaattacggaccatccgcttctactca 41761320  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41761319 accccaatacatggagtttatcccaactcctggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 41761220  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||       |  |||||||    
T  41761219 tgttt---tgtttatgcttttttgcatatgtaatcacttgagaacatcaaatgatttgatgacttgatagctatgtaatgttatttttttgattatgtaa 41761123  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41761122 tgacttatgaacatcaaatatatgac 41761097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 43519870 - 43520192
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43519870 ataaacaaacaccacttaggggtcttgctccactagatccaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 43519969  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  43519970 accccaatacatggagtttatcccaactccagaatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactaatttaattaatgctttttggact 43520069  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||    
T  43520070 tgttt---agtttacgcttttttagatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttatttttttggctatgtaa 43520166  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  43520167 tgactcatgagcatcaaatatatgac 43520192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 41781954 - 41782276
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41781954 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccacttctactca 41782053  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||    
T  41782054 accctaatacatggagtttatcctaactccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgcttttggacaagtttaattattgctttttagact 41782153  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||       ||||||||||    
T  41782154 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaataacttaagaacatcaaataatttgatgacttgatggctacgtaatgttatttttttggctatgtaa 41782250  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41782251 tgacttatgaacatcaaatatatgac 41782276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35403352 - 35403038
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35403352 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccagatccaaattacgggccatccgcttctaatca 35403253  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35403252 accgcaatacatggagt--------actccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 35403161  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    ||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  35403160 tgtttaa---tttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 35403064  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35403063 tgacttatgaacatcaaatatatgac 35403038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52867851 - 52867527
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52867851 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggaattattagagtttcaaatccaagttacgggccatccgcttctactca 52867752  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  52867751 accccaatacttggagtctatcccaacttcaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgattttggactagtttgattaatgctttttggact 52867652  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta--nnnnnnnggctatgt 319  Q
    |||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||||||    
T  52867651 tgttt---agtttatacttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgcaatgttatttttttttggctatgt 52867555  T
Q  320 aatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52867554 aatgacttatgaacatcaaatatatgac 52867527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11255624 - 11255300
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11255624 ataaacaaacaccactcaggggtcctgctccacaaaatccaactgttcatggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatcagcttctactca 11255525  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  11255524 accccaatacatggagtttatcccaactccagaatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttggact 11255425  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta--nnnnnnnggctatgt 319  Q
    |||||   ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||         | ||||||    
T  11255424 tgttt---agtttatactttttttgatatgtaatcacttaagaacatcaaataatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttttgcctatgt 11255328  T
Q  320 aatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11255327 aatgacttatgaacatcaaatatatgac 11255300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 51012367 - 51012681
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||    
T  51012367 ataaacaaacatcactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagctattagagttccaaatcgaaa---------atccgcttctactca 51012457  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  51012458 acgccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 51012557  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta-nnnnnnnggctatgta 320  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||        |||||||||    
T  51012558 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatcttttgatgatttgatggctatgtaatgttattttttttggctatgta 51012654  T
Q  321 atgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  51012655 gtgacttatgaacatcaaatatatgac 51012681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48646429 - 48646115
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||| |||||| || ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  48646429 ataatcaaacatcattgaagggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaattgtgggccatctgcttctactca 48646330  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  48646329 accccaatacatggagtttatcccaattccgggatttccaaagcagtgatgcctgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggact 48646230  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   | |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  48646229 tgttt---aatttatgcttttttggatatgtagtgacttaagaacatcaa--------atgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 48646141  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  48646140 tgacttatgaacatcaaatatatgac 48646115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 54386581 - 54386895
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  54386581 ataaacaagcaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaattgctcctggagttattagagtttcaaatccaaattgcgagtcatccgcttctactca 54386680  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  54386681 accccaatacatggagtttatcccaattccaggatttccaaagtagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggact 54386780  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||        ||||||||||| ||||||| |||||       ||||||||||    
T  54386781 tgttt---aatttatgtttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaa--------atgacttgatggctatgtagtgttatttttttggctatgtaa 54386869  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  54386870 tgacttatgaacatcaaatgtatgac 54386895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Original strand, 11602110 - 11602424
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| ||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||    
T  11602110 ataaacaaacaccagtgaagggtccgactccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatctccttctaatca 11602209  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  11602210 accccaatacatggagtttatcccaatcccaggatttccaaagcagtgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgatttttgcact 11602309  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||        ||||| | ||    
T  11602310 tgttt---actttatgc-tttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgacttgataacttgatggatatgtaatgttctttttttggctaagaaa 11602405  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaat 340  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11602406 tgacttatgaacatcaaat 11602424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Original strand, 43507791 - 43507929
Alignment:
Q  83 agttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||    
T  43507791 agttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaatagtgatgcatgttttaa 43507890  T
Q  183 ttatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  43507891 ttatgcttttggactagtttaattaatgtttttttgact 43507929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 320227 - 320105
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  320227 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaagatttccaaaacagtgatgcatgtt 320128  T
Q  179 taaattatgcttttggactagtt 201  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  320127 ttaattatgtttttggactagtt 320105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4173067 - 4172945
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  4173067 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaagatttccaaaacagtgatgcatgtt 4172968  T
Q  179 taaattatgcttttggactagtt 201  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  4172967 ttaattatgtttttggactagtt 4172945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 33265144 - 33265266
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  33265144 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaagatttccaaaacagtgatgcatgtt 33265243  T
Q  179 taaattatgcttttggactagtt 201  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  33265244 ttaattatgtttttggactagtt 33265266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 834610 - 834481
Alignment:
Q  87 ccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattat 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| ||||||    
T  834610 ccaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatggagtttatcccaactccaggatttcgaaaacaatgatgcatgttttaattat 834511  T
Q  187 gcttttggactagttcaattgatgtttttt 216  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  834510 gcttttggactagtttaattaatgtttttt 834481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 216
Target Start/End: Original strand, 5438331 - 5438460
Alignment:
Q  87 ccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattat 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||| ||||||    
T  5438331 ccaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatggagtttatcccaactccaggatttcaaaaacaatgatgtatgttttaattat 5438430  T
Q  187 gcttttggactagttcaattgatgtttttt 216  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5438431 gcttttggactagtttaattaatgtttttt 5438460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2692934 - 2692747
Alignment:
Q  23 taaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2692934 taaacaaacaccactgaggggtcctgctccaaaaaatccaactactcctagagttatttgagttccaaattcaaattacgggccatctgcttctactcaa 2692835  T
Q  123 ccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttgga 219  Q
    |||||         |||||||| ||||  |  |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  2692834 cccca--------ggtttatcctaactgta-tatttccaaagcagtgatgcttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttgga 2692747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Original strand, 27383062 - 27383199
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||      
T  27383062 caaacactagtgaggggtcctgcaccagcacatccaactgctcctgacgttattagagttccatatccaaattatggttcatccggttcaactcaaccta 27383161  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    | | |||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  27383162 agttcatggagtttatcccaacccccggattttcaaag 27383199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 164
Target Start/End: Original strand, 44973441 - 44973547
Alignment:
Q  58 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||| ||  ||||||||  | | ||||||||||||||||| ||| || ||    
T  44973441 atccaactgctcctggagttattaaagtaccatatccaaattatggtccatccggtttaactcaacctaagttcatggagtttatcccaaatcccggctt 44973540  T
Q  158 tccaaag 164  Q
    |||||||    
T  44973541 tccaaag 44973547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 195
Target Start/End: Original strand, 50132443 - 50132587
Alignment:
Q  58 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatt 157  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||  | | |||||||||||||| ||| || || ||    
T  50132443 atccaactgctcctgacgttattagagtaccatatccaaattatggtccatccggttcaactcaacctaagttcatggagtttatcctaacccctggctt 50132542  T
Q  158 tccaaagca-------ttaatgcatgtttaaattatgcttttgga 195  Q
    ||||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||    
T  50132543 tccaaagaagtgatacttgatgcatgtttaaattatgcttttgga 50132587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9591014 - 9590877
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    |||||| || ||||||||||||  |||  | |||||||||||||||  | ||||| ||| ||| |||||| ||| || ||||||| ||| |||||| |      
T  9591014 caaacatcaatgaggggtcttgtaccagcacatccaactgctcctgacgctattaaagtaccatatccaagttatggtccatccggttcgactcaatcta 9590915  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  9590914 aattcatggagtttatcccaacccccagatttccaaag 9590877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 164
Target Start/End: Original strand, 4613973 - 4614079
Alignment:
Q  58 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatt 157  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||   ||| |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| || ||||||||||  |||||||    
T  4613973 atccaattgctcctagacttattagagtaccatatcctggttatgggccatccggttcaactcaacctaaattcatgaagcttatcccaacctcaggatt 4614072  T
Q  158 tccaaag 164  Q
    |||||||    
T  4614073 tccaaag 4614079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2692754 - 2692712
Alignment:
Q  240 tttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatg 282  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2692754 tttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgacttgatg 2692712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 160
Target Start/End: Original strand, 10767218 - 10767300
Alignment:
Q  78 attagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttcc 160  Q
    ||||| |||||| ||||||  || || ||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10767218 attagggttccatatccaacctatggtccacccggttcgactcaacctcaattcatggagtttataccaactcccggatttcc 10767300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44557732 - 44557596
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| | | |  |||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||  || || ||| ||| ||| | |||||| |    
T  44557732 caaacaccaatgaggggtcatgcactaggtcatccaactcctcctggcataattagagttccatatccaacctatggtccacccggttcgaatcaacctc 44557633  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    ||| ||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  44557632 aattcatggagtttat-acaacccccggatttccaaag 44557596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 143
Target Start/End: Original strand, 7150015 - 7150111
Alignment:
Q  47 tgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatc 143  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| |  || |||||| ||| ||| ||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7150015 tgctccaccacatccaactgctactgaagtcattagaatgtcatatccaagttatgggtcattcagttctactcaaccctaattcatggagtttatc 7150111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 42942226 - 42942548
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942226 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaattcaaattacgggccatccgcttctactca 42942325  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  42942326 atctcaatacatggagtttatccctactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggact 42942425  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  42942426 tgttt---agtttatacttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttctggctatgtaa 42942522  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  42942523 tgacttatgaacatcaaatatatgac 42942548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 5036891 - 5037213
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5036891 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgttcctggaattattagagttccaaatccaaattacgagtcatccgcttctactca 5036990  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  5036991 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgtttttttgact 5037090  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||     
T  5037091 tgttt---agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtag 5037187  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  5037188 tgacttataaacatcaaatatatgac 5037213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33708502 - 33708180
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33708502 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccactagatccaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacggatcatccgcttctactca 33708403  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  33708402 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatttttttggactaatttaattaatgctttttggact 33708303  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       | ||||||||    
T  33708302 tgttt---agtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttgcctatgtaa 33708206  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33708205 tgacttatgaacatcaaatatatgac 33708180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41042276 - 41041954
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  41042276 ataaacaaacaccactgaggggtcatgctccacaaaatccaactgcttccggagttattagagttccaaatccaaattataggtcatccgcttctactca 41042177  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||| ||||    
T  41042176 acctcaatacatggagtttatcccaactccaggattttcaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttgaactagtttaattaatgccttttagact 41042077  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |       ||||||||||    
T  41042076 tgttt---agtttatgctttttaggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtaatttttttggctatgtaa 41041980  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  41041979 tgacttatgaacatcagatatatgac 41041954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 301
Target Start/End: Original strand, 22272713 - 22272989
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22272713 ataaacaaacaccaccgaggggtcctgctccacaaaatccaattgctcctagagttattagagttccaaatccaaattatgggtcatccgcttctactca 22272812  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22272813 accccaatacatggagtttatccctactccaggatttccaaagcattgatgcatttttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttggact 22272912  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatg 301  Q
    |||||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22272913 tgttt---aatttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatg 22272989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 38547667 - 38547981
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  38547667 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcttggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactca 38547757  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38547758 acgccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 38547857  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta-nnnnnnnggctatgta 320  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||    
T  38547858 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttttgctatgta 38547954  T
Q  321 atgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  38547955 gtgacttatgaacatcaaatatatgac 38547981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8609490 - 8609177
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||         |||||||||||||||    
T  8609490 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaattgctccgggagttattagagtttcaaatccaaa---------atccgcttctactca 8609400  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8609399 acgccaatacatggagtttatcccaactctaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 8609300  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||     
T  8609299 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttattttttgggctatgtag 8609203  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  8609202 tgacttatgaacatcaaatagatgac 8609177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40339372 - 40339051
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40339372 ataaacaaacaccactgagggatcttgctccacaaaatccaactggtcctggagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttcaactca 40339273  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||   ||||| ||     
T  40339272 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttgaactagtttaattaatacgttttgaacc 40339173  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||       ||||||||||    
T  40339172 tgtttat---tttatgcttttttggatatgtgatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggttatataatgttatttttttggctatgtaa 40339076  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatga 346  Q
    | | |||||||||||||||||||||    
T  40339075 ttaattatgaacatcaaatatatga 40339051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 13282837 - 13283150
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||         || ||||||||||||    
T  13282837 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcgtggagttattagagttctaaatccaaa---------attcgcttctactca 13282927  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13282928 atgccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcgtttggactagtttaattgatgttttttggact 13283027  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||       |||||||||     
T  13283028 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaattttatttttttggctatgtag 13283124  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13283125 tgacttatgaacatcaaatatatgac 13283150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 27691606 - 27691920
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27691606 ataaacaaacactactgaggggtcatgctccacaagatccaactgctcttggggttattagaatttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 27691705  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  27691706 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggact 27691805  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    | |||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||       ||||||||||    
T  27691806 tattt---agtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat--------ttgatgactatgtaatgttatttttttggctatgtaa 27691894  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27691895 tgacttatgaacatcaaatatatgac 27691920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13485793 - 13485479
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13485793 ataaacaaacaccactgagggatcctgctccacaaaatccaactgcttctggagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactta 13485694  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  13485693 accccaatacatggagcttataccaactccaggatttccaaagcattgatgcat-------ttatgtttttagactagtttaattaatgctttttgtact 13485601  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  13485600 tgttt---agtttatgcttttctggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatcacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 13485504  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatga 346  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  13485503 tcacttatgaacatcaaatatatga 13485479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 64 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13108015 - 13107743
Alignment:
Q  64 ctgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13108015 ctgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaa 13107925  T
Q  164 gcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaag 263  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13107924 gcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt---agtttatgctcttttggatatgtaatcacttaag 13107828  T
Q  264 aacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta-nnnnnnnggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13107827 aacatcaaatgatttaatgacttgatgactatgtaatgttattttttttggctatgtagtgacttttgaacatcaaatatatgac 13107743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9672861 - 9672550
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9672861 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaattgctcctagagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctacaca 9672762  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || ||| ||||||||||    
T  9672761 acctcaatacatggagtttattccaacttcaggatttccaaagtagtgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttcgttaatgctttttggact 9672662  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   | |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||        ||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  9672661 tgttt---aatttatgtttttttggatatgtaatgactcaagaacattaa--------atgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 9672573  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatat 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  9672572 tgatttatgaacatcaaatatat 9672550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26240099 - 26239853
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26240099 ataaacaaacaccactaagggttcctgcttcacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattgtgggccatccgcttctactca 26240000  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||    || |||  |||||||||    
T  26239999 accccaatacatggagtttatccaaattccaggatttccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagt----ttaatgccttttggact 26239904  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 275  Q
    |||||   | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26239903 tgttt---aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatga 26239853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7744815 - 7744501
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  7744815 ataaacaaacaccacttagggatcctgcttcacaaaatccaactgcttcttgagttattagagttccaaatccaaattgcgggccatccgcttctactcc 7744716  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  7744715 accctaatacatggagtttatcccaattccaggattttcaaagcagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggact 7744616  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   | |||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||        || |||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  7744615 tgttt---aatttatgtttttttagatatgcaatgacttaagaacatcaa--------ataacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 7744527  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    || |||||||||||||||| ||||||    
T  7744526 tggcttatgaacatcaaatgtatgac 7744501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41825342 - 41825113
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41825342 ataaacaaacttcactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattgcggggcatccgcttctactca 41825243  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||                   ||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41825242 accccaata-------------------ccaggatttccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgttttttgactagtttaattaatgttttttggact 41825162  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaat 273  Q
    |||||   | |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  41825161 tgttt---aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaaaaacatcaaat 41825113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 601190 - 601053
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  601190 ttagagttccaaatccaaattacgggacatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaaaagtgatgcatgtt 601091  T
Q  179 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  601090 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgcttttt 601053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 29237754 - 29237876
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || | |||||||||    
T  29237754 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactctaggatttctaaaacagtgatgcatgtt 29237853  T
Q  179 taaattatgcttttggactagtt 201  Q
    | ||||||||||||| |||||||    
T  29237854 ttaattatgcttttgaactagtt 29237876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 216
Target Start/End: Original strand, 35509975 - 35510112
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  35509975 ttagagttccaaattcaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggattttatcccaactccaggatttccaaaacagtgatgcatgtt 35510074  T
Q  179 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 216  Q
    | ||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  35510075 ttaattatgtttttgaactagtttaattaatgcttttt 35510112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33762045 - 33761923
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| |||    
T  33762045 ttagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaactccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaagagtgatgcacgtt 33761946  T
Q  179 taaattatgcttttggactagtt 201  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  33761945 ttaattatgcttttggactagtt 33761923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 206
Target Start/End: Original strand, 15306825 - 15306952
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |||||||||    
T  15306825 ttagagtttcaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatggagtttatcccaactccagaatttcgaaaacagtgatgcatgtt 15306924  T
Q  179 taaattatgcttttggactagttcaatt 206  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15306925 ttaattatgcttttggactagtttaatt 15306952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 206
Target Start/End: Original strand, 15487194 - 15487321
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |||||||||    
T  15487194 ttagagtttcaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatggagtttatcccaactccagaatttcgaaaacagtgatgcatgtt 15487293  T
Q  179 taaattatgcttttggactagttcaatt 206  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15487294 ttaattatgcttttggactagtttaatt 15487321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Original strand, 11788754 - 11788897
Alignment:
Q  31 caccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaata 130  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  11788754 caccaatgaggggtcctgctccataaaatccaactgctcctggagttattagagtaccatatcaaagttatgggcaatccggttctattcaaccccaatt 11788853  T
Q  131 catggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgca 174  Q
     |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  11788854 gatggcgtttatcacaaccccaggatttccaaagaattgatgca 11788897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17808170 - 17808043
Alignment:
Q  37 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 136  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| | ||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  17808170 tgaggggtcctgctccaccacttccaactgctcttggagttattagaatgccatattcaagttatggaccatccggttctactcaaccctaattcatgga 17808071  T
Q  137 gtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17808070 gtttatcccaaccccaggatttccaaag 17808043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11721043 - 11720922
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    ||||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||  || | ||||| ||||||| ||||      
T  11721043 caaacaccagttatgggtcctgctccacaaaatccaactgctcctgaagttattagagtaccatatccaagttttggacaatccggttctactaaaccta 11720944  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaac 148  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  11720943 aattcatggagtttatcccaac 11720922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Original strand, 10268813 - 10268949
Alignment:
Q  28 aaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccca 127  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||  | ||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |    
T  10268813 aaacaccagtgaggggtcatgcaccagcacatccaactgcttctgccgttattagagtaccatatccaagttatggtccatctggttcgactcaacctaa 10268912  T
Q  128 atacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    || |||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  10268913 attcatggagtttatcccaaccctcggatttccaaag 10268949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15143727 - 15143590
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| |||  | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| || ||||||| ||| | ||||||      
T  15143727 caaacaccattaaggggtcctgcaccatcacatccaactgctcctggcgttattcgagtgccatatccagattatggtccatccggttcaagtcaaccta 15143628  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    | | ||| |||||||||||||| || || |||||||||    
T  15143627 agttcatagagtttatcccaacccccggctttccaaag 15143590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 347
Target Start/End: Original strand, 22272978 - 22273013
Alignment:
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22272978 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 22273013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11032226 - 11032085
Alignment:
Q  23 taaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaa 122  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | | |||  | ||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| | | | ||||||    
T  11032226 taaacaaacaccagttaggggtcctacaccagcacatccaactgcttctgccgttattagagtaccatatccaagttatggaccatctggtccgactcaa 11032127  T
Q  123 ccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    ||  ||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  11032126 cctaaattcatggagtttattccaaccctcggatttccaaag 11032085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Original strand, 32823256 - 32823391
Alignment:
Q  28 aaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccca 127  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||| |  |||||||| |||||||  | |||||||||||| || |||  || || ||| ||| ||| | |||||| ||    
T  32823256 aaacaccaatgaggggtcctgcaccaggtcatccaactcctcctggcataattagagttccatattcaacctatggtccacccggttcgaatcaacctca 32823355  T
Q  128 atacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    || ||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  32823356 attcatggagtttat-acaacccccggatttccaaag 32823391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30940101 - 30939779
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30940101 ataaacaaacaccgctgaggggtcttgctccacaaaatccaactgctcctggagttattacagttccaaatccaaattatgggtcatccgcttctactca 30940002  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||  |||||| |||    
T  30940001 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttcgactagtttaattaatactttttgaact 30939902  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  30939901 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 30939805  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30939804 tgacttatgaacatcaaatatatgac 30939779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23905944 - 23905622
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23905944 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcttggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 23905845  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  23905844 acctcaatacatggagtttatcccaactcaaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgcttttcgactagtttaattaatgctttttggact 23905745  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||       ||||||||||    
T  23905744 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatggtttgatggcttgatgactacgtaatgttatttttttggctatgtaa 23905648  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23905647 tgacttatgaacatcaaatatatgac 23905622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35693042 - 35692720
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35693042 ataaacaaacaccactgaagggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagccctaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 35692943  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35692942 accccaatacatggagtttatctcaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 35692843  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||       | ||||||||    
T  35692842 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcacatgattttatgacttgatgactatttaatgttatttttttgtctatgtaa 35692746  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35692745 tgacttatgaacatcaaatatatgac 35692720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 46439202 - 46438880
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46439202 ataaacaaacaccattaaggggtcctgctccacaaaatccaattgctcttggagttgttagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 46439103  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  46439102 accccaatacatggagtttatcccaactccagaatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgatttttggact 46439003  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||       ||||||||||    
T  46439002 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggttatgtaatgttatttttttggctatgtaa 46438906  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  46438905 tcacttatgaacattaaatatatgac 46438880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27665737 - 27665416
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27665737 ataaacaaacaccactgaggggttctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgagtcatccgcttctactca 27665638  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  27665637 accccaatacattgagtttatcacaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggact 27665538  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       || |||||||    
T  27665537 tgttt---agtttacgcttttttgaatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta-ttttttggttatgtaa 27665442  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27665441 tgacttatgaacatcaaatatatgac 27665416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37115212 - 37114898
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37115212 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactactcctggagttattagagttccaaatccaaattacatgccatccgcttctactca 37115113  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  37115112 accataatacatggagtttatccctactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgcttattggact 37115013  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||       ||||||||||    
T  37115012 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat--------ttgatgactatgtaatgttatttttttggctatgtaa 37114924  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37114923 tgacttatgaacatcaaatatatgac 37114898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38473810 - 38473493
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38473810 ataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaaaatacaactgctcatagagttattagagttctaaatcaaaattacgggtcatccgcttttactca 38473711  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||       
T  38473710 accccaatacatggagtttatcccaactccagaatttccaaaacattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttgg--- 38473614  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
         || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  38473613 -----attagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 38473519  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  38473518 tgacttatgaacatcaaatatatgac 38473493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29996186 - 29995910
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29996186 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaggatccaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 29996087  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  29996086 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatatttttgaactagtttaattaatgctttttggact 29995987  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatg 301  Q
    |||||   |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29995986 tgttt---agtttacgcttttttagatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatg 29995910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48852018 - 48851741
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48852018 ataaacaaacactactgaggggccctgctccacaaagtccaactgcttctggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 48851919  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48851918 accccaatacatggagtttatcccaacctcaggatttccaaagtagtgatgcttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 48851819  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtt 303  Q
    |||||   | |||||| |||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  48851818 tgttt---aatttatg-ttttttagatatataatgacttaagaacatcaaatgacttgatgacttgatggctatgtaatgtt 48851741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 79 - 342
Target Start/End: Original strand, 66570 - 66831
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||    
T  66570 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactctaagatttccaaaacattgatacatgtt 66669  T
Q  179 taaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgattt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66670 taaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttgaacttgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgattt 66766  T
Q  279 gatgacttgatgactatgtaatgtt-annnnnnnggctatgtaatgacttatgaacatcaaatat 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  66767 aatgacttgatgactatgtaatgttgttttttttggctatgtaatgacttattaacatcaaatat 66831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 47385895 - 47385638
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  47385895 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgttcttagagttaccagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctaccca 47385796  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||    
T  47385795 actccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaacaatgatgcttgtttaaattatgcttttggagtagtttaattaatactttttggact 47385696  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatg 282  Q
    |||||   | || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  47385695 tgttt---aattaatgcttttttggatatgtaatgacttgagaacatcgaatgacttgatg 47385638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24228091 - 24227893
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||    
T  24228091 ataaacaaacatcattgaggggttctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagatttccaaatccaaattatgggcaatcctcttccactca 24227992  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccagga-tttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttgga 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24227991 accccaatacatggagtttatcccaactccaggattttccgaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttgga 24227893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 6603985 - 6604149
Alignment:
Q  28 aaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccca 127  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  6603985 aaacatcactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctagagttattagagttccaaatccaaattacgagtcatccgcttctactcaacctca 6604084  T
Q  128 atacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6604085 atacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgctttt 6604149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39858910 - 39858741
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39858910 ataaacaaacatcactgaggg-tcctgctccacaaaattcaactgctcatagagttattagatttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 39858812  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39858811 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 39858741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 129 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37792618 - 37792404
Alignment:
Q  129 tacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||      
T  37792618 tacatggagtttatcccaaccccaggatttccaaagcagtgatgcttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt-- 37792521  T
Q  229 aagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgactta 328  Q
     | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||| |||||    
T  37792520 -actttatgc-tttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgacttgatgacttaatgactatgtaatgttctttttttggctatgtaattactta 37792423  T
Q  329 tgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  37792422 tgaacatcaaatgtatgac 37792404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 13168539 - 13168708
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13168539 ataaacaaacatcactgaggg-tcctgctccacaaaattcaactgcttctagagttattagatttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 13168637  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  13168638 accccaatacatgaagtttatcccaactccaggatttccaaagaatttatgcttgtttaaattatgatttt 13168708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 45359778 - 45359947
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45359778 ataaacaaacatcactgaggg-tcctgctccacaaaattcaactgctcctagagttattagagttccaaatcgaaattacgggccatccgcttatactca 45359876  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  45359877 accccaatacatgaagtgtatcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttatttaaattatgctttt 45359947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35402947 - 35402810
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  35402947 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttctaaaacagtgatgcatgtt 35402848  T
Q  179 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  35402847 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgcttttt 35402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34776448 - 34776332
Alignment:
Q  230 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  34776448 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttatttttttggctatgtaatgacttat 34776349  T
Q  330 gaacatcaaatatatga 346  Q
    |||||||||||||||||    
T  34776348 gaacatcaaatatatga 34776332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Original strand, 13168720 - 13168836
Alignment:
Q  230 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttat 329  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  13168720 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaatgacttat 13168819  T
Q  330 gaacatcaaatatatga 346  Q
    |||||||||||||||||    
T  13168820 gaacatcaaatatatga 13168836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 39858729 - 39858613
Alignment:
Q  230 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttat 329  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||||    
T  39858729 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctaagtaatgacttat 39858630  T
Q  330 gaacatcaaatatatga 346  Q
    |||||||||||||||||    
T  39858629 gaacatcaaatatatga 39858613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 347
Target Start/End: Original strand, 6604146 - 6604279
Alignment:
Q  212 tttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtt-annnnnn 310  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |          
T  6604146 tttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttggtggctatgtaatgttaatttttt 6604242  T
Q  311 nggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604243 ttgctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 6604279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 37795534 - 37795437
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctact 119  Q
    ||||||||||| || ||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37795534 ataaacaaacatcagtgcaaggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctact 37795437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 37795862 - 37795765
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctact 119  Q
    ||||||||||| || ||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37795862 ataaacaaacatcagtgcaaggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctact 37795765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 34776580 - 34776499
Alignment:
Q  49 ctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaata 130  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34776580 ctccacaaaattcaactgctcctagagttattagaattccaaatccaaattacggatcatccgcttctactcaaccccaata 34776499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 269 - 346
Target Start/End: Original strand, 45360013 - 45360090
Alignment:
Q  269 caaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatga 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45360013 caaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttatttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatga 45360090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Original strand, 367142 - 367278
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| ||| || | ||||| |||||||||| ||     
T  367142 caaacaccagtgaggggtct-gctccaccacatccaactgctcctggagttattagaatgacacgtccaagttatggtctatccggttctactcaatcct 367240  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  367241 aattcatggagtttatctcaaccccaagatttccaaag 367278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25972468 - 25972289
Alignment:
Q  23 taaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaa 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||   | ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||  |||| | ||| ||||||    
T  25972468 taaacaaacaccaatgaggggtcccacaccaggacatccaactgctcctggcgttattagagtaccatatccaaattatggttcatctggttcaactcaa 25972369  T
Q  123 ccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagca-------ttaatgcatgtttaaattatgcttttgga 195  Q
    ||  | | |||||||||||||||||| || |  ||||||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25972368 cctaagttcatggagtttatcccaacccccgactttccaaagaagtgatacttgatgcatgtttaaattatgcttttgga 25972289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Original strand, 7402314 - 7402451
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| | | | |||||||||||||||  || |||||| ||| | |||||  | |||||||||||||     
T  7402314 caaacacgagtgaggggtcttgctccaccacatccaatttcacttggagttattagagtatcatatccaagttatgagccatttggttctactcaaccct 7402413  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||| |||| |||||    
T  7402414 aattcatggaatttatcccaaccccagaattttcaaag 7402451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 278
Target Start/End: Original strand, 45359959 - 45360007
Alignment:
Q  230 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgattt 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45359959 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgattt 45360007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 164
Target Start/End: Original strand, 13035143 - 13035260
Alignment:
Q  47 tgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatccca 146  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||| | |  || |||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  13035143 tgctccaccacatccaactgcttctgaagtaattaaaatgtcatatccaagttatgggtcatccggttctaatcaaccataattcatggagtttatccca 13035242  T
Q  147 actccaggatttccaaag 164  Q
    || |||||||||||||||    
T  13035243 accccaggatttccaaag 13035260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24227901 - 24227792
Alignment:
Q  239 ttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatga--cttatgaacatc 336  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||       |||||||||||||   |||||||||||    
T  24227901 ttttttggatatgtaattccttaagaatatcgaatgatttgatgactttatggcaatgtaatgttatttttttggctatgtaatgaattttatgaacatc 24227802  T
Q  337 aaatatatga 346  Q
    ||||||||||    
T  24227801 aaatatatga 24227792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Original strand, 17199915 - 17200040
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | | |||  | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| || |||||   ||| |||||    
T  17199915 ataaacaaacaccaatgaggggtcctacaccaacacatccaactgctcctgc-gttattagagtaccatatccaaattatggtccatctagttcaactca 17200013  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaac 148  Q
    |||  | | ||||||||||||||||||    
T  17200014 acctaagttcatggagtttatcccaac 17200040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 148
Target Start/End: Original strand, 23965407 - 23965528
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| || ||||||  ||| | ||||||      
T  23965407 caaacaccattgaggggtcttgcaccatcacatccaactgctcctggcgttattcgagtgccatatccagattatggtccatccaattcaagtcaaccta 23965506  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaac 148  Q
    | | |||| |||||||||||||    
T  23965507 agttcatgaagtttatcccaac 23965528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 347
Target Start/End: Original strand, 22154619 - 22154654
Alignment:
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22154619 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 22154654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 347
Target Start/End: Original strand, 22210534 - 22210569
Alignment:
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210534 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 22210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29995921 - 29995886
Alignment:
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995921 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 29995886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 6057813 - 6057901
Alignment:
Q  60 ccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 148  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||  | |  |||||||||||||||||    
T  6057813 ccaactcctcctggcgttattagagtaccatatccaaattatggtccacccggttcaactcaacctaagtttatggagtttatcccaac 6057901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 148
Target Start/End: Original strand, 31914422 - 31914512
Alignment:
Q  58 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 148  Q
    |||||||||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| | ||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  31914422 atccaactgctcttggcgttgttcgagtgccatatccaaattatggtccatccggttcaagtcaacctaagttcatggagtttatcccaac 31914512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 34776498 - 34776460
Alignment:
Q  154 gatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34776498 gatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 34776460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47385615 - 47385587
Alignment:
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47385615 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaat 47385587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3013144 - 3012823
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3013144 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacaaaattcaattgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 3013045  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  3013044 accccaatacatggagtttatccctactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttggact 3012945  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||        |||||||||    
T  3012944 tgttt---agtttatgcttttttgaatatgtaatcacttaagaatatcaaatgatttgatgatttgatggctatgtaatgttattttttt-gctatgtaa 3012849  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3012848 tgacttatgaacatcaaatatatgac 3012823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45046174 - 45045851
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45046174 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatctaaattacgggtcatccgcttctactca 45046075  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  45046074 actccaatacacggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgattttggactagtttaattaatgctttttggact 45045975  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta-nnnnnnnggctatgta 320  Q
    |||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||    
T  45045974 tgttt---agtttatgcgtttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaataatttgatgacttgatgactatgtaatgttattttttttggctatgta 45045878  T
Q  321 atgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45045877 atggcttatgaacatcaaatatatgac 45045851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51895857 - 51895535
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  51895857 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgtttctggagttattagagttcaaaatccaaattatgggtcatccgcttctactca 51895758  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  51895757 accataatacatggagtttatccctactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgcttattggact 51895658  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||       ||||||||||    
T  51895657 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatatattgttatttttttggctatgtaa 51895561  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  51895560 tgacttatgaacataaaatatatgac 51895535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4855651 - 4855336
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  4855651 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactca 4855561  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4855560 acgccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttggact 4855461  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnng--gctatgt 319  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |  |||||||    
T  4855460 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttttttttttgttgctatgt 4855364  T
Q  320 aatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4855363 agtgacttatgaacatcaaatatatgac 4855336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 46583273 - 46582961
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  46583273 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgtttctactca 46583174  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccagga-tttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46583173 accccaatacatggagtttatcccaactccaggattttcaaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttggac 46583074  T
Q  221 ttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgta 320  Q
    ||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||       |||||||||    
T  46583073 ttgttt---agtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat--------ttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgta 46582985  T
Q  321 atgacttatgaacatcaaatatat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  46582984 atgacttatgaacatcaaatatat 46582961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 2870031 - 2870353
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2870031 ataaacaaacaccattgaggggttctgcttcacaagatccaactgctcctggagttattagagttcaaaatccaaattacgggtcatccggttctactca 2870130  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |  ||||||||||    
T  2870131 accccaatacatggagtttatcccgactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattactcctttttggact 2870230  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||        ||||||| |    
T  2870231 tgttt---agtttacgcttttttggatatgtaatcacataagaacatcaaatgatttgctgacttgatggctatgtaatgttattttttttgctatgtga 2870327  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2870328 tgacttatgaacatcaaatatatgac 2870353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33600843 - 33600526
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  33600843 ataaacaaacaccaataaggggtcctgctccacaaaatccaactgctccgggagttattagagttccaaatccaaattacaggtcatccacttctactca 33600744  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  33600743 accccaatacatgaagtttattccaactccaggatttccaaaacattgatgcatgtttaaattattctttttgactagtttaattaatgctttttgaact 33600644  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        || |||||||    
T  33600643 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaaacacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttgtttttttggttatgtaa 33600547  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  33600546 tgacttattaacatcaaatat 33600526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26225235 - 26224923
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         |||||||||||||||    
T  26225235 ataaacaaacaccactgatgggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaa---------atccgcttctactca 26225145  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26225144 aagccaatacatggagtttatcc-aactccaagatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 26225046  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||      
T  26225045 tgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtgg 26224949  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26224948 tgacttatgaacatcaaatatatgac 26224923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34777821 - 34777507
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||         |||||||||||||||    
T  34777821 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattaaagttgcaaatccaaa---------atccgcttctactca 34777731  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34777730 acgccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatat-tgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 34777632  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta--nnnnnnnggctatgt 319  Q
    ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||          |||||||    
T  34777631 tgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttattttttttttgctatgt 34777535  T
Q  320 aatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34777534 agtgacttatgaacatcaaatatatgac 34777507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Original strand, 37344784 - 37345064
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgagggg-tcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactc 120  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37344784 ataaacaaacactactgagggggtcctgctccacaaaatccaactgcccctagagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactc 37344883  T
Q  121 aa-ccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttgga 219  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  37344884 aaaccccaatacatggagtttatcccaacttcaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgattttggactagtttaattaaagctttttgga 37344983  T
Q  220 cttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtt 303  Q
    |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37344984 cttgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcatttaagaacatcaaatgatttgatgacttaatgactatgtaatgtt 37345064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25278051 - 25277776
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgagggg-tcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactc 120  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25278051 ataaacaaacactactgagggggtcctgcttcacaaaatccaactgcccctagagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactc 25277952  T
Q  121 aa-ccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttgga 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  25277951 aaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgattttggactagtttaattaaagctttttgga 25277852  T
Q  220 cttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgta 298  Q
    |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25277851 cttgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcatttaagaacatcaaatgatttgatgacttaatgactatgta 25277776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 27087724 - 27088041
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         |||||||||||||||    
T  27087724 ataaacaaacaccactgaagggtactgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaa---------atccgcttctactca 27087814  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  27087815 acgccaatacatgaagtttatcacaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatattttttggact 27087914  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta----nnnnnnnggctat 317  Q
    |||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||    
T  27087915 tgttt---agtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttttttggctat 27088011  T
Q  318 gtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27088012 gtagtgacttatgaacatcaaatatatgac 27088041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 15104886 - 15105200
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  15104886 ataaacaaacaccactgaggggtcatgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttctaaatccaaattacgggacatccacttctacaca 15104985  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||    
T  15104986 actccaatagatggagtttatcccaactccaagatttccaaagcagtgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttcattaatgctttttgggct 15105085  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||        ||||||||||  |||||||| ||||       |||||| |||    
T  15105086 tgttt---aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaa--------atgacttgatagctatgtaacgttatttttttggctatataa 15105174  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15105175 tgacttatgaacatcaaatatatgac 15105200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 52643318 - 52643060
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  52643318 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatctaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattgttggtcatccgcttctactca 52643219  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatg-ttttttggac 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | | |||| || |||||||||| || |||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  52643218 accccaatacatggagtttatctcaattccaagatttccaaagtagtgatgcttgcttaaattatgtttctggactagtttaattaatgtttttttggac 52643119  T
Q  221 ttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatg 282  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  52643118 ttgttt---aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacgtcaaatgacttgatg 52643060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31238176 - 31238005
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31238176 ataaacaaaaatcactgaggggtcttgctccacaaaatccaactgcttctagagttattagacttccaaatctaaattacgggccatccgcttctactca 31238077  T
Q  122 accccaatacatggagtttat-cccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31238076 accccaatacatggagtttatacccaactccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgctttt 31238005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 50555775 - 50555606
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  50555775 ataaacaaatatcactgaggg-tcctgctccacaaaattcaactgctcctagagttattagagtttcaaatccaaattaagggtcatccgtttctactca 50555677  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  50555676 accctaatgcatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 50555606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20944428 - 20944295
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  20944428 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaacagtgatgcatgtt 20944329  T
Q  179 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20944328 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgtt 20944295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8168896 - 8168759
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  8168896 ttagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaactccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaagagtgatgcatgtt 8168797  T
Q  179 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  8168796 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgcttttt 8168759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6818218 - 6818086
Alignment:
Q  212 tttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnn 311  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||           
T  6818218 tttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttggtggctatgtaatgttattttttt 6818122  T
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6818121 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 6818086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6818343 - 6818215
Alignment:
Q  64 ctgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaa 163  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6818343 ctgctcctagagttattagagtttcaaacccaaattacgagtcatctgcttctacttaaccccaatacatggagtttatctcaactccaggatttccaaa 6818244  T
Q  164 gcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
     |||| |||| |||||||||||| |||||    
T  6818243 acattgatgcttgtttaaattatactttt 6818215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31238008 - 31237876
Alignment:
Q  212 tttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnn 311  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||           
T  31238008 tttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcatttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttattttttt 31237912  T
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31237911 ggctatgttttgatttatgaacatcaaatatatgac 31237876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 50555594 - 50555520
Alignment:
Q  230 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta 304  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50555594 agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 50555520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Original strand, 35009289 - 35009411
Alignment:
Q  37 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccc-caatacatgg 135  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| || ||||||||||  ||| |||||    
T  35009289 tgagaggtcatgctccacaaaatccaactgcttttggagttgttagagtaccatatccaaattatgggaaatccggttttactcaacccagaattcatgg 35009388  T
Q  136 agtttatcccaactccaggattt 158  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  35009389 agtttatcccaactccgggattt 35009411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42559567 - 42559444
Alignment:
Q  41 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 140  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||  || || ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  42559567 gggtcctgctccaccacatctaactgctcttggagttattcgagtaacatattcaagttatgggtcatccgattctactcaaccccaattcatgtagttt 42559468  T
Q  141 atcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||    
T  42559467 atcccaaccccatgattttcaaag 42559444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 195
Target Start/End: Original strand, 43869650 - 43869792
Alignment:
Q  60 ccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttc 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |  ||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  43869650 ccaactgctcctggcgttattagagtaccatatccaaattatggtccattctgttcaactcaacctaagttcatggagtttatcccaactctcggctttc 43869749  T
Q  160 caaagca-------ttaatgcatgtttaaattatgcttttgga 195  Q
    ||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43869750 caaagaagtgatacttgatgcatgtttaaattatgcttttgga 43869792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 148
Target Start/End: Original strand, 23172477 - 23172598
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| |||  | ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||| | | ||||||||      
T  23172477 caaaaaccagtgaggggtcctgcaccaacacatccaactgctccaggcgttattagagtaccatatccaaattatgatccatccggtccgactcaaccta 23172576  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaac 148  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  23172577 agttcgtggagtttatcccaac 23172598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 35479202 - 35479087
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||| |  |||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||  || || ||| ||| ||| | |||||| |    
T  35479202 caaacaccaatgaggggtcctgcaccaggtcatccaactcctcctggcataattagagttccatatccaacctatggtccacccggttcaaatcaacctc 35479103  T
Q  127 aatacatggagtttat 142  Q
    ||| ||||||||||||    
T  35479102 aattcatggagtttat 35479087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 50555505 - 50555474
Alignment:
Q  315 tatgtaatgacttatgaacatcaaatatatga 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50555505 tatgtaatgacttatgaacatcaaatatatga 50555474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25277757 - 25277723
Alignment:
Q  313 gctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25277757 gctatgtaatggcttatgaacatcaaatatatgac 25277723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 347
Target Start/End: Original strand, 37345078 - 37345112
Alignment:
Q  313 gctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37345078 gctatgtaatggcttatgaacatcaaatatatgac 37345112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 47264948 - 47264866
Alignment:
Q  78 attagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttcc 160  Q
    ||||| |||||| ||||||  || || ||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  47264948 attagggttccatatccaacctatggtccacccggttcgactcaacctcaattcatggagtttataccaactcccggatttcc 47264866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 164
Target Start/End: Original strand, 35009452 - 35009484
Alignment:
Q  132 atggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35009452 atggagtttatcccaaccccaggatttccaaag 35009484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44275908 - 44275586
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  44275908 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcatggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctactta 44275809  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  44275808 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaatcaatgctttttagact 44275709  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    | |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||       ||||||||||    
T  44275708 tattt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaaggttatttttttggctatgtaa 44275612  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  44275611 tgacttatgaacatcaaatatatgac 44275586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 17515762 - 17516084
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17515762 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaattccgggtcatccgcttctactca 17515861  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  17515862 accccaatacatggagtttatcccaactccaagatttccaaagtattgatgcatgtttaaattatgtttttgaactagtttaattaatgctttttggact 17515961  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  17515962 tgttt---agtttatgcttttctggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 17516058  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||    
T  17516059 tcacttatgtacatcaaatatatgac 17516084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 21349146 - 21349468
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||| || | ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21349146 ataaacaaatactagtgaggggccctgctccacaaaatccaattgctcctggagttagtagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactca 21349245  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  21349246 accccaatacatggagtttatcccaacttcaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttggact 21349345  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  21349346 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtattcacataagaacatcaaatgatttgttgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 21349442  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21349443 tgacttatgaacatcaaatatatgac 21349468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 2660665 - 2660988
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2660665 ataaacaaacaccacttaggggtcctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagaattctaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 2660764  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2660765 accccaatacatggagtttatctcaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatatttttggactagtttaattaatgttttttggact 2660864  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta-nnnnnnnggctatgta 320  Q
    |||||   |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||    
T  2660865 tgttt---agtttacgcttttttggataagtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgtcttgatgactatgtaatgttattttttttggctatgta 2660961  T
Q  321 atgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2660962 atgacttatgaacatcaaatatatgac 2660988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 35 - 346
Target Start/End: Original strand, 43765585 - 43765894
Alignment:
Q  35 actgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatg 134  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  43765585 actgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctgctggagttattagagttcaaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaagcccaatacgtg 43765684  T
Q  135 gagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagttt 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||   |||||    
T  43765685 gagtttatcccaactccagaatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttggacttattt---agttt 43765781  T
Q  235 atgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta-nnnnnnnggctatgtaatgacttatgaac 333  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  43765782 atgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttattttttttggctatgtaatgacttatgaac 43765881  T
Q  334 atcaaatatatga 346  Q
    |||||||||||||    
T  43765882 atcaaatatatga 43765894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 23 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23292861 - 23292539
Alignment:
Q  23 taaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23292861 taaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttcaaaatccaaattacaggtcatccgcttctactcaa 23292762  T
Q  123 ccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggactt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  23292761 ccccaatacatggagtttatccctacttcaggatttacaaagcattgatgcatgttcaaattatgcttttgaactagtttaattaatgctttttggactt 23292662  T
Q  223 gtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaag-aacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||       | ||||||||    
T  23292661 gttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaaacatcaaatgatttgatgacttgatggttttgtaatgttatttttttgactatgtaa 23292565  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23292564 tgacttatgaacatcaaatatatgac 23292539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 46198172 - 46198494
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  46198172 ataaacaaacaccactgaggggtcatactccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccacttctactca 46198271  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttcc-aaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  46198272 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaagcattgatgcatgtttaaattatatttttggactagtttaattaatgctttttggac 46198371  T
Q  221 ttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgta 320  Q
    ||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||       |||||||||    
T  46198372 ttgttt---agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggttatataatgtta-ttttttggctatgta 46198467  T
Q  321 atgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||    
T  46198468 atatcttatgaacatcaaatatatgac 46198494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7884576 - 7884263
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  7884576 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactca 7884486  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7884485 acgccaatacatggagtttatcccaactcgaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 7884386  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||      
T  7884385 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtgg 7884289  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  7884288 tgacttatgaacattaaatatatgac 7884263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 41978189 - 41978502
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         || ||||||||||||    
T  41978189 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------attcgcttctactca 41978279  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41978280 acgccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 41978379  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||         ||||||||     
T  41978380 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgcaatgtttttttttttgctatgtag 41978476  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41978477 tgacttatgaacatcaaatatatgac 41978502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 44794659 - 44794973
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44794659 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagaatttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 44794758  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  44794759 accccaatacatggagtttatcccagctccagaatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggact 44794858  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||       ||||||||||    
T  44794859 tgttt---agtttacgcttttttggatatataatcacttaagaacatcaaatgat--------ttgatgactatgtaatgttatttttttggctatgtaa 44794947  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  44794948 tgacttatgaacatcaaatatatgac 44794973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35905415 - 35905098
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  35905415 ataaacaaacaccactcaggggtcctgcaccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactca 35905325  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35905324 acgccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgattttggactagtttaattaatgttttttggact 35905225  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta----nnnnnnnggctat 317  Q
    |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||    
T  35905224 tgttt---agtttatgattttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttattttatttttttgctat 35905128  T
Q  318 gtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35905127 gtagtgacttatgaacatcaaatatatgac 35905098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 51685052 - 51685365
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51685052 ataaacaaacaccactaaggggtcctgctccacaacatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 51685151  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| || |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  51685152 accccaatacatggagtttatcccaattccaagatttccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgttttttgactagtttaattaatgttttttggact 51685251  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||    
T  51685252 tgttt---aatttatgtttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaa--------atgacttgatggctatgtaatgtt-tttttttggctatgtaa 51685339  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  51685340 tgacttatgaacatcaaatgtatgac 51685365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2225856 - 2225586
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  2225856 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactca 2225766  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2225765 atgcgaatacatggagtttatcccaacttcaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgctttttgactagtttaattaatgttttttggact 2225666  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta 304  Q
    |||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2225665 tgttt---agtttatgattttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgaattgatggctatgtaatgtta 2225586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 54898878 - 54899126
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  54898878 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattaaagttccaaatccaaa---------atccgcttctactca 54898968  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  54898969 acgccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaattttttttggact 54899068  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatg 282  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899069 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatg 54899126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 37 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 53190532 - 53190278
Alignment:
Q  37 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 136  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53190532 tgaggggtcctgctccacaaaatccaactgcttctgaagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaatacatgga 53190442  T
Q  137 gtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttat 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  53190441 gtttatcccaacttcaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgctttttgactagtttaattaatgttttttggacttgttt---agtttat 53190345  T
Q  237 gcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtt 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53190344 gcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtt 53190278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48830508 - 48830194
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  48830508 ataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaaaatccaactgcttctggagttattagagttccaaattcaaattgcggatcatccgcttctactca 48830409  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  48830408 accccaatacatggagtttatcccaattccaagatttccaaagtaatgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttgaact 48830309  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||        |||||||||||  ||||||||||||       ||||||||||    
T  48830308 tgttt---aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaa--------atgacttgatggttatgtaatgttaattttttggctatgtaa 48830220  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  48830219 tggcttatgaacatcaaatatatgac 48830194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 42279948 - 42280261
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||    
T  42279948 ataaacaaacaccaccgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattgcgagccatccacttccactca 42280047  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  42280048 accccaatacatggagtttatcccaattccaggatctccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgcttttttgact 42280147  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   | |||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  42280148 tgttt---aatttatgctttttggaatatgtaatgacttaagaacatcaa--------atgacttgatggctatgtaatgtta-ttttttggctatgtaa 42280235  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42280236 tgacttatgaacatcaaatgtatgac 42280261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 285
Target Start/End: Original strand, 610052 - 610312
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||    
T  610052 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccaaccacctctataca 610151  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| |||||||||     
T  610152 accccaatacatggagtttatcccaactctaagattttcaaagctgtgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttcattaatgctttttggaca 610251  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgact 285  Q
    |||||   | ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  610252 tgttt---actttatgcttttttggatgtgtaatgacttatgaacatcaaatgacttgatgact 610312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27898782 - 27898613
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27898782 ataaacaaacatcactgaggg-tcctgctccacaaaattcaactgctcctagagttattagagttccaaatccaaattaggggtcatccgcttctactca 27898684  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  27898683 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgttttt 27898613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30599791 - 30599577
Alignment:
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  30599791 accccaatacatggagtttatcccaactctagaatttccaaagcattgatgcatgttaaaattatgcttttgaactagtttaattaatgctttttggact 30599692  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  30599691 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaa--------atgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 30599603  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30599602 tgacttatgaacatcaaatatatgac 30599577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 2377472 - 2377641
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2377472 ataaacaaacatcactgaggg-tcctgttccacaaaattcaactgctcctagagttattacagtttcaaatccaaattatgggccatccgcttctactca 2377570  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  2377571 accccaatacatggagtttaacccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatactttt 2377641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 53093601 - 53093464
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  53093601 ttagagttccaaatccaaattacgggtcatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaacagtgatgcatgtt 53093502  T
Q  179 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  53093501 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgcttttt 53093464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 46112928 - 46113241
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||    
T  46112928 ataaacaaacaccactgagtggtcctcttccacaaaatcaaattgctactggaattattagagttccaaatccaaattacgggctatccacttctataca 46113027  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||| |    
T  46113028 accccaatacatggagtttatcccaactctaagatttcgaaagttgtgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttcattaatgccttttggaat 46113127  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta-nnnnnnnggctatgta 320  Q
    |||||   | |||||||  |||| || ||||||| |||| ||||||| ||        |||||||||||| ||||||||||||        |||||||||    
T  46113128 tgttt---aatttatgc--ttttagatatgtaatgacttgagaacattaa--------atgacttgatgattatgtaatgttattttttttggctatgta 46113214  T
Q  321 atgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  46113215 atgacttatgaacatcaaatgtatgac 46113241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 46309570 - 46309692
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  46309570 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaagatttccaaaacagtgatgcatgtt 46309669  T
Q  179 taaattatgcttttggactagtt 201  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  46309670 ttaattatgtttttggactagtt 46309692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 197
Target Start/End: Original strand, 24845352 - 24845523
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    | ||||||| |||| |||||||||||    
T  24845352 ataaacaaacatcagtgagtggtcctgctctacaaaattcaattgctcctggagttattagagttccata----agttacgggtcatctgcttctactca 24845447  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggact 197  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24845448 accccattacacggagtttatcccaactccaggatttccaaagcagtgatgcttgtttaaattatgcttttggact 24845523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 38192838 - 38192716
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  38192838 ttagagtttcaaattcaaattacgggccatctgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaacagtgatgcatgtt 38192739  T
Q  179 taaattatgcttttggactagtt 201  Q
    | | |||||||||||||||||||    
T  38192738 ttagttatgcttttggactagtt 38192716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 208 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27898620 - 27898485
Alignment:
Q  208 atgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannn 307  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  27898620 atgttttttgaacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttattt 27898524  T
Q  308 nnnnggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatga 346  Q
        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27898523 ttttggctatgtaataacttatgaacatcaaatatatga 27898485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Original strand, 2377653 - 2377769
Alignment:
Q  230 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttat 329  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  2377653 agtttatacttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaatgacttat 2377752  T
Q  330 gaacatcaaatatatga 346  Q
    |||||||||||||||||    
T  2377753 gaacatcaaatatatga 2377769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 195
Target Start/End: Original strand, 5134038 - 5134180
Alignment:
Q  60 ccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttc 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||  ||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  5134038 ccaactgctcctggcgttattagagtaccatatccaaattatggtccatccagttcaactcaacctaagttcatggagtttatcccaactctcggctttc 5134137  T
Q  160 caaagca-------ttaatgcatgtttaaattatgcttttgga 195  Q
    ||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5134138 caaagaagtgatacttgatgcatgtttaaattatgcttttgga 5134180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 164
Target Start/End: Original strand, 41624661 - 41624802
Alignment:
Q  23 taaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaa 122  Q
    ||||||||||||| |||| | || ||| |||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||  ||| ||||||    
T  41624661 taaacaaacaccaatgagagatcctgcaccagcacatcctactgctcctggcgttattagagtaccatatccaaattatggtccatccagttcaactcaa 41624760  T
Q  123 ccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    ||  | | ||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  41624761 cctaagttcatggagtttatcccaactgccggctttccaaag 41624802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 195
Target Start/End: Original strand, 5126783 - 5126925
Alignment:
Q  60 ccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttc 159  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  5126783 ccaactgctcttggcgttattagagtatcatatccaaattatggtccatccggttcaactcaacctaagttcatggagtttatcccaactctcggctttc 5126882  T
Q  160 caaagca-------ttaatgcatgtttaaattatgcttttgga 195  Q
    ||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5126883 caaagaagtgatacttgatgcatgtttaaattatgcttttgga 5126925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22219798 - 22219661
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    ||||||||| ||| || || |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| |  || ||  || ||| ||| |||||| |||||||||||||     
T  22219798 caaacaccagtgaaggttcctgctccaccacatccaactgcttatggagttattagaatgtcatattaaagttatgggtcatccggttctactcaaccct 22219699  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    ||| ||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  22219698 aattcatggagtttatctcaaccccgggattttcaaag 22219661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Original strand, 54093502 - 54093639
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    |||||| || ||||||||| ||| |||  | |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||| ||| |||||| |      
T  54093502 caaacatcagtgaggggtcctgcaccaacacatccaactgctcctagcgttattagaattccatatccaaattatggttcatccggttcaactcaatcta 54093601  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    | | |||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  54093602 agttcatggagtttatcccaacccccagatttccaaag 54093639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7589994 - 7589868
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||  | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||   || || ||| |||||    
T  7589994 ataaacaaacaccaatgaggggtcctgcaccagcatatccaactactcctggcgttattagagtaccatatccaagttatggtttattcggttcgactca 7589895  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaac 148  Q
    |||  ||| |||| |||||||||||||    
T  7589894 acctaaattcatgaagtttatcccaac 7589868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 136
Target Start/End: Original strand, 28626932 - 28626981
Alignment:
Q  87 ccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28626932 ccaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatgga 28626981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 347
Target Start/End: Original strand, 54899152 - 54899187
Alignment:
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54899152 ggctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgac 54899187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35863119 - 35863049
Alignment:
Q  74 agttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcc 144  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||| | | |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35863119 agttattagagtaccatattcaagttatgtgtcatccggttctactcaatcccaattcatggagtttatcc 35863049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 340
Target Start/End: Original strand, 24845543 - 24845571
Alignment:
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24845543 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaat 24845571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 17696658 - 17696980
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  17696658 ataaacaaacaccactgagggatcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttgttagagttccaaatccaaattacaggacatctgcttctactca 17696757  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17696758 atcccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttgcactagtttaattaatgttttttggact 17696857  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  17696858 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatcatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 17696954  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  17696955 tcacttatgaacatcaaatatatgac 17696980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 39455611 - 39455933
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  39455611 ataaacatacatcactgaggggtcctacttcacaaaatccaattgctcttggagttattagagttccaaatccaaattaggggtcatccgcttctactct 39455710  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  39455711 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggact 39455810  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  39455811 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 39455907  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39455908 tgacttatgaacatcaagtatatgac 39455933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42518926 - 42518603
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||    
T  42518926 ataaacaaacaacaccgaggggtgctgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgagacatccacttcaactca 42518827  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  42518826 accccaatacatggagtttatcccaactccagaatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttagttaatgttttttggact 42518727  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta-nnnnnnnggctatgta 320  Q
    |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||        |||||||||    
T  42518726 tgttt---agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgattttatgatttgataacaatgtaatgttattttttttggctatgta 42518630  T
Q  321 atgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  42518629 aagacttatgaacatcaaatatatgac 42518603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 346
Target Start/End: Original strand, 40560675 - 40560997
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40560675 ataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctagagttattagagttccaaatctaaattacgggtcatccgcttctactca 40560774  T
Q  122 a-ccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggac 220  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40560775 acccccaatacatggagtttatccatactctagaatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttctggactagtttaattaatgttttttggac 40560874  T
Q  221 ttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgta 320  Q
    ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||       |||||||||    
T  40560875 ttgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacctaagaacatcaaatgatttgatgacttgatagctatgtaatgttatttttttggctatgta 40560971  T
Q  321 atgacttatgaacatcaaatatatga 346  Q
    || ||| |||||||||||||||||||    
T  40560972 attactgatgaacatcaaatatatga 40560997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 304
Target Start/End: Original strand, 2767386 - 2767664
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||  |||||||||||    
T  2767386 ataaacaaacaccactgaggggtcctactccgcaaaatccaactgctcctagagttattagagttccaattc-aaattacgggtcatatgcttctactca 2767484  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2767485 accccaatacatggagtttattccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 2767584  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta 304  Q
    |||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2767585 tgttt---agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta 2767664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44709449 - 44709129
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  44709449 ataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaaactccaactgctcttggagttattagagttctaaatctaaattacgggtcatccgcttttactca 44709350  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  44709349 accccaatacatggagtttatcccaactccatgatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgcttttagactagtttaattaatgctttttggact 44709250  T
Q  222 tgtttataagtttatgc-ttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgta 320  Q
    |||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |        | |||||||    
T  44709249 tgttt---agtttatgctttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgacggctatgtaatgat-tttttttgtctatgta 44709154  T
Q  321 atgacttatgaacatcaaatatatg 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44709153 atgacttatgaacatcaaatatatg 44709129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14388785 - 14388472
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14388785 ataaacaaacacaactgaggggtcg-gctccacaaaatccaactgctcctagagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 14388687  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  14388686 actccaatacatgaagtttatcccaactctaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgcttttggactaatttaattaatgctttttggact 14388587  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||       |||| |||||    
T  14388586 tgttt---agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat--------ttgatggctatgtaatgttatttttttggctttgtaa 14388498  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  14388497 tgacttgtgaacatcaaatatatgac 14388472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 344
Target Start/End: Original strand, 6797959 - 6798276
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  6797959 ataaacaaacaccgctaaggggtcccgctacacaaaatccaactgctcctgaagttattagagttccaaatccaaattttggatcatccgcttctactca 6798058  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  6798059 accccaatacatggagtttatcctaagtccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgttgttagactagtttaattaatgctttttggact 6798158  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||| | ||||||       ||||||||||    
T  6798159 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaattatttgatga-tttatggctatttcatgtta-ttgtttggctatgtaa 6798253  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6798254 tgacttatgaacatcaaatatat 6798276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19907947 - 19907778
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19907947 ataaacaaacatcactgaggg-tcctgctccacaaaattcaactgctcatagagttattagatttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 19907849  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19907848 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 19907778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39664432 - 39664281
Alignment:
Q  41 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 140  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39664432 gggtcctgctccacaaaattcaactgctcctagagttattagagttccaaatccaaattacaggtcatccgcttctactcaacccctatacatggagttt 39664333  T
Q  141 atcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39664332 atcccaactctaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 39664281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 37645928 - 37646098
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||| | |||| |||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||| |    
T  37645928 ataaacaaacactagtgagtggtcatgttctacaaaatccaattgttcctggagttattagagtttcatatccaagttactggtcatccgcttctactta 37646027  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  37646028 accccaatacatgaaatttatcccaactccaggatttccaaagcagtgttgcttgtttaaattatgctttt 37646098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6784855 - 6784718
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || | |||||||||    
T  6784855 ttagagttccaaatccaattttcgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatggagtttatcccaactcaaggatttcgaaaacagtgatgcatgtt 6784756  T
Q  179 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  6784755 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgcttttt 6784718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 39664269 - 39664152
Alignment:
Q  230 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta-nnnnnnnggctatgtaatgactta 328  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  39664269 agtttatgcttttttggatatataatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttattttttttggctatgtaatgactta 39664170  T
Q  329 tgaacatcaaatatatga 346  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39664169 tgaacatcaaatatatga 39664152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19907766 - 19907650
Alignment:
Q  230 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttat 329  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||||    
T  19907766 agtttatgcttttttggatatgtgatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctaagtaatgacttat 19907667  T
Q  330 gaacatcaaatatatga 346  Q
    |||||||||||||||||    
T  19907666 gaacatcaaatatatga 19907650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 203 - 347
Target Start/End: Original strand, 16763573 - 16763719
Alignment:
Q  203 aattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgt 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16763573 aattaatgttttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatggcttgatggctatgtaatgt 16763669  T
Q  303 ta-----nnnnnnnggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16763670 tattttttttttttggctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgac 16763719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40151432 - 40151295
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||   ||| |||||||  | |||||||||||| |    
T  40151432 caaacactaatgaggggtcctgctccagcacatccaactgctcctggacttattagagtatcatatcctggttatgggccatatggttctactcaacctc 40151333  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40151332 aattcatggagtttatcccaacaccaggatttccaaag 40151295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 151
Target Start/End: Original strand, 14000800 - 14000928
Alignment:
Q  23 taaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaa 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |  | | | |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  14000800 taaacaaacaccaatgaggggtcttgcactagcacacctaactgctcatggcgttattagagtaccatatccaaattatggtccatccgattcaactcaa 14000899  T
Q  123 ccccaatacatggagtttatcccaactcc 151  Q
    ||  | | |||||||||||||||||||||    
T  14000900 cctaagttcatggagtttatcccaactcc 14000928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26584470 - 26584356
Alignment:
Q  49 ctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 148  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||    
T  26584470 ctccaccacatccaactgctcctagagttattagaatgacatatccaagttatggatcatccgattctactcaaccctaattcatcgagtatatcccaac 26584371  T
Q  149 tccaggatttccaaa 163  Q
     ||||||||| ||||    
T  26584370 cccaggattttcaaa 26584356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Original strand, 16763517 - 16763569
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctgga 74  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16763517 ataaactaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctgga 16763569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 164
Target Start/End: Original strand, 4046813 - 4046864
Alignment:
Q  113 ttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4046813 ttctactcaaccataattcatggagtttatcccaaccccaggatttccaaag 4046864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 340
Target Start/End: Original strand, 37646100 - 37646128
Alignment:
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37646100 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaat 37646128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7372652 - 7372376
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7372652 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 7372553  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||    
T  7372552 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttatttaatgctttttggact 7372453  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatg 301  Q
    |||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7372452 tgttt---agtttatgcttttttgaatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatg 7372376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 20523818 - 20524141
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20523818 ataaacaaacaccactgaggtgtcctgctccacaaaatccaactgctccatgagttattagacttccaaatccaaattatgggtcatccgcttctactca 20523917  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  20523918 accccaatacatggagtttatcccaactcaaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaactaatgctttttggact 20524017  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta-nnnnnnnggctatgta 320  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||    
T  20524018 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcccttaagaacgtcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttattttttttggctatgta 20524114  T
Q  321 atgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20524115 atgacttatgaacatcaaatatatgac 20524141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32438766 - 32438450
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         |||||||||||||||    
T  32438766 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaa---------atccgcttctactca 32438676  T
Q  122 a-ccccaatacatggagtttatcccaactccaggattt-ccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttgga 219  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32438675 aaccccaatacatggagtttatcccaactccgggattttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttgga 32438576  T
Q  220 cttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta-nnnnnnnggctatg 318  Q
     |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||    
T  32438575 gttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttattttttttggctatg 32438479  T
Q  319 taatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32438478 tagtgacttatgaacatcaaatatatgac 32438450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Original strand, 32517319 - 32517599
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgagggg-tcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactc 120  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32517319 ataaacaaacactactgagggggtcctgcttcacaaaatccaactgcccctagagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactc 32517418  T
Q  121 aa-ccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttgga 219  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  32517419 aaaccccaatacatggagtttatcccaacttcaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgattttggactagtttaattaaagctttttgga 32517518  T
Q  220 cttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtt 303  Q
    |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32517519 cttgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcatttaagaacatcaaatgatttgatgacttaatgactatgtaatgtt 32517599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 6899926 - 6900240
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  6899926 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgcttttggagttattagagttccaaatccaaattgtgggccatctgcttctactca 6900025  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6900026 accccaatacatgaattttatcccaattccaggatttccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttggact 6900125  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||        ||||||||||| ||| |||||||||       ||||||||||    
T  6900126 tgttt---aatttatacttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaa--------atgacttgatggctacgtaatgttatttttttggctatgtaa 6900214  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6900215 tgacttatgaacatcaaatgtatgac 6900240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 7050199 - 7050513
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  7050199 ataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaaaatccaactggtcctcgagttattagagtttcaaacccaaattgcgagtcatccgcttctactca 7050298  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  7050299 accccaatacatgaagtttatcccaattccaggatttccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggact 7050398  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   | |||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  7050399 tgttt---aatttatgtttttttggatatataatgacttaagaacatcaa--------atgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 7050487  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7050488 tgacttatgaacatcaaatatatgac 7050513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 10568841 - 10569156
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| |||| ||||||  ||   ||||||||||||||||    
T  10568841 ataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaaaatccaactgatactagagttattagagttacaaaaccaaatagcgaaacatccgcttctactca 10568940  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  10568941 accccaaaacataaagtttatcccaattccaggatttccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggact 10569040  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta-nnnnnnnggctatgta 320  Q
    |||||   | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||        |||||||||    
T  10569041 tgttt---aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaa--------atgacttgatggctatgtaatgttattttttttggctatgta 10569129  T
Q  321 atgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10569130 atgagttatgaacatcaaatatatgac 10569156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 107 - 290
Target Start/End: Original strand, 18643855 - 18644035
Alignment:
Q  107 atccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaatt 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18643855 atccgcttctactcaacgccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaatt 18643954  T
Q  207 gatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatg 290  Q
     |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18643955 aatgttttttggacttgttt---agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaataatttgatgacttgatg 18644035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 11355664 - 11355834
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11355664 ataaacaaacatcactgagggatcctgctccacaaaaaccaaccgctcctagagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctactca 11355763  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  11355764 accccaatacatggagtttatcccaactctaggatttccaaagcattgatgtttgtttgaattatgctttt 11355834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 11355850 - 11355963
Alignment:
Q  234 tatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttatgaac 333  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||    
T  11355850 tatgcttttttggatttgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgatatttgtttggctatgtaatgacttatgaac 11355949  T
Q  334 atcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||    
T  11355950 atcaaatatatgac 11355963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21091776 - 21091709
Alignment:
Q  149 tccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  21091776 tccaggatttccaaagcattgatgcctgtttaaattatgcttttggacttgtttaatttatgtttttt 21091709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25170986 - 25170896
Alignment:
Q  58 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 148  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||| ||||||||  | | ||| ||||||||||||||    
T  25170986 atccaactgctcctagcgttattagagttccatatcgaaattatggtccatccggttcaactcaacctaagttcattgagtttatcccaac 25170896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7372387 - 7372352
Alignment:
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372387 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 7372352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30640589 - 30640454
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| ||| |  |||||||| |||||||  | ||||||||| || ||||||  || || ||||||| ||| | |||||| |    
T  30640589 caaacacaaatgaggggtcctgcaccaggtcatccaactcctcctggcataattagagtttcatatccaacctatggtccatccggttcgaatcaacctc 30640490  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaactccaggatttccaa 162  Q
    ||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  30640489 aattcatggagtttataccaacccccggatttccaa 30640454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 148
Target Start/End: Original strand, 31209695 - 31209815
Alignment:
Q  28 aaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccca 127  Q
    |||||||| ||||||||| ||| | |  | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| || | || || ||| |||||||   |    
T  31209695 aaacaccagtgaggggtcatgcacaaacacatccaactgctcctggcgttattagagtaccatatccaagttatggtctattcggttcgactcaacataa 31209794  T
Q  128 atacatggagtttatcccaac 148  Q
    || | ||||||||||||||||    
T  31209795 attcgtggagtttatcccaac 31209815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21091648 - 21091613
Alignment:
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21091648 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatttatgac 21091613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 347
Target Start/End: Original strand, 32517613 - 32517647
Alignment:
Q  313 gctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32517613 gctatgtaatggcttatgaacatcaaatatatgac 32517647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 54
Target Start/End: Original strand, 9399100 - 9399132
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccac 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9399100 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccac 9399132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Original strand, 29114039 - 29114119
Alignment:
Q  78 attagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggattt 158  Q
    ||||| |||||| ||||||  || || ||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29114039 attagggttccatatccaacctatggtccacccggttcgactcaacctcaattcatggagtttataccaactcccggattt 29114119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24540883 - 24540561
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24540883 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaagatccaacaactcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 24540784  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  24540783 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatatttttggactagtttaattaatgctttttggact 24540684  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  24540683 tgttt---agtttacgcttttttggatatgtgatcacttaataacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttatggctatgtaa 24540587  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24540586 tgacttatgaacatcaaatatatgac 24540561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2854001 - 2853722
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2854001 ataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 2853902  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2853901 accctaatacatggagtttatcccaactccaggatttctatagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttggact 2853802  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta 304  Q
    |||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2853801 tgttt---agtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatataatgtta 2853722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 7268284 - 7268599
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||         || ||||||||||||    
T  7268284 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattaaagttccaaatacaaa---------attcgcttctactca 7268374  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  7268375 acgccaatacatgaagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatattttttggact 7268474  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatg--ttannnnnnnggctatgt 319  Q
    |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||         |||||||    
T  7268475 tgttt---agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtttttttttttttgctatgt 7268571  T
Q  320 aatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7268572 agtgacttatgaacatcaaatatatgac 7268599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 28820826 - 28821134
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||              |||    
T  28820826 ataaacaaacacgactgaagggtcctgctccacaaaatccaacttctcctggagttattaaagttccaaattcaaattacggg--------------tca 28820911  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28820912 accccaatacatgaagtttatcccaactccaagatttccaaagtattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggact 28821011  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  28821012 tgttt---agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacctcaaatgattttatgacttgatgcctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 28821108  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28821109 tgacttatgaacatcaaatatatgac 28821134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 92 - 347
Target Start/End: Original strand, 8540172 - 8540425
Alignment:
Q  92 tccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttt 191  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8540172 tccaaattacggaccatccgcttctactcaaccccaatacatgtagtttatccctactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttt 8540271  T
Q  192 tggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatga 291  Q
    ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8540272 tggactaatttaattaatgctttttggacttgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgattg 8540368  T
Q  292 ctatgtaatgtta-nnnnnnnggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540369 ctatgtaatgttattttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 8540425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 347
Target Start/End: Original strand, 21841470 - 21841755
Alignment:
Q  50 tccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaact 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21841470 tccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaatacatggagtttatcccaact 21841560  T
Q  150 ccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggaca 249  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |    
T  21841561 ccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttctgggctagtttaattaatgttttttggacttgttt---agtttatgcttttttggata 21841657  T
Q  250 tgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21841658 tgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtttttttttttgctatgttgtgatttatgaacatcaaatatatgac 21841755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18624692 - 18624413
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  18624692 ataaacaaacacaactgaggggtcatgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttctaaatccaaattacgggccatccatttctacaca 18624593  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  18624592 accccaatagatggagtttatcccaactccaagatttccaaagtagtgatacttgtttaaattatgtttttggactagtttcattaatgctttttggact 18624493  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta 304  Q
    |||||   | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  18624492 tgttt---aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgacttgatgacttgatagctatgtaacgtta 18624413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 257
Target Start/End: Original strand, 17574759 - 17574981
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  17574759 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactca 17574849  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  17574850 acgccaatacatggagtttatcccaacttcagaatttccaaaacattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaat-ttttttggact 17574948  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatca 257  Q
    |||||   |||||||||||||| | | |||||||||    
T  17574949 tgttt---agtttatgctttttggtatatgtaatca 17574981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30467961 - 30467790
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30467961 ataaacaaacatcattgaggggtcttgctccacaaaatctaactactcctagagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 30467862  T
Q  122 accccaatacatggagtttat-cccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30467861 accccaatacatggagtttatacccaacttcaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgctttt 30467790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 12737561 - 12737730
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||| |||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12737561 ataagcaaacatcactgaggg-tcctgctccacaaaattcaactgctcctagagttattagatttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 12737659  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12737660 accgcaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 12737730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 12800384 - 12800553
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||| |||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12800384 ataagcaaacatcactgaggg-tcctgctccacaaaattcaactgctcctagagttattagatttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 12800482  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12800483 accgcaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 12800553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 2180231 - 2180400
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| |||| |||| || | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2180231 ataaacaaacatcactaaggg-tcctactccacaaaattcaactgctcctagagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactca 2180329  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2180330 accccaatacatggagtttatcccaactctaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 2180400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32135378 - 32135204
Alignment:
Q  170 atgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatc 269  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32135378 atgcttgtttaaattatccttttagactagtttaattaatgctttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaatatc 32135282  T
Q  270 aaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32135281 aaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtaatttttttggctatgtaatgacttatggacatcaaatatatgac 32135204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42473046 - 42472909
Alignment:
Q  79 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  42473046 ttagagttccaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatggagtttatcccaactccaggatttcgaaaacagtgatgcatgtt 42472947  T
Q  179 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42472946 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgtttttt 42472909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Original strand, 12800565 - 12800681
Alignment:
Q  230 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttat 329  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  12800565 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaatgacttat 12800664  T
Q  330 gaacatcaaatatatga 346  Q
    |||||||||||||||||    
T  12800665 gaacatcaaatatatga 12800681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Original strand, 12737742 - 12737858
Alignment:
Q  230 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttat 329  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  12737742 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgacggctatgtaatgttatttttttggctatgtaatgacttat 12737841  T
Q  330 gaacatcaaatatatga 346  Q
    |||||||||||||||||    
T  12737842 gaacatcaaatatatga 12737858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Original strand, 2180412 - 2180528
Alignment:
Q  230 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttat 329  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||| |||||||||    
T  2180412 agtttatgctttttttgatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttatggctatgttatgacttat 2180511  T
Q  330 gaacatcaaatatatga 346  Q
    |||||||||| ||||||    
T  2180512 gaacatcaaagatatga 2180528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 249 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30465105 - 30465007
Alignment:
Q  249 atgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30465105 atgtaatcacttaagaacatcaaacgatttgatgactttatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 30465007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Original strand, 19997580 - 19997729
Alignment:
Q  47 tgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatccca 146  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||  ||||| | ||||| ||| |||||||||||| |||    
T  19997580 tgctccaccacatccaactgcttctgaagttattagaatgccatatccaagttatgggccatcctattctatttaaccctaattcatggagtttattcca 19997679  T
Q  147 actccagg-atttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttgga 195  Q
    || || || |||| ||||| | | |||| || ||||||||||||||||||    
T  19997680 acccccggaattttcaaagaagtgatgcttgattaaattatgcttttgga 19997729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15458085 - 15457980
Alignment:
Q  58 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatt 157  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| |||  | ||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  15458085 atccaactgctcctgacgttattagagtaccatatccaagttatagtccatccggttcgactcaacctaaattcatggagtttatcccaacctccggatt 15457986  T
Q  158 tccaaa 163  Q
    ||||||    
T  15457985 tccaaa 15457980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 257
Target Start/End: Original strand, 17576937 - 17577012
Alignment:
Q  178 ttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatca 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17576937 ttaatttatgcttttggactagtttaattaat-ttttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatca 17577012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 257
Target Start/End: Original strand, 17575631 - 17575701
Alignment:
Q  183 ttatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatca 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17575631 ttatgcttttggactagtttaattaat-ttttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatca 17575701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9221339 - 9221238
Alignment:
Q  47 tgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatccca 146  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||  | | ||||||||||||| ||    
T  9221339 tgctccaccacatccaactgctcctggagttgttagaatgacatatccaagttatgggccatccagttctactcaaccatagttcatggagtttatcaca 9221240  T
Q  147 ac 148  Q
    ||    
T  9221239 ac 9221238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Original strand, 27076234 - 27076371
Alignment:
Q  27 caaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaacccc 126  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| ||| ||||| | |  || |||||| |||  |||||||   ||||||||| |||     
T  27076234 caaacactagtgaggggtcctgctccaccacatccaactactcctagagctattaaaatgtcatatccaagttataggccatctagttctactcatccct 27076333  T
Q  127 aatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 164  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  27076334 aattcatggagtttatcccaaccccaagattttcaaag 27076371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 77
Target Start/End: Original strand, 34328064 - 34328109
Alignment:
Q  32 accactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagtt 77  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34328064 accactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagtt 34328109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2853673 - 2853638
Alignment:
Q  312 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2853673 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgac 2853638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 70
Target Start/End: Original strand, 8540127 - 8540174
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcc 70  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8540127 ataaacaaacactactgaggg-tcctgctccacaaaatccaactgctcc 8540174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 347
Target Start/End: Original strand, 3745 - 4058
Alignment:
Q  31 caccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaata 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3745 caccactgaggggtcctgctccacaagatctaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaata 3844  T
Q  131 catggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataa 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||   |    
T  3845 catggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatatttttggactaatttaattaatgctttttggacttgttt---a 3941  T
Q  231 gtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttatg 330  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||       |||||||||||||||||||    
T  3942 gtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaattttatttttttggctatgtaatgacttatg 4041  T
Q  331 aacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||||||||||||    
T  4042 aacatcaaatatatgac 4058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 347
Target Start/End: Original strand, 4917 - 5230
Alignment:
Q  31 caccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaata 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4917 caccactgaggggtcctgctccacaagatctaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaata 5016  T
Q  131 catggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataa 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||   |    
T  5017 catggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatatttttggactaatttaattaatgctttttggacttgttt---a 5113  T
Q  231 gtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttatg 330  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||       |||||||||||||||||||    
T  5114 gtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaattttatttttttggctatgtaatgacttatg 5213  T
Q  331 aacatcaaatatatgac 347  Q
    |||||||||||||||||    
T  5214 aacatcaaatatatgac 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 8702 - 9023
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8702 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatacaactgctcatagagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctactca 8801  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  8802 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaacattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgtttttcggact 8901  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||||| ||     
T  8902 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttacgaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttattttttt-gctatatag 8997  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8998 tgacttatgaacatcaaatatatgac 9023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 108269 - 107955
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||    
T  108269 ataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggatttattagagttccaaatccaaatttcgggtcatccacttccacaca 108170  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||    
T  108169 accccaatacatggagtttatcccaactccaagatttccaaagtagtgatgcttgtttaaattatgtttttggattagtttcattaatgctttttggact 108070  T
Q  222 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaa 321  Q
    |||||   | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||        ||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||    
T  108069 tgttt---aatttatgtttttttggatatgtaatgacttaagaatatcaa--------atgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 107981  T
Q  322 tgacttatgaacatcaaatatatgac 347  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||    
T  107980 tgacatatgaacatcaaatgtatgac 107955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 17 - 187
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactca 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17 ataaacaaacatcactgagggatcctgctccacaaaaaccaaccgctcctagagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctactca 116  T
Q  122 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  117 accccaatacatggagtttatcccaactctaggatttccaaagcattgatgtttgtttgaattatgctttt 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 203 - 316
Alignment:
Q  234 tatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttannnnnnnggctatgtaatgacttatgaac 333  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||    
T  203 tatgcttttttggatttgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgatatttgtttggctatgtaatgacttatgaac 302  T
Q  334 atcaaatatatgac 347  Q
    ||||||||||||||    
T  303 atcaaatatatgac 316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1454 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1454
Description:

Target: scaffold1454; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 97
Target Start/End: Original strand, 1706 - 1781
Alignment:
Q  22 ataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  1706 ataaacaaacaccactgaggggtcatgcttcacaaaatccaactgctcctaaagttattagagtttcaaatccaaa 1781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University