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	Query
	Query hiting target	Query hiting target's complemental strand
	Query's complemental strand hiting target	Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13386_low_30 (Length: 347)

Name: NF13386_low_30

Description: NF13386

Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]

Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)

[»] NF13386_low_30

[»] chr3 (4 HSPs)

[»] chr6 (4 HSPs)

[»] scaffold0036 (1 HSPs)

[»] chr5 (4 HSPs)

[»] chr4 (4 HSPs)

[»] scaffold0573 (1 HSPs)

[»] scaffold0096 (1 HSPs)

[»] chr7 (4 HSPs)

[»] scaffold0028 (1 HSPs)

[»] scaffold0500 (1 HSPs)

[»] chr2 (2 HSPs)

[»] chr1 (1 HSPs)

Alignment Details

Target: chr3 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 4)

Name: chr3

Description:

Target: chr3; HSP #1

Raw Score: 227; E-Value: 1e-125

Query Start/End: Original strand, 1 - 254

Target Start/End: Complemental strand, 20969328 - 20969074

Alignment:

Q	1	ttatgaggaatgtcaatcggtttgtaaggagagagaatgtgtaagagctgaatgggagattgatgaagtgttggtagaagattatgagatgtttctaata	100	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20969328	ttatgaggaatgtcaatcggtttgtaaggagagagaatgtgtaaaagctgaatgggagattgatgaagtgttggtagaagattatgagatgtttctaata	20969229	T

Q	101	gtttttctaaaacaacatgcaccagtaaatgga-ggaagagaaaatgtttgttgcacgcttaaactgtaattgctacagtttaaatatataaatttccca	199	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20969228	gtttttctaaaacagcgtgcaccagtaaatggagggaagagaaaatgtttgttgcacgcttaaactgtaattgctacagtttaaatatataaatttcccg	20969129	T

Q	200	aactatccctgatgtatttgttgagataatattaataaacccctattttaagttt	254	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20969128	aactatccctgatgtatttgttgagataatattaataaatccctattttaagttt	20969074	T

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Target: chr3; HSP #2

Raw Score: 52; E-Value: 9e-21

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 19684863 - 19684970

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	19684863	tgttgagacaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgacaata-tatatttagattttattttataaatgaattctgatattattgtattta	19684960	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19684961	acatctttgt	19684970	T

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Target: chr3; HSP #3

Raw Score: 52; E-Value: 9e-21

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 19694474 - 19694581

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	19694474	tgttgagacaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttagattttattttataaatgaattatgatattattgtattta	19694571	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19694572	acatctttgt	19694581	T

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Target: chr3; HSP #4

Raw Score: 49; E-Value: 6e-19

Query Start/End: Original strand, 270 - 330

Target Start/End: Complemental strand, 20968694 - 20968634

Alignment:

Q	270	tatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtatttaacatctttgtgtg	330	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20968694	tatatttagattttattttataaatgaattctgatattattgtatttaacatctttgtgtg	20968634	T

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Target: chr6 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 4)

Name: chr6

Description:

Target: chr6; HSP #1

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 216 - 327

Target Start/End: Original strand, 8987986 - 8988095

Alignment:

Q	216	tttgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtatt	315	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	8987986	tttgttgagataatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttagattttattttataaatgaattatgatattattgtatt	8988083	T

Q	316	taacatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8988084	taacatctttgt	8988095	T

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Target: chr6; HSP #2

Raw Score: 52; E-Value: 9e-21

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 9003270 - 9003377

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	9003270	tgttgagataatattcataaatccttatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttagattttattttataaatgaattatgatattattgtattta	9003367	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9003368	acatctttgt	9003377	T

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Target: chr6; HSP #3

Raw Score: 52; E-Value: 9e-21

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 9012435 - 9012542

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	9012435	tgttgagataatattcataaatccttatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttagattttattttataaatgaattatgatattattgtattta	9012532	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9012533	acatctttgt	9012542	T

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Target: chr6; HSP #4

Raw Score: 49; E-Value: 6e-19

Query Start/End: Original strand, 209 - 327

Target Start/End: Complemental strand, 28927348 - 28927232

Alignment:

Q	209	tgatgtatttgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatatta	308	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|
T	28927348	tgatgcatttgttgagataatattcataaatccttatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttatattttattttataaatggattctgataata	28927251	T

Q	309	ctgtatttaacatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28927250	ttgtatttaacatctttgt	28927232	T

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Target: scaffold0036 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)

Name: scaffold0036

Description:

Target: scaffold0036; HSP #1

Raw Score: 56; E-Value: 4e-23

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 104251 - 104359

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	104251	tgttgagataatattcacaaattcctattttaagttttaaagatgaaaaat-tatatttaaattatattttataaatgaattctgatattattgtattta	104349	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	104350	acatctttgt	104359	T

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Target: chr5 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 4)

Name: chr5

Description:

Target: chr5; HSP #1

Raw Score: 50; E-Value: 1e-19

Query Start/End: Original strand, 219 - 330

Target Start/End: Complemental strand, 19667699 - 19667590

Alignment:

Q	219	gttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtatttaa	318	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19667699	gttgagataatattcataaatccctatgttaa-ttttaaagatgaaaaaa-tatatttagattttattttataaatgatttctgatattattgtatttaa	19667602	T

Q	319	catctttgtgtg	330	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19667601	catctttgtgtg	19667590	T

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Target: chr5; HSP #2

Raw Score: 49; E-Value: 6e-19

Query Start/End: Original strand, 217 - 327

Target Start/End: Complemental strand, 729137 - 729029

Alignment:

Q	217	ttgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattt	316	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	729137	ttgttgagaaaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttcaattttattttataaatggattctgatattattgtattt	729040	T

Q	317	aacatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	729039	aacatctttgt	729029	T

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Target: chr5; HSP #3

Raw Score: 48; E-Value: 2e-18

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Complemental strand, 720156 - 720049

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	720156	tgttgagaaaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttcaattttattttataaatggattctgatattattgtattta	720059	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	720058	acatctttgt	720049	T

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Target: chr5; HSP #4

Raw Score: 48; E-Value: 2e-18

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Complemental strand, 6332873 - 6332766

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	6332873	tgttgagaaaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttcaattttattttataaatggattctgatattattgtattta	6332776	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6332775	acatctttgt	6332766	T

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Target: chr4 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 4)

Name: chr4

Description:

Target: chr4; HSP #1

Raw Score: 49; E-Value: 6e-19

Query Start/End: Original strand, 217 - 327

Target Start/End: Original strand, 111495 - 111603

Alignment:

Q	217	ttgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattt	316	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	111495	ttgttgagaaaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttcaattttattttataaatggattctgatattattgtattt	111592	T

Q	317	aacatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	111593	aacatctttgt	111603	T

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Target: chr4; HSP #2

Raw Score: 48; E-Value: 2e-18

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 120592 - 120699

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	120592	tgttgagaaaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttcaattttattttataaatggattctgatattattgtattta	120689	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	120690	acatctttgt	120699	T

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Target: chr4; HSP #3

Raw Score: 45; E-Value: 1e-16

Query Start/End: Original strand, 217 - 327

Target Start/End: Complemental strand, 3474517 - 3474409

Alignment:

Q	217	ttgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattt	316	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	3474517	ttgttgagaaaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttcaattttattttataaatggattctgatactattgtattt	3474420	T

Q	317	aacatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3474419	aacatctttgt	3474409	T

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Target: chr4; HSP #4

Raw Score: 44; E-Value: 5e-16

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 14915894 - 14916001

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	14915894	tgttgagataatattcataaatccttatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttatattttattttataaatggattctgataatattgtattta	14915991	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14915992	acatctttgt	14916001	T

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Target: scaffold0573 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)

Name: scaffold0573

Description:

Target: scaffold0573; HSP #1

Raw Score: 48; E-Value: 2e-18

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 3344 - 3451

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	3344	tgttgagataatattcataaatccttatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttatattttattttataaatggattctgatattattgtattta	3441	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3442	acatctttgt	3451	T

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Target: scaffold0096 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)

Name: scaffold0096

Description:

Target: scaffold0096; HSP #1

Raw Score: 48; E-Value: 2e-18

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 48363 - 48470

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	48363	tgttgagaaaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttcaattttattttataaatggattctgatattattgtattta	48460	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48461	acatctttgt	48470	T

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Target: chr7 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 4)

Name: chr7

Description:

Target: chr7; HSP #1

Raw Score: 48; E-Value: 2e-18

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 606080 - 606187

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	606080	tgttgagaaaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttcaattttattttataaatggattctgatattattgtattta	606177	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	606178	acatctttgt	606187	T

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Target: chr7; HSP #2

Raw Score: 48; E-Value: 2e-18

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 615175 - 615282

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	615175	tgttgagaaaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttcaattttattttataaatggattctgatattattgtattta	615272	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	615273	acatctttgt	615282	T

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Target: chr7; HSP #3

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002

Query Start/End: Original strand, 223 - 330

Target Start/End: Original strand, 13946480 - 13946585

Alignment:

Q	223	agataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtatttaacatc	322	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13946480	agataatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaaa-atatttagattttagtttataaatggattctgatattattgtatttaacatc	13946577	T

Q	323	tttgtgtg	330	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13946578	tttgtgtg	13946585	T

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Target: chr7; HSP #4

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001

Query Start/End: Original strand, 221 - 330

Target Start/End: Original strand, 13908813 - 13908920

Alignment:

Q	221	tgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtatttaaca	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	13908813	tgagataatattcataaatccctatttga-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttagattttagtttataaatggattctgatattattgtatttaata	13908910	T

Q	321	tctttgtgtg	330	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13908911	tctttgtgtg	13908920	T

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Target: scaffold0028 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)

Name: scaffold0028

Description:

Target: scaffold0028; HSP #1

Raw Score: 45; E-Value: 1e-16

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 81167 - 81275

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	81167	tgttgagaaaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaaatatatttcaattttattttataaatggattctgataatattgtattta	81265	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	81266	atatctttgt	81275	T

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Target: scaffold0500 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)

Name: scaffold0500

Description:

Target: scaffold0500; HSP #1

Raw Score: 44; E-Value: 5e-16

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 3307 - 3414

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	3307	tgttgagaaaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttcgattttattttataaatggattatgatattattgtattta	3404	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3405	acatctttgt	3414	T

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Target: chr2 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)

Name: chr2

Description:

Target: chr2; HSP #1

Raw Score: 44; E-Value: 5e-16

Query Start/End: Original strand, 271 - 330

Target Start/End: Original strand, 31715855 - 31715914

Alignment:

Q	271	atatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtatttaacatctttgtgtg	330	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	31715855	atatttaaattttattttataaatgaattataatattattgtatttaacatcgttgtgtg	31715914	T

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Target: chr2; HSP #2

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 24988505 - 24988612

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	24988505	tgttgagaaaatattcataaatccatatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttcaattttattttataaatggattctgatatcattgtattta	24988602	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24988603	acatctttgt	24988612	T

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Target: chr1 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)

Name: chr1

Description:

Target: chr1; HSP #1

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001

Query Start/End: Original strand, 218 - 327

Target Start/End: Original strand, 21758621 - 21758728

Alignment:

Q	218	tgttgagataatattaataaacccctattttaagttttaaagatgnnnnnnntatatttaaattttattttataaatgaattgtgatattactgtattta	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	21758621	tgttgagaaaatattcataaatccctatttta-gttttaaagatgaaaaaa-tatatttcgattttatttcataaatggattatgatattattgtattta	21758718	T

Q	318	acatctttgt	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21758719	acatctttgt	21758728	T

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