View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13386_low_9 (Length: 636)

Name: NF13386_low_9
Description: NF13386
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13386_low_9
NF13386_low_9
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (24-615)||(41041358-41041961)
chr8 (35-615)||(40338446-40339046)
chr8 (42-606)||(29237959-29238536)
chr8 (42-606)||(15307058-15307634)
chr8 (42-606)||(15487427-15488003)
chr8 (42-606)||(27404926-27405501)
chr8 (76-466)||(5037235-5037625)
chr8 (24-416)||(27691913-27692305)
chr8 (24-416)||(33707795-33708187)
chr8 (24-338)||(42942541-42942855)
chr8 (24-338)||(22273006-22273328)
chr8 (35-424)||(13485114-13485474)
chr8 (35-339)||(26239504-26239808)
chr8 (77-449)||(3152483-3152863)
chr8 (26-339)||(7744193-7744506)
chr8 (35-200)||(8609008-8609173)
chr8 (24-200)||(38547974-38548150)
chr8 (35-339)||(41824733-41825037)
chr8 (24-200)||(13107574-13107750)
chr8 (45-284)||(9672292-9672531)
chr8 (24-200)||(13283143-13283314)
chr8 (42-217)||(35510181-35510356)
chr8 (42-217)||(33761643-33761818)
chr8 (42-217)||(600809-600984)
chr8 (432-594)||(9672095-9672270)
chr8 (81-438)||(11720339-11720697)
chr8 (520-606)||(41824644-41824730)
chr8 (517-598)||(7744112-7744193)
chr8 (517-606)||(26239415-26239504)
chr8 (301-420)||(12515887-12516006)
chr8 (517-606)||(11720132-11720221)
chr8 (355-420)||(28432939-28433004)
chr8 (355-423)||(25371236-25371304)
chr8 (381-423)||(10770940-10770982)
chr8 (549-606)||(13107510-13107567)
chr8 (549-606)||(13283321-13283378)
chr8 (549-606)||(38548157-38548214)
chr8 (301-384)||(24285797-24285880)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (24-615)||(11254704-11255307)
chr4 (24-606)||(35402453-35403045)
chr4 (24-598)||(51012674-51013261)
chr4 (24-491)||(41760637-41761104)
chr4 (24-466)||(49523879-49524321)
chr4 (26-598)||(2692076-2692661)
chr4 (24-416)||(43520185-43520577)
chr4 (24-400)||(42981367-42981743)
chr4 (362-615)||(41760373-41760638)
chr4 (24-339)||(48645809-48646122)
chr4 (53-360)||(834096-834402)
chr4 (282-606)||(11641094-11641431)
chr4 (26-339)||(54386890-54387203)
chr4 (53-360)||(5438561-5438863)
chr4 (42-217)||(319846-320021)
chr4 (42-217)||(4172686-4172861)
chr4 (42-217)||(33265350-33265525)
chr4 (43-217)||(41782288-41782462)
chr4 (42-217)||(43507993-43508168)
chr4 (424-615)||(42981742-42981946)
chr4 (35-169)||(11602435-11602569)
chr4 (65-194)||(11640838-11640967)
chr4 (66-155)||(52867414-52867503)
chr4 (517-605)||(48645721-48645809)
chr4 (517-579)||(54387203-54387265)
chr4 (355-420)||(32652936-32653001)
chr4 (355-423)||(4614587-4614655)
chr4 (301-423)||(28101484-28101606)
chr4 (310-423)||(7150446-7150559)
chr4 (520-606)||(833939-834028)
chr4 (471-606)||(5438869-5439020)
chr4 (368-423)||(27385571-27385626)
chr4 (366-420)||(13449570-13449624)
chr4 (86-170)||(7150221-7150305)
chr4 (471-518)||(834043-834090)
chr4 (355-407)||(10544180-10544232)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (24-615)||(38472898-38473500)
chr7 (24-606)||(22154647-22155242)
chr7 (24-606)||(22210562-22211157)
chr7 (35-606)||(45360095-45360678)
chr7 (24-615)||(46438282-46438887)
chr7 (35-615)||(24227194-24227787)
chr7 (35-606)||(34775745-34776327)
chr7 (24-606)||(35692132-35692727)
chr7 (24-453)||(6604272-6604701)
chr7 (24-421)||(23905232-23905629)
chr7 (35-606)||(47384989-47385576)
chr7 (24-416)||(27665031-27665423)
chr7 (24-416)||(29995501-29995893)
chr7 (41-373)||(39858271-39858602)
chr7 (24-338)||(37114591-37114905)
chr7 (37-317)||(13168843-13169122)
chr7 (285-475)||(69132-69322)
chr7 (277-588)||(48310948-48311273)
chr7 (26-230)||(38550441-38550645)
chr7 (26-285)||(37792150-37792409)
chr7 (42-217)||(35402545-35402719)
chr7 (33-275)||(48851450-48851691)
chr7 (433-606)||(48851253-48851439)
chr7 (108-210)||(69032-69134)
chr7 (517-606)||(38550227-38550316)
chr7 (117-230)||(20478921-20479034)
chr7 (523-606)||(6604699-6604782)
chr7 (42-112)||(66845-66915)
chr7 (301-423)||(11683621-11683743)
chr7 (472-606)||(77252-77399)
chr7 (355-420)||(4321800-4321865)
chr7 (265-408)||(7402878-7403021)
chr7 (365-424)||(32840551-32840610)
chr7 (355-420)||(34691873-34691938)
chr7 (64-179)||(48310750-48310867)
chr7 (345-417)||(34784575-34784647)
chr7 (307-406)||(23168652-23168751)
chr7 (346-423)||(40360951-40361028)
chr7 (86-170)||(13035621-13035705)
chr7 (422-466)||(23905125-23905169)
chr7 (355-411)||(13035937-13035993)
chr7 (356-420)||(48302873-48302936)
chr7 (334-373)||(13169123-13169162)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (35-615)||(2767691-2768284)
chr2 (35-615)||(6798283-6798876)
chr2 (24-615)||(17696973-17697577)
chr2 (24-559)||(14387923-14388479)
chr2 (24-465)||(16763712-16764153)
chr2 (42-606)||(6784070-6784648)
chr2 (24-466)||(39455926-39456367)
chr2 (42-606)||(24206313-24206900)
chr2 (190-615)||(34400956-34401394)
chr2 (247-606)||(44708604-44708976)
chr2 (41-373)||(19907308-19907639)
chr2 (307-615)||(42518203-42518522)
chr2 (35-338)||(40561002-40561305)
chr2 (35-188)||(39663994-39664147)
chr2 (35-162)||(44708996-44709123)
chr2 (517-606)||(39663847-39663936)
chr2 (24-110)||(42518524-42518610)
chr2 (301-423)||(4047377-4047499)
chr2 (117-230)||(37021388-37021501)
chr2 (252-423)||(20941686-20941856)
chr2 (524-606)||(19581872-19581954)
chr2 (355-423)||(26581545-26581613)
chr2 (260-339)||(19581960-19582039)
chr2 (310-423)||(161441-161554)
chr2 (80-125)||(37646238-37646283)
chr2 (355-420)||(38149341-38149406)
chr2 (86-170)||(161216-161300)
chr2 (345-416)||(7744707-7744778)
chr2 (471-518)||(39663948-39663995)
chr2 (395-423)||(11022252-11022280)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (24-615)||(30598982-30599584)
chr3 (35-615)||(43765899-43766492)
chr3 (24-615)||(21349461-21350065)
chr3 (24-615)||(46198487-46199090)
chr3 (24-615)||(44274991-44275593)
chr3 (35-604)||(27897899-27898480)
chr3 (24-519)||(17516077-17516570)
chr3 (35-579)||(2377774-2378324)
chr3 (138-606)||(53188482-53188963)
chr3 (24-416)||(2660981-2661373)
chr3 (74-465)||(54899250-54899649)
chr3 (24-416)||(44794966-44795358)
chr3 (35-400)||(2225165-2225538)
chr3 (26-425)||(46113236-46113635)
chr3 (26-449)||(610363-610786)
chr3 (24-338)||(23292232-23292546)
chr3 (300-606)||(35904531-35904850)
chr3 (26-339)||(51685360-51685673)
chr3 (24-339)||(48829886-48830201)
chr3 (53-275)||(35904851-35905073)
chr3 (24-200)||(41978495-41978671)
chr3 (26-290)||(42280256-42280521)
chr3 (24-200)||(7884094-7884270)
chr3 (44-217)||(38192457-38192630)
chr3 (42-215)||(46609724-46609897)
chr3 (42-217)||(53093197-53093372)
chr3 (42-217)||(46309776-46309951)
chr3 (252-422)||(13466154-13466324)
chr3 (24-142)||(53190118-53190239)
chr3 (64-170)||(24845668-24845776)
chr3 (517-606)||(51685673-51685762)
chr3 (517-598)||(42281795-42281876)
chr3 (517-572)||(48829831-48829886)
chr3 (355-423)||(32843436-32843504)
chr3 (356-423)||(23876220-23876287)
chr3 (355-420)||(41945414-41945479)
chr3 (355-423)||(35862440-35862508)
chr3 (442-606)||(13466364-13466547)
chr3 (355-406)||(2976359-2976410)
chr3 (526-606)||(24845879-24845959)
chr3 (86-170)||(35862691-35862775)
chr3 (345-417)||(49495067-49495139)
chr3 (81-170)||(22219218-22219308)
chr3 (549-606)||(41978678-41978735)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (24-615)||(7371757-7372359)
chr6 (24-606)||(32437864-32438457)
chr6 (35-606)||(18644031-18644623)
chr6 (35-599)||(11355967-11356530)
chr6 (24-416)||(20524134-20524526)
chr6 (78-466)||(32517672-32518060)
chr6 (24-339)||(7050506-7050821)
chr6 (294-606)||(9399135-9399460)
chr6 (24-339)||(10569149-10569462)
chr6 (117-466)||(33267813-33268155)
chr6 (433-615)||(20524583-20524778)
chr6 (126-339)||(6901999-6902212)
chr6 (41-132)||(6900250-6900341)
chr6 (517-606)||(7050821-7050910)
chr6 (517-606)||(10569462-10569551)
chr6 (517-599)||(6902212-6902294)
chr6 (127-230)||(32455022-32455125)
chr6 (355-423)||(17935548-17935616)
chr6 (560-606)||(33267730-33267776)
chr6 (86-170)||(24431587-24431671)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (42-606)||(50554885-50555462)
chr1 (24-606)||(27088034-27088628)
chr1 (24-606)||(26224327-26224930)
chr1 (35-606)||(15105204-15105788)
chr1 (42-606)||(33599925-33600511)
chr1 (24-453)||(6817664-6818093)
chr1 (78-466)||(45045438-45045826)
chr1 (78-466)||(37345137-37345525)
chr1 (78-466)||(25277302-25277698)
chr1 (54-416)||(46582573-46582935)
chr1 (24-338)||(3012516-3012830)
chr1 (24-359)||(31237556-31237883)
chr1 (24-338)||(51895228-51895542)
chr1 (24-295)||(2870346-2870617)
chr1 (364-615)||(37087316-37087580)
chr1 (54-339)||(52642698-52642981)
chr1 (24-200)||(34777338-34777514)
chr1 (24-200)||(4855167-4855343)
chr1 (42-217)||(8168515-8168690)
chr1 (517-606)||(52642609-52642698)
chr1 (117-230)||(9120813-9120926)
chr1 (523-598)||(6817591-6817666)
chr1 (117-230)||(1443400-1443513)
chr1 (117-230)||(47012213-47012326)
chr1 (355-423)||(42558848-42558916)
chr1 (355-423)||(3369967-3370035)
chr1 (86-170)||(3370338-3370422)
chr1 (345-417)||(51122987-51123059)
chr1 (549-606)||(34777274-34777331)
chr1 (395-423)||(5784211-5784239)
chr1 (359-423)||(32086009-32086073)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (24-606)||(21841748-21842344)
chr5 (35-606)||(2180533-2181113)
chr5 (42-606)||(42472265-42472841)
chr5 (243-615)||(28821360-28821745)
chr5 (24-416)||(2853253-2853645)
chr5 (41-373)||(12737869-12738200)
chr5 (41-373)||(12800692-12801023)
chr5 (24-359)||(30464679-30465014)
chr5 (12-338)||(32134897-32135223)
chr5 (24-338)||(8540418-8540732)
chr5 (318-606)||(18624097-18624398)
chr5 (322-606)||(17577011-17577309)
chr5 (322-606)||(17575700-17575998)
chr5 (322-606)||(17574980-17575278)
chr5 (24-229)||(28821127-28821332)
chr5 (24-200)||(7268592-7268768)
chr5 (24-167)||(24540425-24540568)
chr5 (462-615)||(34328108-34328274)
chr5 (102-319)||(41494524-41494741)
chr5 (117-230)||(40781430-40781543)
chr5 (117-229)||(29620912-29621024)
chr5 (355-420)||(1344283-1344348)
chr5 (357-423)||(28036377-28036443)
chr5 (355-416)||(18341214-18341275)
chr5 (310-420)||(1343744-1343854)
chr5 (345-417)||(27349967-27350039)
chr5 (549-606)||(7268782-7268839)
chr5 (86-170)||(27076733-27076817)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (24-466)||(9016-9458)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (26-599)||(107376-107960)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (24-599)||(309-891)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (24-230)||(4051-4257)
scaffold0058 (24-230)||(5223-5429)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (164-518)||(1403-1752)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 435; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 41041961 - 41041358
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041961 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 41041862  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  41041861 caatggtatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaattt 41041762  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  41041761 gattgaatttttg-gacagaaatgtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcaaaatacaatagcattttaaaca 41041663  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41041662 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcccttcaaacctcttc 41041563  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa----- 518  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||         
T  41041562 tctccccctatcctttgccttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaataacatagttcttcagcttcatcaacccac 41041463  T
Q  519 --------tttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgaca 610  Q
            ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41041462 acaaaaattttacaattttcaccgtcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgttgaca 41041363  T
Q  611 gtgtt 615  Q
    |||||    
T  41041362 gtgtt 41041358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 40339046 - 40338446
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40339046 tgatggtatgcaaatgtatgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaacaaggatcacagtgatatct 40338947  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||        
T  40338946 gttgtgaaaattcaaggacctatttgattgtattttcactaatttgaggatcgatacgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattt 40338847  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40338846 tttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattaca-ggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaa 40338748  T
Q  335 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctc--------acttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctct 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40338747 caaaatactcctatcaatatcttaatcagcctaagctcacttcctaacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctct 40338648  T
Q  427 ccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc---------- 516  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||              
T  40338647 ccccgtatcctctggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagtctagttcttcagcttcatcaactcacaca 40338548  T
Q  517 ---aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacagtg 613  Q
       || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  40338547 aaaaaattacaatttttaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacgcatcacataatcattgttgacagtg 40338448  T
Q  614 tt 615  Q
    ||    
T  40338447 tt 40338446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 606
Target Start/End: Original strand, 29237959 - 29238536
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||||| |||    
T  29237959 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacaaatgatcaaattgatttctgttatga 29238058  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngaga 241  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||       || |    
T  29238059 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgacggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgaca 29238158  T
Q  242 gaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaata 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29238159 gaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaataactcaaccaaacaaaata 29238258  T
Q  342 ctcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29238259 ctcctatcaataacttaatcaacctaagcttacttcctacacaatcaactttatccaccaaccttgcccttcaaacctcttctctgcccctatcatttgg 29238358  T
Q  442 cttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaattt 528  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||             || |||||||||    
T  29238359 cttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacaattt 29238458  T
Q  529 tcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  29238459 tcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 29238536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 606
Target Start/End: Original strand, 15307058 - 15307634
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || || ||||| | |||| |||||| |||    
T  15307058 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttt-actttgttcagcaaatatatgtacaaatgatcaaattgatttctgttatga 15307156  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngaga 241  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||       || |    
T  15307157 taattcaaggaccaatttgatggtttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgaca 15307256  T
Q  242 gaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaata 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307257 gaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaata 15307356  T
Q  342 ctcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgg 441  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15307357 ctcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttgg 15307456  T
Q  442 cttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaattt 528  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||             || |||||||||    
T  15307457 cttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacgcaaaaaaattacaattt 15307556  T
Q  529 tcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  15307557 tcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 15307634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 606
Target Start/End: Original strand, 15487427 - 15488003
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || || ||||| | |||| |||||| |||    
T  15487427 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttt-actttgttcagcaaatatatgtacaaatgatcaaattgatttctgttatga 15487525  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngaga 241  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||       || |    
T  15487526 taattcaaggaccaatttgatggtttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgaca 15487625  T
Q  242 gaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaata 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15487626 gaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaata 15487725  T
Q  342 ctcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgg 441  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15487726 ctcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttgg 15487825  T
Q  442 cttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaattt 528  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||             || |||||||||    
T  15487826 cttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacgcaaaaaaattacaattt 15487925  T
Q  529 tcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  15487926 tcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 15488003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 42 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 27405501 - 27404926
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||| |||    
T  27405501 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttatttttt-ctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatga 27405403  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngaga 241  Q
     |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||       || |    
T  27405402 taattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatatttttgaca 27405303  T
Q  242 gaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaata 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27405302 gaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaata 27405203  T
Q  342 ctcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27405202 ctcctatcaataacttaatcaacctaagttcacttcctagacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttgg 27405103  T
Q  442 cttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaattt 528  Q
    |||||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||             || ||||| |||    
T  27405102 cttcttgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta-ttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacagttt 27405004  T
Q  529 tcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  27405003 tcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 27404926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 76 - 466
Target Start/End: Original strand, 5037235 - 5037625
Alignment:
Q  76 tgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcacta 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5037235 tgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcacta 5037334  T
Q  176 atttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||       || | ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037335 atttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaatttctttgacataagggtttgattcattcattgacaacctctttt 5037434  T
Q  276 tattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcact 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037435 cattacaacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcact 5037534  T
Q  376 tcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 466  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5037535 tcctacacaatcaactttatcgatcaaccttgccttccaaacctcttctcttcccctatcatttggcttatccatcaaccttgcatttctt 5037625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 416
Target Start/End: Original strand, 27691913 - 27692305
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27691913 tatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 27692012  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27692013 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaattt 27692112  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  27692113 gattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatatcatttttaaca 27692212  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27692213 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 27692305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 24 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 33708187 - 33707795
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33708187 tatatgacttatgatgatatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggaaca 33708088  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  33708087 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaatgaccaattt 33707988  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  33707987 gattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatagacttggcacaatacaatatcattttaaaca 33707888  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 416  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33707887 actcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 33707795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 24 - 338
Target Start/End: Original strand, 42942541 - 42942855
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42942541 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtcttttgataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatca 42942640  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  42942641 caatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcaataatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaattt 42942740  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  42942741 gattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaaca 42942840  T
Q  324 actcaatcaaacaaa 338  Q
    |||||||||||||||    
T  42942841 actcaatcaaacaaa 42942855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 24 - 338
Target Start/End: Original strand, 22273006 - 22273328
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22273006 tatatgacttatgatggtatgcaattgcctgtctctttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatca 22273105  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  22273106 caatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgatgatcgatacgatggatatgcatataattcaaggaccaattt 22273205  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttt--------tattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcat 315  Q
    |||||||       || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22273206 gattgaaattttttgatagaaaggtttgattcatttattgacaacctcttttcattacaacattacaacattacatggacttgacacaatacaatagcat 22273305  T
Q  316 tttaaacaactcaatcaaacaaa 338  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22273306 tttaaacaactcaatcaaacaaa 22273328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 13485474 - 13485114
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13485474 tgatggtatgcaaatgtctgt-tttttataatcaaagtgtttgtcttctactttttactt----cagcaaatgtatgcctcaaggatcacagtgatatct 13485380  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||                    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||           
T  13485379 gttgtgaaaattgaaggacctatttgatg--------------------atcgatatgatggatatgtacataattcaaggaccaatttgatt----ttt 13485304  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13485303 tttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggtacaatacaatagcattttaaacaactcaatcgaa 13485204  T
Q  335 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttct 424  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13485203 taaaatactcatatcaatatcttaatcaacataagttcgcttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaaccttttct 13485114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26239808 - 26239504
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26239808 tgatggtatgcaaatgtctttctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttgagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatat 26239709  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  |||||| |||| |||||||        
T  26239708 gttgtgaaaattcaatgacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaattggattgaaattt 26239609  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
       || ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  26239608 tttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacacagacttgatacaatacaataacattttaaacaactcaatcaca 26239509  T
Q  335 caaaa 339  Q
    |||||    
T  26239508 caaaa 26239504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3152863 - 3152483
Alignment:
Q  77 gtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaa 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||    
T  3152863 gtcttttactttttactttgttcagtagatgtatgcaccaaggatcacattgatttatgttgtgaaaattcaagaactgatttgatggtaatttcactaa 3152764  T
Q  177 tttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctcttttt 276  Q
    |||| ||||  || ||||||||| | ||| |||  ||| || ||||||||||||       || ||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||     
T  3152763 tttggggatgaatgtgatggatagacatacaatagaagaaccaatttgattgaatttttttgacagaagggttgaattcattcattgacaacttcttttc 3152664  T
Q  277 atta--------caacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 368  Q
    ||||        ||||||||||   ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3152663 attataacattacaacattacacacacttgacacaataaaataacattttaaacgacttaatcaaacaaattactcctatcaatattttaatcaacctaa 3152564  T
Q  369 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctcca 449  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  3152563 gctcacttcctatacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaagcctcttctctaacactatcctttggcttctcca 3152483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7744506 - 7744193
Alignment:
Q  26 tatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 125  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  7744506 tatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaagaataaaa 7744407  T
Q  126 gtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttga 225  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  ||| || |||||||    
T  7744406 gtgaaatatgatgtgaaaattcaaggacttatttgatggtgttttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaagaaccaatttga 7744307  T
Q  226 ttgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaac 325  Q
    |||||       || ||||  |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  7744306 ttgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattgacagcctcttttcattacaacattatacagacttggcacaatacaataacattttaaacaac 7744207  T
Q  326 tcaatcaaacaaaa 339  Q
    ||||||| ||||||    
T  7744206 tcaatcacacaaaa 7744193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8609173 - 8609008
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8609173 tgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 8609074  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8609073 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatat 8609008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 38547974 - 38548150
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38547974 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 38548073  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38548074 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcaaaatgatggatat 38548150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 41825037 - 41824733
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  41825037 tgatggtatgcaaatgtctggctttttacaatcacagtgtatatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaagcatcacggtgatatat 41824938  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||  || ||| ||||||||||||        
T  41824937 gttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggatcaatatgatggatagacatacaatagaatgaccaatttgattgaatttt 41824838  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
       || ||||  |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  41824837 tttgacagaagggttaaattcattcattggcaacctcttttcattacaacattacacaggcttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaca 41824738  T
Q  335 caaaa 339  Q
    |||||    
T  41824737 caaaa 41824733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13107750 - 13107574
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13107750 tatatgacttatgatggtaggcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 13107651  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13107650 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgagaatcgaaatgatggatat 13107574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9672531 - 9672292
Alignment:
Q  45 caaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaa 144  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9672531 caaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtctgtcttttactttttagtttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaa 9672432  T
Q  145 ttcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaa 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||  |||||| ||||||||||||       || ||||    
T  9672431 ttcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatacgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaattttttcgacagaa 9672332  T
Q  245 atgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaac 284  Q
      ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9672331 gggttggattcattcattgacaacatcttttcattacaac 9672292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 13283143 - 13283314
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13283143 tatatgacttatgatgatatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttgagcaaatgtatgcaccaaggatca 13283242  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatat 200  Q
    ||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13283243 cagtgata-----tgtgaaaattcaaggacctatttgatcgtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatat 13283314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 35510181 - 35510356
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||    
T  35510181 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggaccacattgatatctgttatga 35510280  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||    
T  35510281 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataatttaaggac 35510356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33761818 - 33761643
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  33761818 atgcaaatgtttgtccttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgtttagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 33761719  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  33761718 taattcaatgaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 33761643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 600984 - 600809
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||    
T  600984 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttctcttttactttttactttattcagcaaatgtatgcacaaaggatcaaattgatttctgttatga 600885  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||    
T  600884 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgacggatatgaatataattcaaggac 600809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 432 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 9672270 - 9672095
Alignment:
Q  432 tatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa------------- 518  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||                 
T  9672270 tatcctgtggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgatcagcaccattgtttttaaaataacttagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaa 9672171  T
Q  519 tttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcac 594  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9672170 tttacaattttcaccatcatcttatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattcacacatcac 9672095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 81 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11720697 - 11720339
Alignment:
Q  81 tttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttt-cactaattt 179  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||  || | ||   ||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |    
T  11720697 tttactttttactttgttcaacacatatatgcaccaaggatcacattgtcatatttttaaaaacttcaaggacttatttgatgatatttttcactaatgt 11720598  T
Q  180 gaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttg-attcattcattgacaacctctttttat 278  Q
      | |||||| ||||  ||| | | | |||| |||||| |||||||| |||       || | ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  11720597 aggaatcgatttgatatatagacaaacaatttaaggaccaatttgatggaaagattttgaca-aaatggttgcattcattcattttcaacctcttttcat 11720499  T
Q  279 tacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcc 378  Q
    ||||| ||||||  || ||  |||||| || |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  11720498 tacaatattacacagaattagcacaatacagtagcatgttaaacaacttaaacaaacaaattactcctattaaatacttaatcaacctaagctcacttcc 11720399  T
Q  379 tacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctt 438  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  11720398 tacacagtcaactttgtccatcaaccttgtccttcaaacctcttcactgccactatcctt 11720339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 520 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 41824730 - 41824644
Alignment:
Q  520 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41824730 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccattcacacatcacataaccattgtt 41824644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 517 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 7744193 - 7744112
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataa 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7744193 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtattattttaacaaatcattcacacatcacataa 7744112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 517 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 26239504 - 26239415
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26239504 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtattactttaacaaaccattcacacatcacataaccattgtt 26239415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 12516006 - 12515887
Alignment:
Q  301 acaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   |||| || | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12516006 acaatacaatagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattatgactattaaaaacttaatcaacctaagctcacttcccatacaatcaactttgtccatc 12515907  T
Q  401 aaccttgccctccaaacctc 420  Q
    ||| || |||||||||||||    
T  12515906 aacatttccctccaaacctc 12515887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 517 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 11720221 - 11720132
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||  |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11720221 aattcacaattttcaccatcatcttgtacaaagaaaattcaaaatcagtagaacttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgtt 11720132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28433004 - 28432939
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 420  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28433004 cttaatcaccctcagctcacttcttatacaatcaactttgcccatcaaccttgccctccaaacctc 28432939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 25371304 - 25371236
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25371304 cttattcaacctaagttcacttcctacacactcaactttgtccatcaatcttgctctccaaacatcttc 25371236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 10770982 - 10770940
Alignment:
Q  381 cacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10770982 cacagtcaactttgtccatcaaccttgccttccaaacctcttc 10770940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 549 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 13107567 - 13107510
Alignment:
Q  549 caaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  13107567 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 13107510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 549 - 606
Target Start/End: Original strand, 13283321 - 13283378
Alignment:
Q  549 caaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  13283321 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 13283378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 549 - 606
Target Start/End: Original strand, 38548157 - 38548214
Alignment:
Q  549 caaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  38548157 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 38548214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 384
Target Start/End: Original strand, 24285797 - 24285880
Alignment:
Q  301 acaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatc-aatatcttaatcaacctaagctcacttcctacaca 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||   ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24285797 acaatacaatagcatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatat-ttaatcaacttaatctcacttcctacaca 24285880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 11255307 - 11254704
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  11255307 tatatgacttatgatggtatgcaaatatctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgctcagcaaatgtatgcactaatgatca 11255208  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||    
T  11255207 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaacgatcaattt 11255108  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  11255107 gattgaaattttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatataatagcattttaaaca 11255008  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11255007 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaattaactttatccaacaaccttgccctccaaacctcttc 11254908  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------- 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||           
T  11254907 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcatagttcttcggcttcatcaaccaca 11254808  T
Q  517 -----aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacag 611  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11254807 caaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataatcattgttgacag 11254708  T
Q  612 tgtt 615  Q
    ||||    
T  11254707 tgtt 11254704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 35403045 - 35402453
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35403045 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtctgtcgtttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 35402946  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  35402945 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagaaccaattt 35402846  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  35402845 gattgaaattttttgacataagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacacggacttggcacagtacaatagcattttaaaca 35402746  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35402745 actcaatcaaaaaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 35402646  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------- 516  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||           
T  35402645 tctgcccctatcctttgccttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacccac 35402546  T
Q  517 ------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
          |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  35402545 acaaaaaatttacaattttcaccatcatcctat---atcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattgacacatcacatgaccattgtt 35402453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 598
Target Start/End: Original strand, 51012674 - 51013261
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51012674 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcg 51012773  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||| ||| |    
T  51012774 cagtaatatctgttgtgaaaatttaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggattgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgt 51012873  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  51012874 gattgaatttttttgatagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaaca 51012973  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51012974 acccagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagcttacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 51013073  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcat-------- 515  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||            
T  51013074 tctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcattaacccac 51013173  T
Q  516 -----caatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataa 598  Q
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  51013174 acaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataa 51013261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 41761104 - 41760637
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41761104 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 41761005  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  41761004 cagtgatatctggtatgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaattt 41760905  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  41760904 gattgaaattttttgccagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttcaaca 41760805  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760804 actcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 41760705  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaa 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41760704 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaa 41760637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 466
Target Start/End: Original strand, 49523879 - 49524321
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49523879 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtgtttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 49523978  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||    
T  49523979 cagttatatttgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaatgaccaattt 49524078  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  49524079 gattgaaatattttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatgaacttggcacaatacaataatattttaaaca 49524178  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49524179 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 49524278  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 466  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49524279 tctgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 49524321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 26 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 2692661 - 2692076
Alignment:
Q  26 tatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 125  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2692661 tatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgaaccaaggatcaca 2692562  T
Q  126 gtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttga 225  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  |||||| |||||||    
T  2692561 atgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttga 2692462  T
Q  226 ttgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaac 325  Q
    | |||       || ||||   ||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  2692461 tggaaattttttgacagaaggattgaattcattcgttgacaacctcttttaattacaacattacagagacttggcacaatacaataacattttaaacaac 2692362  T
Q  326 tcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctc 425  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2692361 ttaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaagctgacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctc 2692262  T
Q  426 tccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc--------- 516  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||             
T  2692261 tgccactatcctttagcttctccatcaaccttgcatttcttccatgacctgcatcattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacccagac 2692162  T
Q  517 ----aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataa 598  Q
        |||| |||||||||||| || ||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2692161 aaaaaattgacaattttcaccgtcgtcctatacaaagaaaattcaaaatcagtacaatttaaacaaaccattcacacatcacataa 2692076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 24 - 416
Target Start/End: Original strand, 43520185 - 43520577
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43520185 tatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 43520284  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43520285 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggatctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaattt 43520384  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  43520385 gattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatatcattttaaaca 43520484  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43520485 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgtcctccaaa 43520577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Original strand, 42981367 - 42981743
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42981367 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 42981466  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42981467 cagtgatacctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttaaggatcgatatgatagatatgtatataattcaaggaccaattt 42981566  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  42981567 gattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcatcgacaacctcttttcattacaacaatacatgaacttggcacaatacaataacattttaaaca 42981666  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42981667 actcaatgaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaatctaagctcatttcctacacaatcaactttatccatc 42981743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 362 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 41760638 - 41760373
Alignment:
Q  362 aacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcat 461  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760638 aacctaagctcacttcctacccaatcaactttatgcatcaaccttgccctccaaacctcttctctcccc-tatcctttggcttctccatcaaccttgcat 41760540  T
Q  462 ttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaattttcaccatcatcctatacaat 548  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760539 ttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagctcagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaat 41760440  T
Q  549 caaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacagtgtt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41760439 caaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgttgacagtgtt 41760373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 48646122 - 48645809
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48646122 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtct--ctttttacaatcaaagtatttgtcttttactttttactttattcagcaaatgtatgcaccaaggatca 48646025  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  |||||| |||||    
T  48646024 cagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaattt 48645925  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||  |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  48645924 gattgaaattttttgacagaagggttaaattcatttattgacaacctcttttcattacaacattacatagacttggcacaatacaataacattttaaaca 48645825  T
Q  324 actcaatcaaacaaaa 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  48645824 actcaatcaaacaaaa 48645809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 53 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 834402 - 834096
Alignment:
Q  53 tgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaagga 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  834402 tgtctttttatattcaaagtgtttgtcttttatttttt-ctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaagga 834304  T
Q  153 cctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttga 252  Q
    || |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||       || ||||| ||||||    
T  834303 ccaatttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaaggtttga 834204  T
Q  253 ttcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaat 352  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  834203 ttcattcattgacaaccttttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaat 834104  T
Q  353 atcttaat 360  Q
    | ||||||    
T  834103 aacttaat 834096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 282 - 606
Target Start/End: Original strand, 11641094 - 11641431
Alignment:
Q  282 aacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctac 381  Q
    |||||||||  |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11641094 aacattacacagacttttcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaacatcttaatcaacctaagttcacttcctac 11641193  T
Q  382 acaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcacca 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  11641194 acaatcaactttatccatcaaccttgccctccaatcctcttctttgctagtatcctttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccatcacca 11641293  T
Q  482 ttgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtact 568  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||             |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||     
T  11641294 ttgtttttaaaataacctagttattcagcttcatcaacccagacaaaaaattgacaattttcaccatcatcctatacaaagaaaattcaaaatcagtaca 11641393  T
Q  569 atttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11641394 atttaaaaaaaccattcacacatcacataaccattgtt 11641431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 339
Target Start/End: Original strand, 54386890 - 54387203
Alignment:
Q  26 tatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 125  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  54386890 tatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaagaattgca 54386989  T
Q  126 gtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttga 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||  |||||| |||||||    
T  54386990 gtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggagagacatacaatcgaaggaccaatttga 54387089  T
Q  226 ttgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaac 325  Q
    |||||       || ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  54387090 ttgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacacagacttggcacaatacaataacattttaaacaac 54387189  T
Q  326 tcaatcaaacaaaa 339  Q
    ||||||| ||||||    
T  54387190 tcaatcacacaaaa 54387203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 360
Target Start/End: Original strand, 5438561 - 5438863
Alignment:
Q  53 tgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaagga 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  5438561 tgtctttttatattcaaagtgtttgtcttttatttttt-ctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaagga 5438659  T
Q  153 cctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttga 252  Q
        ||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||       || ||||| ||||||    
T  5438660 ----tttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaaggtttga 5438755  T
Q  253 ttcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaat 352  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5438756 ttcattcattgacaaccttttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaat 5438855  T
Q  353 atcttaat 360  Q
    | ||||||    
T  5438856 aacttaat 5438863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 320021 - 319846
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  320021 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 319922  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  319921 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 319846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4172861 - 4172686
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  4172861 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 4172762  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  4172761 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 4172686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 33265350 - 33265525
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  33265350 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 33265449  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  33265450 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 33265525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 41782288 - 41782462
Alignment:
Q  43 tgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaa 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41782288 tgcatatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgtttagcaaatgtatgcaccaaggatcacggtgatatctgttgtgaa 41782387  T
Q  143 aattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41782388 aaatcaaggaccaatttgatgatattttcactaatttgaggattgatatgatggatatgcatataattcaaggac 41782462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 43507993 - 43508168
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||    
T  43507993 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatttgttatga 43508092  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  43508093 taattcaaggaccaatttgatggtatcttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 43508168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 424 - 615
Target Start/End: Original strand, 42981742 - 42981946
Alignment:
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa----- 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||         
T  42981742 tctccccctatcctttggcttctccatcaacattggatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttcttcaacttcatcaagccac 42981841  T
Q  519 --------tttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgaca 610  Q
            ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42981842 acaaaaaatttacaatttttaccttcatcctgtacaatcaaaaggcaaaatcagtactatttaaataaatcattcacacatcacataaccattgttgaca 42981941  T
Q  611 gtgtt 615  Q
    |||||    
T  42981942 gtgtt 42981946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 169
Target Start/End: Original strand, 11602435 - 11602569
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11602435 tgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgtttagcagatgtatgcaccaaggatcacagtgatatat 11602534  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattt 169  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| ||||||    
T  11602535 gttgtgaaaattgaacgacttatttgattgtattt 11602569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 11640838 - 11640967
Alignment:
Q  65 atcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgg 164  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  11640838 atcaaagtgtatgttttttactttttactttgttcagcagatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattgaacgacttatttgattg 11640937  T
Q  165 tattttcactaatttgaggatcgatatgat 194  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11640938 tattttcactaatttggagatcgatatgat 11640967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52867503 - 52867414
Alignment:
Q  66 tcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacct 155  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52867503 tcaaagtgtctgtcttctactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacct 52867414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 517 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 48645809 - 48645721
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgt 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  48645809 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaaggcaaaatcagtactattttaacaaatcattcacacatcgcataaccattgt 48645721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 517 - 579
Target Start/End: Original strand, 54387203 - 54387265
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaa 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54387203 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaaa 54387265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 355 - 420
Target Start/End: Original strand, 32652936 - 32653001
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 420  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32652936 cttaatcaccctaagctcacttcctatacaatcaactttttccatcaaccttgccctccaaacctc 32653001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 423
Target Start/End: Original strand, 4614587 - 4614655
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4614587 cttaatcaacttaagctcacttcctacatagtcaactttgtccatcaaccatgccctccaaacctcttc 4614655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28101606 - 28101484
Alignment:
Q  301 acaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | | ||   |||||||   ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||    
T  28101606 acaatacaatagcatgttaaacaactcaaacagatatattatgactatcaaatacttaatcaacctaagttcattttctacacagtcaactttgtccatc 28101507  T
Q  401 aaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  28101506 gaccttgccctccaaacctcttc 28101484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 423
Target Start/End: Original strand, 7150446 - 7150559
Alignment:
Q  310 tagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 409  Q
    |||||| |||||||||||||  || |||| ||   |||||||   |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  7150446 tagcatgttaaacaactcaaaaaaccaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaacctcacttcttacatagtcaactttgtccatcaaccttgcc 7150545  T
Q  410 ctccaaacctcttc 423  Q
    ||| ||||||||||    
T  7150546 ctctaaacctcttc 7150559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 520 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 834028 - 833939
Alignment:
Q  520 ttacaattttcaccatcatcctatacaatca---aaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  834028 ttacagttttcacaatcatcctatacaatcatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 833939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 471 - 606
Target Start/End: Original strand, 5438869 - 5439020
Alignment:
Q  471 gaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaattttcaccatcatcctataca---atcaaaag 554  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||             || ||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  5438869 gaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacagttttcacaatcatcctatacaatcatcaaaag 5438968  T
Q  555 acaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  ||| | |||||| ||||| ||||||    
T  5438969 acaaaatcagtataatttaaacaaaatatttatacatcaaataaccattgtt 5439020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 423
Target Start/End: Original strand, 27385571 - 27385626
Alignment:
Q  368 agctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27385571 agctcagttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgtcttccaaacctcttc 27385626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13449624 - 13449570
Alignment:
Q  366 taagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 420  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13449624 taagctcacttcatatgcaatcaactttgtccatcaactttgccctccaaacctc 13449570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Original strand, 7150221 - 7150305
Alignment:
Q  86 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttt 170  Q
    ||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||| ||| |||||||   | |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7150221 tttttactttgttctacacatatatgcgccaaggatcacattgacatctgtttaaataattaaaggacttatttgatggtatttt 7150305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 471 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 834090 - 834043
Alignment:
Q  471 gaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa 518  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  834090 gaccatcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaa 834043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 355 - 407
Target Start/End: Original strand, 10544180 - 10544232
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 407  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10544180 cttaatgaatctaagctcactatctacacaatcaactttctccatcaatcttg 10544232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 38473500 - 38472898
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38473500 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgt-ttttactttttactttgtttagcaaatgtatgcaccaaggatca 38473402  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  38473401 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatgagtatgtatataattcaaggaccaattt 38473302  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  38473301 gattgaaattttttgacaaaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcaaaatacaatagcattttaaaca 38473202  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38473201 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagttcacttcctacacaatcaactttatccatcaactttgccctccaaacctcttc 38473102  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------- 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||           
T  38473101 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaattgcctagttattcagcttcatcaacccac 38473002  T
Q  517 -----aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacag 611  Q
         || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38473001 acaaaaaattacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtattgtttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgttgacag 38472902  T
Q  612 tgtt 615  Q
    ||||    
T  38472901 tgtt 38472898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 606
Target Start/End: Original strand, 22154647 - 22155242
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  22154647 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagagtctgtcttttactttttactttgtttagcaaatatatgcaccatggatca 22154746  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  22154747 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaattt 22154846  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  22154847 gattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaaca 22154946  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22154947 attcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacgatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctcttc 22155046  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa----- 518  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||         
T  22155047 tctgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacatcattgtttttaaaataacctagttcttcaacttcatcaacccac 22155146  T
Q  519 --------tttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22155147 aaaaaaatattacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaggacaaattcagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgtt 22155242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 606
Target Start/End: Original strand, 22210562 - 22211157
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  22210562 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagagtctgtcttttactttttactttgtttagcaaatatatgcaccatggatca 22210661  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  22210662 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaattt 22210761  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  22210762 gattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaaca 22210861  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22210862 attcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacgatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctcttc 22210961  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa----- 518  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||         
T  22210962 tctgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacatcattgtttttaaaataacctagttcttcaacttcatcaacccac 22211061  T
Q  519 --------tttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22211062 aaaaaaatattacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaggacaaattcagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgtt 22211157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 606
Target Start/End: Original strand, 45360095 - 45360678
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45360095 tgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttatcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatat 45360194  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||        
T  45360195 gttgtgaaaattcaaagacctatttgatggtattttcactaattttaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattt 45360294  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
       || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  45360295 tttgacataagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaat-cattagcattttaaacaactcaatccaa 45360393  T
Q  335 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45360394 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaaactcacttcctatacaatcaactttttccatcaaccttgccctccaaacctcttctccgcccctat 45360493  T
Q  435 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aattt 521  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||             |||||    
T  45360494 cctttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagtttttcagcttcatccacccacacaaaaaattt 45360593  T
Q  522 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45360594 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacagaccattcgcacatcacataaccattgtt 45360678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 46438887 - 46438282
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  46438887 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtccgtctttctataatcaaagtgtttgtcttctactttttactctattcagcaaatgtatccaccaaggatca 46438788  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46438787 aagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcacttatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaattt 46438688  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | | | ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  46438687 gattgaaattttttgacatataggtttgattcattcgttgacaacctcttttcagtacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaaca 46438588  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  46438587 actcaaccaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacttcttc 46438488  T
Q  424 tctc-cccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------ 516  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||          
T  46438487 tctcccccctatcctttggcttctctatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcaacttcatcaaccca 46438388  T
Q  517 -------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgac 609  Q
           || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46438387 cacaaaaaaattacaattttcaccatcatccaatgcaatcaaaagacaaattcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgttgac 46438288  T
Q  610 agtgtt 615  Q
    ||||||    
T  46438287 agtgtt 46438282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24227787 - 24227194
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24227787 tgatggtatacaaatgtctgtctttttgtaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgtaccaatgatcacagtgatatct 24227688  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||        
T  24227687 gttgtgaaaattaaatgtcctatttgatggtattttcactaatttgaggattgatatgatggatgtgtatataatttaaggacatatttgattgaaattt 24227588  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
       || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  24227587 tttgacaacaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattgcaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatgaaa 24227488  T
Q  335 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  24227487 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacttcttctctccccttat 24227388  T
Q  435 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aattt 521  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             ||||     
T  24227387 cgtttgacttctccatcaaacttgcatttcttccatgactagtaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaattc 24227288  T
Q  522 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacagtgtt 615  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  24227287 acaatttccaccgtcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtaatatttaaacaaatcattcacacatcacataatcattgttaacagtgtt 24227194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 34776327 - 34775745
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34776327 tgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatctgagtgtctgtcttttagtttttactttgtttagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 34776228  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||        
T  34776227 gttgtgaaaattcaaagatctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattaaaaaaa 34776128  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
       || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34776127 tttgacagaagagtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttgggacaat-caatagcattttaaacaactcaatcaaa 34776029  T
Q  335 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 434  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34776028 caaaatacacctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccctat 34775929  T
Q  435 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------------aattta 522  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||            ||||||    
T  34775928 catttggcttctccatcaaccttacatttcttccatgactagtaccattatttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaattta 34775829  T
Q  523 caattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  34775828 caattttcaccatcatcctatacaaccaaaagacaaaatcaatactatttaaacaaaccattcgcacatcatataaccattgtt 34775745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 35692727 - 35692132
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35692727 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttgctttttacttcgttcggcaaatatatgcaccaaggatca 35692628  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  35692627 cagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaattt 35692528  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  35692527 gattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatagca-tttaaaca 35692429  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35692428 acacaatcaaacaaaatacttttatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccaccaaccttgccctccaaacctcttc 35692329  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgttttt-aaaatagcctagttctccagcttcatc------ 516  Q
    |||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||          
T  35692328 tctgtccccatcatttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccgttgtttttaaaaatagtctagttcttcagcttcatcaaccca 35692229  T
Q  517 -------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
           |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35692228 cacaaaaaatttacaattttcacaatcatcttatacaatcaaaagacaaaatcaatataatttaaagaaaacattcacacatcacataaccattgtt 35692132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 24 - 453
Target Start/End: Original strand, 6604272 - 6604701
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6604272 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagtaaatgtatgcaccaatgatca 6604371  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  6604372 cagtgatatatgttgtgaaaagtcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaattt 6604471  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6604472 gattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatgaacttggcacaatacaatagcattttaaaca 6604571  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6604572 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctcaatcaacctaagctcacttcctatacaatcaactttatccatcaaccttgcccttcaaacctcttc 6604671  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaa 453  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6604672 tttgcccctatcctttggcttctccatcaa 6604701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23905629 - 23905232
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23905629 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttttcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatca 23905530  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||    
T  23905529 caatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgattgatatgcatataattcaatgaccaattt 23905430  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||| ||       || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23905429 gatttaaattttttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaaca 23905330  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctct 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23905329 actgaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctct 23905232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 35 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 47385576 - 47384989
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||| | |    
T  47385576 tgatggtatgtaaatgtctgtctttttacaatcaatgtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcat----gatcaca-tgatgtat 47385482  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||        
T  47385481 gttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtaatttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatataatagaaggaccaatttgattgaatttt 47385382  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatg--------gacttgacacaatgcaatagcattttaaacaact 326  Q
       || ||||| |||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||          |||||| ||||||  ||||  ||| |||||||||    
T  47385381 tttgacagaaaggttgaattcattcattgacaaccactgttcattacaacattacagcattacacagacttggcacaataaaataaaattctaaacaact 47385282  T
Q  327 caatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctct 426  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47385281 caatcaaacaaatcactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccttccaaacctcttctct 47385182  T
Q  427 ccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatca--------- 517  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||             
T  47385181 gccactatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacccacaca 47385082  T
Q  518 ----atttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
        |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  47385081 aaagatttacaattttcaccattatcctgtacaatcaaaagacaaaatcagtaccatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgtt 47384989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 24 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 27665423 - 27665031
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665423 tatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgcctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 27665324  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27665323 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacatatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaattt 27665224  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||| ||       || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  27665223 gattaaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatatcattttaaaca 27665124  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27665123 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacagttaattttatccatcaaccttgtcctccaaa 27665031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29995893 - 29995501
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995893 tatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 29995794  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||    
T  29995793 cagtgatatttgttgtgaaaattcaaggacctatttcatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataatttaaggatcaattt 29995694  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  29995693 gattgaaatattttgacagaaatgtttggttcattcattgaaaacctctgttcattacaacattacatagacttggcacaatacaatatcattttaaaca 29995594  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29995593 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 29995501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 41 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39858602 - 39858271
Alignment:
Q  41 tatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtg 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39858602 tatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaatgatcacagtgatatctgttgtg 39858503  T
Q  141 aaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngag 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||       ||     
T  39858502 aaaattcaaggacctatttcatggtattttcactcatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgac 39858403  T
Q  241 agaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaat 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858402 agaatggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaat-caataacattttaaacaactcaatcaaacaaaat 39858304  T
Q  341 actcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858303 actcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 39858271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 24 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37114905 - 37114591
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37114905 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatttcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatta 37114806  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  37114805 caatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaattt 37114706  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | |||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37114705 gattgaaattttttgacaaaaagatttgattcattcattgacaacctcttttcaatacaacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaaca 37114606  T
Q  324 actcaatcaaacaaa 338  Q
    |||||||||||||||    
T  37114605 actcaatcaaacaaa 37114591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 37 - 317
Target Start/End: Original strand, 13168843 - 13169122
Alignment:
Q  37 atgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgt 136  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13168843 atgatatgcaaatgtctgtatttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttattttgttcagcgaatgtatgcaccaaggatcacattgatatctgt 13168942  T
Q  137 tgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnn 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||          
T  13168943 tgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatgttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttt 13169042  T
Q  237 ngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattt 317  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13169043 tgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaat-caatagcattt 13169122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 285 - 475
Target Start/End: Original strand, 69132 - 69322
Alignment:
Q  285 attacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacaca 384  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69132 attacatggacttggcacagtacaatagtatttaaaacaactcaatcaaacaaaatactcatattaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacaca 69231  T
Q  385 atcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagacca 475  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  69232 atgaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgacca 69322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 277 - 588
Target Start/End: Original strand, 48310948 - 48311273
Alignment:
Q  277 attacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactt 376  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48310948 attacaacattacacagacttgacataatataatagcattttaaacaattcaatcaaacaaattactcatgtcaatatcttaatcaacctaagttcactt 48311047  T
Q  377 cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccag 476  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||    
T  48311048 cctacacaatcgactttatccatcaacattgccctccaaacctcttctccgccactattcttaggcttctccattaaccttgcattccttccatgaccag 48311147  T
Q  477 caccattgttt-ttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatc 562  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||             |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||   ||||||    
T  48311148 caccattgtttataaaaataacatagttcttcagcttcatcaacccagataaaaaattgacaattttcaccatcatcttatacaaagaaaatttaaaatc 48311247  T
Q  563 agtactatttaaacaaatcattcaca 588  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  48311248 agtacaatttaaacaaaccattcaca 48311273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38550645 - 38550441
Alignment:
Q  26 tatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 125  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550645 tatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttattttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 38550546  T
Q  126 gtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttga 225  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  |||||| |||||||    
T  38550545 gtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggactaatttga 38550446  T
Q  226 ttgaa 230  Q
    |||||    
T  38550445 ttgaa 38550441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37792409 - 37792150
Alignment:
Q  26 tatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 125  Q
    |||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  37792409 tatgacatatgatggtaagcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtctttgacttttactttttactttgtacaacaaatgtatgcaccaatgatcaca 37792310  T
Q  126 gtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttga 225  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||  |||  |||||| |||||||    
T  37792309 gtgatatatggtgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcaatatgatggatagacatgcaatagaaggaccaatttga 37792210  T
Q  226 ttgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaaca 285  Q
    | |||       || ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37792209 tggaaatattttgacagaagggttgaattcattcattgacaacctcttttcattacaaca 37792150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35402719 - 35402545
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||    
T  35402719 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttatcttttacattttactttgttcagcaaatatatgctcaaaggatcacattgatatctgttatga 35402620  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||    
T  35402619 taattcaaggaccaatttgatgatattttcactaatttgaggatcgaaatgatggat-tgaatataattcaaggac 35402545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 48851691 - 48851450
Alignment:
Q  33 tctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatat 132  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  48851691 tctgatggtatgcaaatgtatgtctttttacaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttggtcagcaaatgtatgccccaaggatcacaatgatat 48851592  T
Q  133 ctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaann 232  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||| || | ||| |||  | |||| |||||||| |||      
T  48851591 atgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgagattttcactaattt-tggatcaatatgatgggtagacatacaatagagggaccaatttgatggaaag 48851493  T
Q  233 nnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttt 275  Q
         || ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48851492 attttgacagaatggttgaattcattcattgacaacctctttt 48851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 433 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 48851439 - 48851253
Alignment:
Q  433 atcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa-------------t 519  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||             |    
T  48851439 atcctttggtttctccatcaaccttgcatttcttccattaccagcaccattgtttttgaaataatctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaat 48851340  T
Q  520 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  48851339 ttacaattttcaccatcatcttatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgtt 48851253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Original strand, 69032 - 69134
Alignment:
Q  108 tatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatata 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  69032 tatgcaccaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatata 69131  T
Q  208 att 210  Q
    |||    
T  69132 att 69134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 517 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 38550316 - 38550227
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38550316 aatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccattcacacatcacataaccattgtt 38550227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Original strand, 20478921 - 20479034
Alignment:
Q  117 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaagga 216  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  20478921 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 20479020  T
Q  217 caaatttgattgaa 230  Q
    | ||| ||||||||    
T  20479021 ccaatgtgattgaa 20479034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 523 - 606
Target Start/End: Original strand, 6604699 - 6604782
Alignment:
Q  523 caattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  6604699 caattttcaccatcatcctatacaatcaaaagataaaataagtactatttaaacaaactattcacacatcacataaccattgtt 6604782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 112
Target Start/End: Original strand, 66845 - 66915
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgc 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66845 atgcaaatgcctttctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgc 66915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Original strand, 11683621 - 11683743
Alignment:
Q  301 acaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||  ||| ||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  11683621 acaatacaatagcatgttaaaaaactcaaacaagtaaattatgactatcaaaaacttaatcaacctaagctcacttcctatacactcaactttgtccatc 11683720  T
Q  401 aaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11683721 aaccttgccctccaaacctcttc 11683743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 472 - 606
Target Start/End: Original strand, 77252 - 77399
Alignment:
Q  472 accagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa-------------tttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaa 558  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  77252 accaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaa 77351  T
Q  559 aatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||    
T  77352 aatcagtataatttaaacaaaacattcatacattaaataaccattgtt 77399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 355 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4321865 - 4321800
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 420  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4321865 cttaatcaccctaagcttacttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctc 4321800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 408
Target Start/End: Original strand, 7402878 - 7403021
Alignment:
Q  265 caacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaac 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   || |   ||||| || |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||   |||||||   ||||||||||    
T  7402878 caacctcttttcattacaacattacacacacatagtacaatacagtagcatgttaaacaacccaaacaaacaaattatgactatcaaatacttaatcaac 7402977  T
Q  365 ctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgc 408  Q
    |||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7402978 ctaatcttacatcctacacaatcaactttgtccatcaaccttgc 7403021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 365 - 424
Target Start/End: Original strand, 32840551 - 32840610
Alignment:
Q  365 ctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttct 424  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32840551 ctaagttcacttcctacacaatcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctattct 32840610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 355 - 420
Target Start/End: Original strand, 34691873 - 34691938
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34691873 cttaatcaacctaagttcacttcatatacaatcaactttgtccatcaacgttgccctccaaacctc 34691938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 179
Target Start/End: Original strand, 48310750 - 48310867
Alignment:
Q  64 aatcaaagtgtttgtcttttactttt-tactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgat 162  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  48310750 aatcaaagtgtctgtctttttattttctactttgttcagcaaatatatgtagcaaagatcatattgatatatgttgtgataattcaatgacttatttgat 48310849  T
Q  163 ggta-ttttcactaattt 179  Q
    | || |||||||||||||    
T  48310850 gatatttttcactaattt 48310867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34784647 - 34784575
Alignment:
Q  345 ctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 417  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  34784647 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcacttcttatacaatcaactttgtccatcaacattgcccttcaaac 34784575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 406
Target Start/End: Original strand, 23168652 - 23168751
Alignment:
Q  307 caatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaacctt 406  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||||||| || |||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23168652 caataacatgttaaacaatccaatcaaacgaattacttctatcaaatacttaatcaatctaaactcacttcgtacacaatcaactttatccgtcaacctt 23168751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 423
Target Start/End: Original strand, 40360951 - 40361028
Alignment:
Q  346 tatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40360951 tatcaattactttatcaatctaagctcactttctaaacaatcaactttgtccatcaaccttgctctccaaacttcttc 40361028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Original strand, 13035621 - 13035705
Alignment:
Q  86 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttt 170  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||   | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13035621 tttttactttgttttgcacatatatgcaccaaggatcacattgacatctgtttaaataattcaaggacttatttgatggtatttt 13035705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23905169 - 23905125
Alignment:
Q  422 tctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 466  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23905169 tctctgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 23905125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 411
Target Start/End: Original strand, 13035937 - 13035993
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccct 411  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  13035937 cttaatcaacctaatctcacttcctacatagtcaactttctccatcaaccttcccct 13035993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 48302936 - 48302873
Alignment:
Q  356 ttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 420  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  48302936 ttaatcaccctaagctcacttcctgtacaatcaactttgtccatcaacgttg-cctccaaacctc 48302873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 373
Target Start/End: Original strand, 13169123 - 13169162
Alignment:
Q  334 acaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 373  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13169123 acaaaatattcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 13169162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 615
Target Start/End: Original strand, 2767691 - 2768284
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2767691 tgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagagtttgtcttttactttttactttgttcagaaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 2767790  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||        
T  2767791 attgtgaaaattcaaggaccaatttgatggtattttcactaaattgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaatttt 2767890  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
       || | ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2767891 tttgacataaaggttttattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatgggtttggcacaatacaatagcattttaaacaacttaatcaaa 2767990  T
Q  335 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2767991 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagcttacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 2768090  T
Q  435 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aattt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             |||||    
T  2768091 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaattt 2768190  T
Q  522 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacagtgtt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2768191 acaattttcaccatcatcctatataatcaaaagacaaaaccagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgttgatagtgtt 2768284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 615
Target Start/End: Original strand, 6798283 - 6798876
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6798283 tgatgatatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcatcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 6798382  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||        
T  6798383 gttgtgaaaattcaaggacatatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatttgatgaatatgtatacaattgaaggaccaatttgattgaatttt 6798482  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
       || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6798483 tttgacagaaaggtttgactcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaa 6798582  T
Q  335 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6798583 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 6798682  T
Q  435 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatca-------------attt 521  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||             ||||    
T  6798683 ctcttggcttctccgtcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctagttcgtcagcttcatcaacctacacaaaatattt 6798782  T
Q  522 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacagtgtt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  6798783 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccgttgttgatagtgtt 6798876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 615
Target Start/End: Original strand, 17696973 - 17697577
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17696973 tatatgacttatgatggtatgcaaatatctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttctactttttactttgttcaacaaatgtatccaccaaggatca 17697072  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  17697073 tagtgatgtatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcaccaattttaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccagttt 17697172  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  17697173 gattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcgttgacaacctcttttcataacaacattacatggacttggcataatacaatagcattttaaaca 17697272  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697273 attcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacttaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 17697372  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------- 516  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||           
T  17697373 tctccccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacctac 17697472  T
Q  517 ------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgaca 610  Q
          ||| |||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17697473 acaaaaaatctacaattttcacaaatatattatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgttgaca 17697572  T
Q  611 gtgtt 615  Q
    |||||    
T  17697573 gtgtt 17697577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 14388479 - 14387923
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388479 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtttttttataatcaaagtgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 14388380  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14388379 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatagtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaattt 14388280  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattaca--------tggacttgacacaatgcaatagcat 315  Q
    |||||||        | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||| |||||| |||||||||    
T  14388279 gattgaagtttttttacataaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcat 14388180  T
Q  316 tttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388179 tttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaa 14388080  T
Q  416 acctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcat 515  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  14388079 acctcttctctgcccctatcatttagcttctccatcaaccttgcatttcttccattaccagcaccattgtttttaaaatagcctaattcctcagcttcat 14387980  T
Q  516 c-------------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaa 559  Q
    |             |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14387979 caacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctgtacaatcaaaagacaaa 14387923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 24 - 465
Target Start/End: Original strand, 16763712 - 16764153
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16763712 tatatgacttatgatagtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctatcttttactttttactctgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 16763811  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| |    
T  16763812 cagtgatatctgttgtgtaaattcaatgacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgt 16763911  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16763912 gattgaatttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaaca 16764011  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16764012 actcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagttcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctctaaacctcttc 16764111  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttct 465  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16764112 tctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttct 16764153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 42 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 6784648 - 6784070
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||  | |||| |||||| |||    
T  6784648 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacttttgactttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatccaattgatttctgttatga 6784549  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttc-actaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngag 240  Q
     |||||||||||| |||||||| | ||||  |||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||       ||     
T  6784548 taattcaaggaccaatttgatgtttttttttactaatttaaagatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgac 6784449  T
Q  241 agaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaat 340  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6784448 agaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaat 6784349  T
Q  341 actcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 440  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  6784348 actcctatcaataacttaatcaacctaagttcacttcctaaacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccctatcatttg 6784249  T
Q  441 gcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaatt 527  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||             || ||||||||    
T  6784248 gcttctcgatcaactttgcatttcttccatgaccaacatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccaaccaaaaaaattacaatt 6784149  T
Q  528 ttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  6784148 ttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 6784070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 24 - 466
Target Start/End: Original strand, 39455926 - 39456367
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39455926 tatatgacttatgatggtatacaaatgtctgtctttttataatcaaagt-tctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 39456024  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||    
T  39456025 tagtgatatctgttgtgaaaatttaaggacctatttgatgatattttcactcatttgagaatcaatatgatgaatatgcatataattcaatgaccaattt 39456124  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  39456125 gattgaatttttttgacaaaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaaca 39456224  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39456225 actcaatcaaacaaaatactcttatcaatatcttaattaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 39456324  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 466  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39456325 tctgcccctatcctttggcttttccatcaaccttgcatttctt 39456367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 24206900 - 24206313
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||| | |    
T  24206900 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaattgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttataa 24206801  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttc--actaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnnga 239  Q
     |||||||||||| |||||||| | ||||   |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||       ||    
T  24206800 taattcaaggaccaatttgatgatttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatatttttga 24206701  T
Q  240 gagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattaca--------tggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatc 331  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24206700 cagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacattacatggacttagaacaatacaatagcattttaaacaactcaatc 24206601  T
Q  332 aaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccc 431  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24206600 aaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacataatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccc 24206501  T
Q  432 tatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aa 518  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||             ||    
T  24206500 tatcatttggcttctcgatcaaccttgcattttttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaa 24206401  T
Q  519 tttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  24206400 attacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaataaaacattcatacatcaaataaccattgtt 24206313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 190 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 34401394 - 34400956
Alignment:
Q  190 atgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattac 289  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||        | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34401394 atgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttaacaaaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattac 34401295  T
Q  290 atggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaa 389  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34401294 atgaacttggcacaatgcaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaataatcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctactcaatcaa 34401195  T
Q  390 ctttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgttttt 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  34401194 ctttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttctatttcttccatgaccagcaccattattttt 34401095  T
Q  490 aaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaac 576  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||             ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34401094 aaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaactttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatatgtactatttaaac 34400995  T
Q  577 aaatcattcacacatcacataactattgttgacagtgtt 615  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34400994 aaattattcacacatcacataactattgttgacagtgtt 34400956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 247 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 44708976 - 44708604
Alignment:
Q  247 gtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44708976 gtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcgcaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcct 44708877  T
Q  347 atcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttct 446  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44708876 atcaatatcttaatcaacctaagcccacttcctacacaattaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttct 44708777  T
Q  447 ccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaattttcacc 533  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||             |||||||||||||||||    
T  44708776 ccatcaaccttgcatgtgttccatgaccagcaccattatttttaaaataacctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacc 44708677  T
Q  534 atcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44708676 atcatcatatacaatcaaaagacaaaataagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgtt 44708604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 41 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19907639 - 19907308
Alignment:
Q  41 tatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtg 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19907639 tatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaatgatcacagtgatatctgttgtg 19907540  T
Q  141 aaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngag 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||       ||     
T  19907539 aaaattcaaggacctatttcatggtattttcactcatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgac 19907440  T
Q  241 agaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaat 340  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19907439 agaatggtttgattcattcattgataacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaat-caataacattttaaacaactcaatcaaacaaaat 19907341  T
Q  341 actcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19907340 actcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 19907308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 307 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 42518522 - 42518203
Alignment:
Q  307 caatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaacctt 406  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42518522 caataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaataaacctaagatcacttcttacacaatcaactttatccatcaacctt 42518423  T
Q  407 gccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctc 506  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42518422 gccctccaaacttcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgatcagcaccattgtttttaaaatagcctagttctt 42518323  T
Q  507 cagcttcatc-------------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatca 593  Q
     |||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42518322 tagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagac--aatcagtactatttaaacaaatcattcacgcatca 42518225  T
Q  594 cataactattgttgacagtgtt 615  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  42518224 cataaccattgttgacagtgtt 42518203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 35 - 338
Target Start/End: Original strand, 40561002 - 40561305
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40561002 tgatgatatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatggcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacattgatatct 40561101  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||| ||||||        
T  40561102 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatgtgcatataatttaaggaccaatttaattgaaattt 40561201  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
        | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40561202 tttaacaaaaaggtttgattcattcattgacaacatcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaa 40561301  T
Q  335 caaa 338  Q
    ||||    
T  40561302 caaa 40561305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39664147 - 39663994
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39664147 tgatggtatgcagatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatat 39664048  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39664047 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 39663994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44709123 - 44708996
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44709123 tgatggtatgcaaatgtctgcatttttataatcaaagtgtctgtctttgactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 44709024  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgat 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  44709023 gttgtgaaaattcaaggaccaatttgat 44708996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 517 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 39663936 - 39663847
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  39663936 aatttacaattttcactatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattcgcacatcacataaccattgtt 39663847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 42518610 - 42518524
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtat 110  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42518610 tatatgacttatgatggtatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtat 42518524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Original strand, 4047377 - 4047499
Alignment:
Q  301 acaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  4047377 acaatacaatagcatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttgtccatt 4047476  T
Q  401 aaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4047477 aactttgccctccaaacctcttc 4047499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Original strand, 37021388 - 37021501
Alignment:
Q  117 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaagga 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||    
T  37021388 aggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggttttttcattaatttgaggatcaaaatgatggatatgattataattcaagga 37021487  T
Q  217 caaatttgattgaa 230  Q
    | ||| ||||||||    
T  37021488 ccaatgtgattgaa 37021501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 423
Target Start/End: Original strand, 20941686 - 20941856
Alignment:
Q  252 attcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaa 351  Q
    ||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||   || |  |||||| || || ||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||    
T  20941686 attcattcatcttcaacctcttttcattacaacgttacacacacctagcacaatacagtaacatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaa 20941785  T
Q  352 tatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20941786 atacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttgtccatcaaccttg-catccaaacctcttc 20941856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 524 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 19581954 - 19581872
Alignment:
Q  524 aattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  19581954 aattttcaccatcatcctacacaattaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccattcacacatcgcataaccattgtt 19581872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 355 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26581613 - 26581545
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26581613 cttaatcaacctaagctcacttcatacacaatcaactttgtccatcaaccttcccctctaaacctcttc 26581545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19582039 - 19581960
Alignment:
Q  260 attgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 339  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19582039 attgaaaacctcttttcattacaacattacagagacttgacacaatacaataacattttaaacaattcaatcaaacaaaa 19581960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 423
Target Start/End: Original strand, 161441 - 161554
Alignment:
Q  310 tagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 409  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  161441 tagcatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacttaatcaaccaaacctcactttctacatagtcaactttgtccatcaaccttgcc 161540  T
Q  410 ctccaaacctcttc 423  Q
    ||| ||||||||||    
T  161541 ctctaaacctcttc 161554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 37646238 - 37646283
Alignment:
Q  80 ttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37646238 ttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaaagatcaca 37646283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 420
Target Start/End: Original strand, 38149341 - 38149406
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 420  Q
    |||||||| || || |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38149341 cttaatcaccccaatctcactttttatacaatcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctc 38149406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Original strand, 161216 - 161300
Alignment:
Q  86 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttt 170  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||   | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  161216 tttttactttgttatgcacatatatgcaccaaggatcacgttgacatctgtttaaataattcaaggacttatttgatggtatttt 161300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 7744707 - 7744778
Alignment:
Q  345 ctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 416  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  7744707 ctatcaaaaacttaataaacctaagctcaattcctaaagtatcaactttgtccatcaacctcaccctccaaa 7744778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 471 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 39663995 - 39663948
Alignment:
Q  471 gaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa 518  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39663995 gaccaacaccattgttttcaaaataacctagttcttcagcttcatcaa 39663948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 395 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11022280 - 11022252
Alignment:
Q  395 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11022280 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 11022252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 30599584 - 30598982
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30599584 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttctgcaaatgtatgcaccaaggatca 30599485  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  30599484 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcaatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaattt 30599385  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  30599384 gattgaaattttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaaca 30599286  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599285 actcaatgaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 30599186  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------- 516  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||           
T  30599185 tctccccctatcctttgacttctccatcaatcttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagtctagttcttcaacttcatcaacccac 30599086  T
Q  517 ------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgaca 610  Q
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30599085 acaaaaaatttacaattttcaccatcatcttatacaatcaaaagacaaaataagtactatttaaacaaatcattcacacat-acataaccattgttgaca 30598987  T
Q  611 gtgtt 615  Q
    |||||    
T  30598986 gtgtt 30598982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 615
Target Start/End: Original strand, 43765899 - 43766492
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43765899 tgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcatagtgatatct 43765998  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||        
T  43765999 gttgtgaaaattcaaggacatatttgatagtattttcactaatttgatgatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattt 43766098  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43766099 tttgatagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaatgttacatgaacttgacacaataaaatagcattttaaacaactcaatcaaa 43766198  T
Q  335 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 434  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43766199 caaaatactcctatcaatatattaatcaatctaagctcacttcctacacaatcagctttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 43766298  T
Q  435 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aattt 521  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||             |||||    
T  43766299 cctttggcttctccatcaatcttgcatttcatccatgaccagcaccattgtttttaaaattgcctagttcttcaacttcatcaacccacacaaaaaattt 43766398  T
Q  522 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacagtgtt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43766399 acaattttcaccatcatcctatacaataaaaagacaaaatttgtactacttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacagtgtt 43766492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 615
Target Start/End: Original strand, 21349461 - 21350065
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21349461 tatatgacttatgatagtatgcaaatgtctatctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggacca 21349560  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  21349561 cagtgataattgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaatgaccaattt 21349660  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    ||||||         | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  21349661 gattgatttttttttacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcgcaatagaatagcattttaaaca 21349760  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  21349761 actcaatcaaacaaaatactcatatcaatgtcttaatcaacataagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgccctcaaaacttcttc 21349860  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------- 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||           
T  21349861 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccatcaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccac 21349960  T
Q  517 ------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgaca 610  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21349961 acaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatctgtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgttgaca 21350060  T
Q  611 gtgtt 615  Q
    |||||    
T  21350061 gtgtt 21350065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 615
Target Start/End: Original strand, 46198487 - 46199090
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  46198487 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtttttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcatcaaagatca 46198586  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46198587 caatgatatctgttgtaaaaatcca-ggacctatttgatggtatttttactaatttgaggatcgatatgatagatatgtatataattcaaggaccaattt 46198685  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  46198686 gattgaaattttttgacataaatgtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttgacacaatataataacattttaaaca 46198785  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198786 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagtccacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 46198885  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------- 516  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||           
T  46198886 tctccccctatcctttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagaaccattgtttttaaaataggctagttcttcagcttcatcaacccac 46198985  T
Q  517 ------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgaca 610  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  46198986 acaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaattaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacatagccattgttgaca 46199085  T
Q  611 gtgtt 615  Q
    |||||    
T  46199086 gtgtt 46199090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 44275593 - 44274991
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44275593 tatatgacttatgatggtatgcaaatgactgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttaatttttactttgttcagcaaatgtatgcatcaaggatca 44275494  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  44275493 caatgatatctattgtgaaaattcaagaacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgtgtataattcaaggaccaattt 44275394  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||        |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  44275393 gattgaaattttttcaga--aaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatgaacttggcacaatacaataccattttaaaca 44275296  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44275295 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcccttccttcacaatcaaatttatccatcaaccttgccctccaaacgtcttc 44275196  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------- 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||           
T  44275195 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttccatttcttcgatgaccagaaccattgtttgtaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccac 44275096  T
Q  517 ------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgaca 610  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275095 acaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatatgtactatttaaacaaattattcacacatcacataactattgttgaca 44274996  T
Q  611 gtgtt 615  Q
    |||||    
T  44274995 gtgtt 44274991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 27898480 - 27897899
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27898480 tgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccagggatcacagtgatatct 27898381  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||        
T  27898380 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaacttgattgaatttt 27898281  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
       || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27898280 tttgacaaaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaat-caatagcattttaaacaacttaatcaaa 27898182  T
Q  335 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 434  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27898181 caaaatactcctatcaatatattaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctat 27898082  T
Q  435 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aattt 521  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||             |||||    
T  27898081 catttgccttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcaacttcatcaacccacacaaaaaattt 27897982  T
Q  522 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattg 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  27897981 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttacacaaaccattcgcacatcacataaccattg 27897899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 519
Target Start/End: Original strand, 17516077 - 17516570
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17516077 tatatgacttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtatctgtcttttactttttactttgttaagcaaatgtatgcaccaaggatca 17516176  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  17516177 caatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttttactaatttgagtatcgatatgatggatatg-atataattcaaggaccaattt 17516275  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17516276 gattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggaattggcacaatacaatagcattttaaaca 17516375  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516376 actcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 17516475  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaat 519  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17516476 tctccccc-atcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcaacaat 17516570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 579
Target Start/End: Original strand, 2377774 - 2378324
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377774 tgatgatatgcaaatatttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 2377873  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||        
T  2377874 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgttatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattt 2377973  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
        | | ||  ||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2377974 tttaacataagggtttgattcatt-----acaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaat-caataacattttaaacaactcaatcaaa 2378067  T
Q  335 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 434  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2378068 -aaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcatttcctacgcaatcaactttatccatcaaccttgctctccaaacctcttctctgcccctat 2378166  T
Q  435 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa-------------ttt 521  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||             |||    
T  2378167 cctttgacttatccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaatttt 2378266  T
Q  522 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaa 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378267 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaa 2378324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 138 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 53188963 - 53188482
Alignment:
Q  138 gtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnn 237  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||           
T  53188963 gtgaaaattcaatgacctatttgatgacattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaattttttt 53188864  T
Q  238 gagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaa 337  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  53188863 gacagaaaggtttcattcattcattgacaacctattttcattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaa 53188764  T
Q  338 aatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  53188763 aatactcctatcaatatcttaatcaatctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaactttgccctccaaacctcttctctgcccctatcat 53188664  T
Q  438 ttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttaca 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||             ||||||||    
T  53188663 ttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccgttgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttaca 53188564  T
Q  525 attttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  53188563 attttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 53188482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 24 - 416
Target Start/End: Original strand, 2660981 - 2661373
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2660981 tatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 2661080  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  2661081 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaaccaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaattt 2661180  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||| ||       || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  2661181 gattaaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacatggcacaatacaatatcattttaaaca 2661280  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 416  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2661281 actcaatcaaacaaaatacccctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 2661373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 74 - 465
Target Start/End: Original strand, 54899250 - 54899649
Alignment:
Q  74 tttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899250 tttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcac 54899349  T
Q  174 taatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctt 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||||       ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54899350 taatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccgatgtgattgaatttttttgacggaaaggtttgattcattcattgacaacctctt 54899449  T
Q  274 tttatta--------caacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacc 365  Q
    || ||||        |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899450 ttcattacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacc 54899549  T
Q  366 taagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttct 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54899550 taagctcacttcctacacaatcaactttacccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccttatcatttggcttctccatcaaccttgtatttct 54899649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 416
Target Start/End: Original strand, 44794966 - 44795358
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44794966 tatatgacttatgatggtatgaaaatgtccgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 44795065  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  44795066 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatggatataattcaagaaccaattt 44795165  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||||    
T  44795166 gattgaaatattttgacataatggtttggttcattcatcgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcataatacaatattattttaaaca 44795265  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44795266 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 44795358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 35 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2225538 - 2225165
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225538 tgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 2225439  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||  || ||||        
T  2225438 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgtatataattcaaggaccaatgcgaatgaatttt 2225339  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttt--------tattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaact 326  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2225338 tttgacagaaatgtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaacaact 2225239  T
Q  327 caatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 400  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225238 cagtcaagcaaaatactcctatcaatatattaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 2225165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 26 - 425
Target Start/End: Original strand, 46113236 - 46113635
Alignment:
Q  26 tatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46113236 tatgacttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 46113335  T
Q  126 gtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttga 225  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||| | ||| |||  |||||| |||||||    
T  46113336 gtgatttatgttgtgaaaattcaaggacttgtttgatggtatcttcactaatttagggattgatgtgatggataaacatacaatagaaggaccaatttga 46113435  T
Q  226 ttgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaac 325  Q
    |||||       || ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  46113436 ttgaaattttttgacagaagggttggattcattccttgacaacctcttttcattacaacattacacagacttgacacaatacaataacattttaaacaac 46113535  T
Q  326 tcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctc 425  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  46113536 tcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcccgcacaatcaactttatccatcagccttgccctccaagcctcttctc 46113635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 26 - 449
Target Start/End: Original strand, 610363 - 610786
Alignment:
Q  26 tatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 125  Q
    |||||| | |||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  610363 tatgacttatgattatatgcaaatgtctgcttttttacaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcata 610462  T
Q  126 gtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttga 225  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||| |||  |||||| |||||||    
T  610463 gtgatttatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatgcgatggatagacatacaatagaaggaccaatttga 610562  T
Q  226 ttgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaac 325  Q
    |||||       || ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  610563 ttgaatttttttgacagaagggttgaattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacacatacttggcacaatacaataacattttaaacaac 610662  T
Q  326 tcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctc 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  610663 tcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaataaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaagccttttctc 610762  T
Q  426 tccccctatcctttggcttctcca 449  Q
    |  | ||||| |||||||||||||    
T  610763 taacactatcttttggcttctcca 610786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 24 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23292546 - 23292232
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23292546 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatttatgcaccaaggatca 23292447  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||    
T  23292446 caatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggatcaattt 23292347  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23292346 gattgaaattttttgacagaaaagtttgattcattcattgacaacctattttcattacaacattatatggacttgtcacaatacaatagcattttaaaca 23292247  T
Q  324 actcaatcaaacaaa 338  Q
    |||||||||||||||    
T  23292246 actcaatcaaacaaa 23292232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 300 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 35904850 - 35904531
Alignment:
Q  300 cacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccat 399  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904850 cacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaaactcacttcctacacaatcaactttatccat 35904751  T
Q  400 caaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcct 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35904750 caaccttgccctccaaacctgttctctgcccctatcgtttgccttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcct 35904651  T
Q  500 agttctccagcttcatc-------------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattca 586  Q
    | |||| ||||||||||             |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  35904650 aattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaataaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattca 35904551  T
Q  587 cacatcacataactattgtt 606  Q
     |||||| ||||| ||||||    
T  35904550 tacatcaaataaccattgtt 35904531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 339
Target Start/End: Original strand, 51685360 - 51685673
Alignment:
Q  26 tatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 125  Q
    |||||| | ||||| | |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51685360 tatgacttatgatggtttgcaaatgtccgtctttttacaatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaacgatcaca 51685459  T
Q  126 gtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttga 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||| |||  |||||| |||||||    
T  51685460 gtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggattgatatgatcgatagacatacaatagaaggaccaatttga 51685559  T
Q  226 ttgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaac 325  Q
    |||||       || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  51685560 ttgaaattttttgacagaaaggttaaattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacacagacttgacacaatacaataacatttcaaacaac 51685659  T
Q  326 tcaatcaaacaaaa 339  Q
    ||||||| ||||||    
T  51685660 tcaatcacacaaaa 51685673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 48830201 - 48829886
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48830201 tatatgacttatgatgatatacaaatgtctgtctttttacaatcaaagtatatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcactaaggatca 48830102  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||  |||||| |||||    
T  48830101 cagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttgtttgatggtattttcactaatttggagatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaattt 48830002  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | ||  |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  48830001 gattgaatttttttgacataagggttaaattcattcattgacaaccacttttcattacaacattacacagacttggcacaatacaataacattttaaaca 48829902  T
Q  324 actcaatcaaacaaaa 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  48829901 actcaatcaaacaaaa 48829886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35905073 - 35904851
Alignment:
Q  53 tgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaagga 152  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35905073 tgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatga 35904974  T
Q  153 cctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttga 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||       || ||||| ||||||    
T  35904973 cctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttga 35904874  T
Q  253 ttcattcattgacaacctctttt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35904873 ttcattcattgacaacctctttt 35904851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 41978495 - 41978671
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978495 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 41978594  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41978595 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatat 41978671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 290
Target Start/End: Original strand, 42280256 - 42280521
Alignment:
Q  26 tatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttt-tactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcac 124  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42280256 tatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttacttttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcac 42280355  T
Q  125 agtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttg 224  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||| |||  |||||| ||||||    
T  42280356 aatgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggattgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttg 42280455  T
Q  225 attgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattaca 290  Q
    ||||||       || ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42280456 attgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttcattacaacattaca 42280521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7884270 - 7884094
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7884270 tatatgacttatgatggtaggcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 7884171  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7884170 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggattgaaatgatggatat 7884094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38192630 - 38192457
Alignment:
Q  44 gcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaa 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  38192630 gcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgata 38192531  T
Q  144 attcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  38192530 attcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 38192457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46609897 - 46609724
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  46609897 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 46609798  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaagg 215  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  46609797 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 46609724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 53093372 - 53093197
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  53093372 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtatttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 53093273  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  53093272 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 53093197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 46309776 - 46309951
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||    
T  46309776 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaatgatcacattgatatctgttatga 46309875  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||    
T  46309876 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcatggac 46309951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 422
Target Start/End: Original strand, 13466154 - 13466324
Alignment:
Q  252 attcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaa 351  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||   ||||  || ||| || |||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13466154 attcattcattttcaacctcttttcattacaacattacacaaacttagcataatacagtagcatgttaaacaatccaatcaaacaaattacacctatcaa 13466253  T
Q  352 -tatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctctt 422  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13466254 atat-ttaatcaacctaaactcacttcctacacaatcaactttgtccatcaacctttccctccaatcctctt 13466324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 53190239 - 53190118
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttact---ttgttcagcaaatgtatgcaccaagga 120  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  53190239 tatatgacttatgatggtatgcaaatatgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttaataatttgttcagcaaatgtatgcaccaagga 53190140  T
Q  121 tcacagtgatatctgttgtgaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  53190139 tcacagtgatatctgttgtgaa 53190118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 170
Target Start/End: Original strand, 24845668 - 24845776
Alignment:
Q  64 aatcaaagtgtttgtctttt--actttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttga 161  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  24845668 aatcaaagtgtatgtcttttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatcacattgatatatgttgtgataattcaaagacttatttga 24845767  T
Q  162 tggtatttt 170  Q
    |||||||||    
T  24845768 tggtatttt 24845776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 517 - 606
Target Start/End: Original strand, 51685673 - 51685762
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  51685673 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcggtactattttaacaaaccattcacacgtcacataaccattgtt 51685762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 517 - 598
Target Start/End: Original strand, 42281795 - 42281876
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataa 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  42281795 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccattcgcacatcaaataa 42281876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 517 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 48829886 - 48829831
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactattt 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48829886 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactattt 48829831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 32843504 - 32843436
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32843504 cttaatcaacctaagctcacatcctacacagtcaactttgtcgatcaaccttgccctccaaaactcttc 32843436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 356 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23876287 - 23876220
Alignment:
Q  356 ttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23876287 ttaatcaacctaaactcacttcatacagagtcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctcttc 23876220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 355 - 420
Target Start/End: Original strand, 41945414 - 41945479
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 420  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  41945414 cttaatcaccctaagctcacttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgtcctctaaacctc 41945479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 35862508 - 35862440
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||    
T  35862508 cttaatcaacttaagctcgcttcctacacaatcaactttgttcatcaaccttgccatgcaaacctcttc 35862440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 442 - 606
Target Start/End: Original strand, 13466364 - 13466547
Alignment:
Q  442 cttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcac------cattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa-------------ttta 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||      |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||             ||||    
T  13466364 cttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaccacaaattccattgtttttaaaataacctagctcttcagcttcatcaacccagacaaaaaattta 13466463  T
Q  523 caattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
     | ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||  | || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13466464 tagttttcaccatcatcctatacaaagaaaattcaaaatcagtaaaagtttaacaaaccattcccacatcacataaccattgtt 13466547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2976410 - 2976359
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaacctt 406  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2976410 cttaatcaacctaagctcaattcctacacactcaactttgtccatcaacctt 2976359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 526 - 606
Target Start/End: Original strand, 24845879 - 24845959
Alignment:
Q  526 ttttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||  |||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24845879 ttttcaccatcatcttatgcaaagaaaattcaaaatccataaaatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgtt 24845959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35862775 - 35862691
Alignment:
Q  86 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttt 170  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||| |||||||   | ||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  35862775 tttttactttgttctgcacatatatgcaacaaggatcacattgacatctgtttaaataattcaaggacttatctgattgtatttt 35862691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49495139 - 49495067
Alignment:
Q  345 ctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 417  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  49495139 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcagttcctaaaatatcaactttgtccatctacctcaccctccaaac 49495067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22219308 - 22219218
Alignment:
Q  81 tttactttt-tactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttt 170  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||   | ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  22219308 tttacttttgtactttgttctgcacatatatgcaccaaggatcgcattgacatctgtttaaataattcaaggatttatttgatgatatttt 22219218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 549 - 606
Target Start/End: Original strand, 41978678 - 41978735
Alignment:
Q  549 caaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  41978678 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 41978735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 7372359 - 7371757
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7372359 tatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatca 7372260  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  7372259 cagtgat-tcgattgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaattt 7372161  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    ||||||        || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  7372160 gattgatattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaataccattttaaaca 7372061  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372060 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 7371961  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa----- 518  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||         
T  7371960 tctccccttatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttcctcaacttcatcaacccac 7371861  T
Q  519 -------tttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacag 611  Q
            ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7371860 acaaaatattacaattttcaccatcattctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacatgtcacataactattgttgacag 7371761  T
Q  612 tgtt 615  Q
    ||||    
T  7371760 tgtt 7371757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 32438457 - 32437864
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32438457 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatggaccaaggatca 32438358  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||| |    
T  32438357 tagtgatatctattgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattaaaggaccaatat 32438258  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32438257 gattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaatctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatgcaatagcattttaaaca 32438158  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32438157 actcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacc-cttc 32438059  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------- 516  Q
    | | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||           
T  32438058 tttgcccctagcattt-gcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccac 32437960  T
Q  517 ------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
          |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  32437959 acaaaaaatttacaattttcaaaattatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 32437864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 606
Target Start/End: Original strand, 18644031 - 18644623
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644031 tgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 18644130  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||        
T  18644131 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgatgatcgaaataatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttt 18644230  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttatta--------caacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaact 326  Q
       || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||        ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18644231 tttgacagaaaggtttgattcattcattgacaatctcttttcattacaacattacaacattacacagacttggcacaatacaatagcattttaaacaact 18644330  T
Q  327 caatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctct 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644331 cagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagttcacttcctactcaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctct 18644430  T
Q  427 ccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc---------- 516  Q
     |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||              
T  18644431 gcccctagcatttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaaccctcaca 18644530  T
Q  517 ---aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
       || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||    
T  18644531 aaaaaattacaattttcacaattatcttatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatatatcaaataacaattgtt 18644623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 35 - 599
Target Start/End: Original strand, 11355967 - 11356530
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355967 tgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 11356066  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| ||||||||||||        
T  11356067 gttgtgaaaattcaaggacctgtttgatggtatttttactaatttgaggatcgatatg---------catataattcaaggaccaatttgattgaaactt 11356157  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttt--------tattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaact 326  Q
       || | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  11356158 tttgacataagggtttgattcattcattgaccacctcttttcattacaacattacaacattacatgaacttggcacaatagaatagcattttaaacaact 11356257  T
Q  327 caatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctct 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11356258 caatcaaacaaaatacttctatcaatatcgtaatcaacctaagctgacttcctacaca-------------atcaaccttgccctccaaacctcttctct 11356344  T
Q  427 ccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc---------- 516  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||              
T  11356345 gcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttctatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaactcacaca 11356444  T
Q  517 ---aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataac 599  Q
       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11356445 aaaaatttacaattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaataagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataac 11356530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 416
Target Start/End: Original strand, 20524134 - 20524526
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524134 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 20524233  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20524234 tagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatacatatataattcaaggaccaattt 20524333  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||        | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20524334 gattgaattttttttacataaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatgaacttggcacaatacaatagcattttaaaca 20524433  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 416  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524434 actcaataaaacaaaatactcatatcaatatcataatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 20524526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 78 - 466
Target Start/End: Original strand, 32517672 - 32518060
Alignment:
Q  78 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32517672 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaattcaaggaactatttgatggtattttcactaat 32517771  T
Q  178 ttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctcttttta 277  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||       || | ||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  32517772 ttgaggatcggtatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcagtcattgacaacctcttttca 32517871  T
Q  278 ttacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32517872 ttacaacattacatggacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttc 32517971  T
Q  378 ctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32517972 ctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccatatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 32518060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 339
Target Start/End: Original strand, 7050506 - 7050821
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050506 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 7050605  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  |||||| |||||    
T  7050606 cagtgatatatgttgtgaaaattcaatgacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaattt 7050705  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | ||  |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  7050706 gattgaatttttttgacaaaagggttaaattcatccattgacaacctcttttcattacaacattacacagacttggcacaatacaataacattttaaaca 7050805  T
Q  324 actcaatcaaacaaaa 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  7050806 actcaatcaaacaaaa 7050821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 294 - 606
Target Start/End: Original strand, 9399135 - 9399460
Alignment:
Q  294 acttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaacttt 393  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9399135 acttggcacaataaaataacattctaaacaactcaaacaaacaaatcactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcatttcctacacaatcaacttt 9399234  T
Q  394 atccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaa 493  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  9399235 atccatcaactttgccttccaaacctcttctctgccactatcctttggcttctccatcaaccttgcttttctaccatgaccagcacccttgtttttaaaa 9399334  T
Q  494 tagcctagttctccagcttcatca-------------atttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaat 580  Q
    || ||||||||| |||||||||||             ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  9399335 taacctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaagatttataattttcaccatcgtcctatacaatcaaaagacaaaattagtactatttaaacaaac 9399434  T
Q  581 cattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9399435 cattcacacattacataaccattgtt 9399460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 339
Target Start/End: Original strand, 10569149 - 10569462
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10569149 tatatgacttatgatgatatgcaaatgtctatctttttacaatcaaagtgtctgttttttactttttactttgtttagcaaatgtatgcaccaaggatca 10569248  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  |||||  |||||    
T  10569249 caatgatatatgt--tgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggatcaattt 10569346  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  10569347 gattgaaattttttgatagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatagacttggcacaatacaataacattttaaaca 10569446  T
Q  324 actcaatcaaacaaaa 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  10569447 actcaatcaaacaaaa 10569462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 117 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 33268155 - 33267813
Alignment:
Q  117 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaagga 216  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||        |||    
T  33268155 aggatcacattgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcaataatttagggatcgatatgatggatagacatac-------gga 33268063  T
Q  217 caaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatg-gacttgacacaatgcaatagcat 315  Q
    | ||||  ||||||       |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||| ||||| |||    
T  33268062 ccaattcaattgaaattttttgagagaagggttgaattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacagacttggcacaatacaataacat 33267963  T
Q  316 tttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaa 415  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  33267962 tttaaacagctcattcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgacc-ccaa 33267864  T
Q  416 acctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 466  Q
    |||| | |||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33267863 acctatactctgccactatcctttgccttcttcatcaaccttgcatttctt 33267813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 433 - 615
Target Start/End: Original strand, 20524583 - 20524778
Alignment:
Q  433 atcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa-------------t 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||             |    
T  20524583 atcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgacgagcaccgttgtttttaaaatagcatagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaat 20524682  T
Q  520 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacagtgtt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20524683 ttacaattttcaccatcatcctatacaagcagaagacaaaatttgtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgttgacagtgtt 20524778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 339
Target Start/End: Original strand, 6901999 - 6902212
Alignment:
Q  126 gtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttga 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||| |||  |||||| |||||||    
T  6901999 gtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggattgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttga 6902098  T
Q  226 ttgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaac 325  Q
    |||||       || ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  6902099 ttgaatttttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacgcagacttgacacaatacaataactttttaaacaac 6902198  T
Q  326 tcaatcaaacaaaa 339  Q
    ||||||| ||||||    
T  6902199 tcaatcacacaaaa 6902212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 132
Target Start/End: Original strand, 6900250 - 6900341
Alignment:
Q  41 tatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatat 132  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6900250 tatgcaaatgtctgtccttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgaaccaaggatcacagtgatat 6900341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 517 - 606
Target Start/End: Original strand, 7050821 - 7050910
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  7050821 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcaatactattttaacaaaccattcacacatcgcataaccattgtt 7050910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 517 - 606
Target Start/End: Original strand, 10569462 - 10569551
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  10569462 aatttacaattttcaccatcatcctgtacaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccattcacacatcgcataaccattgtt 10569551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 517 - 599
Target Start/End: Original strand, 6902212 - 6902294
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataac 599  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6902212 aatttacaaatttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagttctattttaacaaaccattcacacatcacataac 6902294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32455125 - 32455022
Alignment:
Q  127 tgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgat 226  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||| | ||    
T  32455125 tgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaaggaccaatgtaat 32455026  T
Q  227 tgaa 230  Q
    ||||    
T  32455025 tgaa 32455022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 423
Target Start/End: Original strand, 17935548 - 17935616
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  17935548 cttaatcaacctaagctcacatcctactcagtcaactttgtccctcaaccttaccctccaaaactcttc 17935616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 33267776 - 33267730
Alignment:
Q  560 atcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33267776 atcaatactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgtt 33267730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24431671 - 24431587
Alignment:
Q  86 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttt 170  Q
    |||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||  ||| || ||||   | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24431671 tttttacttaattctgcacatatatgcaccaaggatcacgttgacatttgtttaaataattcaaggacttatttgatggtatttt 24431587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 50555462 - 50554885
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacttttt-actttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtg 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50555462 atgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagttttttaccttgttcagtaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtg 50555363  T
Q  141 aaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngag 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||       ||     
T  50555362 aaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgac 50555263  T
Q  241 agaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaat 340  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50555262 agaatgatttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaat-caataacattttaaacaactccatcaaacaaaat 50555164  T
Q  341 actcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50555163 actcctatcaatatcttaatcaacctaaactcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttg 50555064  T
Q  441 gcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaatt 527  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||             |||||||||||    
T  50555063 gcttctccatcaatcttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagtttcatcaacccacacaaaaaatttacaatt 50554964  T
Q  528 ttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50554963 ttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattcgcacatcacataactattgtt 50554885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 606
Target Start/End: Original strand, 27088034 - 27088628
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtcttttt-ataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatc 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27088034 tatatgacttatgatgatatgcaaatatgtgtcttttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatc 27088133  T
Q  123 acagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||     
T  27088134 acagtgatatctgttgtgaaaagtcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatg 27088233  T
Q  223 tgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaac 322  Q
    ||||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27088234 tgattgaattttt--gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaac 27088331  T
Q  323 aactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctctt 422  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27088332 aactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctctt 27088431  T
Q  423 ctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------ 516  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||          
T  27088432 ctctgcccctaacatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaaccca 27088531  T
Q  517 -------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
           |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  27088532 cacaaaaaatttacaattttcacaattatcttatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataactattgtt 27088628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 26224930 - 26224327
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224930 tatatgacttatgatgatatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 26224831  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| |    
T  26224830 cagtgatatttgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtcttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgt 26224731  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctcttttta--------ttacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcat 315  Q
    |||||||       || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  26224730 gattgaatttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcagtacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaataacat 26224631  T
Q  316 tttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaa 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26224630 tttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcccttcaa 26224531  T
Q  416 acctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcat 515  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26224530 acctcttctcttcccctatcttttgtcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcat 26224431  T
Q  516 c-------------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactat 602  Q
    |             |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||    
T  26224430 caacccacacaaaaaatttacaattttcataattatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccat 26224331  T
Q  603 tgtt 606  Q
    ||||    
T  26224330 tgtt 26224327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 606
Target Start/End: Original strand, 15105204 - 15105788
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |    
T  15105204 tgatggtatgcgaatgtctgtctttttgcaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatcacaatgatttat 15105303  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  |||||| ||||||||||||        
T  15105304 gttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaaattt 15105403  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
        | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15105404 cttaacagaatggttggattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacacagacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaa 15105503  T
Q  335 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 434  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||    
T  15105504 caaattactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcatttcctacacaatcaacttcatccatcaaccttgtcatccaaacctcttctctgacactat 15105603  T
Q  435 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aattt 521  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||             |||||    
T  15105604 catttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaataacctaattcttcagcttcatcaacccacataaaaaattt 15105703  T
Q  522 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15105704 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagaaaaaatcagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgtt 15105788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 33600511 - 33599925
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33600511 atgcaaatgtctgtctttttacaatcaaattgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacattgatatctgttgtga 33600412  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnn-gag 240  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||        ||     
T  33600411 aaattcaaggacatatttgatagtattttcactaatttgaggatcgaaaggatggatatgcatataattcaaggaccgatttgattgaattttttttgac 33600312  T
Q  241 agaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaac--------attacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatca 332  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33600311 agaaaggtt-gattcattcattgacaacctcttttcattacaactttacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatca 33600213  T
Q  333 aacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33600212 aacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctgccttcctagacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttccctgcccct 33600113  T
Q  433 atcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc--------------aa 518  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||              ||    
T  33600112 atcatttgccttctctatcaaccttgcatttcttccatgaccatcaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagattcatcaacccacacaaaaaaa 33600013  T
Q  519 tttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  33600012 tttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 33599925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 24 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 6818093 - 6817664
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6818093 tatatgacttatgatggtatgcacatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtctttcactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 6817994  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  6817993 cagtgatatatgttgtgaaaaaccaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaattt 6817894  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6817893 gattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattatatgtacttggcacaatacaatagcattttaaaca 6817794  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6817793 actcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcttacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 6817694  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaa 453  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6817693 tctgcccctatcctttggcttctccatcaa 6817664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 78 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 45045826 - 45045438
Alignment:
Q  78 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45045826 tcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctattgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 45045727  T
Q  178 ttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctcttttta 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||       || | ||  ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  45045726 ttgaagatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcattcattgacaacttcttttca 45045627  T
Q  278 ttacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045626 ttacaacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttc 45045527  T
Q  378 ctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045526 ctacacaatcaactttatccatcaagcttgccctccaaacctcttctttgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 45045438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 78 - 466
Target Start/End: Original strand, 37345137 - 37345525
Alignment:
Q  78 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37345137 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaattcaaggaactatttgatggtattttcactaat 37345236  T
Q  178 ttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctcttttta 277  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||       || | ||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  37345237 ttgaggatcggtatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcagtcattgacaacctcttttca 37345336  T
Q  278 ttacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345337 ttacaacattacatggacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttc 37345436  T
Q  378 ctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345437 ctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccatatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 37345525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 78 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25277698 - 25277302
Alignment:
Q  78 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277698 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 25277599  T
Q  178 ttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctcttttta 277  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||       || | ||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  25277598 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcagtcattgacaacctcttttca 25277499  T
Q  278 ttacaacattaca--------tggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaag 369  Q
    |||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25277498 ttacaacattacaacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaag 25277399  T
Q  370 ctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277398 ctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 25277302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 54 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 46582935 - 46582573
Alignment:
Q  54 gtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggac 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582935 gtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcagatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggac 46582836  T
Q  154 ctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgat 253  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||       || ||||| ||||| |    
T  46582835 ctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggt 46582736  T
Q  254 tcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaata 353  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46582735 tcattcattgacaacctcttttcattacaacaatacatggacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaata 46582636  T
Q  354 tcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46582635 tcttaatcaacctaagctcacttcctacaaaatcaagtttatccatcaaccttgtcctccaaa 46582573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3012830 - 3012516
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3012830 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 3012731  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  3012730 caatgatatctgttgtgaaaatccaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcaatatgatggatatgcatataattcaaggaccaattt 3012631  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |    
T  3012630 gattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctattttcatcacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaata 3012531  T
Q  324 actcaatcaaacaaa 338  Q
    |||||||||||||||    
T  3012530 actcaatcaaacaaa 3012516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31237883 - 31237556
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237883 tatatgacttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttatagtcaaagtgaatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 31237784  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  31237783 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattatcactaatttgaggatcgatataatggatatgcatataattcaaggaccaattt 31237684  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  31237683 gattgaaattttttgatagaagggtttgattcattcattgacaacctctttt--------cattacatggacttggtacaatacaatatcattttaaaca 31237592  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaa 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237591 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaa 31237556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 51895542 - 51895228
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51895542 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatttcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 51895443  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||    
T  51895442 caatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagggccaattt 51895343  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  51895342 gattgaatttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacatgacataatacaataacattttaaaca 51895243  T
Q  324 actcaatcaaacaaa 338  Q
    |||||||||||||||    
T  51895242 actcaatcaaacaaa 51895228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 295
Target Start/End: Original strand, 2870346 - 2870617
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870346 tatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgcatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 2870445  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2870446 caatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaattt 2870545  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggac 295  Q
    |||||||       || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2870546 gattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttcgttacaacattacatggac 2870617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 364 - 615
Target Start/End: Original strand, 37087316 - 37087580
Alignment:
Q  364 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37087316 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcatttggcttctccatcaaccttgcattt 37087415  T
Q  464 cttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatca-------------atttacaattttcaccatcatcctatacaatca 550  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||  |||  || ||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37087416 cttccatgaccagcaccattgttattaaaatagcctcattcctcaacttcatcaacccacacaaaatatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 37087515  T
Q  551 aaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacagtgtt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37087516 aaagacaaaatcagtactatttaaacaaagcattcacacatcacataaccattgttgacagtgtt 37087580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 52642981 - 52642698
Alignment:
Q  54 gtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggac 153  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52642981 gtctttttacaatcaaagtgt--gtcttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggac 52642884  T
Q  154 ctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgat 253  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||  |||  || ||| ||||||||||||       || ||||  |||  ||    
T  52642883 ttatttgatggtattttcactaatttagggatcgatatgatggatagacatgcaatagaaagaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttaaat 52642784  T
Q  254 tcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 339  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  52642783 tcattcattggcaacctcttttcattacaacattacacagacttggcacaatgcaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 52642698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34777514 - 34777338
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777514 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 34777415  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatat 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34777414 cagtgatatctgttatgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatat 34777338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4855343 - 4855167
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4855343 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaattgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatta 4855244  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4855243 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatat 4855167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8168690 - 8168515
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  8168690 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgtttagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 8168591  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggac 217  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  8168590 taattcaatgaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 8168515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 517 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 52642698 - 52642609
Alignment:
Q  517 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  52642698 aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccattgacacatcacataaccattgtt 52642609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9120926 - 9120813
Alignment:
Q  117 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaagga 216  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  9120926 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 9120827  T
Q  217 caaatttgattgaa 230  Q
    | ||| ||||||||    
T  9120826 ccaatgtgattgaa 9120813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 523 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 6817666 - 6817591
Alignment:
Q  523 caattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataa 598  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6817666 caattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaattagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataa 6817591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Original strand, 1443400 - 1443513
Alignment:
Q  117 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaagga 216  Q
    ||||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  1443400 aggattacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 1443499  T
Q  217 caaatttgattgaa 230  Q
    | ||| ||||||||    
T  1443500 ccaatgtgattgaa 1443513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47012326 - 47012213
Alignment:
Q  117 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaagga 216  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||    
T  47012326 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgattgatatgattataattcaagga 47012227  T
Q  217 caaatttgattgaa 230  Q
    | ||| ||||||||    
T  47012226 ccaatgtgattgaa 47012213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 355 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 42558916 - 42558848
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42558916 cttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttgtccatcaaccatgccctccaaacctcttc 42558848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3370035 - 3369967
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3370035 cttaatcaaccaaagctcactccctacgtagtcaactttgtccatcaaccttgtcctccaaacctcttc 3369967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3370422 - 3370338
Alignment:
Q  86 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttt 170  Q
    |||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||   | ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3370422 tttttactttattatgcacatatatgcaccaaggatcacattgacatctgtttaaataattcaaagacttatttgatggtatttt 3370338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Original strand, 51122987 - 51123059
Alignment:
Q  345 ctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 417  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  51122987 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcagttcctaaagtatcaactttgtccatctacctcaccctccaaac 51123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 549 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 34777331 - 34777274
Alignment:
Q  549 caaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  34777331 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 34777274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 395 - 423
Target Start/End: Original strand, 5784211 - 5784239
Alignment:
Q  395 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5784211 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 5784239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 423
Target Start/End: Original strand, 32086009 - 32086073
Alignment:
Q  359 atcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||    
T  32086009 atcaatctaaactcacttactaaacaatcaactttgtccatcaacatttccttccaaaactcttc 32086073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 606
Target Start/End: Original strand, 21841748 - 21842344
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21841748 tatatgacttatgatgatatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttcttcagcaaatgtatgcactaagaatca 21841847  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| |    
T  21841848 cagtgatatctattgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgt 21841947  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  21841948 gattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttgccacaatacaataacattttaaaca 21842047  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21842048 actcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttagtcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctcttc 21842147  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc------- 516  Q
    ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||           
T  21842148 tctgcccctagcatttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccac 21842247  T
Q  517 -------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
           ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  21842248 acaaaaaaatttacaattttcacagttatcctatacaatcaaaagataaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 21842344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 606
Target Start/End: Original strand, 2180533 - 2181113
Alignment:
Q  35 tgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 134  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2180533 tgatggtatgcaaa-gtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcatcaaggatcacagtgatatct 2180631  T
Q  135 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnn 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||        
T  2180632 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattt 2180731  T
Q  235 nnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaa 334  Q
       || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  2180732 tttgacacaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaat-caataacattttaaa--actcaatcaaa 2180828  T
Q  335 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |    
T  2180829 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcgatcaaccttgtcctccaaacctcttctttgcccctgt 2180928  T
Q  435 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aattt 521  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||             |||||    
T  2180929 cctttgacttctccattaaccttgcatttctttcatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcaacttcatcaacccacataaaaaattt 2181028  T
Q  522 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||    
T  2181029 acaattttcaccatcatcttatgcaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaataaaccattcggacatcacataaccattgtt 2181113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 42472841 - 42472265
Alignment:
Q  42 atgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtga 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||| |||    
T  42472841 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttatttttt-ctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatga 42472743  T
Q  142 aaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngaga 241  Q
     |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||       || |    
T  42472742 taattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatatttttgaca 42472643  T
Q  242 gaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaata 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42472642 gaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaata 42472543  T
Q  342 ctcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgg 441  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  42472542 ctcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctagacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttgg 42472443  T
Q  442 cttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa-------------tttacaattt 528  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||              ||||| |||    
T  42472442 cttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaatattacagttt 42472343  T
Q  529 tcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  42472342 tcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 42472265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 243 - 615
Target Start/End: Original strand, 28821360 - 28821745
Alignment:
Q  243 aaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821360 aaatgtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatac 28821459  T
Q  343 tcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggc 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||     
T  28821460 tcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaacctttccctccaaacctcttatatccctctatcctttggt 28821559  T
Q  443 ttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc-------------aatttacaatttt 529  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             |||||||||||||    
T  28821560 ttctccatcaaccttgcatttcttccttgaccaacaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaatttt 28821659  T
Q  530 caccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacagtgtt 615  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28821660 caccatcatcctatgcaatcaatagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgttgacattgtt 28821745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 24 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2853645 - 2853253
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2853645 tatatgacttatgataatatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgcatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 2853546  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2853545 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaagacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaattt 2853446  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
     ||||||       || | ||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  2853445 cattgaaatattttgacataaaggtttggttcattcattgacaatctattttcattacaacattacatggacttggcacattacaatatcattttaaaca 2853346  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 416  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2853345 actcaatcaaacaaaatattcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcttacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 2853253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 41 - 373
Target Start/End: Original strand, 12737869 - 12738200
Alignment:
Q  41 tatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtg 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12737869 tatgcaaatgtctgtctttttataattaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtg 12737968  T
Q  141 aaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngag 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||       ||     
T  12737969 aaaattcaatgacctatttggtggtattttcactaatttgatgatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgac 12738068  T
Q  241 agaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaat 340  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738069 agaatggtttgattcattcatcgacaacctctttttattacaacattacatggacttggcacaat-caatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaat 12738167  T
Q  341 actcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738168 actcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 12738200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 41 - 373
Target Start/End: Original strand, 12800692 - 12801023
Alignment:
Q  41 tatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtg 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12800692 tatgcaaatgtctgtctttttataattaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtg 12800791  T
Q  141 aaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngag 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||       ||     
T  12800792 aaaattcaatgacctatttggtggtattttcactaatttgatgatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgac 12800891  T
Q  241 agaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaat 340  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12800892 agaatggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaat-caatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaat 12800990  T
Q  341 actcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12800991 actcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 12801023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 24 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30465014 - 30464679
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30465014 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttatagtcaaagtgcatgtcttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaaggatca 30464915  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  30464914 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattatcactaattttaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaattt 30464815  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  30464814 gattgaaattttttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttggcacaatacaatatcattttaaaca 30464715  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaa 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30464714 actcaatcaaacaaaatactcctatgaatatcttaa 30464679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32135223 - 32134897
Alignment:
Q  12 atggacatcatctatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatg 111  Q
    ||||||||||  |||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135223 atggacatcaaatatatgacttaggatgttatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatg 32135124  T
Q  112 caccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattc 211  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32135123 caccaaggatcacagtgatctccgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattc 32135024  T
Q  212 aaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaata 311  Q
    |||||| ||||||||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32135023 aaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatcgacttgacacaatacaata 32134924  T
Q  312 gcattttaaacaactcaatcaaacaaa 338  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  32134923 acattttaaacaactcaatcaaacaaa 32134897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 24 - 338
Target Start/End: Original strand, 8540418 - 8540732
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8540418 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatttatgcaccaaggatca 8540517  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||    
T  8540518 caatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggatcaattt 8540617  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  8540618 gattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctattttcattacaacattacatggatttgacacaatacaatagcattttaaaca 8540717  T
Q  324 actcaatcaaacaaa 338  Q
    |||||||||||||||    
T  8540718 actcaatcaaacaaa 8540732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 318 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 18624398 - 18624097
Alignment:
Q  318 taaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 417  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  18624398 taaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaacttcatccatcaaccttgtcatccaaac 18624299  T
Q  418 ctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc- 516  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||     
T  18624298 ctcttctctgacactatcctttggattctctatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttctttagcttcatca 18624199  T
Q  517 ------------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattg 604  Q
                |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18624198 acccacataaaaaatttacaattttcactatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattg 18624099  T
Q  605 tt 606  Q
    ||    
T  18624098 tt 18624097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 322 - 606
Target Start/End: Original strand, 17577011 - 17577309
Alignment:
Q  322 caactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactt-cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 420  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577011 caactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 17577110  T
Q  421 ttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc---- 516  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||        
T  17577111 ttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacc 17577210  T
Q  517 ---------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
             |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  17577211 cacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcatatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaatcattcatacatcaaataaccattgtt 17577309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 322 - 606
Target Start/End: Original strand, 17575700 - 17575998
Alignment:
Q  322 caactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactt-cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 420  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575700 caactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 17575799  T
Q  421 ttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgttttt-aaaatagcctagttctccagcttcatc--- 516  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||       
T  17575800 ttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaaatagcctaattcttcagcttcatcaac 17575899  T
Q  517 ---------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
             |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  17575900 ccacacaaaaatttacaattttcacaatcatcatatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaatcattcatacatcaaataaccattgtt 17575998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 322 - 606
Target Start/End: Original strand, 17574980 - 17575278
Alignment:
Q  322 caactcaatcaaacaaaatactcctatcaatat-cttaatcaacctaagctcactt-cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacct 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17574980 caactcagtcaaacaaa-tactcctatcaatatacttaatcaacctaagctcactttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacct 17575078  T
Q  420 cttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc--- 516  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||       
T  17575079 cttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaac 17575178  T
Q  517 ----------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
              |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  17575179 ccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcatatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaatcattcatacatcaaataaccattgtt 17575278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Original strand, 28821127 - 28821332
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28821127 tatatgacttatgatgatatgcaaatatctgtctttttataatcaaaatgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcatcaaagatca 28821226  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28821227 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgttattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaattt 28821326  T
Q  224 gattga 229  Q
    ||||||    
T  28821327 gattga 28821332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 7268592 - 7268768
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7268592 tatatgacttatgatggtatgtaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 7268691  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7268692 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgttattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatat 7268768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24540568 - 24540425
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24540568 tatatgacttatgatggtatgaaaatgtatgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 24540469  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtat 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24540468 cagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtat 24540425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 462 - 615
Target Start/End: Original strand, 34328108 - 34328274
Alignment:
Q  462 ttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa-------------tttacaattttcaccatcatcctatacaat 548  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34328108 ttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttcctcagcttcatcaacccacacaaaatatttacaattttcaccatcatcctatacaat 34328207  T
Q  549 caaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgttgacagtgtt 615  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34328208 caaaagacaaaatcagtattatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgttgacagtgtt 34328274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41494741 - 41494524
Alignment:
Q  102 caaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatata 201  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |    
T  41494741 caaatatatgcactaaggattacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggaattatttgatggtattttcacaaatttggggatcaatatgatggataga 41494642  T
Q  202 tatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgaca 301  Q
     ||| |||  |||||| |||||||| |||       || | ||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| ||    
T  41494641 catacaatagaaggaccaatttgatggaaagattttgataaaagggttgaattcattcattgacaacctcttttcattactacattacacagacttggca 41494542  T
Q  302 caatgcaatagcatttta 319  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  41494541 caatacaataacatttta 41494524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Original strand, 40781430 - 40781543
Alignment:
Q  117 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaagga 216  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  40781430 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 40781529  T
Q  217 caaatttgattgaa 230  Q
    | ||| ||||||||    
T  40781530 ccaatgtgattgaa 40781543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29621024 - 29620912
Alignment:
Q  117 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaagga 216  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||   | |||||||||||    
T  29621024 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcaaaatgatggatatgattgtaattcaagga 29620925  T
Q  217 caaatttgattga 229  Q
    | ||| |||||||    
T  29620924 ccaatgtgattga 29620912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 355 - 420
Target Start/End: Original strand, 1344283 - 1344348
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 420  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1344283 cttaatcagcctaagctcacttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctc 1344348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 357 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28036443 - 28036377
Alignment:
Q  357 taatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28036443 taatcaatctaagctcacttcctacacaatcaattttgtccatcaaccttgccctccaaacttcttc 28036377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 355 - 416
Target Start/End: Original strand, 18341214 - 18341275
Alignment:
Q  355 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 416  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18341214 cttaatcaatttaagctcacttcctacacaatcaactttgtccatcaacattgccctccaaa 18341275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 1343854 - 1343744
Alignment:
Q  310 tagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 409  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   ||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  1343854 tagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattatgactatcaaaaacttaatcagcataagctcactttctatacaatcaactttgtccatcaaccttgtc 1343755  T
Q  410 ctccaaacctc 420  Q
    || ||||||||    
T  1343754 cttcaaacctc 1343744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Original strand, 27349967 - 27350039
Alignment:
Q  345 ctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 417  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  27349967 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcaattcctaaagtatcaactttgtccatcaacctcaccctccaaac 27350039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 549 - 606
Target Start/End: Original strand, 7268782 - 7268839
Alignment:
Q  549 caaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 606  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7268782 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgtt 7268839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Original strand, 27076733 - 27076817
Alignment:
Q  86 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttt 170  Q
    |||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||||| ||| |||||||   | ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27076733 tttttactttattctgcacatatttgcaccaaggatcacattgacatctgtttaaataattcaatgatttatttgatggtatttt 27076817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 466
Target Start/End: Original strand, 9016 - 9458
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9016 tatatgacttatgatagtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcggcagatgtatgcaccaaggatca 9115  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  9116 cagtgatatctattgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggactaattt 9215  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaaca 323  Q
    |||||||       || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9216 gattgaatttttttgacataagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaaca 9315  T
Q  324 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9316 actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcgatcaaccttgccctccaaacctcttc 9415  T
Q  424 tctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttctt 466  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9416 tctgctcctatcatttggcttctccatcaaccttacatttctt 9458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 107960 - 107376
Alignment:
Q  26 tatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 125  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  107960 tatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaatgatcaca 107861  T
Q  126 gtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttga 225  Q
    ||||| | | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||  || ||| |||||||    
T  107860 gtgatttatattgtgaaaatttaaggacttatttgatggtattttcactaatttagggatcgatatgatggatagacatacaatagaatgaccaatttga 107761  T
Q  226 ttgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttttattacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaac 325  Q
    |||||       || ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||   ||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  107760 ttgaaattttttgacagaagggtt-gattcattcattgacaaccttttttcattactacattacacaaacttggcacaatacaataacattttaaacaac 107662  T
Q  326 tcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctc 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  107661 tcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctcaaaacctcttcgc 107562  T
Q  426 tccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatc--------- 516  Q
    |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||             
T  107561 tgacactatcctttggcttcttcatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattg-ttttaaactaacctagttcttcaacttcatcaacccacac 107463  T
Q  517 ----aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataac 599  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  107462 aaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataac 107376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 24 - 599
Target Start/End: Original strand, 309 - 891
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  309 tatatgactcctgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcggcaaatgtatgcaccaaggatca 408  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |||||    
T  409 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctgtttgatggtatttttactaatttgaggatcgatatg---------catataattcaaggaccaattt 499  T
Q  224 gattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttt----------------tattacaacattacatggacttgacacaatgc 307  Q
    |||||||       || | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||                 |||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  500 gattgaaactttttgacataagggtttgattcattcattgaccacctcttttcattacaacattacaacattacaacattacatgaacttggcacaatag 599  T
Q  308 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||             ||||||||||    
T  600 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcgtaatcaacctaagctgacttcctacaca-------------atcaaccttg 686  T
Q  408 ccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctcc 507  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  687 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttctatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttc 786  T
Q  508 agcttcatc-------------aatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcac 594  Q
    |||||||||             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  787 agcttcatcaactcacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaataagtactatttaaacaaaccattcacacatcac 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 230
Target Start/End: Original strand, 4051 - 4257
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4051 tatatgacttatgatggtataaaaatgtctgtcttttgataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 4150  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  4151 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaattt 4250  T
Q  224 gattgaa 230  Q
    |||||||    
T  4251 gattgaa 4257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 230
Target Start/End: Original strand, 5223 - 5429
Alignment:
Q  24 tatatgacctctgatgatatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 123  Q
    |||||||| | ||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5223 tatatgacttatgatggtataaaaatgtctgtcttttgataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatca 5322  T
Q  124 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaattt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  5323 cagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaattt 5422  T
Q  224 gattgaa 230  Q
    |||||||    
T  5423 gattgaa 5429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 150; Significance: 6e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 164 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 1752 - 1403
Alignment:
Q  164 gtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatatatataattcaaggacaaatttgattgaannnnnnngagagaaatgtttgattcattcattg 263  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||  |||||| |||||||| |||       || |||| || ||||   ||||||||    
T  1752 gtattttcactaatttggagatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgatggaaatattttgatagaa-tggttga---attcattg 1657  T
Q  264 acaacctcttttt-attacaacattacatggacttgacacaatgcaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatca 362  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1656 acaacatctttttcattacaacattacatagacttggcataatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaacatcttaatca 1557  T
Q  363 acctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatt 462  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1556 gcctaaattcacttcctacacaatcaactttatccat--accttgccctccaaacctcttctttgcaagtatcctttgacttctgcatcaaccttgcatt 1459  T
Q  463 tcttacaagaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttctccagcttcatcaa 518  Q
    |||| || |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1458 tcttccatgctcatcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaa 1403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University