View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13396_low_19 (Length: 202)

Name: NF13396_low_19
Description: NF13396
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13396_low_19
NF13396_low_19
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (3-175)||(23889084-23889256)
chr5 (3-175)||(24948975-24949147)
chr5 (3-176)||(25196954-25197127)
chr5 (3-175)||(30931505-30931677)
chr5 (3-175)||(23721107-23721279)
chr5 (3-175)||(24691284-24691456)
chr5 (3-175)||(11547251-11547424)
chr5 (6-184)||(29889986-29890164)
chr5 (31-147)||(2507991-2508107)
chr5 (31-147)||(18378517-18378633)
chr5 (31-147)||(30148955-30149071)
chr5 (47-147)||(30165431-30165531)
chr5 (31-147)||(33513319-33513435)
chr5 (31-147)||(37674580-37674696)
chr5 (47-147)||(3786496-3786596)
chr5 (31-147)||(5634851-5634967)
chr5 (31-147)||(8668577-8668693)
chr5 (47-147)||(9314413-9314513)
chr5 (47-147)||(12129117-12129217)
chr5 (47-147)||(15761978-15762078)
chr5 (47-147)||(18503851-18503951)
chr5 (31-147)||(28646185-28646301)
chr5 (47-147)||(31829541-31829641)
chr5 (31-147)||(32602557-32602673)
chr5 (47-147)||(34613472-34613572)
chr5 (47-147)||(37774083-37774183)
chr5 (47-147)||(6871264-6871364)
chr5 (47-147)||(26477354-26477454)
chr5 (47-147)||(29970194-29970294)
chr5 (47-147)||(30026349-30026449)
chr5 (47-147)||(37361759-37361859)
chr5 (47-147)||(37751938-37752038)
chr5 (47-147)||(40476655-40476755)
chr5 (47-147)||(43075217-43075317)
chr5 (52-147)||(24678378-24678473)
chr5 (52-147)||(24720905-24721000)
chr5 (47-147)||(9551655-9551755)
chr5 (47-147)||(13327924-13328024)
chr5 (47-147)||(18127044-18127144)
chr5 (47-147)||(23002235-23002335)
chr5 (47-147)||(28962901-28963001)
chr5 (47-147)||(31428398-31428498)
chr5 (47-147)||(33289491-33289591)
chr5 (47-147)||(33774428-33774528)
chr5 (47-147)||(41671668-41671768)
chr5 (47-147)||(15661863-15661963)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (3-175)||(16417906-16418078)
chr3 (3-175)||(15895969-15896141)
chr3 (3-184)||(18527200-18527381)
chr3 (3-184)||(16629751-16629932)
chr3 (3-175)||(4884329-4884501)
chr3 (3-175)||(5648631-5648803)
chr3 (3-175)||(35877584-35877756)
chr3 (3-166)||(8304529-8304692)
chr3 (3-174)||(15362612-15362783)
chr3 (3-175)||(4685828-4686000)
chr3 (3-175)||(4799797-4799969)
chr3 (3-175)||(15744343-15744515)
chr3 (3-175)||(8292791-8292964)
chr3 (3-175)||(14450185-14450358)
chr3 (3-175)||(18048079-18048251)
chr3 (31-147)||(20580093-20580209)
chr3 (31-147)||(10393047-10393163)
chr3 (31-147)||(17988185-17988301)
chr3 (31-147)||(18222106-18222222)
chr3 (31-147)||(21671603-21671719)
chr3 (47-147)||(28119202-28119302)
chr3 (47-147)||(31967717-31967817)
chr3 (31-147)||(37000339-37000455)
chr3 (31-147)||(51778914-51779030)
chr3 (47-147)||(4349930-4350030)
chr3 (47-147)||(5463896-5463996)
chr3 (31-147)||(5612550-5612666)
chr3 (47-147)||(18239648-18239748)
chr3 (47-147)||(24325052-24325152)
chr3 (47-147)||(28336217-28336317)
chr3 (47-147)||(29668232-29668332)
chr3 (31-147)||(47020383-47020499)
chr3 (47-147)||(48462826-48462926)
chr3 (52-147)||(11113613-11113708)
chr3 (31-147)||(51794000-51794117)
chr3 (47-147)||(4413830-4413930)
chr3 (47-147)||(5618386-5618486)
chr3 (47-147)||(6544514-6544614)
chr3 (47-147)||(7070124-7070224)
chr3 (47-147)||(18327567-18327667)
chr3 (47-147)||(22874110-22874210)
chr3 (47-147)||(22889169-22889269)
chr3 (47-147)||(50137315-50137415)
chr3 (47-146)||(22390813-22390912)
chr3 (47-147)||(4718524-4718624)
chr3 (47-147)||(4890134-4890234)
chr3 (47-147)||(5010605-5010705)
chr3 (47-147)||(6189209-6189309)
chr3 (47-147)||(7993476-7993576)
chr3 (47-147)||(8208652-8208752)
chr3 (47-147)||(10639984-10640084)
chr3 (47-147)||(18280301-18280401)
chr3 (47-147)||(18295602-18295702)
chr3 (47-147)||(18310903-18311003)
chr3 (47-147)||(28018189-28018289)
chr3 (47-147)||(29151573-29151673)
chr3 (47-147)||(32436068-32436168)
chr3 (59-147)||(20055631-20055719)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (3-184)||(22478622-22478803)
chr6 (3-175)||(24852674-24852846)
chr6 (3-175)||(24307786-24307958)
chr6 (3-186)||(27291387-27291570)
chr6 (3-173)||(23763010-23763180)
chr6 (3-175)||(13302121-13302293)
chr6 (3-175)||(22938021-22938193)
chr6 (3-175)||(23860466-23860638)
chr6 (3-175)||(26985976-26986148)
chr6 (3-162)||(15427487-15427646)
chr6 (3-184)||(12046776-12046957)
chr6 (3-175)||(26996924-26997097)
chr6 (3-175)||(27305521-27305693)
chr6 (3-175)||(20157640-20157812)
chr6 (3-175)||(22175020-22175192)
chr6 (47-147)||(16671073-16671173)
chr6 (47-147)||(4522247-4522347)
chr6 (31-147)||(4727276-4727392)
chr6 (47-147)||(17022208-17022308)
chr6 (31-147)||(26786094-26786210)
chr6 (47-147)||(27004670-27004770)
chr6 (47-147)||(27194443-27194543)
chr6 (47-147)||(27254697-27254797)
chr6 (47-147)||(27482073-27482173)
chr6 (47-147)||(29569951-29570051)
chr6 (47-147)||(30561161-30561261)
chr6 (31-147)||(16947178-16947294)
chr6 (47-147)||(26780768-26780868)
chr6 (47-147)||(26915310-26915410)
chr6 (47-147)||(27041342-27041442)
chr6 (47-147)||(27632877-27632977)
chr6 (47-147)||(29498351-29498451)
chr6 (47-147)||(34452228-34452328)
chr6 (47-147)||(34466516-34466616)
chr6 (47-147)||(4548922-4549022)
chr6 (47-147)||(4769944-4770044)
chr6 (47-147)||(14145255-14145355)
chr6 (47-147)||(26119569-26119669)
chr6 (47-147)||(28204388-28204488)
chr6 (47-147)||(29546425-29546525)
chr6 (47-147)||(16746784-16746884)
[»] scaffold0089 (4 HSPs)
scaffold0089 (3-175)||(43299-43471)
scaffold0089 (3-175)||(9907-10079)
scaffold0089 (3-175)||(26656-26828)
scaffold0089 (3-163)||(50213-50373)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (3-175)||(16506439-16506611)
chr7 (3-175)||(16521533-16521705)
chr7 (3-184)||(16038161-16038342)
chr7 (3-184)||(16453074-16453255)
chr7 (3-175)||(2151429-2151601)
chr7 (3-175)||(10919977-10920149)
chr7 (3-166)||(11427889-11428052)
chr7 (3-175)||(2970327-2970500)
chr7 (31-147)||(3442230-3442346)
chr7 (31-147)||(11438504-11438620)
chr7 (31-147)||(16739534-16739650)
chr7 (31-147)||(16754589-16754705)
chr7 (31-147)||(17520486-17520602)
chr7 (31-147)||(17532613-17532729)
chr7 (31-147)||(26488809-26488925)
chr7 (31-147)||(26540949-26541065)
chr7 (47-147)||(26432219-26432319)
chr7 (47-147)||(31567468-31567568)
chr7 (52-147)||(31090900-31090995)
chr7 (47-147)||(4148233-4148333)
chr7 (47-147)||(5150433-5150533)
chr7 (31-147)||(26322942-26323058)
chr7 (47-147)||(2109962-2110062)
chr7 (47-147)||(2773495-2773595)
chr7 (47-147)||(5118411-5118511)
chr7 (47-147)||(5124934-5125034)
chr7 (47-147)||(31121885-31121985)
chr7 (47-147)||(45384297-45384397)
chr7 (47-147)||(26673008-26673108)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (3-175)||(27437660-27437832)
chr2 (3-184)||(21706387-21706568)
chr2 (3-175)||(28879065-28879237)
chr2 (3-175)||(34304855-34305027)
chr2 (3-175)||(12652394-12652566)
chr2 (3-175)||(20834772-20834944)
chr2 (3-166)||(19459622-19459785)
chr2 (31-147)||(12583772-12583888)
chr2 (31-147)||(12719802-12719918)
chr2 (47-147)||(27800628-27800728)
chr2 (31-147)||(39055009-39055125)
chr2 (31-147)||(39887019-39887135)
chr2 (47-147)||(263958-264058)
chr2 (47-147)||(16832529-16832629)
chr2 (47-147)||(16888852-16888952)
chr2 (47-147)||(19419690-19419790)
chr2 (47-147)||(34283957-34284057)
chr2 (47-147)||(40230444-40230544)
chr2 (31-147)||(9353173-9353289)
chr2 (47-147)||(11638407-11638507)
chr2 (47-147)||(11644596-11644696)
chr2 (31-147)||(13939723-13939839)
chr2 (47-147)||(22929222-22929322)
chr2 (3-147)||(27389887-27390031)
chr2 (47-147)||(27774283-27774383)
chr2 (47-147)||(37372103-37372203)
chr2 (31-147)||(37689085-37689201)
chr2 (31-147)||(37704350-37704466)
chr2 (47-147)||(37922421-37922521)
chr2 (47-147)||(21680393-21680493)
chr2 (47-147)||(27795422-27795522)
chr2 (47-147)||(31873204-31873304)
chr2 (47-147)||(40192753-40192853)
chr2 (47-147)||(32046747-32046847)
chr2 (47-147)||(34276395-34276495)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (3-184)||(1897127-1897308)
chr4 (3-175)||(14661884-14662056)
chr4 (3-174)||(15220905-15221076)
chr4 (3-184)||(15298022-15298203)
chr4 (3-175)||(17010872-17011044)
chr4 (3-162)||(14238728-14238887)
chr4 (31-147)||(18803135-18803251)
chr4 (3-147)||(15394547-15394691)
chr4 (31-147)||(30750688-30750804)
chr4 (47-153)||(14095503-14095609)
chr4 (47-147)||(6566812-6566912)
chr4 (47-147)||(18120088-18120188)
chr4 (31-147)||(27169160-27169276)
chr4 (47-147)||(31129720-31129820)
chr4 (47-147)||(36347722-36347822)
chr4 (47-147)||(5002857-5002957)
chr4 (47-147)||(54830399-54830499)
chr4 (47-147)||(14766511-14766611)
chr4 (47-147)||(19370226-19370326)
chr4 (47-147)||(24595535-24595635)
chr4 (47-147)||(34192164-34192264)
chr4 (47-147)||(40108841-40108941)
chr4 (52-147)||(33680552-33680647)
chr4 (47-147)||(21966670-21966770)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (3-184)||(17259-17440)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (3-175)||(24149-24321)
scaffold0143 (47-147)||(15955-16055)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (3-175)||(21375726-21375898)
chr8 (3-175)||(27612091-27612263)
chr8 (3-175)||(33243702-33243874)
chr8 (3-166)||(16280316-16280479)
chr8 (3-175)||(16274395-16274567)
chr8 (3-175)||(2140445-2140618)
chr8 (3-175)||(14554483-14554656)
chr8 (3-175)||(19666021-19666193)
chr8 (31-147)||(19507101-19507217)
chr8 (31-147)||(19521979-19522095)
chr8 (31-147)||(19671386-19671502)
chr8 (3-147)||(22086169-22086313)
chr8 (47-147)||(19211522-19211622)
chr8 (47-147)||(3332675-3332775)
chr8 (47-147)||(19281651-19281751)
chr8 (47-147)||(28365138-28365238)
chr8 (31-147)||(33255649-33255765)
chr8 (113-175)||(19660106-19660168)
chr8 (47-147)||(12095899-12095999)
chr8 (47-147)||(18707526-18707626)
chr8 (47-147)||(31492912-31493012)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (3-175)||(16211195-16211367)
chr1 (3-184)||(20457953-20458135)
chr1 (3-184)||(20341864-20342045)
chr1 (31-147)||(28581912-28582028)
chr1 (47-147)||(10940430-10940530)
chr1 (47-147)||(10959622-10959722)
chr1 (47-147)||(41796505-41796605)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (3-184)||(18429-18610)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (3-184)||(4187-4368)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (3-163)||(3369-3529)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (10-166)||(51507-51670)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (31-147)||(18144-18260)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (47-147)||(5177-5277)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (47-147)||(17089-17189)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (52-178)||(10448-10575)
[»] scaffold0354 (1 HSPs)
scaffold0354 (3-72)||(18108-18177)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (47-147)||(458-558)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (47-147)||(4886-4986)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23889256 - 23889084
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23889256 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaaatctctcaaactaac 23889157  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23889156 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacccgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 23889084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24949147 - 24948975
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24949147 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaaatctctcaaactaac 24949048  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24949047 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcctacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 24948975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25197127 - 25196954
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25197127 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacttgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 25197028  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25197027 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcctcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgtt 25196954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30931677 - 30931505
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30931677 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacccgtttgattcttcaccttgagtgccaaatctctcaaactaac 30931578  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30931577 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 30931505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 23721107 - 23721279
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23721107 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacccgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 23721206  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23721207 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 23721279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 24691284 - 24691456
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24691284 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 24691383  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  24691384 caaatcaacctccttgaacatgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtgtttaatttgt 24691456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11547424 - 11547251
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11547424 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 11547325  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaag-tttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11547324 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagctttttaatttgt 11547251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Original strand, 29889986 - 29890164
Alignment:
Q  6 cttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaa 105  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  29889986 cttcaacattggtctggagaatagtgagcaaaccaccatatcggagtcgaaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaagctaaccaa 29890085  T
Q  106 atcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29890086 atcaacctccttgcacttgtaggatttagtcttcttcataccagtaatgtttacaaagtttttaatttgtctagtcctt 29890164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2508107 - 2507991
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  2508107 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacctccttgaacttgtagcac 2508008  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  2508007 ttagtcttcttcatacc 2507991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 18378517 - 18378633
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  18378517 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 18378616  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  18378617 ttagtcttcttcatacc 18378633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30149071 - 30148955
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  30149071 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 30148972  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  30148971 ttagtcttcttcatacc 30148955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30165531 - 30165431
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30165531 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacctccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 30165432  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  30165431 c 30165431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33513435 - 33513319
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  33513435 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 33513336  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  33513335 ttagtcttcttcatacc 33513319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 37674580 - 37674696
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  37674580 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 37674679  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  37674680 ttagtcttcttcatacc 37674696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3786596 - 3786496
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3786596 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 3786497  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  3786496 c 3786496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5634967 - 5634851
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |     
T  5634967 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 5634868  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  5634867 ttagtcttcttcatacc 5634851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 8668577 - 8668693
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |     
T  8668577 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttatagcac 8668676  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  8668677 ttagtcttcttcatacc 8668693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9314513 - 9314413
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9314513 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 9314414  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  9314413 c 9314413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12129217 - 12129117
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12129217 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 12129118  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  12129117 c 12129117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 15761978 - 15762078
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15761978 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 15762077  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  15762078 c 15762078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 18503851 - 18503951
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18503851 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 18503950  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  18503951 c 18503951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28646301 - 28646185
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  28646301 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 28646202  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    || ||||||||||||||    
T  28646201 ttggtcttcttcatacc 28646185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 31829541 - 31829641
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31829541 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 31829640  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  31829641 c 31829641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 32602557 - 32602673
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| || |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  32602557 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccccgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 32602656  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  32602657 ttagtcttcttcatacc 32602673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 34613572 - 34613472
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34613572 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 34613473  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  34613472 c 34613472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 37774083 - 37774183
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37774083 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 37774182  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  37774183 c 37774183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6871364 - 6871264
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  6871364 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttggtcttcttcatac 6871265  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  6871264 c 6871264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26477454 - 26477354
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26477454 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagggccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 26477355  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  26477354 c 26477354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 29970194 - 29970294
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29970194 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagcgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 29970293  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  29970294 c 29970294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30026449 - 30026349
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30026449 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagcgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 30026350  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  30026349 c 30026349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 37361759 - 37361859
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37361759 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagcgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 37361858  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  37361859 c 37361859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37752038 - 37751938
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37752038 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagcgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 37751939  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  37751938 c 37751938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 40476655 - 40476755
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40476655 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 40476754  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  40476755 c 40476755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43075317 - 43075217
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43075317 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttctttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 43075218  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  43075217 c 43075217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24678473 - 24678378
Alignment:
Q  52 tcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24678473 tcggaaccctgtttgactcttgaccttgagcgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatacc 24678378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24721000 - 24720905
Alignment:
Q  52 tcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24721000 tcggaaccctgtttgactcttgaccttgagcgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatacc 24720905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 9551655 - 9551755
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9551655 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 9551754  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  9551755 c 9551755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 13327924 - 13328024
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13327924 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 13328023  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  13328024 c 13328024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 18127044 - 18127144
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18127044 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 18127143  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  18127144 c 18127144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 23002235 - 23002335
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23002235 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 23002334  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  23002335 c 23002335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 28962901 - 28963001
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28962901 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 28963000  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  28963001 c 28963001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31428498 - 31428398
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31428498 cggagtcggaaccctgtttggctcttgaccttgagcgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 31428399  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  31428398 c 31428398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33289591 - 33289491
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33289591 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 33289492  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  33289491 c 33289491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33774528 - 33774428
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33774528 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 33774429  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  33774428 c 33774428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 41671768 - 41671668
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41671768 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 41671669  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  41671668 c 41671668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 15661863 - 15661963
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  15661863 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtaacacttagtcttcttcatac 15661962  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  15661963 c 15661963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 16417906 - 16418078
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16417906 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaaatctctcaaactaac 16418005  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16418006 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 16418078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 15895969 - 15896141
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15895969 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 15896068  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15896069 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 15896141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18527381 - 18527200
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18527381 tctcttcaacattggtctggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 18527282  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18527281 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgtctagtcctt 18527200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 16629751 - 16629932
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  16629751 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaactctctcaaactacc 16629850  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  16629851 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgcctagtcctt 16629932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4884501 - 4884329
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4884501 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggaatcggaaacccgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 4884402  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4884401 caaatcaacctccttgaacttgtaggacttagtcttctttatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 4884329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 5648803 - 5648631
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5648803 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacccgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 5648704  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5648703 caaatcaacctccttgaacttgtaggacttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 5648631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 35877756 - 35877584
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35877756 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 35877657  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  35877656 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 35877584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 8304529 - 8304692
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8304529 tctcttcaacattagttcggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaaatctctcaaactaac 8304628  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagttt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8304629 caaatcaacctccttgaacttgtaggacttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagttt 8304692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Original strand, 15362612 - 15362783
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15362612 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcgaaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 15362711  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15362712 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttg 15362783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4686000 - 4685828
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  4686000 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaacataccggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaaccaac 4685901  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4685900 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 4685828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 4799797 - 4799969
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4799797 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacccgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 4799896  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4799897 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 4799969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 15744343 - 15744515
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15744343 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaattctctcaaactaac 15744442  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15744443 caaatcaacctccttgaacctgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 15744515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 8292964 - 8292791
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8292964 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 8292865  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaag-tttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8292864 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagctttttaatttgt 8292791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 14450185 - 14450358
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14450185 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 14450284  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaag-tttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14450285 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagctttttaatttgt 14450358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18048251 - 18048079
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  18048251 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttggttcttaaccttgagtgccaattccctcaaactaac 18048152  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18048151 caaatcaacttccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 18048079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 20580093 - 20580209
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  20580093 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacctccttgaacttgtagcac 20580192  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  20580193 ttagtcttcttcatacc 20580209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10393163 - 10393047
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  10393163 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgctaactctctcaaactaaccaaatccacctccttgaacttgtagcac 10393064  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  10393063 ttagtcttcttcatacc 10393047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 17988185 - 17988301
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  17988185 aagcaatcccccatatcggagtcggaatcctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 17988284  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  17988285 ttagtcttcttcatacc 17988301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18222222 - 18222106
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  18222222 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 18222123  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  18222122 ttagtcttcttcatacc 18222106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21671719 - 21671603
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  21671719 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 21671620  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  21671619 ttagtcttcttcatacc 21671603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 28119202 - 28119302
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28119202 cggagtcggaaacctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 28119301  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  28119302 c 28119302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 31967717 - 31967817
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31967717 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacctccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 31967816  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  31967817 c 31967817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 37000339 - 37000455
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  37000339 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 37000438  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  37000439 ttagtcttcttcatacc 37000455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 51779030 - 51778914
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  51779030 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 51778931  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  51778930 ttagtcttcttcatacc 51778914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 4349930 - 4350030
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4349930 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 4350029  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  4350030 c 4350030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5463996 - 5463896
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5463996 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 5463897  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  5463896 c 5463896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 5612550 - 5612666
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  5612550 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 5612649  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  5612650 ttagtcttcttcatacc 5612666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18239748 - 18239648
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18239748 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 18239649  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  18239648 c 18239648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24325152 - 24325052
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24325152 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 24325053  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  24325052 c 24325052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28336317 - 28336217
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28336317 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatctacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 28336218  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  28336217 c 28336217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 29668232 - 29668332
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  29668232 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacctccttgaacttgtagcacctagtcttcttcatac 29668331  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  29668332 c 29668332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 47020499 - 47020383
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  47020499 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 47020400  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    || ||||||||||||||    
T  47020399 ttggtcttcttcatacc 47020383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 48462926 - 48462826
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48462926 cggagtcggaaccctatttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacctccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 48462827  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  48462826 c 48462826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Original strand, 11113613 - 11113708
Alignment:
Q  52 tcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11113613 tcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatacc 11113708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 51794117 - 51794000
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctcc-ttgaacttgtagga 129  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |    
T  51794117 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttcctttgaacttgtagca 51794018  T
Q  130 tttagtcttcttcatacc 147  Q
     |||||||||||||||||    
T  51794017 cttagtcttcttcatacc 51794000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4413930 - 4413830
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  4413930 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttggtcttcttcatac 4413831  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  4413830 c 4413830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 5618386 - 5618486
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  5618386 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcactttgtcttcttcatac 5618485  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  5618486 c 5618486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 6544514 - 6544614
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6544514 cggagtcggaatcctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 6544613  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  6544614 c 6544614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7070224 - 7070124
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7070224 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 7070125  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  7070124 c 7070124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18327667 - 18327567
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18327667 cggagtcggaaacctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 18327568  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  18327567 c 18327567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 22874110 - 22874210
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22874110 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgctaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 22874209  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  22874210 c 22874210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 22889169 - 22889269
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22889169 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgctaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 22889268  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  22889269 c 22889269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 50137315 - 50137415
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50137315 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 50137414  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  50137415 c 50137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 146
Target Start/End: Original strand, 22390813 - 22390912
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22390813 cggagtcggaaccctgtttgattcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 22390912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4718624 - 4718524
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4718624 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 4718525  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  4718524 c 4718524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4890234 - 4890134
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4890234 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 4890135  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  4890134 c 4890134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5010705 - 5010605
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5010705 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccagatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 5010606  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  5010605 c 5010605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6189309 - 6189209
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6189309 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 6189210  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  6189209 c 6189209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7993576 - 7993476
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7993576 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccagatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 7993477  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  7993476 c 7993476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8208752 - 8208652
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8208752 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 8208653  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  8208652 c 8208652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10640084 - 10639984
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10640084 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccagatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 10639985  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  10639984 c 10639984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 18280301 - 18280401
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18280301 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 18280400  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  18280401 c 18280401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 18295602 - 18295702
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18295602 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 18295701  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  18295702 c 18295702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 18310903 - 18311003
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18310903 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 18311002  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  18311003 c 18311003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28018289 - 28018189
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  28018289 cggagtcggaaccctgtttgcctcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttggtcttcttcatac 28018190  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  28018189 c 28018189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 29151573 - 29151673
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29151573 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 29151672  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  29151673 c 29151673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32436168 - 32436068
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32436168 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 32436069  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  32436068 c 32436068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20055719 - 20055631
Alignment:
Q  59 cctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacc 147  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20055719 cctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatacc 20055631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 22478622 - 22478803
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22478622 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacgtgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 22478721  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22478722 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttttaatttgtctagtcctt 22478803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24852846 - 24852674
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24852846 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 24852747  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24852746 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 24852674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 24307786 - 24307958
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24307786 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 24307885  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24307886 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 24307958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 27291387 - 27291570
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||    
T  27291387 tctcttcaacattagtccggagaataggaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtctgattcttgaccttaagtgccaattctctcaaaccaac 27291486  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctttg 186  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27291487 caaatcaacctctttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtagtgtttacaaagtttttaatttgtctaatcctttg 27291570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23763180 - 23763010
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23763180 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaatcaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgacaaatctctcaaactaac 23763081  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaattt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23763080 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaattt 23763010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 13302121 - 13302293
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13302121 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacccgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 13302220  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13302221 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 13302293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 22938021 - 22938193
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||    
T  22938021 tctcttcaacattagtccggagaatagcaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttggttcttaaccttgagtgctaattccctcaaactaac 22938120  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22938121 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 22938193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 23860466 - 23860638
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||    
T  23860466 tctcttcaacattagtccggagaatagcaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttggttcttaaccttgagtgctaattccctcaaactaac 23860565  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23860566 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 23860638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26986148 - 26985976
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26986148 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagccaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 26986049  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26986048 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 26985976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 162
Target Start/End: Original strand, 15427487 - 15427646
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15427487 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacccgtttgattcttcaccttgagtgccaaatctctcaaactaac 15427586  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15427587 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaa 15427646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 12046776 - 12046957
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  12046776 tctcttcaacattggtccgaagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgtcaattctctcaaactaac 12046875  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  12046876 caaatcaacctctttgaacttgtaggatttagttttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgtccagtcctt 12046957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26997097 - 26996924
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26997097 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatactggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 26996998  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaag-tttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26996997 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagctttttaatttgt 26996924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 27305521 - 27305693
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| || ||||||| |||    
T  27305521 tctcttcaacattagtccggagaataggaagcaaaccaccgtatcggagtcggaaacctgtctgattcttgaccttaagtgccaattccctcaaaccaac 27305620  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27305621 caaatcaacctctttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatggttacaaagtttttaatttgt 27305693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20157812 - 20157640
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||    
T  20157812 tctcttccacattggtacggagaatagtaagtaaaccaccatatcggagtcgaaaaccggtttgattcttaaccttgagtgctaattccctcaaactaac 20157713  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20157712 caaatcaacctctttgaacttgtaggacttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 20157640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 22175020 - 22175192
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||    
T  22175020 tctcttccacattggtacggagaatagtaagtaaaccaccatatcggagtcgaaaaccggtttgattcttaaccttgagtgctaattccctcaaactaac 22175119  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22175120 caaatcaacctctttgaacttgtaggacttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 22175192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16671173 - 16671073
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16671173 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacctccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 16671074  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  16671073 c 16671073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4522347 - 4522247
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4522347 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 4522248  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  4522247 c 4522247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 4727276 - 4727392
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  4727276 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 4727375  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  4727376 ttagtcttcttcatacc 4727392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17022308 - 17022208
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17022308 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 17022209  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  17022208 c 17022208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26786210 - 26786094
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  26786210 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 26786111  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  26786110 ttagtcttcttcatacc 26786094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27004770 - 27004670
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27004770 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 27004671  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  27004670 c 27004670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27194543 - 27194443
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27194543 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 27194444  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  27194443 c 27194443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 27254697 - 27254797
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27254697 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 27254796  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  27254797 c 27254797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27482173 - 27482073
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27482173 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 27482074  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  27482073 c 27482073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29570051 - 29569951
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29570051 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 29569952  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  29569951 c 29569951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 30561161 - 30561261
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30561161 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 30561260  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  30561261 c 30561261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 16947178 - 16947294
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  16947178 aagcaatcccccgtaccggagtcggaaccctgtttgactctcgaccttgagtgccaactctctcaagctaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 16947277  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  16947278 ttagtcttcttcatacc 16947294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 26780768 - 26780868
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  26780768 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcactttgtcttcttcatac 26780867  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  26780868 c 26780868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26915410 - 26915310
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26915410 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcatttagtcttcttcatac 26915311  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  26915310 c 26915310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27041442 - 27041342
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27041442 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttctttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 27041343  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  27041342 c 27041342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 27632877 - 27632977
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27632877 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttaagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 27632976  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  27632977 c 27632977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29498451 - 29498351
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  29498451 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcactttgtcttcttcatac 29498352  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  29498351 c 29498351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 34452228 - 34452328
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34452228 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttaagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 34452327  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  34452328 c 34452328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 34466516 - 34466616
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34466516 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttaagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 34466615  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  34466616 c 34466616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 4548922 - 4549022
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4548922 cggagtcggaaccctgtttggctcttgaccttgagcgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 4549021  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  4549022 c 4549022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4770044 - 4769944
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4770044 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 4769945  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  4769944 c 4769944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 14145255 - 14145355
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14145255 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 14145354  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  14145355 c 14145355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 26119569 - 26119669
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26119569 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 26119668  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  26119669 c 26119669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28204488 - 28204388
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28204488 cggagtcggaaccctgtttggctcttgaccttgagcgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 28204389  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  28204388 c 28204388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29546525 - 29546425
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29546525 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 29546426  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  29546425 c 29546425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16746884 - 16746784
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16746884 cggagtcggaaccttgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 16746785  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  16746784 c 16746784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 43299 - 43471
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43299 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaactctctcaaactaac 43398  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43399 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 43471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 9907 - 10079
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9907 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacccgtttgattcttaaccttgagtgccaactctctcaaactaac 10006  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10007 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 10079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26828 - 26656
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  26828 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgcaaattctctcaaactaac 26729  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26728 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 26656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 50213 - 50373
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  50213 tctcttcgacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaaataac 50312  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaag 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  50313 caaatcgacctccttgaacttgtaggatttagtgtttttcatacctgtaatgtttacaaag 50373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 16506439 - 16506611
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16506439 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaaatctctcaaactaac 16506538  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  16506539 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagttttgaatttgt 16506611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 16521533 - 16521705
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16521533 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagttggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaaatctctcaaactaac 16521632  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16521633 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 16521705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16038342 - 16038161
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16038342 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 16038243  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  16038242 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgtccagtcctt 16038161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 16453074 - 16453255
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16453074 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 16453173  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  16453174 caaatcaacctccttaaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaattcgtctagtcctt 16453255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 2151601 - 2151429
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2151601 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 2151502  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2151501 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 2151429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 10919977 - 10920149
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10919977 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 10920076  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10920077 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 10920149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 11427889 - 11428052
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11427889 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 11427988  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagttt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11427989 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagttt 11428052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 2970500 - 2970327
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2970500 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 2970401  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaag-tttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2970400 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagctttttaatttgt 2970327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3442346 - 3442230
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  3442346 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 3442247  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  3442246 ttagtcttcttcatacc 3442230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11438620 - 11438504
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  11438620 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 11438521  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  11438520 ttagtcttcttcatacc 11438504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 16739534 - 16739650
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  16739534 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 16739633  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  16739634 ttagtcttcttcatacc 16739650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 16754589 - 16754705
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  16754589 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 16754688  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  16754689 ttagtcttcttcatacc 16754705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17520602 - 17520486
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  17520602 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 17520503  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  17520502 ttagtcttcttcatacc 17520486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 17532613 - 17532729
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  17532613 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 17532712  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  17532713 ttagtcttcttcatacc 17532729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 26488809 - 26488925
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  26488809 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 26488908  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  26488909 ttagtcttcttcatacc 26488925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 26540949 - 26541065
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  26540949 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 26541048  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  26541049 ttagtcttcttcatacc 26541065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26432319 - 26432219
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26432319 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactgaccaaatccacctccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 26432220  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  26432219 c 26432219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 31567468 - 31567568
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31567468 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 31567567  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  31567568 c 31567568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Original strand, 31090900 - 31090995
Alignment:
Q  52 tcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31090900 tcggaaacctgtttgactcctgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatacc 31090995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 4148233 - 4148333
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  4148233 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttggtcttcttcatac 4148332  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  4148333 c 4148333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 5150433 - 5150533
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5150433 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgtcaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 5150532  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  5150533 c 5150533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 26322942 - 26323058
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  26322942 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgtctcttgaccttgagcgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 26323041  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  26323042 ttagtcttcttcatacc 26323058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 2109962 - 2110062
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2109962 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 2110061  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  2110062 c 2110062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2773595 - 2773495
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2773595 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 2773496  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  2773495 c 2773495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5118511 - 5118411
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5118511 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 5118412  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  5118411 c 5118411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5125034 - 5124934
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5125034 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 5124935  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  5124934 c 5124934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31121985 - 31121885
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31121985 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 31121886  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  31121885 c 31121885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 45384397 - 45384297
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45384397 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccagatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 45384298  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  45384297 c 45384297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 26673008 - 26673108
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26673008 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaaccctctcaaaccaaccagatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 26673107  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  26673108 c 26673108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 27437660 - 27437832
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27437660 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccgtatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 27437759  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27437760 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 27437832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 21706387 - 21706568
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21706387 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 21706486  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  21706487 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgtccagtcctt 21706568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28879237 - 28879065
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28879237 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 28879138  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28879137 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 28879065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 34304855 - 34305027
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34304855 tctcttcaacatgagtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 34304954  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34304955 caaatcaacttccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 34305027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12652566 - 12652394
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12652566 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacccgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 12652467  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12652466 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 12652394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20834944 - 20834772
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20834944 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaagccaccataccggagtcggaaacccgtttgattcttcaccttgagtgccaaatctctcaaactaac 20834845  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20834844 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctataatgtttacaaagtttttaatttgt 20834772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 19459622 - 19459785
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19459622 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 19459721  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagttt 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19459722 caaatcaacctccttgaatttgtaggattttgtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagttt 19459785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12583888 - 12583772
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  12583888 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 12583789  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  12583788 ttagtcttcttcatacc 12583772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 12719802 - 12719918
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  12719802 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 12719901  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  12719902 ttagtcttcttcatacc 12719918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27800728 - 27800628
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27800728 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacctccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 27800629  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  27800628 c 27800628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 39055009 - 39055125
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  39055009 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 39055108  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  39055109 ttagtcttcttcatacc 39055125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39887135 - 39887019
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  39887135 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 39887036  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  39887035 ttagtcttcttcatacc 39887019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 263958 - 264058
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  263958 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 264057  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  264058 c 264058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 16832529 - 16832629
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16832529 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 16832628  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  16832629 c 16832629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16888952 - 16888852
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16888952 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 16888853  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  16888852 c 16888852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 19419690 - 19419790
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19419690 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 19419789  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  19419790 c 19419790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 34284057 - 34283957
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34284057 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 34283958  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  34283957 c 34283957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40230544 - 40230444
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40230544 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 40230445  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  40230444 c 40230444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 9353173 - 9353289
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |     
T  9353173 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 9353272  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  9353273 ttagtcttcttcatacc 9353289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 11638407 - 11638507
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11638407 cggagtcggaaccctgtttgactcttgactttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 11638506  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  11638507 c 11638507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 11644596 - 11644696
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11644596 cggagtcggaaccctgtttgactcttgactttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 11644695  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  11644696 c 11644696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 13939723 - 13939839
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| |  |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  13939723 aagcaatcccccatatcggagtcggaacctcgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatctacttccttgaacttgtagcac 13939822  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  13939823 ttagtcttcttcatacc 13939839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 22929222 - 22929322
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22929222 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 22929321  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  22929322 c 22929322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27390031 - 27389887
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| || | |||||||||| |||||| || || || |||||    
T  27390031 tctcttcaacattggtccggagaatgctaagcaaaccaccatatcggagttggaaaccggttggacttttaaccttgagtgccaactcccttaagctaac 27389932  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27389931 caaatccacttctttgaatttgtaggacttagttttcttcatacc 27389887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27774383 - 27774283
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27774383 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 27774284  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  27774283 c 27774283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37372203 - 37372103
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37372203 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttctttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 37372104  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  37372103 c 37372103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 37689085 - 37689201
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| |     
T  37689085 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccagatccacttccttgaacttgtagcac 37689184  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  37689185 ttagtcttcttcatacc 37689201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 37704350 - 37704466
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| |     
T  37704350 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccagatccacttccttgaacttgtagcac 37704449  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  37704450 ttagtcttcttcatacc 37704466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37922521 - 37922421
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37922521 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaagctaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 37922422  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  37922421 c 37922421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 21680393 - 21680493
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21680393 cggagtcggaaccctgtttgacttttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 21680492  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  21680493 c 21680493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27795522 - 27795422
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27795522 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 27795423  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  27795422 c 27795422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31873304 - 31873204
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31873304 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccagatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 31873205  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  31873204 c 31873204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 40192753 - 40192853
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40192753 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 40192852  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  40192853 c 40192853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32046847 - 32046747
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  || || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32046847 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagagctaactctctcacactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 32046748  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  32046747 c 32046747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 34276495 - 34276395
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34276495 cggagtcggaaccctgtttgacttttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 34276396  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  34276395 c 34276395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1897308 - 1897127
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1897308 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 1897209  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  1897208 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgtccagtcctt 1897127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14662056 - 14661884
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14662056 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 14661957  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14661956 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 14661884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15221076 - 15220905
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15221076 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctctcaaactaac 15220977  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15220976 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttg 15220905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 15298022 - 15298203
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15298022 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaagcttgagtgccaattctctcaaactaac 15298121  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  15298122 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcacacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgcctagtcctt 15298203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17011044 - 17010872
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17011044 tctcttcaacattagtccgaagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 17010945  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17010944 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 17010872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 162
Target Start/End: Original strand, 14238728 - 14238887
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||||| || ||  ||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  14238728 tctcttcgacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcagagtcggaacccggtcggattcttaaccttgagtgctaactctcttaagctaac 14238827  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14238828 caaatcaacctccttgaacttgtaggacttagtcttcttcatacctgcaatgtttacaaa 14238887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 18803135 - 18803251
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  18803135 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacctccttgaacttgtagcac 18803234  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  18803235 ttagtcttcttcatacc 18803251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 15394547 - 15394691
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || | |||||||||| |||||| || || || |||||    
T  15394547 tctcttcaacattggtccggagaatgctaagcaaaccaccatatcggagtcggaaaccggttggacttttaaccttgagtgccaactcccttaagctaac 15394646  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacc 147  Q
     ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15394647 aaaatccacttccttgaatttgtaggacttagtcttcttcatacc 15394691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30750804 - 30750688
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  30750804 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 30750705  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  30750704 ttagtcttcttcatacc 30750688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14095609 - 14095503
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14095609 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 14095510  T
Q  147 cggtaat 153  Q
    | |||||    
T  14095509 ctgtaat 14095503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6566912 - 6566812
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6566912 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 6566813  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  6566812 c 6566812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 18120088 - 18120188
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18120088 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 18120187  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  18120188 c 18120188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27169276 - 27169160
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  27169276 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgactttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 27169177  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  27169176 ttagtcttcttcatacc 27169160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 31129720 - 31129820
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31129720 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 31129819  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  31129820 c 31129820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 36347722 - 36347822
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36347722 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 36347821  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  36347822 c 36347822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5002957 - 5002857
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5002957 cggagtcggaaccctgtttgactcttgactttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 5002858  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  5002857 c 5002857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 54830499 - 54830399
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  54830499 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttggtcttcttcatac 54830400  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  54830399 c 54830399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 14766511 - 14766611
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14766511 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 14766610  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  14766611 c 14766611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19370326 - 19370226
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19370326 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 19370227  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  19370226 c 19370226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 24595535 - 24595635
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24595535 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 24595634  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  24595635 c 24595635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 34192164 - 34192264
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34192164 cggagtcgaaaacctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 34192263  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  34192264 c 34192264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 40108841 - 40108941
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40108841 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaaccctctcaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 40108940  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  40108941 c 40108941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Original strand, 33680552 - 33680647
Alignment:
Q  52 tcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33680552 tcggaaccctgtttgactcttgaccttgagcgccaactctctcaaactaaccgaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatacc 33680647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21966770 - 21966670
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  || || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21966770 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagagctaactctctcacactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 21966671  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  21966670 c 21966670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17440 - 17259
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17440 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgattgccaattctctcaaactaac 17341  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17340 caagtcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagttttttatttgtctagtcctt 17259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24321 - 24149
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24321 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacccgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 24222  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24221 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 24149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16055 - 15955
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  16055 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttggtcttcttcatac 15956  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  15955 c 15955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 21375726 - 21375898
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21375726 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 21375825  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21375826 gaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 21375898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 27612091 - 27612263
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27612091 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacccgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 27612190  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27612191 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 27612263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33243874 - 33243702
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33243874 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatactggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 33243775  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33243774 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 33243702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16280479 - 16280316
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  16280479 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgtcaattctctcaaactaac 16280380  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagttt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16280379 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagttt 16280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16274567 - 16274395
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16274567 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatactggagtcggaaacctgtttcattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 16274468  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16274467 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 16274395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 2140445 - 2140618
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  2140445 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttcagtgccaactctctcaaactaac 2140544  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaag-tttctaatttgt 175  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2140545 caagtcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagctttttaatttgt 2140618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14554656 - 14554483
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14554656 tctcttcgacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattcttcaccttgagtgccaactctctcaaactaac 14554557  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaag-tttctaatttgt 175  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14554556 caagtcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagctttttaatttgt 14554483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19666193 - 19666021
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  19666193 tctcttcaacattagtctggagaatagtaagcacaccaccataccggagtcggaaacccgtttgattcttcaccttcagtgccaactctctcaaactaac 19666094  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19666093 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 19666021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 19507101 - 19507217
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  19507101 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 19507200  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  19507201 ttagtcttcttcatacc 19507217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19522095 - 19521979
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  19522095 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 19521996  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  19521995 ttagtcttcttcatacc 19521979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19671502 - 19671386
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  19671502 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 19671403  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  19671402 ttagtcttcttcatacc 19671386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 22086169 - 22086313
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || | |||||||||| |||| | || || || |||||    
T  22086169 tctcttcaacattggtccggagaatgctaagcaaaccaccatatcggagtcggaaaccggttggacttttaaccttgagtgccgactcccttaagctaac 22086268  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22086269 caaatccacttccttgaatttgtaggacttagtcttcttcatacc 22086313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 19211522 - 19211622
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19211522 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 19211621  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  19211622 c 19211622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 3332675 - 3332775
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3332675 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactgaccaaatctacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 3332774  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  3332775 c 3332775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 19281651 - 19281751
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  19281651 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttggtcttcttcatac 19281750  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  19281751 c 19281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 28365138 - 28365238
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28365138 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcagactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 28365237  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  28365238 c 28365238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33255765 - 33255649
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  33255765 aagcaatcccccgtaccggagtcggaaccctgtttgacccttgaccttgagtgccaactctctcaagctaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 33255666  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  33255665 ttagtcttcttcatacc 33255649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 175
Target Start/End: Original strand, 19660106 - 19660168
Alignment:
Q  113 tccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19660106 tccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 19660168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 12095899 - 12095999
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12095899 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagcgccaactctcttaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 12095998  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  12095999 c 12095999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18707626 - 18707526
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18707626 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 18707527  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  18707526 c 18707526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 31492912 - 31493012
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31492912 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccagatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 31493011  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  31493012 c 31493012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 16211195 - 16211367
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  16211195 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttaagtgccaattctctcaaactaac 16211294  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgt 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16211295 caaatcaacctccttgaatttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtttttaatttgt 16211367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20458135 - 20457953
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20458135 tctcttcaacattggtccggagaatagtgagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattcttaactttgagtgccaactctctcaaactaac 20458036  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggt-aatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  20458035 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaaatgtttacaaagtttttaatttgcctagtcctt 20457953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 20341864 - 20342045
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  20341864 tctcttcaacattggtccgaagaatagtaagcaaaccaccacatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctttcaaactaac 20341963  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  20341964 caaatcaacctctttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtctttaatttgtctagtcctt 20342045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28582028 - 28581912
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  28582028 aagcaatcccccgtaccggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaagctaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 28581929  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  28581928 ttagtcttcttcatacc 28581912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10940530 - 10940430
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  10940530 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcactttgtcttcttcatac 10940431  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  10940430 c 10940430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10959722 - 10959622
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  10959722 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcactttgtcttcttcatac 10959623  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  10959622 c 10959622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 41796505 - 41796605
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41796505 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagggccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 41796604  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  41796605 c 41796605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 126; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18610 - 18429
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18610 tctcttcaacattggtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacttgtttgattcttaaccttgagagccaattctctcaaactaac 18511  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  18510 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacttgtaatgtttacaaagtttttaatttgcctagtcctt 18429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 122; Significance: 8e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 4187 - 4368
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  4187 tctcttcaacattggtccgaagaatagtaagcaaaccaccacatcggagtcggaaacctgtttgattcttaaccttgagtgccaattctttcaaactaac 4286  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaagtttctaatttgtttagtcctt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  4287 caaatcaacctctttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaagtctttaatttgtctagtcctt 4368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 117; Significance: 8e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 3369 - 3529
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaac 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3369 tctcttccacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccataccggagtcggaaacctgtttgattctttaccttgagtgccaactctctcaaactaac 3468  T
Q  103 caaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggtaatgtttacaaag 163  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3469 caaatcaacctctttgaacttgtaggatttagtcttcttcatacctgtaatgtttacaaag 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 51507 - 51670
Alignment:
Q  10 aacattagt-ccggagaataag-aagcaaaccaccg-tatcggaatcggaaacctgtttg-attcttaa-ccttgaa-tgccaaatctctcaaactaacc 103  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51507 aacattagtaccggagaattagtaagcaaaccaccaatatcggagtcggaaacctgtttgtattcttaaaccttgaagtgccaaatctctcaaactaacc 51606  T
Q  104 aaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttctt-cataccggtaatgtttacaaagttt 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  51607 aaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttccttacctgtaatgtttacaaagttt 51670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 18144 - 18260
Alignment:
Q  31 aagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggat 130  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  18144 aagcaatcccccatatcggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcac 18243  T
Q  131 ttagtcttcttcatacc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  18244 ttagtcttcttcatacc 18260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5277 - 5177
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5277 cggagtcggaaccctgtttgacttttgaccttgagtgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 5178  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  5177 c 5177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17189 - 17089
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17189 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctctcaaaccaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 17090  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  17089 c 17089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 178
Target Start/End: Original strand, 10448 - 10575
Alignment:
Q  52 tcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcataccggt- 150  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||     
T  10448 tcggaatcctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatacctgtg 10547  T
Q  151 aatgtttacaaagtttctaatttgttta 178  Q
    | | ||||||||| |||| |||||||||    
T  10548 attatttacaaagattctcatttgttta 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0354 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0354
Description:

Target: scaffold0354; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18177 - 18108
Alignment:
Q  3 tctcttcaacattagtccggagaataagaagcaaaccaccgtatcggaatcggaaacctgtttgattctt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18177 tctcttcaacattagtccggagaatagtaagcaaaccaccatatcggagtcggaaacctgtttgattctt 18108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 458 - 558
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  458 cggagtcggaaccctgtttgactcttgaccttgagtgccaactctcttaaactgaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 557  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  558 c 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4986 - 4886
Alignment:
Q  47 cggaatcggaaacctgtttgattcttaaccttgaatgccaaatctctcaaactaaccaaatcaacctccttgaacttgtaggatttagtcttcttcatac 146  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4986 cggagtcggaaccctgtttggctcttgaccttgagcgccaactctctcaaactaaccaaatccacttccttgaacttgtagcacttagtcttcttcatac 4887  T
Q  147 c 147  Q
    |    
T  4886 c 4886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University