View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1339_high_17 (Length: 255)

Name: NF1339_high_17
Description: NF1339
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1339_high_17
NF1339_high_17
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (34-236)||(4920783-4920978)
chr5 (36-236)||(4583076-4583269)
chr5 (34-236)||(5908625-5908820)
chr5 (36-242)||(15890158-15890356)
chr5 (34-236)||(40517763-40517958)
chr5 (34-236)||(12866488-12866684)
chr5 (34-209)||(10127065-10127226)
chr5 (34-159)||(33727938-33728063)
chr5 (34-236)||(22694839-22695033)
chr5 (46-236)||(42987428-42987611)
chr5 (34-236)||(12834511-12834707)
chr5 (36-236)||(6092468-6092650)
chr5 (36-228)||(17853232-17853416)
chr5 (36-159)||(20973435-20973558)
chr5 (36-236)||(29245890-29246083)
chr5 (36-236)||(30996553-30996745)
chr5 (36-228)||(13401943-13402127)
chr5 (54-236)||(28045613-28045787)
chr5 (34-159)||(18207045-18207170)
chr5 (41-129)||(3564683-3564770)
chr5 (36-220)||(6155859-6156034)
chr5 (36-228)||(35311787-35311963)
chr5 (34-110)||(42717567-42717643)
chr5 (60-159)||(28568984-28569083)
chr5 (61-159)||(38972949-38973047)
chr5 (35-220)||(6369669-6369846)
chr5 (39-161)||(40187599-40187721)
chr5 (39-148)||(23044933-23045042)
chr5 (36-107)||(1218804-1218875)
chr5 (58-154)||(2681248-2681344)
chr5 (122-236)||(35194014-35194121)
chr5 (42-138)||(39422394-39422490)
chr5 (37-236)||(38006421-38006601)
chr5 (52-155)||(2412681-2412784)
chr5 (34-236)||(12447338-12447520)
chr5 (60-133)||(43523801-43523874)
chr5 (47-146)||(32574887-32574987)
chr5 (39-145)||(12915514-12915619)
chr5 (129-220)||(1218728-1218812)
chr5 (60-133)||(18116480-18116553)
chr5 (45-139)||(27088321-27088413)
chr5 (104-236)||(15564593-15564718)
chr5 (98-159)||(2985174-2985235)
chr5 (104-149)||(10822533-10822578)
chr5 (86-159)||(27900390-27900463)
chr5 (43-95)||(12457596-12457648)
chr5 (70-134)||(24207736-24207800)
chr5 (48-159)||(29664998-29665106)
chr5 (34-98)||(35193938-35194002)
chr5 (113-159)||(8453389-8453435)
chr5 (60-96)||(10822501-10822537)
chr5 (40-96)||(12712512-12712568)
chr5 (164-208)||(18116566-18116610)
chr5 (168-228)||(27088416-27088476)
chr5 (110-150)||(30116816-30116856)
chr5 (164-208)||(43523744-43523788)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (34-236)||(44953371-44953566)
chr3 (34-236)||(7469714-7469909)
chr3 (34-236)||(39655209-39655404)
chr3 (34-236)||(29284293-29284488)
chr3 (34-236)||(49580021-49580216)
chr3 (34-236)||(44252704-44252899)
chr3 (34-236)||(39728628-39728823)
chr3 (34-236)||(44639231-44639426)
chr3 (36-236)||(34025911-34026104)
chr3 (36-236)||(48390755-48390948)
chr3 (34-236)||(52572566-52572761)
chr3 (34-218)||(23546884-23547055)
chr3 (37-234)||(52198114-52198304)
chr3 (79-236)||(44172583-44172733)
chr3 (79-236)||(44179283-44179433)
chr3 (34-236)||(4015980-4016175)
chr3 (34-236)||(54317101-54317296)
chr3 (36-236)||(22535779-22535972)
chr3 (38-236)||(44106734-44106923)
chr3 (34-236)||(4557241-4557436)
chr3 (34-236)||(42758331-42758526)
chr3 (36-220)||(48305579-48305756)
chr3 (36-236)||(43582535-43582727)
chr3 (34-236)||(17146090-17146281)
chr3 (36-228)||(23580792-23580977)
chr3 (36-228)||(23154003-23154187)
chr3 (36-133)||(6738343-6738440)
chr3 (34-227)||(34119622-34119808)
chr3 (58-231)||(34154375-34154542)
chr3 (34-236)||(49025638-49025820)
chr3 (34-236)||(830966-831154)
chr3 (48-133)||(20087050-20087135)
chr3 (34-142)||(10371209-10371323)
chr3 (48-236)||(29842265-29842445)
chr3 (34-236)||(53631861-53632056)
chr3 (48-147)||(42243426-42243525)
chr3 (37-236)||(10823641-10823824)
chr3 (57-149)||(10043241-10043333)
chr3 (49-155)||(19111765-19111871)
chr3 (61-147)||(30616244-30616330)
chr3 (42-159)||(3385800-3385917)
chr3 (34-97)||(29858511-29858574)
chr3 (161-236)||(31126851-31126926)
chr3 (39-149)||(3414478-3414588)
chr3 (34-155)||(23910188-23910310)
chr3 (46-159)||(30904766-30904876)
chr3 (46-156)||(41936967-41937071)
chr3 (80-155)||(2490336-2490411)
chr3 (39-133)||(1772340-1772434)
chr3 (59-117)||(30682889-30682947)
chr3 (42-159)||(27252592-27252708)
chr3 (168-236)||(6738457-6738525)
chr3 (34-101)||(31126767-31126834)
chr3 (38-96)||(1337118-1337175)
chr3 (164-218)||(31098566-31098620)
chr3 (80-146)||(35687473-35687539)
chr3 (83-145)||(55438762-55438824)
chr3 (98-146)||(1337080-1337128)
chr3 (192-236)||(20086966-20087010)
chr3 (39-95)||(31271240-31271296)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (35-236)||(3483860-3484054)
chr6 (34-236)||(32853801-32853996)
chr6 (34-236)||(2367283-2367478)
chr6 (34-236)||(5863319-5863514)
chr6 (34-236)||(27534641-27534836)
chr6 (35-236)||(12141342-12141536)
chr6 (34-236)||(10142454-10142649)
chr6 (36-236)||(27738729-27738922)
chr6 (34-245)||(10188016-10188213)
chr6 (34-155)||(30986284-30986405)
chr6 (35-236)||(24225655-24225855)
chr6 (36-235)||(32532498-32532690)
chr6 (35-236)||(11762402-11762596)
chr6 (34-156)||(31496464-31496586)
chr6 (34-156)||(31501850-31501972)
chr6 (36-236)||(12309529-12309728)
chr6 (50-236)||(32053045-32053218)
chr6 (45-159)||(9442457-9442570)
chr6 (36-208)||(15498309-15498474)
chr6 (34-159)||(12678030-12678155)
chr6 (50-159)||(28079648-28079757)
chr6 (34-236)||(14254915-14255109)
chr6 (49-159)||(13769099-13769209)
chr6 (46-236)||(30816214-30816398)
chr6 (39-160)||(20610923-20611044)
chr6 (98-228)||(14506051-14506174)
chr6 (89-218)||(20349039-20349161)
chr6 (74-155)||(9458889-9458970)
chr6 (107-159)||(14410864-14410916)
chr6 (60-155)||(9458694-9458789)
chr6 (39-146)||(18908933-18909040)
chr6 (45-159)||(256439-256553)
chr6 (39-159)||(34178276-34178390)
chr6 (34-220)||(24602804-24602971)
chr6 (170-236)||(14032513-14032579)
chr6 (80-146)||(19367049-19367115)
chr6 (39-96)||(9402666-9402723)
chr6 (58-159)||(29341283-29341384)
chr6 (35-94)||(7393836-7393895)
chr6 (34-93)||(14034583-14034642)
chr6 (58-96)||(14506164-14506202)
chr6 (98-160)||(32959886-32959948)
chr6 (34-93)||(14410804-14410862)
chr6 (98-160)||(29199885-29199947)
chr6 (80-118)||(30624483-30624521)
chr6 (80-149)||(17546884-17546953)
chr6 (39-96)||(32959938-32959995)
chr6 (108-160)||(7393897-7393949)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (36-236)||(24927906-24928099)
chr8 (34-236)||(32303017-32303213)
chr8 (36-236)||(27932370-27932563)
chr8 (36-228)||(29108760-29108945)
chr8 (34-159)||(4230666-4230791)
chr8 (34-226)||(20399559-20399744)
chr8 (36-235)||(40248309-40248501)
chr8 (51-236)||(45236022-45236200)
chr8 (36-235)||(24869962-24870154)
chr8 (36-209)||(39445514-39445680)
chr8 (34-228)||(1063472-1063665)
chr8 (34-152)||(5858588-5858706)
chr8 (34-236)||(43113562-43113757)
chr8 (36-236)||(17220674-17220862)
chr8 (38-236)||(34777023-34777208)
chr8 (34-236)||(1012574-1012770)
chr8 (34-137)||(2075770-2075873)
chr8 (37-212)||(37960901-37961069)
chr8 (37-236)||(17469212-17469392)
chr8 (46-228)||(24568903-24569077)
chr8 (34-159)||(35215563-35215687)
chr8 (39-149)||(15068529-15068639)
chr8 (36-228)||(11254953-11255131)
chr8 (48-147)||(14155571-14155670)
chr8 (58-159)||(6388476-6388577)
chr8 (57-196)||(14687396-14687528)
chr8 (52-225)||(34139415-34139580)
chr8 (60-216)||(27056517-27056666)
chr8 (39-157)||(28345520-28345638)
chr8 (46-146)||(27777146-27777246)
chr8 (39-99)||(29416128-29416188)
chr8 (43-209)||(30481366-30481525)
chr8 (39-145)||(15173821-15173927)
chr8 (183-236)||(28977192-28977245)
chr8 (180-236)||(2075909-2075965)
chr8 (98-209)||(9642351-9642455)
chr8 (68-209)||(8545319-8545453)
chr8 (34-156)||(17084049-17084165)
chr8 (180-236)||(4230794-4230850)
chr8 (39-155)||(10297489-10297605)
chr8 (98-145)||(39379581-39379627)
chr8 (98-159)||(14186347-14186408)
chr8 (43-128)||(29918665-29918750)
chr8 (129-159)||(2075885-2075915)
chr8 (43-133)||(12468166-12468254)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (34-236)||(16866131-16866326)
chr7 (34-236)||(18125164-18125359)
chr7 (34-236)||(35074431-35074627)
chr7 (34-236)||(21702621-21702816)
chr7 (34-236)||(30650593-30650788)
chr7 (36-235)||(10072429-10072621)
chr7 (34-236)||(25905590-25905785)
chr7 (34-236)||(45885701-45885896)
chr7 (34-236)||(17851816-17852009)
chr7 (34-236)||(7779970-7780165)
chr7 (34-236)||(17885427-17885622)
chr7 (36-236)||(39455953-39456144)
chr7 (36-236)||(45380068-45380261)
chr7 (36-236)||(38152849-38153041)
chr7 (36-236)||(43507407-43507600)
chr7 (34-159)||(24753196-24753320)
chr7 (36-236)||(3226884-3227077)
chr7 (36-236)||(37182237-37182429)
chr7 (36-236)||(39316957-39317150)
chr7 (36-242)||(44734297-44734494)
chr7 (34-209)||(12980366-12980534)
chr7 (34-236)||(27850268-27850457)
chr7 (36-209)||(38139730-38139896)
chr7 (35-159)||(18825803-18825933)
chr7 (36-159)||(41741388-41741511)
chr7 (36-134)||(44658405-44658503)
chr7 (34-158)||(16079046-16079170)
chr7 (34-226)||(41103628-41103807)
chr7 (42-236)||(45708815-45708993)
chr7 (49-236)||(2630525-2630705)
chr7 (34-159)||(37579294-37579418)
chr7 (34-125)||(44785194-44785285)
chr7 (39-159)||(3157115-3157234)
chr7 (48-226)||(5377057-5377228)
chr7 (39-149)||(37218047-37218157)
chr7 (34-133)||(37195945-37196044)
chr7 (36-133)||(44985856-44985952)
chr7 (37-236)||(3920500-3920680)
chr7 (57-149)||(27896434-27896526)
chr7 (108-236)||(16811692-16811812)
chr7 (121-236)||(44794051-44794158)
chr7 (42-155)||(27063370-27063483)
chr7 (74-154)||(22973425-22973505)
chr7 (60-155)||(42908003-42908098)
chr7 (39-149)||(8906530-8906640)
chr7 (74-160)||(18684005-18684091)
chr7 (34-96)||(26004422-26004484)
chr7 (39-160)||(30839074-30839196)
chr7 (60-146)||(33841123-33841208)
chr7 (39-190)||(27063146-27063290)
chr7 (34-159)||(24425412-24425525)
chr7 (102-236)||(25979921-25980048)
chr7 (98-236)||(26622913-26623044)
chr7 (39-160)||(29157380-29157503)
chr7 (80-160)||(31426039-31426119)
chr7 (60-216)||(5565269-5565418)
chr7 (39-96)||(23533557-23533614)
chr7 (35-159)||(23329020-23329144)
chr7 (180-236)||(24753137-24753193)
chr7 (168-236)||(37196061-37196129)
chr7 (57-160)||(10990820-10990923)
chr7 (47-94)||(23457156-23457203)
chr7 (47-93)||(19439971-19440017)
chr7 (34-96)||(23475211-23475273)
chr7 (76-141)||(44845113-44845178)
chr7 (94-146)||(10995830-10995882)
chr7 (74-208)||(43218273-43218400)
chr7 (172-236)||(44658516-44658580)
chr7 (74-155)||(32546228-32546312)
chr7 (104-156)||(26004480-26004532)
chr7 (39-147)||(37103068-37103176)
chr7 (75-190)||(29014929-29015043)
chr7 (92-159)||(29292736-29292803)
chr7 (104-160)||(28309523-28309579)
[»] chr4 (76 HSPs)
chr4 (34-236)||(43893191-43893385)
chr4 (34-236)||(7608933-7609128)
chr4 (34-236)||(6382209-6382405)
chr4 (34-236)||(44317497-44317693)
chr4 (34-236)||(11028035-11028231)
chr4 (34-236)||(21423824-21424019)
chr4 (34-236)||(31918495-31918691)
chr4 (34-236)||(5902557-5902746)
chr4 (34-236)||(55826560-55826756)
chr4 (34-236)||(11122806-11123001)
chr4 (34-236)||(47550290-47550485)
chr4 (36-236)||(31752419-31752612)
chr4 (34-235)||(26564795-26564989)
chr4 (36-209)||(15987201-15987367)
chr4 (36-236)||(48459444-48459637)
chr4 (36-228)||(39046923-39047108)
chr4 (34-133)||(37349171-37349270)
chr4 (34-156)||(39375314-39375436)
chr4 (39-209)||(19882998-19883161)
chr4 (36-220)||(32585468-32585639)
chr4 (34-209)||(6481972-6482140)
chr4 (94-236)||(1724307-1724442)
chr4 (49-159)||(37107444-37107553)
chr4 (36-236)||(42299754-42299944)
chr4 (34-216)||(10302067-10302242)
chr4 (45-145)||(19548886-19548985)
chr4 (61-149)||(43309526-43309614)
chr4 (38-136)||(1724211-1724308)
chr4 (42-159)||(7334142-7334258)
chr4 (34-146)||(7985062-7985174)
chr4 (49-236)||(19534418-19534592)
chr4 (80-236)||(47239368-47239517)
chr4 (36-133)||(12505479-12505577)
chr4 (105-158)||(32596192-32596245)
chr4 (42-155)||(41914941-41915054)
chr4 (34-192)||(1866486-1866637)
chr4 (39-155)||(45065286-45065402)
chr4 (36-96)||(53906277-53906337)
chr4 (39-158)||(21956756-21956875)
chr4 (104-155)||(12825468-12825519)
chr4 (44-159)||(39086190-39086305)
chr4 (46-160)||(36919155-36919269)
chr4 (161-235)||(53906362-53906436)
chr4 (39-148)||(15733468-15733577)
chr4 (58-159)||(25941171-25941272)
chr4 (58-155)||(30672998-30673095)
chr4 (47-159)||(9929118-9929229)
chr4 (60-147)||(3737821-3737908)
chr4 (80-155)||(14605908-14605983)
chr4 (46-156)||(8843754-8843864)
chr4 (46-156)||(8856718-8856828)
chr4 (57-135)||(11696875-11696953)
chr4 (46-159)||(33615278-33615391)
chr4 (74-147)||(47103783-47103856)
chr4 (59-147)||(25265127-25265214)
chr4 (39-155)||(31415873-31415989)
chr4 (57-140)||(43553498-43553581)
chr4 (39-96)||(25298787-25298844)
chr4 (169-242)||(28695207-28695280)
chr4 (99-155)||(29527849-29527905)
chr4 (39-94)||(30266284-30266339)
chr4 (39-94)||(30285849-30285904)
chr4 (108-159)||(36306818-36306869)
chr4 (84-209)||(42907876-42907994)
chr4 (57-139)||(4737862-4737944)
chr4 (69-155)||(4741189-4741274)
chr4 (39-93)||(10574373-10574427)
chr4 (59-96)||(568489-568526)
chr4 (92-133)||(4766329-4766370)
chr4 (39-96)||(29527896-29527953)
chr4 (98-155)||(31782650-31782707)
chr4 (176-209)||(33916147-33916180)
chr4 (70-159)||(35304489-35304578)
chr4 (168-220)||(13770519-13770571)
chr4 (192-236)||(42774724-42774768)
chr4 (42-102)||(50375865-50375925)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (34-236)||(24414068-24414263)
chr2 (34-236)||(30846903-30847099)
chr2 (34-236)||(9632344-9632539)
chr2 (34-236)||(13830694-13830888)
chr2 (34-236)||(36128042-36128238)
chr2 (36-159)||(37106720-37106843)
chr2 (34-236)||(37999441-37999630)
chr2 (34-236)||(10920603-10920791)
chr2 (36-236)||(7314586-7314779)
chr2 (34-236)||(8915874-8916068)
chr2 (35-236)||(13705292-13705492)
chr2 (37-159)||(37472698-37472820)
chr2 (42-236)||(10208375-10208561)
chr2 (46-236)||(45115516-45115701)
chr2 (37-236)||(12193766-12193958)
chr2 (36-139)||(12341648-12341751)
chr2 (36-242)||(44746047-44746246)
chr2 (34-134)||(18106054-18106155)
chr2 (48-228)||(45256789-45256962)
chr2 (34-155)||(31942121-31942243)
chr2 (39-209)||(22900779-22900942)
chr2 (34-236)||(42797937-42798120)
chr2 (60-146)||(15546785-15546871)
chr2 (46-160)||(19104785-19104903)
chr2 (34-159)||(6027837-6027950)
chr2 (49-159)||(35248336-35248446)
chr2 (60-149)||(10212444-10212533)
chr2 (39-155)||(14331559-14331669)
chr2 (39-155)||(26755772-26755888)
chr2 (58-157)||(14540811-14540910)
chr2 (47-146)||(40734533-40734632)
chr2 (80-155)||(43371585-43371660)
chr2 (119-159)||(16226758-16226798)
chr2 (39-155)||(24051565-24051681)
chr2 (39-83)||(25213945-25213989)
chr2 (80-155)||(38342501-38342576)
chr2 (60-148)||(4427963-4428051)
chr2 (83-115)||(12341618-12341650)
chr2 (39-130)||(13954802-13954893)
chr2 (39-130)||(14096009-14096100)
chr2 (49-140)||(37309695-37309786)
chr2 (80-155)||(44057915-44057990)
chr2 (168-209)||(30696909-30696950)
chr2 (39-96)||(35409121-35409177)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (37-236)||(23490710-23490902)
chr1 (34-232)||(49250709-49250900)
chr1 (37-236)||(36187159-36187351)
chr1 (34-236)||(51421816-51422011)
chr1 (35-236)||(24236698-24236892)
chr1 (34-236)||(34611031-34611226)
chr1 (34-236)||(29936374-29936575)
chr1 (34-236)||(19572448-19572643)
chr1 (36-236)||(17134905-17135098)
chr1 (38-236)||(18354020-18354211)
chr1 (45-159)||(24710875-24710989)
chr1 (36-157)||(5181069-5181190)
chr1 (34-236)||(28297891-28298099)
chr1 (47-159)||(16408970-16409082)
chr1 (48-236)||(40087414-40087594)
chr1 (36-236)||(45866124-45866316)
chr1 (34-220)||(12494984-12495163)
chr1 (34-236)||(42439606-42439801)
chr1 (36-145)||(23968621-23968730)
chr1 (34-236)||(44615411-44615607)
chr1 (34-236)||(44792962-44793158)
chr1 (32-236)||(34673216-34673413)
chr1 (36-157)||(39616322-39616443)
chr1 (58-236)||(29871245-29871416)
chr1 (36-236)||(13390371-13390547)
chr1 (34-220)||(9982826-9983005)
chr1 (37-159)||(35936768-35936890)
chr1 (34-155)||(42707773-42707894)
chr1 (36-236)||(50426593-50426786)
chr1 (39-160)||(19003607-19003728)
chr1 (78-236)||(17091939-17092090)
chr1 (34-102)||(20774651-20774719)
chr1 (48-147)||(13798278-13798377)
chr1 (36-134)||(13020646-13020744)
chr1 (47-157)||(33293480-33293590)
chr1 (58-209)||(10778527-10778671)
chr1 (45-145)||(48576059-48576165)
chr1 (61-209)||(34085220-34085361)
chr1 (36-236)||(3627935-3628118)
chr1 (34-133)||(2514811-2514911)
chr1 (47-209)||(16903508-16903663)
chr1 (98-236)||(16433167-16433295)
chr1 (161-236)||(49741063-49741138)
chr1 (180-236)||(20774590-20774647)
chr1 (36-105)||(34059086-34059155)
chr1 (161-236)||(23966830-23966906)
chr1 (98-159)||(34060025-34060086)
chr1 (163-218)||(10105242-10105297)
chr1 (80-147)||(16237286-16237353)
chr1 (80-159)||(23058494-23058573)
chr1 (106-160)||(44632149-44632203)
chr1 (122-209)||(48125707-48125787)
chr1 (180-236)||(24710816-24710872)
chr1 (164-208)||(25181190-25181234)
chr1 (180-236)||(39616261-39616317)
chr1 (34-93)||(16433115-16433174)
chr1 (161-204)||(23719592-23719635)
chr1 (30-104)||(23719629-23719704)
chr1 (39-89)||(10450018-10450068)
chr1 (42-155)||(35069833-35069946)
chr1 (104-141)||(47644866-47644903)
chr1 (192-236)||(42707917-42707961)
chr1 (48-92)||(49740976-49741020)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (34-220)||(33366-33551)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (34-159)||(90624-90743)
[»] scaffold0795 (1 HSPs)
scaffold0795 (38-143)||(267-371)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
scaffold0519 (36-228)||(10262-10440)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (34-145)||(14120-14230)
scaffold0014 (172-237)||(14235-14301)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (33-236)||(14732-14928)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (39-155)||(67780-67896)
scaffold0008 (39-155)||(75623-75739)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (34-145)||(7738-7848)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (36-133)||(14900-14998)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (80-155)||(3000-3075)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (80-155)||(211395-211470)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (180-236)||(4214-4271)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (68-144)||(107361-107437)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (58-156)||(4542-4639)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (80-118)||(449770-449808)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4920978 - 4920783
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4920978 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttggttatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 4920879  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4920878 tgggacgggtaacgggtatatag-------gtatccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgt 4920786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4583269 - 4583076
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4583269 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttggatatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 4583170  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    |||||||||||||||||||       ||||  ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  4583169 ggacgggtaacgggtatat-------aggttcccaccccaaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 4583077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 5908625 - 5908820
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5908625 gtggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgattgggtttgggtatgggtatgagttttccccgatctcgaaacacgggta 5908724  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||       || |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5908725 tgggacgggtaacgggtata-------tatgtacacaccccaaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgt 5908817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15890356 - 15890158
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15890356 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggtttttcccgttttgactaggtttggctatgtgtatgggttttctccgatttcaaaacacgggtatg 15890257  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||        ||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  15890256 ggacgggtaacgggtatataggta--------cccacccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 15890165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40517958 - 40517763
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40517958 gtggttacccgcctgaaccaaattcaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatcccaaaacacgggta 40517859  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  40517858 tgggatgggtaacgggtata-------tagttacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaaggtaaaaaattattttatgttgatatgttatgt 40517766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 12866488 - 12866684
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  12866488 gtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgagttttctccgatttcaaaacatgggta 12866587  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt-tatg 232  Q
    ||||||||||||| ||||||       |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  12866588 tgggacgggtaacaggtata-------taggtacccaccgcgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtctatg 12866680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10127226 - 10127065
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127226 gtggttatccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 10127127  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    |||||||||||     ||         |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10127126 tgggacgggta-----ta---------taggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaa 10127065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Original strand, 33727938 - 33728063
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33727938 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgattgggtttggatatgggtatggattttccccgatctcaaaacacgggta 33728037  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33728038 tgggacgggtaacgggtatataggta 33728063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 22694839 - 22695033
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22694839 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggaattttcccgttttaactgggtttgggtatgggtatggg-tttccccgatctcaaaatacgggta 22694937  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||||  |||||||||||        ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  22694938 tgggacgactaacgggtata-------gaggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtaatgt 22695030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Original strand, 42987428 - 42987611
Alignment:
Q  46 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42987428 ccgaaccaaattcaatttggcgggtttttcccgttttgactgagtttgggtacgggtatggattttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgtgtaa 42987527  T
Q  146 cgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||| ||||       |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  42987528 cggatata-------taggtacccatcccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttat 42987611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 12834511 - 12834707
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||    
T  12834511 gtggttacccgtccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttttctccaatttcaaaacatggata 12834610  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt-tatg 232  Q
    ||||||||||||| ||||||       |||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  12834611 tgggacgggtaacaggtata-------taggtacctaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattaatttatgttgatatgtctatg 12834703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 6092468 - 6092650
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             
T  6092468 ggttacccgcccgaaccaaattcaatttaacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatctcaaaac--------- 6092558  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
      ||||||||||||||||       |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6092559 --acgggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgtta 6092649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Original strand, 17853232 - 17853416
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17853232 ggttacccacctgaaccaaacctaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatggatatgggttttccccgatttc-aaacacgggtatg 17853330  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    ||||||||||||| ||||       ||| || |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17853331 ggacgggtaacggatata-------tagatacccactccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 17853416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 159
Target Start/End: Original strand, 20973435 - 20973558
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  20973435 ggttacccgcccgaaccaaacccattctgacgggttttccccgttttgactgggtttggttatgggtatgggttttccccgattttcaaacacgggtatg 20973534  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  20973535 ggatgggtaacgggtatataggta 20973558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 29245890 - 29246083
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29245890 ggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactaggtttgggtatgggtatgagttttctccgatttcaaaacacgggtatg 29245989  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    |||||  ||||  |||||       |||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||||||    
T  29245990 ggacgaataacatgtata-------taggtacccaccccaaacccatacccatacccatcccaaatgtaaaaaattattttatgttggtatgtcatgtta 29246082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30996745 - 30996553
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||    
T  30996745 ggttatccgtccgaaccaaacccaatttgacggattttccc-gttttgactgggtttgggtatgagtatgggttttctccgattttaaaacacgagtatg 30996647  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    |||| |||||||||||||||       |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||    
T  30996646 ggacaggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacacacacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttaagttgatatgccatgtta 30996554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Original strand, 13401943 - 13402127
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  13401943 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttttccgttttgactaggtttgggtatgggtatgagtttttcccgattttcaaacacgggtatg 13402042  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    | |||||||||||||||       ||||||| |||| |||||| || ||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13402043 gaacgggtaacgggtat-------ttaggtacccactccgaaccca-accgatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 13402127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28045787 - 28045613
Alignment:
Q  54 aatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtata 153  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28045787 aatccaatttgacgtatttttcccattttgactgtgtttaggtatgggtatgggtttttccctaattcaaaacacgaatatgggacgggtaacgggtata 28045688  T
Q  154 taggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||||        ||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  28045687 taggta--------cccacccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttat 28045613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18207170 - 18207045
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||| || |||    
T  18207170 gtggttacccacccaaaccaaacccaatttgacgtgtttttcccgttttgactgggtttgggcatgagtttgggttttcctcgatttcaaaactcgtgta 18207071  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18207070 tgggacaggtaacaggtatataggta 18207045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 129
Target Start/End: Original strand, 3564683 - 3564770
Alignment:
Q  41 cccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  3564683 cccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccc-gttttgactgggtttgggtatgggtatggattttctccgatttcaaaacacg 3564770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 220
Target Start/End: Original strand, 6155859 - 6156034
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6155859 ggttatccacccgtaccaaatcaaatttaacgggttttcttcgttttgactgggtttgggtatgtgtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtata 6155958  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgt 220  Q
    |||| |||||  ||||||       || ||| ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  6155959 ggacaggtaa--ggtata-------tatgtacccaccccgaacccatacccaaaaccgtcacaaatgttgaaaattactttatgt 6156034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35311963 - 35311787
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||| |||         ||||| ||||||||||||||||    
T  35311963 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttttccgttttgactgagtttgggtatggatat---------ccgatttcaaaacacgggtatg 35311873  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    ||||||||||| | ||||       |||||| |||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  35311872 ggacgggtaacagatata-------taggtacccactccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgt 35311787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 110
Target Start/End: Original strand, 42717567 - 42717643
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttt 110  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42717567 gtggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactggatttgggtatgggtatgggttt 42717643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Original strand, 28568984 - 28569083
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28568984 atttgacgggttttccctgatttgactgggtttgggtatgagtttggattttccccgatttcaaaatgcgggtacgggacgggtaacggggatataggta 28569083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38973047 - 38972949
Alignment:
Q  61 tttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  38973047 tttgacaggttttccccgttttgactgggtttaggtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacatgggtatgggataggtaacgggaatataggta 38972949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6369846 - 6369669
Alignment:
Q  35 tggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtat 134  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  6369846 tggttacccgctcgaaccaaacctaatttgacggttttttctcgttttgattgagtttgggcatgggtatgagttttccctgatttcaaaatacgagtat 6369747  T
Q  135 gggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgt 220  Q
    |||| |||||||| |||||       || ||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6369746 ggga-gggtaacgtgtata-------tatgtacccaccccgaacccatactttaacccgtccaaaatgtaaaaaattactttatgt 6369669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Original strand, 40187599 - 40187721
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| || |||||||||||| || |||||||||||||  | ||    
T  40187599 tacccgtccgaaccaaactcattttgacgggttttcctcgctttgactgggtttggaaatgagtttgggttttccccaatttcaaaacacgggtgcgaga 40187698  T
Q  139 cgggtaacgggtatataggtatt 161  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  40187699 cgggtaacggagatataggtatt 40187721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 148
Target Start/End: Original strand, 23044933 - 23045042
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| ||||||  || |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  23044933 tacccgcccaaaccaaccccgatttgacgggtttttcccaatttgactgagtttgggtatgggtttaggttttccccgatttcaaaatacgggtacggga 23045032  T
Q  139 cgggtaacgg 148  Q
     |||||||||    
T  23045033 tgggtaacgg 23045042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1218875 - 1218804
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1218875 ggttacccgctcgaaccaaatccaatttgacgagttttttccattttgactgggtttgggtatgggtatggg 1218804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2681344 - 2681248
Alignment:
Q  58 caatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatat 154  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| || |||| |||| |||||| ||| ||||    
T  2681344 caatttgacgggttttccccgatttgactgagtttgggcatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacaggtacgggatgggtaatggggatat 2681248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Original strand, 35194014 - 35194121
Alignment:
Q  122 aaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||     
T  35194014 aaaacacgggtatgggacgggtaacgggtata-------taggtacccaccccaaactcatactcaaacccgtcccgaatgtagaaaattactttatgtt 35194106  T
Q  222 gatatgttatgttat 236  Q
     ||||| ||||||||    
T  35194107 aatatgctatgttat 35194121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 39422490 - 39422394
Alignment:
Q  42 ccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  39422490 ccgcccgaaccacacccaaattgacaggttttccccgctttgattgggtttggatatgagtttgggtttttctcgatttcaaaacacgggtatggga 39422394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Original strand, 38006421 - 38006601
Alignment:
Q  37 gttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 136  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||            |||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  38006421 gttacccgccctaaccaaatccgatttgacgggttttctccattttgactgggtt------------tgggttttccccaatttcaaaatacgggtatgg 38006508  T
Q  137 gacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||| ||||| | ||||       |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||  |||| || |||||||  |||||| |||||||    
T  38006509 gacgcgtaacagatata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccgaatgttgaaaattaatttatgttaatatgtcatgttat 38006601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 155
Target Start/End: Original strand, 2412681 - 2412784
Alignment:
Q  52 caaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggta 151  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| ||  |||| ||| || |||||||||||||||||||    |||||||||    
T  2412681 caaattcaatttgacggattttccccattttgattgagtttgggtatgggtttgaatttttcccaatttcaaaacacgggtatgggataaataacgggta 2412780  T
Q  152 tata 155  Q
    ||||    
T  2412781 tata 2412784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12447520 - 12447338
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||            |||||  |||   ||||||| ||||    
T  12447520 gtggttacccacccgaaccaaacccaatttgacggattt-ccccattttgactgggtttgggt------------tttccttgattgtaaaacacaggta 12447434  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||        |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  12447433 tgggacaggtaatgggtatataggtac-------ccaccccgaacctatacccaaacccgtcccaaatatagaaaactactttatgttaatatgtcatgt 12447341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 43523874 - 43523801
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43523874 atttgacggatttttcccgatttgactgagtttgggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacgggta 43523801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 146
Target Start/End: Original strand, 32574887 - 32574987
Alignment:
Q  47 cgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgac-tgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  32574887 cgaaccaaatccattttgacaggtttttcccgctttgacctgggtttggggacaggtttgggttttccccgatttcaaaacacagatacgggatgggtaa 32574986  T
Q  146 c 146  Q
    |    
T  32574987 c 32574987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12915619 - 12915514
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||| || || || ||||||    
T  12915619 tacccgcccaaaccaacaccgatttgacggattt-ccccgatttgactggggttgggtatgggtttgggtttttcccgatttcataatacaggcatggga 12915521  T
Q  139 cgggtaa 145  Q
    | |||||    
T  12915520 caggtaa 12915514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1218812 - 1218728
Alignment:
Q  129 gggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgt 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||        |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1218812 gggtatgggacaggtaacgggtatataggtac-------ccactccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgt 1218728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 18116480 - 18116553
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  18116480 atttgacggatttttcccgatttgactgagtttgggtatgagtttgggttttctccgatttcaaaatacgggta 18116553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 139
Target Start/End: Original strand, 27088321 - 27088413
Alignment:
Q  45 cccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggac 139  Q
    |||||||||||  || ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||| |||| | || |||||||||||||||    
T  27088321 cccgaaccaaactcattttgacgg--tttccccgttttaactaggtttgggtatgtgtttaggttttcctcgattttaagacacgggtatgggac 27088413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15564718 - 15564593
Alignment:
Q  104 tgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt 203  Q
    |||||||| |||||| |||| | | | |||||||| |||||||||||||||  |||||       || ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15564718 tgggtttttcccgatttcaagaaatgcgtatgggatgggtaacgggtatatctgtatt-------catcccgaactcatactcaaactcgtcccgaatgt 15564626  T
Q  204 aaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    | |||| |||||||  | ||||||| |||||||    
T  15564625 agaaaattactttacattgatatgtcatgttat 15564593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2985235 - 2985174
Alignment:
Q  98 tgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||| || |||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2985235 tgggtttgagttttctccgatttcaagacatgggtttgggacgggtaacgggtatataggta 2985174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 149
Target Start/End: Original strand, 10822533 - 10822578
Alignment:
Q  104 tgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 149  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10822533 tgggttttctccgatttcaaaacacgggtataggacgggtaacggg 10822578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 27900390 - 27900463
Alignment:
Q  86 tgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  27900390 tgggtttggatataggtttgagtttttcccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaatgtggatataggta 27900463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 12457648 - 12457596
Alignment:
Q  43 cgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggg 95  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  12457648 cgcccgtaccaaacccaatttgacggggtttccccgctttgattgggtttggg 12457596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24207800 - 24207736
Alignment:
Q  70 ttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtat 134  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24207800 tttttcccgctttgattgagtttgggtatgggtttgagttttccccgatttcaaaacacaggtat 24207736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29665106 - 29664998
Alignment:
Q  48 gaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||| || ||||| ||||| || |||||| |||  ||| ||||||||||||||   || ||||||||    
T  29665106 gaaccaaattcaatttgacgggtttttcc-gctttgattgagtttgtgtatgagtttgggttctcc--gatttcaaaacacgggtacatgatgggtaacg 29665010  T
Q  148 ggtatataggta 159  Q
    || |||||||||    
T  29665009 gggatataggta 29664998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 98
Target Start/End: Original strand, 35193938 - 35194002
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtat 98  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  35193938 gtggttacccgcccaaatcaaacccaatttgacggattttttccgttttggctggatttgggtat 35194002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 159
Target Start/End: Original strand, 8453389 - 8453435
Alignment:
Q  113 cccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  8453389 cccgatttcaaaacacgggtatgggatgggtaacagatatataggta 8453435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 96
Target Start/End: Original strand, 10822501 - 10822537
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10822501 atttgacgggttttccccattttgactggatttgggt 10822537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 96
Target Start/End: Original strand, 12712512 - 12712568
Alignment:
Q  40 acccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    |||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12712512 acccgcccaaaccaaccccgatttgacaggttttccccgatttgactgagtttgggt 12712568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Original strand, 18116566 - 18116610
Alignment:
Q  164 gtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  18116566 gtatccaccccgaactcatacccaaaccctacccgaatgtaaaaa 18116610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 27088416 - 27088476
Alignment:
Q  168 ccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  27088416 ccaccccgaacccatacccaaacccgtctcgaatgtagaaaattattttatgttgatatgt 27088476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30116856 - 30116816
Alignment:
Q  110 ttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggt 150  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30116856 ttccccgatttcaaaacacgagtatgggacggttaacgggt 30116816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43523788 - 43523744
Alignment:
Q  164 gtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  43523788 gtatccaccccgaactcatacccaaaccctacccgaatgtaaaaa 43523744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 44953371 - 44953566
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44953371 gtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtttgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 44953470  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44953471 tgggacgggtaacgggtatataggtact-------caccccgaactcatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgt 44953563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 7469714 - 7469909
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7469714 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccctgatctcgaaacacgggta 7469813  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7469814 tgggacgggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatacacaaacccgtcccaaatgtaaaacactactttatgtggatatgttatgt 7469906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 39655209 - 39655404
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39655209 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 39655308  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||| ||||||       |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39655309 tgggacgggtaacaggtata-------taggtacccaccccaaacccatacccaaacccgtctcaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgt 39655401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29284488 - 29284293
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29284488 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatctcgaaacacgggta 29284389  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29284388 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccagcccgaacccatacccaaacccgtcccagatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgt 29284296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 49580216 - 49580021
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49580216 gtggttatccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 49580117  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||||||||||| |||||||       |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  49580116 tgggacgggtaacgagtatata-------ggtacccacctcgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatattgatatgttatgt 49580024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44252899 - 44252704
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44252899 gtggttacccgtccgaatcaaaccaaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcgaaacacgggta 44252800  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||| ||||| ||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44252799 tgggacgtgtaacaggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatataaaaaactactttatgttgatatgttatgt 44252707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39728823 - 39728628
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39728823 gtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgagtataggttttcctcgatctcaaaatacgggta 39728724  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||| ||||||||||||||       || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  39728723 tgggatgggtaacgggtata-------taagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgt 39728631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44639426 - 44639231
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44639426 gtggttacccgtccgaacgaaacccaatttgactggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttttcccatatctcaaaacacgggta 44639327  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  44639326 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgt 44639234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34026104 - 34025911
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34026104 ggttaccctcccgaaccaaaaccaatttgacggttttttcccgttttgactgggtttggatatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacaggtatg 34026005  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    |||||||||||| |||||       ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  34026004 ggacgggtaacgagtata-------taggtttccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 34025912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 48390755 - 48390948
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48390755 ggttacccgttcgaaccaaatccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 48390854  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    |||||||||||||| |||       |||||| ||| || |||| |||||||| || |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  48390855 ggacgggtaacgggaata-------taggtacccatcctgaacccatacccatacccgtcccgaacgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 48390947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52572761 - 52572566
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52572761 gtggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacaggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgagttttcctcgatctcaaaacacgggta 52572662  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||       |||| | ||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  52572661 tgggacgggtaacgggtata-------tagggacccaccccgaatccatactcaagcccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttaatatgttatgt 52572569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Original strand, 23546884 - 23547055
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23546884 gtggttacccgcatgaaccaaacccaatttaacgggttttccccgttttgactgggtttggg------tatgggttttccccgatctcgaaacacgggta 23546977  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttat 218  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23546978 tgggacgggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttat 23547055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 52198304 - 52198114
Alignment:
Q  37 gttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52198304 gttacccgcccaaaccaaacctaatttgacgggttttttctgttttgactgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatctcaaaacacaggtatgg 52198205  T
Q  137 gacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtt 234  Q
    |||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  52198204 gacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattactttacgttgatatgctatgtt 52198114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44172733 - 44172583
Alignment:
Q  79 ttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaac 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||| |||||||||||    
T  44172733 ttttgactgggtttgagtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtata-------taagtacccaccccgaac 44172641  T
Q  179 tcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44172640 ccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttat 44172583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44179433 - 44179283
Alignment:
Q  79 ttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaac 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||| |||||||||||    
T  44179433 ttttgactgggtttgagtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtata-------taagtacccaccccgaac 44179341  T
Q  179 tcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44179340 ccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttat 44179283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 4015980 - 4016175
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4015980 gtggttacccacccgaacgaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacatgggta 4016079  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||||| |||||||||||       |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  4016080 tgggacggataacgggtata-------taggtacccactccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcagaaaactaccttatgttgatatgtcatgt 4016172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 54317296 - 54317101
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||  |||    
T  54317296 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgagtatgtgtttgagttttccccgatttcaaaacacaagta 54317197  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  54317196 taggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccattcccaaacccgtcccaaacgaagaaaattactttatgttgatatgccatgt 54317104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 22535779 - 22535972
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22535779 ggttatccgcccgaaccaaactcaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagttttccccaatttcaaaacacggatatg 22535878  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    ||||||||||||||||||        ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  22535879 ggacgggtaacgggtata-------caggcacccaccccgaacccatacacatactcgtcctaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 22535971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Original strand, 44106734 - 44106923
Alignment:
Q  38 ttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggg 137  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44106734 ttacccgcccgaacaaaactcaatttgacgg-ttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatgg-ttttccccaatcttaaaacacgggtatggg 44106831  T
Q  138 acgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||| ||||||| ||||       |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  44106832 acgcgtaacggatata-------taggtatctaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttaatatgttatgttat 44106923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 4557241 - 4557436
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  4557241 gtggttacccacccgaacaaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtttgggttttccccgttttcaaaacatgggta 4557340  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||||||||||| |||||       |||||| ||||||||||| ||||||||||    |||| |||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  4557341 tgggacgggtaacgagtata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaatctatcccgaatgcagaaaattactttatgttgatatgtcatgt 4557433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42758526 - 42758331
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  42758526 gtggttacccgcccgatccaaacccaatttgacggattttccccgttttaactgggtttgggtatgagtttgggtttcccccgatttcaaaacacaggta 42758427  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| || | | |||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  42758426 tgggacgggtaacaggtatatag-------gtatgcaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaacgaagaaaattactttatgttgatatgccatgt 42758334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 220
Target Start/End: Original strand, 48305579 - 48305756
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48305579 ggttacccacccgaaccaaacccaatctgacgggttttccccattttgactgggtttggttatgggtatgagttttccccaatttcaaaacacgggtatg 48305678  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgt 220  Q
    | ||| ||| ||||||||       |||||| |||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  48305679 gaacgagtatcgggtata-------taggtacccaccccgaacctatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattactttatgt 48305756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43582727 - 43582535
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43582727 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgatgggttttctccgtttttactgggtttgagtatgtgtatgagttttccccgatttcaaaacacgggtatg 43582628  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
     ||||||||||| |||| ||||||        ||  ||||||| ||||  || || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||    
T  43582627 agacgggtaacgtgtatgtaggta--------cccacccgaacccatattcatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatattgatatgtcatgtta 43582536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 17146090 - 17146281
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  17146090 gtggtcacccgtccaaaccaaatccaatttgacgggttt-ccccgttttgaca---tttgggtatgggtatgggttttttccaatctcaaaacatgggta 17146185  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||| ||||||||| | ||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17146186 tggaacgggtaacagttata-------taggtatccaccccgaacccatacacaaacccttcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgt 17146278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23580977 - 23580792
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  23580977 ggttacctgcccgaattaaattcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagttttccccaatttcaaaacacgagtatg 23580878  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
      ||||||||||||||||||       |||| |||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  23580877 aaacgggtaacgggtatata-------ggtacccactccgaacccatacccacacttatcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgt 23580792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Original strand, 23154003 - 23154187
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23154003 ggttacccgccggaaccaaccccaatttgacgggtttttcccgttttaactgagtttgggtatgggtatgggttttccccgatttc-aaacacgggtatg 23154101  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    | |||||||||| |||||       |||||| |||| |||||| ||||| || ||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23154102 gaacgggtaacgagtata-------taggtacccactccgaacccatactcatacctatcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 23154187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 133
Target Start/End: Original strand, 6738343 - 6738440
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6738343 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacaggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggta 6738440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34119808 - 34119622
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  34119808 gtggttaaccacccgaaccaaatctaatttgacgggttttccccattttgattgggtttgggtatgagtttgagtttttcccgattttaaaacacgggta 34119709  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatg 227  Q
    || ||||| |||| ||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||    
T  34119708 tgagacggataacaggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgcagaaaactactttgtgttgatatg 34119622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34154542 - 34154375
Alignment:
Q  58 caatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||  | |||        
T  34154542 caatttgacggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatgtgttttccccgatttcaaaacatgggtatgaaacgggtaacaagaata---- 34154447  T
Q  158 tattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgtggatatgttat 231  Q
       |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34154446 ---taggtacccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgttat 34154375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 49025820 - 49025638
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||    
T  49025820 gtggttacccgcctgaaccaaacccaatttgatgggtttttcctgttttgactgggtttgggt------------tttccccgatctcaaaacacgggta 49025733  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccac-cccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||         |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  49025732 tgggacgggtaacaggtatataggta---------cacatccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgttatg 49025642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 831154 - 830966
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || |||| | ||||||||||||||    
T  831154 gtggttacccgcccaaaccaaaccaaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggta------tttcccgttttcaaaacacgggta 831061  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    || ||||| ||||| ||||||        |||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  831060 tgagacggataacgagtatat--------ggtacccaccctgaacccatacccaaattcgtcccgaatgcagaaaattactttatgttaatatgctatgt 830969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20087135 - 20087050
Alignment:
Q  48 gaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20087135 gaaccaaatccaatttgacggattttctccgttttgactgggtttggatatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggta 20087050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 142
Target Start/End: Original strand, 10371209 - 10371323
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgac------tgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaaca 127  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  10371209 gtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtttgggtatgagtatggattttccccaatctcaaaaca 10371308  T
Q  128 cgggtatgggacggg 142  Q
    |||||||||| ||||    
T  10371309 cgggtatggggcggg 10371323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29842445 - 29842265
Alignment:
Q  48 gaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  29842445 gaaccaaatctaatttgacgggtttttcatgttcggattgggtttgggtataggtatgggttttccc-gattttaaaacacgggtatgggactggtaacg 29842347  T
Q  148 ggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    || |||       |||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||    
T  29842346 ggaata-------taggtacccaccccgaacccatactcatacccgtctcaaatgtaaaaaattactttatgttgatttgtcatgttat 29842265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 53632056 - 53631861
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||| ||  |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||  || | |||||||| |||    
T  53632056 gtggttactcgttcgaaccaaacttaatttgacgggttttcctcgttttgaatgggtataggtatgggtttgagttttcccaaattttaaaacacgtgta 53631957  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    || |||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  53631956 tgagacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatactcaaactcgtcccgaatctagaaaattactttatgttgatatgccatgt 53631864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 42243525 - 42243426
Alignment:
Q  48 gaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  42243525 gaaccaaacccaatttgacgggttttccccggtttgactgggtttgggtatgagtttgggtttttcccgatttcaatacacgggtatgagatgggtaacg 42243426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Original strand, 10823641 - 10823824
Alignment:
Q  37 gttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 136  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || |||||||| |||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||     
T  10823641 gttacccgcccaaaccaaattcaatttgacgagttttttccattttgactaggtttgggtatgggt------tttctccgatctcaaaacacgggtatga 10823734  T
Q  137 gacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||  | ||||||||||||| |||           |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10823735 gattgataacgggtatataagtac----------ccccgaacccatacccaaacctctcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttat 10823824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 10043241 - 10043333
Alignment:
Q  57 ccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 149  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10043241 ccaatttgacgggttttctccactttgactgggtttgggtatgggtttgggttttccctggtttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggg 10043333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19111871 - 19111765
Alignment:
Q  49 aaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  19111871 aaccaaatccaatttgacggatttttccctttttgattgggtttgggtatgagtttgagtttttcccgatttcaaaacacgggtacgggatggataacgg 19111772  T
Q  149 gtatata 155  Q
    |||||||    
T  19111771 gtatata 19111765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 147
Target Start/End: Original strand, 30616244 - 30616330
Alignment:
Q  61 tttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30616244 tttgaggggtttttcccgttttgactgaatttgagtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacggatatgggacgggtaacg 30616330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Original strand, 3385800 - 3385917
Alignment:
Q  42 ccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgg 141  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||  ||||  || || |||||||||||||| ||||| |    
T  3385800 ccgcccgaaccaaacccaattcgacgggttttccccgctttgactgggtttaggtatggatttgaatttttacccatttcaaaacacgggtacgggacag 3385899  T
Q  142 gtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||| | |||||||||    
T  3385900 gtaacgaggatataggta 3385917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Original strand, 29858511 - 29858574
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggta 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29858511 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttaacggattttccccgttttgactgggtttgggta 29858574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 236
Target Start/End: Original strand, 31126851 - 31126926
Alignment:
Q  161 taggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||  |||||||    
T  31126851 taggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgcagaaaactacattgtgttgatatgccatgttat 31126926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 149
Target Start/End: Original strand, 3414478 - 3414588
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |  ||||||| ||| ||||    
T  3414478 tacccacccgaaccaaacccaattcgataggttttccccgctttgattgggtttggttatgggtttgagtttttcccgattttcaaacacgagtacggga 3414577  T
Q  139 cgggtaacggg 149  Q
    | |||||||||    
T  3414578 caggtaacggg 3414588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 155
Target Start/End: Original strand, 23910188 - 23910310
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  23910188 gtggttacctgtccgaatcgaattcaatttgacggattttttccgttttgactgggtttgtgtatgagtttgagttttcctcgatttcaaaacacggata 23910287  T
Q  134 tgggacggg-taacgggtatata 155  Q
    || || ||| || ||||||||||    
T  23910288 tgagatgggttatcgggtatata 23910310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Original strand, 30904766 - 30904876
Alignment:
Q  46 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  30904766 ccgaactaaatccaatttgacgggttt-ccccgcttttactgg-tttgggtatgagtttggcttttttctgatttcaaaacacgggtacgggacgggt-a 30904862  T
Q  146 cgggtatataggta 159  Q
    |||| |||||||||    
T  30904863 cggggatataggta 30904876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Original strand, 41936967 - 41937071
Alignment:
Q  46 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    ||||| |||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||      |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||    
T  41936967 ccgaatcaaatcaaatttgatggattttcctcgttttgattgggtttgagtat------gggttttccccgattttaaaacacgagtatgagacggataa 41937060  T
Q  146 cgggtatatag 156  Q
    |||||||||||    
T  41937061 cgggtatatag 41937071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2490411 - 2490336
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||| ||| |||||    
T  2490411 tttgactgggtttggatatgggtttgagttttccccgatttcaaaatacgggtacagaacgggtaatggggatata 2490336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 133
Target Start/End: Original strand, 1772340 - 1772434
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||| |||| ||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |||| | |||| |||||||    
T  1772340 tacctgcccaaaccaatcccgatttgacggattttccccgatttgactgggtctgggtatggttttgggttttcttcgattttaaaatacgggta 1772434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 30682947 - 30682889
Alignment:
Q  59 aatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 117  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  30682947 aatttgacaggttttctctgttttgactgggtttgggaatggatatgagttttccccga 30682889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27252708 - 27252592
Alignment:
Q  42 ccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgg 141  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||||| || || |||||| || || || ||||| ||||| |||||||    
T  27252708 ccgcccgaactaaatctaatttgacgggttttatcggatttgattgggtttgggtatgagtttgagttttctccaatttc-aaacatgggtacgggacgg 27252610  T
Q  142 gtaacgggtatataggta 159  Q
     |||| |  |||||||||    
T  27252609 ataacagtgatataggta 27252592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 236
Target Start/End: Original strand, 6738457 - 6738525
Alignment:
Q  168 ccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  6738457 ccaccccaaatccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttat 6738525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 101
Target Start/End: Original strand, 31126767 - 31126834
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatggg 101  Q
    ||||||| || |||||||||||   || |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31126767 gtggttaaccacccgaaccaaacttaaattgatgggttttccccgttttgatttggtttgggtatggg 31126834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 1337175 - 1337118
Alignment:
Q  38 ttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    ||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1337175 ttacccgcctgaactaaacccattttgacggattt-ccccgttttgactgggtttgggt 1337118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31098620 - 31098566
Alignment:
Q  164 gtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttat 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  31098620 gtatccactccgaactcatacccaaatccgtccttaatgtaaaaaattactttat 31098566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 146
Target Start/End: Original strand, 35687473 - 35687539
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaac 146  Q
    |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||    
T  35687473 tttgactgggtttgagtatgagtttgagttttccccgatttcataatacgggtacgagacgggtaac 35687539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 55438762 - 55438824
Alignment:
Q  83 gactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    ||||| |||||||||||| | | |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||    
T  55438762 gactgagtttgggtatggatttaggttttccccaatttaaaaacacgggtatgggacaggtaa 55438824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1337128 - 1337080
Alignment:
Q  98 tgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaac 146  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1337128 tgggtttgggttttcaccgatttcaaaacaagtgtatgggacgggtaac 1337080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20087010 - 20086966
Alignment:
Q  192 cgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||    
T  20087010 cgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttat 20086966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 95
Target Start/End: Original strand, 31271240 - 31271296
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggg 95  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  31271240 tacccgtccgaatcaaactcaatttgacggatttttcccgctttgactgggtttggg 31271296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Original strand, 3483860 - 3484054
Alignment:
Q  35 tggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3483860 tggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgtgtatgggttttccccgatctcgaaacacgggtat 3483959  T
Q  135 gggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtt 234  Q
    |||| ||||||||||||||       |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3483960 gggatgggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtt 3484052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32853996 - 32853801
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32853996 gtggttatccgaccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttggttatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 32853897  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32853896 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgt 32853804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2367478 - 2367283
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2367478 gtggttacccgtccgaaccaaacccaatttgatgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 2367379  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||       || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2367378 tgggacgggtaacgggtata-------taagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatggaaaaaattactttatgtggatatgttatgt 2367286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 5863319 - 5863514
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5863319 gtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggta 5863418  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||       ||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  5863419 tgggacgggtaacgggtata-------tagatacccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaatattttatgttgatatgttatgt 5863511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27534836 - 27534641
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27534836 gtggttaaccgtccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatgagttttccccgatctcgaaacacgggta 27534737  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27534736 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaatccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgt 27534644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12141536 - 12141342
Alignment:
Q  35 tggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12141536 tggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtacgggtatgggttttccccaatctcaaaacacggatat 12141437  T
Q  135 gggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtt 234  Q
    ||||||||| |||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||    
T  12141436 gggacgggtgacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatacgttatgtt 12141344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 10142454 - 10142649
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10142454 gtggttatccgctcgaaccaaactcaatttggcgggttttcctcgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaaaacgggta 10142553  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||| |||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  10142554 tgggacaggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaactcatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgt 10142646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27738922 - 27738729
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27738922 ggttacctgcccgaaccaaattcaatttgatgggtttttcccgttttgactgggtttaggtatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 27738823  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    ||||||||||| | ||||       || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27738822 ggacgggtaacagatata-------tatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgtta 27738730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Original strand, 10188016 - 10188213
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10188016 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 10188115  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||||||||     ||         |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||    
T  10188116 tgggacgggta-----ta---------taggtacccaccccgaacccatacccaaacccatcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatattatgt 10188201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30986405 - 30986284
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30986405 gtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 30986306  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30986305 tgggacgggtaacgggtatata 30986284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24225855 - 24225655
Alignment:
Q  35 tggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt------tttccccgatctcaaaacac 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  24225855 tggttacccgtccgaaccaaattcaatttgacaggttttccccgttttgattgggtttgggtttgggtatgggtatggattttccccgatctcaaaacac 24225756  T
Q  129 gggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  24225755 ggatatgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatgcccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgt 24225663  T
Q  229 tatgttat 236  Q
    ||||||||    
T  24225662 tatgttat 24225655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32532690 - 32532498
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32532690 ggttatccgcccaaatcaaatccaatttgacgggttttttccgttttcattgggtttgagtatgagtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 32532591  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    |||||||||| |||||||||       |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  32532590 ggacgggtaatgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 32532498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11762596 - 11762402
Alignment:
Q  35 tggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtat 134  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | | |||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  11762596 tggttactcgcccgaacacaatccaatttgacgggttttccccatttttactgggtttggatatggatttaggtttttcccgatttctaaacaagggtat 11762497  T
Q  135 gggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtt 234  Q
    ||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||    
T  11762496 gggacgggtaacgggtatat-------aggtgtccaccccgaactcatacccaaacccatcccaaatgtagaaaattactttatgttgatatgccatgtt 11762404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31496586 - 31496464
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31496586 gtggttacccgtccaaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagttttccccgatctcgaaacatgggta 31496487  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatatag 156  Q
    |||||||||  ||||||||||||    
T  31496486 tgggacgggggacgggtatatag 31496464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31501972 - 31501850
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31501972 gtggttacccgtccaaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagttttccccgatctcgaaacatgggta 31501873  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatatag 156  Q
    |||||||||  ||||||||||||    
T  31501872 tgggacgggggacgggtatatag 31501850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12309728 - 12309529
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtat------gggttttccccgatctcaaaacacg 129  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||      |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  12309728 ggttacccgcccgaaccagacccaatttgacgagttttccccattttgactgggtttgggtttgggtatgggtatgggtattccctgatttcaaaacacg 12309629  T
Q  130 ggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgtt 229  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||       || ||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  12309628 ggtatggaacgggtaacaggtata-------tatgtacccaccccgaaccgatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtc 12309536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32053218 - 32053045
Alignment:
Q  50 accaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 149  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32053218 accaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtat------gggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaacggg 32053125  T
Q  150 tatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||       || ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  32053124 tata-------tatgtacccaccccaaacccatacccaaacccgtccaaaatgtaaaaaaatactttatgttgatatgtcatgttat 32053045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9442570 - 9442457
Alignment:
Q  45 cccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggta 144  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9442570 cccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgg-tttgggtatgggtatgggattttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggta 9442472  T
Q  145 acgggtatataggta 159  Q
    ||||||||| |||||    
T  9442471 acgggtatagaggta 9442457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15498474 - 15498309
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15498474 ggttatccgcccgaatcaaacccaatttaacgggttttctccgttttgaatgggtttgggtatggatatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 15498375  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaa 208  Q
     ||| ||||| |||||||||       |||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  15498374 agacaggtaatgggtatata-------ggtacccatcccgaacccacacccaaacccgtcccaaatgtaaaaa 15498309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Original strand, 12678030 - 12678155
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| || |||||||| | |  | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||| ||||    
T  12678030 gtggttacccacctgaaccaaacctatctcgacaggttttcgccgttttgactgggtttgggtatgagtttgcgttttccccgatttcaagacacaggta 12678129  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  12678130 tgggacgggtaaagggtatataggta 12678155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 159
Target Start/End: Original strand, 28079648 - 28079757
Alignment:
Q  50 accaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 149  Q
    |||||| ||| |||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28079648 accaaacccattttgacgggtatttcccgctttggctgagtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacatgggtacgggacgggtaacggg 28079747  T
Q  150 tatataggta 159  Q
     |||||||||    
T  28079748 gatataggta 28079757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14255109 - 14254915
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| | |||| |||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| || |||||||||||    
T  14255109 gtggttacccactcgaatcaaacccattttgacagattttcctcgttttgactgggtttgggtatgggtttgagttttctctgatttc-aaacacgggta 14255011  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||| |||||||  |||       |||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  14255010 tgggacgtgtaacggaaata-------taggtacccaccatgaacccatacccaaattcgtcccaaatgcaaataataactttatgttgatatgtcatgt 14254918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13769209 - 13769099
Alignment:
Q  49 aaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 148  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13769209 aaccaaacccaatttcacgggttttactcgctttgactgggtttaggtatgggtttcggttttccccgacttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgg 13769110  T
Q  149 gtatataggta 159  Q
      |||||||||    
T  13769109 acatataggta 13769099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30816398 - 30816214
Alignment:
Q  46 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||  | |  |||||||||||||||| ||||||    
T  30816398 ccgaaccaaacccaatttgatggattttccccgttttgattgggtttggatatgggtttgagttttccccatttt--aaacacgggtatgggatgggtaa 30816301  T
Q  146 cgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatg---taaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
     |||||||       |||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30816300 tgggtata-------taggaacccaccccgaacccatatccaaacccgtcccgaatgcaaaaaaaaactactttatgttgatatgtgatgttat 30816214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 160
Target Start/End: Original strand, 20610923 - 20611044
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||  |||||| | | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  20610923 tacccgccaaaaccaacttcgatttgacgggtttttcccgatttaactgggtttaggtatgggtttggggtttccccgatttcaaaatacgggtagggga 20611022  T
Q  139 cgggtaacgggtatataggtat 160  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  20611023 cgggtaacgggaatatatgtat 20611044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14506174 - 14506051
Alignment:
Q  98 tgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtccc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||       ||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  14506174 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaacaagtat-------ttaggtacccaccccgaacccatacttaaacccgtccc 14506082  T
Q  198 aaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  14506081 aaatgcagaaaactactttgtgttgatatgt 14506051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20349161 - 20349039
Alignment:
Q  89 gtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaa 188  Q
    |||| |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||       |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20349161 gttttggtatgagtttggattttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgagtaacggggata-------taggtacccaccccgaactcatacccaa 20349069  T
Q  189 actcgtcccaaatgtaaaaaactactttat 218  Q
    |  |||  ||||||||||||| || |||||    
T  20349068 atccgttgcaaatgtaaaaaattaatttat 20349039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9458970 - 9458889
Alignment:
Q  74 ccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  9458970 ccccgatttgactgggtttgggtatgggtctgggttttccccgatttaataatacgggtacgggatgggtaacgggaatata 9458889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Original strand, 14410864 - 14410916
Alignment:
Q  107 gttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14410864 gttttcccagatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 14410916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9458789 - 9458694
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||| || |||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  9458789 atttgacggattttccccgatttgactgggtttgggtatgagtttgagatttccccaatttcaaaatacgggtacgggacagataacggggatata 9458694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18909040 - 18908933
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| ||||||   | ||||||||| |||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  18909040 tacccgcccaaaccaacctcgatttgacggatttttcccgatgtgactgagtttgagtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacggatatggga 18908941  T
Q  139 cgggtaac 146  Q
    ||||||||    
T  18908940 cgggtaac 18908933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 256439 - 256553
Alignment:
Q  45 cccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggta 144  Q
    |||||||||||  |||||| | || ||||||||| ||||  || ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  256439 cccgaaccaaactcaatttaatggattttccccgctttggttgtgtttgggtatgagtttgagttttccccgatttcaaaacatgggtacgagacgggta 256538  T
Q  145 acgggtatataggta 159  Q
    | ||| |||||||||    
T  256539 atgggcatataggta 256553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 159
Target Start/End: Original strand, 34178276 - 34178390
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||      ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||    
T  34178276 tacccgcctgaaccatacccaatttgatgggtgttccccgttttgacagggtt------tgggtatgggtttcccctgatttcaaaacacgggtacgaga 34178369  T
Q  139 cgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||||||  | |||||||||    
T  34178370 cgggtaacaaggatataggta 34178390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 24602804 - 24602971
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||            ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  24602804 gtggttacccacccgaacgaaactcaatttgacggtttttccctgttttgactgggtt------------tgggttttcccagatttcaaaacatgggta 24602891  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgt 220  Q
    || |||||||||| ||||||       ||| || ||||||||||| ||||||||||| | || | |||||| |||| ||||||||||    
T  24602892 tgtgacgggtaacaggtata-------tagatacccaccccgaacccatacccaaacccatcacgaatgtagaaaattactttatgt 24602971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14032579 - 14032513
Alignment:
Q  170 accccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  14032579 accccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcataaaattactttatgttgatatgtcatgttat 14032513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19367115 - 19367049
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaac 146  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||    
T  19367115 tttgactgagtttggatatgggtatggattttccccaattttaaaacacgggtatgagacgggtaac 19367049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 9402723 - 9402666
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9402723 tacccgcccgaaccaaacccaatttgatggattttccccgctttgactggatttgggt 9402666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29341384 - 29341283
Alignment:
Q  58 caatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 157  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||| |  ||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||    
T  29341384 caatttgatgagttttctccgttttgattgggtttggatatgagtttgggtttttcccgattttcaaacatgggcatgagacgggtaacggagatatagg 29341285  T
Q  158 ta 159  Q
    ||    
T  29341284 ta 29341283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Original strand, 7393836 - 7393895
Alignment:
Q  35 tggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgg 94  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  7393836 tggttacacgtccgaatcaaatccaatttgacggattttccccattttgattgggtttgg 7393895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 14034642 - 14034583
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttg 93  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14034642 gtggttacccacccgaactaaacccattttgatgggttttacccgttttgactgggtttg 14034583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14506202 - 14506164
Alignment:
Q  58 caatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14506202 caatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggt 14506164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 32959948 - 32959886
Alignment:
Q  98 tgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtat 160  Q
    ||||| |||||||||||  || |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  32959948 tgggtttgggttttccctaatttcaaaacacgggtacggaacgggtaacggggatataggtat 32959886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 93
Target Start/End: Original strand, 14410804 - 14410862
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttg 93  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  14410804 gtggttacccgtccaaaccaaatctaatttgacggatttt-cccgttttgactaggtttg 14410862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Original strand, 29199885 - 29199947
Alignment:
Q  98 tgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtat 160  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  29199885 tgggtttggattttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacagggatatatgtat 29199947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 30624521 - 30624483
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30624521 tttgactgggtttgggtttgggtttgggttttccccgat 30624483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 149
Target Start/End: Original strand, 17546884 - 17546953
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| || |||| || ||||  |||||||||    
T  17546884 tttgactgggtttgggtatgggtttggggtttcctcgatttcataatacggatacgggatcggtaacggg 17546953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 32959995 - 32959938
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    ||||| |||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  32959995 tacccacccgaatcaaacctaatttgacggattttcctcgttttgattgggtttgggt 32959938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 160
Target Start/End: Original strand, 7393897 - 7393949
Alignment:
Q  108 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtat 160  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||    
T  7393897 ttttccccgatttcaaaacacgagtaagagacggataatgggtatataggtat 7393949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24928099 - 24927906
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24928099 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccctgatctcgaaacacgggtatg 24928000  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
     |||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24927999 agacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 24927907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32303213 - 32303017
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32303213 gtggttacccgcccgaaacaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcgaaacacgggta 32303114  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32303113 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactattttatgttgatatgttatg 32303021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27932563 - 27932370
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27932563 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 27932464  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    ||||| ||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  27932463 ggacgagtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatactcatatccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 27932371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Original strand, 29108760 - 29108945
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||    
T  29108760 ggttactcgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgattttaaaacatgggtatg 29108859  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||       || ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29108860 ggacgggtaacgggtata-------tatgtacccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 29108945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Original strand, 4230666 - 4230791
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4230666 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacaggta 4230765  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4230766 tgggacgagtaacgggtatataggta 4230791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20399744 - 20399559
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20399744 gtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgagttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtttgggttttctccgatttcaaaacacgggta 20399645  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatat 226  Q
    ||||||||||||||||||||       ||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||| || ||||||| |||||    
T  20399644 tgggacgggtaacgggtata-------tagatacccaccccgaacccattcccaaacccgtcccgaatgcaaaaaattattttatgttgatat 20399559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Original strand, 40248309 - 40248501
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40248309 ggttactcgcctgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatatgttttccccgatttcaaaacacgggtatg 40248408  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
     ||||| |||||||||||       |||||| ||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  40248409 agacggataacgggtata-------taggtacccatcccgaacccatacccatatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 40248501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45236200 - 45236022
Alignment:
Q  51 ccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggt 150  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45236200 ccaaaaccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgagtatgggtatgagttttccctgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggt 45236101  T
Q  151 atataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||       |||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  45236100 atata-------ggtacccaccccgaacccatatccatacccgtcccaaatgtaaaaaattaatttatgttgatatgttatgttat 45236022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Original strand, 24869962 - 24870154
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24869962 ggttatccgctcgaatcaaatccaatttgacgggtttttcccgttttgactgaatttgggtatggctatgagttttccccgattttaaaacacgggtatg 24870061  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
     |||||||||||||||||       |||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  24870062 tgacgggtaacgggtata-------taggtacccaccccgagcccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 24870154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Original strand, 39445514 - 39445680
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39445514 ggttactcgtccgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactaggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatg 39445613  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    |||| |||||||||| ||       |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39445614 ggacaggtaacgggttta-------taggtacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaa 39445680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1063665 - 1063472
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtat------gggttttccccgatctcaaaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||      ||||||| |||||| ||||||||    
T  1063665 gtggttacccgcccgaaccaaacccgatttgacgggttttccccgttttgactgggtgtgggtgtgggtatgggtatgggtttttcccgatttcaaaaca 1063566  T
Q  128 cgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatg 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       || ||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1063565 cgggtatgggacggttaacgggtata-------taagtacccaccccgaactcatacccaaatccatcccaagtgtaaaaaattactttatgttgatatg 1063473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 152
Target Start/End: Original strand, 5858588 - 5858706
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5858588 gtggttacctacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttttcccgatttaaaaacacgggta 5858687  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtat 152  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5858688 tgggacgggtaacgggtat 5858706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 43113562 - 43113757
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  43113562 gtggttacccacccgaaccaaacccaatttaacgggttttccctgctttgactgggtttgcgtatgagattgggtttttcccgatttcaaaacacgggca 43113661  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||| ||||||       |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | |||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43113662 tgggacgggtaacaggtata-------taggtacccaccccgaactcatacccaaatccgtctcgaatgcagaaaactacttcatgttgatatgttatgt 43113754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17220862 - 17220674
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17220862 ggttacccgcacgaaccaaatccaatttgacgggttttccccattttgactgagtttgggtatgggtatggattttccccgatttcaaaacacgggtatg 17220763  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    ||| || | | || ||||       |||||| |||||||||||     |||| || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||    
T  17220762 ggatggatgatggttata-------taggtacccaccccgaac-----cccatacccgtcccaaatgtaaaagattactttatgttgatatgtcatgtta 17220675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34777208 - 34777023
Alignment:
Q  38 ttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggg 137  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34777208 ttacccgtccgaaccaaacccaatttaacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtat------gggtttttcccgatctcaaaacacgggtatgga 34777115  T
Q  138 acgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||| ||||| |||||       ||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  34777114 acgagtaacaggtat-------ttaggtacccaccccgaacccatacccaaatccatcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttat 34777023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1012770 - 1012574
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| | |||    
T  1012770 gtggttacccacccgaatcaaacccaatttgacgggttttcctcgttttgattgagtttgggtatgagtttgggttttccccgat-ttaaaacatgagta 1012672  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatg--taaaaaactactttatgtggatatgttat 231  Q
    |||||||||||| |||||||       |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  1012671 tgggacgggtaatgggtata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcaaaaaaaactactttatgttgatatgccat 1012579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 137
Target Start/End: Original strand, 2075770 - 2075873
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2075770 gtggttacccgcctgaaccaaacccaatttgacggattttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatctcaaaacatgggta 2075869  T
Q  134 tggg 137  Q
    ||||    
T  2075870 tggg 2075873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Original strand, 37960901 - 37961069
Alignment:
Q  37 gttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 136  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37960901 gttacccacccgaaccgaacctaatttgatgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgagtttgggttttccccgatttaaaaacacgggtatgg 37961000  T
Q  137 gacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaacta 212  Q
    ||| |||||| ||||||       ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  37961001 gacaggtaacaggtata-------taggtacacaccccgaactcatacccaaacccgtcccaaatgttataaacta 37961069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17469392 - 17469212
Alignment:
Q  37 gttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 136  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||            |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17469392 gttacccacccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggt------------tttccccgatttcaaaacacgggtatgg 17469305  T
Q  137 gacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||||||||||||||||       |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  17469304 gacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccaaacccatacccaaacccgtcccaactgcagaaaactactttatgttgatatgccatgttat 17469212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24569077 - 24568903
Alignment:
Q  46 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||     
T  24569077 ccgaaccaaacctaatttgacgggttttccccgttt-gattgggtttaggtatgggtatggatttttcccgatttcacaacatgggtatgggacaggtag 24568979  T
Q  146 cgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    |||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  24568978 cgggtatatag-------gtatccaccccgaacccatactcaaatccgtcccgaatggagaaaactactttatgttgatatgt 24568903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35215687 - 35215563
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35215687 gtggttacccgtccgacccaaacccaatttgaccggtttttcccgttttgaccgggtttgggtatgattttgggtttt-cccgatttcaaaacacgggta 35215589  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    || ||||||||||| |||||||||||    
T  35215588 tgagacgggtaacgagtatataggta 35215563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 149
Target Start/End: Original strand, 15068529 - 15068639
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  15068529 tacccgcccaaaccaaccccgatttgacgggttttccccgatttgactgggtctgggtatgggttcgggttttccccgatttcaaaatacgggtacggga 15068628  T
Q  139 cgggtaacggg 149  Q
    | |||||||||    
T  15068629 caggtaacggg 15068639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Original strand, 11254953 - 11255131
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||       ||| |||| | || |||||||||||||    
T  11254953 ggttacctgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttttccgttttgactaggtttgggtatggg-------ttttcccgctttccaaacacgggtatg 11255045  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    |||||| |||| ||||||       |||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  11255046 ggacggataacaggtata-------taggtacccactacgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgt 11255131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14155670 - 14155571
Alignment:
Q  48 gaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||||||    
T  14155670 gaaccaaacccaatttgacgggttttccccggtatgactgggtttgggtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtataagatgggtaacg 14155571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Original strand, 6388476 - 6388577
Alignment:
Q  58 caatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 157  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  6388476 caatttgacgggctttctccgttttgactgagtttgggtatgggtttgggtcttccccgattttaaaacacgggtacaagacgggtaacggggatatagg 6388575  T
Q  158 ta 159  Q
    ||    
T  6388576 ta 6388577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14687528 - 14687396
Alignment:
Q  57 ccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatag 156  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || |||       
T  14687528 ccaatttggcgggttttccccactttgattgggtttgggtatggatttgggttttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgagaaacagggata--- 14687432  T
Q  157 gtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcc 196  Q
        || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14687431 ----tatgtatccaccccgaacccatacccaaactcgtcc 14687396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34139580 - 34139415
Alignment:
Q  52 caaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggta 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||  ||||| ||||    
T  34139580 caaacccaatttgacgggttttcctcgttttgactgggtttgggtatgtgt-ttggttttccccgatttaaaaacacggatataggacatgtaacaggta 34139482  T
Q  152 tataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatg-taaaaaactactttatgtggata 225  Q
    ||       |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  34139481 ta-------taggtacccaccccgaac-catacccaaacccgtcccgaatgcaaaaaaattactttatgttgata 34139415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 216
Target Start/End: Original strand, 27056517 - 27056666
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||||||||       |||     
T  27056517 atttgacgggttttcctcgctttggctgggtttggttatgggtttgggtttttcccgatttcaaagtacaggtatgggacgggtaacgg-------ggtt 27056609  T
Q  160 ttaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactacttt 216  Q
     ||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27056610 atatctacccaccccgaacccatacacatactcgtcccaaatgtaaaaaattacttt 27056666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28345638 - 28345520
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||  |||    
T  28345638 tacccgcccgaaccaaatcctttttgacgggtttttcccgctttgactgggtttcggtataggtttggattttacccgattccaaaacacgggtacagga 28345539  T
Q  139 cgggtaacgggtatatagg 157  Q
     |||||||| | |||||||    
T  28345538 tgggtaacgaggatatagg 28345520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 146
Target Start/End: Original strand, 27777146 - 27777246
Alignment:
Q  46 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  27777146 ccgaaccaaacttaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgtgtttgagtttttcccgatttcaaaacacaggtacgggacaggtaa 27777245  T
Q  146 c 146  Q
    |    
T  27777246 c 27777246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 99
Target Start/End: Original strand, 29416128 - 29416188
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29416128 tacccacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatg 29416188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 30481366 - 30481525
Alignment:
Q  43 cgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacggg 142  Q
    ||||||||||||| | || |||| || ||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||| ||| ||||| |||| |    
T  30481366 cgcccgaaccaaacctaaattgatggattttccctgttttgattgggtttgagtatgagtttgggtttttcctgatttcaaaatacgagtatgagacgag 30481465  T
Q  143 taacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    ||| | | |||       |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30481466 taatgaggata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgtaaaaaa 30481525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 145
Target Start/End: Original strand, 15173821 - 15173927
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||    
T  15173821 tacccgcccaaaccaacctcgatttgacgggttttctctgatttgactgggtttgggtatgtgtttgagtttttcccgatttcaaaatacgggtacggga 15173920  T
Q  139 cgggtaa 145  Q
    |||||||    
T  15173921 cgggtaa 15173927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 236
Target Start/End: Original strand, 28977192 - 28977245
Alignment:
Q  183 acccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28977192 acccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttat 28977245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Original strand, 2075909 - 2075965
Alignment:
Q  180 catacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2075909 catacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttat 2075965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Original strand, 9642351 - 9642455
Alignment:
Q  98 tgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtccc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||     |||||| ||||||| ||||| || || ||||||    
T  9642351 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggggttata--ta-----tatccatcccgaacccatactcatacccgtccc 9642443  T
Q  198 aaatgtaaaaaa 209  Q
    ||||||||||||    
T  9642444 aaatgtaaaaaa 9642455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 209
Target Start/End: Original strand, 8545319 - 8545453
Alignment:
Q  68 ggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtat 167  Q
    ||||||| ||| ||| ||| || ||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||       ||| ||     
T  8545319 ggttttctccgctttaacttggattgggtataagtttgggttttctccgatttcaaaacacgggtatggaacgagtaacggggata-------tagatac 8545411  T
Q  168 ccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8545412 ccaccccgaacccatactcaaactcgtcccaaatgtagaaaa 8545453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Original strand, 17084049 - 17084165
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||      | | | ||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  17084049 gtgggtacccacccgaaccaaattcaagttgacgggttttccccgctttgactgggtt------ttgatttgggttttctccgattttaaaacacgggta 17084142  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatatag 156  Q
     | ||||||||||||| ||||||    
T  17084143 cgagacgggtaacggggatatag 17084165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Original strand, 4230794 - 4230850
Alignment:
Q  180 catacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||    
T  4230794 catacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatacattatgttat 4230850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10297605 - 10297489
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| | ||  | ||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||    
T  10297605 tacccgcccaaaccaatcctgatttgacgggttttccctgattttattgggtttggatgtgaatttgggttttccccgatttcaaaatacggggacggga 10297506  T
Q  139 cgggtaacgggtatata 155  Q
    | ||||||||| |||||    
T  10297505 caggtaacggggatata 10297489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Original strand, 39379581 - 39379627
Alignment:
Q  98 tgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39379581 tgggtatgggttttccc-gatctcaaaacacgggtacgggacgggtaa 39379627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14186408 - 14186347
Alignment:
Q  98 tgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14186408 tgggtttgagtttttctcgatttcaaaacacgggtatgggatgggtaacggatatataggta 14186347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29918750 - 29918665
Alignment:
Q  43 cgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacac 128  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||    
T  29918750 cgcccgaaccaaattcaaactgacgagtttttcctgctttgactggttttgggtatgagtttgagtttttcccgatttcaaaacac 29918665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2075915 - 2075885
Alignment:
Q  129 gggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2075915 gggtatgggacgggtaacgggtatataggta 2075885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 133
Target Start/End: Original strand, 12468166 - 12468254
Alignment:
Q  43 cgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||  | |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  12468166 cgcctgaaccaaacccaatttgatgggttt-ctccgttttgactgg-tttgagtatgaatttgggttttcctcgatttcgaaacacgggta 12468254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16866326 - 16866131
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16866326 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggttatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 16866227  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16866226 tgggacgagtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgt 16866134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 18125164 - 18125359
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18125164 gtggttactcgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgtgtatgagtatgggtttttcccgatctcgaaacacgggta 18125263  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18125264 tgggacgggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacgcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgt 18125356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35074627 - 35074431
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35074627 gtggttacccgcccgaaccaaacccaattagacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatcttaaaacacgggta 35074528  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35074527 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaacccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatg 35074435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21702816 - 21702621
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21702816 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtatgggttttccccgatctcgaaacacgggta 21702717  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21702716 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccataccccaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgt 21702624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30650788 - 30650593
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30650788 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttaggtatgggtatgagttttccccaatctcaaaacacgggta 30650689  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30650688 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgt 30650596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10072621 - 10072429
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10072621 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 10072522  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    | ||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  10072521 gaacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccataaccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 10072429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25905785 - 25905590
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25905785 gtggttacccgctcgaactaaacccaatttgacaggttttcccctttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccaatctcaaaacacaggta 25905686  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaac-tcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  25905685 tgggacgggtaacgggtacataggta--------ccaccccgaactcatacccaaacatcgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatg 25905594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 45885701 - 45885896
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45885701 gtggttacccgctcgaaccaaacccaatttaacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagttttccccgatctcaaaacacgggta 45885800  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||||||||||  |||||       |||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45885801 tgggacgggtaacaagtata-------taggtacccaccccgaacccataccaaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgt 45885893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17852009 - 17851816
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  17852009 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatggattttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatct--taacacgggta 17851912  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||| ||||       |||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17851911 tgggacgggtaacggatata-------taggtacccatcccgaacccatacccaaacccatcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgt 17851819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7780165 - 7779970
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7780165 gtggttacccatccgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 7780066  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||||| ||| |||||||||       |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||    
T  7780065 tgggacggataatgggtatata-------ggtacccaccccgaacctatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaatttattttatgttgatatgttatgt 7779973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17885622 - 17885427
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  17885622 gtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgaatatgggtatgggttttccccgattttaaaacatgggta 17885523  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatcc-accccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  17885522 tgggacgggtaacgggtatataggt--------tccaaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatg 17885431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 39455953 - 39456144
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39455953 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgagttttccccgttttgactgggtttgggtatggatatgggttttccccgatttcaaaacatgggtatg 39456052  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    ||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  39456053 ggacgggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaac-catactcatacccgtcccaaatgt-aaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 39456143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45380261 - 45380068
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  45380261 ggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgg-ttttccctgttttgactgggtttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaaatacgggtatg 45380163  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgtggatatgttatgtt 234  Q
    ||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||    
T  45380162 ggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacctaaactcgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgacatgtcatgtt 45380070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38153041 - 38152849
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38153041 ggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacggattttccc-gttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatttcaaaacatgggtatg 38152943  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    | |||| |||||| ||||       |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  38152942 gaacggataacggctata-------taggtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 38152850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43507600 - 43507407
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43507600 ggttacccgtctgaaccaaacccaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtataagtatgggttttccccgatttcaaaacatgggtatg 43507501  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
     |||||||||||||||||       |||| | |||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  43507500 agacgggtaacgggtata-------taggcacccaccctgaacccatacctatactcgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 43507408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24753320 - 24753196
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24753320 gtggttacccgtccgaaccaaattcaatttgacggattttctccgttttgactgggtttggatatgggtatgggtttt-cccgatctcaaaacacgggta 24753222  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24753221 tgggacgggtaacgggtatataggta 24753196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 3226884 - 3227077
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3226884 ggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacggattttcctcgttttaactgagtttgagtatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 3226983  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    ||||||||||| || |||       |||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  3226984 ggacgggtaacaggaata-------taggtacccaccccgaacccatactcatacacatcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 3227076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37182429 - 37182237
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  37182429 ggttacccgcccgaatcaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatgggttttctccgaattcaaaacacgggtatg 37182330  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |       ||  |||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||    
T  37182329 ggacgggtagcgggtatataggtact-------ca-tccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattatcttatgttgatatgtcatgtta 37182238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39317150 - 39316957
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39317150 ggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggatatgagtatgagttttcctcgatttcaaaacacgggtatg 39317051  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    ||||||||| ||||||||       || ||||||| || ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  39317050 ggacgggtagcgggtata-------tatgtatccatcctgaactcatacccatatccgtctcaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 39316958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 242
Target Start/End: Original strand, 44734297 - 44734494
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  44734297 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccc--ttttgactgggtttgggaatgtgtatgtgtttttctcgatttcaaaacacgggtatg 44734394  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    |||| ||||| |||||||       |||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  44734395 ggaccggtaatgggtata-------taggtacccaccccgaacccatacacatatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 44734487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12980534 - 12980366
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12980534 gtggttacccgctagaaccaaactcaatttaacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggttttggttttccccgatttcaaaacacgggta 12980435  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    |||||||||||| |||||||       || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12980434 tgggacgggtaatgggtata-------taagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcaaaaaa 12980366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 27850268 - 27850457
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27850268 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggtttttccccgttttga------ttgggtttgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggta 27850361  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||| ||       |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |  ||||||| ||||    
T  27850362 tgggacgggtaacgggtgta-------taggtacccatcccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaattactttacgatgatatgtcatgt 27850454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Original strand, 38139730 - 38139896
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  38139730 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatgggttttccccaatttcaaaacacgagtatg 38139829  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    |||||||||| | |||||       || ||| ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  38139830 ggacgggtaatgagtata-------taagtacccaccccgaacccataaccaaacccgtctcaaatgtaaaaaa 38139896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Original strand, 18825803 - 18825933
Alignment:
Q  35 tggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggta------tgggtatgggttttccccgatctcaaaacac 128  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18825803 tggttaaccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtgagggtgtgggtttgggttttccccgatttcaaaacac 18825902  T
Q  129 gggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18825903 gggtatgggacgggtaacgggtatataggta 18825933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 159
Target Start/End: Original strand, 41741388 - 41741511
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41741388 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatgagttttccccatttttactggatttgggtatgagtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 41741487  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
     ||||| |||||||||| ||||||    
T  41741488 agacggataacgggtatgtaggta 41741511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 134
Target Start/End: Original strand, 44658405 - 44658503
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtat 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44658405 ggttacctgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttcctcgttttgactgggtttgggtatgggtatgagtttttcccgatttcaaaacacgggtat 44658503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16079170 - 16079046
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16079170 gtggttacccgcccgaagcaaacctaatttgacgagttttttcggttttgactgagtttgggtataagtttgggttttctccgatctcaaaacacgggta 16079071  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16079070 tgggacgggtaacgggtatataggt 16079046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41103807 - 41103628
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||| ||||||||||||||    
T  41103807 gtggttacccgcgcgaaccaaatccgatttgacggatttttcccgttttgactgggtgtgggtatgggt------tttccccgatttcaaaacacgggta 41103714  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatat 226  Q
    |||||||| |||||||||||       || ||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  41103713 tgggacggttaacgggtata-------taagtacccaccccgaacccatacataaacccgtcctaaatgtaaaaaattattttatgttgatat 41103628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 236
Target Start/End: Original strand, 45708815 - 45708993
Alignment:
Q  42 ccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgg 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||      ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45708815 ccgcccgaatcaaatccaatttgatagattttcctcgttttgactgggttttggta------tgggttttctccgatctcaaaacacgggtattggacgg 45708908  T
Q  142 gtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||    
T  45708909 gtaacgggtata-------taggtacccaccccgaactcatacctaaacccgtccaaaatgtaaaa---tactttatgttgatatgttatattat 45708993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 236
Target Start/End: Original strand, 2630525 - 2630705
Alignment:
Q  49 aaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 148  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2630525 aaccaaacccaatttgacgtgttttacccatttttactgggtttgggtatgggtttgggttttccccgat-ttaaaacatgggtatgggacgggtgacgg 2630623  T
Q  149 gtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatg-taaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||       ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  2630624 gtata-------tagatacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcaaaaaaactactttatgttgatatgccatgttat 2630705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37579418 - 37579294
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||  |    
T  37579418 gtggttacccgcccgaaccaaacccaattagacgggttttccccgttttgactaggtttgggtatgggtttggatttttcccgatttcgaaacacgg--a 37579321  T
Q  134 tggg-acgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||    
T  37579320 tgggtaagggtaacgggtatataggta 37579294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 125
Target Start/End: Original strand, 44785194 - 44785285
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44785194 gtggttacccgcccgaatcaaacccaatttgacgagttttccccgttttgactaagtttgggtatgggtatgggttttctccgatctcaaaa 44785285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3157234 - 3157115
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  3157234 tacccgcccgaaccaaacctaatttgtcgg-ttttccccgctttgacttggtttgggtatgggtttaggttttccccgatttcaaaatatgggtatggga 3157136  T
Q  139 cgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  3157135 cggataacggggatataggta 3157115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5377228 - 5377057
Alignment:
Q  48 gaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5377228 gaaccaaatctaatttaacggatttttcccgttttgattggggttgagtatgagtttgggttttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaaag 5377129  T
Q  148 ggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatat 226  Q
    ||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| |||| | |||| |||||||||| |||||    
T  5377128 ggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaatctgtcccgaatgcagaaaattactttatgttgatat 5377057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 37218157 - 37218047
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || || ||||||||| |||| ||||    
T  37218157 tacccacccgaaccaaactcaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtttgagttttatcctatttcaaaacacaggtacggga 37218058  T
Q  139 cgggtaacggg 149  Q
    |||||||||||    
T  37218057 cgggtaacggg 37218047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 133
Target Start/End: Original strand, 37195945 - 37196044
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37195945 gtggttatccgcccaaaccaaactcaatttgacggattttccctgttttgattaggtttgggtatgggtatggattttccccgatttcaaaacacaggta 37196044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 133
Target Start/End: Original strand, 44985856 - 44985952
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  44985856 ggttacccatccgaaccaaatctaatttgacggattttctccgttttgattgggtttgggtatggatatgggttttctccgatttc-aaacacgggta 44985952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3920680 - 3920500
Alignment:
Q  37 gttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 136  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||            |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3920680 gttacccacccgaaccaaacccaatttgatgggtttttcccgttttgactgggttt------------gggttttccccgatttcaaaacactggtatgg 3920593  T
Q  137 gacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||| |||| ||||||       |||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||  |||||||    
T  3920592 gacggataacaggtata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaaactgtcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgccatgttat 3920500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 27896434 - 27896526
Alignment:
Q  57 ccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 149  Q
    ||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27896434 ccaatttgatgggtttttctcgctttgattgggtttgggtatgggtttgggttttcccttatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggg 27896526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16811812 - 16811692
Alignment:
Q  108 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||        ||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16811812 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgagacggataatgggtatatagata--------cccacccgaacccatacccaaagccgtcccaaatgtaaaa 16811721  T
Q  208 aactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  16811720 aattactttatgttgatatattatgttat 16811692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Original strand, 44794051 - 44794158
Alignment:
Q  121 caaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||        ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  44794051 caaaacacgggtatgagacgggtaacgagtata--------aggtacccaccccgaacccatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgt 44794142  T
Q  221 ggatatgttatgttat 236  Q
     |||||||||||||||    
T  44794143 tgatatgttatgttat 44794158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27063483 - 27063370
Alignment:
Q  42 ccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgg 141  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | || ||||||| |||||||    
T  27063483 ccgcccaaaccaaccccgatttgacggatttttcccaatttgactgggtttgggtatgggtctcggttttccccgatttaataatacgggtacgggacgg 27063384  T
Q  142 gtaacgggtatata 155  Q
    |||||||| |||||    
T  27063383 gtaacgggaatata 27063370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22973505 - 22973425
Alignment:
Q  74 ccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatat 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  22973505 ccccgatttgactgggtttgggtatgggtttgggttttccacgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaatggggatat 22973425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Original strand, 42908003 - 42908098
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  42908003 atttgacggttttttcccaatttgattgggtttgggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaatggggatata 42908098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 149
Target Start/End: Original strand, 8906530 - 8906640
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||    
T  8906530 tacccgcccaaacccactccgatttgacgggttttctccgctttgattggatttgggtatgggtttgagttttctccgatttcaaaacacgagtatgaga 8906629  T
Q  139 cgggtaacggg 149  Q
    ||  |||||||    
T  8906630 cgaataacggg 8906640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18684091 - 18684005
Alignment:
Q  74 ccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtat 160  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  18684091 ccccgatttgactaggtttgggtatgggttcgggttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacagggatatatgtat 18684005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 96
Target Start/End: Original strand, 26004422 - 26004484
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26004422 gtggttacccgcccgaaccaaacacaatttgatgggtttttcccgttttgactgggtttgggt 26004484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 160
Target Start/End: Original strand, 30839074 - 30839196
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttcc-ccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggg 137  Q
    ||||||| | ||||||  || |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  30839074 tacccgctcaaaccaaccccgatttgacgggttttcttccgatttgactgggtttgggtatgagtttgagttttccctgatttcaaaatacgggtatggg 30839173  T
Q  138 acgggtaacgggtatataggtat 160  Q
    ||| |||||| | ||||| ||||    
T  30839174 acgagtaacgtggatatatgtat 30839196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33841208 - 33841123
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaac 146  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33841208 atttgacgggtttttcccgctttgactgg-tttgagtatgaatttgagttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 33841123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27063290 - 27063146
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||| ||| ||||||  || ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||| |||| |||||| |||||||  |||    
T  27063290 taccctcccaaaccaaccccgatttgacggattttccctgatttgactgggtttgggtatgagtttgagttttcctcgatttcaaaatacgggtacagga 27063191  T
Q  139 cgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaac 190  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| |       ||||||||||||||||||||||    
T  27063190 cggataacggggatatatgtact-------caccccgaactcatacccaaac 27063146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24425525 - 24425412
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  |            |||| | ||| ||||||||||||||    
T  24425525 gtggttaccagcccgaaccaaacccaatttgacggattttctccgttttgattgggtttgaat------------tttctctgatttcaaaacacgggta 24425438  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24425437 tgggacgggtaacgggtatataggta 24425412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 236
Target Start/End: Original strand, 25979921 - 25980048
Alignment:
Q  102 tatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaat 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||       || ||| ||||||| ||||||||||||||  | | ||||||    
T  25979921 tatgggttttccccgatttcaaaacacaggtatgagacgggtaacggatata-------tatgtacccaccccaaactcatacccaaatcctttccaaat 25980013  T
Q  202 gtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||||| || ||||||| || |||| |||||||    
T  25980014 gtaaaaaattattttatgttgaaatgtcatgttat 25980048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26623044 - 26622913
Alignment:
Q  98 tgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtccc 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||       || ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  26623044 tgggtttgggttttccctgatttcaaaacacgggtatgggatgggtaatgggtata-------taagtacccaccccgaacccatacccaaactcgtttc 26622952  T
Q  198 aaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
     |||| |||||| || ||||||| ||||||  |||||||    
T  26622951 gaatgcaaaaaattattttatgttgatatgccatgttat 26622913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 29157503 - 29157380
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctc--aaaacacgggtatgg 136  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||  || | |||||||||     
T  29157503 tacccgtccaaaccaactccgatttgacgggttttcaccaatttgacagggtttgggtatggttttggattttccccgatttcataatatacgggtatga 29157404  T
Q  137 gacgggtaacgggtatataggtat 160  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  29157403 gacgggtaacggggatatatgtat 29157380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31426119 - 31426039
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtat 160  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  31426119 tttgactgggttttggtattggtttgggttttccccgatttaaaaatacgggtatgagacgggtaacggggatatatgtat 31426039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 216
Target Start/End: Original strand, 5565269 - 5565418
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||| |||||||||       |||     
T  5565269 atttgacggattttccccgctttgactggatttggttataggtttgggttttccctgatttcaaagtacggatatgggatgggtaacgg-------ggtt 5565361  T
Q  160 ttaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactacttt 216  Q
     || ||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||    
T  5565362 atatgtacccacccctaacccatacccatacacatcccaaatgtaaaaaattacttt 5565418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 96
Target Start/End: Original strand, 23533557 - 23533614
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23533557 taccctcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgatttgactgggtttgggt 23533614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23329144 - 23329020
Alignment:
Q  35 tggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtat 134  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||| || |  ||||| || ||| | ||||||   ||||    
T  23329144 tggttatccgcttgaaccaaattcaatttgacgggtttttcctgttttagctgggattgggtatgagtttaagtttttcctgattttaaaacatctgtat 23329045  T
Q  135 gggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  23329044 gggacgggtagcgggtatataggta 23329020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24753193 - 24753137
Alignment:
Q  180 catacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  24753193 catacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttat 24753137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 236
Target Start/End: Original strand, 37196061 - 37196129
Alignment:
Q  168 ccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37196061 ccaccccgaatccatacccaaacccgtcataaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttat 37196129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Original strand, 10990820 - 10990923
Alignment:
Q  57 ccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatag 156  Q
    |||||| ||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||    
T  10990820 ccaattagacaggttttccccgccttgaatgagtttgagtatgggttgggtttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaatagggatatag 10990919  T
Q  157 gtat 160  Q
    ||||    
T  10990920 gtat 10990923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23457203 - 23457156
Alignment:
Q  47 cgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgg 94  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23457203 cgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgctttgactgggtttgg 23457156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 93
Target Start/End: Original strand, 19439971 - 19440017
Alignment:
Q  47 cgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttg 93  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19439971 cgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgctttgactgggtttg 19440017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 96
Target Start/End: Original strand, 23475211 - 23475273
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23475211 gtggataccctctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgctttgactgggtttgggt 23475273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 44845113 - 44845178
Alignment:
Q  76 ccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgg 141  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  44845113 ccgttttgactgagttttggtatgggtttgggttttccccgatttcataatacgggtacgggacgg 44845178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 146
Target Start/End: Original strand, 10995830 - 10995882
Alignment:
Q  94 ggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaac 146  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10995830 ggtatgagtttgggttttccccgatttcaagacacgggtatgggacgggtaac 10995882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43218400 - 43218273
Alignment:
Q  74 ccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccc 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| || |  |||  ||||||||||||||  ||||| ||| |       |||||    
T  43218400 ccccgatttgactgggtttgggtatgggtttgggttttccccaatttcataatataggtgcgggacgggtaacggcgatatatgtact-------caccc 43218308  T
Q  174 cgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaa 208  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  43218307 cgaactcatacccaaaccctagccaaatgtaaaaa 43218273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Original strand, 44658516 - 44658580
Alignment:
Q  172 cccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||    
T  44658516 cccgaacccatacccaaacccgtaccaaatgtaaaaaaatattttatgttgatatgtcatgttat 44658580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 74 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32546312 - 32546228
Alignment:
Q  74 ccccgttttgactgggtttggg---tatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  32546312 ccccgatttgactgggtttggggcgtatgggtttggatttttcccgatttcaaaatacgggtacggaacgggtaacggggatata 32546228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 156
Target Start/End: Original strand, 26004480 - 26004532
Alignment:
Q  104 tgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatag 156  Q
    |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26004480 tgggttttcctcgatttcaaaacttgggtatgggacgggtaacaggtatatag 26004532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 147
Target Start/End: Original strand, 37103068 - 37103176
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||| |||  || || ||||| || ||| |||||| ||||||| ||||    
T  37103068 tacccgctcaaaccaactccaatttgacggatcttctccgatttgattgggtttggatataagtttgtgtttttcctgatttcaaaatacgggtacggga 37103167  T
Q  139 cgggtaacg 147  Q
     ||||||||    
T  37103168 agggtaacg 37103176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Original strand, 29014929 - 29015043
Alignment:
Q  75 cccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccacccc 174  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||  ||| |  ||||||||||    
T  29014929 cccgatttgattgggtttaggtatgagtttgagtttttcccgatttcaaaatacgggtacgggacggatagcggggatatatatat-atatatccacccc 29015027  T
Q  175 gaactcatacccaaac 190  Q
    |||| ||||| |||||    
T  29015028 gaacccatactcaaac 29015043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29292803 - 29292736
Alignment:
Q  92 tgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||  | |||||||||    
T  29292803 tgggtttgggtatggattttccccgatttcaaaacacgggtacgagatgggtaacatggatataggta 29292736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28309579 - 28309523
Alignment:
Q  104 tgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtat 160  Q
    |||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28309579 tgggttctccctgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacgggaatatatgtat 28309523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 76)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43893385 - 43893191
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43893385 gtggttacccgcccgagccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg-tttccccgatctcgaaacacgggta 43893287  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43893286 tgggacgggtaacgggtata-------taggtatccaccccgaattcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgt 43893194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7609128 - 7608933
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7609128 gtggttacccacccgaactaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactggatttgggtatgggtatgggttttccccgatctcgaaacacgggta 7609029  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7609028 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactctatgttgatatgttatgt 7608936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 6382209 - 6382405
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6382209 gtggttacccgcccgaatcaaacccaatttgacgggttttccccgctttgactgggtttgggtatgggtatgggttttctccgatctcaaaacacgggta 6382308  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6382309 tgggacgggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactattttatgttgatatgttatg 6382401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44317693 - 44317497
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44317693 gtggttactcgcccgaatcaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcgaaacacgggta 44317594  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44317593 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatg 44317501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11028231 - 11028035
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11028231 gtggttacccacccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactggatttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 11028132  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  11028131 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaactcatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaaattactttatattgatatgttatg 11028039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21424019 - 21423824
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21424019 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccaatctcgaaacacgggta 21423920  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    || |||||||||||||||||||       |||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  21423919 tgagacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccaaacccatacacaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatat 21423827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 31918495 - 31918691
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31918495 gtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatgggttttccccgatctcgaaacacgggta 31918594  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||||| |||| |||||||       ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31918595 tgggacgagtaatgggtata-------tagttacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatg 31918687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 5902557 - 5902746
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5902557 gtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtt------tgggtatgggttttccccgatctcgaaacacgggta 5902650  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  5902651 tgggacgggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatct 5902743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 55826560 - 55826756
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  55826560 gtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacggattttccctgttttgactgggtttggatatgagtatgggttttccccgatctcgaaacacaggta 55826659  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55826660 tgggacgggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatatccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatg 55826752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 11122806 - 11123001
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11122806 gtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacggattttttccgttttgactgagtttgggtatgggtatgggttttctccgatctcgaaacacgggta 11122905  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  11122906 tgggacgggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttttgt 11122998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 47550290 - 47550485
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47550290 gtggttacccgcccgaaccaaactcaatttggcggattttccccattttgactgggtttgggtataggtatgagttttccccgatctcaaaacacgggta 47550389  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||| ||||||       |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  47550390 tgggacgggtaacaggtata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgt 47550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31752612 - 31752419
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31752612 ggttacccgcccgaatcaaatccaatttgacgggtttttaccgttttgattgggtttggatatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 31752513  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
     |||| |||||| |||||       |||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  31752512 agacgagtaacgagtata-------taggttcccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 31752420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26564989 - 26564795
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||| ||||||| ||||||    
T  26564989 gtggttacccacccgaaccaaatccaatttgacggattttcttcgttttgactgggtttgggtatgagtttgagctttccccgatttcaaaacgcgggta 26564890  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26564889 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaaaccatacccaaacccgtcccaaatgcagaaaactactttatgttgatatgtcatgt 26564797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Original strand, 15987201 - 15987367
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  15987201 ggttacccacccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccattttgattgggtttgggtatgggtatgagttttcccagattttaaaacacgggtatg 15987300  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    ||| ||||||||||||||       ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15987301 ggatgggtaacgggtata-------tagatacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatataaaaaa 15987367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48459637 - 48459444
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  48459637 ggttacccgtccgaatcaaaccaaatttgatgggtttttcccattttgattggatttgagtatggatatgggttttccccgatttcaaaacatgggtatg 48459538  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    | ||||||||| ||||||||       |||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  48459537 gaacgggtaacaggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccatacccatcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgtta 48459445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39047108 - 39046923
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  39047108 ggttacccgtccgaatcaaacccaatttgatgggttttctccgttttgactgaatttgagtatgggtatgggttttccccaatttccaaacacgggtatg 39047009  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    ||||  ||||||||||||||       |||| |||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39047008 ggacatgtaacgggtatata-------ggtacccactccaaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 39046923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 37349270 - 37349171
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37349270 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacaggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtttgagttttccccgatttcaaaacacgggta 37349171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39375436 - 39375314
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  39375436 gtggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggtttttcctattttgactgagtttggatatgagtttggcttttccccgatttcaaaatacgggta 39375337  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatatag 156  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  39375336 taggacgggtaacgggtatatag 39375314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 19882998 - 19883161
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  19882998 tacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgctttgattgggtttgagtatgagtttgggttttccccgattttaaaacacggatacggga 19883097  T
Q  139 cgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
     |||||||||| |||       ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  19883098 agggtaacggggata-------taggtatccaccccgaaccgatacacaaactcgtcccgaatgtataaaa 19883161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32585639 - 32585468
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |      |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32585639 ggttatccgcccaaaccaaacccaatttgaccggttttcccctttttgactgggtttgggtatgaat------tttctccgatttcaaaacacgggtatg 32585546  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgt 220  Q
    |||| |||||||||||||||       |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32585545 ggacaggtaacgggtatata-------ggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaacttactttatgt 32585468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Original strand, 6481972 - 6482140
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||    
T  6481972 gtggttatccacccgaatcaaactcaatttgacggattttctctgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccaatttaaaaacacgggta 6482071  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    ||||||| |||| |||||||       || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6482072 tgggacgagtaaagggtata-------tatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcaaaaaa 6482140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 236
Target Start/End: Original strand, 1724307 - 1724442
Alignment:
Q  94 ggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcg 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||       |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1724307 ggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggttata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaacccg 1724399  T
Q  194 tcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1724400 tcccgaatgcagaaaactactttatgttgatatgtcatgttat 1724442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37107553 - 37107444
Alignment:
Q  49 aaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 148  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37107553 aaccaaatttaatttgacgggtttttcccattttgactgggtttgtgtatgagtttgggttttccca-atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 37107455  T
Q  149 gtatataggta 159  Q
    |||||||||||    
T  37107454 gtatataggta 37107444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42299944 - 42299754
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||     
T  42299944 ggttacccatccgaaccaaactcaatttgacgggttttttccggtttgactgagtttaggtatgggtatggattttccccgatttcaaaacac-ggtat- 42299847  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    ||||||||||||||||||       |||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||  ||||||    
T  42299846 ggacgggtaacgggtata-------taggtacccaccctgaacccatactcaaacacgtcccaaatat-aaaaagtactttatgttgatatgccatgtta 42299755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10302242 - 10302067
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||| |||||||||  ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  10302242 gtgggtacccgcccatacccactccgatttgatgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttaggttttccccgatttcaaagtacgggta 10302143  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactacttt 216  Q
    || ||||||||||||       |||  || ||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||    
T  10302142 tgagacgggtaacgg-------ggttatatgtacccaccccgaacccatacccatatccgtcccaaatgtaaaaaattacttt 10302067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 145
Target Start/End: Original strand, 19548886 - 19548985
Alignment:
Q  45 cccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggta 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  19548886 cccgaaccaaacccaatttgacgg-ttttcccctctttgactgggtttgggtatggataagggttttccccgatttcaaaacacaggtacgggacgggta 19548984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 43309614 - 43309526
Alignment:
Q  61 tttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 149  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43309614 tttgacgggttttctccgctttgactgggtttgagtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 43309526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 1724211 - 1724308
Alignment:
Q  38 ttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 136  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  1724211 ttacccacccgaaccaaactcaatttgacgtgttttccccgttt-gactgggtttgggtatgggtttgggtttttcccgatttcaaaacatgggtatgg 1724308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Original strand, 7334142 - 7334258
Alignment:
Q  42 ccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgg 141  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  7334142 ccgcctgaaccaaacctaatttgacgggtttttcccgctttgactgggtttgggtatggatttggattttccccgatttcaaaacac-ggtacgggacgg 7334240  T
Q  142 gtaacgggtatataggta 159  Q
     ||| ||| |||||||||    
T  7334241 ataatggggatataggta 7334258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Original strand, 7985062 - 7985174
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  7985062 gtggttatccgcctgaaccaaacccaatttgacgggttttcctggttttgattgggtttgggtataagtttggattttctccgatttcaaaacatgggta 7985161  T
Q  134 tgggacgggtaac 146  Q
    |||||||| ||||    
T  7985162 tgggacggataac 7985174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19534592 - 19534418
Alignment:
Q  49 aaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||      |||| |||||| ||||| | ||||   |||||||||||||||||| |    
T  19534592 aaccaaatccaatttgacgggttttctccgttttcattgggtttggg------tatgagttttctccgattttaaaatctgggtatgggacgggtaacag 19534499  T
Q  149 gtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||       |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||| ||||||| |||||||    
T  19534498 gtata-------taggtacccacctcgaactcatacccaaacccgtcacgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgttat 19534418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Original strand, 47239368 - 47239517
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaact 179  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||  |||||| ||||     
T  47239368 tttgattggatttggatatgggtatggattttttccgattttaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtata-------taggttcccaccctgaacc 47239460  T
Q  180 catacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||    
T  47239461 catacccatacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttat 47239517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 133
Target Start/End: Original strand, 12505479 - 12505577
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt-gggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12505479 ggttaccctcccgaaccaaatttaaattgacgggttttctccgctttgattgggtttagggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 12505577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 158
Target Start/End: Original strand, 32596192 - 32596245
Alignment:
Q  105 gggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggt 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32596192 gggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggt 32596245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 41914941 - 41915054
Alignment:
Q  42 ccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgg 141  Q
    |||||| ||||||  || |||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||    
T  41914941 ccgcccaaaccaaccccgatttgatggattttccccgatttgactgggttcgggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatatgggtacgggaagg 41915040  T
Q  142 gtaacgggtatata 155  Q
    |||||||| |||||    
T  41915041 gtaacggggatata 41915054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 192
Target Start/End: Original strand, 1866486 - 1866637
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||| ||| ||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  1866486 gtgggtactcgcccaaaccaaccccgatttgacggattttccccgatttgactaggtctgggtatgagtatgggtttttcccgatttcaaaatacgggta 1866585  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactc 192  Q
     | ||||||||| | | |||       || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1866586 cgagacgggtaatgcggata-------tatgtatccaccccgaacccatacccaaactc 1866637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45065402 - 45065286
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  45065402 tacccgcccaaaccaaccccgatttgacgagttttccccaatttgactgggtttgggtataggtttaggttttcctcgatttcaaaatacgggtacggga 45065303  T
Q  139 cgggtaacgggtatata 155  Q
    || ||||| || |||||    
T  45065302 cgagtaacagggatata 45065286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 96
Target Start/End: Original strand, 53906277 - 53906337
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53906277 ggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggt 53906337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 158
Target Start/End: Original strand, 21956756 - 21956875
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| | ||| |||||||||| || ||||||||  ||||| | |||||||||||| || |    
T  21956756 tacccgcccgaaccaaatcaaatttgacaggtttttcccattttaattggatttgggtatgagtttgggttttttccgattttaaaacacgggtacggaa 21956855  T
Q  139 cgggtaacgggtatataggt 158  Q
     | |||||||| ||||||||    
T  21956856 tgagtaacggggatataggt 21956875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 155
Target Start/End: Original strand, 12825468 - 12825519
Alignment:
Q  104 tgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12825468 tgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggatatata 12825519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39086305 - 39086190
Alignment:
Q  44 gcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggt 143  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| |||| ||||  || ||||||    
T  39086305 gcccaaaccaaactcaatttgacggattttctccgttttgattgggtttggatatgagtttgagttttctccgatttcacaacatgggtgcggtacgggt 39086206  T
Q  144 aacgggtatataggta 159  Q
    |||||| |||||||||    
T  39086205 aacggggatataggta 39086190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36919269 - 36919155
Alignment:
Q  46 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||| || || |||||||||||  | |||||| | |||| ||||| ||||    
T  36919269 ccgaaccaaactcaatttgacgggtttttctcgctttaactgggtttgggtatgagtttgagttttccccgactttaaaacatgtgtataggacgagtaa 36919170  T
Q  146 cgggtatataggtat 160  Q
    || | ||||||||||    
T  36919169 cgtggatataggtat 36919155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 235
Target Start/End: Original strand, 53906362 - 53906436
Alignment:
Q  161 taggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  53906362 taggtacccaccccgaacccatatctaaactcgtcccaaatgtaaaaaattacttcatgttgatatgtcatgtta 53906436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 148
Target Start/End: Original strand, 15733468 - 15733577
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||  ||||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | ||    
T  15733468 tacccgcccaaaccaaccccgatttgataggttttccccgattttattaggtttgggtatggatatgagttttcctcgatttcaaaatacgggtacgaga 15733567  T
Q  139 cgggtaacgg 148  Q
    ||||||||||    
T  15733568 cgggtaacgg 15733577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25941272 - 25941171
Alignment:
Q  58 caatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 157  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||| | |||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||    
T  25941272 caatttaatgggttttccccactttgatttggtttgggcatgtgtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtacgggacaggtaacgggaagatagg 25941173  T
Q  158 ta 159  Q
    ||    
T  25941172 ta 25941171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30673095 - 30672998
Alignment:
Q  58 caatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||    
T  30673095 caatttgacgggttttccctgatttgattgggtttgggtatgagtttggattttctccgattttaaaatacgggtacgggacggataatggggatata 30672998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Original strand, 9929118 - 9929229
Alignment:
Q  47 cgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| | |||||||||    
T  9929118 cgaaccaaatccattttgactggatttcccccttt-gactagatttgggtatgggtatgagtttttcctgatttcaaaatacgggtatagtacgggtaac 9929216  T
Q  147 gggtatataggta 159  Q
      | |||||||||    
T  9929217 atggatataggta 9929229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3737908 - 3737821
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||| ||| |||||  ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3737908 atttgacggattttttccgctttgacttggtttaggtgtgggttagggtttttcccaatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 3737821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Original strand, 14605908 - 14605983
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||| || |||||    
T  14605908 tttgactgagtttgggtatgggtttgggttttctccgatttcaaaatacgggtacgagacgggtaacagggatata 14605983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Original strand, 8843754 - 8843864
Alignment:
Q  46 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| || ||  |||| |||||| | ||||||| |||  ||||||||||     
T  8843754 ccgaaccaaattaaatttgacgggttttccgtgctttgactgggtttggatatgtgtttgaatttttcccgattttaaaacacaggtgcgggacgggtag 8843853  T
Q  146 cgggtatatag 156  Q
    |||| ||||||    
T  8843854 cggggatatag 8843864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Original strand, 8856718 - 8856828
Alignment:
Q  46 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| || ||  |||| |||||| | ||||||| |||  ||||||||||     
T  8856718 ccgaaccaaattaaatttgacgggttttccgtgctttgactgggtttggatatgtgtttgaatttttcccgattttaaaacacaggtgcgggacgggtag 8856817  T
Q  146 cgggtatatag 156  Q
    |||| ||||||    
T  8856818 cggggatatag 8856828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 11696953 - 11696875
Alignment:
Q  57 ccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  11696953 ccaatttgataggttttcttcgtgttgactgggtttgggtatgggtttaggttttctccgatttcaaaacaccggtatg 11696875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Original strand, 33615278 - 33615391
Alignment:
Q  46 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaa 145  Q
    |||||||||| || ||||||| | |||| || | || || ||||||||||||||||| |  ||||||| |||| | | || || ||||||||||||||||    
T  33615278 ccgaaccaaacccgatttgacagattttacctgcttagattgggtttgggtatgggtttaagttttcctcgatttaataaaacaggtatgggacgggtaa 33615377  T
Q  146 cgggtatataggta 159  Q
    |||| |||||||||    
T  33615378 cggggatataggta 33615391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 47103856 - 47103783
Alignment:
Q  74 ccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  47103856 ccccgatttgactgggtttttgtatgggtttgggttttccccaatttcaaaatacgggtacggggcgggtaacg 47103783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 147
Target Start/End: Original strand, 25265127 - 25265214
Alignment:
Q  59 aatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  25265127 aatttgacgggttttttccgctttgactgcgtttgggtatggct-tgggttttccccgattttaaaacatgggtacgggataggtaacg 25265214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Original strand, 31415873 - 31415989
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| || |||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  31415873 tacccgcccaaatcaaccccgatttaacgggttttccccgatttgactgggtttaggtataagtttggattttctccgatttcaaaatacgggtacggga 31415972  T
Q  139 cgggtaacgggtatata 155  Q
     || |||| || |||||    
T  31415973 tggataacagggatata 31415989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43553581 - 43553498
Alignment:
Q  57 ccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacg 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  | | | ||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  43553581 ccaatttgacgggttttctccgctttgactgagtttgggtatgcatttcgatttttttcgatttcaaaacacgggtatgggacg 43553498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 96
Target Start/End: Original strand, 25298787 - 25298844
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||    
T  25298787 tacccgcccgacccaaattcaatttgacggatttttcccactttgactgggtttgggt 25298844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 242
Target Start/End: Original strand, 28695207 - 28695280
Alignment:
Q  169 caccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttatattatt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| | |||||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  28695207 caccccgaactcatacccaaactcgtctcaaatataggaaattgctttatgttgatatgcaatgttattttatt 28695280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29527905 - 29527849
Alignment:
Q  99 gggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  29527905 gggtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacgtgacgggtaacggggatata 29527849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 94
Target Start/End: Original strand, 30266284 - 30266339
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgg 94  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30266284 tacccgcccaaaccaaccccgatttgacgggttttctccgatttgactgggtttgg 30266339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 30285904 - 30285849
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgg 94  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30285904 tacccgcccaaaccaaccccgatttgacgggttttctccgatttgactgggtttgg 30285849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36306869 - 36306818
Alignment:
Q  108 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  36306869 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgagacggttaacggggatataggta 36306818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42907994 - 42907876
Alignment:
Q  84 actgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcata 183  Q
    ||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||  ||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||        ||||||||| | ||||    
T  42907994 actggatttgggtatgattatgagttttctccgaattcaaaacacggatacgggacgagtaatggggatataggtac-------ccaccccgagcccata 42907902  T
Q  184 cccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  42907901 cccaaactcgtcccgaatgtagaaaa 42907876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 139
Target Start/End: Original strand, 4737862 - 4737944
Alignment:
Q  57 ccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggac 139  Q
    |||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||  |||| || |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  4737862 ccaattcgatgggttttcccccctttgacttggtttgaatatgagtttgggttttcctcgattttaaaacatgggtatgggac 4737944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 155
Target Start/End: Original strand, 4741189 - 4741274
Alignment:
Q  69 gttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  4741189 gttttccccgttt-gactgagtttggatatgagtttgagttttcctcgattttaaaacatgggtatgggacggataacagggatata 4741274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 93
Target Start/End: Original strand, 10574373 - 10574427
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttg 93  Q
    ||||||||| || |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10574373 tacccgcccaaatcaatcccgatttgacgggttttccccgatttgactgggtttg 10574427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 568526 - 568489
Alignment:
Q  59 aatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  568526 aatttgacgggttttccccgatttgactaggtttgggt 568489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 92 - 133
Target Start/End: Original strand, 4766329 - 4766370
Alignment:
Q  92 tgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4766329 tgggtatgggtataggttttccccgaattcaaaacacgggta 4766370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 29527953 - 29527896
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  29527953 tacccgcccaaaccaacttcgatttgacgggttttccccgctttgatagggtttgggt 29527896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31782707 - 31782650
Alignment:
Q  98 tgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||| |||||    
T  31782707 tgggtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacggtacaggtaacggggatata 31782650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33916180 - 33916147
Alignment:
Q  176 aactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33916180 aactcatacccaaactcatcccaaatgtaaaaaa 33916147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 159
Target Start/End: Original strand, 35304489 - 35304578
Alignment:
Q  70 ttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |  || | ||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35304489 ttttctccgttttgattggatttggatatgggtttgggttttctctaattttaaaacataagtacgggacgggtaacggggatataggta 35304578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 13770519 - 13770571
Alignment:
Q  168 ccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgt 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  13770519 ccaccccgaactcatactcaaacccgtcccgaatgcataaaactattttatgt 13770571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42774768 - 42774724
Alignment:
Q  192 cgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  42774768 cgtccaaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttat 42774724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 102
Target Start/End: Original strand, 50375865 - 50375925
Alignment:
Q  42 ccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggt 102  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  50375865 ccgcccgaaccaaactcaattcgacggatttttcccgctttgattgggtttgggcatgggt 50375925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 24414068 - 24414263
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24414068 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatcggttttccccgatctcaaaacacgggta 24414167  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||| ||||||       |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24414168 tgggacgggtaacaggtata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgt 24414260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30847099 - 30846903
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30847099 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcgaaacacgggta 30847000  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30846999 tgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaattgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatg 30846907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9632539 - 9632344
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9632539 gtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgaatgggtttgagtatgggtatgggttttccccgatctcgaaacacgggta 9632440  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9632439 tgggacgggtaatgggtatatag-------gtatccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgt 9632347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13830888 - 13830694
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13830888 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttttcctcgatctcaaaacacgggta 13830789  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||| |||||||||||||       || ||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13830788 tgggac-ggtaacgggtata-------taagtacccaccccgaacccatactcaaacctgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgt 13830697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 36128042 - 36128238
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||| || |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  36128042 gtggttactcgtccgaaccaaacctaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgtggtttccccgatctcgaaacacgggta 36128141  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |       |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36128142 tgggatgggtaacgggtatataggtact-------caccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatg 36128234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37106843 - 37106720
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37106843 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 37106744  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37106743 ggacgggtaacgggtatataggta 37106720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37999630 - 37999441
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37999630 gtggttagtcgcccgaaccaaattcaatttgacgggtttcccccattttgactgggt------atgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 37999537  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    || |||||||||||||||||       || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37999536 tgagacgggtaacgggtata-------taagtacccaccccgaactcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgt 37999444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10920791 - 10920603
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||    
T  10920791 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgataggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggattttttccgatctcaaaacacgagta 10920692  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||         |||||     |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10920691 tgggacgg---------atata-----taggtatccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgt 10920606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 7314586 - 7314779
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||    
T  7314586 ggttaaccgcccgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatgggttttccccgattttaaaatacgagtatg 7314685  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    ||||||||||||||||||       |||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  7314686 ggacgggtaacgggtata-------taggttcccaccccgaacccatacccacacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 7314778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 8915874 - 8916068
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8915874 gtggttatccgcccaaatcaaattcaatttgacggatttttcccgttttgactgagtttggatatgggtatgggtttt-ctcgatctcaaaacacgggta 8915972  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||||||||| ||||||       |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  8915973 tgggacgggtaacaggtata-------taggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgt 8916065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Original strand, 13705292 - 13705492
Alignment:
Q  35 tggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg------gttttccccgatctcaaaacac 128  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||||    
T  13705292 tggttacccgtccgaaccatacccaatttgacgggttttccccgttttgacagggtttgggtatgggtatgggtatgagttttccccgatttcaaaacac 13705391  T
Q  129 gggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||       |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  13705392 gggtatgagacaggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtgaaaaattactttatgttgatatgt 13705484  T
Q  229 tatgttat 236  Q
     |||||||    
T  13705485 catgttat 13705492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 37472698 - 37472820
Alignment:
Q  37 gttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 136  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37472698 gttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatggattttccccgatttcaaaacacgggtatgg 37472797  T
Q  137 gacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  37472798 gacgggtaacgggtatttaggta 37472820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 236
Target Start/End: Original strand, 10208375 - 10208561
Alignment:
Q  42 ccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgg 141  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10208375 ccgcccgaaccaaagttaatttgacgg-ttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccaatcttaaaacacgggtatgggacgg 10208473  T
Q  142 gtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||| || ||||       |||||| | ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  10208474 gtaatggatata-------taggtacctaccccgaacccatactcaaaccagtcccaaatgtaaaaaattactttatgttaatatgttatgttat 10208561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45115701 - 45115516
Alignment:
Q  46 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatggg--tatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45115701 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatatgagttttcctcgatttcaaaacacgggtatgagacgggt 45115602  T
Q  144 aacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||| ||||||       |||||| ||| ||||||| ||||   |||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  45115601 aacaggtata-------taggtacccatcccgaacccatagttaaacccatcccaaatgtaaaaaattacattatgttgatatgtcatgttat 45115516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Original strand, 12193766 - 12193958
Alignment:
Q  37 gttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 136  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  12193766 gttacccacccgagccaaacccaatttgacgggtttttccgattttgactgggtttgggtatgagtatgtgtttttcccgatttcagaacacgggtatgg 12193865  T
Q  137 gacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||||||| |||||||       ||| || ||||| ||||  |||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  12193866 gacgggtaatgggtata-------tagatacccacctcgaatccatatccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttat 12193958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12341751 - 12341648
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12341751 ggttatccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacaggtatg 12341652  T
Q  136 ggac 139  Q
    ||||    
T  12341651 ggac 12341648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 242
Target Start/End: Original strand, 44746047 - 44746246
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  44746047 ggttacccacccgtaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgagtttgggtatggatttgggttttccccgatttcaaaacacgaatatg 44746146  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
    |||||||||| |||||||       || ||| ||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||  ||||||    
T  44746147 ggacgggtaatgggtata-------tatgtacccacttcaaactcatactcaaacccgtcccaaatgtagaaaatcactttatcttgatatgccatgtta 44746239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 134
Target Start/End: Original strand, 18106054 - 18106155
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaattt-gacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106054 gtggttacccgcccgaatcaaactcaattttgacggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggt 18106153  T
Q  133 at 134  Q
    ||    
T  18106154 at 18106155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45256962 - 45256789
Alignment:
Q  48 gaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    ||||||||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  45256962 gaaccaaatcagatttaatggatttttcccgttttgactgggtgtggatatgagtatgagttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggttaatg 45256863  T
Q  148 ggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    ||||||       || ||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  45256862 ggtata-------taagtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttattttgatatgt 45256789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 155
Target Start/End: Original strand, 31942121 - 31942243
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctc-aaaacacgggt 132  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  31942121 gtggttacccgcccaaaccaaactcaatttgatgggtttttcccgctttgactgggtttggatatgggtttgggttatcctcgatttcaaaaacacgggt 31942220  T
Q  133 atgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||    
T  31942221 atgagacgggtaacaggtatata 31942243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22900942 - 22900779
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| |||| |  || |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22900942 tacccgccctaacccatcccgatttgacgggttttcctcactttgacttggtctgggtatgggtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatggga 22900843  T
Q  139 cgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    || ||||||||  ||||  ||     || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  22900842 cgagtaacggggttata--ta-----tacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaacgtaaaaaa 22900779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 42797937 - 42798120
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||      || |||||| |||||||      |||||||||||||    
T  42797937 gtggttacccgcccgaaccaaatctaatttgacgggtttt-tctgttttgactgggtt------tgagtatggattttccc------caaaacacgggta 42798023  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    || |||||||||||||||||       || ||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42798024 tgagacgggtaacgggtata-------taagtacccaccccgaacccatacacaaacctgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgttatg 42798116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15546871 - 15546785
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaac 146  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15546871 atttgacgagttttccccgctttgactggatctgggcatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 15546785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Original strand, 19104785 - 19104903
Alignment:
Q  46 ccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgg----gtatgggacgg 141  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||    |||||||| |     
T  19104785 ccgaatcaaacccaatttgatgggttttttccgttttgattgggtttgggtatgagtttgggttttccccgatttccaaacacgggcctgtatgggatgt 19104884  T
Q  142 gtaacgggtatataggtat 160  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19104885 gtaacgggtatataggtat 19104903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Original strand, 6027837 - 6027950
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||            ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  6027837 gtggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtt------------tgggttttccccgattttaaaacatgggta 6027924  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    || |||||||||| ||||||||||||    
T  6027925 tgagacgggtaacaggtatataggta 6027950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 159
Target Start/End: Original strand, 35248336 - 35248446
Alignment:
Q  49 aaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 148  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| |  ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35248336 aaccaaacccattttgatgggttttcctcactttgattgagtttgggtacgggtttgggttttccacgattacaaaacacgggtatgggacgggtaaagg 35248435  T
Q  149 gtatataggta 159  Q
    | ||| |||||    
T  35248436 ggataaaggta 35248446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10212533 - 10212444
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 149  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||    
T  10212533 atttgacgagtttttcctgttttgactgggttttggtatgagtttgggttttccccgatttccaaacacggttacgggacaggtaacggg 10212444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14331669 - 14331559
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||      ||||||||||| || | |||| || |||||||||    
T  14331669 tacccacccaaaccagctccgatttgacgggttttccccggtttgactaggtttgggtat------gggttttcccctatttaaaaatacaggtatggga 14331576  T
Q  139 cgggtaacgggtatata 155  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14331575 cgggtaacggggatata 14331559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26755888 - 26755772
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    |||| |||| ||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| | |||| | |||||| |||    
T  26755888 tacctgcccaaaccaaccccgatttgacgggtttttcccgatttgactgggtttgggtatgagtttgggttttcttcgattttaaaatatgggtatcgga 26755789  T
Q  139 cgggtaacgggtatata 155  Q
    ||  ||||||| |||||    
T  26755788 cgattaacggggatata 26755772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14540910 - 14540811
Alignment:
Q  58 caatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 157  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14540910 caatttgacgagtttttcttgttttgactgaattttggtatgaattggagttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaacgggtatatagg 14540811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 146
Target Start/End: Original strand, 40734533 - 40734632
Alignment:
Q  47 cgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaac 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||  | |||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  40734533 cgaaccaaattcaatttgacgggttttatccgctttgatttggtttgggtatgaatttgggttttcagcgattttcaaacacgggtatgagacgggtaac 40734632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43371660 - 43371585
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43371660 tttgactgagtttgggtattggtttgagttttccccgattttaaaatacgggtacgggacgggtaacggggatata 43371585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 159
Target Start/End: Original strand, 16226758 - 16226798
Alignment:
Q  119 ctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226758 ctcaaaacaagggtatgggacgggtaacgggtatataggta 16226798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Original strand, 24051565 - 24051681
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    |||| |||| || ||| ||| |||||| || ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||| ||| ||||||||    
T  24051565 tacctgcccaaatcaactccgatttgatggattttctccgatttaattgggtttgggtatgggtttgggatttctccgattttaaaatacgagtatggga 24051664  T
Q  139 cgggtaacgggtatata 155  Q
    |||||||| || |||||    
T  24051665 cgggtaacagggatata 24051681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 25213989 - 25213945
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttg 83  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25213989 tacccacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgctttg 25213945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Original strand, 38342501 - 38342576
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||| |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  38342501 tttgattgggtttggatatgggtttgagttttccccgattttaaaatacggatacgggacgggtaacggggatata 38342576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4428051 - 4427963
Alignment:
Q  60 atttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 148  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||  ||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  4428051 atttaacgggtttttcccaatttgactgaatttgagtatgggtttgggttttccccgacttcataatacgggtaagggacgggcaacgg 4427963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 12341650 - 12341618
Alignment:
Q  83 gactgggtttgggtatgggtatgggttttcccc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12341650 gactgggtttgggtatgggtatgggttttcccc 12341618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13954893 - 13954802
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgg 130  Q
    ||||||| | |||||||  ||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | |||||||||    
T  13954893 tacccgctctaaccaaacgcaaattgacaggttttctacgctttgactgggtttgggtatgtgtttgaattttccccgattttaaaacacgg 13954802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14096100 - 14096009
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgg 130  Q
    ||||||| | |||||||  ||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | |||||||||    
T  14096100 tacccgctctaaccaaacgcaaattgacaggttttctacgctttgactgggtttgggtatgtgtttgaattttccccgattttaaaacacgg 14096009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 140
Target Start/End: Original strand, 37309695 - 37309786
Alignment:
Q  49 aaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacg 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||| || || ||||| | | || |||| ||| ||||||||||||    
T  37309695 aaccaaattcaatttgatgggtttttcccgctttgactaagtttgggtatgagtttgagtttttctcaatttcaatacatgggtatgggacg 37309786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44057990 - 44057915
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    |||||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  44057990 tttgactgggtttgggtacgagtttggattttccctgatttcaaaataccggtacgggacgggtaatggggatata 44057915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30696950 - 30696909
Alignment:
Q  168 ccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  30696950 ccaccccgaactcatacccaaacctatcccaaatgtaaaaaa 30696909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 96
Target Start/End: Original strand, 35409121 - 35409177
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggt 96  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||    
T  35409121 tacccgcccgaaccaaatcaaatttgac-gatttaacacgttttgactgggtttgggt 35409177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Original strand, 23490710 - 23490902
Alignment:
Q  37 gttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23490710 gttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggtttttcctgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcgaaacacgggtatgg 23490809  T
Q  137 gacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||||||||||||||       |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23490810 gacgggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccataccaaaacccgtcccaaatgtaaaaaactaatttatgtggatatgttatgttat 23490902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 232
Target Start/End: Original strand, 49250709 - 49250900
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49250709 gtggttatccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagttttccccgatctcaaaacacgggta 49250808  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    |||||||||||| |||||||       |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49250809 tgggacgggtaatgggtata-------taggtatccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatg 49250900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Original strand, 36187159 - 36187351
Alignment:
Q  37 gttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 136  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36187159 gttacccgcccgaaccaaactcaatttggcgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 36187258  T
Q  137 gacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||||||||||||||       |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||    
T  36187259 gacgggtaacgggtata-------taggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaagttattttatgttgatatgttatgttat 36187351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 51422011 - 51421816
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51422011 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatctcaaaacacgggta 51421912  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||||||||||  |||||       || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  51421911 tgggacgggtaacatgtata-------tatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactctatgttgatatgttatgt 51421819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Original strand, 24236698 - 24236892
Alignment:
Q  35 tggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtat 134  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24236698 tggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttaggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtat 24236797  T
Q  135 gggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtt 234  Q
    || ||||| ||||||||||       |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  24236798 ggaacggggaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgtt 24236890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34611226 - 34611031
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34611226 gtggttacccgcctgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgattgaatttgggtatgggtatgggtttttcccgatctcaaaacacgggta 34611127  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||| |       |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  34611126 tgggacatgtaacgtgtatataggtact-------caccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaatactactttatgttgatatgttatat 34611034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29936575 - 29936374
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatg------ggtatgggttttccccgatctcaaaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29936575 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactaagtttgggtatgagtatgggtatgggttttccccgatctcaaaata 29936476  T
Q  128 cgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29936475 cgggtatgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg 29936383  T
Q  228 ttatgttat 236  Q
    | |||||||    
T  29936382 taatgttat 29936374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 19572448 - 19572643
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19572448 gtggttacccgcccgaaccaaacctaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatttcaaaacacgggta 19572547  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||| |||||||||||||       |||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  19572548 tgggacaggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgt 19572640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17135098 - 17134905
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17135098 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttctctgttttgactgggtttgggtgtgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 17134999  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatcca-ccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtt 234  Q
     |||||||||||||||||||||||        ||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  17134998 agacgggtaacgggtatataggta--------ccatccccgaacccatacccatactcgtcccatatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtt 17134907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Original strand, 18354020 - 18354211
Alignment:
Q  38 ttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggg 137  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18354020 ttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggtttttcccgttttgactggatttgaatatgggtatgggttttccccgatttcaaaacatgggtatggg 18354119  T
Q  138 acgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||||||||||||||       || ||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||    
T  18354120 acgggtaacgggtata-------taagttcccaccccgaaccgatacccatactcgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttat 18354211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24710989 - 24710875
Alignment:
Q  45 cccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggta 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710989 cccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggatatgagtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggta 24710890  T
Q  145 acgggtatataggta 159  Q
    |||||||||||||||    
T  24710889 acgggtatataggta 24710875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5181190 - 5181069
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5181190 ggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttaggtatgggtatgggttttccccgatttcaaaatacgggtatg 5181091  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatatagg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5181090 ggacgggtaacgggtatatagg 5181069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28298099 - 28297891
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt------------tttccccgatctc 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||            |||||||||||||    
T  28298099 gtggttacccacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccctgttttgattggatttgggtatgggtatgggtatgggtatgagttttccccgatctc 28298000  T
Q  122 aaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt-aaaaaactactttatgt 220  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28297999 gaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata-------ggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactattttatgt 28297907  T
Q  221 ggatatgttatgttat 236  Q
     |||||||||||||||    
T  28297906 tgatatgttatgttat 28297891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16409082 - 16408970
Alignment:
Q  47 cgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaac 146  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16409082 cgaatcaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccaatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 16408983  T
Q  147 gggtatataggta 159  Q
     ||||||||||||    
T  16408982 aggtatataggta 16408970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Original strand, 40087414 - 40087594
Alignment:
Q  48 gaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  40087414 gaaccaaattcaatttgacggattttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatgagttttccccgat-tcaaaacacaggtatgggatgagtaacg 40087512  T
Q  148 ggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    || |||       |||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||    
T  40087513 ggaata-------taggtacccaccccgaactcatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatatcatgttat 40087594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 45866124 - 45866316
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45866124 ggttacccgcccgagccaaacctaaattgacgggttttctcc-ttttgactaggtttgggtatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 45866222  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
     ||| ||||| | |||||       |||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  45866223 agacaggtaatgagtata-------taggtacccaccccaaactcatacccatacccatcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 45866315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12495163 - 12494984
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  12495163 gtggttacccacctgaaccaaatccaatttgacggattttccccactttgactgggtttcggtatgggttttggtttttcccgatttcaaaacacggata 12495064  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgt 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||       |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12495063 tgggacgtgtaacgggtatata-------ggtacccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtagaaaactactatatgt 12494984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 42439606 - 42439801
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||   ||||  || ||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||    
T  42439606 gtggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacaaattttttccattttgactgagtttgggtatgggtatgaattttttccgatctcaaaacatgggta 42439705  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    ||||||| ||||||||||||       |||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42439706 tgggacgagtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatatccaaactcatcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgt 42439798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23968730 - 23968621
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23968730 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccattttgattgggtttgggtatgggtatgggttttccccggtttcaaaacacgggtatg 23968631  T
Q  136 ggacgggtaa 145  Q
    ||||||||||    
T  23968630 ggacgggtaa 23968621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 44615411 - 44615607
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  44615411 gtggttacccacccagaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtttgggttttccctgatttaaaaacacgggta 44615510  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaat-gtaaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||||||||||| ||||||       |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||  |||    
T  44615511 tgggacgggtaacaggtata-------taggtacccaccccaaactcatacccaaacccgtcccaaatccaaaaaaactactttatcttgatatgccatg 44615603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44793158 - 44792962
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  44793158 gtggttacccacccagaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtttgggttttccctgatttaaaaacacgggta 44793059  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaat-gtaaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||       |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||  |||    
T  44793058 tgggacgggtaacaggtatata-------ggtacccaccccaaactcatacccaaacccgtcccaaatccaaaaaaactactttatcttgatatgccatg 44792966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 34673216 - 34673413
Alignment:
Q  32 cagtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacggg 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||    
T  34673216 cagtgattacccgcccgaaccaaacccaatttaacggattttccccattttaactgggtttgggtatgggtttgggtttttcccaatttcaaaacacggg 34673315  T
Q  132 tatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttat 231  Q
    |||| ||| |||||||||||||       |||||| ||||||||||| |||||||||||  || || || | | ||||||||||||||| ||||||  ||    
T  34673316 tatgagactggtaacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaacctgttccgaacgaagaaaactactttatgttgatatgccat 34673408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39616443 - 39616322
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  39616443 ggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgagttttccccgttttgactgagtttgggtatgagtatgggttttcccctatttcaaaacacgggtata 39616344  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatatagg 157  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  39616343 ggacgggtaacaagtatatagg 39616322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 236
Target Start/End: Original strand, 29871245 - 29871416
Alignment:
Q  58 caatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||        
T  29871245 caatttgacgggttttcctcgttttgactaagtttgggtatgagtttgggttttctccgatttcaaaacatgggtatgggacaggtaactggtata---- 29871340  T
Q  158 tattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
       |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||| |||||||    
T  29871341 ---taggtacccaccctgaactcatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgttat 29871416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13390547 - 13390371
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||           
T  13390547 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttt-ccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgaattttccccgatttcaaaacac------- 13390456  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgtta 235  Q
             |||||||||       |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  13390455 ---------acgggtata-------taggtacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 13390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 9982826 - 9983005
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| || |||||||||||| |    
T  9982826 gtggttactctcccgaaccaaatccaatttgatggattttctccgttttgactgggtttgggtatgagtttgaattttccccaatttcaaaacacgggaa 9982925  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgt 220  Q
    ||||| |||||||| |||||       |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| | |||| ||||||||||    
T  9982926 tgggatgggtaacgagtata-------taggtacccaccccgaacccatacccaaacccatcccgaatgcagaaaattactttatgt 9983005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 35936768 - 35936890
Alignment:
Q  37 gttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgg 136  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  35936768 gttacctgtccgaaccaaattcaatctgacgggtttttctcattttgacttggtttgggtatgagtttgggttttccccgatttcaaatcacgagtatgg 35936867  T
Q  137 gacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  35936868 gacggataacgggtatataggta 35936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 155
Target Start/End: Original strand, 42707773 - 42707894
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42707773 gtggttatccgtccaaactaaatttaatttgacggatttttcccattttgactgggtttgggtatgagtatgagttttctccgatttcaaaacacgggta 42707872  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  42707873 tgggacgggtaacgggaatata 42707894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 50426593 - 50426786
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactggg------tttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacg 129  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||      ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  50426593 ggttaccggctcgaaccaaacccaatttaacaggttttctccgttttgactgggtttgggtttgggtttgggtatgggctttccctgatttcaaaacacg 50426692  T
Q  130 ggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgtt 229  Q
    |||||| ||||| |||||||||||       |||||| ||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||     
T  50426693 ggtatgagacggataacgggtata-------taggtacccaccccgaacccatacc------cgtcccaaatgtaaaaatttactttatgttgatatgtc 50426779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 160
Target Start/End: Original strand, 19003607 - 19003728
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| || |||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19003607 tacccgcccaaagcaaccccgatttgacgggttttccccgatttgactaggtttgggtatgggttcgggttttccccgattacaaaatacgggtatggga 19003706  T
Q  139 cgggtaacgggtatataggtat 160  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||    
T  19003707 cggataacggggatatatgtat 19003728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 236
Target Start/End: Original strand, 17091939 - 17092090
Alignment:
Q  78 gttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaa 177  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |       |||||||||    
T  17091939 gttttgactgagtttggatatgagtatgagttttccccgattttataacacaggtatgggacgcgtaacgggtatataggcact-------caccccgaa 17092031  T
Q  178 ctcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    | ||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  17092032 cccatgcccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttat 17092090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20774719 - 20774651
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20774719 gtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggt 20774651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13798377 - 13798278
Alignment:
Q  48 gaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  13798377 gaaccaaacccaatttaacgggttttccccggtatgactgggtttgggtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgagatgggtaacg 13798278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13020744 - 13020646
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtat 134  Q
    ||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13020744 ggttacctgtccgaaccaaactcaatctgacgggttttctccgtcttgactgggtttggttatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgagtat 13020646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 157
Target Start/End: Original strand, 33293480 - 33293590
Alignment:
Q  47 cgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaac 146  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  33293480 cgaactaaatccattttgacgaattttttccgttttgattgggtttgggtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaat 33293579  T
Q  147 gggtatatagg 157  Q
    ||| |||||||    
T  33293580 ggggatatagg 33293590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 209
Target Start/End: Original strand, 10778527 - 10778671
Alignment:
Q  58 caatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 157  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  10778527 caatttgacgggttttttccgctttgactgggtttgggtatgagtttaagtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg-------gg 10778619  T
Q  158 tattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    |  ||| |||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||    
T  10778620 ttatagatatccaccccgaacccatactcatacccgtctcaaatgtaaaaaa 10778671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 145
Target Start/End: Original strand, 48576059 - 48576165
Alignment:
Q  45 cccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg------gttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  48576059 cccgaaccaaatccaaattgatgggttttccccattttgactaggtttgggtatgggtatgggttagagttttccccaatctcaaaacacaggtatgaga 48576158  T
Q  139 cgggtaa 145  Q
    |||||||    
T  48576159 cgggtaa 48576165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34085361 - 34085220
Alignment:
Q  61 tttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtat 160  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| || |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||       |||      
T  34085361 tttgacgggttttctccgctttgactgggttaggatatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgagtatgggatgggtaacgg-------ggtta 34085269  T
Q  161 taggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34085268 tatgtacccaccccgaacccatacccatactcgtcctaaatgtaaaaaa 34085220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 3627935 - 3628118
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||||            || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3627935 ggttacccgcccgaaccaaactcaatttgatgagtttttcccgttttgactgggt------------ataggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 3628022  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgt--aaaaaactactttatgtggatatgttatgt 233  Q
    |||||||||||||||||        |||||| ||||||||||| ||||| ||  |  |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  3628023 ggacgggtaacgggtat-------gtaggtacccaccccgaacccatactcattccagtcccaaatgtaaaaaaaattactttatgttgatatgtcatgt 3628115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2514911 - 2514811
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt-gggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggt 132  Q
    |||| |||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||    
T  2514911 gtgggtacccgtccaaaccaaacccaacttgatgggttttccccgttttgattgggtttggggtatgagtttgggttttccccaatttcaaaacacgggt 2514812  T
Q  133 a 133  Q
    |    
T  2514811 a 2514811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16903663 - 16903508
Alignment:
Q  47 cgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaac 146  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||| |||||||||| |||||| | | |||| ||| || | |||||||| ||| ||||  |||||     
T  16903663 cgaaccaaatccaagttgacggattttcctcactttgattgggtttgggcatgggtttagatttttcccaattttaaaacacgagtacgggataggtaat 16903564  T
Q  147 gggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    ||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16903563 ggggatataggtac-------ccaccccgaactcatacccaaacccgtcccgaatgtaaaaaa 16903508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 236
Target Start/End: Original strand, 16433167 - 16433295
Alignment:
Q  98 tgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtccc 197  Q
    ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||           |||||||| ||||||||||| |  |||    
T  16433167 tgggtttgagttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggatatataggta----------cccccgaacccatacccaaacccacccc 16433256  T
Q  198 aaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||| | |||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  16433257 aaatgcagaaaattactttatgttgatatgtcatgttat 16433295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 236
Target Start/End: Original strand, 49741063 - 49741138
Alignment:
Q  161 taggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49741063 taggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgttatgttat 49741138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20774647 - 20774590
Alignment:
Q  180 catacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa-ctactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20774647 catacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttat 20774590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 105
Target Start/End: Original strand, 34059086 - 34059155
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatg 105  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34059086 ggttatccgtccgaaccaaattcaatttgacgggttattcccgttttgactagatttgggtatgggtatg 34059155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23966906 - 23966830
Alignment:
Q  161 taggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaa-aaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23966906 taggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgttatgttat 23966830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 159
Target Start/End: Original strand, 34060025 - 34060086
Alignment:
Q  98 tgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  34060025 tgggtatgagttttcctcgatttcaaaacacgggtatgagacggataacaggtatataggta 34060086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10105297 - 10105242
Alignment:
Q  163 ggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  10105297 ggtatccactccgaactcatacccaaactcgtttcgaatgtaaaaaattactttat 10105242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 147
Target Start/End: Original strand, 16237286 - 16237353
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 147  Q
    |||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16237286 tttgactgagtttggatatgaatttgggttttccccgatttcaaaatacgggtaagggacgggtaacg 16237353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23058573 - 23058494
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||  || ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  23058573 tttgactgggtttgagtatgggtttgagttttctccgatttcaaaatgcgagtacgagacgggtaacggggatataggta 23058494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 160
Target Start/End: Original strand, 44632149 - 44632203
Alignment:
Q  106 ggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtat 160  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  44632149 ggttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtgtatgggtat 44632203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 209
Target Start/End: Original strand, 48125707 - 48125787
Alignment:
Q  122 aaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaa 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  48125707 aaaacacgggtacgggacgggtaacgaggatatagg-------tatccaccccgaacccatacccaaactcgtcgcgaatgtagaaaa 48125787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24710872 - 24710816
Alignment:
Q  180 catacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||    
T  24710872 catactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatacattatgttat 24710816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25181234 - 25181190
Alignment:
Q  164 gtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaa 208  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25181234 gtatccaccctgaactcatactcaaactcgtcccaattgtaaaaa 25181190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39616317 - 39616261
Alignment:
Q  180 catacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||    
T  39616317 catacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttat 39616261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 93
Target Start/End: Original strand, 16433115 - 16433174
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttg 93  Q
    ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  16433115 gtggttacccatccgaaccaaactcaatttgacggattttccccattttgattgggtttg 16433174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23719635 - 23719592
Alignment:
Q  161 taggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgta 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23719635 taggtatccatcccgaactcatactcaaactcgtcccgaatgta 23719592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23719704 - 23719629
Alignment:
Q  30 atcagtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttcccc-gttttgactgggtttgggtatgggtat 104  Q
    |||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||||    
T  23719704 atcagtgggtacccgacgaaaccaaattcaatttgacgggttttcccctgctttgacgaggtttgggtataggtat 23719629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 89
Target Start/End: Original strand, 10450018 - 10450068
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactggg 89  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10450018 tacccgcccaaaccaaccccaatttgacgggttttccccaatttgactggg 10450068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 35069833 - 35069946
Alignment:
Q  42 ccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgg 141  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||  |||| ||  ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||| ||| || |||||||   |||||    
T  35069833 ccgcccaaaccaaccccgatttgacggagtttctccaatttgactggatttgggtatgagtttgagttttccccgatttcataatacgggtacaagacgg 35069932  T
Q  142 gtaacgggtatata 155  Q
    ||||| || |||||    
T  35069933 gtaacagggatata 35069946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Original strand, 47644866 - 47644903
Alignment:
Q  104 tgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  47644866 tgggttttccccgatctcaaaacacaggtacgggacgg 47644903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 236
Target Start/End: Original strand, 42707917 - 42707961
Alignment:
Q  192 cgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||    
T  42707917 cgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttat 42707961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 92
Target Start/End: Original strand, 49740976 - 49741020
Alignment:
Q  48 gaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt 92  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  49740976 gaaccaaactcaatttgacggattttcccctttttgactgggttt 49741020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33551 - 33366
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgac------tgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaaca 127  Q
    |||||||||| || |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33551 gtggttacccacctgaactaaactcaatttgacgggttttacccgttttgatcgggtttgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaaca 33452  T
Q  128 cgggtatgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  33451 cgggtatgggacgggtaacgggtata-------tatgtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcagaaaactactttatgt 33366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 90743 - 90624
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  90743 gtggttacccgcccgaactaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtat------gggttttccccgatttcaaaacacgggta 90650  T
Q  134 tgggacgggtaacgggtatataggta 159  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||    
T  90649 tgagacggttaacgggtatattggta 90624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0795 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0795
Description:

Target: scaffold0795; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 371 - 267
Alignment:
Q  38 ttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggg 137  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  371 ttacccgccagaaccaaactcaatt-gacgggttttctccgttttgactgagtttgggtatgggtatcagttttcctcaatctcaaaacacgggtatggg 273  T
Q  138 acgggt 143  Q
    ||||||    
T  272 acgggt 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10440 - 10262
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatg 135  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||       ||| |||| | || |||||||||||||    
T  10440 ggttacctgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttttccgttttgactaggtttgggtatggg-------ttttcccgctttccaaacacgggtatg 10348  T
Q  136 ggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgt 228  Q
    |||||| |||| ||||||       |||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  10347 ggacggataacaggtata-------taggtacccactacgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgt 10262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 145
Target Start/End: Original strand, 14120 - 14230
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||    
T  14120 gtggttacccacccaaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgtttgggtttgggtatgagtttgagttttccccgat-ttaaaacacgggta 14218  T
Q  134 tgggacgggtaa 145  Q
    ||| ||||||||    
T  14219 tggaacgggtaa 14230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Original strand, 14235 - 14301
Alignment:
Q  172 cccgaactcatacccaaactcgtcccaaatg-taaaaaactactttatgtggatatgttatgttata 237  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  14235 cccaaactcatacccaaactcgtcctgaatgcaaaaaaactattttatgttgatatgtcatgttata 14301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14928 - 14732
Alignment:
Q  33 agtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggt 132  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||  | ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||  |     
T  14928 agtgtttacctgcccaaaccaaatttaatttgacggggtttttcagttttcactggatttgggtatgagtttgggttttctccgatttcaaaacacatgc 14829  T
Q  133 atgggacgggtaacgggtatataggtattaggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatg 232  Q
    ||||||||| ||| |||||||||       |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||| |||||| |||     
T  14828 atgggacggataatgggtatata-------ggtacccaccttgaacacatacccaaactcgtcccaaatgtagaaaattatttaatgttgatatgatata 14736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 67896 - 67780
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| || ||||    
T  67896 tacccgcccaaaccaaccccgatttgacaggttttccccgatttgactgggtttgagtatgggtttggattttccccgattttaaaatacggatacggga 67797  T
Q  139 cgggtaacgggtatata 155  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  67796 cggataacggggatata 67780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 75739 - 75623
Alignment:
Q  39 tacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatggga 138  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| || ||||    
T  75739 tacccgcccaaaccaaccccgatttgacaggttttccccgatttgactgggtttgagtatgggtttggattttccccgattttaaaatacggatacggga 75640  T
Q  139 cgggtaacgggtatata 155  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  75639 cggataacggggatata 75623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7848 - 7738
Alignment:
Q  34 gtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | ||||| || || ||||||||||||||    
T  7848 gtggttacccacccgaactaaatttaatttgacgggttttccccgttttgattgagtttgggtatgtgt-tagattttctccaatttcaaaacacgggta 7750  T
Q  134 tgggacgggtaa 145  Q
    || |||||||||    
T  7749 tgagacgggtaa 7738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14998 - 14900
Alignment:
Q  36 ggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt-gggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggta 133  Q
    |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14998 ggttaccctcccgaaccaaatttaaattgacgggttttctccgctttgattgggtttagggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 14900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3075 - 3000
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| |||| || |||||    
T  3075 tttgactgggtttgggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacaggacggataactgggatata 3000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 211470 - 211395
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 155  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||| || |||||    
T  211470 tttgactgagtttgggtatgggtttgggttttctccgatttcaaaatacgggtacgagacgggtaacagggatata 211395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4271 - 4214
Alignment:
Q  180 catacccaaactcgtcccaaatgtaa-aaaactactttatgtggatatgttatgttat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  4271 catacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaaaatactttatgttgatatgtcatgttat 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Original strand, 107361 - 107437
Alignment:
Q  68 ggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggta 144  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||| || ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  107361 ggttttccccactttgattgggtttaggtataggtttgagtttttctcgatttcaaaacacaggtatgggacgggta 107437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 156
Target Start/End: Original strand, 4542 - 4639
Alignment:
Q  58 caatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatag 156  Q
    ||||||||  ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| || ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  4542 caatttgattggttttatccgttttaactgagtttgagtatgagtttgg-ttttccccaatttcaaaatacgggtatgggacaggtaacagggatatag 4639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 449808 - 449770
Alignment:
Q  80 tttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  449808 tttgactgggtttgggtttgggtttgggttttccccgat 449770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University