View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13402_high_27 (Length: 332)

Name: NF13402_high_27
Description: NF13402
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13402_high_27
NF13402_high_27
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (6-304)||(20274-20572)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (6-269)||(19802-20065)
scaffold0122 (6-269)||(24106-24369)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (6-332)||(1455-1780)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (6-332)||(7283908-7284233)
chr7 (54-332)||(3895099-3895376)
chr7 (54-328)||(44865308-44865582)
chr7 (54-332)||(143713-143991)
chr7 (54-332)||(15822327-15822604)
chr7 (54-332)||(35094890-35095166)
chr7 (50-332)||(47289855-47290138)
chr7 (54-332)||(39046523-39046796)
chr7 (54-332)||(45452063-45452339)
chr7 (54-328)||(12369735-12370009)
chr7 (54-330)||(11287493-11287768)
chr7 (54-332)||(12759061-12759340)
chr7 (54-332)||(13862828-13863103)
chr7 (54-332)||(12248015-12248294)
chr7 (54-332)||(26070161-26070437)
chr7 (54-332)||(26093948-26094224)
chr7 (55-332)||(16569902-16570179)
chr7 (55-332)||(16595483-16595760)
chr7 (21-332)||(17223797-17224111)
chr7 (6-85)||(111121-111200)
chr7 (13-332)||(13377603-13377924)
chr7 (6-85)||(32493898-32493977)
chr7 (21-269)||(14271760-14272009)
chr7 (54-332)||(49047569-49047847)
chr7 (6-85)||(1936869-1936948)
chr7 (6-85)||(126739-126818)
chr7 (272-332)||(3049657-3049717)
chr7 (13-85)||(3060272-3060344)
chr7 (95-245)||(16914866-16915015)
chr7 (16-269)||(34241063-34241317)
chr7 (50-308)||(9838977-9839236)
chr7 (54-332)||(13274861-13275129)
chr7 (54-314)||(31501265-31501526)
chr7 (50-245)||(48356804-48357001)
chr7 (50-245)||(9611468-9611665)
chr7 (54-314)||(28722202-28722464)
chr7 (272-332)||(111390-111450)
chr7 (272-332)||(126489-126549)
chr7 (272-332)||(2028995-2029055)
chr7 (272-332)||(2190307-2190367)
chr7 (272-332)||(42056410-42056470)
chr7 (13-70)||(13389693-13389750)
chr7 (272-328)||(32494167-32494223)
chr7 (54-127)||(25124407-25124482)
chr7 (13-69)||(16919870-16919926)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (6-332)||(15319-15644)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (11-332)||(11584125-11584448)
chr5 (54-332)||(21397166-21397444)
chr5 (54-332)||(28261595-28261867)
chr5 (54-332)||(4865337-4865613)
chr5 (54-332)||(24183027-24183305)
chr5 (54-332)||(11337081-11337359)
chr5 (54-332)||(1168100-1168377)
chr5 (54-332)||(20712150-20712428)
chr5 (54-332)||(21646636-21646912)
chr5 (121-332)||(24475654-24475861)
chr5 (54-332)||(19405611-19405891)
chr5 (93-245)||(21906859-21907011)
chr5 (13-319)||(19862296-19862604)
chr5 (76-245)||(23981433-23981603)
chr5 (54-332)||(3673936-3674215)
chr5 (13-332)||(21222462-21222781)
chr5 (54-332)||(23493993-23494272)
chr5 (54-269)||(21310603-21310819)
chr5 (13-331)||(5450695-5451015)
chr5 (54-308)||(16595606-16595860)
chr5 (54-269)||(21297069-21297285)
chr5 (54-223)||(23466619-23466787)
chr5 (54-332)||(28902265-28902545)
chr5 (54-332)||(28938660-28938940)
chr5 (54-332)||(432537-432815)
chr5 (54-332)||(7728494-7728774)
chr5 (272-332)||(21650769-21650829)
chr5 (266-332)||(21906791-21906857)
chr5 (50-332)||(21617090-21617374)
chr5 (272-332)||(2031884-2031944)
chr5 (272-332)||(11342759-11342819)
chr5 (272-332)||(21205000-21205060)
chr5 (114-255)||(22885792-22885932)
chr5 (89-174)||(6456852-6456937)
chr5 (13-171)||(37983598-37983758)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (11-332)||(6261-6581)
scaffold0310 (45-332)||(1-287)
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (54-332)||(13817586-13817862)
chr3 (54-332)||(19570586-19570861)
chr3 (54-332)||(317405-317681)
chr3 (54-332)||(16181842-16182118)
chr3 (54-332)||(22144167-22144445)
chr3 (54-332)||(16995956-16996232)
chr3 (54-332)||(50111946-50112224)
chr3 (54-332)||(54424086-54424364)
chr3 (54-332)||(12349434-12349712)
chr3 (54-332)||(6154226-6154504)
chr3 (54-332)||(14298495-14298773)
chr3 (54-332)||(14304122-14304400)
chr3 (54-332)||(17100727-17101004)
chr3 (54-332)||(17101412-17101689)
chr3 (54-294)||(38527841-38528079)
chr3 (54-325)||(8631871-8632142)
chr3 (54-332)||(35123770-35124047)
chr3 (54-329)||(34439237-34439513)
chr3 (54-332)||(14295512-14295790)
chr3 (54-332)||(14301139-14301417)
chr3 (54-332)||(17938648-17938925)
chr3 (49-332)||(17522780-17523062)
chr3 (143-332)||(53898440-53898628)
chr3 (113-332)||(55440803-55441022)
chr3 (54-332)||(3578162-3578440)
chr3 (175-332)||(6146763-6146919)
chr3 (158-332)||(19260839-19261012)
chr3 (54-314)||(11060902-11061161)
chr3 (54-158)||(6146664-6146769)
chr3 (54-332)||(11328859-11329134)
chr3 (54-188)||(14527975-14528110)
chr3 (130-304)||(11196291-11196457)
chr3 (54-332)||(17139582-17139861)
chr3 (6-85)||(7854306-7854385)
chr3 (6-85)||(54037976-54038055)
chr3 (6-85)||(3992874-3992953)
chr3 (58-332)||(14059112-14059386)
chr3 (6-85)||(55513194-55513273)
chr3 (54-332)||(16880197-16880477)
chr3 (113-332)||(39656600-39656817)
chr3 (6-85)||(2844515-2844594)
chr3 (54-332)||(12560131-12560409)
chr3 (11-85)||(15857120-15857194)
chr3 (13-245)||(17204841-17205076)
chr3 (13-319)||(17191628-17191936)
chr3 (21-319)||(3576298-3576598)
chr3 (6-85)||(19232090-19232169)
chr3 (132-223)||(15876250-15876341)
chr3 (6-85)||(17955832-17955915)
chr3 (263-332)||(12349834-12349903)
chr3 (93-332)||(12488662-12488899)
chr3 (4-85)||(16743991-16744072)
chr3 (272-332)||(3992624-3992684)
chr3 (272-332)||(38167988-38168048)
chr3 (266-332)||(14528118-14528185)
chr3 (13-180)||(13301323-13301491)
chr3 (13-180)||(13311979-13312147)
chr3 (13-90)||(38810868-38810945)
chr3 (272-332)||(2844265-2844325)
chr3 (272-332)||(16261527-16261587)
chr3 (272-332)||(30153016-30153076)
chr3 (6-85)||(45581955-45582034)
chr3 (272-332)||(53771115-53771175)
chr3 (272-332)||(54685422-54685482)
chr3 (54-245)||(14080669-14080863)
chr3 (21-88)||(15550919-15550986)
chr3 (159-245)||(47784767-47784853)
chr3 (55-255)||(33368822-33369024)
chr3 (54-180)||(11882113-11882240)
chr3 (272-332)||(33341955-33342015)
chr3 (13-68)||(12031849-12031904)
chr3 (54-127)||(51961031-51961106)
chr3 (114-188)||(15517848-15517921)
chr3 (54-188)||(9590648-9590784)
chr3 (272-332)||(7854056-7854116)
chr3 (159-314)||(12953056-12953210)
chr3 (276-332)||(17956109-17956165)
chr3 (272-332)||(23492447-23492507)
chr3 (272-328)||(45581709-45581765)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (54-332)||(55376494-55376770)
chr4 (54-332)||(53704629-53704906)
chr4 (54-332)||(23269829-23270107)
chr4 (54-331)||(44346902-44347177)
chr4 (58-332)||(8872372-8872644)
chr4 (54-332)||(34395331-34395609)
chr4 (54-332)||(44055989-44056266)
chr4 (54-332)||(30457977-30458255)
chr4 (54-332)||(53907604-53907872)
chr4 (54-332)||(12837096-12837373)
chr4 (54-332)||(16732243-16732520)
chr4 (54-332)||(21959359-21959636)
chr4 (73-332)||(45458769-45459028)
chr4 (54-332)||(819826-820089)
chr4 (54-245)||(20813442-20813634)
chr4 (54-332)||(52265403-52265681)
chr4 (54-332)||(30232391-30232669)
chr4 (54-332)||(27961045-27961324)
chr4 (54-332)||(13809405-13809683)
chr4 (54-332)||(18494224-18494501)
chr4 (50-269)||(7185735-7185954)
chr4 (54-332)||(15044902-15045181)
chr4 (6-85)||(5682380-5682459)
chr4 (6-85)||(54118120-54118199)
chr4 (6-85)||(25119059-25119138)
chr4 (54-314)||(41256263-41256524)
chr4 (135-308)||(47535042-47535214)
chr4 (13-255)||(15013137-15013379)
chr4 (54-332)||(15109243-15109522)
chr4 (13-332)||(41165808-41166119)
chr4 (272-332)||(14951836-14951896)
chr4 (54-199)||(14901437-14901584)
chr4 (272-328)||(5682648-5682704)
chr4 (272-332)||(15272433-15272493)
chr4 (54-242)||(7964606-7964796)
chr4 (95-332)||(18276508-18276743)
chr4 (13-70)||(47534933-47534990)
chr4 (272-332)||(25119328-25119388)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (54-332)||(37611742-37612020)
chr8 (54-332)||(22234700-22234976)
chr8 (54-332)||(20573087-20573365)
chr8 (54-332)||(19992952-19993227)
chr8 (54-332)||(41246732-41247009)
chr8 (54-332)||(20481679-20481955)
chr8 (54-332)||(20561526-20561804)
chr8 (54-229)||(25122618-25122793)
chr8 (54-332)||(21681076-21681356)
chr8 (13-332)||(21198005-21198325)
chr8 (58-158)||(7000524-7000624)
chr8 (45-332)||(23837272-23837561)
chr8 (54-332)||(39446660-39446939)
chr8 (54-328)||(22981351-22981622)
chr8 (197-332)||(20653944-20654078)
chr8 (13-245)||(17285364-17285600)
chr8 (54-148)||(20529748-20529843)
chr8 (6-85)||(16404852-16404931)
chr8 (211-332)||(20647882-20648002)
chr8 (6-85)||(24716714-24716793)
chr8 (6-85)||(39115599-39115678)
chr8 (13-314)||(29306509-29306813)
chr8 (6-85)||(274767-274846)
chr8 (6-85)||(641003-641082)
chr8 (6-85)||(826809-826888)
chr8 (13-314)||(33528517-33528819)
chr8 (13-332)||(5854688-5855007)
chr8 (50-245)||(15933458-15933655)
chr8 (50-314)||(26011586-26011848)
chr8 (132-332)||(38533723-38533922)
chr8 (272-332)||(274517-274577)
chr8 (272-332)||(641272-641332)
chr8 (272-332)||(827078-827138)
chr8 (272-332)||(16039002-16039062)
chr8 (272-332)||(41506930-41506990)
chr8 (50-255)||(22742914-22743122)
chr8 (137-269)||(25296295-25296426)
chr8 (137-269)||(25758315-25758446)
chr8 (272-332)||(39115349-39115409)
chr8 (54-174)||(31194217-31194340)
chr8 (135-253)||(23151810-23151928)
chr8 (114-188)||(27233047-27233120)
chr8 (272-332)||(24716983-24717043)
chr8 (54-241)||(38635541-38635731)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (54-332)||(14948-15224)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (54-331)||(25875816-25876091)
chr2 (54-332)||(23836601-23836878)
chr2 (54-332)||(32465932-32466207)
chr2 (54-332)||(271244-271521)
chr2 (54-332)||(4448028-4448306)
chr2 (54-332)||(36890581-36890858)
chr2 (54-332)||(25602098-25602377)
chr2 (54-332)||(28974123-28974400)
chr2 (54-295)||(27261915-27262156)
chr2 (54-332)||(24571188-24571465)
chr2 (54-332)||(22579758-22580032)
chr2 (49-332)||(68066-68351)
chr2 (6-88)||(15633535-15633617)
chr2 (6-85)||(19794581-19794660)
chr2 (13-332)||(43645967-43646289)
chr2 (6-85)||(20627190-20627269)
chr2 (6-85)||(22275046-22275125)
chr2 (6-85)||(22284279-22284358)
chr2 (54-313)||(31146073-31146334)
chr2 (6-85)||(43642833-43642912)
chr2 (13-187)||(19660098-19660273)
chr2 (241-332)||(6879511-6879601)
chr2 (13-245)||(19666688-19666921)
chr2 (21-202)||(25305634-25305818)
chr2 (54-266)||(722531-722742)
chr2 (54-232)||(23821534-23821713)
chr2 (54-232)||(23830613-23830792)
chr2 (54-150)||(19669003-19669101)
chr2 (272-332)||(22274796-22274856)
chr2 (272-332)||(22284029-22284089)
chr2 (207-314)||(9636837-9636943)
chr2 (276-332)||(21274174-21274230)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (54-332)||(11548-11827)
scaffold0359 (54-332)||(1391-1667)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (54-332)||(254710-254987)
scaffold0011 (54-332)||(261316-261593)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (54-328)||(22403005-22403279)
chr1 (61-332)||(41212146-41212415)
chr1 (54-332)||(49967724-49968002)
chr1 (54-332)||(35054830-35055108)
chr1 (54-332)||(9783959-9784234)
chr1 (95-332)||(21718302-21718537)
chr1 (54-232)||(35522247-35522426)
chr1 (13-318)||(20177263-20177570)
chr1 (159-332)||(27329757-27329928)
chr1 (6-85)||(41218729-41218808)
chr1 (13-222)||(13376711-13376923)
chr1 (6-85)||(21860335-21860414)
chr1 (4-85)||(41394528-41394609)
chr1 (12-85)||(44034829-44034902)
chr1 (272-332)||(35522432-35522492)
chr1 (54-332)||(16656712-16656992)
chr1 (54-332)||(16645986-16646266)
chr1 (54-265)||(19603238-19603449)
chr1 (13-314)||(21195106-21195408)
chr1 (54-332)||(51627558-51627837)
chr1 (13-308)||(17609026-17609322)
chr1 (54-245)||(22143256-22143448)
chr1 (50-332)||(37233750-37234033)
chr1 (272-332)||(15861547-15861607)
chr1 (54-255)||(8537803-8538007)
chr1 (54-255)||(8603042-8603246)
chr1 (272-328)||(21860089-21860145)
chr1 (272-332)||(44035092-44035152)
chr1 (13-84)||(27675120-27675191)
chr1 (272-332)||(22367093-22367152)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (54-332)||(5143-5419)
scaffold0480 (54-332)||(8776-9055)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (54-332)||(4359-4635)
[»] scaffold0016 (6 HSPs)
scaffold0016 (54-331)||(164290-164565)
scaffold0016 (6-85)||(166116-166195)
scaffold0016 (12-85)||(162036-162109)
scaffold0016 (13-90)||(116410-116487)
scaffold0016 (272-332)||(162299-162359)
scaffold0016 (272-332)||(166385-166445)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (54-332)||(18570353-18570630)
chr6 (54-332)||(32898864-32899142)
chr6 (54-332)||(22441008-22441285)
chr6 (54-332)||(13014603-13014882)
chr6 (54-330)||(16106592-16106868)
chr6 (54-330)||(16086093-16086369)
chr6 (54-332)||(18432717-18432994)
chr6 (121-332)||(31628342-31628552)
chr6 (54-332)||(18777220-18777481)
chr6 (13-319)||(21623255-21623563)
chr6 (54-332)||(18399012-18399290)
chr6 (6-85)||(18583641-18583720)
chr6 (13-314)||(22361619-22361920)
chr6 (54-314)||(17083093-17083352)
chr6 (6-85)||(19983144-19983223)
chr6 (6-85)||(35015009-35015088)
chr6 (54-332)||(25367130-25367410)
chr6 (21-245)||(18629469-18629695)
chr6 (54-223)||(33324874-33325046)
chr6 (54-307)||(21410944-21411197)
chr6 (50-245)||(17556909-17557104)
chr6 (54-223)||(35135906-35136078)
chr6 (272-332)||(26089809-26089869)
chr6 (54-247)||(16887685-16887881)
chr6 (272-332)||(15742341-15742401)
chr6 (272-332)||(18583391-18583451)
chr6 (272-332)||(23994997-23995057)
chr6 (272-332)||(35015278-35015338)
chr6 (54-247)||(15079606-15079797)
chr6 (159-332)||(18381684-18381856)
chr6 (114-223)||(29605632-29605739)
chr6 (272-332)||(18002617-18002677)
chr6 (277-331)||(25744331-25744385)
chr6 (13-172)||(33538223-33538384)
chr6 (166-314)||(28195101-28195248)
chr6 (13-85)||(14152632-14152704)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (54-332)||(218-496)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (54-332)||(717-995)
scaffold0673 (63-332)||(6749-7018)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (54-332)||(11603-11881)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (54-332)||(22765-23043)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (54-332)||(48221-48496)
scaffold0068 (54-332)||(61669-61944)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (54-332)||(25285-25563)
scaffold0158 (153-332)||(25032-25210)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (54-332)||(10011-10289)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (54-306)||(4663-4913)
scaffold0447 (54-306)||(9277-9527)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (54-306)||(7272-7522)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (54-332)||(95-370)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (54-332)||(132144-132423)
scaffold0021 (50-332)||(88349-88631)
scaffold0021 (54-332)||(11761-12041)
scaffold0021 (54-283)||(16022-16253)
scaffold0021 (54-283)||(25553-25784)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (54-332)||(60880-61159)
scaffold0001 (89-330)||(70552-70793)
scaffold0001 (54-193)||(79785-79925)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (54-332)||(24623-24901)
scaffold0037 (272-332)||(95049-95109)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (54-332)||(7643-7922)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (54-332)||(11464-11741)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (54-332)||(112441-112718)
scaffold0022 (54-332)||(102815-103095)
scaffold0022 (259-330)||(109666-109737)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (54-332)||(85406-85683)
scaffold0014 (54-332)||(159373-159651)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (54-332)||(38372-38650)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (54-330)||(117857-118134)
scaffold0035 (54-332)||(109356-109635)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (73-332)||(252903-253162)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (54-330)||(9063-9339)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (15-171)||(8-164)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (54-332)||(70687-70964)
scaffold0031 (95-328)||(31122-31352)
scaffold0031 (50-308)||(97088-97347)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (54-328)||(21590-21862)
scaffold0120 (54-332)||(31285-31561)
scaffold0120 (54-163)||(47445-47554)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (54-208)||(2961-3115)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (50-332)||(46239-46521)
scaffold0034 (54-332)||(40732-41010)
scaffold0034 (6-85)||(80188-80267)
scaffold0034 (272-328)||(79942-79998)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (54-332)||(33736-34014)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (54-332)||(471-749)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (58-332)||(1990-2263)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (115-332)||(5015-5231)
[»] scaffold0342 (3 HSPs)
scaffold0342 (95-332)||(6014-6251)
scaffold0342 (6-85)||(304-383)
scaffold0342 (272-332)||(572-632)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (158-332)||(146675-146848)
scaffold0025 (118-255)||(85683-85818)
scaffold0025 (50-245)||(53506-53703)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (13-332)||(76699-77020)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (54-332)||(33622-33901)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (54-332)||(3393-3671)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (6-85)||(30418-30497)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (54-285)||(7927-8157)
[»] scaffold0686 (3 HSPs)
scaffold0686 (12-85)||(5735-5808)
scaffold0686 (12-85)||(5941-6014)
scaffold0686 (272-332)||(6204-6264)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (13-245)||(197107-197340)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (135-308)||(2623-2795)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (258-332)||(617-691)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (13-332)||(35552-35873)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (54-245)||(8170-8363)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (235-332)||(32277-32373)
scaffold0091 (235-332)||(41930-42026)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (21-332)||(69531-69843)
scaffold0009 (272-316)||(244923-244967)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (54-223)||(1440-1611)
scaffold0456 (54-223)||(8585-8756)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (6-85)||(31132-31211)
scaffold0184 (272-332)||(31401-31461)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (6-85)||(41633-41712)
scaffold0078 (272-332)||(41383-41443)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (54-247)||(89760-89952)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (21-245)||(6885-7112)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (54-269)||(1242-1458)
scaffold0409 (54-269)||(9497-9713)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (54-308)||(2211-2465)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (274-332)||(89584-89642)
scaffold0028 (54-188)||(79756-79891)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (6-85)||(42678-42754)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (272-332)||(17525-17585)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (160-319)||(28623-28781)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (54-247)||(22323-22518)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (13-269)||(43651-43908)
scaffold0080 (50-223)||(23562-23737)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (54-150)||(70201-70298)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (272-332)||(55655-55715)
scaffold0032 (13-188)||(104477-104653)
scaffold0032 (113-245)||(93728-93860)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (13-181)||(31244-31414)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (159-332)||(6735-6907)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (54-188)||(10879-11014)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (272-332)||(6664-6724)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (272-332)||(1099-1159)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (21-85)||(1371-1435)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (272-332)||(13507-13567)
scaffold0251 (272-332)||(21481-21541)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (272-332)||(15023-15083)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (54-255)||(855-1059)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (279-332)||(10094-10147)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (272-332)||(9628-9688)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (13-70)||(442-499)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (272-328)||(12641-12697)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (272-332)||(186647-186706)
scaffold0004 (272-332)||(193609-193668)


Alignment Details
Target: scaffold0049 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20572 - 20274
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20572 agaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 20473  T
Q  106 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20472 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 20373  T
Q  206 aataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20372 aataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggttaattatgctttgttgttg 20274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 269
Target Start/End: Original strand, 19802 - 20065
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19802 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 19901  T
Q  106 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19902 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 20001  T
Q  206 aataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002 aataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 20065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 269
Target Start/End: Original strand, 24106 - 24369
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24106 agaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 24205  T
Q  106 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24206 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 24305  T
Q  206 aataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 aataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 24369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1780 - 1455
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1780 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 1681  T
Q  106 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1680 ttggatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcctatgtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 1581  T
Q  206 aataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||    
T  1580 aataattgaattgttgttggttgaattatatgttcaaa--gtatgagaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgttgaattatgttatgtgattg 1483  T
Q  305 ttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1482 atgaattgtgataagtttcatgatcaat 1455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 332
Target Start/End: Original strand, 7283908 - 7284233
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7283908 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 7284007  T
Q  106 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7284008 ttatatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtgtgaagttatg 7284107  T
Q  206 aataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 304  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7284108 gatgattgaattgttattagttgaattgtatgttcaaagt--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatcctttgttgttg 7284205  T
Q  305 ttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7284206 ttgaattgtgataagtttcatgatcaat 7284233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3895376 - 3895099
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3895376 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataatt 3895277  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    
T  3895276 gatgaaattcatgctctaattctgatgaaatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaa--gtatgaaa 3895179  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3895178 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 3895099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44865582 - 44865308
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44865582 taaggtaagggggttaga-ttcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 44865484  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44865483 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 44865384  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  44865383 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 44865308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 143991 - 143713
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  143991 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtataaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 143892  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  143891 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 143793  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  143792 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 143713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 15822327 - 15822604
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  15822327 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcagttatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 15822426  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  15822427 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatg-ttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaaatgtatgaa 15822525  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15822526 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 15822604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35095166 - 35094890
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35095166 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 35095067  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  35095066 gatgaaattcatgctctaattgtgataacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtatatgaaa 35094968  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||   | ||||||||||||||    
T  35094967 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaat 35094890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 50 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47290138 - 47289855
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 147  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47290138 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaaatgcttaattggatgaattgattaattgttc 47290039  T
Q  148 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  47290038 ataaatgatgaaattcgagctctaattatgatgccatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgt 47289940  T
Q  248 atgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  47289939 atgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 47289855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 39046523 - 39046796
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046523 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 39046622  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||||    
T  39046623 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattattgttagttgaattgtatgttcaa-----ttgaa 39046717  T
Q  253 aataga-tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  39046718 aaatgagtatatg-tgaaaatat-ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 39046796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 45452063 - 45452339
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  45452063 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 45452162  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  45452163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 45452260  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45452261 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaatttgtga--catgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 45452339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 54 - 328
Target Start/End: Original strand, 12369735 - 12370009
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  12369735 taaggtaagggggttagatttcatcattatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 12369834  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  12369835 tgattaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttacggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 12369932  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  12369933 aaatgggtatctgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgat 12370009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11287768 - 11287493
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||      
T  11287768 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 11287670  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||     
T  11287669 tgatgaaattagtgctctgattatgttgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgag 11287572  T
Q  253 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatca 330  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  11287571 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatca 11287493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12759340 - 12759061
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  12759340 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataa 12759241  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||   |    
T  12759240 atgatgaaatttgtgctccaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaaatgt-gaa 12759142  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || || |||||||||||||||||    
T  12759141 aaaggggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaat 12759061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 13862828 - 13863103
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||| |||||||||| ||||      
T  13862828 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaa----gcttaattgggtgaatagattaattgtccataaa 13862923  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  13862924 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 13863021  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  13863022 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaat 13863103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 12248015 - 12248294
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12248015 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aattgattacttgttcata 12248112  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |  |    
T  12248113 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgtttaaagtatgag 12248212  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  12248213 aaaatag-tatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 12248294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 26070161 - 26070437
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  26070161 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26070257  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||    
T  26070258 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26070357  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26070358 aaat-ggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 26070437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 26093948 - 26094224
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  26093948 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26094044  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||    
T  26094045 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26094144  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26094145 aaat-ggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 26094224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 55 - 332
Target Start/End: Original strand, 16569902 - 16570179
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16569902 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16569999  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  16570000 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16570099  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16570100 aat-ggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaat 16570179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 55 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16595760 - 16595483
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16595760 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16595663  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  16595662 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16595563  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16595562 aat-ggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaat 16595483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 332
Target Start/End: Original strand, 17223797 - 17224111
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaatttt-caattatttgtatgat- 114  Q
    ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||     
T  17223797 aaagtgaagcttgggctaagaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaatttttcaattattt-tatgatt 17223895  T
Q  115 aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattga 214  Q
    |||||||||||||  | |||  |||||||||||| |  || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| | |||||| || ||||||||    
T  17223896 aagtgcttaattgagtaaata-attaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcacgaagttgtggataattga 17223994  T
Q  215 attgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgt 313  Q
    ||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17223995 attgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatactcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgt 17224092  T
Q  314 ggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     |||||  ||||| |||||    
T  17224093 tgtaagagtcatgttcaat 17224111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 111121 - 111200
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  111121 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 111200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377603
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-g 13377826  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    ||||| |||||| || ||||  | ||| |||||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  13377825 tatgaataagtgattcattgagt-aatcgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttga 13377727  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  13377726 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatactcaaattgattaattatgctatgttgttgtt 13377629  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || ||||| |||| |||||| |||||    
T  13377628 gaattgtgataagattcatgttcaat 13377603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 32493898 - 32493977
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32493898 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 32493977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 269
Target Start/End: Original strand, 14271760 - 14272009
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-ta 115  Q
    ||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  14271760 aaagtgaagcttaggttaggaattggtgataattaaggtaagggaattagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaata 14271858  T
Q  116 agtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaa 215  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||| ||    
T  14271859 agtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagttg-tcaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaa 14271956  T
Q  216 ttgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  14271957 ttgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaaat-gatatatgttgaa 14272009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 49047569 - 49047847
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  49047569 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtta-tatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcaga 49047666  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || |  |||| |||||| |||| | |||||||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |    
T  49047667 attgttagaatttgtgctccaattataatgacatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 49047766  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | | | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  49047767 agagtgg-tatatgttgaaa-tatgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 49047847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 1936869 - 1936948
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  1936869 agaatcatagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatca 1936948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 126818 - 126739
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  126818 agaatcataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 126739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3049717 - 3049657
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3049717 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 3049657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3060272
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatca 3060272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 245
Target Start/End: Original strand, 16914866 - 16915015
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatg 193  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||    
T  16914866 ttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatg 16914963  T
Q  194 tatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
     ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  16914964 catgaaattgatg-ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 16915015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Original strand, 34241063 - 34241317
Alignment:
Q  16 gagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga 113  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | || ||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||    
T  34241063 gagctaaagtgaagcttgggttaagaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatga 34241162  T
Q  114 -taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataatt 212  Q
     |||||| |||||| ||  || ||||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||| |||||  ||||||  ||| ||||| ||    ||||||    
T  34241163 ttaagtgattaatt-gagtaagtgattaattgttcatagttgataaaattcgtgttataattatgatgttatgtttgaatgcatgaaattggtgataatt 34241261  T
Q  213 gaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||    
T  34241262 gaattgttgttggtgaaattgcatgttaaaagtatgtgaaagta-atatatgttgaa 34241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9839236 - 9838977
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  |||||||||||    
T  9839236 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9839139  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  9839138 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9839039  T
Q  246 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttga 308  Q
     | ||||| | | ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||    
T  9839038 atgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttga 9838977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13275129 - 13274861
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  13275129 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 13275032  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| | |||||| |   |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||  |||    
T  13275031 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttggtaattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagt--atg 13274934  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | || ||     || |    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  13274933 agaa-ag-----tggt----atatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 13274861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31501526 - 31501265
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatca-taatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |||||| ||  |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||    
T  31501526 taaggtaagggggttagaattcaacaataatcaattagttgtaattttca-ttaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcat 31501429  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  |||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| ||  ||||| ||    |||||||||||||| || ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  31501428 agttgatgaaattagtgatctaattatgaagatatgtttaaatacatgaaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagtatgt 31501329  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtg 314  Q
    |||||| |||||||  |||| | |||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  31501328 gaaaat-gatatattgtgaata-atgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtg 31501265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48357001 - 48356804
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 146  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| || ||||||||||  | || ||||||||||||    
T  48357001 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcattcgttgtatgattaaatgcttaattgagt-aagtgattaattgtt 48356903  T
Q  147 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||||  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  48356902 catagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 48356804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9611665 - 9611468
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  |||||||||||    
T  9611665 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9611568  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  9611567 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9611468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28722464 - 28722202
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| || |||||||||| || || ||| |  ||||||||    
T  28722464 taaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaaatgcttaattgaat-aagtgaatctttgttcat 28722366  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  28722365 agttgttgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 28722266  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtg 314  Q
    |||||| |||||||  || || ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  28722265 gaaaat-gatatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtg 28722202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 111390 - 111450
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  111390 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 111450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 126549 - 126489
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  126549 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 126489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2029055 - 2028995
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2029055 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 2028995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 2190307 - 2190367
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2190307 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 2190367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 42056410 - 42056470
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  42056410 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 42056470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 13389750 - 13389693
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13389750 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13389693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Original strand, 32494167 - 32494223
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  32494167 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 32494223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124407
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 25124407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16919926 - 16919870
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggtta 69  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16919926 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggtta 16919870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 332
Target Start/End: Original strand, 15319 - 15644
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15319 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatcacttttgtaattttaaattat 15418  T
Q  106 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15419 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 15518  T
Q  206 aataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgt 305  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  15519 gacaattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtataaaaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttga 15617  T
Q  306 tgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15618 tgaattgtgatatgtttcatgatcaat 15644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584125
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 11584349  T
Q  111 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11584348 tgataagtgcttaattggatgaattaattaattgttcatgagtggtgaaattcgtgctctatttatgatgacatatttggatgtatgaagttatgaataa 11584249  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct---ttgttgttgttg 307  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  11584248 ttgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtatgaaaa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttg 11584150  T
Q  308 atttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | ||||| || ||||||||||||||    
T  11584149 aattgtgatatgtttcatgatcaat 11584125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21397444 - 21397166
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21397444 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 21397345  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21397344 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 21397246  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21397245 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 21397166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28261867 - 28261595
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28261867 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 28261768  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28261767 ggtgaaattcgtgctctagttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt--atgaaa 28261670  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| || |||| |||||||||    
T  28261669 a---atatgtgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaat 28261595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4865613 - 4865337
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4865613 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 4865514  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  4865513 ggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaa 4865416  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4865415 aatgggtat-gggtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 4865337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 24183027 - 24183305
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  24183027 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 24183126  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  24183127 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtcatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttcaaagtgtatgaa 24183226  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  24183227 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaat 24183305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 11337081 - 11337359
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11337081 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattggttaattgttcataa 11337179  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  11337180 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatga 11337277  T
Q  252 aaata-gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11337278 gaatatggtaaatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 11337359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 1168100 - 1168377
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||||||||      
T  1168100 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaaatgcttattttggtgaattgattaattgttcataaa 1168198  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  1168199 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataatagaatggttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 1168298  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1168299 aat-gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 1168377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20712428 - 20712150
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  20712428 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttgcaattttcaattacttgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataa 20712329  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg- 250  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||  |||||     
T  20712328 -tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataactgaattgttgttgattgaattacatgttcaaa--gtatga 20712232  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  20712231 aaaatgggtatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaat 20712150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 21646636 - 21646912
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21646636 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttattgcaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaaatgttcatatg 21646734  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  21646735 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttaaaagtgtatgaa 21646833  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21646834 aatgggtatgt-atgaaaatatgttcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 21646912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24475861 - 24475654
Alignment:
Q  121 ttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24475861 ttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-t 24475763  T
Q  221 gttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagt 320  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  || ||    
T  24475762 gttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgt 24475666  T
Q  321 ttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||    
T  24475665 ttcatgatcaat 24475654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19405891 - 19405611
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19405891 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 19405793  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |    
T  19405792 aatgatgaaatttatgctctaattatgatgacatatttgaatgtatgaagttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 19405693  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19405692 aaaa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattagttgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 19405611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21907011 - 21906859
Alignment:
Q  93 aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagat 192  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21907011 aattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagac 21906912  T
Q  193 gtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  21906911 atatgaagttatggataattgaattgatgttggttgaattacatgttcaaagt 21906859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19862604 - 19862296
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||| ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||    
T  19862604 taggagctaaagtgaagtttaggctaaaaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgt 19862505  T
Q  110 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    |||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||    
T  19862504 atgaataagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgat 19862406  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19862405 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 19862308  T
Q  308 atttgtggtaag 319  Q
    | ||||| ||||    
T  19862307 aattgtgataag 19862296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 245
Target Start/End: Original strand, 23981433 - 23981603
Alignment:
Q  76 atcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaatt 174  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23981433 atcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaatttagtgcattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaatt 23981532  T
Q  175 gtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
     |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  23981533 atgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagt 23981603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3674215 - 3673936
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt---tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  3674215 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaattttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcat 3674118  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||  || ||||| |  |||||||||||||||||||   ||||  ||| ||||||| |      
T  3674117 aattgttagaattcgtgctcaaattatgatgatatgtttgaatacattaagttgttgataattgaattgttgttagggaaatttcatgatcaaagtatga 3674018  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3674017 gaaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 3673936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Original strand, 21222462 - 21222781
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  21222462 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtatgggggttagagttcaatcataattatttagtgtaatttttcaatta-ttgt 21222560  T
Q  110 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    |||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||    
T  21222561 atgattaagtgcttaattg--agtattgattaattgttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgat 21222658  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    |||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || ||||||| || || | |||| |||| |||||||||||    
T  21222659 aattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgtttaattgtgctatgttgttgttg 21222756  T
Q  308 atttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | ||||| |||| |||||| |||||    
T  21222757 aattgtgataagattcatgttcaat 21222781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23494272 - 23493993
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||  |||||||||||||    
T  23494272 taaggtaagggggttagaaatcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aatcaattaattgttcat 23494175  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||||||| || | ||||||||||||   ||| |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  23494174 aattgttagaattcgtgctccaactatgatgacatgttcgaatgcatgaagttgtggaaaattgaattgttattagtggaattttatgttcaaa--gtat 23494077  T
Q  250 gaa-aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  23494076 gaagaataggtatatgttg-agatatgcgaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaat 23493993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 269
Target Start/End: Original strand, 21310603 - 21310819
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  21310603 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 21310701  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||    
T  21310702 aatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21310801  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  21310802 aaaat-gatatatgttgaa 21310819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 5450695 - 5451015
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |    
T  5450695 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgataataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-g 5450793  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
     || | ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||  || |  ||||| ||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  5450794 cataaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcataattgttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttga 5450892  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5450893 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgtt 5450990  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaa 331  Q
    || ||||| |||  |||||| ||||    
T  5450991 gaattgtgataaaattcatgttcaa 5451015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16595860 - 16595606
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  16595860 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgactaattgttcat 16595763  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||   ||||  ||||||||||| |      
T  16595762 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgatagagaaatttcatgttcaaagtatga 16595663  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttga 308  Q
    |||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||||    
T  16595662 gaaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatgttatgttgatgttga 16595606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 269
Target Start/End: Original strand, 21297069 - 21297285
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  21297069 taaggtaagggggttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcata 21297167  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || | |||||||| |||||| | |||||| ||||||  | | ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||    
T  21297168 aatgttaaaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21297267  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  21297268 aaaat-gatatatgttgaa 21297285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23466787 - 23466619
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||     
T  23466787 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattattgcaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattgtgt-aattgattaattgttcataa 23466690  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 223  Q
     |  |  ||||||||||| |||| ||   ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23466689 ttattagaattcgtgctccaattatggcaacatgtttgtatgtaagaagttatg-ataattgaattgttgtt 23466619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28902545 - 28902265
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  28902545 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28902448  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||  || |   |||||||||| |     
T  28902447 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 28902348  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  28902347 agaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaat 28902265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28938940 - 28938660
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  28938940 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28938843  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||  || |   |||||||||| |     
T  28938842 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 28938743  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  28938742 agaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaat 28938660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 432815 - 432537
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||    
T  432815 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttactgcaatttttcaattgtt-gcatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgatcata 432718  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || | ||||||| |||| |||| |||||| ||||||  ||| ||| |||| |  ||||||||||||||||| ||  || |  ||||||||||| |  |    
T  432717 attgttaaaattcgcgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgtagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgag 432618  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  432617 aaaat-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatactatgttgttgttggattgtggtaagattcatgttcaat 432537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7728774 - 7728494
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||   ||| |||  |||  |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7728774 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgtaaattttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 7728676  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||| ||| |||| ||| |  || |||  ||| ||||| ||    |||||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||| |      
T  7728675 aattgttagaattcgtactccaattatgaagttatatttgaatggatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 7728576  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  7728575 gaaagt-gatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaat 7728494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21650829 - 21650769
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21650829 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 21650769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21906857 - 21906791
Alignment:
Q  266 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21906857 tgaaaatatgttcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 21906791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21617374 - 21617090
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||  ||||||||||    
T  21617374 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagggattaattgt 21617277  T
Q  146 tcatatgtgatga-aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaag 244  Q
    ||||  ||  | | |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| |||    
T  21617276 tcattagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttagtgaaattgcatgttccaag 21617177  T
Q  245 tgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | ||||||| | | ||||||||| || ||||||| || || |||||| | || |||||||||||| ||||| | || |||||| |||||    
T  21617176 tatatgaaagt-gttatatgttg-aactatgctctaaatgttgaattgttctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaat 21617090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2031944 - 2031884
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2031944 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 2031884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11342819 - 11342759
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  11342819 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 11342759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21205060 - 21205000
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21205060 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 21205000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22885932 - 22885792
Alignment:
Q  114 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattg 213  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | ||||||||   || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    |||||||    
T  22885932 taagtgcttaattgaat-aattgataatttgttcatggttgttgaaattcgtgctttaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattg 22885834  T
Q  214 aattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaat 255  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  22885833 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 22885792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6456937 - 6456852
Alignment:
Q  89 ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaatt 174  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  6456937 ttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaatt 6456852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 37983758 - 37983598
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  37983758 taggagctaaagtgaagcttgggctagaaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 37983659  T
Q  111 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 171  Q
    |||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||    
T  37983658 tgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaatttgtgctcta 37983598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 332
Target Start/End: Original strand, 6261 - 6581
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6261 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 6360  T
Q  111 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6361 tgataagtgcttaattggatgaattgattaactgttcataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataa 6460  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgat 309  Q
    ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| || | | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  6461 ttggattgttgttagttgaaatacatgttcaaagt--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaa 6558  T
Q  310 ttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||| ||||||| |||||||||    
T  6559 ttgtgataagtttaatgatcaat 6581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 45 - 332
Target Start/End: Original strand, 1 - 287
Alignment:
Q  45 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaaatg 100  T
Q  145 ttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaag 244  Q
    || |||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  101 ttaataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaag 200  T
Q  245 tgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |  |||| || | | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  201 t--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaat 287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13817862 - 13817586
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13817862 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgtacatatgt 13817763  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13817762 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 13817664  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13817663 atgggtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaat 13817586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 19570586 - 19570861
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19570586 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaatttttcatatgt 19570684  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19570685 gatgaaatttgtgctctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 19570783  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19570784 atgagtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaat 19570861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 317405 - 317681
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  317405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 317504  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  317505 gatgaaattcgtgctctaagtatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaa 317602  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  317603 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 317681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 16181842 - 16182118
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16181842 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 16181941  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  16181942 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttaaattacatgttcaaagtgtatgaaa 16182040  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  16182041 atgggtatgtg-tgaaaatatgccaaattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaat 16182118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 22144167 - 22144445
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||      
T  22144167 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactttttgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaactgttcataac 22144266  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22144267 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 22144365  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22144366 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 22144445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 16995956 - 16996232
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16995956 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattattcataagt 16996055  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  16996056 ggtgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttacttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaa 16996153  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16996154 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 16996232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 50111946 - 50112224
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  50111946 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 50112045  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  50112046 tgatgaaattcatgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 50112143  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  50112144 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 50112224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 54424364 - 54424086
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt-aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  54424364 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 54424265  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||     
T  54424264 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 54424167  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54424166 aaattgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 54424086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 12349434 - 12349712
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||      
T  12349434 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgtccataaa 12349533  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |    
T  12349534 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtataaatttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtgag-a 12349632  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12349633 agttgttatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 12349712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 6154226 - 6154504
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6154226 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttctatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6154325  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    | ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  6154326 tcatgaaattcgtcctctaattataatgacatgtttagatgtatgaaattatgaatagttgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtttatgaa 6154424  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6154425 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 6154504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14298773 - 14298495
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  14298773 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14298674  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  14298673 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-a 14298575  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  14298574 tatggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaat 14298495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14304400 - 14304122
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  14304400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14304301  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  14304300 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-a 14304202  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  14304201 tatggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaat 14304122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17101004 - 17100727
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  17101004 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17100906  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  17100905 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 17100808  T
Q  253 a-atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17100807 acatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 17100727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17101689 - 17101412
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  17101689 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17101591  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  17101590 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 17101493  T
Q  253 a-atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17101492 acatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 17101412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38528079 - 38527841
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  38528079 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaactatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 38527980  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38527979 gatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 38527881  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 294  Q
    || | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38527880 atgggtatgtg-ggaaaatatgctcaattggtgaattatgc 38527841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8632142 - 8631871
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  8632142 taaggtaagggggttaggattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattaattaattgttcttaag 8632043  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  | |    
T  8632042 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtttgag-a 8631944  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcat 325  Q
    | | | ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  8631943 agttggtatatgttgaaaatatgcttatttagtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcat 8631871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35124047 - 35123770
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  35124047 taaggtaaaggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35123948  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||    
T  35123947 tgatgaaattcgtactttaattatgatgacgtgtttggatgtatgaaattatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgtt-aaagtgtatgaa 35123849  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35123848 aa-gggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaat 35123770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 54 - 329
Target Start/End: Original strand, 34439237 - 34439513
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34439237 taaggtaaggagattagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 34439336  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttta-gatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | | |    
T  34439337 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttatgaggtatgaagttatggataaatgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgt-a 34439435  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatc 329  Q
    |||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  34439436 aaatgggtatgtgtttaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14295790 - 14295512
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||      
T  14295790 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14295692  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  |||    
T  14295691 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14295592  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  14295591 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 14295512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14301417 - 14301139
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||      
T  14301417 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14301319  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  |||    
T  14301318 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14301219  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  14301218 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 14301139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17938925 - 17938648
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |    
T  17938925 taagataagggggttagggttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcttgag 17938826  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||  |||  |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  17938825 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttggatgtataaag-catggttaagcgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaa--gtatgag 17938729  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  17938728 aagttgatatatgttgaaaatatgcttaattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaat 17938648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 49 - 332
Target Start/End: Original strand, 17522780 - 17523062
Alignment:
Q  49 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 147  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17522780 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgagaagtgcttatttgggtgaattgattatttgttc 17522878  T
Q  148 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  17522879 ataaatgatgaacttcgtgctctaattatgatgacagttttggatgtatgaagatgtggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtat 17522978  T
Q  248 atgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17522979 aacaaaat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaat 17523062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 143 - 332
Target Start/End: Original strand, 53898440 - 53898628
Alignment:
Q  143 tgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaa 242  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  53898440 tgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatctatgaagttatgaataattgaattgt-gttagttgcattaaatgttcaa 53898538  T
Q  243 agtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  53898539 agtgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaat 53898628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 113 - 332
Target Start/End: Original strand, 55440803 - 55441022
Alignment:
Q  113 ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataatt 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  55440803 ataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatt 55440902  T
Q  213 gaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgattt 311  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||||| ||    
T  55440903 gaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatgagaaaat-gatatatgatgaaaatatgctcaactggttgaattatactatgttgtggttgaatt 55441001  T
Q  312 gtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  55441002 gtgataagtttcatgatcaat 55441022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3578440 - 3578162
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  3578440 taaggtaagcgggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtaggaataagtgcttaattgggtaaattgattaattgttcataa 3578342  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||| |||| | |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |  ||    
T  3578341 atgatgatattcattctctaattatgatgacatgttga-atgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgttcaaagtatgaga 3578243  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3578242 aaatag-tatatgttgaaaatatgctcaactggttgaattacgctatgttgtggttgaattgcgataagtttcatgatcaat 3578162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 175 - 332
Target Start/End: Original strand, 6146763 - 6146919
Alignment:
Q  175 gtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  6146763 gtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgta-ttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatat 6146861  T
Q  275 gctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  6146862 gctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaat 6146919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 158 - 332
Target Start/End: Original strand, 19260839 - 19261012
Alignment:
Q  158 aaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aaaata 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||     
T  19260839 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaaaaatg 19260936  T
Q  257 gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19260937 ggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 19261012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 314
Target Start/End: Original strand, 11060902 - 11061161
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||      
T  11060902 taaggtaagggggttggaattcatcataatcataattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattaattatttgttaatgg 11060999  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| |  ||    
T  11061000 atgatgaaattcgtgctctaattatgatca-atttttaaatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagttgaatttcaggttcaaagtatgaga 11061098  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtg 314  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11061099 aaat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtg 11061161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 158
Target Start/End: Original strand, 6146664 - 6146769
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6146664 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6146763  T
Q  153 tgatga 158  Q
    ||||||    
T  6146764 tgatga 6146769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 11328859 - 11329134
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  11328859 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 11328956  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| ||||||||||||     | || ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |     
T  11328957 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtt-----gcataaagttgttaataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 11329051  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     |||| | | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  11329052 agaaagtgg-tatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 11329134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Original strand, 14527975 - 14528110
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  14527975 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgttcataa 14528073  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14528074 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 14528110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 304
Target Start/End: Original strand, 11196291 - 11196457
Alignment:
Q  130 tgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttga 229  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11196291 tgaattgattaattgttcatggatgatgaaatttgtgctctaataatgatgatatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 11196390  T
Q  230 attgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttg 304  Q
    ||| |||||| |        |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11196391 attttatgttga--------gaaaat-ggtatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgatttgttgttg 11196457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17139861 - 17139582
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||    
T  17139861 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattcttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaagtgttcat 17139764  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||| |   |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||| | |      
T  17139763 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaactatga 17139664  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  17139663 gaaaat-ggtatatgttg-aaatatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 17139582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7854385 - 7854306
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7854385 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7854306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 54037976 - 54038055
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  54037976 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 54038055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3992953 - 3992874
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3992953 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 3992874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 332
Target Start/End: Original strand, 14059112 - 14059386
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtg 154  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||   ||    
T  14059112 gtaagggggttataattcatcataatcattttagtgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgact-aattgactaattgttcatgattg 14059209  T
Q  155 atgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa 254  Q
     |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||   ||||  ||||||||||| |  |||||    
T  14059210 ttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgtttttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaa 14059309  T
Q  255 tagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  14059310 t-gacatatgttgaaa-tatgctcaatttgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaat 14059386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 55513273 - 55513194
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  55513273 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 55513194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16880477 - 16880197
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  16880477 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaacaagtgtttaattgagt-aattgattaattgttca 16880380  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |     
T  16880379 taattgtttgaattcgtgctccaattacgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatg 16880280  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtg-aattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     |||| | | |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  16880279 agaaagt-ggtatatgtt-agaatatgctcaatttgtgaaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaat 16880197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39656817 - 39656600
Alignment:
Q  113 ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataatt 212  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  || | |||| ||||||| |||| |||||  ||||||  || |||||| ||    ||||||    
T  39656817 ataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaatccgtgctccaattatgatgttatgtttgaatttatgaaattggtgataatt 39656719  T
Q  213 gaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgattt 311  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  39656718 gaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaatt 39656621  T
Q  312 gtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || ||||| |||||| |||||    
T  39656620 gttgtaagattcatgttcaat 39656600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2844594 - 2844515
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2844594 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 2844515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 12560131 - 12560409
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  12560131 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcatttattgcaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcata 12560228  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||  ||| ||  |||  |||||||||  ||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  12560229 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgattgaatgcttgaagttattgatacttgaatttttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 12560328  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  12560329 aaagt-ggtatatg-tgaaaatatgcccaactggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaat 12560409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857194
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 15857194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17205076 - 17204841
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||| |  |    
T  17205076 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattccatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtg-g 17204978  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    || ||  |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |    
T  17204977 tacgaacaagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttga 17204879  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||  |||||||||||    
T  17204878 taatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 17204841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191628
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||  ||||||||| ||||| || |    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcacaatcattttagtgtaatttttcaattgtt-g 17191838  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    |||||  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |    
T  17191837 tatgaacaattgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttga 17191739  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |    
T  17191738 taatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatttatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgttatgttgttgct 17191641  T
Q  307 gatttgtggtaag 319  Q
    || ||||| ||||    
T  17191640 gaattgtgataag 17191628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 319
Target Start/End: Original strand, 3576298 - 3576598
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ata 115  Q
    ||||||||||||| | ||  | || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| | |||    
T  3576298 aaagtgaagcttgggctaggaatttgtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaatt-gttgtacgaata 3576396  T
Q  116 agtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaa 215  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||||| |  || |  ||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||    
T  3576397 agtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttcaaagttgttataattcgtactctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaa 3576495  T
Q  216 ttgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgt 313  Q
    |||||||| ||  ||||  ||||||||  ||||||| |||  ||||||| ||| || ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  3576496 ttgttgttggtgaaatttcatgttcaa--tgtatgagaaagtgatatatattg-aattatgctcaaattgatggattatgctatgttgttgttgaattgt 3576592  T
Q  314 ggtaag 319  Q
    | ||||    
T  3576593 gataag 3576598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 19232169 - 19232090
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  19232169 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatca 19232090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15876341 - 15876250
Alignment:
Q  132 aattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 223  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||| ||| |  |||| ||||||||||||    
T  15876341 aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgataatatgtttaaatgcatgatgttgttgataactgaattgttgtt 15876250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 17955832 - 17955915
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttg----agttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17955832 agaatcataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 17955915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 263 - 332
Target Start/End: Original strand, 12349834 - 12349903
Alignment:
Q  263 tgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12349834 tgttgataatatgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 12349903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 332
Target Start/End: Original strand, 12488662 - 12488899
Alignment:
Q  93 aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttaga 191  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | | || ||||||||||||||  || |  ||||| |||||||||| ||||    ||||| ||    
T  12488662 aattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtca-ttaattaattgttcataattgttagaattcatgctctaattatgatattgtgtttgga 12488759  T
Q  192 tgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaatt 290  Q
    || |||||||| |  |||||||||||||||||  |  ||||  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  12488760 tgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaatt 12488857  T
Q  291 atgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  12488858 atgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 12488899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 85
Target Start/End: Original strand, 16743991 - 16744072
Alignment:
Q  4 ggagaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  16743991 ggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatca 16744072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3992684 - 3992624
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3992684 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 3992624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38168048 - 38167988
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38168048 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaat 38167988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 332
Target Start/End: Original strand, 14528118 - 14528185
Alignment:
Q  266 tgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  14528118 tgaaaatatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 14528185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Original strand, 13301323 - 13301491
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||||  |||  ||||||    
T  13301323 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtgatttttcatttgttgtat 13301422  T
Q  112 ga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatg 180  Q
    || |||||||||||||| || || |||||| | |||| ||  || |||| |||||||||||||| |||||    
T  13301423 gattaagtgcttaattgaat-aagtgattattggttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatg 13301491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Original strand, 13311979 - 13312147
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||||  |||  ||||||    
T  13311979 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtgatttttcatttgttgtat 13312078  T
Q  112 ga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatg 180  Q
    || |||||||||||||| || || |||||| | |||| ||  || |||| |||||||||||||| |||||    
T  13312079 gattaagtgcttaattgaat-aagtgattattggttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatg 13312147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 90
Target Start/End: Original strand, 38810868 - 38810945
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 90  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  38810868 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttt 38810945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2844325 - 2844265
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2844325 tatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 2844265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16261587 - 16261527
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16261587 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 16261527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30153076 - 30153016
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  30153076 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 30153016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 45582034 - 45581955
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag-ggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  45582034 agaatcataggagaaaaa-tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatca 45581955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 53771175 - 53771115
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  53771175 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 53771115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 54685422 - 54685482
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  54685422 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 54685482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14080863 - 14080669
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  14080863 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaactatg-gtatgaataagtgtttaattggataaat-gattaattgtgca 14080766  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||  || | |||||||||||| || | |||||| ||||||  ||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||    
T  14080765 tagatgttaaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatga-taattgaattgtggttagtgaatttgcatgttcaaagt 14080669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15550986 - 15550919
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 88  Q
    ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15550986 aaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatcactt 15550919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784853
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 47784853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Original strand, 33368822 - 33369024
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  33368822 aaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaattttca-ttaattgcatgattaagtgcttatttgaat-aattaattatttgttcata 33368919  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||| | ||    
T  33368920 gttgttgaaattcgtgctttaattgtggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgtggttggtgaaattgcatgttcatagtatgtg 33369019  T
Q  251 aaaat 255  Q
    |||||    
T  33369020 aaaat 33369024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 11882113 - 11882240
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || || |||||| |||||| ||     
T  11882113 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaacttttaatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcttag 11882211  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatg 180  Q
     || |||| ||| |||||||||| |||||    
T  11882212 atgttgaatttcatgctctaattatgatg 11882240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33342015 - 33341955
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || || || ||||||||||||||    
T  33342015 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaat 33341955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 12031904 - 12031849
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggtt 68  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12031904 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggtt 12031849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961106
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 51961106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15517921 - 15517848
Alignment:
Q  114 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15517921 taagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcataaatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgttt 15517848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Original strand, 9590648 - 9590784
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  9590648 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaaattgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtggttaattgttcata 9590746  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
      || | |||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  9590747 gttgttaaaatccgtgctctaactatgatgatatgttt 9590784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7854116 - 7854056
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  7854116 tatgttcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 7854056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12953210 - 12953056
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaataga 258  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||  ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||| | |     
T  12953210 aattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattagattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagt-gt 12953112  T
Q  259 tatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtg 314  Q
    ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  12953111 tatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtg 12953056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 332
Target Start/End: Original strand, 17956109 - 17956165
Alignment:
Q  276 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  17956109 ctcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 17956165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23492507 - 23492447
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23492507 tatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 23492447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 45581765 - 45581709
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  45581765 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 45581709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 55376494 - 55376770
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55376494 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttttgaaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 55376593  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  55376594 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttctaa--gtatgaaa 55376691  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  55376692 aatgggtatgtg-tgaaaatatactcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 55376770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 53704629 - 53704906
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53704629 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 53704728  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  53704729 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaa 53704826  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  53704827 aaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 53704906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 23269829 - 23270107
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23269829 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 23269928  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23269929 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 23270027  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  23270028 aatgggtatgtgttgaaaatatactcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaat 23270107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44347177 - 44346902
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44347177 taaggtaagggagttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 44347078  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  44347077 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtaagaaa 44346979  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaa 331  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||    
T  44346978 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaa 44346902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 58 - 332
Target Start/End: Original strand, 8872372 - 8872644
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 157  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8872372 gtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtg 8872471  T
Q  158 aaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aaaata 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||     
T  8872472 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagctatgaatgattgaagtgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaaaatg 8872569  T
Q  257 gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  8872570 ggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 8872644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34395609 - 34395331
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||      
T  34395609 taaggtaagggggttagaattcatcattatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaactgattaattgttcataaa 34395510  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34395509 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtaatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 34395411  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34395410 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 34395331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44056266 - 44055989
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44056266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 44056167  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  44056166 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat-tttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 44056070  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44056069 aaatgaatatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 44055989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30458255 - 30457977
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  30458255 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttgaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 30458156  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||| | | ||    
T  30458155 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatggataattaaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgt-aa 30458057  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30458056 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 30457977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 53907604 - 53907872
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  53907604 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtagttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggat--------taattgttcatatgt 53907695  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||    
T  53907696 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttattagttggattgtatgttcaaa--gtatgaaa 53907793  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||    
T  53907794 aatgggtatgtg-tgaaaatatgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaat 53907872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 12837096 - 12837373
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  12837096 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgaatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 12837194  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||     
T  12837195 tgatgatattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 12837292  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||    
T  12837293 aaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaat 12837373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16732520 - 16732243
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttc-aattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  16732520 taaggtaaagaggttagaattcatcataatcattattgcaattttttaattagt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 16732422  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||     
T  16732421 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgag 16732324  T
Q  253 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16732323 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 16732243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 21959359 - 21959636
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||      
T  21959359 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattaattgattgttcataaa 21959458  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||  ||  |||||  ||||| |    
T  21959459 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttaaatgtatgaagttatggatatttgaattgttgttgattgaattacat-ctcaaa--gtatgaa 21959555  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21959556 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 21959636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Original strand, 45458769 - 45459028
Alignment:
Q  73 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 171  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45458769 ttcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataagtgatgaaatttgtgctcta 45458868  T
Q  172 attgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaa 271  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |  |||  | | |||||||| || |    
T  45458869 attatgatgacatgtttagatgtatgaagtgatagataattgaattgttgttagttgaattacatgctcaaaatatgagaagtttg-tatatgttaaaga 45458967  T
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  45458968 tatgttcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaat 45459028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 819826 - 820089
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  819826 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 819925  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||               || | ||||    
T  819926 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt-gttg---------------gtttgtgaa 820009  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  820010 aatgtgtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 820089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Original strand, 20813442 - 20813634
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20813442 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttaaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20813541  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  20813542 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagt 20813634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 52265403 - 52265681
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  52265403 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgtttaattgggt-aattgattaattgttcata 52265500  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |  |    
T  52265501 gatgatgaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgag 52265600  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  52265601 aaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaat 52265681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 30232391 - 30232669
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  30232391 taaggtaagagggttagaattcatcataatcacttattgcaattttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcat 30232488  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |  ||| ||||||| | |    
T  30232489 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgt 30232587  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||  |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  30232588 gaaaagtgggttatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaat 30232669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27961324 - 27961045
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  27961324 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattgttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 27961227  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||    
T  27961226 aattgttagaatccgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttatgaataattgaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagt--at 27961129  T
Q  250 gaa-aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| ||  | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | | |||||||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  27961128 gaagaagtggtatatgttgaaa-tatgctaaattggttgaattatgttatattgttgttgaattgttataagattcatgatcaat 27961045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 13809405 - 13809683
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  13809405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcata 13809502  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |   |||||||||||||||| ||   |||  ||||||||||| |  |    
T  13809503 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaagtatgag 13809602  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  13809603 aaaat-ggtatatgttg-aaatatgctcaattagttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 13809683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 18494224 - 18494501
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||  | ||||||| |||||||||||     
T  18494224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatg-gtatgaataggtgcttaattgtgt-aattgatcaattgttcataa 18494321  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     || |  ||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |  ||| ||||||| |  ||    
T  18494322 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgttcgtatgtatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgaga 18494420  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||  | ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  18494421 aaaatggtatatgttg-aaatgtgctcaattggttggatgatgctatgttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaat 18494501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Original strand, 7185735 - 7185954
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 147  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  7185735 taattaaggtaaggaggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttc 7185833  T
Q  148 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    |||  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |    
T  7185834 atagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtat 7185933  T
Q  248 atgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  7185934 gtgaaaat-gatatatgttgaa 7185954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15045181 - 15044902
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  15045181 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 15045084  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |      
T  15045083 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15044984  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  15044983 gaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaat 15044902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 5682380 - 5682459
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  5682380 agaatcataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatca 5682459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 54118120 - 54118199
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54118120 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 54118199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 25119059 - 25119138
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  25119059 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatca 25119138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 314
Target Start/End: Original strand, 41256263 - 41256524
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  41256263 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 41256361  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  41256362 agttgttgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgttga-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 41256460  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtg 314  Q
    |||||| |||||||  || || ||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  41256461 gaaaat-gatatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtg 41256524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 308
Target Start/End: Original strand, 47535042 - 47535214
Alignment:
Q  135 tgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgt 234  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||      
T  47535042 tgattaattgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 47535141  T
Q  235 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttga 308  Q
    | ||||||||| |  |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47535142 aagttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttga 47535214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 15013137 - 15013379
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||| || ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||||| || || ||    
T  15013137 taggagctaaagtgaagcttgagctaggatttg-tgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaattttcatttgtt-gt 15013234  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaa 207  Q
    ||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| || ||| |    
T  15013235 atgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgtttaaattcgtgctctaattatgatgatatgttga-atgcatgaaattgatg-a 15013331  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaat 255  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  15013332 taattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 15013379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 15109243 - 15109522
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| |||||    
T  15109243 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattattcat 15109340  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |   | |  ||||| ||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |      
T  15109341 aatagttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15109440  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | |||||||||||||  ||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  15109441 gaaagt-gatatatgttgaat-tatactcaaattgataaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaat 15109522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Original strand, 41165808 - 41166119
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| |  |    
T  41165808 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtg-g 41165906  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||            |||| |||||| |||| |||| | || |||  ||| |||||||| |  |    
T  41165907 tatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttag----------aatttgtgctccaattatgataatatatttgaatgcatgaagttgttga 41165995  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41165996 taattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgtt 41166093  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || |||||| |||  ||||| |||||    
T  41166094 gaattgtggcaagagtcatgttcaat 41166119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14951896 - 14951836
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  14951896 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 14951836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14901584 - 14901437
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14901584 taaggtaagggggttaaatttcatcataatcattttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcat 14901487  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaa 199  Q
    || || |  |||||||||||||||| |||  | ||||||  |||||||||    
T  14901486 atttgttataattcgtgctctaattatgacaatatgtttgaatgtatgaa 14901437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Original strand, 5682648 - 5682704
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  5682648 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 5682704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 15272433 - 15272493
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  15272433 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaat 15272493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 242
Target Start/End: Original strand, 7964606 - 7964796
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || ||| ||||||||||||    
T  7964606 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgttcata 7964704  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaa 242  Q
      || | |||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  7964705 gttgttaaaatccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 7964796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18276743 - 18276508
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatg 193  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | |  ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||    
T  18276743 ttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-atgtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgaatg 18276646  T
Q  194 tatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattat 292  Q
     ||||| ||    |||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||||| | | ||||||||| || ||||||| || || |||||| |    
T  18276645 catgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagcatgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgt 18276548  T
Q  293 gctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | |||||||||| ||||| | || |||||| |||||    
T  18276547 gctatattgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaat 18276508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 47534933 - 47534990
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47534933 taggagctaaagtgaagcttgggcgaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 47534990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 25119328 - 25119388
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25119328 tatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 25119388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37612020 - 37611742
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  37612020 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataag 37611921  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37611920 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 37611822  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  37611821 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 37611742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 22234700 - 22234976
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22234700 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgaatgaattgattaattgttcataagt 22234799  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  22234800 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacgtgtttagatgtatgaagttatgaataatttaattg-tgttagttgaattacatgctcaaagtgtatgaaa 22234898  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22234899 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 22234976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 20573087 - 20573365
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20573087 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20573186  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20573187 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 20573286  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20573287 aa-gggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 20573365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 19992952 - 19993227
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19992952 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttttgtaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 19993050  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19993051 gatgaaatccgtactctaattatgatgacatgtttagatgtacgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacttgttcaaagtgtatgaaa 19993149  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||    
T  19993150 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaat 19993227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41247009 - 41246732
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  41247009 taaggtaagggggttagagttcatcataatcacttattgtaattttcaattagttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataaa 41246910  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt-gtatga 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||| | |  |    
T  41246909 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaattgttgttggttgaattacatgttaaaagtagga--a 41246812  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41246811 aaatgggtatatgatg-aaatatgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 41246732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20481955 - 20481679
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||       
T  20481955 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaat-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgttcatgga 20481858  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  20481857 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 20481760  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  20481759 aaatggatatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaat 20481679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 20561526 - 20561804
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20561526 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20561625  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||     
T  20561626 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 20561723  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20561724 aaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20561804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25122793 - 25122618
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25122793 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 25122694  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttga 229  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25122693 gatcaaattcgtgctccaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgctagttga 25122618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21681356 - 21681076
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21681356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaatttgttgaattgattaattgttcata 21681258  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |  |    
T  21681257 aatgataaaattcgtgatctaattatgatgacatatttgaatgtataagtttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgtttaaagtatgag 21681158  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | ||  | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  21681157 agaa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaat 21681076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Original strand, 21198005 - 21198325
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||    
T  21198005 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcattataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gt 21198103  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||    
T  21198104 atgattaagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagat 21198202  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  21198203 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgttatgttgttgttg 21198300  T
Q  308 atttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||    
T  21198301 aattgtggtaagaatcatgttcaat 21198325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 158
Target Start/End: Original strand, 7000524 - 7000624
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7000524 gtaagggggttagttttcatcataatcacttttttaattttcaattatttgtatgataagtgcttaataggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 7000623  T
Q  158 a 158  Q
    |    
T  7000624 a 7000624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23837561 - 23837272
Alignment:
Q  45 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgta---attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgatt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||   |||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  23837561 ggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttaatatagattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gatt 23837464  T
Q  140 aattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgtt 239  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |  ||||  |||||    
T  23837463 aattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttattgaaatttcatgtt 23837364  T
Q  240 caaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  23837363 caaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aactatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaat 23837272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 39446660 - 39446939
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  39446660 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 39446757  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||||    
T  39446758 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaa--gtat 39446855  T
Q  250 gaa-aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| ||  | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  39446856 gaagaagtgttatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 39446939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22981622 - 22981351
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  22981622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatt--ttgtatgaataagtgcttaattgggt-aattgattaattgttcaga 22981526  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  22981525 tg--atgaaatttgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 22981428  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    ||| | | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22981427 aaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgat 22981351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Original strand, 20653944 - 20654078
Alignment:
Q  197 gaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20653944 gaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgagaaattggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgct 20654041  T
Q  296 ttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
      ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20654042 aagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20654078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17285600 - 17285364
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactttt-gt---aattttcaattattt 107  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||    
T  17285600 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaaattttcaatt-gtt 17285502  T
Q  108 gtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatga 206  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |      
T  17285501 gtatgattaagtgcttaattgaat-aattgaataattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttg 17285403  T
Q  207 ataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||    
T  17285402 ataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 17285364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Original strand, 20529748 - 20529843
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20529748 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 20529843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 16404852 - 16404931
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16404852 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 16404931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 332
Target Start/End: Original strand, 20647882 - 20648002
Alignment:
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgat 309  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  20647882 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgagaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaa 20647979  T
Q  310 ttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  20647980 ttgtgataagtttcatgatcaat 20648002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 24716714 - 24716793
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24716714 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 24716793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 39115678 - 39115599
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39115678 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatca 39115599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29306813 - 29306509
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag-ggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||  | || ||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  |||    
T  29306813 taggagctaaactgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagaggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttg 29306714  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||  || | | ||||||||||||| | |||||| |||||   ||| ||||| |||   |    
T  29306713 tatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattgattgttcatagatgttaatattcgtgctctaactatgatgatatgttctaatgcatgaaattagtga 29306615  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  29306614 taattgaattgttgttggtgaatttgtatgttcaaagtttgtgaaaat-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 29306517  T
Q  307 gatttgtg 314  Q
    || |||||    
T  29306516 gaattgtg 29306509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 274846 - 274767
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  274846 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 274767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 641003 - 641082
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  641003 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 641082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 826809 - 826888
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  826809 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 826888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33528819 - 33528517
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  33528819 taggagctaaagtgaagtttgagctaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 33528720  T
Q  111 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaata 209  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||||||||||| ||  || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||    
T  33528719 tgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcttagatgttgaattccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgata 33528621  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttga 308  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||    
T  33528620 attgaattgttgttgatgaaattgtatcttcttagtatatgaaaat-gatatatgttgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttga 33528523  T
Q  309 tttgtg 314  Q
     |||||    
T  33528522 attgtg 33528517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5855007 - 5854688
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| || |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||    
T  5855007 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattg-tgctaattaaggtaaggaggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gt 5854910  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    ||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||    
T  5854909 atgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggcgat 5854811  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || ||||||| || || ||| || |||| |||||||||||    
T  5854810 aattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgagttgtgctatgttgttgttg 5854713  T
Q  308 atttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | ||||| | || |||||| |||||    
T  5854712 aattgtgatgagattcatgttcaat 5854688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15933655 - 15933458
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgtt-catcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  15933655 taattaaggtaagggggttagaattaaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 15933558  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  15933557 tcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 15933458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26011848 - 26011586
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||  | || |||||||||||    
T  26011848 taattaaggtaagggggtta---ttcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgtttaattgagt-aagtgattaattgt 26011754  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||    
T  26011753 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagt 26011654  T
Q  246 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtg 314  Q
     | ||||| | | ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  26011653 atgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtg 26011586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38533922 - 38533723
Alignment:
Q  132 aattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaat 231  Q
    |||||| ||||||||||||  || |  ||||||| ||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||    
T  38533922 aattgactaattgttcataattgttagaattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaat 38533823  T
Q  232 tgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatca 330  Q
       ||||||||||| |  |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| | || |||||| |||    
T  38533822 ctcatgttcaaagtatgagaaaatgg-tatatgttgaaa-tatgctcaaattattgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttca 38533725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 274577 - 274517
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  274577 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 274517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 641272 - 641332
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  641272 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 641332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 827078 - 827138
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  827078 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 827138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 16039002 - 16039062
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16039002 tatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 16039062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 41506930 - 41506990
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  41506930 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 41506990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22743122 - 22742914
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  22743122 taattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgt 22743024  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || ||||||||||||| | ||| || ||| ||||||   || ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||    
T  22743023 tcatagttgttgaaattcgtgctttgattatggtgatatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 22742924  T
Q  246 gtatgaaaat 255  Q
     | |||||||    
T  22742923 atgtgaaaat 22742914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25296426 - 25296295
Alignment:
Q  137 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtat 236  Q
    ||||||||||||||  || | |||||||||| |||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||| |||| ||  ||||| ||    
T  25296426 attaattgttcatacatgttaaaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcat 25296327  T
Q  237 gttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  25296326 gttcaaagcttgtgaaaat-gatatatgttgaa 25296295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25758446 - 25758315
Alignment:
Q  137 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtat 236  Q
    ||||||||||||||  || | |||||||||| |||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||| |||| ||  ||||| ||    
T  25758446 attaattgttcatacatgttaaaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcat 25758347  T
Q  237 gttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  25758346 gttcaaagcttttgaaaat-gatatatgttgaa 25758315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39115409 - 39115349
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||    
T  39115409 tatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaat 39115349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Original strand, 31194217 - 31194340
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  31194217 taaggtaagggggttagttttcatcataatcatttttagtgcaaattttcaatt-gttgtatgaataattgcttaatt-gagtaattgattaattgttca 31194314  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaatt 174  Q
    |   || |  ||||||||||||||||    
T  31194315 tgattgttagaattcgtgctctaatt 31194340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 253
Target Start/End: Original strand, 23151810 - 23151928
Alignment:
Q  135 tgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgt 234  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||| |||||| || |||  ||| |||||  ||   ||||||||||||||||| ||  ||||      
T  23151810 tgattaattgttcatatttgttaaaattcgtgttccaattatgatgatatatttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 23151909  T
Q  235 atgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  23151910 atgttcaaattgtatgaaa 23151928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Original strand, 27233047 - 27233120
Alignment:
Q  114 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27233047 taagtgcttaattgaat-aagtgattattagttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttt 27233120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 24716983 - 24717043
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||||||| |||||    
T  24716983 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaat 24717043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Original strand, 38635541 - 38635731
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || ||| |  ||||||||    
T  38635541 taaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgaatctttgttcat 38635639  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttca 241  Q
    |  || |||||||||||||||| || | |||| ||||||  ||  ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||    
T  38635640 agttgttgaaattcgtgctctagttatcatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 38635731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15224 - 14948
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatatgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 15125  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  15124 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttagattacatgttcaaagtgtatgaaa 15026  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15025 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 14948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 331
Target Start/End: Original strand, 25875816 - 25876091
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25875816 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataagt 25875915  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25875916 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 25876014  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaa 331  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || | |||||||||||    
T  25876015 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaa 25876091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 23836601 - 23836878
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  23836601 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgaatgataagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataagt 23836700  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23836701 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattg-tgttagtggaattacatgttcaaagtgtatgaaa 23836799  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23836800 atgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 23836878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32466207 - 32465932
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32466207 taaggtaagggg-ttagtcttcatcataatcacttttgaaaattttaattatttgtacgataagtgcttatttgaatgaattgattaattgttcatatgt 32466109  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  32466108 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaa 32466011  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32466010 aatggatatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 32465932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 271521 - 271244
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||      
T  271521 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattattcataaa 271423  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  271422 tgaagaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-a 271324  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  271323 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 271244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 4448028 - 4448306
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||      
T  4448028 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttatatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataaa 4448127  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  4448128 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-a 4448226  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | | | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  4448227 aatgggtttgtgttgaaaatatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaat 4448306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 36890581 - 36890858
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||      
T  36890581 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgttattttcaattatg-gtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 36890679  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  36890680 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatggcatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 36890779  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||||||||    
T  36890780 aatgga-atatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaat 36890858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25602377 - 25602098
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  25602377 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatg 25602279  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||    
T  25602278 gatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatg 25602181  T
Q  251 a-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25602180 agaaattgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 25602098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28974400 - 28974123
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  28974400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattatttcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 28974302  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |  |||    
T  28974301 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgagaa 28974202  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28974201 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaat 28974123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27262156 - 27261915
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27262156 taaggtaagggagttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatg 27262058  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||    
T  27262057 gatgatgaaatttgtgccctaattatgatgacatgtttggatgtataaagttatggataattgaattgttgttagttcaattacatgttcaaa--gtatg 27261960  T
Q  251 a-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 295  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27261959 agaaattggtatatgttgaaaatatgctc-attggtgaattatgct 27261915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 24571188 - 24571465
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaat-tttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  24571188 taaggttagggggttagaattcatcataatcattattgcaatgtttcaattatt-gtatgaataaatgcttaattgggt-aattgattaattgttcatag 24571285  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||   ||||  |||||||| || |  ||    
T  24571286 atgatgaaattcgtgctctaattttgatgacacgtttgaatgcatgaagttgtggatacttgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaggtatgaga 24571385  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  24571386 aaat-gatatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaat 24571465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 22579758 - 22580032
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  22579758 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 22579855  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | |||| |||| || |  ||    
T  22579856 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatgtatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaactttatgatcaaggtatgaga 22579954  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||  | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22579955 aaaatgttatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgct---ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 22580032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 68351 - 68066
Alignment:
Q  49 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaatt 143  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  68351 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataaattttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaatagattaatt 68254  T
Q  144 gttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa 243  Q
    |||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||    
T  68253 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 68154  T
Q  244 gtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || |  |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  68153 gtatgagaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaat 68066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15633617 - 15633535
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 88  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  15633617 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatcactt 15633535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 19794581 - 19794660
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19794581 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 19794660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43646289 - 43645967
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaattttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||| |||| | |  |||    
T  43646289 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcagtcataatcatttttagtgtaaatttccaattgttg 43646190  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    ||||| |||||| |||||||  | ||| ||||||||||||| |  || |  |||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  43646189 tatgaataagtgtttaattgagtaaat-gattaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttga 43646091  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||  ||||| ||||| |  |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43646090 taattggattgttgttggtgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgtt 43645993  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||  |||||||||  ||||| |||||    
T  43645992 gaactgtggtaagaatcatgttcaat 43645967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 20627190 - 20627269
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  20627190 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatca 20627269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22275125 - 22275046
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22275125 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatca 22275046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22284358 - 22284279
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22284358 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 22284279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 313
Target Start/End: Original strand, 31146073 - 31146334
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||    
T  31146073 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatcttttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaataagtgcttaactgagt-aattgattaattgtcca 31146171  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  |||||||| || |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |     
T  31146172 taattgttagaattcgtgttccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatg 31146271  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgt 313  Q
     |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  31146272 agaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatg-tgttgttgaattgt 31146334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 43642833 - 43642912
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  43642833 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatca 43642912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660098
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||  |||  |||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaa-ggggttagaattcatcataatcactttagtgtaatttttcatttgttgta 19660175  T
Q  111 tga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtt 187  Q
    ||| |||||| |||| ||||  || |||||| |||||| ||  || |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  19660174 tgattaagtgtttaa-tggaataagtgattatttgttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatgatatgtt 19660098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6879601 - 6879511
Alignment:
Q  241 aaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| || |||| |||||||||    
T  6879601 aaagtgtatgaaaatgggtatgtgt-gaaaatatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaat 6879511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19666921 - 19666688
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||    
T  19666921 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgta 19666823  T
Q  111 tg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaata 209  Q
    || |||| |||||||||| || || ||||||||||||||||  || | |||||| |||||||| | | |||| ||||||  ||| ||||| ||    |||    
T  19666822 tgaataaatgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcatgctctaactataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgata 19666724  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||||||||||| || ||  | ||| |||||||||||    
T  19666723 attgaattgtttttggtgaatttgcatgttcaaagt 19666688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25305818 - 25305634
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatg-ata 115  Q
    ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  | ||||||| |||||  ||||||| |||    
T  25305818 aaagtgaagcttgggctatgaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtataattttacaatt-gttgtatgaata 25305720  T
Q  116 agtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt 202  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||||| |  || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  25305719 agtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtt 25305634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 722742 - 722531
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||  || ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||     
T  722742 taaggtaaaggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttgcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataa 722645  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     || | |||||||||||| |||| ||||   ||||||  ||||||||| ||    |||||||| |||||||| ||  ||||| ||| ||||||| |||||    
T  722644 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatattatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatga 722545  T
Q  252 aaatagatatatgtt 266  Q
    |||| ||||||||||    
T  722544 aaat-gatatatgtt 722531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 23821534 - 23821713
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  23821534 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23821631  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatt 232  Q
      || | ||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||| | |||||| |  |||||||||||||||||  |||||||    
T  23821632 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttgattgaatt 23821713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 23830613 - 23830792
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  23830613 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23830710  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatt 232  Q
      || | ||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||| | |||||| |  |||||||||||||||||  |||||||    
T  23830711 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttgattgaatt 23830792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Original strand, 19669003 - 19669101
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  19669003 taaggtaacggggttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aaatgattaattgttcat 19669100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22274856 - 22274796
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  22274856 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaat 22274796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22284089 - 22284029
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  22284089 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaat 22284029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9636943 - 9636837
Alignment:
Q  207 ataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgt 305  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||  || || ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||    
T  9636943 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtg-aattatgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgt 9636846  T
Q  306 tgatttgtg 314  Q
    ||| |||||    
T  9636845 tgaattgtg 9636837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 332
Target Start/End: Original strand, 21274174 - 21274230
Alignment:
Q  276 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  || ||||||||||||||    
T  21274174 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaat 21274230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 11548 - 11827
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11548 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 11647  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11648 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttcttggttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 11747  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  11748 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 11827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1667 - 1391
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||      
T  1667 taaggcaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatt--caattatttgtatgaaaagtggttaattgaatgaattgattaattgtgtataaa 1570  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  1569 tgatgaaattcgtgctctaatcatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttggtggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 1472  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1471 aaatgggtatgtgatgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 1391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 254710 - 254987
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  254710 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 254808  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  254809 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttg-tagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 254907  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  254908 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 254987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 261316 - 261593
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  261316 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 261414  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  261415 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtag-tagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 261513  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  261514 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 261593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 328
Target Start/End: Original strand, 22403005 - 22403279
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22403005 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 22403104  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22403105 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtctagatgtatgaagttatgaataattaaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 22403203  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  22403204 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 22403279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 61 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41212415 - 41212146
Alignment:
Q  61 agggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaa 160  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41212415 agggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaa 41212316  T
Q  161 ttcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aaaatagat 259  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| | |    
T  41212315 ttcgtgctctaattatgatgacctgtttagaggtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaactgtatgttcaaa--gtatgaaaaatgggt 41212218  T
Q  260 atatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  41212217 atgtg-taaaaatatgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 41212146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 49968002 - 49967724
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  49968002 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcacttattgtaattttcaattatttgcatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcaaaaa 49967903  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||  ||    
T  49967902 tcatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaattata-aaa 49967804  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  49967803 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaat 49967724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35055108 - 35054830
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta-attttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||      
T  35055108 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttatttctattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattggttaattgttcataaa 35055009  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  35055008 tgatttaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 35054911  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  35054910 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaat 35054830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 9783959 - 9784234
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  9783959 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttactgcaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgataaattgttcataag 9784058  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||     
T  9784059 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagt--atgag 9784156  T
Q  253 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9784157 aagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgct---ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 9784234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 95 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21718537 - 21718302
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21718537 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatggatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgt 21718439  T
Q  195 atgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21718438 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgagaaattggtatgtgttcaaaatatgctcaattggtgaattatg 21718341  T
Q  294 ctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21718340 ctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaat 21718302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 35522247 - 35522426
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  35522247 taaggtaagggagttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagggcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35522346  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35522347 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatt 35522426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20177570 - 20177263
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||    
T  20177570 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaatta-ttg 20177472  T
Q  109 tatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    ||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| | |||||| |  |    
T  20177471 tatgtttaagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttga 20177373  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20177372 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgtt 20177275  T
Q  307 gatttgtggtaa 318  Q
    || |||||||||    
T  20177274 gaattgtggtaa 20177263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 332
Target Start/End: Original strand, 27329757 - 27329928
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaataga 258  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |  ||| ||||||| | ||||||  |     
T  27329757 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatga-taattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgtgaaaagtgg 27329855  T
Q  259 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  27329856 gttatgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaat 27329928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41218808 - 41218729
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41218808 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatca 41218729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376923
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-g 13376809  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||   | |||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  13376810 tatgattaagtgcttaatttagt-aattgattaattgttcatagatgatgagaatcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttga 13376908  T
Q  208 taattgaattgttgt 222  Q
    ||||| |||||||||    
T  13376909 taattaaattgttgt 13376923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21860414 - 21860335
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21860414 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 21860335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41394609 - 41394528
Alignment:
Q  4 ggagaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41394609 ggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 41394528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034902
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 44034902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522492
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 35522492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16656992 - 16656712
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  16656992 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16656895  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||  || |   |||||||||| |     
T  16656894 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 16656795  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  16656794 agaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaat 16656712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16646266 - 16645986
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  16646266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16646169  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||| ||||| |||| ||  ||||  ||||||||||| |     
T  16646168 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataatttaattgatgttggtaaaatttcatgttcaaagtatg 16646069  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     |||| | |||||||||||||  ||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  16646068 agaaagt-gatatatgttgaat-tattctcaaattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaat 16645986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19603449 - 19603238
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  19603449 taaggtaagggggctagaattcatcataatca-tttagtgcaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 19603353  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || | |||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||||||||| ||    |||||||| |||||||| ||  ||||| ||| ||||||| |||    
T  19603352 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatat 19603253  T
Q  250 gaaaatagatatatgt 265  Q
    |||||| |||||||||    
T  19603252 gaaaat-gatatatgt 19603238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21195408 - 21195106
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| || ||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||    
T  21195408 taggagctaaagtgaagcttgggctaggatttg-tgctaactaaggtaaggggtttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgt 21195310  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    ||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||| ||    ||    
T  21195309 atgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgat 21195211  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||  || || ||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  21195210 aattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttg 21195113  T
Q  308 atttgtg 314  Q
    | |||||    
T  21195112 aattgtg 21195106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 51627558 - 51627837
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  51627558 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gcatgaataagtgcttaattgagt-aattgattatttgttcat 51627655  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |   | |  |||| |||||| |||| |||||| ||| ||  ||| ||||| || |  || |||||||||||||||||  || |  ||||||||||| |      
T  51627656 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgatatgcttgaatgcatgaatttgttgatgattgaattgttgttagtgaaacttcatgttcaaagtatga 51627755  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  51627756 gaaaatgg-tatatgttgaaa-tatgttcaattggttgaattatgatatggtgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 51627837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17609322 - 17609026
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||    
T  17609322 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gt 17609224  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    ||||| |||||||||||||  | || |||||| ||| |||||  || |  |||||||||||||||| |||||| || |||  ||| ||||| ||    ||    
T  17609223 atgattaagtgcttaattgagt-aagtgattagttgatcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgat 17609125  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||| |||||||||||    
T  17609124 aattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttg 17609027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Original strand, 22143256 - 22143448
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22143256 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 22143352  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |  || | ||||||||||||||| | ||||||  |||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  22143353 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagt 22143448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 332
Target Start/End: Original strand, 37233750 - 37234033
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | || ||| |||||||    
T  37233750 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtattattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgt 37233847  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    | |||  || |  |||||||||| || || |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  37233848 taatagttgttagaattcgtgctttagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcaaagt 37233947  T
Q  246 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     ||||||| | ||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||| ||||| | || |||||| |||||    
T  37233948 atatgaaagt-gatatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaat 37234033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 15861547 - 15861607
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15861547 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 15861607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 8537803 - 8538007
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||    
T  8537803 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8537901  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
       || ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  8537902 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 8538001  T
Q  250 gaaaat 255  Q
    ||||||    
T  8538002 gaaaat 8538007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 8603042 - 8603246
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||    
T  8603042 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8603140  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
       || ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  8603141 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 8603240  T
Q  250 gaaaat 255  Q
    ||||||    
T  8603241 gaaaat 8603246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21860145 - 21860089
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  21860145 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 21860089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 44035092 - 44035152
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  44035092 tatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 44035152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675120
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatc 84  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatc 27675120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22367152 - 22367093
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22367152 tatgctcaattggtgaat-atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 22367093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 5143 - 5419
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5143 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttctaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 5242  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5243 gatgaaattcgtgctcttattatgatgagatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 5341  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5342 ataggtatgtg-cgaaaatatgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 5419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 8776 - 9055
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8776 taaggtaagggggttagagttcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggaaaattgattaattgttcata 8874  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |    
T  8875 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 8974  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  8975 aaaat-gatatatgttg-atatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaat 9055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4635 - 4359
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4635 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacgtttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 4536  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4535 gatgaaattcgtgctctaattataatgacatgtttagatgtatcaaattatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 4437  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | ||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  4436 atgggtatgtg-tgaaaatatgttcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaat 4359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 6)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 164565 - 164290
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  164565 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaattgtatggtaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataagt 164466  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  164465 gatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 164367  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaa 331  Q
    || | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||    
T  164366 atgggtatgtg-tgaagatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaa 164290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 166116 - 166195
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  166116 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 166195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162109
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 162109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 90
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116487
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 90  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcattttt 116487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 162299 - 162359
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  162299 tatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 162359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 166385 - 166445
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  166385 tatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 166445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18570630 - 18570353
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18570630 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 18570531  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||  ||||| ||    
T  18570530 gatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgatgttatggataattgaattgttattagttaaattacatgttcaaa--gtatgaaa 18570433  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18570432 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 18570353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32899142 - 32898864
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  32899142 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 32899043  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  32899042 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 32898945  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32898944 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 32898864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22441285 - 22441008
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  22441285 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcatatat 22441186  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||  ||||| |||  ||||| ||    
T  22441185 gatgaaattcgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtgatggggtgaattacatgttaaaa--gtatgaaa 22441088  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22441087 aatgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaat 22441008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 13014603 - 13014882
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattat--ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13014603 taaggtaagggggttagaatttatcataatcacttattgtaattttcaattatgtttgtatgaaaagtgctaaattgggtgaattgattaattgttcata 13014702  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||    
T  13014703 agtgatgaaattcgtgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttgaa---gtatg 13014799  T
Q  251 -aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     ||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  13014800 aaaaatgggtatgagttggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaat 13014882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16106868 - 16106592
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||      
T  16106868 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattaattaattgttcgtaaa 16106769  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||    
T  16106768 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 16106671  T
Q  253 aataga-tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatca 330  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16106670 aaatgagtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatca 16106592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16086369 - 16086093
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  16086369 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 16086270  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  | |||    
T  16086269 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattacatgttcaaagt--acgaa 16086172  T
Q  253 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatca 330  Q
    || | | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  16086171 aaatgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatca 16086093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18432994 - 18432717
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  18432994 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaaattttcaattatt-gtatgaaaagagcttaattgggtgaattgattatttgttcataaa 18432896  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||| |||  ||||| |    
T  18432895 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatacttgaattgttgttgattgaattacatgttaaaa--gtatgaa 18432798  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18432797 aaatgggtgtatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 18432717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31628552 - 31628342
Alignment:
Q  121 ttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtt 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31628552 ttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtattcgaattatgattacatgtttagatgtatgaagttattgataattgaattgtt 31628453  T
Q  221 gttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaag 319  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31628452 gttagttgaattacatgttcaaagt--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataag 31628355  T
Q  320 tttcatgatcaat 332  Q
    |||||||||||||    
T  31628354 tttcatgatcaat 31628342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18777481 - 18777220
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||                 ||||||      
T  18777481 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattggaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattg-----------------ttcataaa 18777399  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  18777398 agatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 18777301  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18777300 aaatgggtatgtgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 18777220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21623563 - 21623255
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaattt-tcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||||| ||||||  |||    
T  21623563 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttctcaatt-gttg 21623465  T
Q  109 tatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  21623464 tatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcataaatgttagaattcgtgctccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttga 21623366  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21623365 taattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgtt 21623268  T
Q  307 gatttgtggtaag 319  Q
    || ||||||||||    
T  21623267 gaattgtggtaag 21623255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18399290 - 18399012
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  18399290 taaggtaagggggttagaattcttcataatcattttagtgtaaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcata 18399193  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  18399192 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 18399093  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | || |||||| |||||    
T  18399092 aaaatag-tatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaat 18399012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18583720 - 18583641
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18583720 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 18583641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Original strand, 22361619 - 22361920
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgtaatttt-caattatttgta 110  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||    
T  22361619 taggagctaaagtgaagcttggcctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtaatttttcaattgtt-gta 22361717  T
Q  111 tga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaata 209  Q
    ||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||    
T  22361718 tgaataagtgcttaattg-agcaaatgattaattgttcatagatgataaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgata 22361816  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttga 308  Q
    ||||||||||||||  |  ||||  ||||||||||| |  |||| | || ||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22361817 attgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gacataagttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttga 22361914  T
Q  309 tttgtg 314  Q
     |||||    
T  22361915 attgtg 22361920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 314
Target Start/End: Original strand, 17083093 - 17083352
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||     
T  17083093 taaggtaagggggttagaattcattttaatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatag 17083191  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     || | | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| |  ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | |||    
T  17083192 ttgttaatattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtga-taattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtga 17083290  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtg 314  Q
    |||| |||||||||||||  | ||||| || || |||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  17083291 aaat-gatatatgttgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtg 17083352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 19983144 - 19983223
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19983144 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 19983223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 35015009 - 35015088
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  35015009 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 35015088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 25367130 - 25367410
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  25367130 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagcaattgattaattgttcat 25367227  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaag-ttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  |||||||||| || |  ||||| |||||||||||||   ||||  ||||||||||| |     
T  25367228 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaagttttttgataatggaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatg 25367327  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     |||| | | | ||||||| |||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  25367328 agaaagt-ggtttatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaat 25367410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 18629469 - 18629695
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aag 117  Q
    ||||||||||||| | ||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||    
T  18629469 aaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaattttttatttgttgtatgattaag 18629568  T
Q  118 tgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaat 216  Q
    || ||||||| || || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  18629569 tgtttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatg-ataattgaat 18629666  T
Q  217 tgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  18629667 tgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 18629695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33325046 - 33324874
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatt--ttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||  |||||||| | |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33325046 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattatttcaattaat-gtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttca 33324949  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 223  Q
    ||  || | ||||||||||||||| |  ||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||||||||||||||    
T  33324948 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgataattgaattgttgtt 33324874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 307
Target Start/End: Original strand, 21410944 - 21411197
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  21410944 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gaggaattgactaattgttcat 21411041  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |   | |  |||| |||||| |||| |||||  |||| |  ||| |||||||| |  |||||||||| |||||||  | ||||  ||||||||||| |      
T  21411042 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgttatgtatgaatgcatgaagttgttgataattgaatggttgttaaataaatttcatgttcaaagtatga 21411141  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    |||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||    
T  21411142 gaaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatgctatgttgatgttg 21411197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 245
Target Start/End: Original strand, 17556909 - 17557104
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatca-cttttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 146  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| || || ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  17556909 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatctagtgtaatttttcattaattgcattattaagtgcttaattgaat-aattgattatttgtt 17557007  T
Q  147 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  17557008 catagttgtt-aaattcgtgctctaattatgatgatatgttt-gatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 17557104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 35135906 - 35136078
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35135906 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattagat-aattgattaattgttca 35136003  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgtt 223  Q
    ||  || | ||||||||||||||| |  ||||| ||||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  35136004 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgtt 35136078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26089869 - 26089809
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26089869 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 26089809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Original strand, 16887685 - 16887881
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||||    
T  16887685 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattgaat-aaatgattaattgttca 16887782  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    ||  || | ||||||||||||||| | |||| | ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  16887783 tagatgttaaaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtgt 16887881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 15742341 - 15742401
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15742341 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 15742401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18583451 - 18583391
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  18583451 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 18583391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23995057 - 23994997
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23995057 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 23994997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 35015278 - 35015338
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  35015278 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 35015338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Original strand, 15079606 - 15079797
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15079606 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattattt-tatgaataagggattaattggat-aattgattaattattcat 15079702  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    |  || | ||||||||||||||| |  ||||| |||||   ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  15079703 agatgtt-aaattcgtgctctaactaggatgatatgttgt-atgcatgaagttgaggataattgaattgttgtt-gtgaaattgcatgttcaaagtgt 15079797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 332
Target Start/End: Original strand, 18381684 - 18381856
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaataga 258  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || |||  ||  |||||||| |  |||||||||| |||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||    
T  18381684 aatttgtgctctaattatgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-ga 18381782  T
Q  259 tatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||    
T  18381783 tatatgttgaat-tatgcttaaattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaat 18381856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29605739 - 29605632
Alignment:
Q  114 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattg 213  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||    
T  29605739 taagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaa-ttagtgataattg 29605642  T
Q  214 aattgttgtt 223  Q
    ||||||||||    
T  29605641 aattgttgtt 29605632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 18002617 - 18002677
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  18002617 tatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 18002677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744385
Alignment:
Q  277 tcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaa 331  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaa 25744385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Original strand, 33538223 - 33538384
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || |||  || |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  33538223 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgcgaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 33538322  T
Q  111 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaa 172  Q
    |||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  33538323 tgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaa 33538384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 28195101 - 28195248
Alignment:
Q  166 gctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgt 265  Q
    |||| |||| |||||| ||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| |  |||||| | ||||||     
T  28195101 gctccaattatgatgatatgtttgaatgtatgaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcatagtatgagaaaat-ggtatatga 28195199  T
Q  266 tgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtg 314  Q
    || |||| ||||||||| | ||||||||||  || ||||||||| |||||    
T  28195200 tg-aaatgtgctcaattagttgaattatgccatgatgttgttgaattgtg 28195248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 14152704 - 14152632
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  14152704 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggcaagggggttattcttcatcataatca 14152632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 496 - 218
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  496 taaggtaagggggttagaattaatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 397  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||  |||||||||||    
T  396 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaaattcatgtttcaagtgtatgaa 297  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  296 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 717 - 995
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  717 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattgattgttcatatg 816  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||    
T  817 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagatgaattacatgttcaaagt--atgaa 914  T
Q  253 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  915 aaatgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaat 995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 63 - 332
Target Start/End: Original strand, 6749 - 7018
Alignment:
Q  63 ggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaat 161  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6749 ggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgatcagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatatgtgatgaaat 6848  T
Q  162 tcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatat 261  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||    
T  6849 tcgtgctctaattacgaggacatgtttagatgtatgaagttatgaatagttgaattgttgttggttgaattacatgttcagagtgtatgaaaatgggtat 6948  T
Q  262 atgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6949 gtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 7018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 11603 - 11881
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11603 taagctaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 11702  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  |||||    
T  11703 tgatgaaatttgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggatgaattacatgttcaaagt--atgaa 11800  T
Q  253 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||||||||||||    
T  11801 aaatgggtattagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaat 11881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23043 - 22765
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23043 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatcaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 22944  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  22943 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttttgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 22846  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22845 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48496 - 48221
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48496 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 48398  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  48397 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagt--atgaaa 48300  T
Q  254 a-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  48299 aatgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 48221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 61944 - 61669
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  61944 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 61846  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  61845 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagt--atgaaa 61748  T
Q  254 a-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  61747 aatgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 61669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25563 - 25285
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25563 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 25464  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||| |||    
T  25463 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25364  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  25363 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaat 25285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25210 - 25032
Alignment:
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||| |||    
T  25210 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25111  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  25110 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaat 25032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10289 - 10011
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  10289 taaggtaagggggttagaattcataataatcattattgcaaattttcaattctttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 10190  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  10189 tgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagagtatgaa 10090  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10089 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 10011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4913 - 4663
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4913 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 4816  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| ||    
T  4815 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaaa 4718  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4717 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtt 4663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9527 - 9277
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9527 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 9430  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| ||    
T  9429 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaaa 9332  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9331 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtt 9277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7272
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7522 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 7425  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| ||    
T  7424 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaaa 7327  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7326 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtt 7272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 370 - 95
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 271  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||     
T  270 tgatgaaattcgtgctctaat---gatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattgcatgttcaaa--gtatgag 176  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  175 aaattggtatatgttgaaaatatgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 95  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 132144 - 132423
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  132144 taaggtaagggggttggaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttctatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 132243  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg- 250  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||     
T  132244 atgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattatatgttcaaa--gtatga 132341  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  132342 aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 132423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 88631 - 88349
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  88631 taataaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgtcca 88532  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||  |||    
T  88531 taaatgatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaaatgttgttagttgaattacatgttcaaa--gta 88434  T
Q  249 tg-aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  88433 tgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgatcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 88349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12041 - 11761
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12041 taaggtaaggtggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtcaattgattaattgttcata 11943  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |    
T  11942 aatgatgaatttcgtgctctaattatgatgacatgtttcaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 11843  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  11842 aaaa-agatatgagttgaaaacatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaat 11761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16253 - 16022
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaatt-gttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16253 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 16155  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |      
T  16154 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 16055  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattg 283  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  16054 gaaaat-gatatgagttgaaaatatgctccattg 16022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25784 - 25553
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaatt-gttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25784 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 25686  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |      
T  25685 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgttttaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 25586  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattg 283  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  25585 gaaaat-gatatgagttgaaaatatgctccattg 25553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 61159 - 60880
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  61159 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 61060  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg- 250  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||     
T  61059 atgatgaaattcgtgctctaattatgataacatgtttagatgtatgatgttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatga 60962  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||| | ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  60961 aaaatgggtatgtgttaaaaatatacttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 60880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 89 - 330
Target Start/End: Original strand, 70552 - 70793
Alignment:
Q  89 ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  70552 ttgtaattttcaattatttgtaagaaaagtgcttatttggatgagttgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 70651  T
Q  189 agatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtg 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70652 agatgtatgaagttaatgaataattgatttattgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaaaagtaggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtg 70749  T
Q  287 aattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatca 330  Q
    |||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  70750 aattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatca 70793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 193
Target Start/End: Original strand, 79785 - 79925
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  79785 taagctaagggggttagaattgatcataatcactcattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 79884  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatg 193  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  79885 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatg 79925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 24623 - 24901
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||      
T  24623 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgaaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgtccataaa 24722  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  24723 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttattgataattaaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 24820  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24821 aaatgggtatgtgttgaacatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 24901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 95109 - 95049
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  95109 tatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 95049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7922 - 7643
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  7922 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 7823  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgac-atgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg- 250  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||     
T  7822 tgatgaaattcatgatctaattatgatgcctatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatga 7725  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | || || |||||||||||||||||    
T  7724 aaaatgggtatatgatgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaat 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11741
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||      
T  11464 taaggtatgggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaagtgtttaattgt-tgaattgattaattgttcataaa 11562  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||  ||||| |    
T  11563 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaa--gtatgaa 11660  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  11661 aaatgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaat 11741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 112441 - 112718
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||      
T  112441 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtacttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 112539  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||     
T  112540 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaacaattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 112637  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  112638 aaattggtatatgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 112718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 102815 - 103095
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  102815 taaggtaaggggtttataattcatcataatcattttttgtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 102912  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |     
T  102913 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtttttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 103012  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     |||| | | |||||| ||  |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  103013 agaaagt-ggtatatggtg-gaatatgctaaatttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataacattcatgttcaat 103095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 109737 - 109666
Alignment:
Q  259 tatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatca 330  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  109737 tatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattttgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatca 109666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 85683 - 85406
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      
T  85683 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtttataaa 85585  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||     
T  85584 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 85487  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  85486 aaattggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 85406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 159651 - 159373
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  159651 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtacgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 159553  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  159552 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatggcattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 159453  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  159452 aat-gatatgagttgaaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 159373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38650 - 38372
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  38650 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 38551  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| | |   |    
T  38550 tgatgaaatacgcgctctaattatgatgacatgtttagatttatgaatttatgaataattgaatttttgttggttgaattacatgttcaaag-gaagaga 38452  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38451 aatgggtatatgttgaaaatatgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 38372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 330
Target Start/End: Original strand, 117857 - 118134
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  117857 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 117955  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  117956 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atg 118053  T
Q  251 aaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatca 330  Q
    | || | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  118054 agaagttggtatatgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatca 118134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 109356 - 109635
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  109356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 109454  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||    
T  109455 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatg 109552  T
Q  251 a-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | |||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  109553 agaaattggtatatattgaaaatatgataaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 109635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 73 - 332
Target Start/End: Original strand, 252903 - 253162
Alignment:
Q  73 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 171  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| |     
T  252903 ttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtgcataaatgataaaattcgtgctttg 253002  T
Q  172 attgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaa 270  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||| |||| | ||||||||||||    
T  253003 attatgatgacatgtttggatgtatgaagttagggataattgaattgttgttagttgaattacattttcaaa--gtatgagaaattggtatatgttgaaa 253100  T
Q  271 atatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  253101 atatgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 253162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 54 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9339 - 9063
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt--caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| | ||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||     
T  9339 taaggtaagggggttagaatttatcataatcattattgcaattttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaatttttcataa 9241  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  9240 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atga 9143  T
Q  252 aaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatca 330  Q
     || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  9142 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatca 9063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 8
Alignment:
Q  15 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgat 65  T
Q  115 aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  64 aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctcta 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 70964 - 70687
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||      
T  70964 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgtaattttcagttatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaatagtttataaa 70866  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  70865 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatt-catgttcaaagtatgagaa 70767  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  70766 aatgga-atatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 70687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31352 - 31122
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31352 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattatttgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgt 31254  T
Q  195 atgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaa-ttatg 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  31253 atgaagttatggataattgaattgtggttagttgaatt-catgttcaaagtataagaaaat-ggtatatgttgaaaatatgctcaatttgttaagttatg 31156  T
Q  294 ctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31155 -tttgtagttgttgaattgtgataagtttcatgat 31122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Original strand, 97088 - 97347
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgata-agtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||||  ||| | ||||||||||    
T  97088 taatgaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgatttagtgtttaattgagtgagt-gattaattgt 97185  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| || || ||    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  97186 tcatagttgttaagattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcataaaattggtgataattgaattgttgttggtggaattgcatgttcaaagt 97285  T
Q  246 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttga 308  Q
     | ||||| | | ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  97286 atgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttggtgttga 97347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21862 - 21590
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  21862 taaggtaagggggttataattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaaaggcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 21764  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  21763 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 21665  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  21664 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 21590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31561 - 31285
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  31561 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 31463  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  31462 tgatgaaattcatgatctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattaaatgttcaaagtatgagaa 31364  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31363 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaat 31285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Original strand, 47445 - 47554
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  47445 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 47543  T
Q  153 tgatgaaattc 163  Q
    |||||||||||    
T  47544 tgatgaaattc 47554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 208
Target Start/End: Original strand, 2961 - 3115
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2961 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataaatgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 3060  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3061 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 3115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 46521 - 46239
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46521 taattaaggtaagagggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 46423  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttg-aattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||| |    
T  46422 taaatgatgaaattcgtactctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtat 46323  T
Q  248 atgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     ||||||  |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  46322 gtgaaaagtgggttatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaat 46239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41010 - 40732
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  41010 taaggtaagggggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaatagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 40912  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttg-aattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||| | |||    
T  40911 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtatgtga 40812  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||  |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  40811 aaagtgggttatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaat 40732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 80267 - 80188
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  80267 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 80188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 79998 - 79942
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  79998 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 79942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34014 - 33736
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  34014 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattact-gtatgattaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcgtaa 33916  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  33915 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatga 33818  T
Q  252 -aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
     |||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| || || |||||||||||||||||    
T  33817 gaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaat 33736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 471 - 749
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  471 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcatttattgctatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 568  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |  |    
T  569 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaaattatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgag 668  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  669 aaaat-ggtatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2263 - 1990
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgat 156  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  2263 gtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgctcataaatgat 2165  T
Q  157 gaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaata 256  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||     
T  2164 gaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgcgaaaat- 2066  T
Q  257 gatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  2065 ggtatatgatgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatg-tgttgttgatttgttataagattcatgatcaat 1990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 115 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5231 - 5015
Alignment:
Q  115 aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattga 214  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5231 aagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattga 5132  T
Q  215 attgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgt 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5131 attgttgttagttgaattacatgttcaca--gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgt 5034  T
Q  314 ggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | |||||||||||||||||    
T  5033 gataagtttcatgatcaat 5015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6251 - 6014
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  6251 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgacgacatgtttgaatgt 6153  T
Q  195 atgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatg 293  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6152 atgaagttatggataattggattgttgttggtagaatttcatgttcaaagtatgagaaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatg 6053  T
Q  294 ctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || ||| |||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  6052 ctatgtggttgttgaattgtgataatattcatgttcaat 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 304 - 383
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  304 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatca 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 572 - 632
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  572 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 146848 - 146675
Alignment:
Q  158 aaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aaaata 256  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||     
T  146848 aaattcatgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgtataattgaactgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaaaaatg 146751  T
Q  257 gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  146750 ggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 146675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 85818 - 85683
Alignment:
Q  118 tgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt 217  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||    |||||||||||    
T  85818 tgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttta-atgcatgaaattggtgataattgaatt 85721  T
Q  218 gttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaat 255  Q
    |||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  85720 gttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 85683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53703 - 53506
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  53703 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 53606  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || |  ||||| |||||||||  |||||| ||||||  ||| ||||  ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  53605 tcatagttgttagaattcatgctctaataatgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 53506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Original strand, 76699 - 77020
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |    
T  76699 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-g 76797  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    |||||| |||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |    
T  76798 tatgattaagtacttaattgagt-aattgagtaattgttcatagatgatgaaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttga 76896  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  76897 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgttcaaattgttgaattatgctatgttgttgtt 76994  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || ||||||| || |||||| |||||    
T  76995 gaattgtggtgagattcatgttcaat 77020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 33622 - 33901
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  33622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 33719  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||||    
T  33720 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaa--gtat 33817  T
Q  250 gaa-aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| ||  | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  33818 gaagaagtgttatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 33901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3671 - 3393
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  3671 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 3574  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  3573 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttaatgttcaaagtatgag 3474  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  3473 aaagt-ggtatatg-tgaaaatatgctcaattggtccaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgatcaat 3393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 30497 - 30418
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30497 agaatcatagaagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatca 30418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8157 - 7927
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  8157 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 8060  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
    | || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  8059 tttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 7960  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt 285  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7959 aaagt-ggtatatg-tgaaaatatgctcaattggt 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5808
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 5808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6014
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 6204 - 6264
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  6204 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 6264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 197107 - 197340
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  197107 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattg-tgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 197205  T
Q  111 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaata 209  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  || |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| || |  |||    
T  197206 tgattaagtgcttaattggat-aagtgattaattgttcttagatgttgaatttcgggctctaattatgatgatatgtttgaatgtatgaaattgttgata 197304  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||    
T  197305 attgaattgttgttggtgaaattgcaagttcaaagt 197340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2795 - 2623
Alignment:
Q  135 tgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgt 234  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||||     
T  2795 tgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgc 2696  T
Q  235 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttga 308  Q
    ||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  2695 atgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgttgttga 2623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Original strand, 617 - 691
Alignment:
Q  258 atatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  617 atatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35873 - 35552
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||| || |    
T  35873 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtt-g 35775  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    ||||| || |||||||||||  | ||  ||||||||||||| |  |  |  ||||||||||| |||  |||||| ||||||  ||| ||||||||||  |    
T  35774 tatgaataggtgcttaattgagtaaaa-gattaattgttcaaagttcttataattcgtgctccaatcatgatgatatgtttgaatgcatgaagttattga 35676  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  35675 taattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatactcaaattgttgatttatgctatgttgttgtt 35578  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||  |||||||||  ||||| |||||    
T  35577 gaaatgtggtaagagtcatgttcaat 35552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8363 - 8170
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8363 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttaatgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttcat 8266  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  8265 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagt 8170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32373 - 32277
Alignment:
Q  235 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  32373 atgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgt-ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 32277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 332
Target Start/End: Original strand, 41930 - 42026
Alignment:
Q  235 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  41930 atgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgt-ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 42026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 69843 - 69531
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aa 116  Q
    ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  69843 aaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaagataagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaa 69745  T
Q  117 gtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaat 216  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||    ||||||||||    
T  69744 gtgcttaattg-agaaagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaaattggttataattgaat 69646  T
Q  217 tgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtgg 315  Q
    ||||||  ||  ||||| ||||| ||||| | ||||| | | ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| |||||     
T  69645 tgttgtaggtgaaattgcatgtttaaagtatgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtga 69548  T
Q  316 taagtttcatgatcaat 332  Q
    | || |||||| |||||    
T  69547 tgagattcatgttcaat 69531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 316
Target Start/End: Original strand, 244923 - 244967
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggt 316  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  244923 tatgctcaattgatgaattatgacatgttgttgttgatttgtggt 244967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 1440 - 1611
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1440 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 1537  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 223  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  1538 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 8585 - 8756
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8585 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 8682  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 223  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  8683 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 8756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 31132 - 31211
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  31132 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatca 31211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 31401 - 31461
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  31401 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 31461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41712 - 41633
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  41712 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatca 41633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41443 - 41383
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  41443 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 41383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Original strand, 89760 - 89952
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  89760 taaggtaagggggttagaattcatcataatctttttagtgtaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttcata 89857  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
      || | |||||||||||| || | |||||| ||||||  ||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  89858 gatg-ttaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatg-atacttgaattgttgtt-gtgaatttgtatgttcaaagtgt 89952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 6885 - 7112
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taa 116  Q
    ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| |||  |||||||||  | |  |||||||| |||    
T  6885 aaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaattataatcattttaatgtaatttttcaatcgttgtatgaataa 6984  T
Q  117 gtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaat 216  Q
    |||||||||||  | ||| ||||  |||||||||  ||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||    
T  6985 gtgcttaattgagtaaat-gatttgttgttcataattgtcaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaat 7083  T
Q  217 tgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  7084 tgttgttagtgaaatttaatgttcaaagt 7112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 269
Target Start/End: Original strand, 1242 - 1458
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1242 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 1339  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| || || ||    ||||||| ||||||||| ||  ||||| ||| ||||||| | |    
T  1340 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgt 1439  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  1440 gaaaat-gatatatgatgaa 1458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 269
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9713
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9497 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 9594  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| || || ||    ||||||| ||||||||| ||  ||||| ||| ||||||| | |    
T  9595 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgt 9694  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  9695 gaaaat-gatatatgatgaa 9713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 308
Target Start/End: Original strand, 2211 - 2465
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||    
T  2211 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgcaatttttaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattaatcata 2308  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |  |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |    
T  2309 attattagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 2408  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttga 308  Q
    ||| | || |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2409 aaagt-gacatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttga 2465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 332
Target Start/End: Original strand, 89584 - 89642
Alignment:
Q  274 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  89584 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaat 89642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 79891 - 79756
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  79891 taaggtaagggg-ttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttcat 79795  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
    |  || | |||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  79794 agatgctaaaattcgtgcactaactatgatgatatgttt 79756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42754 - 42678
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42754 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatca 42678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 17525 - 17585
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17525 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 17585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 28781 - 28623
Alignment:
Q  160 attcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagat 259  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |  |||| | |||    
T  28781 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaagtatgagaaagt-gat 28683  T
Q  260 atatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaag 319  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  28682 atatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatggtatgttgttgttgaattgtagtaag 28623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Original strand, 22323 - 22518
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22323 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgttattttttaatta-ttgtatgaataagtgattaattggatg-attgattgattgttcat 22420  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    |  || | ||||||||||||||| |  ||| | ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  22421 agatgttaaaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtgt 22518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 43651 - 43908
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||  ||||    
T  43651 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatt-gttgt 43749  T
Q  110 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||  || | |||||  |||||||||| |||||  ||||||  ||| ||||| ||    ||    
T  43750 atgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaattaatgctctaattatgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgat 43848  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  43849 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaaggatatgaaagt-gatatatgttgaa 43908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 223
Target Start/End: Original strand, 23562 - 23737
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| | |  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  23562 taattaagataagggggttagaattcaatcataatgattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgtt 23660  T
Q  147 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 223  Q
    ||||  || ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||  ||  ||||| || |  |||||||||||||||||    
T  23661 catagttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgtatacatgaaatttttgataattgaattgttgtt 23737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Original strand, 70201 - 70298
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || || |||||||||||||||||||    
T  70201 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttgtgaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaaatgtat-aattgattaattgttcata 70298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 55715 - 55655
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  55715 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 55655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Original strand, 104477 - 104653
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||| | || ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||  |||||    
T  104477 taggagctaaagtgaagcttgggctaagaatttgtgctaattaaggtaagtgggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaatt-gttgta 104575  T
Q  111 tg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
    || |||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||  || | |||||| |||||||| | |||||| ||||||    
T  104576 tgaataattgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcatagatgttaaaattcatgctctaactatgatgatatgttt 104653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Original strand, 93728 - 93860
Alignment:
Q  113 ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgat-gaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataat 211  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||| |||||| |||| |  ||| |||||||| |  |||||    
T  93728 ataagtgcttaattgggtaaatt-attaattgttcataactgttagaaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataat 93826  T
Q  212 tgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||||| ||||||||   ||||  |||||||||||    
T  93827 tgaatggttgttagagaaatttcatgttcaaagt 93860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31414 - 31244
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  31414 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgt 31316  T
Q  110 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatga 181  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| ||||||    
T  31315 atgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatga 31244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6907 - 6735
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaataga 258  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||    
T  6907 aattcgtgctataattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-ga 6809  T
Q  259 tatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  6808 tatatgttg-aattttgctcaaattgttgaattatgctatgctattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaat 6735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11014 - 10879
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  11014 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtataattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aaataattaattgttcata 10917  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
      || |  |||||||||||||  | |||||| ||||||    
T  10916 gatgttataattcgtgctctatctatgatgatatgttt 10879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 6664 - 6724
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  6664 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaat 6724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 1099 - 1159
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  1099 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Original strand, 1371 - 1435
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1371 aaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatca 1435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 13507 - 13567
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13507 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 13567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 21481 - 21541
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21481 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 21541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15083 - 15023
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15083 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 15023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 855 - 1059
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||  || || |||||| ||||||||    
T  855 taaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattaaat-aagtgattatttgttcat 953  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  954 agttgttaaaattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 1053  T
Q  250 gaaaat 255  Q
    ||||||    
T  1054 gaaaat 1059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 332
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10147
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10094 aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 10147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 9628 - 9688
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9628 tatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 9688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 442
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| | |||||||||||||||    
T  499 taggagctaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataactgaggtaagggggttag 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Original strand, 12641 - 12697
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  12641 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 12697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 186647 - 186706
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||| || ||||||||||||||    
T  186647 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaat 186706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 193609 - 193668
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||| || ||||||||||||||    
T  193609 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaat 193668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University