View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13402_high_5 (Length: 448)

Name: NF13402_high_5
Description: NF13402
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13402_high_5
NF13402_high_5
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (1-427)||(12690-13116)
scaffold0467 (1-406)||(1-406)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (1-430)||(26915-27344)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (1-430)||(20649151-20649580)
chr8 (1-430)||(21847133-21847562)
chr8 (13-295)||(16415653-16415935)
chr8 (8-430)||(21193348-21193770)
[»] chr3 (12 HSPs)
chr3 (9-430)||(6149445-6149866)
chr3 (1-422)||(15943195-15943616)
chr3 (1-430)||(17201755-17202184)
chr3 (1-431)||(30150476-30150906)
chr3 (90-430)||(25768423-25768763)
chr3 (1-404)||(13963973-13964376)
chr3 (1-335)||(8271086-8271420)
chr3 (1-400)||(22149368-22149767)
chr3 (1-422)||(17321194-17321615)
chr3 (81-146)||(22259970-22260035)
chr3 (81-146)||(22268464-22268529)
chr3 (386-430)||(5224953-5224997)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (1-430)||(1660341-1660770)
chr6 (1-430)||(16103659-16104088)
chr6 (9-430)||(21412024-21412445)
chr6 (181-430)||(18421098-18421347)
chr6 (140-430)||(17786689-17786980)
chr6 (1-431)||(16378870-16379300)
chr6 (1-404)||(16646493-16646896)
chr6 (1-430)||(22364862-22365291)
chr6 (1-335)||(14149752-14150085)
chr6 (1-164)||(19982365-19982528)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (1-430)||(110-539)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-430)||(27295-27724)
scaffold0008 (1-430)||(130842-131274)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (21-430)||(3250-3659)
scaffold0462 (1-37)||(3222-3258)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-430)||(25698-26126)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-427)||(20928559-20928985)
chr1 (1-422)||(20528558-20528979)
chr1 (1-431)||(20827816-20828246)
chr1 (1-422)||(22128871-22129293)
chr1 (8-430)||(41214286-41214708)
chr1 (1-103)||(23312571-23312673)
chr1 (7-189)||(20172642-20172824)
chr1 (86-146)||(21200280-21200340)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (1-430)||(4727-5155)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-422)||(315-736)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (21-430)||(15000164-15000572)
chr4 (1-431)||(15289510-15289940)
chr4 (88-383)||(18272663-18272958)
chr4 (168-237)||(28266083-28266152)
chr4 (1-173)||(12339484-12339656)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (1-430)||(22281226-22281655)
chr2 (1-164)||(25131580-25131743)
chr2 (270-422)||(25131850-25132002)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (29-430)||(8745-9146)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (1-430)||(6213-6645)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (1-430)||(3282-3711)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (1-430)||(23509079-23509508)
chr5 (1-431)||(24584604-24585034)
chr5 (1-422)||(21828211-21828631)
chr5 (118-189)||(33314011-33314082)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-422)||(97046-97465)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (18-427)||(7795-8204)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-430)||(8676-9105)
scaffold0021 (1-304)||(91021-91324)
scaffold0021 (1-404)||(20258-20661)
scaffold0021 (1-404)||(29834-30237)
[»] scaffold0465 (2 HSPs)
scaffold0465 (1-287)||(12124-12410)
scaffold0465 (328-430)||(12015-12117)
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (1-431)||(27104135-27104565)
chr7 (1-431)||(7827379-7827809)
chr7 (1-431)||(27173760-27174190)
chr7 (1-197)||(4443402-4443598)
chr7 (8-404)||(13459497-13459893)
chr7 (345-430)||(16575135-16575220)
chr7 (345-430)||(16590442-16590527)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-366)||(4226-4591)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-217)||(16420-16636)
scaffold0162 (355-430)||(16662-16737)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-172)||(24482-24653)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (244-430)||(3172-3358)
scaffold0302 (1-41)||(1730-1770)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (260-430)||(73081-73251)
scaffold0011 (260-430)||(77462-77632)
scaffold0011 (1-136)||(73284-73419)
scaffold0011 (1-136)||(77665-77800)
scaffold0011 (1-103)||(182509-182611)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-335)||(25152-25485)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-422)||(35537-35957)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (1-197)||(32464-32659)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (1-422)||(5377-5798)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (1-97)||(35595-35691)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (1-153)||(4009-4161)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (88-197)||(2182-2291)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (8-189)||(77947-78128)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-164)||(49178-49341)


Alignment Details
Target: scaffold0467 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13116 - 12690
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13116 aacatacgacacttatgaaccaaagtatcaaaatctcggatctcctaaacacacatgtactgattgatatccggcctaagcccactctcaaacttcacac 13017  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13016 atttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgtttccttgttt 12917  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12916 cagattcagaaactcaatttccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccagttcaccacatcacct 12817  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12816 cccatctcaagtcttcctttggcattagcccaccagtgctctgcttcctcagctagcatatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtaacca 12717  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccct 427  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12716 tagctcggaaaatccgctccatcccct 12690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 406 - 1
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  406 aacatacgacacttatgaaccaaagtatcaaaatctcggatctcctaaacacacatgtactgattgatatccggcctaagcccactctcaaacttcacac 307  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  306 atttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgtttccttgttt 207  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  206 cagattcagaaactcaatttccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccagttcaccacatcacct 107  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  106 cccatctcaagtcttcctttggcattagcccaccagtgctctgcttcctcagctagcatatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtaacca 7  T
Q  401 tagctc 406  Q
    ||||||    
T  6 tagctc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Original strand, 26915 - 27344
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26915 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactctcaaacttcacac 27014  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27015 acttcgaaatcatagcatcctcaacattgatgtagggacaaaacctagaaagttcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgttt 27114  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27115 cagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtctttcgggaaataattcctcaagaattcaaacttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 27214  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27215 cccatctcaagtcttcctttggcattggtccaccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgctaatctgaccttctggtcatctcccgtaacca 27314  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27315 tagctcggaaaatccgctccatcccctgca 27344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20649580 - 20649151
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20649580 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgtacatacatttactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacac 20649481  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20649480 acttcgaaaccatagcatcttcaacattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgttt 20649381  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20649380 taaattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaactttgaacttcgcccaggtcacaacatcacct 20649281  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20649280 cccaactcaagtcttcctttggcattagtccacaagtgctctgcttcctcagcaagcatatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtcacca 20649181  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  20649180 tagctcgaaaaacccgctccatgccctgca 20649151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 21847562 - 21847133
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21847562 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcgaatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactctcaaacttcacac 21847463  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21847462 acttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcaccgcatactcggctaccgacatgatcccttgttt 21847363  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  21847362 cagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcacaacaccacct 21847263  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
     ||| ||||||||| || |||||||| |||||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||    
T  21847262 tccaactcaagtctgcccttggcattggtccaccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatcaccagtaacca 21847163  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21847162 tagcttggaaaatccgctccattccctgca 21847133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 295
Target Start/End: Original strand, 16415653 - 16415935
Alignment:
Q  13 ttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacactacgaaacca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16415653 ttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatcccctggacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaacca 16415752  T
Q  113 tagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttttagattcagaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16415753 tagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagttcctcaaacttcgccgcatattcggctacagacatgatccattgtttcagattcagaaa 16415852  T
Q  213 ctcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacat 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16415853 ctcaatctccttcttggtcctcaagtcttcggggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagccgaggtcaccacat 16415935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 21193770 - 21193348
Alignment:
Q  8 gacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacactacga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  21193770 gacacttatgcaccaaagtatcaaaatctcggatctcctgaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcaaacttcacacacttcga 21193671  T
Q  108 aaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttttagattc 207  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || |  |||    
T  21193670 aaccatcgcatcttcagcaatgatgtacggacaaaacctcgaaagcttctcgaacttcgccgcatactcggctacagagatgctcccttacttcaagttc 21193571  T
Q  208 agaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatct 307  Q
    |||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| || || ||  | ||||    
T  21193570 agaaacgctacctccttcctggtcctcaaatcttcagggaaatacttcctcaagaactcagctttgaacttcgcccaagtcacgacttccccaacaatct 21193471  T
Q  308 caagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcg 407  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |  ||  | |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |     
T  21193470 caagtcttcccttggcattggtccaccaatattcggcctcctcagcaagcatatgagtcgtcaatctgaccttctggtcatcactcgtcaccatagcaca 21193371  T
Q  408 gaaaatccgctccattccctgca 430  Q
     || |||| |||||| |||||||    
T  21193370 aaatatcctctccatgccctgca 21193348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 9 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 6149866 - 6149445
Alignment:
Q  9 acacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacactacgaa 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||    
T  6149866 acactaatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatattcggcctaagcccactctcaaacttcacatacttcaaa 6149767  T
Q  109 accatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttttagattca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  6149766 accatagcatcctcagcattgatgtaggggcaaaacctcgaaagttcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatgcttccttgtttcagattca 6149667  T
Q  209 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6149666 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttaaacttcgcccaggtcaccacatcacctcccatctc 6149567  T
Q  309 aagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcgg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  6149566 aagtcttcctttggcattagtccaccagtgctctgcttcctcagcaagcatatgagtcgctagcctgaccttctggtcacctcctgtcaccatagctcgg 6149467  T
Q  409 aaaatccgctccattccctgca 430  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  6149466 aaaatccgctccataccctgca 6149445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15943616 - 15943195
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15943616 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacgc 15943517  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||    
T  15943516 acttcgaaatcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggccactgacaagattccttgctt 15943417  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15943416 tagattcagaaactcaatctcattcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 15943317  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
     ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||| ||  | |||||||||||| | ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  15943316 tccaactcaagccttcccttggcattggtccaccagtgctccgcttcctcagtcaacatatgagtcgccagtctaaccttttggtcatctcctgtaacca 15943217  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccat 422  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  15943216 tagctcggaaaatctgctccat 15943195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Original strand, 17201755 - 17202184
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17201755 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaaatctaggatctcctaaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcaaacttcacac 17201854  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||| ||||||| ||    
T  17201855 acttggaaaccatcgcatcctcagcattgatgtacggacaaaacctcaaaagctcctcaaacttcgccacatacacagctatggacatgctcccttgctt 17201954  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |  ||||| ||||| |  |||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| || || ||     
T  17201955 caagttcaggaactccacttccttcctggtcctcaaatcttcaggaaaatacttcctcaagaactcagctttgaactttgcccaagtcacaacttctcca 17202054  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||| | | |||  | |||| ||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||| | ||||||||    
T  17202055 ccaatctcaagtcttcccttagcattagtccactaatactcggcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgttcatcactcgtcacca 17202154  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    |||| || || |||| |||||| |||||||    
T  17202155 tagcacgaaatatcctctccatgccctgca 17202184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 30150476 - 30150906
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30150476 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactttcaaacttcacac 30150575  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||    
T  30150576 acttggaaaccatagcatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgctt 30150675  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||| ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || ||     
T  30150676 caaattcaggaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctcca 30150775  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||  | |||| ||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  30150776 ccaatctcaagtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcacca 30150875  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgcaa 431  Q
    |||| || || |||| |||||| || |||||    
T  30150876 tagcacgaaagatcctctccatgccttgcaa 30150906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 90 - 430
Target Start/End: Original strand, 25768423 - 25768763
Alignment:
Q  90 aaacttcacacactacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatg 189  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||   |||||||| |||    
T  25768423 aaacttcacacactttgaaaccatagcatcttcagcattgatgtacggacaaaaccttgaaagctcctcaaacttttctgcatacgtagctacagatatg 25768522  T
Q  190 atcccttgttttagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtca 289  Q
     | |||||||| |  ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  25768523 cttccttgtttcaagttcagaaactcaacctccttcctggtcctcaaatcttcagggaaatacttcctcaagaactcagctttgaacttcgcccaggtca 25768622  T
Q  290 ccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatc 389  Q
    | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  25768623 caacttctcctcccaactcaagtcttcctttggcattagtccaccaatgttcggcctcctcagcaagcatatgagtcgccaatctgaccttttggtcatc 25768722  T
Q  390 ccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
     | |||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||    
T  25768723 actcgtcaccatagcacggaatatcctctctatgccctgca 25768763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 13964376 - 13963973
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13964376 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactctcaaacttcacac 13964277  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||    
T  13964276 acttggaaaccatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttgctt 13964177  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||| ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || ||| | |||||| | | ||| ||||| || || ||     
T  13964176 caaattcaggaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagctttgaaccttgtccaagtcacaacctctcca 13964077  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
     | |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||  | |||| | ||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  13964076 tcaatctcaagtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcaacaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcacca 13963977  T
Q  401 tagc 404  Q
    ||||    
T  13963976 tagc 13963973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8271420 - 8271086
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8271420 aacatacgacacttattcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactttcaaacttcacac 8271321  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||    
T  8271320 actttgaaaccatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttgctt 8271221  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||| ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || ||     
T  8271220 caaattcaggaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctcca 8271121  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccacca 335  Q
    || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  8271120 ccaatctcaagtcttcccttagcattggtccacca 8271086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22149767 - 22149368
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| |||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22149767 aacatatgacacttgtgcaccaaagtgtcaaaatcacggatctcttgcacacacatgtactgatagacatctagccaaagcccactctcaaacttcacac 22149668  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  || ||||| |||| |||  ||||||||||   ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||    
T  22149667 acttggacaccattgcattctcgacattgatgtacagacaaaaccttgcaaactcttcaaacttcgccgcatactcggccacagacatacttccttgctt 22149568  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |  || |  || || | | ||||| | |||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||| ||  |||||||| | ||||| |||||||| || ||     
T  22149567 caagtttaagaattctaccaccttccttgtcctcaaatcttccgaaaaatacttcctcaagaactcggccttgaaccttgcccaagtcaccacctccccc 22149468  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| | |||| ||||||||||||||| || |  || |||||||||||||| || |||||||    
T  22149467 tccatctcaagtcttcctttggcattagtccactaatactctgcctcctcagcaagcatatgagtagccaacctaaccttctggtcatcgccagtcacca 22149368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17321615 - 17321194
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17321615 aacatacgacacttatgcaccaaggtatcaaactctcgaatctcctgaacacacatatactgatagatatccggcctaagtccactttcaaatttcacac 17321516  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  || ||||| ||||||||| |||| ||||| |   |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||| ||||||  |     
T  17321515 acttggacaccatcgcatcctcaacattaatgtacgagaaaaacctcgaaagctcttcaaactttgctgcatactcagccacggacatgctcccttactg 17321416  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |  ||||  ||||| |  |||||  | || ||||| || || || ||  |||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||| || || ||     
T  17321415 caagttcaagaactccacttcctttctagttctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcaaccttgaaccttgcccaagtcacaacctctcca 17321316  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| | |||  | |||||||||||||| ||  | || |  ||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  17321315 cctatctcgagtctccccttagcattcgtccaccaatactcagcctccttagcaagcatgtggttagccaacctgaccttctgatcatcactagtcacca 17321216  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccat 422  Q
    |||| ||||| |||| ||||||    
T  17321215 tagcacggaagatcctctccat 17321194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 146
Target Start/End: Original strand, 22259970 - 22260035
Alignment:
Q  81 tccactctcaaacttcacacactacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacct 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||    
T  22259970 tccactctcaaacttaacacacttggacaccatagcatcttcaacattgatataaggacaaaacct 22260035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22268529 - 22268464
Alignment:
Q  81 tccactctcaaacttcacacactacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacct 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||    
T  22268529 tccactctcaaacttaacacacttggacaccatagcatcttcaacattgatataaggacaaaacct 22268464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 5224953 - 5224997
Alignment:
Q  386 catcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5224953 catctcccgtaaccatagcttggaaaatccgctccatcccctgca 5224997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 1660770 - 1660341
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1660770 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgaccggcctaagcccactctcaaacttcacac 1660671  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1660670 acttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagttcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgttt 1660571  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1660570 cagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcaccg 1660471  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    |||| |||||| || || ||||||||  ||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1660470 cccaactcaagcctgcccttggcattgatccaccagtactctgcttcctcagcaaacatatgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtaacca 1660371  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1660370 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 1660341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Original strand, 16103659 - 16104088
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16103659 aacatacgacacttttgcaccaaagtatgaaagtctcggatctcctagacgcacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacac 16103758  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||    
T  16103759 acttcgaaaccatagcatcttcagcattgatgtagggaaaaaacctggaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgcttccttgatt 16103858  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103859 caaattcagaaactcaacctccttcttagtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcagctttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 16103958  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16103959 cccatttcaagtcttcctttggcattagtccaccagtgctccgcttcctcagcaagcacatgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtcacca 16104058  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16104059 tagcttggaaaatccgctccataccctgca 16104088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 21412445 - 21412024
Alignment:
Q  9 acacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacactacgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21412445 acacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcaaacttcacacacttcgaa 21412346  T
Q  109 accatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttttagattca 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || || || || ||||    
T  21412345 accatagcatcttcagcattgatgtacggacaaaacttcgaaagctcctcaaacttcgcctcatactcggctacagacatgcttccctgcttcaggttca 21412246  T
Q  209 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctc 308  Q
    |||| || | ||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  21412245 gaaattccacctccttcctagttctcaaatcttcagggaaatacttccttaagaattctgctttgaacttcgcccaggtcacaacttctcctcccatctc 21412146  T
Q  309 aagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcgg 408  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| | |||  | |||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  21412145 aaatcttcctttgacattagtccaccagtactcagcctcctcagcaagcatatgagtcgccaatctggccttttggtcatctcccgtcaccatagcacga 21412046  T
Q  409 aaaatccgctccattccctgca 430  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  21412045 aatatccgctccatgccctgca 21412024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 181 - 430
Target Start/End: Original strand, 18421098 - 18421347
Alignment:
Q  181 acagacatgatcccttgttttagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttag 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18421098 acagacatgatcccttgttatagattcagaaactcaatctccttgttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaacctggaacttag 18421197  T
Q  281 cccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgacctt 380  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18421198 cccaggtcacaacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccagtgctctgcttccttagcaagcatatgagtcgctagtctgacctt 18421297  T
Q  381 ctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18421298 ctggtcatccctcgtcaccatagatcggaaaatccgctccattccctgca 18421347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 140 - 430
Target Start/End: Original strand, 17786689 - 17786980
Alignment:
Q  140 aaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttttagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtc 239  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17786689 aaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatattcggctacagacatgcttccttgtttcagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtc 17786788  T
Q  240 ttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgc 339  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17786789 ttcagggaaatatttcctcaagaattcgaccttgaacttagcctaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccagtgc 17786888  T
Q  340 tctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctga-ccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
     || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17786889 ccttcttcctcagctagcatatgagtcgctagtctgagccttctggtcatttcccgtaaccatagctcggaaaatccgttccataccctgca 17786980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16379300 - 16378870
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16379300 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactttcaaacttcacac 16379201  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||    
T  16379200 acttggaaaccatagcatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgctt 16379101  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||| ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || ||     
T  16379100 caaattcaggaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctcca 16379001  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||  | |||| ||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  16379000 ccaatctcaagtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcacca 16378901  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgcaa 431  Q
    |||| || || |||| |||||| || |||||    
T  16378900 tagcacgaaagatcctctccatgccttgcaa 16378870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16646896 - 16646493
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16646896 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctccttaacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacac 16646797  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||    
T  16646796 acttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttgctt 16646697  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||| ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || |||  ||||||| | | ||| ||||| ||  | ||     
T  16646696 caaattcaggaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagtcttgaacgttgtccaagtcacaacccctcca 16646597  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
     | |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||  | |||| ||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  16646596 tcaatctcaagtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcacca 16646497  T
Q  401 tagc 404  Q
    ||||    
T  16646496 tagc 16646493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22365291 - 22364862
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22365291 aacatacgacacttatacaccaaagtatcaaaatctcggatctcctgaacacacatatactgatagatatccggcctaagctcactttcaaacttcacac 22365192  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |     
T  22365191 acttcgaaaccattgcatcttcaacattgatgtatggaaaaaatctcgaaagctcttcaaacttcgccgtatactcagctacagacatgctcccttgcta 22365092  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |  ||||  ||||| |  |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||     
T  22365091 caagttcaagaactctacttccttcctggtcctcaaaccttcagggaaatacttcctcaagaactcaactttgaactttgcccaagtcacaacttctcca 22364992  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || |||||||||||||| || | |||||||||||| | |||  | |||| ||||||||| |||||  | |  |||||||||| |||||| |  |||||||    
T  22364991 ccaatctcaagtcttcccttagaattagtccaccaatactcggcctcctcagcaagcatgtgagtaaccaacctgaccttctagtcatcacttgtcacca 22364892  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    |||| ||||| |||| ||| || |||||||    
T  22364891 tagcacggaatatcctctctatgccctgca 22364862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 14149752 - 14150085
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || ||| | |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  14149752 aacatacgacactgatgcac-aaggtatcaaaatctcggatctcttgaacacacatatacagatagaaatccagcctaagcccactttcaaatttcacac 14149850  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||    
T  14149851 acttggacaccatcgcatcctcagcattgatgtacggacaaaacctcgacagctcctcaaacatcgccgcatactcagccacggacatactcccttgctt 14149950  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |  ||||  ||||| | ||||||| | |||||||| || ||  | ||  |||||||||| || ||   ||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  14149951 caagttcaagaactccacctccttcctagtcctcaaatcctctagaaagtacttcctcaaaaactcggtcttgaacttagcccaagtcacaacctctcca 14150050  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccacca 335  Q
    || ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  14150051 ccaatctcaagttttcccttagcattagtccacca 14150085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19982528 - 19982365
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| || |||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | || ||  |||||||| || || || ||||| |  | ||||||||||||| |||    
T  19982528 aacatacgatacttgtgtaccaaagtataaaaatctcggatctcatgaaaacgtatgtactgataaatctcgggcctcaaacgactctcaaacttctcac 19982429  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaactt 164  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||| || ||||||| ||||||    
T  19982428 attttgaaaccatagcatcctcaacattaatatacgaacaaaaccttgatagctccttaaactt 19982365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Original strand, 110 - 539
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  110 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactaatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcaaac 209  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210 acttcgagatcataccatcctcaacattgatgtagggacaaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 309  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  310 cagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttacgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccacgtcaccacataacct 409  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  410 cccaactcaagccttcctttggcattagtccatcagtgctctgcttcctcagctagcatatgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtaacca 509  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  510 tagctcggaaaatccgctccataccctgca 539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Original strand, 27295 - 27724
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27295 aacatacgacacttatgcaccaaagtataaaagtctaggatctactgaacacacatgtattgatagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 27394  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27395 acttcgaaaccacagcatcctcagcattgatatagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgttt 27494  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27495 cagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaatttgactttgaacttagcccaggtccccacatcacct 27594  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||     
T  27595 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccagtgctttgcttcctcagcaagcatataagtcgctagtctgaccttctggtcatctctcgtgaccg 27694  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27695 tagctcggaaaatccgctccatcccctgca 27724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 131274 - 130842
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  131274 aacatacgacacttatgcactaaagtatcaaagtctcggatctcttgaacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacac 131175  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagc---tcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttg 197  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  131174 acttcgaaatcatagcatcctcaacattaatgtagggacagaacctcgaaagtaattcctcgaacttcgccgcatactcggccacagacatgattccttg 131075  T
Q  198 ttttagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatca 297  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131074 cttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatca 130975  T
Q  298 cctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtca 397  Q
     ||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||| |||||| ||  | |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||  |||| |    
T  130974 tctcccaattcaagccttcccttggcattggtccactagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcgccagtctaaccttttggtcatcttccgtaa 130875  T
Q  398 ccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  130874 caatagctcagaaaatccgctccattccctgca 130842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 430
Target Start/End: Original strand, 3250 - 3659
Alignment:
Q  21 caaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacactacgaaaccatagcatcc 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  | ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  3250 caaagtctcaaagtctcggatctcttggatacacatatactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatatcatct 3349  T
Q  121 tcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttttagattcagaaactcaatct 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  3350 tcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcagaaactcaacct 3449  T
Q  221 ccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttccttt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3450 ccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaataattaagctttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttccttt 3549  T
Q  321 ggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctcc 420  Q
    ||||||||||||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3550 ggcattagtccactagttctctgcttcctcagcaagcatatgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtcaccatagctcggaaaatccgctcc 3649  T
Q  421 attccctgca 430  Q
    || |||||||    
T  3650 ataccctgca 3659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 3222 - 3258
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctc 37  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3222 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctc 3258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Original strand, 25698 - 26126
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25698 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctcaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacac 25797  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  25798 acttcgaaaccatagcatcttcagcattgatgtaaggacaaaacctcgaaagcttcttaaacttcgccgcatactcggctacaaacatgcttccttgttt 25897  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25898 cagattcagaaactcaacctccttcttagttctcaagtcttcagggaaatacttcc-caagaattcaactttgaacttagcccaagtcaccacattacct 25996  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  25997 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccagtgctctgcttcctcaacaagcatatgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcctgtcacca 26096  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26097 tagctcggaaaatccaccccataccctgca 26126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 20928559 - 20928985
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20928559 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacac 20928658  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  20928659 acttcgaaatcatagcatcctgagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctacagacatgattcctttctt 20928758  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20928759 cagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcggggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcatct 20928858  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| ||  | | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20928859 cccatctcaagccttcccttggcattggtccaccaatgctctgcttcctcagtcaacttatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtaacca 20928958  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccct 427  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20928959 tagctcggaaaatccgttccattccct 20928985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 20528558 - 20528979
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20528558 aacatacgatacttattcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacatatgtactggtagatctccggcctaagcccactctcaaacttcacac 20528657  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||    
T  20528658 acttcgaaatcatagcatcctcaacattgatgtagggaaaaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctatagacatgattccttactt 20528757  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20528758 cagattcagaaactcaatgtccttcttggtcctcaagtcttcggggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcatct 20528857  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||    
T  20528858 cccatctcaagccttcctttggcattagtccaccagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcgctagtctaaccttctggtcatcttccgtaacca 20528957  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccat 422  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  20528958 tagcttggaaaatccgctccat 20528979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20828246 - 20827816
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20828246 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactttcaaacttcacac 20828147  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||    
T  20828146 acttggaaaccatagcatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgctt 20828047  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||| ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || ||     
T  20828046 caaattcaggaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctcca 20827947  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||  | |||| ||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  20827946 ccaatctcaagtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcacca 20827847  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgcaa 431  Q
    |||| || || |||| |||||| || |||||    
T  20827846 tagcacgaaagatcctctccatgccttgcaa 20827816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22129293 - 22128871
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22129293 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctaggatctcctaaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcaaatttcacac 22129194  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||    
T  22129193 acttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgtacgaacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcaaccacggacatgctcccttgctt 22129094  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |  ||||  ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| || ||  |     
T  22129093 caagttcaagaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagctttgaacttagcccaagtcacaacctcttca 22128994  T
Q  301 cccatctcaag-tcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacc 399  Q
    || |||||||| | || | || |||||||||||||| | |||  | |||| ||||| ||||||||| || |  |||||||| || ||||| |  ||||||    
T  22128993 ccaatctcaagcttttgccttagcattagtccaccaatactcggcctcctcagcaatcatatgagtagccaacctgaccttttgatcatcactagtcacc 22128894  T
Q  400 atagctcggaaaatccgctccat 422  Q
    |||| ||| || |||| ||||||    
T  22128893 atagttcgaaagatcctctccat 22128871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 41214708 - 41214286
Alignment:
Q  8 gacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacactacga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||| |||    
T  41214708 gacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactgatagatatccagcctgagcccactttcgaacttcacacacttcga 41214609  T
Q  108 aaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttttagattc 207  Q
    ||||||  |||| |||||||| || || | |||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || |  |||    
T  41214608 aaccatcccatcttcagcattaatatacggacaaaacctcaaaagctcttcaaacatcgcagcatactcagccacagacatgctcccttgcttcaagttc 41214509  T
Q  208 agaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatct 307  Q
    |  ||||| |  |||||  | |||||||| || ||||| ||  |||||||||| || |||  ||||||| | ||||| ||||| || || || || ||||    
T  41214508 aagaactccacttcctttctagtcctcaaatcctcaggaaaggacttcctcaaaaactcagtcttgaaccttgcccaagtcacaacctctccaccgatct 41214409  T
Q  308 caagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcg 407  Q
    | ||||| || || ||||| ||| |||| | |||  | |||| ||||||||| || || || |  ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||    
T  41214408 cgagtctccccttagcattcgtctaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgggtagccaacctgaccttctgatcatcactagtcaccatagcacg 41214309  T
Q  408 gaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||    
T  41214308 gaagatcctctccattccttgca 41214286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23312673 - 23312571
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23312673 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaaatctcggatctcatgaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcaaacttcacac 23312574  T
Q  101 act 103  Q
    |||    
T  23312573 act 23312571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Original strand, 20172642 - 20172824
Alignment:
Q  7 tgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacactacg 106  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||||| |  || || || || || |||||||||| |||||||||||  |    
T  20172642 tgacacttgtgcatcaaagtatcaaaatctcagatctcatgaaagcagatgtactgatgaatctcgggactcagaccactctcaaccttcacacacttag 20172741  T
Q  107 aaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatg 189  Q
    | |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||  || | |||||||||||| || |||||||| || |||||||||    
T  20172742 acaccatagcatcctcaatattgatgaagggacaaaaccaggatatctcctcaaacttggcggcatactccgcaacagacatg 20172824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21200340 - 21200280
Alignment:
Q  86 tctcaaacttcacacactacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacct 146  Q
    ||||||||||||| || |  || ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21200340 tctcaaacttcacgcattttgataccatagtatcctccgcattgatgtagggacaaaacct 21200280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 5155 - 4727
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5155 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctggacacacatgtactgatagatatccggtctaagcccactctcaaacttcacac 5056  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5055 acttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggggcaaaacctcgaaggttcctcaaacttcgccgcatactcggcgaaagacatgatcccttgttt 4956  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955 cagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctctagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 4856  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||| || | |||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||    
T  4855 cccatctcaa-ccttcctttgacattagtcaactagtgctctgcttcctcagcaagcatttgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcctgtgacca 4757  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
     ||||| ||||||| | ||||| |||||||    
T  4756 cagctcagaaaatctgttccatgccctgca 4727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 736 - 315
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  736 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacac 637  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  636 acttcgaaaccatagcatcctccgcattgatgtagagacaaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgattccttgctt 537  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  536 cagatttagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacgtagcccaggtcaccacatcacct 437  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||| || | | ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  436 cccaactcaagccttcctttggcgtttgtccaccagtgctctgcttcttcagctagcatatgagttgcaagtttgaccttctagtcatctcccgtaacca 337  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccat 422  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  336 tagctcggaaaatccgctccat 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 430
Target Start/End: Original strand, 15000164 - 15000572
Alignment:
Q  21 caaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacactacgaaaccatagcatcc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15000164 caaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcc 15000263  T
Q  121 tcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttttagattcagaaactcaatct 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15000264 tcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagttcctcaaacttcgccgtatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacct 15000363  T
Q  221 ccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttccttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||    
T  15000364 ccttcttggtcctcaagtcttccggg-aatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcaccccccaactcaagcctgccctt 15000462  T
Q  321 ggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctcc 420  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15000463 ggcattggtccaccagtactctgcttcctcagctaacatatgagtcgctagtctgaccttctagtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctcc 15000562  T
Q  421 attccctgca 430  Q
    ||||||||||    
T  15000563 attccctgca 15000572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15289940 - 15289510
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15289940 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcagatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccattctcaaacttcacac 15289841  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||  ||    
T  15289840 acttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttactt 15289741  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||  ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || ||     
T  15289740 caaattcaagaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctcca 15289641  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |||| ||| | |||  | |||| ||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  15289640 ccaatctcaagtcttcccttagcattggtccgccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcacca 15289541  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgcaa 431  Q
    |||| || || |||| |||||| || |||||    
T  15289540 tagcacgaaagatcctctccatgccttgcaa 15289510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 383
Target Start/End: Original strand, 18272663 - 18272958
Alignment:
Q  88 tcaaacttcacacactacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagaca 187  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||    
T  18272663 tcaaacttcacacacttgggcaccattgcatcctcagcattaatgtacgaacaaaacctcgatagctcctcaaacgtcgccgcatactcagctatggaca 18272762  T
Q  188 tgatcccttgttttagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggt 287  Q
    || ||||||| || |  ||||  ||||| |  | |||| | ||||| || ||||| || ||| |||||||||| || ||| | |||||||| ||||| ||    
T  18272763 tgctcccttgcttcaagttcaagaactccactttcttcctagtccttaaatcttctggaaaatacttcctcaaaaactcagctttgaactttgcccaagt 18272862  T
Q  288 caccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctg 383  Q
    ||| || || || || |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||  | |||| ||||||||| || || || |  |||||||||||    
T  18272863 cacaacctctccaccaatctcaagtcttcccttagcattagtccaccaatactcggcctcctcagcaagcatgtgggtagcaaacctgaccttctg 18272958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28266152 - 28266083
Alignment:
Q  168 cgcatactcggctacagacatgatcccttgttttagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28266152 cgcatactcggctacagacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaag 28266083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12339656 - 12339484
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| || ||||| ||||||| ||||| || || | |||||||| |||||| || |||| ||  || || ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  12339656 aacatacgaaacttaggcaccaaggtatcgaaatccctgatctcctgaacacacatatactagtgaatctctggcctcaaaccactctcaaacttcacac 12339557  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcata 173  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  12339556 atttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaaggacaaaacctcgaaagtttctcgaacttagctgcata 12339484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Original strand, 22281226 - 22281655
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22281226 aacatacgacacttatgcaccaaagtataaaagtctcggatctcctgaacaaacatgtactgataaatatccggcctaagcccactctcaaacttcacac 22281325  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||    
T  22281326 acttcgaaatcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacttcgaaagttcctcgaacttcgctgcatactcgactacagacatgattccttactt 22281425  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22281426 cagattcaaaaactcaatctccttcttggtcctcaagtctttcgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggttaccacatcacct 22281525  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22281526 cccatctcaagccttcctttggcattggtccaccagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtaacca 22281625  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22281626 tagctcggaaaatccgctccatcccctgca 22281655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 25131580 - 25131743
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25131580 aacatacgacacttttgcaccaaggtatcaaaatctcgaatctcctgaacacacatatactgataaatatccggcctaagtccactttcaaatttcacac 25131679  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaactt 164  Q
    |||  || ||||| ||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25131680 actgtgacaccatcgcatcctcaacattaatgtacggacaaaacctcgaaagctcctcaaactt 25131743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 422
Target Start/End: Original strand, 25131850 - 25132002
Alignment:
Q  270 cttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgct 369  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| | |||  | |||| ||||||||| || || |||    
T  25131850 cttgaaccttgcccaagtcacaacctctccgccgatctcgagtctccccttagcatttgtccaccaatactcggcctcctcagcaagcatgtgggtagct 25131949  T
Q  370 attctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccat 422  Q
    |  ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  25131950 aacctgaccttctgatcatcactagtcaccatagcacggaagatcctctccat 25132002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 29 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 9146 - 8745
Alignment:
Q  29 caaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacactacgaaaccatagcatcctcagcatt 128  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9146 caaagtctcagatctccttaacacacatgtattgatagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcctcagcatt 9047  T
Q  129 gatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttttagattcagaaactcaatctccttcttg 228  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  9046 gatgtagggacaaaacctagacagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcagaaactcaacctccttattg 8947  T
Q  229 gtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattag 328  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||    
T  8946 gtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactcatgtcttcctttggcgctag 8847  T
Q  329 tccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccattccctg 428  Q
    ||||||| |||||| | |||| ||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8846 tccaccagtgctctgcctcctcagtcaacatatgagtcgctagcctgaccttctggtcatcttccgtaaccatagctcggaaaatccgctccataccctg 8747  T
Q  429 ca 430  Q
    ||    
T  8746 ca 8745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 6645 - 6213
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6645 aacatacgacacttatgcactaaagtatcaaagtctcggatctcttgaacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacac 6546  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagc---tcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttg 197  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6545 acttcgaaatcatagcatcctcaacattaatgtagggacagaacctcgaaagtaattcctcgaacttcgccgcatactcggccacagacatgattccttg 6446  T
Q  198 ttttagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatca 297  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6445 cttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatca 6346  T
Q  298 cctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtca 397  Q
      ||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||| |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  6345 tttcccaactcaagccttcccttggcattggtccactagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtaa 6246  T
Q  398 ccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6245 ccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 6213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 3711 - 3282
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3711 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctggacacacatgtactgatagatatctggcctaagcccactatcaaacttcacac 3612  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3611 acttcgaaaccataacatcttcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctatagacatgcttccttgttt 3512  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  3511 cagattcaaaaactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcagctttgaacttttcccaggtcacaacttcacct 3412  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3411 cccatatcaagtcttcccttggcattagtccaccagtgctccgcttcctcagtaagcatatgagtcgccaatctaaccttctggtcatctcccgtcacca 3312  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  3311 tagcatggaatatccgctccatgccctgca 3282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Original strand, 23509079 - 23509508
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  23509079 aacatacgacacttatgcatcaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcgcac 23509178  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||| || ||| || ||||||||||||||| ||||| ||    
T  23509179 acttcgaaatcatagcatccttagcattgatgtatggacaaaacctcaaaagttcctcgaacttcaccacatgcttggctacagacatgattccttgctt 23509278  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509279 cagattcagaaactcaatcgccttcttggtcctcaagtcttcggggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 23509378  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    |||| || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23509379 cccaacttaagccttcctttggcattggtccaccagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtaacca 23509478  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23509479 tagctcggaaaatccgctccatcccctgca 23509508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 24584604 - 24585034
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  24584604 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaactctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatccgacctaagcccactctccaacttcacac 24584703  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||    
T  24584704 acttcgaaaccatagcatcctcaacattgatgtagggacaaaaccttgcaagctccttaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttgctt 24584803  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||| ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || |||   |||||| | | ||| ||||| || || ||     
T  24584804 caaattcaggaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagttttgaacattgtccaagtcacaacctctcca 24584903  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
     | |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||  | |||| ||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  24584904 tcaatctcaagtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatctgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcacca 24585003  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgcaa 431  Q
    |||| || || |||| |||||| || |||||    
T  24585004 tagcacgaaagatcctctccatgccttgcaa 24585034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 21828211 - 21828631
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  21828211 aacatacgacacttatgcaccaaag-atcgaaatctctaatctcctgaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcgaacttcacac 21828309  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||  ||||||  ||    
T  21828310 acttcgaaaccatcgcatcttcagcattaatgtacgtacaaaacctcgaaagctcctcaaactttgctgcatactcagcgacagacatactcccttactt 21828409  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |  ||||  ||||| |  |||||  | |||||||| || ||||| ||  | ||| |||| || ||   ||||||| ||||||| ||||| || || ||     
T  21828410 caagttcaagaactccacttcctttctagtcctcaaatcctcaggaaagtatttcatcaaaaactcggtcttgaacctagcccaagtcacaacctctcca 21828509  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || | ||||||||| || || ||||||||||||||   |||  |||||| ||||||||| || || || |  ||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  21828510 ccgacctcaagtctccccttagcattagtccaccaaaactcagcttcctcagcaagcatgtgggtagccaacctgaccttctgatcatcactagtcacca 21828609  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccat 422  Q
    |||| ||||| |||| ||||||    
T  21828610 tagcacggaagatcctctccat 21828631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33314082 - 33314011
Alignment:
Q  118 tcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatg 189  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33314082 tcctctgcattaatgtacggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcagctactgacatg 33314011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 97046 - 97465
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  97046 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacatat--actgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacac 97143  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  97144 acttcgaaaccataacatcttcaacattgatgtacggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgcctcatactcggctacagacatgcttccttgttt 97243  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| || ||  |     
T  97244 cagattcaaaaactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatatttcctcaagaattcagctttgaactttgtccaggtcacaacttcttca 97343  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  97344 ccaaactcaagtcttcttttggcattagtccaccactgctcagcttcctcagcaagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtcacca 97443  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccat 422  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  97444 tagcacggaatatccgctccat 97465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8204 - 7795
Alignment:
Q  18 caccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacactacgaaaccatagca 117  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8204 caccaaaatatcaaagtctgggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcgcactctcaaacttcacacacttcgaaatcatagca 8105  T
Q  118 tcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttttagattcagaaactcaa 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  8104 tcctcagcattgatgtagggacaaaacctcaaaagttcctcgaacttcgccacatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaacttca 8005  T
Q  218 tctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcc 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||    
T  8004 tctccttcttggccctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacatagcccaggtcacctcatcacctcccaactcaagcctgcc 7905  T
Q  318 tttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgc 417  Q
    ||||||||| |||||| | |||| | |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7904 tttggcattggtccactagtgctatgcttcctcagctagcatatgagtcgctagtttgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgc 7805  T
Q  418 tccattccct 427  Q
    ||||| ||||    
T  7804 tccatcccct 7795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Original strand, 8676 - 9105
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  8676 aacatacgacacttatgtaccaaagtatcaaagtctcggatctcctggacacacaaatactgataaatattcggcctaagcccactttcaaactttacac 8775  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8776 acttcgaaaccatagcatctttagcattgatgtacggataaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgttt 8875  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || | ||||    
T  8876 cagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcatcaagaattcagctttgaacttcgcccaggtcacaactttacct 8975  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  |||||| | |||||||| ||||||| | | |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8976 cccatctcaattcttcctttggcattagtccaatagtgctcagcttcctcaacaagcatacgagtcgccagtttgaccttctgatcacctcccgtcacca 9075  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    |||| | ||| ||||||||| | |||||||    
T  9076 tagcaccgaatatccgctccgtgccctgca 9105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 91021 - 91324
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || || || ||||| | || |||||| ||||||||||||||||||     
T  91021 aacatacgacacttatgcaccaaagtttcaaagtctctgatctcctgaacacacatttattgatagattttcgtcctaagcccactctcaaacttcacat 91120  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  91121 acttcgaaatcttagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccatgttt 91220  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  91221 cagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 91320  T
Q  301 ccca 304  Q
    ||||    
T  91321 ccca 91324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 20661 - 20258
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20661 aacatatgacacctatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactggtagatatccggcctaagcccactttcaaacttcacac 20562  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||    
T  20561 acttggaaaccatcgcatccttagcattaatgtacggacaaaacctcacaagctcctcaaacttcgccgcatactcagccacggacatactcccttgctt 20462  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |  ||||  ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || ||| |||||||| ||||||| | |||||| |  ||     
T  20461 caagttcaagaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaacctagcccaaggcaccacctatcca 20362  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||  | |||| ||||||||| || || || |  || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  20361 ccaatctcaagtcttcccttagcattagtccaccaatactcggcctcctcagcaagcatgtgggtagccaacctaaccttctgatcatcactagtcacca 20262  T
Q  401 tagc 404  Q
    ||||    
T  20261 tagc 20258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 30237 - 29834
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30237 aacatatgacacctatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactggtagatatccggcctaagcccactttcaaacttcacac 30138  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||    
T  30137 acttggaaaccatcgcatccttagcattaatgtacggacaaaacctcacaagctcctcaaacttcgccgcatactcagccacggacatactcccttgctt 30038  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |  ||||  ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || ||| |||||||| ||||||| | |||||| |  ||     
T  30037 caagttcaagaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaacctagcccaaggcaccacctatcca 29938  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||  | |||| ||||||||| || || || |  || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  29937 ccaatctcaagtcttcccttagcattagtccaccaatactcggcctcctcagcaagcatgtgggtagccaacctaaccttctgatcatcactagtcacca 29838  T
Q  401 tagc 404  Q
    ||||    
T  29837 tagc 29834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12410 - 12124
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12410 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatctggcctaagcccactctcaaacttcacac 12311  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12310 acttcgaaatcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagttgctcgaacttcgccgcatactcggctacagacatgattccttgttt 12211  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12210 cagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcggggaaatacttcctcaataattcaaccttgaacttagcccaggt 12124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 328 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12117 - 12015
Alignment:
Q  328 gtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccattccct 427  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12117 gtccaccagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccatcccct 12018  T
Q  428 gca 430  Q
    |||    
T  12017 gca 12015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27104565 - 27104135
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27104565 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactttcaaacttcacac 27104466  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||    
T  27104465 acttggaaaccatagcatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgctt 27104366  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||| ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || ||     
T  27104365 caaattcaggaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctcca 27104266  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||  | |||| ||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  27104265 ccaatctcaagtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcacca 27104166  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgcaa 431  Q
    |||| || || |||| |||||| || |||||    
T  27104165 tagcacgaaagatcctctccatgccttgcaa 27104135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 7827379 - 7827809
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7827379 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactttcaaacttcacac 7827478  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||    
T  7827479 acttggaaaccatagcatcctccgcattgatgtaggggcaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgctt 7827578  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||| ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || ||     
T  7827579 caaattcaggaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctcca 7827678  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||  | |||| ||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  7827679 ccaatctcaagtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcacca 7827778  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgcaa 431  Q
    |||| || || |||| |||||| || |||||    
T  7827779 tagcacgaaagatcctctccatgccttgcaa 7827809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 27173760 - 27174190
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27173760 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactttcaaacttcacac 27173859  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||    
T  27173860 acttggaaaccatagcatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgctt 27173959  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||| ||||| |  |||||| | |||||||| || || || ||  |||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || ||     
T  27173960 caaattcaggaactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctcca 27174059  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||  | |||| ||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||| |  ||||| |    
T  27174060 ccaatctcaagtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcacga 27174159  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccattccctgcaa 431  Q
    |||| || || |||| |||||| || |||||    
T  27174160 tagcacgaaagatcctctccatgccttgcaa 27174190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 4443402 - 4443598
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  4443402 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctccttaacacacatatactgatagatatccggcctatgtccactttcaaatttcacac 4443501  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttg 197  Q
    |||  || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  4443502 acttggacaccattgcatcctcaacattaatgtacgcataaaacctcgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcagccacagacatgctcccttg 4443598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 404
Target Start/End: Original strand, 13459497 - 13459893
Alignment:
Q  8 gacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacactacga 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |  ||||| ||||||||| || |||| ||||  |||||||||||||||| |||    
T  13459497 gacacttgtgcaccaaagtatcgaagtctctaatatcctaaacacacacatactgatagatatccagcttaagcccacgttcaaacttcacacacttcga 13459596  T
Q  108 aaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttttagattc 207  Q
    |||||| ||||| ||  |||| ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||  |  ||||||| | ||||||| || |  |||    
T  13459597 aaccattgcatcttcgacattaatgtagggataaaacctcggaagttcctcaaactttgcagcatacttagtgacagacaagctcccttgcttcaagttc 13459696  T
Q  208 agaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatct 307  Q
    |  || || |  |||||| || ||||||| || || || ||| |||||||||| || |||  ||||||| || || | ||||| || || || |  ||||    
T  13459697 aagaattccacttccttcctgctcctcaaatcctctggaaaatacttcctcaaaaactcagtcttgaacctaacctaagtcactacctctccactgatct 13459796  T
Q  308 caagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagc 404  Q
    |||||||||| || ||||| ||| |||| |||||  | |||| | ||||||| || || ||||   |||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  13459797 caagtcttcccttagcattcgtcaaccaatgctcagcctcctcaacaagcatgtgggtagctaacttgaccttctaatcatcaccagtcaccatagc 13459893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16575220 - 16575135
Alignment:
Q  345 ttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  16575220 ttcctcagcaagcatatgagttgccagtctgaccttctggtcatctcccatcaccatggcatggaatatccgctccatgccctgca 16575135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 430
Target Start/End: Original strand, 16590442 - 16590527
Alignment:
Q  345 ttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  16590442 ttcctcagcaagcatatgagttgccagtctgaccttctggtcatctcccatcaccatggcatggaatatccgctccatgccctgca 16590527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4591 - 4226
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4591 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactttcaaacttcacac 4492  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||    
T  4491 acttcgaaaccatagcatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgctt 4392  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||| ||||| |  |||||| | || ||||| || || || ||  |||||||||| || ||| |||||||| |   ||| ||||| || || ||     
T  4391 caaattcaggaactccacttccttcctagttctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttatccaagtcacaacctcccca 4292  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtc 366  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  4291 ccaatctcaagtcttcccttagcattagtccaccaatactctgcttccttagctaccatgtgagtc 4226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 16420 - 16636
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16420 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcttgaacacacatgtactgatagatatccggcccaagtccactctcaaacttcacac 16519  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
     || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16520 gcttcgaaaccatagcatcctcaagattgatgtagggacaaaacctagacagctcctgaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgttt 16619  T
Q  201 tagattcagaaactcaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  16620 cagattcagaaactcaa 16636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 430
Target Start/End: Original strand, 16662 - 16737
Alignment:
Q  355 agcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16662 agcatatgagttgctagtctgaccttatggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccataccctgca 16737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 24482 - 24653
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24482 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcccactttcaaacttcacac 24581  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcat 172  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24582 acttcgaaaccatagcatcctccgcattgatgtaggggcaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcat 24653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 244 - 430
Target Start/End: Original strand, 3172 - 3358
Alignment:
Q  244 gggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctcta 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||     
T  3172 gggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcccttggcattggtccaccaatgctctg 3271  T
Q  344 cttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    |||||| ||  | |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3272 cttcctcagtcaacatatgagtcgccagtctaaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccatcccctgca 3358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 1730 - 1770
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggat 41  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1730 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggat 1770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 260 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 73251 - 73081
Alignment:
Q  260 agaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  || |||||    
T  73251 agaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcctttggcgttagtccaccagtgctctgcttcctcggctagcat 73152  T
Q  360 atgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  73151 atgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgcgctataccctgca 73081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 260 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 77632 - 77462
Alignment:
Q  260 agaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  || |||||    
T  77632 agaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcctttggcgttagtccaccagtgctctgcttcctcggctagcat 77533  T
Q  360 atgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  77532 atgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgcgctataccctgca 77462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 73419 - 73284
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  73419 aacatacgacatttttgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaaattcacac 73320  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtagg 136  Q
    ||| ||| | |||||| |||||| |||||| |||||    
T  73319 acttcgagatcatagcgtcctcaacattgaagtagg 73284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 77800 - 77665
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  77800 aacatacgacatttgtgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaaattcacac 77701  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtagg 136  Q
    ||| ||| | |||||| |||||| |||||| |||||    
T  77700 acttcgagatcatagcgtcctcaacattgaagtagg 77665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 182509 - 182611
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  182509 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactaatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcaaac 182608  T
Q  101 act 103  Q
    |||    
T  182609 act 182611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25485 - 25152
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||||||| | |    
T  25485 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaaatcttgaatctcttgaacacacatatactgatagacatccggcctaatcccactttcaaacttcgcgc 25386  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||    
T  25385 acttggaaaccatcgcatcctcagcattgatgtacggacaaaacctcggaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacgaacatgctcccttgctt 25286  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |  ||||  ||||| |  |||||| | ||||| || || || || ||  |||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||  || || ||     
T  25285 caagttcaagaactccacttccttcctagtccttaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagctttgaacttagcccaagtca-aacttctcca 25187  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccacca 335  Q
    || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  25186 ccaatctcaagtcttccattagcattggtccacca 25152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35957 - 35537
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  35957 aacatacgacacttatgcaccaaag-atcgaaatctctaatctcctgaacacacatatactgatagatatccgggctaagcccactttcaaacttcacac 35859  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||  ||||||| ||    
T  35858 acttcgaaaccatcgcatcttcagcattaatgtatggacaaaacctcgaaagctcctcaaactttgctgcatactcagccacagacatactcccttgctt 35759  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     | |||||  ||||| |  |||||  | || ||||| || ||||| ||  | ||| |||| || ||   ||||||| ||||||| ||||| || || ||     
T  35758 caaattcaagaactccacttcctttctagtactcaaatcctcaggaaagtatttcgtcaaaaactcggtcttgaacctagcccaagtcacaacctctcca 35659  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || | ||||||||| || || ||||||||||||||   |||  |||||| ||||||||| || || || |  ||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  35658 ccgacctcaagtctccccttagcattagtccaccaaaactcagcttcctcagcaagcatgtgggtagccaacctgaccttctgatcatcactagtcacca 35559  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccat 422  Q
    |||| ||||| |||| ||||||    
T  35558 tagcacggaagatcctctccat 35537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32659 - 32464
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  32659 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtcttggatctcctaaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcaaaattcacac 32560  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttg 197  Q
    |||  || | |||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||  ||||| |||||||    
T  32559 acttggaca-catcacatcctcaacattaatgtacgaacaaaacctcgcaagctcctcaaattttgccgcatactcagccacgaacatgctcccttg 32464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5798 - 5377
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5798 aacatacgacgcttatgcaccaagatatcaaaatctcaaatctcctgaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcaaacttcacac 5699  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgttt 200  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||| |||| || || | |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  5698 acttcgaaaccattgcatcttcaacattaatatacggacaaaaccacgaaagctcttcaaactttggcgcatactcagccactgacatgctcccttgctt 5599  T
Q  201 tagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacct 300  Q
     |  ||||  ||||| |  |||||  | || ||||| || || || ||  | |||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||| || || ||     
T  5598 caagttcaagaactccacttcctttctagttctcaaatcctctggaaagtatttcctcaaaaactcaaccttgaaccttgcccaagtcacgacctctcca 5499  T
Q  301 cccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccactgctctacttccttagcaagcatatgagtcgctattctgaccttctggtcatcccccgtcacca 400  Q
    || |  |||||||| || || ||||| |||||||| | |||  | |||| ||||||||| || || || |  ||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  5498 ccgacttcaagtctccccttagcattcgtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgggtagccaacctgaccttctgatcatcactagtcacca 5399  T
Q  401 tagctcggaaaatccgctccat 422  Q
    |||| || || |||| ||||||    
T  5398 tagcacgaaagatcctctccat 5377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 35595 - 35691
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttca 97  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35595 aacatacgacacttgtgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactgatagatgtccggcctaagcccactctcaaacttca 35691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 4009 - 4161
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  4009 aacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaaatcttcgatctcctggacacaaatatactgatacatatccagcctaagcctactttcaaacttcacac 4108  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagc 153  Q
    |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||    
T  4109 acttggaaaccataacatcctccgcattgatgtacgggcaaaacctggaaagc 4161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 197
Target Start/End: Original strand, 2182 - 2291
Alignment:
Q  88 tcaaacttcacacactacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagaca 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  2182 tcaaacttcacacacttcgaaaccatcgcatcttcaacattaatgtacggacaaatcctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcagccacggaca 2281  T
Q  188 tgatcccttg 197  Q
    || |||||||    
T  2282 tgctcccttg 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 77947 - 78128
Alignment:
Q  8 gacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacactacga 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| | ||  ||||| ||||| || || || ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||    
T  77947 gacacttgtgcaccaaagtatcaaagtcacaaatctcatgaaagcagatatactgataaatctcgggcctcaatccactctcaaacttcacacatttcga 78046  T
Q  108 aaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatg 189  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |  | |||||| || |||||||||    
T  78047 caccatagcatcctcaacattaatgtagcgacaaaaccttgatagctcctcaaacttagtggtatactccgcaacagacatg 78128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 49178 - 49341
Alignment:
Q  1 aacatatgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctaaacacagatgtactggtagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacac 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||| || || || || ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  49178 aacatgtgacacttgtgcaccaaagtatcaaaatctctgatctcatgaaaacagatgtattgataaatctcaggcctcaaaccactctcaaacttcacac 49277  T
Q  101 actacgaaaccatagcatcctcagcattgatgtaggcacaaaacctcgaaagctcctcaaactt 164  Q
    | |  || | ||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||| | |||||| |||||    
T  49278 atttagatatcatagcatcctcaacattaatgtacgggcaaaacatcgacaactcctcgaactt 49341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University