View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13421_low_20 (Length: 232)

Name: NF13421_low_20
Description: NF13421
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13421_low_20
NF13421_low_20
[»] chr2 (71 HSPs)
chr2 (1-129)||(37255336-37255467)
chr2 (1-128)||(23901830-23901960)
chr2 (1-128)||(32948497-32948626)
chr2 (1-130)||(17600887-17601019)
chr2 (1-130)||(27024466-27024598)
chr2 (1-130)||(34518418-34518550)
chr2 (1-129)||(27651033-27651164)
chr2 (1-128)||(11185023-11185153)
chr2 (1-128)||(32327412-32327542)
chr2 (1-129)||(14660497-14660628)
chr2 (1-129)||(40635269-40635400)
chr2 (1-128)||(746517-746647)
chr2 (1-132)||(2324885-2325019)
chr2 (1-128)||(4609677-4609807)
chr2 (1-128)||(13815218-13815348)
chr2 (1-128)||(14697537-14697667)
chr2 (1-128)||(45371041-45371171)
chr2 (1-131)||(6594455-6594588)
chr2 (1-130)||(4034643-4034775)
chr2 (1-130)||(25294886-25295018)
chr2 (1-130)||(40037194-40037325)
chr2 (1-117)||(6430524-6430642)
chr2 (1-128)||(38997152-38997282)
chr2 (1-131)||(1091948-1092081)
chr2 (1-130)||(32856434-32856566)
chr2 (1-125)||(10424646-10424773)
chr2 (1-106)||(15925131-15925238)
chr2 (1-128)||(10244582-10244712)
chr2 (1-128)||(11159672-11159802)
chr2 (1-128)||(26710396-26710526)
chr2 (1-128)||(27400454-27400584)
chr2 (1-131)||(33427644-33427777)
chr2 (1-128)||(2914138-2914268)
chr2 (1-128)||(5726180-5726310)
chr2 (1-108)||(9444741-9444850)
chr2 (1-130)||(7892686-7892818)
chr2 (1-128)||(37620867-37621000)
chr2 (1-117)||(40735515-40735633)
chr2 (1-103)||(8432942-8433046)
chr2 (1-87)||(32608431-32608518)
chr2 (1-114)||(1229678-1229793)
chr2 (27-128)||(447633-447737)
chr2 (1-67)||(42899966-42900033)
chr2 (1-87)||(12842154-12842241)
chr2 (21-87)||(28014861-28014928)
chr2 (1-128)||(35158050-35158169)
chr2 (1-87)||(41172509-41172596)
chr2 (58-128)||(43898971-43899042)
chr2 (58-128)||(12333497-12333567)
chr2 (58-130)||(13543622-13543696)
chr2 (58-130)||(34249363-34249437)
chr2 (1-128)||(39301197-39301316)
chr2 (1-131)||(145333-145455)
chr2 (58-127)||(39103145-39103216)
chr2 (1-132)||(27331349-27331476)
chr2 (1-128)||(28641292-28641411)
chr2 (1-128)||(29687092-29687211)
chr2 (1-130)||(3711684-3711805)
chr2 (58-128)||(4258587-4258659)
chr2 (1-130)||(12730112-12730233)
chr2 (29-103)||(12827142-12827217)
chr2 (58-128)||(19428426-19428498)
chr2 (5-49)||(35126835-35126879)
chr2 (5-49)||(44481883-44481927)
chr2 (58-123)||(28566703-28566770)
chr2 (58-130)||(2688727-2688801)
chr2 (3-59)||(30545874-30545931)
chr2 (72-126)||(3266399-3266455)
chr2 (1-41)||(40544155-40544195)
chr2 (75-130)||(42900781-42900837)
chr2 (1-41)||(43356147-43356187)
[»] chr4 (112 HSPs)
chr4 (1-131)||(48657870-48658003)
chr4 (1-128)||(21366609-21366739)
chr4 (1-128)||(31532135-31532265)
chr4 (1-131)||(34276599-34276732)
chr4 (1-132)||(146425-146559)
chr4 (1-129)||(2826681-2826811)
chr4 (1-128)||(9798517-9798647)
chr4 (1-132)||(32366656-32366790)
chr4 (1-128)||(44984813-44984943)
chr4 (1-128)||(54574940-54575070)
chr4 (1-117)||(54608014-54608132)
chr4 (1-128)||(55519879-55520009)
chr4 (1-130)||(19387686-19387818)
chr4 (1-126)||(50457812-50457940)
chr4 (1-130)||(53461814-53461946)
chr4 (1-130)||(22618512-22618642)
chr4 (1-129)||(42085259-42085390)
chr4 (1-128)||(18462013-18462143)
chr4 (1-128)||(26091258-26091388)
chr4 (5-132)||(36532826-36532956)
chr4 (1-128)||(47344708-47344838)
chr4 (1-128)||(56022998-56023128)
chr4 (3-118)||(50534685-50534802)
chr4 (1-128)||(53854430-53854559)
chr4 (1-130)||(237529-237661)
chr4 (1-126)||(397454-397582)
chr4 (1-128)||(407806-407934)
chr4 (3-117)||(41560382-41560498)
chr4 (1-130)||(50234052-50234184)
chr4 (1-129)||(31914250-31914380)
chr4 (1-129)||(39077597-39077728)
chr4 (1-129)||(55056258-55056389)
chr4 (1-128)||(23437644-23437774)
chr4 (1-132)||(42765838-42765971)
chr4 (1-117)||(50536636-50536754)
chr4 (1-127)||(6019980-6020109)
chr4 (3-125)||(6285361-6285486)
chr4 (1-130)||(38591720-38591848)
chr4 (1-131)||(45797531-45797664)
chr4 (1-128)||(51363059-51363188)
chr4 (1-128)||(52728307-52728436)
chr4 (1-130)||(47662100-47662232)
chr4 (1-117)||(35446557-35446675)
chr4 (2-117)||(23609140-23609257)
chr4 (1-112)||(27373128-27373241)
chr4 (1-131)||(41702456-41702589)
chr4 (1-128)||(48313609-48313737)
chr4 (1-131)||(55776097-55776229)
chr4 (1-131)||(55840275-55840407)
chr4 (1-130)||(2243510-2243642)
chr4 (1-130)||(3692208-3692340)
chr4 (1-103)||(22468796-22468900)
chr4 (1-130)||(31070072-31070203)
chr4 (1-132)||(1932815-1932949)
chr4 (1-128)||(29478412-29478542)
chr4 (1-117)||(31972348-31972466)
chr4 (1-128)||(42222343-42222473)
chr4 (1-128)||(49881059-49881193)
chr4 (1-128)||(54086461-54086590)
chr4 (1-128)||(54425034-54425163)
chr4 (3-129)||(3170680-3170809)
chr4 (1-128)||(39587781-39587909)
chr4 (1-127)||(53834055-53834184)
chr4 (2-132)||(14017372-14017503)
chr4 (3-128)||(41949436-41949566)
chr4 (1-129)||(43471694-43471825)
chr4 (153-216)||(51755461-51755524)
chr4 (1-117)||(33897507-33897625)
chr4 (3-128)||(42033229-42033357)
chr4 (4-117)||(42509351-42509466)
chr4 (1-86)||(52396778-52396865)
chr4 (1-128)||(41632007-41632136)
chr4 (1-130)||(29777255-29777387)
chr4 (29-127)||(35344868-35344968)
chr4 (3-112)||(48259528-48259638)
chr4 (34-128)||(35595772-35595869)
chr4 (1-117)||(51951734-51951851)
chr4 (1-117)||(54805626-54805748)
chr4 (1-130)||(37239088-37239209)
chr4 (1-79)||(48654866-48654945)
chr4 (1-128)||(9997931-9998050)
chr4 (1-128)||(45633779-45633898)
chr4 (1-128)||(52688401-52688520)
chr4 (1-130)||(20351840-20351961)
chr4 (1-130)||(31881312-31881433)
chr4 (1-126)||(54216365-54216482)
chr4 (58-127)||(33048991-33049062)
chr4 (58-131)||(43891027-43891102)
chr4 (1-128)||(15060289-15060408)
chr4 (1-128)||(22620645-22620764)
chr4 (58-130)||(47812005-47812079)
chr4 (3-48)||(43231556-43231601)
chr4 (5-49)||(1662330-1662374)
chr4 (1-49)||(14335172-14335220)
chr4 (5-49)||(27580175-27580219)
chr4 (5-49)||(27872635-27872679)
chr4 (1-115)||(33289755-33289860)
chr4 (70-128)||(34552430-34552490)
chr4 (5-49)||(38547672-38547716)
chr4 (58-117)||(54216748-54216808)
chr4 (1-106)||(5117461-5117557)
chr4 (58-130)||(27873548-27873620)
chr4 (27-130)||(42558271-42558369)
chr4 (1-106)||(46708764-46708860)
chr4 (60-107)||(54709955-54710002)
chr4 (5-55)||(27398668-27398718)
chr4 (58-130)||(54715134-54715208)
chr4 (58-106)||(4486604-4486653)
chr4 (58-106)||(52461462-52461511)
chr4 (5-49)||(573859-573903)
chr4 (1-41)||(3293102-3293142)
chr4 (5-49)||(46720081-46720125)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-130)||(39554-39686)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (1-129)||(739703-739834)
chr5 (1-129)||(3466680-3466811)
chr5 (1-129)||(35626090-35626221)
chr5 (1-129)||(43262182-43262313)
chr5 (1-128)||(24253434-24253564)
chr5 (1-128)||(27501055-27501185)
chr5 (1-117)||(40886040-40886157)
chr5 (1-128)||(27938949-27939080)
chr5 (1-129)||(7722101-7722232)
chr5 (1-129)||(39932631-39932762)
chr5 (1-127)||(15398483-15398612)
chr5 (1-126)||(6901851-6901979)
chr5 (1-130)||(29789293-29789425)
chr5 (1-128)||(13504742-13504872)
chr5 (1-128)||(15683843-15683973)
chr5 (1-117)||(18479680-18479798)
chr5 (1-117)||(31938949-31939067)
chr5 (1-117)||(43326391-43326509)
chr5 (1-129)||(890958-891088)
chr5 (1-128)||(2484292-2484422)
chr5 (1-128)||(5185024-5185154)
chr5 (1-128)||(12648849-12648979)
chr5 (10-131)||(28424792-28424916)
chr5 (1-128)||(34451302-34451432)
chr5 (1-128)||(40278858-40278988)
chr5 (1-85)||(38756533-38756618)
chr5 (1-107)||(5137767-5137875)
chr5 (1-107)||(40110286-40110393)
chr5 (1-118)||(25831573-25831691)
chr5 (1-127)||(27278474-27278607)
chr5 (3-130)||(763777-763907)
chr5 (1-47)||(40632551-40632597)
chr5 (59-130)||(13957770-13957843)
chr5 (58-131)||(5497372-5497447)
chr5 (55-127)||(9424593-9424667)
chr5 (1-128)||(31293989-31294119)
chr5 (58-128)||(19295829-19295901)
chr5 (1-130)||(23195246-23195367)
chr5 (1-130)||(38015512-38015633)
chr5 (1-115)||(42658676-42658781)
chr5 (1-106)||(38492665-38492761)
chr5 (58-130)||(6973162-6973236)
chr5 (1-128)||(27503431-27503550)
chr5 (5-50)||(36472354-36472399)
chr5 (5-49)||(1402576-1402620)
chr5 (58-128)||(14972077-14972149)
chr5 (5-49)||(27390653-27390697)
chr5 (1-130)||(33617637-33617758)
chr5 (55-130)||(612755-612833)
chr5 (5-48)||(2585518-2585561)
chr5 (39-107)||(4149774-4149844)
chr5 (58-106)||(6206983-6207032)
chr5 (58-130)||(9171033-9171106)
chr5 (58-106)||(36365468-36365517)
chr5 (58-128)||(3656568-3656640)
chr5 (70-128)||(9374502-9374562)
chr5 (1-41)||(13957722-13957762)
chr5 (58-106)||(36948513-36948561)
[»] chr3 (95 HSPs)
chr3 (1-117)||(29625839-29625957)
chr3 (1-132)||(32234394-32234527)
chr3 (1-129)||(35748310-35748441)
chr3 (1-130)||(43125883-43126014)
chr3 (1-130)||(43612045-43612177)
chr3 (1-132)||(47257845-47257979)
chr3 (3-130)||(49330091-49330221)
chr3 (1-132)||(41293315-41293448)
chr3 (1-127)||(51170034-51170163)
chr3 (1-128)||(52629006-52629135)
chr3 (1-130)||(38416722-38416854)
chr3 (1-131)||(47809593-47809727)
chr3 (1-129)||(48739232-48739363)
chr3 (1-128)||(24100335-24100464)
chr3 (1-128)||(41464404-41464534)
chr3 (1-128)||(22399149-22399278)
chr3 (1-131)||(52638894-52639027)
chr3 (1-131)||(53943585-53943717)
chr3 (1-130)||(7855112-7855244)
chr3 (1-126)||(48609775-48609903)
chr3 (1-129)||(27066977-27067108)
chr3 (1-130)||(46126039-46126170)
chr3 (1-128)||(28048392-28048522)
chr3 (1-128)||(37324593-37324723)
chr3 (1-128)||(44222881-44223011)
chr3 (1-127)||(55453245-55453374)
chr3 (1-131)||(7755304-7755436)
chr3 (1-130)||(40130957-40131089)
chr3 (1-130)||(44806736-44806868)
chr3 (1-126)||(47894822-47894950)
chr3 (1-129)||(40419887-40420018)
chr3 (1-129)||(40804509-40804640)
chr3 (1-106)||(46134408-46134515)
chr3 (1-127)||(46949426-46949553)
chr3 (4-128)||(5560025-5560154)
chr3 (3-130)||(35594175-35594305)
chr3 (1-128)||(40643852-40643982)
chr3 (1-132)||(51452747-51452880)
chr3 (1-130)||(39053446-39053578)
chr3 (1-130)||(39634570-39634701)
chr3 (1-126)||(43183964-43184092)
chr3 (1-129)||(2666052-2666183)
chr3 (1-114)||(52215128-52215243)
chr3 (1-132)||(42291894-42292028)
chr3 (1-104)||(24376625-24376730)
chr3 (1-130)||(20754391-20754523)
chr3 (9-131)||(52864550-52864674)
chr3 (1-129)||(18946955-18947086)
chr3 (1-128)||(37313451-37313581)
chr3 (1-117)||(41732580-41732698)
chr3 (1-117)||(51146227-51146345)
chr3 (3-94)||(36368993-36369086)
chr3 (1-94)||(53637893-53637988)
chr3 (1-132)||(41216507-41216641)
chr3 (1-128)||(51102378-51102508)
chr3 (16-131)||(33550464-33550582)
chr3 (1-107)||(53832506-53832614)
chr3 (1-79)||(47182052-47182131)
chr3 (1-127)||(43021766-43021896)
chr3 (1-87)||(37758981-37759068)
chr3 (1-67)||(48546894-48546959)
chr3 (1-67)||(54159051-54159118)
chr3 (58-131)||(55000175-55000250)
chr3 (58-130)||(49130677-49130751)
chr3 (1-104)||(17665549-17665643)
chr3 (1-131)||(25641698-25641820)
chr3 (58-128)||(38156632-38156704)
chr3 (1-130)||(42589882-42590003)
chr3 (1-130)||(51416021-51416142)
chr3 (5-48)||(21597220-21597263)
chr3 (1-131)||(39141122-39141245)
chr3 (58-130)||(44945933-44946007)
chr3 (68-128)||(52756067-52756129)
chr3 (5-55)||(53115503-53115553)
chr3 (58-129)||(54707219-54707292)
chr3 (5-49)||(30251572-30251616)
chr3 (58-128)||(51224038-51224110)
chr3 (1-115)||(54401239-54401344)
chr3 (5-49)||(55380041-55380085)
chr3 (1-48)||(28576184-28576231)
chr3 (1-106)||(34279744-34279840)
chr3 (5-48)||(41882063-41882106)
chr3 (5-48)||(50731986-50732029)
chr3 (5-48)||(50780827-50780870)
chr3 (58-130)||(31286791-31286865)
chr3 (58-130)||(41635798-41635872)
chr3 (1-128)||(47510940-47511059)
chr3 (58-130)||(48534005-48534079)
chr3 (61-128)||(24688216-24688285)
chr3 (61-128)||(37028825-37028894)
chr3 (3-55)||(8847723-8847775)
chr3 (9-49)||(25353614-25353654)
chr3 (5-49)||(42998860-42998904)
chr3 (1-41)||(45058935-45058975)
chr3 (5-49)||(51143873-51143917)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (1-131)||(2892240-2892373)
chr6 (1-129)||(11988973-11989104)
chr6 (1-128)||(22551061-22551191)
chr6 (1-132)||(34527858-34527992)
chr6 (1-131)||(5882558-5882691)
chr6 (1-130)||(2593850-2593982)
chr6 (1-130)||(22341786-22341918)
chr6 (1-130)||(26377202-26377334)
chr6 (1-128)||(18101495-18101625)
chr6 (3-129)||(24168145-24168274)
chr6 (1-130)||(19415531-19415663)
chr6 (1-128)||(8615292-8615422)
chr6 (1-117)||(14891391-14891509)
chr6 (1-131)||(7393583-7393716)
chr6 (1-130)||(5294799-5294931)
chr6 (1-130)||(5299351-5299483)
chr6 (1-128)||(599944-600074)
chr6 (1-107)||(7345134-7345242)
chr6 (1-115)||(16703418-16703534)
chr6 (1-129)||(1970763-1970894)
chr6 (5-129)||(10507907-10508034)
chr6 (3-127)||(19281056-19281183)
chr6 (1-94)||(24224105-24224200)
chr6 (1-128)||(28947139-28947269)
chr6 (4-128)||(959904-960031)
chr6 (1-128)||(33452572-33452702)
chr6 (1-131)||(23261926-23262059)
chr6 (1-87)||(30743491-30743578)
chr6 (1-77)||(30467656-30467733)
chr6 (55-128)||(28948845-28948920)
chr6 (58-128)||(18661833-18661905)
chr6 (61-129)||(15965535-15965605)
chr6 (58-128)||(3786848-3786920)
chr6 (58-115)||(13329480-13329538)
chr6 (1-45)||(1939579-1939623)
chr6 (1-41)||(4487579-4487619)
chr6 (70-128)||(4487638-4487698)
chr6 (5-49)||(7167638-7167682)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (1-130)||(13356118-13356250)
chr8 (1-130)||(2275965-2276096)
chr8 (1-130)||(32984075-32984207)
chr8 (1-129)||(45236564-45236695)
chr8 (3-112)||(44088460-44088571)
chr8 (1-128)||(10646175-10646305)
chr8 (1-128)||(24079901-24080031)
chr8 (1-128)||(35628829-35628959)
chr8 (3-130)||(9013738-9013867)
chr8 (1-131)||(33981660-33981793)
chr8 (1-130)||(9303572-9303704)
chr8 (1-128)||(9734307-9734435)
chr8 (5-130)||(12032986-12033114)
chr8 (1-126)||(32114301-32114429)
chr8 (6-131)||(33730638-33730766)
chr8 (1-129)||(5946099-5946230)
chr8 (1-129)||(43328759-43328890)
chr8 (1-117)||(25185951-25186069)
chr8 (1-128)||(40435153-40435283)
chr8 (1-128)||(41862272-41862402)
chr8 (1-112)||(2714601-2714714)
chr8 (1-127)||(22878443-22878572)
chr8 (1-131)||(37956473-37956606)
chr8 (1-132)||(17718718-17718852)
chr8 (1-117)||(31830967-31831085)
chr8 (1-128)||(37419992-37420122)
chr8 (1-131)||(41231998-41232131)
chr8 (3-117)||(25248087-25248203)
chr8 (1-129)||(6366038-6366169)
chr8 (1-106)||(29048426-29048533)
chr8 (1-117)||(3904129-3904246)
chr8 (1-117)||(45066604-45066722)
chr8 (15-128)||(41981534-41981650)
chr8 (1-128)||(41653947-41654077)
chr8 (1-131)||(13760643-13760778)
chr8 (1-127)||(37301326-37301455)
chr8 (18-130)||(31336163-31336278)
chr8 (4-112)||(45258565-45258675)
chr8 (3-118)||(42701300-42701418)
chr8 (1-127)||(41639966-41640095)
chr8 (1-50)||(41981485-41981534)
chr8 (58-128)||(41425429-41425500)
chr8 (1-128)||(31940367-31940485)
chr8 (3-55)||(39915888-39915940)
chr8 (1-128)||(117329-117448)
chr8 (1-128)||(9713738-9713857)
chr8 (58-128)||(2379239-2379311)
chr8 (58-130)||(3211304-3211378)
chr8 (55-112)||(38631748-38631806)
chr8 (58-129)||(4447294-4447367)
chr8 (1-112)||(32373744-32373845)
chr8 (58-128)||(10378408-10378480)
chr8 (70-123)||(4975412-4975467)
chr8 (58-115)||(41843352-41843410)
chr8 (61-128)||(33622467-33622535)
chr8 (5-49)||(33896914-33896958)
chr8 (70-128)||(39901679-39901739)
chr8 (1-41)||(40458851-40458891)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (1-130)||(33839713-33839845)
chr7 (1-128)||(45690097-45690227)
chr7 (1-131)||(49171359-49171492)
chr7 (1-129)||(31625757-31625887)
chr7 (1-128)||(23393051-23393181)
chr7 (1-128)||(25893917-25894047)
chr7 (1-128)||(29446891-29447020)
chr7 (1-127)||(33423276-33423405)
chr7 (1-130)||(36389409-36389541)
chr7 (1-130)||(45482711-45482843)
chr7 (1-132)||(2341657-2341792)
chr7 (1-129)||(35328068-35328199)
chr7 (1-129)||(35355941-35356072)
chr7 (1-128)||(22979647-22979777)
chr7 (1-128)||(27018169-27018299)
chr7 (1-132)||(46913162-46913298)
chr7 (1-130)||(17855481-17855613)
chr7 (1-130)||(40670616-40670748)
chr7 (1-130)||(47066975-47067107)
chr7 (1-129)||(30076526-30076657)
chr7 (1-129)||(37846015-37846146)
chr7 (1-117)||(15877603-15877721)
chr7 (1-128)||(31429475-31429605)
chr7 (1-128)||(33695821-33695951)
chr7 (1-131)||(35767527-35767660)
chr7 (1-130)||(5183823-5183955)
chr7 (1-130)||(26579715-26579847)
chr7 (1-131)||(41990856-41990988)
chr7 (2-132)||(35757016-35757149)
chr7 (1-128)||(20165814-20165944)
chr7 (1-128)||(28233936-28234066)
chr7 (1-132)||(33332842-33332975)
chr7 (1-128)||(33411313-33411443)
chr7 (1-128)||(47740331-47740461)
chr7 (1-128)||(48609677-48609807)
chr7 (1-107)||(31586901-31587009)
chr7 (1-128)||(10028541-10028673)
chr7 (15-130)||(41904272-41904390)
chr7 (1-128)||(5712221-5712351)
chr7 (1-128)||(19563500-19563630)
chr7 (1-117)||(43499538-43499656)
chr7 (4-127)||(33870301-33870424)
chr7 (3-105)||(44564393-44564497)
chr7 (1-128)||(45063357-45063485)
chr7 (12-132)||(44405412-44405535)
chr7 (1-129)||(10618351-10618475)
chr7 (3-94)||(33720071-33720164)
chr7 (1-129)||(24228594-24228714)
chr7 (55-130)||(44659940-44660017)
chr7 (1-130)||(35752032-35752153)
chr7 (1-115)||(48085911-48086016)
chr7 (1-129)||(37127990-37128110)
chr7 (1-117)||(2332072-2332179)
chr7 (70-131)||(39323720-39323782)
chr7 (58-130)||(45237531-45237605)
chr7 (1-46)||(26456162-26456207)
chr7 (1-130)||(7876326-7876447)
chr7 (58-132)||(46898012-46898088)
chr7 (58-130)||(24923022-24923096)
chr7 (1-128)||(36816845-36816964)
chr7 (1-128)||(43489271-43489390)
chr7 (58-129)||(46817420-46817493)
chr7 (58-128)||(26371149-26371221)
chr7 (5-49)||(33393385-33393429)
chr7 (5-49)||(47460843-47460887)
chr7 (1-41)||(47906838-47906878)
chr7 (61-126)||(39453484-39453551)
chr7 (1-128)||(21718170-21718288)
chr7 (58-106)||(498211-498260)
chr7 (5-49)||(7257438-7257482)
chr7 (5-49)||(15644017-15644061)
chr7 (5-49)||(16482854-16482898)
chr7 (1-41)||(26941611-26941651)
chr7 (1-49)||(29863068-29863116)
chr7 (5-49)||(37443673-37443717)
chr7 (1-41)||(39866718-39866758)
chr7 (5-49)||(44003441-44003485)
[»] chr1 (93 HSPs)
chr1 (3-132)||(5981224-5981356)
chr1 (1-132)||(31040761-31040895)
chr1 (1-130)||(31308053-31308185)
chr1 (1-129)||(38790196-38790327)
chr1 (1-129)||(39646620-39646751)
chr1 (1-129)||(50774269-50774400)
chr1 (1-128)||(3611188-3611318)
chr1 (1-117)||(24245037-24245155)
chr1 (1-128)||(25678259-25678389)
chr1 (1-128)||(36566382-36566512)
chr1 (1-128)||(45538205-45538335)
chr1 (1-128)||(47317367-47317497)
chr1 (1-130)||(44662022-44662154)
chr1 (1-117)||(4068695-4068813)
chr1 (1-132)||(17994947-17995081)
chr1 (1-128)||(21139412-21139542)
chr1 (1-128)||(25058740-25058870)
chr1 (1-128)||(26085398-26085528)
chr1 (1-128)||(47671638-47671768)
chr1 (1-128)||(51057123-51057253)
chr1 (1-131)||(6327545-6327677)
chr1 (1-131)||(47187157-47187290)
chr1 (1-130)||(38331857-38331989)
chr1 (1-126)||(43251763-43251891)
chr1 (3-131)||(23984809-23984940)
chr1 (1-129)||(41999867-41999998)
chr1 (1-128)||(26277229-26277359)
chr1 (1-128)||(35273648-35273778)
chr1 (1-117)||(3285454-3285571)
chr1 (1-131)||(24885553-24885686)
chr1 (1-130)||(23932507-23932639)
chr1 (1-128)||(2450546-2450676)
chr1 (1-86)||(25518866-25518952)
chr1 (1-128)||(37620192-37620322)
chr1 (1-117)||(46784475-46784593)
chr1 (1-128)||(46967041-46967171)
chr1 (1-89)||(23220970-23221059)
chr1 (1-128)||(33112818-33112947)
chr1 (1-116)||(42863917-42864034)
chr1 (1-130)||(35692661-35692793)
chr1 (1-125)||(28888633-28888760)
chr1 (1-129)||(46616601-46616732)
chr1 (3-130)||(4808699-4808829)
chr1 (1-117)||(26794356-26794474)
chr1 (1-106)||(45475866-45475972)
chr1 (1-128)||(51045596-51045726)
chr1 (1-130)||(26524887-26525019)
chr1 (3-128)||(47383732-47383860)
chr1 (1-87)||(31844428-31844515)
chr1 (1-129)||(33884140-33884271)
chr1 (1-129)||(33959981-33960112)
chr1 (1-131)||(36003182-36003318)
chr1 (1-117)||(49253987-49254105)
chr1 (1-130)||(42234892-42235012)
chr1 (1-117)||(5980120-5980238)
chr1 (1-128)||(49398988-49399118)
chr1 (1-130)||(42313359-42313491)
chr1 (1-64)||(51403074-51403137)
chr1 (1-130)||(48373556-48373679)
chr1 (1-129)||(4156439-4156577)
chr1 (1-131)||(4953104-4953226)
chr1 (1-127)||(6626025-6626143)
chr1 (38-128)||(13312531-13312624)
chr1 (1-131)||(47772169-47772302)
chr1 (50-128)||(27983603-27983683)
chr1 (58-128)||(30289910-30289982)
chr1 (1-67)||(2556909-2556976)
chr1 (1-128)||(2657355-2657474)
chr1 (1-128)||(41467632-41467751)
chr1 (5-49)||(5961338-5961382)
chr1 (5-49)||(27924729-27924773)
chr1 (1-72)||(31979993-31980065)
chr1 (58-128)||(41895164-41895236)
chr1 (1-106)||(24215815-24215911)
chr1 (1-59)||(33187392-33187451)
chr1 (5-55)||(2954911-2954961)
chr1 (58-115)||(13281576-13281634)
chr1 (58-130)||(33073310-33073384)
chr1 (3-48)||(39637950-39637996)
chr1 (70-128)||(7561528-7561588)
chr1 (1-45)||(13313249-13313293)
chr1 (1-130)||(29770722-29770843)
chr1 (71-128)||(31286504-31286563)
chr1 (58-130)||(10928166-10928240)
chr1 (58-115)||(34752328-34752386)
chr1 (1-41)||(26472258-26472298)
chr1 (5-49)||(26685912-26685956)
chr1 (1-41)||(32448700-32448740)
chr1 (1-41)||(35991678-35991718)
chr1 (5-49)||(38716318-38716362)
chr1 (5-49)||(39475854-39475897)
chr1 (1-41)||(44544125-44544165)
chr1 (5-49)||(52367939-52367983)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (1-128)||(1921-2051)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (1-128)||(11133-11263)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-130)||(13760-13892)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-129)||(176706-176837)
scaffold0007 (1-130)||(278058-278192)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (3-129)||(3133-3262)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (1-130)||(18852-18984)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (1-117)||(2444-2562)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-131)||(75241-75374)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-87)||(32613-32700)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (3-128)||(4596-4724)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (58-128)||(7190-7262)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (3-48)||(4626-4671)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (3-48)||(3447-3492)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (5-49)||(14800-14844)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (5-49)||(20548-20592)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 37255467 - 37255336
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  37255467 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattaccca 37255368  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37255367 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 37255336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 23901830 - 23901960
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23901830 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 23901929  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23901930 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23901960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 32948497 - 32948626
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  32948497 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 32948595  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacc 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32948596 tcattcttctatgggtactctagttgtcacc 32948626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 17600887 - 17601019
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17600887 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 17600986  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17600987 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 17601019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 27024466 - 27024598
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27024466 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 27024565  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27024566 ttattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 27024598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 34518418 - 34518550
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34518418 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 34518517  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
      ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34518518 ctattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 34518550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27651164 - 27651033
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27651164 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 27651065  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27651064 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 27651033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 11185023 - 11185153
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11185023 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 11185122  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11185123 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11185153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 32327412 - 32327542
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32327412 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatcca 32327511  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  32327512 tcattcttccataggtaccctagttgtcacc 32327542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 14660497 - 14660628
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14660497 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattaccca 14660596  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  14660597 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacct 14660628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 40635269 - 40635400
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40635269 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 40635368  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  40635369 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40635400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 746517 - 746647
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  746517 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 746616  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  746617 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 746647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2325019 - 2324885
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2325019 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 2324920  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
     |||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  2324919 ccattcttccatgaataccctagttgtcaccttta 2324885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 4609677 - 4609807
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4609677 tgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 4609776  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4609777 acattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4609807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13815348 - 13815218
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13815348 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 13815249  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     | |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  13815248 cctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 13815218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14697667 - 14697537
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggt-tgggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  14697667 tgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattaccca 14697568  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14697567 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 14697537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 45371041 - 45371171
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  45371041 tgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 45371140  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45371141 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45371171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6594588 - 6594455
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  6594588 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 6594489  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6594488 ccatttttccatgggtaccctagttgtcaccttt 6594455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 4034643 - 4034775
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4034643 tgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 4034742  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4034743 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 4034775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295018
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtcccctt 25295018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 40037194 - 40037325
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  40037194 tgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 40037293  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40037294 tcatttttc-atgggtaccctagttgtcacctt 40037325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 6430524 - 6430642
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  6430524 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 6430623  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||||||||    
T  6430624 ccattcttccatgggtacc 6430642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 38997152 - 38997282
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  38997152 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattaccca 38997251  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  38997252 ccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1092081 - 1091948
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  1092081 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 1091982  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1091981 ccatttttccatgggtaccctagttgtcaccttt 1091948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 32856566 - 32856434
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  32856566 tgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattaccca 32856467  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  32856466 ccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 32856434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 10424646 - 10424773
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  10424646 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattaccca 10424745  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtc 125  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10424746 ccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 15925131 - 15925238
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15925131 tgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatcca 15925230  T
Q  99 tcattctt 106  Q
    ||||||||    
T  15925231 tcattctt 15925238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 10244712 - 10244582
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  10244712 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattaccca 10244613  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  10244612 ccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 11159672 - 11159802
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattgg-ttgggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||  || |||||||||| | |||||||||| |||    
T  11159672 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccacttaaaaatgtgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattaccca 11159771  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11159772 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 26710396 - 26710526
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26710396 tgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattaccca 26710495  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  26710496 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 26710526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 27400454 - 27400584
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27400454 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 27400553  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  27400554 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 27400584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33427777 - 33427644
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  33427777 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacaca 33427678  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  33427677 ccattctttcatgggtaccctagttatcaccttt 33427644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2914268 - 2914138
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  2914268 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattaccca 2914169  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  2914168 ccattcttccatggatatcctagttgtcacc 2914138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 5726180 - 5726310
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5726180 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccacttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 5726279  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  5726280 ccattcttccatggataccctagttgtcacc 5726310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 9444741 - 9444850
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9444741 tgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 9444840  T
Q  99 tcattcttct 108  Q
     |||| ||||    
T  9444841 ccattattct 9444850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7892818 - 7892686
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattgg-ttgggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  7892818 tgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattaccca 7892719  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| || | || |||||||||||||||    
T  7892718 ccattcttccatagataccctagttgtcacctt 7892686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37621000 - 37620867
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggat---caagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattgg-ttgggtaaattat 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  37621000 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattat 37620901  T
Q  96 ccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  37620900 ccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 37620867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 40735515 - 40735633
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  40735515 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattaccca 40735614  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  40735615 tcattcttccatgagtacc 40735633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 8433046 - 8432942
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8433046 tgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccactttaaaatatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 8432947  T
Q  99 tcatt 103  Q
     ||||    
T  8432946 ccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 32608431 - 32608518
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32608431 tgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 32608518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 1229678 - 1229793
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| | ||||||||||| ||||||| |||    
T  1229678 tgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattaccca 1229777  T
Q  99 tcattcttctatgggt 114  Q
     |||||||| ||||||    
T  1229778 ccattcttccatgggt 1229793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 447737 - 447633
Alignment:
Q  27 tcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttg 123  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||    
T  447737 tcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctagttg 447638  T
Q  124 tcacc 128  Q
    |||||    
T  447637 tcacc 447633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 42899966 - 42900033
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtg 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  42899966 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgcgcttatgtg 42900033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 12842154 - 12842241
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc-actaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg 87  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| | ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  12842154 tgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaattaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggg 12842241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014861
Alignment:
Q  21 gtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg 87  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 28014861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 35158169 - 35158050
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  35158169 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccat 35158080  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  35158079 cattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35158050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 41172509 - 41172596
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg 87  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41172509 tgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 41172596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 43899042 - 43898971
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  43899042 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 43898971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12333567 - 12333497
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatcattcttctatgggtacctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||   |||||||||||||    
T  12333567 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccatcattctttcatggtagcctagttgtcacc 12333497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13543696 - 13543622
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13543696 tgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 13543622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Original strand, 34249363 - 34249437
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  34249363 tgcttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 34249437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39301316 - 39301197
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39301316 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccat 39301227  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||||    
T  39301226 cattctttcatggatagcctagttgtcacc 39301197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 145333 - 145455
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||           ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  145333 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatacg----------tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccat 145422  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  145423 cattctttcatgggtagcctagttgtcaacttt 145455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 39103145 - 39103216
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39103145 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 27331349 - 27331476
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||       | || ||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  27331349 tgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatat------atatgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccat 27331442  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  27331443 cattctttcatgggtagcctaattgtcaccttta 27331476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28641411 - 28641292
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28641411 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 28641322  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28641321 tattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28641292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 29687092 - 29687211
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  29687092 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccat 29687181  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29687182 cattctttcatgggtagcctagttgtcacc 29687211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 3711684 - 3711805
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3711684 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 3711773  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  3711774 cattctttcatgggtagcctagttgccacctt 3711805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 4258587 - 4258659
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  4258587 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcacc 4258659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 12730112 - 12730233
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||          ||| || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  12730112 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat----------aaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccat 12730201  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||  |||| || |||||||| ||||||    
T  12730202 cattctttcatggatagcctagttgccacctt 12730233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 103
Target Start/End: Original strand, 12827142 - 12827217
Alignment:
Q  29 aagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcatt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  12827142 aagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 12827217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19428498 - 19428426
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  19428498 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 19428426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 35126835 - 35126879
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35126835 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 35126879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 44481883 - 44481927
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44481883 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 44481927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 28566770 - 28566703
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttg 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  28566770 tgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttg 28566703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2688801 - 2688727
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  2688801 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacctt 2688727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Original strand, 30545874 - 30545931
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatg 59  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  30545874 aaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatacaatctaaaaatatg 30545931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 126
Target Start/End: Original strand, 3266399 - 3266455
Alignment:
Q  72 atgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatgggt-acctagttgtca 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  3266399 atgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 40544195 - 40544155
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  40544195 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 130
Target Start/End: Original strand, 42900781 - 42900837
Alignment:
Q  75 tgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggtacctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42900781 tgtattggttgagataaattacccaccattcttccatgtgtacctagttgtcacctt 42900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 43356147 - 43356187
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  43356147 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 43356187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 112)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 48657870 - 48658003
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48657870 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatcca 48657969  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48657970 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttt 48658003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21366739 - 21366609
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21366739 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 21366640  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21366639 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 21366609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31532265 - 31532135
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31532265 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 31532166  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31532165 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31532135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 34276599 - 34276732
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34276599 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 34276698  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34276699 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttt 34276732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 146559 - 146425
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  146559 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattaccca 146460  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcaccttta 132  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  146459 ccattcttctatgcgtactctagttgtcaccttta 146425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2826811 - 2826681
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2826811 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 2826712  T
Q  99 tcattcttctatgggtacctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  2826711 ccattcttccatggtaccctagttgtcacct 2826681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 9798517 - 9798647
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9798517 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 9798616  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9798617 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9798647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32366790 - 32366656
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  32366790 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattaccca 32366691  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  32366690 ccattcttccatgggtaccctagttgtcactttta 32366656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 44984813 - 44984943
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  44984813 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 44984912  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44984913 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44984943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 54575070 - 54574940
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  54575070 tgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 54574971  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54574970 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54574940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 54608014 - 54608132
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54608014 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 54608113  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  54608114 tcattcttccatggatacc 54608132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 55519879 - 55520009
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  55519879 tgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattaccca 55519978  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  55519979 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 55520009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19387818 - 19387686
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19387818 tgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 19387719  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19387718 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 19387686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 50457940 - 50457812
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  50457940 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattataca 50457841  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtca 126  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  50457840 ccattcttccatgggtaccctagttgtca 50457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 53461946 - 53461814
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  53461946 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 53461847  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  53461846 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 53461814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22618642 - 22618512
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| |||     
T  22618642 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttaggtaaattacccac 22618544  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22618543 cattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 22618512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 42085259 - 42085390
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  42085259 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 42085358  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc-tagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  42085359 ccattcttccatgggtaccatagttgtcacct 42085390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18462143 - 18462013
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  18462143 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcaccca 18462044  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18462043 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 18462013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26091388 - 26091258
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26091388 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 26091289  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26091288 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26091258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532826
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccat 36532857  T
Q  103 tcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  36532856 tcttccatgggtatcctagttgtcaccttta 36532826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 47344708 - 47344838
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  47344708 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattca 47344807  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47344808 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 56023128 - 56022998
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  56023128 tgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatcca 56023029  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  56023028 tcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 56022998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 50534685 - 50534802
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  50534685 aaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 50534784  T
Q  101 attcttctatgggtacct 118  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  50534785 attcttccatgggtacct 50534802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 53854559 - 53854430
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  53854559 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 53854460  T
Q  99 tcattcttctatgggtacctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  53854459 ccattcttccatggtaccctagttgtcacc 53854430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 237529 - 237661
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  237529 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 237628  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  237629 ccattcttccatgggtaccctagttatcacctt 237661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 397454 - 397582
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  397454 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 397553  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtca 126  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||    
T  397554 ccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 407806 - 407934
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  407806 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaattatccacc 407905  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  407906 attctttcatgggtaccctagttgtcacc 407934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 41560382 - 41560498
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| ||| |    
T  41560382 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccacc 41560481  T
Q  101 attcttctatgggtacc 117  Q
    ||||||| |||||||||    
T  41560482 attcttccatgggtacc 41560498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 50234052 - 50234184
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  50234052 tgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 50234151  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  50234152 ccattcttctatggataccctagttgtcacctt 50234184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 31914250 - 31914380
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31914250 tgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 31914348  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31914349 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 31914380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 39077597 - 39077728
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  39077597 tgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 39077696  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39077697 acattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39077728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 55056389 - 55056258
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  55056389 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 55056290  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  55056289 ccattctttcatgggtacccttgttgtcacct 55056258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 23437644 - 23437774
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  23437644 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 23437743  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23437744 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23437774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 42765971 - 42765838
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42765971 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 42765873  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc-tagttgtcaccttta 132  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42765872 ccattcttccatgggtaccttagttgtcaccttta 42765838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 50536754 - 50536636
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  50536754 tgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaatatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattaccca 50536655  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     ||||||||||||||||||    
T  50536654 ccattcttctatgggtacc 50536636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 6019980 - 6020109
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  6019980 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 6020079  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6020080 ccattcttccatgggtaccctagttgtcac 6020109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Original strand, 6285361 - 6285486
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  6285361 aaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 6285460  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtc 125  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6285461 attcttccatgggtaccctagttgtc 6285486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 38591720 - 38591848
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  38591720 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt---aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccac 38591816  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38591817 cattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 38591848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 45797531 - 45797664
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  45797531 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccta 45797630  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  45797631 ccattcttccataggtaccctagttgtcaccttt 45797664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 51363059 - 51363188
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  51363059 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 51363158  T
Q  99 tcattcttctatgggtacctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  51363159 ccattcttccatggtaccctagttgtcacc 51363188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 52728436 - 52728307
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  52728436 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgaggtaaattaccca 52728337  T
Q  99 tcattcttctatgggtacctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  52728336 ccattcttccatggtaccctagttgtcacc 52728307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 47662232 - 47662100
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  47662232 tgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 47662133  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47662132 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacctt 47662100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 35446557 - 35446675
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35446557 tgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 35446656  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||||||||    
T  35446657 ccattcttccatgggtacc 35446675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 23609140 - 23609257
Alignment:
Q  2 gaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||     
T  23609140 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcac 23609239  T
Q  100 cattcttctatgggtacc 117  Q
    |||||||| |||||||||    
T  23609240 cattcttccatgggtacc 23609257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 27373128 - 27373241
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27373128 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 27373227  T
Q  99 tcattcttctatgg 112  Q
     |||||||| ||||    
T  27373228 ccattcttccatgg 27373241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 41702589 - 41702456
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41702589 tgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 41702490  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  41702489 ccattcttccatggataccctagttgtcatcttt 41702456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 48313609 - 48313737
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| | |||||||| |||||||||| |||     
T  48313609 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaatatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccac 48313707  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  48313708 catttttccatgggtaccctagttgtcacc 48313737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 55776097 - 55776229
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  55776097 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 55776195  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||  ||  ||| ||||||||||||||||    
T  55776196 ccattctttcataagtaccctagttgtcaccttt 55776229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 55840275 - 55840407
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  55840275 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 55840373  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||  ||  ||| ||||||||||||||||    
T  55840374 ccattctttcataagtaccctagttgtcaccttt 55840407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 2243510 - 2243642
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  2243510 tgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattaccca 2243609  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2243610 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacctt 2243642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3692340 - 3692208
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3692340 tgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 3692241  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3692240 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 3692208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22468900 - 22468796
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  22468900 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 22468801  T
Q  99 tcatt 103  Q
     ||||    
T  22468800 ccatt 22468796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31070203 - 31070072
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  31070203 tgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 31070105  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31070104 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 31070072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 1932815 - 1932949
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1932815 tgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatcca 1932914  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  1932915 tcattttttcatgggtaccctagttatcaccttta 1932949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 29478412 - 29478542
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  29478412 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattaccca 29478511  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  29478512 ccattcttccataggtaccctagttgtcacc 29478542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 31972466 - 31972348
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  31972466 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 31972367  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||  |||||||||    
T  31972366 ccattctttcatgggtacc 31972348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 42222343 - 42222473
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  42222343 tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacaca 42222442  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42222443 ccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 42222473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 49881193 - 49881059
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-----taaatta 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||     |||||||    
T  49881193 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaatta 49881094  T
Q  95 tccatcattcttctatgggtac-ctagttgtcacc 128  Q
     ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  49881093 cccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 49881059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 54086461 - 54086590
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  54086461 tgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccgcttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattaccca 54086559  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54086560 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54086590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 54425034 - 54425163
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  54425034 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattaccca 54425133  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacc 128  Q
      ||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  54425134 cgattcttccat-ggtacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 129
Target Start/End: Original strand, 3170680 - 3170809
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  3170680 aaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 3170779  T
Q  101 attcttctatgggtac-ctagttgtcacct 129  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  3170780 attcttccatggatactctagttgtcacct 3170809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39587909 - 39587781
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  39587909 tgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattaccca 39587810  T
Q  99 tcattcttctatgggtacctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  39587809 ccattcttccat-ggtacctaattgtcacc 39587781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 53834184 - 53834055
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||| |||    
T  53834184 tgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattaccca 53834085  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
     |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  53834084 ccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14017503 - 14017372
Alignment:
Q  2 gaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |   |    
T  14017503 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact-taagtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgcc 14017405  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14017404 attcttccatgggtaccctagttgtcaccttta 14017372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 41949436 - 41949566
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgct--tatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41949436 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 41949535  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||  || |||| |||||||||||||    
T  41949536 ccattctttcataggtaccctagttgtcacc 41949566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 43471825 - 43471694
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  43471825 tgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43471726  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  43471725 ccattcttccatggataccctagttgtcacct 43471694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 216
Target Start/End: Original strand, 51755461 - 51755524
Alignment:
Q  153 taatgagtagagtagtaggcatcttcttgtgtgagatcccatattcccattcacggtccccact 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51755461 taatgagtagagtagtaggcatcttcttgtgtgagatcccatattcccattgacggtccccact 51755524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 33897625 - 33897507
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||  ||||  ||||||| |||    
T  33897625 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattaccca 33897526  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  33897525 ccattcttctataggtacc 33897507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 42033229 - 42033357
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||   |||||| ||||||||| | ||||||| ||| |    
T  42033229 aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccacc 42033328  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42033329 attcttccatgggtaccctagttgtcacc 42033357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 117
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509466
Alignment:
Q  4 aaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatca 101  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  102 ttcttctatgggtacc 117  Q
    |||||| ||| |||||    
T  42509451 ttcttccatgagtacc 42509466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 52396778 - 52396865
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa-gatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  52396778 tgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41632136 - 41632007
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  41632136 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatatcgcttaaaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 41632038  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  41632037 tcattctttcatgggtatcctagttgtcacc 41632007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 29777387 - 29777255
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  29777387 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 29777288  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| |||| || |||| ||||||||||    
T  29777287 ccattcttccatggataccctaattgtcacctt 29777255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 127
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344968
Alignment:
Q  29 aagatagttcatggataccacta-aaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggtaaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtca 35344967  T
Q  127 c 127  Q
    |    
T  35344968 c 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 48259638 - 48259528
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatca 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  48259638 aaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccacttaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccacca 48259539  T
Q  102 ttcttctatgg 112  Q
    |||||| ||||    
T  48259538 ttcttccatgg 48259528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595869
Alignment:
Q  34 agttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 35595869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 51951734 - 51951851
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccat 99  Q
    ||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| |||     
T  51951734 tgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgtgtaaattacccac 51951833  T
Q  100 cattcttctatgggtacc 117  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  51951834 cattcttccatggatacc 51951851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 54805748 - 54805626
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatg----cttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaatta 94  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||     |||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  54805748 tgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatta 54805649  T
Q  95 tccatcattcttctatgggtacc 117  Q
      ||||||| ||| |||||||||    
T  54805648 ctcatcattgttccatgggtacc 54805626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 37239209 - 37239088
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37239209 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccat 37239120  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  37239119 cattctttcatgggtagcctagttgccacctt 37239088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 48654866 - 48654945
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtat 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  48654866 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 48654945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9998050 - 9997931
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  9998050 tgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccac 9997961  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9997960 cattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9997931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45633898 - 45633779
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  45633898 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 45633809  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  45633808 cattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 52688401 - 52688520
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||          ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  52688401 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaata----------tatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 52688490  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  52688491 cattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20351961 - 20351840
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccat 99  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||          | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20351961 tgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccat 20351872  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  20351871 cattctttcatgggtagtctagttgtcacctt 20351840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31881433 - 31881312
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  31881433 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcat 31881344  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  31881343 cattctttcatgggtagcctagttgccacctt 31881312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 54216365 - 54216482
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || || |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  54216365 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----------aatatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgat 54216454  T
Q  100 cattcttctatgggt-acctagttgtca 126  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  54216455 cattctttcatgggtaacctagttgtca 54216482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 33048991 - 33049062
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33048991 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 131
Target Start/End: Original strand, 43891027 - 43891102
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggtacc-tagttgtcaccttt 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  43891027 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcaccttt 43891102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15060408 - 15060289
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15060408 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccat 15060319  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  15060318 cattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15060289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 22620645 - 22620764
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  22620645 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccat 22620734  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22620735 cattcttttatgggtagcctagttgccacc 22620764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Original strand, 47812005 - 47812079
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  47812005 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcacctt 47812079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 43231556 - 43231601
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 48  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43231556 aaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 1662374 - 1662330
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1662374 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 1662330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 14335220 - 14335172
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  14335220 tgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccac 14335172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 27580175 - 27580219
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27580175 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27580219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 27872635 - 27872679
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27872635 aatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccac 27872679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 33289755 - 33289860
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||           ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33289755 tgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatacg----------tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 33289844  T
Q  100 cattcttctatgggta 115  Q
    |||||||  |||||||    
T  33289845 cattctttcatgggta 33289860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 128
Target Start/End: Original strand, 34552430 - 34552490
Alignment:
Q  70 taatgtgtattggttgg-gtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  34552430 taatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34552490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 38547716 - 38547672
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38547716 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 38547672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 54216808 - 54216748
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggtacc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||| ||||    
T  54216808 tgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggatacc 54216748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5117557 - 5117461
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5117557 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 5117468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27873620 - 27873548
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  27873620 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattct--tttgggtagcctagttgtcacctt 27873548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Original strand, 42558271 - 42558369
Alignment:
Q  27 tcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgt 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||       |||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  42558271 tcaagatagttcatagataccacttaaaa-------atgtggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagttgt 42558363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 46708860 - 46708764
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  46708860 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccat 46708771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 54710002 - 54709955
Alignment:
Q  60 cttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatcattcttc 107  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54710002 cttatgtaattaatgtttattggttgagtaaattatccaccattcttc 54709955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 27398718 - 27398668
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaa 55  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27398718 aatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 27398668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Original strand, 54715134 - 54715208
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  54715134 tgcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacctt 54715208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4486653 - 4486604
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctt 106  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4486653 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 4486604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 106
Target Start/End: Original strand, 52461462 - 52461511
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctt 106  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52461462 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 52461511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 573859 - 573903
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  573859 aatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 573903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 3293142 - 3293102
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  3293142 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 46720081 - 46720125
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  46720081 aatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggataccac 46720125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 39686 - 39554
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  39686 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 39587  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39586 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 39554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 739834 - 739703
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  739834 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattaccca 739735  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  739734 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 739703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3466811 - 3466680
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3466811 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 3466712  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3466711 ccattcttttatgggtaccctagttgtcacct 3466680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 35626090 - 35626221
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  35626090 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 35626189  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35626190 ccattcttccatgggtactctagttgtcacct 35626221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 43262313 - 43262182
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  43262313 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43262214  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43262213 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 43262182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 24253434 - 24253564
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24253434 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 24253533  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24253534 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24253564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27501185 - 27501055
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  27501185 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattaccca 27501086  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27501085 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 40886157 - 40886040
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  40886157 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccac 40886058  T
Q  100 cattcttctatgggtacc 117  Q
    |||||||| |||||||||    
T  40886057 cattcttccatgggtacc 40886040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 27938949 - 27939080
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27938949 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 27939048  T
Q  99 tcattcttctatgggt--acctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  27939049 ccattcttccatgggttaccctagttgtcacc 27939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 7722101 - 7722232
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattgg-ttgggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  7722101 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattaccca 7722200  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  7722201 ccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 7722232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 39932631 - 39932762
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  39932631 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaa 39932730  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39932731 ccattcttccatgggtactctagttgtcacct 39932762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15398612 - 15398483
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15398612 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 15398513  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcac 127  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  15398512 ccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 6901851 - 6901979
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  6901851 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 6901950  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtca 126  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6901951 ccattcttccatgggtaccctagttgtca 6901979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 29789425 - 29789293
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  29789425 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattaccca 29789326  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29789325 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 29789293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13504872 - 13504742
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  13504872 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatcca 13504773  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  13504772 ccattcttccatggataccctagttgtcacc 13504742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 15683843 - 15683973
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15683843 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 15683942  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  15683943 ccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18479798 - 18479680
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18479798 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 18479699  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     ||||||||||||| ||||    
T  18479698 ccattcttctatggatacc 18479680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 31938949 - 31939067
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31938949 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 31939048  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||||||||    
T  31939049 ccattcttccatgggtacc 31939067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 43326509 - 43326391
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  43326509 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43326410  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||||||||    
T  43326409 ccattcttccatgggtacc 43326391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 890958 - 891088
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| | |     
T  890958 tgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccacttaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctac 891057  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  891058 cattcttccatgggtatcctaattgtcacct 891088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2484422 - 2484292
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2484422 tgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 2484323  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2484322 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2484292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 5185024 - 5185154
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||  ||    
T  5185024 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactca 5185123  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5185124 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 12648849 - 12648979
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  12648849 tgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 12648948  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  12648949 ccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28424916 - 28424792
Alignment:
Q  10 gcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttc 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  28424916 gcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 28424817  T
Q  108 tatgggtac-ctagttgtcaccttt 131  Q
     |||| ||| |||||||||||||||    
T  28424816 catggatactctagttgtcaccttt 28424792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 34451302 - 34451432
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  34451302 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 34451401  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  34451402 ccattcttccatggataccctagttgtcacc 34451432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40278988 - 40278858
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||| |||    
T  40278988 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattaccca 40278889  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  40278888 tcattcttccatgaataccctagttgtcacc 40278858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 38756618 - 38756533
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||    
T  38756618 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttg 38756533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 5137767 - 5137875
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattg-gttgggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  5137767 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatcca 5137866  T
Q  99 tcattcttc 107  Q
     ||||||||    
T  5137867 ccattcttc 5137875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 40110286 - 40110393
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| |    
T  40110286 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatcta 40110384  T
Q  99 tcattcttc 107  Q
     ||||||||    
T  40110385 ccattcttc 40110393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 25831573 - 25831691
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25831573 tgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaattaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25831671  T
Q  99 tcattcttctatgggtacct 118  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  25831672 ccattctttcatgggtacct 25831691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27278607 - 27278474
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatag----ttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaatta 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  27278607 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaatta 27278508  T
Q  95 tccatcattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
     ||| |||||||| || |||| ||||||||||||    
T  27278507 cccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Original strand, 763777 - 763907
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||  |||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  763777 aaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatc 763876  T
Q  101 attcttctatgggtac-ctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  763877 attctttgatggatactctagttgtcacctt 763907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 40632551 - 40632597
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632551 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 40632597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 130
Target Start/End: Original strand, 13957770 - 13957843
Alignment:
Q  59 gcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13957770 gcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 13957843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 131
Target Start/End: Original strand, 5497372 - 5497447
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  5497372 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttt 5497447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 9424667 - 9424593
Alignment:
Q  55 atatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  9424667 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31294119 - 31293989
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||  | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||| |||    
T  31294119 tgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccacttaaaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattaccca 31294020  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31294019 ccattcttacatgggtaccctagttgtcacc 31293989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 19295829 - 19295901
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  19295829 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 19295901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23195367 - 23195246
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  23195367 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgt 23195278  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23195277 cattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 23195246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 38015633 - 38015512
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38015633 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 38015544  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  38015543 cattctttcatgggtagcctagttgccacctt 38015512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 42658781 - 42658676
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42658781 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 42658692  T
Q  100 cattcttctatgggta 115  Q
    |||||||  |||||||    
T  42658691 cattctttcatgggta 42658676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 38492665 - 38492761
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38492665 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccat 38492754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Original strand, 6973162 - 6973236
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  6973162 tgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgacacctt 6973236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 27503431 - 27503550
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  27503431 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcat 27503520  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  27503521 cattctttcatgggtagcctagttgtcacc 27503550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 36472399 - 36472354
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 50  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36472399 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccact 36472354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 1402620 - 1402576
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1402620 aatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 1402576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 14972077 - 14972149
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  14972077 tgcttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 14972149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 27390653 - 27390697
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27390653 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27390697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 33617637 - 33617758
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  33617637 tgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcac 33617726  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  33617727 cattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 33617758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 612833 - 612755
Alignment:
Q  55 atatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg--gtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  612833 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcacctt 612755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 48
Target Start/End: Original strand, 2585518 - 2585561
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 48  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2585518 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 2585561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 107
Target Start/End: Original strand, 4149774 - 4149844
Alignment:
Q  39 atggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttc 107  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  4149774 atggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttc 4149844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 106
Target Start/End: Original strand, 6206983 - 6207032
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctt 106  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6206983 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9171106 - 9171033
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  9171106 tgcttatgtggttaatgtgtattgattgggtaaattacttgtcattctttcataggtagcctagttgtcacctt 9171033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 36365517 - 36365468
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattctt 106  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36365517 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctt 36365468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3656640 - 3656568
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  3656640 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3656568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9374562 - 9374502
Alignment:
Q  70 taatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  9374562 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 13957722 - 13957762
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  13957722 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 13957762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 36948561 - 36948513
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatcattctt 106  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  36948561 tgcttatgtggctaatgtgtattggtagggtaaattacccaccattctt 36948513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 95)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 29625957 - 29625839
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  29625957 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 29625858  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     ||||||||||||||||||    
T  29625857 ccattcttctatgggtacc 29625839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32234527 - 32234394
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  32234527 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccac 32234428  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32234427 tattcttccatgggtaccctagttgtcaccttta 32234394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 35748441 - 35748310
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  35748441 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 35748342  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  35748341 tcattcttccatggataccctagttgtcacct 35748310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 43125883 - 43126014
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  43125883 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43125982  T
Q  99 tcattcttctatgggtacctagttgtcacctt 130  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43125983 ccattcttttataggtacctagttgtcacctt 43126014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 43612177 - 43612045
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  43612177 tgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43612078  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43612077 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 43612045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 47257845 - 47257979
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  47257845 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 47257944  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  47257945 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttta 47257979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Original strand, 49330091 - 49330221
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  49330091 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatc 49330190  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  49330191 attcttccatgggtaccctagttgtcacctt 49330221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 41293448 - 41293315
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  41293448 tgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccacttaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccac 41293349  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41293348 cattcttctatgggtaccctaattgtcaccttta 41293315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 51170163 - 51170034
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  51170163 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 51170064  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc-tagttgtcac 127  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51170063 ccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 52629006 - 52629135
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52629006 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 52629105  T
Q  99 tcattcttctatgggtacctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  52629106 ccattcttccatggtaccctagttgtcacc 52629135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 38416854 - 38416722
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  38416854 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 38416755  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38416754 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 38416722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47809727 - 47809593
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt--gggtaaattatcc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  47809727 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattaccc 47809628  T
Q  98 atcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  47809627 accattcttccatgggtaccctagttgtcaccttt 47809593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 48739363 - 48739232
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  48739363 tgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 48739264  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  48739263 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 48739232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 24100335 - 24100464
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24100335 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 24100433  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24100434 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24100464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 41464404 - 41464534
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  41464404 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 41464503  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41464504 gcattcttccatgggtactctagttgtcacc 41464534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 22399149 - 22399278
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  22399149 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccacttaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccac 22399248  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22399249 cattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22399278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 52638894 - 52639027
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  52638894 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattaccca 52638993  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52638994 ccattattctatgggtaccctagttgtcaccttt 52639027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 53943717 - 53943585
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  53943717 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 53943618  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  53943617 ccattcttccat-ggtactctagttgtcaccttt 53943585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7855244 - 7855112
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  7855244 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattaccca 7855145  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7855144 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 7855112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 48609775 - 48609903
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  48609775 tgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 48609874  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtca 126  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48609875 ccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27067108 - 27066977
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27067108 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 27067009  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  27067008 tcattcttccatggataccctagttgtcacct 27066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 46126039 - 46126170
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  46126039 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 46126138  T
Q  99 tcattcttctatgggtacctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  46126139 ccattcttccatggtaccctagttgtcacctt 46126170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28048522 - 28048392
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtatt-ggttgggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||   |||||||||||| |||    
T  28048522 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattaccca 28048423  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28048422 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28048392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 37324593 - 37324723
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  37324593 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 37324692  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37324693 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 44222881 - 44223011
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44222881 tgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 44222980  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44222981 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44223011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 55453374 - 55453245
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  55453374 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 55453275  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
     |||||||| || |||| ||||||||||||    
T  55453274 ccattcttccataggtaccctagttgtcac 55453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7755436 - 7755304
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||| | ||||    
T  7755436 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccacttaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccat 7755337  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  7755336 cattcttccatgggtaccctacttgtcaccttt 7755304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 40131089 - 40130957
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40131089 tgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 40130990  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  40130989 ccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 40130957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 44806736 - 44806868
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  44806736 tgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatcca 44806835  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
      ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  44806836 caattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 44806868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 47894950 - 47894822
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  47894950 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatcca 47894851  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtca 126  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  47894850 ccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 40419887 - 40420018
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||  ||    
T  40419887 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactca 40419986  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  40419987 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40420018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 40804640 - 40804509
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  40804640 tgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattaccca 40804541  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40804540 ccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 40804509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 46134408 - 46134515
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  46134408 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattca 46134507  T
Q  99 tcattctt 106  Q
     |||||||    
T  46134508 ccattctt 46134515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 46949426 - 46949553
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccat 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  46949426 tgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggataaattacccac 46949525  T
Q  100 cattcttctatgggtacctagttgtcac 127  Q
    |||||||| |||| || || ||||||||    
T  46949526 cattcttccatggatatcttgttgtcac 46949553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5560154 - 5560025
Alignment:
Q  4 aaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtga--ttaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  5560154 aaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccac 5560055  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  5560054 cattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Original strand, 35594175 - 35594305
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |    
T  35594175 aaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccacc 35594274  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  35594275 attcttccatgggtaccctagttgttacctt 35594305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 40643852 - 40643982
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40643852 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 40643951  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40643952 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 40643982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 51452880 - 51452747
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  51452880 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 51452781  T
Q  99 tcattcttctatgggtacctagttgtcaccttta 132  Q
    ||||||||| ||||   |||| ||||||||||||    
T  51452780 tcattcttccatggtaccctaattgtcaccttta 51452747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 39053446 - 39053578
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  39053446 tgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattaccca 39053545  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacctt 130  Q
    ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||    
T  39053546 tcatttttttatggatactctagttgtcacctt 39053578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 39634701 - 39634570
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  39634701 tgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 39634603  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
      ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39634602 caattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 39634570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 43183964 - 43184092
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  43183964 tgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactca 43184063  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtca 126  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||    
T  43184064 ccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 2666052 - 2666183
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  2666052 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattaccca 2666151  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacct 129  Q
      ||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  2666152 ctattctttcatgggtactctagttgtcacct 2666183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 52215128 - 52215243
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  52215128 tgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 52215227  T
Q  99 tcattcttctatgggt 114  Q
     |||||||||||||||    
T  52215228 ccattcttctatgggt 52215243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 42291894 - 42292028
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42291894 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 42291993  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  42291994 ccattcttccataggtaccctagttgtcaccttta 42292028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 24376625 - 24376730
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  24376625 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattaccca 24376724  T
Q  99 tcattc 104  Q
     |||||    
T  24376725 ccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20754523 - 20754391
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20754523 tgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 20754424  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  20754423 ccattattccatgagtaccctagttgtcacctt 20754391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864674
Alignment:
Q  9 agcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatcattcttc 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||   |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagtaaattacccaccattcttc 52864649  T
Q  108 tatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  52864650 catgggtaccctagttgtcaccttt 52864674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 18946955 - 18947086
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| |||    
T  18946955 tgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattaccca 18947054  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  18947055 ccattcttccatgggtaccctacttgtcacct 18947086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 37313451 - 37313581
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37313451 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 37313550  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  37313551 ccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 37313581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 41732580 - 41732698
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  41732580 tgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 41732679  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     ||| |||| |||| ||||    
T  41732680 ccatccttccatggatacc 41732698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 51146345 - 51146227
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  51146345 tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattaccca 51146246  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||  |||||||||    
T  51146245 ccattctttcatgggtacc 51146227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 36368993 - 36369086
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaatta 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  36368993 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaatta 36369086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 53637893 - 53637988
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaatta 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53637893 tgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaatta 53637988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 41216507 - 41216641
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||    
T  41216507 tgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattaccca 41216606  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcaccttta 132  Q
      ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  41216607 ctattcttccataggtactctagttgtcaccttta 41216641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 51102508 - 51102378
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  51102508 tgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 51102409  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     ||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  51102408 ccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550464
Alignment:
Q  16 tgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatggg 113  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  114 ta-cctagttgtcaccttt 131  Q
    || ||||||||||||||||    
T  33550482 taccctagttgtcaccttt 33550464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 53832614 - 53832506
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc-actaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||||||   |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  53832614 tgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaattaaaaaggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatcca 53832515  T
Q  99 tcattcttc 107  Q
     ||||||||    
T  53832514 ccattcttc 53832506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 47182052 - 47182131
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtat 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  47182052 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 47182131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 43021766 - 43021896
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggt-gggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcc 97  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||   |||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  43021766 tgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattaccc 43021865  T
Q  98 atcattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
    | |||||||  || |||| ||||||||||||    
T  43021866 accattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 37758981 - 37759068
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg 87  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37758981 tgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggg 37759068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 48546959 - 48546894
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtg 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48546959 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaa-atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 48546894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 54159118 - 54159051
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtg 67  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54159118 tgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 54159051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 55000250 - 55000175
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  55000250 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttt 55000175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Original strand, 49130677 - 49130751
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49130677 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtctcctt 49130751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 17665643 - 17665549
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17665643 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccat 17665554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 25641698 - 25641820
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||          ||| || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25641698 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat----------aaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 25641787  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  25641788 cattctttcatgggtagcctagttgccaccttt 25641820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 38156704 - 38156632
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  38156704 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 42589882 - 42590003
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42589882 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 42589971  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  42589972 cattctttcatgggtagcctagttgccacctt 42590003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 51416021 - 51416142
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  51416021 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcat 51416110  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  51416111 cattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 51416142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 21597263 - 21597220
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 48  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21597263 aatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 21597220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 39141245 - 39141122
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||         || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  39141245 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat--------atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccat 39141154  T
Q  100 cattcttctatgggtacctagttgtcaccttt 131  Q
    |||||||  ||||  |||||||| ||||||||    
T  39141153 cattctttcatggtaacctagttatcaccttt 39141122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44946007 - 44945933
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  44946007 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcacctt 44945933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 52756129 - 52756067
Alignment:
Q  68 attaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  52756129 attaatgtgtattggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 52756067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Original strand, 53115503 - 53115553
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaa 55  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  53115503 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 53115553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 54707292 - 54707219
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  54707292 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacct 54707219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 30251616 - 30251572
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30251616 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 30251572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 51224110 - 51224038
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  51224110 tgcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 51224038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 54401239 - 54401344
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  54401239 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 54401328  T
Q  100 cattcttctatgggta 115  Q
    |||||||  |||||||    
T  54401329 cattctttcatgggta 54401344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 55380041 - 55380085
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  55380041 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 55380085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 28576231 - 28576184
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 48  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28576231 tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 34279840 - 34279744
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34279840 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 34279751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 41882106 - 41882063
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 48  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41882106 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 50732029 - 50731986
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 48  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  50732029 aatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50731986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 48
Target Start/End: Original strand, 50780827 - 50780870
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 48  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  50780827 aatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50780870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31286865 - 31286791
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  31286865 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcacctt 31286791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 41635872 - 41635798
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatgggt-acctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  41635872 tgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcacctt 41635798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 47511059 - 47510940
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  47511059 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcat 47510970  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  47510969 cattctttcatgggtagcctagttgtcacc 47510940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 48534079 - 48534005
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  48534079 tgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 48534005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 128
Target Start/End: Original strand, 24688216 - 24688285
Alignment:
Q  61 ttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggt-acctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  24688216 ttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 128
Target Start/End: Original strand, 37028825 - 37028894
Alignment:
Q  61 ttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  37028825 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37028894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 8847775 - 8847723
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaa 55  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  8847775 aaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccacttaaaa 8847723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Original strand, 25353614 - 25353654
Alignment:
Q  9 agcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25353614 agcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 25353654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 42998904 - 42998860
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42998904 aatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 42998860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 45058935 - 45058975
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  45058935 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 45058975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 51143873 - 51143917
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  51143873 aatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccac 51143917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 2892240 - 2892373
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2892240 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 2892339  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2892340 ccattcttctatgggtaccctagttgtcatcttt 2892373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 11989104 - 11988973
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11989104 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 11989005  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11989004 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 11988973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22551191 - 22551061
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22551191 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacctaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 22551092  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22551091 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22551061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34527992 - 34527858
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34527992 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 34527893  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34527892 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttta 34527858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 5882558 - 5882691
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5882558 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 5882657  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5882658 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttt 5882691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2593982 - 2593850
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2593982 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatcca 2593883  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  2593882 ccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 2593850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22341918 - 22341786
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22341918 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 22341819  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc-tagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22341818 ccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 22341786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26377334 - 26377202
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26377334 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 26377235  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26377234 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 26377202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18101625 - 18101495
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18101625 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 18101526  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18101525 tcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 18101495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 129
Target Start/End: Original strand, 24168145 - 24168274
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  24168145 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 24168244  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24168245 attcttccatgggtaccctagttgtcacct 24168274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19415663 - 19415531
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19415663 tgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 19415564  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19415563 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 19415531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 8615292 - 8615422
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8615292 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 8615391  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
      ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8615392 ctattcttccatgggtaccctagttgtcacc 8615422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14891509 - 14891391
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14891509 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 14891410  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||||||||    
T  14891409 ccattcttccatgggtacc 14891391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7393716 - 7393583
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  7393716 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 7393617  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc-tagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  7393616 ccattcttccatgggtaccataattgtcaccttt 7393583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 5294931 - 5294799
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||  ||    
T  5294931 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactca 5294832  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  5294831 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 5294799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 5299483 - 5299351
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||  ||    
T  5299483 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactca 5299384  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  5299383 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 5299351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 599944 - 600074
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  599944 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatcca 600043  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  600044 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 600074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 7345242 - 7345134
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  7345242 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 7345143  T
Q  99 tcattcttc 107  Q
     ||||||||    
T  7345142 ccattcttc 7345134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 16703418 - 16703534
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  16703418 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgca 16703517  T
Q  99 tcattcttctatgggta 115  Q
    ||||||||| |||||||    
T  16703518 tcattcttccatgggta 16703534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 1970763 - 1970894
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1970763 tgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 1970862  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  1970863 ccattcttccatgggtactttagttgtcacct 1970894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 10508034 - 10507907
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| || ||| |||    
T  10508034 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccat 10507935  T
Q  103 tcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  10507934 tcttcgatggctaccctagttgtcacct 10507907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19281183 - 19281056
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  19281183 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 19281084  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
    ||||||  || |||| ||||||||||||    
T  19281083 attctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24224200 - 24224105
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaatta 94  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24224200 tgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaatta 24224105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 28947139 - 28947269
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28947139 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 28947238  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28947239 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28947269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 960031 - 959904
Alignment:
Q  4 aaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatca 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  960031 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 959932  T
Q  102 ttcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  959931 ttctttcatgggtaccctagttgtcacc 959904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33452702 - 33452572
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  33452702 tgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 33452603  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33452602 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 33452572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23262059 - 23261926
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23262059 tgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtattggttggggtaaattatcca 23261960  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     | |||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  23261959 ccgttctttcataggtaccctagttgtcaccttt 23261926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 30743578 - 30743491
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg 87  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  30743578 tgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggg 30743491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 30467733 - 30467656
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||||    
T  30467733 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaacatgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28948920 - 28948845
Alignment:
Q  55 atatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28948920 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28948845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 18661833 - 18661905
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  18661833 tgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 18661905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 129
Target Start/End: Original strand, 15965535 - 15965605
Alignment:
Q  61 ttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  15965535 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 15965605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 3786848 - 3786920
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  3786848 tgcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3786920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 115
Target Start/End: Original strand, 13329480 - 13329538
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  13329480 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 13329538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 1939623 - 1939579
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggata 45  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  1939623 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 4487579 - 4487619
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  4487579 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 4487619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 128
Target Start/End: Original strand, 4487638 - 4487698
Alignment:
Q  70 taatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  4487638 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 7167638 - 7167682
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7167638 aatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccac 7167682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13356250 - 13356118
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13356250 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 13356151  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13356150 tcattcttccatgggtactctagttgtcacctt 13356118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 2275965 - 2276096
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  2275965 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccat 2276064  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  2276065 cattcttccatgggtagactagttgtcacctt 2276096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 32984207 - 32984075
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  32984207 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 32984108  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32984107 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 32984075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 45236695 - 45236564
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45236695 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 45236596  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45236595 ccattcttttatgggtatcctagttgtcacct 45236564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 44088571 - 44088460
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  44088571 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 44088472  T
Q  101 attcttctatgg 112  Q
    ||||||| ||||    
T  44088471 attcttccatgg 44088460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 10646175 - 10646305
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10646175 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 10646274  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10646275 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 10646305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24080031 - 24079901
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24080031 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 24079932  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24079931 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 24079901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 35628829 - 35628959
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  35628829 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattaccca 35628928  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35628929 ccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Original strand, 9013738 - 9013867
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  9013738 aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttaggtaaattacccacca 9013837  T
Q  102 ttcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9013838 ttcttccatgggtaccctagttgtcacctt 9013867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33981793 - 33981660
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33981793 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 33981694  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  33981693 ccattcttccataggtaccctagttgtcaccttt 33981660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9303704 - 9303572
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggt-tgggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  9303704 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattaccca 9303605  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9303604 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 9303572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 9734307 - 9734435
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||| |    
T  9734307 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaattacccacc 9734406  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9734407 attcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033114
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcat 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  103 tcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtcacctt 12033114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 32114301 - 32114429
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  32114301 tgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 32114400  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtca 126  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32114401 ccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33730766 - 33730638
Alignment:
Q  6 atgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcatt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  33730766 atgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 33730667  T
Q  104 cttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  33730666 cttccatggataccctagttgtcaccttt 33730638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 5946099 - 5946230
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5946099 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 5946198  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||  || |||| ||||||||||||||    
T  5946199 ccattctttcataggtaccctagttgtcacct 5946230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 43328759 - 43328890
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  43328759 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattaccca 43328858  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  43328859 ccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 43328890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 25185951 - 25186069
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25185951 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25186050  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| || ||||||    
T  25186051 ccattcttccataggtacc 25186069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40435283 - 40435153
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40435283 tgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 40435184  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  40435183 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 41862272 - 41862402
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  41862272 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 41862371  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  41862372 ccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 2714601 - 2714714
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2714601 tgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 2714700  T
Q  99 tcattcttctatgg 112  Q
     |||||||| ||||    
T  2714701 ccattcttccatgg 2714714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 22878443 - 22878572
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22878443 tgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 22878542  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22878543 caattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 37956473 - 37956606
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37956473 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 37956572  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||| ||  |||| || ||||||||||||||||    
T  37956573 ccattatttcatggataccctagttgtcaccttt 37956606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17718852 - 17718718
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  17718852 tgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 17718753  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
     |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  17718752 ccattcttccatgggtaccctagctgtcaccttta 17718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 31831085 - 31830967
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattg-gttgggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| | |    
T  31831085 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattaccta 31830986  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||||||||    
T  31830985 ccattcttccatgggtacc 31830967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 37419992 - 37420122
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||    
T  37419992 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattaccca 37420091  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  37420092 ccattcttccataggtaccctagttgtcacc 37420122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 41231998 - 41232131
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41231998 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattaccca 41232097  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
      |||| || |||| || ||||||||||||||||    
T  41232098 ctattcctccatggataccctagttgtcaccttt 41232131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 25248087 - 25248203
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25248087 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatc 25248186  T
Q  101 attcttctatgggtacc 117  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  25248187 attcttccatggatacc 25248203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 6366038 - 6366169
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6366038 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 6366137  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  6366138 ccattctttcatggataccctagttgtcacct 6366169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 29048533 - 29048426
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  29048533 tgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 29048434  T
Q  99 tcattctt 106  Q
     |||||||    
T  29048433 ccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 3904129 - 3904246
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| |||    
T  3904129 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattaccca 3904227  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||||||||    
T  3904228 ccattcttccatgggtacc 3904246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 45066722 - 45066604
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||    ||||||| |||    
T  45066722 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattaccca 45066623  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  45066622 tcattcttccatgggtacc 45066604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981650
Alignment:
Q  15 ttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  113 gta-cctagttgtcacc 128  Q
     || |||||||||||||    
T  41981634 ataccctagttgtcacc 41981650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 41653947 - 41654077
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  41653947 tgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 41654046  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  41654047 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 41654077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13760778 - 13760643
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||  |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  13760778 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 13760679  T
Q  99 tcattcttctatgggt---acctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| ||||||    ||||||||||||||||    
T  13760678 ccattcttccatgggtgtaccctagttgtcaccttt 13760643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 37301455 - 37301326
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  37301455 tgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 37301356  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
     |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  37301355 ccattctttcatgggtaccctagttgtcac 37301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336278
Alignment:
Q  18 ttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  116 -cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||||||||||    
T  31336263 ccctagttgtcacctt 31336278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 45258565 - 45258675
Alignment:
Q  4 aaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatca 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  45258565 aaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 45258664  T
Q  102 ttcttctatgg 112  Q
    |||||| ||||    
T  45258665 ttcttccatgg 45258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 42701418 - 42701300
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact----aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcc 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42701418 aaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaaaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatcc 42701321  T
Q  98 atcattcttctatgggtacct 118  Q
    | ||| |||| ||||||||||    
T  42701320 accatccttccatgggtacct 42701300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 41639966 - 41640095
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  41639966 tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgcttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattaccca 41640065  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
     |||||||| || | || ||||||||||||    
T  41640066 ccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 41981485 - 41981534
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41981485 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 41981534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41425500 - 41425429
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  41425500 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattatccataattcttttatgggtagcctagttgccacc 41425429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 31940367 - 31940485
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31940367 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccatc 31940456  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  31940457 attctttcatgggtagcctagttgccacc 31940485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 39915940 - 39915888
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaa 55  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39915940 aaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39915888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 117448 - 117329
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  117448 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcat 117359  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  117358 cattctttcatgggtagcctagttgtcacc 117329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 9713738 - 9713857
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9713738 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 9713827  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  9713828 cattctttcatgggtagcctagttgccacc 9713857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 2379239 - 2379311
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  2379239 tgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2379311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Original strand, 3211304 - 3211378
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatccatcattcttctatgggtacc-tagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3211304 tgcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacctt 3211378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 112
Target Start/End: Original strand, 38631748 - 38631806
Alignment:
Q  55 atatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgg 112  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  38631748 atatgcttatgtggttaatatgtattggttgggataaattatccaccattcttcaatgg 38631806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 4447367 - 4447294
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4447367 tgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 4447294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 32373845 - 32373744
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  32373845 tgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccac 32373757  T
Q  100 cattcttctatgg 112  Q
    |||||||| ||||    
T  32373756 cattcttccatgg 32373744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 10378408 - 10378480
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10378408 tgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4975467 - 4975412
Alignment:
Q  70 taatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttg 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  4975467 taatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttg 4975412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 115
Target Start/End: Original strand, 41843352 - 41843410
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  41843352 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 41843410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33622535 - 33622467
Alignment:
Q  61 ttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggtacctagttgtcacc 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||   |||||||||||||    
T  33622535 ttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcatggtagcctagttgtcacc 33622467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 33896958 - 33896914
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  33896958 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccac 33896914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 128
Target Start/End: Original strand, 39901679 - 39901739
Alignment:
Q  70 taatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatgggtacc-tagttgtcacc 128  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  39901679 taatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtcacc 39901739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 40458891 - 40458851
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  40458891 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40458851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33839845 - 33839713
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33839845 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 33839746  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc-tagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33839745 ccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 33839713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45690227 - 45690097
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45690227 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 45690128  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45690127 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 49171492 - 49171359
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  49171492 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 49171393  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  49171392 ccattcttccatgagtaccctagttgtcaccttt 49171359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 31625757 - 31625887
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  31625757 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-cca 31625855  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31625856 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 31625887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23393181 - 23393051
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23393181 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 23393082  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23393081 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23393051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25894047 - 25893917
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25894047 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25893948  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25893947 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25893917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 29446891 - 29447020
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccat 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||     
T  29446891 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaattacccac 29446990  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29446991 cattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 33423405 - 33423276
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33423405 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 33423306  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33423305 ccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 36389409 - 36389541
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  36389409 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 36389508  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36389509 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 36389541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 45482711 - 45482843
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  45482711 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattaccca 45482810  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  45482811 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 45482843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2341792 - 2341657
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2341792 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 2341693  T
Q  99 tcattcttctat-gggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  2341692 ccattcttccatggggtaccctagttgtcaccttta 2341657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 35328199 - 35328068
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  35328199 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 35328100  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  35328099 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 35328068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 35355941 - 35356072
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  35355941 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 35356040  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  35356041 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 35356072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22979777 - 22979647
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  22979777 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 22979678  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22979677 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 22979647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 27018169 - 27018299
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27018169 tgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 27018268  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27018269 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 27018299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 46913162 - 46913298
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaa---tatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  46913162 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 46913261  T
Q  97 catcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  46913262 caccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttta 46913298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 17855481 - 17855613
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  17855481 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 17855580  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17855581 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 17855613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 40670616 - 40670748
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40670616 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 40670715  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc-tagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40670716 ccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 40670748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 47067107 - 47066975
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  47067107 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 47067008  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  47067007 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 47066975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 30076657 - 30076526
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  30076657 tgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccca 30076558  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  30076557 tcattcttccatggataccctagttgtcacct 30076526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 37846146 - 37846015
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  37846146 tgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 37846047  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37846046 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 37846015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 15877603 - 15877721
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  15877603 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattaccca 15877702  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||||||||    
T  15877703 ccattcttccatgggtacc 15877721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31429605 - 31429475
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||    
T  31429605 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactca 31429506  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31429505 tcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 31429475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33695951 - 33695821
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33695951 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 33695852  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  33695851 ccattcttccatggataccctagttgtcacc 33695821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 35767527 - 35767660
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  35767527 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 35767626  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  35767627 ccattcttccatggataccctagttgtcaccttt 35767660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 5183955 - 5183823
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  5183955 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 5183856  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||    
T  5183855 ccattcttccatgagtaccctagttatcacctt 5183823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26579847 - 26579715
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  26579847 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 26579748  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  26579747 ccattcttccatggataccctagttgtcacctt 26579715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 41990988 - 41990856
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattgg-ttgggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||  ||    
T  41990988 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactca 41990889  T
Q  99 tcattcttctatgggtacctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  41990888 ccattcttccatgggtacctaattatcaccttt 41990856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 35757149 - 35757016
Alignment:
Q  2 gaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt--gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||  ||    
T  35757149 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactca 35757051  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  35757050 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttta 35757016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20165944 - 20165814
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||  ||    
T  20165944 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactca 20165845  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20165844 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 20165814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28234066 - 28233936
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  28234066 tgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaactaccca 28233967  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     | |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28233966 cctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 28233936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 33332842 - 33332975
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  33332842 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattaccca 33332940  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  33332941 ccattctttcatgggtaccctagttgtcaccttta 33332975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 33411313 - 33411443
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  33411313 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 33411412  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  33411413 ccattcttccataagtaccctagttgtcacc 33411443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 47740461 - 47740331
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  47740461 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 47740362  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  47740361 ccattcttccatggataccctagttgtcacc 47740331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 48609807 - 48609677
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  48609807 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattataca 48609708  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  48609707 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48609677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 31586901 - 31587009
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31586901 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 31587000  T
Q  99 tcattcttc 107  Q
     ||||||||    
T  31587001 ccattcttc 31587009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 10028541 - 10028673
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10028541 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 10028640  T
Q  99 tcattcttctatgggta---cctagttgtcacc 128  Q
      ||||||| |||||||   |||||||||||||    
T  10028641 ctattcttccatgggtataccctagttgtcacc 10028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904390
Alignment:
Q  15 ttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgg 112  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  113 gta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtcacctt 41904390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 5712221 - 5712351
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5712221 tgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 5712320  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  5712321 tcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 5712351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 19563500 - 19563630
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  19563500 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattaccca 19563599  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  19563600 ccattcttccatgggtactctaattgtcacc 19563630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 43499538 - 43499656
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| |||| ||| |||||||||| |||    
T  43499538 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattaccca 43499637  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||| ||||    
T  43499638 ccattcttccatggatacc 43499656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Original strand, 33870301 - 33870424
Alignment:
Q  4 aaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatca 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  33870301 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 33870400  T
Q  102 ttcttctatgggtac-ctagttgtcac 127  Q
       |||||||||||| |||||||||||    
T  33870401 ---ttctatgggtactctagttgtcac 33870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Original strand, 44564393 - 44564497
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  44564393 aaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccacc 44564492  T
Q  101 attct 105  Q
    |||||    
T  44564493 attct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45063485 - 45063357
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  45063485 tgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatcca 45063388  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacc 128  Q
     |||||||  || ||||| ||||||||||||    
T  45063387 ccattctttcattggtactctagttgtcacc 45063357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405535
Alignment:
Q  12 aatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttcta 109  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||| |    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  110 tgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
    ||||||  ||||||||||||||||    
T  44405512 tgggtattctagttgtcaccttta 44405535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 10618351 - 10618475
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  10618351 tgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaataccacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 10618443  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  10618444 ccattcttccatgggtaccctagttatcacct 10618475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 33720164 - 33720071
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaatta 94  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33720164 aaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatta 33720071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 24228594 - 24228714
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24228594 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tatgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccat 24228683  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    |||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  24228684 cattctttcatgggtagcctaattgtcacct 24228714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 130
Target Start/End: Original strand, 44659940 - 44660017
Alignment:
Q  55 atatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  44659940 atatgcttatgtggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagcctagttgccacctt 44660017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 35752153 - 35752032
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  35752153 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 35752064  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  35752063 cattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 35752032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 48085911 - 48086016
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||          | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48085911 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccat 48086000  T
Q  100 cattcttctatgggta 115  Q
    |||||||  |||||||    
T  48086001 cattctttcatgggta 48086016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 37127990 - 37128110
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||          ||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37127990 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat----------aaatatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccat 37128079  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  37128080 cattctttcatgggtagcctagttgtcacct 37128110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 2332072 - 2332179
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          || || |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  2332072 tgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg----------aatatgtgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccac 2332161  T
Q  100 cattcttctatgggtacc 117  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  2332162 catttttccatgggtacc 2332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 131
Target Start/End: Original strand, 39323720 - 39323782
Alignment:
Q  70 taatgtgtattggttgggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  39323720 taatgtgtattggttgggtaaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcaccttt 39323782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 45237605 - 45237531
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  45237605 tgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcacctt 45237531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 26456162 - 26456207
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatac 46  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26456162 tgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatac 26456207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7876447 - 7876326
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||          | | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7876447 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata----------tgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 7876358  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  7876357 cattctttcattggtagcctagttgtcacctt 7876326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 46898088 - 46898012
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  46898088 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccttta 46898012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24923096 - 24923022
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  24923096 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcacctt 24923022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 36816964 - 36816845
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36816964 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccat 36816875  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  36816874 cattctttcatgggtagcctagttgccacc 36816845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 43489271 - 43489390
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43489271 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 43489360  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  43489361 cattctttcatgggtagtctagttgtcacc 43489390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 46817493 - 46817420
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  46817493 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacct 46817420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 26371149 - 26371221
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  26371149 tgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 26371221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 33393385 - 33393429
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33393385 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 33393429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 47460887 - 47460843
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47460887 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 47460843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 47906878 - 47906838
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  47906878 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 47906838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 39453551 - 39453484
Alignment:
Q  61 ttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtca 126  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  39453551 ttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 21718170 - 21718288
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21718170 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccat 21718259  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  21718260 tatttttc-atgggtagcctagttgtcacc 21718288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 498260 - 498211
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattctt 106  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  498260 tgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctt 498211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 7257438 - 7257482
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  7257438 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccac 7257482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 15644061 - 15644017
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15644061 aatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccac 15644017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 16482898 - 16482854
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  16482898 aatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggataccac 16482854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 26941651 - 26941611
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  26941651 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 26941611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 29863068 - 29863116
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29863068 tgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 37443717 - 37443673
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  37443717 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccac 37443673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 39866718 - 39866758
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  39866718 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 44003485 - 44003441
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  44003485 aatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 44003441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 93)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 5981224 - 5981356
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  5981224 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccacc 5981323  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5981324 attcttccatgggtaccctagttgtcaccttta 5981356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 31040761 - 31040895
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  31040761 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 31040860  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
     |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31040861 ccattattccatgggtaccctagttgtcaccttta 31040895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 31308053 - 31308185
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31308053 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 31308152  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31308153 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 31308185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38790327 - 38790196
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38790327 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 38790228  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  38790227 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 38790196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 39646620 - 39646751
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39646620 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatcca 39646719  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39646720 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39646751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 50774269 - 50774400
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  50774269 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattaccca 50774368  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     | |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  50774369 cctttcttccatgggtaccctagttgtcacct 50774400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 3611188 - 3611318
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3611188 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 3611287  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3611288 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3611318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24245155 - 24245037
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24245155 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatcca 24245056  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||||||||    
T  24245055 ccattcttccatgggtacc 24245037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25678389 - 25678259
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25678389 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25678290  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc-tagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25678289 ccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 25678259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 36566382 - 36566512
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  36566382 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattaccca 36566481  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36566482 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36566512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 45538205 - 45538335
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  45538205 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 45538304  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45538305 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45538335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 47317367 - 47317497
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  47317367 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 47317466  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47317467 tcattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47317497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 44662022 - 44662154
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44662022 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 44662121  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44662122 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 44662154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4068813 - 4068695
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4068813 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 4068714  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||||||||    
T  4068713 ccattcttccatgggtacc 4068695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17995081 - 17994947
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17995081 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 17994982  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttta 132  Q
     |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  17994981 ccattcttccatgggtaccctagttggcaccttta 17994947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21139542 - 21139412
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21139542 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 21139443  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  21139442 ccattcttccataggtaccctagttgtcacc 21139412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 25058740 - 25058870
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  25058740 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 25058839  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25058840 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25058870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26085528 - 26085398
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26085528 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 26085429  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26085428 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26085398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 47671638 - 47671768
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  47671638 tgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 47671737  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47671738 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47671768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 51057123 - 51057253
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  51057123 tgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatcca 51057222  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  51057223 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 51057253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6327677 - 6327545
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6327677 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 6327579  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
      ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6327578 ctattcttccatgggtaccctagttgtcaccttt 6327545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 47187157 - 47187290
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47187157 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatcca 47187256  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc-tagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  47187257 ccattctttcatgggtaccgtagttgtcaccttt 47187290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 38331989 - 38331857
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38331989 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 38331890  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38331889 ccattcttccatgggtactctagttgtcacctt 38331857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 43251763 - 43251891
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  43251763 tgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43251862  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtca 126  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43251863 ccattcttccatgggtaccctagttgtca 43251891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 23984809 - 23984940
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||| || |||||||||| ||| |    
T  23984809 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccacc 23984908  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23984909 attcttccatgggtaccctagttgtcaccttt 23984940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 41999867 - 41999998
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41999867 tgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 41999966  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  41999967 ccattcttccatgggtaccctagttatcacct 41999998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 26277229 - 26277359
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26277229 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 26277328  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26277329 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26277359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 35273648 - 35273778
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||  ||    
T  35273648 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacaca 35273747  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35273748 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35273778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 3285454 - 3285571
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||     
T  3285454 tgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccac 3285553  T
Q  100 cattcttctatgggtacc 117  Q
    |||||||| |||||||||    
T  3285554 cattcttccatgggtacc 3285571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 24885553 - 24885686
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24885553 tgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattaccca 24885652  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  24885653 ccattcttccatgaataccctagttgtcaccttt 24885686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23932639 - 23932507
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggt-tgggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  23932639 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattaccca 23932540  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23932539 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 23932507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 2450546 - 2450676
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  2450546 tgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 2450645  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2450646 tcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2450676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 25518866 - 25518952
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25518866 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37620322 - 37620192
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37620322 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 37620223  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  37620222 ccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 46784475 - 46784593
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  46784475 tgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattaccca 46784574  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  46784575 tcattcttccatgggtacc 46784593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 46967171 - 46967041
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||| || ||||||| |||    
T  46967171 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattaccca 46967072  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  46967071 tcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 46967041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 23221059 - 23220970
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggta 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23221059 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggta 23220970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33112947 - 33112818
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33112947 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 33112848  T
Q  99 tcattcttctatgggtacctagttgtcacc 128  Q
     |||||||  ||||   |||||||||||||    
T  33112847 ccattctttcatggtaccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 42863917 - 42864034
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42863917 tgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 42864016  T
Q  99 tcattcttctatgggtac 116  Q
     |||||||| ||| ||||    
T  42864017 ccattcttccatgagtac 42864034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 35692793 - 35692661
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  35692793 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgcttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 35692694  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacctt 130  Q
     | |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  35692693 ccgttcttccatggatactctagttgtcacctt 35692661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 28888633 - 28888760
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  28888633 tgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatcca 28888732  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtc 125  Q
     |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  28888733 ccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 46616601 - 46616732
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46616601 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 46616700  T
Q  99 tcattcttctatgggtac-ctagttgtcacct 129  Q
     |||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  46616701 ccattcttccatgggtactctaggtgtcacct 46616732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808829
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    ||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacctt 4808829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 26794356 - 26794474
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  26794356 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 26794455  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||||||||    
T  26794456 ccattcttccatgggtacc 26794474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 45475972 - 45475866
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45475972 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccac 45475873  T
Q  100 cattctt 106  Q
    |||||||    
T  45475872 cattctt 45475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 51045726 - 51045596
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  51045726 tgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattaccca 51045627  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51045626 ccattcttctacgggtatcctagttgtcacc 51045596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26525019 - 26524887
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  26525019 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 26524920  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
      ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  26524919 ctattcttccatggataccctagttgtcacctt 26524887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 47383860 - 47383732
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |    
T  47383860 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccacc 47383761  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||  || |||| |||||||||||||    
T  47383760 attctttcattggtaccctagttgtcacc 47383732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 31844428 - 31844515
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg 87  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31844428 tgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 31844515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 33884140 - 33884271
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33884140 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 33884239  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  33884240 ccatttttccatgggtaccctaattgtcacct 33884271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33960112 - 33959981
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33960112 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 33960013  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  33960012 ccatttttccatgggtaccctaattgtcacct 33959981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 36003182 - 36003318
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  36003182 tgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattaccca 36003281  T
Q  99 tcattcttct---atgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||||   || |||| ||||||||||||||||    
T  36003282 ccattcttctttcataggtaccctagttgtcaccttt 36003318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 49254105 - 49253987
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  49254105 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 49254006  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||||||| |||| ||||    
T  49254005 ccattcttccatggatacc 49253987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 42234892 - 42235012
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgggtaaattatccatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42234892 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggtaaattatccatc 42234981  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  42234982 attctttcatgggtagcctagttgtcacctt 42235012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 5980120 - 5980238
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  5980120 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 5980219  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
     |||| ||| || ||||||    
T  5980220 ccatttttccataggtacc 5980238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 49399118 - 49398988
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  49399118 tgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattaccca 49399019  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
      ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49399018 ctattcttccatgggtatcctagttgtcacc 49398988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42313491 - 42313359
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42313491 tgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 42313392  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  42313391 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 42313359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 51403137 - 51403074
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttat 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  51403137 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaatgtgcttat 51403074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 48373556 - 48373679
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||       ||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||     
T  48373556 tgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa-------atgtgctt-atgtgtattggttggggtaaattacccac 48373647  T
Q  100 cattcttctatgggtacc-tagttgtcacctt 130  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  48373648 cattcttccatggataccttagttgtcacctt 48373679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 4156439 - 4156577
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaga-------tagttcatggataccact-aaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaa 91  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||       ||||| |||||||||||| |||||| |  |||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  4156439 tgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 4156538  T
Q  92 ttatccatcattcttctatgggtac-ctagttgtcacct 129  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  4156539 ttacccatcatttttccatgggtactctagttgtcacct 4156577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 4953104 - 4953226
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||          | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4953104 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccat 4953193  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcaccttt 131  Q
    |||||||  |||| || |||| |||||||||||    
T  4953194 cattctttcatggatagcctaattgtcaccttt 4953226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6626143 - 6626025
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6626143 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccat 6626054  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcac 127  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  6626053 cattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312531
Alignment:
Q  38 catggataccactaaaa-atatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 13312531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47772302 - 47772169
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||  ||||||  ||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  47772302 tgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattacaca 47772203  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc-tagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  47772202 ccattcttccatgggtaccttaattgtcaccttt 47772169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27983683 - 27983603
Alignment:
Q  50 taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27983683 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27983603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30289982 - 30289910
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatgggtacc-tagttgtcacc 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  30289982 tgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtcacc 30289910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2556976 - 2556909
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtg 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||    
T  2556976 tgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 2657355 - 2657474
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2657355 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 2657444  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2657445 cattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41467751 - 41467632
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41467751 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 41467662  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  41467661 cattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41467632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 5961382 - 5961338
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5961382 aatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 5961338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 27924773 - 27924729
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27924773 aatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 27924729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 31980065 - 31979993
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaa 72  Q
    |||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  31980065 tgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtccttatgtgcttaa 31979993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41895236 - 41895164
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  41895236 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41895164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 24215815 - 24215911
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||          |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24215815 tgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaata----------tatgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccat 24215904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 33187392 - 33187451
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatg 59  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  33187392 tgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccacttaaaaatatg 33187451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Original strand, 2954911 - 2954961
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaa 55  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2954911 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaa 2954961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 13281634 - 13281576
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatccatcattcttctatgggta 115  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13281634 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattattttatgggta 13281576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Original strand, 33073310 - 33073384
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33073310 tgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 33073384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 39637950 - 39637996
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttc-atggatacca 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39637950 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7561588 - 7561528
Alignment:
Q  70 taatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  7561588 taatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 7561528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 13313293 - 13313249
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggata 45  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13313293 tgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 29770722 - 29770843
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccat 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29770722 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 29770811  T
Q  100 cattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    |||| ||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  29770812 cattttttcatgggtagcctagttgccacctt 29770843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31286563 - 31286504
Alignment:
Q  71 aatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31286563 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Original strand, 10928166 - 10928240
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  10928166 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 10928240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 34752386 - 34752328
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatccatcattcttctatgggta 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  34752386 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggta 34752328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 26472298 - 26472258
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  26472298 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 26472258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 26685912 - 26685956
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  26685912 aatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccac 26685956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 32448700 - 32448740
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  32448700 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 35991718 - 35991678
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  35991718 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 35991678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 38716362 - 38716318
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  38716362 aatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccac 38716318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 39475897 - 39475854
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39475897 aatgagcaatttattggtggg-tcaagatagtttatggataccac 39475854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 44544165 - 44544125
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  44544165 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 52367939 - 52367983
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  52367939 aatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccac 52367983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 1921 - 2051
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  1921 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 2020  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2021 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 2051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11263 - 11133
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11263 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 11164  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11163 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13892 - 13760
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttg-ggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13892 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 13793  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13792 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 13760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 176706 - 176837
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  176706 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 176805  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacct 129  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  176806 ccattcttctatgggtatcctagttgtcacct 176837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 278058 - 278192
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac---taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  278058 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacc 278157  T
Q  97 catcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  278158 caccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 278192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 129
Target Start/End: Original strand, 3133 - 3262
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  || |    
T  3133 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcacc 3232  T
Q  101 attcttctatgggtacc-tagttgtcacct 129  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3233 attcttctatggataccttagttgtcacct 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18984 - 18852
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttgg-gtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18984 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatcca 18885  T
Q  99 tcattcttctatgggta-cctagttgtcacctt 130  Q
      ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18884 caattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 18852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 2562 - 2444
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  2562 tgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 2463  T
Q  99 tcattcttctatgggtacc 117  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  2462 tcattcttccatgggtacc 2444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 75374 - 75241
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  75374 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattca 75275  T
Q  99 tcattcttctatgggt-acctagttgtcaccttt 131  Q
     |||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  75274 ccattcttccattggtaacctagttgtcaccttt 75241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 32613 - 32700
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca-ctaaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32613 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggg 32700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4724 - 4596
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac-taaaaatatgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  4724 aaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccacc 4625  T
Q  101 attcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4624 attcttccatgggtaccctagttgtcacc 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 7190 - 7262
Alignment:
Q  58 tgcttatgtgattaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattcttctatgggta-cctagttgtcacc 128  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  7190 tgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 7262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 4671 - 4626
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 48  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4671 aaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacca 4626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 3447 - 3492
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 48  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3447 aaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacca 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 14800 - 14844
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  14800 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccac 14844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 20592 - 20548
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 49  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  20592 aatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccac 20548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University