View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13427_low_1 (Length: 666)

Name: NF13427_low_1
Description: NF13427
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13427_low_1
NF13427_low_1
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (423-644)||(41329832-41330053)
chr8 (44-237)||(41330066-41330250)
chr8 (243-430)||(40423864-40424051)
chr8 (241-421)||(5957831-5958011)
chr8 (244-422)||(12831047-12831225)
chr8 (244-422)||(504043-504221)
chr8 (244-422)||(15197333-15197511)
chr8 (238-424)||(37038477-37038663)
chr8 (244-423)||(14547921-14548100)
chr8 (237-424)||(32032723-32032909)
chr8 (244-422)||(23122519-23122697)
chr8 (244-422)||(34012218-34012396)
chr8 (239-423)||(4854780-4854964)
chr8 (252-422)||(1179870-1180040)
chr8 (244-422)||(30479396-30479574)
chr8 (240-422)||(43414499-43414681)
chr8 (244-424)||(44507010-44507189)
chr8 (239-402)||(8841349-8841512)
chr8 (240-423)||(10284549-10284732)
chr8 (244-430)||(24307715-24307901)
chr8 (238-423)||(16056317-16056502)
chr8 (296-430)||(15258903-15259037)
chr8 (240-422)||(15048099-15048281)
chr8 (282-422)||(20074902-20075034)
chr8 (244-423)||(34307215-34307394)
chr8 (278-423)||(16383376-16383521)
chr8 (244-427)||(9122190-9122363)
chr8 (240-423)||(42221514-42221697)
chr8 (294-417)||(10621059-10621182)
chr8 (240-379)||(42354506-42354645)
chr8 (238-331)||(32707919-32708012)
chr8 (242-425)||(17443822-17444005)
chr8 (265-422)||(14055535-14055692)
chr8 (244-329)||(42710216-42710301)
chr8 (239-367)||(40467755-40467883)
chr8 (341-423)||(24307628-24307710)
chr8 (241-424)||(25838195-25838370)
chr8 (240-422)||(30183794-30183975)
chr8 (303-380)||(38229470-38229547)
chr8 (239-275)||(10621014-10621050)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (244-419)||(19930742-19930917)
chr2 (251-423)||(33436029-33436201)
chr2 (239-423)||(20700814-20700998)
chr2 (244-424)||(28863453-28863633)
chr2 (265-423)||(9058479-9058637)
chr2 (244-422)||(13438343-13438521)
chr2 (244-422)||(17473020-17473198)
chr2 (244-423)||(10249304-10249483)
chr2 (244-426)||(7465657-7465839)
chr2 (244-423)||(30915462-30915641)
chr2 (240-422)||(40613820-40614002)
chr2 (244-422)||(40701478-40701656)
chr2 (244-424)||(32505570-32505750)
chr2 (282-424)||(33436209-33436351)
chr2 (240-423)||(42257192-42257375)
chr2 (244-422)||(4060685-4060863)
chr2 (240-422)||(38732354-38732536)
chr2 (239-424)||(36168834-36169019)
chr2 (244-430)||(28381577-28381764)
chr2 (240-423)||(45097653-45097836)
chr2 (240-426)||(2533120-2533305)
chr2 (244-423)||(38882733-38882914)
chr2 (238-422)||(43490121-43490305)
chr2 (243-402)||(2997408-2997567)
chr2 (282-426)||(41575133-41575278)
chr2 (240-402)||(13365373-13365535)
chr2 (241-422)||(17819923-17820104)
chr2 (238-423)||(38273059-38273243)
chr2 (231-428)||(17823778-17823979)
chr2 (313-424)||(5574479-5574590)
chr2 (238-368)||(3034899-3035029)
chr2 (239-423)||(26891421-26891605)
chr2 (317-422)||(27864704-27864809)
chr2 (239-379)||(3737986-3738126)
chr2 (241-337)||(44152012-44152108)
chr2 (240-416)||(3439985-3440161)
chr2 (244-423)||(15428663-15428841)
chr2 (242-331)||(41758678-41758767)
chr2 (270-415)||(21301448-21301593)
chr2 (301-368)||(3154197-3154264)
chr2 (244-305)||(5574422-5574483)
chr2 (244-305)||(27864808-27864869)
chr2 (240-277)||(33436346-33436383)
chr2 (298-326)||(2329354-2329382)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (240-428)||(24699873-24700060)
chr3 (240-424)||(35536624-35536808)
chr3 (240-423)||(11347840-11348023)
chr3 (244-422)||(53982011-53982189)
chr3 (239-424)||(8956760-8956945)
chr3 (240-422)||(8076393-8076575)
chr3 (240-422)||(14623757-14623939)
chr3 (244-422)||(33644200-33644378)
chr3 (240-423)||(35965700-35965875)
chr3 (244-423)||(49607413-49607592)
chr3 (244-423)||(54868817-54868996)
chr3 (244-421)||(31456690-31456867)
chr3 (240-428)||(30801651-30801839)
chr3 (240-423)||(41189682-41189865)
chr3 (240-422)||(20764833-20765015)
chr3 (240-422)||(51419278-51419460)
chr3 (240-422)||(26141448-26141632)
chr3 (244-424)||(9562997-9563177)
chr3 (270-417)||(52629305-52629452)
chr3 (244-430)||(17470397-17470583)
chr3 (244-423)||(36707350-36707525)
chr3 (242-421)||(13897975-13898154)
chr3 (240-417)||(26754700-26754877)
chr3 (240-422)||(45058471-45058652)
chr3 (240-422)||(47531865-47532047)
chr3 (245-414)||(39670019-39670188)
chr3 (240-423)||(33118768-33118952)
chr3 (240-400)||(36331247-36331407)
chr3 (237-415)||(35093592-35093770)
chr3 (240-417)||(42823116-42823293)
chr3 (319-423)||(27714888-27714992)
chr3 (244-423)||(11095289-11095454)
chr3 (296-422)||(41080709-41080833)
chr3 (244-427)||(25395256-25395438)
chr3 (244-418)||(48587023-48587187)
chr3 (240-425)||(21746106-21746286)
chr3 (242-424)||(48375626-48375808)
chr3 (301-419)||(25407126-25407245)
chr3 (269-423)||(1758404-1758559)
chr3 (242-337)||(43746424-43746519)
chr3 (305-423)||(11907370-11907488)
chr3 (351-426)||(36331407-36331482)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (240-423)||(50052346-50052529)
chr4 (244-422)||(6034044-6034222)
chr4 (244-422)||(41236347-41236525)
chr4 (270-429)||(11511410-11511569)
chr4 (240-423)||(29239885-29240068)
chr4 (244-423)||(48182971-48183150)
chr4 (239-423)||(55475190-55475374)
chr4 (244-423)||(42044289-42044468)
chr4 (240-422)||(50526089-50526271)
chr4 (270-423)||(480395-480548)
chr4 (240-424)||(47986206-47986389)
chr4 (237-422)||(40574779-40574964)
chr4 (239-388)||(41823916-41824065)
chr4 (240-423)||(19670634-19670817)
chr4 (244-423)||(24995029-24995208)
chr4 (240-423)||(29547877-29548060)
chr4 (239-424)||(50813809-50813994)
chr4 (265-422)||(54473476-54473633)
chr4 (240-422)||(31910192-31910374)
chr4 (243-402)||(17983664-17983823)
chr4 (244-423)||(23608234-23608413)
chr4 (282-425)||(29234205-29234348)
chr4 (243-382)||(56300086-56300225)
chr4 (289-428)||(8343130-8343269)
chr4 (240-402)||(18924413-18924575)
chr4 (242-423)||(29977884-29978065)
chr4 (240-423)||(32766957-32767140)
chr4 (241-423)||(48647645-48647827)
chr4 (243-423)||(47104543-47104723)
chr4 (240-422)||(3481654-3481826)
chr4 (240-414)||(29589658-29589831)
chr4 (240-426)||(44536664-44536849)
chr4 (240-424)||(28480186-28480370)
chr4 (240-424)||(28481061-28481245)
chr4 (240-424)||(28481936-28482120)
chr4 (244-417)||(53352496-53352660)
chr4 (289-422)||(55079680-55079814)
chr4 (246-374)||(18768972-18769099)
chr4 (269-417)||(18769114-18769261)
chr4 (299-423)||(32939639-32939757)
chr4 (299-422)||(29535377-29535499)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (239-424)||(31976246-31976431)
chr6 (244-422)||(17598554-17598732)
chr6 (244-424)||(11427614-11427796)
chr6 (244-422)||(32869678-32869856)
chr6 (244-419)||(22880580-22880755)
chr6 (240-422)||(31952948-31953130)
chr6 (233-428)||(4231542-4231737)
chr6 (238-423)||(15989958-15990143)
chr6 (240-423)||(31110679-31110860)
chr6 (240-423)||(30341278-30341461)
chr6 (242-418)||(28536408-28536582)
chr6 (240-422)||(15507942-15508124)
chr6 (244-428)||(29857821-29858005)
chr6 (273-428)||(31109351-31109506)
chr6 (271-423)||(15832576-15832728)
chr6 (279-423)||(6209422-6209566)
chr6 (240-423)||(12732481-12732663)
chr6 (270-419)||(23128075-23128224)
chr6 (244-417)||(9379633-9379807)
chr6 (244-421)||(946377-946554)
chr6 (242-370)||(30870066-30870193)
chr6 (388-424)||(22422084-22422120)
chr6 (239-286)||(22421996-22422043)
chr6 (499-531)||(32659867-32659899)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (237-423)||(35468770-35468956)
chr7 (244-423)||(8080305-8080484)
chr7 (244-422)||(19329842-19330020)
chr7 (244-422)||(4999436-4999614)
chr7 (244-430)||(7389381-7389566)
chr7 (238-424)||(26296642-26296828)
chr7 (244-421)||(32951415-32951592)
chr7 (266-422)||(35137533-35137689)
chr7 (249-423)||(19436114-19436288)
chr7 (239-424)||(22343359-22343544)
chr7 (239-424)||(46033718-46033903)
chr7 (244-423)||(38837216-38837395)
chr7 (265-419)||(3783998-3784152)
chr7 (240-417)||(35522881-35523058)
chr7 (238-423)||(38044196-38044381)
chr7 (240-427)||(32564344-32564531)
chr7 (244-427)||(38267035-38267218)
chr7 (240-422)||(8238212-8238395)
chr7 (244-423)||(40957706-40957885)
chr7 (240-422)||(21234401-21234583)
chr7 (242-424)||(41915739-41915921)
chr7 (240-422)||(40846031-40846213)
chr7 (242-423)||(7727905-7728086)
chr7 (244-423)||(11044187-11044356)
chr7 (296-423)||(36208172-36208299)
chr7 (244-424)||(3434560-3434730)
chr7 (270-419)||(3694370-3694519)
chr7 (313-430)||(36361904-36362021)
chr7 (244-424)||(36362024-36362192)
chr7 (240-422)||(31735884-31736059)
chr7 (238-424)||(12310904-12311088)
chr7 (241-392)||(16374743-16374894)
chr7 (240-422)||(41423682-41423864)
chr7 (242-423)||(18207179-18207359)
chr7 (296-423)||(10343537-10343664)
chr7 (241-421)||(32045838-32046018)
chr7 (242-422)||(39255844-39256023)
chr7 (328-422)||(46374808-46374902)
chr7 (242-423)||(45223041-45223222)
chr7 (240-384)||(27744227-27744371)
chr7 (243-336)||(1766702-1766795)
chr7 (241-381)||(2318160-2318302)
chr7 (240-305)||(46374742-46374807)
chr7 (244-305)||(36361847-36361908)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (239-423)||(32813246-32813430)
chr1 (244-423)||(2581914-2582093)
chr1 (244-422)||(9474798-9474976)
chr1 (244-422)||(27564657-27564835)
chr1 (244-428)||(48716204-48716388)
chr1 (238-426)||(51898599-51898787)
chr1 (251-425)||(50630455-50630629)
chr1 (242-423)||(23597011-23597192)
chr1 (244-424)||(41758803-41758983)
chr1 (265-423)||(38632264-38632422)
chr1 (244-422)||(37649198-37649376)
chr1 (242-423)||(49811447-49811628)
chr1 (244-422)||(3000319-3000497)
chr1 (240-421)||(11152296-11152476)
chr1 (244-423)||(38595153-38595332)
chr1 (244-422)||(47452242-47452420)
chr1 (239-422)||(50590917-50591100)
chr1 (240-423)||(5958918-5959101)
chr1 (265-423)||(8346330-8346489)
chr1 (233-428)||(41608404-41608599)
chr1 (244-422)||(43132-43310)
chr1 (231-428)||(45044469-45044666)
chr1 (234-424)||(37926350-37926540)
chr1 (244-419)||(26274435-26274607)
chr1 (288-419)||(44548342-44548473)
chr1 (240-422)||(3302451-3302633)
chr1 (240-422)||(47748443-47748624)
chr1 (236-417)||(44453984-44454169)
chr1 (239-392)||(44332288-44332441)
chr1 (238-422)||(6260870-6261054)
chr1 (297-424)||(7740731-7740858)
chr1 (273-384)||(13414799-13414910)
chr1 (296-379)||(48489343-48489426)
chr1 (312-415)||(26440741-26440844)
chr1 (232-331)||(34339958-34340056)
chr1 (242-302)||(11322298-11322358)
chr1 (242-302)||(11480319-11480379)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (244-422)||(40145407-40145585)
chr5 (241-428)||(6679692-6679879)
chr5 (244-419)||(18520806-18520981)
chr5 (244-426)||(2740270-2740452)
chr5 (252-423)||(36732872-36733043)
chr5 (244-422)||(33149560-33149738)
chr5 (244-422)||(35785199-35785377)
chr5 (235-430)||(2252081-2252276)
chr5 (240-423)||(15409528-15409711)
chr5 (235-422)||(20073429-20073616)
chr5 (249-423)||(13811651-13811825)
chr5 (244-422)||(14831814-14831992)
chr5 (240-422)||(26720516-26720698)
chr5 (240-422)||(26990265-26990447)
chr5 (242-422)||(35943812-35943992)
chr5 (240-423)||(31008987-31009170)
chr5 (240-423)||(3921183-3921366)
chr5 (241-422)||(33825243-33825424)
chr5 (294-422)||(28177775-28177903)
chr5 (231-428)||(39688806-39689003)
chr5 (295-422)||(42414275-42414402)
chr5 (231-421)||(16327902-16328092)
chr5 (260-378)||(39557455-39557573)
chr5 (242-423)||(9603812-9603993)
chr5 (274-421)||(36875564-36875702)
chr5 (240-368)||(21370058-21370186)
chr5 (240-422)||(6259919-6260101)
chr5 (240-337)||(2177449-2177546)
chr5 (333-425)||(41470427-41470519)
chr5 (272-373)||(25831334-25831435)
chr5 (359-417)||(10356639-10356698)
chr5 (244-376)||(31132390-31132512)
[»] scaffold1268 (1 HSPs)
scaffold1268 (241-422)||(848-1029)
[»] scaffold1267 (1 HSPs)
scaffold1267 (241-422)||(848-1029)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (270-423)||(10057-10210)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (244-428)||(4023-4207)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (240-422)||(8781-8963)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (241-402)||(152518-152679)
[»] scaffold0316 (2 HSPs)
scaffold0316 (308-399)||(17077-17168)
scaffold0316 (240-326)||(17199-17285)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 423 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 41330053 - 41329832
Alignment:
Q  423 taaaaatacatcaacccaatatttttaatcctctggtttttggaagaaatgatttttgtactgtcaaactcaacaagaagtaagtaaaatttaatcaata 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  41330053 taaaaatacatcaacccaatatttttaatcctctggtttttggaagaaatgatttttgtactgtcaaattcaacaagaagtaagtaaagtttgaccaata 41329954  T
Q  523 attattttaattaagattccaattcaggttcttccatatcatttacccattttttatttattttgagaggatccatattgtataagaaaaaatgttatta 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41329953 attattttaattaagattccaattcaggttcttccatatcatttacccattttttatttattttgagaggatccatattgtataagaaaaagtgttatta 41329854  T
Q  623 aatctcttaacaagttcatatc 644  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  41329853 aatctcttatcaagttcatatc 41329832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41330250 - 41330066
Alignment:
Q  44 tgaataagtgatataaataattggaaaaatagattttttaagttaacaggacaagctagacgcaccaatttgaatgataatgtctatctaatatctcaac 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41330250 tgaataagtgatataaataattggaaaaatagattttttaagttaacaggac---------gcaccaatttgaatgagaatgtctatctaatatctcaac 41330160  T
Q  144 acccccacctaaaataacatgttaaacgggttaacatgttgagctcaacttattttgccaataataaataagttaccttgtcaagtgttaaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41330159 acccccacctaaaataacatgttaaacgggttaacctgttgagctcaacttattttgccaataataaataagttaccttgtcaagtgttaaaaa 41330066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 243 - 430
Target Start/End: Original strand, 40423864 - 40424051
Alignment:
Q  243 aaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcaggg 342  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  40423864 aaatgatacatagacaccttttattcccatacacccttgtacacctcatgtattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggg 40423963  T
Q  343 tccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaata 430  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  40423964 tccacatgactacgtgtcagatttttgtgtggatgtcaaagggtgtattgccacctaagggtatctatgtatcattactcaaaaaata 40424051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 241 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 5958011 - 5957831
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcag 340  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5958011 gaaaatgttacataaacaccctttattctcatacacccttgtacacctcatgcactaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcgg 5957912  T
Q  341 ggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattact 421  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5957911 gatccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagaatgtctatgtatcattact 5957831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12831225 - 12831047
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  12831225 aatgatacatagacaccatttattctcatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 12831126  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12831125 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgtcacctaagggtgtctatgtatcattactc 12831047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Original strand, 504043 - 504221
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  504043 aatgatacatagacaccctttattctcatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagatgagagaaaagagaatgtgtgcttgtgcggggt 504142  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  504143 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactc 504221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15197511 - 15197333
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  15197511 aatgatacatagacactttttattcccatacacccttgtacacctcatgcatttggaagagaaaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 15197412  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15197411 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagagtgtctatgtatcattactc 15197333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 238 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 37038663 - 37038477
Alignment:
Q  238 ttggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || |||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37038663 ttggaaaatgttacataaacaccctttatttctatacacccttgtacaccccatgcactaggaagagagaagaggagaggaaatagaaagtgtgcttgtg 37038564  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    | || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37038563 cgggatccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaaagatgtctatgtatcattactcta 37038477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14548100 - 14547921
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14548100 aatgatacatagacaccctttattcccatacatccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 14548001  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14548000 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaatggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatctttactct 14547921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 32032909 - 32032723
Alignment:
Q  237 attggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgt 336  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||    
T  32032909 attggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacacctcatgtattaggaagagagaagagaaggagaaagagaaagtgtacttgt 32032810  T
Q  337 gcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    ||||| |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  32032809 gcaggatccatatggccacatgtcagatttttgtgtggatgtc-aaggatgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactcta 32032723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Original strand, 23122519 - 23122697
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||    
T  23122519 aatgatacatagacaccctttattctcatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaacaggagagaaaagagaaagtgtgcttatgcggggt 23122618  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23122619 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgccacttaagggtgtctatgtatcattactc 23122697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Original strand, 34012218 - 34012396
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  34012218 aatgatacatagacaccctttattctcgtacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggat 34012317  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34012318 ccacgtgactacgtgtcaaatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattaccacctaagggtgtctatgtatcattactc 34012396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 239 - 423
Target Start/End: Original strand, 4854780 - 4854964
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagaca-tctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4854780 tggaaaatgttacatagacactcttt-attctcatatacccttgtacatcccatacattagtaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtg 4854878  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||||||||  || |||| | |||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4854879 cagggtccatgtggccacatatcagatttttatgtaggtgttaaagggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 4854964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 252 - 422
Target Start/End: Original strand, 1179870 - 1180040
Alignment:
Q  252 atagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatga 351  Q
    ||||||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  1179870 atagacatcctttattcccatatatccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggaatccacatga 1179969  T
Q  352 ccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1179970 ctacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattaccacctaagggtgtctatgtatcattactc 1180040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Original strand, 30479396 - 30479574
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    ||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||  |||    
T  30479396 aatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacacctcatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcgaggt 30479495  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  30479496 ccatatagccacatgtcagatttttatgtggatgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactc 30479574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 43414499 - 43414681
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  43414499 ggaaaatgttacatagacaccctttattgccatacacccttgtacaccccatacattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcg 43414598  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    || ||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43414599 ggatccatgtgaccacgtgttagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtgttgccatctaaggatgtctatgtatcataactc 43414681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 424
Target Start/End: Original strand, 44507010 - 44507189
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| | ||||    
T  44507010 aatgatacatagacatattt-attctcatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtatgcttgtacggggt 44507108  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44507109 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaagagtgtattaccacctaagggtgtctatgtatcattactcta 44507189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 239 - 402
Target Start/End: Original strand, 8841349 - 8841512
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8841349 tggaaaatgttacatagacaccatttattctcatacactcttgtacaccccatgcactaggaaaagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgcttgtgc 8841448  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaagg 402  Q
     |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||    
T  8841449 ggggtccacgtgactacgtgttagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtactgccacctaagg 8841512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 10284549 - 10284732
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||     
T  10284549 ggaaaatgttacatagacaccttttattcttatacaaccttgtacaccccatgcactaggaagagagaagatgaaaggaaagagaaagtgtgcttgtgcg 10284648  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  10284649 gggtccacgtgactacgtgtcaaatttttgtgtgggtgtcaaagagtgtattgtcacttaagggtgtctatgtatcataactct 10284732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 244 - 430
Target Start/End: Original strand, 24307715 - 24307901
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    ||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  24307715 aatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcggggt 24307814  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaata 430  Q
    ||| ||| |||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  24307815 ccatatggccacatatcagatttttgtgtgggtgtcaagggatgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactcttaaaata 24307901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 238 - 423
Target Start/End: Original strand, 16056317 - 16056502
Alignment:
Q  238 ttggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||    
T  16056317 ttgggaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtg 16056416  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    | ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  16056417 cggggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaagggatgtattgtcacataaggatgtttatgtatcataactct 16056502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 296 - 430
Target Start/End: Original strand, 15258903 - 15259037
Alignment:
Q  296 taggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgcca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  15258903 taggaagagagaagaggagaggaaagagaaaatgtgcttgtgcagggtccacgtgaccacatgtcagatttttatgtggatgtccagggatgtattgcca 15259002  T
Q  396 cctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaata 430  Q
     |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  15259003 tctaagagtatctatgtatcataactcttaaaata 15259037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 15048099 - 15048281
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggaga-ggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    ||||||||||| ||||||| | || ||||  ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  15048099 ggaaaatgttatatagacaccctttattccgatacacccttgtacatcccatacattaggaagagagaagaggagataaaaagagaaagtgtgcttgtgc 15048198  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
     |||||||  || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15048199 ggggtccatgtggctacgtgtcagatttttgtgtgg-tgtcaaagggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcataactc 15048281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 282 - 422
Target Start/End: Original strand, 20074902 - 20075034
Alignment:
Q  282 tacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaa 381  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20074902 tacacctcatgaactaggaagagagaagagaagaggaaagagaaagtgtgcttgtgcagggt--------ccacgtgtcacatttttatgtgggtgtcaa 20074993  T
Q  382 aggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20074994 agagtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 20075034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 34307394 - 34307215
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    ||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  34307394 aatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatatattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcggggt 34307295  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
     || ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  34307294 tcatatgtccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactct 34307215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16383521 - 16383376
Alignment:
Q  278 cttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatg 377  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16383521 cttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcggggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtg 16383422  T
Q  378 tcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  16383421 tcaaggggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactct 16383376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 244 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9122363 - 9122190
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  9122363 aatgatacatagacattctttattcccatacactcttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggat 9122264  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaa 427  Q
    |||| |||| || |||||||||||| ||||| ||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9122263 ccacgtgactacatgtcagatttttgtgtgggtg----------tattgccacctaagggtgtctatgtatcattactttaaaa 9122190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 42221697 - 42221514
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||       
T  42221697 ggaaaatgttatataaacatcctttatttacatacacccttgtacaccctatatatttggaagagagaagatgagatgaaagagaaagtgtgcttgtatg 42221598  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||| | | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42221597 gggtccatatgattacgtgtcagatttttgtgtgggtgtccaggaatgtattgtcacctaaggatgtatatgtatcattactct 42221514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 417
Target Start/End: Original strand, 10621059 - 10621182
Alignment:
Q  294 attaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || || |  || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |    
T  10621059 attaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggatcgatgtggctacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattac 10621158  T
Q  394 cacctaaggatgtctatgtatcat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10621159 cacctaaggatgtctatgtatcat 10621182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 240 - 379
Target Start/End: Original strand, 42354506 - 42354645
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||      
T  42354506 ggaaaatgttacatagacaccatttattctcatacacccttctacaccccatgcactaggaagagagaagagaagatgaaagagaaagtgtgcttatgtg 42354605  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtc 379  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  42354606 agatccacatgaacacgtgtcagatttttataaggatgtc 42354645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 331
Target Start/End: Original strand, 32707919 - 32708012
Alignment:
Q  238 ttggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtg 331  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32707919 ttggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtg 32708012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17444005 - 17443822
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    ||||||||||||||||| | || ||    ||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||  ||    
T  17444005 aaaatgttacatagacaccctttataagaatacatccttgtacaactcatgcactgggaagagagaagagaagatgaaagagaaagtgtctttgtgtggg 17443906  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaa 425  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||| ||    | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17443905 gtccacatgactacatgtcagatttttgtgtgagtgttaagaagtgtattgtcacctaaggttgtctatgtatcataactctaa 17443822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 422
Target Start/End: Original strand, 14055535 - 14055692
Alignment:
Q  265 attctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca-gggtccacatgaccacgtgtcaga 363  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||| | |||||||| |||| || ||| |||    
T  14055535 attctcatacacctttgtatacctcattcattaagaagagagaagatcagaggaaagaaaaagtg-gcttgtgtaggggtccacgtgactacatgtaaga 14055633  T
Q  364 tttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||||| |||||||||||| |  | ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  14055634 tttttgtgtggatgtcaaggagtgtattgtcacctaagggtgtcaatgtatcataactc 14055692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 329
Target Start/End: Original strand, 42710216 - 42710301
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtg 329  Q
    |||| |||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42710216 aatgatacacagacaccctttattcccatacacccttgtacaccccatacattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtg 42710301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40467883 - 40467755
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || | |||| |   ||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  40467883 tggaaaatgttacatagacaccttttatccccataaatttttgtacaccccatagactaggaagagagaagatgagaggaaagagaaagtgtgcttgtgc 40467784  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttt 367  Q
       |||||| ||  ||| |||||||||||    
T  40467783 gaagtccacgtggtcacatgtcagatttt 40467755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24307710 - 24307628
Alignment:
Q  341 ggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  24307710 ggtccatatggccacatatcagatttttgtgtgggtgtcaatggatgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactct 24307628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 25838370 - 25838195
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcag 340  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||  |||||| |||||||||||  ||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |    
T  25838370 gaaaatgttacatagatatcctttattgccatacaaccttgtacaccctatacattagcaaaagagaagaggagagaaaagaaaaagtgtgcttgtacgg 25838271  T
Q  341 ggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
     |||||  |||| |||||        || |||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  25838270 agtccatgtgacaacgtg--------ttgtgtggatgtcaaaaagtgtattgccacctaaggatatctatttatcataactcta 25838195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 30183794 - 30183975
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||| |||||||||| |||  ||| |||||| |||||| || | ||||||||||||||| || |       
T  30183794 ggaaaatgttagatagacatcctttatttacatacactcttgtacaccccatatatttggaagaaagaagatga-atgaaagagaaagtgtgcttatatg 30183892  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
      ||||| ||||  |||| |||||||||| | ||  |||| | | || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  30183893 aagtccatatgattacgtatcagatttttgtatgagtgtccaggaatgtattgccacgtaaggatgtatatgtatcattactc 30183975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 38229547 - 38229470
Alignment:
Q  303 agagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtca 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  38229547 agagaagagaagaggaaagagaaaatgtgcttgtacagaatccacgtgaccacatgtcagatttttgtgtgggtgtca 38229470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 275
Target Start/End: Original strand, 10621014 - 10621050
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcataca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10621014 tggaaaatgttacatagacatcttttattcccataca 10621050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 244 - 419
Target Start/End: Original strand, 19930742 - 19930917
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  19930742 aatgatacatagacaccttttattcccatacacccttgtacacctcatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgtttgtgcggggt 19930841  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcatta 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19930842 ccacatgactacgtgtcagatttttgtgtggatgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcatta 19930917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 251 - 423
Target Start/End: Original strand, 33436029 - 33436201
Alignment:
Q  251 catagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatg 350  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  33436029 catagacaccttttattctcatacacccttgtacacctcatgcattaggaagagagaagatgagaggaaagagaaagtgtgcttgtgcggggtccacgtg 33436128  T
Q  351 accacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    || |||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33436129 actacgtgttagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 33436201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 239 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20700998 - 20700814
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20700998 tggaaaatgttacatagacaccctttattcccatacacccttgtacaccccatgcactaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgcttatgc 20700899  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20700898 ggggtccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtaggagtcaaagggtgtattgccacataaggatgtctatgtatcattactct 20700814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 28863633 - 28863453
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  28863633 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtacacctcatgcattaggaagagagaagaggagataaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 28863534  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28863533 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattattcta 28863453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 265 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9058637 - 9058479
Alignment:
Q  265 attctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagat 364  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9058637 attcccatacactcttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggtccacatgactacgtgtcagat 9058538  T
Q  365 ttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9058537 ttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 9058479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13438521 - 13438343
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  13438521 aatgatacatagacaccctttattcccatacatccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 13438422  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13438421 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaggatgtattgtcacctaagggtgtctatgtatcattactc 13438343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17473198 - 17473020
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  17473198 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtacacctcatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggat 17473099  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17473098 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccatctaagggtgtctatgtatcattactc 17473020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Original strand, 10249304 - 10249483
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  10249304 aatgatacatagacaccctttattctcatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagaaaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 10249403  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10249404 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgtcacctaagggtgtctatgtatcattactct 10249483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 426
Target Start/End: Original strand, 7465657 - 7465839
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  ||||    
T  7465657 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtacacctcatgcattaggaagagagaagaagagataaaagagaaagtgtgcttgtgtggggt 7465756  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaa 426  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7465757 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccatctaagggtgtctatgtatcattactctaaa 7465839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 30915641 - 30915462
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| ||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||    
T  30915641 aatgatacatagacatccattatttccatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtgtgcttgtacggggt 30915542  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30915541 ccacgtgactacgtgtcagatttttatgtgggggtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 30915462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 40613820 - 40614002
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  40613820 ggaaaatgttacatagacaccctttattcccatacacccttgtacaccccatacattatgaagaaagaataggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcg 40613919  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40613920 gggtccatgtggccacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcataactc 40614002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 40701656 - 40701478
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40701656 aatgatacatagacaccttttatttccatacacccttgtacacccgatgcattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtgtgattgtgcggggt 40701557  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40701556 ccacgtaactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactc 40701478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 424
Target Start/End: Original strand, 32505570 - 32505750
Alignment:
Q  244 aatgttacatagaca-tctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcaggg 342  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||    
T  32505570 aatgatacatagacactcttt-attctcatacacccttgtacaccccatgcattaagaagagagaagaggagagaaaatagaaagtgtgcttgtgcgggg 32505668  T
Q  343 tccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32505669 tccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgtcacctaagggtgtctatgtatcattactcta 32505750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 282 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 33436351 - 33436209
Alignment:
Q  282 tacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaa 381  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33436351 tacacctcatgaactaggaagagagaagaggataggaaagagaaagtgtgcttgtgcaaagtccacatggtcacgtgtcagatttttatgtgggtgtcaa 33436252  T
Q  382 aggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    | | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33436251 aaggtgtattgccatctaaggatgtctatgtatcattactcta 33436209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 42257375 - 42257192
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||| ||||||||||| | || |||   |||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  42257375 ggaaaatattacatagacaccctttatttctatacactcttgtacaccccatacattaggaagaaagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcg 42257276  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42257275 gggtccatgtggccacgtgtcagatttttatgtgggtgtcaaatgatgtattgccacctaaagatgtctatgtatcataactct 42257192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4060863 - 4060685
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||| || |    
T  4060863 aatgatacataaacatcttttatttccatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagatgagagaaaaaagaaagtgtgcttatgcgggat 4060764  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4060763 ccacgtaactacgtgtcagatttttgtgtggatgtcaaaaggtgtattgtcacctaagggtgtctatgtatcattactc 4060685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 38732536 - 38732354
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  38732536 ggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacatccttgtacatctcatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcg 38732437  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  38732436 gggtccatatgaccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaagggatgtattgtcacataagggtgtttatgtatcataactc 38732354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 239 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 36169019 - 36168834
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  36169019 tggaaaatgttacataaacaccctttattctcatacactcttgtacaccccatacattaggaagagagaataggagagaaaagagaaagtatgcttgtgc 36168920  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
     |||||||  || |||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36168919 ggggtccatgtggccacgtgtcaaatttttgtgtgggagttaaaggatgtattgtcatctaaggatgtctatgtatcataactcta 36168834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 430
Target Start/End: Original strand, 28381577 - 28381764
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||    
T  28381577 aatgatacatagacaccctttattcccatacatccttgtacaccccatatattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggagt 28381676  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc-taaaaata 430  Q
    |||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28381677 ccatgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcgaaaggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactcataaaaata 28381764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 45097653 - 45097836
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  45097653 ggaaaatgttacataaacatcttttaattgcatacactcttgtacatccgatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcg 45097752  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45097753 gggtccatatggccacatgtcagatttttgtatgggtgtcaagggatgtattgccacctaaggatgtttatgtatcataactct 45097836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 240 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2533305 - 2533120
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||| ||| ||| | || |||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||     
T  2533305 ggaaaatgttatatatacaccctttattcccatacacccttgtacaccccatacattgggaagagagaagaggagataaaagaaaaagtgtgcttgtgcg 2533206  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaa 426  Q
    ||||| |  || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2533205 gggtctatgtggctacgtgtcagatttttgtgtgg-tgtcaaaggatgtattgccacttaaggatgtctatgtatcataactctaaa 2533120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Original strand, 38882733 - 38882914
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc---ag 340  Q
    |||| |||||||| | | || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||| | ||||||    |    
T  38882733 aatgatacatagagaccatttattcccatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagataagataagagaaaagagaaagtgcgcttgtgcggggg 38882832  T
Q  341 ggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38882833 ggtccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtggatgtcaaagggt-tattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 38882914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 238 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43490305 - 43490121
Alignment:
Q  238 ttggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||    
T  43490305 ttggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccctatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagataaagtgtacttgtg 43490206  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    | ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  43490205 cggggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgtcacctaagggtgtttatgtatcataactc 43490121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Original strand, 2997408 - 2997567
Alignment:
Q  243 aaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcaggg 342  Q
    ||||||||||||||||  ||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||    
T  2997408 aaatgttacatagacactttttaattgcatacacccttgtacacctcatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcgggg 2997507  T
Q  343 tccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaagg 402  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  2997508 tccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaagg 2997567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 282 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 41575278 - 41575133
Alignment:
Q  282 tacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcaggg-tccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtca 380  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||    
T  41575278 tacatctcatgcattaggacgagagaagaggagatgaaagagaaagtgtgcttgtgtaggggtccacatgaccacatgtcaaatttttgtgtgaatgtca 41575179  T
Q  381 aaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaa 426  Q
    |||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41575178 aagggtgtattaccatctaaggatgtctatgtatcattactttaaa 41575133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 240 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13365535 - 13365373
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  13365535 ggaaaatgttacatagacaccttttaattgcattcacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcg 13365436  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaagg 402  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||    
T  13365435 gggtccatatggtcacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtatattgccatctaagg 13365373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 241 - 422
Target Start/End: Original strand, 17819923 - 17820104
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacaccctt-gtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    |||||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||      
T  17819923 gaaaatgttatataaacatcatt-attctcataaaccttttgtacacctcatgcattaggaagagagaagaggagatgaaagagaaaatgtgtttgtgtg 17820021  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  17820022 gggtccacgtaaccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctatagttgtctatgtatcataactc 17820104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 238 - 423
Target Start/End: Original strand, 38273059 - 38273243
Alignment:
Q  238 ttggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||    
T  38273059 ttggaaaatattacataaacaccatttattctcatacatc-ttgtacaccccatacattaggaagagagaataggagagaaaagagaaagtgtgctagtg 38273157  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38273158 cggggtccatgtggctacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaagggtgtattgccatctaagaatgtctatgtatcataactct 38273243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 231 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17823979 - 17823778
Alignment:
Q  231 ttaaaaattggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17823979 ttaaaaataggaaaatgttacatagacatcctttatttacatacacccttgtacaccccatatatttggaagagagaagatgagatgaaagagaaagtgt 17823880  T
Q  331 gattgtgcagggtcc----acatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaa 426  Q
    | ||||   ||||||    | ||    ||||||||||||||| ||||| |||  | | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17823879 gcttgtatggggtccatatatatagttacgtgtcagatttttgtgtgggtgttcaggaatgtattgccacctaaggatgtatatgtatcattactcttaa 17823780  T
Q  427 aa 428  Q
    ||    
T  17823779 aa 17823778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 313 - 424
Target Start/End: Original strand, 5574479 - 5574590
Alignment:
Q  313 agaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgt 412  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  5574479 agagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggatccacgtgactacgtgtcagatttttatgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagagtgtctatgt 5574578  T
Q  413 atcattactcta 424  Q
    ||||||||||||    
T  5574579 atcattactcta 5574590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 368
Target Start/End: Original strand, 3034899 - 3035029
Alignment:
Q  238 ttggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  |||||    
T  3034899 ttggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacaccttggtacacctcatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtatacttgtg 3034998  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagattttt 368  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3034999 cggggtccatatgaccacatgtcagattttt 3035029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 239 - 423
Target Start/End: Original strand, 26891421 - 26891605
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||  || ||||||   |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |    
T  26891421 tggaaaatgttacatatacacccttaattttcatacacatttttacaccctgtatattaggaagagagaagagaagaggaaagagaaaatgtgcttgttc 26891520  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
      ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  26891521 gaggtccacgtgaccacatgtcagatttttgtgtgggtgtctaggggtgtattgccacctaagggtggctatgtatcataactct 26891605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27864809 - 27864704
Alignment:
Q  317 gaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatca 416  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27864809 gaaagagaaagtgtgcttttgcggggtccacgtgattacgtgtcagatttttgtgtggatgtcaaagggtgtattgccacataagggtgtctatgtatca 27864710  T
Q  417 ttactc 422  Q
    ||||||    
T  27864709 ttactc 27864704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3738126 - 3737986
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||| |||||||||  ||    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  3738126 tggaaaatgttacatagacaccctatattttcatacacctttgtacaccctatattctaggaagaaagaagaggagaggaaaaagaaaatgtgcttgtgc 3738027  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtc 379  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  3738026 ggggtccacatgaccacatgtcagatttttgtgtgggtgtc 3737986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 241 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 44152108 - 44152012
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44152108 gaaaatgttacataaacaccttttattcgcatacacccttgtatatctcatgcattaggaagagagaagaggagatgaaagagaaagtgtgcttgtg 44152012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 240 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3440161 - 3439985
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||  |||||||| |||||||||  ||    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  3440161 ggaaaatgttacatagacaccctttatttccatacacctttgtacaccctatattctagaaagagagaagaggagaggaaagagaaaatgtgcttgtgcg 3440062  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatca 416  Q
    |||||||| | | ||| ||| |||||||| ||||| |||| | |  | ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3440061 gggtccacgtaatcacatgttagatttttgtgtgggtgtccaggagtgtattgccacctaagggtgtctacgtatca 3439985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Original strand, 15428663 - 15428841
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |  ||||    
T  15428663 aatgttacatagacatcatttaccctcatacacccttgtacacc-catgtactagaaagagaaaagaggagatgaaagagaaaatgtgtttgcgtggggt 15428761  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
      ||||| |||| |||||||||||| ||||  ||| || || | ||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  15428762 ttacatggccacatgtcagatttttgtgtgagtgttaaggggtgtatggccacataaggatgtttatgtatcataactct 15428841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41758767 - 41758678
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtg 331  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  41758767 aaaatgttacatagacacattttattctcatacatccttgtacaccccatatattaggaagagagaagaggagataaaagagaaaatgtg 41758678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 415
Target Start/End: Original strand, 21301448 - 21301593
Alignment:
Q  270 catacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagattttta 369  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| || |||||||     
T  21301448 catacactcatgtacacctcatgcactaggaagaaagaagagaagataaaagagaaagtgtgtttgtgtagagtccacatgatcacgtatctgatttttg 21301547  T
Q  370 tgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatc 415  Q
    ||||  | || | |  ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  21301548 tgtgagtatcgaggagtatattgccacttaaagatgtctatctatc 21301593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3154264 - 3154197
Alignment:
Q  301 agagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagattttt 368  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| || || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  3154264 agagaaaagaggagatgaaagagaaactgtgtttgggcgggatccatgtgaccacgtgtcagattttt 3154197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 5574422 - 5574483
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagaga 305  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  5574422 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtacacgccatgcattaggaagaga 5574483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27864869 - 27864808
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagaga 305  Q
    |||| ||||| |||| | || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  27864869 aatgatacattgacaccctttattctcatacacccttgtacatcccatgtattaggaagaga 27864808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33436383 - 33436346
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacc 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33436383 ggaaaatgttacatagacaccttttattctcatacacc 33436346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2329382 - 2329354
Alignment:
Q  298 ggaagagagaagaggagaggaaagagaaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2329382 ggaagagagaagaggagaggaaagagaaa 2329354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 240 - 428
Target Start/End: Original strand, 24699873 - 24700060
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  24699873 ggaaaatgttacatagacatcttttattctcatacatc-ttatacacctcataaactaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgtttgtaca 24699971  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 428  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24699972 gggtccacgtggccacgtgccagatttttatgtgggtgtcaaaaggtgtattgccaactaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 24700060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 240 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 35536808 - 35536624
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |    
T  35536808 ggaaaatgttacatagacaccatttattctcatacacccttctacaccccatgcactaggaagagagaagagaagatgaaagaggaagtgtgcttgtgta 35536709  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35536708 aggtccacatgaccacgtgtcacatttttatgtgggtgtcaaatggtgtattgccacataaggatgtctatgtatcattactcta 35536624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 11347840 - 11348023
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    |||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  11347840 ggaaaatggtacatagacaccctttattcccatacacccttatacaccccatacattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttatgca 11347939  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11347940 gggtccatgtggccacgtgtcagatttttgtgtggatgtcaaaggatgtattgtcacctaaggatgtctatgtatcataactct 11348023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 53982189 - 53982011
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  53982189 aatgatacatagacaccctttattcccatacaaccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 53982090  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53982089 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactc 53982011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 239 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 8956945 - 8956760
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||   || | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||     
T  8956945 tggaaaatgttacatagacagcatttattctcatacacccttctacaccctgtgcactaggaagagagaagagaagatgaaagaggaagtgtgcttgtgt 8956846  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8956845 aaggtccacatgaacacgtgtcacatttttatgtgggtgtcaaaggatgtattgccacataaggatgtctatgtatcattactcta 8956760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8076575 - 8076393
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  8076575 ggaaaatgttacatagacaccatttattctcatacacttttgtacaccccatgcactaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgcttgtgcg 8076476  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8076475 gggtccacgtgactacgtgttagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtactgccacctaagggtgtttatgtatcattactc 8076393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 14623757 - 14623939
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||      
T  14623757 ggaaaatgttacatagacaccatttattctcatacatccttctacacctcatgcactagaaagagagaagagaagatgaaagagaaagtgtgcttgtgtg 14623856  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14623857 aggtccacatgaacacatgtcagatttttatgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 14623939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33644378 - 33644200
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  33644378 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttatacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 33644279  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33644278 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacccaagggtgtctatgtatcattactc 33644200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 35965700 - 35965875
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35965700 ggaaaatgttacatagacaccttttattctcatacacccttgtacacctcatgaattaagaaaagaaaagaggagaggaaagagaaagtgtgcttgtgca 35965799  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    || |        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35965800 ggat--------ccacgtgtcagatttttatgtgggtgtcaaaggatgtattatcacttaaggatgtatatgtatcattactct 35965875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 49607592 - 49607413
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  || |    
T  49607592 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtacacgtcatgcattaggaagagaaaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgtgggat 49607493  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49607492 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 49607413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Original strand, 54868817 - 54868996
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  54868817 aatgatacatagacaccttttatttccatacacccttgtacaccctatgcattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtgtgattgtgcggggt 54868916  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54868917 ccacgtaactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 54868996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 31456867 - 31456690
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||| ||| | || |||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  31456867 aatgatacataaacaccctttattcccatgcacccttgtacaccccatgcattaggaagagaaaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 31456768  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattact 421  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  31456767 ccacatgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccgcctatgggtgtctatgtatcattact 31456690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 240 - 428
Target Start/End: Original strand, 30801651 - 30801839
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||      
T  30801651 ggaaaatgttacatagacaccttttattctcatacacccttgtacaccccatgtactaggaagagagaagatgagaggaaagagaaaatgtgcttgtgtg 30801750  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 428  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| | ||||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  30801751 gggtccatatgactacatgtcatatttttgtgtgggtatcaaagggtgtattatcacctaagggtgtctatgtatcattgctcaaaaaa 30801839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 41189682 - 41189865
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||  ||||||| |||||||||  |||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  41189682 ggaaaatgttacatagacaccctttatttccatacactcttgtacactccatacattaggaagaaagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcg 41189781  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||||||  || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41189782 gggtccatgtggccacgtgtcaaatttttatgtgggtgtcaaatgatgtattgccacctaaggatgtatatgtatcataactct 41189865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 20764833 - 20765015
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |     
T  20764833 ggaaaatgttacatagacaccatttattctcatacacccttgtacaccccatacattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtgtgcttgtacg 20764932  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20764933 gggtccatgtggccacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaagagtgtattaccacctaaggatgtctatgtctcataactc 20765015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 51419278 - 51419460
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  51419278 ggaaaatgttacataaacaccttttatttccatacacccttgtacaccccatacattaggaagagagaataggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcg 51419377  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51419378 gggtctatgtggccacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaaggatgtattgtcatctaaggatgtctatgtatcataactc 51419460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 26141448 - 26141632
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagaga--gaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||  ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26141448 ggaaaatgttacatagacaccctttatttccatacactcttgtacaccccatacattaggaagagaaagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtg 26141547  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
      |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26141548 tggggtccatgtgaccacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaagggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcataactc 26141632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 9563177 - 9562997
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||| | | || |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |    
T  9563177 aatgatacatagataccctttattcccatacacctttgtacaactcatgcattaggaagagagaagaggagagaagagagaaagtgtgtttgtgcaggat 9563078  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  9563077 ccacgtgactacgtgtcagatttttatatggatgtcaaaggttgtattgtcatctaatggtgtttatgtatcattactcta 9562997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 270 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 52629452 - 52629305
Alignment:
Q  270 catacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagattttta 369  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||||||||     
T  52629452 catacacccttgtacatcccatgcattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtgtgcttgtacggggtccacgtgactacgtgtcagatttttg 52629353  T
Q  370 tgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcat 417  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52629352 tgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcat 52629305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17470583 - 17470397
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||||||   ||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||||    
T  17470583 aatgatacatagacaccatttattctcatacatatttgtacatcccatgcattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtgtgcttgtgtggggt 17470484  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaata 430  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| | | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17470483 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaaaggtgtattgccacctaaaggtgtctatgtatcattactctagaaata 17470397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Original strand, 36707350 - 36707525
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    || || || |    
T  36707350 aatgatacatagacaccttttattcccatacattcttgtacacctcatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtg----tgcgcgggat 36707445  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36707446 ccacgtaactacgtgtcagatttttgtgtggatgtcaaagggtgtattgtcacctaagggtatctatgtatcattactct 36707525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 421
Target Start/End: Original strand, 13897975 - 13898154
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||  || |||||| |||  | |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||   |    
T  13897975 aaaatgttagatagacaccatttattctcatacacttttctacaccccatacactagggagagagaagagaagatgaaagagaaagtgtgcttgtgtgag 13898074  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattact 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13898075 gtccacatgaacacgtgtcagatttttatgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaaggatgtttatctatcattact 13898154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 240 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26754877 - 26754700
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagaca-tctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||  ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26754877 ggaaaatgttacatagacactctttatttc-catacacctttgtacaccctatattctaggaagagagaagaggagaggaaagagaaaatgtgcttgtgc 26754779  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcat 417  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26754778 ggggtccatgtgaccacatgtcagatttttgtgtggatgtccaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgaatcat 26754700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 45058471 - 45058652
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||     
T  45058471 ggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacaccattgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtatacttgtgcg 45058570  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  45058571 gggtccatatggtcacatgtcagatttttatgtgggtgtc-aagggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactc 45058652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47532047 - 47531865
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||| ||||||||   |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  47532047 ggaaaatgttacataaacaccctttattcccatacacacttgtacattccatacattaggaagagagaataggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcg 47531948  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| || ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47531947 gggttcatatggccacgtgtcagattcttgtgtggatgttaaaaggtgtattgccatctaaggatgtctatgtatcataactc 47531865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 39670188 - 39670019
Alignment:
Q  245 atgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtc 344  Q
    |||||||| ||||||| || |||  | |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| |  ||||    
T  39670188 atgttacacagacatcatttatttccgtacacccttgtacatctcatacattaagaagagagaagaggagagaaaagaggaagtgtgcgtgtacgaggtc 39670089  T
Q  345 cacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtat 414  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39670088 cacatgatcacgtgtcaaatttttatatagatgtcaagggatatattgccacataaggatgtctatgtat 39670019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 33118768 - 33118952
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaag-aggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||| |||||| | || |||  |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     
T  33118768 ggaaaatgttacgtagacaccctttatttccatacacccttgtacaccccatgcactagggagagagaaggaggagaggaaagagaaagtgtgtttctga 33118867  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
     || ||||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33118868 gggatccacgtgactacgtgtcaaatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgtcacctaagggtgtctatgtatcataactct 33118952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 240 - 400
Target Start/End: Original strand, 36331247 - 36331407
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  36331247 ggaaaatgttacatatacatcttttaattgcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcg 36331346  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaa 400  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| || |  ||||||||||||    
T  36331347 gggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgcattgccacctaa 36331407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 35093770 - 35093592
Alignment:
Q  237 attggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgt 336  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||| ||||    
T  35093770 attggaaaatgttacctagacatcatttattctcatacacctttgtacatctcatgcactaggaagagagaaaaaaagatgcaagagaaagtgtgcttgt 35093671  T
Q  337 gcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatc 415  Q
       | || ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | | ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  35093670 atggagttcacatgaccacatgtcagatttttgcgtggatgtcaaatgttgtattgtcacctaaagttgtctatgtatc 35093592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 240 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 42823293 - 42823116
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||| |  || |||     
T  42823293 ggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacacctcatgtattaggaagagagaagagaataagaaagagaaagtatacttatgcg 42823194  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcat 417  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| || | |||| |||| ||| | ||| ||||||||||    
T  42823193 gggtccatatgaccacatgtcaaatttttttgtgggtgtcaaggggtgtattaccacataatggtgtttatgtatcat 42823116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 319 - 423
Target Start/End: Original strand, 27714888 - 27714992
Alignment:
Q  319 aagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcatt 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  27714888 aagagaaagtgtgcttgtgcggggtccacatgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattaccacctaaaggtgtctatgtatcatt 27714987  T
Q  419 actct 423  Q
    |||||    
T  27714988 actct 27714992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Original strand, 11095289 - 11095454
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||            |||||||||||||| || ||| ||||    
T  11095289 aatgatacatagacaccctttattctcatacacccttgtacacccgatgcattaggaagaga------------aaagagaaagtgtgtttatgcggggt 11095376  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
      || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11095377 --acgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 11095454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41080833 - 41080709
Alignment:
Q  296 taggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgcca 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||| | | |||| |    
T  41080833 taggaagagagaagaggagatgaaagagaaaatgtgcttgtg-tgggtccacatgaccacatatcagatttttgcgtgggtgtcaaagggtgttttgcta 41080735  T
Q  396 cctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  41080734 -ctaaggatgtctatgtatcattactc 41080709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 427
Target Start/End: Original strand, 25395256 - 25395438
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||  ||||    
T  25395256 aatgttacatagacatcttttatcctcatacatctttgtacacc-catgtactagaaagagaaaagagaagatgaaagagaaaatgtgtttgtgtggggt 25395354  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaa 427  Q
    | | ||  |||| |||||||||||| ||||| | | || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  25395355 ctatatagccacatgtcagatttttgtgtgggtattaagggatgtatggccacataaggatgtttatgtatcatagctctaaaa 25395438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 418
Target Start/End: Original strand, 48587023 - 48587187
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||          ||||||||||||  |||||| || |    
T  48587023 aatgatacatagacaccctttattcccatatacccttgtacatcccatgcattaggaagagagaa----------aagagaaagtgtacttgtgcgggat 48587112  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcatt 418  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  48587113 ccacgtgactacgtgtcagatttttatgtaggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtatctatgtatcatt 48587187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 425
Target Start/End: Original strand, 21746106 - 21746286
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||| |||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||       
T  21746106 ggaaaatattacatggacatcatttatttacatacacccttgtacacctcatatatttggaagagagaagatgagatgaaagagaaagtgtgcttgtatg 21746205  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgt--ggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaa 425  Q
    |||||         ||||||||||||||| |||  || |||| | | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21746206 gggtc-------ttacgtgtcagatttttgtgtgggggtgtccaggaatgtattgccacctaaggatgtatatgtatcattactctaa 21746286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 424
Target Start/End: Original strand, 48375626 - 48375808
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    ||||||||||||||||| | || |||  |||||| | |||||||||  ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  48375626 aaaatgttacatagacaccctttatttccatacatctttgtacaccctatattctaggaagagagaagaggagaggaaagagaaaatgtgcttgtgcggg 48375725  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    |||||  |||||||  ||||||||||| | ||||| |  | || | ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  48375726 gtccatgtgaccacacgtcagatttttgtatggattttcaggggtgtattgtcacctaagggtgtctatgaatcataactcta 48375808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 419
Target Start/End: Original strand, 25407126 - 25407245
Alignment:
Q  301 agagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcaga-tttttatgtggatgtcaaaggatatattgccaccta 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||    
T  25407126 agagagaagaggagatgaaagagaaagtgtgtttgtgtgggatccatatgatcacgtgtcagattttttgtgtgtgtgtcaaggggtatattgccaccta 25407225  T
Q  400 aggatgtctatgtatcatta 419  Q
     || ||| ||||||||||||    
T  25407226 tggttgtgtatgtatcatta 25407245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 423
Target Start/End: Original strand, 1758404 - 1758559
Alignment:
Q  269 tcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagattttt 368  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  | |||||| | ||||  ||||||||||||    
T  1758404 tcatacacctttgtacacc-catgcattaggaagagagaagaggagatgaaagagaaaatgtgtttgtgtggagtccacgtaaccatatgtcagattttt 1758502  T
Q  369 atgtggatgtcaa--aggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
     ||||| ||||||   || | |||||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  1758503 gtgtgggtgtcaaggggggtgtattgcaacctatggttgactatgtatcataactct 1758559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 43746519 - 43746424
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    ||||||||||||| ||| | ||  || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  43746519 aaaatgttacataaacaccctttgttgtcatacacccttgtacacctcatgcactaggaagaaagaagaggagatgaaagagaaattgtgtttgtg 43746424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11907488 - 11907370
Alignment:
Q  305 agaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggat 404  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||  | |  | ||||| ||||||||| |    
T  11907488 agaagaggagagaaaagagaaaatgtgcttgtgcggggtccatatgaccacatgtcagatttttgtgtgagtgttcaggtgtgtattgtcacctaagggt 11907389  T
Q  405 gtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  11907388 gtctatgtatcataactct 11907370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 36331407 - 36331482
Alignment:
Q  351 accacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaa 426  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| || |  ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  36331407 accacatgccagatttttgtgtggatgtcaaggggtgcattgccatctaagggtgtttatgtatcataactctaaa 36331482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 50052346 - 50052529
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  50052346 ggaaaatgttacatagacaccctttattcccatacacctttgtacaccttatgcactaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgcttgtgcg 50052445  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50052446 gggtccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 50052529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6034222 - 6034044
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  6034222 aatgatacatagacaccttttattctcatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggat 6034123  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6034122 ccacgtgactacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactc 6034044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41236525 - 41236347
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  41236525 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 41236426  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41236425 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtggatgtcaaaaggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactc 41236347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 270 - 429
Target Start/End: Original strand, 11511410 - 11511569
Alignment:
Q  270 catacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagattttta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11511410 catacacccttgtacacctcatgcattaagaagagagaagagaagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggtccacgtgactacgtgtcagattttta 11511509  T
Q  370 tgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaat 429  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11511510 tgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactcaaaaaat 11511569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 29240068 - 29239885
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  29240068 ggaaaatgttacatagacaccctttattcccatacactcttgtacaccccatgcactaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgcttgtgtg 29239969  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29239968 gggtccacgtgactacgtgttagatttttgtgtggatgtcaaatggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 29239885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Original strand, 48182971 - 48183150
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  48182971 aatgatacatagacaccctttattctcatacacccttgtacaccccatgcattaagaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 48183070  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48183071 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacgtaagggtgtctatgtatcattactct 48183150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 239 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 55475374 - 55475190
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  || |||    
T  55475374 tggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttatgc 55475275  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  55475274 agggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaaggatgtttatgtatcataactct 55475190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Original strand, 42044289 - 42044468
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  42044289 aatgatacatagacaccctttatttccatacacccttgtacatcccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 42044388  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42044389 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtacaaggatgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 42044468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 50526089 - 50526271
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||| ||| | || |||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||     
T  50526089 ggaaaatgttacataaacaccctttatttctatacacccttgtacaccccatgcactaggaagagagaagaggagaggaaatagaaagcgtgcttgtgcg 50526188  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50526189 gaatccacgtgaccacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaaagatgtctatgtatcattactc 50526271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 270 - 423
Target Start/End: Original strand, 480395 - 480548
Alignment:
Q  270 catacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagattttta 369  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||||||||     
T  480395 catacacctttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtacggggtccacgtgactacgtgtcagatttttg 480494  T
Q  370 tgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  480495 tgtgggtgtcaaagggtgtattgtcacctaagggtgtctatgtatcattactct 480548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 240 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 47986389 - 47986206
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||     
T  47986389 ggaaaatgttacatagacacctttaattg-catacacccttgtacatcccatgtattaggaagagagaagagaataagaaagagaaagtgtacttgtgcg 47986291  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  47986290 gggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtggatgtcaagggatgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactcta 47986206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 237 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 40574964 - 40574779
Alignment:
Q  237 attggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgt 336  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40574964 attgtaaaatgttagatagacaccttttattctcatacacccttgtacaccccatatattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgt 40574865  T
Q  337 gcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
     | || ||||  |  |  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40574864 tcgggatccatgtagcagcgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattaccacctaaggatgtctatgtatcataactc 40574779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 239 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 41824065 - 41823916
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41824065 tggaaaatgttacatagacaccatttattctcatacacctttgtacacctcatgcattaggaagagagaagaagagagaaaagagaaagtgtgcttgtgc 41823966  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatat 388  Q
     |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  41823965 ggggtccatgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaaggatat 41823916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 19670634 - 19670817
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  19670634 ggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcg 19670733  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||  |||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  19670734 gggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgagtgtcaaggggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactct 19670817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Original strand, 24995029 - 24995208
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||    
T  24995029 aatgatacatagacaccctttattcccatacaccattgtacaccccatgcattaagaagagagaagaggagagaaaagagaaaatgtgcttgtgcggggt 24995128  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  24995129 ccacgtgactacgtgtcaaatttttatgtgggtgtcaaagggtgtattgccatctaagggtgtccatatatcattactct 24995208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 29547877 - 29548060
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  || |||     
T  29547877 ggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagaaaaagtgtacttatgcg 29547976  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    || |||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29547977 ggatccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaagggatgtattgccacctaaggatgtttatgtatcataactct 29548060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 239 - 424
Target Start/End: Original strand, 50813809 - 50813994
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||    
T  50813809 tggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacatctcatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgc 50813908  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
     |||| || |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || | |||| |||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  50813909 ggggttcatatgaccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattaccacctaagagtgtttatgtatcataactcta 50813994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 265 - 422
Target Start/End: Original strand, 54473476 - 54473633
Alignment:
Q  265 attctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagat 364  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  54473476 attcccatacacccttgtacactccatgtattaggaagagagaagaggagagaaaagataaagtgtgcttgtgcggggtccacgtgactacgtgttagat 54473575  T
Q  365 ttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| ||||| ||||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54473576 ttttgtgtgggtgtcaaatggtgtattgtcacctaagggtgtctatgtatcattactc 54473633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31910374 - 31910192
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  31910374 ggaaaatgttacatagacaccatttattcccatacactcttgtacatcccatacattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcg 31910275  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||||||  || | | ||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31910274 gggtccatgtggctatgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagagtgtattgtcacctaaggatgtctatgtatcataactc 31910192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Original strand, 17983664 - 17983823
Alignment:
Q  243 aaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcaggg 342  Q
    ||||||||||||||||  ||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||    
T  17983664 aaatgttacatagacactttttaattgcatacacccttgtacacctcatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcgggg 17983763  T
Q  343 tccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaagg 402  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  17983764 tccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaagg 17983823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23608413 - 23608234
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||    
T  23608413 aatgatacatagacatcctttattcccatacatccctgtacacctcatgcattaggaagagagaagaggagataaaagagaaagtgtgcttgtgtggagt 23608314  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
     ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23608313 tcacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaatggtgtattgtcatctaagggtgtctatatatcattactct 23608234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 282 - 425
Target Start/End: Original strand, 29234205 - 29234348
Alignment:
Q  282 tacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaa 381  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||  | | ||||    
T  29234205 tacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggtccacgtgactacgtgtcagatttttgtgaaggtatcaa 29234304  T
Q  382 aggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaa 425  Q
    ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29234305 agggtgtattgccatctaagggtgtctatgtatcattactctaa 29234348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 382
Target Start/End: Original strand, 56300086 - 56300225
Alignment:
Q  243 aaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcaggg 342  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||||||  |||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  56300086 aaatgttacgtagacattctttattctcatacaatcttgtacatctcatacattagaaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgtttgtgcagga 56300185  T
Q  343 tccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaa 382  Q
    | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  56300186 ttcatatgaccacatgtcagatttttgtgtggatgtcaaa 56300225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 289 - 428
Target Start/End: Original strand, 8343130 - 8343269
Alignment:
Q  289 catgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatat 388  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  8343130 catgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtatacttatgcggggtccatatggccacatgtcagatttttatgtaggtgtcaaaggatgt 8343229  T
Q  389 attgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 428  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  8343230 attgccacctaaggatgtttatgtatcataactcgaaaaa 8343269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 402
Target Start/End: Original strand, 18924413 - 18924575
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  18924413 ggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttttacacctcatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcg 18924512  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaagg 402  Q
    | || || ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  18924513 gagttcatattgccacatgtcagatttttgtgtggatatcaaggggtgtattgccacctaagg 18924575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 29978065 - 29977884
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||| |||  |||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||    
T  29978065 aaaatgttacatagatatcttttattcctatacacacttgtacaccccatacattagtgagagaaaagagaagatgaaagagaaagtgtgcttgtgtggg 29977966  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || || | |||||||||||| || | | ||||||||||||||||    
T  29977965 gtccatatgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaggggtgtattgccacctatggttctgtatgtatcattactct 29977884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 32767140 - 32766957
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |  |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  32767140 ggaaaatgttacatagacacattttaattgcatacacccttgtacactctatgtattagaaagagagaggagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgca 32767041  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||| |||||| || | ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  32767040 gggtccatatggccacatgtcagatttttgtatgggtgtcaaggggtgtattgccacctaagagtgtttatgtatcataactct 32766957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 241 - 423
Target Start/End: Original strand, 48647645 - 48647827
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcag 340  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| | ||||| | |||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  48647645 gaaaatgttacatagacatcatttatttttatacatctttgtacattctatgcactaggaagagagaagaggagaggaaagagaaattgtgcttgtgcgg 48647744  T
Q  341 ggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  | | |||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  48647745 agtccacgtgaccacgtgttagatttttatgtgggtgttaagaggtgtattgttacctaaggatgtttatgtgtcataactct 48647827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 47104723 - 47104543
Alignment:
Q  243 aaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcaggg 342  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||    
T  47104723 aaatgttacgtagacactttttattctcgtacattctagtacacctcatgcattaagaagagagaagaggagatgaaagagaaagtgtgtttgtgtgggg 47104624  T
Q  343 tccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    || | |  ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  47104623 tcaataaaaccacgtgtcaaatttttgtgtgggtgtcagagagtgtattgtcatctaagaatgtctatatatcattactct 47104543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3481826 - 3481654
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||          ||| | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||      
T  3481826 ggaaaatgttacatagacaccctttattctcatacaccct----------atgcactagaaagagagaagatgggaggaaagagaaagtgtgcttgtgtg 3481737  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3481736 gggtccacgtgactatgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagagtgtattgccacctaaaggtgtctatgtatcattactc 3481654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 240 - 414
Target Start/End: Original strand, 29589658 - 29589831
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| | |  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||      
T  29589658 ggaaaatattacatagacaccttttaattgcatacactcttgtacacctcatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgtg 29589757  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtat 414  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||| |||||| || | ||||| || |||||| ||| |||||||    
T  29589758 gggtccatatggccacatatcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattg-caactaagggtgtttatgtat 29589831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 240 - 426
Target Start/End: Original strand, 44536664 - 44536849
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |  ||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  || ||      
T  44536664 ggaaaatgttacatagacacattttaattgcatacattcttgtacaccctatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttatgtg 44536763  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaa 426  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  44536764 gggtctatatgaccacatgtcagatttttgtgtggatgtc-aagggtgtattgccacctaaaagtgtttatgtatcataactctaaa 44536849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 424
Target Start/End: Original strand, 28480186 - 28480370
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||    ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||      
T  28480186 ggaaaatgttacatagacaccctttataagaatacatccttgtacaactcatgcactaggaagagagaagaggagatgaaggagaaagtgtgtttgtgtg 28480285  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||| ||    | ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  28480286 gggtccacatgactacatgtcagatttttgtgtgagtgttaagaagtgtattgtcacctaaggttgtctatgtattataactcta 28480370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 424
Target Start/End: Original strand, 28481061 - 28481245
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||    ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||      
T  28481061 ggaaaatgttacatagacaccctttataagaatacatccttgtacaactcatgcactaggaagagagaagaggagatgaaggagaaagtgtgtttgtgtg 28481160  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||| ||    | ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  28481161 gggtccacatgactacatgtcagatttttgtgtgagtgttaagaagtgtattgtcacctaaggttgtctatgtattataactcta 28481245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 424
Target Start/End: Original strand, 28481936 - 28482120
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||    ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||      
T  28481936 ggaaaatgttacatagacaccctttataagaatacatccttgtacaactcatgcactaggaagagagaagaggagatgaaggagaaagtgtgtttgtgtg 28482035  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||| ||    | ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  28482036 gggtccacatgactacatgtcagatttttgtgtgagtgttaagaagtgtattgtcacctaaggttgtctatgtattataactcta 28482120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 417
Target Start/End: Original strand, 53352496 - 53352660
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  53352496 aatgatacatagacaccctttattttcatacacccttgtacacct--------aggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtatgcttgtgcggggt 53352587  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcat 417  Q
    |||| | || ||||||||||||||| ||| | ||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  53352588 ccacttaactacgtgtcagatttttgtgtaggtgttaaagaatgtattg-cacctaagggtgtctatgtatcat 53352660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 422
Target Start/End: Original strand, 55079680 - 55079814
Alignment:
Q  289 catgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcaggg-tccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggata 387  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||  ||| |||| ||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||  | |     
T  55079680 catgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgtgggggtccatatggccacatgtcagatttttgtatgggtgtcaagaggtg 55079779  T
Q  388 tattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  55079780 tattgccacctaagggtgtttatgtatcataactc 55079814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 374
Target Start/End: Original strand, 18768972 - 18769099
Alignment:
Q  246 tgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtcc 345  Q
    ||||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || | |||| |||||||||| |||| |||||  || |      
T  18768972 tgttacataaacatcatttaccctcatacatccttgtacacc-catgtattaggaagagaaaaaatgagatgaaagagaaaatgtgtttgtgtgggattt 18769070  T
Q  346 acatgaccacgtgtcagatttttatgtgg 374  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18769071 acatgaccacatgtcagatttttgtgtgg 18769099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18769261 - 18769114
Alignment:
Q  269 tcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagattttt 368  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | ||| |||||| || |||||| |||||||||| |||  |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18769261 tcatacactcttgtacacc-catgtactagaaagagaaaaaaggagatgaaagagaaaatgtatttgtgtggggtttacatgaccacgtgtcagattttt 18769163  T
Q  369 atgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcat 417  Q
     ||||| ||| | ||| | ||| |  || ||||||||| ||||||||||    
T  18769162 gtgtgggtgttagagggtgtatgggtacataaggatgtttatgtatcat 18769114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 423
Target Start/End: Original strand, 32939639 - 32939757
Alignment:
Q  299 gaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacct 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    ||||     | ||||||||||||||||| ||||| |||| |  ||| ||||| |||||    
T  32939639 gaagagagaagaggagatgaaagagaaagtgtgtttgtatgaggtc-----ggccacgtgtcagattttt-tgtggctgtcgagagatgtattgtcacct 32939732  T
Q  399 aaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||    
T  32939733 taggatatctatatatcattactct 32939757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29535499 - 29535377
Alignment:
Q  299 gaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacct 398  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||  || ||||| || ||| ||| || |||||| |||||||  |||  ||| ||||| |||||    
T  29535499 gaagagagaataagagatgaaagagaaagtgtgtttgtgtgggatccacgtggccatgtg-catatttttgtgtggataccaagagatgtattgtcacct 29535401  T
Q  399 aaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||  |||||||||||||| ||||    
T  29535400 aagattgtctatgtatcataactc 29535377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 239 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 31976431 - 31976246
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31976431 tggaaaatgttacatagacaccatttattctcatacacccttgtacaccccatacattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgc 31976332  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
     |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31976331 ggggttcatgtgaccacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaagggtatattgccacctaaggatgtctatgtatcataactcta 31976246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17598732 - 17598554
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  17598732 aatgatacatagacaccttttatttccatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 17598633  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17598632 ccacgtgacaacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaagatgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactc 17598554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 11427796 - 11427614
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  11427796 aatgatacatagacaccctttattctcatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggat 11427697  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccaccta--aggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  11427696 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaggatgtattgccacctaagagggtgtctatgtatcattactcta 11427614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32869856 - 32869678
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  32869856 aatgatacatagacaccctttattcccatacatccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 32869757  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32869756 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatctttactc 32869678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 419
Target Start/End: Original strand, 22880580 - 22880755
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  22880580 aatgatacatatacaccatttattcccatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 22880679  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcatta 419  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22880680 ccacgtgactacgtgtcagaattttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcatta 22880755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 31952948 - 31953130
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||      
T  31952948 ggaaaatgttacatagacaccatttattctcatacatccttctacaccccatgcactaggaagagagaagagaagatgaaagagaaagtgtgtttgtgtg 31953047  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31953048 aggtccacatgaacacatgtcagatttttatgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaaggatgtctatctatcattactc 31953130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4231737 - 4231542
Alignment:
Q  233 aaaaattggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtga 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      
T  4231737 aaaaattggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtac 4231638  T
Q  333 ttgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 428  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| || | ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  4231637 ttgtgcggggtccatatggccacgtgtcagatttttgtgtgggtggcaaggggtgtattgccacctaatgatgtttatgaatcataactcaaaaaa 4231542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 238 - 423
Target Start/End: Original strand, 15989958 - 15990143
Alignment:
Q  238 ttggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||    
T  15989958 ttggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatatattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtg 15990057  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    | ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  15990058 cggggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactct 15990143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 31110679 - 31110860
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  31110679 ggaaaatgttacatagacatcctttatttccatacacctttgtacaccccatacattaggaagagagaagagtagagaaaagagaaagtgtgcttgtgca 31110778  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||||||  ||   ||||||||||||||  ||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31110779 gggtccatgtggttacgtgtcagatttt--tgtgagtgtcaaagggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcataactct 31110860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 30341278 - 30341461
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  30341278 ggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatatattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcg 30341377  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  30341378 gggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactct 30341461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 418
Target Start/End: Original strand, 28536408 - 28536582
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||  ||    
T  28536408 aaaatgttacatcgacatcatttattttcatacacccttgtacaccccatgcagtaggaagagggaagagaagataaaagagaaagtgtgcttgtgtggg 28536507  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcatt 418  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28536508 gtccacatgac--cgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaagggttgtattgccacctaaggatgtttatgtatcatt 28536582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 15507942 - 15508124
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  15507942 ggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacatccttgtacaccccatatattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcg 15508041  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  15508042 gggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactc 15508124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 244 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29858005 - 29857821
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| || |    
T  29858005 aatgatacatagacaccatttattcccatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagagaagagaaaagagaaagtgtgcttatgcgggat 29857906  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 428  Q
    |||| | || ||||||||||||||| ||||| ||| ||| | | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  29857905 ccacgtaactacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaaaggtgtattgccatctaaaggtgtctatgtatcattactccaaaaa 29857821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 273 - 428
Target Start/End: Original strand, 31109351 - 31109506
Alignment:
Q  273 acacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgt 372  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || ||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||    
T  31109351 acacccttgtataccccatgcattaggaagagaaaagaggagagaaaagagaaagtgtacttttgcggggtctacgtgactacgtgtcagatttttgtgt 31109450  T
Q  373 ggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 428  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  31109451 ggatgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctattaatcattactcaaaaaa 31109506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 271 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15832728 - 15832576
Alignment:
Q  271 atacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttat 370  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |    
T  15832728 atacacccttgtacaccccatgcattaggaagatagaagaggagaaaaaagagaaaatgtatttgtgcaggatccacgtgactacgtgtcaaatttttgt 15832629  T
Q  371 gtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15832628 gtgggtgtcaaatgatttattgtcacctaaaggtgtctatgtatcattactct 15832576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 279 - 423
Target Start/End: Original strand, 6209422 - 6209566
Alignment:
Q  279 ttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgt 378  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||  |||    
T  6209422 ttgtacatcccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgctagtgcggggtccacgtgactacgtgacagatttttgtgtgagtgt 6209521  T
Q  379 caaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6209522 caaatagtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 6209566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 12732663 - 12732481
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||   |||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||      
T  12732663 ggaaaatgttacatagacatctttatttc-catacatttttgtgcaccttatgtactagaaagagagaagaggagatgaaagagaaaatgtgcttatgtg 12732565  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12732564 ggatccacatagccacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaatgattatattgccacttaagaatgtctatgtatcattactct 12732481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 270 - 419
Target Start/End: Original strand, 23128075 - 23128224
Alignment:
Q  270 catacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagattttta 369  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||| |||| |||||||||||||||     
T  23128075 catacacccttgtacatcccatgcattaggaagagaaaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgtgggatccacgtgactacgtgtcagatttttg 23128174  T
Q  370 tgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcatta 419  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  ||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  23128175 tgtgggtgtcaaaggatgtattatcacataaaggtgtctatatatcatta 23128224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 417
Target Start/End: Original strand, 9379633 - 9379807
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattc-tcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcaggg 342  Q
    ||||||| || |||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||   |     
T  9379633 aatgttatatggacatccttcatttatcatacatccttgtataccttatgcattaggaagagaaaagagaagatgaaagagaaaatgtgtttgtgtgaga 9379732  T
Q  343 tccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcat 417  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | ||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9379733 tccacatggccacgtgtcaaatttttgtatgggtgtcaagggatgtattgtcatctaaggatgtctatgtatcat 9379807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 244 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 946554 - 946377
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| ||||| ||||  ||| ||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || || |    
T  946554 aatgatacattgacactttttattgtcatacattcttgtacatctcatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgctagagcgggat 946455  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattact 421  Q
      || |||| | |||||||||||||  || | ||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  946454 ttacgtgactaggtgtcagatttttgggtaggtgtcaaagggtgtattatcacctaaggatgtctatgtatcgttact 946377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30870193 - 30870066
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    ||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||  ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  30870193 aaaatgtta-atagacaccctttattttcatacacctttgtacaccctatatactagaaagagagaagaggagaggaaagagaaaatgtgcttgtgcggg 30870095  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttat 370  Q
    |||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  30870094 gtccatgtgaccacatgttagatttttat 30870066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 424
Target Start/End: Original strand, 22422084 - 22422120
Alignment:
Q  388 tattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22422084 tattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 22422120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Original strand, 22421996 - 22422043
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacac 286  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  22421996 tggaaaatgttacatagacaccatttattctcatacacccttgtacac 22422043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 499 - 531
Target Start/End: Original strand, 32659867 - 32659899
Alignment:
Q  499 gaagtaagtaaaatttaatcaataattatttta 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32659867 gaagtaagtaaaatttaatcaataattatttta 32659899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 237 - 423
Target Start/End: Original strand, 35468770 - 35468956
Alignment:
Q  237 attggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgt 336  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35468770 attggaaaatgttacatatacaccttttattctcatacatccttatacatctcatgaactaggaagagagaagaggataggaaagagaaagtgtgtttgt 35468869  T
Q  337 gcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35468870 gcagggtccacatggtcacatattagatttttatgtgggtgtcaaatgatgtattgccatctaaggatgtctatgtatcattactct 35468956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Original strand, 8080305 - 8080484
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  8080305 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtacaccccatgcaataggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 8080404  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8080405 ccacgtgactacgtgtcagatttttatgtaggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 8080484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19330020 - 19329842
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  19330020 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 19329921  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19329920 ccacgtgattacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 19329842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Original strand, 4999436 - 4999614
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  4999436 aatgatacatagacaccttttattctcatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagataaaagagaaagtgtgtttgtgcggggt 4999535  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  4999536 ccacgtgactacgtatcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgccatctaagggtgtctatgtatcattactc 4999614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 7389566 - 7389381
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  7389566 aatgatacatagacatcctttattcccatacaccct-gtacaccccatgtattaggaagagagagtaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 7389468  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaata 430  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7389467 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagagtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactcttaaaata 7389381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 238 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 26296828 - 26296642
Alignment:
Q  238 ttggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    |||||||||||||| |||||| | |  |||  ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||    
T  26296828 ttggaaaatgttacgtagacaccatatatttccatacacccttgtacacctcatacattaagaagagagaagaggagagaaaagagaaaatgcgcttgtg 26296729  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26296728 cggggtccatatggccacgtatcagatttttatgtggatgttaaagggtatattgtcacctaaggatgtctatgtatcataactcta 26296642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 421
Target Start/End: Original strand, 32951415 - 32951592
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  32951415 aatgatacatagacaccccttattctcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 32951514  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattact 421  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  32951515 ccacgtgactacgtgttagatttttgtgtggatgttaaaggatgtattgtcatctaagagtgtctatgtatcattact 32951592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35137689 - 35137533
Alignment:
Q  266 ttctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatt 365  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||    
T  35137689 ttctcatacacccttgtacatcccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgtttgtgcggggtccacgtgactacgtgttagatt 35137590  T
Q  366 tttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35137589 tttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatttatcattactc 35137533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 423
Target Start/End: Original strand, 19436114 - 19436288
Alignment:
Q  249 tacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccaca 348  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||| || |||||     
T  19436114 tacatagacaccatttattctcatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagaaaagagaagagaaaagagaaagtgtgcttatgcgggatccacg 19436213  T
Q  349 tgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19436214 tgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgtcacctaaggatgtctatgtatcattactct 19436288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 239 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 22343544 - 22343359
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||    
T  22343544 tggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacacctcatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgc 22343445  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
     ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  22343444 ggggtccatatggtcacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactcta 22343359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 239 - 424
Target Start/End: Original strand, 46033718 - 46033903
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  46033718 tggaaaatgttacatagacaccatttattctcatacacccttgtacaccccatacattaggaatagagaagaggagagaaaagagaaaatatgcttgtgc 46033817  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
     | || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  46033818 ggagttcatgtgaccacgtgtcagatttttatgtgggtgttaaagggtgtattgccacctaagaatatctatgtatcataactcta 46033903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 38837395 - 38837216
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  38837395 aatgatacatagacaccctttatttccatacacccttgtacatcccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 38837296  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38837295 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtaggtgtacaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 38837216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 265 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3784152 - 3783998
Alignment:
Q  265 attctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagat 364  Q
    |||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  3784152 attcacatacattcttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggatccacgtgactacgtgtcagat 3784053  T
Q  365 ttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcatta 419  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3784052 ttttgtgtgggtgtcaaaagatgtattgccacctaagggtgtctatgtatcatta 3783998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 240 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 35523058 - 35522881
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  35523058 ggaaaatgttacataaacaccatttattcccatacacccttgtacaccccatacattaggaagagagaagaagagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcg 35522959  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcat 417  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35522958 ggatccatatggccacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaatggtgtattgccacttaaggatgtctatgtatcat 35522881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 238 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 38044381 - 38044196
Alignment:
Q  238 ttggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  |||||    
T  38044381 ttggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagaaaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtg 38044282  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    | ||||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  38044281 cggggtccatatggctacatgtcagatttttgtgtggatgtcaaggggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactct 38044196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 427
Target Start/End: Original strand, 32564344 - 32564531
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  32564344 ggaagatgttacatagacatattttaattgcatacacccttgtacacctcatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtatttgtgcg 32564443  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaa 427  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||    
T  32564444 gggtccatatagccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaagaatgtttatgtatcataactcaaaaa 32564531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 38267218 - 38267035
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||| ||| || |||  |||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  38267218 aatgatacatagatatcatttatttccatacaccttcgtacatcccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 38267119  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaa 427  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38267118 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgtcacataagggtgtctatgtatcattactcaaaaa 38267035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8238395 - 8238212
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  8238395 ggaaaatgttacatagacgccttttaattgcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcg 8238296  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccaccta-aggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||    
T  8238295 gggtccatatgactacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctacagggtgtttatgtatcataactc 8238212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 40957885 - 40957706
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | || |    
T  40957885 aatgatacatagacacccattattttcatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtgtgcttgtacgggat 40957786  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40957785 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtatcaaagagtgtattgccacctaagagtgtctatgtatcattactct 40957706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21234583 - 21234401
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| ||||||     
T  21234583 ggaaaatgttacatagacaccttttattctcatacaccattgtacaccccatacattaggaagagaggaaaggagaggtaagagaaaatgtgcttgtgcg 21234484  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| ||  || | |||||||| |||||| ||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21234483 gggtacatgtggctacgtgtcaaatttttgtgtgagtgtcaaagggtgtattgtcacctaaggatgtctatgtatcataactc 21234401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 242 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 41915921 - 41915739
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||    
T  41915921 aaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatatattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcggg 41915822  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| ||| | |||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  41915821 gtccatatggccacatgtcagatttttgtgtaggtgtcaaggggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactcta 41915739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 40846031 - 40846213
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | |  |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  40846031 ggaaaatgttacatagataccttttaattgcatacacccttgtacatctcatcttttaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtatttgtgcg 40846130  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||||||| || || || ||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40846131 gggtccatataactacatgttagatttttgtgtggatgtcaaggggtgtattgccacctaaggatgtttatgtatcataactc 40846213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 7728086 - 7727905
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |  |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||| ||    
T  7728086 aaaatgttacatagacaccttttaattgcatacatccttgtacaccccatatattaggaagagagaagagaagaagaaacagaaagtgtacttgtgcggg 7727987  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | | |||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  7727986 gtccatatgaccacatgtcagatttttatgtgaatgtcaagaggtgtattaccacctaagggtgtttatgtatcataactct 7727905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11044356 - 11044187
Alignment:
Q  244 aatgttacatagaca-tctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcaggg 342  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  11044356 aatgatacatagacactcttt-attttcatacacctttgtacacctcatgcattaggaagagagaagatgagaggaaagagaaagtgtacttgtgcgggg 11044258  T
Q  343 tccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||| |||| |||||||||          || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11044257 tccacgtgactacgtgtcag----------gggtgtcaaaggatgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 11044187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 296 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 36208299 - 36208172
Alignment:
Q  296 taggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgcca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| | || |||| |||    
T  36208299 taggaagagagaagaggagaggaaagagaaaatgtgcttgtgcagggtccacgtgaccacatgtcagctttttgtgtgggtgtcaatgaatgtattacca 36208200  T
Q  396 cctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36208199 cctaagggtgtctatgtatcataactct 36208172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 244 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3434730 - 3434560
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||          ||||||||||||| |||||| || |    
T  3434730 aatgatacatagacaccctttattcccatacagccttgtacaccccatgcattaggaagagagaa----------aagagaaagtgtgcttgtgcgggat 3434641  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3434640 ccacgtgactacgtgtcagttttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 3434560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 270 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3694519 - 3694370
Alignment:
Q  270 catacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagattttta 369  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||     
T  3694519 catacactcttgtacaccccatgcattgggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggatccacatgactacgtgtcagatttttg 3694420  T
Q  370 tgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcatta 419  Q
    ||||| ||| ||| | | ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  3694419 tgtgggtgttaaaaggtgtattgtcacctaagggtgtgtatatatcatta 3694370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 313 - 430
Target Start/End: Original strand, 36361904 - 36362021
Alignment:
Q  313 agaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgt 412  Q
    |||| |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36361904 agagaaaagagaaagtgtgcttgtgtggggtccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaggatgtattgccacctaagggtgtctatgt 36362003  T
Q  413 atcattactctaaaaata 430  Q
    |||||||||||| |||||    
T  36362004 atcattactctataaata 36362021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 36362192 - 36362024
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||            |||||||||||||| |||||  ||||    
T  36362192 aatgatacatagacaccctttattctcatacacccttgtacatcccatgtattaggaagaga------------aaagagaaagtgtgcttgtgtggggt 36362105  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36362104 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaggatgtattaccacctaagggtgtctatgtatcattactcta 36362024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31736059 - 31735884
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  31736059 ggaaaatgttagatagataccttttattcccatacacccttgtacaccccatacattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcg 31735960  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    || ||||  || |||||||       ||| ||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31735959 ggatccatgtggccacgtg-------tttgtgtgggtgttaaagagtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcataactc 31735884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 238 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 12311088 - 12310904
Alignment:
Q  238 ttggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||| ||||||| ||  |  | |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||     
T  12311088 ttggaaaatgttacatagacaccctttatttccatacacctttgtacatcttgtatactaggaagagagaagaggaaaggaaagataaaatgtgcttgtt 12310989  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| || |  |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12310988 caggatccacgtgaccacatgtcagatttttgtatggatatcca--gatatatttccacctaagggtgtctatgtatcataactcta 12310904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 241 - 392
Target Start/End: Original strand, 16374743 - 16374894
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcag 340  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||       
T  16374743 gaaaatgttacatagacaccctttattctcatacacctttgtacactccatacattaggaagagagaaaaagagatgaaagagaatgtgtgcttgtgtga 16374842  T
Q  341 ggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattg 392  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  16374843 gatccacgtgaccacgtgtcagatttttgtgtggatgtcaagggatgtattg 16374894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41423864 - 41423682
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||| |     
T  41423864 ggaaaatgttacataaacaccctttattctcatacacctttgtacaccccatgcactaggaagagagaagaggagatgaaagagaaaatatgcttgtacg 41423765  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    || || || ||||||| |||||||||||| |||   ||||||  | | |||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  41423764 ggatctacgtgaccacatgtcagatttttgtgtaagtgtcaagaggtgtattaccatctaatgatgtctatgtatcataactc 41423682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18207359 - 18207179
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    ||||||||| ||||| | | || ||| ||||||||||||||||||   ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||    
T  18207359 aaaatgttagatagataccctttattatcatacacccttgtacactctatccactaggaagagagaagaggagatgaaagagaaagtgtgcttgtgtggg 18207260  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    || ||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18207259 gttcacgtg-ccacgtgttagatttttgtatgggtgtcaagaggtgtattgccacctaaggttgtctatgtatcataactct 18207179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 423
Target Start/End: Original strand, 10343537 - 10343664
Alignment:
Q  296 taggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgcca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||   | || ||||||||||||| ||||| ||||||    | |||| |||    
T  10343537 taggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgcgtctgcagagtccacggaaacatgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaagatgtgtatttcca 10343636  T
Q  396 cctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10343637 cctaagggtgtctatgtatcattactct 10343664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 32046018 - 32045838
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcag 340  Q
    |||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||| || | ||   |    
T  32046018 gaaaatgttacatagacattctttatttacatacacccttgtacatctcatatatttgaaagagagaagatgagatgaaaaagaaagtatgctagtatgg 32045919  T
Q  341 ggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattact 421  Q
    |||| | |||   ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  32045918 ggtctatatggttacgtgtcagatttttatgtgggtgtccagtaatatattgccacctaagaatatatatgtatcattact 32045838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 422
Target Start/End: Original strand, 39255844 - 39256023
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||    ||  |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |     
T  39255844 aaaatgttacatagacaccctttattatcatacacccttgtacattctatccaccgggaagagagaagaggagatgaaagagaaagtgttcttgtgtgga 39255943  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| | ||| | ||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39255944 gtccacgtg-ccacgtgtcagatttttgtatgggtatcaagtggtgtattgccacctaaggttgtctatgtatcataactc 39256023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 328 - 422
Target Start/End: Original strand, 46374808 - 46374902
Alignment:
Q  328 tgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46374808 tgtgcttgtgcggggtccatgtggccacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaagggtgtgttgccacctaaggatgtctatgtatcataactc 46374902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 45223222 - 45223041
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  |||||| | ||||||||| |||  ||| | ||||||||||| |||| |||||||||| || | ||||    |    
T  45223222 aaaatgtcacatagacatcctttatttacatacatctttgtacaccccatatatttgaaagagagaagatgagatgaaagagaaaatgcgcttgtatgag 45223123  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||  | ||||  ||||||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  45223122 gttaatatgattacgtgtcagatttttgtgtagatgttcaagaatgtattgccacctaaggatgtatatatatcattactct 45223041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 384
Target Start/End: Original strand, 27744227 - 27744371
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||| ||| ||| | || |||| |||| | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||      
T  27744227 ggaaaatgttatataaacaccatttattcccatatatccttgtacatcccatgcactaggaagagagaagaggagaggatagagaaaatgtgcttatgag 27744326  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaagg 384  Q
    || ||||| || |||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  27744327 ggatccacgtggccacatgtcagatttttgtgtgggtatcaaagg 27744371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 336
Target Start/End: Original strand, 1766702 - 1766795
Alignment:
Q  243 aaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgt 336  Q
    ||||||||||||||||   ||  |||||||| || |||||| |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1766702 aaatgttacatagacacactttgttctcatatactcttgtatacctcatatactacgaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgcttgt 1766795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 381
Target Start/End: Original strand, 2318160 - 2318302
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattag-ga-agagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    ||||||||||||||||||   || |||  |||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||| |||| |||||||||||| || || ||     
T  2318160 gaaaatgttacatagacacactttatttccatacacctttgtacactccatgcattagagagagagagaagatgagatgaaagagaaagtatgcttatgt 2318259  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaa 381  Q
     |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  2318260 cgggtccacgtgaccacacgtcagatttttgtgtgggtgtcaa 2318302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Original strand, 46374742 - 46374807
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagaga 305  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  46374742 ggaaaatgttacatagacaccatttattcccatacacccttgtacaccccatacattaggaagaga 46374807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 36361847 - 36361908
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagaga 305  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  36361847 aatgatacatagacaccctttattctcatacacccttgtacattccatgtattaggaagaga 36361908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 239 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 32813430 - 32813246
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32813430 tggaaaatgttacatagacaccatttattcccatacacccttgtacaccccatacattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgc 32813331  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32813330 ggggtccatgtgaccacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaagggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcataactct 32813246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 2582093 - 2581914
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  2582093 aatgatacataaacaccctttattctaatacacccttgtacacctcatgtattaggaagagagaagaggagagaaaaaagaaagtgtgcttgtgcggggt 2581994  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2581993 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 2581914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Original strand, 9474798 - 9474976
Alignment:
Q  244 aatgttacatagaca-tctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcaggg 342  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  9474798 aatgatacatagacactcttt-attctcatacacccttgtacatcccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgtttgtgcgggg 9474896  T
Q  343 tccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9474897 tccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactc 9474976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Original strand, 27564657 - 27564835
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  27564657 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 27564756  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27564757 ccacgtgattacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 27564835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 244 - 428
Target Start/End: Original strand, 48716204 - 48716388
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  48716204 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggaaagaaaagataaagtgtgcttgtgcggggt 48716303  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 428  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  48716304 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtggatgtcaaatggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactcaaaaaa 48716388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 238 - 426
Target Start/End: Original strand, 51898599 - 51898787
Alignment:
Q  238 ttggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || |||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  51898599 ttggaaaatgttacataaacaccctttatttctatacacccttgtacaccccatgcactaggaagagagaagaggagaggaaatagaaagtgtgcttgtg 51898698  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaa 426  Q
    | || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51898699 cgggatccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaaagatgtctatgtatcattactctaaa 51898787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 50630629 - 50630455
Alignment:
Q  251 catagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatg 350  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  50630629 catagacaccatttattctcatacacccttgtacaccctatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggtccacgtg 50630530  T
Q  351 accacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaa 425  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  50630529 actacgtgtcagatttttgtgtgggtaacaaaggatgtattgccacctaagggtatctatgtatcattactctaa 50630455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 242 - 423
Target Start/End: Original strand, 23597011 - 23597192
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| |    
T  23597011 aaaatgttacatagacattttttattctcatacatccttggacacctcatgaactaggaatagagaataggagagaaaagataaagtgtgtttgtgcaag 23597110  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23597111 gtcaacgtggccacgtgtcagatttttatgtgggtatcaaagagtgtattgccacctaatgatgtctatgtatcattactct 23597192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 41758983 - 41758803
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  41758983 aatgatacatagacaccctttattctcatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgtttgtgcggggt 41758884  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    |||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  41758883 ccatgtgactacgtgtcagatttttgtgtggttgtcaaagggtgtattgccatttaatggtgtctatgtatcattactcta 41758803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 265 - 423
Target Start/End: Original strand, 38632264 - 38632422
Alignment:
Q  265 attctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagat 364  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  38632264 attcccatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagaaaaagtgtgcttgtgcggggtccacgtgactacgtgtcagat 38632363  T
Q  365 ttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38632364 ttttgtgtggatgttaaaaggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactct 38632422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 37649376 - 37649198
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |  |    
T  37649376 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagggaaagtgtgcttgtgcggaat 37649277  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37649276 tcacgtgaccacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagagtgtattgccacctaaagatgtctatgtatcattactc 37649198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 242 - 423
Target Start/End: Original strand, 49811447 - 49811628
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |     
T  49811447 aaaatgttacatagacaccctttattctcatacacccttgtgcaccacatacattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgga 49811546  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49811547 gtctatatggctacgtgtcagatttttgtgtggatgtcaaatggtgtattgtcacctaaggatgtctatctatcataactct 49811628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3000497 - 3000319
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| ||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||    
T  3000497 aatgatacatagacatccattatttccatacacccttgtacaccccatatattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtgtgcttgtacggggt 3000398  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3000397 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcattactc 3000319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 240 - 421
Target Start/End: Original strand, 11152296 - 11152476
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||| ||||||| | || ||||||||||| |||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||     
T  11152296 ggaaaatgttatatagacaccatttattctcatacatccttctacaccccatgcactgggaagagagaagaggagaggaaaaagaaagcgtgcttgtgcg 11152395  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattact 421  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11152396 gggtctacatgactacgtgtcagatttttgtgtggatgtcgaagggtgtattgccacctaagg-tgtctatgtttcattact 11152476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 38595332 - 38595153
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| ||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||    
T  38595332 aatgatacatagacatccattatttccatacacccttgtacaccccatatattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtgtgcttgtacggggt 38595233  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  38595232 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaaaggtgtttatgtatcattactct 38595153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Original strand, 47452242 - 47452420
Alignment:
Q  244 aatgttacatagaca-tctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcaggg 342  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||     
T  47452242 aatgatacatagacactcttt-attcccatacatccttgtacaccccatgcaataggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggga 47452340  T
Q  343 tccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47452341 tccacgtgactacgtgttagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattaccacctaagggtgtctatgtatcattactc 47452420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 239 - 422
Target Start/End: Original strand, 50590917 - 50591100
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||    
T  50590917 tggaaaatgttacatagataccttttaattgcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgc 50591016  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
     ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  50591017 ggggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactc 50591100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 5958918 - 5959101
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  5958918 ggaaaatgttacatagacacattttaattgcatacacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcg 5959017  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  | | ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  5959018 gggtccatatgaccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaagaggtgtattgccacttaagggtgtttatgtatcataactct 5959101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 265 - 423
Target Start/End: Original strand, 8346330 - 8346489
Alignment:
Q  265 attctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaa-gaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcaga 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8346330 attctcatacacctttgtacactccatgcattaggaagagaaaaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcagggtccacgtgactacgtgtcaga 8346429  T
Q  364 tttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  8346430 tttttgtgtgggtgtcaaatggtgtattgccacctaaaggtgactatgtatcattactct 8346489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 41608404 - 41608599
Alignment:
Q  233 aaaaattggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtga 332  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||| | |  ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      
T  41608404 aaaaaatggaaaatgttacataaacaccttttaattgcatacacccttgtacaccctatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtac 41608503  T
Q  333 ttgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 428  Q
    |||| | ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||  |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  41608504 ttgtacggggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgagtgtcaaggggtgtattgccacctaaggatgtttatgtatcataactcaaaaaa 41608599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43310 - 43132
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||| | | || ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||    
T  43310 aatgatacatagataccctttattcttatacactcttgtacaccccatgcattagaaagagagaggaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggagt 43211  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  43210 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaggatgtattgtctcctaagactgtctatgtatcattactc 43132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 428
Target Start/End: Original strand, 45044469 - 45044666
Alignment:
Q  231 ttaaaaattggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgt 330  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  45044469 ttaaaaaaaggaaaatgttacgtagacatcatttattctcatacacccttgtacaccccatacattaggaagagagaagagaagagaaaagagaaaatgt 45044568  T
Q  331 gattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 428  Q
    | |||||| |||||||  || | || |||||||||||| | ||| ||||||| | | ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| ||||    
T  45044569 gtttgtgcggggtccatgtggctacatgtcagatttttgtatgggtgtcaaatggtgtattgccacctaaggaaatgtatgtatcataactcttaaaa 45044666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 234 - 424
Target Start/End: Original strand, 37926350 - 37926540
Alignment:
Q  234 aaaattggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgat 333  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| | || |||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  37926350 aaaaatggaaaatattatatagacaccatttattcacatacatccttgtacaccccatacattaggaagagagaagagaagagaaaagagaaagtgtact 37926449  T
Q  334 tgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
    ||| | || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  37926450 tgtacgggatccatgtggccacgtgtcagatttttatgtgggtgttaaaagatgtattgccacctaaagatatctatgtatcataactcta 37926540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 244 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 26274607 - 26274435
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||   || ||||| |||||||  ||||||||| |    
T  26274607 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtgcatctcatgcattaggaagagagaagag---agaaaagaaaaagtgtacttgtgcaggat 26274511  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcatta 419  Q
    |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26274510 ccacgtgactatgtgtcagatttttctgtggatgtcaaatgatgtattgccacataagggtgtctatgtatcatta 26274435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 288 - 419
Target Start/End: Original strand, 44548342 - 44548473
Alignment:
Q  288 tcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggata 387  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| | |     
T  44548342 tcatgcattaggaagagagaagaagagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggtccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtatcaaatggtg 44548441  T
Q  388 tattgccacctaaggatgtctatgtatcatta 419  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44548442 tattgccacctaaagatgtctatgtatcatta 44548473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 3302451 - 3302633
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||       
T  3302451 ggaaaatgttatataaacatcctttattaacatacacccttgtacaccctatatatttggaagagagaagatgagatgaaaaagaaagtgtgcttgtatg 3302550  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3302551 gggtccatatgattacgtgtcagatttttgtgtgggtgtccaggaatatattgtcacctaaggatgtatatgtatcattactc 3302633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47748624 - 47748443
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||     
T  47748624 ggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacactcttgtacaccccatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtatacttgtgcg 47748525  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    || |||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||||||| | | |||||||||| ||||    
T  47748524 ggatccatatggccacatgtcagatttttatatgggtgtc-aagggtgtattgccacctaagggtatttatgtatcataactc 47748443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 44454169 - 44453984
Alignment:
Q  236 aattggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtac----acctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtg 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||| |||    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44454169 aattggaaaatgttacataaacaccatttattcttatacacccttatactctgaccccatgcattaggaagagagaagatgagaggaaagaaaaagtgtg 44454070  T
Q  332 attgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcat 417  Q
     |||||  || ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| | ||||  ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  44454069 cttgtgtgggatccacgtaaccacatgtcagatttttgtgtgggtatcaagagatgtattgccacttaaaggtgtctatgtatcat 44453984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 392
Target Start/End: Original strand, 44332288 - 44332441
Alignment:
Q  239 tggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgc 338  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | |  |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||    
T  44332288 tggaaaatgttacatagataccttttaattgcatacacccttgtacactctatgtattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtatacttgtgc 44332387  T
Q  339 agggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattg 392  Q
     ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  44332388 ggggtccatagggccacatgtcagatttttatgtgggtgtcaagagatatattg 44332441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6261054 - 6260870
Alignment:
Q  238 ttggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||||||  ||  | ||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||    
T  6261054 ttggaaaatgttacatacacaccatttattttcatacacctttgtacaccctatatactagaaagagagaagaggagaagaaatagaaaatgtgcttatg 6260955  T
Q  338 cagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||  | || | |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  6260954 cggggtccacgtgaccacatgttagatttttatgtgggtgttcaggggtgtattaccacctaaggatatctatctatcataactc 6260870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 7740858 - 7740731
Alignment:
Q  297 aggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccac 396  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |  |||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||||| |||| ||||| |||    
T  7740858 aggaagagagaagaggagatgaaaaagaaaatatatttgtgtggggtccacatagccacgtgtcatatttttatgtaggtgtcaatggatgtattgtcac 7740759  T
Q  397 ctaaggatgtctatgtatcattactcta 424  Q
     ||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  7740758 ataaggttgtcaatgtatcataactcta 7740731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 273 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13414910 - 13414799
Alignment:
Q  273 acacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgt 372  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||    
T  13414910 acaccctagtacactccatgcattaggaagagagaagatgatagaaaagagaaaatgtgcttgtgtggggtccacgtgactacgtgttagatttttgtgt 13414811  T
Q  373 ggatgtcaaagg 384  Q
    || |||||||||    
T  13414810 gggtgtcaaagg 13414799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48489426 - 48489343
Alignment:
Q  296 taggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtc 379  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  48489426 taggaagagagaagaggtgagaaaatagaaaatgtgcttgtgcgggatccacgtgaccacatgtcagatttttgtgtggatgtc 48489343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 26440844 - 26440741
Alignment:
Q  312 gagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatg 411  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||     
T  26440844 gagagaaaagagaaagtgtgcttatgcgggatccatgtggccacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaagggtgtattgtcatctaaggatgtctatc 26440745  T
Q  412 tatc 415  Q
    ||||    
T  26440744 tatc 26440741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 331
Target Start/End: Original strand, 34339958 - 34340056
Alignment:
Q  232 taaaaattggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtg 331  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||  ||| | | |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  34339958 taaaaatagaaaaatgttacatagacaccttttattttca-acactcttgtacaccctatgcacttggaagagagaagagaagagaaaaaagaaactgtg 34340056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 302
Target Start/End: Original strand, 11322298 - 11322358
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaag 302  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  11322298 aaaatgttacatagagatcctttattctgatatacccttctacacctcatgcattaagaag 11322358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 302
Target Start/End: Original strand, 11480319 - 11480379
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaag 302  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  11480319 aaaatgttacatagagatcctttattctgatatacccttctacacctcatgcattaagaag 11480379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 40145585 - 40145407
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  40145585 aatgatacatagacaccctttattctcatatacccttgtacacctcgtgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 40145486  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40145485 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtggatgttaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactc 40145407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 241 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6679879 - 6679692
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcag 340  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |    
T  6679879 gaaaatgttacatagacatcatttattgtcatacacccttgtacaccctatacattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaaatgtgtttgtgcgg 6679780  T
Q  341 ggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 428  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6679779 ggtccatgtgaccacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgccacctaaagatgtctatgtatcataactctaaaaa 6679692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 419
Target Start/End: Original strand, 18520806 - 18520981
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18520806 aatgatacatagacaccctttattttcatacacccttgtacacctcatgcattaggaagagagaagaggagataaaagagaaagtgtgcttgtgcggggt 18520905  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcatta 419  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18520906 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcatta 18520981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 244 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2740452 - 2740270
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  2740452 aatgatacatagacaccctttattcccatacacccttgtacatcccatgcattaggaagagagaaggggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggat 2740353  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaa 426  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740352 ccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaa 2740270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 423
Target Start/End: Original strand, 36732872 - 36733043
Alignment:
Q  252 atagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatga 351  Q
    ||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  36732872 atagacaccctttattcccatacacccttgtacacctcatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcggggtccacgtga 36732971  T
Q  352 ccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    | | ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36732972 ctatgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgctacctaagggtgtctatgtatcattactct 36733043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Original strand, 33149560 - 33149738
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  33149560 aatgatacatagacaccctttattctcgtacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggat 33149659  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33149660 ccacgtgactacgtgtcaaatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattaccacctaagggtgtctatgtatcattactc 33149738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35785377 - 35785199
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  35785377 aatgatacatagacaccttttatttccatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagatgagagaaaagagaaagtgtgattgtgcgggat 35785278  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35785277 ccacgtaactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattactc 35785199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 235 - 430
Target Start/End: Original strand, 2252081 - 2252276
Alignment:
Q  235 aaattggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgatt 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||    
T  2252081 aaataggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatatattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtactt 2252180  T
Q  335 gtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaata 430  Q
    |||| ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  2252181 gtgcggggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaaggatgtttatgtatcataactctataaata 2252276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 15409528 - 15409711
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||     
T  15409528 ggaaaatgttacataaacaccctttattcgcatacacccttgtacaccccatacattaggaagagagaagaggagagaaaagagagagtgtgcttgtgcg 15409627  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||||||  || | ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15409628 gggtccatgtggctacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagaatgtattgtcacctaaggatgtctatgtatcataactct 15409711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 235 - 422
Target Start/End: Original strand, 20073429 - 20073616
Alignment:
Q  235 aaattggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgatt 334  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20073429 aaataggaaaatgttagatagacattttttattctcatacacctttgtaaatctcatgaactaggaagagagaagaggagaggaaatagaaagtgtgctt 20073528  T
Q  335 gtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||  ||||||||| | ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  20073529 gtgcagggtccacgtggtcacgtgcaagatttttatgtgagtgtcaaagggtgtattgtcatctaatgatgtctatatatcattactc 20073616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13811825 - 13811651
Alignment:
Q  249 tacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccaca 348  Q
    |||||||||| | || |||| |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  13811825 tacatagacaccatttattcccatacatccttgtacatcccatgcattaggaagagagaagaggagagagaagagaaagtgtgcttgtgcggggtccacg 13811726  T
Q  349 tgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13811725 tgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaatgatgtattgccacctaagggtgtctatgtatctttactct 13811651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 244 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14831992 - 14831814
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| || |    
T  14831992 aatgatacatagacaccctttattcccatacatccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagaggagaaaaaaaagaaagtgtgcttgtgcgggat 14831893  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14831892 ccacgtgactacgtgtcagatttttatgtgggtgtcaaagggtgtattgccacctaagagtgtctatgtatcattactc 14831814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26720698 - 26720516
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||     
T  26720698 ggaaaatgttatatagacatcatttattctcatacaccctagtacaccccatacattaggaagagagaagagaagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcg 26720599  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    || ||||  || ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26720598 ggatccatgtggccacgtgtcagatttttttgtaggtgttaaagggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcataactc 26720516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26990447 - 26990265
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||     
T  26990447 ggaaaatgttatatagacatcatttattctcatacaccctagtacaccccatacattaggaagagagaagagaagagaaaagagaaagtgtgcttgtgcg 26990348  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    || ||||  || ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26990347 ggatccatgtggccacgtgtcagatttttttgtaggtgttaaagggtgtattgccacctaaggatgtctatgtatcataactc 26990265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 242 - 422
Target Start/End: Original strand, 35943812 - 35943992
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  35943812 aaaatgttacatagacacattttatttccatacacccttgtacaccccatgcactaggaagagaaaagaggagaggaaagagaaagtgtgcttgtgtggg 35943911  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
     ||||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35943912 atccacgtaactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaatgatgtattgccacctaagggtgtctatgtatcataactc 35943992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31009170 - 31008987
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||     
T  31009170 ggaaaatgttacatagacaccctttattctcatacacctttgtacaccccatgcactaggaagagagaagagaagaggaaatagaaagtgtgcttgtgcg 31009071  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31009070 ggatccacgtgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtggaagaatgtattgtcacctaaggatgtttatgtatcataactct 31008987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 423
Target Start/End: Original strand, 3921183 - 3921366
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  3921183 ggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacaccccatatattaggaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtacttgtgcg 3921282  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  3921283 gggtccatatggccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacctaagggtgtttatgtatcataactct 3921366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 241 - 422
Target Start/End: Original strand, 33825243 - 33825424
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcag 340  Q
    ||||||||||||| |||| | || ||||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |     
T  33825243 gaaaatgttacattgacaccatttattctcatacagccttctacaccccatgcactaggaagagagaagagaagataaaagagaaagtgtgcttgtgtaa 33825342  T
Q  341 ggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33825343 ggttcacatgaacacgtgtcagatttttatgtgggtgtcaaggagtgtattgccacctaagaatgtctatgcatcattactc 33825424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28177903 - 28177775
Alignment:
Q  294 attaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgc 393  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  28177903 attaggaagagggaagaggagagaaaagagaaagtgtgtttgtgcggggtccatgtgaccacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgc 28177804  T
Q  394 cacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28177803 cacctaaggatgtctatgtatcataactc 28177775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 428
Target Start/End: Original strand, 39688806 - 39689003
Alignment:
Q  231 ttaaaaattggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  39688806 ttaaaaataggaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacctttgtacaccctatgtattaggaagagagaagaaaagaagaaagagaaagtgt 39688905  T
Q  331 gattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 428  Q
      || ||| |||| || |||||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  39688906 acttatgcggggttcatatgaccacatatcagatttttgtgtgggtgtcaagggatgtattgccacttaagggtgtttatgtatcataactcttaaaa 39689003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 422
Target Start/End: Original strand, 42414275 - 42414402
Alignment:
Q  295 ttaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgcc 394  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  42414275 ttaggaagagagaagaggaaagaaaagataaagtgtgcttgtgcggggtccacatgactacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgcc 42414374  T
Q  395 acctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||    
T  42414375 acctactggtgtctatgtatcattactc 42414402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327902
Alignment:
Q  231 ttaaaaattggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgt 330  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| | || ||| ||||| ||  || |||||| |||  |||||| ||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  16328092 ttaaaaaatggaaaatgttagataaacaccatttattttcatatacttttctacaccccatatattagggagagagaagagaaaatgaaagaaaaagtgt 16327993  T
Q  331 gattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattact 421  Q
    | |||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  16327992 gcttgtgtgaggtgcacatgaacacgtgtcagatttttatgtgggtgtcaatggatgtattgccacctaaggatatttatctatcattact 16327902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 378
Target Start/End: Original strand, 39557455 - 39557573
Alignment:
Q  260 ctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgt 359  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||  ||| |||||||    
T  39557455 cttttattctcatagatccatgtacacctcatgtattaggaagagagaagaggagataaaagagaaagtgtgattgtatggggtccatgtgatcacgtgt 39557554  T
Q  360 cagatttttatgtggatgt 378  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  39557555 cagatttttgtgtggatgt 39557573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9603993 - 9603812
Alignment:
Q  242 aaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagg 341  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||| | || | | || |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||   ||    
T  9603993 aaaatgttacgtagacaccatttattctcatacacctttgtacatcccaagcactaagaagagagaagacgaaatgaaagagaaagtgtgattgtatggg 9603894  T
Q  342 gtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||| || |  | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9603893 gtccatatgaccatgtgtcagatttttgtgtaggtgtgaatgagtgtattatcacctaaggatgtatatgtatcattactct 9603812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 421
Target Start/End: Original strand, 36875564 - 36875702
Alignment:
Q  274 cacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtg 373  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||          |||||| ||||    
T  36875564 cacccttgtacaccccatgtattaggaagagagaagaggagaaaaaagagaaagtgtgcttgtgcgggatccacgtgac---------tatttttgtgtg 36875654  T
Q  374 gatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattact 421  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36875655 ggtgtcaaagggtgtattgccacctaagggtgtctatgtatcattact 36875702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 240 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21370186 - 21370058
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| ||||||| || ||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||     
T  21370186 ggaaaatgttacataaacaccctttattttcatacacctttgtacatcttatatactaggaagaaagaagatgagaggaaagagaaaatgtgtttgtgcg 21370087  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagattttt 368  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21370086 gggtccacgtgaccacatgtcagattttt 21370058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 6259919 - 6260101
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||| |||||||| | |||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||      
T  6259919 ggaaaatgttacatagatatcctttattcctatacacacttgtacatcccatacattagtgagagagaagaggagatgaaagagaaagtgtgcttctgtg 6260018  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
     ||||||  |||||| |||| ||||||||  |||| ||| ||||| | ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  6260019 aggtccatgtgaccatgtgttagatttttgcgtgggtgttaaagggtgtattgtcacctatggttgtgtatgtatcattactc 6260101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2177546 - 2177449
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtg 337  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2177546 ggaaaatgttacagagacacattttattctcatacacccttgtacatccaatgcactaggaagagagaagaggagaggaaagagaaaatgtgcttgtg 2177449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 333 - 425
Target Start/End: Original strand, 41470427 - 41470519
Alignment:
Q  333 ttgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaa 425  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || || | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  41470427 ttgtgcggggtccacgtgactacgtgtcagatttttatatgaattttaaaggatgtattgccacctaaaggtgtctatgtattattactctaa 41470519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25831435 - 25831334
Alignment:
Q  272 tacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatg 371  Q
    |||||| ||||| ||| |||  ||||| |||| | ||||||| | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25831435 tacacctttgtagaccccatccattagaaagaaaaaagaggatatgaaagagaaaatgtgtttgtgtggggtccacatgaccacgtgttagatttttttg 25831336  T
Q  372 tg 373  Q
    ||    
T  25831335 tg 25831334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10356698 - 10356639
Alignment:
Q  359 tcagatttttatgtggatgtcaaagg-atatattgccacctaaggatgtctatgtatcat 417  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10356698 tcagatttttgtgtgggtgtcaatgggatgtattgccacctaaggatgtctatgtatcat 10356639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31132512 - 31132390
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||          ||||| ||||| || |||||| ||||    
T  31132512 aatgatacataaacaccctttattttcatacacccttgtacacctcatgcattagaaagagaga----------aaagaaaaagtatgcttgtgcggggt 31132423  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggat 376  Q
    |||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  31132422 ccacgtgactacttgtcagatttttgtgtggat 31132390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1268 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1268
Description:

Target: scaffold1268; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 241 - 422
Target Start/End: Original strand, 848 - 1029
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcag 340  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  848 gaaaatgttacataaacaccctttattcccatacactcttgtacaccccatgcactaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgcttgtgcgg 947  T
Q  341 ggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    | | ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  948 gattcacgtgactacgtgtcagttttttgtgtggatgttaaagggtgtattgccacctaaagatgtctatgtatcattactc 1029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1267 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1267
Description:

Target: scaffold1267; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 241 - 422
Target Start/End: Original strand, 848 - 1029
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcag 340  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  848 gaaaatgttacataaacaccctttattcccatacactcttgtacaccccatgcactaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgcttgtgcgg 947  T
Q  341 ggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    | | ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  948 gattcacgtgactacgtgtcagttttttgtgtggatgttaaagggtgtattgccacctaaagatgtctatgtatcattactc 1029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 270 - 423
Target Start/End: Original strand, 10057 - 10210
Alignment:
Q  270 catacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagattttta 369  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10057 catacacccttgtacaccctatgcattaggaagagagaagaggagagaaaagagaaagtgtgcttgtacgcggtccacgtgactacgtgtcagattttta 10156  T
Q  370 tgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactct 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  10157 tgtggatgtcaaaggatgtattgccacctaaaggtgtctatgtatcataactct 10210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 244 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4207 - 4023
Alignment:
Q  244 aatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggt 343  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| || |    
T  4207 aatgatacatagacaccatttattcccatacacccttgtacaccccatgcattaggaagagagaagagaagagaaaagagaaagtgtgcttatgcgggat 4108  T
Q  344 ccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactctaaaaa 428  Q
    |||| | || ||||||||||||||| ||||| ||| ||| | | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  4107 ccacgtaactacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaaaggtgtattgccatctaaaggtgtctatgtatcattactccaaaaa 4023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 240 - 422
Target Start/End: Original strand, 8781 - 8963
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgca 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||||      
T  8781 ggaaaatgttacatagacaccttttattcttatacacccttgtacaccccatatattaggaagagagaagatgggaggaaagagaaaatgtacttgtgtg 8880  T
Q  340 gggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaaggatgtctatgtatcattactc 422  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||| ||| |||||||||   | ||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  8881 gggtccacgtgactatgtgtcaaatttttgtgtagatgtcaaatagtgtattgtcacttaaggatgtctatatatcataactc 8963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 241 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 152679 - 152518
Alignment:
Q  241 gaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcag 340  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |    
T  152679 gaaaatgttacatagacaccttttaattgcatacacccttgtacatcccatgtattagaaagagagaagagaagaagaaagagaaagtgtatttgtgcgg 152580  T
Q  341 ggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccacctaagg 402  Q
    | |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||| ||||    
T  152579 gatccatatgaccacatgtcagatttttgtgtgggtgtcaaggggtgtattgccacccaagg 152518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17168 - 17077
Alignment:
Q  308 agaggagaggaaagagaaagtgtgattgtgcagggtccacatgaccacgtgtcagatttttatgtggatgtcaaaggatatattgccaccta 399  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  17168 agagaagaggaaagagaaaatgtgcttgtgcggggtccatgtgaccacatgtcagatttttgtgtggatgtcgagggatgtattgcaaccta 17077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17285 - 17199
Alignment:
Q  240 ggaaaatgttacatagacatctttcattctcatacacccttgtacacctcatgaattaggaagagagaagaggagaggaaagagaaa 326  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||  |||||||| |||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17285 ggaaaatgttacatagacaccctttatttccatacacctttgtacaccttatattctaggaagagagaagaggagaggaaagagaaa 17199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University