View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13434_low_7 (Length: 417)

Name: NF13434_low_7
Description: NF13434
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13434_low_7
NF13434_low_7
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (16-252)||(37260167-37260418)
chr8 (262-401)||(32984113-32984252)
chr8 (263-401)||(24079937-24080075)
chr8 (262-401)||(2714556-2714695)
chr8 (262-401)||(5946054-5946193)
chr8 (262-401)||(6365993-6366132)
chr8 (262-401)||(37956428-37956567)
chr8 (262-394)||(9734262-9734393)
chr8 (262-385)||(31831007-31831130)
chr8 (262-401)||(32114256-32114395)
chr8 (262-385)||(37419947-37420070)
chr8 (262-401)||(40435189-40435328)
chr8 (262-401)||(41231953-41232092)
chr8 (262-393)||(41862227-41862358)
chr8 (262-385)||(43328714-43328837)
chr8 (262-401)||(45236601-45236740)
chr8 (262-401)||(10646130-10646269)
chr8 (262-401)||(25185906-25186045)
chr8 (262-401)||(33730677-33730816)
chr8 (262-401)||(44088479-44088618)
chr8 (263-401)||(9303610-9303748)
chr8 (263-401)||(13356156-13356294)
chr8 (263-401)||(33981699-33981837)
chr8 (263-393)||(35628785-35628915)
chr8 (262-391)||(9013691-9013820)
chr8 (264-401)||(13760684-13760821)
chr8 (262-393)||(17718766-17718897)
chr8 (262-401)||(29048439-29048578)
chr8 (262-401)||(37301361-37301500)
chr8 (262-401)||(41653902-41654041)
chr8 (263-401)||(45258518-45258656)
chr8 (262-385)||(2275920-2276042)
chr8 (263-385)||(45066644-45066766)
chr8 (262-401)||(22878398-22878537)
chr8 (263-401)||(41639922-41640060)
chr8 (262-401)||(42701325-42701465)
chr8 (262-393)||(25248046-25248171)
chr8 (266-362)||(39915887-39915983)
chr8 (311-401)||(12032986-12033076)
chr8 (276-354)||(41981454-41981532)
chr8 (266-347)||(117408-117489)
chr8 (266-347)||(31940326-31940407)
chr8 (266-347)||(40458851-40458932)
chr8 (304-401)||(3904126-3904222)
chr8 (266-347)||(4975486-4975567)
chr8 (266-347)||(27243218-27243299)
chr8 (266-347)||(27254793-27254874)
chr8 (321-401)||(41981534-41981614)
chr8 (266-347)||(4447374-4447455)
chr8 (266-347)||(10378320-10378401)
chr8 (266-347)||(32373805-32373886)
chr8 (266-347)||(41843264-41843345)
chr8 (262-354)||(33896915-33897006)
chr8 (266-320)||(33622571-33622625)
chr8 (266-401)||(2379151-2379275)
chr8 (266-347)||(3211217-3211297)
chr8 (266-339)||(3490486-3490559)
chr8 (266-347)||(9509479-9509560)
chr8 (262-364)||(31148953-31149054)
chr8 (266-347)||(38631663-38631744)
chr8 (266-347)||(9713700-9713778)
chr8 (263-354)||(26196389-26196479)
chr8 (262-334)||(164729-164800)
chr8 (267-322)||(40649935-40649990)
chr8 (324-394)||(31336163-31336233)
chr8 (362-401)||(33622502-33622541)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (262-401)||(2324925-2325064)
chr2 (262-401)||(13815254-13815393)
chr2 (262-401)||(23901785-23901924)
chr2 (262-401)||(746472-746611)
chr2 (262-401)||(6594494-6594633)
chr2 (262-401)||(11184978-11185117)
chr2 (262-401)||(38997107-38997246)
chr2 (263-401)||(34518374-34518512)
chr2 (262-401)||(4034598-4034737)
chr2 (262-401)||(6430479-6430618)
chr2 (262-393)||(14660452-14660583)
chr2 (262-401)||(17600842-17600981)
chr2 (262-401)||(26710351-26710490)
chr2 (262-401)||(32608386-32608525)
chr2 (266-401)||(40635228-40635363)
chr2 (262-401)||(45370996-45371135)
chr2 (263-401)||(10244618-10244756)
chr2 (262-401)||(5726135-5726274)
chr2 (262-401)||(10424601-10424740)
chr2 (262-401)||(27024421-27024560)
chr2 (262-401)||(27400409-27400548)
chr2 (262-401)||(27651070-27651209)
chr2 (262-401)||(32327367-32327506)
chr2 (262-401)||(32948452-32948590)
chr2 (263-385)||(2914190-2914312)
chr2 (263-401)||(4609633-4609771)
chr2 (265-401)||(12842112-12842248)
chr2 (262-401)||(33427683-33427822)
chr2 (263-401)||(37620903-37621044)
chr2 (263-401)||(1091987-1092125)
chr2 (262-401)||(7892724-7892863)
chr2 (262-401)||(40037149-40037288)
chr2 (262-401)||(37255373-37255507)
chr2 (262-385)||(40735470-40735593)
chr2 (263-401)||(14697573-14697711)
chr2 (262-380)||(42899921-42900039)
chr2 (262-401)||(9444689-9444835)
chr2 (262-401)||(15925086-15925225)
chr2 (265-401)||(11159631-11159766)
chr2 (262-401)||(8432952-8433091)
chr2 (270-401)||(32856472-32856603)
chr2 (266-401)||(41172468-41172603)
chr2 (307-401)||(25294886-25294980)
chr2 (262-335)||(12814620-12814693)
chr2 (266-401)||(35158086-35158210)
chr2 (266-401)||(145292-145416)
chr2 (266-347)||(28641371-28641452)
chr2 (266-347)||(39301276-39301357)
chr2 (262-354)||(44481834-44481926)
chr2 (304-401)||(1229675-1229772)
chr2 (266-401)||(4258500-4258623)
chr2 (266-347)||(8056636-8056717)
chr2 (266-347)||(12333574-12333655)
chr2 (266-347)||(29687051-29687132)
chr2 (262-354)||(35126786-35126878)
chr2 (266-347)||(3266306-3266387)
chr2 (266-347)||(21734979-21735060)
chr2 (266-347)||(27331308-27331389)
chr2 (266-347)||(27764941-27765022)
chr2 (266-339)||(34249275-34249348)
chr2 (266-347)||(40544155-40544236)
chr2 (266-346)||(12730071-12730151)
chr2 (332-401)||(447669-447738)
chr2 (266-347)||(13543703-13543784)
chr2 (270-347)||(19428505-19428582)
chr2 (266-347)||(39103057-39103138)
chr2 (266-347)||(43899049-43899130)
chr2 (266-322)||(2000441-2000497)
chr2 (327-399)||(28014856-28014928)
chr2 (266-347)||(43356109-43356187)
chr2 (266-347)||(28566777-28566858)
chr2 (263-363)||(30545828-30545928)
chr2 (263-354)||(38985350-38985439)
chr2 (335-401)||(12827142-12827207)
chr2 (266-347)||(2688808-2688889)
chr2 (286-347)||(3711663-3711724)
chr2 (262-299)||(28019959-28019996)
chr2 (262-322)||(10176565-10176625)
[»] chr7 (92 HSPs)
chr7 (262-401)||(33839751-33839890)
chr7 (263-401)||(2341698-2341836)
chr7 (265-401)||(33411271-33411407)
chr7 (266-401)||(25893953-25894088)
chr7 (262-401)||(33423311-33423450)
chr7 (262-401)||(15877558-15877697)
chr7 (262-401)||(22979683-22979822)
chr7 (262-401)||(23393087-23393226)
chr7 (262-401)||(33695857-33695996)
chr7 (262-401)||(35355896-35356035)
chr7 (262-385)||(45063407-45063530)
chr7 (266-401)||(45690133-45690268)
chr7 (262-401)||(47067013-47067152)
chr7 (262-401)||(49171398-49171537)
chr7 (262-401)||(10028496-10028635)
chr7 (262-401)||(17855436-17855575)
chr7 (262-385)||(20165866-20165989)
chr7 (262-393)||(27018124-27018255)
chr7 (262-401)||(31586856-31586995)
chr7 (266-401)||(35328105-35328240)
chr7 (262-401)||(45482666-45482805)
chr7 (262-401)||(47740367-47740506)
chr7 (263-401)||(41990894-41991032)
chr7 (262-401)||(46913117-46913258)
chr7 (262-393)||(31625712-31625843)
chr7 (262-401)||(33720072-33720211)
chr7 (262-401)||(33870253-33870392)
chr7 (262-401)||(37846052-37846191)
chr7 (262-401)||(40670571-40670710)
chr7 (262-401)||(48609713-48609852)
chr7 (275-401)||(36389377-36389503)
chr7 (271-401)||(5183861-5183991)
chr7 (263-401)||(43499494-43499632)
chr7 (266-401)||(5712180-5712315)
chr7 (262-385)||(33332797-33332919)
chr7 (279-393)||(29446863-29446977)
chr7 (262-392)||(31429520-31429650)
chr7 (262-391)||(19563455-19563584)
chr7 (262-394)||(35757064-35757195)
chr7 (266-401)||(26579753-26579888)
chr7 (262-401)||(10618306-10618438)
chr7 (272-401)||(44564356-44564485)
chr7 (300-399)||(28233974-28234073)
chr7 (262-401)||(35767489-35767621)
chr7 (262-354)||(16482855-16482947)
chr7 (266-347)||(26941611-26941692)
chr7 (266-347)||(35752113-35752194)
chr7 (266-347)||(36816924-36817005)
chr7 (266-401)||(46817457-46817581)
chr7 (266-346)||(37127949-37128029)
chr7 (263-354)||(29863024-29863115)
chr7 (306-385)||(30076579-30076658)
chr7 (266-347)||(24228553-24228634)
chr7 (266-339)||(24923111-24923184)
chr7 (266-347)||(25037587-25037668)
chr7 (266-401)||(32556642-32556766)
chr7 (266-347)||(43489230-43489311)
chr7 (266-347)||(48085870-48085951)
chr7 (266-346)||(29098763-29098843)
chr7 (321-401)||(41904272-41904352)
chr7 (266-354)||(44003442-44003530)
chr7 (266-347)||(498267-498348)
chr7 (266-347)||(2332031-2332112)
chr7 (266-347)||(7876407-7876488)
chr7 (266-347)||(29610647-29610728)
chr7 (266-347)||(39323628-39323709)
chr7 (266-339)||(39453562-39453635)
chr7 (266-347)||(39866677-39866758)
chr7 (262-339)||(45502903-45502980)
chr7 (266-347)||(47906838-47906919)
chr7 (262-354)||(33393336-33393428)
chr7 (266-346)||(41855071-41855151)
chr7 (266-347)||(21718129-21718210)
chr7 (266-401)||(26371061-26371185)
chr7 (266-347)||(44659856-44659936)
chr7 (262-354)||(7257389-7257481)
chr7 (262-354)||(15644018-15644110)
chr7 (263-322)||(35557739-35557798)
chr7 (263-354)||(47460844-47460935)
chr7 (262-319)||(30077043-30077100)
chr7 (266-347)||(33455108-33455189)
chr7 (318-401)||(44405412-44405495)
chr7 (266-347)||(35484648-35484730)
chr7 (266-339)||(45237620-45237693)
chr7 (266-347)||(46103133-46103213)
chr7 (266-347)||(46898095-46898176)
chr7 (266-366)||(38448508-38448608)
chr7 (266-317)||(35823302-35823353)
chr7 (265-354)||(7720575-7720664)
chr7 (294-354)||(37443674-37443734)
chr7 (302-352)||(26456157-26456207)
chr7 (263-354)||(21649450-21649542)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (262-401)||(2892195-2892334)
chr6 (262-401)||(5882513-5882652)
chr6 (262-401)||(599899-600038)
chr6 (262-401)||(7393622-7393761)
chr6 (262-401)||(14891415-14891554)
chr6 (262-401)||(18101531-18101670)
chr6 (263-401)||(34527898-34528036)
chr6 (262-401)||(2593888-2594027)
chr6 (262-401)||(7345148-7345287)
chr6 (262-401)||(8615247-8615386)
chr6 (262-401)||(16703373-16703512)
chr6 (262-401)||(22551097-22551236)
chr6 (262-401)||(24168098-24168237)
chr6 (266-401)||(26377240-26377375)
chr6 (267-401)||(24224106-24224240)
chr6 (262-401)||(1970718-1970857)
chr6 (262-401)||(30743484-30743623)
chr6 (268-401)||(11989010-11989143)
chr6 (262-401)||(959940-960079)
chr6 (262-393)||(19415577-19415708)
chr6 (262-384)||(30467656-30467778)
chr6 (262-399)||(10507946-10508083)
chr6 (268-401)||(22341824-22341959)
chr6 (262-401)||(19281091-19281230)
chr6 (262-401)||(28947094-28947233)
chr6 (262-382)||(5294856-5294976)
chr6 (262-382)||(5299408-5299528)
chr6 (262-401)||(33452608-33452747)
chr6 (287-401)||(23261965-23262079)
chr6 (262-337)||(929666-929741)
chr6 (266-339)||(28948932-28949005)
chr6 (262-354)||(7167589-7167681)
chr6 (266-401)||(13329392-13329516)
chr6 (274-347)||(4487546-4487619)
chr6 (266-339)||(15965444-15965517)
chr6 (266-346)||(3291019-3291099)
chr6 (266-339)||(1398564-1398637)
chr6 (266-351)||(1939579-1939664)
chr6 (266-347)||(3786760-3786841)
chr6 (266-346)||(13844847-13844927)
chr6 (262-311)||(11743070-11743119)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (262-401)||(739740-739879)
chr5 (262-401)||(15398518-15398657)
chr5 (262-401)||(24253389-24253528)
chr5 (262-401)||(18479704-18479843)
chr5 (262-401)||(43326415-43326554)
chr5 (263-401)||(39932587-39932725)
chr5 (262-401)||(3466717-3466856)
chr5 (262-401)||(5184979-5185118)
chr5 (262-401)||(15683798-15683937)
chr5 (266-401)||(35626049-35626184)
chr5 (262-401)||(6901806-6901945)
chr5 (262-401)||(7722056-7722195)
chr5 (262-401)||(25831528-25831666)
chr5 (262-401)||(27938904-27939043)
chr5 (266-401)||(31938908-31939043)
chr5 (262-401)||(40886064-40886202)
chr5 (262-401)||(12648804-12648943)
chr5 (262-401)||(13504778-13504917)
chr5 (266-401)||(40278894-40279029)
chr5 (266-401)||(43262219-43262354)
chr5 (262-401)||(27278509-27278652)
chr5 (263-401)||(27501091-27501229)
chr5 (262-385)||(5137722-5137845)
chr5 (263-401)||(38756524-38756662)
chr5 (262-393)||(2484336-2484467)
chr5 (262-401)||(890913-891051)
chr5 (292-401)||(29789331-29789440)
chr5 (262-401)||(28424831-28424968)
chr5 (266-374)||(40110245-40110352)
chr5 (262-401)||(763730-763869)
chr5 (266-401)||(4149705-4149830)
chr5 (262-353)||(40632506-40632597)
chr5 (297-401)||(34451292-34451396)
chr5 (262-362)||(2585469-2585569)
chr5 (262-366)||(12558090-12558193)
chr5 (266-347)||(42658741-42658822)
chr5 (266-363)||(5120036-5120132)
chr5 (266-347)||(6973074-6973155)
chr5 (266-347)||(9424671-9424752)
chr5 (266-347)||(13957681-13957762)
chr5 (266-347)||(23195327-23195408)
chr5 (266-347)||(27503390-27503471)
chr5 (266-347)||(33617596-33617677)
chr5 (266-347)||(36365524-36365605)
chr5 (262-362)||(36472347-36472448)
chr5 (266-347)||(38015593-38015674)
chr5 (266-339)||(42247869-42247942)
chr5 (266-401)||(5497284-5497408)
chr5 (266-347)||(9374581-9374662)
chr5 (266-339)||(14971989-14972062)
chr5 (266-347)||(19295741-19295822)
chr5 (262-354)||(18327245-18327337)
chr5 (262-354)||(38637982-38638074)
chr5 (263-322)||(9527124-9527183)
chr5 (263-354)||(27390605-27390696)
chr5 (266-339)||(9171112-9171185)
chr5 (262-375)||(31294051-31294164)
chr5 (262-354)||(1402577-1402669)
chr5 (262-354)||(24167856-24167948)
chr5 (262-362)||(40686906-40687006)
chr5 (266-337)||(15300962-15301033)
chr5 (289-401)||(38492647-38492748)
chr5 (282-347)||(3656647-3656712)
chr5 (266-347)||(6206895-6206976)
chr5 (279-339)||(3940418-3940478)
chr5 (266-322)||(33624043-33624099)
chr5 (288-351)||(36948564-36948626)
chr5 (288-362)||(20207080-20207154)
chr5 (262-315)||(28756085-28756138)
chr5 (365-401)||(9424628-9424664)
[»] chr4 (117 HSPs)
chr4 (262-401)||(21366645-21366784)
chr4 (262-393)||(51363014-51363145)
chr4 (262-394)||(49881106-49881238)
chr4 (262-401)||(23437599-23437738)
chr4 (266-401)||(34276558-34276693)
chr4 (266-401)||(44984772-44984907)
chr4 (262-401)||(53854465-53854604)
chr4 (262-401)||(55056295-55056434)
chr4 (263-401)||(397410-397548)
chr4 (263-401)||(9798473-9798611)
chr4 (262-394)||(407761-407892)
chr4 (262-401)||(146465-146604)
chr4 (262-401)||(237484-237623)
chr4 (262-401)||(2826717-2826856)
chr4 (262-401)||(6019935-6020074)
chr4 (262-401)||(27373083-27373222)
chr4 (262-401)||(42085214-42085353)
chr4 (262-392)||(18462058-18462188)
chr4 (263-401)||(45797487-45797625)
chr4 (263-401)||(55776053-55776190)
chr4 (263-401)||(55840231-55840368)
chr4 (266-401)||(6285318-6285453)
chr4 (262-401)||(31532171-31532310)
chr4 (262-401)||(32366696-32366835)
chr4 (262-401)||(39077552-39077691)
chr4 (262-401)||(41702495-41702634)
chr4 (262-401)||(47344663-47344802)
chr4 (266-401)||(53461852-53461987)
chr4 (262-401)||(54607969-54608108)
chr4 (262-401)||(41949389-41949530)
chr4 (262-391)||(22618559-22618687)
chr4 (262-401)||(3170633-3170772)
chr4 (262-401)||(29478367-29478506)
chr4 (262-401)||(31070110-31070248)
chr4 (262-401)||(31972372-31972511)
chr4 (262-401)||(42222298-42222437)
chr4 (262-401)||(42765878-42766016)
chr4 (262-401)||(43471731-43471870)
chr4 (262-401)||(54424989-54425128)
chr4 (262-401)||(54574976-54575115)
chr4 (262-401)||(56023034-56023173)
chr4 (263-401)||(42033183-42033321)
chr4 (262-401)||(1932770-1932909)
chr4 (262-401)||(19387724-19387863)
chr4 (266-393)||(26091302-26091429)
chr4 (262-401)||(29777293-29777432)
chr4 (266-401)||(41560339-41560474)
chr4 (262-401)||(50457846-50457985)
chr4 (263-401)||(31914206-31914343)
chr4 (263-385)||(33897547-33897669)
chr4 (263-401)||(50534639-50534777)
chr4 (262-382)||(53834109-53834229)
chr4 (262-401)||(22468806-22468945)
chr4 (262-401)||(23609094-23609233)
chr4 (262-401)||(39587815-39587954)
chr4 (263-401)||(48657832-48657964)
chr4 (262-401)||(50234007-50234146)
chr4 (262-401)||(38591675-38591810)
chr4 (263-385)||(48654822-48654944)
chr4 (263-401)||(50536660-50536798)
chr4 (262-385)||(2243465-2243588)
chr4 (262-401)||(35446513-35446651)
chr4 (262-401)||(41632043-41632181)
chr4 (262-401)||(47662138-47662277)
chr4 (262-401)||(55519834-55519973)
chr4 (262-401)||(14017412-14017549)
chr4 (262-401)||(3692246-3692385)
chr4 (262-385)||(48259563-48259685)
chr4 (262-361)||(48313564-48313662)
chr4 (262-401)||(54086417-54086554)
chr4 (262-392)||(51951689-51951819)
chr4 (262-401)||(54805650-54805793)
chr4 (295-401)||(52728342-52728448)
chr4 (266-347)||(5117517-5117598)
chr4 (262-339)||(42557589-42557666)
chr4 (266-347)||(45633858-45633939)
chr4 (262-354)||(14335173-14335265)
chr4 (262-354)||(27580126-27580218)
chr4 (262-362)||(34835184-34835284)
chr4 (311-391)||(36532876-36532956)
chr4 (266-400)||(46708778-46708901)
chr4 (262-365)||(27398664-27398767)
chr4 (263-354)||(38547673-38547764)
chr4 (266-347)||(15060368-15060449)
chr4 (266-401)||(20351878-20352002)
chr4 (266-347)||(31881393-31881474)
chr4 (266-347)||(34552330-34552411)
chr4 (266-347)||(37239169-37239250)
chr4 (266-347)||(43890939-43891020)
chr4 (266-401)||(54216772-54216896)
chr4 (262-354)||(1662331-1662423)
chr4 (310-401)||(42509351-42509442)
chr4 (262-361)||(49057933-49058032)
chr4 (303-393)||(52396774-52396865)
chr4 (269-347)||(49014112-49014190)
chr4 (266-347)||(3293102-3293183)
chr4 (266-347)||(11972208-11972289)
chr4 (266-347)||(22620604-22620685)
chr4 (262-355)||(43231510-43231602)
chr4 (266-347)||(54216324-54216405)
chr4 (266-347)||(54715046-54715127)
chr4 (262-354)||(46720032-46720124)
chr4 (266-339)||(4486668-4486741)
chr4 (262-339)||(6371336-6371413)
chr4 (266-347)||(9998010-9998091)
chr4 (266-347)||(47811917-47811998)
chr4 (262-354)||(573810-573902)
chr4 (266-347)||(27873627-27873708)
chr4 (278-347)||(52461386-52461455)
chr4 (266-347)||(52688360-52688441)
chr4 (341-401)||(35595773-35595833)
chr4 (266-352)||(33289714-33289800)
chr4 (266-347)||(33558021-33558102)
chr4 (262-306)||(17555617-17555661)
chr4 (335-391)||(35344868-35344924)
chr4 (288-354)||(27872612-27872678)
chr4 (266-339)||(18206609-18206682)
[»] chr3 (106 HSPs)
chr3 (262-401)||(41464359-41464498)
chr3 (262-401)||(47257800-47257939)
chr3 (262-401)||(49330044-49330183)
chr3 (262-401)||(7855150-7855289)
chr3 (262-401)||(27067014-27067153)
chr3 (262-401)||(29625863-29626002)
chr3 (262-401)||(40130995-40131134)
chr3 (262-401)||(43125838-43125977)
chr3 (262-401)||(43612083-43612222)
chr3 (262-401)||(52215083-52215222)
chr3 (262-401)||(52628961-52629100)
chr3 (262-392)||(44806691-44806821)
chr3 (263-393)||(51170077-51170207)
chr3 (262-391)||(2666007-2666136)
chr3 (266-394)||(47809640-47809768)
chr3 (266-401)||(20754429-20754564)
chr3 (266-385)||(28048444-28048563)
chr3 (262-401)||(38416760-38416899)
chr3 (262-401)||(39053401-39053540)
chr3 (262-401)||(40419842-40419981)
chr3 (262-401)||(46134363-46134502)
chr3 (263-401)||(35748347-35748485)
chr3 (262-401)||(18946910-18947049)
chr3 (262-401)||(22399104-22399242)
chr3 (262-401)||(24100290-24100428)
chr3 (262-401)||(32234434-32234572)
chr3 (266-401)||(40643811-40643946)
chr3 (262-401)||(42291849-42291988)
chr3 (262-401)||(43183919-43184058)
chr3 (262-401)||(51452786-51452925)
chr3 (262-401)||(24376580-24376719)
chr3 (262-401)||(37313406-37313545)
chr3 (262-401)||(39634608-39634746)
chr3 (278-401)||(46126010-46126133)
chr3 (262-401)||(48739269-48739408)
chr3 (262-401)||(51102414-51102553)
chr3 (262-401)||(53832520-53832659)
chr3 (262-401)||(55453280-55453419)
chr3 (262-400)||(7755344-7755481)
chr3 (264-401)||(48609732-48609869)
chr3 (262-374)||(54159051-54159163)
chr3 (262-401)||(36368946-36369085)
chr3 (266-401)||(37324552-37324687)
chr3 (262-385)||(40804562-40804685)
chr3 (263-401)||(43021722-43021861)
chr3 (262-401)||(53637848-53637987)
chr3 (262-401)||(53943623-53943762)
chr3 (263-401)||(35594129-35594267)
chr3 (262-403)||(37758936-37759077)
chr3 (262-401)||(41293355-41293493)
chr3 (262-401)||(41732535-41732674)
chr3 (266-401)||(44222840-44222975)
chr3 (263-382)||(47894875-47894994)
chr3 (262-401)||(5560061-5560207)
chr3 (262-401)||(41216462-41216601)
chr3 (262-385)||(52638849-52638972)
chr3 (262-374)||(48546894-48547004)
chr3 (262-393)||(46949382-46949512)
chr3 (262-385)||(51146267-51146390)
chr3 (262-362)||(41882055-41882155)
chr3 (262-362)||(53115454-53115554)
chr3 (266-401)||(25641657-25641781)
chr3 (266-347)||(34279800-34279881)
chr3 (266-347)||(42589841-42589922)
chr3 (266-347)||(54401198-54401279)
chr3 (262-354)||(21597220-21597312)
chr3 (266-362)||(48726062-48726158)
chr3 (262-354)||(55379992-55380084)
chr3 (263-361)||(50731979-50732077)
chr3 (263-361)||(50780779-50780877)
chr3 (266-347)||(17665603-17665684)
chr3 (266-347)||(31286872-31286953)
chr3 (266-347)||(37028734-37028815)
chr3 (266-347)||(39141205-39141286)
chr3 (266-347)||(41635879-41635960)
chr3 (266-347)||(45058894-45058975)
chr3 (304-385)||(47182049-47182130)
chr3 (266-347)||(47511019-47511100)
chr3 (266-347)||(51415980-51416061)
chr3 (266-347)||(54707299-54707380)
chr3 (262-354)||(25353561-25353653)
chr3 (262-362)||(28576176-28576276)
chr3 (263-354)||(51143825-51143916)
chr3 (264-366)||(47402810-47402911)
chr3 (266-347)||(38156711-38156792)
chr3 (262-354)||(30251573-30251665)
chr3 (262-354)||(42998861-42998952)
chr3 (266-347)||(24688125-24688206)
chr3 (266-347)||(40022085-40022166)
chr3 (266-339)||(44946016-44946089)
chr3 (266-347)||(49130589-49130670)
chr3 (266-347)||(51224117-51224197)
chr3 (315-392)||(52864550-52864627)
chr3 (266-347)||(55000257-55000338)
chr3 (262-366)||(2227995-2228099)
chr3 (262-354)||(43176810-43176902)
chr3 (322-401)||(33550503-33550582)
chr3 (263-330)||(48752093-48752160)
chr3 (262-330)||(52434146-52434215)
chr3 (287-354)||(40165683-40165750)
chr3 (287-366)||(41609099-41609178)
chr3 (266-366)||(8847718-8847818)
chr3 (263-307)||(37741443-37741487)
chr3 (263-352)||(177169-177258)
chr3 (290-347)||(52756150-52756207)
chr3 (262-299)||(51942543-51942580)
[»] chr1 (101 HSPs)
chr1 (262-401)||(24245061-24245200)
chr1 (262-401)||(31308008-31308147)
chr1 (262-401)||(43251718-43251857)
chr1 (262-401)||(45538160-45538299)
chr1 (262-394)||(23220972-23221104)
chr1 (266-401)||(3611147-3611282)
chr1 (262-401)||(4068719-4068858)
chr1 (262-401)||(6327584-6327722)
chr1 (262-401)||(17994987-17995126)
chr1 (262-401)||(21139448-21139587)
chr1 (262-401)||(44661977-44662116)
chr1 (263-401)||(25678295-25678433)
chr1 (262-393)||(5981177-5981308)
chr1 (262-401)||(26085434-26085572)
chr1 (262-401)||(26277184-26277323)
chr1 (262-401)||(33112853-33112992)
chr1 (262-401)||(33884095-33884234)
chr1 (262-401)||(33960018-33960157)
chr1 (262-401)||(38790233-38790372)
chr1 (262-401)||(39646575-39646714)
chr1 (266-401)||(50774228-50774363)
chr1 (262-401)||(25058695-25058834)
chr1 (262-393)||(25518821-25518952)
chr1 (262-401)||(31040716-31040855)
chr1 (262-401)||(31844383-31844522)
chr1 (266-401)||(36003141-36003276)
chr1 (262-393)||(46784430-46784561)
chr1 (262-401)||(46967077-46967216)
chr1 (266-401)||(47383768-47383903)
chr1 (263-401)||(37620228-37620366)
chr1 (265-385)||(23932561-23932681)
chr1 (262-401)||(5980075-5980214)
chr1 (262-401)||(23984762-23984901)
chr1 (266-401)||(26794315-26794450)
chr1 (262-401)||(38331895-38332034)
chr1 (262-401)||(41999822-41999961)
chr1 (262-401)||(42863872-42864011)
chr1 (266-401)||(47317326-47317461)
chr1 (262-401)||(47671593-47671732)
chr1 (262-401)||(49254011-49254150)
chr1 (262-391)||(47187112-47187241)
chr1 (262-401)||(35692699-35692839)
chr1 (262-401)||(24885508-24885647)
chr1 (262-401)||(26524925-26525064)
chr1 (262-401)||(28888588-28888727)
chr1 (262-401)||(46616556-46616695)
chr1 (262-374)||(48373511-48373623)
chr1 (262-401)||(36566337-36566476)
chr1 (262-401)||(49399024-49399163)
chr1 (262-371)||(51403074-51403182)
chr1 (262-385)||(3285409-3285531)
chr1 (266-385)||(35273607-35273726)
chr1 (266-385)||(51057082-51057201)
chr1 (262-374)||(31979998-31980110)
chr1 (290-401)||(2450529-2450640)
chr1 (262-401)||(42313397-42313540)
chr1 (262-401)||(27983639-27983762)
chr1 (262-374)||(2556909-2557021)
chr1 (262-394)||(45475885-45476009)
chr1 (266-347)||(2657314-2657395)
chr1 (266-347)||(26472258-26472339)
chr1 (266-347)||(41467711-41467792)
chr1 (296-385)||(51045648-51045737)
chr1 (268-351)||(13313249-13313332)
chr1 (266-347)||(6626103-6626184)
chr1 (266-347)||(30289989-30290070)
chr1 (266-347)||(32448659-32448740)
chr1 (266-347)||(42234851-42234932)
chr1 (262-362)||(2954862-2954962)
chr1 (309-401)||(4808699-4808791)
chr1 (262-354)||(26685863-26685955)
chr1 (266-347)||(4953063-4953144)
chr1 (266-347)||(10928078-10928159)
chr1 (266-347)||(29770681-29770762)
chr1 (266-347)||(33073222-33073303)
chr1 (266-347)||(44544125-44544206)
chr1 (266-347)||(51155668-51155749)
chr1 (262-346)||(24649802-24649886)
chr1 (262-354)||(27924730-27924822)
chr1 (262-366)||(39475843-39475946)
chr1 (267-354)||(48683402-48683489)
chr1 (266-339)||(4243577-4243650)
chr1 (266-347)||(13281641-13281722)
chr1 (262-363)||(33187347-33187448)
chr1 (266-347)||(46428332-46428413)
chr1 (262-354)||(1388480-1388572)
chr1 (262-314)||(4156188-4156240)
chr1 (262-354)||(10920207-10920299)
chr1 (262-354)||(38716319-38716411)
chr1 (262-354)||(39637907-39637996)
chr1 (263-339)||(52323946-52324022)
chr1 (266-336)||(7561632-7561702)
chr1 (266-347)||(34752393-34752474)
chr1 (266-347)||(35991678-35991759)
chr1 (266-347)||(44293534-44293615)
chr1 (265-354)||(52367893-52367982)
chr1 (262-354)||(5961339-5961431)
chr1 (305-393)||(47772216-47772304)
chr1 (266-347)||(41895243-41895324)
chr1 (262-307)||(10919313-10919358)
chr1 (344-401)||(13312567-13312624)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (262-401)||(39592-39731)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (262-401)||(11169-11307)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (262-401)||(13798-13937)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (262-401)||(75280-75419)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (262-393)||(1876-2007)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (262-401)||(18890-19029)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (262-401)||(2468-2607)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (262-401)||(32568-32707)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (267-401)||(176666-176800)
scaffold0007 (263-401)||(278014-278154)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (262-401)||(3095-3225)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (262-354)||(109-201)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (297-401)||(4632-4736)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (262-362)||(4618-4719)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (262-362)||(3399-3500)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (262-354)||(14751-14843)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (262-354)||(20549-20641)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (266-347)||(7101-7183)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (266-336)||(17917-17987)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (266-339)||(19228-19301)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Original strand, 37260167 - 37260418
Alignment:
Q  16 attagctagaaattattctgttaannnnnnnnngtccatcttggtgttaaccttttatgttcgttccattatcatattattattggcatgttattgagat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37260167 attagctagaaattattctgttaatttttttttgtccatcttggtgttaaccttttatgttcgttccattatcatattattattggcatgttattgagat 37260266  T
Q  116 cacaaggatctaaaat---------------gttgtaagtttaatcatataaaattcgaaagtatttcttcataaagctaggttaaaagtgtatataaat 200  Q
    ||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37260267 cacaaggatctaaaatgtcgtgaatttaaatgttgtaagtttaatcatataaaattcgaaagtatttcttcataaagctaggttaaaagtgtatataaat 37260366  T
Q  201 attttatactttcaagtatactctcatttctacacacttacgtatacaaaaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37260367 attttatactttcaagtatactctcatttctacacacttatgtataaaaaaa 37260418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32984252 - 32984113
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32984252 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 32984153  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  32984152 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 32984113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24080075 - 24079937
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24080075 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 24079976  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  24079975 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 24079937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 2714556 - 2714695
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2714556 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2714655  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  2714656 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 2714695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 5946054 - 5946193
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5946054 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5946153  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  5946154 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 5946193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 6365993 - 6366132
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6365993 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaa 6366092  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6366093 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 6366132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 37956428 - 37956567
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37956428 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 37956527  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  37956528 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37956567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 394
Target Start/End: Original strand, 9734262 - 9734393
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  9734262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaa 9734360  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 394  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9734361 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 9734393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 31831130 - 31831007
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31831130 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31831031  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  31831030 atgtgcttatgtggctaatgtgta 31831007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 32114256 - 32114395
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  32114256 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 32114355  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  32114356 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaatt 32114395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Original strand, 37419947 - 37420070
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  37419947 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 37420046  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37420047 atgtgcttatgtgactaatgtgta 37420070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40435328 - 40435189
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40435328 ctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40435229  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  40435228 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 40435189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 41231953 - 41232092
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41231953 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41232052  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  41232053 atgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaatt 41232092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Original strand, 41862227 - 41862358
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  41862227 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 41862326  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41862327 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 41862358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Original strand, 43328714 - 43328837
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43328714 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43328813  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  43328814 atgtgcttatgtggctaatgtgta 43328837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 45236740 - 45236601
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45236740 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45236641  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  45236640 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 45236601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 10646130 - 10646269
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10646130 ctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 10646229  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  10646230 atgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 10646269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 25185906 - 25186045
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25185906 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaa 25186005  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  25186006 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 25186045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33730816 - 33730677
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33730816 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33730717  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33730716 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33730677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 44088618 - 44088479
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44088618 ctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 44088519  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44088518 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 44088479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9303748 - 9303610
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9303748 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 9303649  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||    
T  9303648 tgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaatt 9303610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13356294 - 13356156
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13356294 tagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 13356195  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  13356194 tgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 13356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33981837 - 33981699
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33981837 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 33981738  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33981737 tgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33981699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 393
Target Start/End: Original strand, 35628785 - 35628915
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  35628785 tagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccacttaaaaa 35628884  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35628885 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgg 35628915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 391
Target Start/End: Original strand, 9013691 - 9013820
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9013691 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 9013790  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 391  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  9013791 atgtacttatgtggctaatgtgtattggtt 9013820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 264 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13760821 - 13760684
Alignment:
Q  264 agattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13760821 agattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaat 13760722  T
Q  364 gtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  13760721 gtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 13760684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17718897 - 17718766
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17718897 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 17718798  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17718797 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 17718766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29048578 - 29048439
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29048578 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 29048479  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  29048478 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 29048439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37301500 - 37301361
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  37301500 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccacttaaaa 37301401  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  37301400 atgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 37301361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 41653902 - 41654041
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  41653902 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccacttaaaa 41654001  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  41654002 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 41654041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 45258518 - 45258656
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45258518 tagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaa 45258617  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45258618 tgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaatt 45258656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Original strand, 2275920 - 2276042
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  2275920 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 2276018  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    || |||||||||| ||||||||||    
T  2276019 atatgcttatgtggctaatgtgta 2276042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 263 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 45066766 - 45066644
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45066766 tagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 45066667  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  45066666 tgtgcttatgtggctaatgtgta 45066644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 22878398 - 22878537
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22878398 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 22878497  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  22878498 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 22878537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 41639922 - 41640060
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||||    
T  41639922 tagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgcttaaaaa 41640021  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    | || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  41640022 tatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaatt 41640060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 42701465 - 42701325
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccattt---a 358  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||   |    
T  42701465 ctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 42701366  T
Q  359 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42701365 aaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 42701325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Original strand, 25248046 - 25248171
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  25248046 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactttaaa 25248139  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  25248140 atgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgg 25248171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39915983 - 39915887
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39915983 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 311 - 401
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033076
Alignment:
Q  311 aatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 12033076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 276 - 354
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981532
Alignment:
Q  276 aagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 41981532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 117489 - 117408
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  117489 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 117408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 31940326 - 31940407
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  31940326 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 31940407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40458932 - 40458851
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  40458932 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40458851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 304 - 401
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904222
Alignment:
Q  304 caatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaatt 3904222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4975567 - 4975486
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  4975567 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 4975486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27243299 - 27243218
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||||    
T  27243299 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27254874 - 27254793
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||||    
T  27254874 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 401
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981614
Alignment:
Q  321 ttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 41981614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4447455 - 4447374
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  4447455 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg 4447374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 10378320 - 10378401
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  10378320 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg 10378401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32373886 - 32373805
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  32373886 attacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg 32373805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 41843264 - 41843345
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||    
T  41843264 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatg 41843345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33897006 - 33896915
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  33897006 ctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagatacca 33896915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33622625 - 33622571
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaat 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33622625 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaat 33622571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 2379151 - 2379275
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  |||| || |||||||           || ||||    
T  2379151 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg-----------aatatgt 2379239  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2379240 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 2379275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 3211217 - 3211297
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  3211217 attacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 3211297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3490559 - 3490486
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3490559 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagat 3490486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9509560 - 9509479
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||    
T  9509560 attacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg 9509479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31149054 - 31148953
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31149054 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccacttaaaa 31148956  T
Q  362 atg 364  Q
    |||    
T  31148955 atg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 38631663 - 38631744
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||    
T  38631663 attacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg 38631744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 9713700 - 9713778
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  9713700 attacctttgaagaatggtgggtaatttac---ccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 9713778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26196479 - 26196389
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  26196479 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatacca 26196389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Original strand, 164729 - 164800
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtc 334  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  164729 ctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttg-tggtggagtc 164800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649935
Alignment:
Q  267 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 322  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaattt 40649935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 394
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336233
Alignment:
Q  324 ttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 394  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||| ||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggg 31336233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 362 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33622541 - 33622502
Alignment:
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33622541 atgtggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaatt 33622502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2325064 - 2324925
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2325064 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2324965  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2324964 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 2324925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13815393 - 13815254
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13815393 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 13815294  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13815293 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 13815254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 23901785 - 23901924
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23901785 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23901884  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  23901885 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 23901924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 746472 - 746611
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  746472 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 746571  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  746572 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 746611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6594633 - 6594494
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6594633 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 6594534  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  6594533 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 6594494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 11184978 - 11185117
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11184978 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 11185077  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11185078 atgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaatt 11185117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 38997107 - 38997246
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38997107 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 38997206  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  38997207 atgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaatt 38997246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 34518374 - 34518512
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34518374 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 34518473  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  34518474 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 34518512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 4034598 - 4034737
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4034598 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 4034697  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  4034698 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 4034737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 6430479 - 6430618
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6430479 ctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 6430578  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  6430579 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 6430618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Original strand, 14660452 - 14660583
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14660452 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 14660551  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14660552 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 14660583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 17600842 - 17600981
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17600842 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 17600941  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  17600942 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 17600981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 26710351 - 26710490
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26710351 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 26710450  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||    
T  26710451 atgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaatt 26710490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 32608386 - 32608525
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  32608386 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccacttaaaa 32608485  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  32608486 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 32608525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 40635228 - 40635363
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40635228 attacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40635327  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  40635328 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 40635363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 45370996 - 45371135
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45370996 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45371095  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  45371096 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 45371135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10244756 - 10244618
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10244756 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 10244657  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||    
T  10244656 tgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaatt 10244618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 5726135 - 5726274
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  5726135 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccacttaaaa 5726234  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| |||| || |||||||||| ||||| || ||||||    
T  5726235 atgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaatt 5726274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 10424601 - 10424740
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10424601 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 10424700  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||    
T  10424701 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaatt 10424740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 27024421 - 27024560
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27024421 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27024520  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27024521 atatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 27024560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 27400409 - 27400548
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27400409 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27400508  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  27400509 atgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaatt 27400548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27651209 - 27651070
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27651209 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27651110  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  27651109 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 27651070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 32327367 - 32327506
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  32327367 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 32327466  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  32327467 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 32327506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 32948452 - 32948590
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  32948452 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccacttaaaa 32948550  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  32948551 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaatt 32948590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 2914312 - 2914190
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2914312 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 2914213  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    |||||||||||| || |||||||    
T  2914212 tgtgcttatgtggctgatgtgta 2914190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 4609633 - 4609771
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4609633 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 4609732  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  4609733 tgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaatt 4609771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 265 - 401
Target Start/End: Original strand, 12842112 - 12842248
Alignment:
Q  265 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  12842112 gattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaattaaaaatg 12842211  T
Q  365 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  12842212 tgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 12842248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33427822 - 33427683
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33427822 ctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 33427723  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33427722 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33427683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37621044 - 37620903
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg---agtcaagatggttcatggataccatttaa 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37621044 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggataccacttaa 37620945  T
Q  360 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  37620944 aaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaatt 37620903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1092125 - 1091987
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1092125 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 1092026  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  1092025 tgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 1091987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7892863 - 7892724
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  7892863 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccacttaaaa 7892764  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  7892763 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaatt 7892724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 40037149 - 40037288
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  40037149 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 40037248  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||    
T  40037249 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaatt 40037288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37255507 - 37255373
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37255507 ctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 37255413  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  37255412 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaatt 37255373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Original strand, 40735470 - 40735593
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  40735470 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 40735569  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    |||| |||||| | ||||||||||    
T  40735570 atgtacttatgcggctaatgtgta 40735593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14697711 - 14697573
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14697711 tagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 14697612  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||    
T  14697611 tgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaatt 14697573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 380
Target Start/End: Original strand, 42899921 - 42900039
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42899921 ctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 42900020  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaat 380  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  42900021 atgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 9444689 - 9444835
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttac-------ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9444689 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatggatacca 9444788  T
Q  355 tttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  9444789 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 9444835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 15925086 - 15925225
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15925086 ctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15925185  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||    
T  15925186 atatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaatt 15925225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 401
Target Start/End: Original strand, 11159631 - 11159766
Alignment:
Q  265 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 364  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  11159631 gattacctttgaaaaatggtg-gtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccacttaaaaatg 11159729  T
Q  365 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  11159730 tgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaatt 11159766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8433091 - 8432952
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  8433091 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccactttaaa 8432992  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || | |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  8432991 atatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 8432952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 270 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856472
Alignment:
Q  270 cctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgctt 369  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  370 atgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaatt 32856472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 41172468 - 41172603
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  41172468 attacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaatgt 41172567  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  41172568 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 41172603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 307 - 401
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25294980
Alignment:
Q  307 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 25294980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 335
Target Start/End: Original strand, 12814620 - 12814693
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12814620 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 35158210 - 35158086
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  35158210 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 35158122  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35158121 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 35158086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 145292 - 145416
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||           ||    
T  145292 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac-----------gt 145380  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  145381 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 145416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28641452 - 28641371
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  28641452 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 28641371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39301357 - 39301276
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  39301357 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39301276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 44481834 - 44481926
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  44481834 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 44481926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 304 - 401
Target Start/End: Original strand, 1229675 - 1229772
Alignment:
Q  304 caatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||    
T  1229675 caatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaatt 1229772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 4258500 - 4258623
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  4258500 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgg-gtcaagatagttcatg-----------aatatgt 4258587  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4258588 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 4258623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 8056636 - 8056717
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  8056636 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg 8056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12333655 - 12333574
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  12333655 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 12333574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 29687051 - 29687132
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  29687051 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 29687132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 35126786 - 35126878
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  35126786 ctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 35126878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 3266306 - 3266387
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  3266306 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21735060 - 21734979
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||    
T  21735060 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatg 21734979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 27331308 - 27331389
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | |||||||| |||||||    
T  27331308 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg 27331389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27765022 - 27764941
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  27765022 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 27764941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Original strand, 34249275 - 34249348
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  34249275 attatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 34249348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40544236 - 40544155
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  40544236 attacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 266 - 346
Target Start/End: Original strand, 12730071 - 12730151
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 346  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  12730071 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 12730151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 332 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 447738 - 447669
Alignment:
Q  332 gtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  447738 gtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 447669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13543784 - 13543703
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  13543784 attacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 13543703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19428582 - 19428505
Alignment:
Q  270 cctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||    
T  19428582 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatg 19428505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 39103057 - 39103138
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||    
T  39103057 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatg 39103138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 43899130 - 43899049
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  43899130 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 43899049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2000497 - 2000441
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2000497 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 2000441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  327 gtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaa 399  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 43356109 - 43356187
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  43356109 attacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 43356187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28566858 - 28566777
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  28566858 attacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatg 28566777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 363
Target Start/End: Original strand, 30545828 - 30545928
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  30545828 tagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatacaatctaaaaa 30545927  T
Q  363 t 363  Q
    |    
T  30545928 t 30545928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38985439 - 38985350
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||| ||||||||||||||    
T  38985439 tagattacatttga-gaacggtgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgat-atgtcaagatagttcatggatacca 38985350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 401
Target Start/End: Original strand, 12827142 - 12827207
Alignment:
Q  335 aagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  12827142 aagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 12827207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2688889 - 2688808
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| || || | |||||||| |||||||    
T  2688889 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg 2688808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 3711663 - 3711724
Alignment:
Q  286 agtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  3711663 agtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3711724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28019996 - 28019959
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28019996 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 322
Target Start/End: Original strand, 10176565 - 10176625
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 322  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  10176565 ctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 92)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33839890 - 33839751
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33839890 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33839791  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33839790 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33839751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2341836 - 2341698
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  2341836 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaa 2341737  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2341736 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 2341698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 401
Target Start/End: Original strand, 33411271 - 33411407
Alignment:
Q  265 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33411271 gattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatg 33411370  T
Q  365 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33411371 tgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 33411407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25894088 - 25893953
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25894088 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 25893989  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  25893988 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 25893953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33423450 - 33423311
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33423450 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33423351  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33423350 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33423311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 15877558 - 15877697
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15877558 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15877657  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  15877658 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaatt 15877697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22979822 - 22979683
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22979822 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 22979723  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  22979722 atatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 22979683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23393226 - 23393087
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23393226 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23393127  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  23393126 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 23393087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33695996 - 33695857
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33695996 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33695897  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33695896 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33695857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 35355896 - 35356035
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  35355896 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 35355995  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35355996 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 35356035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 45063530 - 45063407
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45063530 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45063431  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  45063430 atgtgcttatgtggctaatgtgta 45063407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 45690268 - 45690133
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  45690268 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45690169  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  45690168 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 45690133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 47067152 - 47067013
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47067152 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47067053  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47067052 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47067013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 49171537 - 49171398
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49171537 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 49171438  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  49171437 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 49171398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 10028496 - 10028635
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  10028496 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 10028595  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  10028596 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 10028635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 17855436 - 17855575
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  17855436 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 17855535  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  17855536 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 17855575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20165989 - 20165866
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20165989 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 20165890  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  20165889 atgtacttatgtggctaatgtgta 20165866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Original strand, 27018124 - 27018255
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27018124 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27018223  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27018224 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 27018255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 31586856 - 31586995
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31586856 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31586955  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31586956 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 31586995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 35328240 - 35328105
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35328240 attacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 35328141  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35328140 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 35328105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 45482666 - 45482805
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  45482666 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 45482765  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  45482766 atatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaatt 45482805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 47740506 - 47740367
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  47740506 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 47740407  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47740406 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47740367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41991032 - 41990894
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  41991032 tagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaa 41990933  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  41990932 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaatt 41990894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 46913117 - 46913258
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46913117 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 46913216  T
Q  362 a--tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |  |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  46913217 atgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 46913258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Original strand, 31625712 - 31625843
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31625712 ctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 31625811  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31625812 atgtgcttatgtgactaatgtatattggttgg 31625843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33720211 - 33720072
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33720211 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33720112  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  33720111 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 33720072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 33870253 - 33870392
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33870253 ctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccatttaaaa 33870352  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33870353 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33870392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37846191 - 37846052
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || |||||||||| ||||||    
T  37846191 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccacttaaaa 37846092  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37846091 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 37846052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 40670571 - 40670710
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40670571 ctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40670670  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  40670671 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 40670710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 48609852 - 48609713
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  48609852 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaa 48609753  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  48609752 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 48609713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 275 - 401
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389503
Alignment:
Q  275 gaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtg 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  375 actaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaatt 36389503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 271 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183861
Alignment:
Q  271 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgctta 370  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  371 tgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 5183861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 43499494 - 43499632
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43499494 tagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 43499593  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    | | |||||||| | ||||| || | |||||| ||||||    
T  43499594 tatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaatt 43499632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 5712180 - 5712315
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5712180 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 5712279  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  5712280 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 5712315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Original strand, 33332797 - 33332919
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33332797 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 33332895  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    || |||||||| | ||||||||||    
T  33332896 atatgcttatgcggctaatgtgta 33332919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 279 - 393
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29446977
Alignment:
Q  279 aatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgacta 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  379 atgtgtactggttgg 393  Q
    ||||||| |||||||    
T  29446963 atgtgtattggttgg 29446977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31429650 - 31429520
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  31429650 ctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccacttaaaa 31429551  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttg 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31429550 atgtgtttatgtgactaatgtgtattggttg 31429520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 391
Target Start/End: Original strand, 19563455 - 19563584
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  19563455 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 19563554  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 391  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19563555 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 19563584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35757195 - 35757064
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  35757195 ctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 35757097  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 394  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35757096 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 35757064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26579888 - 26579753
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  26579888 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 26579789  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    | ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  26579788 gtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 26579753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 10618306 - 10618438
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  10618306 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-------gatagttcatgaataccacttaaaa 10618398  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10618399 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 10618438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 272 - 401
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564485
Alignment:
Q  272 tttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttat 371  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  372 gtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 44564485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 300 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233974
Alignment:
Q  300 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaa 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 35767489 - 35767621
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||       | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35767489 ctagattacctttgaagaatggtgggta-------ccccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 35767581  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| |||| || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35767582 atgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaatt 35767621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16482947 - 16482855
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16482947 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggatacca 16482855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26941692 - 26941611
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  26941692 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 26941611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35752194 - 35752113
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  35752194 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 35752113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36817005 - 36816924
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  36817005 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 36816924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 46817581 - 46817457
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  46817581 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 46817493  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  46817492 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 46817457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 346
Target Start/End: Original strand, 37127949 - 37128029
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  37127949 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 37128029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Original strand, 29863024 - 29863115
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  29863024 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggatacca 29863115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 306 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076579
Alignment:
Q  306 atgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgta 30076579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 24228553 - 24228634
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  24228553 attacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 24228634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24923184 - 24923111
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  24923184 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 24923111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25037668 - 25037587
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  25037668 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg 25037587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32556766 - 32556642
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||| |||||||           || ||||    
T  32556766 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg-----------aatatgt 32556678  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32556677 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 32556642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 43489230 - 43489311
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  43489230 attacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 43489311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 48085870 - 48085951
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  48085870 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 48085951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 346
Target Start/End: Original strand, 29098763 - 29098843
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 346  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  29098763 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 29098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 401
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904352
Alignment:
Q  321 ttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 41904352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 44003530 - 44003442
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44003530 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 44003442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 498348 - 498267
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  498348 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 498267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 2332031 - 2332112
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  2332031 attatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg 2332112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7876488 - 7876407
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  7876488 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 7876407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 29610647 - 29610728
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||    
T  29610647 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg 29610728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 39323628 - 39323709
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  39323628 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39323709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39453635 - 39453562
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  39453635 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 39453562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 39866677 - 39866758
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  39866677 attacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 45502980 - 45502903
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  45502980 ctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaagat 45502903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47906919 - 47906838
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  47906919 attacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 47906838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 33393336 - 33393428
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  33393336 ctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 33393428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 266 - 346
Target Start/End: Original strand, 41855071 - 41855151
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 346  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41855071 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttcat 41855151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 21718129 - 21718210
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  21718129 attacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 21718210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 26371061 - 26371185
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  26371061 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 26371149  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26371150 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 26371185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 44659856 - 44659936
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  44659856 attacctttgaagaatggtg-gtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 44659936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 7257389 - 7257481
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  7257389 ctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 7257481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15644110 - 15644018
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  15644110 ctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatacca 15644018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 322
Target Start/End: Original strand, 35557739 - 35557798
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 322  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557739 tagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47460935 - 47460844
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  47460935 tagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 47460844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30077100 - 30077043
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaa 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30077100 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 33455108 - 33455189
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  33455108 attacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 33455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 401
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405495
Alignment:
Q  318 aatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 44405495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 35484648 - 35484730
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  35484648 attatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 35484730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 45237693 - 45237620
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  45237693 attacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagat 45237620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 46103133 - 46103213
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  46103133 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 46103213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 46898176 - 46898095
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||    
T  46898176 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatg 46898095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448508
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||  |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  366 g 366  Q
    |    
T  38448508 g 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 35823302 - 35823353
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagc 317  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35823302 attaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7720664 - 7720575
Alignment:
Q  265 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| | | | | || ||||| ||||||||||||||    
T  7720664 gattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggatacca 7720575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443674
Alignment:
Q  294 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagatacca 37443674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 352
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456207
Alignment:
Q  302 accaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatac 352  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatac 26456207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21649542 - 21649450
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaa-tggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||  |  |||||||||||||||||||||| || || || | ||||| ||| ||||||||||    
T  21649542 tagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttattagtagatttaagatagtttatggatacca 21649450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 2892195 - 2892334
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2892195 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2892294  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  2892295 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 2892334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 5882513 - 5882652
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5882513 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5882612  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  5882613 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 5882652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 599899 - 600038
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  599899 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 599998  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  599999 atgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaatt 600038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7393761 - 7393622
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7393761 ctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 7393662  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  7393661 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 7393622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14891554 - 14891415
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14891554 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 14891455  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  14891454 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 14891415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18101670 - 18101531
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  18101670 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 18101571  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  18101570 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 18101531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34528036 - 34527898
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  34528036 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaa 34527937  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34527936 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 34527898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2594027 - 2593888
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2594027 ctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2593928  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2593927 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 2593888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7345287 - 7345148
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  7345287 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 7345188  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  7345187 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 7345148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 8615247 - 8615386
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8615247 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 8615346  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  8615347 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 8615386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 16703373 - 16703512
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  16703373 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 16703472  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  16703473 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaatt 16703512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22551236 - 22551097
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  22551236 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacctaaaa 22551137  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  22551136 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 22551097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 24168098 - 24168237
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24168098 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24168197  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  24168198 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 24168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26377375 - 26377240
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26377375 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 26377276  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  26377275 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 26377240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 267 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24224240 - 24224106
Alignment:
Q  267 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24224240 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 24224141  T
Q  367 cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  24224140 cttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaatt 24224106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 1970718 - 1970857
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  1970718 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 1970817  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1970818 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 1970857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 30743623 - 30743484
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  30743623 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccacttaaaa 30743524  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  30743523 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaatt 30743484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 268 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11989010
Alignment:
Q  268 tacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgc 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  368 ttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 11989010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 960079 - 959940
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  960079 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccacttaaaa 959980  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  959979 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 959940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19415708 - 19415577
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19415708 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccacttaaaa 19415609  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19415608 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 19415577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30467778 - 30467656
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||     
T  30467778 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaac 30467679  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgt 384  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  30467678 atgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10508083 - 10507946
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10508083 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 10507984  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaa 399  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10507983 atgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 10507946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 268 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341824
Alignment:
Q  268 tacctttgaagaatggtgagtaatttacccacca--accaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 22341824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19281230 - 19281091
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  19281230 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 19281131  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  19281130 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 19281091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 28947094 - 28947233
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  28947094 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaa 28947193  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  28947194 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 28947233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 262 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5294976 - 5294856
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5294976 ctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 5294877  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgt 382  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5294876 atgtgcttatgtgactaatgt 5294856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 262 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5299528 - 5299408
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5299528 ctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 5299429  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgt 382  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5299428 atgtgcttatgtgactaatgt 5299408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33452747 - 33452608
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33452747 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33452648  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33452647 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 287 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261965
Alignment:
Q  287 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtac 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||| ||||     
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  387 tggttgggataaatt 401  Q
    |||||||| ||||||    
T  23261979 tggttggggtaaatt 23261965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 337
Target Start/End: Original strand, 929666 - 929741
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaag 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  929666 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28949005 - 28948932
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  28949005 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 28948932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 7167589 - 7167681
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  7167589 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggatacca 7167681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 13329392 - 13329516
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| || ||||| |||||           |||| ||||    
T  13329392 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca-----------taaatatgt 13329480  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  13329481 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 13329516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 4487546 - 4487619
Alignment:
Q  274 tgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  4487546 tgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 4487619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Original strand, 15965444 - 15965517
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||    
T  15965444 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagat 15965517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 346
Target Start/End: Original strand, 3291019 - 3291099
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| || ||||| ||||||    
T  3291019 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcat 3291099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Original strand, 1398564 - 1398637
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  1398564 attatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagat 1398637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1939664 - 1939579
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata 351  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||    
T  1939664 attatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 3786760 - 3786841
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  3786760 attacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatg 3786841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 346
Target Start/End: Original strand, 13844847 - 13844927
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 346  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  13844847 attacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcat 13844927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11743119 - 11743070
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaa 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11743119 ctagattacccttgaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaa 11743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 739879 - 739740
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  739879 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 739780  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  739779 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaatt 739740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15398657 - 15398518
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15398657 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15398558  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  15398557 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 15398518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 24253389 - 24253528
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24253389 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24253488  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  24253489 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 24253528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18479843 - 18479704
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  18479843 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 18479744  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  18479743 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 18479704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43326554 - 43326415
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43326554 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43326455  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  43326454 atgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 43326415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 39932587 - 39932725
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39932587 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39932686  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  39932687 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 39932725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3466856 - 3466717
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3466856 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 3466757  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  3466756 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 3466717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 5184979 - 5185118
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  5184979 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 5185078  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  5185079 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 5185118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 15683798 - 15683937
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15683798 ctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15683897  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  15683898 atgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaatt 15683937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 35626049 - 35626184
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35626049 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 35626148  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35626149 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 35626184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 6901806 - 6901945
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  6901806 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 6901905  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  6901906 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 6901945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 7722056 - 7722195
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7722056 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 7722155  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  7722156 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaatt 7722195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 25831528 - 25831666
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25831528 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaattaaaa 25831626  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  25831627 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 25831666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 27938904 - 27939043
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27938904 ctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27939003  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  27939004 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 27939043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939043
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaatt 31939043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40886202 - 40886064
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  40886202 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 40886104  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  40886103 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 40886064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 12648804 - 12648943
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12648804 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 12648903  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  12648904 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 12648943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13504917 - 13504778
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13504917 ctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 13504818  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  13504817 atgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaatt 13504778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40279029 - 40278894
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  40279029 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgt 40278930  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||    
T  40278929 gcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaatt 40278894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43262354 - 43262219
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  43262354 attacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43262255  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  43262254 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 43262219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27278652 - 27278509
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatgg----ttcatggataccattt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    ||||||||||||| ||    
T  27278652 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggataccactt 27278553  T
Q  358 aaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  27278552 aaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 27278509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27501229 - 27501091
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27501229 tagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 27501130  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  27501129 tgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaatt 27501091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Original strand, 5137722 - 5137845
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5137722 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5137821  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  5137822 atgtgtttatgtggctaatatgta 5137845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756524
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaatt 38756524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2484467 - 2484336
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  2484467 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 2484368  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  2484367 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgg 2484336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 890913 - 891051
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  890913 ctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccactt-aaa 891011  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  891012 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 891051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 292 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789331
Alignment:
Q  292 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  392 gggataaatt 401  Q
    ||||||||||    
T  29789340 gggataaatt 29789331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28424968 - 28424831
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  28424968 ctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 28424871  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  28424870 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 28424831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 374
Target Start/End: Original strand, 40110245 - 40110352
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  40110245 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 40110343  T
Q  366 gcttatgtg 374  Q
    |||||||||    
T  40110344 gcttatgtg 40110352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 763730 - 763869
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  763730 ctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcacttaaaa 763829  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||    
T  763830 atgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaatt 763869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 4149705 - 4149830
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||| ||||||||||    
T  4149705 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgg---------ggtt-atggataccacttaaaaatgt 4149794  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  4149795 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 4149830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Original strand, 40632506 - 40632597
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacc 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40632506 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 40632597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 297 - 401
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451396
Alignment:
Q  297 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  397 aaatt 401  Q
    |||||    
T  34451392 aaatt 34451396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 2585469 - 2585569
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  2585469 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaa 2585568  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  2585569 a 2585569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12558193 - 12558090
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  12558193 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 12558095  T
Q  362 atgtg 366  Q
    |||||    
T  12558094 atgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42658822 - 42658741
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  42658822 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 42658741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 363
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120132
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 363  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaat 5120132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 6973074 - 6973155
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  6973074 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 6973155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9424752 - 9424671
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  9424752 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 9424671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 13957681 - 13957762
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  13957681 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 13957762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23195408 - 23195327
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  23195408 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 23195327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 27503390 - 27503471
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  27503390 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 27503471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 33617596 - 33617677
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  33617596 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg 33617677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36365605 - 36365524
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  36365605 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 36365524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36472448 - 36472347
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca-tttaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  36472448 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccactttaaa 36472349  T
Q  361 aa 362  Q
    ||    
T  36472348 aa 36472347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38015674 - 38015593
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  38015674 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 38015593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 42247942 - 42247869
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  42247942 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 42247869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 5497284 - 5497408
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  5497284 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 5497372  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  5497373 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 5497408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9374662 - 9374581
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  9374662 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 9374581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Original strand, 14971989 - 14972062
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  14971989 attaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 14972062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 19295741 - 19295822
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||    
T  19295741 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg 19295822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18327337 - 18327245
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18327337 ctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 18327245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38638074 - 38637982
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  38638074 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 38637982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9527183 - 9527124
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9527183 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Original strand, 27390605 - 27390696
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27390605 tagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 27390696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9171185 - 9171112
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  9171185 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 9171112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31294164 - 31294051
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||  | | || |||| |||||| ||||||    
T  31294164 ctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccacttaaaa 31294065  T
Q  362 atgtgcttatgtga 375  Q
    || |||||| ||||    
T  31294064 atatgcttacgtga 31294051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1402669 - 1402577
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  1402669 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 1402577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24167948 - 24167856
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| | |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  24167948 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 24167856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 40686906 - 40687006
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  40686906 ctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaa 40687005  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  40687006 a 40687006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300962
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaag 337  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaatttatcggtggagtcaag 15300962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 401
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492748
Alignment:
Q  289 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactg 388  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  389 gttgggataaatt 401  Q
    |||||| ||||||    
T  38492736 gttggggtaaatt 38492748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656647
Alignment:
Q  282 ggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatg 3656647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 6206895 - 6206976
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||||| || |||||||    
T  6206895 attacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatg 6206976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940418
Alignment:
Q  279 aatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagat 3940418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33624099 - 33624043
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 322  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33624099 attacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 33624043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36948626 - 36948564
Alignment:
Q  288 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||    
T  36948626 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggata 36948564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20207154 - 20207080
Alignment:
Q  288 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||   | ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20207154 taatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggataccatctaaaaa 20207080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 315
Target Start/End: Original strand, 28756085 - 28756138
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 315  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28756085 ctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9424664 - 9424628
Alignment:
Q  365 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9424664 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 9424628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 117)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21366784 - 21366645
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21366784 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 21366685  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  21366684 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 21366645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Original strand, 51363014 - 51363145
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51363014 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 51363113  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51363114 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 51363145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 49881238 - 49881106
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49881238 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 49881139  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 394  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  49881138 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggg 49881106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 23437599 - 23437738
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23437599 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23437698  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  23437699 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 23437738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 34276558 - 34276693
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34276558 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 34276657  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  34276658 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 34276693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 44984772 - 44984907
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44984772 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 44984871  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44984872 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 44984907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 53854604 - 53854465
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53854604 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 53854505  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  53854504 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 53854465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 55056434 - 55056295
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  55056434 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaa 55056335  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  55056334 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 55056295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 397410 - 397548
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  397410 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 397509  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  397510 tgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 397548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 9798473 - 9798611
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9798473 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 9798572  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  9798573 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 9798611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 394
Target Start/End: Original strand, 407761 - 407892
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  407761 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaa 407859  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 394  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  407860 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 407892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 146604 - 146465
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  146604 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 146505  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  146504 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaatt 146465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 237484 - 237623
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  237484 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaa 237583  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  237584 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 237623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2826856 - 2826717
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2826856 ctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2826757  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  2826756 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 2826717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 6019935 - 6020074
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6019935 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 6020034  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  6020035 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 6020074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 27373083 - 27373222
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  27373083 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 27373182  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  27373183 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 27373222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 42085214 - 42085353
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42085214 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 42085313  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  42085314 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 42085353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18462188 - 18462058
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  18462188 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 18462089  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttg 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18462088 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg 18462058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 45797487 - 45797625
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45797487 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 45797586  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45797587 tgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 45797625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 55776053 - 55776190
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55776053 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 55776151  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  55776152 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 55776190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 55840231 - 55840368
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55840231 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 55840329  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  55840330 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 55840368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 6285318 - 6285453
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  6285318 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 6285417  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6285418 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 6285453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 31532310 - 31532171
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31532310 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31532211  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  31532210 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 31532171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32366835 - 32366696
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32366835 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 32366736  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  32366735 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaatt 32366696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 39077552 - 39077691
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39077552 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 39077651  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  39077652 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 39077691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41702634 - 41702495
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41702634 ctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 41702535  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  41702534 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 41702495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 47344663 - 47344802
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47344663 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47344762  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47344763 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47344802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 53461987 - 53461852
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53461987 attacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 53461888  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  53461887 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 53461852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 54607969 - 54608108
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  54607969 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaa 54608068  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  54608069 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 54608108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 41949389 - 41949530
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41949389 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41949488  T
Q  362 atgtgct--tatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  41949489 atgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 41949530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22618687 - 22618559
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22618687 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaa 22618589  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 391  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  22618588 atgtgcttatgtggctaatatgtattggtt 22618559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 3170633 - 3170772
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  3170633 ctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 3170732  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  3170733 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 3170772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 29478367 - 29478506
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29478367 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 29478466  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||| ||||||    
T  29478467 atgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaatt 29478506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 31070248 - 31070110
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31070248 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 31070150  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  31070149 atgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaatt 31070110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 31972511 - 31972372
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  31972511 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 31972412  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  31972411 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 31972372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 42222298 - 42222437
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  42222298 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccacttaaaa 42222397  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  42222398 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 42222437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 42766016 - 42765878
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  42766016 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 42765918  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  42765917 atgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 42765878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43471870 - 43471731
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43471870 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43471771  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  43471770 atgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 43471731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 54424989 - 54425128
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54424989 ctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 54425088  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  54425089 atgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaatt 54425128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 54575115 - 54574976
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  54575115 ctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 54575016  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  54575015 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 54574976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 56023173 - 56023034
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  56023173 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 56023074  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  56023073 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 56023034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 42033183 - 42033321
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  42033183 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 42033282  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| ||||||  ||||||| || |||||| ||||||||    
T  42033283 tgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaatt 42033321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 1932770 - 1932909
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  1932770 ctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 1932869  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  1932870 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaatt 1932909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19387863 - 19387724
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19387863 ctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaa 19387764  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  19387763 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 19387724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26091429 - 26091302
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26091429 attatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 26091330  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  26091329 gtttatgtggctaatgtgtattggttgg 26091302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29777432 - 29777293
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||||    
T  29777432 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccacttaaaa 29777333  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  29777332 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 29777293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 41560339 - 41560474
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41560339 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41560438  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  41560439 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 41560474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 50457985 - 50457846
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50457985 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 50457886  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||    
T  50457885 atgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaatt 50457846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 31914206 - 31914343
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31914206 tagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 31914305  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31914306 tgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaatt 31914343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 263 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 33897669 - 33897547
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33897669 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 33897570  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    | || |||| || ||||||||||    
T  33897569 tatgattatatggctaatgtgta 33897547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 50534639 - 50534777
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  50534639 tagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 50534738  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  50534739 tgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 50534777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 262 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53834229 - 53834109
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53834229 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 53834130  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgt 382  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  53834129 atgtgcttatgtgactaatgt 53834109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22468945 - 22468806
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  22468945 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccacttaaaa 22468846  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  22468845 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 22468806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 23609094 - 23609233
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23609094 ctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccacttaaaa 23609193  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  23609194 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 23609233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 39587954 - 39587815
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39587954 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39587855  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||||    
T  39587854 atgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaatt 39587815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 48657832 - 48657964
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  48657832 tagattacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 48657925  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  48657926 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 48657964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 50234007 - 50234146
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  50234007 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccacttaaaa 50234106  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  50234107 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaatt 50234146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 38591675 - 38591810
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    |    
T  38591675 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt----a 38591770  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  38591771 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 38591810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 263 - 385
Target Start/End: Original strand, 48654822 - 48654944
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  48654822 tagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccacttaaaaa 48654921  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  48654922 tgtacttatgtggctaatgtgta 48654944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 50536798 - 50536660
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  50536798 tagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaa 50536699  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    | || |||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  50536698 tatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaatt 50536660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Original strand, 2243465 - 2243588
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2243465 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2243564  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||  ||||||| || |||||||    
T  2243565 atgtatttatgtggcttatgtgta 2243588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 35446513 - 35446651
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  35446513 ctagattaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 35446611  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35446612 atgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaatt 35446651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41632181 - 41632043
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  41632181 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggatatcgcttaaaa 41632083  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  41632082 atgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaatt 41632043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 47662277 - 47662138
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  47662277 ctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccacttaaaa 47662178  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47662177 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47662138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 55519834 - 55519973
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  55519834 ctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 55519933  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  55519934 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaatt 55519973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14017549 - 14017412
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||    
T  14017549 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt--aa 14017452  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
     |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  14017451 gtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 14017412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3692385 - 3692246
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  3692385 ctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccacttaaaa 3692286  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  3692285 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 3692246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 48259685 - 48259563
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||    
T  48259685 ctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccactt-aaa 48259587  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  48259586 atgtgcttatgtggctaatatgta 48259563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 361
Target Start/End: Original strand, 48313564 - 48313662
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48313564 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaa 48313662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 54086417 - 54086554
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  54086417 ctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccgcttaaaa 54086514  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  54086515 atgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaatt 54086554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 392
Target Start/End: Original strand, 51951689 - 51951819
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  51951689 ctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagttaaaa 51951788  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttg 392  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  51951789 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttg 51951819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 54805793 - 54805650
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54805793 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccacttaaaa 54805694  T
Q  362 atgtg----cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  54805693 atgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 54805650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728342
Alignment:
Q  295 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  395 ataaatt 401  Q
     ||||||    
T  52728348 gtaaatt 52728342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5117598 - 5117517
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  5117598 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 5117517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 339
Target Start/End: Original strand, 42557589 - 42557666
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42557589 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45633939 - 45633858
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  45633939 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 45633858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14335265 - 14335173
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  14335265 ctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagatacca 14335173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 27580126 - 27580218
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27580126 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 27580218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 34835184 - 34835284
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  34835184 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaa 34835283  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  34835284 a 34835284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532876
Alignment:
Q  311 aatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 36532876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 46708901 - 46708778
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  46708901 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 46708813  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaat 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  46708812 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaat 46708778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27398767 - 27398664
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  27398767 ctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 27398668  T
Q  362 atgt 365  Q
    ||||    
T  27398667 atgt 27398664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38547764 - 38547673
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  38547764 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 38547673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15060449 - 15060368
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  15060449 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 15060368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20352002 - 20351878
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  20352002 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 20351914  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20351913 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 20351878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31881474 - 31881393
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  31881474 attacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 31881393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 34552330 - 34552411
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  34552330 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatg 34552411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37239250 - 37239169
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  37239250 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 37239169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 43890939 - 43891020
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  43890939 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatg 43891020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 54216896 - 54216772
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  54216896 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 54216808  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  54216807 gcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaatt 54216772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1662423 - 1662331
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  1662423 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 1662331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 401
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509442
Alignment:
Q  310 aaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaatt 42509442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 49058032 - 49057933
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||  || || || |||||| ||||||||||||||    
T  49058032 ctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccatttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 393
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  303 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaa-gatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Original strand, 49014112 - 49014190
Alignment:
Q  269 acctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  49014112 acctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 49014190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3293183 - 3293102
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  3293183 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11972289 - 11972208
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  11972289 attacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 22620604 - 22620685
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  22620604 attatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 22620685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 355
Target Start/End: Original strand, 43231510 - 43231602
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  43231510 ctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccat 43231602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 54216324 - 54216405
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  54216324 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 54216405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 54715046 - 54715127
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  54715046 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatg 54715127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 46720032 - 46720124
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  46720032 ctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggatacca 46720124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4486741 - 4486668
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  4486741 attatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 4486668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6371413 - 6371336
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6371413 ctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagat 6371336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9998091 - 9998010
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  9998091 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatg 9998010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 47811917 - 47811998
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  47811917 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatg 47811998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 573810 - 573902
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  573810 ctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 573902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27873708 - 27873627
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| || ||||| |||||||    
T  27873708 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatg 27873627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Original strand, 52461386 - 52461455
Alignment:
Q  278 gaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  52461386 gaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 52461455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 52688360 - 52688441
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| || |||||||    
T  52688360 attaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg 52688441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 401
Target Start/End: Original strand, 35595773 - 35595833
Alignment:
Q  341 gttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35595773 gttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 35595833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 352
Target Start/End: Original strand, 33289714 - 33289800
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatac 352  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |  ||||||| ||||||| ||||    
T  33289714 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac 33289800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33558102 - 33558021
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||| |||||||    
T  33558102 attatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg 33558021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17555661 - 17555617
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17555661 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 391
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344924
Alignment:
Q  335 aagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 391  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 35344924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 354
Target Start/End: Original strand, 27872612 - 27872678
Alignment:
Q  288 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  27872612 taatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggatacca 27872678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206609
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagat 18206609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 106)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 41464359 - 41464498
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41464359 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41464458  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  41464459 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 41464498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 47257800 - 47257939
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  47257800 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 47257899  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47257900 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47257939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 49330044 - 49330183
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49330044 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 49330143  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  49330144 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 49330183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7855289 - 7855150
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  7855289 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccacttaaaa 7855190  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  7855189 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaatt 7855150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27067153 - 27067014
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  27067153 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 27067054  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27067053 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 27067014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29626002 - 29625863
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29626002 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 29625903  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  29625902 atatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 29625863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40131134 - 40130995
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40131134 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40131035  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  40131034 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 40130995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 43125838 - 43125977
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43125838 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43125937  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43125938 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 43125977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43612222 - 43612083
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43612222 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43612123  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43612122 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 43612083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 52215083 - 52215222
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52215083 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 52215182  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  52215183 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 52215222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 52628961 - 52629100
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52628961 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 52629060  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  52629061 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 52629100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 392
Target Start/End: Original strand, 44806691 - 44806821
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44806691 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaa 44806790  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttg 392  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  44806791 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttg 44806821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 263 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 51170207 - 51170077
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  51170207 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 51170108  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51170107 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 51170077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 391
Target Start/End: Original strand, 2666007 - 2666136
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2666007 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2666106  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 391  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2666107 ctgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 2666136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 47809768 - 47809640
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  47809768 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47809669  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttggg 394  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  47809668 gtttatgtggctaatgtgtattggttggg 47809640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20754564 - 20754429
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  20754564 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatat 20754465  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20754464 gtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 20754429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28048563 - 28048444
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28048563 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 28048464  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  28048463 gcttatgtggctaatgtgta 28048444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 38416899 - 38416760
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38416899 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 38416800  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  38416799 atgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 38416760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 39053401 - 39053540
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39053401 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39053500  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  39053501 atgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaatt 39053540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 40419842 - 40419981
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40419842 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40419941  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  40419942 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 40419981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 46134363 - 46134502
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46134363 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 46134462  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  46134463 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 46134502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 35748485 - 35748347
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35748485 tagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 35748386  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35748385 tatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 35748347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 18946910 - 18947049
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18946910 ctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagttaaaa 18947009  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  18947010 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaatt 18947049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 22399104 - 22399242
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||    
T  22399104 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccactt-aaa 22399202  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  22399203 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaatt 22399242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 24100290 - 24100428
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  24100290 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 24100388  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  24100389 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 24100428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32234572 - 32234434
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  32234572 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 32234474  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  32234473 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 32234434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 40643811 - 40643946
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  40643811 attatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcatttaaaaatgt 40643910  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  40643911 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 40643946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 42291849 - 42291988
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||    
T  42291849 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttgaaa 42291948  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  42291949 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 42291988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 43183919 - 43184058
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43183919 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaaaa 43184018  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||    
T  43184019 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaatt 43184058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 51452925 - 51452786
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  51452925 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 51452826  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||    
T  51452825 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaatt 51452786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 24376580 - 24376719
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24376580 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 24376679  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||    
T  24376680 atgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaatt 24376719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 37313406 - 37313545
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  37313406 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 37313505  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  37313506 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37313545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 39634746 - 39634608
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  39634746 ctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccacttaaaa 39634648  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  39634647 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 39634608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 278 - 401
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126133
Alignment:
Q  278 gaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgact 377  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  378 aatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaatt 46126133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 48739408 - 48739269
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48739408 ctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaa 48739309  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  48739308 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 48739269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 51102553 - 51102414
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  51102553 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 51102454  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  51102453 atgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 51102414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 53832659 - 53832520
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  53832659 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaattaaaa 53832560  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    | | ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  53832559 aggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 53832520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 55453419 - 55453280
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  55453419 ctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 55453320  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  55453319 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 55453280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7755481 - 7755344
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||    
T  7755481 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccactt-aaa 7755383  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaat 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||    
T  7755382 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaat 7755344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 264 - 401
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609869
Alignment:
Q  264 agattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 363  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  364 gtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 48609869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54159163 - 54159051
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54159163 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccacttaaaa 54159064  T
Q  362 atgtgcttatgtg 374  Q
    |||||||||||||    
T  54159063 atgtgcttatgtg 54159051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 36368946 - 36369085
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36368946 ctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 36369045  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||    
T  36369046 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaatt 36369085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 37324552 - 37324687
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  37324552 attacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatat 37324651  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
      ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37324652 atttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 37324687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 40804685 - 40804562
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40804685 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 40804586  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||    
T  40804585 atgtgtttatgtggctaatgtgta 40804562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 43021722 - 43021861
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-ggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  43021722 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 43021821  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  43021822 atgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaatt 43021861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 53637848 - 53637987
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  53637848 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccacttaaaa 53637947  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||    
T  53637948 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaatt 53637987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 53943762 - 53943623
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53943762 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 53943663  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || | |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  53943662 atatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaatt 53943623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 35594129 - 35594267
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  35594129 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 35594228  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    | |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  35594229 tatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaatt 35594267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 403
Target Start/End: Original strand, 37758936 - 37759077
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  37758936 ctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccacttaaaa 37759035  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattga 403  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37759036 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattga 37759077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41293493 - 41293355
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||| || |||    
T  41293493 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccactt-aaa 41293395  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  41293394 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 41293355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 41732535 - 41732674
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41732535 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41732634  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  41732635 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 41732674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 44222840 - 44222975
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  44222840 attacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccacttaaaaatgt 44222939  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  44222940 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 44222975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 263 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47894994 - 47894875
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47894994 tagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 47894895  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgt 382  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47894894 tgtgcttatgtgactaatgt 47894875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5560207 - 5560061
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaat-----gagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  5560207 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccact 5560108  T
Q  357 taaaaatgtgcttatgtgac--taatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||    
T  5560107 taaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaatt 5560061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 41216462 - 41216601
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  41216462 ctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccacttaaaa 41216561  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  41216562 atgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaatt 41216601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Original strand, 52638849 - 52638972
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  52638849 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccacttaaaa 52638948  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    |||||||| |||| ||||||||||    
T  52638949 atgtgcttctgtggctaatgtgta 52638972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48547004 - 48546894
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  48547004 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaa-atagttcatggataccacttaaaa 48546907  T
Q  362 atgtgcttatgtg 374  Q
    |||||||||||||    
T  48546906 atgtgcttatgtg 48546894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Original strand, 46949382 - 46949512
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46949382 ctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 46949480  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  46949481 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgg 46949512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 51146390 - 51146267
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51146390 ctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 51146291  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    || |||||||||| ||||||||||    
T  51146290 atttgcttatgtggctaatgtgta 51146267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41882155 - 41882055
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  41882155 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaa 41882056  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  41882055 a 41882055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 53115454 - 53115554
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  53115454 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 53115553  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  53115554 a 53115554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 25641657 - 25641781
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||           |||| ||||    
T  25641657 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgt 25641745  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  25641746 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 25641781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34279881 - 34279800
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  34279881 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 34279800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 42589841 - 42589922
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  42589841 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 42589922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 54401198 - 54401279
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  54401198 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 54401279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21597312 - 21597220
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  21597312 ctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 21597220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 48726158 - 48726062
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  48726158 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggataccatctaaaaa 48726062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 55379992 - 55380084
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  55379992 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 55380084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50732077 - 50731979
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  50732077 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaa 50731979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 361
Target Start/End: Original strand, 50780779 - 50780877
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  50780779 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaa 50780877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17665684 - 17665603
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  17665684 attacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 17665603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31286953 - 31286872
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  31286953 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 31286872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 37028734 - 37028815
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  37028734 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatg 37028815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39141286 - 39141205
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  39141286 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39141205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41635960 - 41635879
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  41635960 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 41635879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 45058894 - 45058975
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  45058894 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 45058975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 304 - 385
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182130
Alignment:
Q  304 caatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgta 47182130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47511100 - 47511019
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  47511100 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 47511019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 51415980 - 51416061
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  51415980 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 51416061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 54707380 - 54707299
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  54707380 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 54707299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 25353561 - 25353653
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  25353561 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 25353653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28576276 - 28576176
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  28576276 ctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaa 28576177  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  28576176 a 28576176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Original strand, 51143825 - 51143916
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  51143825 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggatacca 51143916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 264 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402810
Alignment:
Q  264 agattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 363  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T
Q  364 gtg 366  Q
    |||    
T  47402812 gtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38156792 - 38156711
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  38156792 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 38156711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 30251665 - 30251573
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  30251665 ctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 30251573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42998952 - 42998861
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  42998952 ctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 42998861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 24688125 - 24688206
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  24688125 attacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 24688206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 40022085 - 40022166
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  40022085 attacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40022166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 44946089 - 44946016
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  44946089 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 44946016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 49130589 - 49130670
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||    
T  49130589 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatg 49130670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51224197 - 51224117
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  51224197 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 51224117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 392
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864627
Alignment:
Q  315 agcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttg 392  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttg 52864627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 55000338 - 55000257
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||||| |||||||    
T  55000338 attaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg 55000257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2228099 - 2227995
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||| || || |||    
T  2228099 ctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcacttcaaa 2228000  T
Q  362 atgtg 366  Q
    |||||    
T  2227999 atgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43176902 - 43176810
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  43176902 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggatacca 43176810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550503
Alignment:
Q  322 tgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 33550503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 330
Target Start/End: Original strand, 48752093 - 48752160
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  48752093 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtgg 48752160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 330
Target Start/End: Original strand, 52434146 - 52434215
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg 330  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  52434146 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgg 52434215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 354
Target Start/End: Original strand, 40165683 - 40165750
Alignment:
Q  287 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40165683 gtaatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 40165750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 366
Target Start/End: Original strand, 41609099 - 41609178
Alignment:
Q  287 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 366  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||| |  ||||||||||    
T  41609099 gtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg 41609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8847818 - 8847718
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||  |||| || ||||| | |||||| ||||||||||    
T  8847818 attacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccacttaaaaatgt 8847719  T
Q  366 g 366  Q
    |    
T  8847718 g 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 307
Target Start/End: Original strand, 37741443 - 37741487
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaat 307  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37741443 tagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 352
Target Start/End: Original strand, 177169 - 177258
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatac 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||| |||||||  |||||||  || ||||||||    
T  177169 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatac 177258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52756207 - 52756150
Alignment:
Q  290 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  52756207 atttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 52756150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 51942580 - 51942543
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51942580 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccac 51942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 101)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24245200 - 24245061
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24245200 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24245101  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  24245100 atgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaatt 24245061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 31308008 - 31308147
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31308008 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31308107  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31308108 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 31308147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 43251718 - 43251857
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43251718 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43251817  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  43251818 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 43251857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 45538160 - 45538299
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45538160 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45538259  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  45538260 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 45538299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23221104 - 23220972
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23221104 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23221005  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 394  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23221004 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 23220972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 3611147 - 3611282
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3611147 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 3611246  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  3611247 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 3611282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4068858 - 4068719
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4068858 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 4068759  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  4068758 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 4068719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6327722 - 6327584
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6327722 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 6327623  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6327622 atgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaatt 6327584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17995126 - 17994987
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  17995126 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaa 17995027  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  17995026 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 17994987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21139587 - 21139448
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21139587 ctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 21139488  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  21139487 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 21139448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 44661977 - 44662116
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  44661977 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 44662076  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  44662077 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 44662116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25678433 - 25678295
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25678433 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 25678334  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  25678333 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 25678295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Original strand, 5981177 - 5981308
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5981177 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5981276  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5981277 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 5981308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26085572 - 26085434
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  26085572 ctagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 26085474  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26085473 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 26085434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 26277184 - 26277323
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26277184 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 26277283  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26277284 atttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 26277323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33112992 - 33112853
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33112992 ctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33112893  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33112892 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33112853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 33884095 - 33884234
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33884095 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaa 33884194  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33884195 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33884234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33960157 - 33960018
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33960157 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaa 33960058  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33960057 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33960018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 38790372 - 38790233
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  38790372 ctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 38790273  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38790272 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 38790233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 39646575 - 39646714
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  39646575 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccacttaaaa 39646674  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39646675 atgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaatt 39646714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 50774228 - 50774363
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  50774228 attacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 50774327  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  50774328 gcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaatt 50774363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 25058695 - 25058834
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25058695 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccacttaaaa 25058794  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  25058795 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 25058834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Original strand, 25518821 - 25518952
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25518821 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 25518920  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25518921 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 31040716 - 31040855
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31040716 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31040815  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  31040816 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 31040855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 31844383 - 31844522
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31844383 ctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31844482  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31844483 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 31844522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 36003141 - 36003276
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36003141 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 36003240  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  36003241 gcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaatt 36003276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Original strand, 46784430 - 46784561
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46784430 ctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccacttaaaa 46784529  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46784530 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgg 46784561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 46967216 - 46967077
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46967216 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 46967117  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||    
T  46967116 atgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaatt 46967077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 47383903 - 47383768
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  47383903 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47383804  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  47383803 gcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaatt 47383768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37620366 - 37620228
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37620366 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 37620267  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  37620266 tgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37620228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 265 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23932681 - 23932561
Alignment:
Q  265 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  23932681 gattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccacttaaaaatg 23932582  T
Q  365 tgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  23932581 tgcttatgtggctaatgtgta 23932561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 5980075 - 5980214
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  5980075 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaa 5980174  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  5980175 attagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 5980214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 23984762 - 23984901
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23984762 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23984861  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||    
T  23984862 atgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaatt 23984901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 26794315 - 26794450
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  26794315 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 26794414  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  26794415 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 26794450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 38332034 - 38331895
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  38332034 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 38331935  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38331934 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 38331895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 41999822 - 41999961
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41999822 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaa 41999921  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  41999922 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 41999961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 42863872 - 42864011
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  42863872 ctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 42863971  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  42863972 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 42864011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 47317326 - 47317461
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  47317326 attacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 47317425  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47317426 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47317461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 47671593 - 47671732
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47671593 ctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47671692  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47671693 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47671732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 49254150 - 49254011
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  49254150 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 49254051  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  49254050 atgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaatt 49254011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 391
Target Start/End: Original strand, 47187112 - 47187241
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  47187112 ctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 47187211  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 391  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  47187212 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 47187241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 35692839 - 35692699
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaattta-cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||    
T  35692839 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgcttaaa 35692740  T
Q  361 aatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  35692739 aatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 35692699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 24885508 - 24885647
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24885508 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24885607  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || || |||||||  ||||||||| ||||| || ||||||    
T  24885608 atatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaatt 24885647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26525064 - 26524925
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  26525064 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccacttaaaa 26524965  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    || |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  26524964 atatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 26524925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 28888588 - 28888727
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28888588 ctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 28888687  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||| ||||||||    
T  28888688 atgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaatt 28888727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 46616556 - 46616695
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  46616556 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 46616655  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  46616656 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 46616695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Original strand, 48373511 - 48373623
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48373511 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 48373610  T
Q  362 atgtgcttatgtg 374  Q
    |||||||||||||    
T  48373611 atgtgcttatgtg 48373623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 36566337 - 36566476
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36566337 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 36566436  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  36566437 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaatt 36566476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 49399163 - 49399024
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  49399163 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccacttaaaa 49399064  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  49399063 atgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaatt 49399024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 51403182 - 51403074
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  51403182 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 51403084  T
Q  362 atgtgcttat 371  Q
    ||||||||||    
T  51403083 atgtgcttat 51403074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Original strand, 3285409 - 3285531
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  3285409 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 3285507  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  3285508 atgtgcttatgtggctaatgtgta 3285531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 266 - 385
Target Start/End: Original strand, 35273607 - 35273726
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35273607 attatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 35273706  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  35273707 gcttatgtggctaatgtgta 35273726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 266 - 385
Target Start/End: Original strand, 51057082 - 51057201
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  51057082 attacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccacttaaaaatgt 51057181  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  51057182 gcttatgtggttaatgtgta 51057201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31980110 - 31979998
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31980110 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31980011  T
Q  362 atgtgcttatgtg 374  Q
    |||| ||||||||    
T  31980010 atgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 290 - 401
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450640
Alignment:
Q  290 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactgg 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  390 ttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||    
T  2450629 ttggggtaaatt 2450640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 42313540 - 42313397
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagta----atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccattt 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||    
T  42313540 ctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaataccactt 42313441  T
Q  358 aaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  42313440 aaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 42313397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27983762 - 27983639
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||    
T  27983762 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg----------------ggataccatttaaaa 27983679  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  27983678 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 27983639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2557021 - 2556909
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  2557021 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 2556922  T
Q  362 atgtgcttatgtg 374  Q
    ||||| |||||||    
T  2556921 atgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 262 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 45476009 - 45475885
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  45476009 ctagattacctttgaagaatggt--------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaa 45475918  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 394  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45475917 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 45475885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 2657314 - 2657395
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  2657314 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 2657395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26472339 - 26472258
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  26472339 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 26472258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41467792 - 41467711
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  41467792 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 41467711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045648
Alignment:
Q  296 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgta 51045648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 268 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13313332 - 13313249
Alignment:
Q  268 tacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata 351  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  13313332 tacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6626184 - 6626103
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  6626184 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 6626103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30290070 - 30289989
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30290070 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatg 30289989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 32448659 - 32448740
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  32448659 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 42234851 - 42234932
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  42234851 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 42234932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 2954862 - 2954962
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  2954862 ctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaa 2954961  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  2954962 a 2954962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 401
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808791
Alignment:
Q  309 aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||| |||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 4808791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 26685863 - 26685955
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  26685863 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 26685955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 4953063 - 4953144
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  4953063 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 4953144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 10928078 - 10928159
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10928078 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg 10928159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 29770681 - 29770762
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  29770681 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 29770762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 33073222 - 33073303
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  33073222 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg 33073303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44544206 - 44544125
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  44544206 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51155749 - 51155668
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  51155749 attacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg 51155668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24649886 - 24649802
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 346  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  24649886 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27924822 - 27924730
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  27924822 ctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 27924730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39475946 - 39475843
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||    
T  39475946 ctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgg-gtcaagatagtttatggataccacctaaaa 39475848  T
Q  362 atgtg 366  Q
    |||||    
T  39475847 atgtg 39475843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683402
Alignment:
Q  267 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 48683402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4243650 - 4243577
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  4243650 attacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagat 4243577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13281722 - 13281641
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  13281722 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 13281641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 363
Target Start/End: Original strand, 33187347 - 33187448
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  33187347 ctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccacttaaaa 33187446  T
Q  362 at 363  Q
    ||    
T  33187447 at 33187448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 46428413 - 46428332
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  46428413 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 1388480 - 1388572
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  1388480 ctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 1388572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4156240 - 4156188
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156240 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 10920207 - 10920299
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  10920207 ctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 10920299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38716411 - 38716319
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  38716411 ctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 38716319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 39637907 - 39637996
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttc-atggatacca 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  39637907 ctagattacctatgaagaatggtgggtaatttaccc----accaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 339
Target Start/End: Original strand, 52323946 - 52324022
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  52323946 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagat 52324022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7561702 - 7561632
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaa 336  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  7561702 attacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaa 7561632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34752474 - 34752393
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||  | ||||| |||||||    
T  34752474 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatg 34752393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35991759 - 35991678
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  35991759 attacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 35991678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44293615 - 44293534
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  44293615 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44293534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 354
Target Start/End: Original strand, 52367893 - 52367982
Alignment:
Q  265 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  52367893 gattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 52367982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5961431 - 5961339
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  5961431 ctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 5961339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772216
Alignment:
Q  305 aatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||| || ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttgg 47772216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41895324 - 41895243
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||  |||||||| |||||||    
T  41895324 attacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatg 41895243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10919358 - 10919313
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaat 307  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10919358 ctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312567
Alignment:
Q  344 catggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 13312567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 39731 - 39592
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39731 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39632  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  39631 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 39592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11307 - 11169
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11307 ctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 11209  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  11208 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 11169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13937 - 13798
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13937 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 13838  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  13837 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 13798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 75419 - 75280
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  75419 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccacttaaaa 75320  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  75319 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 75280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Original strand, 1876 - 2007
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1876 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 1975  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1976 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 2007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19029 - 18890
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  19029 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaa 18930  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  18929 atgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaatt 18890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2468
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2607 ctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2508  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  2507 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 2468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 32568 - 32707
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32568 ctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccatttaaaa 32667  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  32668 atgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 32707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 267 - 401
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176800
Alignment:
Q  267 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  367 cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 176800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Original strand, 278014 - 278154
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata--ccatttaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||    
T  278014 tagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccccacttaaa 278113  T
Q  361 aatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  278114 aatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 278154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 3095 - 3225
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3095 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcacttaaaa 3185  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  3186 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 3225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 109 - 201
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  109 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaatacca 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 297 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4736 - 4632
Alignment:
Q  297 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggat 396  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  4736 caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggat 4637  T
Q  397 aaatt 401  Q
    |||||    
T  4636 aaatt 4632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4719 - 4618
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaa 360  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4719 ctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaa 4620  T
Q  361 aa 362  Q
    ||    
T  4619 aa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 3399 - 3500
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaa 360  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3399 ctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaa 3498  T
Q  361 aa 362  Q
    ||    
T  3499 aa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 14751 - 14843
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  14751 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 14843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20641 - 20549
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  20641 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 20549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 7101 - 7183
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  7101 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 7183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 336
Target Start/End: Original strand, 17917 - 17987
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaa 336  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||    
T  17917 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaa 17987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19301
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagat 19301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University