View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1343_high_141 (Length: 218)

Name: NF1343_high_141
Description: NF1343
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1343_high_141
NF1343_high_141
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (13-187)||(45235927-45236101)
chr8 (20-187)||(27932282-27932449)
chr8 (13-187)||(29108874-29109048)
chr8 (20-187)||(24870076-24870242)
chr8 (13-187)||(1063369-1063543)
chr8 (20-187)||(32302929-32303097)
chr8 (13-187)||(17220579-17220748)
chr8 (21-187)||(24927819-24927985)
chr8 (30-183)||(34776945-34777098)
chr8 (13-187)||(11255060-11255230)
chr8 (20-166)||(2075907-2076053)
chr8 (20-167)||(4230791-4230938)
chr8 (13-185)||(39445630-39445793)
chr8 (13-168)||(28977185-28977340)
chr8 (13-187)||(1012480-1012655)
chr8 (20-187)||(20399461-20399628)
chr8 (19-187)||(43113678-43113845)
chr8 (13-187)||(34139310-34139483)
chr8 (13-187)||(17469118-17469291)
chr8 (13-187)||(24568802-24568974)
chr8 (109-187)||(40248423-40248501)
chr8 (13-121)||(35215367-35215474)
chr8 (20-92)||(40248494-40248566)
chr8 (31-189)||(14186205-14186358)
chr8 (13-130)||(34021341-34021456)
chr8 (13-182)||(36131974-36132141)
chr8 (13-128)||(29089573-29089685)
chr8 (20-86)||(31325134-31325199)
chr8 (127-186)||(30481474-30481533)
chr8 (128-172)||(9642418-9642462)
chr8 (132-179)||(27056615-27056662)
chr8 (134-186)||(29918590-29918642)
chr8 (156-187)||(2075863-2075894)
chr8 (60-123)||(4594274-4594336)
chr8 (141-187)||(37961014-37961060)
chr8 (134-186)||(8545402-8545454)
chr8 (67-123)||(40789483-40789538)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (13-187)||(31752324-31752498)
chr4 (20-187)||(47550406-47550573)
chr4 (13-187)||(47239438-47239612)
chr4 (13-187)||(48459349-48459523)
chr4 (13-187)||(39046821-39046994)
chr4 (20-187)||(32585363-32585531)
chr4 (20-187)||(6382325-6382493)
chr4 (20-187)||(5902667-5902834)
chr4 (20-187)||(7608845-7609012)
chr4 (13-158)||(42774629-42774774)
chr4 (19-187)||(21423735-21423903)
chr4 (20-187)||(31918611-31918779)
chr4 (20-187)||(44317409-44317577)
chr4 (20-187)||(43893103-43893270)
chr4 (20-187)||(11122922-11123089)
chr4 (13-187)||(19534324-19534497)
chr4 (20-187)||(11027947-11028115)
chr4 (13-187)||(6482088-6482262)
chr4 (13-187)||(26564700-26564873)
chr4 (13-187)||(1724363-1724536)
chr4 (13-187)||(42299659-42299832)
chr4 (50-187)||(55826676-55826814)
chr4 (13-187)||(37348992-37349165)
chr4 (13-138)||(425692-425816)
chr4 (13-172)||(7985189-7985348)
chr4 (13-167)||(4766389-4766540)
chr4 (20-189)||(12825512-12825680)
chr4 (25-108)||(15987372-15987455)
chr4 (24-187)||(28695195-28695357)
chr4 (13-177)||(13770518-13770681)
chr4 (13-187)||(32596237-32596410)
chr4 (13-189)||(39188384-39188557)
chr4 (13-187)||(37107280-37107453)
chr4 (50-168)||(13015323-13015446)
chr4 (13-92)||(53906429-53906508)
chr4 (13-121)||(9230152-9230262)
chr4 (109-187)||(53906358-53906436)
chr4 (132-185)||(10302071-10302124)
chr4 (128-187)||(15987315-15987374)
chr4 (24-114)||(29755456-29755545)
chr4 (25-140)||(39375160-39375272)
chr4 (51-123)||(18423474-18423545)
chr4 (134-186)||(33516126-33516178)
chr4 (88-123)||(16216793-16216828)
chr4 (13-55)||(13015557-13015599)
chr4 (128-169)||(43309468-43309509)
chr4 (134-186)||(42907875-42907927)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (21-187)||(7314700-7314866)
chr2 (13-187)||(12193879-12194053)
chr2 (20-187)||(13705413-13705580)
chr2 (20-189)||(10920515-10920684)
chr2 (13-187)||(45256686-45256860)
chr2 (20-187)||(8915989-8916156)
chr2 (20-187)||(24414184-24414351)
chr2 (13-187)||(37106562-37106729)
chr2 (20-187)||(37999353-37999520)
chr2 (20-187)||(13830606-13830773)
chr2 (13-187)||(36128158-36128333)
chr2 (20-189)||(10208480-10208649)
chr2 (20-187)||(30846815-30846983)
chr2 (20-187)||(42798040-42798208)
chr2 (20-187)||(9632256-9632423)
chr2 (20-187)||(45115428-45115595)
chr2 (20-187)||(6027941-6028108)
chr2 (13-148)||(18106181-18106316)
chr2 (13-187)||(31942238-31942411)
chr2 (13-114)||(37472854-37472955)
chr2 (13-187)||(44746161-44746335)
chr2 (13-187)||(14540649-14540818)
chr2 (13-187)||(19104893-19105066)
chr2 (13-127)||(16226839-16226952)
chr2 (20-83)||(16105488-16105551)
chr2 (128-179)||(22900772-22900823)
chr2 (131-179)||(15546725-15546773)
chr2 (13-70)||(37319805-37319862)
chr2 (42-121)||(30978795-30978873)
chr2 (60-123)||(38342657-38342719)
chr2 (42-123)||(4427794-4427874)
chr2 (61-105)||(17598816-17598859)
chr2 (51-123)||(26755631-26755703)
chr2 (134-186)||(30696908-30696960)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (13-187)||(18354132-18354306)
chr1 (13-187)||(45866237-45866411)
chr1 (13-187)||(17092011-17092185)
chr1 (13-186)||(40087516-40087689)
chr1 (13-187)||(17134810-17134984)
chr1 (21-187)||(24236813-24236979)
chr1 (13-187)||(50426713-50426881)
chr1 (13-187)||(19572564-19572737)
chr1 (13-161)||(42707908-42708056)
chr1 (20-187)||(36187272-36187439)
chr1 (20-187)||(42439722-42439889)
chr1 (13-187)||(23966735-23966910)
chr1 (20-187)||(29936286-29936453)
chr1 (13-167)||(39616166-39616320)
chr1 (13-183)||(3628041-3628213)
chr1 (13-166)||(5180908-5181061)
chr1 (20-187)||(28297803-28297971)
chr1 (20-187)||(34610943-34611110)
chr1 (20-187)||(49250825-49250992)
chr1 (20-187)||(51421728-51421895)
chr1 (13-187)||(34060077-34060245)
chr1 (27-187)||(16408823-16408979)
chr1 (13-187)||(29871337-29871510)
chr1 (28-167)||(24710736-24710875)
chr1 (13-187)||(9982942-9983115)
chr1 (20-166)||(20774502-20774649)
chr1 (13-187)||(44615527-44615701)
chr1 (13-187)||(44792868-44793042)
chr1 (13-187)||(12494874-12495047)
chr1 (13-187)||(49741059-49741232)
chr1 (94-187)||(13390357-13390450)
chr1 (24-187)||(34673334-34673496)
chr1 (13-189)||(16433217-16433386)
chr1 (13-145)||(35936911-35937042)
chr1 (21-110)||(13020559-13020648)
chr1 (84-187)||(23490823-23490926)
chr1 (7-125)||(44632250-44632367)
chr1 (60-186)||(2514678-2514804)
chr1 (128-185)||(34085213-34085270)
chr1 (13-56)||(13390312-13390355)
chr1 (135-186)||(16903508-16903559)
chr1 (63-128)||(24159994-24160058)
chr1 (67-123)||(12718904-12718959)
chr1 (60-128)||(36616797-36616864)
chr1 (60-124)||(38733902-38733965)
chr1 (14-104)||(8679669-8679758)
chr1 (135-185)||(10778621-10778671)
chr1 (28-78)||(23493497-23493547)
chr1 (157-186)||(23058473-23058502)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (13-190)||(35311685-35311861)
chr5 (13-189)||(17853343-17853518)
chr5 (13-187)||(4582981-4583155)
chr5 (20-189)||(42987530-42987699)
chr5 (13-187)||(28045517-28045691)
chr5 (13-187)||(3564780-3564954)
chr5 (13-187)||(1218619-1218791)
chr5 (20-187)||(4920695-4920862)
chr5 (13-187)||(12834627-12834802)
chr5 (20-187)||(22694954-22695121)
chr5 (13-187)||(29246004-29246178)
chr5 (13-187)||(12866604-12866779)
chr5 (20-187)||(40517675-40517842)
chr5 (13-187)||(15890069-15890242)
chr5 (13-187)||(6155971-6156145)
chr5 (30-187)||(6092571-6092728)
chr5 (20-187)||(5908741-5908908)
chr5 (20-187)||(30996466-30996632)
chr5 (13-183)||(13402061-13402229)
chr5 (21-187)||(6369566-6369732)
chr5 (13-178)||(27088414-27088577)
chr5 (13-188)||(27302787-27302959)
chr5 (7-149)||(20973576-20973718)
chr5 (13-187)||(12447244-12447417)
chr5 (13-170)||(3573087-3573243)
chr5 (13-187)||(2985010-2985183)
chr5 (24-190)||(38006519-38006684)
chr5 (13-187)||(30115346-30115519)
chr5 (13-187)||(35194042-35194215)
chr5 (13-190)||(8453423-8453598)
chr5 (13-153)||(33862271-33862409)
chr5 (13-187)||(2412779-2412952)
chr5 (20-92)||(10126977-10127049)
chr5 (21-187)||(18206888-18207054)
chr5 (128-187)||(10127058-10127117)
chr5 (22-129)||(42717742-42717849)
chr5 (71-183)||(33420388-33420498)
chr5 (52-123)||(2681096-2681166)
chr5 (42-123)||(20634050-20634130)
chr5 (42-123)||(20650164-20650244)
chr5 (88-152)||(15564573-15564637)
chr5 (60-123)||(34259148-34259210)
chr5 (157-187)||(20973549-20973579)
chr5 (13-70)||(15564517-15564574)
chr5 (157-186)||(28569075-28569104)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (13-187)||(17885332-17885506)
chr7 (13-171)||(37182142-37182300)
chr7 (20-187)||(38139844-38140012)
chr7 (13-187)||(44734409-44734583)
chr7 (20-187)||(7779882-7780049)
chr7 (20-187)||(16866043-16866210)
chr7 (20-187)||(30650505-30650672)
chr7 (20-187)||(37196050-37196217)
chr7 (20-187)||(45885817-45885984)
chr7 (21-189)||(25979967-25980135)
chr7 (20-187)||(45379980-45380148)
chr7 (13-187)||(39316862-39317036)
chr7 (13-183)||(41741506-41741675)
chr7 (20-182)||(44794084-44794246)
chr7 (20-189)||(17851728-17851897)
chr7 (13-158)||(44985981-44986124)
chr7 (13-187)||(12980244-12980418)
chr7 (20-187)||(18125280-18125447)
chr7 (20-187)||(21702533-21702700)
chr7 (20-187)||(35074343-35074511)
chr7 (13-187)||(43507300-43507486)
chr7 (24-187)||(3920417-3920579)
chr7 (20-167)||(24753050-24753196)
chr7 (21-187)||(41103528-41103697)
chr7 (13-187)||(39456067-39456239)
chr7 (49-187)||(44658501-44658639)
chr7 (28-176)||(25905510-25905659)
chr7 (13-187)||(18825924-18826097)
chr7 (13-187)||(37579130-37579303)
chr7 (20-187)||(38152776-38152928)
chr7 (51-187)||(16811635-16811770)
chr7 (77-186)||(3226999-3227108)
chr7 (24-185)||(27850380-27850540)
chr7 (20-187)||(45708917-45709081)
chr7 (13-187)||(2630625-2630799)
chr7 (13-187)||(5376953-5377126)
chr7 (20-185)||(46127237-46127398)
chr7 (109-187)||(10072429-10072507)
chr7 (13-187)||(24425249-24425421)
chr7 (28-187)||(26622834-26622992)
chr7 (13-187)||(16078881-16079054)
chr7 (13-177)||(23328477-23328641)
chr7 (20-187)||(25782959-25783125)
chr7 (35-187)||(26004526-26004675)
chr7 (13-86)||(3227696-3227769)
chr7 (14-92)||(10072357-10072436)
chr7 (13-86)||(26004673-26004746)
chr7 (128-185)||(8906643-8906700)
chr7 (47-123)||(21750665-21750740)
chr7 (132-185)||(5565361-5565414)
chr7 (139-179)||(10995894-10995934)
chr7 (128-174)||(27896540-27896586)
chr7 (139-185)||(33841071-33841117)
chr7 (108-153)||(3274765-3274810)
chr7 (51-123)||(18683857-18683928)
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (21-187)||(20086879-20087044)
chr3 (13-187)||(22535893-22536067)
chr3 (13-186)||(29842170-29842343)
chr3 (13-186)||(48390870-48391042)
chr3 (13-187)||(34025816-34025990)
chr3 (19-187)||(44639143-44639310)
chr3 (20-187)||(39728540-39728707)
chr3 (20-187)||(44172495-44172662)
chr3 (20-187)||(44179195-44179362)
chr3 (20-187)||(44252616-44252783)
chr3 (13-183)||(43582440-43582609)
chr3 (22-187)||(17146202-17146367)
chr3 (21-187)||(23580698-23580863)
chr3 (13-186)||(34154280-34154449)
chr3 (20-187)||(49579933-49580100)
chr3 (13-187)||(6738446-6738620)
chr3 (20-189)||(44106842-44107011)
chr3 (13-173)||(10823759-10823919)
chr3 (20-187)||(52198023-52198191)
chr3 (20-187)||(29284205-29284372)
chr3 (20-187)||(39655325-39655492)
chr3 (20-187)||(44953487-44953654)
chr3 (20-187)||(7469830-7469997)
chr3 (20-187)||(52572478-52572645)
chr3 (20-171)||(49025550-49025701)
chr3 (13-176)||(30682684-30682846)
chr3 (13-187)||(4557357-4557530)
chr3 (13-187)||(34119521-34119692)
chr3 (13-187)||(53631767-53631940)
chr3 (60-187)||(23154116-23154242)
chr3 (24-187)||(42758248-42758410)
chr3 (7-125)||(48306650-48306768)
chr3 (24-187)||(54317018-54317180)
chr3 (13-187)||(4016096-4016269)
chr3 (13-187)||(31126847-31127020)
chr3 (13-187)||(19111598-19111770)
chr3 (20-142)||(23547069-23547191)
chr3 (13-181)||(830872-831039)
chr3 (20-152)||(41937089-41937220)
chr3 (120-187)||(48305693-48305760)
chr3 (98-153)||(23910330-23910385)
chr3 (126-187)||(23546994-23547055)
chr3 (128-176)||(30616344-30616392)
chr3 (13-128)||(14208264-14208377)
chr3 (88-123)||(1772538-1772573)
chr3 (132-178)||(10043343-10043389)
chr3 (140-186)||(30904868-30904914)
chr3 (42-123)||(23330033-23330113)
chr3 (13-74)||(55225249-55225310)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (20-187)||(10142570-10142737)
chr6 (20-187)||(12141254-12141421)
chr6 (20-187)||(32853713-32853880)
chr6 (22-187)||(24225569-24225734)
chr6 (20-187)||(5863435-5863602)
chr6 (20-187)||(10188125-10188292)
chr6 (13-187)||(27534546-27534720)
chr6 (20-187)||(2367195-2367362)
chr6 (20-187)||(3483975-3484142)
chr6 (43-190)||(27738664-27738811)
chr6 (13-174)||(14032419-14032579)
chr6 (13-187)||(12309441-12309608)
chr6 (13-187)||(12678146-12678318)
chr6 (13-187)||(24602908-24603081)
chr6 (13-183)||(14505949-14506118)
chr6 (63-187)||(32053000-32053124)
chr6 (13-187)||(7393939-7394112)
chr6 (13-186)||(14254821-14254993)
chr6 (13-187)||(30816120-30816296)
chr6 (109-187)||(32532498-32532576)
chr6 (47-187)||(11762342-11762481)
chr6 (13-92)||(32532426-32532505)
chr6 (13-118)||(14245110-14245214)
chr6 (13-118)||(14410954-14411058)
chr6 (21-82)||(32052927-32052988)
chr6 (126-186)||(20349039-20349099)
chr6 (136-187)||(15498309-15498360)
chr6 (88-123)||(9458234-9458269)
chr6 (148-187)||(14410907-14410946)
chr6 (157-186)||(28079749-28079778)
chr6 (134-186)||(256545-256597)
chr6 (126-186)||(34346058-34346118)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (13-168)||(4119-4275)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
scaffold0519 (13-187)||(10163-10333)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (13-187)||(14638-14811)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (20-186)||(197380-197545)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (13-187)||(33256-33429)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (13-153)||(6269-6408)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (20-187)||(90467-90633)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (13-127)||(32642-32755)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (13-121)||(36018-36128)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (13-175)||(33446-33611)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (13-84)||(14299-14370)
scaffold0014 (108-140)||(14268-14300)
[»] scaffold1630 (1 HSPs)
scaffold1630 (20-73)||(1492-1545)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (52-123)||(16847-16917)
[»] scaffold0902 (1 HSPs)
scaffold0902 (13-102)||(748-836)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 45235927 - 45236101
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45235927 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 45236026  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45236027 ataacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatggatatgggttcggggtgggtacctatata 45236101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 27932282 - 27932449
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27932282 tcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat 27932381  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27932382 atcaacataaaataattttttacatttgggacggatatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 27932449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29109048 - 29108874
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  29109048 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataat 29108949  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29108948 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacatatata 29108874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24870242 - 24870076
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24870242 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttt-attaacatgacaattatcaaacaaattaacatgacat 24870144  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24870143 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggctcggggtgggtacctatata 24870076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 1063369 - 1063543
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1063369 aatacgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcgtttaaatatcaatggtaatttttatcaacatgacaattatcaaacaaaataac 1063468  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1063469 aagacatatcaacataaagtaattttttacacttgggatggatttgggtatgagttcggggtgggtacttatata 1063543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 32302929 - 32303097
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32302929 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 32303028  T
Q  120 atcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32303029 atcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 32303097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 17220579 - 17220748
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17220579 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 17220678  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  17220679 atgacatatcaacataaagtaatcttttacatttgggacgggtatg-----gggttcggggtgggtacctatata 17220748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 24927819 - 24927985
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 120  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24927819 cactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacata 24927918  T
Q  121 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24927919 tccacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 24927985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 183
Target Start/End: Original strand, 34776945 - 34777098
Alignment:
Q  30 atttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataa 129  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34776945 atttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataa 34777044  T
Q  130 aataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34777045 aataattttttacatttgggatggatttgggtatgggttcggggtgggtaccta 34777098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11255230 - 11255060
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |   | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11255230 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatgac---ggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaaaataac 11255134  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11255133 at-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatata 11255060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2076053 - 2075907
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2076053 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 2075954  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatggg 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2075953 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatggg 2075907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4230938 - 4230791
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  4230938 tcacttttacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataatgt 4230839  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4230838 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggt 4230791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39445793 - 39445630
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39445793 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgatcatt-aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 39445695  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    |||||||||| ||        |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39445694 atgacatatctac--------attttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctata 39445630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28977340 - 28977185
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28977340 aataagttcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 28977241  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggtt 168  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  28977240 ataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtgtgggtt 28977185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 1012480 - 1012655
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||    |||||||||||||||||||    
T  1012480 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtacttttta-taacacagcaattatcaaacaaaataac 1012578  T
Q  113 atgacatatcaacataaaata--attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1012579 atggcatatcaacataaagtagttttttttgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 1012655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 20399461 - 20399628
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatc-aaacaaaataacatgaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||  ||| |||||||||||  |    
T  20399461 tcactttaacatttgttagaccgattgatttggttggtcctttaaatatcaatgctagtttttat-aacacgacaattatataaaaaaaataacatggta 20399559  T
Q  119 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20399560 tatcaacataaaataattttttgcattcgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtatctatata 20399628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43113845 - 43113678
Alignment:
Q  19 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||| |||    
T  43113845 ttcactttaacatttgttataccgattgatttagttgctccttcaaatatcaatgatagtttttat-aacacgacaattatctaacaaaataacataaca 43113747  T
Q  119 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| || || |||| | |||| | ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43113746 tatcaacatgaagtagttttctgcattcgagacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatata 43113678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 34139310 - 34139483
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  34139310 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttgtttactcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataac 34139408  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||   |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34139409 atggtctatcaacataaagtaatttttttgcattcgggacgggtttgggtat-ggttcggggtgggtacctatata 34139483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 17469118 - 17469291
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||    
T  17469118 aatatgttcactttaaaattttttagacccattgatttagtttctcctttaaatatcaatggtagcttttat-aacaaggcaattatcaaacaaaataac 17469216  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||||||||| || |||| | || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17469217 atggcatatcaacataaagtagttttctgcagttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatata 17469291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 24568802 - 24568974
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||    |||||||||||||||||||    
T  24568802 aatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagttttta-taacacatcaattatcaaacaaaataac 24568900  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
     ||||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24568901 -tgacatatcaacataaagtagttttctccattcgggacggatttgagtatgggttcggggtggatacctatata 24568974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40248501 - 40248423
Alignment:
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40248501 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatatgggtatgggttcgggatgggtacctatata 40248423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Original strand, 35215367 - 35215474
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  35215367 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctccattaaatatcaagggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataac 35215465  T
Q  113 atgacatat 121  Q
    ||| |||||    
T  35215466 atggcatat 35215474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 40248566 - 40248494
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatga 92  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40248566 tcactttaacatttgttagactgaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatga 40248494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 14186205 - 14186358
Alignment:
Q  31 tttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaa 130  Q
    ||||||||||  | ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||     |||| ||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14186205 tttgttagaccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagttt-----aacacgactgttatcaaacaaaataacatggcatattaacataaa 14186299  T
Q  131 ataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
     ||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14186300 ttaattttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcagggtgagtacctatatatc 14186358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Original strand, 34021341 - 34021456
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   | |||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  34021341 aatatgctcactttaacatttgttagattaattgatttcgttgctcctttaaatatcaatagtagttttta-tataatgacaattatcaaacaaaataac 34021439  T
Q  113 atgacatatcaacataaa 130  Q
    || |||||||||||||||    
T  34021440 at-acatatcaacataaa 34021456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36132141 - 36131974
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| || | ||||| ||| |  ||||||| | |||| || ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||    
T  36132141 aatatgctcattttaacatttgtttgaccgattaatttaattgcttctttaaattttaatggtaatttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataac 36132043  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacct 182  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||    
T  36132042 atgacatat-aacataaaataactttctgcattcgggacggatttgtgtatgagttcggggtggatacct 36131974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 29089573 - 29089685
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  | | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  29089573 aatatgtttactttaa-atttgttagacccattaatttagttgctcctttaaatatcaatgatag-ttttaataacacaataattatcaaacaaaataac 29089670  T
Q  113 atgacatatcaacata 128  Q
    || ||||| |||||||    
T  29089671 at-acataccaacata 29089685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Original strand, 31325134 - 31325199
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta 86  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31325134 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatc-tttaaatatcaatggtagtttttatta 31325199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30481533 - 30481474
Alignment:
Q  127 taaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30481533 taaattaattttttacattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatat 30481474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9642462 - 9642418
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9642462 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggg 9642418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27056662 - 27056615
Alignment:
Q  132 taattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggta 179  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  27056662 taattttttacatttgggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggta 27056615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Original strand, 29918590 - 29918642
Alignment:
Q  134 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||    
T  29918590 attttttacatttgggacgggtttgtgtatggtttcggggtgggtacatatat 29918642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 187
Target Start/End: Original strand, 2075863 - 2075894
Alignment:
Q  156 atgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2075863 atgggtatgggttcggggtgggtacctatata 2075894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4594336 - 4594274
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4594336 tttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 4594274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37961060 - 37961014
Alignment:
Q  141 acatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  37961060 acatttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgtgtacctatata 37961014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8545454 - 8545402
Alignment:
Q  134 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8545454 attttctacatttgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtatctatat 8545402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Original strand, 40789483 - 40789538
Alignment:
Q  67 atcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40789483 atcaatgaaagttcttat-atcatgatagttatcaaaccaaataacatgacatatca 40789538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 31752324 - 31752498
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31752324 aatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcattgttagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 31752423  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31752424 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggaacctatata 31752498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47550573 - 47550406
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47550573 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 47550474  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47550473 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 47550406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47239612 - 47239438
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47239612 aatatgctcactttaacatttgataaatgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 47239513  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  47239512 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtatgggtatgggttcagggtgggaacctatata 47239438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 48459349 - 48459523
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48459349 aatatgctcactttaacattttttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 48459448  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48459449 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 48459523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 39046821 - 39046994
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39046821 aatatgctcattttaacatttgttagacggaatgatttagttaatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 39046920  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39046921 at-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggagtgggtacctatata 39046994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 32585363 - 32585531
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgat-agtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32585363 tcactttaacaattgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgattagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagaca 32585462  T
Q  119 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32585463 tataaacataaagtaagtttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatata 32585531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6382493 - 6382325
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6382493 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 6382394  T
Q  120 atcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6382393 atcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 6382325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5902834 - 5902667
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  5902834 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataagataacat 5902735  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5902734 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 5902667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 7608845 - 7609012
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7608845 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatgacagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 7608944  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608945 atcaacatagagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 7609012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Original strand, 42774629 - 42774774
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42774629 aatatgttcattttaacatttgttagaaggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 42774728  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatg 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42774729 atgacatatcaacataaagtaattttttacattttggacgggtatg 42774774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 21423735 - 21423903
Alignment:
Q  19 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 118  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  21423735 ttcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataaca 21423834  T
Q  119 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21423835 tatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgtgtatgggtttggggtgggtacctatata 21423903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31918779 - 31918611
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31918779 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 31918680  T
Q  120 atcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31918679 atcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtaactatata 31918611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 44317409 - 44317577
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44317409 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatcgtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 44317508  T
Q  120 atcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44317509 atcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 44317577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 43893103 - 43893270
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43893103 tcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 43893202  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  43893203 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgaattcggggtggatacctatata 43893270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11123089 - 11122922
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||    
T  11123089 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtactttttattaacatgacaattataaaacaaaataacaaaacat 11122990  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11122989 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatata 11122922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 19534324 - 19534497
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  19534324 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttagatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 19534422  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19534423 atgacatatcaacataaaataattttctacattcgtgacgggtttgggtatgagttcgaggtgggtacctatata 19534497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 11027947 - 11028115
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11027947 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatataaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 11028046  T
Q  120 atcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11028047 atcaatataaagtaatttttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatata 11028115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6482262 - 6482088
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  6482262 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgttagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataac 6482164  T
Q  113 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6482163 atggcatatcaatataaattagtttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatata 6482088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 26564700 - 26564873
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||| ||||    
T  26564700 aatatgttcactttaacatttgtttgaccgattgatttagttgttccgttaaatatcaatgatagtttttat-aacacggcagttatcaaacaaactaac 26564798  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26564799 atgacatatcaacataaagtagttttctgcatttgggacgggtttgggtatggtttcggggtgggtacctatata 26564873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1724536 - 1724363
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||    ||||||| |||||||||||    
T  1724536 aatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatctaacaaaataac 1724438  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1724437 atgacatatcaacataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 1724363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 42299659 - 42299832
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  42299659 aatatgttcactttaacatttgttagagaggatgatttagttgctcatttaaatatcaacagtagtttttattaacaagacaattatcaaacaaaataac 42299758  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  42299759 atggcatatcaacataaagt-actttttatatttgggacgtgtttgagtatgggttcagggtgggtacctatata 42299832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 55826814 - 55826676
Alignment:
Q  50 tagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgg 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  55826814 tagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacgtgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgg 55826715  T
Q  149 gacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55826714 gacgggtttggatatgggttcggggtgggtacctatata 55826676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 37348992 - 37349165
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||| | |||||||||| |||  || |||||||||||||||||||    
T  37348992 aatatgctcactttaagatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaacggtagtttttat-aacgcgagaattatcaaacaaaataac 37349090  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37349091 atggcatatcaacataaaataattttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtggatacctatata 37349165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 425692 - 425816
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  425692 aatatgttcactttaagatttgttagaccgattgatttagttgttcttttaaatatcaatggtagttttta-taacatgacaattatcaaacaaaataac 425790  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataatttt 138  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||    
T  425791 atggcatatcaacataaagtaatttt 425816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 7985348 - 7985189
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||    
T  7985348 aatattttcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcatttaaatatcaacggtagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataac 7985249  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  7985248 atgacttatcaacataaaatacttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggg 7985189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4766540 - 4766389
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagt-ttttattaacatgataattatcaaacaaaataa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4766540 aatatgtttactttaacatttgttagaggtaatgatttagtttatcctttaaatatcaatgatagttttttattaacatgacaattatcaaataaaataa 4766441  T
Q  112 catgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 167  Q
    ||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||| |||| || |||||    
T  4766440 cataacatatcaacataaagta----tttacatttgggacgggtatgagtttgggt 4766389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12825680 - 12825512
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12825680 tcactttaatatttattagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaattttagtttttat-aacacgataattatcaaacaaaataacatgatat 12825582  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    ||||||||||| ||||||| | || | ||||| | | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  12825581 atcaacataaagtaattttctgcactcgggacaggtttgggtataggttcagggtgggtacgtatatatc 12825512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15987455 - 15987372
Alignment:
Q  25 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15987455 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaa 15987372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28695357 - 28695195
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  28695357 tttaacatttgttaaaccgaatgatttagttgctcctttaaatattaatgatagttttta-taacgtgacaattatcaaataaaataacattgcatatca 28695259  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||  |||||  || ||||| ||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28695258 acataaagcaatttcctatatttgagacgagtttgggtatgagttcggggtgagtacctatata 28695195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13770681 - 13770518
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || || |||||| |||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  13770681 aatatgttcactttaacatttgtttgaccgattgatttagttgctccttcaaatattaatggtcgtttttat-aacacggtaattatcaaacaaaataac 13770583  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtggg 177  Q
    ||| | ||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  13770582 atggcttattaacataaaatagttttatgcattcgggacgggtttgagtatgagttcggggtggg 13770518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32596410 - 32596237
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  32596410 aatatgctcactttaaaatttgttagacttaatgatttagttgttccttcaaatattaatgctagtttttat-aacatgacaattatcaaaccaaatgac 32596312  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||| | |||   | |||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  32596311 atggtatatcaacataaaataattttctacattcgagacaagtttgggtatgagtttgaggtggggacctatata 32596237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 39188384 - 39188557
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||    
T  39188384 aatatgttcactttaacatttgttagaacgattgatttagttttttctttaaatataaatggtagttttt--taacacgacagttatcaaacaaaataac 39188481  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |  | |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39188482 atgacatatcaacataaaacaattttatgcattcgggatgagtttggacatgggtttggggt-ggtacctatatatc 39188557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 37107280 - 37107453
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  37107280 aatatgctcattttaatatttgtcagaccgattgatttagttgcttctttaaataccaatggtagtttttat-aacatggcaattatcaaacaaaataac 37107378  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||    | | |||||   |||||||||||||||||||||    
T  37107379 atgacatatcaacataaagtaattttctgcattcgggatatattttggtataaattcggggtgggtacctatata 37107453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13015446 - 13015323
Alignment:
Q  50 tagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta-----acatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 144  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||| |     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015446 tagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacatgaaaatgaaaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 13015347  T
Q  145 ttgggacggttatgggtatgggtt 168  Q
    | | ||||| | || |||||||||    
T  13015346 tcgagacgggtttgagtatgggtt 13015323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 53906508 - 53906429
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatga 92  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53906508 aatacgttcactttaacatttgttagaaggaatgatttagttgatccattaaatatcaatagtagtttttattaacatga 53906429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Original strand, 9230152 - 9230262
Alignment:
Q  13 aatatgttcacttt-aacatttgttagacggaatgatttagttgatct--tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  9230152 aatatgttcacttttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacagttatcaaacaaaat 9230250  T
Q  110 aacatgacatat 121  Q
    ||||||||||||    
T  9230251 aacatgacatat 9230262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 53906436 - 53906358
Alignment:
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  53906436 taacatgacatatcaacatgaagtaattttttacatttgggacgagtttagatatgggttcggggtgggtacctatata 53906358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 185
Target Start/End: Original strand, 10302071 - 10302124
Alignment:
Q  132 taattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10302071 taattttttacatttgggacggatatgggtatgggttcggggtgggtacatata 10302124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15987374 - 15987315
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15987374 aaaataattttttatatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatata 15987315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 29755545 - 29755456
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacat 114  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||  |  |||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29755545 tttaacatttgttagatcgattgatttagttacttctttaaatatcaatggtagtgttta-taacacggtaattatcaaacaaaataacat 29755456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 140
Target Start/End: Original strand, 39375160 - 39375272
Alignment:
Q  25 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 124  Q
    |||||||||||| ||  || | ||||||||| || ||||||||| | || |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39375160 ttaacatttgttcgattgatttatttagttgttcctttaaatattagtggtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataacatgac--atcaa 39375256  T
Q  125 cataaaataatttttt 140  Q
    | |||| |||||||||    
T  39375257 cgtaaagtaatttttt 39375272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 123
Target Start/End: Original strand, 18423474 - 18423545
Alignment:
Q  51 agttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18423474 agttgctcctttaactatcaatgaaagtttttat-atcaagatagttatcaaaccaaataacatgacatatca 18423545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33516178 - 33516126
Alignment:
Q  134 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33516178 attttttacatttgagacgggtttgggtataggttcggggtgggtacttatat 33516126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16216828 - 16216793
Alignment:
Q  88 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16216828 catgataattatcaaaccaaataacatgacatatca 16216793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 13015599 - 13015557
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg 55  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13015599 aatatgttcactttaacatctgttagaccgaataatttagttg 13015557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Original strand, 43309468 - 43309509
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttc 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  43309468 aaaataattttttacatttgagacaggtatgggtatgggttc 43309509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Original strand, 42907875 - 42907927
Alignment:
Q  134 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||| |||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42907875 attttctacattcgggacgagtttgggtatgggctcggggtgggtacctatat 42907927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7314866 - 7314700
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7314866 cactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgatatttatcaaacaaaataacatgacata 7314767  T
Q  121 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7314766 tcaacataaaataattttttacatttgggacgggtgtgggtatgggttcggggtgggaacctatata 7314700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12194053 - 12193879
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12194053 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatgtagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 12193954  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||    
T  12193953 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatggatatggattcgaggtgggtatctatata 12193879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13705580 - 13705413
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13705580 tcactttaacatttgttatacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat 13705481  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13705480 atcaacataaagtaatttttcacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatata 13705413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 10920515 - 10920684
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10920515 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 10920614  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10920615 atcaacataaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtggatacctatatatc 10920684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 45256686 - 45256860
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45256686 aatacgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 45256785  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45256786 aagacatatcaaaataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacttatata 45256860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8916156 - 8915989
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8916156 tcactttcacatttgttagacaaaataatttagttaatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 8916057  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8916056 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatata 8915989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24414351 - 24414184
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24414351 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 24414252  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24414251 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 24414184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 37106562 - 37106729
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37106562 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 37106661  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37106662 at-atatatcaacataaagtaattttttacatttgggac------gggtatgggttcggagtgggtacctatata 37106729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 37999353 - 37999520
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37999353 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgattctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 37999452  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37999453 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacttatata 37999520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 13830606 - 13830773
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13830606 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttatttacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 13830705  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13830706 atcaacataaagtaattttttacatttgggacaggtttgagtatgggttcggggtgggtacttatata 13830773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36128333 - 36128158
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36128333 aataagttcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 36128234  T
Q  113 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36128233 ataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatata 36128158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10208649 - 10208480
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10208649 tcactttcacatttgtaagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 10208550  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10208549 attaacataaagtaattttttacatttgggactggtttgagtatgggttcggggtaggtacctatatatc 10208480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 30846815 - 30846983
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30846815 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 30846914  T
Q  120 atcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30846915 atcaacataaagtagtttttttacaattgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 30846983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42798208 - 42798040
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42798208 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 42798109  T
Q  120 atcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42798108 atcaacataaagtaatttttttacatttgggacaggtttgtgtatgggttcggggtgggtacttatata 42798040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 9632256 - 9632423
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  9632256 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaataacataacat 9632355  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9632356 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatata 9632423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 45115428 - 45115595
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45115428 tcactttaacatttattagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat 45115527  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45115528 atcaacataatgtaattttttacatttgggatgggtttaactatgggttcgggatgggtacctatata 45115595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6028108 - 6027941
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| | |    
T  6028108 tcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggctt 6028009  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6028008 atcaacataaaatacttttctgcattcaggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 6027941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18106316 - 18106181
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18106316 aataagttcactttcacatttgttagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 18106217  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgg 148  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106216 ataatgtatcaacataaaataattttttacatttgg 18106181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31942411 - 31942238
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  31942411 aatatgttcactttaacatttgttagaccgactgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataac 31942313  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| ||||||| |||||| || |||| | |||||| ||| | | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31942312 atggcatatcagcataaagtagttttctgcatttgtgacaggtttggttatgggtttggggtgggtacttatata 31942238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 37472955 - 37472854
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37472955 aatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 37472856  T
Q  113 at 114  Q
    ||    
T  37472855 at 37472854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44746335 - 44746161
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||| ||||||||    
T  44746335 aatatgctcactctaacatttgttagacggaataatttatttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataaccattacaatgatcaaataaaataac 44746236  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| ||| |  |||||||| ||||||    
T  44746235 atggcatatcaagataaagtgattttctacatttgggacgggtttgagtatgagtttgaagtgggtacatatata 44746161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 14540649 - 14540818
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||     |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  14540649 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttaaatatcg----tagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 14540743  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| | || |||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  14540744 atgacatatcaacataaagtaattttctacgttcgggacggatttgagtatggattccgagtgggtgcctatata 14540818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19105066 - 19104893
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  19105066 aatatgctcactttaacatttgttagaccgatcgatttagttgctcttttaaatatcgatagtagtttttat-aacacggcaattattaaacaaaataac 19104968  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||| | |||| ||||||| | || |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  19104967 atgacacgtcaacataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgagtatggattcgaggtggatacctatata 19104893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16226952 - 16226839
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||    
T  16226952 aatatattcactttaacatttcttagaccaattgatttagttgctaatttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaataaaataac 16226854  T
Q  113 atgacatatcaacat 127  Q
    |||||| ||||||||    
T  16226853 atgacaaatcaacat 16226839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Original strand, 16105488 - 16105551
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagttttta 83  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  16105488 tcactttaacatttgttagacataatgatttagttgatctgtgaaatatcaatggtaattttta 16105551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Original strand, 22900772 - 22900823
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggta 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22900772 aaaataattttttacgtttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggta 22900823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Original strand, 15546725 - 15546773
Alignment:
Q  131 ataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggta 179  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  15546725 ataattttttacatttgggaagggtatgggtatgggttcagggtgggta 15546773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 37319805 - 37319862
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatca 70  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||    
T  37319805 aatatgttcattttaacatttgttagaccgattgatttagttgctactttaaatatca 37319862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 121
Target Start/End: Original strand, 30978795 - 30978873
Alignment:
Q  42 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatat 121  Q
    |||| ||| ||||| || ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30978795 gaataattcagttgctcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 30978873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 38342719 - 38342657
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38342719 tttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 38342657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 4427794 - 4427874
Alignment:
Q  42 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||| ||| ||||| || |||||  |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4427794 gaataattaagttgctcctttaaccatcaatgaaagttcttat-atcatgatagttatcaaaccaaataacatgacatatca 4427874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Original strand, 17598816 - 17598859
Alignment:
Q  61 ttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaaca 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17598816 ttaaatatcaatgattgttttta-taacatgacaattatcaaaca 17598859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 123
Target Start/End: Original strand, 26755631 - 26755703
Alignment:
Q  51 agttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26755631 agttgctcctttaactatcaatgaaagttctttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatggcatatca 26755703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Original strand, 30696908 - 30696960
Alignment:
Q  134 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30696908 attttttacatttgggataggtttgggtatgagttcggggtgggtacatatat 30696960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18354306 - 18354132
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18354306 aatatgttcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 18354207  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  18354206 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtatgggtatcggttcggggtgggaacttatata 18354132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45866411 - 45866237
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45866411 aatatgttcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 45866312  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45866311 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgagtttggggtgggtacctatata 45866237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17092185 - 17092011
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17092185 aatatgttcactttaacatttattagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 17092086  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  17092085 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggcatgggttcggggtgagtgcctatata 17092011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40087689 - 40087516
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40087689 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 40087590  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40087589 atgatatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggtacctatat 40087516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 17134810 - 17134984
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17134810 aatatgttcactttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 17134909  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17134910 atgacatatcaacataaagtaattttttacatatgggacgagtatgggtatgggttcggggatggtacctatata 17134984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24236979 - 24236813
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 120  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24236979 cactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacata 24236880  T
Q  121 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24236879 tcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatata 24236813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 50426881 - 50426713
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50426881 aatatgctcactttaacatttgtaagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 50426782  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50426781 atgacatatcaacataaagtaaatttttacatttgggac------gggtatgggttcggggtgggtacctatata 50426713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19572737 - 19572564
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19572737 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaa-tatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataac 19572639  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19572638 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 19572564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42708056 - 42707908
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42708056 aatatgctcactttaacatctgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 42707957  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42707956 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggt 42707908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36187439 - 36187272
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36187439 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 36187340  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36187339 atcaacataaaataactttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatata 36187272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42439889 - 42439722
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42439889 tcactttaacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 42439790  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42439789 atcaacataaagtaattttttacatttgggatgagtttggatatgggttcggggtgggtacctatata 42439722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 23966735 - 23966910
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23966735 aatatgctcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatactttaaatatcaatagtagtttttataaacatgacaattatcaaacaaaataac 23966834  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23966835 ataacatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 23966910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 29936286 - 29936453
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  29936286 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaataacattacat 29936385  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29936386 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 29936453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 39616166 - 39616320
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39616166 aatatgctcactttaacatctgttagacggaatgatttaactgatcatttaaatatcaatggtaatttttattaacatgataattagcaaacaaaataac 39616265  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39616266 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgggt 39616320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3628213 - 3628041
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3628213 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatattaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 3628114  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataa--ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3628113 atgacatatcaacataaagtaattttttttacatttgggactggaatgagtatgggttcggggtgggtaccta 3628041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Original strand, 5180908 - 5181061
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5180908 aatatgctcactttaaaatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 5181007  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatggg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  5181008 atgacatatcaacataaaataattttttacatttggaacgggtatgggtttggg 5181061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 28297803 - 28297971
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28297803 tcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 28297902  T
Q  120 atcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28297903 atcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 28297971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 34610943 - 34611110
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  34610943 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataacat 34611042  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34611043 atcaacataaagtagtattttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatata 34611110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 49250992 - 49250825
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  49250992 tcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatcaacatgacaattatcaaacaaaatagcataacat 49250893  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  49250892 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtggatacctatata 49250825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 51421728 - 51421895
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51421728 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatagcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacat 51421827  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51421828 atcaacatagagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatata 51421895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34060245 - 34060077
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34060245 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggttgtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 34060146  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34060145 at-acatatcaacataaagtaatttttttacaattgggac------gggtatgggttcggagtgggtacctatata 34060077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 187
Target Start/End: Original strand, 16408823 - 16408979
Alignment:
Q  27 aacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaaca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  16408823 aacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat----aca 16408918  T
Q  127 taaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| | | | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16408919 taaagtaattttttacatttggagcgggtttagctatgggttcggggtcggtacctatata 16408979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29871510 - 29871337
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  29871510 aatatgctcattttaatatttgttagaccgattgatgtagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacatgggaattatcaaacaaaataac 29871412  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29871411 atgacatatcaacataaaataattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcagggtgggtacctatata 29871337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 24710736 - 24710875
Alignment:
Q  28 acatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacat 127  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24710736 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataatgtatcaacat 24710835  T
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 167  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  24710836 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggt 24710875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9983115 - 9982942
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9983115 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattaatttagttgctcctttgaatatcaatggtagttttgat-aacatgagaattatcaaacaaaataac 9983017  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| | |||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9983016 atgatatattaacataaagtaattttctgcattcgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 9982942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 20774502 - 20774649
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20774502 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaataaaagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 20774601  T
Q  120 atcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatggg 166  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20774602 atcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatggg 20774649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44615701 - 44615527
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  44615701 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataac 44615603  T
Q  113 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||| ||||| ||  ||||||  ||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44615602 atggcatatcaagataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatata 44615527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 44792868 - 44793042
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  44792868 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataac 44792966  T
Q  113 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||| ||||| ||  ||||||  ||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44792967 atggcatatcaagataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatata 44793042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 12494874 - 12495047
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  12494874 aatatgttcactttaacatttgttagaccgataaatttagttgctcctttaaatatcagtggtagtttttat-aacacgccaattataaaacaaaataac 12494972  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| ||| |||||||| | || |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12494973 atgtcatgtcaacatatagtagttttctacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtacctatata 12495047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 49741232 - 49741059
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  49741232 aatatgttcactttaacatttgttaaaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaaaataac 49741134  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || |||||| |||||||| || |||| | |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49741133 ataacatattaacataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 49741059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 187
Target Start/End: Original strand, 13390357 - 13390450
Alignment:
Q  94 aattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13390357 aattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctatata 13390450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34673496 - 34673334
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34673496 tttaacatttgttagaccggttgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 34673398  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||| || |||| | | || || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34673397 acataaagtagttttcttcgttcggaacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 34673334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16433386 - 16433217
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |     | |||||||||||||||||||    
T  16433386 aatatgctcactttaatatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataat----acaattatcaaacaaaataac 16433291  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  || | |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16433290 atgacatatcaacataaagtaattttctgcatttggggtgggtttgggtatgggttcgg---gggtacctatatatc 16433217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35937042 - 35936911
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||| |  |||||||||||||||||||    
T  35937042 aatatgctcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttgt-aacacggaaattatcaaacaaaataac 35936944  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatt 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35936943 atgacatatcaacataaagtaattttctacatt 35936911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Original strand, 13020559 - 13020648
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaata 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13020559 cactttaatatttgttagacggaatgatttagttgatactttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 13020648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23490926 - 23490823
Alignment:
Q  84 ttaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  23490926 ttaagatgacaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaattagttttttacatttgggacgggttttggtatgggttcggggtgggtaccta 23490827  T
Q  184 tata 187  Q
    ||||    
T  23490826 tata 23490823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 44632367 - 44632250
Alignment:
Q  7 tcgaagaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  44632367 tcgaacaatatgatcactttaacatttgttagacctattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacgacaattgtcaaacaa 44632269  T
Q  107 aataacatgacatatcaac 125  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  44632268 aataatatggcatatcaac 44632250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 186
Target Start/End: Original strand, 2514678 - 2514804
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat-atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||| | | |     
T  2514678 tttaaatatcaatggtagtttttatta-cacggcaattatcaaacaaaataacatgacatgttcaacataaaataattttatgcattcgggacagattta 2514776  T
Q  159 ggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||  |||||||||| || ||||||    
T  2514777 ggtatgtattcggggtggatatctatat 2514804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 185
Target Start/End: Original strand, 34085213 - 34085270
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34085213 aaaataattttttacatttaggacgagtatgggtatgggttcggggtgggtacatata 34085270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 56
Target Start/End: Original strand, 13390312 - 13390355
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttga 56  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13390312 aatatgctcactttaacatttgttagacgaaatgatttagttga 13390355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 186
Target Start/End: Original strand, 16903508 - 16903559
Alignment:
Q  135 ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16903508 ttttttacattcgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatat 16903559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24160058 - 24159994
Alignment:
Q  63 aaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacata 128  Q
    |||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24160058 aaatatcaatgacaatttttat-aatatgacaattatcaaatcaaataacatgacatatcaacata 24159994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12718959 - 12718904
Alignment:
Q  67 atcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12718959 atcaatgaaagttcttat-atcatgataattatcaaaccaaataacatgacatatca 12718904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 128
Target Start/End: Original strand, 36616797 - 36616864
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacata 128  Q
    |||||||||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36616797 tttaaatatcaacgacaatttttat-aacttgacaattatcaaaccaaataacatgacataacaacata 36616864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 124
Target Start/End: Original strand, 38733902 - 38733965
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 124  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  38733902 tttaaatatcaatgacaatttttat-aacatgacaattatcaaaccaaataacatagcatatcaa 38733965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 8679758 - 8679669
Alignment:
Q  14 atatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaac 104  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||  ||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||    
T  8679758 atatattcactttaacatttccttgactaaatgatttgattgctcctttaaatatcaatgataattttta-taacatgatgatcatcaaac 8679669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10778671 - 10778621
Alignment:
Q  135 ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  10778671 ttttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtggatatctata 10778621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23493547 - 23493497
Alignment:
Q  28 acatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagt 78  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23493547 acatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagt 23493497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 186
Target Start/End: Original strand, 23058473 - 23058502
Alignment:
Q  157 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23058473 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 23058502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 35311685 - 35311861
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35311685 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 35311784  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 190  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35311785 at-acatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggagtgggtacctatatatct 35311861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17853518 - 17853343
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17853518 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 17853419  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17853418 at-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtatctatatatc 17853343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 4582981 - 4583155
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4582981 aatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 4583080  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4583081 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggggtgggaacctatata 4583155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42987699 - 42987530
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42987699 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 42987600  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42987599 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatc 42987530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 28045517 - 28045691
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatt-aacatgataattatcaaacaaaataa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||    
T  28045517 aatatgttcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatttaacataacaattataaaacaaaataa 28045616  T
Q  112 catgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28045617 catgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-gggtgggtacctatata 28045691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3564954 - 3564780
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3564954 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 3564855  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggt-gggtacctatata 187  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  3564854 at-acatatcaacataaagtaattttttacatttggaacgggtatggatatgggttcggagtagggtacctatata 3564780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 1218619 - 1218791
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1218619 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagttttt-ttaacatgacaattatcaaacaaaataac 1218717  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1218718 at-acaaatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtacctatata 1218791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 4920695 - 4920862
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4920695 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 4920794  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4920795 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatata 4920862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12834802 - 12834627
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12834802 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaacgatttaattgatcattcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 12834703  T
Q  113 at-gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12834702 atagacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtaggtacctatata 12834627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22695121 - 22694954
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22695121 tcactttcacatttgttagacaaaatgatatagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacattacat 22695022  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22695021 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctctata 22694954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29246178 - 29246004
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29246178 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgattcattaaatatcaatggtagtgtttattaacataacaattatcaaacaaaataac 29246079  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29246078 atgacataccaacataaaataattttttacatttgggatgggtatgggtatgggtttggggtgggtacctatata 29246004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12866779 - 12866604
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12866779 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaacaatttaattgatcattcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 12866680  T
Q  113 at-gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12866679 atagacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgcggtgggtacctatata 12866604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 40517675 - 40517842
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40517675 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 40517774  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40517775 atcaacataaaataattttttacctttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtaactatata 40517842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 15890069 - 15890242
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  15890069 aatatgttcactttaacatttgttagacgtaattatttaattgatccttcaaatatcaatggtagttttcattaatatgacaattatcaaataaaataac 15890168  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15890169 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-gggtgggtacctatata 15890242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6156145 - 6155971
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6156145 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttatttgctcctttaaatatcaatgatattttttattaccatgacaattatcaaacaaaataac 6156046  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6156045 atgtcatataaacataaagtaattttcaacatttgtgacggttttgggtatgggttcggggtgggtacatatata 6155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6092728 - 6092571
Alignment:
Q  30 atttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataa 129  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6092728 atttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataa 6092629  T
Q  130 aataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6092628 agtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 6092571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5908908 - 5908741
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5908908 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 5908809  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  5908808 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgtgtacatatata 5908741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 30996466 - 30996632
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  30996466 tcactttaacatt-gttagacggaatgatttatttgatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatggcat 30996564  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30996565 atcaacttaaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtgtgtgttcggggtgggtacctatata 30996632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13402229 - 13402061
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13402229 aatatgctcattttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 13402130  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  13402129 at-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatcggt-tgggttcggagtgggtaccta 13402061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 6369566 - 6369732
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  6369566 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaacatcaacggtagttttcattaacatgataattatcaaacaaaataacacgacgca 6369665  T
Q  121 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6369666 tcaacataaagtaattttttacattttggacgggttaaagtatgggttcggggtgggtacatatata 6369732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27088577 - 27088414
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  27088577 aatatgcttactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacataacaattatcaaacaaaataac 27088479  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggt 178  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27088478 at-acatatcaacataaaataattttctacattcgagacgggtttgggtatgggttcggggtgggt 27088414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27302959 - 27302787
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |   | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27302959 aatatgatcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtacgt---agtaacatgacaattatcaaacaaaataac 27302863  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatat 188  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27302862 atgacatattaacataaagtaattttttacgtttgggacgtgtatgactatggattcggggtgggtacctatatat 27302787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20973718 - 20973576
Alignment:
Q  7 tcgaagaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    ||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20973718 tcgaacaatacgctcactttaatattttttagacggaatgatttagttgatactttacatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 20973619  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttggg 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20973618 aataccatgacatatcaacataaagtaattttttacatttggg 20973576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 12447244 - 12447417
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||  || || |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  12447244 aatatattcactttaacatttgttagatcgattgatttaactgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 12447342  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12447343 atgacatattaacataaagtagttttctatatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatata 12447417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 3573087 - 3573243
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  3573087 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttgaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacagaataac 3573185  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | || |||||||||||    
T  3573186 atgacatatcaacataaaataattttctacattcgggaggggtttgagtatgggttcg 3573243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 2985010 - 2985183
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||    
T  2985010 aatatgctcactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacaacaattatcaaataaaataac 2985108  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||| | | ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  2985109 atgacatatcaatataaaataattttctatattcgagacagatttgggtatggtttcgggatgagtacctatata 2985183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38006684 - 38006519
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||| |||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38006684 tttaacaattgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatgacatatta 38006586  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 190  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38006585 acataaattaattttcaacattcgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 38006519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 30115346 - 30115519
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| |||| | |||||||| |||| |  |||||||||||||||||||    
T  30115346 aatatgctcactttaacatttgttagactgatcgatttagttgctcctttaaatataaatggtggtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataac 30115444  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  30115445 atagcatatcaacataaaataattttatgcattcgggacgggtttgaatatgggttcgggatgggtaccaatata 30115519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35194215 - 35194042
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  35194215 aatatgttcactttaacattttttagaccaattgatttagtttattctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacagcaattatcaaacaaaataac 35194117  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||  ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35194116 atagcatattaacataaagtaattttctacattcgggacgggtttgagtatgagtttggggtgggtacctatata 35194042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8453598 - 8453423
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8453598 aatatgctcattttaacatttgtttgaccgaatgatttagttactcctttaaatatcaatggtaattttta-taacatgacaattattaaacaaaataac 8453500  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacg-gttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 190  Q
      ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||  || |||||| ||||||||||||||    
T  8453499 --gacatattaacataaactaattttctacatttgggacgagttttgagtatgactttggggtgtgtacctatatatct 8453423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33862409 - 33862271
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33862409 aatatgttcactttaacatttgttagccc-attgatttagttggtcatttaaatatcaatcgtagtttttac-aacatgacaattatcaaacaaaataac 33862312  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgg 153  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  33862311 atggcatatcaacataaaatagttttctgcattcgggacgg 33862271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2412952 - 2412779
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| | ||  | |||||||||||||||||||    
T  2412952 aatatgctcactttaatatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaattgtagtttttatga-cacaacaattatcaaacaaaataac 2412854  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | |||  ||||||  | ||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  2412853 atgacatatcaatataaagtaattttctgcatacgggacgagtttgggtattggttcaggatgggtacatatata 2412779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 92
Target Start/End: Original strand, 10126977 - 10127049
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatga 92  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10126977 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatga 10127049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 18206888 - 18207054
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataa-ttatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||| |||| |  || |||| ||||||||||||||| |||    
T  18206888 cactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattagtagtttttat-aacacggcaaattattaaacaaaataacatggcat 18206986  T
Q  120 atcaacata-aaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18206987 atcaacatagaagtaattttctacattcgggacgggtttgaatatgggttc-gggtgggtacctatata 18207054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Original strand, 10127058 - 10127117
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127058 aaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 10127117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 42717849 - 42717742
Alignment:
Q  22 actttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatc-aaacaaaataacatgacata 120  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||     
T  42717849 actttaacatttgttagaccggttgatttagtttctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacgacaattatcaaaacaaaatatcatggcatg 42717751  T
Q  121 tcaacataa 129  Q
    |||||||||    
T  42717750 tcaacataa 42717742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 33420498 - 33420388
Alignment:
Q  71 atgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcg 170  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| | |||||||||||||     
T  33420498 atgatagtttttat-aacacgacaattatcaaataaaataacatgacatatcaatataaaat-attttctacattcaagacgggtttgggtatgggttca 33420401  T
Q  171 gggtgggtaccta 183  Q
    |  ||||||||||    
T  33420400 gaatgggtaccta 33420388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 123
Target Start/End: Original strand, 2681096 - 2681166
Alignment:
Q  52 gttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2681096 gttgatcctttaactatcaatgaaagttcttattt-catgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 2681166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 20634050 - 20634130
Alignment:
Q  42 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||| |||| |||| || ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20634050 gaataatttggttgttcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 20634130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 20650164 - 20650244
Alignment:
Q  42 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||| |||| |||| || ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20650164 gaataatttggttgttcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 20650244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 152
Target Start/End: Original strand, 15564573 - 15564637
Alignment:
Q  88 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacg 152  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  15564573 catgacaattttcaaaaaaaataacatgacatatcaatgtaaagtaattttctacattcgggacg 15564637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Original strand, 34259148 - 34259210
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34259148 tttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 34259210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20973579 - 20973549
Alignment:
Q  157 tgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20973579 tgggtatgggttcggggtgggtacctatata 20973549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 15564517 - 15564574
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatca 70  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||||||||| || |||||||||||    
T  15564517 aatatgtacactttaatatttgttagagtggatgatttagttgctcatttaaatatca 15564574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28569104 - 28569075
Alignment:
Q  157 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28569104 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 28569075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 17885332 - 17885506
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17885332 aatatgttcactttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattgacatgacaattatcaaacaaaataac 17885431  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17885432 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggttggaacctatata 17885506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Original strand, 37182142 - 37182300
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37182142 aatatgttcactttaacatttgttagacacaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 37182241  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcgg 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37182242 atgacatatcaacataagataattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgg 37182300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38140012 - 38139844
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38140012 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat 38139913  T
Q  120 atcaacataaaataatt-ttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38139912 atcaatataaaataatttttttacatttgagacgggtttggttatgggttcggggtgggtacttatata 38139844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44734583 - 44734409
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44734583 aatatgctcgctttaatatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaataaaataac 44734484  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44734483 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatatgtgtatgggttcggggtgggtacctatata 44734409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 7779882 - 7780049
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7779882 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 7779981  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7779982 atcaacataaaataaatttttacatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatata 7780049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 16866043 - 16866210
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16866043 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttaatcatttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacat 16866142  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16866143 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 16866210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 30650505 - 30650672
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30650505 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacat 30650604  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30650605 atcaacataaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 30650672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37196217 - 37196050
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  37196217 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttatatatcaatggtagtttttattaacatgacagttatcaaacaaaataacataacat 37196118  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37196117 atcaacataaagtaattttttacatttatgacgggtttgggtatggattcggggtgggtagctatata 37196050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45885984 - 45885817
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45885984 tcactttcacatttgttagacaaaatgattaagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacat 45885885  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45885884 atcaacataaagtaattttttacatttgggacggattttggtatgggttcggggtgggtacctatata 45885817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25980135 - 25979967
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25980135 cactttaacatttgttagacggaatgatttatttaatcctttaaatatcaatgtaagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatt 25980036  T
Q  121 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  25980035 tcaacataaaataattttttacatttggaaaggatttgggtatgagtttggggtgggtacatatatatc 25979967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 45379980 - 45380148
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45379980 tcactttaacatttgttagacgaactgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat 45380079  T
Q  120 atcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45380080 gtcaacataaagtaatttttttacatttgggacgagtttaggtatgggttcggggtgggtacctatata 45380148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 39316862 - 39317036
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39316862 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaatcgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 39316961  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||| ||| ||||||    
T  39316962 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgagacggatatgggtatgagttcaggatggatacatatata 39317036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41741675 - 41741506
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41741675 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccgttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 41741576  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  41741575 atgacatatcagtataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttc-gggtgggtaccta 41741506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44794246 - 44794084
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44794246 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaagtatcaatggtagtttttagtaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 44794147  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacct 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44794146 atcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacct 44794084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 17851728 - 17851897
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17851728 tcactttcacatttattagataaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 17851827  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17851828 atcaacataaagtagttttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatc 17851897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44986124 - 44985981
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44986124 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 44986025  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatg 158  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44986024 at-acatatcaacat-aaataattttttacatttgggacgggtatg 44985981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 12980244 - 12980418
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  12980244 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacgaaaattatcaaacaaaataac 12980342  T
Q  113 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12980343 atggcatatcaacataaaatattttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 12980418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18125447 - 18125280
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18125447 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgattctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 18125348  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18125347 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgcgttcggggtgggtacctatata 18125280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 21702533 - 21702700
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21702533 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatataaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 21702632  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702633 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggttggggtatgggttcggggtgggtacctatata 21702700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 35074343 - 35074511
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35074343 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 35074442  T
Q  120 atcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35074443 atcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggttgggtacctatata 35074511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 43507300 - 43507486
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaa---------- 102  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||              
T  43507300 aatatgctcactttaaaatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaaaataac 43507399  T
Q  103 --acaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43507400 atacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtataggtatgggttcagggtgggtgcctatata 43507486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Original strand, 3920417 - 3920579
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3920417 tttaacatttgttagaccgattcatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacatggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 3920515  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3920516 acataaaataattttctacattcgggacagttttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 3920579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 24753050 - 24753196
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24753050 tcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcttt-aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 24753148  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24753149 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggt 24753196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 41103528 - 41103697
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatca---atgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  41103528 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcatcaatggtaatttgtattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagag 41103627  T
Q  118 atatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41103628 atatcaacataaaataattttttacatttaggacgggtttatgtatgggttcggggtgggtacttatata 41103697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39456239 - 39456067
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  39456239 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttccaatatcaatggtaatttttattaccatggcaattatcaaacaaaataac 39456140  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39456139 atgacatatcaacataaagtaa-tttttacatttgggacgggtatgagtat-ggttcggggtgggtacctatata 39456067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44658639 - 44658501
Alignment:
Q  49 ttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgg 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44658639 ttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaatatttttttacatttgg 44658540  T
Q  149 gacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
     |||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44658539 tacgggtttgggtatgggttcgggataggtacctatata 44658501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 25905510 - 25905659
Alignment:
Q  28 acatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacat 127  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25905510 acatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 25905609  T
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggt-tatgggtatgggttcggggtgg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  25905610 aaaataattttttacatttgggacgatgtttgggtatgagttcggggtgg 25905659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18826097 - 18825924
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  18826097 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcttttatatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 18825999  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18825998 atggcatatcaacgtaaaataattttctgtatttgggatgggtttgggtacgggttcggggtgggtacctatata 18825924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 37579130 - 37579303
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37579130 aatatgctcactttaacatttgttagatggattgatttagttgctcatttaaatatcaatgataatttttat-aacatgacaattatcaaacaaaataac 37579228  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37579229 atggcatagcaacataaagtaattttctgcatttgagacagctttgggtataggttcggggtgggtacctatata 37579303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 38152776 - 38152928
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||               ||||||||||||||||||||||||||    
T  38152776 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttagatatcaatggtagt---------------aattatcaaacaaaataacatgacat 38152860  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38152861 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatata 38152928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 187
Target Start/End: Original strand, 16811635 - 16811770
Alignment:
Q  51 agttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttggga 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16811635 agttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataatatatcaacataaagtaattttttacatttggga 16811734  T
Q  151 cggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16811735 cggctttgggtatgggttc-gggtgggtatctatata 16811770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3227108 - 3226999
Alignment:
Q  77 gtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgg 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  3227108 gtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggatgtgtatgagtatgggttcggggtgg 3227009  T
Q  177 gtacctatat 186  Q
    ||||||||||    
T  3227008 gtacctatat 3226999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27850540 - 27850380
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27850540 tttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgaaagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 27850442  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
     | |||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27850441 tcgtaaagtaattttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctata 27850380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45709081 - 45708917
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  45709081 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaatatgacaattatcaaacaaaataatataacat 45708982  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||| |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45708981 atcaacataaagta---ttttacattttggacgggtttaggtatgagttcggggtgggtacctatata 45708917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2630799 - 2630625
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||    
T  2630799 aatatgttcactttaacatttgatagaccgattgatttagttgctcatttaaatatcaatggtagttttta-taatacggcaattatcaaacaaaataac 2630701  T
Q  113 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2630700 atggcatatcaacataaagtagtttttttgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatata 2630625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 5376953 - 5377126
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||    
T  5376953 aatatgctcattttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaattac 5377051  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5377052 atgatatatcaacataaagtaattttctgcattcgggacagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 5377126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 46127398 - 46127237
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  46127398 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagttatta-taacacgacaatgatcaaacaaaataacatgacat 46127300  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    ||   |||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||| | |||| |||||||||||||    
T  46127299 at---cataaaataattttctgcatttgggacgggtttgagtatgagatcggtgtgggtacctata 46127237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 187
Target Start/End: Original strand, 10072429 - 10072507
Alignment:
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10072429 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 10072507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 24425249 - 24425421
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24425249 aatatgctcactttaacatttgttagaccggttgatttatttg-tcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgataattatcaaacagaataac 24425346  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| | |||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  24425347 atggcatatcaacatatagtaattttatgcatttggaacgggtttggaaatggggtcagggtgggtacctatata 24425421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 26622834 - 26622992
Alignment:
Q  28 acatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacat 127  Q
    ||||||||| |||  | ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26622834 acatttgtttgaccaattgatttaattgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacaacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacat 26622932  T
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26622933 aaaataattttttgcattcgaaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 26622992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 16078881 - 16079054
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  16078881 aatatgttcactttaacattttttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaagggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataac 16078979  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||| |  |||   ||||  | ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  16078980 atggcatatcaacgtaaagtaattttctgtattcatgacgagtttgggtataggtttggggtgggcacctatata 16079054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 23328477 - 23328641
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  23328477 aatatgctcactttagcatttattagaccgattgatttagttattcctttaaatatcaatgataattttta-tagcacgacaattatcaaacaaaataac 23328575  T
Q  113 atgacatatcaacat-aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtggg 177  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  23328576 aagacatgtcaacataaaaataattttctccattcgggacgggtttgggtataggatcggggtggg 23328641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25783125 - 25782959
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||| |||| ||| || || ||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||| ||    
T  25783125 tcactttaatatttattataccgattgatttagttgctcctttaaatattgatgatagtttttat-aacactgcaattatcaaacaaaataatatgagat 25783027  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || |||||||| ||||||| | |||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25783026 attaacataaagtaattttctgcattcgggacggattttggtatgagttcggggtgggtacctatata 25782959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26004675 - 26004526
Alignment:
Q  35 ttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataa 134  Q
    |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26004675 ttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aagaagacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaa 26004577  T
Q  135 ttttttacatttgggacg-gttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||| | |||| ||| || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26004576 ttttctgcattcggggcgagtt---ggtatgggttcggggtgggtatctatata 26004526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3227769 - 3227696
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta 86  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3227769 aatatgctcacttcaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttatta 3227696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Original strand, 10072357 - 10072436
Alignment:
Q  14 atatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatag-tttttattaacatga 92  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10072357 atatgctcactttaacatttgttaggcggaatgatttagttgatcatttaattatcaatggtagttttttattaacatga 10072436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26004746 - 26004673
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta 86  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26004746 aatatgctcattttaacatttgttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatggtagtttttatta 26004673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8906700 - 8906643
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8906700 aaaataattttttacatttggaacaggtatggatatgggttcggggtgggtacatata 8906643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 21750665 - 21750740
Alignment:
Q  47 atttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21750665 atttagttggtcttttaactatcaatgaaagttcatat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 21750740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5565414 - 5565361
Alignment:
Q  132 taattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5565414 taattttttacatttgggatgtgtatgggtatgggttaggggtgggtacatata 5565361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10995934 - 10995894
Alignment:
Q  139 ttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggta 179  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10995934 ttacatttggaacgggtatgggtatgggttcggggtgggta 10995894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27896586 - 27896540
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggt 174  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27896586 aaaataattttttatattcgggacgggtatgggtatgagttcggggt 27896540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Original strand, 33841071 - 33841117
Alignment:
Q  139 ttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  33841071 ttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgagtacatata 33841117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3274810 - 3274765
Alignment:
Q  108 ataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  3274810 ataacatgacatatcaacataatgtaattttctacattcgggacgg 3274765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 123
Target Start/End: Original strand, 18683857 - 18683928
Alignment:
Q  51 agttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | || |||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18683857 agttgatcatttaactatcaatgaaaattcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatggcatatca 18683928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 20086879 - 20087044
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20086879 cactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaagcaaaataacatgacata 20086978  T
Q  121 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20086979 tcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagta-gggttcggggtgggtacctatata 20087044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22536067 - 22535893
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22536067 aatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 22535968  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22535967 atgacatatcaacataaaataattttttacatttaggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggtgcctgtata 22535893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Original strand, 29842170 - 29842343
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29842170 aatatgctcacttcaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 29842269  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29842270 atgacaaatcaacataaagtaattttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatat 29842343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 48391042 - 48390870
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48391042 aatatgttcacttcaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagttttt-ttaacatgacaattatcaaacaaaataac 48390944  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48390943 atgacatatcaacataaagtaattttttacgttcgggacgggtatgggtatgggttcaggatgggtacctatat 48390870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 34025816 - 34025990
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34025816 aatatgctccctttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 34025915  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  34025916 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtggaaacctatata 34025990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 44639143 - 44639310
Alignment:
Q  19 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 118  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44639143 ttcactttcacatttgttagata-aatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 44639241  T
Q  119 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44639242 tatcaacataaaataattttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 44639310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 39728540 - 39728707
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39728540 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttaatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacagaacaattatcaaacaaaataacattacat 39728639  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39728640 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 39728707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 44172495 - 44172662
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44172495 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 44172594  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44172595 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 44172662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 44179195 - 44179362
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44179195 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 44179294  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44179295 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 44179362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 44252616 - 44252783
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44252616 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 44252715  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44252716 atcaacataaagtagttttttatatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 44252783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Original strand, 43582440 - 43582609
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43582440 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatatcaatggtagtttttatttacatgataattatcaaacaaaataac 43582539  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  43582540 atgacatatcaatataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttc-gggtgggtaccta 43582609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17146367 - 17146202
Alignment:
Q  22 actttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatat 121  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17146367 actttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatat 17146268  T
Q  122 caacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17146267 caacataaagtaattttttacatttgggaagggtttgtgtatgggttcggggtggatacctatata 17146202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 23580698 - 23580863
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23580698 cactttaacatttgttatacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acata 23580796  T
Q  121 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23580797 tcaacataaaataattttttacatttgggataagtgtgggtatgggttcggagtgggtacctatata 23580863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Original strand, 34154280 - 34154449
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  34154280 aatatgttcactttaatatttgttagacataatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata-- 34154377  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
       ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34154378 ---acatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 34154449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 49579933 - 49580100
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  49579933 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaatcatcaaacaaaataacataacat 49580032  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49580033 atcaatataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcgaggtgggtacctatata 49580100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6738620 - 6738446
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6738620 aatatgctcactttaacatctgttagacataatgatttaattgatccttccaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataac 6738521  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  6738520 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatggatttggggtgggtacctatata 6738446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44107011 - 44106842
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44107011 tcactttcacatttgtaagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 44106912  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44106911 attaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtagatacctatatatc 44106842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10823919 - 10823759
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10823919 aataagttcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 10823820  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcgggg 173  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  10823819 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggagaggtttgggtatgggttcgggg 10823759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 52198023 - 52198191
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat-aacatgaca 118  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||    
T  52198023 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataaacatagca 52198122  T
Q  119 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52198123 tatcaacgtaaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 52198191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 29284205 - 29284372
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29284205 tcactttcacatttgttaaacaaaattatttagttgatcttttaaatattaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 29284304  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29284305 atcaacataaagtagttttttacatctgggacgggtttgggtatgggttcgggctgggtacctatata 29284372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39655492 - 39655325
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39655492 tcactttcacatttgttagagaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 39655393  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39655392 atcaacataaagtagttttttacatttgagacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatata 39655325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44953654 - 44953487
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44953654 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 44953555  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44953554 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgagtatgagttcggggtgagtacctatata 44953487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7469997 - 7469830
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7469997 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacat 7469898  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| ||||||| || | ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7469897 atccacataaagtagtgttttacatttgggacgggtttgtgtatgggttcggggtgggtacctatata 7469830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 52572478 - 52572645
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  52572478 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatactttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 52572577  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  52572578 attaacataaagtaattttttacatttgggacgggcttgagtatggattcggggtgggtccctatata 52572645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 171
Target Start/End: Original strand, 49025550 - 49025701
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  49025550 tcactttcacatttattagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacataacaattatcaaacaaaataacataacat 49025649  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcgg 171  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  49025650 atcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgg 49025701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 30682684 - 30682846
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30682684 aatatgttcactttaacatttgttagaacgaatgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacatgaccattatcaaacaaaataac 30682782  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgg 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| | || |||| |||||| |||||    
T  30682783 atgacatatcaacataaagtaattttctacattcaggacgggtttgagtataggttcgaggtgg 30682846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4557530 - 4557357
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  4557530 aatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaaaataac 4557432  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4557431 atgacatatcaacataaagtaattttctgcattcgggatagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 4557357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 34119521 - 34119692
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||      
T  34119521 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcatttcaatatcaatgttagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata-- 34119617  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||||| ||| || |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34119618 atggcatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 34119692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 53631767 - 53631940
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||    
T  53631767 aatatgctcactttatcatttgttagaccgatcgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataac 53631865  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53631866 atggcatatcaacataaagtaattttctagattcgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtacctatata 53631940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23154242 - 23154116
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgg 159  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||     
T  23154242 tttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggataggtatga 23154144  T
Q  160 gtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23154143 gtatgggttcggagtgggtacctatata 23154116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Original strand, 42758248 - 42758410
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42758248 tttaacatttgttagaccggttgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aacatggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 42758346  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||| ||||||| | | || ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42758347 acataaagtaattttcttcgttcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgcatacctatata 42758410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 48306768 - 48306650
Alignment:
Q  7 tcgaagaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48306768 tcgaacaatacgctcactttaatatttgttagacggaatgatttagttgatactttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 48306669  T
Q  107 aataacatgacatatcaac 125  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  48306668 attaacatgacaaatcaac 48306650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Original strand, 54317018 - 54317180
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54317018 tttaacatttgttagacatgttgatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 54317116  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||| ||||||| | | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54317117 acataaagtaattttcttcgtttgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtacctatata 54317180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4016269 - 4016096
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||| ||  |||||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  4016269 aatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcgatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaaaataac 4016171  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||  || |||| | |||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4016170 atgacatatcaacataaggtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggagtgggtacctatata 4016096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31127020 - 31126847
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||||||||    
T  31127020 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttat-aatacgacaattatcaaacaaaataac 31126922  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||||| ||  || |||| | |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31126921 atggcatatcaacacaatgtagttttctgcatttgggacgagtttgggtatgagttcggggtggatacctatata 31126847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 19111598 - 19111770
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  19111598 aatatgatcactttaacatttgttataccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgaaaattatcaaacaaaataac 19111696  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| | |||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19111697 atgacatat-aacataaagtaattttctacattttgtacgggtttgggcatgggtttagggtgggtacttatata 19111770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23547191 - 23547069
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23547191 tcactttcacatttgttaaacaaaattatttagttgatcctttaaatataaatgctagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 23547092  T
Q  120 atcaacataaaataattttttac 142  Q
    || |||||||| || ||||||||    
T  23547091 attaacataaagtagttttttac 23547069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 830872 - 831039
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||    
T  830872 aatatgctcacgttaacattttttagaccaattgatttagtttctccttaaaatatcaatgatagtttttat-aagacggcaattatcaaacaaaataac 830970  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacc 181  Q
    ||  ||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  830971 atagcatattaacataaagtaattttctgcattcgggacgaatttgggtatgggttcagggtgggtacc 831039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41937220 - 41937089
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  41937220 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcatttcaatatcaatgttagtcttta-taacacgacaattatcaaacaaaataatatgacat 41937122  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacg 152  Q
     |||||| ||| || |||| | |||||| ||||    
T  41937121 gtcaacacaaagtagttttctgcatttgagacg 41937089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48305760 - 48305693
Alignment:
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48305760 atcaacataaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatata 48305693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23910385 - 23910330
Alignment:
Q  98 atcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23910385 atcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttctacattcgggacgg 23910330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23547055 - 23546994
Alignment:
Q  126 ataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23547055 ataaagtagttttttacatttgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 23546994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30616392 - 30616344
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgg 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30616392 aaaataattttttacgtttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgg 30616344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 14208264 - 14208377
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||| |||| ||||||||||  | ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14208264 aatattttcattttaacatttccttgactgaatgattttgttgctcctttaaatatcaatgaca-ttttta-taacatgacaattatcaaaccaaataac 14208361  T
Q  113 atgacatatcaacata 128  Q
    ||   |||||||||||    
T  14208362 atagtatatcaacata 14208377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1772573 - 1772538
Alignment:
Q  88 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1772573 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 1772538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10043389 - 10043343
Alignment:
Q  132 taattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggt 178  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10043389 taattttttatattcgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggt 10043343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30904914 - 30904868
Alignment:
Q  140 tacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30904914 tacattcgagacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatat 30904868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 23330033 - 23330113
Alignment:
Q  42 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||| ||||||||| || ||||| ||||||| | |||| |||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23330033 gaataatttagttgctcgtttaactatcaataaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccgaataacatgacatatca 23330113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 55225310 - 55225249
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatga 74  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  55225310 aatatgttcactttaacatttttttaatcgaatgatttaattgctcttttatatatcaatga 55225249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10142737 - 10142570
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10142737 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 10142638  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10142637 atcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatata 10142570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 12141254 - 12141421
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  12141254 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgttagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacgt 12141353  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12141354 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 12141421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 32853713 - 32853880
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32853713 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacat 32853812  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32853813 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 32853880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 24225569 - 24225734
Alignment:
Q  22 actttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatat 121  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24225569 actttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatat 24225668  T
Q  122 caacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24225669 caacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggcatgggttcggggtgggtacctatata 24225734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5863602 - 5863435
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5863602 tcactttcacattttttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacataacat 5863503  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5863502 atcaacataaaatatttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtatctatata 5863435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10188292 - 10188125
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||    
T  10188292 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcgaacaaaataacataatat 10188193  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10188192 atcaacataaaataattttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 10188125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 27534546 - 27534720
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27534546 aataagttcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgattctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 27534645  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27534646 ataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatggattcggggtgggtacctatata 27534720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 2367195 - 2367362
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2367195 tcactttaacatttgttagacaaaatgatttagtttatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 2367294  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2367295 atccacataaagtaattttttccatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 2367362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3484142 - 3483975
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  3484142 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatgaaacaaaataacataacat 3484043  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3484042 atccacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 3483975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 190
Target Start/End: Original strand, 27738664 - 27738811
Alignment:
Q  43 aatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttac 142  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27738664 aatgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcatacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttac 27738763  T
Q  143 atttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 190  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27738764 atttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatatct 27738811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 14032419 - 14032579
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||    
T  14032419 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aacacaacaattatcaaacaaaataac 14032517  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggt 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14032518 atgacatatcaacataaagtaattttatgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggt 14032579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 12309441 - 12309608
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||       || |||| |||||||||||||||||||    
T  12309441 aatatgtttactttaacatttgttagacgaaatgatttaattgcccctttaaatatcaatgatagt-------aatatgacaattatcaaacaaaataac 12309533  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12309534 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatcggttcggggtgggtacatatata 12309608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12678318 - 12678146
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  12678318 aatatgctcactttaac-tttattagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgataatttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 12678221  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12678220 atgacatatcaatataaaataattttctcaattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatata 12678146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24603081 - 24602908
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||    
T  24603081 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgtcaattatcaaacaaaataac 24602983  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||| |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24602982 atggcacatcaacataaagtaattttctacattcgtgatgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatata 24602908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Original strand, 14505949 - 14506118
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  14505949 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 14506047  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
     ||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  14506048 gtgacatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacgggtttaagtatgggttcggggtgggtaccta 14506118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 187
Target Start/End: Original strand, 32053000 - 32053124
Alignment:
Q  63 aaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggta 162  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  32053000 aaatatcattgtaagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtatttttttacattttggacgggtttgggta 32053099  T
Q  163 tgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||    
T  32053100 tgggtttggggtgggtacatatata 32053124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7394112 - 7393939
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||     
T  7394112 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatgttagttttta-taacacggtaattatcaaacaaaataat 7394014  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||  ||| |  | || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7394013 atgatataccaacataaaataaatttatgcattcaggatgagtttgagtatgggttcggggtggatacctatata 7393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Original strand, 14254821 - 14254993
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta-acatgataattatcaaacaaaataa 111  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||||    
T  14254821 aatatgttgactttaacatttattagaccgaatgatttaatcgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacatca-aatt-tcaaacaaaataa 14254918  T
Q  112 catgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14254919 catgacatatcaacataaagttattatttgcatttgggacgaatttgggtatgggttcatggtgggtacctatat 14254993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 30816120 - 30816296
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  30816120 aatatgtacactttaacatttgttagaccgattgatttaggtgctcctttaaatgtcaatggtagttttta-taacacggcaattatccaacaaaataac 30816218  T
Q  113 atgacatatcaacataaaata---attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||||||||||||||| ||    |||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30816219 atcacatatcaacataaagtagtttttttttgcattcgggacgggtttggatatgggttcggggtgggttcctatata 30816296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 187
Target Start/End: Original strand, 32532498 - 32532576
Alignment:
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32532498 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 32532576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 187
Target Start/End: Original strand, 11762342 - 11762481
Alignment:
Q  47 atttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacattt 146  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11762342 atttagttgctcctataaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatataacaaaataacatggcatatcaacataaagtaattttctacattt 11762440  T
Q  147 gggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  11762441 gggatgggtttgggtatgagttcggggtggacacctatata 11762481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 32532426 - 32532505
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatga 92  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32532426 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttggtcctttaaatatcattggtagtttttattaacatga 32532505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Original strand, 14245110 - 14245214
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  14245110 aatatgttcactttaacatttattagaccgaatgatttagtcgctcctttaaatattaatggtagttttta-taacacgacaattttcaaacaaaataac 14245208  T
Q  113 atgaca 118  Q
    ||||||    
T  14245209 atgaca 14245214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14411058 - 14410954
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  14411058 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgatggttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataac 14410960  T
Q  113 atgaca 118  Q
    | ||||    
T  14410959 acgaca 14410954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Original strand, 32052927 - 32052988
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagttttt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  32052927 cactttaacatttgttagacggaatgatttatttaatcctttaaatatcaatgtaagttttt 32052988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 186
Target Start/End: Original strand, 20349039 - 20349099
Alignment:
Q  126 ataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20349039 ataaattaattttttacatttgcaacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatat 20349099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 187
Target Start/End: Original strand, 15498309 - 15498360
Alignment:
Q  136 tttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15498309 tttttacatttgggacgggtttgggtgtgggttcgggatgggtacctatata 15498360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 123
Target Start/End: Original strand, 9458234 - 9458269
Alignment:
Q  88 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9458234 catgataattatcaaaccaaataacatgacatatca 9458269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14410946 - 14410907
Alignment:
Q  148 ggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14410946 ggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 14410907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28079778 - 28079749
Alignment:
Q  157 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28079778 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 28079749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 256597 - 256545
Alignment:
Q  134 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||| ||||||| ||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  256597 attttctacatttaggaggggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatat 256545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34346118 - 34346058
Alignment:
Q  126 ataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34346118 ataaattaattttctacattcggaacggatttgggtatagattcggggtgggtacctatat 34346058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 4119 - 4275
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4119 aatatgttcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 4218  T
Q  113 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggtt 168  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  4219 atgacatatcaacataaagtattttttttacatttgggacgagtttgggtatgggtt 4275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 10163 - 10333
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |   | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10163 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatgac---ggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaaaataac 10259  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10260 at-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatata 10333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 14638 - 14811
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||     
T  14638 aatatgctcactttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttac-aacacaataattatcaaacaaaataat 14736  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  14737 atatcatatcaacattaaataattttctacatttgggacgagtttgggtatgtgttcaaggtgggtacctatata 14811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 197545 - 197380
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  197545 tcactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacaaggtaattatcaaacaaaataacatggcat 197447  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| | ||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  197446 atcaacataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgggtatagattcggtttgggtacctatat 197380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 33256 - 33429
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||    
T  33256 aatatgtttactttaacaattgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatcgtagtttttat-aacacaacaattaccaaacaaaataac 33354  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| ||| |||||||||| || |||| | |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33355 atggcatgtcaacataaagtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatata 33429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 153
Target Start/End: Original strand, 6269 - 6408
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||| |||||| || |||||| || || || || ||||||||||||||||    
T  6269 aatatgttcactttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatttcaatggtaattttta-tagcacgacaactatcaaacaaaataac 6367  T
Q  113 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgg 153  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||    
T  6368 atggcatatcaacataaagtaactttctgcatttgagacgg 6408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 90467 - 90633
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||| || ||||    |||||| ||||||||||||||| |||    
T  90467 tcactttaatatttgttagaccgattgatttatttgctcctttaaatatcaatggttgttttaat-aacacatcaattattaaacaaaataacatggcat 90565  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||  | || |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  90566 atcaacataaaataattttctgcattcaggacgaatttgtgtatgggttcggggagggtaccaatata 90633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 32755 - 32642
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||  |||||| ||    
T  32755 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgatc-attaaatatcactggtagtttttattaccatgaccattatcactcaaaatcac 32657  T
Q  113 atgacatatcaacat 127  Q
    ||||| |||| ||||    
T  32656 atgacctatctacat 32642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Original strand, 36018 - 36128
Alignment:
Q  13 aatatgttcacttt-aacatttgttagacggaatgatttagttgatct--tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  36018 aatatgttcacttttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacagttatcaaacaaaat 36116  T
Q  110 aacatgacatat 121  Q
    ||||||||||||    
T  36117 aacatgacatat 36128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 33446 - 33611
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaa-ca---aaa 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| ||   |||    
T  33446 aatatgttcactttaatatttgttacaccgactgatttaattgcttctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgaaaattatcaaatcaaataaa 33544  T
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtg 175  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || |||| | |||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  33545 taacatggcatatcatcataaagtagttttctgcatttgtgacgggtttggttatgggtttggggtg 33611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14370 - 14299
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttat 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  14370 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttaattgttcctttaaatatcaatggtagtttttat 14299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14300 - 14268
Alignment:
Q  108 ataacatgacatatcaacataaaataatttttt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14300 ataacatgacatatcaacataaaatagtttttt 14268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1630 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1630
Description:

Target: scaffold1630; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 73
Target Start/End: Original strand, 1492 - 1545
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatg 73  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1492 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatg 1545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 123
Target Start/End: Original strand, 16847 - 16917
Alignment:
Q  52 gttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16847 gttggtcttttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgataattatcaaaccaaataacatggcatatca 16917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0902 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0902
Description:

Target: scaffold0902; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 102
Target Start/End: Original strand, 748 - 836
Alignment:
Q  13 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaa 102  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  748 aatatgttcactataacatttctttgatcgaatgatttggttgctactttaaatatcaatggtaggtttta-taacatgacaaatatcaa 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University